5FPEA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 1h-1,2,4-triazol-3-amine (at485) in an alternate binding site.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
b'GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 377
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpeA04
4WYBA 3HTVA 3KZBA 5AQIA 5BN9A 2A42A 5AQSA 2YHYA 2D0OA 3L4IA 3DXKA 2NLXA 4JNEA 5AQXA 3JS6A 3QICA 2FSKA 5EVZA 3HM8A 4BGBA 1T6CA 2P9PA 5LY3A 4FWMA 4WQ5C 3H3OB 4IJNA 4H0PA 5BPLA 1QHAA 4NO7A 1V4TA 2A3ZA 4CZGA 2ZGZA 3AAPA 3OHRA 1KXPA 2ZWHA 5KQDA 3BEXA 5KQ8A 4K41A 5E84A 3ID8A 3U4LA 2GTDA 3CJ1A 3EZWA 2I7PA 4B9QA 1ZBSA 4KBOA 1RGIA 1NGJA 2P9SA 3MCPA 1BWFO 3LL3A 1NLVA 4BRAA 3LDLA 1T44A 4H0VB 2E1ZA 1MDUB 4B1YB 4BC2A 4CBUA 4BR7A 3WEEB 1GLDG 3AY9A 3LM2A 3MDQA 1BDGA 3U9ZA 4BC4A 5BRDA 2VYPA 4RWTA 1TUUA 2OANA 4H5NA 1JCFA 2QM1A 4B1UB 2CH6A 3AAQA 1KAZA 1NGDA 1MA9B 3EN9A 3O4WA 1IG8A 2D4WA 2DPNA 2P9KA 3S41A 3D2EB 1TUYA 1U6ZA 1J6ZA 3GDQA 1U2VA 2CGKA 4J8FA 3MN9A 3AARA 2QXLA 4PKGA 3KVGA 4CZKA 4IJAA 1QQNA 4FWRA 5AQFA 1GLLO 1P8ZA 1R59O 3CJ9A 3UB5A 3CETA 1K8KB 4CJ7A 2A41A 4A62A 2FF3B 1DEJA 3DXMA 3IDHA 4C23A 3QFUA 3CQYA 4FO0A 3WT0A 5AFUH 4CZFA 3ZEUA 2CH5A 3KHYA 4HWIA 5ELZA 4O8KA 4BRGA 2P9IB 5BR9A 2YCHA 3D7EO 1HKGA 3DJCA 4FWOA 1QZ6A 2V51B 3C7NA 4PL7A 3SMPA 4CZIA 3CJCA 2E8AA 3O1BA 3FZFA 4NB4A 4BQZA 1HUXA 2Q36A 1BO5O 2P9UB 1DGKN 2IVOA 2P9NA 3MMVA 3GOIA 3UKRB 1EQYA 3FFKB 1QQOA 2KHOA 2AP1A 3R8EA 5F0XA 5BRFA 3L6QA 3GG4A 3QDKA 1H1VA 4I6MA 4LC9B 1NGHA 3VESA 5I9EB 4H0YB 1E4FT 1KAXA 1YXQA 2F9TA 5AFUA 5EXWA 2D1KA 2NRHA 1XUPO 3U9DA 3ZETA 3BF1A 5AZIA 4JHDA 4L3QA 3UE5A 4AM7A 3IFRA 5AZJB 1NGCA 2E88A 1TYQB 4FWLA 4A2BA 3UKUA 4H5WA 3I8BA 3WXLA 3GBTA 3JXUA 2A5XA 1GLEG 3O80A 1BUPA 3ENOA 5AQOA 4A61A 1V4SA 2VCPA 4YDUA 4M7XA 1YVNA 4CZLA 4JD2B 1NGFA 3BF3A 1NGBA 2W41A 3A5OC 1S3XA 1G99A 3VETA 4H5RA 3VENA 1HPMA 4BC3A 4AM6A 2V7ZA 2D0PA 5KPZA 4BRIA 5AQLA 1GLAG 3WXJA 3WXIA 4CI6A 3R6MA 5BPMA 3VGKA 1C0GA 3WQTA 4BROA 4PKIA 3WEEA 4JAXA 3VEYA 3RSEB 3VGLA 5BREA 2ASPA 5KPTA 4PL8A 4JN4A 4FWQA 4MLHA 5BN8A 3CHWA 2P9LA 5AQZA 1E4GT 3VEVA 1XC3A 3DAWA 3VEZA 4K42A 4XH4A 1NGIA 3DXKB 4CD1A 2V7YA 3O5BA 3H3NO 3QBWA 4H5VA 2P9PB 4CBWA 1BU6O 3F9MA 3EO3A 1ZC6A 2YI1A 4M63C 1MWKA 3W3DA 4DQ8A 2IIRA 3D2FA 1Z05A 4FOIA 3A5NC 3W0LA 1S22A 3LDPA 1GLCG 1XQSC 3CERA 4MO4A 2Q0UA 4IO8A 1HKBA 3H6EA 4ISEA 2ZF5O 3CJAA 2E2PA 4BRLA 2P9SB 4M7YA 2FSJA 3FLCO 3WQUA 1ATNA 5FPEA 1KAYA 5FPDA 4F9OA 1ZXOA 5AQKA 2E20A 3LDQA 1GLFO 1YUWA 3QFPA 4DHYA 2I7NA 3GL1A 4CBXA 5AQQA 5AQTA 3MN5A 3R9PA 3GE1A 1WOQA 1Q18A 3FZMA 2CGLA 5E26A 3ULEA 4FWSA 4BRPA 3CIPA 1BOTO 3CQXA 3QMLA 4MLEA 3UKRA 4EIAA 2QWLA 1Z6RA 4B1XB 5LJWA 2E1YA 2GWJA 4MO5A 3HSCA 1C0FA 3HBTA 4FPBA 4BG9A 1U2VB 4BRMA 4BRNA 4BR4A 2PBDA 5LJVA 3P4IA 4XEIA 5CE3A 3M3ZA 4BR0A 4BGAA 4QS7A 3H1VX 5AQWA 3FE1A 2IVNA 3BP8A 3MK6A 4FSVA 2FXUA 4H0OA 2GELA 5AQGA 3IUCA 4BRCA 3L0QA 3VF6A 3WUHA 2YJEA 4FWNA 4IWVA 1QZ5A 3ATVA 4QS9A 3FZHA 3ZEUB 3LDNA 1CZAN 1NGGA 3FGUA 3FR0A 3HI0A 4H03B 4YDUC 3VERA 4FL9A 4CZHA 3ENHA 4A2AA 1NWKA 4GNIA 3H1QA 3SK3A 4B1WB 2FLOA 2E2NA 2QWQA 4CD3A 3C7NB 1Y64A 5AQMA 5JLHA 2QWMA 2FSNA 3QB0A 3U8XA 3MN7A 4BC5A 3ATUA 3SLCA 3A8YA 4IXCA 2QWRA 3A0IX 3A5LC 3H46O 1D4XA 3RSEA 4BQLA 4EFHA 3ZX2A 3SMSA 1RDWX 2A40A 4FPAA 5AQJA 4EAHD 3ZX3A 4K25A 2E2QA 2QWPA 3ZETB 2AA4A 3O08A 2QWNA 1SZ2A 5AZIB 1X3MA 2ASOA 1JCEA 1BG3A 2HOEA 4JHDB 2ITMA 4BVOA 4ISFA 4K43A 4BRDA 5AR0A 1NM1A 5EY4A 2HF4A 4FWKA 4WQ4A 3CJ7A 5FPNA 3UKUB 5BPNA 2UYTA 5EOYA 4BRQA 4E1JA 2YHWA 4XH1A 4H5TA 2QW9A 5BRHA 1BA0A 3ZX0A 3D2EA 5FPMA 2QWOA 3M6GA 4DCHA 1ATRA 1LCUA 4CZJA 3TPQA 2E2OA 2V52B 4FWPA 5AQVA 4QS8A 1GLJO 4BG8A 4WQ5A 1GLBG 3VEWA 4BRFA 3O8MA 1MWMA 1K8KA 4BR9A 1BA1A 2GUPA 3VOVA 2Q97A 4DB3A 3VF4A 2ASMA 4IZ9A 2H3GX 3FZKA 3SJHA 4RCHA 1ATSA 2Q2RA 1NMDA 3B8AX 1YAGA 2P9LB 4CZEA 4EHUA 1X9JA 1IJJA 5EX5A 2P9IA 2HMPA 4O5FA 1SAZA 3CJBA 2NZTA 2YHXA 2WUSA 3H45C 3EL2A 5ADXH 4BR5A 5JLFA 5AQRA 4BR2A 3VF2A 1HKCA 1X3NA 1RFQA 3D2FB 2P9UA 3J8AA 3O1WA 3CI5A 3MN6A 5B8HA 4GY2B 4XH5A 2P9KB 5JICA 3QBXA 3VPZA 4BVPA 1NBWA 2Q1NA 5AQNA 2Q0RA 2VWBA 5KPRA 1WUAA 1LOTB 2IVPA 4EHTA 1T6DA 4HTLA 3LM9A 1JCGA 3M1FA 3VEOA 4H0XB 5F2RA 1QQMA 3DWLA 3DXMB 5JMVA 2GEMA 3EKUA 5AZJA 3VGMA 2CGJA 1TYQA 2W40A 3BUZB 4BREA 2F9WA 2PAVA 2YJFA 5ADXA 2FF6A 3ULEB 1HX1A 3G25A 3TU5A 2A6AA 3VEXA 1DKGD 3LDOA 1NGAA 4B1VA 1OKJA 4Y0WA 2ZGYA 4JD2A 2HF3A 4ISGA 4PKHA 4RTFD 4BRKA 4FOEA 2BTFA 5AQPA 5F1XA 3HZ6A 4Z94A 1NGEA 3EKSA 4CZMA 2EWSA 3I33A 4H0TB 3C0BA 2Q31A 5AQYA 2P9NB 3O6WA 3FZLA 5AQUA 5TKYA 3A5MC 4B1ZA 1ESVA 1SQKA 3WXKA 3IMXA 5AQHA 2GWKA 1HLUA 2BUPA 4I6MB 2J4RA 1HJOA 4WQ4C 4BRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O3FA 4KHQA 3HTVA 5BN9A 2A42A 3L4QA 4CIFA 3P38A 4OLBA 4E7LA 1VQ5N 1GOCA 5KK4A 2FSKA 2OA8A 3HM8A 4ILHA 4KHUA 5LY3A 4CFBA 3JAMO 3G6EN 2ZJRL 1ASVA 3THXA 1ZYQA 4DMNA 1XMOK 1UA0A 4IJNA 2BGGA 2A3ZA 4CIGA 2ZGZA 3I0SA 2KBKA 1HNIA 4BWMA 3VQBA 5DMRA 4RW4A 4B9QA 2I7PA 4YY3K 1RGIA 2ETJA 3K9JA 1NGJA 1VSEA 3PY8A 2YHAA 3LL3A 4BRAA 4FK4A 4GVMA 3C94A 3NGIA 3VMFB 2O8FA 1SKWA 3LPTA 3AVHA 3RRGA 1BQNA 2E1ZA 4W5QA 2YNGA 4B1YB 4UADE 4CBUA 4EZ6A 4F3OA 5CZ2A 2E2FA 3AY9A 3LM2A 2JLEA 1NRBA 1BDGA 3OBWA 4DR6K 5HBMA 3PV8A 3NGYA 3KLEA 2F8SA 4BE7B 2OANA 4CHNA 3V1RA 4U7BA 3AAQA 1KAZA 1NGDA 1MA9B 3EN9A 4ZTFA 4RW8A 4PUOA 3L2RA 3D2EB 1FKPA 4H4MA 3S5TA 1TUYA 1J6ZA 3GDQA 4J8FA 3Q7CA 3P31A 3J7AP 4JKDA 4DUZK 2JGUA 5C12A 3RRHA 1GLLO 1R59O 3CJ9A 3CETA 2A41A 4A62A 1ZBFA 2FF3B 1DEJA 3TAMA 4CE9A 4C23A 4KTWA 4DWIA 3SUNA 2MN5A 1BI4B 2IAJA 4FJGA 5ELZA 1BISA 4DF4A 3RWUA 3CMAN 2RF2A 3BZKA 2YCHA 5M1PA 2V51B 1RILA 1OVYA 2O8BA 3SMPA 2Z1JA 3VQQA 3FZFA 4NB4A 3C65A 1D9FA 1HUXA 1DGKN 3D0PA 3J7ZO 3CCEN 1QQOA 4ELUA 2KHOA 2AP1A 1RDBA 5BRFA 3QEVA 3CFRA 5HROA 3DM2A 3GG4A 4HVJA 3QDKA 5JS2A 1NGHA 3PIOL 4H0YB 3MX5A 1T8EA 2F9TA 3NMUA 1L3VA 3OJUA 1XUPO 2KTQA 1G15A 3UE5A 1I39A 4PHTX 2E88A 1TYQB 3TANA 3WXLA 3T1HK 3AVNA 4LF5K 4FCYA 1OH8A 4G9ZA 2YX6A 2QA4N 4YDUA 1YVNA 2B68A 4C1NI 4FM1A 1Q8IA 3BF3A 2W41A 1D9DA 4IDKA 4CK1A 1IO2A 4E0DA 4FJ9A 1YTUA 3PIPL 4H5RA 2OZMA 3VENA 4BC3A 4AM6A 3OYMA 5AQLA 3WXIA 2YHBA 3ZSXA 5BPMA 3J80O 1MYNA 3VQ8A 3SCXA 3OYHA 1CN2A 3VEYA 3OJSA 1JLAA 3LP2A 1UOCA 4PL8A 5AQZA 4CEFA 5JENA 1TKDA 4CJQA 1SUQA 5LL6Z 3AVLA 2EHGA 3CCMN 5M1QA 4NXMK 3BGRA 2KZMA 1NGIA 4BEBA 1IG9A 3VQCA 3G10A 2IOCA 1U45A 4KH6A 3TI0A 1Q9YA 4B9TA 4H5VA 3PO5A 4FJMA 3F9MA 1KQSM 2YI1A 1K73O 2D0AA 2YIPA 1VQ9N 4O8UA 3LANA 4KO0A 1Z05A 1S22A 3LDPA 4Z4EA 2Q0UA 4BDZA 2E3FA 1VK0A 1HKBA 4KPYA 4ISEA 5CY4A 3JYTA 4DTXA 1ILYA 2GMOA 1SS6A 2O8CA 4E3SA 2E2PA 2P9SB 4F2RA 4JKFA 2FSJA 4R5PA 5FPDA 4F9OA 2OTJN 1NOYA 3SBTA 1S9GA 3LDQA 1WWNA 1SN1A 5AQQA 4X66K 5AQTA 3MN5A 3R9PA 1WOQA 4DSLA 2CGLA 4LFBK 5E26A 2DTUA 2B4JA 3BY5A 3DLBA 4A59A 3L56A 2QWLA 1Z6RA 1HYSA 4A5AA 4FJHA 3M8QA 4BDYA 4FPBA 3HBTA 2VWJA 5CHIA 2FBXA 1TI5A 3EE8A 4KH5A 3ULDA 3ZSOA 2PBDA 2G8WA 4LY7A 3CFPA 1NU0A 3M5RA 3ZT3A 1NK9A 4E7IA 1EX4A 1TGOA 1GPSA 3OYKA 4BGAA 3DRPA 2O8EB 2O4IA 5AQWA 2OTLN 4B9VA 4AHCA 3MK6A 3K5NA 3L2UA 3MAQA 4JKHA 1DJTA 4BRCA 1DTTA 1RCHA 3VF6A 4QS9A 2YC1C 3AVFA 2VY6A 1CZAN 3HI0A 3KOXA 3O3GA 4H03B 2JWLA 1REVA 2UU9K 3ENHA 4A2AA 2UXBK 1NWKA 4GNIA 3SPYA 4V1DC 4F3TA 3C7NB 1Y64A 2BH1A 4B3MK 4QCLA 4CJWA 1X9SA 4LSNA 4BC5A 3ZSWA 3DRSA 3V6DA 3ISNC 1TKZA 3THVA 3V1QA 4IXCA 1GOAA 1EWRA 5KI6A 3SMSA 4UJ0A 1S72N 5FROA 3NH0A 1ZU3A 5AQJA 3HRGA 4EAHD 2LR3A 4B3SK 4HHFA 4DR1K 1X3MA 1C56A 3ZCMA 4ISFA 3KK2A 5EY4A 1HYZA 5FPNA 1ZBHA 4BRQA 2HSTA 4E1JA 1RBTA 1Z25A 1I94K 4H5TA 3RMDA 2QW9A 4FJKA 4I2PA 5BRHA 3CCQN 3R1XA 4B9NA 3O9TA 1L3TA 4JLHA 4DCHA 1ATRA 3D6RA 2E2OA 3AVBA 2KJAA 1CZBA 2V52B 2HNYA 4QS8A 1LQIA 4O4GA 3L2VA 4WQ5A 1S1XA 3O8MA 1OMYA 5FLXO 4CJ5A 4JS4A 4I9QA 4O5BA 3VOVA 2YNIA 3VF4A 3G71N 3NF6A 2I61A 2H3GX 2LJMA 3FZKA 2VG7A 3B8AX 1W97L 4B3OA 4CZEA 4RW7A 2A1RA 1YJWN 3PLAA 5EX5A 1T7AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O3F A;  4KHQ A;  3HTV A;  5BN9 A;  2A42 A;  3L4Q A;  4CIF A;  3P38 A;  4OLB A;  4E7L A;  1VQ5 N;  1GOC A;  5KK4 A;  2FSK A;  2OA8 A;  3HM8 A;  4ILH A;  4KHU A;  5LY3 A;  4CFB A;  3JAM O;  3G6E N;  2ZJR L;  1ASV A;  3THX A;  1ZYQ A;  4DMN A;  1XMO K;  1UA0 A;  4IJN A;  2BGG A;  2A3Z A;  4CIG A;  2ZGZ A;  3I0S A;  2KBK A;  1HNI A;  4BWM A;  3VQB A;  5DMR A;  4RW4 A;  4B9Q A;  2I7P A;  4YY3 K;  1RGI A;  2ETJ A;  3K9J A;  1NGJ A;  1VSE A;  3PY8 A;  2YHA A;  3LL3 A;  4BRA A;  4FK4 A;  4GVM A;  3C94 A;  3NGI A;  3VMF B;  2O8F A;  1SKW A;  3LPT A;  3AVH A;  3RRG A;  1BQN A;  2E1Z A;  4W5Q A;  2YNG A;  4B1Y B;  4UAD E;  4CBU A;  4EZ6 A;  4F3O A;  5CZ2 A;  2E2F A;  3AY9 A;  3LM2 A;  2JLE A;  1NRB A;  1BDG A;  3OBW A;  4DR6 K;  5HBM A;  3PV8 A;  3NGY A;  3KLE A;  2F8S A;  4BE7 B;  2OAN A;  4CHN A;  3V1R A;  4U7B A;  3AAQ A;  1KAZ A;  1NGD A;  1MA9 B;  3EN9 A;  4ZTF A;  4RW8 A;  4PUO A;  3L2R A;  3D2E B;  1FKP A;  4H4M A;  3S5T A;  1TUY A;  1J6Z A;  3GDQ A;  4J8F A;  3Q7C A;  3P31 A;  3J7A P;  4JKD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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