5AQFA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 127
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqfA04
1G99A 3L6QA 2GEMA 4BR0A 2IVPA 4O8KA 5AQMA 3EL2A 3O08A 5AQZA 3ZETA 1HKBA 3H1QA 3O8MA 3ZX0A 5KQ8A 1NGGA 1RDWX 3A5NC 5BREA 2GUPA 2HF3A 4EHUA 4XH1A 4FWRA 3VEZA 4CZLA 5FPEA 1SZ2A 3FZHA 4AM6A 4CBXA 3HI0A 3O1WA 4BC2A 3B8AX 3UKUB 2HF4A 1BA1A 4BG9A 3VF6A 1GLJO 3SK3A 4BRMA 3R9PA 4XEIA 4A2AA 3BF1A 3BUZB 3M6GA 2NLXA 4HTLA 1BUPA 2P9PA 5FPMA 3VF4A 4JHDA 4YDUC 1BDGA 4BC5A 2YHXA 4FOIA 3GDQA 3ATVA 3ZEUB 5ADXH 4CZFA 2CGKA 4FPBA 1HUXA 1WOQA 2W40A 5ADXA 5AQNA 4BRPA 5AQYA 4NO7A 3UKRA 5AQOA 2P9SB 2QWPA 4MO4A 1RGIA 4O5FA 4ISEA 4FPAA 3W0LA 5BRFA 3R6MA 3I8BA 2Q2RA 4DCHA 1U2VB 4BREA 4FL9A 3D2FB 3DXKB 3IMXA 3VETA 5F2RA 3G25A 3ZX2A 1GLAG 4IJNA 3QFPA 3U9ZA 4H0YB 1LOTB 2QWMA 2HMPA 1X3MA 4CD1A 1ATSA 2QWOA 1QQNA 4PL8A 1ZBSA 2D0OA 4H0XB 4BR5A 1BWFO 4HWIA 3VEWA 4BG8A 5KPZA 3FZLA 2FF3B 4K41A 4B1ZA 5BN9A 5F0XA 3WXLA 3VGKA 2YJEA 3ZX3A 1NMDA 1NGCA 2FXUA 5BRHA 3FZKA 4A62A 3DJCA 5AQSA 2Q97A 2ZGZA 4J8FA 4B1VA 1YXQA 3A5LC 3H1VX 2PBDA 4JD2A 4BRAA 4BVOA 2QW9A 3VEVA 4FWSA 1HLUA 5AQIA 2V52B 4IJAA 3CQYA 4WQ4C 4BRGA 3IUCA 3VEOA 2P9IB 4H03B 4BR7A 1Q18A 1TYQB 1HKGA 2DPNA 4H0VB 3ZEUA 3DAWA 2EWSA 1ZC6A 5AR0A 2BTFA 4CZJA 3EO3A 3LDQA 2E2NA 3L0QA 2GTDA 2CH6A 3KZBA 1KXPA 5JMVA 1X9JA 1S22A 4CZMA 4BC4A 3VGLA 5AQWA 3O6WA 2YCHA 2QWLA 2P9NA 3MN9A 3HM8A 1NGAA 4FWQA 4FWKA 5AZIB 2FSNA 3CJAA 4WQ4A 2CH5A 4ISFA 2VCPA 1BOTO 2YJFA 1WUAA 2Q0RA 2P9KB 3FZFA 2QWNA 5F1XA 4FO0A 3ATUA 2A6AA 1BO5O 4BR9A 3ENOA 3VGMA 3H6EA 2YHYA 4FWNA 2I7PA 3DXMB 3QICA 3GL1A 4QS9A 4BRKA 1NWKA 1NGDA 2E2PA 1SAZA 5BR9A 1BA0A 1T6DA 4CD3A 3H3NO 3C7NB 3U4LA 2ASOA 2F9TA 1NM1A 4QS7A 5AQVA 1J6ZA 3M1FA 3F9MA 2P9IA 3CJCA 1GLFO 3AARA 3ENHA 3RSEB 2ZGYA 4RWTA 4I6MB 3FLCO 4BGAA 3MK6A 2QXLA 3SMPA 4GNIA 3FFKB 4CZHA 5AZJB 4CBWA 3D2EB 1BU6O 1Z05A 3VESA 1GLDG 1E4GT 1NGIA 4CZKA 2F9WA 4JNEA 1HPMA 3VOVA 4FOEA 1XUPO 1GLBG 3CERA 3LDNA 4IO8A 1P8ZA 3CI5A 3CJ1A 4BR4A 4GY2B 4BROA 2CGJA 1Y64A 1V4SA 4KBOA 4IXCA 3WEEB 2A3ZA 4MLHA 1S3XA 3ULEB 3SJHA 4IZ9A 1E4FT 3EKSA 4K42A 2V7ZA 3IFRA 2P9UB 2ITMA 4F9OA 2J4RA 3FE1A 3H3OB 2P9KA 1D4XA 5AQFA 1NGBA 2E2QA 4K25A 3BF3A 5CE3A 2P9LB 3I33A 2D0PA 3UB5A 5BPLA 1YAGA 3CIPA 3WUHA 2ASMA 2E8AA 3UKUA 4CZEA 3ZETB 5AFUH 3WXJA 4BR2A 2GWJA 4LC9B 4EFHA 1HJOA 1ATRA 3WXKA 3QFUA 5AFUA 5AQKA 4PL7A 3LDLA 4E1JA 2YHWA 5I9EB 4H0PA 1HX1A 5AQQA 4CBUA 1IJJA 4M7YA 1JCFA 2E88A 4H0TB 3MMVA 2I7NA 1JCGA 2QM1A 2Q1NA 4BQZA 4H5NA 1X3NA 1DKGD 4PKGA 2HOEA 3QB0A 3FR0A 4RCHA 1ESVA 4H5TA 5AQLA 4B1YB 3LDOA 3CHWA 3SLCA 4K43A 2P9SA 4BRIA 2OANA 3VENA 2P9PB 1K8KB 3MCPA 3FGUA 3VEYA 4JHDB 4FSVA 1SQKA 1U2VA 4CZGA 2NZTA 3D2FA 3DXKA 4L3QA 3A8YA 2Q36A 4H0OA 1H1VA 1MWKA 3LL3A 4CI6A 2UYTA 5BPNA 3ID8A 3H46O 5ELZA 1DEJA 2A5XA 3ULEA 2V51B 1TUYA 3JS6A 2ZWHA 4QS8A 3DWLA 3UKRB 5E84A 3QDKA 2E20A 2IVNA 4A61A 2P9UA 1YVNA 1YUWA 4XH4A 1MA9B 2IVOA 2W41A 1EQYA 1GLCG 3QBXA 2NRHA 4WQ5C 1MWMA 4Y0WA 3CJBA 5LY3A 3O80A 5AQGA 3WT0A 2IIRA 3KVGA 2WUSA 1TUUA 3GE1A 4CZIA 3AAPA 4DHYA 5AQPA 2E2OA 3H45C 2V7YA 3VF2A 1C0FA 1XQSC 3QBWA 1GLEG 1U6ZA 3O5BA 5AQHA 3UE5A 3EZWA 4EIAA 3MN5A 4M63C 1GLLO 3R8EA 3P4IA 1NGHA 1QZ5A 2FSJA 4PKIA 4BRLA 4BRHA 1TYQA 1QZ6A 4RTFD 4BVPA 4B1XB 4JAXA 4WYBA 4WQ5A 3HBTA 3W3DA 1QQMA 4DB3A 4H5VA 4H5RA 5AQTA 1BG3A 4JD2B 4B9QA 4BRNA 4BRQA 2FF6A 5AQUA 5EOYA 5E26A 2A42A 1K8KA 1T44A 1NGJA 4H5WA 3AAQA 4B1UB 2Q31A 2GWKA 2H3GX 3A5MC 3O4WA 5BPMA 3LM9A 4A2BA 4MLEA 1ATNA 3TPQA 3VEXA 1ZXOA 2E1YA 1QQOA 3M3ZA 3HSCA 5JLFA 5AZIA 5EX5A 3VPZA 4B1WB 4BRFA 1LCUA 5KQDA 1KAYA 5EVZA 3C0BA 1NGFA 2QWQA 1V4TA 5B8HA 4FWLA 3KHYA 3S41A 3O1BA 3L4IA 1QHAA 2AA4A 2VYPA 2A41A 2YI1A 3BP8A 3U9DA 4FWMA 3IDHA 2P9NB 5JLHA 3DXMA 4JN4A 1C0GA 3CJ9A 4FWPA 3HTVA 3MN7A 4YDUA 2A40A 4FWOA 4BRDA 1JCEA 3C7NA 1XC3A 5LJWA 2D4WA 3AY9A 4EAHD 3CQXA 1R59O 4ISGA 5EY4A 2CGLA 1KAZA 5AQXA 2D1KA 2VWBA 3BEXA 4XH5A 4AM7A 4MO5A 3VERA 5AQJA 3A0IX 4EHTA 3RSEA 4DQ8A 3A5OC 3EKUA 4I6MA 3HZ6A 3WQTA 2Q0UA 5FPDA 4CJ7A 1IG8A 3CJ7A 5AZJA 5BRDA 2KHOA 3D2EA 5KPTA 1MDUB 5BN8A 1NLVA 3QMLA 2BUPA 1Z6RA 5AQRA 5EXWA 1T6CA 3CETA 1RFQA 4BQLA 5FPNA 1HKCA 3J8AA 4C23A 3GG4A 2AP1A 2ASPA 2FLOA 3MN6A 3SMSA 2FSKA 3D7EO 3WXIA 5TKYA 3EN9A 3U8XA 5LJVA 3WEEA 1DGKN 1NGEA 4NB4A 2E1ZA 3GBTA 4BC3A 1KAXA 3TU5A 4BGBA 3FZMA 3WQUA 2ZF5O 3OHRA 4PKHA 4BRCA 2QWRA 4IWVA 4M7XA 3LDPA 5JICA 1NBWA 3JXUA 2PAVA 4Z94A 2P9LA 3MDQA 3LM2A 2GELA 1CZAN 1OKJA 5KPRA 3GOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L3UA 1ASUA 2B6AA 2W42A 4GKJK 4W5OA 2OZMA 4O8KA 5AQMA 5GIPA 3O08A 4CFDA 3CCEN 4K8ZA 4QOZB 1HKBA 4KTZA 3NFAA 4NYNA 2P5OA 1ITGA 2GUPA 3KKRA 4EHUA 3VQDA 3OYAA 3FZHA 3V9UA 4GKKK 2F8SA 2JWLA 3O3HA 1NJIO 4N76A 3UKUB 4C8LA 1BA1A 3LPUA 4CJEA 3MEEA 2LJMA 2B68A 3R9PA 1RT3A 3IS9A 3EYZA 2C1GA 4CHOA 1C0MA 4YOYA 4YDUC 1BDGA 3V9ZA 3MAQA 3ZT2A 4CEBA 3M8RA 2CGKA 3THYA 2W40A 3CW4A 1RBUA 3S3NA 3SPYA 1P0AA 3UKRA 1HRHA 1T7EA 4JKAA 3CC2N 4ISEA 4A57A 2Q2RA 4DCHA 4E7HA 4O4GA 1U4BA 4CJLA 2YNIA 1Q81O 1KCFA 1XHXA 1DQ7A 1CXUA 3G25A 1GLAG 4OLAA 4CJWA 1DT9A 1RT1A 4ID1A 4CQKA 3MWPA 3LWMA 1U45A 1LOTB 2QWMA 4DTOA 4M41A 1BMRA 3CPEA 4CD1A 3SV4A 3C6UA 4E89A 5KRTA 4B9LA 2HHWA 1QQNA 2Z1HA 1TAQA 1D8YA 3CM5A 3V1RA 3NF7A 1BWFO 4CW7B 1QQCA 4HWIA 3VEWA 4CECA 3CXCM 4HCCA 3T1HK 2YILA 3FZLA 1HNIA 3L2QA 2X78A 1T3VA 3WXLA 3VGKA 2YJEA 2YBRC 3B6PA 1I2VA 5C2DA 1NGCA 2NRVA 1U49A 1CZ9A 3K9KA 2ZGZA 3NGZA 3V9XA 4RG8A 1HQEA 1HLUA 3WNEA 4IJAA 3NF6A 4BRGA 4IG0A 3VEOA 2P9IB 1JKHA 4BR7A 1Q18A 1TVRA 2QTDA 3C95A 4CFCA 2DPNA 4H0VB 1KFSA 1UGLA 3DAWA 3HXMA 1ZC6A 5AR0A 2HMIA 1W9HA 1T0ZA 1N34K 1VQKN 1T1TA 3G4SN 2GV9A 3NGYA 1YJWN 1W2BM 1DTTA 5IT9O 5JMVA 3PIPL 1X9JA 1C0UA 2E6MA 4W5QA 4CZMA 3AO1A 4DTRA 4CF9A 1BISA 4DQIA 4JKCA 2P9NA 3MN9A 1VQON 1NGAA 1J5EK 3WNGA 2I5JA 4E1NA 2KPYA 1BRZA 1BGXT 4LFAK 2G8WA 2CH5A 4DTSA 3DOKA 2HHQA 3OYFA 3VQ8A 5DM7L 5M1PA 4DSEA 2QWNA 3SAHA 2FBYA 3CQ8A 5F1XA 1W97L 1X9MA 4KHWA 4C1NK 3ATUA 1VQ6N 2A6AA 3SCXA 4LF6K 3VGMA 3H6EA 3DXMB 3QICA 3GL1A 1VQLN 4BRKA 1SAZA 5BR9A 1BA0A 4AEIA 1NM1A 2F8TA 4C8KA 1Q86O 3CCMN 1EX4A 3SUPA 5H1SQ 1VRTA 2LSNA 1HNWK 1ZBIA 3CJCA 3THWB 2BANA 4NYFA 4KHSA 3SMPA 5AZJB 1Z05A 4DU4A 4YY3K 1VHXA 4M3YA 1NGIA 4JK9A 3VOVA 1XUPO 4JI6K 4CFAA 3DRRA 4BE7B 4RW8A 4Z0UA 1CZBA 4W5RA 4BROA 3L4QA 4I2PA 5CZ1A 4WCEL 4CCHA 3WEEB 4MLHA 1T7AA 1QS4A 3EKSA 1FKOA 4LD0A 1JLFA 2P9UB 4L8RB 1NK8A 1PTXA 3HT3A 3HO1A 3FE1A 2P9KA 1JZAA 3CCJN 1NGBA 3HK2A 2VY6A 1KVAA 2IAJA 4ZTJA 4Q0BA 3VTHA 5C15A 3I33A 3UB5A 1PX9A 3CIPA 3WUHA 4DLEA 1Z26A 1KD1O 4OPJA 5MLCQ 4CZEA 3I55N 4JK8A 4LSLA 1YJ9N 1S1TA 1P90A 1EKEA 2GWJA 1Q9XA 1VK0A 1ATRA 3QFUA 1IH7A 4OGCA 1NK5A 4E1JA 1HX1A 3E9LA 4CBUA 1NK7A 3KOXA 3ZSXA 3SV3A 4H0TB 2A1RA 1HMVA 3MMVA 3AVCA 1JCGA 1U47A 5D3GA 4FLYA 2HOEA 3QB0A 1ESVA 3OYJA 2P9SA 3G71N 1OZZA 4X65K 2Y1IA 1VSDA 1RDCA 5HRRA 4GV6A 4B3RK 1SKWA 1UAXA 4CERA 1X1PA 4FJNA 4JHDB 1SQKA 1J53A 1U2VA 4CZGA 5JVGL 2D56A 1J54A 3A8YA 4KH5A 4H0OA 4DV5K 4CI6A 2BE2A 3K5NA 3E7RL 2UYTA 2NRWA 3V9WA 4MFBA 3MXIA 1A5XA 3ULEA 3NMUA 4KPYA 2ZWHA 4QS8A 3DWLA 2IVNA 3NVKA 4BDPA 1OVQA 1YUWA 3HM9A 4OKEA 2IVOA 1EQYA 4FJJA 1WSHA 4DQSA 4PY5A 4Y0WA 3WNHA 4CJVA 3O80A 4E7JA 3LWLA 4OX9K 4FJ9A 1BIUA 2IIRA 4CZIA 1ASWA 2EHGA 3PUFA 1KFDA 5CZ2A 4CESA 3TWHA 4FLWA 4I7FA 1U6ZA 3EE9A 5AQHA 1I39A 1RDUA 1WN7A 3KKSA 1GLLO 3P4IA 2E5LK 4B1XB 3PX6A 1YHQN 4WYBA 3HBTA 2QXFA 3E01A 1P00A 5K14A 4B3MK 3LANA 2B5JA 2F7TA 5LMNK 4B9QA 2FF6A 3KP1A 3LZIA 3DLGA 4IDKA 2Q31A 5C42A 2GWKA 4O8UA 2H3GX 3O4WA 3LM9A 4JKBA 4A2BA 3VEXA 2RN2A 3E1YA 3TPQA 3K0SA 1QQOA 3HSCA 5C25A 5AZIA 2YNGA 4XJXA 2KW4A 1WBBA 4BRFA 1LCUA 1QE1A 5KQDA 1KAYA 3VQ6A 5SWMA 4JS4A 2HNZA 4OPAA 1D9FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3L3U A;  1ASU A;  2B6A A;  2W42 A;  4GKJ K;  4W5O A;  2OZM A;  4O8K A;  5AQM A;  5GIP A;  3O08 A;  4CFD A;  3CCE N;  4K8Z A;  4QOZ B;  1HKB A;  4KTZ A;  3NFA A;  4NYN A;  2P5O A;  1ITG A;  2GUP A;  3KKR A;  4EHU A;  3VQD A;  3OYA A;  3FZH A;  3V9U A;  4GKK K;  2F8S A;  2JWL A;  3O3H A;  1NJI O;  4N76 A;  3UKU B;  4C8L A;  1BA1 A;  3LPU A;  4CJE A;  3MEE A;  2LJM A;  2B68 A;  3R9P A;  1RT3 A;  3IS9 A;  3EYZ A;  2C1G A;  4CHO A;  1C0M A;  4YOY A;  4YDU C;  1BDG A;  3V9Z A;  3MAQ A;  3ZT2 A;  4CEB A;  3M8R A;  2CGK A;  3THY A;  2W40 A;  3CW4 A;  1RBU A;  3S3N A;  3SPY A;  1P0A A;  3UKR A;  1HRH A;  1T7E A;  4JKA A;  3CC2 N;  4ISE A;  4A57 A;  2Q2R A;  4DCH A;  4E7H A;  4O4G A;  1U4B A;  4CJL A;  2YNI A;  1Q81 O;  1KCF A;  1XHX A;  1DQ7 A;  1CXU A;  3G25 A;  1GLA G;  4OLA A;  4CJW A;  1DT9 A;  1RT1 A;  4ID1 A;  4CQK A;  3MWP A;  3LWM A;  1U45 A;  1LOT B;  2QWM A;  4DTO A;  4M41 A;  1BMR A;  3CPE A;  4CD1 A;  3SV4 A;  3C6U A;  4E89 A;  5KRT A;  4B9L A;  2HHW A;  1QQN A;  2Z1H A;  1TAQ A;  1D8Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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