4Z94A

Actin complex with a chimera of tropomodulin-1 and leiomodin-1 actin-binding site 2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/structural protein
total genus 110
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4z94A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4z94A04
3BUZB 5JLFA 4DHYA 1P8ZA 3FGUA 2F9TA 2P9IA 5BPNA 5EOYA 2ASOA 4FL9A 4JNEA 3VOVA 3M3ZA 3U9ZA 2P9PB 5AQHA 3A5OC 2D0OA 1HUXA 4XH4A 5AQTA 5AQMA 2VWBA 1U2VA 2E2PA 1NGIA 3VEWA 1HKCA 1DEJA 2E2QA 2EWSA 3BF1A 2J4RA 1MDUB 3QBXA 3VENA 3WEEB 1D4XA 5BRHA 2ASMA 3VERA 4QS7A 4CBXA 5KQ8A 4JD2B 1BG3A 4BQZA 5AZJA 3L4IA 4BRFA 4B1WB 2VYPA 2IVOA 4BGBA 5E26A 2A6AA 4BC2A 4MO4A 4L3QA 2P9UA 3UKRA 3H1QA 3R8EA 2E8AA 5AQQA 4WYBA 2FXUA 3WXLA 4ISFA 4LC9B 3ZX3A 3I8BA 5AQLA 2WUSA 3ZEUB 2Q1NA 1NBWA 2CH5A 2CH6A 3FZHA 3DXKB 5ELZA 1MA9B 2Q97A 4BROA 1EQYA 4DQ8A 1BA0A 2QWMA 3WXJA 5AQSA 2IIRA 2Q2RA 2D4WA 3SMPA 3KHYA 4CZFA 5JICA 3ATUA 4RWTA 3LDNA 4H5TA 5AQYA 2P9PA 3RSEB 2YHYA 5BN8A 4FOEA 3TU5A 1BWFO 3H3NO 3EKUA 4H0VB 1NM1A 4BC4A 4BC5A 5AQRA 1NGJA 4JD2A 5LJWA 3A5NC 1JCFA 2ZF5O 2I7PA 2YCHA 1H1VA 1Z05A 3UE5A 5ADXH 4FWKA 3VEZA 1QQOA 4A62A 2A40A 5TKYA 1Q18A 4FOIA 2ZGYA 4IZ9A 5LJVA 3CJCA 2YJEA 3ATVA 2P9SB 2QM1A 4PKIA 1QHAA 3O6WA 4EIAA 4CD1A 3S41A 1V4SA 4H0OA 4JHDA 2E1YA 5EX5A 4C23A 3MK6A 1DKGD 2E1ZA 4DB3A 4BG8A 3P4IA 1NLVA 3D2EA 1WUAA 2V7ZA 4H0PA 2ASPA 4NB4A 3CJ7A 3A8YA 3FZKA 3RSEA 1LOTB 3UKUB 2V7YA 2Q0RA 1GLDG 1HX1A 4CZHA 2P9UB 5KPRA 4BR2A 3VGMA 3FE1A 4PKGA 1NGHA 3ZETA 5FPDA 4H5VA 5KPTA 3LM9A 3SK3A 4CI6A 4YDUC 4B1UB 1QZ5A 2QWPA 3VESA 3JS6A 5BRDA 1MWKA 3MCPA 1BO5O 4NO7A 4PKHA 5BPMA 3LDOA 3EL2A 4BG9A 3ENOA 4EAHD 5EVZA 3VETA 5F2RA 4O8KA 3IFRA 4BRLA 4H03B 3AAPA 1IJJA 3GBTA 2FF3B 4BRPA 1ATRA 5AQKA 2AA4A 5FPEA 4M7YA 3O1BA 5B8HA 2P9SA 5AQIA 5AQFA 4QS9A 3WQTA 5JMVA 2GTDA 3IMXA 1TYQB 4K41A 2P9LB 3H6EA 4BVOA 4BC3A 4B1XB 2ITMA 3H1VX 4IJNA 5BN9A 2A41A 1HKBA 1T6DA 4CZJA 4GY2B 4QS8A 3VEVA 1RGIA 3OHRA 3FFKB 3U9DA 2AP1A 3UKUA 4BRMA 3CQXA 3MDQA 4BGAA 4DCHA 1T6CA 1XC3A 4EHUA 3KVGA 1KAXA 1K8KB 4H5WA 4RCHA 2E2NA 3DXMB 2FF6A 4ISGA 1T44A 1G99A 2FSJA 3BP8A 2GWJA 1HPMA 4Y0WA 3DAWA 3MN7A 4JHDB 3GDQA 4FPAA 3WUHA 4Z94A 2GUPA 1GLFO 3U8XA 1KAZA 4BRQA 5AR0A 3SLCA 4BRDA 3D2FA 3D7EO 4B1ZA 2DPNA 4CD3A 3GE1A 5EXWA 4BR7A 3D2EB 1Y64A 2GELA 2BUPA 3HSCA 2IVNA 5F1XA 1GLCG 4EHTA 3H46O 4FWPA 3CJ1A 3ZETB 2QWOA 1XQSC 4FWOA 1TYQA 2P9LA 3MN9A 2W41A 4BVPA 5AFUA 1OKJA 4AM7A 3TPQA 2A42A 4WQ5C 1ZC6A 4B9QA 3FZLA 4H5NA 5CE3A 3WXKA 3VEXA 2YI1A 2YHXA 2W40A 1BDGA 2P9KB 4CJ7A 2CGKA 1GLBG 1KAYA 1NMDA 3A5MC 3EKSA 3VGKA 4BRAA 1K8KA 2E2OA 2YJFA 2QWRA 3VPZA 3HTVA 2F9WA 4FPBA 3IDHA 3DXMA 3WXIA 5AQZA 5AQWA 1YUWA 3AY9A 4HWIA 4FWRA 5BR9A 3CERA 5BPLA 1NGBA 3H3OB 1HKGA 3H45C 4I6MA 3DWLA 5AQNA 4JN4A 3R6MA 5AQXA 1S3XA 4H0YB 2H3GX 3GG4A 2P9NA 3GL1A 2HF3A 4BR9A 2HOEA 2I7NA 3EN9A 3CHWA 4IO8A 4BRKA 1U6ZA 3WT0A 4CBUA 5BREA 2BTFA 5AQGA 3QB0A 1X3NA 2KHOA 3L6QA 4FWSA 2E20A 2D0PA 3ZX0A 1MWMA 3LDPA 4BRHA 3L0QA 5AQJA 1GLJO 1GLLO 1X3MA 4YDUA 5AQPA 5AQUA 1YXQA 4M7XA 2OANA 4XH1A 1YAGA 2P9KA 1V4TA 2Q31A 1TUUA 1SZ2A 3D2FB 5FPNA 5I9EB 3B8AX 3QICA 1X9JA 5E84A 4CZKA 4A61A 3WQUA 2A5XA 3KZBA 4PL7A 3QBWA 1DGKN 3EZWA 1S22A 3W0LA 4BQLA 2CGLA 1NGCA 4E1JA 4IWVA 5KPZA 2YHWA 2QXLA 4BR4A 3VGLA 2QW9A 4B1YB 3FR0A 4ISEA 3FLCO 4K43A 4AM6A 4IXCA 4K42A 3HI0A 4MO5A 1JCEA 1E4GT 1NGGA 3O1WA 1NGAA 4FWMA 4CZIA 2V52B 4BR5A 3BF3A 4PL8A 3CJAA 2FSNA 5LY3A 4MLEA 3UB5A 3ULEA 3BEXA 3VEOA 3LL3A 3CJ9A 4I6MB 4F9OA 4EFHA 4IJAA 5ADXA 3O8MA 1BA1A 3FZMA 5FPMA 1QQNA 2P9NB 5AQOA 1R59O 5AZIB 4B1VA 4FSVA 1TUYA 2IVPA 4H0TB 2FSKA 4XEIA 3QMLA 3VF6A 2ZGZA 1KXPA 2QWNA 1ESVA 5BRFA 4K25A 3AARA 3EO3A 3MN5A 2PBDA 5AQVA 2HMPA 3QFPA 3QFUA 4CZMA 2E88A 2V51B 4BREA 5F0XA 1C0GA 1GLEG 3O08A 1HLUA 3C7NB 4CBWA 1SAZA 1ATNA 3ZX2A 4WQ5A 1RDWX 4FO0A 3I33A 3AAQA 3QDKA 2NZTA 4M63C 1YVNA 3CETA 2FLOA 4KBOA 4CZLA 2QWQA 1JCGA 1WOQA 2QWLA 4CZEA 3M1FA 3W3DA 2HF4A 1GLAG 3R9PA 2PAVA 2NRHA 3ID8A 2NLXA 3LDQA 3O5BA 1BOTO 3IUCA 3WEEA 1NWKA 1HJOA 4FWLA 4RTFD 4XH5A 4CZGA 3CJBA 1RFQA 3LDLA 1NGFA 3VF2A 1SQKA 3HBTA 2GEMA 4H0XB 3VF4A 3J8AA 4J8FA 2P9IB 1E4FT 4A2BA 2GWKA 1CZAN 1NGEA 2D1KA 4BRNA 4MLHA 4O5FA 3FZFA 4BRCA 5AZIA 2Q0UA 3O80A 2A3ZA 3ENHA 3VEYA 3C0BA 4FWNA 1U2VB 1ZBSA 4BR0A 1J6ZA 3ZEUA 3U4LA 4BRGA 1ATSA 1NGDA 1BU6O 3DXKA 1C0FA 2UYTA 2VCPA 4H5RA 5AFUH 3MN6A 4A2AA 3GOIA 3SMSA 5KQDA 2ZWHA 1XUPO 3JXUA 3C7NA 1LCUA 5AZJB 3HZ6A 4FWQA 3SJHA 2CGJA 3ULEB 4BRIA 1BUPA 4HTLA 1QZ6A 3O4WA 3UKRB 4WQ4C 3DJCA 1ZXOA 2Q36A 4WQ4A 3HM8A 1Z6RA 3LM2A 3A0IX 5JLHA 3CQYA 3F9MA 3CI5A 3MMVA 5EY4A 1IG8A 3CIPA 1QQMA 3M6GA 4JAXA 3G25A 4GNIA 3A5LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J1EA 1S1UA 3EEQA 2HHXA 3K0SA 2WFBA 4JI7K 1J5EK 4CGFA 4WFNL 1VSMA 3U9ZA 3AO1A 3A5OC 1WBBA 5AQTA 5AQMA 3NVKA 1SL0A 2IS3A 2E6LA 2ZJRL 3K9JA 1MDUB 3TAGA 3WEEB 1D4XA 4QS7A 2VQFK 3AVGA 3TABA 3L3VA 4BQZA 3PO5A 2F4VK 2KTQA 2VYPA 1KTQA 2A6AA 4BC2A 2B6AA 4MO4A 3UKRA 3C65A 3H1QA 5TKWA 3THWB 4DS5A 2VQEK 1CZ9A 4ISFA 3DLLL 2VWJA 4CJ3A 3NMUA 4JKAA 3HP9A 1NBWA 4AQYK 5ELZA 1MA9B 3F5TA 4KTWA 3DRRA 3LP1A 1BA0A 4DQ8A 3MWPA 4B9UA 4JKDA 4NLBA 1UAXA 2E4LA 1VRTA 2Q2RA 5JICA 4E7KA 1LW0A 3HPHA 2PYLA 1RCHA 2P5GA 3BZCA 4KTQA 2YHYA 1WSHA 4IEIA 4AH9A 4HUGA 1BQMA 2HHQA 1BWFO 3AVMA 4B9TA 3OYDA 4O8UA 1JLGA 4KV8A 2G8VA 4BC4A 2DFHA 1YIJN 4CHPA 3KTQA 3I56N 3RMDA 4FW2A 5EU7A 3UE5A 4Z0UA 5FRMA 5TKYA 4KKOA 4FJ7A 1C0MA 1Q81O 4FOIA 4DFMA 4LY7A 3TAPA 4CJFA 5LJVA 3CJCA 2YJEA 1C0UA 1X9MA 4KFBA 3O6WA 2O8EB 4CECA 1NKBA 5EX5A 1HQEA 2HHHK 3U3GA 3VQDA 1YJNN 2E1ZA 2OTLN 4DSKA 3P4IA 5C10A 1NLVA 3D2EA 1S72N 1WUAA 3A8YA 3L8BA 1LOTB 3UKUB 4CHNA 2V7YA 3OYMA 2XO7A 2ATQA 4CEEA 2Z1GA 3E9OA 5KPRA 2Y1JA 1NGHA 3ZETA 5FPDA 3KIOA 4F4KA 4ID1A 2GV9A 3L4QA 4CI6A 4N56A 4B1UB 1TK8A 2QWPA 3AVNA 4CJQA 2WOMA 4ILHA 1K73O 3VESA 4PQUA 1MWKA 1QHTA 3MCPA 4O0JA 4NO7A 3SQ4A 5CYMA 3THXB 3ENOA 4V19S 4C1NI 2YX6A 1I94K 4Z4EA 4CW7B 5GIOA 4GVEA 2YNIA 2PFUA 1ATRA 4YHHK 5FPEA 3O1BA 2YNHA 2RKIA 5AQIA 2D0CA 1ZBUA 4CESA 3IMXA 1TYQB 1U47A 3J7ZO 3ENBA 3KK7A 3VQ4A 4BC3A 3SUPA 5AJ3K 2G8IA 3H1VX 3QO9A 1J53A 4OVLA 2A41A 1T6DA 4FM1A 4JKCA 3OYFA 1NJXA 3TSQA 3NH0A 1RGIA 2AP1A 3MDQA 4YNQA 1XC3A 1IKVA 3T1AA 4X62K 4FLVA 4CEBA 3MXJA 3NCIA 2HNZA 1BQNA 3TTDA 4DV7K 5MLCQ 1VQ6N 4Y0WA 4CJ5A 3RMCA 3VTHA 3QEWA 3GDQA 3WUHA 1QTMA 1GLFO 4DTOA 5HP1A 1KAZA 4BRDA 3D7EO 4WCEL 4BE0A 2AJQA 5HOOA 4CJVA 1Y64A 4DR3K 1HNIA 4FLUA 4AHRA 2BUPA 1DTTA 2JWKA 1GLCG 4EHTA 4FWPA 4JI3K 4DMNA 4HTUA 3NH2A 2QWOA 4I9LA 4G1QA 1FXXA 3OYNA 1VQ9N 1IBMK 5AFUA 3TPQA 3KWGA 3RR8A 1RBRA 4FJLA 2RN2A 2I5JA 3FZLA 5C24A 1TKZA 2YI1A 3VEXA 1XNRK 3KLFA 1BDGA 3VQQA 4CJ7A 2CGKA 1HYVA 3SNNA 4YOYA 4AHSA 2ZJQL 3CCVN 2G8KA 4W5OA 3G4SN 1K8KA 1T7PA 5KTQA 1OVQA 4KRFA 1FKPA 2E6MA 2X6SA 5AQZA 1U45A 5AQWA 1YUWA 3CYGA 1NU0A 4OPKA 5BPLA 4IOXA 3LZJA 1HKGA 1BISA 3O3GA 4I6MA 3DWLA 3LDSA 2YHBA 4FJKA 5CHIA 4H0YB 4B3TK 3O4QA 3CC2N 1MU2A 3GL1A 2HF3A 2X78A 3AVFA 3K58A 4JI0K 3QB0A 2KHOA 4GMJB 4KH6A 4EP5A 1VQ4N 2HHWA 3HT3A 4JI8K 2D0PA 4JKEA 1OH7A 3LDPA 1ZYQA 1S5JA 3PIOL 3NHGA 1RTDA 4YDUA 3LP2A 2WONA 5AQUA 5HRRA 1YXQA 1VQKN 4J2BA 3QETA 4DG1A 2BH1A 2P9KA 1BI4A 5GAGP 4FJNA 1VSFA 5FPNA 5I9EB 3LPUA 4CZKA 5LL6Z 4B8AB 1F21A 1B9FA 1NK5A 2NRVA 2P1JA 2OPSA 3VTIA 2CGLA 2KLAA 5FRNA 1SV5A 5T7BA 4IWVA 5KPZA 2YHWA 2QXLA 4BR4A 5C42A 4HVJA 4IFEA 4UQGA 3FR0A 3QESA 1M90O 4K43A 1YJWN 3HI0A 1GOBA 4QCLA 4MO5A 1JCEA 1UA0A 2OCEA 2W42A 1NGGA 5KRTA 3VA3A 1Y97A 1X1PA 2V52B 1VQ8N 3MECA 1B9DA 3DM2A 3UB5A 2O8FB 1JL2A 4FJ5A 5LMNK 4C8MA 1TL3A 3CM6A 4IJAA 1EO1A 3CCRN 3O8MA 4DR7K 3FZMA 1QQNA 3MCAB 4GKJK 3AA4A 5J2PA 2HHSA 1TUYA 3PX6A 3VF6A 3NBPA 1T03A 2ZGZA 3I0SA 3NH1A 3AARA 3HO1A 2PYJA 5C0YA 4FK2A 5LMUK 4FXDA 3QFPA 3QFUA 4CZMA 4W5NA 4CJKA 3HK2A 4CBWA 4LFAK 1KVBA 2HBMA 2XHBA 3HYFA 1WAFA 1RDWX 2NZTA 3CETA 3O9UA 1WOQA 2QWLA 1VQ5N 2F8TA 3M1FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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