4Z94A

Actin complex with a chimera of tropomodulin-1 and leiomodin-1 actin-binding site 2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Protein binding/structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4z94A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4z94A04
2A42A 1RGIA 4CI6A 4EFHA 1YVNA 3VF4A 3AARA 4BRCA 1NGBA 1QQNA 2P9UA 3VPZA 3FZMA 2DPNA 3CJBA 5BN8A 1TUYA 3BUZB 1U6ZA 3R9PA 5AQWA 4WQ4A 5AQMA 3CERA 4BR0A 1NGFA 4HTLA 2D1KA 1RFQA 4BR7A 5F0XA 3DWLA 5AZJA 2P9NA 5ADXH 3DXMB 2Q31A 3D2FB 4XH1A 1E4GT 1Y64A 2Q97A 2A6AA 3D2EB 4GY2B 4M63C 4WYBA 3U9ZA 1Z05A 3C7NB 4H5VA 2A41A 4KBOA 5AQXA 3VGLA 2YI1A 4AM6A 2VCPA 3QFPA 2FSNA 2Q1NA 3BEXA 2D0PA 4YDUC 2I7NA 3FR0A 5BRHA 3EKUA 2GTDA 3CJ7A 4IWVA 4H0VB 3H46O 2FSKA 4CZFA 1QQMA 4FSVA 3ZX2A 3A0IX 2ZGYA 4CZGA 4JNEA 2V7YA 5KQDA 1NLVA 2BUPA 5I9EB 3SMSA 2E1ZA 3GDQA 3AAPA 3HZ6A 1GLAG 3MN6A 2E2QA 3S41A 1MWKA 4BQZA 3O4WA 2V7ZA 3CJAA 1QZ5A 4FO0A 1EQYA 5EX5A 1KAZA 3UKRB 2QWLA 1HUXA 3WXKA 3QBXA 4I6MA 3WT0A 3CI5A 4ISEA 3DXMA 4L3QA 5AQJA 3D2FA 3O1BA 3D2EA 1G99A 2QWQA 2V51B 3AY9A 5KQ8A 3VGKA 3H3OB 4BRGA 4PKIA 3C7NA 5ADXA 4JAXA 2ZF5O 5JICA 2KHOA 4CBWA 5BN9A 5BRFA 3A8YA 2ASMA 2E2OA 1GLCG 4FPAA 5JMVA 2FSJA 2H3GX 2GEMA 3M6GA 1T6CA 1QHAA 4HWIA 4FWOA 2CH5A 1BU6O 1C0GA 4ISFA 2QWNA 3VF6A 1T6DA 1QQOA 3HSCA 5LJWA 4QS8A 1NGIA 3HI0A 3L0QA 4A2AA 4WQ4C 3KZBA 1NMDA 2FLOA 5FPEA 2FF6A 3IUCA 2NLXA 1BA1A 2QW9A 2E20A 3C0BA 3VEWA 1LCUA 4B1VA 2ZWHA 3A5OC 2IVPA 4BR5A 4GNIA 2YJEA 1NGJA 4A61A 4CZKA 1ESVA 2W40A 3D7EO 3MDQA 3P4IA 1SZ2A 3FZKA 5AR0A 5LY3A 4BC4A 3LDLA 4BR4A 3I8BA 3JXUA 1P8ZA 3RSEB 1DGKN 3GBTA 2E2PA 4QS9A 3B8AX 3SJHA 3VETA 4EHTA 1CZAN 1KAXA 3UKRA 2QWMA 3A5MC 3WXLA 4BRQA 1S3XA 1GLJO 4DB3A 4XH4A 4LC9B 5AQSA 3GG4A 2CGLA 1NWKA 1E4FT 4Y0WA 1NGAA 4DQ8A 2ASPA 5EXWA 4BREA 5AQVA 3WQUA 3DAWA 3CJCA 3O1WA 5AZIB 4NO7A 1GLEG 5AQQA 3W0LA 1JCGA 4F9OA 2E1YA 5E26A 5B8HA 1WUAA 2Q2RA 2IIRA 4XEIA 3MK6A 3SLCA 4PL8A 3ENOA 4IXCA 1ZBSA 2HF4A 4FWMA 4H5RA 3WXJA 1T44A 1YUWA 4H0OA 3H1VX 4FWKA 4FWRA 4FWPA 4O5FA 5JLHA 3FFKB 3EN9A 5JLFA 1Q18A 4BRDA 4JHDB 1IJJA 4NB4A 1J6ZA 4B1XB 3EZWA 5FPNA 3HBTA 4A2BA 1DEJA 3IMXA 2GELA 4M7YA 3VGMA 4RWTA 1NM1A 3CHWA 1C0FA 2QWOA 1JCFA 3ZEUB 2ITMA 3ID8A 2IVNA 4BRFA 3CIPA 4H5WA 1TYQB 1KXPA 2AA4A 3LDNA 1MA9B 3HM8A 3ZX3A 4C23A 4CZIA 2IVOA 3VF2A 1TUUA 3FLCO 3FE1A 3U9DA 1NBWA 1GLLO 5AQTA 4BC3A 4BROA 2D0OA 5AQPA 2QWPA 3MCPA 4Z94A 3LDPA 4BVOA 2E2NA 1V4TA 1HKCA 1V4SA 4BRLA 5AQHA 3ZETB 3LL3A 1HKGA 4BQLA 4BG9A 2F9TA 2QXLA 4BRPA 1QZ6A 1HX1A 4RTFD 4H03B 3LM2A 2W41A 3ATVA 3H3NO 3ATUA 2YHXA 1IG8A 5F2RA 3G25A 1U2VB 4B1UB 5BRDA 3QMLA 3KHYA 4WQ5C 1XC3A 3L6QA 5CE3A 4B1WB 5BPNA 2ZGZA 4J8FA 2GWJA 1BWFO 2YCHA 4MLEA 4CZEA 1K8KB 3LDQA 5AQFA 5BPLA 2AP1A 3CETA 4BRAA 4H5TA 2PAVA 4K42A 3F9MA 3H45C 4JD2B 2WUSA 3U8XA 2A5XA 5AFUH 1WOQA 3I33A 4BRMA 4AM7A 4CBUA 4CZHA 1HJOA 4K43A 1RDWX 3O08A 1NGCA 4EHUA 3FZFA 3R6MA 1NGEA 2HOEA 2A3ZA 3CQYA 1NGGA 3JS6A 3VEXA 3ZEUA 3VENA 4K25A 1ZXOA 5AQZA 2I7PA 2EWSA 1TYQA 2UYTA 4O8KA 4BRNA 4WQ5A 1BA0A 4H0PA 3A5NC 3M3ZA 2P9LB 2YHWA 3QDKA 4JN4A 1HLUA 3O5BA 1BO5O 3HTVA 1HPMA 3LM9A 3KVGA 4H0XB 4CBXA 2P9IB 1SQKA 2NZTA 5E84A 3H6EA 3QICA 4IZ9A 2GUPA 4M7XA 4QS7A 4BGBA 4E1JA 4H0TB 4MO5A 3ZETA 4DCHA 3ULEB 1H1VA 1D4XA 3SMPA 1GLBG 2P9PB 3WEEB 3W3DA 3FZHA 1U2VA 4FWNA 1YAGA 3SK3A 5FPDA 2ASOA 1ZC6A 3BP8A 3LDOA 2E8AA 1MDUB 5BR9A 4BRIA 1K8KA 3TPQA 3VEZA 2Q36A 3CJ1A 4IO8A 3A5LC 3UE5A 5EVZA 3H1QA 3J8AA 4I6MB 3R8EA 4JD2A 1Z6RA 2P9KB 3VOVA 4BVPA 1OKJA 4BC5A 5EOYA 4FPBA 4DHYA 2P9SB 1XQSC 3BF1A 2VWBA 3ENHA 5AFUA 1NGHA 3QFUA 3L4IA 5AQOA 1SAZA 3EO3A 5AQKA 2D4WA 4BG8A 4BR9A 4BR2A 1JCEA 1HKBA 3VEYA 2P9LA 1GLDG 3RSEA 3VEOA 2A40A 3OHRA 2FXUA 3EKSA 2V52B 4CZMA 1X3MA 1MWMA 2P9IA 1ATNA 3DXKB 3CQXA 2HF3A 4K41A 4EIAA 2NRHA 4EAHD 4B1ZA 3ULEA 3UKUB 4BRHA 3MN9A 1BUPA 3DJCA 2GWKA 3GOIA 4BC2A 1X9JA 5AZIA 2YJFA 2BTFA 2P9PA 3WQTA 2HMPA 3WEEA 4BGAA 5F1XA 2Q0RA 4B9QA 5KPZA 2PBDA 2CGJA 3UB5A 1ATRA 4MLHA 1X3NA 4ISGA 3M1FA 3QB0A 2Q0UA 2FF3B 4YDUA 4A62A 1LOTB 4CZLA 4FL9A 2P9UB 2CGKA 2J4RA 3U4LA 4RCHA 5AQYA 1KAYA 3CJ9A 4CD1A 3O8MA 3FGUA 3VEVA 3EL2A 3IFRA 2OANA 2P9KA 1DKGD 3ZX0A 3QBWA 3VESA 3TU5A 4FWLA 4FOIA 2CH6A 3GE1A 2P9SA 4IJAA 4JHDA 4H5NA 4B1YB 1R59O 5AZJB 1ATSA 2P9NB 5AQIA 5BPMA 5BREA 4FOEA 4IJNA 5EY4A 4FWQA 2YHYA 4MO4A 2QWRA 1BDGA 2F9WA 4PL7A 4CD3A 1XUPO 3WUHA 1YXQA 3FZLA 3O6WA 5LJVA 5AQNA 5ELZA 3MN5A 3GL1A 5AQGA 2QM1A 2VYPA 1BOTO 5AQUA 3DXKA 4PKGA 1BG3A 1GLFO 5KPTA 4PKHA 5KPRA 4XH5A 2E88A 3WXIA 1S22A 5FPMA 4FWSA 5TKYA 4BRKA 3MN7A 3IDHA 3O80A 3UKUA 3BF3A 5AQLA 5AQRA 1NGDA 3VERA 3AAQA 4CJ7A 4CZJA 4H0YB 3MMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GKKK 3HM9A 3K9KA 4CIGA 4GV9A 2UUAK 1YVNA 3VF4A 3JAMO 3MXIA 3CM5A 3AARA 4FJMA 2RN2A 2YNGA 2G8IA 1VHXA 1ILYA 2UU9K 1YJ9N 4NCGA 4YOYA 4DR4K 3R9PA 1IO2A 4Y1DA 4J2AA 2O8EA 1NGFA 3ZT2A 4HTLA 3IS9A 1OH8A 3DWLA 2HHQA 1U4BA 2Q31A 3F73A 2Q97A 3D2EB 3OY9A 2ZJPL 1S1XA 1ZYQA 3VGLA 3QFPA 4F8RA 2O8FB 2FSNA 2QI2A 1EKEA 4OVLA 3HP9A 3P31A 3R3LA 1BI4B 5M1OA 3CC4N 4DSEA 3DLKA 3EKUA 4B3SK 1BCMA 3CFRA 4CGHA 4CJQA 1QQMA 2EX3A 4FSVA 3KK1A 4CERA 1CLQA 2KZZA 3SAHA 2XY7A 5KQDA 1NLVA 3ZSWA 2O4GA 3E1YA 3I0SA 4CJFA 3SUNA 3C6TA 2E2QA 3OS0A 1TGOA 3S41A 5C2FA 3OYKA 3VQDA 3CJAA 4PHTX 1EQYA 4JKGB 4AHCA 4CJPA 3NH0A 4KI6A 3CCEN 3K0SA 2QWLA 2HBKA 4JKCA 4I6MA 4FJHA 3CI5A 3RMBA 3OYBA 3PSIA 3O1BA 3VTHA 2XO7A 4BRGA 3CYGA 3C7NA 4JAXA 4L8RB 1VSDA 5BRFA 1UA0A 1L3SA 2A1SA 1K9MO 4IG0A 3NF8A 2KZMA 1N5YA 1S1UA 4ISFA 3DRRA 1TL1A 3E66A 4YOVA 5JENA 3KK7A 3J7YP 1NGIA 4B8CA 4DSJA 1F21A 2FLOA 5FPEA 4BECA 2NLXA 4KH5A 5E41A 3CCRN 1HR0K 2FBVA 4Z0UA 2F8TA 2QEXN 3TSUA 4BR5A 2YJEA 1KD1O 2W40A 3MDQA 3P4IA 1SZ2A 3V9ZA 3V6DA 3IRXA 4CJEA 1HYVA 4BC4A 2I5JA 1RT6A 1RDUA 1JXBA 4AILC 1B9DA 3SJHA 4JI0K 3VETA 4EHTA 3OBYA 3UKRA 3O9QA 5CZ2A 3OVNA 2HNZA 1WSHA 1HQUA 4IOCL 1E4FT 4CGDA 5DK5A 5MLCQ 4BE1A 4JLHA 4C1NI 4DQ8A 4HTUA 4FLXA 2ASPA 3S3NA 4M3ZA 3WQUA 3AA5X 3DAWA 3O1WA 4B9TA 2ZQBA 1JKHA 1RT2A 1Q82O 4F9OA 2O8DB 3LP0A 1N33K 3THWA 4DU3A 1CXQA 2YHBA 2WC9A 4Q5VA 3RMCA 4B9NA 4OKJA 4ZTFA 4YY3K 3J81O 3SLCA 4PL8A 1ZBSA 3BY5A 2HF4A 3K9JA 3WXJA 1T44A 4H0OA 3TI0A 1NJXA 3THYA 1OVYA 3QINA 5JLHA 3FFKB 3V4IA 1ASWA 4FJKA 4NB4A 1J6ZA 4OKKA 3OYFA 4JI2K 3LWMA 1VQON 4FJGA 5GAGP 4CGFA 3CCMN 4B9UA 3J7AP 2B4JA 4RWTA 3H08A 1TK5A 4DG1A 3ZEUB 5GINA 5C10A 3SQ1A 1D9FA 3CQ8A 4H5WA 4FK4A 2AA4A 3LDNA 4AHUA 4C23A 2OPSA 3ITHA 4PQUA 1Z25A 3QEWA 3FE1A 1VQMN 4MQ3A 3U9DA 1NBWA 4CEDA 5AQPA 4IBNA 4BVOA 4CJWA 2E2NA 3VQAA 1HKCA 1V4SA 3TANA 4BRLA 3LL3A 4BQLA 2F9TA 5GAEP 3HSTB 2OTJN 1HX1A 1L3UA 4H03B 3H3NO 4DSLA 3L3VA 4GVEA 2YHXA 4BDZA 4F3OA 1U2VB 3ZT0A 4MDAA 3KHYA 3HOTA 1XC3A 3L6QA 4KHQA 4B3MK 3B6PA 3BZKA 4J8FA 2W6LA 2YCHA 1IKXA 3ZYYX 5BPLA 1YVUA 2AP1A 4E1NA 4JS5A 2D0AA 4H5TA 4K42A 2FBXA 1VQPN 3CC2N 3H45C 3DOLA 4FW1A 2B6AA 1WOQA 4AM7A 4WFBL 3HPGA 4CE9A 4E89A 1NGEA 4KI4A 1NGGA 1T7PA 3VENA 2XY5A 1RDCA 2I7PA 4Y1CA 2UYTA 4BRNA 2DFHA 4H0PA 3C6AA 4JN4A 4CJRA 3O5BA 3AA3A 4DUZK 4H0XB 4CBXA 2P9IB 2JWKA 4OX9K 3MXJA 3KLHA 5JS1A 5KTQA 3H6EA 4DV6K 4IZ9A 4M7XA 3V1QA 1BIUA 4H0TB 3NGYA 4MDBA 4DCHA 3ULEB 2HMIA 3ALYA 2D0BA 4DSFA 3I56N 2P9PB 2GX9A 3WEEB 4RW7A 1BQNA 3W3DA 1RT5A 2BE2A 1LWFA 4FWNA 4NYNA 4CJ4A 1YAGA 2JLEA 2VWJA 3QEXA 4CF2A 3QNOA 4FK0A 1N32K 4I7FA 1NJYA 4NCBA 1HMVA 3M5RA 5TKWA 3CJ1A 4B8AB 4ELTA 4J2EA 1QS4A 1NK4A 3R8EA 3SV4A 4BVPA 1OKJA 1LW2A 3KD1E 5EOYA 2KFNA 4G9ZA 3CM6A 2X74A 5AFUA 3RVCA 1JLGA 3SBGA 3QFUA 4HVJA 3C65A 5AQOA 3CFPA 4K8XA 1J5OA 3IG1A 3EO3A 4GV3A 2NRTA 4FJJA 1IG9A 1HKBA 2IDOA 3DLRA 3AV9A 2YNIA 3OHRA 2ZE2A 4CZMA 5GIPA 3Q7BA 4O0IA 1ATNA 3DXKB 3CQXA 1HNVA 3RMDA 2FBTA 3U3YA 4F2RA 5M1NA 5JVGL 1EXQA 4B1ZA 1ZBLA 4DR2K 1BUPA 5J2MA 1GOCA 4KAZA 1X9JA 3ZSZA 3WQTA 4BGAA 5F1XA 4M3UA 1KFSA 1C1AA 4JS4A 3DRSA 2PBDA 2WFBA 4DQQA 1YI2N 4MLHA 3AVNA 5HOOA 1K8AO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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