3CERA

Crystal structure of the exopolyphosphatase-like protein q8g5j2. northeast structural genomics consortium target blr13
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
ESVTVAGIDCGTNSIRLKIARVDADGMHEVVPRILRVIRLGQDVDKTHRFADEALERAYVAAREFAGVIAEHPIDGLRFVATSATRDAENREEFEDEIERILGVRPEVIPGTEEADLSFLGATSVVNRDDLPAPYLVVDLGGGSTELVIGGDGVSAPTTQVQGAFSMNIGSVRMTERHLTNDPPTQTQIDEAVADVDEHIDEAFRTVDAGKARTIIGVSGTVTTMTALAMGLKEYDHTVVDGHRLSFEDAYAVDDKFLRMTRAERREYKTIHPGRIDVVGGGAVVWSRVLARVSEAAKADHGEAIDSFVASEHGLLDGIVLDYGRRLLAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Possible exopolyphosphatase-like protein
publication title Crystal structure of the exopolyphosphatase-like protein Q8G5J2. Northeast Structural Genomics Consortium target BlR13.
rcsb
source organism Bifidobacterium longum ncc2705
total genus 112
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02541 Ppx-GppA Ppx/GppA phosphatase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cerA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3cerA02
1LCUA 3VGMA 4BREA 3CJCA 3FFKB 3MN7A 3U8XA 4BR0A 5KPTA 3WEEB 4YDUC 4BRPA 3EN9A 5AQZA 1NGBA 3GOIA 3O6WA 3VF6A 2DPNA 4Z94A 1YUWA 2CH5A 2YCHA 2QXLA 3FE1A 1KAYA 4A62A 3FGUA 3KHYA 1MWKA 4H5RA 5F2RA 3EKSA 4O5FA 1E4GT 2YHWA 3TPQA 4B9QA 1Z05A 2YI1A 1YXQA 4FO0A 5AQWA 5F1XA 5LJWA 3FLCO 1J6ZA 1RGIA 4BRNA 5JLHA 4DB3A 3VGLA 1YAGA 4FPAA 3DXMB 5B8HA 4PKGA 2HMPA 3WQTA 1IG8A 5AZIB 5BPMA 2Q36A 4YDUA 1JCGA 4DHYA 1X9JA 3ZETA 5LY3A 4A61A 2EWSA 3H3NO 4CZJA 2E8AA 3SMSA 3VPZA 4JD2A 3H45C 4DCHA 4BR2A 3H6EA 3BEXA 1BO5O 2OANA 3M3ZA 2CGKA 2YJEA 4EAHD 1ATSA 2F9WA 3QBXA 2FF6A 2CH6A 3FZMA 3H3OB 5AQMA 4CZEA 5TKYA 4B1ZA 2QM1A 5AQSA 3BUZB 1U2VA 3VERA 2W41A 4JNEA 1KAZA 1GLLO 5AQVA 4BR5A 4C23A 5KQDA 2F9TA 3O1BA 1V4SA 1TYQB 3W3DA 3ZEUA 4H0XB 4BC2A 3ENHA 3VEZA 4K42A 3CJ9A 3AARA 1T6CA 3HSCA 5AQQA 3C0BA 1SZ2A 3MN6A 4Y0WA 4CD3A 3EKUA 3VGKA 2P9LB 1Z6RA 2V7YA 3A5MC 3MCPA 3QBWA 1NWKA 4H0VB 1BG3A 3A0IX 2IVNA 4K25A 4GY2B 1X3NA 2Q0RA 4PKIA 4BR7A 2GEMA 3IFRA 3ZX3A 4BG8A 4H0TB 1E4FT 1SAZA 4FWQA 4JD2B 2GTDA 3SLCA 4BRQA 3S41A 2QWNA 2Q1NA 4AM7A 4FWPA 1NGCA 4H03B 3U9DA 3WT0A 2Q97A 3L0QA 3LL3A 1NBWA 3LDPA 2IVOA 3VEYA 1C0GA 5CE3A 3O8MA 1MDUB 2ZGZA 3IDHA 4M63C 4EHTA 1U2VB 5BN8A 2HF4A 3D2FB 3H46O 1V4TA 3UE5A 3DAWA 5AZIA 3VEXA 2PAVA 3FR0A 3GBTA 4WQ4C 3WUHA 1YVNA 3HM8A 2NZTA 3ZEUB 1QQNA 2Q0UA 3LDQA 1QZ5A 4H5NA 2QWMA 4RWTA 3WQUA 5AZJA 4CD1A 5BPLA 4B1WB 3CI5A 3GG4A 4CZFA 1D4XA 5AQGA 2FXUA 1OKJA 1XC3A 4O8KA 4XH4A 3TU5A 1S22A 2YHXA 5AFUA 3LDOA 3CIPA 2GUPA 4B1VA 2E2QA 3HBTA 2E88A 4FOIA 1QHAA 4QS9A 1Q18A 4RCHA 1LOTB 3MMVA 4WYBA 5AQTA 4MLEA 5EXWA 1TYQA 2D1KA 1GLFO 4IO8A 4WQ4A 2P9PB 5FPEA 4E1JA 4JN4A 3ATVA 5ELZA 1QQMA 2AA4A 2E2NA 2E2OA 1DGKN 4XH5A 4EIAA 2P9LA 4EFHA 2I7NA 4H5WA 4BC5A 1BOTO 3KVGA 2E20A 2QWOA 3DJCA 4B1UB 2GELA 5EOYA 3DWLA 4BRFA 5AZJB 2P9IA 3VEWA 1T44A 3C7NA 2FSKA 1HLUA 2BTFA 1KXPA 3SK3A 4CZLA 3ATUA 5JICA 3A5NC 2FLOA 2P9SB 4CZMA 1GLAG 3CJBA 4BRAA 1DEJA 3O1WA 5ADXH 1TUYA 3R6MA 2P9KA 3DXKB 3O5BA 3D2FA 5FPDA 2WUSA 3QMLA 3MN9A 4AM6A 2NLXA 4FPBA 5AQXA 4FWOA 5AQLA 1BU6O 4A2BA 3FZLA 1NGIA 4FWRA 2QWQA 1GLDG 2Q2RA 3R9PA 1QZ6A 2GWKA 1NGEA 3GE1A 4GNIA 3VF2A 1RFQA 4BRCA 5BPNA 3UKRB 2J4RA 1NGJA 1GLJO 2HF3A 2A41A 4IJAA 3UB5A 4BRKA 4CZIA 2D4WA 3MN5A 4BRGA 4HWIA 3D2EB 4NB4A 3CJ1A 4FWKA 2W40A 1GLCG 1NLVA 3WXLA 5AQKA 2QW9A 5BRHA 1HKGA 4BRHA 1HJOA 4QS7A 4H0YB 3FZFA 3WXIA 1DKGD 3VENA 3O4WA 2P9IB 2P9NA 1HKBA 1ATRA 3EZWA 3C7NB 3BF3A 3QFUA 5EX5A 1K8KB 2P9PA 3VF4A 2ZWHA 3M1FA 3AAPA 3JXUA 2P9KB 3A5LC 2A6AA 4H0OA 4BQLA 3VEVA 4FWLA 2QWRA 5KQ8A 4NO7A 4JHDA 3UKUB 2YHYA 3LDLA 3AAQA 2VWBA 1NGDA 1KAXA 1NGGA 3MDQA 3HTVA 4IJNA 4BC3A 3JS6A 1NGHA 4ISGA 2YJFA 3AY9A 4BQZA 3QICA 4EHUA 1H1VA 4CZKA 5BREA 4BGBA 2VCPA 2P9UA 4FL9A 4FOEA 2A3ZA 4A2AA 4BROA 4CBWA 1ZBSA 3A8YA 5ADXA 1MA9B 2ZF5O 2E2PA 1Y64A 2P9SA 4WQ5C 1HUXA 3CQYA 1U6ZA 1ZC6A 1QQOA 3R8EA 4BVOA 1NGAA 3O80A 3DXKA 1ATNA 2A42A 2GWJA 2QWPA 4B1YB 4CJ7A 4LC9B 2KHOA 5FPMA 5AQOA 3A5OC 3LM9A 3G25A 2P9NB 3QDKA 4KBOA 1P8ZA 4B1XB 3FZHA 3CJ7A 3UKRA 2QWLA 4IZ9A 1JCEA 5AQUA 3EL2A 4FWSA 4CZHA 3HI0A 4CBUA 4JAXA 2VYPA 1G99A 5JMVA 5AQYA 3H1QA 3D2EA 4JHDB 5I9EB 1ESVA 5BRFA 3SMPA 4HTLA 4IWVA 5BN9A 4BG9A 1WUAA 4BR9A 2AP1A 3L6QA 4WQ5A 3VOVA 2HOEA 3LDNA 3W0LA 4M7YA 4XEIA 4ISEA 4I6MA 2V7ZA 4M7XA 2ASPA 4DQ8A 3ZX0A 4MO5A 4FWNA 2UYTA 1NGFA 1NM1A 2P9UB 3CERA 4CBXA 2FF3B 5AQJA 1K8KA 2I7PA 5AQNA 1BWFO 3ENOA 1C0FA 2V51B 3H1VX 5AQRA 1ZXOA 5LJVA 1HKCA 5FPNA 3GDQA 2NRHA 2IVPA 5EY4A 3EO3A 1CZAN 3OHRA 3UKUA 4PL8A 3F9MA 5BRDA 1XQSC 4RTFD 3BF1A 3IMXA 3VESA 3P4IA 4H0PA 4H5VA 4IXCA 2ZGYA 3J8AA 4CZGA 2Q31A 3CQXA 3CHWA 4BC4A 4J8FA 2ITMA 3U9ZA 5AQHA 2CGJA 4BR4A 3ULEA 4FWMA 1BDGA 1BA1A 1WOQA 2BUPA 1X3MA 1GLBG 4BRDA 4ISFA 2E1ZA 5AFUH 1GLEG 2H3GX 5AQFA 3RSEA 4H5TA 3I33A 5EVZA 5KPRA 2FSJA 5JLFA 3LM2A 3VETA 1BUPA 3WXKA 1MWMA 1T6DA 4PL7A 3M6GA 5AR0A 4I6MB 1S3XA 4CI6A 4L3QA 2A5XA 3FZKA 5KPZA 3ID8A 3CETA 3QFPA 3BP8A 4QS8A 3O08A 3WEEA 3L4IA 1HPMA 4MO4A 1NMDA 3CJAA 1IJJA 3KZBA 1HX1A 4BRIA 3ZETB 1BA0A 2PBDA 4BVPA 2D0PA 3B8AX 2V52B 2FSNA 1JCFA 5E84A 5BR9A 3VEOA 3U4LA 5AQIA 2D0OA 4FSVA 4BRLA 3SJHA 1SQKA 2E1YA 4MLHA 3DXMA 3ULEB 1RDWX 3MK6A 3IUCA 4BGAA 4F9OA 3GL1A 3QB0A 2ASOA 5F0XA 2CGLA 3ZX2A 1R59O 5AQPA 3RSEB 5E26A 1TUUA 4XH1A 4BRMA 1XUPO 3I8BA 4K41A 3D7EO 1EQYA 2ASMA 2IIRA 3WXJA 2A40A 4PKHA 3HZ6A 4K43A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H4MA 3VGMA 4BREA 3FFKB 4BR0A 1NNEA 2XY7A 4BRPA 3K59A 4MFBA 1RBUA 5AQZA 2KW4A 3VF6A 4FJ8A 1Y97A 4EZ6A 3OY9A 2VQFK 2YCHA 3TTFA 4M42A 3FGUA 3KHYA 4H5RA 3RTVA 1ILYA 4LF8K 1B9FA 5LJWA 5HLFA 1KVBA 3K5NA 1W97L 1YT3A 2JWLA 2PYJA 5SWMA 3AA5X 1SS6A 2YX6A 2LSNA 4DQSA 4PKGA 3T19A 2QA4N 5HBMA 2HMPA 3MEEA 5BPMA 2YKMA 4YDUA 1OVQA 4JRQA 4KRFA 3VQQA 3FFIA 2E8AA 1IG9A 4CFDA 3HP9A 4JD2A 3H45C 1N8RO 3BEXA 2CGKA 4EAHD 1ATSA 2OTLN 3QEIA 3SUQA 2G8KA 5KGXA 5AQMA 2D0AA 2OTJN 5TKYA 4OKKA 2WC9A 4DR7K 4N47A 3OYNA 5AQVA 4N56A 4F8RA 4F2RA 4GVMA 5JVGL 4DQPA 4FM2A 3K9KA 4BY9C 4C8NA 4CIFA 4XIUA 2OPPA 4CESA 3DLBA 4H0XB 1VQLN 3MXIA 2QXFA 2RE2A 4YOTA 3C6UA 3AARA 3CJ9A 1T6CA 3KWIA 1L5UA 4M3ZA 3C0BA 3AVHA 2HVHA 3MN6A 1TK8A 1LV5A 2VWKA 3QBWA 1U49A 1BG3A 1XI1A 4GY2B 4LF4K 4BR7A 2GEMA 4AH9A 4H0TB 1E4FT 4FWQA 4A5BA 4BRQA 4FWPA 1VSMA 4A5AA 3KIOA 5MLCQ 3U9DA 2O8FA 2Q97A 3QEPA 3L0QA 5GIPA 3VEYA 1C0GA 5CE3A 4WF9L 1KQSM 2HHTA 2ZGZA 1WNSA 1U2VB 1TAQA 2HF4A 3D2FB 1K8AO 3UE5A 4LSNA 2UXCK 3ZLJA 2PAVA 4BWJA 3VQ4A 3GBTA 4CJEA 2F8TA 4KTQA 3JSMA 3PO4A 1TAUA 3C95A 2QWMA 2O8CA 4RWTA 5AZJA 5BPLA 4B1WB 3CI5A 3TTDA 3LWLA 3NDKA 4IOCL 4RW4A 5AFUA 3RMCA 3CIPA 4W5TA 3LALA 3NF7A 1EETA 2HNYA 4DV3K 4DV7K 2FBTA 1Q18A 1Z25A 2KZMA 4KH6A 1TYQA 1S1VA 4IDHA 4DUZK 4WQ4A 4CK3A 1DGKN 4IFYA 3DLRA 1FXXA 4JKEA 4FJHA 2G8IA 4EIAA 3ZT0A 3O9QA 2I7NA 3QIOA 1WSJA 3DJCA 1D5AA 3DWLA 4CEOA 3ZSXA 4CF2A 3NF6A 2P9IA 5LMUK 1LW0A 1QE1A 1JLCA 1F21A 4I7FA 3C7NA 4O5BA 4CZMA 3CJBA 4KI6A 1DEJA 4DTNA 3I55N 3VQCA 5GAGP 4FJGA 3R6MA 2E4LA 3QMLA 4AM6A 3MN9A 4C8OA 4FPBA 4IFEA 3KD1E 4FWOA 1S9EA 3LPTA 2QWQA 4E89A 5GAHP 3R9PA 1QZ6A 4JI0K 2E6LA 4JK9A 4DSKA 1HYVA 3HVTA 3VQDA 4CGIA 1A5VA 2J4RA 4IJAA 3E9OA 4ZTJA 4OX9K 3CCQN 2D0BA 2XY6A 4F4KA 3MX5A 3D2EB 3NHGA 3CJ1A 3NVMA 2GX9A 3MX2A 1EWQA 1NLVA 3V4IA 5BRHA 1LAVA 3B6PA 4BRHA 3VA0A 3FZFA 1RTJA 2HSTA 3TANA 4WFNL 3EZWA 4BDYA 3QFUA 5EX5A 3CCLN 2P9PA 4W5NA 3VF4A 4JKGB 4FWLA 4OKJA 3UKUB 3ZT1A 4JI7K 5EU7A 5HRRA 4CEFA 3P31A 3RMBA 2YNGA 4B3RK 4ISGA 4IBNA 3T1YK 3VN5A 3V1QA 1VSHA 1IH7A 2P9UA 1Z26A 4FL9A 4FOEA 4ID5A 1ZBSA 3NVKA 3KKSA 1Y64A 3CQYA 3MEGA 1LWCA 3BY5A 3NMUA 1Q7YO 5HRNA 5GAEP 3KKRA 2G8HA 4N76A 1IKWA 3THXB 1P8ZA 4DV5K 4B1XB 3CJ7A 5M1FA 1NK8A 4DF8A 1U4BA 1NJYA 4IZ9A 3D0PA 1JCEA 4FWSA 2VYPA 1G99A 1W0HA 2IS3A 3OYMA 4JHDB 5SZTA 3SI6A 3SMPA 3QEXA 1WUAA 2VG7A 3SYZA 5LMNK 3VOVA 4CGFA 2FC0A 4ISEA 3M8RA 4M7XA 2RHKA 3PSIA 5AQJA 3NF8A 2W42A 4EZ9A 4DUYK 1W7AA 3ENOA 3E9LA 1QSSA 5AQRA 4KI4A 1ZXOA 5LJVA 1HKCA 4E7JA 3CFRA 5EY4A 4W5OA 1CZAN 3OHRA 1T03A 4PL8A 1GOAA 3F9MA 4X66K 3UIQA 1XQSC 4RTFD 3CCRN 3T7ZA 4H0PA 4OGCA 4AHSA 3AVJA 3OYCA 4HHTA 2Q31A 3CQXA 4BC4A 4Z4CA 4J8FA 3U9ZA 2B6AA 4DWIA 4DV0K 1TGOA 1X3MA 4O0JA 3ZSOA 3P5JA 3ASMA 4FJMA 5AQFA 1VRUA 4BE0A 5EVZA 1VQ7N 2FSJA 1NK5A 3VETA 3NH0A 1U47A 4OPHA 4I6MB 1S3XA 4JI6K 5KPZA 1N5YA 3DOKA 4YOVA 3JYTA 2VGMA 1YHQN 3LANA 3NAEA 1VQMN 3AA3A 3CJAA 1IJJA 4YFUA 2NRWA 3NFAA 1HX1A 3LWMA 1K73O 4E0DA 2Y1JA 3J7ZO 3HOTA 4YNQA 1WLJA 3V9XA 4JK7A 4DV4K 4HCCA 4AQYK 1IBKK 3VMFB 2D0PA 1P90A 2DTUA 1YJ9N 4AHVA 4CGJA 1YJWN 3VEOA 1JXEA 5C42A 2D0OA 4BRLA 1O1WA 1EWRA 1SQKA 4OPKA 4BGAA 3MK6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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