3DXKB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0944636
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
211
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 56
structure length 211
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxkB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxkB02
1NGGA 4B1VA 4IO8A 5AQKA 5ADXH 2W41A 4BRMA 1NGCA 2HOEA 4NO7A 4CZHA 3BF1A 3ZEUB 4K25A 3C7NA 4BC3A 4DHYA 3OHRA 2GEMA 1K8KA 1WOQA 1MWMA 3GG4A 3J8AA 2ITMA 3VEVA 4ISFA 3D2EB 3ATUA 2EWSA 3CJAA 2E2NA 4BRDA 2IIRA 3AAPA 3UKUA 3IFRA 4MO5A 2F9TA 3ZETB 4FWSA 4A62A 1HPMA 3R9PA 2P9KB 4O8KA 4FWLA 4YDUC 1BWFO 1E4FT 4H0TB 4BVPA 1BO5O 5EXWA 5AQTA 1NGFA 4H0YB 4BGAA 4BQLA 4H5VA 5AFUA 1XUPO 5AZIB 5BRHA 5FPDA 5LJWA 3GBTA 4WQ4A 1ZBSA 4JHDA 3KVGA 4IXCA 3DXMB 2YCHA 2P9LA 1GLJO 4Z94A 3UE5A 1J6ZA 2KHOA 3HI0A 5E26A 3VPZA 3AARA 5AQUA 4ISEA 3AY9A 4FWKA 1Z05A 1TUUA 1BDGA 2ZWHA 3IDHA 2NZTA 3D7EO 5FPEA 1RGIA 4CZEA 3BEXA 5AQIA 3LDQA 2E2QA 3HM8A 4CZIA 4A61A 5KQ8A 2HF4A 3R6MA 2P9IB 5F0XA 3QBXA 3D2FB 3VGLA 3O80A 4BR9A 2IVNA 3SMPA 4BR0A 3ENOA 1ATSA 3A5OC 3RSEB 1KAXA 1NLVA 3H3OB 4FWPA 1H1VA 3VENA 3UB5A 2V52B 4BRKA 1U6ZA 2I7PA 2P9PB 4XEIA 4EHTA 2YHXA 1MDUB 3H1VX 2CGJA 4JN4A 3UKRB 4K41A 1YXQA 4GNIA 5AQRA 1BA1A 2D4WA 4FSVA 3S41A 3VEXA 4XH1A 3IMXA 3A5NC 3VEWA 1KAZA 2GELA 3IUCA 2QWLA 4JAXA 4BRIA 1SQKA 1WUAA 1QHAA 4BC5A 5BPMA 2QWNA 5JLFA 2YHWA 2WUSA 5BR9A 3WT0A 3MN6A 1BOTO 2P9UB 4BC4A 3TU5A 1GLFO 3G25A 3EO3A 2VYPA 1BG3A 5BN9A 3O4WA 2P9SA 4WYBA 5BRFA 3W3DA 1GLEG 4RCHA 1GLBG 3AAQA 3H6EA 1QZ5A 3VOVA 5AQHA 5EOYA 5BPNA 4GY2B 4BG9A 1NGJA 3BP8A 4FPAA 5F1XA 5AQPA 5AZIA 4H0VB 4H0OA 1QZ6A 4PL7A 4BRFA 4O5FA 2GUPA 2NRHA 2D0OA 3CIPA 3CI5A 5I9EB 2E8AA 3WQTA 4EIAA 5KQDA 4CZLA 3QDKA 1T44A 3LM2A 4B1WB 1NBWA 3L0QA 4FWRA 2FSJA 3ATVA 3JS6A 1GLCG 1TYQA 2I7NA 3QICA 4FWNA 4C23A 4QS9A 2A5XA 2Q36A 3R8EA 2D0PA 2YI1A 5AQVA 5AQOA 4BG8A 4AM6A 1HJOA 2P9IA 4JD2B 5AZJB 1G99A 2A40A 1U2VB 3KHYA 4BRGA 1EQYA 1QQNA 3W0LA 5JLHA 4BQZA 3MMVA 3EKSA 3VF4A 1RDWX 4IWVA 3JXUA 1DGKN 1JCFA 3M3ZA 3CERA 1IG8A 5EX5A 1NGEA 3ZX2A 3WEEB 4WQ5A 2E1ZA 2HF3A 3O08A 4I6MB 3QFPA 2FSKA 1LCUA 3LDOA 4KBOA 3QBWA 5JICA 2J4RA 3VETA 1GLDG 2YHYA 1SAZA 3L4IA 1NGHA 3LDLA 1ZXOA 4B9QA 4FOIA 4MLEA 3U9DA 3DXKA 4RWTA 1JCGA 2ZGZA 1X9JA 3QB0A 2E88A 3CQXA 5AQXA 2VCPA 2PAVA 3GDQA 3O1BA 3C7NB 3A5LC 4JNEA 1NGDA 4XH4A 3ZX3A 2QW9A 3CHWA 3HBTA 5KPZA 3DJCA 2IVOA 5AR0A 2E2PA 1GLLO 1K8KB 2P9UA 3FLCO 2IVPA 3ULEA 3VEOA 4H0PA 5ADXA 3GL1A 1X3NA 4MO4A 4EHUA 5BPLA 4BRLA 4B1ZA 4HWIA 5CE3A 4EAHD 4FWQA 3FR0A 4PKIA 3UKUB 1C0GA 3FZMA 1NWKA 3KZBA 2QWRA 4PKGA 1XQSC 5FPNA 2QM1A 3FZLA 3WXIA 3FZHA 1MWKA 3CJBA 2BUPA 3A5MC 3WXKA 5TKYA 5JMVA 3ZEUA 2QWMA 1QQMA 5EY4A 5KPTA 2Q0RA 4CI6A 3GE1A 3EKUA 3CJ9A 4FPBA 3VESA 3ENHA 4JHDB 2Q1NA 3GOIA 4RTFD 2P9LB 3D2EA 3H46O 4WQ4C 3FFKB 3H1QA 2GWJA 1NGBA 5E84A 4L3QA 3VF6A 5AFUH 4BRPA 4YDUA 3ZETA 3CETA 1T6CA 5BRDA 1HLUA 1Y64A 3F9MA 4PL8A 2P9KA 4J8FA 5AQQA 1DKGD 4FWOA 3WUHA 4CBWA 1U2VA 3VEYA 2OANA 2PBDA 3O6WA 4BRHA 4BREA 4H03B 3QFUA 1OKJA 1BUPA 4E1JA 2GTDA 4ISGA 4CJ7A 5AQGA 3O5BA 1TUYA 2ASPA 1HX1A 2F9WA 3U8XA 4BC2A 4BGBA 2W40A 2FSNA 4H5RA 1HKGA 3CQYA 3DXMA 5AQWA 3DAWA 3EN9A 4IJNA 2CGLA 1SZ2A 4B1YB 2YJEA 1V4SA 2D1KA 2V51B 1KAYA 4Y0WA 4BR5A 1NMDA 4XH5A 4FL9A 3WXLA 3FZKA 3A8YA 5LJVA 1CZAN 2QWOA 4BRNA 1RFQA 1T6DA 4CZMA 2FXUA 1E4GT 2H3GX 3LM9A 3M6GA 3D2FA 4BRCA 3BF3A 5LY3A 3VEZA 3VF2A 2E20A 2E2OA 1BU6O 3RSEA 4H5NA 3O1WA 1HUXA 1ZC6A 5AQLA 4CD3A 2QWQA 2A6AA 4FO0A 3DWLA 5AQMA 5AQSA 2P9PA 4BRAA 3SMSA 4B1XB 3FZFA 1D4XA 1XC3A 3ZX0A 2GWKA 3UKRA 4LC9B 2P9SB 4B1UB 2ZF5O 3CJ1A 4HTLA 4BROA 1NGAA 3BUZB 3HSCA 4BR2A 2P9NB 4CD1A 1S22A 2UYTA 1HKBA 4MLHA 4EFHA 3HZ6A 3H3NO 3M1FA 4F9OA 3CJ7A 3EL2A 2CH6A 2E1YA 4M63C 4BRQA 2A42A 1V4TA 2FLOA 2ASMA 2BTFA 4FWMA 3L6QA 4M7YA 5AQFA 1KXPA 1C0FA 1ESVA 2CGKA 3U4LA 3VGMA 2Q0UA 4H5WA 4A2BA 3HTVA 1GLAG 3SJHA 1TYQB 2YJFA 4CZGA 1LOTB 4CZJA 2AA4A 3SLCA 5F2RA 3VGKA 4DQ8A 1HKCA 3U9ZA 4CBXA 5BREA 3VERA 1BA0A 1ATRA 5AQJA 4H0XB 4FOEA 2Q97A 3H45C 3MK6A 4IJAA 1YVNA 2ZGYA 4PKHA 4CZKA 2QWPA 5ELZA 5AQYA 3WQUA 2Q2RA 3FE1A 2AP1A 2HMPA 3I8BA 2V7YA 3A0IX 4NB4A 2V7ZA 4CZFA 3ID8A 4K42A 3O8MA 4WQ5C 1P8ZA 4IZ9A 1Q18A 1X3MA 3LL3A 4DCHA 1ATNA 2FF6A 5EVZA 1DEJA 2A3ZA 2Q31A 3QMLA 1JCEA 3MN5A 1IJJA 1QQOA 3B8AX 4QS8A 5AQNA 4JD2A 5AZJA 4DB3A 2A41A 3DXKB 1NM1A 3MN7A 3WXJA 2DPNA 5FPMA 5AQZA 4AM7A 4BR4A 3CJCA 3MCPA 3P4IA 4CBUA 3EZWA 5B8HA 3MDQA 4QS7A 3MN9A 4H5TA 2FF3B 3SK3A 3TPQA 3I33A 1S3XA 5KPRA 2NLXA 3FGUA 3WEEA 5BN8A 3ULEB 1NGIA 4I6MA 3LDPA 4K43A 1MA9B 4BVOA 1YAGA 2CH5A 4BR7A 2ASOA 3LDNA 2QXLA 1YUWA 1R59O 1Z6RA 4M7XA 4A2AA 2P9NA 2VWBA 3C0BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LPUA 4I2PA 1NGGA 4B1VA 5ADXH 4FLUA 4JKGA 4M3WA 1NGCA 4NO7A 4CZHA 3ZEUB 4TSXA 1BCOA 3NH2A 4JKCA 4MDAA 4AF1A 1RT1A 3OHRA 4DTMA 2W6KA 3J8AA 3PSIA 5HP1A 4L8RB 2G8VA 2ITMA 3VEVA 4OO1J 4ISFA 4BECA 5C0YA 2E2NA 3AO5A 3AAPA 4CJLA 4B3RK 1NK6A 3UKUA 3IFRA 3ZETB 1HPMA 3TR8A 4JRPA 1BIZA 1NJXA 1I39A 1BWFO 2E6MA 1XI1A 5EXWA 1L3VA 1NGFA 4CK2A 3ZLJA 5FPDA 5AFUA 5AZIB 1ZBSA 3SQ2A 4IXCA 3DOLA 3MAQA 1YT3A 1J6ZA 3HI0A 3PX0A 4FJLA 5AQUA 1X9MA 1VSMA 4ISEA 1EP4A 1TUUA 3TSUA 3HOTA 1RGIA 3VQCA 4CZEA 3LDQA 4EP5A 2E2QA 3OYFA 1VQPN 1RTHA 3ASMA 4A61A 3KLGA 2HF4A 3R6MA 4NYNA 2P5OA 4FJ9A 3RWUA 2KZZA 3OYMA 2DY4A 3VQ5A 1ATSA 3HPHA 1KAXA 1VSEA 1NLVA 3H3OB 3THYA 2UXDK 4FLVA 4BRKA 2D0CA 4YOWA 2VQEK 2I7PA 3SQ0A 4E72A 3DLGA 1NJIO 4XEIA 3TAQA 2OPPA 3P1GA 4GNIA 4OVLA 1BA1A 1S6PA 1TL3A 3VEXA 2O8CA 1TL1A 4CESA 1DLOA 4K8ZA 1WSHA 3VEWA 5MLCQ 1RBRA 2QWLA 4JI2K 1RBTA 1SQKA 4BWJA 4FM0A 1WUAA 5LL6Z 3HO1A 3RMDA 4E1MA 4FK4A 4DV6K 5BR9A 4DQQA 3MN6A 4OGEA 1WLJA 3VQAA 4OLBA 1BOTO 2P9UB 4BC4A 1BG3A 3VN5A 4YOXA 5BRFA 3CCRN 4A5BA 1KLMA 4BG9A 1IKYA 5KI6A 4A59A 1VQ7N 2C1GA 1WSIA 2HBJA 4HCBA 4WE1A 2GUPA 4FXDA 2BH1A 2NRHA 2D0OA 3OVNA 3SAGA 4JI6K 4PY5A 5CZ1A 4FWRA 3QICA 4FWNA 1Q9YA 1BIUA 3R8EA 3LANA 3S9HA 2YI1A 3VQDA 3V81A 4JKHA 4AM6A 2P9IA 1WB9A 3E01A 2A40A 1VK0A 3CCQN 1QSSA 2HW3A 3CYGA 1EQYA 1QQNA 3KK7A 2W00A 3TABA 2OZMA 1RDWX 1JCFA 4IDHA 1IG8A 5EX5A 1NGEA 3ZX2A 4FJXA 3SYZA 2E1ZA 2HF3A 3O08A 4I6MB 1FW6A 4O44A 1LCUA 4HUEA 3LDOA 3QBWA 4CFAA 3VETA 3L4IA 1VQ6N 1ZXOA 4B9QA 1X9SA 4FOIA 4MLEA 3U9DA 3DXKA 1A5VA 3QB0A 4RW7A 4C1NI 5HRPA 3CQXA 3QNNA 2PAVA 2QXFA 1NGDA 4XH4A 3NF9A 4Z4IA 1S9GA 5KPZA 4YHHK 2IVOA 2E2PA 2E6LA 3FLCO 1NK8A 3VEOA 3SCXA 3SNNA 4IG3A 2P1JA 1RDDA 1X3NA 4MO4A 3CPWM 1N32K 4EAHD 3UKUB 3P39A 4A5AA 3KZBA 1J54A 5M1FA 2QWRA 4AILC 3C6AA 2QM1A 3JSMA 3FZLA 1Q9XA 3VQPA 4CJKA 3ZT1A 3CJBA 3CC4N 2E5LK 4KH6A 1NKBA 4I9QA 5EY4A 1ZBLA 3THWA 2Q0RA 3DLHA 3GE1A 4JLHA 4E7KA 3PX6A 4AHTA 5M1OA 3D2EA 3H46O 1OVYA 4CEDA 2GWJA 1NGBA 2D0AA 5AFUH 4BRPA 4YDUA 3I8DA 3LP3A 1HLUA 2Z1GA 3F9MA 3F9KA 1DKGD 4H4OA 1U2VA 3S3NA 3VEYA 2OANA 4H03B 3WNFA 3MEEA 4IBNA 1RCHA 4ISGA 4A57A 2KFZA 4RG8A 5AQGA 2ZD1A 2GUIA 1GOCA 1T3VA 2ZM6K 3U8XA 1XC9A 4BGBA 2W40A 4H5RA 1S9EA 2YNHA 3HYFA 5J2MA 4YY3K 4CHQA 2CGLA 1VQLN 2YJEA 4DSEA 4W5QA 1XNRK 4AQYK 4N76A 4BR5A 1U47A 1C0UA 4CCHA 4DSKA 5KRTA 2O8CB 3CXCM 4KHNA 1B92A 1RT7A 1E4GT 3EYZA 3M6GA 3D2FA 5TKWA 4BRCA 3BF3A 3L2QA 1BI4B 2E2OA 4DR1K 3TARA 4YOTA 3J80O 3ZT4A 4CGDA 2GX9A 1ZC6A 5CR4A 2A6AA 1LW2A 4BRAA 3L2VA 2P9PA 2HNDA 4NCBA 4JS5A 3TAPA 3ZX0A 4M41A 2G8WA 2YNFA 3UKRA 3QESA 1CZBA 1LWCA 3DRSA 4C1NK 3KLEA 1QE1A 4HTLA 1NK7A 1YTUA 3BUZB 1YJ9N 2DTUA 4CD1A 1ASWA 3VQQA 5JS2A 4NCGA 4EFHA 1Q8IA 3O9UA 3RVCA 2KZMA 2HB5A 3CQ8A 3AV9A 1NNEA 3QIPA 4M63C 3MX2A 4RW6A 3NF7A 2FLOA 1C0TA 3L6QA 3VQBA 1KXPA 1FKPA 1ESVA 3NE6A 3OYNA 2O8FA 3HTVA 1VQON 4X66K 3HP9A 4KHYA 4CF2A 3U9ZA 2YNIA 4LD0A 3ZSXA 1JKHA 3VERA 1BA0A 1ATRA 1DT9A 4CHOA 2DFFA 4LF8K 4LF6K 1RT2A 3MX5A 2Q97A 4J2AA 4Z4HA 3H45C 1LWFA 4IJAA 2ZGYA 4PKHA 4CZKA 3RMCA 2QWPA 5AQYA 3WQUA 1VRTA 3FE1A 3VTHA 4DV1K 3I8BA 3G4SN 1A5WA 3TANA 4CEFA 1VSIA 5E41A 3DOKA 2V7ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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