3ATVA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-bound and mg ion-free state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atvA04
3BF3A 3VESA 5KPZA 2ZWHA 2ITMA 3WXIA 3TU5A 1H1VA 2GWJA 3VF2A 2ASOA 4FO0A 2D0OA 4XH1A 4BC4A 1DGKN 5BREA 1NWKA 1YXQA 2E2PA 5AQTA 1JCEA 2IVNA 3H1QA 5FPEA 2P9NA 2H3GX 2PAVA 1GLDG 3DAWA 3ULEB 4JAXA 4H0YB 3LDPA 1YAGA 2W40A 3M3ZA 4FPBA 3EN9A 3LM2A 3VETA 1C0GA 2V52B 3MN7A 5LY3A 1NGHA 4BRDA 1ESVA 1NGBA 3QBWA 1LOTB 3J8AA 4ISFA 4WQ5A 3H6EA 3R8EA 3UKRA 3VEWA 5ADXA 1XUPO 2P9KA 5JLHA 4JNEA 3CERA 2I7NA 4QS8A 2BTFA 3EKUA 3O1BA 1E4GT 3VF6A 4BGAA 4BC2A 5AQOA 4A62A 1YUWA 3MK6A 3MN5A 3WQUA 4WQ5C 1RGIA 2A5XA 1DKGD 3GDQA 4H0XB 2P9UA 1NLVA 4NB4A 2E8AA 4WQ4C 4M63C 2ZGZA 3KHYA 3A8YA 4PKIA 2GEMA 3FGUA 1SQKA 3ATUA 2P9PA 3HBTA 3GE1A 3WQTA 4JHDB 4H5NA 3A5NC 4BRGA 2CGLA 1T6CA 3SJHA 3FZLA 5ADXH 1BA1A 1KAZA 3RSEA 2AP1A 2ASPA 2FF3B 4DHYA 4PKGA 1TYQA 2P9KB 1HPMA 2E88A 3KZBA 4QS9A 5FPMA 3WXKA 4B1ZA 5AFUH 4H5VA 3OHRA 5EVZA 3CJ9A 4XH4A 4CZEA 4YDUC 2QM1A 3VEOA 2P9IB 4DB3A 5AQUA 3SMSA 3GBTA 4BR7A 4BRAA 2YJFA 2F9TA 3U9DA 2P9UB 2VYPA 4CD3A 4CZIA 4K41A 5BPNA 2CH5A 4IJAA 4BC5A 1ZC6A 3QDKA 4BC3A 4FWPA 3U9ZA 3B8AX 3CJCA 2P9PB 5F1XA 3ZEUB 2A6AA 5ELZA 1QZ5A 4LC9B 5FPNA 1X3NA 3A5OC 3ID8A 2ASMA 4FWOA 5EXWA 3DXMA 5LJWA 5BN8A 3A5LC 4BR5A 3ULEA 2BUPA 5TKYA 2IVPA 5KPTA 4BG8A 1SZ2A 1QQNA 4H0OA 4K42A 3GG4A 1S22A 4BVPA 4FWNA 1KAYA 1NGDA 3TPQA 2Q97A 3FR0A 4AM7A 3H45C 2YI1A 1HKCA 3QMLA 2Q2RA 2HOEA 3H46O 4M7YA 1SAZA 5LJVA 1QHAA 1MA9B 5F2RA 5JMVA 2QWRA 4F9OA 3VEXA 4BVOA 4H5RA 5AQYA 3I8BA 4CZHA 4BR2A 5BRHA 4A2BA 2E2OA 4IXCA 4BRLA 5AQHA 2GELA 2I7PA 4WYBA 4FWRA 3D2EB 3FZMA 1G99A 1MWMA 3F9MA 3S41A 3DXMB 3UB5A 4BG9A 5BPLA 1NGAA 1V4TA 4JHDA 4MLHA 3FZHA 5AQFA 1GLLO 3A0IX 3VGLA 1NMDA 1BA0A 3CHWA 2CGJA 4H03B 3BEXA 3LL3A 3VERA 4IJNA 4H0VB 2D1KA 1BO5O 3UKUB 3HI0A 2V51B 3ENHA 3O4WA 5AQGA 3GOIA 1KAXA 1T44A 1HX1A 3VGMA 1X3MA 3LDNA 4NO7A 1Y64A 3FZFA 2QWQA 3W0LA 3BUZB 2E20A 3CI5A 1QZ6A 1WOQA 3ZX0A 3ZX2A 1MDUB 3R6MA 1GLBG 3MMVA 3IFRA 5AQZA 2A40A 1NGFA 2P9LA 2IVOA 1NGCA 2V7YA 3WXJA 3QFUA 2YJEA 3FE1A 3BP8A 4H0TB 4M7XA 4CZJA 3P4IA 2NZTA 4MO4A 4BQZA 4DCHA 3JS6A 3ZEUA 4Z94A 2A42A 4EHTA 1JCFA 4BRPA 3LDQA 5E26A 3DJCA 4O5FA 4FWQA 4JD2B 1V4SA 2A3ZA 4AM6A 1T6DA 1D4XA 3DXKB 4C23A 3HTVA 4DQ8A 1BU6O 3R9PA 1U6ZA 5JICA 2FLOA 3O6WA 5AQWA 1Z6RA 4GY2B 1Z05A 3AAQA 2WUSA 3C0BA 4FSVA 3L0QA 2FF6A 3ENOA 2YCHA 1BDGA 4JN4A 3D7EO 4CBUA 4E1JA 1TUUA 2YHWA 2P9LB 2E1YA 2UYTA 5BPMA 1NM1A 4EIAA 3FLCO 3O1WA 4J8FA 5AQKA 3U4LA 3QICA 2E2NA 5E84A 2GUPA 1LCUA 1GLAG 2F9WA 4K43A 5CE3A 3VEVA 1ZXOA 4BGBA 4CBWA 5AQVA 2P9SA 3D2EA 4XEIA 4A2AA 4BREA 3SK3A 1K8KB 3CIPA 1DEJA 3D2FA 3H3NO 5AQMA 3M6GA 4CBXA 1ATNA 4FPAA 3DWLA 4BRKA 1BG3A 4FWMA 4I6MA 3WEEA 2Q0UA 3GL1A 1WUAA 4CZFA 3QFPA 3UKUA 3HM8A 1NGGA 4GNIA 2IIRA 3AAPA 5JLFA 2QXLA 2HMPA 3VEZA 3SLCA 4CZMA 1EQYA 1J6ZA 2Q0RA 3A5MC 2A41A 4RTFD 5BN9A 3WT0A 2YHXA 2HF4A 4XH5A 3MN9A 1OKJA 3IMXA 3C7NB 1BUPA 4CI6A 1Q18A 4RCHA 3UE5A 4B1VA 4BRHA 5AQPA 1BOTO 4L3QA 1QQMA 3KVGA 5BR9A 3CJBA 2QW9A 1NBWA 5AQIA 2FSJA 4BR0A 2P9SB 1U2VB 4BQLA 3EO3A 3VEYA 3D2FB 4EHUA 3O8MA 1E4FT 4JD2A 5KQDA 4RWTA 1GLJO 4CZGA 4BRQA 4H5WA 4I6MB 1XQSC 3WEEB 3DXKA 4FWKA 3LDLA 2FXUA 3ZX3A 4BRCA 2ZF5O 2EWSA 2D4WA 4FWSA 3VPZA 3ZETA 1YVNA 1IG8A 1QQOA 1ATRA 4HTLA 4QS7A 1HLUA 1R59O 4CZKA 3L6QA 5BRDA 1S3XA 2ZGYA 5EY4A 3CJAA 2Q36A 3H3OB 3BF1A 3MDQA 5AQRA 1TUYA 1CZAN 1GLFO 5EX5A 1ZBSA 2FSKA 2FSNA 4WQ4A 4FL9A 3ATVA 3CQXA 1RDWX 4MLEA 4PKHA 5AQJA 3AARA 4FWLA 5AQSA 3EL2A 3WXLA 4FOIA 1XC3A 4B9QA 5AFUA 3VOVA 3CQYA 3VF4A 2DPNA 3M1FA 1K8KA 3QBXA 5KQ8A 2VWBA 2QWMA 2QWOA 3EZWA 5AQXA 1HUXA 4HWIA 1HJOA 2KHOA 2YHYA 3ZETB 4H5TA 1NGJA 4B1WB 4PL7A 3CJ1A 4B1UB 5EOYA 3LDOA 4ISGA 2P9NB 1X9JA 2QWLA 2E2QA 3FZKA 4MO5A 3AY9A 2QWNA 2J4RA 4YDUA 2V7ZA 1GLEG 1HKBA 3WUHA 5F0XA 4BRNA 3SMPA 3UKRB 4BR4A 3C7NA 1IJJA 3HSCA 4O8KA 4B1YB 4EFHA 3L4IA 5FPDA 1KXPA 5AQNA 1JCGA 3MCPA 3CETA 2QWPA 1P8ZA 5AZJA 3I33A 4A61A 4IWVA 3CJ7A 4BRIA 2GWKA 1U2VA 4Y0WA 4BROA 5BRFA 2W41A 3O08A 2Q1NA 4IZ9A 2VCPA 4IO8A 3LM9A 5AZIA 3U8XA 4KBOA 3QB0A 2P9IA 2NRHA 3H1VX 3JXUA 1HKGA 5AR0A 3IUCA 4EAHD 5B8HA 3IDHA 2HF3A 2CGKA 3O5BA 2Q31A 2OANA 3O80A 5AQQA 3FFKB 5AQLA 4BRMA 4CZLA 1MWKA 3HZ6A 4FOEA 4K25A 3RSEB 2E1ZA 3MN6A 4H0PA 5KPRA 5I9EB 1RFQA 1TYQB 3G25A 4BR9A 3VGKA 4ISEA 4CD1A 2GTDA 4CJ7A 5AZJB 1ATSA 2AA4A 4BRFA 1NGEA 2CH6A 5AZIB 3VENA 3W3DA 1C0FA 1BWFO 1NGIA 1GLCG 2PBDA 4PL8A 2D0PA 4B1XB 2NLXA 3EKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RTVA 2D0BA 3L2QA 5KPZA 4E7HA 3OYFA 3OJSA 1TK5A 4AHRA 4XH1A 3THXA 5BREA 3VQ4A 2UXCK 2E2PA 1SV5A 1C6VA 2PAVA 2A1RA 2QA4N 4JAXA 2VGNA 1YAGA 3TANA 4CFAA 2P51A 1NG9A 1NGHA 4BEBA 4BRDA 1UGLA 1ESVA 4CF9A 4WQ5A 3SF4D 4DS5A 3SCXA 4U67L 2E3GA 3O1BA 4BE1A 2O8BB 2FBXA 1RTIA 1NOZA 3NHGA 3THWA 1WSEA 4FZZA 4FJGA 2IOCA 1N4NA 1RGIA 3SPZA 2P9UA 2HMIA 1G15A 2E8AA 3ASMA 2NNWA 3AV9A 1K73O 1OVQA 3A8YA 2GEMA 2LI7A 2QXFA 1QHTA 4O4GA 3VQ9A 3I55N 3GE1A 5E41A 2IGIA 2MBKA 3OYHA 1ZBLA 5ADXH 1BA1A 4RW7A 1XMOK 5FRMA 4OPAA 2ASPA 3SV3A 4C1NI 4GVEA 3M8PA 4FXDA 4FM2A 1ZBUA 1KV0A 4UADE 3KZBA 1RTDA 3V1OA 2GUIA 1N5YA 2FBTA 1NJYA 1OVYA 3O3GA 3QINA 5M1OA 4CJQA 3U9DA 4CHYA 4K41A 2HBKA 2CH5A 3HOTA 4BC5A 1U04A 1ZBIA 1YITN 2O8DB 4CEFA 3B8AX 3VQ8A 3SZ2A 2P9PB 3NAEA 5F1XA 4U7BA 2OYQA 5FPNA 1O1WA 1KFSA 4UAEF 3JYTA 1TVRA 3L2VA 5GIPA 4W5OA 4BR5A 4JKAA 3DMJA 1VQ6N 4HVJA 1RBRA 3WNGA 1K9MO 3SYZA 1JL1A 2YEOA 3BZKA 1QQNA 4K42A 4RW8A 2AJQA 1S22A 4FWNA 3TPQA 4LF8K 1FKOA 4DU1A 3H45C 4FK2A 2Q2RA 2E0HA 4F4KA 1KFDA 1HJRA 4CF1A 2KKZA 3WNEA 1TKDA 2NY8X 4LFCK 4LFAK 3VEXA 3THYB 4NYFA 2WTUA 4ZTFA 2I7PA 2HSTA 3D2EB 3FZMA 5C24A 3S41A 3UB5A 2OTLN 4JHDA 2E2FA 3RMCA 3S3OA 1B9FA 3A0IX 3VQ5A 1NMDA 1BA0A 5EU7A 2CGJA 3E9OA 3BEXA 4CFDA 1GOAA 1TAQA 4H0VB 1BO5O 4HHFA 1KLMA 3TTDA 3T1HK 2BE2A 1HNIA 3HI0A 3PSMA 5AQGA 1P0AA 1T44A 1HX1A 3VGMA 5C10A 1S1VA 2O4GA 1U45A 3SQ1A 3FZFA 3PIOL 3BUZB 3CI5A 3CCRN 3ZX0A 1P00A 1VQ5N 3NVKA 1RTHA 5T7BA 4E7LA 1WSFA 5AQZA 1WSIA 2A40A 3OYAA 4CGGA 4AH9A 3AVJA 1NK8A 3L4QA 2F7TA 4O0JA 2HHTA 4JI0K 4DKWA 2I5JA 3EE9A 1ITGA 1RT7A 3JS6A 4ILHA 3ZEUA 3QEVA 3O4QA 1VRTA 1D5AA 2KYQA 4CJFA 5E26A 1TL1A 4O5FA 4DTUA 4FK4A 2Z1IA 3KP0A 3CMEN 3C94A 4M3UA 4MQ3A 4C8NA 1A5VA 4KPYA 5KRSA 4OKEA 1U6ZA 3WXMB 1C56A 4GY2B 3K59A 5C25A 3L0QA 2VQEK 3PX0A 1HQEA 4PWDA 2BGGA 3DLGA 4KTZA 1BDGA 1BCGA 5GAEP 2UUCK 4JEPA 3P39A 3D7EO 1Q8IA 2RHKA 2E1YA 2W00A 1FW6A 3FLCO 2KFNA 5CZ2A 1Q9XA 3NF9A 3U4LA 1MYNA 5E84A 4JKDA 3OYDA 4FVUA 3G0ZA 3HPHA 5CE3A 4UJ0A 1ZXOA 4CERA 4DFMA 4UY8O 4O0IA 5IWAK 1RT3A 3PLAA 2P9SA 1S6PA 5KK4A 5H1SQ 2G8FA 1VK0A 5MLCQ 3MXIA 3V9UA 4ILJA 4FPAA 1BG3A 4FWMA 4I6MA 4BDZA 3BGRA 1YT3A 1WAFA 1LWFA 3HM8A 4GNIA 2IIRA 5JLFA 1NPIA 2HMPA 2QTDA 4DR1K 4DTSA 1TV6A 2Q0RA 1K6YA 4H4MA 3WT0A 3O9TA 3CG7A 1BUPA 4CI6A 4KH5A 1LW2A 4R79A 1BI4B 4BRHA 4F2RA 1IKVA 3HM9A 4L3QA 3CFOA 5BR9A 3KVGA 3CJBA 2QW9A 2NUBA 3TSUA 4OJRA 5AQIA 4UAFE 1XC9A 3MEGA 1NK4A 3D2FB 4KRFA 1E4FT 1I6FA 4JD2A 1I6GA 4N76A 4BWJA 2Z1GA 4Z4HA 3DXKA 4FWKA 4LD0A 3NCIA 1QVFM 3ZX3A 1NRAA 3VPZA 4C8MA 1YVNA 4J2DA 1IG8A 1WSJA 3MX5A 1L5UA 4ID1A 3T7ZA 2LJMA 3CC2N 3ITHA 1BQMA 4YHHK 1VSMA 2Z1HA 3N4QA 1T7AA 4Z0UA 5LMNK 1GLFO 3C6HA 3SI6A 2XY6A 2FSKA 1I39A 2HB5A 4IFVA 4WQ4A 4FL9A 4CJWA 3QLHA 4LY7A 3CQXA 4FM0A 4MLEA 4KH6A 2QKKA 4FWLA 3OYLA 4JKHA 5AFUA 5JS2A 3VOVA 2XY5A 5CZ1A 4FLVA 1HNXK 1QE1A 3CW4A 4O5BA 1NK0A 1HJOA 2E3FA 2KHOA 2YHYA 4CIGA 4NLCA 3THXB 1VSLA 3HO1A 3K9KA 4PL7A 4B1UB 3VQ7A 3PX4A 4DR4K 4C8KA 2QWLA 3HSTB 4CEQA 4DTOA 4C8OA 4MO5A 3F73A 1Z26A 2G8KA 2RF2A 3ENBA 3CF5L 3AO5A 3ZLJA 3AY9A 3E7RL 4FJMA 4A57A 2JWLA 5JVHL 4BRNA 5F0XA 2HHHK 4DSEA 4EFHA 1LWEA 3L4IA 4F3OA 3KLGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3RTV A;  2D0B A;  3L2Q A;  5KPZ A;  4E7H A;  3OYF A;  3OJS A;  1TK5 A;  4AHR A;  4XH1 A;  3THX A;  5BRE A;  3VQ4 A;  2UXC K;  2E2P A;  1SV5 A;  1C6V A;  2PAV A;  2A1R A;  2QA4 N;  4JAX A;  2VGN A;  1YAG A;  3TAN A;  4CFA A;  2P51 A;  1NG9 A;  1NGH A;  4BEB A;  4BRD A;  1UGL A;  1ESV A;  4CF9 A;  4WQ5 A;  3SF4 D;  4DS5 A;  3SCX A;  4U67 L;  2E3G A;  3O1B A;  4BE1 A;  2O8B B;  2FBX A;  1RTI A;  1NOZ A;  3NHG A;  3THW A;  1WSE A;  4FZZ A;  4FJG A;  2IOC A;  1N4N A;  1RGI A;  3SPZ A;  2P9U A;  2HMI A;  1G15 A;  2E8A A;  3ASM A;  2NNW A;  3AV9 A;  1K73 O;  1OVQ A;  3A8Y A;  2GEM A;  2LI7 A;  2QXF A;  1QHT A;  4O4G A;  3VQ9 A;  3I55 N;  3GE1 A;  5E41 A;  2IGI A;  2MBK A;  3OYH A;  1ZBL A;  5ADX H;  1BA1 A;  4RW7 A;  1XMO K;  5FRM A;  4OPA A;  2ASP A;  3SV3 A;  4C1N I;  4GVE A;  3M8P A;  4FXD A;  4FM2 A;  1ZBU A;  1KV0 A;  4UAD E;  3KZB A;  1RTD A;  3V1O A;  2GUI A;  1N5Y A;  2FBT A;  1NJY A;  1OVY A;  3O3G A;  3QIN A;  5M1O A;  4CJQ A;  3U9D A;  4CHY A;  4K41 A;  2HBK A;  2CH5 A;  3HOT A;  4BC5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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