4Z94A

Actin complex with a chimera of tropomodulin-1 and leiomodin-1 actin-binding site 2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4z94A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4z94A04
3CIPA 3GG4A 3LDNA 4M7YA 4CZFA 4J8FA 2H3GX 2E2QA 3ATVA 5E84A 3VENA 1BA1A 2AP1A 3CQYA 1NMDA 2GUPA 5LJVA 5AQSA 3IDHA 3C7NB 3GL1A 3H3OB 4IJNA 1V4SA 4CZLA 4EHTA 4ISGA 2P9IA 3VERA 4JD2B 1QZ5A 2QWLA 3EL2A 3DXMA 4BREA 1QQNA 3VGMA 1ATNA 3ENHA 5FPNA 3SJHA 3VETA 5FPDA 2Q97A 3WQTA 4MLHA 2FXUA 4KBOA 1D4XA 2Q1NA 4H03B 4BRGA 5FPEA 2A3ZA 3IFRA 3P4IA 2VYPA 2E88A 4JNEA 3A5NC 1HKCA 1R59O 1OKJA 4BRCA 1K8KA 4CZKA 4PL7A 4CBXA 3L0QA 5BREA 5BRDA 2D4WA 5CE3A 3RSEB 5BPNA 3QBXA 1YVNA 4CBWA 1TYQB 3GBTA 3MN5A 4H5NA 3DAWA 3VGLA 1HJOA 1BU6O 2FLOA 3O5BA 5AQIA 1MA9B 3EZWA 4H5TA 4FSVA 5F0XA 5BRFA 3UKUA 2FSKA 1NGIA 5AQJA 3D7EO 3VEYA 1Z6RA 3O1WA 5AQYA 3WXJA 2IVPA 5KQ8A 5JLHA 1QHAA 5ELZA 3C7NA 2NRHA 4EFHA 3GOIA 4JD2A 1Y64A 3ATUA 5TKYA 3WXKA 1DEJA 1ZC6A 4RWTA 2GWKA 1S22A 3FR0A 1IJJA 1GLFO 5F2RA 1C0FA 4BRPA 3HI0A 4BVPA 3LM2A 5KPTA 5AZIB 4B1XB 5LJWA 2QWMA 3U9DA 4M63C 2QWRA 3FE1A 3EKUA 4AM7A 3FZMA 3A5MC 3G25A 3CI5A 4F9OA 3AAPA 4BC5A 3DWLA 3RSEA 2NZTA 4GY2B 4ISEA 4QS8A 4BRNA 4CZGA 3VEWA 1TYQA 3CJBA 5AQZA 3CQXA 3TPQA 2V7YA 2HOEA 1NGFA 5AQKA 5AQRA 5ADXA 4PKIA 4HWIA 1MWMA 5KPRA 3FZKA 5AFUH 1HPMA 4DHYA 2QM1A 2D1KA 2ZF5O 4WQ4A 2P9NB 5AQTA 2E20A 2CH5A 4H5RA 3VEZA 2ZGZA 2QW9A 5EXWA 5ADXH 2A41A 4WQ5A 1ATSA 3D2EB 5EY4A 4JN4A 1GLJO 4FOIA 3R6MA 1NLVA 3WUHA 1GLLO 2W41A 4MLEA 3LDPA 4FWSA 4Y0WA 3GDQA 3JS6A 2Q31A 2YHWA 4BQLA 1GLEG 4H5WA 1EQYA 1KAXA 1SQKA 2E1ZA 4FO0A 1BWFO 1BO5O 2YCHA 2CGLA 5B8HA 3QB0A 1MDUB 5AZIA 1E4FT 1GLAG 2FSJA 4B9QA 5JMVA 2P9KB 1QQMA 3AAQA 2ZGYA 5AQUA 1T6CA 3M1FA 2Q0RA 1GLCG 2IIRA 1NWKA 4NB4A 5I9EB 3O6WA 1XUPO 4EIAA 5BN8A 4IJAA 3MN7A 5AQMA 5AQLA 1RDWX 5AQQA 3O8MA 1T44A 4A2BA 3A5OC 4BR5A 4BRQA 1BUPA 2A40A 5FPMA 2ASOA 2YJFA 3W0LA 4H0OA 4H0VB 1NGCA 1P8ZA 2YHYA 4FWOA 5AQHA 2P9NA 3GE1A 3M6GA 4ISFA 5E26A 3MK6A 3SK3A 4B1UB 3OHRA 3D2EA 3WEEB 2YHXA 2E2NA 4GNIA 5AQPA 4BR9A 4CJ7A 4BRAA 2IVOA 1TUYA 3D2FA 2GELA 4BC4A 1WUAA 1ESVA 1U2VB 2YJEA 4CZEA 2VWBA 4K25A 3QFPA 3TU5A 4BRMA 5BPMA 4H0YB 1IG8A 3U4LA 3SMSA 2P9PB 4FWPA 3IMXA 3CJ1A 3HBTA 5F1XA 3CERA 4K42A 3HSCA 2ITMA 1G99A 3J8AA 1Z05A 3U9ZA 5EOYA 1YXQA 4BGBA 2HF4A 3A0IX 4IXCA 2GWJA 4BR4A 1NGEA 3H46O 3QDKA 1S3XA 4WYBA 5AQXA 2E2PA 2P9KA 3JXUA 3CJCA 4BR2A 3WXIA 1LCUA 4YDUC 4B1YB 3ZX3A 2ZWHA 3L4IA 4H0PA 4YDUA 3QMLA 3B8AX 3LL3A 3SLCA 1ZBSA 1NGGA 4QS7A 4I6MB 1GLBG 3VF4A 4BC2A 4BRLA 3DXKB 1BA0A 2P9LB 2P9SB 1WOQA 3CETA 1T6DA 4BC3A 3O80A 2OANA 3BF3A 3BF1A 1X3NA 3UB5A 2E1YA 3CJAA 1XQSC 2BUPA 4H0TB 4RCHA 3FFKB 4NO7A 3VOVA 4BROA 2I7NA 3VEVA 4LC9B 4DCHA 3MDQA 1ATRA 4FL9A 5KPZA 1LOTB 1JCFA 5AFUA 3HM8A 3LDQA 3WEEA 3WT0A 4CZJA 2CH6A 4L3QA 2QWNA 1U2VA 3KHYA 2YI1A 4A62A 3AY9A 2E8AA 2E2OA 1SAZA 4B1WB 2P9PA 4DB3A 4WQ4C 4E1JA 3MN6A 5AQGA 2A5XA 1V4TA 1C0GA 2P9UB 2V52B 1HX1A 4WQ5C 2HF3A 2Q36A 3ZX2A 3O4WA 3UE5A 4BG9A 3D2FB 1NGJA 4PKGA 3BUZB 2HMPA 5AQVA 3UKRB 4BGAA 3EN9A 3VEXA 2Q0UA 2W40A 5BRHA 3KVGA 4FPAA 3VPZA 4EHUA 4BRDA 4DQ8A 1NGAA 2EWSA 5AQNA 3ZX0A 2F9WA 2VCPA 4I6MA 5AR0A 1YAGA 4FWRA 3DXKA 3EO3A 2P9SA 2P9LA 3MN9A 3H1VX 2AA4A 2ASMA 4O5FA 3MCPA 1YUWA 4MO4A 1HLUA 3ZETB 4RTFD 4O8KA 4JAXA 3EKSA 2FSNA 4HTLA 4FWMA 2PBDA 4FPBA 2GEMA 3H1QA 4CI6A 1J6ZA 3L6QA 1BOTO 5AQOA 4BRFA 4BR7A 1JCEA 3F9MA 1DKGD 3QFUA 4B1ZA 3FZHA 2P9UA 3C0BA 4CZMA 2A6AA 1Q18A 1NBWA 2FF3B 3HZ6A 3BEXA 3KZBA 5AZJB 4CZIA 3BP8A 2V51B 5BN9A 4XEIA 3UKRA 3ZEUB 4C23A 3CJ9A 4JHDB 4K41A 1NM1A 5JICA 1JCGA 4AM6A 4BRIA 3IUCA 1KXPA 1NGHA 2WUSA 3QICA 5EX5A 4CZHA 3WQUA 3VF6A 4BG8A 4IO8A 1HUXA 1H1VA 1U6ZA 3W3DA 5EVZA 3U8XA 1TUUA 5JLFA 1KAZA 3I33A 3I8BA 4IWVA 4BVOA 3VEOA 2QWOA 4H5VA 4BRKA 1BDGA 2KHOA 2I7PA 3ULEB 3FGUA 2J4RA 3ZETA 2DPNA 2UYTA 1GLDG 5AQFA 1SZ2A 3LDOA 3FZFA 2CGKA 3S41A 4PKHA 4H0XB 3CJ7A 5BR9A 4CD1A 3MMVA 3H6EA 3FZLA 4XH1A 3R8EA 3A5LC 1NGDA 1XC3A 3QBWA 2QWQA 4FWNA 5BPLA 5AZJA 2IVNA 4XH5A 2NLXA 4FWKA 2Q2RA 3VGKA 3ZEUA 4MO5A 2QXLA 4JHDA 2P9IB 5AQWA 3ID8A 3DXMB 1X9JA 1RFQA 5KQDA 2ASPA 1MWKA 4A61A 4EAHD 2D0OA 3R9PA 3O1BA 1ZXOA 2CGJA 2FF6A 4Z94A 1KAYA 2F9TA 2A42A 1CZAN 4CD3A 3A8YA 3O08A 4BR0A 1NGBA 4QS9A 1K8KB 2BTFA 3WXLA 4B1VA 1E4GT 3SMPA 3VESA 3LDLA 4K43A 4XH4A 1HKBA 3H45C 3ULEA 3AARA 3H3NO 1HKGA 2D0PA 1RGIA 2PAVA 3DJCA 4FWQA 4M7XA 4BRHA 4BQZA 4CBUA 4FOEA 1BG3A 3M3ZA 5LY3A 1DGKN 3HTVA 3FLCO 3VF2A 1QZ6A 4IZ9A 4A2AA 2V7ZA 2GTDA 4FWLA 3LM9A 1QQOA 3UKUB 3ENOA 1X3MA 3CHWA 2QWPA 4PL8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CIPA 1T3VA 4IOXA 4M7YA 4W5OA 2H3GX 2FC0A 3VMFB 3VENA 3OYMA 4RW7A 3V6DA 5LJVA 2XY5A 1ILYA 2ZJQL 2DFEA 1XI1A 1TVRA 3OYJA 4DTXA 3EL2A 4M3ZA 1QQNA 3VGMA 1D9DA 4Z4GA 5FPNA 4AHCA 2ATQA 3CQ8A 3KLIA 5T7BA 4E7KA 3DLEA 5FPEA 2A3ZA 3CXCM 2OPSA 2VYPA 2X6NA 2O8DB 4JNEA 3QNOA 3MECA 1HKCA 4KI6A 4CZKA 4PL7A 3OYAA 3T69A 5GIPA 4H4OA 5CE3A 4X65K 1BCOA 4WFAL 3U3GA 1TV6A 3ULDA 2NRRA 3DAWA 4OLBA 3HK2A 4E72A 2KQ2A 3O5BA 2PZSA 5AQIA 1RDCA 3EZWA 4GVMA 3EY1A 4JLHA 4FSVA 5F0XA 1OH8A 4FZZA 4OPKA 1IV0A 1W9HA 4OKEA 1Z6RA 1S1VA 3WXJA 1UA0A 4ICLA 3CCUN 3EYZA 2OPQA 3O3GA 2OCEA 1RILA 3NF9A 1WSEA 3OYHA 1REVA 4CHNA 4O4GA 3GOIA 1DEJA 4IFYA 5CYMA 1Q8IA 3OS1A 1IJJA 3OYNA 1C0FA 3HI0A 3F5TA 5AZIB 4NXNK 2O8DA 3VQDA 4M63C 3FZMA 2PY5A 1KD1O 4DU4A 4E1NA 5FRNA 4BRNA 2HHQA 3THXB 4N47A 3CCMN 1VQNN 3K59A 5AQZA 5CZ2A 1NGFA 5AQKA 5AQRA 5ADXA 2IGIA 2OPPA 3FZKA 3AA4A 2ZF5O 2P9NB 2ZGZA 2QW9A 1GOAA 2A1SA 1ATSA 1DTQA 3S3NA 3CYGA 3C6UA 3C65A 4FLUA 3I0SA 1HJRA 3WUHA 4G9ZA 3GDQA 5M1QA 2Q31A 1C1BA 3IG1A 3VN5A 4X64K 1BO5O 1VSLA 4F2SA 4I2QA 3HT3A 3VTHA 3QB0A 1MDUB 5AZIA 1E4FT 3TSPA 2FSJA 2XY7A 2HNYA 5JMVA 3G4SN 2P9KB 3ZT1A 3VQQA 5J2MA 1T6CA 4IG3A 3HVRA 2Q0RA 1GLCG 2IIRA 1JKHA 2GX9A 4EIAA 4IJAA 1ZBFA 1LW0A 3THXA 2ZJPL 3NF6A 1DTTA 2UUBK 1NK0A 1C0UA 4BR5A 1BQNA 1BUPA 2OTLN 4FW1A 4CEDA 5M1PA 2YHYA 4FM2A 2P9NA 4ISFA 2KLAA 1RT5A 1SKSA 2DTUA 4GNIA 1TUYA 4BC4A 4HUGA 1MU2A 4CZEA 3K5MA 4K25A 3QFPA 1IG8A 3NF7A 3SMSA 1ZBUA 4JK8A 3HBTA 3HSCA 2EX3A 2ITMA 4Z4HA 1G99A 4V19S 4KHWA 1BGXT 2EHGA 2HF4A 4BWMA 1Q7YO 2JWLA 1Q81O 2P9KA 2WC9A 4BR2A 1S72N 4MDAA 4YDUC 3ZSVA 2D0AA 3NGZA 4H0PA 2D0BA 1YJ9N 4C8KA 1BL3A 1J5EK 3HOSA 4B3TK 2ZQBA 1NGGA 3OJSA 3PO5A 4BC2A 4BRLA 4CF2A 3T1YK 3C6HA 4FK2A 1BA0A 4KFBA 5J2QA 3O80A 3IAYA 2GV9A 3BF3A 4RW6A 3BF1A 2E1YA 3CJAA 1XQSC 5FRMA 1VQ7N 3VOVA 2I7NA 4CHYA 4CF9A 4DCHA 1ZBLA 3DOKA 4DWIA 1LOTB 1JCFA 4NCGA 2AJQA 4DTRA 4CHPA 4B3SK 4BACA 3DLKA 4A62A 4E7HA 1NKEA 1EO1A 3MN6A 5AQGA 2NRXA 2P9UB 1C0MA 1TL1A 2HF3A 2Q36A 3NH1A 3ZX2A 3UE5A 2O8FB 4LFBK 3D2FB 4W5TA 1JJ2M 4PKGA 3LWLA 3UIQA 4I9QA 3UKRB 1NJXA 5I3UA 4LF4K 1RT7A 1VAZA 1CXQA 3ASMA 5BRHA 3NDKA 1W0HA 2YKNA 4CEQA 1X9MA 1TAQA 2P1JA 4B9VA 5AQNA 3ZX0A 4CJRA 2NRWA 1QS4A 4LD0A 5C42A 3QESA 4IKFA 4E1MA 4JK7A 3NVKA 4FW2A 4O5FA 2NRZA 3DLHA 4EZ9A 1HLUA 1XNQK 1O1WA 1HNVA 1BHLA 1EKEA 3CCSN 1NK4A 5AQOA 1T03A 1NU0A 3QFUA 4B1ZA 3FZHA 3HVTA 3BY5A 2P9UA 1VSKA 4Y1CA 2RF2A 5AZJB 4CZIA 2Z1JA 4O0IA 1FKOA 3T1HK 3MEEA 3UKRA 4I9LA 1JCGA 4FVMA 4KB1A 1KXPA 1J9AA 2BH1A 3HP9A 3TSQA 3BDPA 2WFBA 3HYFA 3QICA 5EX5A 4ELTA 4HTUA 3WQUA 4AHSA 3VF6A 1HUXA 3DOLA 4B9TA 2NRTA 4KHPK 1U6ZA 4KHSA 1TUUA 1KAZA 4IWVA 3CF5L 1HQUA 3V9SA 3OJUA 4OLAA 1YIJN 2E6LA 3CFPA 1QSYA 1BDGA 5HRRA 4YOXA 2I7PA 2P5GA 3ULEB 1U4BA 3FGUA 3NCIA 4DFKA 1UWBA 4A5AA 3L2RA 1GLDG 1SZ2A 1JLGA 4H0XB 3A2FA 3TAEA 3T1AA 4L8RB 1FW6A 3CCJN 4XJXA 2YV0X 3FZLA 1TKTA 2E5LK 3A5LC 3J7YP 4CEOA 3P31A 1XC3A 3J81O 3QBWA 5BPLA 5M1OA 5AZJA 2QEXN 4DLEA 2HBJA 4XH5A 5M1NA 3OY9A 4CEAA 3LP0A 2Q2RA 4DF4A 4CK1A 4GV3A 4B3RK 4MO5A 1CXUA 1RTJA 1YJWN 2Y1IA 5AQWA 1NKBA 3IKMA 3DXMB 3QEPA 1RFQA 3SUOA 2YHAA 4DTMA 3PIOL 2D0OA 5CR4A 4DUZK 1ZXOA 3RTVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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