5AQYA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
AKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqyA04
3VEWA 3SJHA 2FF3B 1NGJA 1CZAN 2H3GX 4A61A 3HTVA 4YDUA 1HKCA 4I6MB 3RSEA 4CD1A 2P9UB 3CJ7A 4JAXA 3CJ9A 3MN9A 3O1BA 1X3MA 3G25A 2FLOA 3MN5A 4FWOA 1U2VB 4WYBA 4CZKA 2VYPA 3DWLA 1ATNA 4JD2B 4AM7A 5CE3A 1BOTO 3U9DA 5ELZA 3CJCA 3GBTA 2QXLA 3EKUA 4BRKA 3H1QA 3UKUA 3D2FA 3WEEB 5KQ8A 4B1WB 3LDPA 5BN8A 3FFKB 4ISFA 4FWMA 1GLBG 1T44A 5AQGA 5AQTA 2P9LB 1U6ZA 4BRMA 4CZFA 1EQYA 1MDUB 1Z05A 3CHWA 3ENOA 1KXPA 2A42A 2GUPA 2YI1A 2E2PA 3ENHA 3WXKA 1NGEA 3SMPA 1DGKN 3QMLA 1YAGA 2V52B 3BF3A 4CZEA 4C23A 4BRHA 2Q2RA 5F1XA 3ID8A 4H0YB 1HPMA 5AQQA 1V4TA 1XC3A 1ZC6A 2P9PB 1KAXA 4H5VA 2FSJA 3C0BA 4FWLA 3DXKB 5AQHA 4CI6A 1MWMA 2HF3A 5BRHA 3H45C 3CJ1A 3A5MC 5EOYA 4BRQA 2YJFA 2BUPA 3ATVA 3ATUA 4FWRA 5JICA 1NGFA 1LOTB 3LDOA 1BO5O 3H3OB 3FLCO 1SQKA 5TKYA 3IFRA 1WOQA 3U9ZA 2CGJA 4CJ7A 4JN4A 1NLVA 3HI0A 3VF2A 4BC3A 2P9IB 3KHYA 3B8AX 3D2EA 1NGBA 2P9NB 5LJVA 1T6CA 3BP8A 1OKJA 2NZTA 2P9SA 4BC5A 4JNEA 3A5NC 4BRNA 3VESA 4BRFA 5EY4A 1J6ZA 2E2QA 4BRIA 1HX1A 1R59O 5EX5A 4QS9A 5AZIA 2E8AA 2VWBA 2ASPA 4H0XB 2FXUA 4BGAA 3IUCA 5AR0A 4FWQA 4EHTA 4PL7A 2D1KA 1GLEG 1S22A 1NGAA 4CZHA 1NMDA 1C0GA 4Z94A 5AQZA 4EAHD 4LC9B 3CQXA 1C0FA 3D7EO 3VEXA 3KZBA 1RGIA 4FOEA 4B1XB 3WT0A 3UB5A 1GLFO 4FO0A 5AQOA 5BN9A 3MCPA 2HMPA 1DKGD 2E2OA 3J8AA 3ZX2A 1JCFA 5FPDA 2E2NA 1ZBSA 3AARA 4O5FA 3GDQA 4NB4A 3DXMA 3W3DA 5BR9A 3CJAA 5KPTA 3U8XA 2ASOA 4BGBA 3QICA 3HBTA 4BRDA 4I6MA 5I9EB 5LJWA 3L0QA 4CBWA 2A5XA 5AFUA 2P9UA 4FSVA 2HF4A 1BDGA 4IZ9A 4O8KA 1GLJO 5E84A 4FL9A 1KAZA 2WUSA 4BC4A 3WUHA 1U2VA 3ULEB 1GLAG 4JD2A 2W41A 2AA4A 2QWLA 2YHXA 3MMVA 3O6WA 2Q0RA 2Q0UA 3VF4A 4RTFD 3WEEA 3HM8A 3U4LA 4A2BA 3A0IX 1X9JA 3QBWA 2V7YA 1ATRA 1D4XA 5EVZA 1GLCG 3LDNA 4BRPA 1TYQB 4DCHA 2YHWA 4XEIA 5JLFA 3WQTA 2V51B 3IMXA 3KVGA 2P9LA 3VPZA 5JMVA 5B8HA 3A8YA 3QB0A 5BRFA 1SZ2A 4MO4A 2IIRA 3QBXA 4BG9A 1HKGA 3GOIA 3M1FA 4QS8A 3OHRA 5EXWA 3I8BA 3HZ6A 3WXIA 4PKHA 2DPNA 3H3NO 4CZGA 3FZFA 4EHUA 2ZGZA 5AQMA 5BPLA 5BPNA 2P9PA 5AQVA 1DEJA 4FPAA 2Q31A 1NGCA 3DXKA 3VGMA 2J4RA 4IJNA 1X3NA 1YVNA 1HKBA 4H0VB 2GELA 4FPBA 1V4SA 4E1JA 4H5WA 2I7PA 1NGDA 1IJJA 4GNIA 4ISEA 3TPQA 1RDWX 5FPMA 2W40A 2P9IA 5F2RA 1E4FT 4MO5A 4DHYA 5AQNA 4RCHA 4H5RA 2P9NA 2ZGYA 3A5OC 1RFQA 2FF6A 2OANA 5AQUA 2EWSA 2PBDA 3VEVA 2GEMA 3CQYA 3EN9A 5AFUH 2QM1A 2QWOA 4MLEA 3WXJA 3O1WA 3TU5A 4EFHA 5LY3A 2VCPA 4A62A 4BROA 1ZXOA 2CH5A 3M6GA 2YJEA 4QS7A 5F0XA 2HOEA 1JCEA 3LL3A 5AQFA 4JHDB 5ADXA 5AQRA 1P8ZA 1TUUA 3GG4A 2ITMA 4AM6A 4BR4A 2GWJA 4F9OA 1K8KB 3BEXA 3LDLA 1BA0A 3VOVA 3AAPA 4ISGA 1HJOA 1XUPO 2QWMA 4B9QA 4CD3A 2GWKA 2ZWHA 4FWNA 2KHOA 3GE1A 3R8EA 3CERA 5BRDA 3SK3A 3DJCA 4H0OA 2IVPA 4EIAA 3CIPA 2F9WA 3L6QA 4H5TA 3I33A 1WUAA 3LM2A 2CGLA 1BWFO 5JLHA 5KQDA 5AQWA 4BQZA 2E88A 2AP1A 4K25A 2QWNA 3ULEA 1ESVA 3VEYA 4BR7A 3MDQA 5AZJB 3GL1A 3QFUA 1YXQA 2ZF5O 3H6EA 2FSKA 3FGUA 4CZMA 1IG8A 4XH1A 2CH6A 3FZMA 1TYQA 2F9TA 4H0PA 2E1YA 3CI5A 4FWKA 3ZEUB 3C7NA 2NLXA 2P9KA 4BR9A 4CBXA 2YHYA 3BUZB 3FZHA 4B1ZA 3ZETB 3LM9A 4FWPA 4M63C 3UKRB 2QWPA 1NGGA 2YCHA 1JCGA 3C7NB 4PKGA 2P9KB 4M7XA 3VETA 2UYTA 3VEZA 4BR0A 4XH5A 3H46O 3O80A 2D4WA 5ADXH 3VGLA 1NWKA 3EZWA 2CGKA 4M7YA 3ZX0A 4H5NA 1QZ5A 1QHAA 5AQIA 1BU6O 3RSEB 3LDQA 3VF6A 2QW9A 1QQNA 2D0OA 1T6DA 4WQ4A 4K42A 3WXLA 5FPEA 2E1ZA 4FOIA 2A40A 5BREA 1NGHA 5AQJA 3FZLA 2IVNA 4IXCA 4MLHA 2V7ZA 3FE1A 4BG8A 4BRLA 4Y0WA 4B1VA 3AAQA 1Q18A 2QWRA 2PAVA 4BC2A 3HSCA 3UE5A 2IVOA 3D2FB 3UKUB 1MA9B 3O5BA 4FWSA 3JS6A 3M3ZA 3EO3A 4XH4A 3ZX3A 4CZLA 4PL8A 2Q36A 2D0PA 4L3QA 1E4GT 3VENA 1QQMA 4H0TB 5KPZA 3O8MA 1BUPA 4CBUA 1HUXA 1QZ6A 3L4IA 1Y64A 1SAZA 3S41A 4HWIA 3BF1A 4JHDA 3QFPA 1BG3A 5E26A 1Z6RA 1QQOA 3FZKA 4B1YB 2FSNA 4BRGA 4A2AA 1K8KA 5AQPA 4H03B 4BVOA 4BREA 3O4WA 1KAYA 3P4IA 4NO7A 2ASMA 4CZJA 3R6MA 4RWTA 4BQLA 4BR2A 1H1VA 1YUWA 4IWVA 3EKSA 1XQSC 1S3XA 3VERA 4CZIA 4WQ5C 3VEOA 4IO8A 3MK6A 2NRHA 5AQSA 3H1VX 3SMSA 2A6AA 2E20A 3DAWA 4YDUC 4PKIA 1GLDG 3D2EB 3VGKA 1MWKA 1NM1A 1NGIA 3R9PA 5AQXA 1ATSA 3CETA 3QDKA 2P9SB 3O08A 4IJAA 4WQ4C 5AQLA 4BVPA 2Q97A 4J8FA 5AZJA 5AQYA 3CJBA 1G99A 3MN6A 4HTLA 1HLUA 4GY2B 2A41A 3FR0A 3MN7A 5AZIB 2GTDA 4DQ8A 3AY9A 2QWQA 1NBWA 2BTFA 3ZEUA 5AQKA 4K43A 3IDHA 3SLCA 4BRAA 1GLLO 3UKRA 3ZETA 3F9MA 2I7NA 3EL2A 3W0LA 1TUYA 4BR5A 4BRCA 4B1UB 1BA1A 5BPMA 3JXUA 4KBOA 5FPNA 4K41A 3A5LC 5KPRA 4DB3A 3DXMB 2Q1NA 4WQ5A 3WQUA 2A3ZA 1LCUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QEWA 3SJHA 4AHCA 1NKEA 3HTVA 4CGIA 1HKCA 5CHIA 4DTPA 1R0AA 1RTJA 4CERA 1DTTA 3MX2A 2LT8A 1K8BA 4CIEA 4AM7A 3N4PA 1NKBA 5ELZA 1BIUA 5FLXO 2QXLA 3F9KA 2N2QA 3NF8A 5KQ8A 3U6FA 1Z25A 4C8OA 3FFKB 1QSYA 4N56A 4E7KA 1GLBG 4IOXA 3E66A 5M1NA 1HYZA 5AQTA 2P9LB 1EQYA 1Z05A 3ENOA 1YTUA 2VWJA 2A42A 3ZLJA 2E2PA 3NMUA 3WXKA 1NGEA 3NH0A 2JWLA 1DGKN 3QMLA 1YAGA 2V52B 3SMPA 1TK0A 3M8PA 4CZEA 2HHXA 2HHHK 4LF9K 4JI4K 2Q2RA 1L5UA 1V4TA 1ZC6A 3NGZA 1C0MA 3V1QA 2O8BA 2FSJA 2YHBA 3C0BA 1T7AA 1ZYVA 1ICAA 3DXKB 3MXMA 1MWMA 4CFDA 3H45C 4BRQA 2GBZA 4AQYK 3MEEA 5H1SQ 1NGFA 5J2QA 1LOTB 3FLCO 2X78A 3OYDA 5TKYA 3RMBA 1TK8A 3D2EA 3OBWA 3PO4A 3PSFA 1NK7A 3WNEA 1I2VA 2FBTA 3K5LA 2JGUA 2N2RA 4BY9C 1UGLA 3OY9A 2XY6A 4DV7K 3SAGA 3TWHA 2ZJRL 1J6ZA 3HPHA 1XHZA 4UADE 1ZBFA 2LY5A 4IDKA 3KP0A 1WMTA 1N34K 4JKCA 2HHWA 5MLCQ 4FJXA 4DFMA 1NGAA 4IFYA 4CZHA 5AQZA 4UAEF 4EAHD 3D7EO 1NPIA 4F3TA 2MZ0A 1DLOA 4M3TA 2O8DB 4FO0A 5AQOA 2HMPA 4LY7A 3JYTA 3J8AA 1JCFA 3AO1A 1NK6A 1Q82O 5KPTA 3CJAA 4CFAA 2DFFA 2OPPA 3AVMA 3BGRA 2HNDA 1Q8IA 5CYMA 3C94A 3U8XA 2ASOA 4M3XA 5I9EB 5LJWA 1HR0K 3AVBA 3KWIA 4JKBA 1CZBA 1WAJA 2E6MA 3ZT3A 2BE2A 4QCLA 2YHAA 1BHLA 4FL9A 1JLEA 4Y1CA 5E84A 4DV2K 4Z4GA 3ULEB 4YOXA 4CGHA 4KTWA 1T7BA 3MMVA 4C8KA 1CXUA 2Q0RA 2Q0UA 2UUBK 3O9SA 3PSIA 4WFNL 1NRBA 4RTFD 2X6SA 1DTQA 2GUIA 3QBWA 1FJGK 3C6TA 1K6YA 3KK7A 5EVZA 4M3ZA 1HQEA 2E5LK 3KLGA 4OKJA 3F2KA 1S9GA 4IDHA 4C8NA 4NYFA 5JLFA 2P9LA 3VPZA 4I2PA 1NK5A 1N6QA 1RT5A 3A8YA 1C55A 3QB0A 5DK5A 3ZSQA 3OYJA 4DUYK 2K35A 1HNIA 1HKGA 3CG7A 3O3HA 3NVKA 4BWJA 4BECA 3OS0A 1BMRA 3HZ6A 1A5VA 4OX9K 4PKHA 3AVIA 2Y1JA 1VQMN 3I8DA 1DEJA 4FPAA 2Q31A 4E7IA 3DXKA 3Q7BA 4LH4A 5M1OA 3CCJN 4LFBK 1YITN 1RBTA 1V4SA 4HHTA 1D9DA 1NGDA 4HCBA 3TAGA 3S3MA 4CEEA 4CJVA 4DHYA 5AQNA 3WXMB 4EZ6A 3TAPA 3A5OC 4CJRA 4DTOA 4DV1K 1PE4A 3KOYA 3L3VA 5HRPA 4RW6A 1SN4A 1S72N 1NOZA 3CCMN 2B3CA 4CEFA 4EFHA 3T69A 4QOZB 2VCPA 2G8FA 1VSFA 2YJEA 3NGYA 2HOEA 2KZZA 1OH5A 1D5AA 5ADXA 1P8ZA 3SI6A 3IAYA 3GG4A 2FC0A 1ZVEA 4BR4A 2GWJA 4F9OA 1B9DA 1K8KB 3DI6A 4GV3A 2X6NA 1BA0A 4G9ZA 3AAPA 1U4BA 3CMEN 3QEVA 4FJLA 1HJOA 1HYVA 1XUPO 2O8DA 2QWMA 1B9FA 1NJYA 1MR4A 2ZWHA 1N8RO 2YILA 2KHOA 5IT9O 3K0SA 1NJIO 4LSLA 3AO2A 4ZTJA 1SV5A 3CIPA 4B9MA 1BQMA 4CFCA 3ZSZA 4DV3K 4DUZK 1LQQA 3I33A 4M42A 2XO7A 2CGLA 3CCUN 1L3TA 3ASMA 5AQWA 2KFNA 3PSMA 4W5TA 1NMNA 2AP1A 1HYSA 3ULEA 1W97L 2JLEA 3KOZA 3SUQA 3EY1A 4CK3A 3VQDA 4FLWA 4YNQA 3DLRA 3RR7A 4ILGB 3QNNA 1RBVA 3LZIA 4LFAK 4XH1A 4Z0UA 2CH6A 3NVMA 4H0PA 3ZEUB 2NRZA 3K5MA 1LW2A 1AHOA 4AHRA 3D6RA 2YBRC 2Z1IA 3TAEA 1G15A 4YOYA 2YNFA 3L2RA 4BR0A 1XNQK 3M8RA 2IOCA 5HLFA 3NDKA 3ZX0A 4M7YA 1S6QA 1GOBA 1EXQA 1QHAA 5AQIA 4PA1A 3VTIA 4OGEA 3TTDA 1T6DA 4WQ4A 4CW7B 2E1ZA 4LF7K 2OTJN 1CXQA 5AQJA 2WOMA 1ZYWA 1S9EA 2IS3A 2DFHA 4BRLA 4Y0WA 2QTDA 3AAQA 4NLBA 3HSCA 2IVOA 1C0TA 4FWSA 1QS4A 4J2EA 3M3ZA 3EO3A 1VHXA 3ZX3A 1NOYA 4J2DA 4CZLA 4FZYA 2Q36A 4ID5A 3ZSWA 2ZQBA 5EU7A 1UWBA 1TKDA 1BUPA 1HUXA 1Y64A 4FCYA 1SAZA 4GVEA 3M8SA 3S41A 4B8AB 5E41A 3BF1A 2LKBA 1WSHA 1BG3A 3DYAA 1WSEA 2IGIA 1QQOA 1WBDA 4W5NA 3S9HA 4A2AA 4DMNA 1K8KA 4JS5A 3AGRA 4BREA 4BVOA 4C1NK 4A5BA 2ZJPL 2X74A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QEW A;  3SJH A;  4AHC A;  1NKE A;  3HTV A;  4CGI A;  1HKC A;  5CHI A;  4DTP A;  1R0A A;  1RTJ A;  4CER A;  1DTT A;  3MX2 A;  2LT8 A;  1K8B A;  4CIE A;  4AM7 A;  3N4P A;  1NKB A;  5ELZ A;  1BIU A;  5FLX O;  2QXL A;  3F9K A;  2N2Q A;  3NF8 A;  5KQ8 A;  3U6F A;  1Z25 A;  4C8O A;  3FFK B;  1QSY A;  4N56 A;  4E7K A;  1GLB G;  4IOX A;  3E66 A;  5M1N A;  1HYZ A;  5AQT A;  2P9L B;  1EQY A;  1Z05 A;  3ENO A;  1YTU A;  2VWJ A;  2A42 A;  3ZLJ A;  2E2P A;  3NMU A;  3WXK A;  1NGE A;  3NH0 A;  2JWL A;  1DGK N;  3QML A;  1YAG A;  2V52 B;  3SMP A;  1TK0 A;  3M8P A;  4CZE A;  2HHX A;  2HHH K;  4LF9 K;  4JI4 K;  2Q2R A;  1L5U A;  1V4T A;  1ZC6 A;  3NGZ A;  1C0M A;  3V1Q A;  2O8B A;  2FSJ A;  2YHB A;  3C0B A;  1T7A A;  1ZYV A;  1ICA A;  3DXK B;  3MXM A;  1MWM A;  4CFD A;  3H45 C;  4BRQ A;  2GBZ A;  4AQY K;  3MEE A;  5H1S Q;  1NGF A;  5J2Q A;  1LOT B;  3FLC O;  2X78 A;  3OYD A;  5TKY A;  3RMB A;  1TK8 A;  3D2E A;  3OBW A;  3PO4 A;  3PSF A;  1NK7 A;  3WNE A;  1I2V A;  2FBT A;  3K5L A;  2JGU A;  2N2R A;  4BY9 C; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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