4BG9A

Apo form of a putative sugar kinase mk0840 from methanopyrus kandleri (orthorhombic space group)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
b'LTRVLGIQLGNTGTDYCVMNEDGDWEIVAREEGVFGKISCVFTLEESRRALREEIAPRVIERVRRVNPDLAVVGTIVDELGLILGPMIHEKTGVPTLAVYGDPWGAPDGDAVGAPYCVAEEYPNCVHVDVGAMAVVTPIRDGRPDFGDAVVSVGTFPLDLAARELLGKEYDEGGKKAAEGEVDENFRRELRSVDVDGKPVFGRVRGSLAPVPPEQERVLRDHIRDAGAPAEDVLRTLVELVAETIVINAAQYDMDLLVLSGGGVKNELLKRRVSELWEGDVSIFAGEELEARGLCLLGLRYLEGEPVPALPCEG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PREDICTED MOLECULAR CHAPERONE DISTANTLY RELATED TO HSP70-F O
publication title Structural Characterization of the Ribonuclease H-Like Type Askha Superfamily Kinase Mk0840 from Methanopyrus Kandleri
pubmed doi rcsb
source organism Methanopyrus kandleri
molecule tags Transferase
total genus 92
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A02
3.30.420.430 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A01
4B9QA 5JMVA 4BRLA 1JCEA 3ID8A 3C0BA 1NBWA 3WQUA 2F9TA 3B8AX 5FPNA 2HF4A 3CERA 4FWQA 3WQTA 4CI6A 2WUSA 1BG3A 1C0GA 2Q2RA 3QMLA 3WT0A 4XH4A 3VOVA 3LDOA 1NGHA 3M6GA 4RWTA 3UE5A 4DHYA 5JICA 5AQVA 1U2VB 4MO4A 4RCHA 4BGBA 4YDUC 1V4TA 2A41A 1U2VA 2HMPA 3FR0A 4CZJA 3U8XA 4M63C 4K42A 2CGLA 3VPZA 2YJEA 5F0XA 4IXCA 3CQXA 4XH1A 2E20A 2Q0UA 1HKCA 2D0PA 4BC5A 1T6CA 1HX1A 3FGUA 3VEOA 4FWMA 5AQRA 4Y0WA 3QDKA 1EQYA 4FPAA 4Z94A 3DWLA 1YUWA 5AFUH 2V52B 4C23A 1BDGA 1BA1A 3UKUB 4IO8A 4CZMA 2ZGYA 2Q0RA 3MCPA 3OHRA 4IWVA 5KQ8A 5BREA 1LOTB 1KAXA 4KBOA 1MWMA 2AP1A 3WEEB 3UKUA 2J4RA 5BR9A 3H6EA 4O8KA 4JD2B 3EN9A 5BN8A 2QWLA 3H3OB 3H1VX 3WEEA 3SMSA 4FOIA 2PBDA 2IVNA 4JD2A 3FZFA 3KHYA 3A5LC 2P9KB 3VEZA 4CZLA 3BF1A 5AQQA 3RSEB 4BRIA 3D2EA 2CGJA 1DGKN 2ITMA 4EFHA 4HWIA 2QW9A 2HOEA 2P9KA 4FWKA 3VEVA 4CZIA 1XQSC 5BPMA 3HSCA 4FWNA 3RSEA 4WQ5C 4EIAA 3GOIA 3GG4A 4WQ4C 5ADXA 4H0VB 2P9SB 5AQWA 3ZX0A 5AQOA 2P9PB 2F9WA 2ASPA 1GLDG 1R59O 3LM2A 3GDQA 1JCFA 2P9SA 3WXIA 4B1UB 1C0FA 2P9PA 2KHOA 1MA9B 3ENHA 1H1VA 1KAZA 3H3NO 3SLCA 3VGMA 5BRHA 2ZGZA 3L6QA 1YVNA 2FLOA 3L0QA 4O5FA 2YJFA 3MN7A 3FZKA 2A5XA 3KZBA 4FWOA 2V7YA 4B1XB 4QS9A 1ZC6A 3FZLA 1RDWX 4FSVA 5AQPA 5ADXH 1NGBA 2YHWA 4A2BA 3GBTA 4CJ7A 2E2PA 3O5BA 3LDQA 4WYBA 2ASOA 2PAVA 3BUZB 4JN4A 4BR2A 5AQKA 4B1WB 5FPDA 3CQYA 3U9DA 3R8EA 3VENA 5BPNA 2BTFA 1BWFO 2P9UB 3SK3A 5KQDA 4A2AA 2D0OA 1U6ZA 3MN6A 3BEXA 2P9UA 3M1FA 1TUUA 5AFUA 4NB4A 4QS8A 2P9IB 4IJNA 3U9ZA 4DCHA 4PL7A 4MO5A 3JXUA 3D2FB 1RFQA 3I33A 1SAZA 1WUAA 5AQMA 2ZWHA 2BUPA 1T6DA 4H0YB 4EHUA 1X3NA 3O1WA 4IJAA 3MK6A 5AZJB 3MN9A 2AA4A 5JLFA 5AQUA 4BRGA 3QBXA 5LJVA 1ATSA 3IDHA 4NO7A 1NGIA 1MDUB 3CJ7A 4ISGA 1SQKA 5F1XA 1E4FT 2A42A 1NWKA 2NRHA 5AZIB 4CD1A 3L4IA 5AQSA 3S41A 3DXKB 4H0PA 1HUXA 3MMVA 2H3GX 2QWPA 3A0IX 4I6MB 3VESA 3H46O 2CH6A 2NZTA 2UYTA 5AZIA 1MWKA 3WXJA 3DXKA 1QZ5A 1HJOA 3MDQA 3QFPA 3R6MA 1YAGA 2HF3A 3J8AA 4L3QA 5F2RA 3BF3A 3EKUA 4BC3A 4CZHA 3QBWA 1GLFO 4DQ8A 3BP8A 2V51B 1HLUA 1KXPA 3ZETB 4PKIA 3G25A 2NLXA 5ELZA 5AQXA 1G99A 3F9MA 2GEMA 4H5VA 4FL9A 3W3DA 2QXLA 3ATVA 3ZETA 3A5NC 3IMXA 4CBUA 3CI5A 1OKJA 3O08A 1NGEA 3CJ1A 3MN5A 3IFRA 1XC3A 1QHAA 5AQNA 5BRFA 3O6WA 4BR7A 2ASMA 4A62A 2W40A 4ISEA 3IUCA 4E1JA 3VF4A 4H5WA 1NM1A 1D4XA 1LCUA 4BR0A 4BC4A 4YDUA 3VERA 2A6AA 3FZHA 5EVZA 3DAWA 2W41A 4BQLA 5EOYA 1GLLO 3H45C 4PKGA 2Q97A 4BRHA 2YHYA 5JLHA 1NGGA 1V4SA 5FPMA 5EXWA 4H5RA 2GWKA 2P9NB 1GLBG 4BRQA 4BREA 4XEIA 2VYPA 3W0LA 3LM9A 3CJ9A 4K25A 2FSNA 1ZBSA 4AM6A 2VWBA 2P9NA 4JHDB 4AM7A 3WXLA 4BC2A 3AAPA 4BRNA 2D1KA 2A3ZA 4CZFA 1IJJA 3HM8A 4PKHA 3VEXA 3UKRB 2Q31A 4CZEA 4JHDA 1TYQB 5EY4A 1QQOA 4BRAA 4BR4A 4B1ZA 5E84A 3UKRA 2Q36A 2YHXA 5LY3A 1TYQA 4FOEA 2P9LB 3CJBA 4BR9A 3A5OC 1BOTO 3GL1A 5E26A 1GLCG 3A5MC 3TU5A 1NGFA 3D7EO 4WQ5A 2DPNA 4JAXA 3HZ6A 1Z05A 4WQ4A 2E2NA 2P9LA 1KAYA 2I7NA 2I7PA 2V7ZA 3CETA 3R9PA 4CD3A 1YXQA 4FWPA 1NLVA 1ZXOA 2Q1NA 4BVOA 1QQNA 4JNEA 3HBTA 4PL8A 2ZF5O 3AARA 4BVPA 3M3ZA 1E4GT 5AQTA 3ZX2A 3O4WA 4BRFA 2P9IA 3ZEUB 1S22A 3CIPA 3CJAA 1DEJA 1X9JA 3D2FA 4H03B 1QQMA 3ZX3A 1NGAA 4BRPA 1RGIA 4H0TB 2FF6A 4H0XB 3ZEUA 2FSJA 5AZJA 1Q18A 2GWJA 5BRDA 1BU6O 3U4LA 3WUHA 3LL3A 4H0OA 2QWQA 4BRCA 4FWSA 4FPBA 3ULEB 3UB5A 4BQZA 1Z6RA 5AQLA 4EAHD 3AY9A 4FO0A 2CGKA 2EWSA 5AQFA 2YI1A 3QFUA 3WXKA 4I6MA 1HKBA 4CZKA 1BA0A 2IIRA 3ULEA 3H1QA 4HTLA 1BO5O 5KPZA 2OANA 3VEWA 3I8BA 4LC9B 3VF6A 4DB3A 5I9EB 1J6ZA 4M7YA 3GE1A 3O8MA 4B1YB 4CBXA 2E2QA 3SJHA 4H5NA 2GTDA 2CH5A 3CJCA 3VF2A 1DKGD 4FWLA 5AR0A 4FWRA 4BRDA 1BUPA 4A61A 2GUPA 1QZ6A 3EZWA 3HI0A 3DXMB 1JCGA 5AQZA 4MLHA 5KPTA 3QB0A 3HTVA 4BRKA 2A40A 3O1BA 4BG9A 4ISFA 1CZAN 4M7XA 1Y64A 4GNIA 1S3XA 1SZ2A 2E1YA 1GLJO 3DXMA 5EX5A 5TKYA 4F9OA 5BN9A 4K41A 2GELA 4BRMA 1ATNA 4BGAA 3JS6A 3DJCA 2D4WA 3D2EB 3ATUA 3FLCO 2E2OA 5AQHA 1WOQA 1T44A 4B1VA 4K43A 5FPEA 1NGDA 4QS7A 3AAQA 3LDNA 2QWNA 1ATRA 2E1ZA 3VEYA 2FXUA 2QWMA 2E88A 1TUYA 2YCHA 1GLEG 4RTFD 5AQGA 1K8KB 2VCPA 3VGLA 2IVOA 4BR5A 1NGCA 3FFKB 3EKSA 1IG8A 3VETA 5BPLA 3LDPA 4J8FA 3QICA 1K8KA 5B8HA 3P4IA 1HPMA 1P8ZA 3A8YA 3LDLA 4IZ9A 2IVPA 1NMDA 1HKGA 2QWRA 2FF3B 3TPQA 4H5TA 2QWOA 3O80A 4XH5A 5LJWA 5AQYA 4CZGA 3FE1A 1XUPO 2QM1A 4MLEA 3EL2A 1ESVA 5AQIA 3SMPA 4BROA 1GLAG 1NGJA 5AQJA 4GY2B 3CHWA 3VGKA 4BG8A 3FZMA 5CE3A 4CBWA 3C7NB 2E8AA 3EO3A 3KVGA 4EHTA 1X3MA 3ENOA 5KPRA 2FSKA 3C7NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4NA 4BRLA 3C0BA 3ZSWA 2OTLN 2F8SA 3HVRA 3L3VA 1D8YA 5FPNA 3CERA 3JAMO 3VQ7A 4CI6A 3THYA 1Q82O 3OJUA 4ID1A 3WT0A 3QNOA 2YNFA 4YOYA 4FLVA 4ICLA 3O9QA 4RWTA 1J5OA 3UE5A 3KK7A 2OZMA 4B08A 4MO4A 4RCHA 4I2QA 3VQ4A 3CM5A 2A41A 3OW2M 3KD5E 4FJ8A 4J2AA 2YHBA 4M63C 3IKMA 4MDBA 3VPZA 4E7IA 4JK8A 3CQXA 4DF8A 4U7BA 1HKCA 3I55N 1WNSA 1RBUA 3VEOA 1TKDA 3SBTA 3PSIA 4Y0WA 1LW2A 4C23A 1E3MA 3CFOA 3UKUB 1JLEA 1C0UA 1HRHA 4BACA 3OY9A 4IBNA 4B9NA 4RW9A 1IG9A 4IWVA 3WEEB 1MWMA 2AP1A 1WSHA 2J4RA 2W42A 1Q8IA 4O8KA 3A2FA 4JKFA 4NLCA 2EHGA 4KHSA 4JI6K 1XNQK 4DTSA 4CF1A 1R0AA 4FOIA 2OTJN 4R79A 4KRFA 3A5LC 4RW8A 4B3TK 4JEPA 3HO1A 4CW7B 3BF1A 3H08A 5D3GA 1DTQA 3ITHA 2P9KA 4CZIA 1XQSC 3AA5X 4FWNA 1BL3A 1B9FA 3GG4A 1VQ7N 2YKNA 1KVBA 5KRTA 3MX5A 4OKKA 2P9SB 5AQWA 4E3SA 3L2QA 5AQOA 2P9PB 5IWAK 4FLYA 1QSYA 1A5WA 4B3RK 3QETA 5C24A 1XMQK 3MECA 3KLEA 2XO7A 3ENHA 4W5RA 1CZ9A 3VGMA 1LWEA 4HUFA 2O8BB 1YVNA 3L0QA 3SQ0A 3WNGA 4O5FA 2YJFA 4CIEA 1D9FA 3KZBA 4K0KK 4DTUA 3LANA 4QS9A 1KFSA 1IH7A 4DTPA 5C2FA 4CCHA 1BI4A 5ADXH 3AVAA 3OYEA 1NG9A 1ZBFA 2X74A 2ZE2A 3BUZB 3K58A 2BGGA 5AQKA 4GKJK 3PIPL 3K57A 3VENA 5BPNA 2BTFA 1DLOA 4DV4K 2P9UB 3LAMA 5KQDA 1VQ8N 1T03A 4FLTA 4TSXA 3E66A 1HYZA 2A1SA 3BEXA 3RRGA 1TUUA 3SQ2A 2G8HA 4QS8A 2D0CA 4IJNA 2B6AA 3JXUA 2WC9A 3E9OA 3I33A 1SAZA 5J2QA 4JI7K 2BUPA 1T6DA 3M8QA 4YHHK 4IJAA 5AQUA 5KRSA 5LJVA 4O4GA 5F1XA 4ISGA 2WTUA 4DFJA 4IOAL 4OKEA 4H0PA 3AGRA 4WFNL 3L2UA 3P31A 2H3GX 1DTTA 1RT5A 1HNXK 4JLHA 2UYTA 1X9WA 4PA1A 1OH6A 1TAQA 4HCBA 1HYSA 1QZ5A 4I2PA 4FJ9A 2W6KA 1S72N 3R6MA 2HF3A 3J8AA 4L3QA 1KVAA 3EKUA 4DQ8A 3QBWA 4O44A 3ZETB 1C6VA 4PKIA 4B9SA 3OYMA 4FLWA 1WB9A 4CJVA 5CZ2A 3VQ9A 2QK9A 4CHOA 3CJ1A 3J7AP 3IFRA 1KRPA 3OYNA 5AQNA 5CY4A 2O8EB 4PQUA 2W40A 1JXEA 4E1JA 2Y1JA 1C1BA 3FZHA 5EVZA 1W0HA 3DAWA 4M3UA 1KTQA 3L2WA 1WSEA 5EOYA 2PYJA 2UXDK 1XNRK 4KO0A 5LMNK 5GAHP 1TKXA 1XHZA 4KTWA 1YITN 4E7JA 3AVGA 1HQEA 5EXWA 4CHZA 1XC9A 2P9NB 1U48A 2G8UA 4DFMA 4F4KA 3N4PA 4DFKA 2VYPA 3W0LA 1REVA 3HL8A 4JHDB 5CZ1A 1JLGA 5HRRA 3RR8A 4OPAA 1IJJA 2RKIA 3HM8A 4PKHA 4B9TA 3MEEA 4J2BA 3VQDA 2Q31A 4CZEA 1TYQB 3L4QA 3K5LA 3KK2A 5EY4A 4GVEA 4Z4IA 4CF0A 4DV6K 1I3AA 3P39A 3SJJA 2P9LB 3CJBA 3GL1A 5E26A 1GLCG 3TU5A 3M5RA 3ZT1A 4CFBA 4WFBL 3NDKA 2DPNA 3NH2A 3R9PA 1BGXT 4CD3A 1NMNA 1YXQA 4JKBA 2BE2A 2Q1NA 3PX0A 3HBTA 1L3SA 2P5GA 1VK0A 4N41A 4BVPA 3O9UA 3ZX2A 2ZJRL 1NK9A 2E5LK 4RG8A 2P9IA 4DTRA 2QI2A 1S22A 1NNEA 2KLAA 3D2FA 2E6LA 4LSLA 4HTUA 3AVMA 3MWPA 3T3FA 3AVKA 3J81O 5BRDA 1BU6O 4ELTA 2QWQA 3NVKA 3SV4A 3ULDA 3KLGA 4RW6A 3UB5A 1Z6RA 5AQLA 3AY9A 5KTQA 1LAWA 4KH6A 4AF1A 3KTQA 3IG1A 2FBYA 2EWSA 5AQFA 5J2MA 3H1QA 1WSIA 4HTLA 4JRPA 3DI6A 3I8BA 4LC9B 3GE1A 4CBXA 3HP9A 2I5JA 3C6AA 2YHAA 4FWRA 1ASVA 3I56N 4CJRA 4RW7A 5AQZA 4MLHA 2KZZA 4BRKA 1CZAN 3E9PA 1Y64A 4GNIA 4F9OA 4M3RA 4OGEA 4BGAA 4LF7K 3TAMA 3DJCA 1IBKK 1B92A 2D4WA 3D2EB 3ATUA 1ZBLA 1VQNN 1QS4A 5AQHA 3HT3A 1WOQA 3PLAA 1N6QA 1T44A 4K43A 3O3HA 4LF6K 2JWKA 2F7TA 1FXXA 3DOKA 4DR5K 3TSUA 1K8KB 4CECA 1W9HA 1VQKN 3EKSA 4LF4K 3KD1E 3KWIA 3QICA 1WAFA 3NF8A 1HPMA 1P8ZA 2PZSA 2YV0X 2BDPA 3O9RA 1F21A 2FF3B 5HRSA 4A5BA 2QWOA 4M42A 3O80A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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