5AQFA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqfA04
2OANA 1K8KA 4CJ7A 2EWSA 2Q1NA 3VEOA 3VEWA 1NGCA 2A42A 2ASOA 2NZTA 2CGLA 4JN4A 3OHRA 3WT0A 4FOIA 2V7ZA 2P9SA 5BRHA 4EAHD 2P9IA 2FSKA 1NBWA 1GLDG 4EFHA 3ZETA 2E8AA 2AP1A 4IZ9A 4CBWA 1C0FA 4RWTA 3VF6A 4A61A 3MCPA 4FWSA 1BO5O 1NLVA 4BRIA 3UE5A 3GG4A 4BC2A 5LY3A 4O5FA 2KHOA 4E1JA 3GL1A 5BPMA 5KPTA 3O1WA 1XC3A 4BRCA 3H46O 3EKUA 4H5RA 4I6MA 2YHXA 3UKUA 3IFRA 3MMVA 3QBWA 2QM1A 4XH1A 4DB3A 3EL2A 2F9TA 2YJFA 3QMLA 2YI1A 4PKHA 3GBTA 3WQTA 2WUSA 3P4IA 1MA9B 4BRNA 1YAGA 5BPLA 4FSVA 3DJCA 2NRHA 3FZHA 4YDUC 3WXJA 4BQZA 2E2PA 2QW9A 3RSEA 5AQFA 1OKJA 4CZEA 1XQSC 4A2BA 2A3ZA 3MDQA 3R6MA 3IMXA 1D4XA 4JAXA 4BVOA 2Q36A 1NM1A 1P8ZA 4FL9A 3FLCO 4CI6A 3HM8A 2V52B 1V4SA 2ASPA 3O6WA 4CD3A 2GWKA 1TUUA 3DXMB 3VEVA 3WXLA 4FWOA 1S22A 4H5NA 3VF2A 3A5MC 3BF1A 2NLXA 2P9NB 3CJCA 2CH6A 4BRQA 2E1ZA 2IVOA 3EKSA 5AQSA 5BN8A 1QQMA 2QWMA 3FFKB 4QS8A 2QWQA 3LDOA 4DQ8A 1HX1A 3L4IA 4MO4A 4HTLA 2A40A 2FSNA 2J4RA 1GLAG 5FPEA 3CI5A 4GNIA 4BC5A 1E4FT 1ESVA 1GLEG 2IVNA 4BG9A 5BPNA 5AQTA 3A5LC 1BU6O 2GUPA 5KPZA 2VYPA 3FE1A 3H6EA 5JLFA 2QWNA 3IDHA 3VENA 4B1WB 1BUPA 5AQJA 4HWIA 1QHAA 3HSCA 5AQXA 4J8FA 1K8KB 3G25A 2W40A 3FZFA 3DWLA 3ULEB 2P9UA 4BR0A 3J8AA 4WYBA 3S41A 1ZC6A 2P9KA 1LCUA 4BR7A 3M3ZA 5LJVA 3QFPA 5EOYA 2F9WA 1Z05A 1IG8A 2CH5A 2P9IB 3R9PA 4BRGA 1GLLO 1BWFO 2BTFA 2CGKA 3BEXA 3FZLA 1X3NA 1QQNA 3DAWA 2GELA 1GLJO 4M63C 1SZ2A 3ZEUB 4FWLA 3SK3A 3SMPA 2ITMA 3VEXA 2P9PA 3BP8A 2BUPA 1ATSA 4Z94A 3A5OC 3GDQA 2V51B 4BGAA 1KAZA 2E88A 3W0LA 4FWRA 3QFUA 3VF4A 3VEYA 4H03B 4BGBA 3F9MA 4K41A 3FZKA 1NGGA 1KXPA 1IJJA 3LM2A 5AZJB 1Z6RA 4FWMA 3JXUA 4H0OA 4ISEA 4RTFD 1NGAA 1NGEA 2YJEA 3U9ZA 4FPAA 5AFUA 5AQHA 3H3NO 4CZHA 4H0VB 4BREA 4M7YA 1TUYA 4ISGA 4CBXA 1TYQA 3O8MA 4BRLA 1DGKN 3D2EA 3MN6A 1H1VA 1GLFO 2E2OA 2FXUA 3U9DA 2VWBA 1HKGA 3H1VX 3VERA 4BRDA 1U6ZA 4XH4A 3ID8A 2GEMA 3RSEB 3W3DA 3WEEB 2E2QA 1JCGA 4MLHA 4BC3A 5AQVA 4O8KA 4XH5A 1WUAA 4AM6A 5BR9A 5LJWA 1GLCG 4Y0WA 1QZ6A 4IXCA 2VCPA 3I33A 5TKYA 4EIAA 2PBDA 5AQIA 3ZX3A 4FPBA 3H3OB 3DXKB 4BR5A 3UB5A 3CQXA 4MLEA 3SLCA 5AQMA 3WUHA 2CGJA 3LL3A 5AZIB 5AQZA 2QWOA 4B1UB 2GWJA 2QXLA 2FF3B 3MN5A 4B1YB 2HOEA 4IO8A 1KAXA 3WXKA 3VGKA 3O08A 3ZX2A 5AQPA 1U2VB 4JD2B 4H5VA 4BR4A 3UKRB 3GE1A 3CJBA 4BRMA 1YVNA 5AQGA 3LDNA 2ZGYA 3O80A 1BDGA 1RGIA 5E84A 2P9LB 3ATUA 1RFQA 3TPQA 1KAYA 4B1XB 4CBUA 3L6QA 1NGHA 4JHDB 3O1BA 4BRFA 5EVZA 4CZGA 1NWKA 1ZXOA 2P9UB 4BC4A 2W41A 1BG3A 4BQLA 1S3XA 1MWKA 1DEJA 3FZMA 1DKGD 3A0IX 3CERA 3DXMA 1BA1A 4H0PA 5KQ8A 1HJOA 3AAPA 3A5NC 4BRAA 4B1ZA 4PKGA 4XEIA 3HTVA 2P9NA 1X9JA 3H45C 3C7NA 1RDWX 4NB4A 1HKBA 5JLHA 1NGFA 5EY4A 1Y64A 3WXIA 1LOTB 3M6GA 1JCEA 4FWKA 4IJNA 5CE3A 1SQKA 4A2AA 3VGLA 2P9SB 2FSJA 2YHWA 2QWLA 2D0OA 3EO3A 5AQLA 4NO7A 1NGBA 4MO5A 4EHUA 3VPZA 3ZETB 3L0QA 1YUWA 5AQQA 4KBOA 3BUZB 3FR0A 3QBXA 2Q0UA 4PL8A 3HZ6A 4FWPA 5KPRA 3SMSA 4H0YB 3LDQA 4CZKA 2E1YA 5ADXH 3IUCA 5AQNA 4QS9A 4BRKA 4WQ5A 2HMPA 2Q0RA 3QICA 3D2EB 5BRFA 3D2FA 5AQKA 5EX5A 5BRDA 1XUPO 2AA4A 5B8HA 1QZ5A 2UYTA 4H5TA 2ASMA 2I7PA 3SJHA 4I6MB 3HI0A 3UKUB 1BOTO 4A62A 4FOEA 3ULEA 4GY2B 4BRPA 3BF3A 5AQWA 1QQOA 2V7YA 4B9QA 3QDKA 3MK6A 3VOVA 5FPNA 5FPMA 2ZGZA 5F2RA 3ZX0A 3U4LA 3O4WA 4H0XB 3ZEUA 3VESA 5ELZA 1T44A 5JMVA 2IIRA 3CHWA 3ENOA 5AQRA 5F1XA 2QWPA 3LDLA 4AM7A 4K25A 2Q31A 4L3QA 3CJAA 1YXQA 1NGDA 1BA0A 3O5BA 4WQ4A 4H5WA 4CZFA 3KHYA 5AQUA 4FWNA 4B1VA 3CJ7A 3EZWA 1HKCA 1JCFA 2A41A 4QS7A 2QWRA 5AZJA 2FLOA 2E2NA 2Q2RA 2PAVA 5JICA 3U8XA 3ENHA 4F9OA 4CD1A 2D1KA 2DPNA 2FF6A 3CQYA 3TU5A 4BR2A 3R8EA 4BRHA 2D4WA 3MN7A 4RCHA 4IJAA 4PL7A 2IVPA 1HUXA 1CZAN 2GTDA 1T6DA 3HBTA 4PKIA 1HPMA 4CZJA 3QB0A 4M7XA 3WEEA 5AQYA 3AARA 3VETA 3M1FA 1R59O 2YHYA 3WQUA 1MDUB 3JS6A 3VGMA 4CZLA 4DHYA 5AR0A 3CJ9A 4WQ5C 4BG8A 2A6AA 4K43A 4IWVA 5AFUH 5ADXA 5BN9A 2HF3A 3C0BA 3KVGA 3AAQA 3GOIA 3DXKA 2ZF5O 3A8YA 1V4TA 4CZIA 2HF4A 3H1QA 3CIPA 3C7NB 1T6CA 5AZIA 2D0PA 4ISFA 4FO0A 2H3GX 4CZMA 1MWMA 1ATRA 2P9KB 3AY9A 3D7EO 1Q18A 4JNEA 3KZBA 3LDPA 2Q97A 5FPDA 1ZBSA 2I7NA 3ATVA 1ATNA 5F0XA 1HLUA 4BROA 1U2VA 3MN9A 4JD2A 4BR9A 1J6ZA 3UKRA 4FWQA 2YCHA 1C0GA 1GLBG 3LM9A 5AQOA 2P9PB 5EXWA 3I8BA 1X3MA 5BREA 3CETA 5I9EB 4WQ4C 2ZWHA 2P9LA 4H0TB 4YDUA 1SAZA 3FGUA 4C23A 4JHDA 5E26A 3D2FB 5KQDA 3EN9A 4BVPA 1G99A 4EHTA 4DCHA 2E20A 1NGJA 4LC9B 1EQYA 1NGIA 2A5XA 1E4GT 3B8AX 4K42A 3CJ1A 1NMDA 1TYQB 1WOQA 3VEZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B9NA 4WFAL 2ATQA 1S1XA 1WSEA 1JLCA 3QESA 3O9QA 3VEOA 5SZTA 4N76A 2CGLA 4FOIA 2HHTA 4FJ7A 4H8KA 2VGMA 1NBWA 3LAMA 3CC2N 3N4QA 2YHAA 3AVFA 1NKCA 2KGQA 3J7AP 2YX6A 4RWTA 3VF6A 4A61A 2YHBA 2KTQA 3MCPA 1T7AA 4NCGA 4BRIA 4Z0UA 4DS4A 3HM9A 2KHOA 1FKPA 1IKVA 4PY5A 1GPTA 2HHWA 1RT1A 3C6TA 4BECA 1OZZA 4B8AB 1ZBHA 3IFRA 3CCVN 2C1IA 2QM1A 3O4NA 3EYZA 4B9SA 4IFVA 4DB3A 2HHVA 1G15A 3CFPA 2D56A 3GBTA 1ZBFA 2WUSA 3VTIA 4YHHK 1WSJA 2YNGA 4DF4A 4BDZA 4FSVA 3ZSWA 1LWFA 3OYJA 4YOYA 2O8FA 1TK0A 4C8LA 1VQ8N 2E6MA 4YOXA 1UGLA 2IS3A 5KRSA 3CQ8A 4JYAK 4A2BA 5HRPA 3IMXA 3HVTA 4JAXA 4KTWA 1Q86O 2Q36A 4FL9A 1DJTA 2OPSA 5I42A 3HM8A 2V52B 2OYQA 1ZFUA 3O6WA 4DTXA 2GWKA 4DMNA 4J2DA 1T7BA 4PUOA 4LY7A 5FRNA 1IBKK 1Q9YA 3U6FA 5JS2A 4DTMA 3L56A 3QEWA 3ZLJA 1JLAA 2CH6A 4MDAA 2F8SA 2BANA 2E1ZA 2B5JA 3O3HA 4YFUA 4OX9K 4JKBA 3RTVA 5C10A 3K59A 3SV4A 4MO4A 4M45A 2A40A 1D8YA 5HP1A 4CCHA 5HLFA 5C12A 1BL3A 2C1GA 4CJVA 5A2QO 5KPZA 1BU6O 4C1NK 3DLGA 4FW2A 2AJQA 4FK4A 1I39A 4CHQA 4HWIA 1WAJA 2YC1C 1L4VA 4N56A 3CF5L 1XRSB 4JKAA 1K8AO 3KK3A 3PSIA 1S72N 1I94K 2ZJPL 3CCQN 1L3TA 4DWIA 1U04A 3ULEB 4WYBA 3S41A 4G1QA 4A59A 4B3MK 2N66A 3M3ZA 5LJVA 1Q81O 1Z05A 1TL1A 3CPEA 1FJGK 2P9IB 4BRGA 4K0KK 2CGKA 3FZLA 5AJ3K 5KTQA 2VG6A 4KH5A 3HK2A 3ZEUB 1T1TA 3HXMA 4FM2A 3SMPA 2HBKA 3VEXA 3G4SN 2P9PA 1T05A 1UA0A 4CQKA 2JWKA 3AO2A 1ATSA 1KVAA 1EWQA 5GAGP 1ASWA 3DLKA 5GAEP 1BGXT 4FWRA 3UIQA 3QFUA 1HNXK 3J81O 4FJIA 4I9QA 2UUAK 4PA1A 1NGGA 3SUQA 5CY0A 3HYFA 5AZJB 3I55N 3K5OA 3OYDA 1NK4A 4ISEA 3PSFA 1PE4A 1KLMA 1NGAA 2UXDK 4HUEA 3U9ZA 4FPAA 4BREA 3T1HK 3ALYA 4I2PA 5C25A 3WXMB 1D9FA 3O8MA 1C55A 4BRLA 5FRMA 3CD6N 4Q5VA 4DTNA 2NRWA 1REVA 4BRDA 4JKCA 1HYVA 3THYA 4CJLA 4DTJA 2GEMA 4MLHA 1Z26A 3T1YK 4DFKA 1P00A 2ZE2A 3VQCA 4H4OA 5LJWA 3J80O 1WBBA 1PX9A 1EXQA 3OYNA 2XY8A 4Y0WA 1RTDA 3DOKA 4CK2A 4YOWA 3V9ZA 4HCBA 1WLJA 3I33A 1YJWN 4EIAA 3C94A 1TAUA 1J54A 2PBDA 5AQIA 2QKKA 3TSUA 3KOZA 4FLYA 3UB5A 1RDCA 4MLEA 3OVNA 3SLCA 2HNYA 3QINA 2CGJA 1RBSA 2W42A 4M3ZA 3LL3A 5AZIB 4DR1K 4FYDA 4A5BA 5D3GA 2GWJA 2FF3B 1XHXA 3MN5A 3ISNC 4DR4K 4IO8A 2LY6A 1EO1A 3CW4A 2QA4N 2KQ2A 3UKRB 2FBXA 1XNRK 2LJMA 4OLBA 1KC8O 4KPYA 4G9ZA 5E84A 2P9LB 1U45A 3HVRA 3VQDA 1BIZA 4CGDA 1C1BA 4FK0A 2MBKA 4JKGB 2ZJRL 2E0HA 3ZSXA 4BC4A 4ZTJA 4BQLA 1BG3A 1HQEA 1MWKA 4A62A 1DEJA 4QOZB 4ELUA 1VSLA 5HL7L 3E7RL 4K8ZA 3A5NC 4BRAA 1T3VA 2XY6A 4XEIA 1TGOA 2VQFK 2OTJN 5DK5A 4OJRA 2UXCK 4CJ5A 5JLHA 4F2RA 4CK1A 1LOTB 3M6GA 3D6RA 3NFAA 5CE3A 3QIOA 4A2AA 2P9SB 2D0OA 4LH5A 2FBVA 4NO7A 1VQ6N 4MO5A 3VPZA 2OCEA 5AQQA 1NJYA 2O8EA 3FR0A 4JK8A 4O4GA 4FWPA 3O9UA 4WFNL 4H0YB 3OA9A 3LDQA 4CZKA 1N33K 1U48A 4QS9A 5GIPA 1CXUA 3D2EB 1VQON 3D2FA 5AQKA 5J1EA 4FJGA 1XUPO 4E72A 1IKWA 3PUFA 3SJHA 2P1JA 3HI0A 1BOTO 3NHGA 2Y1JA 4BRPA 3OBWA 1HYSA 3QDKA 2G8VA 3VOVA 4DFPA 2N2RA 5FPMA 1N8RO 2ZGZA 5F2RA 3E9LA 3TTCA 3KWGA 3K2PA 4OPAA 3M8SA 4ZTFA 3SNNA 2W6KA 2KSKA 4JI2K 3O4WA 3U4LA 2WONA 1RDBA 2XY7A 5ELZA 5JMVA 3CHWA 3BDPA 2QWPA 3LDLA 2N69A 4AM7A 4Q0BA 5E41A 4NLBA 3THXA 4L3QA 3CJAA 2KLAA 4B3RK 3O5BA 3D0PA 2DFHA 3QIPA 3AVCA 1HR0K 3CJ7A 3EZWA 1HKCA 3DI6A 2KJAA 4AHUA 4BWJA 2E2NA 3SAGA 4J2BA 2PAVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4B9N A;  4WFA L;  2ATQ A;  1S1X A;  1WSE A;  1JLC A;  3QES A;  3O9Q A;  3VEO A;  5SZT A;  4N76 A;  2CGL A;  4FOI A;  2HHT A;  4FJ7 A;  4H8K A;  2VGM A;  1NBW A;  3LAM A;  3CC2 N;  3N4Q A;  2YHA A;  3AVF A;  1NKC A;  2KGQ A;  3J7A P;  2YX6 A;  4RWT A;  3VF6 A;  4A61 A;  2YHB A;  2KTQ A;  3MCP A;  1T7A A;  4NCG A;  4BRI A;  4Z0U A;  4DS4 A;  3HM9 A;  2KHO A;  1FKP A;  1IKV A;  4PY5 A;  1GPT A;  2HHW A;  1RT1 A;  3C6T A;  4BEC A;  1OZZ A;  4B8A B;  1ZBH A;  3IFR A;  3CCV N;  2C1I A;  2QM1 A;  3O4N A;  3EYZ A;  4B9S A;  4IFV A;  4DB3 A;  2HHV A;  1G15 A;  3CFP A;  2D56 A;  3GBT A;  1ZBF A;  2WUS A;  3VTI A;  4YHH K;  1WSJ A;  2YNG A;  4DF4 A;  4BDZ A;  4FSV A;  3ZSW A;  1LWF A;  3OYJ A;  4YOY A;  2O8F A;  1TK0 A;  4C8L A;  1VQ8 N;  2E6M A;  4YOX A;  1UGL A;  2IS3 A;  5KRS A;  3CQ8 A;  4JYA K;  4A2B A;  5HRP A;  3IMX A;  3HVT A;  4JAX A;  4KTW A;  1Q86 O;  2Q36 A;  4FL9 A;  1DJT A;  2OPS A;  5I42 A;  3HM8 A;  2V52 B;  2OYQ A;  1ZFU A;  3O6W A;  4DTX A;  2GWK A;  4DMN A;  4J2D A;  1T7B A;  4PUO A; 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