5AQYA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
AKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqyA04
2QM1A 4FWNA 4LC9B 4CZLA 1KXPA 3MN7A 4B9QA 3F9MA 4BVOA 5AQGA 4B1ZA 3HM8A 1MDUB 1ZBSA 3BP8A 4B1VA 5AQQA 1SZ2A 1QQOA 2F9TA 3FFKB 3P4IA 1NGJA 3D7EO 2NZTA 4GNIA 5AQLA 3AAPA 3IUCA 1NGDA 4WYBA 4BRCA 3HZ6A 3HTVA 1XUPO 4A2AA 5BRDA 5AQPA 1YUWA 4QS7A 1NGFA 3LDPA 4H0OA 2P9PB 1CZAN 4H0TB 3EKUA 4EHUA 1X9JA 3CHWA 2P9KA 2P9UA 4JD2B 4BG9A 4IJNA 1TUUA 1HJOA 3FZFA 3MDQA 1HKBA 2E2NA 1GLAG 1T6CA 2QWNA 4GY2B 4H5TA 1E4GT 3VOVA 4AM7A 4KBOA 4XH5A 4RTFD 1K8KB 2EWSA 4CD3A 2Q0RA 1GLEG 3EN9A 3M1FA 4BRIA 3DJCA 3WXJA 3O80A 2Q1NA 1NWKA 4FO0A 4B1YB 3VGKA 3WQUA 4BRKA 3ATVA 5BRHA 2E1YA 4IZ9A 4CZJA 3CJBA 4WQ5C 3FE1A 4BGBA 3VEOA 4CBWA 5BN9A 1TUYA 2FXUA 2A40A 4BR2A 3FLCO 4BR9A 2A41A 5BPLA 1ZXOA 2YJEA 2D0PA 1SAZA 2P9NA 3H1VX 4FWOA 3VF6A 3ZETB 3H6EA 1R59O 3ID8A 1KAYA 4PL7A 3O4WA 4MLEA 2YI1A 3WXIA 1WOQA 2A3ZA 2YCHA 3ZX0A 3L4IA 5KQ8A 5ELZA 4FWQA 3DXMB 3IMXA 1KAZA 4H0PA 1TYQB 4AM6A 4M7YA 3FZKA 1Q18A 3O6WA 4MO5A 4JHDB 2NLXA 1HPMA 1GLBG 2VWBA 3QBWA 1NGEA 4K25A 2D4WA 3VEZA 4PL8A 3CJCA 1QQMA 1YXQA 4FPBA 4CJ7A 2PBDA 3AY9A 3CERA 3BF3A 5AZIB 2IVNA 3CJ7A 3C0BA 1T6DA 4BR0A 4BQLA 2P9IA 2Q0UA 2D0OA 2QWQA 3HBTA 5AQVA 2A5XA 3D2EA 3O5BA 5KQDA 1DEJA 1JCEA 3UKRA 2AP1A 1NM1A 3QICA 4I6MA 2YHXA 4MO4A 4JNEA 5AQZA 1BU6O 4BREA 3H46O 4NO7A 1NGAA 4H5RA 3GL1A 2WUSA 3QB0A 3LL3A 4PKHA 3ZX3A 1DGKN 1HUXA 4FSVA 4CZFA 4WQ4A 4IJAA 3WEEA 1NGBA 1U6ZA 1T44A 2FF3B 3L0QA 2CH6A 4IXCA 1NGGA 2OANA 4H0YB 1MWMA 2ZGYA 2ASOA 3VERA 1NGIA 4CI6A 2HOEA 4BRAA 2QWRA 4H5VA 3MN6A 3VEYA 3WT0A 4A62A 3R8EA 2QWPA 4M7XA 2P9KB 2P9UB 4FWMA 4FOIA 4BC2A 1GLJO 4NB4A 4A61A 4K43A 1RGIA 3CQXA 3FZLA 5AQWA 2H3GX 4CZEA 5BRFA 2GTDA 5JLHA 3VF2A 3QMLA 3HSCA 3RSEA 3CQYA 2CH5A 5AQUA 4FWSA 5AZJB 1OKJA 3J8AA 1C0GA 3GE1A 4C23A 1E4FT 5AQIA 3R6MA 2FF6A 1ESVA 1HX1A 4Z94A 3DAWA 1P8ZA 3WUHA 4BR4A 2CGKA 5JMVA 4CZIA 3AAQA 3B8AX 3W0LA 4FOEA 4O8KA 3TU5A 4BC3A 3MN5A 5FPNA 1V4SA 5EVZA 3VF4A 1QHAA 2CGLA 2P9NB 4B1XB 3UKUA 3MN9A 1LCUA 4QS9A 3O1BA 4XH1A 2P9SA 4JAXA 3W3DA 4BC4A 5AQTA 5F2RA 2E88A 2BUPA 2A6AA 1RDWX 1DKGD 4JN4A 1HLUA 3LDLA 4ISFA 5FPMA 1XQSC 1BA0A 3KZBA 4BGAA 4CZKA 3JS6A 5JICA 3EL2A 1Z05A 4YDUA 5TKYA 3GDQA 5E26A 3U8XA 3VENA 5LJWA 1MA9B 2P9PA 3CETA 4FWPA 2V7ZA 1MWKA 1G99A 2V51B 5BPMA 3ULEA 4BRMA 2HF3A 4EHTA 1WUAA 5ADXA 4CBUA 4EIAA 1GLFO 3A5NC 1ATRA 2P9IB 4QS8A 4BVPA 3ENHA 5FPEA 4DB3A 4B1UB 1NGCA 2BTFA 3CI5A 3UKRB 3A8YA 2QWLA 4I6MB 3EZWA 3IFRA 4WQ4C 5KPTA 5F0XA 3CJ1A 3VESA 3H3NO 3KHYA 3DWLA 2YJFA 3EKSA 4M63C 2KHOA 3GBTA 4HWIA 3U9DA 2F9WA 3LDNA 3S41A 2GEMA 1QZ6A 1ATSA 1YAGA 5ADXH 5BPNA 3SJHA 2GWKA 2IVPA 3ZEUA 4BRNA 3LM2A 3WQTA 4H5NA 2IIRA 3HI0A 4PKIA 2E2QA 5AQNA 1XC3A 1Y64A 5BN8A 3MMVA 4BRLA 2ASMA 4DQ8A 4PKGA 3VEWA 1J6ZA 3C7NA 2GWJA 2P9LA 5E84A 5AQMA 4Y0WA 5AQRA 4CZHA 1KAXA 2D1KA 1NMDA 5I9EB 4BRPA 3AARA 4FWLA 4FPAA 1QZ5A 3RSEB 2ZGZA 2V52B 4EAHD 2FLOA 3O8MA 3I8BA 1JCGA 2I7NA 5BR9A 5AQXA 4EFHA 1IJJA 3MK6A 2HMPA 4XEIA 5AQHA 1D4XA 1X3MA 1NLVA 4B1WB 5JLFA 4ISGA 5AZIA 4DCHA 1Z6RA 3G25A 1BOTO 3CJAA 2FSJA 5AQJA 1H1VA 1QQNA 5AR0A 4FL9A 3SMSA 5AQYA 4CBXA 2W41A 4BRHA 3VEVA 4DHYA 1ATNA 4H03B 3ENOA 3LDQA 1SQKA 2E2OA 1S3XA 3UKUB 4FWKA 2P9SB 1U2VA 5KPRA 4BRFA 2DPNA 3SLCA 4YDUC 5BREA 1YVNA 3H45C 2ZF5O 3BUZB 3D2FA 3DXKA 3H3OB 5EY4A 1C0FA 3U4LA 3QFUA 2J4RA 3BEXA 2E1ZA 4BRDA 1GLLO 4H0XB 4ISEA 3VEXA 4BR7A 5EX5A 4BC5A 2VCPA 5FPDA 3O08A 4MLHA 3ULEB 2QXLA 2GUPA 4RCHA 3UE5A 2ASPA 1BUPA 3A5OC 1GLDG 4FWRA 3VPZA 1RFQA 2PAVA 4BRQA 3SK3A 3QBXA 1BA1A 3QDKA 2W40A 3QFPA 2ITMA 3WXLA 2Q36A 3GG4A 3M6GA 3GOIA 2A42A 5LJVA 1BO5O 3JXUA 3VETA 5AZJA 4HTLA 5KPZA 1V4TA 4H5WA 4CD1A 2Q31A 2GELA 1BG3A 3A5LC 5AQOA 1NGHA 4JD2A 4K41A 5AQSA 4CZGA 3A0IX 2NRHA 1HKGA 2AA4A 2QWMA 2UYTA 3D2EB 3ATUA 3ZEUB 3VGLA 3LM9A 3FZHA 2QWOA 2VYPA 4IWVA 5AFUA 5LY3A 1S22A 1K8KA 4J8FA 3R9PA 5EXWA 4BQZA 4E1JA 4CZMA 5AQKA 3C7NB 2V7YA 2P9LB 3CJ9A 4IO8A 3EO3A 3I33A 3ZX2A 4BROA 5B8HA 4BRGA 1EQYA 1X3NA 3SMPA 2Q2RA 2HF4A 3WEEB 3BF1A 2CGJA 3UB5A 5AQFA 3OHRA 3KVGA 1IG8A 4K42A 3L6QA 2E20A 2YHWA 1BWFO 1LOTB 2E8AA 2Q97A 3IDHA 4BG8A 1NBWA 4BR5A 3A5MC 4O5FA 2I7PA 3LDOA 5AFUH 3TPQA 3ZETA 4A2BA 1JCFA 3VGMA 4F9OA 2QW9A 1ZC6A 4L3QA 5F1XA 3O1WA 4WQ5A 4XH4A 4RWTA 3FGUA 1HKCA 3H1QA 2YHYA 2FSKA 3DXMA 5CE3A 1TYQA 3FR0A 2E2PA 3U9ZA 2ZWHA 1GLCG 3WXKA 3MCPA 4JHDA 1U2VB 3FZMA 4H0VB 1BDGA 5EOYA 3D2FB 3DXKB 2FSNA 3M3ZA 3CIPA 2IVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSEA 3BY5A 2MZ0A 5KRSA 2KFNA 3THVA 1NPIA 3CCRN 3TTDA 3P39A 4NYFA 3M5RA 2YIOA 1KVAA 1MDUB 2NRZA 5KTQA 3P4IA 3P38A 5FDLA 1SL2A 4C8LA 1NGJA 2HHUA 2NZTA 4LSNA 3IUCA 2VQEK 4C8NA 4NCAA 4M41A 3KLHA 4JI7K 5AQPA 4KHYA 1SN1A 3LDPA 4H0OA 1NKCA 4FJKA 1OZZA 1SV5A 4CK3A 1NOYA 5KI6A 1M1KO 3RWUA 3PSIA 3OYKA 5CYQA 3EKUA 1IBKK 3T1YK 4B3SK 3PX0A 2ITGA 4IJNA 3QETA 1KC8O 1HKBA 4Y1CA 1GLAG 1BHLA 4GY2B 4DR6K 4CF2A 4H5TA 3EY1A 3BDPA 4AM7A 3DI6A 3AO4A 2WONA 1RBVA 1BL3A 3DLGA 1XRSB 1JLQA 3DJCA 4KHQA 4KTWA 2HW3A 4FJ9A 4FO0A 1YHQN 4B1YB 4X64K 2QA4N 4JI2K 4JKGA 3ATVA 3QI7A 2X6SA 2O4IA 1YJ9N 2HHTA 4CZJA 3LAMA 3CJBA 2G8KA 4GKKK 4FWOA 1SAZA 2AJQA 4YOWA 3HPGA 3NBPA 3LWMA 1RCHA 3WXIA 1TK0A 1WOQA 3NH2A 4E0DA 2YX6A 4LF5K 4B3MK 3PO4A 3VTIA 4FWQA 1KAZA 2OYQA 3KD5E 4AM6A 3PV8A 3FZKA 1P0AA 3QNOA 3TAPA 1HNZK 2GMOA 2HBLA 5HRRA 1S9GA 2KZZA 1W7AA 3AO5A 4CJLA 1BRZA 2IVNA 3S5TA 2HBMA 4M3TA 4BR0A 1NE5A 2NRRA 2P9IA 2ZD1A 3E7RL 3N4PA 2QI2A 2QK9A 5AQVA 3O5BA 1KV0A 2G8VA 4W5OA 1RDCA 3Q7BA 1CZ9A 4M3XA 5J2QA 4I6MA 2YHXA 4MO4A 5GAGP 3AVHA 4DTRA 2OPRA 1NGAA 2HBKA 4H5RA 2B6AA 1KSPA 4PKHA 2VY6A 2YEOA 1DGKN 3S9HA 3QEPA 3I55N 3WEEA 1NGBA 2BDPA 1NGGA 2OANA 3TAFA 3VERA 4OJRA 1JKHA 3NE6A 1C1CA 4CF1A 4H5VA 3MN6A 1TKDA 4A62A 3VA0A 1DQ7A 2R7YA 4AHRA 2P9UB 5CZ1A 1GOCA 3OYEA 3SPZA 4FM1A 1ZBUA 3K0SA 2NNWA 3NHGA 4H4OA 4FLWA 4I9LA 3L2UA 3EE9A 3SI6A 4B9LA 1LQIA 4A57A 2P5GA 5BRFA 5IT9O 4KH4A 2GTDA 2X74A 4DTMA 2O8EA 1NKBA 3HSCA 4FWSA 5AZJB 1OKJA 3LZIA 4C23A 3PIPL 1U04A 4JYAK 4IG0A 3R6MA 4Z4IA 4B9NA 1P8ZA 5HRNA 3MEDA 4BR4A 3HOTA 1GOAA 3AAQA 3PIOL 4FOEA 3TTFA 4XIUA 4OLBA 3RVCA 2JDQD 1VQKN 3E9PA 3VF4A 4CEDA 1QHAA 3KOXA 2P9NB 3TARA 1LCUA 1YIJN 3O1BA 4XH1A 3S3NA 4JAXA 4PUOA 4YOTA 1VSJA 2E88A 1N4NA 3HVRA 1RDWX 4BE2A 4JN4A 4ISFA 1RT6A 4IFYA 1I3AA 4JS4A 3NGIA 5JICA 3OYLA 2W42A 4B8AB 5LJWA 3AVJA 2V7ZA 4HHFA 2V51B 4EHTA 5LL6Z 4N47A 2KQ2A 4CBUA 1ZVGA 3RTVA 3A5NC 1S6QA 4BVPA 3OS0A 2BTFA 3VQ4A 3RRHA 4E7IA 3RR8A 3IFRA 4WQ4C 5KPTA 1ZYWA 3KKRA 1JL1A 3CC7N 3LP0A 3J80O 4DTPA 4M63C 2KHOA 3DRPA 3I56N 3U9DA 2XY5A 4PWDA 4FYDA 3HSTB 2PY5A 4JRQA 5C24A 5ADXH 3OYGA 2XY6A 3PUFA 1E3MA 4CGDA 4IOCL 3ZEUA 4DV3K 4BRNA 3WQTA 4H5NA 4ILJA 4AH9A 1Q9YA 1LQQA 3HI0A 1J9AA 5AQNA 2O8BB 2FBTA 2KGQA 3V1OA 4B9VA 2HNDA 3KWGA 3C7NA 2GWJA 3NF6A 1U49A 4YORA 1BCGA 1OH8A 1NMDA 5I9EB 3AARA 4FWLA 4HE7A 1QZ5A 2O8FA 4CHZA 1VSIA 3KK7A 4EAHD 2FLOA 1KFSA 3O8MA 4MDBA 1EWRA 2KYQA 4DKWA 3SV3A 3IS9A 1DJTA 3CCUN 5AQHA 3NAEA 1X3MA 3CPWM 5JLFA 4ISGA 1N5YA 2LJMA 2FSJA 1C1AA 1VQON 4DFPA 3ZT4A 3O9QA 1I2UA 5AQYA 5KK4A 4BRHA 3VEVA 4DHYA 3TAGA 1HQEA 3LDQA 3CMAN 3UKUB 4FWKA 1ZYQA 1PE4A 4M3WA 2P9SB 3P5JA 5KPRA 4J2BA 3K5LA 1IKXA 2LKBA 1RBUA 3H45C 3VMFB 5EY4A 3QFUA 3VQDA 1ZBHA 4NXMK 3SBGA 2BANA 4Z0UA 4H0XB 4FW1A 4ISEA 3L2WA 5EX5A 4BC5A 3CYGA 3O08A 4MLHA 3ULEB 1RILA 2QXLA 1TKXA 1LQHA 2GUPA 3ASMA 1YTAA 2ASPA 3A5OC 2N69A 1NJYA 4BRQA 3MECA 2W40A 4TSXA 1RNHA 4KHWA 2ITMA 5LJVA 3K58A 3AVBA 1N8RO 2X78A 5AZJA 1JLEA 2Q31A 2GELA 4CEZA 3SJJA 3A5LC 3VTHA 3V9SA 1RT2A 2YNHA 4YOVA 1NGHA 4CJQA 3D0PA 5AQSA 3NF9A 4DTNA 4OX9K 2YBRC 3B6OA 3SAGA 1BQNA 3D2EB 3VGLA 2FC0A 1JZBA 3LM9A 2VYPA 4M45A 4GVMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1VSE A;  3BY5 A;  2MZ0 A;  5KRS A;  2KFN A;  3THV A;  1NPI A;  3CCR N;  3TTD A;  3P39 A;  4NYF A;  3M5R A;  2YIO A;  1KVA A;  1MDU B;  2NRZ A;  5KTQ A;  3P4I A;  3P38 A;  5FDL A;  1SL2 A;  4C8L A;  1NGJ A;  2HHU A;  2NZT A;  4LSN A;  3IUC A;  2VQE K;  4C8N A;  4NCA A;  4M41 A;  3KLH A;  4JI7 K;  5AQP A;  4KHY A;  1SN1 A;  3LDP A;  4H0O A;  1NKC A;  4FJK A;  1OZZ A;  1SV5 A;  4CK3 A;  1NOY A;  5KI6 A;  1M1K O;  3RWU A;  3PSI A;  3OYK A;  5CYQ A;  3EKU A;  1IBK K;  3T1Y K;  4B3S K;  3PX0 A;  2ITG A;  4IJN A;  3QET A;  1KC8 O;  1HKB A;  4Y1C A;  1GLA G;  1BHL A;  4GY2 B;  4DR6 K;  4CF2 A;  4H5T A;  3EY1 A;  3BDP A;  4AM7 A;  3DI6 A;  3AO4 A;  2WON A;  1RBV A;  1BL3 A;  3DLG A;  1XRS B;  1JLQ A;  3DJC A;  4KHQ A;  4KTW A;  2HW3 A;  4FJ9 A;  4FO0 A;  1YHQ N;  4B1Y B;  4X64 K;  2QA4 N;  4JI2 K;  4JKG A;  3ATV A;  3QI7 A;  2X6S A;  2O4I A;  1YJ9 N;  2HHT A;  4CZJ A;  3LAM A;  3CJB A;  2G8K A;  4GKK K;  4FWO A;  1SAZ A;  2AJQ A;  4YOW A;  3HPG A;  3NBP A;  3LWM A;  1RCH A;  3WXI A;  1TK0 A;  1WOQ A; 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