3DJCA

Crystal structure of pantothenate kinase from legionella pneumophila
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
LILCIDVGNSHIYGGVFDGDEIKLRFRHTSKVSTSDELGIFLKSVLRENNCSPETIRKIAICSVVPQVDYSLRSACVKYFSIDPFLLQAGVKTGLNIKYRNPVEVGADRIANAIAATHSFPNQNIIVIDFGTATTFCAISHKKAYLGGAILPGLRLSADALSKNTAKLPSVEIIKTESVVGRSTIESIQSGVYYGVLGACKELIQRIHHEAFNGDQILILATGGFASLFDKQGLYDHLVPDLVLQGIRLAAMMNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Crystal Structure of Pantothenate Kinase from Legionella Pneumophila
rcsb
source organism Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2008-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA01
1NMDA 3WQUA 3HM8A 5I9EB 2YJEA 2V7ZA 3EKSA 5LJVA 1DEJA 3M3ZA 3UE5A 4F9OA 3CJ9A 1BA0A 1V4SA 2FSNA 4YDUA 3WXKA 2CH5A 1OKJA 3VEXA 2QWQA 3LM9A 4BRHA 4BVOA 2FXUA 1NWKA 2GEMA 4WQ4A 4BG9A 1QQMA 1BA1A 4B1ZA 3ZEUA 4A61A 3WEEA 4PL7A 1GLJO 3VPZA 3ENHA 4H5VA 4M63C 1WOQA 5FPDA 2V51B 3DXMB 5JICA 2E2QA 4BRAA 1YVNA 4CZKA 3GDQA 3W3DA 1NLVA 4DHYA 4XH4A 4CBUA 2P9LA 1SQKA 4MO5A 4BC4A 2IVOA 3VGKA 1NGGA 3R8EA 4CZMA 2ZGZA 4CD1A 1GLEG 5AQQA 3C7NA 4FWKA 3WUHA 3AAQA 3VF2A 3UKRB 3SMPA 5AZIB 3KVGA 5AQRA 2ZWHA 4IWVA 3H45C 5AQJA 5JLFA 3FFKB 4K25A 3WT0A 2QW9A 1ATNA 4ISEA 1RGIA 3VEZA 2CGLA 4XH1A 2A3ZA 1ZBSA 1J6ZA 1BO5O 3A5NC 4GNIA 1GLCG 3R6MA 3DAWA 5ADXA 4JD2B 3SK3A 3BEXA 3H6EA 1NGBA 4BR5A 3VENA 4WQ4C 2YJFA 2HF4A 1JCEA 5F2RA 1P8ZA 3ZETA 4HWIA 4QS7A 1KXPA 2PAVA 3EL2A 3FGUA 1NGIA 3CJBA 3A5MC 1IJJA 4BR4A 4BQZA 3SMSA 2E8AA 3CJAA 2KHOA 5AQSA 3TPQA 2AA4A 3FR0A 3O4WA 4A62A 2E2NA 3CJ1A 4M7XA 4WQ5A 2Q0UA 5EX5A 2QWRA 3MN7A 4BR9A 2GTDA 3CHWA 1ZC6A 3LDNA 3UKUB 5KPRA 1NBWA 4CZLA 4RCHA 3VOVA 3VF4A 3DXKA 3JS6A 4FSVA 3ZX2A 5F0XA 1KAXA 3CQXA 3HBTA 2P9IA 3M6GA 3U9ZA 2P9PA 2F9TA 4DQ8A 4IXCA 2QM1A 1TYQB 4CZFA 3LDQA 1E4GT 3L4IA 4H5WA 3MDQA 3VEWA 3BP8A 4MO4A 1NGFA 5AQWA 4BC5A 3MN6A 1EQYA 1Q18A 2A40A 2ASOA 3L0QA 3OHRA 4IZ9A 4JN4A 5BRHA 4IJNA 2AP1A 4BVPA 3AARA 5ELZA 2ITMA 4BRNA 1NGEA 3A5LC 3A5OC 4WYBA 1HX1A 2E2PA 1Z05A 1BU6O 3ULEA 1BDGA 1NGAA 2BUPA 1HPMA 4ISGA 3O1WA 1BOTO 3D2EB 3DJCA 4CD3A 3VGMA 2Q0RA 1HLUA 1BG3A 1U2VB 2Q31A 1ZXOA 3CI5A 4B1VA 4I6MA 2P9SB 4BR0A 2QWNA 5F1XA 1MDUB 1D4XA 2W40A 2ZF5O 4WQ5C 4BREA 5LY3A 3AY9A 2W41A 1K8KA 1MWKA 4NB4A 4K42A 4MLEA 2VCPA 3MK6A 1QQOA 2V7YA 1X3MA 2VYPA 1TUYA 5BPNA 3O80A 1SAZA 4CZEA 5AQHA 5AQKA 5AQVA 3GOIA 1NGCA 4A2BA 3WXIA 5BPMA 1HKCA 1U6ZA 5AQFA 4BRLA 3A8YA 4BGAA 5EOYA 4FL9A 5FPNA 1NGJA 1MWMA 2BTFA 4M7YA 4PKHA 1IG8A 2VWBA 3QFPA 3F9MA 4EFHA 3C0BA 2D0PA 2QWMA 5AZJA 3VEYA 1Z6RA 3B8AX 1NGDA 4O5FA 3CJCA 3ZEUB 3SJHA 3WEEB 5EXWA 1TUUA 2ASMA 4DB3A 2QWPA 1X3NA 3CIPA 3O5BA 3FZKA 3IDHA 4FOIA 5E26A 3HZ6A 4O8KA 4YDUC 4FPBA 3IUCA 5AQXA 1X9JA 4L3QA 4K41A 4K43A 3AAPA 4EAHD 2E20A 3ATUA 1NGHA 5AFUH 1K8KB 3A0IX 2P9LB 2P9KA 4H03B 3GL1A 3LDPA 3ENOA 5AQLA 4BGBA 1MA9B 1YXQA 3FZLA 4FOEA 3VF6A 2YI1A 4PKGA 2GUPA 5AR0A 1QHAA 3BF3A 3VEVA 3C7NB 3GE1A 3HI0A 4BRIA 4BR2A 4FWLA 1G99A 1QQNA 5JLHA 4EHTA 4CBXA 2GWJA 1HKBA 4ISFA 4H0OA 4CBWA 1RFQA 3I33A 3RSEA 4MLHA 4B1XB 3O8MA 2ASPA 2CGKA 3DWLA 1RDWX 2ZGYA 3QFUA 1HJOA 4B9QA 4BRQA 4PL8A 2IVNA 4BRGA 4CI6A 2HF3A 3BUZB 3EN9A 5AQYA 3I8BA 3ATVA 2Q2RA 4C23A 4BRMA 3TU5A 1QZ6A 1CZAN 3HSCA 2GWKA 3ZX3A 4DCHA 4GY2B 1GLLO 5KPZA 1DKGD 3GG4A 3CERA 1QZ5A 4BRKA 2J4RA 3WXJA 5AQOA 2Q1NA 1C0FA 3H3NO 4BQLA 2D0OA 1NM1A 4H0YB 3ZETB 4AM7A 5AQUA 1KAZA 4XH5A 2IVPA 4H5RA 4AM6A 4B1WB 1GLBG 4FWRA 5AQIA 1T6DA 4RWTA 2HMPA 4BG8A 2H3GX 2A5XA 5KQ8A 3EKUA 3LDLA 2CGJA 3BF1A 3CJ7A 3LM2A 2WUSA 4FO0A 2EWSA 3M1FA 1DGKN 2E88A 4H0TB 5BRDA 3QBWA 3CETA 1BWFO 1HKGA 3O08A 2E2OA 4QS8A 1ESVA 3DXKB 3FE1A 2P9UA 3SLCA 2I7NA 4JAXA 3ID8A 3FLCO 3VEOA 5BN9A 2P9IB 3P4IA 4BRDA 2P9PB 3ZX0A 4PKIA 3KHYA 4FPAA 2HOEA 2YHYA 3H1VX 5TKYA 3GBTA 3UKRA 5AZIA 1SZ2A 5CE3A 1ATRA 1YAGA 2FLOA 3JXUA 4IJAA 1GLDG 4JNEA 3U4LA 3W0LA 4H5TA 3J8AA 2F9WA 5AQNA 3WQTA 1H1VA 3VGLA 2P9NA 3WXLA 4FWMA 3MMVA 4B1YB 3IFRA 5KPTA 2I7PA 4BC3A 3FZHA 2DPNA 3D7EO 1Y64A 2FF3B 4CZJA 4XEIA 1WUAA 3ULEB 4JD2A 2UYTA 4QS9A 4FWPA 4J8FA 1V4TA 3MN9A 2A42A 3O6WA 2D4WA 3MCPA 2A6AA 4RTFD 3FZFA 4BRPA 4CJ7A 5BN8A 2P9UB 5E84A 1LCUA 1C0GA 3KZBA 1S22A 1KAYA 4FWOA 4BR7A 4NO7A 4I6MB 4JHDA 2IIRA 4CZHA 5B8HA 5LJWA 3L6QA 5EVZA 5AFUA 1BUPA 2Q97A 4EIAA 5FPMA 5AQZA 2V52B 3O1BA 3EZWA 3EO3A 4EHUA 4FWNA 5KQDA 3FZMA 5FPEA 2QWOA 3D2FA 2P9NB 5BREA 3UKUA 2E1YA 4HTLA 4H0XB 2CH6A 3QMLA 1YUWA 1XQSC 2A41A 1XC3A 2GELA 5ADXH 3IMXA 5AZJB 2NRHA 1R59O 3H1QA 2QXLA 1TYQA 2Q36A 1T6CA 1HUXA 1GLFO 1XUPO 4KBOA 2FSKA 3R9PA 2FSJA 2YHXA 3HTVA 3H46O 5AQGA 4IO8A 4CZGA 1T44A 4JHDB 5AQMA 4H0PA 3VETA 4BROA 3S41A 3CQYA 4H5NA 1LOTB 1JCFA 4FWQA 1JCGA 3U8XA 2P9KB 3G25A 3QB0A 3VESA 4LC9B 4Y0WA 5JMVA 4H0VB 2NLXA 3U9DA 2YHWA 4BRFA 5EY4A 4A2AA 4E1JA 3QBXA 3D2FB 1E4FT 2OANA 5BPLA 2PBDA 3QICA 3D2EA 1U2VA 4FWSA 1ATSA 4BRCA 2FF6A 4B1UB 5AQPA 3VERA 5BR9A 3LL3A 2P9SA 3H3OB 3MN5A 3RSEB 4BC2A 3DXMA 3QDKA 5AQTA 1GLAG 1S3XA 2NZTA 2YCHA 3LDOA 2QWLA 4CZIA 2D1KA 4Z94A 5BRFA 3UB5A 2E1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1J54A 1NJIO 3CCQN 5I9EB 4IEIA 2YJEA 5LJVA 1DEJA 3CYMA 4M3RA 4F9OA 4B3SK 2UUCK 1WN7A 4OGEA 1RT6A 3HPHA 2G8UA 3WXKA 1OKJA 4KB0A 4KREA 3P1GA 1YJWN 4V19S 3M8QA 4AHRA 2FXUA 2GEMA 2WC9A 4WQ4A 4BG9A 4OGCA 1BA1A 3AVMA 1JL2A 3WEEA 1XC9A 3TTCA 3VPZA 4H5VA 4M63C 2O8DA 4ZHRA 1JJ2M 1RCHA 3K5OA 4DLGA 3NE6A 4CEFA 5JICA 3DXMB 2E2QA 4BRAA 4L8RB 1YVNA 4CZKA 3HPGA 1NLVA 4X66K 1QE1A 3VTIA 4MO5A 3AA4A 2B4JA 2IVOA 2KLAA 1NJZA 2DFHA 3R8EA 2ZGZA 4CD1A 4FK2A 2W6KA 4MFBA 5AQQA 4DQQA 3C7NA 1M1KO 1HJRA 3AVGA 3ZT3A 4NCBA 3SUNA 3WUHA 4DV1K 4JKHA 3VF2A 5AZIB 3TI0A 3ZSRA 4IWVA 1O13A 1Q9XA 5AQJA 3LP3A 3FFKB 2YNGA 4ILGB 1QSLA 3SPZA 3HJFA 3OS0A 1ITGA 3G71N 3OYDA 2CGLA 2XHBA 1VQPN 2UUBK 4LSNA 2IOCA 4GNIA 1S9EA 3R6MA 5KRSA 5M1NA 1KFDA 3VMFB 4Z4CA 3BY5A 1NJYA 4KI4A 4OO1J 3KWGA 3VENA 1WNSA 3OJSA 4DSEA 3CC2N 1IV0A 5JVHL 3SZ2A 1WSIA 4LF4K 4JKGA 3MXMA 1J53A 3CJBA 1HNZK 3A5MC 1IJJA 1XNRK 1EXQA 4W5RA 3CJAA 3TPQA 4KFBA 3O4WA 3FR0A 4IO9L 2Y1IA 1TKZA 4A59A 4HCCA 1QS4A 2B6AA 2F96A 5DM6L 5EX5A 4K8XA 4CK2A 4WCEL 4U67L 4BR9A 2GTDA 4E19A 3LDNA 1VQ7N 4ZTFA 1L3TA 2OZMA 3ZSVA 1ZYQA 5F0XA 3U9ZA 2P9PA 4CERA 2BH1A 3VEWA 3CQ8A 4UY8O 5AQWA 4BC5A 3I56N 1RDDA 1Q18A 3LP0A 3OHRA 4CHOA 5KI6A 1JLQA 1K8AO 5BRHA 1Q81O 1WSFA 5M1OA 4FJ9A 4BVPA 1YJNN 1EWRA 2XY8A 3OW2M 1QSYA 4WFNL 4BRNA 3THVA 3A5LC 4JI2K 4WYBA 1BU6O 5M1QA 2RF2A 2BUPA 1HPMA 3CD6N 3O1WA 4DF8A 1C1CA 3AVAA 3VGMA 2Q0RA 4CFCA 1FKOA 4CK3A 1ZXOA 2VGMA 1RDAA 5K14A 1BI4B 5F1XA 1IKYA 2W40A 4B8CA 2G8WA 1QTMA 1N34K 3AY9A 2W41A 3O3HA 1RBVA 1RT4A 1X3MA 2VYPA 1SKWA 5AQHA 5HRRA 3KLHA 1NGCA 4CJWA 3CPEA 1JLFA 1HYSA 4I2PA 1U6ZA 3RVCA 5AQFA 4IBNA 5EOYA 4CHNA 5FPNA 1D5AA 4DUYK 2D0PA 1BHLA 3V9ZA 3NDKA 1NGDA 4CJQA 3DLEA 4OX9K 4JK8A 1SL1A 2NUBA 1R0AA 5M1FA 3VQPA 1N5YA 2QWPA 3O5BA 3AO3A 5E26A 4O8KA 4JI4K 4WF9L 4CEBA 3IUCA 3O4QA 4KHSA 1X9JA 4WFAL 4K41A 5HRSA 3SUOA 2E20A 4DFPA 1U4BA 2F4VK 3NH1A 5FRNA 3HSTB 3AO4A 4CK1A 4Z4HA 3TABA 3SQ0A 4IOXA 1NJWA 1VSKA 3WNEA 4CJTA 4FOEA 1RBUA 2YI1A 4M3TA 3OYMA 3BDPA 3HI0A 1S1XA 5A2QO 2QA4N 3S3OA 3AVJA 3P39A 4DQRA 2D0BA 2GWJA 1Q86O 4LFBK 2KZZA 1VQ8N 4M3ZA 1RBTA 4DV6K 2ASPA 2OPPA 3QFUA 1FJGK 1HJOA 1NMNA 3LALA 1HQUA 4DQSA 1KVAA 3BUZB 2NRWA 3ATVA 2OCEA 5CYQA 1EWQA 1QZ6A 4R79A 2WBNA 2IGIA 5KPZA 1QZ5A 4NLBA 1QQCA 3WXJA 3RMAA 5AQOA 1C0FA 4DKWA 3ZETB 3H08A 3RRGA 4FXDA 1KAZA 4IFEA 4H5RA 3CCEN 5M1PA 2G8FA 2DTUA 1T6DA 4FM1A 4RWTA 2UXDK 2HMPA 4CFAA 4FLUA 2H3GX 2A5XA 5KQ8A 3WXMB 2CGJA 2OPSA 1YJ9N 3RR8A 5SWMA 3HO1A 2VQFK 1KQSM 1VHXA 1DGKN 1W0HA 1EP4A 3QBWA 4C1NK 2UUAK 1BWFO 1RDCA 3U6FA 3DM2A 3THXB 4OVLA 4QS8A 3SLCA 4JAXA 3VQBA 3ID8A 1W2BM 5HRPA 1YIJN 3D45A 3IS9A 3JXUA 3THYA 4BACA 3W0LA 3EEQA 1RT3A 1S1UA 4B08A 4GKJK 3O4NA 3E9LA 1WBDA 4H5TA 3LP1A 1LW0A 3K9JA 3G6EN 3R1XA 4KHNA 2XRIA 3KLEA 4FJHA 3DLKA 3IFRA 1VSJA 1C0TA 1X9SA 1U49A 1VQMN 4R5PA 4HUFA 4DR7K 3D7EO 1Y64A 2FF3B 4CZJA 1WUAA 4JD2A 2PYLA 1NKEA 3HRGA 4FWPA 4DWIA 4DTPA 2HHVA 3MN9A 2D4WA 4OJRA 1TKTA 2A6AA 1QSSA 1D8YA 5T7BA 4CJ7A 2P9UB 5E84A 1LCUA 1C0GA 4FWOA 3ITHA 4BR7A 2BDPA 2Z1GA 2HB5A 4JHDA 5DMRA 5B8HA 5LJWA 5EVZA 4CJKA 2F7TA 5LMUK 3TAMA 4FM2A 3VQEA 1FW6A 1RTIA 1T7PA 5AQZA 3EZWA 3LWLA 3DLRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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