2E2PA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with adp
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords HEXOKINASE
publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule tags Transferase
total genus 104
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2pA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2pA01
5ADXA 1BUPA 2GUPA 4DQ8A 3FLCO 5AQIA 2Q0UA 4RCHA 3ZEUB 1NGHA 3A0IX 1BU6O 3FZFA 2P9NB 1CZAN 1QQOA 1HX1A 4PL7A 1LCUA 3H1QA 4GNIA 4QS9A 3QFPA 3WT0A 3UE5A 4BREA 5ADXH 1GLEG 1NGEA 1V4TA 4WQ5C 1NM1A 1GLCG 3O4WA 3QDKA 1GLLO 5AQZA 1E4FT 4HTLA 1HJOA 1NBWA 3BF3A 3QFUA 3F9MA 5TKYA 2VCPA 1NGCA 1BA0A 5BREA 4XH5A 3CJ9A 2ZWHA 2ITMA 1K8KB 3L6QA 3ATUA 2EWSA 3BP8A 3ZX3A 3D2FB 2F9TA 1ESVA 3FZKA 3S41A 3LDNA 1GLFO 4JD2B 3GDQA 1X9JA 3WXIA 3HTVA 4B1WB 3ULEB 2IVOA 1XUPO 4RTFD 1S3XA 1WOQA 4BQZA 1JCEA 3SMPA 1TUUA 4FWMA 3I33A 2Q31A 1T44A 3QB0A 2QWRA 3O80A 4EHTA 3QMLA 2I7NA 3ZX0A 5LJWA 2FLOA 3M1FA 1YUWA 1G99A 2OANA 2P9KB 3H45C 1QZ6A 3CJCA 3L4IA 2QXLA 3FGUA 4BVOA 3DXMB 2FSKA 4GY2B 3O8MA 2YHYA 3A8YA 1XC3A 2E20A 3D2EB 3D7EO 2GEMA 4CBUA 1QZ5A 4RWTA 4YDUC 3MMVA 3G25A 2W41A 4BRHA 4FOIA 5AZIB 4CZFA 2CH6A 3BF1A 2P9SA 4I6MB 5AQSA 1IJJA 3L0QA 4IZ9A 3ZX2A 4K41A 1ATRA 2CH5A 1V4SA 3VERA 3UB5A 3VEZA 1HKBA 5FPEA 4XH1A 5AQWA 2UYTA 5EXWA 2QWPA 4EFHA 4K42A 5BRDA 2FSJA 3VEYA 2A41A 3LM9A 5AQVA 4BR4A 4NB4A 3UKRB 4CZLA 1S22A 2CGJA 5F1XA 1MWKA 1BOTO 2E2OA 5AQKA 4BC5A 1U2VA 3DXKA 1Y64A 5JICA 2Q2RA 3MCPA 3RSEA 3ID8A 3WQTA 3EKUA 4DHYA 5I9EB 2P9PA 4FWKA 3WUHA 5JLHA 4WQ5A 2A40A 2P9IB 3LDQA 2QWNA 2QWLA 2HF3A 3EKSA 2V7ZA 4E1JA 2FSNA 3VF4A 4FWPA 4EIAA 3JXUA 4FO0A 3EZWA 3O08A 4MLEA 4BR9A 5BPMA 1R59O 1P8ZA 4NO7A 4PKGA 2A3ZA 3UKUB 5B8HA 2P9LB 3ENOA 4JN4A 3R8EA 4BRMA 4A2BA 1SAZA 2NZTA 2D0PA 3VEWA 4DCHA 5ELZA 4BGBA 2D1KA 5F2RA 3QBWA 3R6MA 4IJNA 4A62A 1X3MA 5AQFA 3SMSA 4CZMA 3A5NC 3GL1A 2E2NA 2D4WA 2YI1A 3IMXA 4FOEA 4FWOA 1C0GA 2P9UB 3WEEB 3O5BA 3A5OC 4BRLA 1YXQA 5BR9A 1SZ2A 3FFKB 3OHRA 4J8FA 2GTDA 2V52B 4L3QA 4YDUA 2Q97A 3HSCA 4H0TB 1MWMA 3R9PA 3DJCA 3LDLA 3A5LC 4FWNA 3C7NA 4FWLA 4AM7A 2YCHA 2A42A 3IUCA 3SLCA 5AQTA 1ZXOA 4WQ4A 4AM6A 2E88A 5FPNA 3FE1A 1HLUA 3IDHA 4CZHA 2FXUA 4BROA 1NGBA 2AP1A 3VOVA 3JS6A 1NGAA 3GBTA 2Q0RA 1T6DA 3MDQA 4BVPA 2BTFA 4XH4A 3C0BA 5E84A 4BQLA 4CBWA 1Z05A 2QWMA 1NGGA 2FF6A 5BN9A 2YJFA 1WUAA 3ZETA 4BR5A 4H0OA 3SJHA 1MA9B 4IXCA 5AQYA 4FSVA 3W3DA 1KAYA 3FZMA 2V7YA 3BUZB 3KHYA 1EQYA 3LM2A 1JCGA 4BC4A 3D2EA 3CJAA 3I8BA 2IIRA 3GOIA 3VGLA 1RDWX 4H5RA 1ZBSA 2E2QA 5AZIA 2A6AA 3U9DA 4H5WA 2PBDA 1U6ZA 2E8AA 3AARA 1NWKA 1E4GT 4CZEA 4JHDB 3QICA 3HBTA 1RFQA 3J8AA 2DPNA 4ISFA 5AZJB 4BRCA 4FL9A 3MN5A 4H0YB 2H3GX 4CZJA 5EOYA 3UKRA 1BDGA 3VESA 3GE1A 4K43A 1BWFO 5JMVA 4PKIA 4CI6A 3LDPA 4H5VA 2P9SB 1IG8A 2NRHA 4B1ZA 5KPZA 2YJEA 3CJBA 5AQXA 2HF4A 2IVPA 3VGKA 1TYQA 1H1VA 2NLXA 3HZ6A 4O8KA 4B1VA 3MN7A 4BG8A 4DB3A 2P9IA 1YAGA 2QWQA 4CD3A 2A5XA 1C0FA 3VF6A 4Z94A 1QQMA 4BRGA 3H46O 3O1WA 4K25A 1U2VB 1J6ZA 5JLFA 5BN8A 5AFUH 3IFRA 3RSEB 3SK3A 1HPMA 4JAXA 4BC2A 3B8AX 5LJVA 1DKGD 2P9PB 1BG3A 3TU5A 2VWBA 3VEVA 3WXJA 4H0PA 2ZF5O 2GWKA 5AQJA 5EY4A 5AQOA 3M3ZA 3AAPA 3U9ZA 1XQSC 5FPDA 4FWSA 3A5MC 4MO4A 5BPNA 4ISGA 3ZEUA 1DGKN 4XEIA 1D4XA 5AR0A 3M6GA 4CZIA 1TUYA 3CQYA 1GLAG 2P9NA 3KVGA 5E26A 4BRIA 4C23A 3U8XA 2IVNA 5FPMA 3VF2A 3H6EA 4BG9A 5AQLA 4EAHD 5AQHA 4H5TA 1ATNA 4PL8A 3H3OB 1NGJA 4BR0A 4A2AA 4IO8A 4JNEA 2ZGZA 3VENA 1QQNA 2ASOA 3CQXA 3O1BA 1HKGA 5LY3A 4H5NA 1K8KA 4MO5A 1NGIA 4CZKA 4H0XB 3HI0A 3D2FA 3W0LA 2HMPA 2F9WA 2Q1NA 3WXKA 4JD2A 1OKJA 1HUXA 5AQNA 3FZLA 4IJAA 4B1XB 3ULEA 4CD1A 4BGAA 2KHOA 5AQQA 1GLBG 4QS7A 5AQRA 2Q36A 1RGIA 4B1YB 3C7NB 3VEXA 4B1UB 5EX5A 2QM1A 3U4LA 4FPBA 2P9KA 3QBXA 4HWIA 1GLDG 2HOEA 4BRQA 5BRFA 1JCFA 4IWVA 1DEJA 2GELA 2V51B 4H0VB 1KXPA 2D0OA 1GLJO 2E1YA 3DXMA 3CIPA 2CGKA 3KZBA 3H3NO 3CJ1A 2AA4A 3CETA 4FWRA 4I6MA 1BO5O 3ZETB 2FF3B 5F0XA 1ATSA 3CERA 3CHWA 2E2PA 4BRKA 3FZHA 4JHDA 3ATVA 4ISEA 5AQMA 5AZJA 5KPRA 5BPLA 1NGFA 1LOTB 1Z6RA 1NGDA 2J4RA 3MN6A 1ZC6A 3P4IA 4CZGA 1HKCA 1KAZA 3ENHA 3WQUA 4CBXA 3LDOA 4BRFA 3CJ7A 4BRAA 3O6WA 5BRHA 3MN9A 3WXLA 4Y0WA 4WQ4C 4BC3A 4BRPA 5AFUA 3HM8A 1YVNA 2YHXA 3EO3A 3AAQA 5EVZA 2QW9A 3BEXA 2I7PA 2GWJA 4M7YA 4WYBA 1NMDA 5KQDA 3LL3A 1T6CA 3DXKB 4LC9B 4M63C 4CJ7A 2ZGYA 4KBOA 2E1ZA 3VPZA 1TYQB 3UKUA 4A61A 2P9LA 4BRNA 4O5FA 4B9QA 5AQGA 4QS8A 4PKHA 1X3NA 2YHWA 5KQ8A 4BR7A 3H1VX 1NLVA 2CGLA 1KAXA 1Q18A 1SQKA 2QWOA 3VGMA 4MLHA 2WUSA 4H03B 3VEOA 1QHAA 2W40A 3FR0A 5CE3A 3AY9A 3VETA 4FWQA 2VYPA 2P9UA 2ASPA 3TPQA 3WEEA 2PAVA 5KPTA 4FPAA 3MK6A 3GG4A 4M7XA 4BR2A 1BA1A 5AQPA 1MDUB 4F9OA 5AQUA 4BRDA 3DWLA 3EL2A 3EN9A 4EHUA 3CI5A 2BUPA 3DAWA 2ASMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKGB 5ADXA 2GUPA 4DV7K 3AVNA 3FLCO 4WCEL 4JS4A 3THYA 4GVEA 4RCHA 3ZEUB 1CZAN 1HX1A 4PL7A 3H1QA 4QS9A 3QFPA 1GLCG 5FDLA 1Q82O 5AQZA 4LF6K 3QFUA 1NBWA 3F9MA 2KQ2A 3SV4A 1VQON 1JLBA 1W0HA 5BREA 4XH5A 2UXCK 1L3VA 2ZQBA 3LAKA 4LSNA 5MLCQ 3D2FB 2F9TA 3S41A 3LDNA 3CCLN 4ELUA 1X9JA 4B9TA 4ELTA 2IVOA 1C1BA 3ZT3A 4A57A 3KWIA 4FWMA 4RW7A 2Q31A 3RMCA 2QWRA 3KTQA 3QMLA 3O4QA 3AVKA 4C8KA 1YUWA 1QHTA 4IG3A 4HHTA 4LF9K 4KTQA 4JI3K 2B5JA 4GY2B 2ZE2A 5CZ1A 1VQ4N 2YHYA 3A8YA 1XC3A 4DQPA 3OYDA 2GEMA 3T3FA 4RWTA 3NGZA 2HHQA 2BANA 3MMVA 2W41A 3OYCA 4FZXC 2P9SA 3MAQA 1ATRA 3ZSQA 1NJZA 3CG7A 2DY4A 2P51A 5FPEA 2ZM6K 5AQWA 2X78A 5M1KA 2QWPA 2VG5A 5BRDA 2O4IA 2A41A 1SL0A 2O8CA 4BR4A 4DS4A 4NB4A 3RRHA 3P39A 3HPGA 4DV6K 4CIGA 5KRTA 3PSIA 4BC5A 3DXKA 1VQKN 3O9UA 5JICA 1JL2A 2OPSA 3RSEA 4JKHA 3M8RA 1JL1A 1Z25A 5I9EB 3AVBA 3JAMO 3D0PA 1Y97A 5JLHA 4WQ5A 4YHHK 4IG0A 2QWNA 3P1GA 2NRVA 3EKSA 3TSPA 5HRNA 1KRPA 5HRRA 3CCMN 1NJYA 3EZWA 4DLGA 3SUQA 1QVFM 4JEPA 4MLEA 3OYEA 5BPMA 1R59O 4NO7A 3CF5L 4PKGA 3AVCA 4JI0K 1QTMA 3UKUB 1M90O 3G6EN 1SAZA 3NH1A 4B3OA 5ELZA 4CJ3A 4BGBA 1S6QA 3R6MA 4NLCA 4IJNA 1NJIO 4A62A 2P5OA 3SMSA 3ZT0A 3MCAB 4JI2K 1QVGM 1BQMA 3GL1A 3KLEA 2FBVA 4YOYA 2P9UB 3DOLA 1VSMA 2ZD1A 3WEEB 3ZSRA 3KIOA 2EHGA 3SQ2A 3T19A 4PUOA 1YXQA 3G71N 4DR2K 4J2EA 3C6TA 3ENBA 1HYZA 4L3QA 4YDUA 1RT1A 2RKIA 1MWMA 3HPOA 3K0SA 4BDPA 4OO1J 5C25A 4GV3A 3C7NA 4M3ZA 2UUAK 3VQBA 1LWCA 5AQTA 3AGRA 1S1TA 1ZXOA 4CEZA 3DLEA 3T1AA 2ATQA 2B6AA 2WONA 4K8ZA 4CFAA 3IG1A 1SV5A 2FXUA 1TAQA 4BROA 1SKWA 3VOVA 1WSIA 3GBTA 4OX9K 3SAFA 2Q0RA 3MDQA 3HT3A 4BVPA 2XY5A 3LALA 1LV5A 4M42A 4CEBA 4DV3K 3O9QA 1LAWA 1ZBHA 1ZBIA 4N56A 4CK3A 4FLXA 4DR3K 3AA4A 4IXCA 1HNXK 3OA9A 3OJUA 3HO1A 4FJXA 3LM2A 3K5NA 1JCGA 4FJ8A 1ZYQA 4BDYA 2O8DB 4CGIA 4H5RA 3LP3A 2E2QA 5AZIA 3ZYYX 2A6AA 3PY8A 3U9DA 3QO9A 1OVYA 1VHXA 1S1WA 4DG1A 3QESA 3SI6A 2OZMA 3J8AA 3I8DA 1IKXA 3U3GA 1VRUA 2O8FB 4BRCA 3TR8A 4DV2K 1SS6A 4H0YB 1SL2A 4KI4A 2KTQA 3UKRA 3VESA 3GE1A 5JMVA 4LFCK 3PUFA 2NRHA 4B3SK 2YJEA 3DLLL 3AO5A 2HF4A 1TYQA 3LPTA 4B1VA 1JLCA 4JYAK 4MDAA 2G8UA 4CJRA 4DTPA 4F8RA 1UA1A 3DRPA 2ETJA 2HHXA 1C0FA 5GADP 3V9ZA 5I3UA 2B4JA 2FBYA 4O44A 1U2VB 4TSXA 2HNDA 5AFUH 3I56N 1HPMA 3BGRA 3B8AX 4JRPA 1QSSA 1BG3A 3TU5A 3VEVA 3AO1A 3MXJA 2XY8A 2ZF5O 4JK7A 1Q86O 3S9HA 2XO7A 4KHWA 3QEPA 3U9ZA 2D5RA 4FWSA 5C12A 4ISGA 2OYQA 1Z26A 4XEIA 1D4XA 1BL3A 5AR0A 3M6GA 1TUYA 3CQYA 1L3UA 5E26A 2IVNA 1N32K 3IAYA 3VQPA 3H6EA 1TK8A 1CXQA 1C0MA 1RBVA 4X62K 4BR0A 4G1QA 1WSHA 4IO8A 3AA5X 4OKEA 3KLFA 3M8SA 2HNYA 2ZGZA 2Z1GA 1D5AA 3CQXA 4QAGA 2KFZA 2P1JA 3O4NA 1KLMA 2QEXN 3W0LA 4JD2A 1OKJA 3FZLA 4B1XB 3ULEA 3KD5E 4JI7K 5KI6A 1XMOK 4NXMK 4KO0A 2Q36A 1I3AA 1RGIA 1YI2N 3NE6A 4KHUA 2QM1A 3U4LA 1U04A 3VQ7A 4HWIA 2P9KA 3QBXA 4IEIA 4BRQA 5BRFA 1CZBA 1YTUA 4H0VB 3CXCM 1KXPA 5HRSA 4KPYA 3CIPA 4X65K 1BIUA 3OVNA 3SQ1A 5E41A 4M3WA 2AA4A 3J80O 3V9UA 1KFDA 1BISA 4CEAA 4CHYA 3CC2N 1ATSA 2O8BB 1N34K 4M3YA 4HUEA 3ALYA 3LP2A 3MX2A 5AQMA 5BPLA 1KCFA 1NGFA 1LOTB 3VN5A 3I55N 3QNNA 3DLBA 1ZC6A 4CZGA 4KB0A 3ENHA 4CBXA 4B9LA 3LDOA 3CJ7A 3OYNA 1XNQK 3RRGA 1BGXT 2QXFA 3O6WA 3DMJA 2P5GA 5J2PA 3LZJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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