3EKUA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 123
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ekuA03
3CHWA 3O8MA 4IWVA 1JCGA 1HX1A 4YDUA 3QFPA 4B1ZA 5EVZA 3U9ZA 1E4FT 3CIPA 3H3OB 3VEYA 4CBUA 3HM8A 3CI5A 3CJBA 3FE1A 3LM9A 1BUPA 4IJNA 4XEIA 4NB4A 4FWMA 3ID8A 1TUYA 4FPBA 1QQOA 2W40A 2E2OA 2AP1A 3ZETB 5KQ8A 4BRHA 4H0OA 1GLJO 4BRAA 5JLFA 3KHYA 5KPRA 3ATVA 1J6ZA 1Z05A 3RSEB 1C0GA 1ATNA 2D0OA 3R6MA 4EAHD 5LJVA 1U2VB 3IMXA 2W41A 3DJCA 4BROA 2ZWHA 5JLHA 1LOTB 1QZ5A 2I7NA 1Y64A 2V7YA 5AQSA 2F9WA 5FPEA 1NGJA 5AQYA 5F1XA 4NO7A 3D2EB 3GBTA 3QMLA 4FWSA 4HTLA 2A6AA 4FWKA 1NGBA 3ZETA 3A0IX 5KQDA 3FZKA 3D2FB 3HTVA 5FPNA 4BRQA 3U4LA 2F9TA 3ENHA 4FPAA 3RSEA 3WT0A 3AY9A 1U2VA 4H0YB 2QXLA 2E8AA 4H0VB 4EIAA 4BRNA 3G25A 4FO0A 1DGKN 2ZGYA 3M1FA 3GE1A 4H0TB 5AZJB 5LJWA 3CJCA 5FPMA 4BR0A 4C23A 3ATUA 3GG4A 3QBXA 1HKCA 3FZMA 2A5XA 1MWMA 1NLVA 4BQZA 2E2NA 5AQHA 3D2FA 4PL8A 4K25A 4H03B 3TPQA 4BRKA 5AQNA 5B8HA 3H3NO 3A5MC 3VF2A 2YHXA 2QWNA 3EKUA 3VF4A 1HJOA 3BF3A 4H5VA 2FF3B 2FSNA 5AQTA 3QB0A 4FWQA 5AZJA 3LL3A 5KPTA 3TU5A 2HF4A 4MO4A 2A42A 3KVGA 1ZXOA 4FWNA 3O1WA 5AQRA 2E20A 1QQMA 5AQVA 2H3GX 5JMVA 3FZLA 1KAXA 5BPLA 3OHRA 3LDQA 4GY2B 2QWLA 4BRMA 2CGJA 3KZBA 5F0XA 1P8ZA 3H6EA 3DAWA 3WXLA 4BC3A 1D4XA 1XUPO 2E2PA 1GLLO 1C0FA 4BRCA 3UKRB 4CZKA 3AAPA 4JAXA 4H5NA 2E88A 5BRDA 1TYQB 5EXWA 4BR2A 4H5WA 4ISEA 3VOVA 3ZEUB 4BC4A 1ESVA 2QWRA 4K41A 2E1ZA 1JCFA 2YHWA 1ATSA 1YAGA 4RTFD 4AM7A 5AR0A 3FR0A 1U6ZA 4XH4A 1HLUA 3BF1A 3HI0A 3LDPA 4WQ4C 3O08A 3O6WA 3GL1A 1NM1A 5EOYA 3UE5A 1IJJA 2BTFA 4IJAA 5AQLA 4JNEA 1TYQA 4A2AA 2GWKA 4MO5A 3ZEUA 2OANA 3L0QA 2V7ZA 3QDKA 1NGDA 4BG8A 3W0LA 3DXMB 5E84A 4A61A 4BVOA 1SZ2A 2ZF5O 1MWKA 4BR5A 2YI1A 4CZEA 1YUWA 4M7YA 3GOIA 4QS7A 2PAVA 3FFKB 3O5BA 4BREA 4CZJA 1NGFA 2KHOA 1HUXA 4BR4A 3CQXA 3JS6A 2FXUA 3EO3A 4H0PA 4FOEA 2P9IB 4XH1A 2HMPA 1XC3A 3FLCO 3O4WA 2QW9A 1E4GT 2CGLA 4PKHA 3VGKA 1BDGA 5KPZA 2P9UB 2E2QA 3DXMA 1IG8A 3J8AA 3O1BA 3WXIA 4E1JA 2Q0RA 2EWSA 2GWJA 5AQUA 2V52B 2ASMA 1BWFO 1SQKA 1GLAG 3WUHA 2GELA 4CD3A 3MN7A 3IDHA 2NLXA 3EL2A 4BG9A 5BPMA 2QWOA 1TUUA 3D2EA 2P9IA 4B1YB 5AQFA 4I6MB 1NGGA 4FWPA 5AQQA 5AQPA 4WQ5A 3MN5A 2P9PB 3H1VX 2D0PA 4BRLA 1SAZA 2V51B 3BEXA 2P9UA 5ELZA 4H5TA 2VWBA 3WQUA 1GLFO 3CJ1A 2E1YA 3CJ9A 4DHYA 5BRHA 3MMVA 2P9NB 3H1QA 1Z6RA 2IVNA 1CZAN 5AQWA 2ASOA 3FGUA 3W3DA 2BUPA 3MCPA 1K8KB 4K43A 5JICA 3R8EA 4JN4A 1NGIA 5EX5A 4L3QA 2FSKA 4AM6A 4B1XB 5AQMA 3EN9A 4B1UB 1NGAA 4WQ5C 4JHDB 3LDLA 3D7EO 4MLEA 1BOTO 1RDWX 1V4SA 2P9KB 3IUCA 4FWRA 2P9PA 1JCEA 2NRHA 3H46O 3WXKA 3I33A 4PKGA 3MN6A 1QHAA 4FOIA 2YCHA 1BA1A 4FSVA 4BR9A 3O80A 1YVNA 5BPNA 1Q18A 2P9NA 3WEEB 4WQ4A 1HKBA 5AZIB 4HWIA 3VESA 3M3ZA 4CBXA 1K8KA 3SMPA 1GLBG 2DPNA 3U8XA 1G99A 2QWQA 4BC5A 4BQLA 4CBWA 1GLEG 2VYPA 4ISGA 2GUPA 3SMSA 2A3ZA 3AAQA 4CZMA 4JHDA 1QZ6A 2YHYA 5E26A 4CI6A 5FPDA 1LCUA 4Y0WA 2ZGZA 2WUSA 2P9KA 3DWLA 5AQXA 2IVOA 1YXQA 4CZHA 1ZBSA 4O5FA 4M7XA 3L4IA 3VEZA 2QWPA 4H0XB 2FLOA 4B9QA 4PL7A 3WEEA 4A62A 1ATRA 5AZIA 5F2RA 3IFRA 3UKRA 4DB3A 1NMDA 4F9OA 1NGCA 4BRGA 1QQNA 3AARA 3HBTA 2PBDA 3A5OC 1WOQA 3EZWA 4RWTA 1NGHA 4WYBA 4BGAA 1HKGA 5ADXH 1EQYA 2FF6A 3A5NC 3ZX2A 4BR7A 2Q97A 5AQZA 3M6GA 1RFQA 2NZTA 2CGKA 3VEXA 4FWLA 5CE3A 3B8AX 3CETA 5ADXA 3SK3A 4CZLA 1NWKA 3SLCA 1BG3A 5AQIA 3VEOA 2GTDA 1S3XA 4PKIA 3VEWA 3R9PA 4QS9A 2FSJA 3S41A 3UB5A 2CH5A 3VENA 2J4RA 2ASPA 5TKYA 3L6QA 3VPZA 3A8YA 3VF6A 4H5RA 4YDUC 1HPMA 5BR9A 2Q0UA 3C0BA 1KAYA 5BRFA 5AQKA 3VETA 3VGLA 5BN9A 3SJHA 4DCHA 2P9LB 5AFUH 3ENOA 1WUAA 3CJAA 4FWOA 4BGBA 2AA4A 5AFUA 4DQ8A 3ULEB 3CQYA 4IZ9A 3ZX0A 4CZGA 4CZFA 3QICA 1DKGD 1BU6O 3QFUA 4GNIA 3MN9A 4Z94A 3CJ7A 1OKJA 4LC9B 2Q2RA 1GLDG 4CJ7A 4J8FA 1V4TA 2ITMA 3P4IA 4CD1A 2Q36A 4BC2A 1ZC6A 4KBOA 4B1VA 1X9JA 2P9LA 1XQSC 1T6CA 3UKUB 5BREA 4EHUA 3DXKB 3LM2A 3FZHA 5I9EB 4IO8A 4MLHA 4EFHA 2A41A 3ULEA 5AQJA 2YJEA 3BUZB 3LDNA 2Q1NA 1GLCG 3QBWA 5BN8A 2I7PA 1MA9B 1T6DA 3VEVA 4BVPA 2IIRA 3I8BA 2VCPA 3HSCA 1T44A 3F9MA 4BRFA 4XH5A 1DEJA 1BA0A 4BRPA 5EY4A 1X3MA 2QWMA 1X3NA 2YJFA 4B1WB 1RGIA 2GEMA 4I6MA 4JD2B 1NBWA 5AQOA 1KAZA 3EKSA 3UKUA 2P9SB 3H45C 3WQTA 3DXKA 3MDQA 3BP8A 3LDOA 1S22A 3VERA 2D4WA 3C7NB 2Q31A 3A5LC 4K42A 1R59O 4RCHA 4O8KA 4FL9A 4ISFA 3JXUA 3FZFA 3MK6A 1BO5O 1NGEA 3WXJA 3U9DA 4IXCA 2A40A 4QS8A 4A2BA 4JD2A 4M63C 4EHTA 2HF3A 3HZ6A 1H1VA 4CZIA 2P9SA 3ZX3A 5LY3A 2D1KA 1MDUB 4BRDA 2UYTA 5AQGA 1KXPA 3GDQA 3VGMA 4BRIA 3C7NA 3CERA 2QM1A 2IVPA 2CH6A 2HOEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HMVA 4DWIA 3CHWA 4JI4K 3O8MA 3DLRA 3D45A 3L2RA 4E7IA 3CIPA 1KSPA 3VEYA 4CGGA 2WBNA 3HM8A 3TSQA 4YOWA 4M3TA 1BUPA 4NB4A 3TAGA 2PFUA 4DV7K 3OS2A 3KJVA 4BE2A 2W40A 1VSJA 4OKEA 3MWPA 1T7PA 2HBLA 4CJQA 3S3NA 5JLFA 1NK9A 1J6ZA 1Z05A 1C0GA 1D9FA 2W41A 1D9DA 3V4IA 4BROA 5JLHA 5GIPA 5C25A 3HM9A 1RT6A 4KTWA 2KFZA 2W00A 1YVUA 3MAQA 2V7YA 5FPEA 2BE2A 3T69A 4KHQA 3KWIA 3CCQN 3MXIA 4FZZA 4CJ3A 4HTLA 3T3FA 2A6AA 3ZETA 4JKFA 3VTIA 3FZKA 3HTVA 4BE7B 5M1OA 1EWRA 3L2VA 4LFCK 4CJVA 5JS2A 4KREA 3WNEA 1S72N 2E8AA 4H4MA 1S6PA 4FO0A 1RTJA 1WSGA 3M1FA 3PUFA 3GE1A 3K2PA 3ISNC 3OYBA 4KPYA 5LJWA 2A1SA 3R3LA 4DG1A 3K0SA 4OKKA 2VG7A 3IRXA 3MXJA 3P1GA 4Q5VA 1VRUA 3K57A 4B9LA 4CGHA 2NRRA 2HW3A 2XY7A 4BQZA 2HB5A 2F7TA 3PX0A 1BIZA 4K25A 4H03B 3TPQA 4FK4A 5AQNA 5B8HA 3A5MC 1T05A 2QWNA 1OH7A 3VQ4A 2C1IA 4FJXA 2G8HA 3TU5A 1TGOA 3L2UA 3O1WA 4CEBA 5AQRA 2E20A 3T19A 2W42A 3MEDA 4HVJA 4FLZA 2BDPA 4I9LA 2H3GX 3CYGA 4JLHA 4C8KA 1S6QA 3OHRA 2X74A 1WSEA 3CCLN 1ZBIA 3E66A 4LH4A 3DAWA 4NYNA 1ASUA 4M3XA 1D4XA 4JV5K 4JKGA 2E2PA 2KKZA 4IFEA 3UKRB 3AAPA 1S9EA 3TTFA 4JAXA 3D0PA 2HSTA 3ZEUB 3P39A 5T7BA 1IG9A 3AVMA 2QWRA 2E1ZA 3AA2A 4WE1A 4CEOA 1C0TA 1YAGA 2PYLA 3OS0A 3QIPA 3LZJA 3RVCA 1U6ZA 4OO1J 3BF1A 3LDPA 4GKJK 1X1PA 3GL1A 2QI2A 5EOYA 1NK4A 3KLFA 4OX9K 3K5NA 1VQ7N 3DLGA 2YNFA 5HOOA 2DFEA 5C12A 3UE5A 1QVGM 2BTFA 5AQLA 4JNEA 1TYQA 3BZKA 1Z26A 4CEAA 3QDKA 3W0LA 3DXMB 3RMCA 3E1YA 2PY5A 5CYQA 4CZEA 2XY8A 2P5GA 4LD0A 2ZQBA 1NGFA 1I39A 3P83D 2YNIA 3CQXA 3MECA 2WTUA 3JS6A 4BDYA 3DLKA 4DSIA 3OBYA 3H08A 4XH1A 3SAHA 1XC3A 4ID5A 1WBBA 2F96A 1TAQA 4JRQA 1QSSA 1NOZA 1U49A 4H4OA 4OLAA 1Q9XA 1SUQA 2EWSA 2GWJA 2NRZA 1RDCA 3DRPA 4ILGB 4JKBA 3IDHA 3KK2A 3EL2A 5BPMA 2O8CA 1TUUA 3DOKA 4RG8A 2HNYA 4KB0A 2HHTA 4I6MB 1NGGA 4KI6A 3LWLA 3O9RA 4CEZA 4C1NK 2V51B 3AVFA 4A5BA 1RBRA 3V1QA 2E1YA 4FK2A 4GV6A 3MMVA 3U3GA 3H1QA 2G8UA 1Z6RA 3W3DA 1K8KB 2QEXN 3T1YK 1FKOA 4FCYA 1SL0A 5AQMA 3EN9A 3K5LA 3D7EO 3DRRA 1U45A 2YHAA 4FWRA 2P9PA 3THXA 3CF5L 3SQ1A 3I33A 2D0AA 3LPTA 1QHAA 1BA1A 1BISA 4BR9A 1YVNA 4KH5A 4HWIA 4IDHA 3P31A 1W2BM 2WOMA 3MX5A 1GLBG 2DPNA 3Q7CA 3U8XA 3KWGA 1VQPN 4ISGA 4DR6K 4KRFA 2YHYA 1TKXA 5E26A 4JKCA 1LCUA 4Y0WA 5FPDA 4DLGA 2WUSA 5AQXA 4YNQA 4OPKA 4FLYA 2UUBK 3NF6A 3CYMA 1YT3A 4H0XB 4CERA 1S1VA 3OJSA 5LMNK 4UY8O 2FLOA 4B9QA 1IKXA 1WBDA 3IFRA 2XY6A 4IOAL 1NMDA 4HHTA 3NHGA 1QQNA 3AARA 3AVJA 5CZ2A 3A5OC 1YIJN 1WOQA 1NGHA 1EQYA 3ZX2A 4BR7A 2Q97A 4CK1A 4K0KK 3M6GA 4DR5K 3TANA 5CE3A 3SK3A 1W9HA 4BE0A 2EHGA 3P5JA 3MEEA 1JLBA 4CJRA 5AQIA 2F8TA 3LP3A 4RW9A 3VEWA 3N4QA 5M1FA 4QS9A 1ZBFA 2KTQA 1VQON 4CJ4A 2J4RA 1NK0A 4H5RA 1KTQA 3AGKA 5BR9A 3M8PA 1KAYA 5BRFA 3ID6A 3VETA 1CZBA 1BGXT 2KW4A 4DCHA 5AFUH 4MFBA 1WUAA 3TAEA 1NKCA 1BQMA 3CJAA 4PQUA 2IS3A 2HVHA 4X65K 5C0YA 4B9UA 5AFUA 1UA0A 4IZ9A 3OBWA 3ALYA 3QFUA 4KHWA 4LC9B 1WN7A 4CJSA 2ITMA 3P4IA 4CD1A 4X66K 3PIOL 1ZC6A 3SUPA 1S1WA 2P9LA 3K59A 1BQNA 5KRTA 5BREA 3OY9A 1TK5A 3FZHA 4M45A 3DRSA 3VQ7A 1IKVA 2JWKA 2YJEA 3LAKA 1GLCG 3J80O 1T6DA 2RHKA 4DSLA 2VCPA 2YKNA 4TSXA 3A2FA 1IKWA 1DEJA 4BRPA 3CPWM 1HNVA 3TAFA 1X3NA 4JD2B 1FK9A 4LF4K 4ZHRA 4CGIA 3P38A 4Z4IA 2P9SB 4IFYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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