5FPEA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 1h-1,2,4-triazol-3-amine (at485) in an alternate binding site.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
total genus 122
structure length 377
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpeA04
2CH6A 5KPZA 4WQ5A 1BWFO 4BC5A 2ZGZA 1JCEA 4NO7A 1C0GA 2W41A 2E2OA 5CE3A 4KBOA 4CD3A 2E2QA 2P9PB 3IDHA 3VF2A 3CETA 4K41A 4AM7A 3DJCA 5AFUH 5AQHA 3EZWA 4FO0A 4BG9A 3FR0A 3BF3A 4PL7A 1U2VB 1NGJA 3DAWA 3VF4A 3LDNA 1HJOA 3LL3A 3ZX3A 1XUPO 4LC9B 1HLUA 3FE1A 2HF3A 2FSJA 4H0PA 3GE1A 4K43A 3TU5A 3IUCA 3QBWA 4FWRA 1KAZA 4BRFA 2NRHA 1WUAA 1V4SA 2QWQA 2OANA 2E2PA 1XQSC 3GG4A 2FXUA 2P9IB 3VETA 3MN5A 3O80A 5E26A 1GLDG 4L3QA 5AQPA 4FWNA 4F9OA 5AFUA 4FWSA 4XEIA 3ENOA 3IMXA 4CZGA 1KAXA 2GWJA 2P9IA 2IVPA 5AQNA 3SJHA 3GOIA 4CBXA 3MK6A 2I7NA 3LDLA 2YCHA 1NBWA 3AY9A 3CJ7A 4CZHA 3H45C 5KPRA 2A42A 5AQZA 4J8FA 4M7YA 2D0PA 5AZIB 4BC4A 4CZFA 5EOYA 2F9TA 3QDKA 4O8KA 3G25A 2E20A 5KQ8A 3VEXA 3ZETB 4PKIA 3H6EA 1HKGA 4DQ8A 4CZKA 3MN7A 2ASPA 4YDUC 1QQOA 3FZLA 4CZMA 3ZETA 4BRDA 3ATUA 3JXUA 3FZKA 2HF4A 4QS7A 4JNEA 1CZAN 2AA4A 4CZEA 3KZBA 3O5BA 2Q36A 2A5XA 5JLFA 3VOVA 3GBTA 2CGLA 3VEVA 1BDGA 5BPLA 3A5NC 3O08A 2V51B 4IJAA 4GNIA 2Q2RA 4B1YB 2E88A 3D2FB 2VYPA 3O1BA 2FSNA 2UYTA 3VF6A 3ZX2A 1BU6O 2P9UB 1HKCA 1YXQA 3FFKB 1NGEA 3FLCO 3O8MA 1E4FT 3CJ9A 1MA9B 3H3NO 2I7PA 1DKGD 3LDOA 3EKUA 4BRGA 2QW9A 2P9UA 3WT0A 1GLBG 5EVZA 4MLHA 3UE5A 2D4WA 2CGKA 3WUHA 2A40A 1RGIA 3ULEA 5AQLA 3VPZA 4FSVA 3GDQA 2E1YA 2QWLA 2E8AA 3VENA 1NGDA 1ZBSA 4WQ5C 3W0LA 2W40A 2Q1NA 4M63C 1QQNA 2P9SB 4B9QA 4FPBA 2EWSA 1K8KB 2QWMA 4H03B 1SAZA 5AQMA 1Z05A 2P9SA 1OKJA 2Q0RA 3CHWA 5BREA 5I9EB 1K8KA 1RDWX 2QWRA 5EY4A 4FPAA 2VWBA 1H1VA 5AQKA 5LJWA 5AQTA 5AQGA 2D0OA 5AQSA 2P9NB 1G99A 3SMPA 1C0FA 4ISGA 1S22A 3WEEB 2P9PA 3ATVA 4IJNA 3JS6A 4A2BA 1IJJA 4EAHD 4FL9A 2IVNA 1X3NA 1U2VA 5AQIA 2P9NA 4BR0A 4CBWA 1GLFO 3SLCA 3WEEA 1NM1A 1MWKA 4H0TB 1NMDA 1YUWA 4C23A 4FWKA 4PKHA 1D4XA 5FPMA 5KQDA 1QZ5A 3WXIA 3I8BA 1YVNA 3ID8A 3SK3A 4BC2A 3LDQA 4PKGA 4AM6A 4MO5A 1NGAA 3CJBA 4BGBA 3WXLA 1Y64A 5FPDA 1NGFA 5LY3A 5AQWA 1LOTB 2WUSA 4RWTA 3WQTA 4JHDB 1ESVA 4BRAA 4BRIA 5JICA 3KVGA 3H3OB 2YHXA 3M1FA 1HKBA 1TUUA 1TYQB 2AP1A 3VGLA 3H1QA 3A5MC 2YHWA 1QQMA 5ADXH 4B1UB 5F2RA 4K25A 4BREA 3R9PA 3BUZB 5AZIA 1TYQA 2BTFA 3UKRB 3L6QA 4B1VA 4BR9A 3CQXA 4FWLA 3AARA 4CZIA 4I6MB 4DB3A 4BQLA 5AQJA 5BN8A 4WQ4C 3MMVA 4DHYA 1S3XA 3I33A 5E84A 5F0XA 4JN4A 5AQRA 4O5FA 2FSKA 3O6WA 3U9ZA 2QM1A 5BR9A 4FWOA 1QZ6A 2P9KB 3D7EO 4PL8A 1ZC6A 1NGBA 3HZ6A 5AQFA 3UKUB 3U9DA 3UB5A 3ZEUB 4CBUA 4A61A 5EXWA 1QHAA 2P9KA 2FF3B 1T6DA 3CERA 3O4WA 4EFHA 3D2FA 5AQXA 3QFPA 3U8XA 2QWNA 1SQKA 3HI0A 3M6GA 3MCPA 3QICA 3RSEB 3ZEUA 4BRHA 1E4GT 3ENHA 4BRPA 4CZJA 4GY2B 3C7NB 1X9JA 2F9WA 3BEXA 3QB0A 5FPEA 2QXLA 3RSEA 1NGGA 1BA1A 3FGUA 5BPMA 3WQUA 2YHYA 3U4LA 4BRLA 2QWPA 5AQVA 3FZFA 3C7NA 1TUYA 2PBDA 3CJAA 3QMLA 5ELZA 4B1ZA 1LCUA 4MLEA 1GLEG 4IO8A 3WXKA 3A8YA 3MN9A 4IWVA 4BGAA 2ITMA 4A62A 1NGIA 2Q31A 4JD2B 1KAYA 1ATNA 2P9LB 4BR7A 3H1VX 2J4RA 3OHRA 4JAXA 3BF1A 2A6AA 4BRNA 1U6ZA 2D1KA 2GELA 4CD1A 1X3MA 3A5LC 3CI5A 3DXKB 4BQZA 2BUPA 5AQOA 4JD2A 4BG8A 2P9LA 1DGKN 3R8EA 5AR0A 1XC3A 3VESA 4IZ9A 5F1XA 2PAVA 2QWOA 3VEOA 3DXKA 4BR4A 2HOEA 3QFUA 1JCFA 4BRMA 3HSCA 3FZMA 3ZX0A 3LM2A 4BRCA 3DWLA 2GWKA 4B1XB 1ZXOA 4BRQA 5BRHA 3FZHA 1MWMA 2VCPA 3AAQA 4FWPA 5TKYA 2E1ZA 5JMVA 3A0IX 3QBXA 5JLHA 3D2EB 2ASOA 3MDQA 4IXCA 1T6CA 2GTDA 2V52B 3B8AX 3P4IA 3VEYA 4BVOA 3D2EA 4H0OA 4BVPA 1NGCA 5LJVA 3M3ZA 3J8AA 4XH1A 2HMPA 2YI1A 4EHUA 1J6ZA 4H0YB 1BG3A 3KHYA 1HPMA 5EX5A 4M7XA 4Z94A 4H5RA 5AQUA 4BC3A 4QS9A 3W3DA 1V4TA 3LM9A 4JHDA 3VERA 2KHOA 1NGHA 2H3GX 4H5WA 4BRKA 1R59O 3C0BA 2FLOA 4RCHA 3VEZA 4BR5A 1BUPA 1JCGA 1ATRA 5FPNA 1GLJO 1NLVA 4H5VA 5KPTA 1P8ZA 3CJ1A 1GLCG 3IFRA 3HTVA 3TPQA 1IG8A 1GLLO 4CJ7A 3DXMB 4H0XB 3CJCA 2A41A 1T44A 3CQYA 4HWIA 2IVOA 1WOQA 3UKRA 5BN9A 3VGMA 3MN6A 4ISEA 4ISFA 3R6MA 5B8HA 3DXMA 4XH4A 3S41A 4I6MA 2CH5A 2NZTA 1BO5O 4FOEA 4HTLA 1HUXA 5BRDA 3L4IA 4MO4A 4BROA 1YAGA 4FWMA 5ADXA 4K42A 4YDUA 2ZWHA 1HX1A 3EO3A 5AZJB 5BRFA 4XH5A 3WXJA 2ASMA 4BR2A 3LDPA 4CZLA 4A2AA 3UKUA 1MDUB 1EQYA 1RFQA 2IIRA 4WQ4A 4H0VB 2ZGYA 1Q18A 5AZJA 1NWKA 2A3ZA 3VGKA 4CI6A 4QS8A 3AAPA 3EL2A 3HBTA 3H46O 5AQYA 4H5NA 3L0QA 2YJEA 5AQQA 4NB4A 3BP8A 2FF6A 5BPNA 2NLXA 3F9MA 4Y0WA 3CIPA 1SZ2A 1BA0A 1Z6RA 2DPNA 2Q0UA 2GUPA 1GLAG 4FWQA 2GEMA 2V7YA 3GL1A 3EN9A 3HM8A 3ULEB 4EIAA 1BOTO 4B1WB 3A5OC 2E2NA 4RTFD 1ATSA 2CGJA 3VEWA 3EKSA 3SMSA 2V7ZA 2ZF5O 4EHTA 1KXPA 4DCHA 4FOIA 4H5TA 2YJFA 3O1WA 2Q97A 1DEJA 4E1JA 4WYBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PSMA 1UAXA 1WBDA 1ZYVA 4DR6K 4O0IA 4WQ5A 2GX9A 3MXIA 4MDAA 3SQ2A 4NO7A 2B6AA 1C0GA 2UUBK 3LWLA 1N34K 2NRVA 4NXNK 4KHNA 4KBOA 3CC2N 1UA0A 4M41A 4N56A 3CETA 3DJCA 5AQHA 3EZWA 1RT1A 2MZ0A 3AV9A 1HYZA 3SV4A 1XWLA 2D0CA 1W97L 3FE1A 1XMOK 3G6EN 3SQ1A 4FJ8A 3J7AP 4K43A 3QBWA 1KAZA 4BRFA 2NRHA 4CGHA 4UY8O 3K9KA 1V4SA 3QEXA 1NRBA 4W5TA 3CCSN 2OANA 1L3TA 3NF7A 4M3WA 3VETA 3GG4A 2FXUA 2P9IB 3OYBA 2QKBA 5E26A 1GLDG 4L3QA 5AQPA 1HNVA 4FWNA 4DUZK 1VAZA 4F9OA 4FWSA 5AFUA 1JKZA 5D3GA 1HNIA 4JKBA 1OH6A 4CZGA 3S9HA 4IDHA 2ATBA 3UIQA 1LW2A 4ID5A 4CBXA 4UJ0A 3F5TA 4CK3A 1SKSA 3SCXA 2LSNA 3N4QA 4CZHA 5KPRA 3L4QA 5AQZA 4FJIA 2F9TA 3NVKA 5JENA 3K5LA 4AB0A 3TTFA 3CF5L 4CFDA 3H6EA 1HKGA 1XHXA 4LF5K 3O9TA 1BIZA 4BWMA 4BRDA 3TWHA 4UADE 1YI2N 3JXUA 3RWUA 2AA4A 3VQ9A 3DLHA 2XO7A 5JLFA 3VEVA 3A5NC 3O08A 4HHTA 3AVJA 1NKCA 4IJAA 4DV0K 4GNIA 1IKWA 3D2FB 3HP6A 3I0SA 4CJFA 2UYTA 4WE1A 3VQ7A 2GL1A 1NK5A 2YIOA 3FLCO 2P5GA 1JZAA 2F96A 3O8MA 1MA9B 3DMJA 1WLJA 2P9UA 3V9UA 4O5BA 1T7PA 2D4WA 2CGKA 4CEEA 2ZJPL 4EZ6A 2GBZA 2QWLA 1BRZA 5HRRA 1KLMA 2E8AA 1VQ5N 5FRMA 4DWIA 4IO9L 1TVRA 3PO4A 4N5SA 2Q1NA 4M63C 2UXDK 4B9QA 2P9SB 3NCIA 1C6VA 4CGDA 3L2QA 1HQEA 1BCOA 2D0AA 1ZBHA 3VQPA 1SN1A 5AQMA 2YHBA 3TSUA 2ATQA 4JKFA 3PLAA 1K8KA 3P83D 2QWRA 1EWRA 3BY5A 4FLTA 5AQSA 3LANA 4L8RB 4F8RA 3QEIA 2IVNA 1U2VA 5AQIA 4OLAA 4DS5A 5C15A 3NAEA 1N36K 4DLGA 4CBWA 3SLCA 3U3YA 4DSFA 1T03A 3TR8A 4PKHA 1D4XA 2PZSA 1TL3A 3K9JA 2PFUA 4NLCA 1QZ5A 1ZU3A 3WXIA 3MAQA 3ID8A 4N47A 2VG7A 4YOTA 1FXXA 4Q5VA 1T7EA 3C6UA 3HVRA 1LOTB 1M1KO 4EZ9A 4RWTA 4BRAA 5JICA 1WSHA 1NJZA 3ZLJA 3PY8A 2YHXA 4DU1A 4ZTJA 1TYQB 2AP1A 3H1QA 3EEQA 5CY0A 3HOSA 4FLWA 4DTSA 1JLQA 5F2RA 4BREA 3AA5X 4LH4A 4RW4A 3AVBA 5AZIA 3LP2A 3ZSZA 1BCGA 4B1VA 1BQMA 3CQXA 3NVMA 4CZIA 4LSLA 2G2KA 4DHYA 4DQPA 4KH4A 3I33A 5AQRA 1LW0A 2HSTA 2YNFA 3SZ2A 4O5FA 1NH5A 5C2FA 4HE7A 4V1DC 1EO1A 4IKFA 4IDKA 3SI6A 1JLFA 3TSQA 4FLUA 5HRNA 4DQIA 4DU3A 2PYJA 4FWOA 1SS6A 3Q7CA 4G1QA 4E7JA 3MECA 4HVJA 1QE1A 2YEOA 2NRWA 1WWNA 2P9KA 2FF3B 3KK1A 4EFHA 1DLOA 3O4WA 1NG9A 2BH1A 2KZZA 5J2QA 3QIPA 3VQDA 1SQKA 3HVTA 3OYMA 3MCPA 3QICA 2VWJA 3V9WA 3SUPA 1E4GT 3ENHA 2BDPA 3NFAA 1LWFA 3ID6A 4GY2B 1X9JA 3HSTB 4CJ4A 4KHUA 2WONA 3VTIA 3DLBA 1HQUA 5BPMA 2QWPA 5AQVA 1KD1O 1VQLN 2PBDA 3DLLL 1LCUA 4RW8A 4IO8A 4AHSA 4AEIA 3V6DA 1Q7YO 3HP9A 4LY7A 3NDKA 3CFRA 4A62A 1LQHA 1K9MO 2UUCK 1RT4A 4ZHRA 4JAXA 2WTUA 4KHSA 2A6AA 1W0HA 4FZYA 2VG5A 1X3MA 3A5LC 3CI5A 1QSSA 2BUPA 5H1SQ 3NH2A 1B9FA 4E0DA 2O8EA 3AA3A 1IKVA 1GOAA 1YJNN 5C0YA 3DM2A 1OVQA 2A1SA 4BRMA 2B3CA 3E9PA 4DTOA 1CZBA 3KLIA 4I7FA 1RBVA 1T3VA 1JLBA 3D0PA 4CEDA 3DLGA 4DR2K 3AAQA 4FWPA 1JLGA 3L3UA 4J2EA 3D2EB 2OYQA 2YNIA 2ASOA 4DV7K 1KCFA 1ILYA 1T6CA 4M3YA 3P4IA 4IEIA 3VEYA 4B9UA 4KTZA 3U6FA 5LJVA 2QTDA 3CFPA 3J8AA 4ILHA 4CERA 4XH1A 1HR0K 2HMPA 2YI1A 3JYTA 1SV5A 5M1PA 1BG3A 2HNDA 4M3ZA 3BZKA 2Z1HA 3LWMA 3CQ8A 1BMRA 3AVHA 3W3DA 4JHDA 5SZTA 2N2QA 3EE8A 4AHVA 1R59O 3DRRA 3NE6A 3TAMA 3ZSWA 1ATRA 5C12A 3I55N 1U47A 2YHAA 3CJ1A 5TKWA 3U3GA 3DRSA 1IG8A 4H0XB 3CJCA 2A41A 3L2VA 5LMNK 3MN6A 4ISFA 3S41A 4KI6A 1F21A 1TKZA 2W6LA 4IFYA 4JI3K 1S6QA 4FOEA 1HNXK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3PSM A;  1UAX A;  1WBD A;  1ZYV A;  4DR6 K;  4O0I A;  4WQ5 A;  2GX9 A;  3MXI A;  4MDA A;  3SQ2 A;  4NO7 A;  2B6A A;  1C0G A;  2UUB K;  3LWL A;  1N34 K;  2NRV A;  4NXN K;  4KHN A;  4KBO A;  3CC2 N;  1UA0 A;  4M41 A;  4N56 A;  3CET A;  3DJC A;  5AQH A;  3EZW A;  1RT1 A;  2MZ0 A;  3AV9 A;  1HYZ A;  3SV4 A;  1XWL A;  2D0C A;  1W97 L;  3FE1 A;  1XMO K;  3G6E N;  3SQ1 A;  4FJ8 A;  3J7A P;  4K43 A;  3QBW A;  1KAZ A;  4BRF A;  2NRH A;  4CGH A;  4UY8 O;  3K9K A;  1V4S A;  3QEX A;  1NRB A;  4W5T A;  3CCS N;  2OAN A;  1L3T A;  3NF7 A;  4M3W A;  3VET A;  3GG4 A;  2FXU A;  2P9I B;  3OYB A;  2QKB A;  5E26 A;  1GLD G;  4L3Q A;  5AQP A;  1HNV A;  4FWN A;  4DUZ K;  1VAZ A;  4F9O A;  4FWS A;  5AFU A;  1JKZ A;  5D3G A;  1HNI A;  4JKB A;  1OH6 A;  4CZG A;  3S9H A;  4IDH A;  2ATB A;  3UIQ A;  1LW2 A;  4ID5 A;  4CBX A;  4UJ0 A;  3F5T A;  4CK3 A;  1SKS A;  3SCX A;  2LSN A;  3N4Q A;  4CZH A;  5KPR A;  3L4Q A;  5AQZ A;  4FJI A;  2F9T A;  3NVK A;  5JEN A;  3K5L A;  4AB0 A;  3TTF A;  3CF5 L;  4CFD A;  3H6E A;  1HKG A; 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