5AQYA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
AKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
total genus 121
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqyA04
1SZ2A 4PKGA 5BN9A 3W0LA 3H3OB 4BRLA 3A5NC 4CI6A 4CZLA 3O80A 4H5NA 3LDLA 5AQSA 3ZETA 3O1BA 5BRFA 3ATUA 2GWJA 5EVZA 4EAHD 3ENOA 2P9PB 1XUPO 2IVOA 3KZBA 5JICA 4EHTA 3ZX2A 4BQLA 1BUPA 2ITMA 3MN5A 1YUWA 4IO8A 1DKGD 2ZWHA 5AQNA 1Z6RA 2I7NA 3G25A 4PL8A 2YHYA 2QWPA 1SQKA 3CJ1A 3DXKA 3O6WA 4IJAA 4JD2B 5BRDA 5EY4A 1X9JA 4BG9A 1BG3A 4CD3A 3VEXA 1HKCA 3DWLA 1GLDG 3FGUA 3BUZB 2YHXA 3MN6A 4CZJA 2ASOA 1GLAG 1P8ZA 2YCHA 5BN8A 3UKRB 4BC2A 1HJOA 3HI0A 4PL7A 3VGLA 4IXCA 4Z94A 4BRAA 3HSCA 2BUPA 1C0GA 5ELZA 3BF3A 3DXMA 1ZBSA 1BO5O 2A42A 3ATVA 3R8EA 2QW9A 3LDPA 3L0QA 4WQ4C 5AFUA 3MN9A 4JHDA 2Q97A 1YAGA 4BRFA 3FZKA 4K43A 2UYTA 5AZJB 3VF4A 1NGIA 2YHWA 3ZX0A 4QS9A 4YDUA 4B1XB 4MO5A 3U8XA 2A40A 3VF2A 5AQWA 4CZKA 2E2QA 1HX1A 3GDQA 2E20A 2P9UB 4E1JA 2D4WA 1NGEA 2FXUA 1Z05A 2CGLA 3MK6A 3VETA 3ZEUB 2IVPA 1ZXOA 5AQKA 3CJCA 3WUHA 3KVGA 4YDUC 3QMLA 3AAPA 3O4WA 4FOEA 1BU6O 1RDWX 2V52B 3CJ7A 3ULEA 3ID8A 3MDQA 4FO0A 1MDUB 2D0PA 5E26A 3AARA 1Y64A 3A0IX 2ZGZA 3F9MA 4XH5A 4BQZA 3D2FB 4CZIA 4FWPA 3I33A 3H1VX 3WQTA 2QWLA 2A6AA 2P9SB 3CJ9A 3UE5A 3SMPA 3QB0A 2HF3A 5AQUA 3HTVA 2QWRA 1NGHA 1NGDA 1NMDA 4ISGA 5AQGA 4B1VA 3OHRA 4L3QA 1ATRA 4CZMA 3H6EA 2P9LA 2CH5A 4CJ7A 3VOVA 5FPEA 2PBDA 3H45C 4IWVA 5FPMA 5JLFA 3CETA 3EN9A 1T6DA 2BTFA 2ZGYA 2E2NA 4QS8A 4BR2A 2FF6A 5AQVA 3WXKA 2CGKA 3LDOA 1NGAA 5AZIA 4MLEA 1ZC6A 1X3MA 4DB3A 1NGBA 4O5FA 4CD1A 4BRPA 4M63C 3ZETB 5KPRA 5F2RA 2FSNA 4FOIA 1JCEA 3DJCA 1ESVA 3D2EA 1EQYA 2NLXA 1U2VA 1S3XA 4BR9A 1D4XA 4BGAA 4CZFA 3FZLA 4PKIA 1HPMA 5EX5A 1QZ5A 5AFUH 2Q2RA 1V4TA 3WEEB 3VEOA 3DAWA 4A62A 3FZFA 2CGJA 3DXKB 1NGGA 1CZAN 4BREA 3BF1A 2D0OA 3CJBA 3BEXA 4FSVA 2I7PA 3MN7A 3SJHA 2VWBA 2E2OA 1BA1A 4RCHA 2QWNA 3B8AX 2GELA 4WQ5A 2E1ZA 2QM1A 2FSKA 1T6CA 1YVNA 1XC3A 4I6MA 2P9NB 3WXIA 3M1FA 5CE3A 4JHDB 4FL9A 3H1QA 3JXUA 4K41A 2P9KB 5ADXA 2ASPA 3WEEA 4FWRA 3CI5A 3GE1A 4J8FA 1GLLO 1GLCG 1YXQA 4K25A 3FZHA 3LM9A 2AP1A 3FLCO 4K42A 3QFUA 2QWQA 3TPQA 2YJEA 1KAZA 3WXJA 2J4RA 4GNIA 2PAVA 4B1WB 3RSEB 4FPAA 3VEWA 4CZEA 4FWSA 4O8KA 4H0XB 1NM1A 3FE1A 4KBOA 1BDGA 1LCUA 2QWOA 4ISEA 2NRHA 3A5LC 4B9QA 1TUUA 4XEIA 3SK3A 1JCGA 1IJJA 1Q18A 2Q31A 3M6GA 3UKRA 3QBWA 5JLHA 3GL1A 3VGMA 4H5WA 3A8YA 3FR0A 4BRMA 4B1YB 1GLJO 4FWNA 3VEVA 1R59O 1C0FA 1K8KA 5LJVA 3AY9A 4CZGA 2A41A 3EZWA 3MCPA 4MLHA 3VGKA 3CERA 4FPBA 1LOTB 1IG8A 3VF6A 5AZJA 3WT0A 1S22A 5KQDA 1BWFO 1MA9B 4EFHA 2E88A 3JS6A 3LDQA 3AAQA 2HF4A 3GBTA 3LM2A 3VEYA 4AM6A 1NWKA 3D7EO 2FF3B 3C0BA 4H0VB 2QWMA 1RGIA 4NO7A 1J6ZA 1KAXA 2V7ZA 3R9PA 3S41A 3UKUA 3QFPA 4QS7A 5KPTA 1WUAA 1NGCA 3SLCA 4BC5A 5BPMA 1BA0A 1HLUA 5ADXH 1QQOA 2FLOA 5B8HA 3GG4A 1WOQA 1HUXA 4CBWA 2NZTA 3VPZA 3U9DA 5AQOA 2IVNA 4H0OA 1E4FT 1E4GT 1OKJA 2YI1A 4AM7A 4H0PA 2HMPA 2OANA 3SMSA 5AQFA 3CHWA 5JMVA 3HZ6A 4FWLA 1XQSC 3HBTA 4GY2B 2FSJA 4I6MB 4B1UB 5FPDA 1JCFA 1MWKA 2KHOA 4RTFD 3IDHA 5KQ8A 3LDNA 1U6ZA 2Q0RA 5AQJA 4WYBA 1RFQA 2QXLA 2D1KA 5F1XA 4BROA 4BR0A 3FFKB 3A5OC 4BR7A 1V4SA 3VERA 3DXMB 3U9ZA 5I9EB 3ENHA 2P9IA 2A5XA 3A5MC 5AR0A 2Q1NA 3J8AA 4JNEA 3W3DA 3WXLA 5AQXA 4C23A 4BRNA 1NLVA 5AQMA 4BRGA 2ASMA 5AQPA 3EKSA 4A2BA 4DQ8A 3C7NA 4BRCA 1TYQA 2F9WA 4WQ5C 2Q36A 5EOYA 2V51B 3R6MA 1DGKN 3CIPA 1KXPA 4M7XA 4DHYA 1G99A 3O5BA 4JN4A 5BPNA 2VCPA 1KAYA 2E1YA 3WQUA 4XH4A 3TU5A 1NBWA 2IIRA 3HM8A 2P9PA 5TKYA 4FWQA 4BRDA 4WQ4A 2F9TA 4IJNA 4JAXA 5LY3A 3CQYA 3ULEB 1QHAA 3EO3A 1H1VA 4Y0WA 2DPNA 3O8MA 4JD2A 2GWKA 1K8KB 4BRHA 3VESA 2ZF5O 5F0XA 5AQHA 4RWTA 2GEMA 3H3NO 4BRKA 2P9NA 3CJAA 3GOIA 3QICA 2V7YA 4CBUA 3L4IA 3ZX3A 2P9KA 5BPLA 3FZMA 2HOEA 4BRQA 4MO4A 2AA4A 4A2AA 3M3ZA 1GLEG 2P9LB 5E84A 4M7YA 4BR5A 5BR9A 4H0TB 5KPZA 1HKBA 4IZ9A 1TUYA 2CH6A 3P4IA 3IMXA 4B1ZA 4LC9B 5BRHA 3IFRA 4H5RA 4BG8A 4HTLA 4EIAA 1QQMA 3QBXA 1ATSA 4FWKA 2A3ZA 3UKUB 5AZIB 2Q0UA 1HKGA 5EXWA 3EL2A 5BREA 5AQYA 3RSEA 4FWOA 1ATNA 3U4LA 3BP8A 2E8AA 5AQRA 1QZ6A 3I8BA 2YJFA 4ISFA 2P9UA 3D2EB 3VEZA 5LJWA 4CZHA 3MMVA 1U2VB 3O08A 3O1WA 2E2PA 3UB5A 2W41A 3ZEUA 1NGJA 5FPNA 1NGFA 1T44A 2H3GX 2WUSA 3L6QA 3LL3A 4XH1A 5AQTA 2GTDA 4FWMA 1GLFO 2VYPA 4H5TA 1QQNA 4A61A 3D2FA 3H46O 4H03B 3QDKA 3IUCA 5AQZA 4H0YB 4BVOA 2P9SA 4BC3A 1MWMA 2EWSA 4BGBA 1DEJA 3KHYA 4BR4A 5AQIA 4DCHA 4HWIA 4NB4A 4BC4A 4BRIA 2P9IB 1SAZA 1X3NA 2W40A 4PKHA 3VENA 5AQLA 2GUPA 5AQQA 1GLBG 4H5VA 4BVPA 4F9OA 3CQXA 3EKUA 1BOTO 4CBXA 4EHUA 3C7NB 1TYQB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BRZA 2O8EB 2E2FA 3NH1A 1HYVA 4B8CA 1TL1A 1RT2A 2OPRA 3ZETA 3O1BA 1JLEA 1QE1A 1NNEA 3AO5A 4J2EA 2GWJA 1JXCA 4CJVA 2P9PB 5AJ3K 5JICA 3KZBA 3K5MA 3J7AP 4B3OA 2G8HA 4BQLA 1SKSA 4LFCK 2KZZA 1YUWA 2ZWHA 5AQNA 2Y1JA 2PYLA 5FRNA 1JZBA 4O44A 3CJ1A 3T1YK 1VQPN 1HKCA 4LSNA 2VQEK 4Z4EA 2YHXA 1N34K 4KAZA 4F8RA 4B3SK 4RG8A 2B68A 1RBTA 2LY5A 3V1OA 4FLVA 2JDQD 1VQMN 3WNFA 2E5LK 5ELZA 2HW3A 4KHYA 4N41A 3Q7BA 3KP1A 3VA3A 3ZT1A 1ZBSA 4FJIA 4CF8A 1KLNA 2QW9A 3LDPA 3V9WA 5AFUA 2W00A 1EKEA 1KFDA 2Q97A 3SZ2A 4F3TA 4K43A 2UYTA 4E1NA 1EWQA 4YDUA 1VK0A 4MO5A 1K73O 2KGQA 1T7BA 3KC6A 2A40A 4B8AB 4B9LA 4X65K 3K9KA 3L3VA 2E2QA 3Q7CA 2P9UB 3SV3A 4E1JA 3G71N 2ZM6K 4JI7K 4CIFA 2YBRC 2KKZA 1Z05A 3PUFA 3HOTA 3PX6A 2IVPA 1LQQA 2JLEA 1ZXOA 2WC9A 3GKUA 1WSFA 3L2QA 1XRSB 4CEZA 3AAPA 3CCJN 3LAKA 2V52B 3ULEA 4KTWA 3MDQA 2W6KA 1MDUB 2D0PA 5E26A 3A0IX 5C10A 3PLAA 4M3RA 3AVJA 4KTZA 4AHUA 1T1TA 3SQ4A 2UXDK 3MX5A 3WQTA 4Z4GA 2F8TA 2QWLA 2A6AA 4G1QA 1OVQA 3NVMA 1QQCA 1B9DA 3QB0A 2HF3A 1JKZA 2QWRA 4DUZK 1QSSA 4FJMA 4DR7K 5AQGA 3OYLA 3OHRA 1B7DA 3L3UA 4L3QA 4O55A 3OYIA 4BE1A 5FPEA 3H45C 4M3WA 3CPWM 3CC7N 2Z1GA 2E2NA 3OTOK 1VSEA 1YT3A 4C8MA 3WXKA 1NGAA 1EXQA 4GV9A 5AZIA 1NJWA 5CHIA 2DFFA 1HYSA 4IOXA 1WSHA 1OVYA 3ZT0A 4CD1A 3SBTA 4FLYA 4DR6K 1QVGM 4B3MK 1N6QA 3O9SA 3EYZA 2KQ2A 1ESVA 2NLXA 4BR9A 3BY5A 4BGAA 4DR4K 3FZLA 1QZ5A 1VSJA 5AFUH 3CC4N 2KBHA 3DAWA 3FZFA 3DXKB 2KTQA 3T3FA 3CJBA 3LPUA 1ASVA 2Z1JA 5IWAK 4HUEA 1IKYA 3CYMA 4DTUA 2HHVA 4M3XA 2O8DB 4G9ZA 2YNIA 2QWNA 1TAUA 3B8AX 5KK4A 4AAZA 1LWFA 2GELA 2HBKA 3KWIA 4CGHA 5EU7A 2E1ZA 3CF5L 2FSKA 1F21A 2GUIA 3U3YA 4O0JA 4DSLA 5CE3A 2WBNA 3JXUA 2K35A 4JKDA 4K41A 5I3UA 3HL8A 5ADXA 2BANA 4FWRA 1N4NA 2O8EA 4EZ9A 4A5BA 3P39A 2OPPA 4K25A 1NU0A 1S1WA 2AP1A 4K42A 1CXQA 3V6DA 3QFUA 2QWQA 3M8QA 1WB9A 1YF5L 3TPQA 3NF9A 1RT6A 1N8RO 3WXJA 2YHAA 4GNIA 2VQFK 2WONA 4B1WB 4CZEA 4FWSA 3T1HK 3QIPA 4KBOA 1BDGA 1O13A 3ZCMA 1JLAA 3SQ0A 4XEIA 3HVTA 3NVKA 1IJJA 2F4VK 4DSIA 4MFBA 1YJNN 3LAMA 5JLHA 3VGMA 3A8YA 1Z25A 4IDKA 2HHUA 1TK0A 1BL3A 4FWNA 4BDYA 3VEVA 4IEIA 3NMUA 4CFDA 1C0FA 3VQ5A 5C42A 1HYZA 4M3ZA 4MLHA 5JENA 1SKRA 3CERA 1UAXA 3VF6A 3WT0A 3C65A 4MDBA 1MA9B 1C0MA 3DLGA 4HHTA 3C95A 4BACA 2X6SA 2E88A 1C0TA 4AM6A 2HF4A 1CN2A 3C0BA 2QWMA 4NO7A 4K0KK 1J6ZA 1KVCA 3LZIA 3KHWA 1KAXA 3C6UA 1L4VA 3N4PA 1KRPA 1LQIA 3S41A 4E1MA 1OH7A 2UXBK 1WUAA 3T7ZA 4B3TK 3KK7A 4I2PA 3TAMA 2R7YA 4BC5A 3ZSYA 1HNZK 3AVGA 5ADXH 2FLOA 3GG4A 2GV9A 4CGGA 1WOQA 4BDPA 1HUXA 1IKXA 4O4GA 1DTTA 3HP6A 1I94K 1NOZA 2XY7A 3TARA 1NE5A 4H0OA 1XHZA 2KSKA 1E4FT 3TABA 1XC9A 3G10A 3O3GA 4B08A 1VAZA 5E41A 4JS5A 3ZSZA 4H0PA 3EZ5A 3AA2A 3PIOL 3SMSA 3K59A 4JI8K 5JMVA 4FWLA 1XQSC 4J2AA 1NPIA 2HHSA 2FSJA 1I39A 5FLXO 4KI6A 1Q9XA 4DQSA 2O4GA 3LDNA 4QOZB 5LMNK 3CCSN 1O1WA 1RBRA 3A5OC 1V4SA 3U9ZA 5CYMA 2A5XA 3KLFA 5AR0A 1XWLA 3OYAA 1NLVA 3SAFA 1ZU3A 2OPSA 4JK7A 4DQ8A 4OPKA 1RILA 4DG1A 4DQIA 1QS4A 5CZ2A 3RR7A 1SEGA 4AHCA 2BE2A 4JN4A 5BPNA 1KAYA 3AA4A 5SWMA 3EE9A 3WQUA 1NBWA 2IIRA 3HM8A 1VQ5N 1FJGK 4V1DC 4IJNA 4WQ4A 5KRTA 4BEBA 1OZZA 3OYNA 4CESA 3HOSA 3AGRA 4O8UA 2DPNA 4H4OA 1OH5A 3AV9A 1NRAA 2D0AA 3P5JA 3HPHA 5F0XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1BRZ A;  2O8E B;  2E2F A;  3NH1 A;  1HYV A;  4B8C A;  1TL1 A;  1RT2 A;  2OPR A;  3ZET A;  3O1B A;  1JLE A;  1QE1 A;  1NNE A;  3AO5 A;  4J2E A;  2GWJ A;  1JXC A;  4CJV A;  2P9P B;  5AJ3 K;  5JIC A;  3KZB A;  3K5M A;  3J7A P;  4B3O A;  2G8H A;  4BQL A;  1SKS A;  4LFC K;  2KZZ A;  1YUW A;  2ZWH A;  5AQN A;  2Y1J A;  2PYL A;  5FRN A;  1JZB A;  4O44 A;  3CJ1 A;  3T1Y K;  1VQP N;  1HKC A;  4LSN A;  2VQE K;  4Z4E A;  2YHX A;  1N34 K;  4KAZ A;  4F8R A;  4B3S K;  4RG8 A;  2B68 A;  1RBT A;  2LY5 A;  3V1O A;  4FLV A;  2JDQ D;  1VQM N;  3WNF A;  2E5L K;  5ELZ A;  2HW3 A;  4KHY A;  4N41 A;  3Q7B A;  3KP1 A;  3VA3 A;  3ZT1 A;  1ZBS A;  4FJI A;  4CF8 A;  1KLN A;  2QW9 A;  3LDP A;  3V9W A;  5AFU A;  2W00 A;  1EKE A;  1KFD A;  2Q97 A;  3SZ2 A;  4F3T A;  4K43 A;  2UYT A;  4E1N A;  1EWQ A;  4YDU A;  1VK0 A;  4MO5 A;  1K73 O;  2KGQ A;  1T7B A;  3KC6 A;  2A40 A;  4B8A B;  4B9L A;  4X65 K;  3K9K A;  3L3V A;  2E2Q A;  3Q7C A;  2P9U B;  3SV3 A;  4E1J A;  3G71 N;  2ZM6 K;  4JI7 K;  4CIF A;  2YBR C;  2KKZ A;  1Z05 A; 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