3DJCA

Crystal structure of pantothenate kinase from legionella pneumophila
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
LILCIDVGNSHIYGGVFDGDEIKLRFRHTSKVSTSDELGIFLKSVLRENNCSPETIRKIAICSVVPQVDYSLRSACVKYFSIDPFLLQAGVKTGLNIKYRNPVEVGADRIANAIAATHSFPNQNIIVIDFGTATTFCAISHKKAYLGGAILPGLRLSADALSKNTAKLPSVEIIKTESVVGRSTIESIQSGVYYGVLGACKELIQRIHHEAFNGDQILILATGGFASLFDKQGLYDHLVPDLVLQGIRLAAMMNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1
publication title Crystal Structure of Pantothenate Kinase from Legionella Pneumophila
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2008-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA01
1GLCG 2HOEA 3GL1A 1Q18A 3VEVA 3G25A 4BR5A 3GDQA 4WQ5A 4MO4A 4B1UB 3L0QA 5AQRA 5BPNA 1NGFA 5AQUA 1T44A 5E84A 3HSCA 4HWIA 5AQSA 4BVOA 4CZJA 2UYTA 3SK3A 3KZBA 4BC5A 4CD1A 4JN4A 1GLEG 4AM6A 3LDQA 3VPZA 4CJ7A 2ASMA 3MN9A 3UKUB 5BRFA 1SAZA 4XH1A 2E2QA 4MLEA 2QWPA 1X3MA 1WUAA 3AARA 5LJWA 1CZAN 1YVNA 3U9ZA 3MN5A 4CBUA 4BRFA 2V7YA 5EX5A 3FZKA 3KVGA 3ZX0A 1NGEA 3BF3A 1NGGA 4RTFD 4BC2A 2FLOA 3VGLA 4PL7A 4YDUA 4C23A 2A3ZA 3C7NA 1KAZA 4XH4A 4BRMA 5B8HA 2Q97A 3DXKB 3VEOA 3EN9A 3I8BA 3C0BA 1KXPA 3U4LA 4BC3A 1RDWX 4KBOA 4BR4A 1E4FT 3BEXA 1OKJA 3VF6A 4BR2A 3L6QA 1MDUB 4BQLA 4AM7A 1JCEA 3DXMA 4B1ZA 3CERA 5AQIA 3HTVA 3LDLA 1NM1A 3VEYA 2ASOA 2ZWHA 3O6WA 5AQWA 1G99A 1XQSC 2P9SB 4FSVA 3FE1A 3WUHA 3UKRA 3VEWA 1NGHA 5JICA 2D1KA 3D7EO 2YI1A 4JNEA 4CZKA 3CIPA 1LCUA 4J8FA 3CJ9A 1HKCA 2QW9A 4FOIA 1MWKA 5EOYA 2D0PA 2AA4A 3H3NO 4H0PA 4BC4A 3D2FB 5BRDA 3H45C 5KPZA 5AQJA 3CQXA 2P9LB 5AQXA 3WQUA 2FXUA 4PKHA 4EIAA 1NMDA 3FZHA 4BVPA 2YHWA 5EVZA 3ZEUB 1HPMA 3M1FA 4BRCA 2QXLA 5FPDA 2P9KB 3O1WA 3H1QA 3FLCO 3D2EA 4FWNA 5AQHA 4DB3A 1T6DA 4Y0WA 1U2VA 3ID8A 4PKIA 5CE3A 5BPMA 4CBWA 2E2PA 2ZGZA 4GY2B 3EKUA 3M3ZA 1NBWA 2YJEA 3ZETB 1MWMA 2FF3B 3O1BA 3DJCA 4I6MB 4CZMA 1K8KB 1ZC6A 1WOQA 3CQYA 1GLDG 3BF1A 3CJ1A 1HKBA 5BN8A 2EWSA 3UB5A 5FPEA 1V4SA 3EO3A 4H0TB 3VEXA 2I7NA 3H6EA 3VESA 4BRKA 5KPRA 2A5XA 2ASPA 1BO5O 4PKGA 5AQZA 2V7ZA 4BGBA 1GLJO 1P8ZA 3CJ7A 4RCHA 2DPNA 1ESVA 3SJHA 3FZMA 3VGMA 2P9NB 2PBDA 1NLVA 4QS9A 3VEZA 5AQTA 1Y64A 2J4RA 4F9OA 4FWPA 4FWMA 3ULEB 4JHDA 3WT0A 4EHTA 5AQMA 1X3NA 3O80A 3WXKA 4FOEA 4CI6A 4BRLA 2E2OA 4WQ4A 1E4GT 1RGIA 4EFHA 3R6MA 2D0OA 1YXQA 3AY9A 3LL3A 3VF4A 5FPNA 2I7PA 4CZIA 3UKUA 1GLFO 1QQOA 5BR9A 1HJOA 3QB0A 3EZWA 4BRNA 4DQ8A 3O5BA 5AFUH 3SLCA 5JMVA 4BRPA 5AFUA 4CD3A 5AQPA 2Q0UA 4CZHA 4BRHA 4L3QA 4IWVA 3S41A 1HKGA 2VCPA 3DWLA 5AQVA 1KAYA 2ZF5O 3ZX2A 4ISFA 2NLXA 4BREA 1GLLO 3A5LC 5KQ8A 3DXKA 5AQKA 1H1VA 1BWFO 3IUCA 3WXIA 1TUUA 3ATVA 5AQNA 3IFRA 4ISGA 2ZGYA 3ATUA 3DXMB 3QFUA 3QDKA 4M7XA 1TUYA 2P9PB 5AZIB 4FO0A 4H0XB 3MDQA 1ATRA 4FWSA 4XH5A 1ZXOA 5KQDA 1BU6O 4WQ5C 2E2NA 3OHRA 2P9SA 3CETA 1BG3A 3KHYA 3O08A 2P9IB 4IZ9A 2P9UA 2HF4A 4A2AA 3LM2A 1GLBG 4BRDA 1YUWA 1QZ6A 4IJAA 4BR7A 3WXLA 2A40A 1NGJA 3H46O 4WQ4C 3MK6A 3BUZB 4BG9A 3R9PA 5KPTA 4FWLA 3D2FA 3LDNA 4H5WA 2QWQA 2NZTA 2GEMA 2YCHA 2P9LA 4DHYA 1QQNA 1BOTO 3MN7A 5BPLA 3DAWA 4CZEA 5AQQA 5F0XA 2FSKA 1TYQB 3FFKB 3ZEUA 1DEJA 4H03B 2P9KA 1ATNA 3WEEA 1HX1A 5JLHA 2IIRA 1Z6RA 4YDUC 2CH5A 2Q31A 3LDPA 4EAHD 1YAGA 4K25A 2AP1A 5ADXA 1BDGA 2CGLA 1X9JA 3U9DA 3FZFA 3GE1A 3RSEB 1NGDA 1BA0A 3ZETA 2E8AA 5AQGA 1K8KA 1R59O 2CGKA 3J8AA 1MA9B 4O5FA 4B9QA 3EL2A 4B1YB 3M6GA 3SMPA 3SMSA 2GELA 3JXUA 4BRGA 4JD2B 3QICA 2ITMA 3AAPA 2H3GX 5AZJA 2NRHA 4MO5A 3L4IA 4BR9A 3ZX3A 5BRHA 2QWRA 2F9TA 1ATSA 1DGKN 4FPAA 3O4WA 1NGIA 3HI0A 3QBXA 2Q1NA 4RWTA 3MCPA 2P9NA 1NGCA 3U8XA 2QWMA 3W0LA 4BRIA 4FWKA 1LOTB 1IG8A 2E1YA 4HTLA 2HF3A 4BQZA 5AR0A 1Z05A 3I33A 4PL8A 3ULEA 2GUPA 2OANA 2BUPA 3GBTA 3H3OB 2E88A 4A2BA 4H5RA 2Q0RA 2D4WA 3QFPA 1S3XA 3TPQA 4QS7A 3HZ6A 3A5MC 1XUPO 4K42A 4A61A 3A5NC 1U6ZA 3LM9A 1NWKA 4IJNA 3VERA 3A5OC 1NGBA 3HM8A 3R8EA 3VETA 1EQYA 1T6CA 4BRAA 3FZLA 1C0FA 3C7NB 1J6ZA 1GLAG 4H5NA 5AQFA 5AQYA 4IXCA 4FWQA 5LY3A 4MLHA 5F1XA 3UE5A 3TU5A 4QS8A 2FSNA 3CHWA 5BN9A 5AQOA 1BUPA 3A0IX 2A42A 2W41A 2A6AA 2QWLA 2QWNA 3IMXA 4H5VA 4CZFA 3HBTA 4BG8A 2GWKA 2BTFA 2W40A 2HMPA 2YHXA 2P9PA 4CZLA 5AZIA 3UKRB 2QWOA 3MN6A 4FPBA 2FSJA 4B1XB 4O8KA 2YHYA 2GWJA 1XC3A 2P9IA 2IVPA 3H1VX 2P9UB 5EY4A 4EHUA 1JCGA 4M63C 3MMVA 4WYBA 1SZ2A 3IDHA 3EKSA 4BRQA 2IVNA 3JS6A 2CH6A 2E1ZA 3GOIA 5EXWA 3VOVA 3W3DA 1SQKA 3CJBA 5LJVA 1ZBSA 4FWRA 5E26A 4B1VA 5I9EB 1V4TA 4BR0A 3D2EB 3VENA 4H5TA 1HUXA 1JCFA 4IO8A 3WQTA 2VYPA 5ADXH 2YJFA 1U2VB 1C0GA 1TYQA 4ISEA 4LC9B 3BP8A 3VGKA 3B8AX 4B1WB 4BROA 3ENOA 2V52B 5BREA 3WEEB 2FF6A 3A8YA 1QQMA 3WXJA 4DCHA 2QM1A 1DKGD 4I6MA 4E1JA 3F9MA 3FGUA 1S22A 1QZ5A 4JAXA 1HLUA 4BGAA 3VF2A 2WUSA 3LDOA 3RSEA 1RFQA 1IJJA 4K43A 4H0VB 1QHAA 4FL9A 4CZGA 4XEIA 5F2RA 5AQLA 2E20A 5FPMA 4A62A 2PAVA 2Q2RA 5ELZA 3FR0A 4JD2A 4H0YB 4M7YA 2VWBA 3AAQA 3QMLA 3O8MA 5AZJB 1KAXA 4Z94A 2CGJA 3CI5A 3CJCA 4NO7A 4NB4A 1D4XA 1NGAA 2IVOA 4H0OA 3GG4A 2GTDA 1BA1A 2KHOA 3CJAA 3ENHA 4K41A 4CBXA 2A41A 3QBWA 5JLFA 2F9WA 4GNIA 3P4IA 4FWOA 2V51B 4JHDB 2Q36A 5TKYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KTQA 2HOEA 4DTOA 1VSFA 3VEVA 3G25A 4CJWA 2ITGA 1NOYA 4BR5A 3GDQA 4WQ5A 4MO4A 3L0QA 1L5UA 4J2BA 2VG7A 3O9SA 4G1QA 1KLMA 2QXFA 4JKFA 1IKWA 3HSCA 3OS2A 1Y97A 2D5RA 4BVOA 4AHUA 3DI6A 3KZBA 4GKKK 4BC5A 1Q82O 2Y1IA 3T3FA 1K73O 3LDQA 3VQBA 4DF8A 3SQ2A 5BRFA 2QTDA 3RRGA 1HPZA 4KHYA 1SL0A 2QWPA 1WUAA 4DQQA 1TV6A 3SUNA 1YVNA 4RW4A 1G15A 5EX5A 1DT9A 3UIQA 3MWTA 5HP1A 1N8RO 4BRMA 5B8HA 5I42A 2Q97A 3EN9A 2O8EA 1KXPA 2XY5A 1RDWX 3NHGA 1TKXA 3CD6N 1D9DA 1E4FT 4FLXA 1VRTA 1S1VA 1A5VA 3QO9A 1MDUB 4BQLA 4AM7A 3AA5X 1JCEA 1QQCA 2ATQA 2P5OA 3VEYA 3K9KA 1NOZA 2ASOA 4KHWA 4KB1A 5AQWA 3KKSA 4KHQA 4YFUA 4FJ5A 3VEWA 5GAHP 5C2FA 2D1KA 2PYLA 2F8SA 3CPWM 2KW4A 3CJ9A 1UAXA 2IGIA 2QW9A 1KFDA 3NF6A 5EOYA 4CK3A 1IV0A 4BC4A 3D2FB 5AQJA 1TKTA 3LP1A 4EIAA 4CFCA 3T7ZA 3M1FA 3O9RA 2QXLA 5FPDA 2P9KB 2X6NA 4JKDA 5KGXA 4DQRA 1LW0A 4FWNA 3HL8A 1KRPA 1U2VA 4PKIA 1BQNA 5CE3A 5BPMA 2O8DA 2E2PA 3ISNC 1XI1A 3CF5L 4PUOA 2D0AA 2HBLA 3THVA 3O1BA 4LFAK 1K8KB 5I3UA 1GLDG 5HROA 1OH8A 5BN8A 4FM0A 4IBNA 1VHXA 3C94A 4UY8O 1V4SA 2HHUA 4H0TB 1U49A 4FXDA 2NRRA 3OYAA 3KK7A 1IBMK 4FCYA 3T1YK 2V7ZA 2GUIA 4HVJA 2DPNA 5CYQA 5C12A 4DQPA 3CM6A 3SUOA 3OYLA 1TK0A 4TSXA 3VEZA 1O1WA 1Y64A 3OBYA 3RR8A 4I2PA 3L2RA 4FWPA 4DTUA 4JHDA 4FW1A 4DTXA 5AQMA 3VQ6A 4DU4A 3O4QA 3O80A 1WN7A 3TTFA 4X62K 1E4GT 1RGIA 4EFHA 2VG6A 3R6MA 4E7IA 4FJHA 2W6KA 3EYZA 1IBKK 3R3LA 4CZIA 1GLFO 1IH7A 1QQOA 1HJOA 3VQ5A 3M5RA 3E01A 3O5BA 4W5QA 4DUYK 4CD3A 5AQPA 4NYNA 4WE1A 3ZT0A 4JKHA 4BRHA 1BIZA 3V9XA 2JLEA 4YOWA 4IWVA 2Z1GA 4H4OA 1KAYA 4GMJB 2DTUA 4CECA 2NLXA 3KLEA 1Z26A 3AVJA 5KQ8A 4FM2A 4M3YA 4M45A 4B3OA 4AH9A 1H1VA 2Z1JA 1ITGA 3WXIA 3IFRA 4ISGA 2BANA 1KLNA 5C0YA 3SCXA 3DOKA 1JLAA 3QFUA 1TUYA 2P9PB 3HP6A 1ZBUA 4FLWA 4DR6K 4LF9K 4YOXA 2O4GA 2GX9A 4FWSA 1BU6O 4WQ5C 5CYMA 2YHBA 4DTSA 4JI6K 2A1SA 3CETA 3KHYA 2P9IB 2P9UA 3EE9A 2E4LA 4BRDA 3VQQA 1SS6A 1SL1A 3VTIA 4FJ7A 3WXLA 1YVUA 3AA2A 3H46O 4WQ4C 3MK6A 3BUZB 4E7HA 1K9MO 4IDKA 3L8BA 1W7AA 4J2AA 4BDYA 1QQNA 4LH5A 3MN7A 5BPLA 4CZEA 5AQQA 5F0XA 2PY5A 1TYQB 3ZEUA 1B9DA 3TTDA 1JJ2M 4AHSA 1YI2N 3M8SA 4NCBA 4DG1A 4EAHD 4C8KA 1YAGA 1HNVA 3L2UA 1S1UA 3J7AP 4C8MA 4F8RA 1YTAA 1BA0A 2E8AA 3L4QA 3NF9A 5AQGA 2X74A 3V6DA 4AHVA 4GKJK 3WNFA 4B1YB 3M6GA 3SMSA 3M8RA 1T3VA 3JXUA 4BRGA 4DV1K 1KVAA 3AAPA 4LF8K 4ID5A 3L3VA 2NRHA 3PV8A 4JLHA 3PSIA 4OKEA 3SBGA 3ZX3A 2QWRA 3K0SA 1VQ6N 4KV8A 4GVEA 2RHKA 1GOBA 4FJNA 3E9OA 5EU7A 3RVCA 4RWTA 1NKEA 3U8XA 1RDDA 3ULDA 4CEEA 1LOTB 4LSLA 3LP2A 1KVBA 4BQZA 3CQ8A 4M3XA 3RMCA 4DLEA 4B9TA 2GUPA 3QIOA 2OANA 2BUPA 5K14A 2GV9A 3GBTA 1N5YA 4H5RA 2Q0RA 1ZBLA 1Q9XA 2D4WA 2BH1A 3TPQA 1JL2A 1WLJA 1XUPO 3AVKA 4A61A 3A5NC 1QHTA 1U6ZA 5IT9O 4FK2A 1RBUA 4JI7K 3D45A 1U45A 2ZJQL 4DV7K 4KPYA 3M8PA 3V4IA 3MX5A 2HHSA 4JK8A 3S9HA 5AQYA 1GLAG 3M8QA 3SUPA 1X9SA 1VQMN 4CHOA 4LF7K 2HMIA 4MLHA 3AVNA 4E3SA 3CCQN 5J1EA 2FSNA 3L2VA 3CC4N 4DFMA 1C1BA 2IDOA 3AGKA 4MDBA 4CZFA 1VQLN 2W40A 2BTFA 2HMPA 2RN2A 4JS4A 2QWOA 3V81A 1NJWA 4CJPA 3QEVA 2GWJA 4C1NI 4Y1DA 3ZCMA 4DU3A 1VQ4N 4DTPA 3NMUA 1C0UA 2HBKA 3MMVA 2VWKA 4CJKA 4GV9A 2IVNA 3P39A 2CH6A 2E1ZA 3GOIA 3TAFA 5LJVA 3G6EN 4CGIA 1YJWN 2W42A 4IO8A 2UUCK 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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