3ATVA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-bound and mg ion-free state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atvA04
2EWSA 5BPNA 3VEYA 3HSCA 3VGMA 3H1VX 4H5NA 3CJBA 1S22A 3AARA 1HUXA 1SZ2A 1IJJA 4K43A 4CZIA 2P9IB 2FF6A 3FFKB 1NGEA 5JLFA 1RGIA 1DKGD 5JMVA 3D2EB 2BUPA 1WUAA 3SK3A 1QZ6A 2IIRA 1IG8A 3VF6A 2HOEA 3ZEUA 2P9LA 4H0PA 5AZJB 2CGJA 4FL9A 1MA9B 4CBWA 5AQWA 5F2RA 2A40A 3BF1A 1Z6RA 1ESVA 2PBDA 4BROA 4BR9A 5KQ8A 2KHOA 1JCEA 3C7NB 4GNIA 1GLLO 3CI5A 2FSKA 3DXKB 4BQZA 4AM7A 2Q0UA 1KAZA 4XH1A 4CZJA 2AP1A 2IVPA 3F9MA 5TKYA 3C0BA 3FE1A 3UB5A 4BGAA 4BRGA 4BR0A 4FWQA 5EXWA 4IWVA 3A5NC 2FSNA 3UKUB 5FPEA 1TYQA 3ENHA 5LY3A 3LDPA 5AQIA 1E4FT 1HLUA 1T6CA 4NO7A 3L6QA 5AQNA 4PKHA 2E1ZA 1X3NA 4BRHA 3H45C 2VCPA 3EO3A 2GELA 4H03B 3QBXA 4M63C 4FOIA 1YVNA 4WQ4A 3EKUA 4DHYA 5AQGA 4FWRA 2Q1NA 3VF2A 4K42A 3ZX0A 1GLFO 4CD1A 1NWKA 1RDWX 1U2VA 4WQ5A 1BA0A 4DCHA 2QWMA 1JCGA 2P9LB 3VPZA 3ZEUB 1ATSA 4BREA 3ATUA 3QBWA 4C23A 3SMSA 1ATNA 4K25A 3FGUA 2V51B 4JD2A 3WEEA 4A61A 4KBOA 3A5OC 1QQOA 2YI1A 1TUUA 3D7EO 3DXMB 4H0OA 1XC3A 3WT0A 4FWPA 2E2OA 5FPDA 1H1VA 1GLJO 4JNEA 2ITMA 5CE3A 2YJFA 4GY2B 3WXKA 3IDHA 4YDUA 2E1YA 3L4IA 3EZWA 3D2EA 5EX5A 1TYQB 2E2NA 4JN4A 1DGKN 4RWTA 4CZKA 2NZTA 5AFUH 4EHUA 4MO4A 5AQQA 1HKCA 3A0IX 1GLAG 3MCPA 3RSEA 3I33A 4H0VB 3LDQA 1K8KA 3P4IA 3VEWA 4CZHA 4EHTA 4ISFA 5AQJA 2F9TA 3FR0A 3SLCA 1T6DA 1JCFA 3ID8A 5AZIB 1U2VB 1HX1A 5EY4A 4BRFA 3CQYA 1DEJA 1MWKA 3TU5A 2E88A 4BRMA 1KAXA 1C0FA 3LDOA 2VYPA 5BN8A 5AQTA 4JD2B 3EL2A 3WEEB 2BTFA 2E2PA 4RTFD 3FZLA 4XH4A 4J8FA 4QS9A 4IO8A 2GUPA 4BVOA 2AA4A 1MDUB 1V4TA 4K41A 3CHWA 4B1XB 3VESA 3CIPA 2VWBA 4BVPA 4MLHA 4BRNA 4BR4A 4CBXA 1BG3A 1X3MA 1ZC6A 4H5VA 3W0LA 1NBWA 3MN6A 3HM8A 1TUYA 3MK6A 2P9KA 5AQKA 5B8HA 2QWQA 1HKBA 3U4LA 2E2QA 4FSVA 2HF4A 3O1WA 3RSEB 3DXMA 1K8KB 4EFHA 2DPNA 5ADXH 1V4SA 5KQDA 1J6ZA 3UKRA 3ULEA 1NGDA 3MDQA 3U9DA 2A5XA 1KAYA 5E26A 5AR0A 2CGKA 3HTVA 2GWJA 5BRHA 2ZGYA 5F0XA 2HMPA 4JAXA 3QFUA 4PL8A 3GE1A 5BN9A 2QXLA 2YHYA 2V7ZA 4BRCA 4WYBA 4BR7A 1G99A 1BU6O 2P9SA 2Q97A 3D2FA 4CZFA 3VEOA 4CJ7A 4BRLA 2I7NA 5AQHA 4BR5A 3AY9A 2H3GX 3M3ZA 5JLHA 5BPLA 3DWLA 3G25A 5AZIA 3ATVA 1QQNA 3A5MC 1HKGA 3R6MA 4M7YA 4BRQA 3CETA 4BR2A 4H5TA 5AQRA 4O8KA 4IJNA 2P9KB 3CJAA 4A2BA 2W41A 2YCHA 2QWRA 2GTDA 1HJOA 3ZX3A 1LOTB 4H5WA 3W3DA 3VOVA 4H0YB 1YAGA 3UKRB 1BO5O 3ULEB 1WOQA 3IMXA 3QICA 3VF4A 3VGKA 1CZAN 5KPZA 2D0PA 1NGJA 3CJ9A 2YHWA 1S3XA 3M1FA 4BGBA 3QMLA 4XH5A 3U9ZA 5AQZA 1C0GA 2QM1A 4FPAA 4MLEA 2Q2RA 3VERA 1SAZA 4FO0A 2QWNA 4BRAA 2ZWHA 5EOYA 5F1XA 2YHXA 4BG9A 4FWNA 2P9SB 1NLVA 4CZLA 2ZF5O 3LL3A 4B9QA 3D2FB 3LDLA 1EQYA 3GDQA 1XQSC 4CZEA 2A6AA 2A42A 3SMPA 2FXUA 1NGBA 4O5FA 5BREA 4BRKA 3GL1A 3JS6A 5LJVA 2A41A 3KZBA 4NB4A 2CH5A 3R9PA 1NGFA 3O4WA 2QWLA 3KVGA 3FLCO 4CI6A 2CH6A 4A2AA 1NGIA 2ZGZA 3HI0A 4H5RA 2E20A 2QWOA 2P9UA 5FPNA 5AQSA 1GLEG 5AQPA 3MMVA 3MN5A 1NMDA 1ATRA 1ZXOA 3GOIA 5BPMA 2D4WA 5BRFA 3A5LC 3QB0A 3O1BA 2Q0RA 4PKGA 4B1YB 2FLOA 3IUCA 5AQUA 3U8XA 1MWMA 4RCHA 1Q18A 1U6ZA 5AQXA 3WQUA 2J4RA 1OKJA 1YXQA 1YUWA 1QQMA 3QDKA 4XEIA 3VETA 3A8YA 4IZ9A 3S41A 1X9JA 1QHAA 4DQ8A 1NGAA 3LM2A 4B1VA 3WXLA 4A62A 5AFUA 5KPTA 3O5BA 3VEZA 1GLCG 3B8AX 3R8EA 2QWPA 2D1KA 3CJCA 3I8BA 1P8ZA 2NRHA 1Y64A 1HPMA 1Z05A 5ELZA 4FWOA 1GLBG 2V7YA 1D4XA 3KHYA 2ASPA 5FPMA 4HTLA 4Z94A 3FZMA 3LDNA 3O80A 2OANA 3H46O 4FPBA 3MN7A 4CD3A 3BEXA 4M7XA 4HWIA 5AQMA 2P9UB 5AQVA 4BG8A 3HBTA 4Y0WA 2IVNA 2E8AA 2QW9A 2P9NB 5BRDA 1BOTO 3VEXA 3BUZB 3IFRA 4EAHD 3WXIA 1RFQA 3UE5A 4PL7A 3TPQA 3WQTA 3OHRA 3VEVA 5EVZA 4FWMA 4ISEA 3H1QA 1NGCA 4PKIA 4CZGA 3HZ6A 4I6MB 3BF3A 4QS8A 3DAWA 4L3QA 5AQYA 2HF3A 4BC2A 2YJEA 2GWKA 3O8MA 1BWFO 2P9PA 4F9OA 3FZKA 2V52B 3AAQA 4DB3A 4H0XB 3WUHA 3H3NO 3CQXA 2GEMA 3EKSA 1BDGA 3AAPA 5LJWA 3ZETA 2Q36A 5I9EB 2A3ZA 5E84A 4JHDA 3CJ7A 5ADXA 3ZX2A 1NGGA 3MN9A 3VENA 5JICA 1E4GT 1QZ5A 1R59O 2Q31A 3CJ1A 1SQKA 2FF3B 4BQLA 4B1ZA 4ISGA 3QFPA 1KXPA 2UYTA 4IJAA 4WQ4C 5KPRA 1GLDG 2F9WA 1T44A 5AQLA 3H6EA 4EIAA 2P9IA 3FZFA 4FOEA 1LCUA 4WQ5C 1XUPO 4BRPA 3GG4A 4CZMA 4LC9B 3JXUA 5AZJA 3BP8A 2WUSA 3CERA 2D0OA 2CGLA 1BUPA 1ZBSA 3O6WA 3GBTA 4FWSA 4QS7A 5AQOA 1BA1A 2PAVA 3LM9A 1NGHA 3L0QA 4H0TB 4MO5A 3VGLA 4BRIA 4E1JA 4AM6A 2FSJA 4BC5A 2P9PB 3O08A 3C7NA 4B1UB 4IXCA 3DXKA 4CBUA 2ASMA 5BR9A 5AQFA 4BRDA 3ZETB 2P9NA 2IVOA 2W40A 3DJCA 4JHDB 4B1WB 3FZHA 4FWKA 4YDUC 3SJHA 2I7PA 3UKUA 4I6MA 2NLXA 3H3OB 3M6GA 3WXJA 1NM1A 4FWLA 2ASOA 3J8AA 4BC3A 3EN9A 3ENOA 4BC4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HSCA 1HRHA 2KTQA 3CJBA 1S22A 4CZIA 2P9IB 1JLGA 3C6UA 1RGIA 4ID5A 5HRSA 4A5BA 2HVHA 4DTMA 4LFCK 1IG8A 2HHVA 2HOEA 1S6PA 3S3NA 3SNNA 5F2RA 1YTAA 2A40A 4CGGA 1Z6RA 1ESVA 2HBKA 2PBDA 1WAJA 3ALYA 2N2QA 3THWA 4CJKA 2YNIA 1JCEA 5HLFA 4B9LA 1IKVA 3CI5A 3KLHA 4JS4A 4OX9K 2KGQA 2JGUA 4BACA 4MFBA 5TKYA 3M5RA 2E2FA 1TVRA 4BE1A 3UB5A 4BGAA 4BR0A 3HP6A 4DF8A 2JDQD 4LF6K 1JXEA 1K73O 3SQ2A 1XNRK 1TYQA 3KC6A 5AQIA 3TAFA 1T6CA 3OYAA 1QE1A 1DT9A 3P31A 2LR3A 4HTUA 4YOWA 4BE0A 5C42A 2GELA 4CIEA 4WQ4A 3KOWA 3EKUA 4DSLA 3C6AA 3VF2A 4CF9A 2G8FA 3ZX0A 1S1XA 1U2VA 1TI5A 4DCHA 2HSTA 4NCGA 4K8XA 3GKUA 3ZEUB 2P9LB 4IFYA 4GKKK 2GX9A 4CK2A 4A61A 3E9PA 3A5OC 2YNFA 3VA3A 1TUUA 4NYNA 4DV0K 4RW6A 4LY7A 4JRQA 4KHPK 3U6FA 1H1VA 1FK9A 1NJIO 4JI7K 5HBMA 2HVIA 1U45A 2ITMA 1L4VA 1IH7A 1S6QA 2YX6A 3O9UA 2B6AA 3DOLA 3NH1A 1NU0A 3IDHA 3QI7A 1NG9A 3QIOA 2E2NA 3DLKA 3AVGA 2KBKA 3TTDA 4CJPA 3KP0A 1WSJA 1O13A 4B9TA 2B68A 5AFUH 4NYFA 1HKCA 4B8AB 4CJLA 1NJZA 1GLAG 4E0DA 3OYCA 3UIQA 4DSEA 3LDQA 1K8KA 3KWIA 4EHTA 2KZMA 3SLCA 4F2RA 3FR0A 3ID8A 4CVNE 4FZYA 4CK1A 3KLEA 4I7FA 2X6NA 4W5OA 1LAWA 1DEJA 4JI1K 4DFMA 2E88A 3AO1A 3OVNA 1Z25A 4CEEA 1KAXA 1S72N 3HK2A 3KK2A 5BN8A 4JD2B 1WSIA 1IKXA 2BTFA 2HNZA 4J8FA 4QS9A 1N5YA 4OKEA 2W42A 3U3YA 2YIPA 1TKXA 2NY9X 1V4TA 3OYFA 4K41A 2KSKA 4B1XB 5FRNA 1B92A 3NF8A 3ZSWA 4DU1A 4UJ0A 4MLHA 5KTQA 4KTQA 1TKDA 1BG3A 3NGYA 1VQNN 1ZC6A 2ZQBA 4JKGA 4JYAK 1EX4A 5E41A 5KGWA 1TUYA 1NK4A 3OTOK 4J2AA 3MK6A 5B8HA 2BH1A 2QWQA 3MEEA 1W2BM 3U4LA 5M1OA 4FJ5A 3O1WA 1FH3A 4N41A 3KP1A 2W6LA 1QS4A 1V4SA 3UKRA 3ULEA 1VSMA 3U9DA 3CCEN 2YILA 2UXBK 2F8TA 2QTDA 4E7LA 2O8CA 2ZGYA 3CM5A 1MR4A 4JAXA 3CC4N 3GE1A 3HOTA 3MXMA 3AVLA 2YHYA 4UAEF 1UA1A 3HVRA 2YKMA 4WYBA 2RN2A 4BR7A 5C10A 3FFIA 1WBDA 1JLCA 3V9SA 4CJ7A 4EZ9A 1HNVA 2D0AA 1N8RO 2I7NA 4BR5A 3AY9A 1S9GA 1S5JA 4DSJA 3G25A 1QQNA 3A5MC 3U3GA 1T03A 1C0UA 3AVKA 3CETA 4BR2A 3AVBA 1UOCA 1B3CA 2YBRC 5AQRA 4I2QA 3RMBA 3MWPA 3CJAA 1NKBA 2QWRA 1BL3A 1HJOA 4LH5A 5D3GA 1VRUA 3P39A 1SL0A 3LPUA 1WOQA 3ZSYA 3VF4A 4DTRA 4B8CA 4K8ZA 3QNNA 3PIPL 3TSUA 1CLQA 3R3LA 2LJMA 4XH5A 3G4SN 1LQIA 3U9ZA 1PE4A 4RG8A 3OYNA 3VERA 4FO0A 4BRAA 3CCQN 2X6SA 2YHXA 3NFAA 4BG9A 4FWNA 1NLVA 2VG7A 3HPGA 3LL3A 1T7AA 4B9QA 4JI4K 3D2FB 3LDLA 1CXUA 3VQ8A 4B3RK 2RF2A 1WSEA 4F3OA 2G8IA 4DQRA 4CJVA 2FXUA 1NGBA 4CJEA 5BREA 4BRKA 3GL1A 3T3FA 4GV6A 1TKZA 3CFOA 2KYQA 1OMYA 2A41A 2KLAA 3KZBA 4FLVA 5CHIA 4NB4A 2HBJA 2DFEA 2QWLA 3THXB 3A2FA 2E3FA 5CY4A 1VNAA 4FW1A 2CH6A 4FLTA 1NGIA 3HI0A 3KIOA 1ZVEA 2PY5A 1RBUA 5FPNA 5AQSA 2P51A 2O8EA 3NGZA 2YV0X 4BEBA 1S1VA 1NMDA 4ILJA 1ATRA 1QVGM 1VQ8N 1ZXOA 4OLBA 2XRIA 1RTDA 1RTIA 1RDUA 1VHXA 4DV5K 2FLOA 1M90O 4I9LA 4M3XA 2HHSA 1HYSA 1Q18A 1U6ZA 2ZE2A 1WBBA 3R1XA 1OKJA 1ZUTA 3QDKA 4DFKA 4OLAA 4XEIA 4JKCA 3M8PA 2B3CA 1B7DA 2RKIA 3LWLA 3RTVA 3O3GA 3LM2A 5AFUA 3WXLA 4A62A 1X9SA 3O5BA 1N4NA 2VG5A 3R8EA 2QWPA 1KVAA 3CCMN 4CJ5A 3KKRA 4CF0A 1HPMA 5EU7A 4E1MA 2R7YA 4HTLA 4Z94A 3AVFA 2OANA 3KLGA 3BEXA 2OPSA 4HWIA 5AQMA 4YHHK 3HXMA 4Y0WA 4FJXA 5J2QA 3ZT1A 2E8AA 2P9NB 1UGLA 3IFRA 3TTFA 1RFQA 3C95A 5M1NA 5CYQA 1ZBLA 3WQTA 3BZCA 5EVZA 4FWMA 2ZJRL 3H1QA 2WOMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HSC A;  1HRH A;  2KTQ A;  3CJB A;  1S22 A;  4CZI A;  2P9I B;  1JLG A;  3C6U A;  1RGI A;  4ID5 A;  5HRS A;  4A5B A;  2HVH A;  4DTM A;  4LFC K;  1IG8 A;  2HHV A;  2HOE A;  1S6P A;  3S3N A;  3SNN A;  5F2R A;  1YTA A;  2A40 A;  4CGG A;  1Z6R A;  1ESV A;  2HBK A;  2PBD A;  1WAJ A;  3ALY A;  2N2Q A;  3THW A;  4CJK A;  2YNI A;  1JCE A;  5HLF A;  4B9L A;  1IKV A;  3CI5 A;  3KLH A;  4JS4 A;  4OX9 K;  2KGQ A;  2JGU A;  4BAC A;  4MFB A;  5TKY A;  3M5R A;  2E2F A;  1TVR A;  4BE1 A;  3UB5 A;  4BGA A;  4BR0 A;  3HP6 A;  4DF8 A;  2JDQ D;  4LF6 K;  1JXE A;  1K73 O;  3SQ2 A;  1XNR K;  1TYQ A;  3KC6 A;  5AQI A;  3TAF A;  1T6C A;  3OYA A;  1QE1 A;  1DT9 A;  3P31 A;  2LR3 A;  4HTU A;  4YOW A;  4BE0 A;  5C42 A;  2GEL A;  4CIE A;  4WQ4 A;  3KOW A;  3EKU A;  4DSL A;  3C6A A;  3VF2 A;  4CF9 A;  2G8F A;  3ZX0 A;  1S1X A;  1U2V A;  1TI5 A;  4DCH A;  2HST A;  4NCG A;  4K8X A;  3GKU A;  3ZEU B;  2P9L B;  4IFY A;  4GKK K;  2GX9 A;  4CK2 A;  4A61 A;  3E9P A;  3A5O C;  2YNF A;  3VA3 A;  1TUU A;  4NYN A;  4DV0 K;  4RW6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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