3DXKB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0944636
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
211
Chain Sequence
b'QAVLTLYAQGLLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 56
structure length 211
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxkB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxkB02
3VGMA 3DJCA 5I9EB 4BG8A 1TYQA 4FWRA 3QICA 1T6CA 1U2VB 5JICA 2D0OA 3VOVA 1QQOA 3BF1A 1SAZA 3O80A 3WXKA 4FPBA 2P9UB 3VPZA 2HF3A 3L0QA 2QXLA 4M63C 2Q2RA 3DXMB 3WT0A 5E84A 4EFHA 3CJ1A 4FOEA 1DGKN 3GG4A 4NB4A 3DAWA 2Q97A 2CGLA 1JCEA 1MWMA 1Z6RA 2A6AA 4WYBA 1BG3A 4A62A 3M3ZA 3QFUA 2ASMA 3KHYA 2P9NA 2AA4A 3AY9A 3I33A 4H5WA 3L4IA 3VGKA 1BA1A 1NGCA 3D2FB 1J6ZA 2D0PA 3O08A 5AQPA 1X9JA 4DB3A 2QWRA 3VEXA 4I6MA 2IIRA 2V7ZA 4BRGA 3VERA 3UKRB 4RCHA 4NO7A 3ATUA 1NGAA 3LDOA 3LDNA 2D4WA 1CZAN 4H0YB 4CJ7A 4BGAA 5TKYA 2H3GX 3W3DA 3AARA 5AQMA 3CERA 1QZ6A 3O6WA 3UE5A 1BA0A 4BRDA 3EN9A 1GLCG 3VENA 3ENHA 3DXKB 3IUCA 4H5NA 2J4RA 2QWOA 3O5BA 4K43A 5CE3A 3ULEA 3UB5A 5KPZA 2P9PB 2ITMA 1R59O 4O5FA 1BU6O 1P8ZA 1V4TA 5BR9A 2D1KA 4FWOA 2QWLA 1BO5O 4CD3A 4PL8A 3LDQA 2YHWA 1NM1A 3ZETA 3CJ9A 4CZFA 4J8FA 4FWMA 4B1XB 2WUSA 3H3OB 3ZX2A 1ZXOA 3H6EA 2P9LA 5BRDA 4JD2A 4JNEA 2GWJA 3FZLA 4Y0WA 2YCHA 2E20A 3WEEA 1Y64A 1T44A 2VCPA 3BF3A 2PAVA 2GUPA 3MK6A 1WUAA 3HTVA 4BROA 3BUZB 3J8AA 1MDUB 3ZX0A 4BC3A 1WOQA 3QB0A 2VYPA 3U8XA 2GELA 5AQNA 1LCUA 1NGGA 4K25A 1NGBA 3HBTA 3U4LA 3VF6A 1NGHA 4BRNA 3EO3A 3MDQA 2FF6A 5AR0A 3CJAA 1NMDA 3A5MC 3F9MA 3ID8A 3QDKA 3C7NA 2F9TA 2YJEA 3WQTA 4E1JA 2HMPA 4CZLA 3WUHA 3H1QA 2YHXA 3GDQA 4CZHA 5BN8A 2A41A 2IVNA 4YDUC 4FOIA 4BRIA 3A5OC 1IJJA 3H46O 4IO8A 3HZ6A 4YDUA 4PKHA 4CZJA 2IVPA 5AQXA 5F2RA 2IVOA 3MMVA 3MN6A 5AZIB 1KAZA 4GNIA 3P4IA 4O8KA 4EHUA 2W40A 4K41A 4M7XA 4EIAA 3AAQA 1E4FT 4FWLA 4FWPA 4CD1A 2FLOA 1GLJO 3KZBA 3MN9A 4A61A 2AP1A 4B1ZA 1NGIA 3VESA 3CQYA 2E1YA 5KQDA 3RSEB 5AZJB 4A2BA 4CI6A 3LM9A 3R9PA 2NLXA 3CHWA 2P9IA 5AQHA 3FLCO 4FWNA 1ESVA 2BTFA 4BRQA 2QWMA 4JAXA 4CZMA 4XH1A 1RGIA 1NWKA 1EQYA 3O8MA 5LJVA 5EVZA 4CBWA 1BOTO 3D2EB 2GEMA 1V4SA 2E2OA 4JHDB 1QQNA 5AQKA 3VEVA 5AQYA 3KVGA 5JLHA 5FPEA 3VEYA 5AQZA 3IDHA 3MN7A 4BR4A 4BRFA 1BWFO 1K8KA 4H0TB 2P9SA 3I8BA 4PL7A 3ZEUA 5BPLA 1ATNA 4FL9A 3VEOA 2E88A 1HKGA 3R6MA 4IJNA 2DPNA 3CJ7A 4RWTA 5BN9A 5AQRA 1ZC6A 1U2VA 5LJWA 5AZIA 4CZIA 2HF4A 3BEXA 5ADXA 3H45C 3HSCA 2ASPA 2P9UA 1DKGD 1X3NA 2ZGZA 2A42A 4BRKA 2Q1NA 2E2PA 2CH6A 2QWQA 1KAYA 2Q0UA 5AFUH 4H0OA 4BVPA 1YUWA 1HUXA 3DXMA 4H5TA 3UKUB 4IWVA 4BR5A 1BUPA 3LM2A 3WQUA 3WXIA 4WQ5C 5BPMA 2E8AA 1ATSA 2F9WA 3VETA 1IG8A 2YJFA 1GLAG 4RTFD 4BC2A 2QWPA 5FPMA 4WQ5A 5JMVA 3A0IX 4QS8A 3SJHA 3FFKB 3DWLA 1TYQB 4AM7A 1S22A 4IJAA 5AQLA 3D2FA 5BREA 3CJCA 3H1VX 5BRFA 3HM8A 1S3XA 1YXQA 1ZBSA 1NBWA 1GLFO 4B1VA 3UKRA 1Z05A 4QS9A 1HLUA 1SZ2A 1NLVA 3LL3A 3GBTA 5AQUA 3IMXA 4B9QA 3QFPA 3CETA 2Q31A 3AAPA 4DCHA 2E2QA 1NGJA 3VEWA 4BR2A 2P9NB 3MN5A 5EY4A 3EKUA 3A8YA 4BR7A 3VEZA 4LC9B 2Q0RA 4CZEA 3FR0A 2A3ZA 2VWBA 5ELZA 3DXKA 5AQQA 1LOTB 4H5RA 5AQFA 4I6MB 5E26A 4BQLA 4CZGA 2P9KB 1ATRA 4HTLA 2P9PA 1KAXA 4MO4A 4L3QA 3U9DA 3WXJA 5BPNA 4ISEA 4F9OA 3UKUA 3A5NC 5EOYA 3QBWA 4XH5A 4BRHA 4GY2B 3O1BA 5KPRA 4MO5A 2CGJA 4BRAA 3W0LA 4BR9A 2A5XA 4BRLA 3GE1A 3L6QA 3FGUA 3VGLA 5AQTA 5AQIA 4FSVA 1NGEA 2V52B 1H1VA 2UYTA 3EKSA 4FWSA 4H5VA 4AM6A 1YAGA 3O4WA 4JN4A 3A5LC 4BVOA 3ULEB 1QQMA 3ATVA 1X3MA 5FPDA 4HWIA 2QM1A 5KPTA 1RDWX 4B1UB 3S41A 4IXCA 1QHAA 3QMLA 4BC4A 4M7YA 2KHOA 1C0GA 3ENOA 5ADXH 2QW9A 3M1FA 3OHRA 3FZKA 3TPQA 3ZETB 2ASOA 2CGKA 2A40A 2E1ZA 5AQJA 3CQXA 1C0FA 1E4GT 1KXPA 1TUYA 1GLDG 2HOEA 1RFQA 2P9LB 1QZ5A 3EL2A 4JD2B 3EZWA 1DEJA 2ZWHA 1GLBG 2BUPA 2FSNA 3WEEB 4DHYA 4K42A 3GL1A 2P9KA 4C23A 2FSJA 5AQGA 3SLCA 4BQZA 1BDGA 4CBXA 4CBUA 2W41A 4A2AA 4PKGA 4FPAA 4EHTA 1XQSC 4KBOA 4BG9A 4XEIA 5AQVA 1XUPO 2GWKA 4FWQA 3TU5A 4ISFA 4B1YB 5JLFA 3C7NB 2FF3B 3C0BA 1HPMA 4BC5A 5F0XA 4BRMA 5BRHA 3RSEA 1U6ZA 1XC3A 5AZJA 2YHYA 3ZX3A 3JXUA 4FWKA 3U9ZA 4EAHD 5AQOA 2QWNA 1MWKA 1D4XA 2NZTA 2FXUA 1T6DA 3CI5A 3MCPA 1HKCA 3CJBA 3FZFA 1GLLO 3SMSA 5AQSA 5B8HA 3FE1A 2YI1A 3D2EA 4BR0A 4JHDA 4BGBA 5KQ8A 2Q36A 4MLHA 3LDPA 1NGDA 1MA9B 4QS7A 5AQWA 1NGFA 4IZ9A 1JCFA 3G25A 5EX5A 3HI0A 4ISGA 5EXWA 1HKBA 4BRPA 3SK3A 3B8AX 2GTDA 2I7PA 4BRCA 2I7NA 4H03B 2NRHA 3FZMA 1G99A 2CH5A 4H0XB 5F1XA 1SQKA 2P9IB 1YVNA 4WQ4C 4B1WB 2EWSA 3R8EA 1TUUA 5AFUA 4DQ8A 4WQ4A 1HX1A 4Z94A 4CZKA 1OKJA 2OANA 1JCGA 3BP8A 3D7EO 3M6GA 3QBXA 1GLEG 3FZHA 3JS6A 2FSKA 3GOIA 4PKIA 3SMPA 2PBDA 2ZGYA 4FO0A 3IFRA 1Q18A 4H0PA 4MLEA 4BREA 1HJOA 1K8KB 3VF2A 4H0VB 4XH4A 2E2NA 2P9SB 3O1WA 3VF4A 3ZEUB 2ZF5O 3H3NO 5FPNA 5LY3A 3WXLA 2V51B 2V7YA 3CIPA 3LDLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QSSA 4M3UA 1FKOA 4FWRA 2RPIA 1U2VB 3CCQN 3LWLA 1NK9A 1OVYA 3SCXA 4G1QA 2YHBA 3MWTA 2IS3A 1K8AO 1VSJA 4ILHA 3VPZA 1KTQA 2GV9A 3E1YA 2Q2RA 4L8RB 1RT6A 4DTMA 4NB4A 1TL1A 4WYBA 3RMBA 3KIOA 1N34K 2P9NA 4EZ9A 3G10A 3K57A 3L4IA 3R3LA 4K0KK 1TKZA 1MU2A 1BA1A 1NGCA 1RBTA 1S9GA 5CY4A 4CK3A 3VEXA 4DFPA 4FLYA 4KTZA 4RCHA 4O55A 1RTHA 1A5XA 1S6QA 2BANA 3T19A 3LDNA 1BQMA 3RWUA 3CC7N 4CJ7A 2NRVA 5TKYA 1NJYA 1RBUA 1Z25A 5I42A 1B9FA 1YJ9N 1FK9A 3AGKA 3O6WA 1RILA 3DLLL 4JKFA 1RT4A 4DG1A 5CYQA 2G8VA 1HYVA 3U3GA 3SAGA 3IUCA 1RT1A 2VQFK 4I2PA 4M3YA 4FJ5A 4B3SK 1HNIA 2P9PB 3ULDA 3G0ZA 1V4TA 4CEFA 3HP9A 4C8OA 3CFPA 1BO5O 4IG0A 4PL8A 4FJLA 3O9RA 1NM1A 3ZETA 3OYDA 4E1NA 4FWMA 1EXQA 1BHLA 1HNXK 3V9SA 2P9LA 1S1XA 4JNEA 3VQQA 3FZLA 4Y0WA 3U3YA 3C6TA 4DV5K 3WEEA 2HHTA 2X6NA 1VQPN 1ZBLA 3MCAB 1SKRA 3J8AA 3G6EN 1MDUB 4AHVA 4BC3A 3K58A 3RVCA 2GELA 1LCUA 3TI0A 4AF1A 4YOYA 1NJIO 1RTJA 3T1AA 4BRNA 3MDQA 3DMJA 1NMDA 4H4MA 5C10A 1LWEA 4ILGB 3WUHA 3L3UA 2YHXA 3ASMA 4CZHA 4ELVA 2A41A 4FOIA 4O8UA 1KQSM 4AQYK 5H1SQ 1Q82O 1O13A 2KZMA 4GNIA 2OPRA 1XI1A 3DRPA 5A2QO 3LPTA 4FZXC 3B6PA 3ZT0A 1IBMK 3EYZA 1YTAA 3SUNA 1WNSA 4EIAA 4HUFA 4LSNA 2E4LA 2W00A 4FWPA 5HRRA 4CIFA 4JRPA 3SZ2A 4B1ZA 3VESA 2E1YA 4W5OA 5KQDA 2KW4A 1VSLA 3O4QA 1T8EA 2P9IA 4DLEA 3FLCO 3EY1A 1KC8O 2VG7A 4M3WA 3EZ5A 4CERA 1L3VA 3SBGA 4DS5A 5I3UA 1RGIA 4JKEA 1NWKA 3OYNA 4KHUA 3TR8A 1VAZA 5EVZA 4CBWA 1BOTO 2E2OA 4JHDB 2O4IA 4KB0A 1S1UA 5AQKA 3VEVA 5JLHA 2Y1JA 1HMVA 4IG3A 4BR4A 1BWFO 1K8KA 4IBNA 1CXQA 3DI6A 4PL7A 2I5JA 1QSYA 3VEOA 2OZMA 2VGMA 2VQEK 3V4IA 4KHNA 4JI8K 3WNFA 1BIUA 4CFCA 4AHUA 5M1NA 4HCCA 1U2VA 3CXCM 3BDPA 1IH7A 4NXMK 5AZIA 3NH2A 1XHZA 2B5JA 3F2KA 3VQ8A 3AVIA 3QEVA 2IDOA 3L2VA 4RG8A 1HUXA 4H5TA 4B9MA 4NYFA 1BUPA 4WQ5C 5BPMA 4BY9C 2OPPA 2HNDA 1N33K 3VETA 2F7TA 1ZYQA 4RTFD 2QWPA 5FPMA 1RT2A 3A0IX 4QS8A 3DWLA 5J2NA 1S22A 4IJAA 4KH5A 4FJXA 5BREA 3L8BA 5BRFA 2HHVA 1SUQA 1HLUA 1NLVA 5AQUA 1Q86O 5M1QA 3D45A 1VSEA 2P1JA 4BE0A 3SJJA 2E2QA 5FROA 4BR2A 4CGJA 1Q81O 3KKSA 3MN5A 4B3MK 3EKUA 1HQUA 3VEZA 4JEPA 3FR0A 2HHIA 4FJ8A 4RW6A 3KK1A 4I6MB 2UU9K 4OPHA 4GKKK 4GVMA 2P9KB 4JKHA 2GX9A 4ID5A 3CCMN 4HTLA 2P9PA 1KAXA 2XO7A 1J53A 4ISEA 4F9OA 5C0YA 3PIOL 1QSLA 4DTRA 4JKGB 4DMNA 3W0LA 4BR9A 3QERA 4BRLA 2ZJQL 3VGLA 3O9UA 3P5JA 3CCUN 4AM6A 3OYGA 3ULEB 4KRFA 1X3MA 4B1UB 1YITN 3I0RA 1U04A 3ZLJA 1E3MA 2QXFA 3L4QA 1C0GA 4PQUA 1JL1A 5HOOA 3PY8A 3FZKA 3TPQA 2BDPA 4YOVA 3QEWA 3HJFA 2IGIA 4KI4A 1Q7YO 2HNZA 4CJSA 3CQ8A 3P39A 1TUYA 3O9TA 5GINA 3E9LA 1M90O 2OTJN 5LMNK 1GLBG 2FSNA 3NF8A 3RRGA 3L2QA 3HP6A 3AVNA 4CF9A 4WF9L 5AQGA 4K8ZA 3PX0A 5DM7L 4CBXA 4PHTX 5DMRA 1BI4B 1JLAA 3L3VA 4FK0A 3KK3A 3CPEA 3THVA 1XQSC 4BG9A 3HK2A 1VQLN 1JXEA 3PSIA 4CJ5A 4FJKA 5D3GA 4IKFA 3G71N 4CHNA 5GAEP 4KHQA 3C0BA 4BRMA 5BRHA 2UXCK 2YHYA 3ZX3A 4WCEL 4YY3K 4FWKA 1D4XA 3KWIA 4E1MA 4DTXA 1NK4A 5GAGP 4FLZA 3VTIA 3MAQA 3FZFA 1J5OA 4JHDA 2FBVA 2Q36A 3CM5A 3QIOA 1LAWA 3AVAA 2O8EB 5AQWA 3RR7A 3V81A 3G25A 1HKBA 3SK3A 3B8AX 3RMCA 2I7PA 4FLTA 2QEXN 1KVAA 3HVTA 4CJFA 2WC9A 4GV6A 3QLHA 3FZMA 3VQ4A 2NRZA 1G99A 2CH5A 3DLKA 1KLNA 1SQKA 1YVNA 4FW1A 3LZIA 3NF7A 4B1WB 4DV2K 3R8EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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