4LY7A

Ancestral rnase h
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
b'MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYKQHEKTFSAGFHLTTNNRMELMAAIVALESLKQPCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAAIQRHTINWKWVKGHAGHPENERCDELARTAAESPTLEDVGYQP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Thermodynamic system drift in protein evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease H
source organism Unidentified
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 153
sequence length 153
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4ly7A00
3QEPA 1QHTA 1TKTA 3SI6A 4CHZA 3LZJA 3OYAA 4BDYA 4DS4A 4FZXC 1CZ9A 3ALYA 3L3UA 3VQ8A 1SL0A 3TARA 3O4QA 3THVA 1BIZA 4DSEA 3QEVA 3OYHA 3TAMA 3BDPA 1NJZA 3TAGA 4CJ4A 4EZ9A 3MECA 4CJFA 1TVRA 1NK6A 4J2EA 3ZCMA 5CYMA 4DTPA 2YNIA 2YNHA 2B4JA 2ZQBA 1RBSA 3DLGA 1B92A 2HNZA 3DRSA 3VQ7A 1FK9A 1NKBA 1ASWA 1HRHA 5HRRA 4E7LA 3MXIA 2DTUA 3KKRA 1VSEA 2G8KA 1UAXA 3EZ5A 4DLEA 4FM0A 1RT7A 1UOCA 4C8NA 4AHRA 3T3FA 4FW1A 4TSXA 3PX0A 1TK5A 4NYFA 3G10A 4B9NA 1J5OA 3ZSQA 3MEDA 1L3TA 4AH9A 1TL3A 4UQGA 4CF1A 3OYGA 1L3UA 4Z0UA 1A5WA 1KLMA 1RBUA 1HNIA 1HNVA 1MU2A 1YTAA 4OGEA 4CK3A 1B9DA 1LAVA 3AVNA 3AVJA 5SZTA 3SZ2A 1D9FA 2DFHA 4CEFA 1BQMA 3HO1A 5C24A 4DU3A 1SKRA 2D0BA 4ELVA 4QOZB 2ITGA 3VQQA 1NJXA 4W5TA 4DF4A 3RMAA 3AA2A 1NOYA 1ASUA 4KB1A 4FW2A 4OLBA 1BHLA 3V81A 1BQNA 1K6YA 3LPTA 2KZZA 4CFAA 2F96A 2RN2A 2ZD1A 1YVUA 2HNDA 2JGUA 3O4NA 1BI4B 4MFBA 3QINA 4YFUA 4OPJA 4FZYA 4J2AA 3ULDA 2YKMA 5CZ2A 1TKZA 3NGIA 3DRPA 4IFYA 4CJSA 3RRHA 4B9VA 4LSNA 2KQ2A 3NFAA 4AHCA 4ID5A 3NGZA 2EHGA 3KK3A 1NK8A 2G8VA 1VSKA 4HVJA 4JRQA 1NJWA 2KW4A 4Y1DA 1VSJA 4B9TA 4XIUA 4C8KA 4KHNA 4E1NA 1RCHA 1VK0A 5HROA 4O0JA 3VQAA 4KHSA 4KRFA 1CLQA 5C25A 4I2QA 4KV8A 1RTDA 4DTXA 1HQUA 4CF0A 2OZMA 2IS3A 4CIFA 2QKBA 2BE2A 1HQEA 5J2PA 4CJEA 1DLOA 4FLTA 1TV6A 3C6TA 3KD1E 4K8ZA 2D0CA 3ZSOA 1UWBA 3IRXA 4FJLA 3V9XA 5J2MA 1KFSA 3FFIA 3LPUA 4LSLA 3T1AA 3ZSVA 3NAEA 4GVMA 4KHQA 4LH5A 5FDLA 4HTUA 3SYZA 3TANA 4FLZA 1HPZA 1D9DA 2P5OA 1NKCA 4FZZA 3MXJA 3M8RA 1JXEA 5E41A 1EETA 3V1QA 4FJIA 3KLEA 3AVKA 2IGIA 3C94A 1SKSA 4CCHA 3VQDA 3SQ4A 4Z4CA 5C42A 2VWJA 5CZ1A 4Z4GA 1HMVA 3SCXA 2P5GA 3DLHA 1VSFA 3V1OA 3ASMA 3QNOA 4DFJA 3KLIA 1VSIA 4FJ5A 4DFMA 1IG9A 4FK4A 1ZBHA 3SV3A 4CHYA 3LP2A 1RDDA 4IFVA 4RW9A 4DU4A 1XHXA 4B9SA 1JXBA 3PO5A 3DRRA 3OYIA 3OYEA 1ZBUA 1RDCA 1NJYA 2YHAA 1VSLA 4E7JA 1KVAA 4M3XA 1NKEA 4LY7A 4ZTJA 1S6QA 1N5YA 3WNHA 1S5JA 2YKNA 3B6PA 4OKKA 3K5OA 3V6DA 4GMJB 1LWCA 1RBTA 2F8TA 3OJUA 2DY4A 1JLEA 1RT3A 2G8UA 4CFDA 1D8YA 2X6NA 4DFKA 4CHQA 4J2DA 3LWLA 5SWMA 3DI6A 4CEDA 1W9HA 4C8LA 3VQEA 2DFEA 1JLAA 1ZYQA 1ZBLA 4JRPA 5JS2A 3C95A 4CJQA 3S9HA 1LW2A 4Z4EA 2O4GA 5HRPA 5JS1A 4W5RA 4FYDA 1QE1A 3QIPA 4B8AB 3TAEA 3KD5E 2NUBA 4FVMA 4DFPA 1X9MA 2G8HA 3KTQA 2HHUA 3SPYA 2Y1JA 3HM9A 3U6FA 4I2PA 4BE2A 1QSYA 1DTQA 3EY1A 5HP1A 4Z4IA 1WSEA 2ATQA 2WOMA 3ITHA 4GW6A 3VQ4A 1VSHA 3VQ6A 1NK7A 4F8RA 4DQIA 2LSNA 2E4LA 4KTWA 2XO7A 4RW4A 4KHYA 3ZSRA 3VQPA 3PV8A 5J2QA 3V9SA 4I9QA 1W0HA 1I39A 1Z25A 3NF8A 4FJ7A 4M42A 2O4IA 2GV9A 4KO0A 4DSKA 4CECA 3TAPA 3AO4A 2HHXA 4R5PA 3L2QA 3UIQA 3V9UA 1BGXT 2WONA 1JL2A 3AO1A 2G8WA 4DTNA 5CYQA 1BI4A 3ZSXA 3AVGA 3NF6A 4IBNA 3VA0A 1ITGA 1TL1A 3DOLA 4OKEA 4B8CA 3ISNC 3V9WA 2Y1IA 1A5XA 4JS5A 4DSFA 2XY7A 1RNHA 1SUQA 1TGOA 4N56A 3DMJA 2W42A 3RMCA 2OZSA 1X9WA 2BDPA 3B6OA 3ZT2A 3OYLA 4FJXA 1GOBA 3HT3A 2HHTA 3JYTA 2KZMA 1QTMA 4BDZA 3MEGA 2R7YA 5KGWA 3MXMA 4ELUA 3T19A 4ELTA 3OJSA 3PY8A 4E0DA 2VG7A 3I0SA 1D5AA 3AO5A 3P1GA 1XC9A 4BE1A 1JL1A 1NK0A 1L3VA 1Y97A 4CF8A 1UA1A 3LAKA 4FXDA 1EKEA 1C0UA 1I3AA 2JLEA 4OJRA 4CIEA 4FLXA 1KSPA 4IG3A 3I8DA 1TAUA 3LANA 1IO2A 2XHBA 1LV5A 3LDSA 1RTIA 3WNFA 3HL8A 3VQ5A 1HYVA 4DG1A 4FLUA 1IKYA 1BISA 1LWEA 1C6VA 3LP1A 4FCYA 3KLFA 2Z1JA 3HPHA 4B9LA 4N41A 3AO3A 4CHOA 3OYFA 1S1TA 1NK9A 1WSIA 4W5QA 4N76A 1S1WA 3K58A 1X1PA 3QEXA 3M8SA 5FRNA 1JLQA 1C1CA 1CXQA 4AHUA 1G15A 1VSDA 3AVMA 4CK1A 5KGXA 4FJ9A 2IC3A 3G0ZA 1C1BA 3PUFA 1NOZA 1XHZA 4FJJA 2XY8A 3VA3A 2QK9A 1HYZA 1R0AA 3KJVA 4CJ3A 4E3SA 3P83D 4HHTA 1FXXA 1RT2A 3DM2A 4NYNA 1WSGA 2X78A 4O55A 3AA3A 3TAQA 4N5SA 4CERA 1HJRA 3VN5A 3RR7A 3AVCA 4CGGA 2Z1HA 1VRTA 4FLYA 3L2UA 4OGCA 4W5OA 1C1AA 1O1WA 1XI1A 3HP6A 3NCIA 1LW0A 4E19A 3SUPA 2E6MA 3ZT4A 3V1RA 3K2PA 3I0RA 5DMRA 3CYMA 4CGHA 1S1UA 3AVBA 3V9ZA 3V4IA 4DSJA 4KREA 4CJVA 5KRSA 4CGFA 3D45A 4OPKA 2OYQA 3HVRA 4M3TA 4I7FA 3RWUA 2VG6A 3LAMA 2PYJA 4FJ8A 1YT3A 4M41A 1JKHA 4FJNA 4AHTA 2X74A 4AHSA 4KAZA 4CEQA 1QS4A 1U04A 1U4BA 4HCBA 4CEZA 2YNFA 3KKSA 4WE1A 3NH1A 1U48A 1C0MA 2XRIA 4QAGA 4KFBA 2FBXA 4LH4A 4AILC 3OYCA 3QEIA 1RTJA 2OPRA 3P5JA 4CGJA 1FKPA 2HB5A 3RMBA 1U45A 4BDPA 2Q3SA 3HPGA 1WSJA 4CEBA 4M3UA 4PY5A 3QIOA 2Z1IA 4N47A 4CGDA 3VQCA 4ZTFA 3SJJA 1BCOA 3K57A 2KFZA 3CQ8A 1EP4A 4O0IA 3O3GA 1RT6A 1WSFA 4DQRA 3DLBA 4H4MA 4DWIA 4CGIA 3K59A 3NDKA 2OPQA 3D0PA 2BGGA 3HVTA 4PWDA 3OYKA 1L3SA 3TWHA 4M3RA 2B5JA 1Q9YA 4F4KA 4YNQA 3HK2A 3QERA 2KFNA 4DTUA 1T7PA 4BWJA 4E89A 2F8SA 3AA5X 1T8EA 1SV5A 1ASVA 3OYJA 3HSTB 4HUFA 3PX6A 3SQ1A 5KTQA 3ZT3A 4E1MA 1U47A 2HMIA 2HVHA 1KLNA 1KCFA 1RDAA 4E7HA 2GUIA 3TI0A 4F2RA 3QNNA 4Y1CA 2ZE2A 4PQUA 3O3FA 4CJ5A 1RBRA 4F3OA 4PA1A 4F3TA 4HCCA 2A1SA 4CEAA 3SPZA 3QO9A 3SQ2A 2RKIA 4QCLA 4Z4HA 4RW6A 4AHVA 2I5JA 4B08A 1J53A 2EX3A 4IDKA 2A1RA 2AJQA 3QETA 1JLCA 1UA0A 1XWLA 1S6PA 4KTZA 3SUNA 3DLEA 3H08A 4DTOA 3VQBA 4DLGA 3OVNA 5DK5A 3DLKA 4DQSA 3A2FA 3ZSWA 3M8PA 2P1JA 4CEEA 4KB0A 3NF9A 4M3YA 5FRMA 4FLWA 2KTQA 3KK2A 1SL1A 1RBVA 3AV9A 3HPOA 4H8KA 2G8IA 3NE6A 3ZSZA 1LWFA 4G1QA 1FKOA 4ZHRA 4C8MA 2YV0X 4DTRA 4KHWA 5CY4A 1NK4A 2QXFA 1VRUA 3S3OA 1JLBA 3NH0A 2YNGA 1T03A 3CFRA 2OA8A 4B9UA 2IDOA 3ZT1A 1QSLA 3BGRA 1IKXA 4L8RB 4Q5VA 4RW7A 4ID1A 1RILA 3KLGA 2RPIA 3DOKA 4CJWA 2QKKA 4CESA 2OPPA 2YHBA 5D3GA 1WNSA 1B9FA 4FJMA 5I3UA 4EP5A 4CFBA 1CZBA 4E7KA 3LWMA 3AVFA 4CJUA 4CJPA 4Q0BA 3NGYA 3CM5A 4BWMA 3K5MA 4DS5A 3RR8A 4K8XA 2GBZA 1WN7A 4F2SA 1T05A 1KVBA 3WNEA 4KI6A 1N6QA 3HXMA 1RT5A 3MEEA 4FLVA 4NCBA 2HHQA 3DYAA 1JLFA 3WNGA 3CFPA 3SNNA 3TR8A 3AO2A 5T7BA 4MQ3A 3SQ0A 3OYBA 1KFDA 1S1XA 1J54A 4DTJA 3U3GA 4FJHA 4CE9A 3M8QA 1WSHA 3TABA 3SUOA 1RTHA 1TAQA 1VSMA 1WAJA 3F73A 4KPYA 2VWKA 1LAWA 3OYNA 3F9KA 2B6AA 4DMNA 3S3NA 2FBTA 4IG0A 4KTQA 3L2WA 4C8OA 1JLGA 4HUEA 2BANA 1WLJA 4FK2A 2ETJA 5J2NA 3QLHA 1F21A 3DLRA 3LP3A 4EP4A 1TKDA 3OS0A 1EX4A 2FBVA 3L2VA 5KI6A 2X6SA 3U3YA 1IH7A 1RDBA 5HRNA 3OYMA 1SKWA 1NK5A 3HP9A 4CK2A 4FK0A 2HW3A 1QSSA 2FC0A 3EYZA 4NCGA 5K14A 4KKOA 3K5LA 4E7IA 2IOCA 1S9GA 3O3HA 1REVA 2XY6A 3KK1A 2PY5A 4CHPA 4KI4A 4M45A 4CJLA 1C0TA 2D0AA 3OS2A 1HYSA 1U49A 2OPSA 3MAQA 1GOCA 3HJFA 4CEOA 2HVIA 1RT4A 3CM6A 1BCMA 4EZ6A 4JLHA 3LZIA 3OY9A 2HHWA 1YTUA 2XY5A 1IKVA 1WAFA 3KIOA 3OYDA 4I9LA 1TK8A 4NCAA 4W5NA 3AA4A 5HLFA 4DQPA 4OLAA 2IAJA 3LALA 1L5UA 3RMDA 4FJKA 1GOAA 3KLHA 3JSMA 3IS9A 1J9AA 3PX4A 3NH2A 3C6UA 3L3VA 3E01A 1BIUA 1TK0A 1EXQA 1Z26A 4O4GA 4CFCA 2Z1GA 3HYFA 4CJKA 4OVLA 3NHGA 3TAFA 3PO4A 1X9SA 4JS4A 3NBPA 1Q9XA 2HHSA 4B9MA 4J2BA 1S1VA 2DFFA 4BE0A 1KVCA 3AVLA 2D5RA 2FBYA 4FM2A 4O44A 4CJTA 4DSIA 2E6LA 3AVAA 1KTQA 2HNYA 3L8BA 3CFOA 4CHNA 3K5NA 3SV4A 1RT1A 3ZT0A 1CXUA 2RF2A 2VG5A 4O5BA 4DQQA 4DTMA 5HRSA 4DF8A 4FJGA 4KHUA 1A5VA 4M3ZA 4RW8A 1QQCA 5HBMA 4CJRA 4M3WA 3AVHA 3CG7A 4LD0A 4DSLA 3AVIA 4HUGA 3RTVA 5I42A 1ZBIA 3IAYA 5FROA 1TKXA 4CF2A 5KRTA 1Q8IA 1BL3A 4FM1A 1KRPA 1DTTA 2PZSA 2P51A 1S9EA 2G8FA 4IKFA 3VQ9A 3S3MA 3OS1A 3L2RA 3LP0A 3IG1A 3ZSYA 3QESA 3QEWA 4H4OA 3SUQA 4DU1A 4CF9A 2PYLA 3RRGA 1ZBFA 1IKWA 2HHVA 4DTSA 4B3OA 4ICLA 4Z4FA 4RG8A 5J1EA 3NF7A 5EU7A 4OKJA 4BACA 4CIGA 4PUOA 1SL2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TKTA 4HTLA 4LF8K 3MN5A 3CCUN 3VQ8A 3O4WA 3H45C 2P9SA 2P9KA 5A2QO 5JICA 1VAZA 1NLVA 2QI2A 4J2EA 4DTPA 4BREA 2E2PA 1VQKN 2B4JA 3MWPA 2IVNA 2HNZA 1YUWA 5HRRA 4E7LA 2RHKA 1VSEA 2F9WA 4AF1A 2G8KA 2CGKA 3T3FA 4CI6A 4H5NA 5GINA 3G10A 3ULEB 3W0LA 1L3UA 4CF1A 4Z0UA 1A5WA 4HCCA 4OPJA 3HOTA 1NG9A 1LAVA 3AVJA 3O08A 4IEEA 5C24A 2D0BA 4QOZB 4DF4A 1NU0A 3RMAA 1NOYA 1N32K 3WXJA 3V81A 1NGDA 1XC3A 2E1YA 2F96A 5F2RA 1YVUA 2PBDA 3O9UA 2YKMA 3NGIA 4IFYA 1K8AO 2CH6A 4BRAA 4WQ4A 3NFAA 4BG9A 3CC2N 4LFCK 4JRQA 1ATNA 1NJWA 4KHSA 3SLCA 4O0JA 1RTDA 1HQUA 1WUAA 2UUBK 5AQJA 4BRHA 3KD1E 4K8ZA 2D0CA 3T1AA 3ZSVA 2GEMA 4KHQA 4LH5A 3SYZA 3E66A 1JCFA 1HPZA 4WFAL 3EKUA 3HZ6A 1EETA 1S3XA 4FJIA 1HKBA 4IJAA 3AVKA 3VQDA 5C42A 4Z4GA 5KQ8A 4JKFA 1GLEG 1JCGA 1XQSC 3THYA 3ASMA 4DCHA 3QNOA 3KLIA 1VSIA 4FK4A 4Y0WA 3SV3A 4CHYA 3LP2A 1RDDA 1JXBA 1XUPO 3OYIA 1RDCA 3L4QA 4MO5A 4JI2K 4M3XA 3MWTA 4LY7A 4DR7K 1S6QA 1N5YA 3WNHA 5F0XA 2DY4A 4B1ZA 5C10A 2G8UA 4BRQA 5SWMA 4CEDA 4M7XA 2WC9A 2NZTA 1ZYQA 4JRPA 1KD1O 3MCAB 4K25A 5HRPA 5JS1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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