4Z94A

Actin complex with a chimera of tropomodulin-1 and leiomodin-1 actin-binding site 2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/structural protein
total genus 110
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4z94A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4z94A04
3O1BA 2P9LA 3TPQA 1BO5O 2A40A 4XEIA 5ADXA 4I6MB 2E2QA 3FZKA 4FSVA 5F2RA 1OKJA 4FWMA 4KBOA 4FWNA 1T44A 3FE1A 2W41A 3VETA 4K25A 1RFQA 2E2PA 3DAWA 4FOEA 3ULEA 4IJAA 3R9PA 3UKUB 5BR9A 5FPNA 4ISGA 2A6AA 2VWBA 3VEWA 2Q0RA 4XH1A 4BQLA 3FZFA 4CZIA 4CZLA 3CI5A 3A5MC 3WXJA 4EHTA 1J6ZA 4CBXA 2VYPA 1KAZA 3DWLA 3H45C 3VEXA 3UKRB 3BF3A 1C0FA 4BR0A 2D0OA 3IMXA 4FWPA 4H0VB 3MK6A 1Z05A 4BR4A 4PL7A 4H0YB 5ADXH 2GWKA 2WUSA 2E2NA 3MN6A 1X3MA 3WXLA 3CQXA 3H46O 4BVOA 3D2EB 1QHAA 3HI0A 3B8AX 4FWOA 3UB5A 5AQZA 3W3DA 2Q97A 3CJ7A 4H0XB 4ISFA 4H5RA 1HX1A 3QBWA 4MO4A 2CGLA 4A61A 5AQOA 2IVNA 5AZJB 4BC2A 1NM1A 4MO5A 5AQKA 3QMLA 1NGEA 3SJHA 5EVZA 5AQLA 5E84A 3C0BA 3VEOA 3EO3A 5EY4A 3I33A 4NB4A 4H5WA 1Q18A 1V4TA 4JHDA 3FZHA 1QQOA 3BP8A 3U8XA 1DKGD 1NGBA 3O80A 5EOYA 3ZEUA 1QZ5A 4CZMA 1U6ZA 2A5XA 1NGGA 3VF4A 1MA9B 5F0XA 1IG8A 3R8EA 4XH4A 3CJCA 1GLEG 3CHWA 4Y0WA 3H3NO 1TYQB 3EL2A 1HUXA 3JS6A 1QZ6A 2E88A 3M3ZA 2J4RA 4AM7A 5JLFA 2HOEA 1JCEA 1NGAA 2ZF5O 4WQ5A 3IUCA 3VGMA 1HKGA 3LDOA 3VENA 4H5TA 3FLCO 4BRFA 5FPDA 4K43A 2CGKA 1ATNA 1T6CA 2P9NB 3G25A 4YDUC 3VPZA 3UE5A 1GLDG 4F9OA 4IXCA 5BPLA 3DXKA 2BUPA 5AQTA 1E4GT 2CH5A 5KQ8A 3WXIA 2P9SA 3EKUA 3QFUA 1K8KA 3CERA 4BREA 5AQMA 5FPMA 4CZFA 1YUWA 2FSJA 2FXUA 2V7YA 4FL9A 5AQSA 4EAHD 1U2VA 4J8FA 3W0LA 3D2FB 3LDNA 4L3QA 5AQFA 4BC4A 1GLCG 1P8ZA 1TUYA 2QWOA 3J8AA 3M6GA 1C0GA 1GLJO 4B1YB 4B1XB 2AP1A 5AQWA 3EKSA 3VF2A 3ENHA 4EHUA 3MCPA 1NGDA 1BUPA 2P9IB 3MN9A 2P9UB 1BDGA 2GEMA 1NGFA 1NGIA 4M7YA 4BRDA 4FWSA 2P9KA 3O08A 4C23A 3BEXA 4FWKA 4LC9B 2FSNA 2I7NA 3A5NC 3L6QA 3RSEA 3QDKA 3SK3A 4BR7A 2CH6A 3QFPA 5AQHA 2W40A 1MDUB 3TU5A 2ZGYA 2A41A 1ZXOA 4JN4A 2VCPA 2IVOA 2D4WA 5TKYA 3DXMB 2D1KA 2QWPA 3VF6A 4BRKA 1ZC6A 2P9PA 5AFUA 5BN9A 2H3GX 4FPBA 1QQNA 1Y64A 3WEEA 4A2BA 3R6MA 3OHRA 3C7NA 4BRMA 1LCUA 2ZGZA 2ZWHA 1NLVA 5AQJA 3VGLA 4BRCA 3ZETA 4BRAA 4DCHA 2IIRA 5BRDA 4CZJA 5JLHA 2HF4A 4BRHA 5JMVA 2A3ZA 4RTFD 3ZX2A 5LY3A 4E1JA 3WQUA 2A42A 3KHYA 3O1WA 4DQ8A 4JAXA 1YVNA 1BA1A 4K41A 4BC3A 5KPRA 4I6MA 3CJ1A 3WXKA 3U4LA 5AQIA 5FPEA 4DHYA 2BTFA 5AFUH 3ZX0A 4DB3A 5AQQA 1NGHA 1G99A 3DJCA 4JNEA 4PKIA 3UKUA 2I7PA 1YXQA 3U9ZA 2FF3B 4JD2B 3A0IX 4GNIA 3ATUA 2EWSA 4FO0A 4XH5A 3GE1A 4BRPA 3VESA 5AQXA 3AAQA 3CJAA 3VERA 3LM2A 4WQ4A 3FFKB 3QBXA 1EQYA 3UKRA 2QWQA 2FF6A 5AZIB 3WUHA 1XUPO 3H1VX 4HWIA 2V52B 3M1FA 3VEYA 3U9DA 1NWKA 1NMDA 5KPZA 2F9WA 2P9LB 1ATSA 3HZ6A 1S3XA 5AQPA 3D2EA 2Q1NA 3MMVA 5EX5A 2QWNA 2GELA 2Q2RA 4EIAA 3CJBA 1H1VA 3MN7A 4FOIA 3JXUA 1QQMA 3H3OB 1GLBG 5AQNA 2GWJA 1GLLO 5AZJA 3A8YA 3CJ9A 3ULEB 4Z94A 1HLUA 2YHYA 3FZMA 2QWMA 4H5NA 4IWVA 5BN8A 3CETA 2YJFA 3VGKA 4A2AA 3D7EO 4NO7A 1BWFO 2FLOA 2E1ZA 3HM8A 3GG4A 4BQZA 3KVGA 4CD3A 1E4FT 2Q0UA 3LM9A 5AR0A 5AQUA 4IO8A 3SMSA 3HSCA 4YDUA 4H5VA 4BRGA 2ASOA 4BROA 1XC3A 4BRIA 3MN5A 1NGJA 2PBDA 1TYQA 2YHWA 4H03B 4O5FA 1HPMA 2V51B 4H0TB 3IFRA 3LL3A 4BRQA 1BG3A 1D4XA 4CD1A 2Q36A 3VOVA 5EXWA 4B9QA 1Z6RA 5BRHA 1SQKA 1ESVA 1BU6O 3GOIA 4B1ZA 4IZ9A 1TUUA 2P9NA 4QS8A 5AQGA 1V4SA 1YAGA 2NLXA 5LJVA 3L0QA 3FZLA 2FSKA 1KAXA 2E2OA 3LDQA 1WOQA 1CZAN 3FGUA 4O8KA 4BR9A 1GLFO 3GDQA 3H6EA 2NRHA 2NZTA 5LJWA 4JHDB 5BRFA 5ELZA 3GBTA 4BG8A 1NBWA 3QICA 3CQYA 3LDPA 3EN9A 3AAPA 4ISEA 3ZEUB 5B8HA 5BPNA 4QS7A 3O4WA 2E8AA 4FWRA 1JCGA 4CBWA 3VEVA 3D2FA 4EFHA 3O6WA 3HTVA 4FWQA 4RWTA 1BA0A 4B1VA 1HKBA 3VEZA 4M63C 1KXPA 1DEJA 2GTDA 4BGAA 3WQTA 4CZEA 4FWLA 2P9IA 2P9UA 2ASPA 4AM6A 3LDLA 3L4IA 3P4IA 4GY2B 3F9MA 1ATRA 4IJNA 1KAYA 2Q31A 4BRLA 4B1WB 4WQ4C 3IDHA 1S22A 2F9TA 3FR0A 4MLHA 3DXKB 3SLCA 2P9SB 1GLAG 1K8KB 4K42A 4CZGA 1HKCA 3DXMA 1NGCA 4M7XA 1WUAA 4MLEA 4H0PA 4BR2A 3S41A 3CIPA 2E1YA 1T6DA 4WQ5C 2KHOA 4H0OA 3H1QA 4CZKA 4CZHA 4B1UB 5KQDA 3O5BA 1MWMA 2HF3A 2IVPA 1BOTO 5BPMA 3ZX3A 1LOTB 1U2VB 3GL1A 4QS9A 1X9JA 3I8BA 4CJ7A 3AARA 1HJOA 5I9EB 4WYBA 3AY9A 2QM1A 1X3NA 2GUPA 3ID8A 2QWRA 4A62A 2AA4A 2E20A 4BRNA 5AQYA 5AQRA 4PKGA 3EZWA 5KPTA 2ASMA 2QWLA 2D0PA 5AQVA 4BVPA 2YJEA 5JICA 2CGJA 4BC5A 4FPAA 2OANA 2P9KB 3QB0A 3MDQA 1ZBSA 3RSEB 4BG9A 4RCHA 2YCHA 4CI6A 1IJJA 2UYTA 4BR5A 3ATVA 2YI1A 1RDWX 5CE3A 3SMPA 3WT0A 3ENOA 4PL8A 4JD2A 5F1XA 2PAVA 2HMPA 2P9PB 2DPNA 1MWKA 2QW9A 3A5LC 1DGKN 4PKHA 3BUZB 1JCFA 2ITMA 3WEEB 4CBUA 3KZBA 4BGBA 5E26A 3C7NB 3BF1A 2QXLA 2YHXA 5AZIA 1RGIA 3O8MA 4HTLA 3A5OC 3ZETB 5BREA 1SAZA 2V7ZA 1SZ2A 1XQSC 3HBTA 1R59O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSHA 3F5TA 4C1NK 3L2VA 3WNHA 3TR8A 3TI0A 1S9EA 2E2QA 1WN7A 1OKJA 1S1VA 4DF8A 2W41A 2KFNA 4GV3A 4LFCK 3BZKA 5BR9A 3R9PA 3ITHA 3ZYYX 3BDPA 4JV5K 2IC3A 4ISGA 3T7ZA 3OYIA 2VWBA 4LF4K 4BQLA 4EHTA 4I9LA 1J6ZA 4JKDA 3SBGA 3VEXA 1KAZA 3DWLA 2RHKA 3O4QA 3UKRB 3BF3A 3V9ZA 1C0FA 4Z4HA 4BR0A 3M8RA 1FXXA 3HPGA 4GW6A 4H0VB 2R7YA 4Y1DA 1UA1A 3O9QA 4JI6K 5HP1A 1YF5L 3DLKA 5FRMA 2E2NA 1A5VA 1X3MA 2E6MA 3CQXA 3H46O 1LV5A 1D8YA 1BI4A 3VQ9A 1QHAA 4C1NI 1S1UA 2XO7A 3SPYA 1NOZA 3QESA 4B3TK 4FWOA 4J2DA 3W3DA 2VG7A 1NJZA 5HLFA 4H0XB 4ISFA 4ELVA 3QBWA 4EZ9A 5AQOA 4GKKK 4O0JA 1NG9A 2HHUA 2KQ2A 5AQKA 2ATQA 1LWCA 3NF9A 3AVJA 4I7FA 1J9AA 5CZ1A 1KCFA 3I33A 4NB4A 4IEEA 1Q18A 1P90A 1V4TA 3ZSOA 3U8XA 3BP8A 3LALA 1QQCA 5EOYA 1U48A 1QZ5A 2QKBA 1NGGA 5DMRA 1MA9B 1YHQN 1U04A 4DQRA 2UXDK 1IBLK 4OO1J 3J7YP 3CHWA 3OYJA 3H3NO 2EHGA 3OJSA 1REVA 2OTLN 4CK2A 5AJ3K 1T8EA 1M90O 1EKEA 5MLCQ 2HOEA 3OYEA 1JCEA 1YT3A 4C8OA 3IUCA 3KWIA 3VGMA 2JWLA 3M8SA 1TVRA 4Z0UA 4W5OA 3AVGA 3KK2A 5C42A 1ATNA 3G25A 2OYQA 4OPJA 3UE5A 1JLBA 1E4GT 5KQ8A 3WXIA 2P9SA 1XHXA 4NCAA 3D45A 1LAWA 3CD6N 1HYSA 1YUWA 4DLEA 2FSJA 2V7YA 3CXCM 1ZBFA 1U2VA 4HVJA 5AQFA 2YKMA 4FJ8A 1WSGA 3SJJA 1VQON 2HNDA 4CJFA 3M6GA 1BQMA 5A2QO 3HL8A 4B1XB 3VF2A 1VK0A 3MCPA 1OVQA 1BDGA 4AH9A 4DS4A 1NGIA 4M7YA 1I94K 4FWKA 3RSEA 4LC9B 4DSLA 1MU2A 4JN4A 3S9HA 2G8IA 2P5OA 2RPIA 2VCPA 4JLHA 1EETA 5TKYA 2D1KA 3ALYA 1I39A 3VF6A 3Q7CA 5AFUA 5BN9A 2H3GX 1Y64A 1VQ4N 3OHRA 1K6YA 2YV0X 4H4OA 4BE1A 3ISNC 4DR4K 5CYMA 4O44A 3ZETA 4DCHA 2IIRA 1T7PA 5JLHA 2HF4A 1BL3A 3ZX2A 5LY3A 1FJGK 5TKWA 3NGIA 4B9SA 3OA9A 2JGUA 3KHYA 1KC8O 3O1WA 2P51A 4BC3A 5KPRA 1S1TA 4AHRA 4WFNL 1GOBA 5FRNA 5FPEA 3KKRA 2G8VA 5AFUH 2QK9A 3S3MA 5HOOA 4JK8A 3UKUA 4PKIA 1G15A 1YXQA 4ICLA 1QVGM 3OY9A 2KKZA 1RT5A 4DQIA 2EWSA 4FO0A 4KPYA 2O4GA 1VSDA 3K57A 4KTZA 4WE1A 3FFKB 3OYBA 1DTQA 3AVBA 3QBXA 4FJ9A 1EQYA 3L2UA 2FF6A 1KQSM 4M42A 1VSEA 3RMBA 1SL1A 2V52B 3M1FA 1BIZA 1QE1A 3HVTA 5JVGL 4IBNA 1BCMA 2X6SA 1ZYQA 3D2EA 2Q1NA 3FFIA 2HBLA 4B9NA 3HOSA 2Q2RA 4U7BA 1H1VA 3MN7A 3TANA 3H3OB 5FLXO 4JI0K 5M1FA 4CJQA 5AQNA 4PHTX 3S3NA 2B6AA 4I9QA 3A8YA 3CJ9A 5C2DA 4H5NA 3AGRA 4IWVA 2G8FA 3RR8A 3CETA 3VGKA 5JS1A 5FROA 3D7EO 3QNOA 1BWFO 3THVA 2JLEA 4CJKA 5IWAK 4BQZA 1ZBHA 3KVGA 4CD3A 2Q0UA 3CMEN 5J2PA 2G8KA 1S1XA 4LD0A 1WSFA 3E9OA 2G8UA 2ZM6K 4ID1A 3SQ4A 1XC3A 3MN5A 2W42A 4ILJA 1TK5A 1TYQA 5HRNA 1KVBA 1BI4B 1YJNN 1ILYA 1HPMA 2V51B 1J53A 1BG3A 4B9QA 4E7JA 5BRHA 1SQKA 1FK9A 4JKCA 1OH5A 1VSLA 3O3HA 3MXJA 4QS8A 5AQGA 3VMFB 1N5YA 3I56N 1UOCA 1B9FA 2AJQA 4IFVA 3TAPA 2HW3A 5CR4A 4OLBA 1QSLA 3VQ6A 3GBTA 4BG8A 1NK8A 1KFSA 3AA4A 3AAPA 4CEZA 4E89A 3CFOA 4FWRA 2WBNA 3VEVA 3WNFA 4KO0A 5KI6A 5C15A 3V6DA 3O6WA 3KK7A 4RWTA 4O4GA 1LW0A 4B1VA 3AVKA 5K14A 4E7LA 2GTDA 4BGAA 3QETA 1B92A 1ASWA 4DTNA 2A1RA 1VSFA 4FJHA 2P9UA 4CGIA 3ZT0A 3P4IA 4DTRA 1ATRA 3P5JA 4IJNA 2Q31A 4BRLA 1U4BA 4DSEA 3IDHA 3C6HA 3EE9A 2VQEK 2P9SB 4CZGA 5CHIA 4BR2A 1ASVA 4CZKA 2QTDA 2G8WA 1RBVA 1MWMA 2IVPA 2ITGA 2F8TA 1LOTB 1WB9A 1U2VB 3GL1A 3MECA 3MEDA 4QS9A 4CHPA 1HJOA 3DLRA 5I9EB 3K5NA 1SKSA 4K8ZA 3PLAA 2UXBK 1HMVA 3ID8A 4WCEL 5HRPA 4CEOA 4BRNA 2NRZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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