4BG9A

Apo form of a putative sugar kinase mk0840 from methanopyrus kandleri (orthorhombic space group)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
b'LTRVLGIQLGNTGTDYCVMNEDGDWEIVAREEGVFGKISCVFTLEESRRALREEIAPRVIERVRRVNPDLAVVGTIVDELGLILGPMIHEKTGVPTLAVYGDPWGAPDGDAVGAPYCVAEEYPNCVHVDVGAMAVVTPIRDGRPDFGDAVVSVGTFPLDLAARELLGKEYDEGGKKAAEGEVDENFRRELRSVDVDGKPVFGRVRGSLAPVPPEQERVLRDHIRDAGAPAEDVLRTLVELVAETIVINAAQYDMDLLVLSGGGVKNELLKRRVSELWEGDVSIFAGEELEARGLCLLGLRYLEGEPVPALPCEG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PREDICTED MOLECULAR CHAPERONE DISTANTLY RELATED TO HSP70-F O
molecule tags Transferase
source organism Methanopyrus kandleri
publication title Structural Characterization of the Ribonuclease H-Like Type Askha Superfamily Kinase Mk0840 from Methanopyrus Kandleri
pubmed doi rcsb
total genus 92
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A02
3.30.420.430 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bg9A01
1QZ6A 2W40A 1WOQA 3WXLA 4RCHA 1NLVA 3FE1A 4BG9A 4FWSA 5AQIA 1U2VA 3JS6A 4ISEA 3CJAA 4FOIA 4FWOA 3O80A 4H5VA 4PKGA 1D4XA 1SQKA 1WUAA 1RDWX 2A42A 4C23A 3GDQA 3ATVA 1MDUB 1QHAA 3DAWA 1T44A 5AQFA 1GLJO 4M63C 4FL9A 3UKUB 4BC4A 2NLXA 5AQWA 3VF6A 1G99A 3BF3A 3A0IX 3D2FA 3O5BA 2YJFA 4CZEA 2P9UB 1GLFO 2HOEA 3WQUA 1ATRA 1KXPA 4XH4A 3VEZA 1GLDG 1BOTO 1OKJA 5KQDA 1P8ZA 3KZBA 1XQSC 2ZF5O 5ELZA 4DB3A 4FO0A 4EHTA 3MMVA 2IVPA 1NGAA 2QM1A 2E2PA 3H6EA 4H0PA 2A5XA 3ULEB 1NBWA 1R59O 4LC9B 2QWMA 2YJEA 1K8KA 3U8XA 4CJ7A 5KQ8A 1XC3A 3ZX2A 4XH1A 4BRMA 3GOIA 3ULEA 5LJVA 1BUPA 2P9SB 3FZHA 3RSEA 2QWQA 2HF4A 3SK3A 5BN8A 1JCGA 2P9NA 2PAVA 4QS8A 3MN7A 3ENHA 4CZKA 5ADXH 2V52B 4B1UB 1NGBA 4FWPA 3CETA 3O6WA 1RFQA 3L0QA 2P9LA 3HZ6A 4NB4A 3A5NC 3FR0A 4AM7A 4EFHA 3CQXA 3EKSA 4H0YB 4QS9A 3O1WA 4ISGA 4JHDB 2QW9A 3CI5A 3GE1A 4CBUA 4CI6A 3WT0A 1NMDA 1NGIA 1S22A 4PKHA 3CERA 1RGIA 4I6MB 3EN9A 4E1JA 5AQNA 3DWLA 3MK6A 4WQ4C 3SMPA 3CJ7A 3FFKB 4JN4A 1HKCA 3WUHA 5EXWA 1HLUA 4I6MA 4WQ4A 3W0LA 1NGEA 5I9EB 1NGDA 4BRIA 1IG8A 5AQHA 5BRFA 2A40A 5AFUA 4BRAA 4BG8A 2GEMA 3A5LC 3H45C 1C0FA 4K41A 3L6QA 3SJHA 3VOVA 2FSKA 2E1YA 5AZIA 3LM2A 1Z05A 2CGLA 3G25A 4BREA 2Q31A 2PBDA 1ESVA 1ATNA 3WXJA 2E2NA 4H03B 2CH6A 5AQGA 2HMPA 5AZJB 4F9OA 2ASOA 2YHWA 3VF4A 3DXKA 2FF3B 2P9IB 3UKRB 3R8EA 4BRKA 1DGKN 4DCHA 5JLFA 5AQZA 3IMXA 4BR4A 5F0XA 2D4WA 3GBTA 3IFRA 3MDQA 1Z6RA 5BPMA 3B8AX 2KHOA 1NGGA 4BC3A 1JCFA 1YVNA 3FZLA 4GNIA 4H0OA 2I7NA 5JLHA 2P9KA 3TU5A 3H46O 2I7PA 4YDUC 4BRFA 3ZETB 3CJBA 4CZFA 5B8HA 5BRDA 4BQLA 2GUPA 2E20A 3QDKA 3TPQA 4ISFA 1GLAG 1GLLO 2GWKA 2NZTA 5KPZA 4A2BA 2P9PA 4BRCA 3FZMA 3M6GA 1NGFA 2IVNA 4DQ8A 5EVZA 4XH5A 3VPZA 3ATUA 4CZIA 2ZWHA 2YHYA 5AQTA 5FPDA 5CE3A 3VEVA 1XUPO 3O8MA 1KAYA 4H5WA 3UKUA 1ZXOA 3R9PA 5AQOA 3DXMB 4WYBA 1KAXA 2E1ZA 3A8YA 1TUUA 3O08A 4IO8A 1DEJA 2BTFA 4BROA 1V4TA 4YDUA 1ZBSA 3EKUA 4CZJA 3QMLA 3W3DA 4IJAA 3H1QA 4CZMA 4J8FA 5AQJA 1TUYA 2W41A 2D1KA 2Q0UA 4MLHA 3O4WA 3CQYA 4K42A 4FSVA 2ITMA 4JD2B 1ZC6A 2V7ZA 3CIPA 2D0OA 3U4LA 3VETA 3WQTA 2GTDA 5AQUA 4BR9A 3H1VX 3LL3A 3BF1A 4RWTA 4A2AA 5AQSA 3LM9A 3WEEB 5KPTA 4PKIA 5LY3A 3LDOA 4DHYA 3VERA 3LDQA 3C0BA 2F9TA 4BRHA 2VCPA 5E26A 3D7EO 2BUPA 4PL8A 2YHXA 4BGAA 4AM6A 2E2QA 3DJCA 2FSNA 3IDHA 4BR0A 3U9ZA 1MWKA 3ZETA 4CBWA 5EOYA 4FPAA 3CJ9A 3HBTA 4O5FA 4CBXA 4H5RA 4RTFD 2VYPA 1NGHA 2QWNA 3AAPA 5JICA 3MN6A 1X3MA 4A61A 2E88A 2WUSA 2NRHA 3C7NA 3EL2A 1BWFO 3D2EB 5FPNA 2HF3A 4K43A 3VEOA 3DXKB 3VESA 5EX5A 3VGKA 4BGBA 1NM1A 1HKBA 5AZJA 2AP1A 3ZEUB 2OANA 4HWIA 3VENA 1EQYA 1X9JA 1T6CA 3A5OC 3FZFA 5AZIB 5EY4A 2AA4A 1QQMA 3VF2A 4FWLA 3QBWA 5JMVA 2Q1NA 2IVOA 5AQKA 1QQNA 4H0XB 3R6MA 2CGJA 5KPRA 3QFUA 3KVGA 5ADXA 1TYQB 4BRGA 1MWMA 4GY2B 3EO3A 5BR9A 4EAHD 1BA1A 2FXUA 5BN9A 4JD2A 4EIAA 3FLCO 5F2RA 3ID8A 3UB5A 3S41A 2Q36A 2Q97A 3HM8A 2F9WA 2E2OA 5AQVA 2YI1A 3HSCA 4A62A 1YXQA 2FSJA 4JHDA 1HX1A 1LCUA 1LOTB 1BA0A 2CGKA 4M7YA 4BC5A 4BRNA 2IIRA 3M1FA 3MN5A 2QWPA 2GELA 4WQ5A 3GL1A 3GG4A 5LJWA 3D2EA 3KHYA 3C7NB 4JAXA 4BR5A 1V4SA 2D0PA 4B1YB 1CZAN 4IJNA 3LDLA 2QWRA 1HPMA 3CJCA 4CZLA 5AQQA 4FWMA 3BP8A 2EWSA 4KBOA 2A3ZA 2ASPA 4BR2A 5AFUH 2UYTA 3QBXA 2P9NB 3FZKA 5F1XA 1ATSA 3OHRA 3VGLA 4NO7A 3AARA 4BRPA 5FPEA 3L4IA 1SZ2A 5AR0A 3AAQA 2FLOA 3WXIA 1E4GT 1GLCG 4BRDA 4CZGA 1K8KB 4H0VB 5BPNA 1E4FT 4IZ9A 1BU6O 1GLBG 3WEEA 4IXCA 5AQYA 4CD1A 1HUXA 4K25A 3SLCA 4FWRA 5BPLA 3H3NO 1MA9B 2ASMA 5TKYA 3H3OB 4H0TB 2A6AA 5E84A 3F9MA 3U9DA 4L3QA 4CD3A 4WQ5C 4FWQA 3ZX0A 2DPNA 2ZGYA 4Z94A 1Y64A 2P9UA 5FPMA 5AQXA 1C0GA 1QZ5A 3D2FB 3M3ZA 2Q2RA 4FOEA 4B1WB 3CHWA 4FWKA 2J4RA 3UE5A 3SMSA 1KAZA 2H3GX 4BQZA 4B9QA 3O1BA 5AQRA 1X3NA 3VGMA 1DKGD 4O8KA 1HKGA 2GWJA 1JCEA 3CJ1A 4H5TA 3WXKA 3DXMA 4QS7A 4XEIA 4B1VA 1BDGA 3LDNA 3J8AA 1TYQA 1U2VB 4HTLA 4EHUA 3VEXA 4FPBA 4BRQA 4B1XB 4MLEA 1T6DA 1BG3A 1SAZA 4H5NA 1GLEG 3QFPA 3A5MC 3ENOA 2P9PB 3BEXA 3MN9A 2V51B 3VEYA 1QQOA 4BRLA 4CZHA 3ZEUA 3I33A 5BREA 1BO5O 4PL7A 2CH5A 2QXLA 5AQMA 2E8AA 1YUWA 3I8BA 4FWNA 2VWBA 3EZWA 3QB0A 4MO5A 2P9KB 1YAGA 2A41A 1NWKA 3JXUA 2P9LB 5BRHA 2YCHA 3HI0A 3QICA 1U6ZA 2ZGZA 1S3XA 3FGUA 1NGJA 3UKRA 2P9IA 3BUZB 3LDPA 4Y0WA 1IJJA 1HJOA 3VEWA 3AY9A 1Q18A 3RSEB 4M7XA 2FF6A 2P9SA 4B1ZA 4BVOA 3IUCA 2V7YA 5AQLA 4JNEA 2QWOA 5AQPA 3ZX3A 4IWVA 1J6ZA 3HTVA 4BC2A 3MCPA 3P4IA 1NGCA 4MO4A 1H1VA 4BR7A 2Q0RA 2QWLA 4BVPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SQ1A 3BZKA 1LWCA 1QZ6A 3VQ5A 2W40A 4CJ4A 5C24A 3WXLA 4RCHA 4FWSA 5AQIA 3G10A 5HBMA 4NXMK 2GUIA 4H5VA 4PKGA 4CIFA 1D4XA 3KK3A 1WBDA 3QINA 3ATVA 1MDUB 1QHAA 3DI6A 1QQCA 1GOCA 1T44A 4F4KA 4DS5A 2NLXA 3L2WA 4CJTA 3T7ZA 4CJQA 3O5BA 2P9UB 4ID1A 1ATRA 2NRTA 1CZBA 3SNNA 1SL1A 1BOTO 3DRSA 1HNZK 4CIGA 3THXA 1U48A 4DR1K 1EO1A 3NFAA 1IH7A 1K73O 5KQ8A 3UIQA 2O8EB 5HRNA 1BIZA 1BUPA 1D8YA 4DTJA 1U4BA 4DQQA 2P9NA 1TKDA 4IKFA 3CCUN 4O0IA 4N41A 4JI3K 2V52B 3O6WA 3PO4A 2O8FB 2QK9A 3L0QA 2P9LA 4AM7A 1WSJA 4DU3A 2UUAK 3CCQN 4OLAA 1JXEA 2QW9A 3SCXA 3GE1A 3THYA 1TKZA 3AVIA 2YV0X 5CZ2A 4CI6A 2DFFA 2IS3A 4UY8O 2YNHA 3RMAA 3R3LA 4DTXA 3CERA 1VQ6N 4JI1K 4OGCA 3T1HK 1NK9A 2Z1HA 3WXMB 3DWLA 1T03A 3CJ7A 3FFKB 4JN4A 1HKCA 1NK6A 2RKIA 4BRIA 1IG8A 2F96A 2VG7A 5KRSA 4IEIA 3NF8A 5AQHA 5AFUA 4BRAA 3LPTA 3A5LC 4K41A 1Y97A 1JL2A 2E1YA 5IWAK 2G8IA 2Q31A 3SUNA 4H03B 5AQGA 4KHSA 1VRUA 3VF4A 1U45A 4Z4GA 2ZM6K 3ZSYA 4DLEA 5HLFA 3HP6A 3KIOA 3IMXA 3ZSZA 2HW3A 2D4WA 2G8UA 3O9UA 2QKBA 5BPMA 5M1NA 4BC3A 1YVNA 3FZLA 4GNIA 2I7NA 1J54A 1VQ4N 3TU5A 4AHRA 3H46O 1RT6A 4YDUC 4BRFA 4LFAK 5B8HA 5BRDA 4B9LA 2E20A 3TPQA 1GLLO 2NZTA 2P9PA 3TABA 4DUYK 3S3MA 2IAJA 4BRCA 3FZMA 3M6GA 1NGFA 2IVNA 4XH5A 4CERA 3VPZA 3HRGA 4YFUA 3ATUA 4CZIA 1IKXA 4W5TA 3ZSOA 1L3SA 5FPDA 4CEQA 5CE3A 1KVCA 1XUPO 3NH1A 4LF5K 4AHSA 3CCVN 1NJYA 1ZXOA 4KPYA 4WYBA 1KAXA 1VAZA 3AO4A 1TUUA 4IO8A 4W5QA 1N34K 1VQPN 4BROA 1E3MA 1V4TA 1ZBSA 3EKUA 4CZJA 1IG9A 3AVNA 2F8TA 4WFAL 1NK8A 4KHQA 4J8FA 5AQJA 2Q0UA 4MLHA 3PUFA 3CQYA 4K42A 3TAMA 4FSVA 3VQCA 3WNGA 3HVRA 2ITMA 1JLAA 2P5OA 4FVMA 2V7ZA 4GV9A 3O9QA 3OS0A 1SUQA 3SI6A 2VQFK 2GTDA 4DSJA 4I2PA 4N56A 4JI0K 4BR9A 3BF1A 3LM9A 5KPTA 5LY3A 4PKIA 5M1FA 1VHXA 1NK5A 4Y1DA 3LDQA 5GAGP 3OVNA 4QAGA 5LMUK 4PWDA 3I8DA 2YHXA 3DJCA 4BR0A 3VQ9A 3QO9A 2HBMA 4CBXA 2VYPA 1UA1A 3G0ZA 4LF6K 5GAHP 3PLAA 2WBNA 3MN6A 2HNDA 5C25A 2NNWA 2EHGA 1BWFO 3D2EB 4CEZA 2X74A 3OYHA 4RW8A 3DXKB 3VESA 1WLJA 3KK1A 3MXMA 2HMIA 1HKBA 4HWIA 2YX6A 1EQYA 4FW2A 1X9JA 3AVHA 5AZIB 3FZFA 1LAWA 2VQEK 3DM2A 3O9RA 5JMVA 4KTWA 2IVOA 1U47A 2CGJA 3QFUA 3OYNA 5C10A 4GY2B 3CMAN 5FLXO 4B3OA 4Z4CA 1QS4A 2FXUA 5BN9A 3S9HA 2WFBA 3C6HA 5F2RA 2RHKA 4CHQA 2Q36A 2Q97A 4FJHA 4JLHA 3K5LA 2HB5A 3QEVA 3DYAA 3ZT4A 2E2OA 5AQVA 4QCLA 4AHVA 2O8CA 1RT7A 1LCUA 1LOTB 1BA0A 4BC5A 4PQUA 2QWPA 3SAGA 1FJGK 4DQIA 5LJWA 4B3TK 3HPOA 3C7NB 3OTOK 1TAUA 3U6FA 2EWSA 2A3ZA 3O9TA 2PY5A 3M8SA 3DOKA 3BY5A 4BR2A 1OVYA 2KLAA 4EZ9A 4CJWA 3DRPA 4J2DA 4FJJA 2QI2A 3AARA 3TANA 3NGYA 1VRTA 1O1WA 2FLOA 2UXCK 1TK0A 3J7AP 3WEEA 4K25A 1ASUA 4CGJA 4CE9A 4CJKA 3NBPA 3H3OB 3DLEA 2A6AA 4BE2A 3DOLA 3F9MA 4L3QA 3ZX0A 3ZSRA 4Z94A 4E3SA 1QZ5A 3D2FB 4M3ZA 3P83D 2J4RA 4E7JA 2VG5A 3VQ6A 1KAZA 2H3GX 4B9QA 3O1BA 5AQRA 3VQEA 3VGMA 4JKGB 1IBLK 4E19A 2GWJA 1JCEA 3CJ1A 3CFRA 3DXMA 5J2PA 3CC4N 1BDGA 1J53A 3LDNA 3CMEN 4IFYA 1CXUA 4FPBA 4BRQA 4B1XB 3O3HA 4CJ3A 4DTMA 1RBRA 4JI8K 5JS1A 4H5NA 4K8XA 3SV3A 4DTOA 3P39A 3NAEA 4CEAA 4CEFA 4Z0UA 4CEOA 1N32K 3ENOA 4B8AB 3LP1A 3CC7N 3QETA 2V51B 4JK7A 4FLXA 1BCOA 4MDBA 3OY9A 1FW6A 3V6DA 3I33A 5BREA 4FYDA 1BO5O 3OYJA 2E8AA 3I8BA 4KH5A 4FWNA 4GKJK 2VWBA 3EZWA 4LSLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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