3DXKB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0944636
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
211
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 56
structure length 211
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxkB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxkB02
3AY9A 4CZLA 2IVNA 4BRAA 2UYTA 4WQ5A 1GLLO 1T6DA 3R9PA 5KQ8A 4NB4A 1C0GA 2CGLA 3O80A 2E2OA 4XH1A 4M63C 1TUUA 2YCHA 5AQUA 3DWLA 4A2BA 3M6GA 5AQKA 1JCFA 4IWVA 1GLBG 2I7PA 4J8FA 4JN4A 3TPQA 1NGIA 4H5WA 3IFRA 3O5BA 1HKBA 3U4LA 3VF2A 3H1QA 1YUWA 2YJEA 4EAHD 1OKJA 2ZF5O 3QBXA 1Z05A 2AA4A 2P9PB 4JD2B 4DHYA 3WEEA 2NZTA 4BR5A 2A41A 4FOIA 3UKUA 3MN5A 4H0TB 3LL3A 1J6ZA 3DJCA 4BREA 5JLHA 4H0PA 1HKGA 4M7XA 4AM6A 2Q1NA 1DGKN 2D1KA 4CZEA 2P9IB 4QS7A 5KPZA 3W0LA 1X3NA 5AQFA 5FPEA 2E20A 4FWPA 3HM8A 1SZ2A 4KBOA 4BRDA 2ASOA 1YAGA 1H1VA 1WUAA 1IG8A 4CJ7A 3BF3A 5BRDA 3AAQA 2A42A 4GNIA 5BRFA 4DQ8A 1CZAN 4C23A 3ZEUB 3FZMA 2Q2RA 3U8XA 3JS6A 2W40A 2YHXA 1BDGA 3C7NA 3H6EA 4XH4A 3WXIA 3VOVA 2BTFA 2Q31A 3VEWA 1GLAG 3FFKB 1NGHA 4FO0A 5KPRA 2FSJA 2E88A 2E8AA 4FWSA 5AQSA 2QWQA 4FWMA 3CJ7A 3WXKA 2E2PA 3QDKA 3CERA 3ID8A 3CJ1A 4MLHA 3MK6A 1QQOA 2A3ZA 2HF3A 3LDQA 4H0XB 3CJ9A 3WT0A 1MWMA 3WXJA 1GLFO 1GLCG 3J8AA 4HWIA 5EOYA 1Z6RA 2ZGZA 3VENA 4DB3A 3FLCO 3I8BA 4PKHA 3H3NO 1GLDG 2QXLA 3MCPA 3TU5A 2P9PA 5AQTA 1X9JA 2P9LA 2YHYA 4GY2B 1MDUB 1U2VA 1NGJA 3MN9A 3UKUB 4K25A 2J4RA 3EKUA 1R59O 2P9KA 2P9SA 5AQJA 3WEEB 1E4FT 2W41A 1KXPA 3O1WA 1C0FA 3VGLA 4BR2A 3CETA 5JMVA 5AQQA 2OANA 3CI5A 1DEJA 5JICA 1KAZA 1QZ6A 1KAXA 4Y0WA 2Q36A 3SK3A 4A2AA 4H0YB 4HTLA 3FZLA 1BG3A 3D2FA 1NM1A 3FGUA 4FPAA 4BR7A 4XEIA 5F0XA 4B1VA 2QWNA 1P8ZA 4CBUA 5AZJA 5AFUH 1ZC6A 5ADXA 4FWKA 5EVZA 3VF4A 2ASMA 2VWBA 5E26A 3CIPA 4ISEA 2QWLA 5AQPA 5AQHA 4B1XB 4BG8A 2QWMA 4PKGA 3UB5A 1ATNA 3LM9A 4FWQA 2IIRA 4CD3A 4B1UB 3ZX3A 3CQXA 3JXUA 1NGEA 1U2VB 4PL7A 1KAYA 2D4WA 3O6WA 3QB0A 3VGKA 4BR0A 1NBWA 4Z94A 3O08A 3ATVA 3EN9A 1QQMA 3QBWA 1MA9B 3VF6A 2F9TA 2QM1A 3FZFA 1BOTO 5AQYA 4PKIA 4IO8A 5F2RA 3C0BA 4B1WB 5TKYA 4CBWA 1BU6O 2IVPA 3D2EA 2GELA 5FPMA 1SQKA 2FSNA 2HOEA 3CJBA 4BROA 1NGFA 2VYPA 4BRIA 1EQYA 5AQGA 4BC3A 2I7NA 3QMLA 1S3XA 2A40A 1ZXOA 2ASPA 4BRNA 1LOTB 4JNEA 3S41A 4AM7A 3VGMA 5AQOA 4BRPA 4BQZA 3A5MC 5EXWA 1MWKA 3UE5A 5AQLA 3O1BA 1GLJO 1XUPO 4BRCA 5FPNA 1NWKA 4MO4A 1YXQA 3DXMA 4WQ4C 4CZHA 3VEVA 1Y64A 2P9IA 2ZWHA 3GOIA 2V52B 3VEYA 5F1XA 4H5TA 2QWRA 5BREA 4YDUC 3ULEA 1TUYA 1NGBA 2QWOA 5BN9A 2Q0RA 1BA1A 2YHWA 1U6ZA 4FPBA 2Q0UA 4E1JA 5CE3A 1NGAA 1YVNA 3HBTA 3VEZA 5AQIA 3B8AX 3L4IA 3BP8A 2P9UB 1HUXA 2GWKA 1V4TA 4CZIA 4EHUA 4FWRA 3RSEB 2GWJA 4O5FA 2D0PA 2D0OA 1NGDA 4FWOA 3LDNA 4BC5A 3C7NB 2F9WA 4O8KA 1DKGD 2AP1A 4IZ9A 2A5XA 1HLUA 5AQWA 4H0VB 4H5VA 3L0QA 2FF6A 1T44A 4JHDB 4B9QA 4H5NA 3ENOA 2Q97A 3LM2A 2EWSA 1HX1A 2PAVA 3W3DA 3LDOA 4A62A 3H1VX 3KZBA 4ISGA 5KQDA 5AQRA 5AQMA 1ATRA 2HMPA 3VETA 3D2FB 3H3OB 1NGCA 3MN7A 2ITMA 4FL9A 2NLXA 2E1YA 5BRHA 4K41A 3EKSA 5AZJB 5LJVA 3DXKB 3AAPA 2CH5A 5AZIA 1XC3A 1T6CA 3IDHA 3VERA 5FPDA 1K8KB 3GDQA 3DXKA 2FXUA 4BGAA 2P9NB 2V7YA 1RGIA 3MN6A 1HKCA 2P9SB 5AQVA 3IMXA 4B1YB 2CH6A 2CGKA 3ZX0A 1SAZA 1V4SA 4RWTA 5EX5A 2E1ZA 3LDPA 3BUZB 5AQZA 3SMSA 3VPZA 3CJAA 1TYQA 2BUPA 3R6MA 4FOEA 1BO5O 2GUPA 3WQTA 5LJWA 3AARA 3VEOA 3I33A 5AQXA 3ULEB 1RDWX 1NLVA 3QFUA 1G99A 2E2QA 3HSCA 4BVOA 4F9OA 4I6MB 3H46O 4WQ4A 4ISFA 4QS8A 3ATUA 2A6AA 3KVGA 5E84A 3DAWA 4BRMA 2P9KB 2FLOA 3UKRB 4BGBA 4CD1A 1D4XA 1NGGA 2H3GX 4A61A 3L6QA 3O8MA 5BPLA 3QICA 3GG4A 3MDQA 3A5LC 3LDLA 4FWLA 3CJCA 4I6MA 3SMPA 3A5NC 4IJNA 4BG9A 1BWFO 1K8KA 3M3ZA 4FWNA 1BUPA 4BRFA 4BRHA 5BPMA 3ZETA 3FE1A 4PL8A 4EFHA 3SLCA 3U9ZA 2HF4A 4BC4A 2V51B 3MMVA 4BRKA 2V7ZA 1NMDA 3A8YA 3D2EB 1ZBSA 3WUHA 2P9NA 5EY4A 2VCPA 4WYBA 1QZ5A 5BR9A 3IUCA 2YI1A 2FSKA 5AR0A 3HI0A 3GL1A 3ZX2A 4MLEA 3WQUA 1ESVA 4JAXA 5I9EB 2WUSA 1JCEA 3RSEA 5ELZA 1IJJA 3ENHA 3M1FA 4BRGA 4JD2A 4BC2A 4DCHA 3BEXA 4RCHA 4H03B 4LC9B 1WOQA 5BPNA 4FSVA 4H0OA 3H45C 4CZFA 1HJOA 3U9DA 4RTFD 3D7EO 1QHAA 2GTDA 4BRQA 5AQNA 4CZJA 2DPNA 4QS9A 4BRLA 4CBXA 1Q18A 2PBDA 4NO7A 4BVPA 4IXCA 1QQNA 4K42A 2QW9A 2P9UA 3FZHA 3WXLA 4IJAA 4XH5A 4K43A 5AZIB 5BN8A 3A5OC 2ZGYA 3G25A 3CHWA 3CQYA 4H5RA 5LY3A 3EZWA 2IVOA 4B1ZA 1BA0A 2KHOA 3BF1A 2QWPA 1LCUA 2P9LB 3EO3A 2FF3B 1ATSA 4JHDA 4MO5A 4BQLA 4EHTA 2YJFA 1GLEG 1HPMA 4BR4A 3VESA 1TYQB 4M7YA 4CZGA 2CGJA 1E4GT 3FR0A 4YDUA 1S22A 3P4IA 4CI6A 3VEXA 3OHRA 3DXMB 2NRHA 3HZ6A 3GE1A 4EIAA 5AFUA 3R8EA 3SJHA 2E2NA 3A0IX 3UKRA 3F9MA 1X3MA 4L3QA 5KPTA 3O4WA 3KHYA 3EL2A 4WQ5C 1RFQA 2GEMA 3FZKA 4CZKA 5B8HA 5ADXH 3ZEUA 1JCGA 1XQSC 4BR9A 4CZMA 3ZETB 5JLFA 3HTVA 3GBTA 3QFPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C2DA 3L2WA 2KQ2A 2UYTA 3M8RA 4KH4A 1C0TA 3CCUN 5KQ8A 4DSFA 3AVKA 5C42A 1C0GA 1XMOK 1EKEA 2CGLA 2O8DB 1TKZA 3SUNA 3KK2A 3V9UA 4XH1A 4N47A 3DWLA 3NE6A 1B92A 1WSHA 4J8FA 2C1IA 1VQON 1QSLA 3VTHA 3ZSZA 5M1PA 3LP0A 1L5UA 1ASVA 2EX3A 4R79A 3QERA 4KHWA 1YUWA 1VQ6N 3LALA 3LPTA 3QO9A 3AVHA 5C24A 4DHYA 3WEEA 1D5AA 4KHSA 4BR5A 2A41A 1SKWA 2R7YA 4FOIA 4DR7K 4ILHA 5M1FA 3QEVA 1CLQA 1I94K 4CJEA 3ZSVA 2UUAK 3OYFA 4JYAK 3PSIA 1GOAA 1S1UA 1LW2A 4ELUA 1Z26A 4QAGA 2HHSA 3JAMO 1YAGA 4Q5VA 4O44A 1WAJA 4CF9A 4CK1A 1U47A 3G4SN 4KHUA 4FZXC 4FZZA 3AAQA 2A42A 3VQDA 3ZEUB 3J80O 2Q2RA 2VWJA 5HBMA 4XH4A 4ELTA 3VOVA 3NAEA 3MXMA 2YNHA 3DLEA 2E88A 4ZTFA 4FWSA 3OBYA 3SNNA 1BGXT 4DV4K 3NDKA 3CERA 3ID8A 2UUCK 4RW9A 2HF3A 3LDQA 4A5BA 4DLEA 3WT0A 1MWMA 3WXJA 4CGIA 4AHSA 1Z6RA 3VENA 3O4QA 2ZJQL 3FLCO 2ZJPL 1DLOA 4JKFA 2QXLA 3VQ8A 3BY5A 2P9PA 2P9LA 2YHYA 1RTIA 1TVRA 1MDUB 1U2VA 4YORA 4KTQA 3O9RA 4AILC 2E4LA 3UKUB 2J4RA 3EKUA 1R59O 5FROA 5AQJA 3TI0A 1KXPA 3AO2A 1C0FA 4BR2A 4BDZA 5IWAK 3O3HA 1QTMA 1L3SA 5JMVA 4A5AA 2KZZA 1QSSA 2FBXA 3O9QA 2GUIA 1L3UA 4DTSA 1S5JA 4KHYA 3FZLA 4CF8A 3OTOK 4ZHRA 4BR7A 2QWNA 1P8ZA 5AZJA 1WAFA 2G8IA 2OPSA 3NGZA 2VWBA 2QWLA 4O8UA 4OKJA 5AQHA 3TSQA 4B08A 4WCEL 1FKPA 4BG8A 2QWMA 4PKGA 4JI2K 4ILGB 3VTIA 3S3MA 4AHTA 3ZX3A 4FJMA 2QKKA 2F4VK 1W0HA 1RBRA 1RT2A 3JYTA 2P1JA 4I9QA 2D4WA 3QB0A 1GOCA 4Z94A 2FBYA 3EN9A 1QQMA 3TTCA 3VF6A 3FZFA 3P5JA 1LWEA 3C0BA 5SZTA 4CFBA 2HOEA 2XO7A 4CJ3A 1KLNA 4GV6A 4F2RA 4PY5A 3ZT2A 3F73A 1IKYA 5AQGA 4FJJA 3F5TA 4JK7A 2ASPA 3S41A 1KLMA 4AM7A 3C6HA 5AQOA 3A2FA 2B4JA 1HMVA 4J2BA 4W5OA 2P5GA 3D0PA 2DFFA 1GLJO 1XUPO 3V81A 3RR7A 4GV9A 3G71N 4B9UA 4FK0A 1XHXA 3V9ZA 1RILA 3CCSN 2QTDA 3CPWM 4E7IA 1Q9YA 3VQ6A 4HCCA 3SAHA 3K5OA 1NU0A 1VSLA 3AA2A 1QE1A 3LWLA 2JWLA 3ZT0A 4JKHA 3U3GA 3OYEA 4KFBA 1D9FA 3QEXA 5AQIA 3L4IA 3NF7A 5FDLA 4FWRA 1NOYA 4O5FA 2D0CA 2D0OA 4FWOA 3LDNA 3O4NA 5KTQA 3M8SA 1Y97A 2F9WA 1RDDA 3KK1A 4DS4A 2AP1A 4M3WA 3OY9A 4B9SA 4DFMA 3L0QA 4CVNE 3VMFB 4DSLA 4B9QA 3IKMA 3DRPA 3C95A 4BE1A 1HX1A 3W3DA 1NK4A 2JGUA 3KZBA 4ISGA 1KVCA 2HMPA 4DR3K 1G15A 1NJWA 3D2FB 1KTQA 4FJ8A 2ITMA 2WC9A 2Y1JA 4KREA 4KI4A 5LJVA 3ALYA 3KLFA 2CH5A 5AZIA 2FBVA 1A5XA 5J2QA 3KD5E 4FLTA 3MCAB 3K58A 3DXKA 2P9NB 2O8CA 2IOCA 4EP4A 3SCXA 5M1OA 3MN6A 3IS9A 1RT1A 3E66A 3ZX0A 4YOWA 5GINA 3S5TA 4RWTA 4DTMA 4IFVA 3ZYYX 3AVCA 4DG1A 3HOTA 2O8EB 4X62K 4IEIA 4JRQA 4R5PA 1IG9A 1BO5O 3WQTA 2Z1GA 3VEOA 4IFYA 5AQXA 4Y1CA 2O4GA 1NLVA 3ZT4A 5DM6L 2X78A 4BVOA 3ZCMA 4F9OA 1F21A 3AVFA 3H46O 4ISFA 4QS8A 3AO3A 2O8FA 4CFCA 3ZSWA 4X66K 3HSTB 1E3MA 1KQSM 3L6QA 3QNNA 2B5JA 3QICA 5DK5A 4G9ZA 2HHVA 4M41A 3CJCA 4YNQA 3NHGA 1BWFO 4FWNA 3HM9A 4EFHA 3OYJA 1M1KO 5CYMA 4M3XA 3D2EB 1WN7A 2IS3A 5DM7L 4BACA 2GV9A 3DYAA 2HSTA 4KH5A 4DQRA 4CK3A 4EZ9A 4E1MA 2YI1A 3GL1A 4MLEA 1HYVA 3WQUA 3S9HA 2VQFK 3SQ1A 5IT9O 4DV1K 4OLAA 2A1SA 1EWRA 3RSEA 3T19A 2F7TA 4DUYK 1IJJA 3O3FA 5J2NA 3MWPA 1VHXA 3HO1A 1NG9A 4E3SA 3SZ2A 2O8CB 1KVAA 3K9KA 4RCHA 4LF6K 4H03B 4X64K 4W5TA 1VSDA 1RT4A 4OVLA 4CZFA 3RRGA 2HHIA 4RTFD 2D5RA 4NLBA 3ZT1A 2GTDA 3SQ2A 3BZCA 3NF6A 4QS9A 4BRLA 4OLBA 4DKWA 1BCMA 4CBXA 1OH7A 4NO7A 2YKMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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