4LY7A

Ancestral rnase h
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYKQHEKTFSAGFHLTTNNRMELMAAIVALESLKQPCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAAIQRHTINWKWVKGHAGHPENERCDELARTAAESPTLEDVGYQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Thermodynamic system drift in protein evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease H
molecule tags Hydrolase
source organism Unidentified
total genus 50
structure length 153
sequence length 153
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4ly7A00
1JL1A 3L2VA 1YTAA 1S5JA 4DS5A 3QIPA 1WSIA 2D0CA 3PUFA 1DTTA 3P83D 4DS4A 2O4GA 2X74A 3CFRA 2ZQBA 4CK3A 3AA5X 3S3OA 3ALYA 3B6PA 3AO1A 3C6UA 3HSTB 4XIUA 3KK3A 1SKSA 4AHCA 1RTJA 1VSFA 2G8IA 4GVMA 3SJJA 3SQ0A 4OGCA 5D3GA 1WSGA 3NGZA 4I7FA 2RF2A 2A1SA 4DMNA 3IAYA 4CFBA 4CHYA 4NCAA 1KFDA 3ZT3A 2DFHA 1JLFA 1RBRA 2LSNA 4KO0A 3SNNA 1TKTA 2DFFA 2IOCA 2Z1GA 3AA3A 1XWLA 1S9EA 4PUOA 3ZSYA 5FRMA 4PY5A 2ETJA 4YFUA 4FJNA 4Z4FA 2HHXA 2IDOA 1RDAA 3MECA 1HQUA 1S1WA 2F96A 3ZT4A 4CGIA 4B9VA 4CCHA 1QQCA 1NKCA 1QSLA 4EP4A 4KAZA 4QCLA 4CJTA 1VSIA 4CK1A 4B08A 3OYHA 1BIUA 3WNHA 3OYEA 2GV9A 3KK2A 1ASUA 4CEOA 1KCFA 1NK5A 4IFVA 3F9KA 2Z1HA 2FBVA 3OYBA 5FROA 1SUQA 3VQQA 1KLNA 3M8QA 1GOBA 4OKKA 3OYFA 2X6NA 3VQ9A 4AILC 2QK9A 3TANA 3HL8A 3MEGA 4B9MA 1QSSA 1BQNA 1C1AA 2FBTA 3DM2A 4DQIA 4W5OA 4BE0A 1CXUA 1X1PA 2D0BA 1CZBA 3IG1A 4PWDA 1QHTA 4OPKA 3NF6A 1IG9A 4QOZB 5HRSA 1XHZA 1A5XA 2KW4A 3LP1A 1TKZA 3O3HA 5JS1A 3D0PA 4DG1A 3WNEA 3VQ8A 2IGIA 1RBVA 4H4OA 2YKMA 4CEAA 4CJFA 3KLHA 3SUNA 4I2PA 4KHNA 4B3OA 4CF8A 4W5QA 2YNGA 1VSLA 4HTUA 4RW8A 2ZD1A 4CEQA 5SZTA 3KLGA 3K57A 1RNHA 1TGOA 2ZE2A 4I2QA 2A1RA 2OA8A 3LAKA 1K6YA 1B9FA 4CIGA 2KQ2A 1TAUA 4FW1A 4YNQA 4DFJA 3RMAA 1RTIA 4B8AB 4R5PA 1NKEA 3HPHA 1ZBLA 1LWEA 3D45A 1HNVA 3HO1A 5KRSA 2KFNA 3T3FA 1NK4A 3DYAA 3ISNC 1JL2A 2XY5A 1VSMA 3I8DA 3QERA 4B9TA 1KRPA 4FJLA 3KKSA 3F73A 3V9XA 2OZMA 1S1VA 3K5NA 3P5JA 4M3RA 3CM5A 4FJKA 4DF8A 1GOCA 1S6QA 5SWMA 4KHQA 1Z25A 2R7YA 1S1XA 3QEXA 3SUPA 4C8LA 1A5VA 2NUBA 1T05A 4M42A 2B5JA 3HVTA 1EKEA 1U4BA 1ZBHA 1IKWA 4DTNA 1EP4A 3CQ8A 3DLRA 3NE6A 1ITGA 3NFAA 4ZTJA 2HHQA 3S3NA 3MXMA 1HRHA 3HP9A 5HRNA 5CY4A 3AVFA 2G8KA 3DLEA 3LP3A 2YHAA 4FLTA 4IFYA 4BE2A 2JGUA 1VRTA 4KHSA 3NF9A 3KTQA 1U49A 1A5WA 1B9DA 4CGDA 4DSLA 3SPYA 4AH9A 4B8CA 4CJ5A 3ZSRA 3DLKA 4CE9A 2W42A 1YVUA 1RT4A 1WSFA 3QNNA 4FLUA 2QKBA 3S3MA 3LZIA 3NH1A 4CJ4A 4E1MA 1TK5A 4Z4CA 3SZ2A 3VA3A 3SPZA 1RILA 3L2WA 3HPOA 3ASMA 3AVBA 1U47A 2E6MA 3K5MA 2FBXA 4E3SA 1HYSA 2B4JA 3G10A 4TSXA 3IRXA 4CJUA 3K2PA 5EU7A 1EETA 3OYAA 2OZSA 3ZSZA 1RT3A 4OGEA 4OLAA 2O4IA 1CZ9A 2QKKA 1NK7A 3DI6A 2DTUA 3V6DA 3DOLA 4IDKA 1X9WA 1JKHA 4LH4A 4NCBA 2XY8A 1FKPA 5J2PA 4AHTA 4FJ7A 4PQUA 3PX0A 5KI6A 4AHRA 4Q0BA 4E7HA 2KZZA 2P5GA 1WAJA 4PA1A 4BWMA 3V9ZA 3V1QA 1UA0A 5CZ2A 2HNYA 4FLZA 4RW6A 1KLMA 3L2UA 4DTPA 3T19A 2F8SA 3AVKA 3AV9A 4CEDA 2IC3A 3V81A 3RMBA 5I42A 4DSKA 3U3GA 1WSJA 3WNFA 1XI1A 4CHNA 4C8MA 3TARA 1RBTA 4OVLA 3KD5E 4KTWA 3VQDA 1UA1A 2YNIA 3MXIA 1BI4B 1VRUA 3TAPA 4KPYA 5HRPA 3EZ5A 1NJWA 4FJJA 4DTJA 4DF4A 4DSIA 4F2RA 3NGYA 2AJQA 1C6VA 1NJZA 4IBNA 1LV5A 4O5BA 3SUOA 1IKXA 3AO4A 4FVMA 4N76A 4DQQA 1FXXA 1S1UA 5JS2A 4DFKA 1C0TA 2HVHA 1KSPA 1HYVA 4NYNA 1DTQA 4RW4A 4FM2A 3VQPA 3HJFA 1W0HA 3ZT2A 4O55A 1LWFA 1VK0A 2I5JA 1NOZA 4M45A 3KLIA 4CGGA 1TKDA 4JS5A 1TL3A 1C0UA 3L2QA 3SV3A 1IH7A 4CIEA 4FJIA 1R0AA 2IAJA 4KI6A 1KVAA 1D9FA 1TAQA 3TABA 3AA2A 3TAEA 2HVIA 1BIZA 3AVIA 2G8VA 3TAMA 4J2AA 4G1QA 3SUQA 3V9WA 3ZSOA 4Z4GA 3O4NA 3OVNA 4O4GA 4ZTFA 5DK5A 4KV8A 2YNHA 1O1WA 5KGXA 4DSJA 3PO5A 2HNZA 3NGIA 4O0IA 1L5UA 1IKYA 4CK2A 2HHTA 1B92A 1JLCA 4E7JA 4CEFA 4FJ8A 3DRSA 4FJXA 3QESA 4CF1A 3P1GA 1N6QA 4B9NA 1HPZA 2X78A 3OS2A 4CECA 4FM1A 3TAQA 1SV5A 4RG8A 4FJ5A 3MAQA 4FK0A 4IKFA 1VSDA 4OKEA 4DTXA 4H4MA 1UWBA 1SL0A 3VA0A 3AA4A 2HHWA 4DQRA 3VQ5A 1HYZA 4HCCA 3ITHA 3V1RA 2E6LA 1JLQA 3HM9A 4DU3A 4EZ6A 4M3ZA 2OYQA 3NCIA 4FJ9A 2FBYA 3K58A 3SQ1A 2DFEA 3ZT0A 3NBPA 3CYMA 3CM6A 1YT3A 1Q9XA 3KJVA 4N5SA 3AO2A 1QE1A 4C8NA 4E1NA 2G8FA 4E89A 1BGXT 1TKXA 3HYFA 3ZT1A 4OJRA 3PX6A 3FFIA 4KKOA 3SCXA 1Q8IA 1ZYQA 4CJSA 4CJVA 4KI4A 4CGHA 2HW3A 1KVBA 3NHGA 4Y1DA 3DLGA 3K59A 3SYZA 2F8TA 2BDPA 4MFBA 3TR8A 1BCMA 3OYKA 4HUFA 3NH0A 1JLEA 3KK1A 3AVCA 4CJLA 5J2QA 4EZ9A 1NK9A 3DRRA 4M3YA 4CGFA 4CHPA 3JYTA 3DLBA 3ZSXA 1BL3A 4Z4IA 2BANA 3DLHA 2RKIA 4J2EA 3OYDA 2EX3A 3NF7A 1LAVA 5C42A 1C0MA 3DMJA 3VQEA 4DTOA 4B9SA 2QXFA 3HP6A 4LD0A 4CIFA 5T7BA 1WAFA 2PYJA 3OY9A 1NK0A 4F2SA 4DTSA 4FXDA 5J1EA 1JLAA 4CJ3A 4I9LA 4DTMA 2HMIA 4CERA 4FK4A 4F8RA 3HK2A 3OYLA 3LWMA 3LAMA 3LWLA 1WLJA 2IS3A 3C6TA 1HJRA 1N5YA 4L8RB 1RT2A 4KFBA 4CEZA 2GUIA 3DRPA 4FLXA 2Y1IA 1BCOA 3EYZA 2DY4A 1UOCA 1VSJA 2WONA 4FLYA 3E01A 1F21A 4F3OA 3A2FA 1ZBFA 3VN5A 3ZSQA 1VSKA 4LSLA 4CJKA 4DU4A 3L3VA 1C1CA 1JLGA 3OYMA 1JXEA 3LPUA 3VQ7A 3KKRA 2HHVA 2D0AA 4BDYA 5C25A 3QLHA 4O0JA 2YV0X 4BDPA 5K14A 1J9AA 5KRTA 3M8SA 3TAFA 4HUEA 3U3YA 3SI6A 3BDPA 4CEBA 4E0DA 4ELUA 1RT7A 3KD1E 1TK0A 5HBMA 3AVGA 3KLFA 3RRGA 1FK9A 1Z26A 3VQ4A 3RR7A 4KB0A 2YKNA 4E7KA 4UQGA 1WSHA 2FC0A 3NF8A 4ID5A 3KIOA 3VQAA 4Y1CA 5HROA 1NJYA 4LH5A 4FLWA 3T1AA 3AVNA 3AVAA 4CF9A 3RMDA 1RT1A 2Z1IA 4DTRA 4LY7A 1SL1A 2BE2A 4CHQA 1JLBA 2B6AA 4M3XA 1SKWA 1KTQA 1U48A 5J2NA 1S1TA 3SQ2A 3O3FA 4DTUA 4ICLA 1SL2A 4CF0A 3RR8A 4HHTA 4J2BA 2HHUA 4OPJA 1VSHA 1Y97A 3WNGA 4KTZA 4N56A 3OYIA 3MEEA 4FLVA 3HVRA 5KTQA 3I0RA 4FZYA 3VQCA 4FK2A 1TL1A 5CYQA 4CFAA 3C95A 2EHGA 1NKBA 3AVLA 4JS4A 4EP5A 4GMJB 4KREA 4H8KA 3LDSA 4DFPA 1CLQA 3V4IA 4E7IA 3ZSVA 1ASVA 4Z4EA 4KRFA 3AO5A 4CHOA 2WOMA 3LP0A 1J53A 3I0SA 4GW6A 3LP2A 1XC9A 4BWJA 1RDDA 5KGWA 4JLHA 4NCGA 4M41A 3RMCA 3QINA 4LSNA 3OS1A 4C8KA 1RTHA 3OJUA 2BGGA 1NOYA 1J5OA 4M3UA 2P1JA 1X9MA 2G8HA 1NJXA 4Q5VA 3OYNA 3OYGA 3SV4A 5J2MA 1J54A 1HQEA 4JRQA 1U45A 4DWIA 3THVA 2HHSA 2OPPA 1XHXA 3CFOA 4AHSA 1T03A 3CFPA 4CGJA 1I3AA 4DFMA 1QSYA 4FZXC 4W5TA 4HUGA 2RN2A 3PY8A 3NDKA 5DMRA 3EY1A 3HT3A 1DLOA 1RBSA 4ID1A 1S6PA 2VG5A 2OPQA 3KLEA 4CFCA 3RTVA 3L3UA 2PZSA 2YNFA 2KZMA 2Y1JA 4DQPA 3MEDA 3QETA 4DQSA 3VQ6A 4CESA 1EXQA 3L8BA 1NK6A 3RRHA 3S9HA 1Q9YA 4KB1A 4KHWA 4OKJA 1D9DA 1LW0A 3TI0A 4IG0A 4J2DA 1UAXA 1RCHA 1VSEA 4RW7A 5FRNA 2VG6A 3LZJA 4N41A 2VWJA 3HPGA 3AVMA 1ZBUA 3CG7A 4CEEA 1ASWA 3SQ4A 2P5OA 1YTUA 4CJPA 4JRPA 2G8UA 4FJGA 5E41A 3PX4A 1RT6A 3M8PA 4N47A 2XY7A 4FZZA 1RDBA 1ZBIA 1QS4A 4DLGA 1HMVA 3LANA 4BE1A 2PY5A 4BACA 3MXJA 3U6FA 4E7LA 3QO9A 1BQMA 3V9SA 1X9SA 1G15A 4HCBA 3V1OA 1QTMA 4I9QA 3G0ZA 4CJRA 3NH2A 1RDCA 1EX4A 3DOKA 4O44A 1KFSA 4ZHRA 1T7PA 4Z4HA 2PYLA 4FYDA 1WSEA 4B9LA 4FJMA 1L3SA 4RW9A 1CXQA 4QAGA 4Z0UA 4BDZA 1RTDA 1LWCA 2OPSA 1JXBA 3AVHA 4WE1A 4HVJA 2E4LA 3QNOA 4CJQA 2D5RA 4M3WA 2XO7A 1BI4A 2ATQA 3UIQA 1S9GA 2HB5A 1L3UA 5CYMA 3QEIA 4K8XA 3QEVA 2KFZA 2HNDA 3LALA 2VWKA 3VQBA 4CFDA 3O3GA 4FJHA 4E19A 3B6OA 1BISA 1T8EA 5HLFA 2G8WA 2X6SA 1C1BA 2XHBA 3QEPA 3K5OA 4NYFA 1BHLA 1RBUA 4ELVA 1D5AA 3HXMA 4W5NA 1REVA 2ITGA 1WN7A 3H08A 4AHUA 4F4KA 4FM0A 3IS9A 3ZSWA 1I39A 3QEWA 3OS0A 5FDLA 3AO3A 1SKRA 5CZ1A 1IKVA 4IG3A 3ZCMA 3L2RA 4ELTA 1KVCA 1WNSA 4W5RA 3C94A 1L3TA 4K8ZA 1LAWA 1LW2A 2Q3SA 3AVJA 3QIOA 4MQ3A 1TV6A 3OJSA 3NAEA 3TWHA 1HNIA 3ULDA 4DLEA 4KHYA 3BGRA 1U04A 1TVRA 2P51A 4FCYA 5HP1A 5HRRA 5I3UA 4CF2A 5C24A 3OYCA 2KTQA 4CHZA 4FW2A 2Z1JA 3LPTA 4AHVA 4F3TA 4C8OA 1IO2A 4M3TA 2VG7A 1FKOA 4CJWA 3M8RA 4DSEA 1L3VA 1NK8A 4CJEA 2XY6A 4KTQA 4B9UA 1W9HA 3K5LA 4OLBA 3PO4A 2OPRA 2JLEA 2YHBA 3O4QA 2RPIA 3TAGA 4DSFA 3RWUA 4DU1A 1D8YA 1RT5A 2XRIA 3OYJA 2GBZA 1MU2A 1TK8A 3JSMA 4KHUA 3PV8A 3V9UA 1GOAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DS5A 3QIPA 2D0CA 1DTTA 3P83D 2X74A 3VF6A 5BRDA 3ALYA 2IVOA 2QXLA 1RTJA 2UXDK 4JKEA 1XQSC 3ZX3A 1WSGA 3TTFA 4LFBK 3IAYA 1HNWK 3ZT3A 1Y64A 1XNQK 3SNNA 2IOCA 1RDAA 3MECA 4B9VA 4UY8O 4K41A 3T7ZA 4B1VA 3CJBA 4CJTA 3WNHA 1SZ2A 2F7TA 2FBVA 2QI2A 3GL1A 1QVFM 1SUQA 1KLNA 4XEIA 3OYFA 3TANA 3MEGA 2D0BA 2FXUA 3HOTA 3LL3A 1IG9A 2O8DA 5AQJA 5HRSA 4I6MA 5E26A 3O3HA 4KHNA 2YKMA 2HHHK 3KLHA 1MWKA 2O8FA 3KK7A 4BC4A 1VSLA 4RW8A 5C2DA 2QTDA 3UE5A 5SZTA 1RNHA 4BRDA 3LAKA 4A61A 2O8EB 5AQUA 1FW6A 4B8AB 1ZBLA 4PL8A 3D45A 5FPDA 1HNVA 1YXQA 3HO1A 5KRSA 3T3FA 3ISNC 4RCHA 3QERA 4FJLA 3F73A 2ZJQL 2OZMA 4FJKA 4O8UA 3CM5A 3K9KA 3WXLA 4DF8A 4NB4A 5SWMA 4KHQA 3SUPA 4M42A 2B5JA 1U4BA 3AARA 3Q7CA 3RVCA 1HKBA 3NFAA 3IKMA 3CIPA 2VQEK 1HRHA 1X3MA 3HP9A 5HRNA 2YHAA 3WEEB 3CF5L 3CQXA 4KHPK 4DSLA 4CE9A 4CZLA 1NNEA 1RT4A 4KH5A 3QNNA 2W41A 5FLXO 3LZIA 2P9IB 1VHXA 5M1NA 3NH1A 3SZ2A 3VA3A 3TSPA 3SPZA 3ASMA 5AQRA 2YHXA 4BR0A 3G10A 3IRXA 4CJUA 3K2PA 2OZSA 1RT3A 1D4XA 4OGEA 4OLAA 3DI6A 3CC2N 1JKHA 4LH4A 5CHIA 4NCBA 2XY8A 4AHTA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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