5FPEA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 1h-1,2,4-triazol-3-amine (at485) in an alternate binding site.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 377
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpeA04
3DXKB 1NM1A 5JICA 3C7NA 3SK3A 4PKGA 3DXKA 3LDOA 3KHYA 2QM1A 1X9JA 3EN9A 5ADXH 2YJEA 3W3DA 3BUZB 5BPLA 4QS8A 3BF1A 4WQ5A 1TUUA 4EIAA 4I6MA 2D4WA 4H5RA 4CBWA 3H46O 2AA4A 3HBTA 5ADXA 2P9LB 5AQPA 1RDWX 2F9TA 3HM8A 4CBUA 3KVGA 4FSVA 3SMSA 1GLAG 3LM9A 3JXUA 3EO3A 1DKGD 3LDQA 1CZAN 4CD3A 3IDHA 4DB3A 5AQIA 1RFQA 3O6WA 1LOTB 4WYBA 1E4FT 2GWJA 5AQZA 1IG8A 4BRGA 2KHOA 5AQKA 4KBOA 3L4IA 3VF4A 4CZIA 4PKHA 4B1VA 2A3ZA 3ATUA 3LDLA 1YUWA 3U9DA 3H6EA 3VGKA 4JNEA 4BG8A 2P9PB 3DWLA 3ZX3A 2P9PA 4H0PA 3QICA 1HPMA 2P9UA 2V7YA 3UE5A 3MK6A 2V51B 1KAXA 4CI6A 4H0VB 3A5MC 2QW9A 3ZX0A 3LM2A 5AFUH 3WQTA 5JMVA 3DXMB 2GEMA 1BA1A 1GLLO 1QQNA 1GLCG 3DXMA 4MO4A 4FO0A 4J8FA 3MN7A 5AFUA 3VETA 5BN9A 3WT0A 2GWKA 5EVZA 2P9IA 3U9ZA 1YVNA 1NGDA 3O1BA 5KQ8A 2IIRA 2ZF5O 4NO7A 4O8KA 3VEZA 3O5BA 4BRCA 1MWKA 3ENOA 5EXWA 2CGLA 2YHYA 3O1WA 2QWRA 4FWMA 3OHRA 1Y64A 5BRDA 5LJVA 3A5LC 3D2FB 2QWLA 4M7XA 3D2FA 4FOIA 2NRHA 3FLCO 1V4SA 3FGUA 3HZ6A 5AQOA 3C0BA 1OKJA 1NGEA 2FF6A 1JCEA 2YJFA 4CZLA 4Z94A 3F9MA 1HLUA 3MN6A 3GOIA 1H1VA 3LDPA 4FL9A 4NB4A 1NGHA 5F1XA 3A0IX 4M7YA 1S22A 2F9WA 3H1QA 4BRMA 2V52B 1YAGA 1MA9B 5CE3A 2W41A 3VEVA 4BREA 1E4GT 2QWNA 4A62A 1Z6RA 3CJ1A 3ZEUB 1BO5O 3CJCA 2J4RA 3ZEUA 4BG9A 1ATNA 4BRQA 3EKSA 3A5OC 1TYQB 1U6ZA 3MN5A 3D2EB 3H1VX 4BRAA 4HWIA 4H5TA 3HI0A 5AQYA 4ISGA 2P9SB 1T6CA 1QQOA 3CJ9A 3M6GA 4IO8A 3JS6A 1GLBG 5BPMA 3C7NB 3FFKB 3VF2A 3BF3A 1NGFA 4BVOA 2D0OA 3LDNA 1NBWA 3ENHA 3AAPA 3WXJA 2AP1A 4E1JA 1D4XA 4I6MB 4FWSA 3ATVA 1BA0A 3EZWA 1BG3A 3FE1A 1EQYA 5F0XA 4CBXA 3TU5A 3R6MA 4FOEA 3U8XA 4CZFA 4RCHA 4QS7A 1NGAA 1HKGA 3VGMA 5KPRA 2I7NA 3M3ZA 1G99A 5AZJA 5BPNA 3DAWA 3O4WA 1NMDA 4CJ7A 3R8EA 2I7PA 2P9KB 4H0TB 3QB0A 3O80A 1J6ZA 2P9KA 1BU6O 3WXIA 3VOVA 4M63C 2HF4A 1SZ2A 5AQGA 1MDUB 3M1FA 4XH1A 3GBTA 4JD2B 5AZIB 4IJNA 4Y0WA 3VEYA 2FSNA 4FWQA 5EX5A 4JD2A 5AZIA 3LL3A 3WXKA 1Z05A 4XH4A 2P9UB 3B8AX 3CQYA 3HTVA 4EHUA 2HMPA 3CERA 2H3GX 4FPBA 1KAZA 1T6DA 2A40A 4FWKA 5AQXA 1NLVA 5E26A 5AQUA 1V4TA 2VYPA 5KQDA 4DHYA 4ISEA 4BRHA 1ZXOA 3J8AA 4GNIA 2YHWA 4BC5A 2P9IB 4CZHA 3CHWA 2HOEA 3CIPA 2E2OA 3VEWA 1XUPO 2W40A 3ZETA 2GUPA 4WQ5C 4CZKA 2PAVA 2IVNA 1HUXA 2ITMA 3H45C 3IMXA 3MN9A 4BRKA 1BOTO 2VWBA 4CD1A 4A2AA 3WUHA 4IXCA 1WUAA 5AQNA 4BC3A 1DGKN 3UKUA 3WEEA 4K41A 3VERA 3VF6A 1R59O 5AQQA 1JCFA 3D7EO 3FR0A 4LC9B 5I9EB 4JN4A 1DEJA 5BR9A 5BREA 4JHDB 4HTLA 2QWQA 2ZGZA 4JHDA 5KPTA 3CJBA 5ELZA 4BR5A 4FWPA 3CJ7A 2ZGYA 4DCHA 4EHTA 2E88A 2A6AA 2CH5A 4MLEA 3H3NO 4H5NA 3DJCA 4A61A 4ISFA 2YHXA 1ATSA 4XEIA 1K8KB 4B1YB 3U4LA 3QMLA 3P4IA 3VEOA 1K8KA 5FPNA 1KXPA 5AQJA 1U2VA 3O08A 4WQ4A 3ZX2A 4BC4A 4PL7A 1SAZA 5FPDA 3EL2A 2OANA 3QDKA 3S41A 5AQRA 2BUPA 2Q31A 1RGIA 2PBDA 4BRFA 1NGCA 4C23A 4BR4A 3ULEA 2ASMA 3VENA 1HX1A 1XC3A 2P9NB 2UYTA 3SJHA 2QXLA 3VEXA 3W0LA 2P9NA 3I33A 4CZGA 5AQMA 4CZMA 4B9QA 4XH5A 3R9PA 4BGAA 3MDQA 4L3QA 5LY3A 3O8MA 1NGBA 3FZMA 4BRPA 2E1YA 4H03B 3AY9A 2BTFA 4IZ9A 1ESVA 5AZJB 1NWKA 2Q1NA 5FPMA 1SQKA 4FPAA 4JAXA 3VGLA 3QFUA 3TPQA 5AQFA 1HJOA 4PKIA 4RTFD 3CJAA 4QS9A 1LCUA 3GL1A 3SMPA 4BQLA 3GG4A 2A42A 5TKYA 3UKRB 3BP8A 3CI5A 2A41A 1ZBSA 3UKRA 4K43A 2E2NA 2E8AA 2FF3B 2P9LA 4MO5A 3CQXA 5AR0A 4WQ4C 5BRFA 1BWFO 4H5VA 1X3MA 4K25A 2CGJA 2GTDA 3AARA 4PL8A 2D0PA 2YCHA 3EKUA 4DQ8A 2DPNA 2IVOA 1Q18A 2Q0UA 4BR7A 5B8HA 4H5WA 3RSEB 3QBXA 3RSEA 4FWLA 1C0FA 4BGBA 4YDUA 1QHAA 3ZETB 1QZ6A 1YXQA 1GLEG 2QWMA 5EY4A 2HF3A 3QBWA 4H0OA 4AM7A 5BN8A 3IUCA 4BC2A 1KAYA 5E84A 3IFRA 5AQHA 3BEXA 5F2RA 2CH6A 3MCPA 2VCPA 5LJWA 3UKUB 1X3NA 4FWRA 3WEEB 5KPZA 1JCGA 2A5XA 4FWOA 3GDQA 5AQLA 1MWMA 2GELA 1ATRA 4EFHA 5FPEA 3L6QA 1WOQA 4CZEA 5JLFA 1QQMA 4BRNA 3A8YA 2QWPA 4BRLA 3VPZA 2YI1A 3L0QA 1XQSC 1TUYA 3H3OB 2FSKA 2ASPA 1NGGA 3SLCA 4B1UB 2NLXA 3A5NC 4IWVA 3HSCA 4BR9A 3AAQA 1GLDG 4O5FA 1ZC6A 4MLHA 4A2BA 2ASOA 1HKCA 4BRIA 3FZLA 4B1ZA 5AQWA 3MMVA 5EOYA 3I8BA 4F9OA 1U2VB 2E1ZA 4B1XB 2E20A 3FZHA 2Q36A 4H0YB 2Q97A 1QZ5A 2ZWHA 5BRHA 2IVPA 1BUPA 2NZTA 2D1KA 4IJAA 4BR2A 3WQUA 2CGKA 3FZFA 1BDGA 5JLHA 4YDUC 3ULEB 2FSJA 1HKBA 1C0GA 3QFPA 2E2PA 4EAHD 2EWSA 2Q0RA 4GY2B 4K42A 4BR0A 1GLJO 2E2QA 2V7ZA 1NGIA 3VESA 3KZBA 3CETA 2Q2RA 4BROA 5AQVA 5AQSA 4H0XB 4BVPA 1P8ZA 4AM6A 4B1WB 3FZKA 1T44A 3GE1A 1NGJA 3ID8A 4RWTA 4FWNA 3WXLA 1TYQA 1S3XA 3G25A 4BRDA 3D2EA 1IJJA 2WUSA 3UB5A 4CZJA 5AQTA 1GLFO 2FXUA 2QWOA 2FLOA 2P9SA 4BQZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1I39A 4CJFA 3DXKB 2WOMA 5JICA 2KQ2A 3SK3A 2ZJRL 2QK9A 3DXKA 2YNHA 1SL1A 2YJEA 2KTQA 5BPLA 3BF1A 2Z1IA 3OS0A 2D4WA 4H5RA 4KTQA 1OMYA 4CBWA 1D5AA 1RNHA 4AEIA 1ZBFA 3HM8A 4JI1K 4JI2K 4CBUA 4CJQA 4FSVA 3NCIA 1GLAG 5JS2A 4LFBK 2BE2A 1DKGD 1NK6A 3IDHA 3OYFA 3G10A 1EO1A 3THXA 4KREA 4GV9A 4BACA 3VF4A 2A3ZA 4DFPA 3ATUA 4CHQA 5CR4A 3OJUA 3VGKA 3THWB 2P9PB 2LJMA 3T69A 2O8CB 2P9PA 1YT3A 4KI6A 2O8CA 3QICA 3CF5L 2V7YA 3N4QA 5J2NA 1X9WA 4QCLA 2RHKA 1KAXA 3KOZA 3ZX0A 2QW9A 4TSXA 4Z4EA 3WQTA 3WXMB 4CK3A 5J1EA 5JMVA 1TV6A 4F4KA 4DTOA 1N6QA 4HCCA 4KHNA 4MO4A 4FO0A 1QS4A 1LWFA 5BN9A 3WT0A 3SUOA 3MECA 4IOCL 1YVNA 1NGDA 5KQ8A 3AGKA 3SI6A 4NO7A 4NYFA 3VEZA 4WCEL 2D0AA 2B68A 4IFEA 3ENOA 5DM6L 3K5NA 2W6LA 3O1WA 3ZSRA 4FWMA 3OHRA 3RMDA 1C0MA 2OA8A 5C0YA 1HNVA 2NRHA 1DTQA 3O9TA 2HNZA 5CHIA 5AQOA 4BECA 1OKJA 1LWCA 1RTDA 1NGEA 2FF6A 4CGFA 4RW9A 3P38A 1L3UA 2HW3A 3GOIA 1H1VA 2KBJA 2G8VA 4NB4A 1TKTA 3A0IX 4FZYA 3MXIA 3J7ZO 4BRMA 1YAGA 2BGGA 1WSGA 5KRSA 5CE3A 2W41A 1CZ9A 5GIOA 1E4GT 2QA4N 3CJ1A 4AB0A 1K73O 4BG9A 3V81A 4BRQA 1U6ZA 3MN5A 1VQ6N 4LH4A 4NLBA 3NGZA 3PSFA 1J53A 2YKNA 3O9SA 4CF1A 4M3YA 4ISGA 4KYPA 3DLRA 1FW6A 1T6CA 4IO8A 4YORA 3C7NB 5DM7L 2D56A 2GX9A 1RT1A 4EP4A 1U49A 4CFCA 2YEOA 3OW2M 4OVLA 4B9UA 2QXFA 3KKSA 4I7FA 4E1JA 1D4XA 3N4PA 3G4SN 4E0DA 4JI3K 2YX6A 4HTUA 1VK0A 1I94K 1XMQK 4Z0UA 1BG3A 4KH5A 3FE1A 5F0XA 4CBXA 3SV3A 3KIOA 1K8BA 4CZFA 4DV6K 2GUIA 1NGAA 1G99A 3O4WA 2WONA 3E9OA 2W42A 4B9LA 3R8EA 1RDAA 2I7PA 3QB0A 2OPRA 2NY9X 4LY7A 3WXIA 4M63C 3U6FA 1QSSA 1RDUA 1SZ2A 4BE2A 2XY8A 3HK2A 4FZXC 3ZT4A 3RTVA 2K35A 4JD2B 1UAXA 5AZIB 4M42A 1Q86O 3VEYA 2FSNA 4JD2A 5EX5A 5AZIA 3LL3A 4I9LA 2P9UB 3D0PA 3HTVA 5FLXO 4ZTFA 1GPTA 1YF5L 4B9TA 4FLUA 4DSKA 4JK8A 2H3GX 1Q7YO 3TTFA 4J2AA 4FJ8A 4C1NI 5AQUA 1LAWA 1V4TA 2OZMA 1BQNA 1T3VA 3RMCA 3J8AA 1VHXA 2YHWA 4M3XA 4BC5A 2XHBA 4CJRA 3P83D 3L2RA 1N4NA 4YOYA 1MR4A 4KAZA 2W40A 3ZETA 3JAMO 1S9GA 2R7YA 4FXDA 4BE7B 4WQ5C 3RRHA 3QERA 4O55A 3HRGA 1NNEA 5HRPA 4F3OA 5GAGP 4BRKA 4DTJA 1QVGM 4CD1A 4A5AA 4GVMA 1WUAA 4YOXA 4BC3A 3UIQA 1HQEA 3SQ0A 3S5TA 4IFYA 2JWKA 4CJ5A 3J7YP 4FJKA 3J81O 2FBXA 1OZZA 3M8QA 2ZE2A 5HLFA 4OPJA 5I9EB 4IOAL 1JKZA 1DEJA 2F4VK 4IBNA 3KD5E 3O4NA 1NRBA 2ZGZA 4M3TA 1GOAA 3H08A 4DS5A 1B92A 4JKGA 1NK7A 5HRSA 3VQ9A 4CEAA 1KFSA 2ZGYA 1JXCA 2P51A 2E88A 4CIFA 3AA2A 3LP2A 3H3NO 2A1SA 1T03A 4B1YB 1FH3A 4XEIA 3V1OA 3OYHA 3QMLA 1OH7A 3KLIA 1NPIA 4LF6K 4BC4A 3V9UA 1SAZA 3I56N 2DFEA 1TKZA 1T7EA 3EY1A 3S41A 1X1PA 4Z4IA 2HHUA 2Q31A 1XHZA 3QIOA 4CESA 2O8DA 2OPPA 2ASCA 5BR8K 3L3UA 4WFBL 3QESA 2E3FA 3KWIA 1VSMA 4QAGA 4GKKK 3ZSXA 3OYBA 4BGAA 4X64K 4DV7K 5D3GA 3HJFA 1LV5A 3AVCA 4CK2A 3DOKA 1NGBA 1U4BA 2E1YA 3TAEA 4FJIA 2BTFA 3ZSOA 3R1XA 3QIPA 1W7AA 5CY0A 4DV5K 4HUEA 2Q1NA 4BE1A 3TPQA 4GMJB 3KK3A 4PKIA 2O8EB 1T0ZA 1LCUA 1OVQA 3SMPA 4AH9A 3C6UA 1VRTA 3CPWM 4GV3A 3CI5A 2A41A 3LAKA 1ZBSA 1C55A 4WE1A 3V9SA 3AA4A 4F3TA 3KLGA 2HHWA 1KLMA 4WQ4C 3K9KA 4CW7B 4H5VA 1X3MA 1VQON 4LF4K 3THVA 2D0PA 3O9RA 3LANA 1S1WA 3Q7BA 3S3MA 3T1AA 1C0FA 3CFPA 4FZZA 1QHAA 1S6QA 1WSFA 2Z1HA 5EY4A 1I2VA 3I0RA 1I3AA 4H0OA 3I0SA 4DR2K 2LI7A 4KHYA 5EU7A 3PX6A 5E84A 3KLFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1I39 A;  4CJF A;  3DXK B;  2WOM A;  5JIC A;  2KQ2 A;  3SK3 A;  2ZJR L;  2QK9 A;  3DXK A;  2YNH A;  1SL1 A;  2YJE A;  2KTQ A;  5BPL A;  3BF1 A;  2Z1I A;  3OS0 A;  2D4W A;  4H5R A;  4KTQ A;  1OMY A;  4CBW A;  1D5A A;  1RNH A;  4AEI A;  1ZBF A;  3HM8 A;  4JI1 K;  4JI2 K;  4CBU A;  4CJQ A;  4FSV A;  3NCI A;  1GLA G;  5JS2 A;  4LFB K;  2BE2 A;  1DKG D;  1NK6 A;  3IDH A;  3OYF A;  3G10 A;  1EO1 A;  3THX A;  4KRE A;  4GV9 A;  4BAC A;  3VF4 A;  2A3Z A;  4DFP A;  3ATU A;  4CHQ A;  5CR4 A;  3OJU A;  3VGK A;  3THW B;  2P9P B;  2LJM A;  3T69 A;  2O8C B;  2P9P A;  1YT3 A;  4KI6 A;  2O8C A;  3QIC A;  3CF5 L;  2V7Y A;  3N4Q A;  5J2N A;  1X9W A;  4QCL A;  2RHK A;  1KAX A;  3KOZ A;  3ZX0 A;  2QW9 A;  4TSX A;  4Z4E A;  3WQT A;  3WXM B;  4CK3 A;  5J1E A;  5JMV A;  1TV6 A;  4F4K A;  4DTO A;  1N6Q A;  4HCC A;  4KHN A;  4MO4 A;  4FO0 A;  1QS4 A;  1LWF A;  5BN9 A;  3WT0 A;  3SUO A;  3MEC A;  4IOC L;  1YVN A;  1NGD A;  5KQ8 A;  3AGK A;  3SI6 A;  4NO7 A;  4NYF A;  3VEZ A;  4WCE L;  2D0A A;  2B68 A;  4IFE A;  3ENO A; 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