4BG9A

Apo form of a putative sugar kinase mk0840 from methanopyrus kandleri (orthorhombic space group)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
LTRVLGIQLGNTGTDYCVMNEDGDWEIVAREEGVFGKISCVFTLEESRRALREEIAPRVIERVRRVNPDLAVVGTIVDELGLILGPMIHEKTGVPTLAVYGDPWGAPDGDAVGAPYCVAEEYPNCVHVDVGAMAVVTPIRDGRPDFGDAVVSVGTFPLDLAARELLGKEYDEGGKKAAEGEVDENFRRELRSVDVDGKPVFGRVRGSLAPVPPEQERVLRDHIRDAGAPAEDVLRTLVELVAETIVINAAQYDMDLLVLSGGGVKNELLKRRVSELWEGDVSIFAGEELEARGLCLLGLRYLEGEPVPALPCEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PREDICTED MOLECULAR CHAPERONE DISTANTLY RELATED TO HSP70-F O
publication title Structural Characterization of the Ribonuclease H-Like Type Askha Superfamily Kinase Mk0840 from Methanopyrus Kandleri
pubmed doi rcsb
source organism Methanopyrus kandleri
molecule tags Transferase
total genus 92
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A02
3.30.420.430 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A01
2QWLA 3UKRB 3MN9A 4JHDB 5JMVA 4CZMA 2CGKA 4CD3A 2YJFA 2CGLA 3AAQA 4FOIA 4EHUA 3HTVA 2W41A 3WQTA 3ENOA 1Y64A 3TU5A 5JICA 5AQOA 3O08A 4B1VA 3W0LA 3L6QA 4CZJA 1LOTB 3EN9A 1TYQA 4IZ9A 4BRAA 4CBXA 3U9DA 2E1YA 4JD2A 4BRQA 3MCPA 5AQVA 1ZBSA 1DGKN 3G25A 2I7PA 4BRMA 2I7NA 3H6EA 4EIAA 3VF6A 4LC9B 3BF3A 3C7NB 3HZ6A 4H03B 4NO7A 3VEOA 3CERA 4BRIA 4FWSA 2Q1NA 2YI1A 4L3QA 4FWPA 3W3DA 4BRNA 3VPZA 3O4WA 3QB0A 1BU6O 4BR9A 3A5MC 2QWNA 2OANA 2V51B 2J4RA 3BF1A 4MO4A 3UKUB 4M63C 3SLCA 1YVNA 4M7XA 4XH1A 5EX5A 4J8FA 3GDQA 4BRDA 3IFRA 5BRFA 2Q2RA 4BR5A 1HLUA 5ADXA 3FLCO 3O1BA 4YDUC 2EWSA 1MDUB 1HPMA 3LDNA 1NWKA 1YAGA 5JLHA 1NLVA 1OKJA 4IO8A 5EXWA 4BRLA 4BRCA 1QZ6A 5KPRA 3C7NA 5AR0A 2P9PB 4H0OA 1GLFO 1NGBA 4H5RA 5AQLA 4H5NA 1QQOA 4CZKA 4CZFA 2YCHA 2Q0UA 3CJ1A 3D2EB 3FZMA 4HTLA 4PL8A 1T6DA 5BPMA 4K43A 3IMXA 1DEJA 1JCEA 1XC3A 5F0XA 3EZWA 3QICA 1LCUA 2E20A 3ENHA 1NGFA 1J6ZA 1NGCA 2QWQA 2A6AA 3AARA 4CI6A 1HKBA 4BROA 4FWRA 5AQIA 5FPMA 1HX1A 2PBDA 4PKGA 4DCHA 3L0QA 1BO5O 5BN9A 2P9PA 4JAXA 3A5OC 3BEXA 4PL7A 3ULEB 3QFUA 4DHYA 3HSCA 3DWLA 3EKUA 5AQHA 2P9KA 4IJNA 1X9JA 3FZLA 3R9PA 5AFUA 1QHAA 3QMLA 1GLJO 1SAZA 1QZ5A 3A5LC 5AQRA 2GWKA 3FR0A 3CQYA 1HKGA 1QQMA 3VEYA 3OHRA 3U4LA 3D7EO 5AZIB 4CD1A 1HJOA 3O80A 3SK3A 3MK6A 2F9TA 4YDUA 4CBWA 4BRHA 3EL2A 3GG4A 1TUUA 4NB4A 5TKYA 5BRHA 3MDQA 3WXLA 3L4IA 2H3GX 1TYQB 5AQNA 4BRKA 4JD2B 3IDHA 3LDPA 2IIRA 4AM7A 4BC4A 4M7YA 1IJJA 1MA9B 2FXUA 3ZX2A 4Z94A 4KBOA 4O5FA 4H5WA 3CHWA 1H1VA 4A2AA 2Q97A 5AZIA 5LY3A 3LDQA 2AA4A 4BVOA 3QBWA 4FWMA 4FWOA 4FL9A 1NGGA 1YUWA 3EKSA 2CH5A 4H0TB 4FPAA 5I9EB 5AQYA 1BA0A 4XH4A 3P4IA 3ATUA 1BOTO 3SJHA 5AZJB 3LM2A 3M6GA 3ZETA 4BQZA 5BR9A 2GUPA 1NGHA 3TPQA 3GBTA 3WUHA 3WXIA 2CGJA 4MLEA 4RTFD 2IVNA 1ATNA 2E2OA 3CJAA 2W40A 2A5XA 4A2BA 2D4WA 4B1YB 3LDLA 2Q31A 4EHTA 1BWFO 5AQKA 3FZKA 4A62A 3VEZA 4WYBA 3DAWA 1V4TA 3WQUA 1S22A 4FWLA 1C0GA 3MMVA 5AZJA 5B8HA 3A5NC 1V4SA 2ITMA 2YJEA 5BRDA 1K8KB 2YHWA 3FE1A 2GEMA 1ATSA 2ASPA 3H3OB 3RSEB 3LDOA 4XH5A 4CZEA 3ZEUB 3C0BA 3DXKB 2F9WA 3QFPA 2A41A 3H3NO 4IXCA 2P9KB 1HKCA 1KAXA 1E4FT 1ESVA 1T6CA 4EFHA 4FPBA 5LJVA 4ISFA 3U8XA 3R6MA 1KAYA 3H46O 3J8AA 4K41A 2QWPA 5F1XA 3UB5A 1Z05A 3I33A 1HUXA 3BUZB 3CETA 4B9QA 1GLCG 3ZX0A 1SQKA 3GL1A 4BR0A 5BREA 2P9LB 1ZXOA 3ATVA 4WQ5C 1K8KA 2Q0RA 2P9UB 3U9ZA 1SZ2A 3RSEA 5AQPA 4GY2B 5ADXH 2IVPA 5AQQA 4BR7A 3ZEUA 3DXKA 2GELA 3H45C 4CJ7A 3VGMA 2QWMA 5ELZA 3QBXA 5AQJA 3FZFA 5AQZA 4DB3A 2P9SB 1BUPA 1TUYA 3I8BA 1RDWX 1NBWA 4RWTA 2BTFA 4CZHA 1R59O 2YHXA 2D0PA 4BG8A 3CJ9A 4WQ4C 4CZLA 5LJWA 2ZF5O 2FSJA 3WEEB 5KPTA 1GLDG 2QXLA 2ASMA 4MLHA 1ZC6A 3HBTA 2GTDA 3SMSA 4K25A 1WUAA 2NRHA 3DXMB 2P9LA 2P9UA 1E4GT 3D2FB 3GOIA 5KQ8A 2BUPA 4BREA 3FGUA 4H5TA 1Q18A 5AQSA 2P9SA 4B1ZA 2QWRA 3FZHA 3CQXA 1NGEA 3O1WA 1RFQA 3WXKA 3ZETB 1IG8A 1CZAN 5E84A 5KPZA 3F9MA 2PAVA 1KXPA 3WEEA 3LL3A 5FPDA 4BQLA 1KAZA 4FWKA 3DXMA 3ZX3A 2E2PA 1P8ZA 2E2QA 4BRFA 4PKHA 3WT0A 1T44A 3D2FA 4FWQA 4BGBA 3HI0A 3R8EA 3VERA 4ISEA 1RGIA 1U6ZA 4QS9A 3AY9A 1MWKA 4EAHD 4IWVA 4QS8A 3A0IX 4WQ5A 3M3ZA 4QS7A 3VF2A 4DQ8A 4H0YB 2QWOA 5AQXA 1X3NA 5EOYA 2NZTA 1X3MA 4RCHA 2VWBA 3EO3A 2A3ZA 1YXQA 2ZWHA 3KVGA 2FF6A 3JXUA 5AQTA 3ID8A 5EY4A 4IJAA 5AQWA 2GWJA 3S41A 4F9OA 4FSVA 5AQGA 4HWIA 4FOEA 4O8KA 2P9IB 4WQ4A 1U2VA 3VOVA 1GLLO 1XUPO 4B1UB 3VGLA 3LM9A 3FFKB 2HF4A 1EQYA 3DJCA 4H0XB 3UKRA 1NGAA 3SMPA 4AM6A 1JCGA 4JHDA 2VCPA 5F2RA 1MWMA 4BC2A 4BRGA 1QQNA 2E88A 3BP8A 2A40A 2WUSA 2E8AA 5AQFA 3KZBA 4I6MB 2DPNA 3H1QA 4B1XB 2AP1A 2HMPA 1NGIA 2V52B 3MN7A 4GNIA 2P9IA 1BDGA 2NLXA 4BGAA 3CJCA 3JS6A 2P9NB 2HF3A 1GLEG 3CI5A 4CZIA 3AAPA 3CIPA 2QW9A 2FSKA 3O5BA 2V7YA 4C23A 2D1KA 4E1JA 5BN8A 1GLBG 3VEXA 3O8MA 4BR2A 4MO5A 3UKUA 2KHOA 2A42A 5BPNA 3VEVA 5FPEA 4I6MA 5AQUA 4BVPA 2ZGZA 1JCFA 1GLAG 1NMDA 2FF3B 4FO0A 5KQDA 4CBUA 3MN5A 2P9NA 3VEWA 1NGJA 2CH6A 2VYPA 4K42A 5E26A 4FWNA 3H1VX 1WOQA 4H0PA 4ISGA 5EVZA 3HM8A 1XQSC 2V7ZA 4Y0WA 2ASOA 5FPNA 1ATRA 1BA1A 1S3XA 2FLOA 4CZGA 3B8AX 4JNEA 4BR4A 3GE1A 1NM1A 3VENA 3WXJA 3D2EA 4BC5A 1BG3A 5CE3A 2HOEA 2UYTA 2D0OA 2E2NA 3O6WA 3CJBA 3KHYA 5AQMA 2ZGYA 1NGDA 3VGKA 3IUCA 4JN4A 4A61A 4BG9A 4BC3A 4B1WB 2FSNA 1D4XA 4XEIA 3A8YA 3CJ7A 1DKGD 2IVOA 4H5VA 4BRPA 2YHYA 3ULEA 3M1FA 5JLFA 3VETA 5BPLA 5AFUH 2E1ZA 3VF4A 3MN6A 1G99A 3UE5A 1U2VB 2Q36A 3QDKA 4PKIA 3VESA 4H0VB 2QM1A 1Z6RA 1C0FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T1YK 1XMQK 3OYNA 2QKBA 1F21A 1RT1A 4CHQA 2F8SA 3V1OA 4F3OA 5J2PA 2NRVA 4KV8A 4DTJA 2YJFA 3KLFA 3SQ4A 1U4BA 1N34K 3ENOA 1Y64A 4ICLA 5JICA 4OKEA 4DQPA 3O08A 2PYJA 1NOZA 4FZXC 3W0LA 3AVNA 1IBLK 3MEEA 3HPOA 1OH6A 4C8KA 1TYQA 1X9SA 2E1YA 4K8ZA 3MCPA 3M8SA 1ZBSA 3CYMA 5GIOA 2O8BA 3VF6A 3DRPA 1VQ8N 4FWSA 2Q1NA 3W3DA 4FWPA 4DTXA 4BR9A 5GAHP 2OANA 2J4RA 4FJNA 4JKDA 4M63C 3SLCA 4CIGA 4DR7K 1RT2A 1XNQK 4XH1A 5EX5A 4M3ZA 1QHTA 1VRTA 4J8FA 2YHAA 4KHYA 2HW3A 3IFRA 5BRFA 1JL2A 4DV3K 3AVKA 3FLCO 3K57A 4JKAA 1MDUB 4HCCA 1YAGA 1OKJA 4E0DA 4IO8A 4BRCA 1VQNN 5HRPA 1ILYA 1TAQA 3NGYA 4H5RA 3VQ5A 4U67L 4IO9L 1VQ7N 4CHOA 2X6SA 1NG9A 4CZKA 3AVJA 4DG1A 2X74A 3DRRA 1VSKA 3NDKA 2GUIA 1LWCA 2YCHA 4DSIA 3D2EB 4BE0A 1T6DA 1IBMK 4K43A 1RDAA 3NAEA 4CFDA 1YJWN 2E20A 3TAFA 1EP4A 1TVRA 1J6ZA 3DLEA 5D3GA 2B4JA 4K0KK 3I0SA 3NHGA 1SL2A 1L3VA 5FPMA 1IV0A 3AO5A 3DLBA 5BN9A 2P9PA 4CIFA 3QLHA 3KD5E 1KTQA 1FKPA 1XMOK 3O9RA 1K6YA 5DM7L 3HSCA 4AHSA 2KW4A 3LZJA 2FBVA 4RG8A 5AQHA 1X9JA 5K14A 2KZMA 3R9PA 5AFUA 1BIZA 3E01A 3A5LC 4OPJA 1RBVA 2QI2A 3CFPA 4CK2A 2GWKA 2ZQBA 4JI0K 5C0YA 3FR0A 1QQMA 4X64K 1JLAA 1OVQA 3MAQA 3OHRA 3WNGA 4CD1A 4BDZA 1HJOA 3SK3A 4BE2A 4YDUA 4DTNA 4CBWA 1U47A 1VSMA 3S9HA 3EL2A 3GG4A 4G1QA 5BRHA 5TKYA 4KTZA 3MDQA 3CCEN 1JLEA 3G6EN 2YKMA 4L8RB 4LF9K 2E5LK 3ZSZA 5C2DA 4I9QA 4CGIA 3RRHA 4LFAK 4BC4A 4JK8A 3C6AA 1SUQA 2P5OA 1NK6A 3LWLA 1UWBA 3Q7CA 3QEPA 5LY3A 1HRHA 3LDQA 3O4QA 4JI1K 3OYBA 3J7AP 2WBNA 4FL9A 4A59A 4GV9A 4Z4IA 3EKSA 3VQEA 1JLBA 4A57A 4XH4A 1B9DA 4WFAL 3NGIA 3TAMA 4FJHA 1RT7A 3SJHA 4KO0A 3M6GA 1N6QA 3E66A 4BQZA 4EZ6A 4JV5K 5BR9A 1NGHA 3CF5L 4WFNL 3OJSA 3WXIA 3KLHA 2CGJA 4RTFD 3AVLA 2E2OA 4NYNA 4DLGA 1A5VA 3C95A 2VWJA 3HRGA 4N47A 2A5XA 3HSTB 4FVMA 3VQ8A 4KHNA 3DOLA 4E7JA 4B1YB 4DV7K 2O8EA 1M90O 5H1SQ 4EHTA 1BWFO 3DLLL 1J5EK 1K8AO 3P83D 5B8HA 2O4GA 2YJEA 5BRDA 3EEQA 3WNEA 3HXMA 1JLGA 4ELVA 4Z4GA 1D5AA 3T1HK 3LDOA 3ZEUB 3DXKB 1Z26A 2F9WA 2IDOA 3QFPA 3TAEA 1YITN 5A2QO 4FJIA 3KK1A 4JKGB 3OBYA 4JKBA 4KPYA 1VHXA 3H08A 4DR5K 1KAYA 1YTUA 2YX6A 1TK5A 2QWPA 4OKKA 1RBUA 3HL8A 3BUZB 2Z1GA 3I33A 3MXIA 4CHPA 3SUQA 1IKVA 3GL1A 5BREA 3ATVA 4WQ5C 1OH7A 3RSEA 3C94A 2I5JA 2IVPA 1S5JA 4BR7A 4DSLA 3LANA 1RT3A 5CR4A 2QWMA 5CZ1A 5M1KA 3OS2A 3DMJA 3FZFA 2P9SB 3O4NA 3M5RA 2Z1JA 3CFRA 3PX6A 2BTFA 4CZHA 3C6UA 3EY1A 3CJ9A 4M3WA 3HBTA 3TSPA 3EE8A 3PO4A 4OKJA 3CQ8A 3QEIA 1RNHA 2P9LA 2P9UA 1E4GT 3A2FA 3D2FB 3OS1A 3GOIA 5KQ8A 4PA1A 1N5YA 1ZYQA 4B9TA 4ELUA 3HYFA 3VA3A 4BREA 4YHHK 3ZYYX 3FGUA 3CCSN 1JLQA 4B1ZA 1A5XA 3CG7A 1TV6A 3AVFA 5JVGL 5KGWA 3ZETB 1KFSA 5E84A 3NGZA 3TI0A 3WEEA 3LL3A 4JRPA 4BDYA 3SQ2A 4BE1A 4BQLA 1KAZA 3NVKA 4NCAA 4OJRA 4BRFA 4PKHA 3KD1E 2O8CB 1ASVA 4DLEA 4ILHA 1UA1A 1RGIA 1U6ZA 3AY9A 4QS8A 3VQQA 3J81O 2G8VA 2ZD1A 4PQUA 5AQXA 1NK8A 3O9QA 5EOYA 1NJIO 1X3MA 2VQFK 2ZWHA 1YXQA 3KVGA 4CEOA 4CJFA 5AQTA 3ID8A 2O8FB 4KI4A 2BGGA 3KWIA 1QSSA 4NLCA 4J2EA 1I3AA 4O44A 3V1RA 4HWIA 1BQMA 4FOEA 4O8KA 4WQ4A 4LF6K 4JLHA 4LF4K 3NF6A 4CGGA 2HHXA 4ZHRA 1BISA 3DJCA 3ZSOA 1KLNA 3SMPA 5F2RA 1MWMA 1BCOA 4M3UA 3LPTA 3HP9A 3AVAA 4HUFA 2WUSA 4M3XA 3KJVA 3BZKA 1NK7A 1NK9A 1NGIA 2XY5A 3MN7A 4GNIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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