5FPEA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 1h-1,2,4-triazol-3-amine (at485) in an alternate binding site.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
total genus 122
structure length 377
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpeA04
5ADXH 2OANA 2FXUA 1D4XA 1BU6O 2VYPA 4BGBA 5EVZA 3HBTA 3SMPA 1ZC6A 3LDQA 3U9ZA 4JAXA 1CZAN 1JCFA 4GNIA 1Y64A 3EL2A 4FWMA 2NLXA 4EHUA 1ATRA 1NGFA 3VGLA 5BR9A 2QWLA 4BR2A 4B1VA 1BA0A 1NGBA 5AFUH 2ZWHA 3GOIA 5KPZA 3SLCA 4BRAA 4H5NA 3H6EA 4XEIA 1HUXA 1C0GA 3QICA 2ZGZA 4BRQA 2HF3A 5F1XA 3GE1A 5AQHA 2W41A 4B1WB 5F2RA 3HI0A 1NGHA 2Q31A 3O4WA 4FPAA 3ID8A 3D2FA 4BRPA 3CETA 2QW9A 1HKCA 3HZ6A 1ATSA 4FL9A 4FWPA 2Q97A 1HKBA 1HPMA 3LM9A 2QWRA 3ENHA 2CGLA 5AZJA 5JICA 3AAQA 5BRDA 3VOVA 1MA9B 2A3ZA 1G99A 2CGKA 2EWSA 5LJWA 3L0QA 2GWKA 1NGIA 3H1QA 2P9UB 5AR0A 2ASPA 3FLCO 3W0LA 1YXQA 2WUSA 3IMXA 4MO5A 3AAPA 4IO8A 3HTVA 1IG8A 2P9KB 2ITMA 3CJ7A 4FPBA 3BF3A 4O8KA 3FE1A 3CJCA 3MN9A 5FPDA 4CZIA 3KZBA 1J6ZA 4FSVA 5AQXA 5ADXA 2I7PA 4DHYA 2D0PA 3ULEB 2V7YA 4M7YA 2AA4A 5AQGA 3QDKA 1NM1A 4B1UB 3CHWA 3R8EA 4JHDA 1X3NA 3MCPA 3VEYA 5KPTA 4FWKA 3H45C 3MDQA 5E26A 1IJJA 3B8AX 1TUYA 3MN5A 3WEEB 2E2NA 5EY4A 3A5OC 3WXKA 4BC4A 2YJFA 3L4IA 5AQNA 4BRDA 2E8AA 1S3XA 2QXLA 1GLAG 1GLFO 2CH6A 4A62A 2E2QA 3UE5A 5ELZA 3VERA 3TU5A 1HLUA 2D0OA 4CZJA 2FF3B 3SK3A 4LC9B 4JD2B 1RFQA 4WQ5C 4YDUA 2ZF5O 5AQYA 3A8YA 3A5MC 4FWSA 3CIPA 2IVNA 4BR4A 3GL1A 5AQIA 2V7ZA 4XH5A 3BF1A 3MN6A 3J8AA 1SQKA 3D2FB 2YHWA 1SZ2A 4BRIA 2FSNA 3CQXA 2E20A 4BRCA 1NGGA 5AQOA 4B1ZA 1GLCG 3U9DA 3LDPA 1XQSC 3H3OB 4JD2A 4FWNA 3VF6A 4AM6A 4NB4A 1NGAA 1V4TA 4NO7A 3O08A 3H46O 3I8BA 2A41A 2P9UA 5I9EB 3D2EB 4IXCA 3ZX3A 5AQPA 2D4WA 1C0FA 4XH4A 2HMPA 2QWMA 2ASOA 3FZHA 1R59O 3DXMB 1YAGA 1X9JA 3ENOA 3KHYA 3P4IA 4H0PA 4BRGA 2PBDA 2QWOA 4A2BA 2A40A 2QWPA 3UKUB 3LDLA 2GELA 3U8XA 3GG4A 5BRHA 3VGKA 5F0XA 5AQUA 1YVNA 4WYBA 3L6QA 5AQVA 5LY3A 4PKIA 4E1JA 5FPMA 2IIRA 2P9IA 2P9PA 5BREA 3O80A 4I6MA 1NGJA 4MO4A 2A5XA 3QB0A 5KQ8A 1QZ6A 2VCPA 3A0IX 3WQUA 4B1YB 1MWMA 1S22A 3ZEUA 5AQTA 1NLVA 2VWBA 4BG8A 1H1VA 4BC5A 3WQTA 3D7EO 3EKUA 1BDGA 2P9LB 5FPNA 3RSEB 2YHYA 1HX1A 4CZEA 1BUPA 5LJVA 4C23A 1JCGA 3SJHA 3WEEA 5AFUA 2P9LA 1Z05A 1GLDG 1KAYA 2D1KA 3D2EA 1Q18A 3HSCA 4CD1A 2F9TA 5AZIA 3O1WA 2GWJA 3VEZA 4FOIA 2YHXA 4BRFA 4IZ9A 1BWFO 3H1VX 3DXKB 2W40A 1YUWA 2A6AA 4KBOA 3VESA 4ISGA 4FWQA 4WQ4A 4WQ5A 2V52B 4HWIA 3UKRB 4IJNA 3R6MA 3OHRA 4RTFD 3VF2A 4H5TA 2Q0UA 3FZLA 2NRHA 3VEXA 3WXJA 1NGDA 2P9KA 2Q1NA 1QQMA 1U2VA 4RCHA 3FR0A 3DWLA 1GLBG 4J8FA 2GEMA 3DJCA 2A42A 2HOEA 1NMDA 1WOQA 4DCHA 4B9QA 5AQQA 4CZLA 1JCEA 3CJ9A 2E1YA 2FF6A 3QBWA 4CZKA 4ISEA 1LCUA 2F9WA 1HJOA 2P9NA 1BG3A 1KXPA 4CBUA 3IFRA 4CJ7A 3VGMA 3ATVA 3EKSA 3ATUA 5JLFA 4CZFA 2IVPA 5AQWA 1EQYA 5AQFA 1XC3A 3BEXA 3FGUA 2V51B 3LDNA 1WUAA 1NGEA 3G25A 3QMLA 2H3GX 3C0BA 4K41A 5AQKA 3DAWA 4QS7A 1NGCA 1DEJA 2DPNA 2E88A 2NZTA 4H03B 4CBXA 4PL8A 3A5LC 3KVGA 2P9SB 1BA1A 1NBWA 1QQNA 4H0OA 3UKUA 4GY2B 3VEOA 3ZETB 3O5BA 3EN9A 4MLHA 2UYTA 4CZMA 4BVPA 4EAHD 5BPNA 3RSEA 4BRNA 3O1BA 2FSKA 3WXLA 2QWNA 4BC2A 1SAZA 1DGKN 4BRHA 3M1FA 2ZGYA 4WQ4C 1U2VB 2HF4A 4L3QA 4BR9A 4BGAA 5KQDA 3M3ZA 3WXIA 4BG9A 1QZ5A 4A61A 2BTFA 2J4RA 1OKJA 4H0XB 4HTLA 3CERA 2FSJA 4H5VA 4JHDB 4F9OA 5B8HA 3AY9A 4QS9A 4EHTA 5BN9A 1BO5O 1DKGD 4Y0WA 1E4FT 2Q36A 2FLOA 1P8ZA 4FOEA 1QQOA 2PAVA 4K43A 4JN4A 4FWRA 3FZFA 1NWKA 3VETA 5BPMA 1GLLO 4EIAA 5AZIB 1V4SA 5BPLA 3M6GA 3I33A 1ZXOA 3CI5A 5JLHA 1GLJO 4K42A 4BRKA 5AQMA 1QHAA 1T6CA 2P9SA 1KAXA 4CI6A 4DB3A 2QWQA 3FZMA 3C7NA 2Q2RA 4IWVA 3CJBA 4IJAA 3VF4A 4DQ8A 3SMSA 1MWKA 1LOTB 3VENA 4H0YB 2Q0RA 2I7NA 3JS6A 5JMVA 1K8KB 2IVOA 3ZEUB 2P9IB 4BROA 3WT0A 1T6DA 3DXKA 3FFKB 3S41A 1Z6RA 3VPZA 4FWLA 3R9PA 4I6MB 2BUPA 2GTDA 2P9PB 2P9NB 2GUPA 4BVOA 3TPQA 4K25A 3BP8A 2QM1A 3ULEA 3GDQA 1ESVA 1RGIA 3O8MA 1X3MA 2YI1A 4H0TB 3VEVA 3H3NO 1E4GT 5E84A 4XH1A 5KPRA 5AQSA 3QFUA 5BN8A 3DXMA 5EOYA 2AP1A 4FWOA 3QFPA 4ISFA 4PL7A 4H5RA 2CGJA 3ZETA 3JXUA 3WUHA 1KAZA 3O6WA 4CD3A 2ASMA 3HM8A 4BR7A 2YJEA 4BQZA 3VEWA 1TUUA 4H0VB 3CJAA 3W3DA 4A2AA 3F9MA 3MMVA 4PKGA 4JNEA 5EXWA 4CZGA 4BRMA 1ATNA 4M63C 4B1XB 5BRFA 3UKRA 4CZHA 3IDHA 1K8KA 1TYQB 3FZKA 5TKYA 4RWTA 1TYQA 4MLEA 3QBXA 3U4LA 4M7XA 2E1ZA 1U6ZA 4CBWA 1BOTO 3CJ1A 3C7NB 3GBTA 4BREA 3MN7A 2YCHA 5CE3A 3EZWA 4BRLA 5AQZA 4O5FA 1RDWX 5AQLA 1T44A 1GLEG 4YDUC 5AQRA 2CH5A 5EX5A 2E2PA 4BR5A 5AZJB 3CQYA 2E2OA 3EO3A 4FO0A 1ZBSA 3LM2A 3LL3A 4QS8A 3UB5A 3A5NC 4BC3A 3BUZB 4Z94A 5FPEA 3IUCA 3ZX0A 4PKHA 3ZX2A 4BQLA 1HKGA 3MK6A 2KHOA 1MDUB 5AQJA 4H5WA 1XUPO 4AM7A 4BR0A 3LDOA 4EFHA 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KFDA 4FLZA 3AV9A 1D4XA 2C1GA 2KLAA 4CJLA 5EVZA 2P1JA 4KPYA 1WSEA 1Q8IA 4OKJA 2EHGA 4GNIA 4EHUA 1ATRA 3S9HA 4ELVA 2DFEA 4B1VA 3ASMA 3DRPA 1BA0A 1NGBA 1MU2A 3OJSA 1OZZA 4I7FA 1C0TA 3RMAA 4FJHA 4OX9K 3V9ZA 5CR4A 3THYB 3CYGA 4A59A 4CJ4A 3H6EA 1MR4A 1HUXA 1C0GA 1S1XA 1HQEA 2Q31A 1VQON 1YJNN 4V19S 5DK5A 4EP5A 4C8LA 4F8RA 2Q97A 1ILYA 1HKBA 2MN5A 1Q9XA 2UUCK 2KKZA 1N6QA 4DR3K 4CERA 4FJNA 3VOVA 2HBJA 4M41A 1G99A 1ITGA 2EWSA 1T05A 2KW4A 3L0QA 2NRTA 3AVCA 2P9UB 3SQ1A 4DR5K 4KH5A 1YXQA 2WUSA 4MO5A 3AAPA 3HTVA 4DR2K 3BF3A 3SBGA 3VQPA 2FBYA 3CJCA 5FPDA 3QNNA 4NXNK 4A5BA 1L3SA 3ULEB 4E7LA 2QEXN 5C12A 3R8EA 3OYFA 3NH0A 4LFAK 4Y1DA 4KH4A 5KPTA 3H45C 3MDQA 4M45A 4CK1A 3B8AX 1TUYA 4LFBK 3T1AA 2E2NA 4J2AA 3A5OC 3LZIA 3WXKA 4J2BA 4CCHA 3HVRA 3QEIA 2QXLA 4DTJA 2CH6A 3D6RA 1E3MA 1TKXA 4JI8K 2D0OA 1NJWA 2GMOA 2LJMA 3AVMA 1DJTA 3E9LA 3A8YA 4KHYA 1JLBA 3SBTA 4YOYA 4FWSA 3CIPA 3DM2A 2HNZA 2V7ZA 1K9MO 3MN6A 1N8RO 2OTLN 2KZMA 1SZ2A 2FSNA 4JKGA 4FLYA 3AVLA 1VAZA 4B1ZA 3CCEN 3CC7N 1GLCG 3U9DA 4B9VA 4JD2A 4JRPA 3PX6A 4DTUA 4PUOA 2N2RA 3HP6A 3P83D 2P9UA 2VG6A 3KWIA 4IXCA 1C0FA 1XWLA 2ASOA 3DXMB 1R59O 2G8WA 1YAGA 2W00A 1ZFUA 3O9SA 3P4IA 4LY7A 2O4GA 4WE1A 4PQUA 1GOAA 2A40A 2QWPA 4BWMA 5C15A 4YFUA 4LF4K 3GG4A 5BRHA 3VGKA 5GAGP 2IC3A 4IG3A 2B6AA 4CHOA 5AQUA 1YVNA 3VQQA 4AHRA 4CEEA 3L6QA 5HL7L 1SL1A 4PKIA 4E1JA 3PV8A 2P9IA 2P9PA 4IKFA 5BREA 2C1IA 2RPIA 3G10A 2P51A 1RILA 1NK9A 3HYFA 3L8BA 1S72N 1PX9A 1FW6A 1S22A 5GIPA 2MBKA 5AQTA 3VQDA 3ZEUA 3OYEA 3VA3A 3KKRA 3D7EO 3EKUA 2P9LB 2G8FA 5FPNA 2DFHA 4OKEA 1P90A 2P9LA 1DQ7A 3HVTA 1Q18A 1RCHA 4O55A 3DLLL 2Z1HA 4HUGA 3O1WA 4FOIA 1VQPN 3CW4A 4IZ9A 4DV5K 1L3TA 4ISGA 2ZJPL 4WQ5A 1YHQN 4IJNA 3KP1A 4RTFD 4O8UA 3OYBA 2Q0UA 2NRHA 1NGDA 3VQCA 2YHBA 1HR0K 2Q1NA 1C1AA 3AVAA 4RCHA 5M1OA 3FR0A 2ZE2A 3K58A 2GEMA 2X74A 4DCHA 1FH3A 5AQQA 5J2PA 2YEOA 3QEVA 5GIOA 2E0HA 2FF6A 3QBWA 3TI0A 4ZTJA 5C0YA 2YX6A 3O4NA 1BHLA 1X9SA 3ZCMA 3C65A 1LCUA 5JS2A 1XMOK 4DKWA 3SCXA 4XJXA 1HJOA 1TGOA 1BG3A 2P9NA 4N41A 4GV6A 5JENA 4F2RA 3VGMA 3SAHA 1VHXA 4KTZA 4IO9L 3VA0A 4CHQA 3WXMB 2KFNA 1EQYA 5AQFA 1C6VA 1JKHA 3M8SA 3I56N 3LDNA 5HROA 3TSUA 3QMLA 3C0BA 4K41A 2E6MA 3TAPA 5AQKA 2B68A 1DEJA 2NZTA 1RDAA 5CZ1A 5D3GA 4PL8A 4DTPA 3KVGA 3K5OA 4DV2K 3K0SA 2KGQA 3MX2A 3VEOA 3OYMA 2KQ2A 4MLHA 1CHZA 2D0AA 1K73O 4Y1CA 4CZMA 4MDBA 1J9AA 4BRNA 3O1BA 1KRPA 3HSTB 3MECA 1SAZA 4BRHA 3OYJA 2NRVA 2XRIA 2LY5A 4H8KA 2E4LA 2DTUA 4FZXC 2KZZA 1D5AA 1C0MA 2PY5A 1HNZK 2BTFA 3E7RL 2GV9A 2FBTA 3P31A 4IOAL 3RMBA 3SQ2A 4F9OA 3EEQA 3MEGA 3C6TA 3AY9A 4QS9A 1DKGD 2BE2A 4Y0WA 2Q36A 1P8ZA 4BACA 2O8CA 3E01A 1NWKA 3VETA 4DSJA 3VQBA 1RT6A 2HW3A 1X9WA 3LALA 4DLGA 4YOVA 1QHAA 4QAGA 1NKBA 2QWQA 4IWVA 4DQ8A 4JKFA 4FZYA 5A2QO 3HT3A 1WMTA 1TK8A 4H0YB 4JKEA 5JMVA 2OTJN 2JDQD 1ASUA 1NE5A 1RDUA 2EX3A 3SF4D 3FFKB 2PZSA 4KKOA 1Z6RA 1W97L 4I2QA 3TAEA 3OYDA 3LPUA 4Z4FA 2ZD1A 5J2QA 2B5JA 3NVMA 4BVOA 1GOCA 1ZYWA 4K25A 1VSEA 4BE0A 1RGIA 2Z1IA 4UADE 1BL3A 2F96A 3PSMA 4J2DA 4DSFA 3TANA 4BWJA 5FRNA 4CF2A 4FCYA 1SS6A 1NOYA 3QEXA 3TAGA 2YC1C 3QFUA 5BN8A 5EOYA 1RBVA 4PL7A 4H5RA 2CGJA 3ZETA 2DFFA 1N33K 3WUHA 3I8DA 3CC2N 3WNEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KFD A;  4FLZ A;  3AV9 A;  1D4X A;  2C1G A;  2KLA A;  4CJL A;  5EVZ A;  2P1J A;  4KPY A;  1WSE A;  1Q8I A;  4OKJ A;  2EHG A;  4GNI A;  4EHU A;  1ATR A;  3S9H A;  4ELV A;  2DFE A;  4B1V A;  3ASM A;  3DRP A;  1BA0 A;  1NGB A;  1MU2 A;  3OJS A;  1OZZ A;  4I7F A;  1C0T A;  3RMA A;  4FJH A;  4OX9 K;  3V9Z A;  5CR4 A;  3THY B;  3CYG A;  4A59 A;  4CJ4 A;  3H6E A;  1MR4 A;  1HUX A;  1C0G A;  1S1X A;  1HQE A;  2Q31 A;  1VQO N;  1YJN N;  4V19 S;  5DK5 A;  4EP5 A;  4C8L A;  4F8R A;  2Q97 A;  1ILY A;  1HKB A;  2MN5 A;  1Q9X A;  2UUC K;  2KKZ A;  1N6Q A;  4DR3 K;  4CER A;  4FJN A;  3VOV A;  2HBJ A;  4M41 A;  1G99 A;  1ITG A;  2EWS A;  1T05 A;  2KW4 A;  3L0Q A;  2NRT A;  3AVC A;  2P9U B;  3SQ1 A;  4DR5 K;  4KH5 A;  1YXQ A;  2WUS A;  4MO5 A;  3AAP A;  3HTV A;  4DR2 K;  3BF3 A;  3SBG A;  3VQP A;  2FBY A;  3CJC A;  5FPD A;  3QNN A;  4NXN K;  4A5B A;  1L3S A;  3ULE B;  4E7L A;  2QEX N;  5C12 A;  3R8E A;  3OYF A;  3NH0 A;  4LFA K;  4Y1D A;  4KH4 A;  5KPT A;  3H45 C;  3MDQ A;  4M45 A;  4CK1 A;  3B8A X;  1TUY A; 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