4Z94A

Actin complex with a chimera of tropomodulin-1 and leiomodin-1 actin-binding site 2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/structural protein
total genus 110
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4z94A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4z94A04
2AP1A 4H5TA 2E88A 2A6AA 2HMPA 3A5OC 1SZ2A 3GL1A 5LY3A 2IVNA 4EFHA 3DAWA 4BRHA 3VOVA 4PKHA 5BRHA 4RCHA 2A5XA 1BG3A 2P9PA 5LJWA 2ZF5O 5AQZA 3VEWA 5F2RA 3LM2A 1Y64A 3D2FA 3SMSA 3CQYA 2F9TA 2VCPA 5AZIA 4FWQA 1E4GT 1GLJO 4LC9B 3ENHA 5AQVA 4YDUA 3ZETA 5ELZA 1T6DA 3FZFA 3WT0A 3UKRB 1QQOA 5AQTA 1YAGA 1HLUA 4XEIA 1WUAA 5BPLA 3CQXA 5AQHA 5KPRA 2GWJA 3AARA 2P9SA 4BG8A 2P9LB 5FPMA 1WOQA 2IVPA 4IO8A 4WYBA 1HKGA 5AQPA 3ENOA 2V51B 3HM8A 4BRLA 1MA9B 2Q0UA 3O1WA 4CBXA 1C0GA 5F0XA 3LL3A 4BR9A 5AQIA 4J8FA 3C7NB 2GWKA 2A3ZA 2HF4A 2E20A 5AQOA 4BRFA 2QWOA 1BUPA 2NZTA 2YJEA 2FF3B 3CJCA 3UE5A 3CJ7A 1BO5O 1SQKA 1BA0A 4ISFA 4BQLA 2P9UB 1BDGA 4Y0WA 1NMDA 2FLOA 3KVGA 3VGLA 3LDQA 2E8AA 1NGFA 2A41A 4H03B 1NGAA 4EHUA 1E4FT 5KPTA 4H5RA 3UKRA 3M6GA 5AQNA 2ASPA 5BN9A 3O1BA 3W3DA 5ADXA 3VETA 3VGMA 1HKBA 1YXQA 4FWSA 3QFPA 3CIPA 2P9LA 5AFUH 2CGLA 4MLHA 2PBDA 3L6QA 1ATRA 3VF6A 4B1ZA 4BRDA 3QBXA 4BR5A 5BRFA 4FL9A 3SMPA 2H3GX 1HJOA 2KHOA 2A42A 2NLXA 2QWQA 3GDQA 5F1XA 2CGKA 1QHAA 1XC3A 3C7NA 3U9ZA 1ZBSA 2E1YA 5TKYA 1NGJA 5E26A 2W40A 4H0TB 1HX1A 3HTVA 4BVPA 2P9PB 1SAZA 5JICA 1ZXOA 3ZX2A 1HKCA 1GLDG 2P9UA 3FR0A 4FPAA 4L3QA 4MLEA 5AQGA 5AQKA 4CZEA 5BPNA 1NGGA 3MDQA 1BWFO 1ZC6A 3VGKA 1HPMA 3UKUB 1DKGD 4M7YA 1BU6O 3FZKA 3A5NC 4CZKA 4FOEA 4HTLA 3L4IA 2QWRA 1JCGA 5FPDA 3WEEB 2D1KA 2W41A 4B9QA 2EWSA 2Q0RA 3EKUA 4JAXA 3VF4A 5CE3A 3O4WA 2P9IB 2ASMA 3MMVA 4BR0A 3L0QA 3CHWA 3FE1A 4GY2B 3WXKA 2FF6A 2GEMA 2E2QA 2A40A 3A0IX 3QBWA 1BOTO 2J4RA 4K43A 1KAZA 3FFKB 1NGHA 4BRAA 4BRQA 4BREA 4BROA 4CZJA 4PL7A 3WUHA 2P9NB 3M3ZA 4CD3A 2Q2RA 3HI0A 1QQMA 1Q18A 4NO7A 4AM7A 3VPZA 1MWKA 3FGUA 4FWKA 3VENA 3OHRA 3UKUA 3DXMB 4CZFA 4GNIA 4BR7A 2V7ZA 1NGCA 2YI1A 3VEXA 1ATSA 5BN8A 4RWTA 1KAXA 5FPEA 1GLCG 3WEEA 3CJ9A 2QXLA 2FSNA 4EAHD 3HSCA 2YHYA 4HWIA 4QS8A 3MN5A 3QICA 3ULEB 5AQSA 2P9KB 2P9IA 4CBUA 4A2BA 3A5LC 3H45C 5BR9A 1U2VB 3CERA 3EKSA 3LDNA 4BC2A 4PL8A 3A5MC 2CH6A 2E2NA 5AQJA 4F9OA 2OANA 4WQ5C 3ZX0A 1X3MA 4I6MB 3BEXA 1TYQB 5BPMA 4QS7A 1MWMA 3QFUA 1OKJA 4XH1A 5AQUA 4FOIA 3J8AA 2P9NA 1NGEA 4EHTA 3HBTA 3SK3A 3H3NO 1GLAG 3QB0A 3A8YA 3CJ1A 4BRGA 1Z05A 1T44A 3DXMA 4ISEA 1C0FA 4K25A 3MN6A 1T6CA 2HF3A 3U4LA 3F9MA 3AAQA 3DXKB 4IXCA 4C23A 5AQRA 1S3XA 2NRHA 1NLVA 1GLLO 3FLCO 1J6ZA 3ZX3A 2GUPA 3ULEA 3VEZA 2FSKA 2P9KA 1JCFA 2UYTA 1U2VA 4XH4A 3W0LA 4CI6A 3IDHA 3ZEUB 3O8MA 3BF3A 3WXLA 3IUCA 4I6MA 5AR0A 5I9EB 1TYQA 1BA1A 5LJVA 4BRKA 3BUZB 3D7EO 3DJCA 3LDLA 4H0XB 3D2EB 4WQ4C 1LOTB 3LM9A 4B1WB 1XQSC 3EL2A 1RFQA 5AZJB 3TU5A 3GG4A 1G99A 2F9WA 3GBTA 5AQXA 2CH5A 4DCHA 1NGIA 3O5BA 4BRIA 2Q36A 3BF1A 3QMLA 4BC4A 5AQQA 4M63C 3CJAA 3R6MA 4BR4A 4IJNA 5JLFA 4A62A 1GLBG 4H0VB 3FZMA 5EOYA 3DXKA 5AQLA 2YHWA 4FWNA 3U8XA 2D4WA 1QQNA 2WUSA 3GE1A 2QW9A 4M7XA 1ESVA 2I7PA 2E1ZA 1KXPA 3LDPA 3GOIA 4RTFD 4CD1A 5JLHA 3MN7A 4KBOA 4BC5A 3ATVA 2I7NA 4FPBA 3ZEUA 1DEJA 1X9JA 4QS9A 1GLEG 2YCHA 3B8AX 3D2EA 2YHXA 2V52B 3JXUA 3H6EA 3DWLA 1IJJA 4JD2B 4JNEA 2E2OA 5EXWA 5AZJA 4WQ5A 1D4XA 3EO3A 1NGDA 2BTFA 1R59O 1U6ZA 1GLFO 5AQFA 4K42A 5BREA 1LCUA 3KZBA 3VF2A 3C0BA 5EX5A 1TUUA 1QZ5A 1MDUB 3O6WA 1TUYA 3MCPA 1HUXA 2QWNA 4NB4A 5EVZA 4BRPA 4CZMA 4DHYA 2ZWHA 3U9DA 4H0YB 2PAVA 5KQDA 3O80A 5B8HA 4E1JA 1H1VA 3SJHA 1V4SA 5E84A 3UB5A 2ASOA 2ZGZA 2QM1A 1X3NA 3RSEB 4FWLA 4K41A 3WQTA 4BG9A 4EIAA 2DPNA 5JMVA 3ID8A 5ADXH 3CJBA 1K8KA 1XUPO 2GELA 4BRNA 3G25A 2D0OA 4BVOA 2AA4A 4IZ9A 1NWKA 1P8ZA 1QZ6A 3H46O 3O08A 2BUPA 3IFRA 2FSJA 2VYPA 3HZ6A 5AQMA 4CJ7A 5BRDA 4YDUC 4JD2A 4BGAA 2QWMA 4Z94A 2ITMA 3R9PA 3H1VX 5AQYA 4H0OA 1DGKN 4WQ4A 3SLCA 1NGBA 5FPNA 1Z6RA 1RGIA 4FSVA 1RDWX 3MN9A 1CZAN 4H0PA 5AQWA 2CGJA 2E2PA 2VWBA 3VEVA 1V4TA 2Q97A 3MK6A 3JS6A 2FXUA 4MO4A 2V7YA 4BR2A 4H5VA 3RSEA 3WXIA 3VEYA 3VESA 4FWMA 2IVOA 3I8BA 3H3OB 2IIRA 4XH5A 3P4IA 1NBWA 3M1FA 3IMXA 4JHDB 4BQZA 2YJFA 3KHYA 1YUWA 2Q1NA 2GTDA 4BGBA 5AFUA 3CI5A 3EN9A 4H5WA 3WXJA 3R8EA 1S22A 4O8KA 4BC3A 4B1YB 4BRCA 3EZWA 4MO5A 2D0PA 3LDOA 4FO0A 5KPZA 3FZLA 4CZLA 4B1VA 1NM1A 4B1XB 4IJAA 3D2FB 4DB3A 3VEOA 3H1QA 3QDKA 5AZIB 1EQYA 3CETA 3FZHA 2Q31A 2ZGYA 3AAPA 4IWVA 4H5NA 3ZETB 4DQ8A 4FWOA 3S41A 3I33A 4B1UB 4CZGA 2HOEA 5EY4A 2QWLA 4A2AA 4CBWA 5KQ8A 4ISGA 4A61A 3WQUA 2P9SB 4FWRA 4PKIA 1KAYA 3BP8A 1ATNA 2QWPA 4O5FA 3ATUA 4FWPA 3VERA 4PKGA 1JCEA 4BRMA 1K8KB 1YVNA 1IG8A 3AY9A 3TPQA 4JN4A 4CZHA 4CZIA 4JHDA 4AM6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CIGA 2AP1A 1K73O 2E88A 3I0RA 4O5BA 4DV1K 1SZ2A 4DTXA 4GV3A 3GL1A 4E7KA 4FCYA 4EFHA 4Z4FA 4B3TK 4JKGA 4BRHA 4PKHA 4NYNA 5D3GA 3S5TA 3QESA 1XNQK 1X9MA 2P9PA 5LJWA 4JS4A 1TK0A 3T69A 3LM2A 1Y64A 3HM9A 2OPSA 3D2FA 4N56A 3SMSA 3LZIA 4LH4A 3V1OA 1ZYQA 5HLFA 4LC9B 4DFPA 3ENHA 4GVEA 1QQOA 3T1AA 4K8XA 3U3GA 3CQXA 2NRZA 4LF4K 3DM2A 5KPRA 4DWIA 2GWJA 1NK0A 4IOXA 4PQUA 2P9LB 1WOQA 3ZT0A 1RTHA 2F96A 1HKGA 2KFNA 3ENOA 1D8YA 3K5OA 4JEPA 5LMUK 2D0BA 4CBXA 4IFVA 3TAEA 4BR9A 3O9RA 2A3ZA 2HF4A 2E20A 1QHTA 4O55A 4HCBA 1BUPA 3RMCA 4JYAK 2YJEA 3B6PA 2HSTA 4KB1A 2KW4A 1L3UA 4B3SK 3CJCA 1NOZA 1SQKA 4ISFA 2P1JA 2P9UB 3N4PA 3ZSZA 1VQ5N 4Y0WA 1EKEA 3KVGA 3VGLA 4KFBA 3QETA 2OA8A 3PLAA 2A41A 4BE2A 4M3ZA 4F8RA 5KPTA 1HJRA 2G8VA 2ASPA 5ADXA 1B9FA 1YXQA 4ID5A 4DQPA 3ZSWA 3OYFA 1U49A 3CIPA 1Q81O 3ZSOA 5JS2A 3L6QA 1ATRA 4Y1CA 4BRDA 4BR5A 1LAWA 4JKFA 3OY9A 2H3GX 4DQIA 1HJOA 1HRHA 4BEBA 2A42A 1A5VA 3VTIA 1HNWK 1U04A 2HHQA 2CGKA 1QHAA 2RHKA 4E1MA 3VA3A 2IC3A 1JLCA 2OPQA 1EO1A 5E26A 2W40A 1HNXK 4N76A 2HVIA 1T8EA 1HX1A 4BVPA 3RMBA 1SAZA 1ZXOA 3ZX2A 1Q86O 2F7TA 5HRSA 3V9WA 2WTUA 4XIUA 1BWFO 3TSPA 1NK9A 1K6YA 3NF9A 3VGKA 4NLBA 3UKUB 4HTUA 2HHIA 4CFAA 3A5NC 4CZKA 4X62K 5JENA 1TKXA 4FOEA 2QI2A 3RRGA 3V9XA 2QWRA 3PIPL 1FKOA 2E4LA 4FZYA 2EWSA 3EKUA 1W97L 4FJ8A 2P51A 1DTTA 3AA4A 4ILGB 5CE3A 2O8DA 1VSMA 5GIOA 4F3TA 3L0QA 2FBYA 1EETA 3CHWA 4OGCA 2E2QA 3VQ6A 3CFOA 3CXCM 3AO5A 4I2QA 2AJQA 3SUOA 5C42A 1NGHA 4DTJA 3SQ2A 4BROA 3UIQA 4DV7K 3OS1A 1TGOA 1L3TA 4CEDA 3VQPA 3KTQA 4B9SA 4EP4A 3J80O 1YVUA 2P5OA 4FJ9A 3MEDA 1MWKA 3FGUA 4FWKA 2W00A 2E6MA 3DXMB 3O3FA 2V7ZA 3ZSRA 3OYJA 1XC9A 4RWTA 3WEEA 4EAHD 2YHYA 4QS8A 2XO7A 3L2RA 4KH5A 3K2PA 3LPTA 1XHZA 4CBUA 5GINA 2OYQA 1IH7A 3LDNA 2ETJA 4BC2A 1S5JA 2CH6A 3K57A 3QEXA 4F9OA 1VSFA 4I6MB 3T1HK 3BEXA 2P5GA 4AQYK 4FM2A 5BPMA 1WSJA 4QS7A 5CZ1A 1OKJA 3C6AA 3MEGA 4DR7K 3J8AA 2P9NA 1YTAA 3CYMA 4ZTFA 4BACA 3H3NO 3A8YA 1RTDA 1C0FA 2RN2A 3VQ4A 3MN6A 1RBVA 4Z4CA 3U4LA 4ICLA 3NH0A 3AAQA 2YHBA 4DSJA 1M90O 4C8OA 1NLVA 2HVHA 4CF0A 3HK2A 3RMAA 3ZX3A 3ULEA 2QKBA 1B9DA 1JCFA 4YOVA 3W0LA 4LF5K 5GIPA 4JRPA 4B3RK 3NMUA 5A2QO 3V9UA 3AGKA 5HROA 3KK3A 1X9WA 1BA1A 2OZMA 4WQ4C 4JI6K 3LP1A 3OYEA 3NVKA 3IS9A 4LF9K 3EL2A 3ID6A 2OTLN 3TU5A 3GG4A 3LP3A 1EX4A 2CH5A 4CGDA 4DCHA 1NGIA 2Q36A 3BF1A 2HBMA 4WE1A 5CR4A 1KRPA 1TVRA 4DFKA 5AQQA 1J53A 2KZZA 3CJAA 4DSKA 4E7LA 3G71N 5JLFA 1JKHA 1GLBG 5EOYA 1BIUA 2D4WA 3ASMA 4FVMA 2WUSA 1RDDA 3QINA 4OLBA 2QW9A 1BHLA 3SPYA 3OBYA 3PX0A 2I7PA 1KXPA 4YOUA 4CD1A 3KLHA 4KBOA 1RT6A 1QTMA 1S1UA 2I7NA 4IFYA 2G8FA 3JSMA 4LY7A 3BZKA 1N32K 1NJIO 4QS9A 4B3OA 1NK4A 4W5RA 1TL1A 3P31A 3D2EA 1IKWA 4FW1A 5EXWA 3OYKA 3DYAA 1U45A 4AHUA 4DMNA 1R59O 5BREA 1E3MA 3AVFA 1Q9YA 4CEAA 1TUUA 1ASUA 1YJ9N 1TUYA 1HUXA 4CZMA 4BRPA 3IG1A 5JVHL 4M3UA 3CCLN 4H0YB 4KTQA 3O80A 4LFCK 2HHXA 3SJHA 2X6SA 2ASOA 2G8WA 4Q5VA 3CCVN 2KZMA 3F73A 4CEBA 2GUIA 3AA3A 4JK8A 4JI4K 1JLAA 3LANA 1K8KA 1NNEA 2IOCA 2DFEA 3H46O 1HNVA 4CJ7A 5KGXA 2W6LA 2WC9A 4DFMA 4JD2A 4BDYA 2IS3A 3VQBA 4BGAA 4AF1A 1NU0A 3VQCA 3LWMA 2UUCK 3NAEA 3SYZA 4WQ4A 2GBZA 1RGIA 4FSVA 4AHCA 3ISNC 5AQWA 3R1XA 4CEZA 1LAVA 3KKRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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