2E2PA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with adp
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
total genus 104
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2pA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2pA01
1P8ZA 3WXIA 1NGAA 3VEXA 2HF4A 4F9OA 3ID8A 2Q97A 3GOIA 3QFPA 4BRFA 4A61A 4EHTA 3GDQA 3UKUA 2GWJA 4H0TB 4BRPA 2BUPA 1JCEA 2P9UB 1X3NA 4WQ4A 3ENHA 4CZIA 3VGLA 3IDHA 2QWPA 4FOIA 4EFHA 4C23A 4BVPA 3M1FA 1WUAA 1GLJO 1D4XA 3ATUA 5E84A 4BRIA 2J4RA 5BPMA 2HOEA 2GTDA 2P9PA 5EXWA 2Q31A 3EKUA 4BVOA 3LM9A 2ASMA 3KVGA 5EX5A 2E8AA 3H1VX 4B1UB 2HMPA 3LL3A 4BRHA 4FPAA 3ZETA 3SLCA 3LDPA 4ISFA 3CJ1A 3H3OB 4YDUC 1NLVA 1NM1A 1T44A 4CD3A 3UE5A 4CBXA 2D0OA 1GLDG 2P9NA 1BO5O 2AP1A 3R8EA 5AQNA 3UKUB 3O5BA 4M7XA 5AQJA 2A3ZA 5TKYA 1BU6O 4FWNA 4FWQA 2H3GX 4Z94A 1TUUA 1JCFA 2Q1NA 3DAWA 1ESVA 4WYBA 1HKBA 3ATVA 4B1WB 4BR4A 3WQTA 5JICA 2D4WA 5AQMA 4IWVA 2A42A 1NGFA 3I33A 2OANA 3FGUA 3SJHA 3VF2A 5LY3A 2P9PB 3HBTA 1S22A 4XEIA 4JD2A 4FWSA 3UKRA 4B1YB 3VPZA 1J6ZA 4KBOA 2V7ZA 4FWPA 4AM7A 2VCPA 3HTVA 1TUYA 5F0XA 1JCGA 3ZETB 2ZGYA 2V7YA 4MLHA 4BC2A 4H5VA 1NGCA 2V51B 3TU5A 3QBWA 4H5NA 1BOTO 3VF4A 4RWTA 3GG4A 4PKIA 4BRQA 1Z6RA 3EKSA 3MN6A 2P9NB 5BR9A 1MA9B 2DPNA 2QM1A 4HTLA 3EL2A 4BR0A 4JAXA 3LM2A 1ZXOA 4BREA 3WXLA 4K41A 3A5NC 5AQHA 2IVNA 4XH1A 3CJ9A 1NWKA 4B9QA 4A62A 2PBDA 2CH5A 1NMDA 3H3NO 4H0YB 1BG3A 4GY2B 4ISGA 4H0VB 1SZ2A 3FZLA 3VENA 3FZMA 5AQFA 4H5TA 2E1YA 4I6MA 2GELA 4JD2B 3EO3A 5AQTA 5FPMA 3A5LC 3RSEA 1QQOA 4WQ5C 4M63C 3IUCA 2E2PA 3ZEUA 5BRDA 1R59O 1HJOA 1NGBA 2YHYA 1MDUB 2I7NA 2KHOA 4QS8A 3VERA 3IFRA 1ATRA 2F9WA 3MCPA 3QFUA 2HF3A 3LDLA 1RDWX 2I7PA 4BGAA 4FWKA 3ZX2A 1OKJA 5KPZA 3FR0A 1GLEG 2QW9A 3CETA 4WQ4C 1KAYA 5BN9A 5ADXH 3CERA 5KPTA 2ASPA 3BEXA 4CZGA 4CZJA 4FWMA 4K42A 4B1ZA 4H0XB 5AFUH 4I6MB 4O5FA 4NO7A 4FOEA 3M6GA 4PL7A 3FZHA 3JXUA 1MWKA 3VGKA 3RSEB 1Q18A 3WXKA 1ATSA 3QB0A 3S41A 3ZEUB 3O1BA 3OHRA 5JLHA 5AQUA 4JNEA 5AQZA 2AA4A 3MDQA 4CZLA 1K8KA 4CZHA 4DB3A 1NGEA 2P9KA 4EHUA 3L6QA 3CQXA 1X3MA 4BRKA 3FZFA 3GE1A 3VF6A 3C0BA 4MO4A 3IMXA 1HKCA 3JS6A 3DWLA 1T6DA 4M7YA 1SQKA 1T6CA 3LDQA 2QWOA 3VGMA 1H1VA 3WQUA 2FLOA 5AQYA 1BA0A 3AY9A 3H1QA 4CBUA 1HLUA 1V4TA 3BUZB 4BROA 3QDKA 2ZWHA 1HKGA 3A0IX 3I8BA 3MK6A 5ADXA 3D7EO 2A41A 5AQWA 3U9DA 3VETA 4BQLA 3L4IA 4A2AA 5AFUA 2E2NA 1Y64A 5LJVA 3U9ZA 1RGIA 2F9TA 4BRGA 2W41A 3HZ6A 3ULEA 2ZGZA 4BR9A 1Z05A 2D1KA 4O8KA 1S3XA 3W3DA 3CJAA 4PKHA 2Q0RA 2QWNA 1K8KB 5AQXA 1NGDA 2P9KB 4EIAA 2A5XA 4CD1A 3QMLA 4DCHA 2E1ZA 1GLLO 5AQPA 3UB5A 4FWLA 1NBWA 3AARA 2FF6A 2GEMA 1EQYA 5F2RA 3HM8A 1QQMA 3O08A 4QS7A 3O4WA 1YXQA 3VEZA 3ZX0A 3DXMA 4BG8A 3A5MC 2PAVA 2YHWA 4H5WA 1YVNA 1XUPO 1ZC6A 3ENOA 5AR0A 2QWLA 5BPNA 2WUSA 4JN4A 3VEOA 4LC9B 4H0OA 3MN7A 2CGKA 2YJEA 3H46O 3P4IA 1DEJA 4EAHD 3ULEB 4BRAA 2GWKA 5BN8A 2E20A 2A40A 2FF3B 2NRHA 4BC4A 1BUPA 4B1XB 3AAPA 3UKRB 4HWIA 3QICA 1QQNA 3CI5A 4BR7A 4BRCA 2GUPA 1HX1A 3M3ZA 5AQKA 4QS9A 1G99A 3DXKA 4IXCA 3J8AA 2ZF5O 1LOTB 4AM6A 4FPBA 5AQQA 2QWRA 4H5RA 1U6ZA 1ZBSA 4CZEA 3DXMB 3CJCA 5EVZA 3MN9A 1U2VA 2YJFA 4RCHA 5AQGA 3VEYA 4BQZA 3AAQA 1BA1A 2IIRA 2V52B 3TPQA 4DHYA 1NGIA 5AZIA 2NZTA 3O6WA 4IJAA 5F1XA 2FSNA 5LJWA 4H0PA 3WEEA 3R6MA 5FPDA 5ELZA 1XQSC 1GLFO 5AZJA 2YI1A 1TYQA 1QZ5A 3B8AX 1IJJA 4CI6A 2CH6A 2ITMA 1CZAN 2IVPA 3O8MA 4JHDA 3DXKB 3W0LA 2FSJA 5KQ8A 4CZKA 1KAXA 3A8YA 2CGLA 3WUHA 5BREA 4FO0A 3KZBA 2VYPA 4BC3A 2EWSA 3WXJA 2Q36A 4BC5A 2Q0UA 3LDNA 3MN5A 4BG9A 3U4LA 2QWMA 3FFKB 5FPNA 4E1JA 4FSVA 5KQDA 3CQYA 1U2VB 4IZ9A 3EN9A 1BDGA 1YAGA 2FXUA 5E26A 5AZIB 4PKGA 3O1WA 4MO5A 1RFQA 1NGHA 4Y0WA 3CJBA 3QBXA 5AQSA 3D2EA 1KAZA 3D2FA 3WEEB 1NGJA 3C7NA 4GNIA 2E88A 4K25A 3GL1A 3DJCA 5AZJB 3L0QA 1E4GT 1TYQB 3F9MA 3SK3A 4RTFD 3HI0A 4YDUA 4BRMA 5AQRA 2QWQA 4PL8A 3WT0A 4JHDB 3FLCO 1YUWA 3A5OC 4FWOA 3BF3A 2A6AA 1E4FT 1XC3A 4FL9A 1V4SA 1GLAG 1HPMA 5BRFA 2D0PA 5AQOA 1LCUA 2YHXA 5FPEA 3ZX3A 5B8HA 1QHAA 2P9LA 4BRDA 3BF1A 3LDOA 4B1VA 2IVOA 2P9SA 1KXPA 5EY4A 4J8FA 4K43A 4NB4A 3R9PA 1WOQA 3VESA 2FSKA 5EOYA 4L3QA 3H45C 3SMPA 1BWFO 4XH4A 3D2EB 3D2FB 4DQ8A 3C7NB 4ISEA 3VOVA 2P9IA 5AQVA 5KPRA 1QZ6A 2QXLA 3GBTA 4H03B 5JLFA 3VEWA 1SAZA 3EZWA 4BGBA 5AQIA 3BP8A 3H6EA 2UYTA 3G25A 3FE1A 4BRNA 2E2OA 1IG8A 1C0FA 1GLBG 4CJ7A 1DGKN 2W40A 3O80A 4CBWA 2Q2RA 3SMSA 2P9UA 4CZMA 2P9LB 5AQLA 1C0GA 2YCHA 2ASOA 5CE3A 3CJ7A 1ATNA 1X9JA 4BRLA 2NLXA 4CZFA 2P9SB 3CIPA 3FZKA 3CHWA 3VEVA 4FWRA 3MMVA 4BR5A 2CGJA 5BPLA 2E2QA 5BRHA 5I9EB 1HUXA 3HSCA 4XH5A 4MLEA 4BR2A 4WQ5A 4A2BA 1MWMA 3U8XA 2P9IB 2VWBA 1NGGA 1DKGD 4IJNA 2BTFA 4IO8A 3KHYA 5JMVA 1GLCG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MEEA 2HF4A 4F9OA 3THWB 5C24A 1DTQA 2FBXA 3GOIA 5GAHP 4BRFA 4A61A 4C8NA 1T05A 2DTUA 2BUPA 1JCEA 5HROA 4WQ4A 5IWAK 1NJXA 3I0RA 1GLJO 3PX6A 4E89A 5BPMA 2O4IA 5EXWA 3EKUA 3TTCA 2QA4N 4JI3K 3AGRA 2LSNA 5LMNK 4JKDA 2HMPA 3O4QA 3ZYYX 2IC3A 4FPAA 4G1QA 1C0TA 3LDPA 4R79A 1NLVA 3CM5A 1T44A 4N41A 3VA0A 3OS0A 4CBXA 3PO4A 4KO0A 4JI6K 3HVRA 2P9NA 5AQNA 4CFDA 5AQJA 5J2MA 1BU6O 3TAPA 5HRSA 3K5MA 1NU0A 2ZE2A 1JCFA 3DRRA 3DAWA 1NJWA 4CGHA 3RTVA 1LAVA 2KW4A 4LF7K 1I3AA 1NGFA 2B4JA 4Z0UA 4IDHA 3IAYA 5LY3A 4YORA 2KZMA 1WSJA 2HHSA 3RRHA 3T69A 3VPZA 1Z25A 1TUYA 4W5QA 2UXBK 3ZETB 2V7YA 4DTOA 4H5VA 2NRTA 4CF9A 3TU5A 1EWRA 3GG4A 3VQAA 3OJSA 4BRQA 2F8TA 4FW1A 1Z6RA 3TAQA 4IG3A 5BR9A 3KK7A 2VGMA 2XY7A 3RMBA 2QM1A 3I55N 2X78A 4JAXA 4OVLA 1F21A 3SZ2A 3WXLA 5CY4A 3PUFA 1NOYA 4FLVA 1T03A 4H0YB 4JYAK 4GY2B 3LPTA 4LD0A 1SZ2A 1W2BM 1TKXA 3VENA 3V9ZA 5AQFA 5GIOA 3KLHA 3EO3A 4WF9L 4KHQA 3IUCA 3QESA 2YV0X 2QTDA 1NGBA 4A57A 2YHYA 3KD5E 1RDCA 3MXJA 2KHOA 3L3VA 5KI6A 4LF5K 4QS8A 1KLMA 1ATRA 3KWIA 1B92A 2A1RA 1RDWX 1UAXA 4BGAA 4KHSA 5HRRA 1KFDA 3R1XA 1QSYA 3CFRA 3ZT3A 3CERA 2OA8A 4IEEA 3D0PA 4BE2A 4CJTA 2I5JA 4IFEA 4FLYA 1OH7A 5J2QA 3M6GA 4PL7A 4U67L 3RR8A 3CF5L 1MWKA 3RSEB 1Q18A 3L2UA 3S41A 3ZEUB 4DQSA 2NRRA 3OHRA 5JLHA 1R0AA 3MDQA 3PIOL 4CZHA 4OKJA 4EHUA 4DQIA 3L6QA 4E7LA 4BRKA 3VF6A 4JI5K 3EY1A 3C0BA 4B9VA 3JS6A 2HHHK 2GX9A 1SQKA 1O1WA 3DLHA 2QWOA 4CJEA 1H1VA 3K9JA 2FLOA 3WQUA 1BA0A 3AY9A 3H1QA 1IG9A 5FROA 2PYJA 1YITN 1RT1A 2OPSA 4CERA 4DU3A 1VQ6N 2QKKA 1RGIA 1D9DA 3P39A 4BR9A 3S3OA 4DS5A 3EE8A 4ILJA 3MAQA 1EWQA 4A5BA 4FJXA 3JYTA 2Q0RA 1ZBHA 1VSEA 2QWNA 5AQXA 1JXBA 2P9KB 4Z4IA 1WSGA 3AVKA 4CD1A 3QMLA 4B9SA 3HPHA 1BI4B 3AARA 4O55A 2FF6A 1EQYA 2D5RA 1WSFA 3SQ0A 1QQMA 4QS7A 4RG8A 2HBJA 4DF8A 3THXB 1YXQA 3ZX0A 4CGGA 3CD6N 4HHTA 2YHWA 3P31A 1K6YA 1LWCA 3HT3A 4CF0A 3C95A 2WUSA 4JN4A 3HL8A 1YJNN 1LAWA 5AJ3K 3H46O 1DEJA 3QEPA 3ULEB 2XHBA 1SKWA 1XMOK 4CFBA 4DTSA 3BZCA 2O8DA 2DY4A 1YF5L 3TAFA 3UKRB 4IFVA 3AO5A 4E7JA 4NXNK 1KD1O 1G99A 3DXKA 3AA5X 1OH8A 1TK8A 2R7YA 2ZF5O 2QWRA 4J2DA 1U6ZA 1WBBA 3QLHA 3V9XA 4IBNA 5A2QO 2E6MA 2O8CB 1BA1A 2V52B 4DSKA 3FFIA 1NGIA 3ZSQA 4E7IA 3OTOK 4H4MA 5T7BA 1XHZA 1VQON 2FBYA 5ELZA 3BDPA 1XQSC 4NXMK 4DSJA 2KFZA 2IGIA 4C1NK 2IVPA 2OPQA 3J80O 4DR1K 3TWHA 4KI6A 4F2RA 4CZKA 3A8YA 4CJWA 1VSFA 2OTLN 3SAGA 1C1BA 3NGYA 3SBGA 4FJHA 3LDNA 3U4LA 1QQCA 3OS2A 3CYMA 5FPNA 4C1NI 5FRMA 3AVFA 2Z1JA 4FSVA 4YOYA 4DQQA 2E5LK 1CZ9A 4Q0BA 1BDGA 1YAGA 2FXUA 4MO5A 4IEIA 1HYVA 3CFOA 3DLGA 4CJ3A 3NF8A 3AVGA 4DMNA 4F2SA 2A1SA 4FJMA 2VG6A 4ILHA 1X1PA 4RTFD 1Q8IA 5HP1A 4JHDB 1YUWA 3A5OC 4FWOA 3DLLL 3DRPA 2JWKA 1E4FT 5J2PA 4FL9A 1GLAG 2O8FB 2Z1IA 5FPEA 2D0CA 3ZX3A 2P9LA 2BE2A 1KXPA 2NRVA 2X74A 4K43A 3MX5A 3QETA 3R9PA 1VSHA 3HO1A 1WOQA 2GUIA 4DG1A 3PY8A 4JK8A 3D2FB 4DQ8A 1RBUA 3C7NB 3O9QA 1ZYQA 1C0UA 4CIGA 2HMIA 1XC9A 2YKMA 4DLEA 3M8SA 4WFNL 4H03B 4E19A 3I8DA 3EZWA 4C8KA 3DYAA 3PSFA 4E0DA 4CJ5A 3H6EA 4X65K 4BRNA 3VA3A 1JL2A 1IG8A 4CJ7A 2YNFA 1XNQK 2X6NA 1S1WA 2E6LA 3NFAA 5AQLA 3CCJN 2YCHA 2ASOA 3HP6A 3K58A 1X9JA 4EZ9A 3F5TA 4KHNA 2P9SB 3ZT1A 3FZKA 4FJJA 3CHWA 4DFPA 3MEGA 3CCQN 1HQUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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