4Z94A

Actin complex with a chimera of tropomodulin-1 and leiomodin-1 actin-binding site 2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Protein binding/structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4z94A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4z94A04
1TYQA 2QXLA 4H5WA 2CH5A 1NGBA 4FPAA 4CZJA 2IVOA 3MMVA 3BUZB 4B1VA 5KPRA 1ATSA 3FZKA 3EKSA 4JN4A 2P9SA 5FPDA 1KAXA 3DXMA 2QWRA 2A5XA 4FSVA 4WYBA 1CZAN 1DGKN 4RWTA 4CZIA 1BUPA 1NBWA 3S41A 3VETA 1NGFA 2P9UA 2ZGZA 4YDUA 3RSEA 3H1QA 3GOIA 5BRDA 1QZ5A 3UKUA 4CBXA 3EZWA 3A5MC 2V51B 2GEMA 3ENOA 2DPNA 2VWBA 5KPTA 5AQMA 3VF4A 3FR0A 3FZFA 3QFUA 3SMSA 5AQYA 3HBTA 3VF6A 5AZJA 3VGMA 4CZMA 5FPEA 3VPZA 5EX5A 4H0XB 2E2NA 4NO7A 2W41A 4H0OA 5AQKA 3DXKB 1MWKA 4B1WB 3ENHA 4EHUA 3CJ1A 1NLVA 3F9MA 1HLUA 1WUAA 3OHRA 2YHYA 3UB5A 3SLCA 5KQDA 3L6QA 3CHWA 3CJBA 1BWFO 3WXLA 3O1WA 3A8YA 4BG8A 2CH6A 4CD1A 5AZIB 3CI5A 4L3QA 4CZGA 3LDNA 4B1XB 3C7NA 4JAXA 4BRNA 4DCHA 1KAZA 4PL7A 2QW9A 3BP8A 4IJNA 1V4SA 1NWKA 3EO3A 4MO5A 3CJ9A 1K8KB 3FZLA 3DAWA 3AAPA 1S3XA 3CQYA 5E26A 4PKHA 4K42A 2IVPA 4B1YB 3ID8A 3W3DA 1KXPA 4M7XA 5AQLA 3WUHA 3GG4A 3QDKA 5EOYA 3WEEA 2YHXA 3H45C 1HKGA 2Q0RA 2Q0UA 5CE3A 3WT0A 3EKUA 5EXWA 4FWOA 3J8AA 2WUSA 4BRIA 3M3ZA 4CBWA 3ZETB 5AQHA 4XEIA 1DEJA 1NM1A 4BC4A 4BR0A 3FZMA 4QS9A 3VGKA 5AFUH 1NGDA 4B9QA 4BRDA 5BRFA 3W0LA 2UYTA 4MO4A 3UE5A 3MN9A 4EHTA 3HM8A 2Q36A 3AARA 1BO5O 4HWIA 5BPLA 3CJCA 4PKGA 1QQOA 1NMDA 5AQOA 1IJJA 3ZX2A 4CZLA 4IJAA 2YCHA 3D2FA 2PBDA 4GY2B 2E2QA 1NGGA 2FSJA 1NGEA 2KHOA 3A5OC 3D2EA 1BA1A 3H46O 4MLHA 3U8XA 4BRPA 1JCFA 5LJWA 2P9LB 2YHWA 3M1FA 3U4LA 5TKYA 5AQQA 3TPQA 2NZTA 1R59O 4H5NA 2FSKA 4A2AA 2EWSA 2GWKA 1T6DA 4PL8A 5AFUA 4O5FA 1BA0A 4NB4A 5JLFA 2CGJA 3O1BA 4EAHD 1IG8A 1HPMA 4ISEA 1BU6O 4CI6A 2I7NA 3GDQA 3DXKA 1T44A 5BREA 4KBOA 4H03B 2CGKA 4BRFA 1U2VA 1JCEA 4FWLA 4QS7A 4XH1A 2P9NB 3WXKA 3LDPA 5EVZA 5F2RA 2ZF5O 4WQ4A 4GNIA 4AM6A 3MDQA 5BPMA 5BRHA 2GWJA 2A41A 3VEWA 3SJHA 1MA9B 1SZ2A 2ASMA 3MCPA 1ATRA 3O08A 3CERA 1K8KA 2Q2RA 1C0GA 3IFRA 2FXUA 1GLLO 4CZFA 2E20A 4O8KA 1ZC6A 1QZ6A 1JCGA 2HOEA 2P9PA 1C0FA 2J4RA 4Y0WA 3VOVA 5AQVA 2A42A 1HKBA 4JHDB 4BR7A 5I9EB 2GUPA 4I6MB 5AQSA 3AY9A 3VEOA 2V52B 3ATVA 5E84A 4BGAA 3FE1A 5FPNA 3O4WA 3VERA 4RTFD 1D4XA 2P9IA 2GTDA 3EL2A 3ZETA 2D0PA 3MN7A 4H5TA 1RGIA 3CJ7A 1X9JA 1NGCA 2ASOA 5FPMA 2NRHA 4JD2B 1TYQB 4IWVA 2P9KA 3SK3A 1GLCG 2E1ZA 3WXJA 5KQ8A 4FWPA 4WQ5C 4M7YA 4BR2A 3CETA 4BROA 2QWNA 5JICA 2P9SB 4IZ9A 1NGHA 1WOQA 3DXMB 3HI0A 5KPZA 5ADXH 5AQGA 2VYPA 1E4FT 4XH5A 1QHAA 3L0QA 4K43A 3LM9A 4A62A 3UKRA 3O8MA 3ZEUA 3VENA 2Q1NA 4BC5A 2P9UB 3RSEB 1MDUB 2OANA 5AQXA 3DJCA 3GL1A 2IVNA 3M6GA 3ULEA 1KAYA 3GBTA 4BC2A 1E4GT 3UKUB 4AM7A 3O5BA 1ESVA 3H3NO 1GLBG 4F9OA 5BR9A 4FWRA 1HX1A 4FOEA 2D1KA 3HSCA 2YJFA 3WQTA 3R6MA 1EQYA 4CBUA 4FWSA 2CGLA 3R9PA 2FLOA 4BQZA 5ADXA 1LCUA 2Q97A 3QBXA 4BRMA 1GLAG 4ISFA 3H6EA 2E8AA 2D4WA 1V4TA 3MK6A 3VF2A 5EY4A 1YXQA 2HF3A 5JLHA 2V7ZA 1NGIA 1X3MA 1HKCA 4DQ8A 3H3OB 1NGJA 3IMXA 3FFKB 2F9TA 3C7NB 2E2OA 2F9WA 2IIRA 1LOTB 3KVGA 4Z94A 3A5LC 2A40A 3O80A 1J6ZA 1ATNA 3EN9A 4DHYA 4ISGA 3LDOA 4CZEA 4FO0A 3KZBA 3BF3A 1XC3A 3FGUA 4FWNA 3WEEB 2BUPA 4FWKA 5AQZA 4H0PA 3VGLA 4YDUC 4BR4A 4FWQA 4IXCA 1GLEG 2A3ZA 4BRGA 5LJVA 5AZIA 2YI1A 3FLCO 3MN5A 3LM2A 3U9DA 3B8AX 2BTFA 3KHYA 3QMLA 4CD3A 3VEVA 5JMVA 3VEXA 4QS8A 1U6ZA 3P4IA 4BRKA 3I8BA 1DKGD 5AR0A 3GE1A 2HMPA 3CIPA 1X3NA 3D2FB 3A5NC 3WQUA 3D2EB 2QWMA 5B8HA 1G99A 4IO8A 2NLXA 4BR9A 2AA4A 3IDHA 3HTVA 4BQLA 1XQSC 3BEXA 1BG3A 4B1ZA 1GLDG 3JXUA 3FZHA 4BR5A 1QQMA 4RCHA 4CZKA 4A2BA 5F0XA 2E88A 5BPNA 4BREA 3HZ6A 2VCPA 3L4IA 3LDLA 4FL9A 2E2PA 3CQXA 3R8EA 3QICA 3LL3A 4BVOA 3CJAA 2QWLA 3IUCA 1QQNA 3U9ZA 4EFHA 1ZXOA 4C23A 1U2VB 2AP1A 1P8ZA 5AQIA 3ZX3A 2P9LA 3WXIA 4CJ7A 4FWMA 1Q18A 1YUWA 4BRLA 3TU5A 5AQJA 4BRHA 5AQNA 1GLFO 4B1UB 4M63C 4PKIA 1RDWX 5AQRA 4BG9A 4BVPA 2W40A 3DWLA 4MLEA 1BDGA 1XUPO 2QM1A 3AAQA 1TUUA 2D0OA 3D7EO 3O6WA 4WQ5A 4HTLA 2P9PB 4DB3A 3C0BA 1MWMA 5AZJB 5ELZA 2FF3B 4JNEA 2GELA 3ZX0A 4CZHA 2ZGYA 3QBWA 4H5RA 4BRCA 2V7YA 2P9NA 1T6CA 2E1YA 2ZWHA 5AQFA 2QWQA 2ASPA 5BN9A 1Z05A 5AQTA 1HJOA 2P9IB 2FF6A 3VEYA 4A61A 3JS6A 4J8FA 4EIAA 4H0TB 2FSNA 2HF4A 4K41A 4H5VA 1SAZA 1GLJO 2ITMA 3QB0A 2Q31A 1YAGA 3LDQA 3ATUA 2P9KB 4K25A 3QFPA 2PAVA 2H3GX 4H0YB 4BGBA 5LY3A 1BOTO 4BRQA 3SMPA 1RFQA 3G25A 4BRAA 5AQWA 1HUXA 1NGAA 2YJEA 4JHDA 3VESA 5F1XA 1TUYA 1H1VA 2A6AA 4I6MA 1OKJA 3A0IX 4FOIA 1Z6RA 5BN8A 5AQPA 3BF1A 4BC3A 4XH4A 4WQ4C 5AQUA 4H0VB 3UKRB 2QWPA 3ZEUB 4LC9B 3I33A 4E1JA 1SQKA 2QWOA 1Y64A 2I7PA 3H1VX 3MN6A 4FPBA 1ZBSA 1S22A 3ULEB 1YVNA 3VEZA 4JD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S6QA 3IRXA 2W6LA 4H5WA 5I42A 3I8DA 3DRRA 3PX6A 1XWLA 5KPRA 1N8RO 1ATSA 4CHZA 3FZKA 1VHXA 5FPDA 3Q7BA 2UUCK 1KAXA 2ZD1A 4GKKK 4FSVA 4ELUA 4WYBA 4KI6A 2IC3A 3OYKA 4PHTX 4RWTA 4CZIA 1LWFA 3MAQA 3MEGA 3NHGA 4CJ4A 4FJHA 1XMQK 3H1QA 3GOIA 1G15A 1C1AA 1JL1A 3UKUA 3CXCM 3EZWA 3S3NA 3A5MC 4BWJA 1YJNN 1RDBA 3VF4A 3FR0A 1VRTA 1XI1A 5AQYA 1JLAA 3FFIA 4JKBA 4DV6K 4H0XB 3NCIA 1BHLA 5EU7A 1XMOK 4EHUA 1T8EA 3NH0A 1HLUA 5KQDA 3IS9A 3CJBA 4IDHA 3LALA 4OGCA 4LF9K 3BZKA 3A8YA 2GV9A 1M90O 3J80O 4BDPA 2BGGA 3TAEA 3KTQA 4CK3A 3NGIA 3AVGA 3CYMA 3P31A 3LP2A 4CJLA 4PL7A 2EX3A 3L2QA 4IJNA 1TKXA 1TK5A 3J7YP 4DQSA 4FJ9A 3CJ9A 2VWJA 3K57A 5C10A 5J2PA 3AAPA 3O9TA 5E26A 4B9UA 2IVPA 2B4JA 2X6NA 4B1YB 3VQDA 1VQ6N 3GG4A 3QDKA 4DTPA 5EOYA 2YNFA 3MCAB 1HKGA 2X78A 4CGHA 5CE3A 3WT0A 4YHHK 4FLVA 3TAMA 2RF2A 4YORA 4BRIA 4F2SA 4AF1A 1NM1A 4DU1A 4BC4A 4BR0A 3FZMA 4QS9A 5C15A 3CD6N 5AFUH 3V9XA 4B9QA 3IAYA 1C1CA 3VQCA 3OYHA 3SJJA 3P39A 5BRFA 3AO1A 4ILJA 3UE5A 4HWIA 3ZSZA 3KKRA 3AA2A 1QQOA 1HYSA 3ZX2A 4CZLA 2YCHA 3O9RA 2KHOA 3E9PA 1B9DA 1JCFA 2P9LB 2Z1GA 4N76A 4F3OA 4YOVA 5TKYA 4LF8K 5GIOA 3TPQA 1LAWA 1WSFA 4E7HA 2EWSA 3ID6A 3OYFA 2Z1JA 3OA9A 1BA0A 4Q0BA 4CJVA 4CEDA 1IG8A 4IFVA 1QVGM 1RT2A 2W6KA 1BU6O 2I7NA 3SAFA 3KKSA 3NF6A 3KLGA 1QTMA 1N33K 5BREA 4KBOA 4RW4A 4JK8A 4KRFA 1JCEA 1VSEA 4JRPA 2YNHA 4DSLA 4JS5A 3CFRA 1RBUA 3ITHA 3WXKA 2W00A 3LDPA 2ZF5O 4AM6A 3CFPA 5BRHA 2GWJA 4DR3K 1VSMA 1X1PA 1F21A 4Z0UA 4CJPA 3SJHA 1ASWA 1SZ2A 1N6QA 3CCVN 1ATRA 4DQPA 1SKWA 2FXUA 3ZCMA 3RR7A 4O8KA 1JCGA 3VQPA 1KC8O 3VOVA 2A42A 3BDPA 1O13A 2P1JA 3V1QA 4CECA 1ZBHA 4IDKA 3MXIA 3ZLJA 4BE0A 1XHXA 3VERA 1D4XA 2P9IA 3AGRA 3ZETA 4CERA 3CCJN 3TI0A 3AVAA 1CLQA 2ASOA 3THYB 1VQLN 2HNDA 2NRHA 3QINA 4IWVA 3WXJA 3CETA 1RTHA 3HVTA 3G10A 1C6VA 1HPZA 5ADXH 5AQGA 4L8RB 4CJ3A 4OKKA 2Y1JA 4K0KK 1QHAA 4YOWA 5HROA 1NMNA 4KHWA 1CZ9A 4A62A 3AA4A 3SUPA 3ZEUA 2JWKA 3HPGA 2OANA 2NRXA 4DSJA 1EKEA 3UKUB 4AM7A 4CEAA 3CCRN 4IOXA 3KLEA 4ILGB 4CHPA 4C8OA 3H3NO 1GLBG 1IH7A 2D1KA 3B6PA 3WQTA 2KW4A 1EQYA 2FLOA 1XC9A 1Z25A 1GLAG 4ISFA 4FLWA 3RTVA 4H8KA 4Y1DA 3F2KA 2HF3A 1HNWK 1EWRA 5JLHA 3AVKA 2A1SA 3TTDA 4FLZA 2F9TA 4DFJA 3ZT0A 1RT3A 3A2FA 1JJ2M 3QEIA 4UY8O 1JKHA 1XNQK 4DR4K 3S9HA 4Z4HA 3OYGA 3PIOL 3A5LC 1ATNA 3RMAA 4FJ8A 4FWKA 4HUFA 1EETA 4BRGA 2HSTA 2HHUA 5AZIA 2YI1A 4JI1K 1YJ9N 4OGEA 4LY7A 3THXA 2ITGA 3B8AX 1Y97A 4MQ3A 1E3MA 3OYNA 3QMLA 3M5RA 4B8CA 4DR1K 3V1RA 4EZ9A 1CXQA 3AVCA 5AR0A 3CIPA 1M1KO 5HP1A 4FZZA 4OPAA 1S72N 1G99A 1NK4A 3KLIA 4DR2K 3MX2A 3DLHA 1XQSC 3SAHA 3FZHA 4WFNL 4BR5A 1EO1A 4DLGA 4KH5A 1W9HA 3MECA 4A2BA 4BREA 1JLQA 4FLXA 3L4IA 1KFDA 3HOSA 4FL9A 2KKZA 1SL0A 2QWLA 3NGZA 1NK7A 3LWLA 3IUCA 4R79A 3O9UA 4NLBA 1ZXOA 1YIJN 4K8XA 4KKOA 4CE9A 2YV0X 4BRLA 4BRHA 1NK0A 1U4BA 1SS6A 4PKIA 2ZJRL 4JRQA 4BE7B 3WNHA 4MLEA 1BDGA 3LPTA 4NXNK 4G1QA 2AJQA 1WSGA 3VA3A 1IKVA 4N47A 4KPYA 3IG1A 4NYFA 4WQ5A 4EZ6A 4MFBA 3P5JA 3EY1A 3C0BA 4I9LA 1MWMA 4B3TK 1D9FA 1QSLA 5ELZA 4M45A 4JNEA 3G6EN 4BECA 2ZGYA 1YF5L 4FLTA 4N41A 4Z4FA 3NBPA 3TABA 1TV6A 5AQTA 3TWHA 4BWMA 2P9IB 4A61A 3JS6A 4EIAA 2FSNA 4K41A 5M1OA 1U45A 3HYFA 1QVFM 3ATUA 1C0MA 4K25A 3QFPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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