3CERA

Crystal structure of the exopolyphosphatase-like protein q8g5j2. northeast structural genomics consortium target blr13
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
ESVTVAGIDCGTNSIRLKIARVDADGMHEVVPRILRVIRLGQDVDKTHRFADEALERAYVAAREFAGVIAEHPIDGLRFVATSATRDAENREEFEDEIERILGVRPEVIPGTEEADLSFLGATSVVNRDDLPAPYLVVDLGGGSTELVIGGDGVSAPTTQVQGAFSMNIGSVRMTERHLTNDPPTQTQIDEAVADVDEHIDEAFRTVDAGKARTIIGVSGTVTTMTALAMGLKEYDHTVVDGHRLSFEDAYAVDDKFLRMTRAERREYKTIHPGRIDVVGGGAVVWSRVLARVSEAAKADHGEAIDSFVASEHGLLDGIVLDYGRRLLAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Possible exopolyphosphatase-like protein
publication title Crystal structure of the exopolyphosphatase-like protein Q8G5J2. Northeast Structural Genomics Consortium target BlR13.
rcsb
source organism Bifidobacterium longum ncc2705
total genus 112
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02541 Ppx-GppA Ppx/GppA phosphatase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cerA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3cerA02
2E88A 1CZAN 2YCHA 3DJCA 1ZBSA 2E1ZA 2EWSA 4FWSA 3H1VX 2UYTA 3CI5A 4QS8A 3EL2A 3WXLA 1BA1A 1GLBG 1ZC6A 2Q36A 1U2VA 1TYQB 3UKRB 1GLLO 4CBXA 3AARA 1QQMA 4FWMA 2D1KA 1TUUA 4A62A 2HOEA 3A0IX 5AQJA 5BRHA 1IJJA 3O5BA 2E2OA 1HJOA 3M3ZA 4BRDA 4CZJA 3AAQA 2PBDA 3MN9A 4CBWA 1QZ6A 4H5TA 2P9KA 3U9DA 5BN8A 3RSEB 2D4WA 3SMSA 1BU6O 3KHYA 3C7NB 1X9JA 1JCEA 5BRDA 4FOIA 3HM8A 2QWOA 4CBUA 1KAYA 4BC3A 2CGLA 4DB3A 3D2EB 5KPZA 4H5WA 1TUYA 5AQHA 2YJEA 3EZWA 1GLCG 1XQSC 5BPLA 1BWFO 2Q2RA 4BQZA 1NLVA 3FE1A 4FWPA 3O1BA 3A5MC 2V7YA 3W3DA 3DWLA 4H5RA 5EOYA 3L4IA 3MK6A 3TPQA 1WOQA 4M63C 3UKUB 4CJ7A 4EFHA 5JMVA 3DXMB 3QMLA 5BR9A 3R9PA 2VWBA 5AQNA 1NGAA 2ITMA 4XEIA 4H0OA 1S22A 4QS9A 3VGKA 3DXKA 4FWQA 4BR4A 4XH1A 4K41A 4GY2B 1HX1A 4CD1A 1SZ2A 3IDHA 5JLFA 4F9OA 4FPAA 5FPEA 2Q0UA 4PKIA 2P9PA 4BRPA 5BPNA 1BDGA 3DAWA 1DKGD 2IVNA 2ASPA 2P9NA 4M7XA 3KVGA 4MO4A 1D4XA 4JD2A 4I6MA 5AQTA 2QWNA 4PKGA 3A5NC 3VF2A 2QWMA 4KBOA 4BGAA 1HUXA 3LM2A 1E4GT 5AZIB 2A5XA 3GDQA 3ZEUA 4BRAA 1BA0A 2YHYA 4MLHA 4BC5A 1XUPO 2P9IA 4BRKA 4JHDA 4B1ZA 4CZKA 4E1JA 1WUAA 2FXUA 3WT0A 1Q18A 3MN7A 1ZXOA 2HF4A 4EIAA 3UE5A 3WQTA 4PKHA 1BO5O 5AQZA 4QS7A 1GLAG 2E8AA 3M6GA 3LDQA 3QFUA 3ZETB 1GLFO 5BREA 4O8KA 4BC4A 5AFUH 3IFRA 4EHTA 4H5NA 5AQRA 3JS6A 4FWLA 4C23A 2BTFA 3LM9A 5FPDA 2CGJA 4IJAA 3VEWA 2P9UB 3O8MA 3OHRA 1HKGA 2ASMA 3SLCA 4CZGA 3FZHA 2OANA 4FO0A 2E1YA 3FGUA 3O6WA 2HMPA 3BEXA 5BRFA 4LC9B 3QBXA 2A3ZA 3BF1A 5KQDA 3CJ7A 2QW9A 4BRMA 3QICA 4FWNA 2NLXA 1R59O 1TYQA 3UKRA 3ULEA 4BC2A 3FZFA 3A8YA 3TU5A 1LOTB 3ENOA 3SMPA 1HKBA 1BG3A 1RGIA 3L6QA 4NO7A 4BG9A 3CJ9A 4BVPA 2F9TA 3FLCO 3JXUA 4IJNA 4FWRA 3ZX2A 3VESA 3FZLA 1Z05A 3QDKA 5KPTA 4ISGA 2CGKA 3O1WA 4M7YA 1ATNA 3A5OC 3C7NA 1YUWA 1NMDA 2ZWHA 3D2EA 1QQOA 3CETA 3VEZA 4BRHA 2KHOA 3H1QA 1IG8A 4K42A 1T44A 2QXLA 4JAXA 3R8EA 5BPMA 4O5FA 3I33A 2A40A 3FR0A 5F1XA 3U8XA 4FWKA 4CZFA 3VGMA 4PL8A 1DGKN 2E2PA 1QHAA 4B1XB 3BUZB 1G99A 2P9KB 1ATSA 3GOIA 1GLEG 3B8AX 4HWIA 5AFUA 3UKUA 2VYPA 3DXMA 5F0XA 3CJBA 4XH4A 4BROA 2GWJA 2Q31A 2FSKA 1MWMA 3O80A 3L0QA 1V4SA 3VPZA 1QQNA 3H45C 3MN5A 3ID8A 1KAZA 2WUSA 3H46O 3HZ6A 4HTLA 1JCGA 3ATUA 2Q0RA 3U9ZA 4A61A 4YDUA 1X3MA 2A42A 1GLDG 2FF6A 3U4LA 3CHWA 4DCHA 5TKYA 4CZHA 2E20A 3FZKA 3VERA 1T6DA 4K43A 2ZGZA 3G25A 5FPMA 1KXPA 3IUCA 4IWVA 3WXJA 5JICA 3WEEB 3H3NO 4NB4A 1H1VA 2PAVA 3VETA 1YAGA 1MDUB 3FFKB 3FZMA 3P4IA 3BF3A 4H0VB 3D2FB 2GWKA 3F9MA 5AQKA 1RFQA 5I9EB 4H03B 1NGCA 3IMXA 3HBTA 4H0TB 5AQLA 1T6CA 5AQGA 1MWKA 4BR7A 1RDWX 3WXKA 2ZF5O 4YDUC 5AZIA 2I7PA 2P9PB 2CH6A 4MLEA 4FPBA 2P9SB 2QWQA 4BRLA 2P9LB 2Q1NA 4IO8A 4CZIA 4JD2B 3ZX0A 4I6MB 3QB0A 4J8FA 3ZETA 5LY3A 2Q97A 4IXCA 2E2QA 3MN6A 3I8BA 5KQ8A 2NRHA 2VCPA 5AZJB 2AP1A 4ISFA 4BRGA 2YJFA 3ZEUB 5AQIA 2P9UA 4JHDB 5LJVA 3H6EA 3ENHA 4RWTA 5AQMA 1Z6RA 2HF3A 3BP8A 2QWRA 4WYBA 3QFPA 2A41A 5AQUA 5CE3A 1C0GA 1K8KB 4AM6A 2YHWA 3MDQA 4A2BA 3EN9A 2V7ZA 2D0OA 2FLOA 4BR5A 4MO5A 5EX5A 3GE1A 1SAZA 3SJHA 2AA4A 4B1UB 2YHXA 5KPRA 5ADXH 4RCHA 1OKJA 2GELA 3VENA 3LDPA 4DHYA 4FL9A 2CH5A 4BGBA 1EQYA 1LCUA 3VEYA 2W40A 1NGFA 2FSNA 5AQWA 3CQXA 4IZ9A 3RSEA 3MMVA 4BRNA 3R6MA 2E2NA 3AY9A 5AQQA 3EO3A 1U2VB 3H3OB 3ULEB 2GTDA 3VF6A 3VEVA 4BR9A 3VEOA 2I7NA 4BQLA 3CIPA 3O4WA 5BN9A 1S3XA 4CI6A 1MA9B 3O08A 2A6AA 2DPNA 5ELZA 2QM1A 1NGDA 2H3GX 3CERA 4B9QA 1NM1A 3VGLA 3CQYA 4FSVA 1HLUA 2IIRA 3WXIA 4BVOA 4FWOA 1Y64A 2J4RA 4B1YB 1BOTO 3MCPA 2IVPA 4WQ4A 2FF3B 1V4TA 5AQYA 5F2RA 4EHUA 3QBWA 5B8HA 1ESVA 1NGIA 3WQUA 2GUPA 3J8AA 5EVZA 2QWPA 3A5LC 4H0PA 3GG4A 4PL7A 4JN4A 3M1FA 3LL3A 4A2AA 1HPMA 5AQFA 4BRCA 5EY4A 3VOVA 3WEEA 4Y0WA 4Z94A 2IVOA 4H0XB 5ADXA 5AQVA 3D2FA 1BUPA 4BG8A 1YVNA 3DXKB 4WQ4C 4BR0A 5FPNA 4DQ8A 1SQKA 2ZGYA 4BREA 4L3QA 3S41A 3C0BA 4GNIA 4CD3A 4B1WB 5AQPA 4AM7A 1NGBA 3HI0A 5AQSA 1JCFA 3LDOA 5AQXA 4WQ5A 1XC3A 2P9SA 3EKSA 2W41A 2ASOA 1NGGA 2P9LA 2P9NB 4JNEA 4CZLA 2FSJA 4CZEA 2QWLA 5E26A 5AR0A 2V51B 1C0FA 1X3NA 3CJAA 3VEXA 3W0LA 1ATRA 4FOEA 3KZBA 3GL1A 3HTVA 3LDLA 5EXWA 5AQOA 5AZJA 4BR2A 4CZMA 5LJWA 2V52B 3CJCA 1QZ5A 5E84A 3SK3A 1HKCA 3EKUA 3CJ1A 2F9WA 2YI1A 2P9IB 3VF4A 4BRFA 1J6ZA 1KAXA 4XH5A 1NGEA 3ATVA 2NZTA 3LDNA 4WQ5C 3GBTA 4EAHD 1E4FT 1GLJO 4H5VA 4ISEA 4B1VA 1K8KA 2D0PA 1NBWA 3AAPA 4H0YB 4K25A 3WUHA 2BUPA 4BRIA 1DEJA 1NGHA 1NGJA 1NWKA 1P8ZA 3D7EO 3UB5A 3ZX3A 4BRQA 1U6ZA 5JLHA 4RTFD 1YXQA 2GEMA 3HSCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YCHA 1CZAN 3AVJA 3VQBA 3THWA 1OH8A 4F4KA 3KK3A 4LSNA 2WFBA 1RDAA 4NLCA 1XHZA 1T7PA 2EHGA 2YKMA 4FK2A 3DRRA 1HJRA 4JKBA 3ULDA 4QS8A 1TK8A 1TL1A 1S6QA 4W5OA 4M3TA 4MDAA 4FWMA 2D1KA 1T3VA 5AQJA 5BRHA 3THYB 3NH2A 1HJOA 2DFFA 2GX9A 2VG5A 4LFCK 1T05A 4JK7A 2P9KA 3U9DA 4XIUA 3KHYA 1P90A 4EP4A 5JS1A 4DB3A 3KJVA 3D2EB 4FJLA 2O8FA 1J9AA 1RDDA 3VQ9A 3OBYA 5AQHA 1W0HA 3CC7N 2WBNA 3L2RA 1GLCG 1DLOA 3SUNA 4CJSA 3OS0A 1NLVA 4E19A 3O1BA 2YNGA 2V7YA 3W3DA 3CCVN 4H5RA 1C0TA 3AO3A 3ZT3A 1LWFA 3QERA 1RBVA 3V1RA 4ID5A 1NGAA 4DS4A 5KRTA 3UIQA 3DXKA 2O8EA 1HPZA 4K41A 1HX1A 3KKRA 2UXCK 3IDHA 3CG7A 1VSIA 2QXFA 3NF9A 3ITHA 4BRPA 4DV5K 1DKGD 1VQ4N 3HM9A 4UY8O 3KVGA 3L2QA 2HHWA 3T69A 4AHVA 1JLGA 3LAMA 1X9SA 5LMNK 2KFZA 3LM2A 4FJXA 1VRTA 4PQUA 1E4GT 4ILJA 4FZYA 2WTUA 1U49A 1N8RO 4B1ZA 3AO4A 4CGJA 3SPYA 1YI2N 4DTMA 1YIJN 1FW6A 1I94K 4PKHA 4QS7A 3SI6A 2E8AA 3ZETB 4NYFA 3SBTA 1UAXA 1S9EA 3RRGA 4DLEA 4CF0A 4JKDA 3T1HK 4E7KA 2VQFK 4FWLA 5FPDA 3LM9A 4OPJA 1NJWA 3VEWA 2P9UB 1JLFA 2FBTA 2G8FA 4DSFA 3MXJA 3OVNA 3BZKA 3FZHA 3SUQA 1EKEA 2OANA 3CQ8A 5KGWA 4LC9B 4RW4A 3MEGA 1HNIA 5KQDA 3CJ7A 1NOYA 4BY9C 1R59O 3UKRA 3ULEA 4KHPK 3A8YA 2RN2A 3SMPA 2F4VK 5GINA 1K9MO 5FLXO 1RGIA 5FROA 4NCBA 3THWB 3FLCO 2OPQA 1D9FA 4FWRA 4B9VA 4CF2A 3BY5A 4DR1K 3HVTA 2E6MA 3QDKA 3K2PA 1JXEA 2VGNA 3O1WA 1QHTA 2HSTA 3A5OC 3C7NA 1YUWA 1QQOA 3CETA 4KTQA 1Q82O 2IGIA 4HUGA 3SAFA 3FR0A 4FWKA 1RTDA 3VGMA 5CYQA 3SV4A 2OPPA 4PL8A 3ZSWA 1QHAA 1NG9A 1NJIO 2P9KB 5C42A 3GOIA 3OYBA 3B8AX 4CHQA 3PO5A 3UKUA 4F2SA 3CJBA 4XH4A 4BROA 1YJWN 2GWJA 3S9HA 2Q31A 4OKJA 3M8QA 1MWMA 1IKXA 3OYLA 5D3GA 1QQNA 5IT9O 2FF6A 2A42A 1IBMK 3AVMA 1K73O 4JK8A 3QINA 5TKYA 4CZHA 4DTJA 2E20A 4KH5A 1G15A 1T6DA 3K5OA 2Y1IA 2YNFA 4CF9A 3SQ1A 3WXJA 4O55A 1UWBA 3VQ4A 4CK1A 1VQKN 5JICA 4E0DA 4CJ4A 4IO9L 3KK7A 4O8UA 5AJ3K 1HNXK 3BF3A 3OS1A 3LPUA 1NKEA 2O8EB 4FJNA 5JS2A 1W9HA 1RNHA 5AQLA 1O13A 1T6CA 4CFAA 1BISA 5AZIA 4NCGA 4OKKA 4MLEA 4FPBA 3THVA 2QWQA 1R0AA 4LFBK 1T03A 3RRHA 3NGZA 4JYAK 4CIEA 3L2UA 3KIOA 3ZX0A 3VQEA 4FVMA 4FJKA 2Q97A 4FW2A 2G8KA 3MN6A 5KQ8A 4EZ9A 5AZJB 2KZMA 4ISFA 5DMRA 5AQIA 2EX3A 3MWTA 5LJVA 3ENHA 5AQMA 1Z6RA 3BP8A 4DU1A 1XWLA 2A41A 1NK4A 1C0GA 3BDPA 4YOYA 4B8AB 4OPHA 4LSLA 4YOXA 3TI0A 3HSTB 3CPWM 3CFOA 3G0ZA 3AV9A 5EX5A 3SJHA 3G4SN 4FM2A 2AA4A 4YORA 4B1UB 1QVGM 3L3UA 2YHXA 4C8NA 1WAFA 5CZ2A 4LF7K 1HNWK 2QK9A 2NUBA 1OKJA 4GKKK 1N5YA 3VENA 4DHYA 2HVHA 3O9UA 4ILGB 4BGBA 4EP5A 1RT3A 1NGFA 5AQWA 5J2QA 4FLWA 2AJQA 2G8WA 3ULEB 4KI6A 1KLMA 1IKVA 4BQLA 3OYMA 3NCIA 3LDSA 2VG7A 2A6AA 2H3GX 4CE9A 3CERA 3TTCA 1B9DA 1KRPA 3AVNA 4N41A 4RW6A 2HHHK 1YTUA 3KWGA 4GV6A 2KKZA 3F73A 2IIRA 4KREA 1M90O 4KI4A 5HRPA 4QAGA 4M41A 4DQRA 3EY1A 5B8HA 2B5JA 5EVZA 1X1PA 2GBZA 2QWPA 4ILHA 2WOMA 1IKYA 3PV8A 3A5LC 4E7LA 2UU9K 4FJJA 5HRNA 3M1FA 4NCAA 1N32K 3DOLA 4JI7K 3DLHA 1ASVA 3E9OA 4F3OA 5ADXA 1C0MA 2ZQBA 4CJVA 1VHXA 4DQPA 5GIPA 1YVNA 1EXQA 1BQMA 4CD3A 4CW7B 4CFCA 1SKWA 4FJHA 4BDPA 5JVHL 3LDOA 4AHRA 4CGHA 3L4QA 1NGGA 3DLRA 2P9NB 3NE6A 3HPHA 5SZTA 3M5RA 2NRRA 2BANA 3HXMA 1X3NA 3VEXA 2KZZA 1ATRA 1BGXT 3DLGA 3KZBA 3HTVA 3LDLA 2F8TA 5LJWA 2V52B 3WXMB 4ELUA 4DLGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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