3DXKB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0944636
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
211
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 56
structure length 211
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxkB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxkB02
4CZMA 4EIAA 3CJ9A 2YJEA 4BC2A 2YJFA 4F9OA 1NGDA 3LM9A 1T44A 5AZIA 1S3XA 5BRFA 1BDGA 3A5OC 5BPNA 2YHYA 4BRCA 4JD2A 1RFQA 3EL2A 3EN9A 1H1VA 1ZXOA 3EKUA 2E2OA 3ULEB 1QQOA 5F0XA 4JAXA 5BR9A 3TPQA 4IJAA 3H6EA 1YUWA 3FGUA 3U9DA 4CBWA 5KPTA 5FPDA 1Z05A 1NM1A 4CBXA 4BRDA 2CGJA 3ZETB 4H0VB 3UKUA 3VGLA 2V7YA 5AFUA 3VGMA 2CGLA 5E84A 1X3MA 3CJ7A 3ATVA 3D2FA 3VEWA 1J6ZA 3CJCA 1QQMA 2A5XA 4IJNA 3FZHA 4FWOA 3SJHA 3SLCA 2P9UA 3QB0A 1D4XA 3ZEUA 3FFKB 2HOEA 2QWPA 3CJAA 4H0YB 5BN8A 1K8KB 2ASPA 2P9KA 1XQSC 3MMVA 4A2AA 3IFRA 4Z94A 5KQDA 3SMPA 4PKIA 3FZFA 1RGIA 4BVPA 3M6GA 4IZ9A 1U2VA 4BGAA 2VCPA 1WUAA 4H0XB 3BF1A 1SZ2A 2ZGYA 4J8FA 5AQHA 2IIRA 4M63C 1E4FT 3DAWA 1X3NA 3UB5A 1X9JA 3P4IA 1TUYA 3H45C 4BR2A 1GLEG 4M7YA 4XEIA 3GOIA 3WT0A 3IDHA 3VEYA 3MN9A 2A40A 1E4GT 1DGKN 4EHTA 4Y0WA 4E1JA 4JHDB 2FLOA 3S41A 1BG3A 1R59O 4FSVA 3BEXA 3BP8A 1DEJA 4FWPA 1JCGA 1EQYA 2ASOA 3O80A 3VEVA 3SMSA 5KQ8A 5LJVA 4CZEA 3VERA 2QWMA 4EFHA 2E88A 4CJ7A 4WQ5C 3O1WA 3WXLA 4ISFA 4H5WA 3DWLA 4CZHA 4HWIA 2P9PA 2YCHA 3KZBA 1MA9B 1YXQA 2NLXA 1NBWA 1WOQA 3KHYA 4CD1A 3ZX2A 2ASMA 3GBTA 3WXIA 3W3DA 3VEOA 4A2BA 1ATSA 4RWTA 5AZJB 4EHUA 3CETA 2QXLA 2YHXA 3FLCO 4H03B 3RSEA 5ADXH 3QBXA 1XUPO 3QFUA 4HTLA 1NMDA 3FR0A 1GLBG 5AQIA 5LY3A 3OHRA 2QWOA 3UKRB 2FF6A 3ZX3A 4B1ZA 3D7EO 2Q36A 3H46O 2E20A 4K42A 5AFUH 1NGJA 1T6DA 3QDKA 1V4SA 1Z6RA 2V52B 4FPAA 4IO8A 3W0LA 4MLHA 1ZBSA 5AQSA 4A62A 2E2PA 1CZAN 2I7NA 2QM1A 5BREA 4PL8A 5AQVA 4I6MA 2BTFA 3VGKA 3CJBA 4XH5A 4FOIA 5AQOA 2GTDA 1MWKA 2V7ZA 4WQ4C 1NLVA 2P9SA 2Q0RA 4BR7A 4DB3A 1G99A 2P9NA 1ESVA 1GLJO 3D2EA 1HX1A 4O8KA 2A3ZA 5AR0A 2P9IA 5AQWA 5KPRA 3WEEB 3LL3A 4FPBA 4BR5A 4FO0A 1NGGA 3R6MA 3GG4A 3MN6A 3ENHA 2FXUA 4CD3A 4IXCA 1HKGA 5AQKA 1IJJA 2ZF5O 3DXMA 1KXPA 1KAZA 4MO5A 4H0PA 4H5TA 5KPZA 5FPNA 4O5FA 2QWLA 3WXKA 2CH5A 1NGIA 1YAGA 3U9ZA 5JLFA 3IMXA 3QBWA 3LDNA 4BQLA 5BRDA 1U6ZA 5F2RA 3HSCA 4H0OA 3EZWA 1NGFA 1TYQB 1KAXA 4FWNA 4BROA 3C7NA 4QS7A 2IVNA 1HJOA 2P9LB 5JICA 5ELZA 4NB4A 2Q31A 3MN5A 4B9QA 5FPEA 1BA0A 5AQLA 1LOTB 3DXKB 4BC3A 3A5NC 2DPNA 5AQRA 3LDPA 4B1WB 2D0PA 4AM7A 4CZKA 1GLAG 5AQGA 1NGAA 1QHAA 1SQKA 3A8YA 3IUCA 3HZ6A 2OANA 3ULEA 3TU5A 3HI0A 1ATRA 2GEMA 1HPMA 2NZTA 4WQ4A 3UE5A 4JN4A 1QQNA 2HF4A 5AQTA 5AZIB 2PAVA 3JXUA 2KHOA 3CI5A 4CZFA 2BUPA 4BRLA 2AA4A 2PBDA 3EKSA 5EOYA 4JD2B 3CQYA 3ZETA 3ID8A 3SK3A 2E1ZA 3A0IX 4B1XB 4GNIA 2QWRA 4NO7A 2GUPA 4K41A 3ATUA 3VF6A 3BUZB 3A5LC 5BN9A 3KVGA 2F9TA 2A41A 3FZMA 3VENA 4BRFA 4FWLA 1NGEA 4CBUA 1RDWX 3UKUB 4PL7A 5AQJA 3A5MC 2A42A 5EXWA 1BU6O 3JS6A 3QMLA 1K8KA 2QWQA 4CZIA 3M1FA 3D2FB 1LCUA 2CGKA 3HBTA 3VEXA 3AAPA 4BRAA 4CZJA 4BR4A 5BPLA 2P9UB 3QFPA 3ZEUB 1QZ6A 3VPZA 4QS9A 1GLCG 3CQXA 1C0GA 1NGCA 4H5NA 4XH4A 4BVOA 1ZC6A 4BGBA 4C23A 2Q2RA 2P9KB 3O5BA 2Q97A 2J4RA 5E26A 4B1VA 4DHYA 4M7XA 2WUSA 4CZGA 3L6QA 5LJWA 3AARA 5AQZA 2FSJA 4BRKA 1U2VB 2GELA 3LDQA 3O08A 4B1UB 3AAQA 3MN7A 1DKGD 4FOEA 4H5RA 3FZKA 3HTVA 3LDOA 3R9PA 2ZWHA 2QW9A 3VOVA 1MDUB 1C0FA 4JHDA 2HF3A 1P8ZA 3VETA 5BRHA 2CH6A 2V51B 4WQ5A 2VYPA 1BWFO 3ENOA 4ISGA 1NGBA 2GWJA 2W41A 5AQMA 1BUPA 2ZGZA 2AP1A 3H3NO 3O8MA 4FL9A 4BC5A 1BO5O 4BRPA 3CHWA 1NWKA 3VF4A 4ISEA 5F1XA 5AQFA 3MK6A 5ADXA 2UYTA 1TUUA 5BPMA 4LC9B 3G25A 2IVOA 4JNEA 1NGHA 3O4WA 4BC4A 1SAZA 2GWKA 2Q0UA 4BQZA 4KBOA 3LDLA 3GDQA 4YDUC 4XH1A 2EWSA 2D4WA 4CZLA 2E2QA 4RTFD 1IG8A 2P9PB 2D1KA 4DQ8A 3HM8A 2VWBA 4QS8A 2I7PA 1GLLO 1GLDG 4K43A 2YHWA 1JCFA 5AZJA 3QICA 3VESA 1XC3A 4FWKA 2E1YA 3M3ZA 2IVPA 1OKJA 2E8AA 5EY4A 4GY2B 3CIPA 5EVZA 2H3GX 5FPMA 3GE1A 3UKRA 4CI6A 4AM6A 5I9EB 3WQTA 3FE1A 3DJCA 1MWMA 3RSEB 1HLUA 1V4TA 1ATNA 5JMVA 4FWSA 3MCPA 3L4IA 1Y64A 3ZX0A 1QZ5A 1S22A 5AQYA 1YVNA 2F9WA 3EO3A 4BRIA 1HKBA 4RCHA 1Q18A 4FWRA 3WUHA 4BRHA 5JLHA 4PKGA 3VF2A 3U8XA 4MLEA 2E2NA 3WXJA 2A6AA 4BG8A 3VEZA 4BRMA 4I6MB 3BF3A 5EX5A 4DCHA 3L0QA 1HKCA 2FSNA 4BRNA 3WEEA 3F9MA 4PKHA 3O1BA 1BOTO 2W40A 2YI1A 4BRGA 3CJ1A 2Q1NA 2ITMA 1T6CA 2P9SB 3MDQA 2P9NB 3C0BA 4WYBA 4YDUA 3I8BA 4BG9A 4FWMA 2FF3B 4H5VA 3D2EB 4FWQA 5B8HA 3LM2A 3H1VX 5AQXA 2P9IB 4A61A 4L3QA 4BRQA 4EAHD 4H0TB 3WQUA 3GL1A 1JCEA 5AQPA 2QWNA 1KAYA 4IWVA 4BR0A 5AQUA 2NRHA 3DXMB 3U4LA 1TYQA 3B8AX 1GLFO 4BREA 3J8AA 3CERA 2P9LA 4BR9A 4K25A 5AQQA 1HUXA 2HMPA 5AQNA 1BA1A 3I33A 3H3OB 3FZLA 2D0OA 3DXKA 5CE3A 2FSKA 3AY9A 5TKYA 3O6WA 4B1YB 3R8EA 3H1QA 3C7NB 4MO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHHK 2YJFA 3AVFA 2P1JA 3O3GA 2GUIA 5M1QA 4YY3K 3S9HA 3A5OC 4JD2A 3SQ2A 4BWMA 1ZXOA 4YNQA 4IOXA 2E2OA 3ULEB 1C1AA 5BR9A 3D0PA 3MWTA 3TPQA 4R79A 4BE7B 3WXMB 1YUWA 3P5JA 4IO9L 3V4IA 5KPTA 3D45A 1YF5L 4CBXA 2XO7A 5LMUK 1Q8IA 1NOYA 2V7YA 4DTOA 4EP5A 3CJ7A 1XI1A 4LF9K 3SJHA 3RRHA 1HNIA 3HPOA 2P9UA 1D4XA 3FFKB 3CCQN 4RW8A 3CJAA 1VAZA 2BDPA 4FJ9A 3VQDA 4F4KA 2ASPA 2Y1IA 3OTOK 1M90O 3CCMN 4CJKA 5M1OA 1JLFA 4FJIA 1K6YA 4B9LA 2VCPA 4H0XB 4JI8K 1SZ2A 4AHVA 4JKAA 4FVMA 2IIRA 3T69A 3M5RA 4DV1K 1RTHA 3H45C 4HCBA 1QS4A 4BR2A 3OS2A 3V9SA 2A1RA 3WT0A 5KGXA 4W5TA 2O8BA 3QEXA 3LANA 3O9UA 2A40A 1XC9A 2F96A 4JHDB 2FLOA 1S9EA 1WB9A 4KTWA 3CXCM 1DEJA 3HK2A 2W6KA 4AHUA 1I3AA 3VEVA 4A5AA 4J2AA 4NYFA 5LJVA 5DK5A 5M1PA 1VQNN 2QWMA 4IFYA 1ZBUA 2RE2A 3E66A 3QIPA 4WQ5C 3OYCA 3OY9A 5HL7L 3ZT1A 3QLHA 1BL3A 4CZHA 4HWIA 4NXMK 4FLZA 4Z4CA 5GAGP 2F8SA 4FM0A 3ZSYA 1NBWA 2KFNA 1NJYA 3DLHA 2WBNA 4CD1A 3ZX2A 4M3RA 4DR7K 3W3DA 3KLHA 3KIOA 1VQ7N 2E6LA 4CF0A 1NKCA 1QSLA 2DFFA 3QETA 1HRHA 4RWTA 4JKCA 2YHXA 2W00A 3CMAN 4DLEA 5KI6A 4DQQA 4F3OA 2F7TA 1VSLA 3UKRB 2FF6A 3ZX3A 4B1ZA 4UQGA 3CFPA 3VTIA 2YKNA 5CHIA 2OZMA 1XHZA 4ELUA 4KHUA 4DR4K 3THWB 1VRUA 3AO2A 3P38A 4FPAA 3W0LA 3QESA 2I7NA 4PL8A 5AQVA 1N33K 3NGZA 3EE8A 3L2WA 4R5PA 1LWFA 2ZJQL 3VQ9A 2VGNA 4FOIA 2E6MA 1MWKA 2O8FB 3CPWM 4WQ4C 2Q0RA 1M1KO 4DB3A 1ESVA 1D9FA 1GLJO 3JSMA 1KVBA 3BZKA 3K5MA 4FO0A 1BI4A 4CD3A 4M45A 4OJRA 4KI6A 3LWMA 3DXMA 5IT9O 3AVJA 4H0PA 3L2UA 4H5TA 5KPZA 4W5QA 4O5FA 2QWLA 5C15A 3TAEA 4L8RB 3DOLA 3SAFA 3NH1A 1QVFM 1YAGA 4I7FA 5FRNA 1NJXA 4Z4IA 1NGFA 5SZTA 2GX9A 3OYAA 2P9LB 4Q0BA 4ELTA 1VSKA 4NB4A 4YOYA 4B9QA 5FPEA 3CD6N 4ID5A 3THVA 4CZKA 2ETJA 1N36K 1VHXA 2EHGA 3HZ6A 1R0AA 3TU5A 3HI0A 1ATRA 4W5NA 1HPMA 1SUQA 3HT3A 3O3FA 4BRLA 1C0UA 2AA4A 1QSSA 3SPYA 4AHTA 3EKSA 4DG1A 4JD2B 3I0RA 2WOMA 1LAWA 2HBMA 3TABA 3VQPA 3OBYA 4I2PA 4YOVA 3SK3A 3K59A 4BEBA 4K41A 3MXMA 4FJ8A 1ZBFA 1D8YA 1KSPA 2ZE2A 3E9OA 2A41A 3L3UA 3VQ8A 4GW6A 1RTJA 3VENA 4BRFA 1RT6A 4KREA 4FJ7A 1DTTA 1NGEA 3CF5L 4CGHA 1WSEA 1KD1O 4DR2K 3CG7A 4FJKA 4X65K 1BU6O 4DFJA 1K8KA 3L4QA 3F9KA 4CZIA 1J5OA 4DQPA 4N5SA 4N47A 1O1WA 3AAPA 4BRAA 1VQKN 2P9UB 2VQEK 3NF9A 4LF5K 1GLCG 3CQXA 5TKWA 4DSEA 4BGBA 4LH5A 4IG0A 2BH1A 4OPJA 2LSNA 2Q97A 5E26A 4M7XA 4JV5K 3L6QA 3AVBA 3K9KA 5AQZA 4NCBA 3LP2A 4BRKA 2OTJN 2GELA 5KGWA 2PY5A 1VSEA 1VSFA 2NUBA 4ILHA 3I8DA 2JWLA 1TKTA 2Z1IA 3VOVA 5C2DA 3F73A 1P8ZA 2PYLA 1CZ9A 3VETA 4E89A 4JI6K 4WQ5A 1ITGA 2VYPA 4DMNA 4JI7K 3OYBA 1NGBA 2QI2A 2ZGZA 3H3NO 3O8MA 1YI2N 4C8LA 4ZHRA 3CHWA 1NWKA 4JI0K 1S1TA 5F1XA 3NDKA 4M3WA 3NF7A 1BQMA 3DRRA 4K8ZA 3TSQA 4RG8A 4JNEA 5CZ2A 4F2SA 3AVAA 3O4WA 4BC4A 1SAZA 2GWKA 3OYFA 1HYZA 2O8EA 3LDLA 4GKKK 2YNFA 2VQFK 2D4WA 5HOOA 2E2QA 1KC8O 2NRXA 3OYJA 5FDLA 2RF2A 2VWBA 5M1KA 3LP1A 5A2QO 5GINA 4DTPA 2IAJA 3KLFA 1W0HA 2IVPA 2E8AA 4DFKA 3SCXA 4YOTA 1CXUA 1RDCA 2RHKA 3VQ4A 4CI6A 3OS0A 4OX9K 5HP1A 4Y1DA 1NU0A 5CR4A 1G15A 3LWLA 3WQTA 3Q7CA 4IOCL 5C2FA 1MWMA 1HLUA 1ATNA 3LAKA 5KTQA 3AVNA 1SKRA 2HHIA 1VSDA 4B9NA 5J2MA 2QXFA 2F9WA 3QNNA 3ZSXA 3UIQA 4FWRA 4F2RA 3KK3A 1EETA 1WAFA 5HLFA 4C8KA 2HW3A 4ICLA 5JLHA 3U8XA 3MEEA 2E2NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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