3ATVA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-bound and mg ion-free state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atvA04
2FSKA 1NGGA 2Q1NA 5TKYA 4BRKA 4JAXA 1T6CA 4H0OA 2Q2RA 2H3GX 1KAYA 3ZEUB 3VESA 5FPNA 3LDOA 4WQ5C 3O80A 3SMPA 4EAHD 3I33A 2VCPA 3GBTA 3CJ1A 3UKRA 5I9EB 1XC3A 2GELA 4J8FA 1BA1A 5AQPA 2ZF5O 3DXMA 3CIPA 2YCHA 4IO8A 1YVNA 3MDQA 4XH1A 3MN6A 3O4WA 5EX5A 4CZJA 5AFUH 4BC4A 2E2PA 5AQFA 1XQSC 1S3XA 2V7ZA 4BRIA 3WXLA 1ZC6A 4IJNA 3ZX2A 4BRGA 5BPLA 4B1XB 1ZXOA 1MA9B 2P9IA 5AFUA 3J8AA 3H46O 4EHTA 1ATSA 2E2NA 4GY2B 2Q0UA 3QBWA 3VENA 3WEEB 1QQOA 1JCEA 3GDQA 4C23A 4DQ8A 1EQYA 4YDUA 4CI6A 1KAXA 3UKUA 4BREA 4I6MB 4FL9A 4A61A 3WQTA 3A8YA 3O8MA 2ITMA 4BRHA 3HZ6A 5B8HA 1MWKA 2QWQA 3VEWA 2CH6A 4PKIA 2V51B 1NGJA 3DXMB 4RWTA 5AQIA 3O1WA 1HKGA 3TPQA 5AQKA 3CJ7A 4CZLA 3FR0A 1KXPA 3C0BA 4XH4A 5ADXH 2D0PA 4LC9B 4B1UB 4HTLA 1DGKN 2P9UA 5FPDA 1IJJA 4QS9A 3QDKA 1QZ6A 2W40A 4EIAA 3H6EA 4DB3A 5BN8A 2F9WA 3SJHA 3W3DA 1GLCG 4BGBA 4BG9A 4IZ9A 1BA0A 1DEJA 2A3ZA 3WXIA 1HPMA 4JHDA 3ULEA 4A2BA 1HKCA 4BR4A 4ISGA 2QWMA 2P9LA 3BF1A 2AP1A 5AZIA 2IVPA 3A0IX 4WQ4C 1P8ZA 2J4RA 4GNIA 2QWOA 2NLXA 3VEXA 3AY9A 1T6DA 2E20A 5BRFA 4WQ5A 3ZEUA 1G99A 1E4FT 3M1FA 1BWFO 3FZFA 3ZETA 4PKHA 2NRHA 3VOVA 5BPMA 3VGLA 2I7PA 3VF6A 1Z6RA 3VEOA 1WUAA 4B1WB 4H5VA 1RDWX 2P9UB 2CH5A 4RTFD 4NO7A 2ASMA 3LL3A 3GG4A 3IDHA 1NGAA 5KPRA 3FE1A 3MN7A 4MLHA 3M3ZA 4IXCA 3HSCA 1MWMA 2EWSA 5BR9A 5AQRA 1GLEG 3QICA 1H1VA 4BRCA 3EKSA 3QMLA 4FWOA 4CZMA 4FOIA 5EY4A 5KQ8A 1IG8A 1U6ZA 3G25A 1NGFA 4BRFA 3FFKB 3OHRA 3VPZA 5F0XA 3EZWA 3FZLA 3A5OC 3S41A 1NGBA 1R59O 2GWKA 3AARA 3L0QA 3LM2A 5AZIB 3H1QA 3WEEA 2A6AA 3H3NO 2E1YA 4ISFA 3O1BA 3I8BA 3ZX3A 2KHOA 3GE1A 3DWLA 4I6MA 4PL8A 3ZETB 4BRMA 1QHAA 3SMSA 4FWKA 4CD1A 3FGUA 5AQGA 1JCFA 3VF4A 1GLBG 4RCHA 3MN5A 4B9QA 3FLCO 1YAGA 2Q0RA 2YHYA 3H45C 3BUZB 3R6MA 2YJFA 1NBWA 3FZKA 1SQKA 3EL2A 4H5RA 1LCUA 2PBDA 4FWNA 4CJ7A 3QFPA 4KBOA 1D4XA 3RSEB 4CZGA 4B1YB 5KPZA 3HBTA 5AQNA 4BRDA 1HX1A 2ZWHA 4BVOA 5AQUA 3CERA 3A5MC 1LOTB 4FWPA 5AQOA 3R8EA 3EN9A 1Q18A 3H1VX 3IMXA 3L6QA 2ZGZA 4WQ4A 1X9JA 3D2EA 3DAWA 4FPAA 4DHYA 4JNEA 2HF4A 2QXLA 5KPTA 2CGLA 5AQMA 4XH5A 3O5BA 4AM6A 2CGKA 4FO0A 3CJCA 2A42A 5AQJA 5EXWA 1RGIA 2YHWA 4EFHA 5BN9A 5EVZA 3SLCA 4H0PA 2GTDA 4BC3A 1HKBA 1BG3A 2GWJA 1S22A 5AQZA 3VF2A 2BUPA 4BQLA 2E88A 3BF3A 4H0XB 4BC2A 5JLFA 1X3MA 2IIRA 1GLDG 4A62A 1DKGD 5JMVA 4CZHA 2FSNA 4FPBA 4BG8A 1HLUA 3ATVA 1HJOA 1NGIA 5AQQA 3W0LA 1OKJA 1T44A 3GOIA 4FWLA 4BRAA 4H5NA 5AR0A 4BGAA 3D2EB 1YXQA 2HF3A 1NM1A 3ZX0A 3CJAA 4MO4A 2A40A 3KVGA 1C0FA 4DCHA 4CD3A 4L3QA 3LDQA 5FPMA 4K25A 2VYPA 1ESVA 4IJAA 3A5LC 2PAVA 4E1JA 1K8KA 1SAZA 4BR0A 1CZAN 4H0VB 5AQYA 5AZJA 3U9DA 3O08A 3VEZA 4H03B 3VGMA 2IVNA 3U4LA 2IVOA 1NGHA 2E1ZA 2V52B 4Y0WA 2E2QA 1TUUA 5AQVA 4B1VA 2FLOA 3RSEA 5F1XA 3HM8A 3L4IA 3P4IA 4AM7A 1U2VA 2F9TA 1NMDA 3QB0A 4CZIA 3FZMA 4FWQA 1NWKA 3CQYA 3KZBA 2ASOA 1ATNA 3D2FA 2P9PA 1NLVA 3CHWA 2FXUA 5AQSA 4K41A 2QM1A 4NB4A 3IFRA 2BTFA 3LDLA 3WT0A 1K8KB 2V7YA 1HUXA 3CI5A 3H3OB 4EHUA 1BU6O 4FSVA 3DXKA 1QQMA 5AZJB 2HOEA 4O8KA 5CE3A 2A5XA 3LDPA 1NGCA 1GLJO 3JS6A 4H0YB 5AQWA 4BROA 1GLLO 2FSJA 2E8AA 5JICA 1U2VB 1BOTO 2P9NB 2Q31A 3CQXA 4FWSA 1BO5O 2FF3B 3CJBA 2VWBA 2QWLA 3ENHA 4B1ZA 4CZKA 3C7NB 3D2FB 2P9PB 4H5TA 2FF6A 4BRQA 4BRPA 1WOQA 1KAZA 1GLAG 2GEMA 3VGKA 4BR2A 3WXJA 2QWNA 5BRHA 1C0GA 2A41A 3IUCA 4CBUA 2P9SB 4JD2B 3VERA 2WUSA 4FOEA 4CZFA 4BC5A 3QBXA 2Q97A 2D1KA 3DXKB 3O6WA 1QQNA 3JXUA 4PL7A 2W41A 4PKGA 1NGDA 4MLEA 4K43A 3VETA 4M63C 1ATRA 4QS8A 4HWIA 2P9KA 1X3NA 2YI1A 5E26A 4ISEA 5JLHA 3DJCA 5F2RA 3AAPA 3UKRB 1XUPO 5BREA 1TYQA 3TU5A 3VEYA 4FWMA 4IWVA 5AQXA 1BUPA 5AQTA 3MK6A 4CBXA 2CGJA 2Q36A 3ATUA 3GL1A 1RFQA 5LY3A 2ASPA 4A2AA 1QZ5A 4JN4A 3UE5A 3MN9A 5AQLA 3HTVA 3AAQA 5ADXA 4BRNA 3BEXA 2QW9A 1J6ZA 2I7NA 4XEIA 4BR9A 2P9IB 3EO3A 4WYBA 1GLFO 1BDGA 3R9PA 4O5FA 1Z05A 4MO5A 3CETA 4BR7A 1TUYA 2YJEA 4YDUC 3UKUB 3B8AX 3U8XA 4F9OA 5LJVA 2P9KB 3LM9A 3D7EO 2D4WA 2OANA 1NGEA 1E4GT 4H5WA 1TYQB 2NZTA 3SK3A 5FPEA 3ENOA 3A5NC 3LDNA 1Y64A 2QWRA 3CJ9A 1V4SA 4K42A 4M7YA 4BVPA 3EKUA 2P9NA 3M6GA 5KQDA 3U9ZA 1YUWA 3FZHA 3UB5A 2GUPA 3MCPA 4CZEA 5AQHA 1SZ2A 1V4TA 2ZGYA 3C7NA 2D0OA 3BP8A 5E84A 4BR5A 3WUHA 4CBWA 4BQZA 4FWRA 4BRLA 3KHYA 1JCGA 3HI0A 5LJWA 2QWPA 3F9MA 1MDUB 2DPNA 3MMVA 4QS7A 3VEVA 2HMPA 5BPNA 2P9SA 4JD2A 3WQUA 3ID8A 4M7XA 5ELZA 5BRDA 5EOYA 4JHDB 4Z94A 2UYTA 3ULEB 2E2OA 2YHXA 4H0TB 3QFUA 2AA4A 2P9LB 1ZBSA 3WXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HSTB 1TKDA 1EETA 1NK7A 4DV1K 3H08A 5E41A 1CN2A 1QTMA 3PUFA 4GKKK 3ZEUB 2E4LA 2B68A 3O80A 1I2VA 3SMPA 3TAMA 3CJ1A 4LD0A 1LWEA 3CXCM 1XC3A 4KHWA 4I9QA 4OLBA 1BA1A 2DFFA 4JS5A 2HHVA 3MDQA 5M1OA 3KLIA 1HJRA 2WONA 2W6LA 3THYA 3WNHA 4IBNA 2I5JA 4BC4A 5AQFA 3OYFA 1XQSC 3WXLA 4IJNA 5C15A 1ZVGA 4BRGA 4B1XB 1YIJN 3H46O 4EHTA 1ATSA 3KJVA 4F8RA 4FXDA 3EZ5A 5K14A 2UXBK 2GV9A 3VN5A 4CJ3A 5GIPA 1YJWN 3RTVA 1ZUTA 3O8MA 3J7YP 1HPZA 2YC1C 2YILA 1XRSB 4CJKA 2QWQA 3VEWA 1ASWA 4PKIA 1VQNN 3TTFA 3OJSA 1NGJA 4FM0A 1SL0A 4RWTA 5AQIA 1IO2A 1OVYA 1KXPA 4XH4A 5ADXH 1CZBA 3G10A 1ZU3A 5GAGP 4Z4IA 4QS9A 2YIOA 1IKVA 1VSFA 1IV0A 4DB3A 2XY6A 4KAZA 1HNIA 1FW6A 3CM6A 1GLCG 3DOKA 3MWTA 4BG9A 4JEPA 3P38A 4K0KK 3V9WA 3L8BA 3QEIA 1DEJA 1TV6A 1L4VA 1HPMA 3ULEA 4A2BA 4AHSA 2KGQA 2IGIA 5DMRA 4BR4A 4FLUA 3U6FA 3HRGA 3BF1A 4CEAA 2IVPA 3MX5A 2GUIA 1P8ZA 4DR7K 2YX6A 1OZZA 2E20A 2LR3A 3AVJA 1YITN 3OYJA 3MXMA 1BWFO 3RWUA 1EKEA 3ZETA 4PKHA 4DSEA 2KJAA 4JKCA 3D0PA 2A7TA 2EHGA 1Z6RA 1LQQA 1SEGA 4B1WB 3SUPA 1RT2A 2CH5A 3OS1A 4YHHK 4QCLA 1BMRA 3CCSN 1QHTA 2IAJA 3E9LA 3MXIA 3FE1A 1LAVA 1SL1A 4JRQA 4LF5K 1H1VA 4O5BA 1VSLA 3G25A 4X66K 4FLVA 4B9VA 2JDQD 3FZLA 4GVMA 3CD6N 1OH8A 1TK0A 4L8RB 5KRTA 1NJXA 4OO1J 1NK6A 4B9SA 4IFYA 3MECA 3AVMA 2FBYA 3H3NO 3P31A 3TANA 3J7ZO 4DTJA 1TAUA 1HRHA 2NY8X 5GADP 3GE1A 3DWLA 3L2UA 2G2KA 4BRMA 4CEDA 4CJPA 2VQEK 3SMSA 4FWKA 4FLZA 3SQ4A 3CCQN 3CCJN 4RCHA 4B9QA 1VQ7N 3AO3A 3DLEA 3O9RA 4DQIA 2YNGA 1VSHA 3RMAA 2O8EB 3FZKA 3S3NA 4H5RA 1LCUA 2PBDA 3QFPA 4KBOA 3AA4A 4NYFA 1XNRK 3RSEB 2QXFA 4B1YB 3HBTA 3AO1A 1L3TA 5AQNA 2D0BA 2N2QA 1VRUA 4DSFA 4AEIA 3U3YA 2E6MA 1KFDA 3A5MC 1LOTB 3O3HA 3SYZA 3EN9A 1FH3A 4B9NA 3L6QA 3K9JA 4DSJA 1ZFUA 1X9JA 3ZSXA 3L2QA 1K9MO 2FC0A 3M8RA 1QVGM 3VQDA 2UUBK 4E19A 1XMQK 1RBSA 4XH5A 1RCHA 3O4NA 3EYZA 2N69A 4OPKA 5AQJA 1B92A 4FJIA 2VQFK 3LANA 4IEIA 4KO0A 4BDZA 1SL2A 1QE1A 3RR8A 1FKOA 4ELVA 2HMIA 4KHSA 2BUPA 2OPQA 2DTUA 3BF3A 5JLFA 2O8BA 4IKFA 3CFRA 1DKGD 4OKJA 2E3FA 2FBVA 2FSNA 4FPBA 2R7YA 1HLUA 5CHIA 4HE7A 3F9KA 3NF8A 3ZSRA 1NK4A 2HBLA 1NGIA 3TWHA 3G0ZA 1OKJA 4HUGA 1S1UA 3GOIA 4FWLA 4CHQA 5AR0A 2P51A 2XHBA 3D2EB 1MU2A 3AVHA 1L3VA 5C42A 1VQ6N 1IKYA 4DCHA 1L3UA 4CD3A 3KP1A 1A5XA 4L3QA 3ZSWA 3HVTA 2YNFA 1B9FA 1ZYVA 4NCAA 1CZAN 1VQPN 5AZJA 1X9SA 4K8ZA 2LJMA 4H03B 4ID5A 4DTUA 3CFPA 1DTTA 1BI4B 5FRMA 3OBYA 4Y0WA 4MDBA 4Z4CA 4FZXC 1TKZA 1P0AA 5F1XA 3HM8A 3OYAA 2Y1JA 1Q9YA 4N56A 2LN8A 1T3VA 1RBUA 3HXMA 3QB0A 4FK2A 3O9SA 1T7EA 4KHPK 1ATNA 4DG1A 3JYTA 4LSNA 3I55N 3HP6A 3PSIA 4DTNA 2D0AA 3KK2A 1GOCA 4DV5K 5J2MA 4DSLA 3DYAA 3LDLA 1QQCA 3O9UA 3V81A 1Q81O 3WT0A 3QNNA 1HUXA 4KHUA 4PY5A 4FSVA 2GL1A 2A5XA 1GLJO 4CGDA 3QEXA 3ZT0A 2OZMA 2NRVA 1RT3A 4JI4K 3Q7CA 4DS5A 2E8AA 1S1VA 4DTSA 3BDPA 1U2VB 1RNHA 4CHYA 3KKSA 1VQ4N 3CJBA 1BCGA 2QI2A 4DV3K 3C95A 4CZKA 3EE8A 3RRGA 1C6VA 2QWNA 3CM5A 1YJ9N 3IUCA 4F2RA 3SQ1A 4Z4GA 2P9SB 4CGIA 3NGIA 5HRRA 1S9EA 4RW6A 4FOEA 4BC5A 1SV5A 3AVBA 2Q97A 1C56A 2HHTA 1KTQA 3O6WA 4FLXA 4BEBA 1HQUA 4CIEA 1Q82O 2W41A 4MLEA 4ILGB 4FJLA 1VQ8N 3ZT4A 3T1YK 4ILJA 1ATRA 1RBVA 1JLBA 3BK3C 5E26A 3R2VA 3K2PA 3VTIA 3P1GA 4ISEA 4KTQA 2KFNA 5F2RA 1JLGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HST B;  1TKD A;  1EET A;  1NK7 A;  4DV1 K;  3H08 A;  5E41 A;  1CN2 A;  1QTM A;  3PUF A;  4GKK K;  3ZEU B;  2E4L A;  2B68 A;  3O80 A;  1I2V A;  3SMP A;  3TAM A;  3CJ1 A;  4LD0 A;  1LWE A;  3CXC M;  1XC3 A;  4KHW A;  4I9Q A;  4OLB A;  1BA1 A;  2DFF A;  4JS5 A;  2HHV A;  3MDQ A;  5M1O A;  3KLI A;  1HJR A;  2WON A;  2W6L A;  3THY A;  3WNH A;  4IBN A;  2I5J A;  4BC4 A;  5AQF A;  3OYF A;  1XQS C;  3WXL A;  4IJN A;  5C15 A;  1ZVG A;  4BRG A;  4B1X B;  1YIJ N;  3H46 O;  4EHT A;  1ATS A;  3KJV A;  4F8R A;  4FXD A;  3EZ5 A;  5K14 A;  2UXB K;  2GV9 A;  3VN5 A;  4CJ3 A;  5GIP A;  1YJW N;  3RTV A;  1ZUT A;  3O8M A;  3J7Y P;  1HPZ A;  2YC1 C;  2YIL A;  1XRS B;  4CJK A;  2QWQ A;  3VEW A;  1ASW A;  4PKI A;  1VQN N;  3TTF A;  3OJS A;  1NGJ A;  4FM0 A;  1SL0 A;  4RWT A;  5AQI A;  1IO2 A;  1OVY A;  1KXP A;  4XH4 A;  5ADX H;  1CZB A;  3G10 A;  1ZU3 A;  5GAG P;  4Z4I A;  4QS9 A;  2YIO A;  1IKV A;  1VSF A;  1IV0 A;  4DB3 A;  2XY6 A;  4KAZ A;  1HNI A;  1FW6 A;  3CM6 A;  1GLC G;  3DOK A;  3MWT A;  4BG9 A;  4JEP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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