4BG9A

Apo form of a putative sugar kinase mk0840 from methanopyrus kandleri (orthorhombic space group)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
LTRVLGIQLGNTGTDYCVMNEDGDWEIVAREEGVFGKISCVFTLEESRRALREEIAPRVIERVRRVNPDLAVVGTIVDELGLILGPMIHEKTGVPTLAVYGDPWGAPDGDAVGAPYCVAEEYPNCVHVDVGAMAVVTPIRDGRPDFGDAVVSVGTFPLDLAARELLGKEYDEGGKKAAEGEVDENFRRELRSVDVDGKPVFGRVRGSLAPVPPEQERVLRDHIRDAGAPAEDVLRTLVELVAETIVINAAQYDMDLLVLSGGGVKNELLKRRVSELWEGDVSIFAGEELEARGLCLLGLRYLEGEPVPALPCEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords PREDICTED MOLECULAR CHAPERONE DISTANTLY RELATED TO HSP70-F O
publication title Structural Characterization of the Ribonuclease H-Like Type Askha Superfamily Kinase Mk0840 from Methanopyrus Kandleri
pubmed doi rcsb
source organism Methanopyrus kandleri
total genus 92
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A02
3.30.420.430 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A01
3VETA 2P9IB 1ATRA 5AZIB 1MWKA 3FZHA 4HTLA 3AARA 3D2FA 4H0PA 4B1XB 3VERA 3EKSA 3C7NA 2Q31A 3J8AA 3CIPA 3CJBA 2FF3B 5FPEA 2AA4A 4CZMA 2V7ZA 5EOYA 3FZFA 2YHXA 1IG8A 4WQ5A 4CZEA 3VGLA 4E1JA 4A2AA 4IJNA 3ZETA 1GLAG 3DWLA 3UB5A 1NGJA 2Q0UA 3VEVA 2W41A 2ITMA 3H3NO 3QB0A 1NGEA 4ISGA 3AAQA 3MK6A 3LDQA 1GLLO 5BREA 2F9TA 3EO3A 3ENHA 2P9UB 3QMLA 5F1XA 4QS7A 1QZ5A 2ASMA 4EIAA 1U6ZA 3CJ7A 3FLCO 4BR5A 1YAGA 2E2OA 3IMXA 2A40A 4BR7A 4BR2A 2GWKA 3VF2A 3O5BA 4A61A 3SMPA 3H46O 5LY3A 3DXMB 4ISEA 4CBWA 4B1ZA 4IO8A 1BA0A 4AM6A 3O08A 5BN8A 4BG9A 1V4TA 4BRPA 4JHDB 3UKUB 1HKCA 4BQZA 3WXKA 4DB3A 2IIRA 1NGGA 1D4XA 2YHWA 2CH5A 3VEXA 1HJOA 3JXUA 3FR0A 5AQSA 3SJHA 5BPLA 4FL9A 1Q18A 1J6ZA 3WEEA 4EAHD 5JLHA 2E8AA 4BRMA 4CZKA 3ZX3A 2QW9A 2A6AA 1NGFA 4CBUA 4YDUA 5I9EB 2ASOA 3ULEA 3WQTA 5JLFA 3G25A 2ZGZA 2Q2RA 1HUXA 3D2EA 4PKGA 2ASPA 3HSCA 4WQ4C 1Y64A 5F2RA 3VENA 1Z6RA 2IVPA 5AQQA 4BRQA 3M6GA 4BRDA 3LL3A 1KXPA 3WQUA 3BEXA 3ZETB 1ATNA 1U2VA 2GUPA 2Q36A 3MN7A 4A62A 2QM1A 1GLFO 2BUPA 3I33A 1GLEG 4B1YB 3DXKA 2IVOA 3LDLA 4JAXA 1MA9B 5AZJA 3MN5A 4CZFA 4DCHA 2F9WA 4BVPA 1Z05A 5BPNA 3W0LA 1ZBSA 3KZBA 5AQUA 1HKGA 3U8XA 2D4WA 3ATUA 1S3XA 3QBXA 4FWOA 4Y0WA 4CD3A 4H0YB 2QXLA 2P9PA 4A2BA 3CJAA 4H0OA 3M3ZA 3A5OC 4JNEA 3A0IX 4WQ5C 4MLHA 1JCEA 4PL7A 5FPNA 2D0OA 2I7PA 4F9OA 2W40A 4B1UB 1HKBA 2EWSA 1HLUA 5LJVA 1X9JA 4H5NA 4XEIA 3RSEA 3VEZA 4K42A 5KQDA 2FSNA 1OKJA 2QWOA 4IXCA 2P9LA 1KAZA 3DAWA 4CJ7A 5KQ8A 2P9NB 1C0GA 1XC3A 3CQYA 3WEEB 1ZXOA 4BG8A 3VGKA 2GWJA 3W3DA 3I8BA 5AQZA 4B1WB 1T6CA 1EQYA 1S22A 5EY4A 5AQPA 3UKRA 4BC2A 2PBDA 3ZEUB 5E26A 1SQKA 1NMDA 3D2EB 2V51B 2FSJA 4EFHA 2QWLA 4CZIA 1BWFO 4MLEA 1QHAA 1DGKN 1K8KA 1ATSA 3A8YA 3WT0A 3BP8A 4BGAA 2QWMA 5E84A 4K25A 2E1YA 1CZAN 1SAZA 1HX1A 1U2VB 1NM1A 1TUUA 2D1KA 3VEYA 1JCGA 1E4GT 5CE3A 5AZJB 4QS9A 4B1VA 5BRDA 4YDUC 3U9ZA 4BRNA 4I6MA 3FE1A 4H5VA 5B8HA 2FF6A 3WXLA 2GEMA 1DKGD 4BVOA 5EVZA 2E2NA 5LJWA 2FSKA 3EKUA 2E2QA 1X3NA 1NGDA 3MMVA 4CZJA 3JS6A 1BG3A 4MO4A 3LDOA 4M7YA 3IDHA 5BN9A 2VYPA 3AAPA 3FGUA 3M1FA 1RFQA 3O1WA 1X3MA 5JMVA 2YCHA 3RSEB 2VCPA 2FLOA 1GLJO 4H0VB 3D7EO 3A5MC 3QICA 1P8ZA 1GLCG 1XQSC 1NGBA 2Q1NA 4BR9A 4EHUA 2A41A 3D2FB 1BU6O 2P9LB 2FXUA 4JN4A 2P9IA 3EN9A 5AZIA 3C7NB 3LM2A 2ZF5O 1E4FT 1RDWX 2VWBA 1JCFA 2J4RA 4H5RA 2E2PA 1TYQA 4BQLA 2CGKA 3GBTA 4IWVA 5AFUH 4LC9B 3SMSA 3CJ9A 5JICA 3IFRA 1SZ2A 4DHYA 4J8FA 1IJJA 3U9DA 3FZMA 2QWPA 4JD2A 3QBWA 5ELZA 3TU5A 3LDNA 3BF1A 1K8KB 3GDQA 2WUSA 2HOEA 4BRFA 3VESA 3VGMA 3SLCA 5TKYA 5EXWA 4K41A 4BRKA 2YI1A 2I7NA 3A5NC 3GG4A 4FWMA 4QS8A 4GNIA 1NBWA 1NGHA 4BC5A 1BUPA 2Q97A 1WUAA 3VEOA 2P9UA 3L0QA 3O6WA 4ISFA 4PKHA 3VEWA 4CBXA 2D0PA 1NGCA 2Q0RA 4HWIA 4CI6A 4AM7A 1TUYA 1G99A 4H0TB 3VF4A 1H1VA 2ZWHA 5BRHA 5AQWA 3O8MA 3O80A 4B9QA 3A5LC 4FWRA 3QDKA 4FWPA 1NLVA 2HF4A 1BOTO 3CJ1A 3KVGA 4M63C 1MDUB 3O1BA 4CZLA 4BRHA 5AFUA 1QQNA 1ZC6A 4DQ8A 1WOQA 4PKIA 4NB4A 3ULEB 5AQTA 3H6EA 4BC4A 1GLBG 2ZGYA 4IJAA 5BPMA 5AQYA 3R8EA 3L4IA 3MDQA 2AP1A 3CETA 3EZWA 2P9KA 1XUPO 2YJFA 5AQJA 1HPMA 4BROA 3HM8A 3EL2A 1TYQB 4K43A 2UYTA 3CI5A 2OANA 3LDPA 4FWQA 2V52B 2HMPA 2QWRA 4NO7A 2A3ZA 3O4WA 5AQKA 3LM9A 2E20A 4M7XA 5AQNA 3P4IA 4JD2B 5EX5A 5BRFA 3DXKB 5AQLA 3GL1A 4BRIA 3HBTA 3B8AX 2P9SA 2YJEA 4H5TA 1BA1A 1V4SA 5AQOA 1NWKA 3HZ6A 4FWNA 1DEJA 3FZLA 2P9PB 4PL8A 3VPZA 3VOVA 2YHYA 2QWNA 1C0FA 4BRGA 4KBOA 1NGAA 2QWQA 4BGBA 5KPTA 5BR9A 1ESVA 1T6DA 4O8KA 4XH1A 3CHWA 4IZ9A 1QQMA 3AY9A 4Z94A 3FFKB 2H3GX 2NRHA 1BO5O 2GELA 4O5FA 1YUWA 2A5XA 3OHRA 5AQHA 4BRCA 4C23A 1GLDG 2A42A 3C0BA 5ADXH 5AQGA 3CQXA 1NGIA 3WXJA 3WUHA 3KHYA 2GTDA 4FWKA 3MCPA 4FPAA 5KPRA 4FOEA 3ID8A 5F0XA 1QZ6A 3QFUA 4GY2B 4H0XB 4FWLA 4CZHA 3SK3A 1LCUA 1MWMA 3F9MA 3ATVA 4XH4A 1QQOA 5AR0A 2P9NA 3H1VX 3S41A 2E1ZA 5FPMA 3UKRB 4EHTA 3GE1A 4FO0A 5AQFA 3QFPA 4H5WA 5AQMA 5AQRA 2NLXA 2P9KB 2PAVA 3CERA 3ZX2A 2E88A 2NZTA 3ZEUA 2DPNA 3H3OB 3GOIA 4FSVA 3MN9A 4BR4A 3DJCA 3L6QA 2V7YA 3H45C 2IVNA 4XH5A 3ZX0A 1LOTB 4FWSA 1RGIA 3R9PA 3TPQA 3ENOA 2P9SB 3VF6A 2CGJA 1BDGA 3BUZB 4I6MB 3H1QA 1T44A 4CZGA 2KHOA 3IUCA 2HF3A 5AQVA 3UE5A 2CH6A 3DXMA 2BTFA 4FOIA 1YVNA 4BRAA 1YXQA 5ADXA 4BREA 3CJCA 4BRLA 4BR0A 1KAYA 4CD1A 3BF3A 5AQIA 3HI0A 1KAXA 4JHDA 4MO5A 4WQ4A 3UKUA 4H03B 3WXIA 2CGLA 4RWTA 4RCHA 3U4LA 5FPDA 4BC3A 4RTFD 3R6MA 3HTVA 4L3QA 3FZKA 1R59O 4WYBA 5AQXA 3MN6A 5KPZA 4FPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HUGA 2NRVA 1NNEA 3HPOA 1NKCA 3FZHA 4JI4K 3CPWM 1TL3A 3M8QA 2UU9K 3D2FA 4CEZA 3AO3A 3C7NA 2Q31A 1J5OA 4EZ6A 4CF0A 2HBKA 3KK1A 3U3YA 3VQPA 4CZMA 3VQ9A 1I39A 4JV5K 1WNSA 1JLAA 3U6FA 1YIJN 3FZFA 3TAFA 3VGLA 3B6PA 4E1JA 2BDPA 3PUFA 2HVIA 3VEVA 4CESA 4ELVA 3LZIA 4OVLA 5GIPA 4DQIA 4DF8A 4CCHA 2E6LA 4DLGA 3OY9A 4Z4IA 5F1XA 3LZJA 2A1SA 4QS7A 4DWIA 3IRXA 4KHWA 1WSGA 1YAGA 4DSFA 2A40A 3DOLA 4H4OA 3FFIA 4BR2A 3OW2M 3AA3A 3VF2A 1XMQK 3ZSOA 1HJRA 2E4LA 4ID5A 2G8KA 3TSQA 1VQNN 4ILGB 4YFUA 3M5RA 1BA0A 1VSEA 3O08A 2KLAA 3HT3A 4IEIA 4BRPA 4KB1A 3SQ4A 1HKCA 2OPPA 3Q7BA 3VQDA 4DB3A 1NKBA 2PYLA 4NXMK 2YHWA 4JS4A 2HHHK 2CH5A 3VEXA 1HJOA 3JXUA 1TV6A 3SJHA 3TANA 2IS3A 5JS1A 4IOAL 3L2VA 3O4QA 1Q18A 1J6ZA 4C8LA 4DTRA 2NRRA 1XNRK 2NRZA 4C8NA 4IG0A 1X9SA 4CZKA 3ZX3A 5CR4A 3OYCA 1ZBLA 4FLYA 4IDHA 3RTVA 5FLXO 1QSLA 3OBYA 5JVHL 4FZZA 4PKGA 2ASPA 3HSCA 4WQ4C 1UWBA 1Y64A 3DLHA 2HHXA 2YV0X 2O8DA 2QXFA 3KLIA 4LF9K 1NJZA 4DQQA 4Y1DA 1KXPA 2QA4N 2D5RA 3ZETB 4O5BA 5SZTA 2Q36A 3MN7A 1KVBA 2QM1A 1RT1A 2BUPA 3J80O 1NG9A 1GLEG 4B1YB 2Y1JA 3ZLJA 3LDLA 2RF2A 3ZT0A 3MN5A 2F9WA 1Z05A 5BPNA 3OJUA 4YOYA 1HKGA 3U8XA 4FK2A 4NCAA 5J2PA 4Y0WA 1BIZA 3AVMA 2P9PA 4A2BA 1REVA 4FZXC 1BQNA 3D6RA 1K8AO 3EE9A 2EHGA 3UIQA 1JLGA 4MLHA 4W5TA 3L3VA 1IO2A 4EP5A 4E7JA 2IAJA 2EWSA 4KO0A 1HLUA 1BISA 4ZHRA 1JXEA 4E89A 3T3FA 1L3SA 4CJRA 4DR2K 3VTHA 2FSNA 1S1UA 3LALA 4WFBL 1HMVA 4CK1A 3TTCA 3MXIA 1WAFA 3ZSVA 2O8EA 3I56N 3AO4A 3W3DA 3HOSA 4B1WB 4V19S 1EQYA 1S22A 3UKRA 4BC2A 3V9ZA 3ZEUB 3TABA 1SL0A 1D5AA 3OVNA 3DLEA 4CEQA 4F3TA 1EWRA 4EFHA 4M3TA 2YNFA 2GUIA 3ZSXA 3SAGA 1ATSA 3A8YA 4BGAA 1VQON 5E84A 5CHIA 4CK2A 4WCEL 4K0KK 1CZAN 1S9EA 2VG5A 3QLHA 4DR6K 4KREA 3O9SA 5AZJB 4YDUC 4KI4A 4BRNA 2FF6A 1FK9A 4DR5K 4B3MK 2HBLA 4IOXA 1TL1A 1VRUA 5A2QO 4GV3A 3K58A 2D0CA 4M7YA 3HK2A 1D9DA 3PO5A 2YKNA 3FGUA 3O3HA 3F5TA 2YCHA 4JKAA 4H0VB 3LP0A 3MWTA 2P9LB 2FXUA 3QIOA 3EN9A 2VWKA 4KTZA 3LM2A 2XY6A 1E4FT 1W97L 2VWBA 3R3LA 4H5RA 4LC9B 3SMSA 4JLHA 3D0PA 1NK7A 4CFAA 1OVYA 3BGRA 4J8FA 4CEFA 4F2SA 5KTQA 5ELZA 3TU5A 1ILYA 2WUSA 3O9RA 4N56A 3VESA 3QEVA 3WXMB 1YJWN 4EP4A 4BRKA 1NGHA 4FJGA 2Q97A 1ASVA 1WUAA 4CF1A 3L0QA 3LANA 5C10A 2PYJA 4YOTA 4ISFA 5M1KA 2W6KA 4FLTA 3OS1A 2D0PA 1Z26A 4JK9A 3NCIA 1A5XA 1TUYA 1G99A 3OYGA 3NVMA 5J2NA 1H1VA 3RMAA 3NH2A 3B6OA 4OLBA 4JKEA 4X65K 3SJJA 1WB9A 3CJ1A 2ITGA 5I3UA 4BRHA 4CGHA 3QNNA 4NB4A 3PX4A 3T7ZA 1GLBG 3HOTA 4CK3A 2O8CB 3L4IA 3MDQA 5HRRA 3CCLN 2D0BA 3EZWA 5HBMA 1LAVA 2YHBA 2YJFA 1KTQA 4DTJA 4K43A 2IDOA 2OANA 4BDZA 2QKKA 2QWRA 2A3ZA 1YI2N 4JKDA 1WSHA 4PWDA 3LM9A 1KLMA 3SYZA 2UXDK 4JD2B 3AA2A 1I94K 2O8FB 3GL1A 3DLBA 4LF7K 4DV5K 4M3XA 3G4SN 1J53A 3NDKA 1B9DA 2OA8A 1NWKA 4CJVA 1S72N 3MX2A 4PL8A 4IFVA 2BGGA 4O55A 5IT9O 4DV2K 3RMDA 5KPTA 4CJEA 1ESVA 4O8KA 3E01A 2O8BA 4CHYA 4Z94A 5CZ2A 4O5FA 4AILC 2A42A 4H4MA 3CQXA 3O4NA 1NGIA 2OZMA 4DR1K 4AHVA 4OPAA 4AF1A 2XO7A 1QTMA 3QFUA 4GY2B 4CVNE 4CZHA 4KHNA 4WF9L 1ZBUA 3DLLL 2OYQA 2B6AA 2UUAK 5BR8K 5FPMA 3GE1A 1HQUA 4DTOA 1N34K 2PY5A 4JKBA 1D8YA 2NLXA 3MEEA 2QK9A 3HJFA 3L2UA 5LMNK 2E88A 3ZEUA 1W0HA 3VMFB 4BE1A 2HSTA 1NU0A 4OGEA 4FSVA 1UAXA 5HROA 3PX0A 1S1WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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