3EKUA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 123
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ekuA03
1SQKA 3A5MC 3UKUB 3WEEB 1IG8A 2P9NB 2Q2RA 1TYQA 2QXLA 4BGBA 4EAHD 4RWTA 3VPZA 4K25A 1D4XA 3ZETB 1Y64A 4BR4A 4J8FA 3O08A 2AA4A 4RCHA 2D1KA 2E2QA 3FGUA 3VEVA 2PBDA 5EVZA 1BA1A 3W3DA 4A62A 5KQDA 3QMLA 4L3QA 3U8XA 4CZJA 2YCHA 3LM9A 4ISEA 2H3GX 4FPAA 2QWLA 3FZFA 3JXUA 3R9PA 1JCFA 5AQXA 3ATUA 3DXKB 1MDUB 5AQZA 3R8EA 5AQVA 4CZEA 1KXPA 3ENOA 2Q1NA 1KAXA 4LC9B 2F9TA 3ZEUB 3FZHA 1QHAA 5AZIB 3SK3A 1GLBG 4CZKA 4B9QA 5KPTA 4FWQA 5AR0A 3HZ6A 3H45C 4CZLA 1NLVA 1ESVA 4JNEA 5BPMA 4BVOA 4CZFA 2E1ZA 2E20A 4H0XB 2ZWHA 4WYBA 4C23A 4H0PA 3FR0A 4YDUA 3LDLA 1LCUA 4YDUC 4XEIA 2YHWA 5AQIA 4EIAA 4MO5A 1E4FT 4IWVA 1GLAG 3C7NB 3U9DA 2D0OA 3CETA 1NMDA 3FZKA 2P9IA 2FXUA 5AQHA 1BU6O 5CE3A 3VF4A 5BRHA 3A8YA 3KZBA 2P9SB 3VGMA 1Z05A 5BPLA 3W0LA 2BTFA 4Y0WA 3FFKB 2KHOA 3BF3A 3RSEA 3ZX0A 1OKJA 1NGCA 4Z94A 1ZXOA 2Q0RA 2QWNA 4QS9A 4B1UB 1G99A 3ATVA 1BO5O 2ZF5O 3DXMA 3VEXA 3C0BA 4EHUA 1C0FA 2ZGYA 5AQJA 4DB3A 4BQLA 5AQOA 3A0IX 1YUWA 2V7ZA 5AQPA 2PAVA 1QQOA 4WQ5A 3L6QA 4BRKA 3AY9A 1NM1A 3VERA 3LL3A 2YJEA 4WQ5C 1BA0A 2CGJA 3LDQA 1T6CA 4H5WA 4JHDA 5AQNA 3VGLA 3IUCA 2GUPA 3EN9A 3H3OB 3H46O 2IVPA 3U9ZA 4MLEA 4MLHA 4QS8A 4FO0A 4FWNA 2HF3A 1HKCA 4IJNA 4FOIA 3GG4A 5BRFA 2P9PA 3VOVA 3VENA 4M63C 2FSNA 1NGJA 3WQTA 4CBXA 4EFHA 5ADXA 2QWPA 5AZJB 1X3NA 2A41A 4H0VB 1HLUA 3MCPA 4BR2A 3VF2A 1HPMA 1JCGA 4I6MB 1TUUA 5F0XA 2HOEA 4DQ8A 4JAXA 5JLFA 1T6DA 4CBWA 5AQRA 4FWKA 2Q0UA 3GL1A 4BC5A 4PKGA 5LJVA 3QFPA 4JD2A 2YI1A 4FWSA 4IJAA 3VETA 3HM8A 3M1FA 3VEZA 5JLHA 2D4WA 3HSCA 1ZBSA 4B1YB 4BR7A 5AQUA 4H5VA 1YVNA 4BRCA 4XH4A 3D2FA 3VF6A 3VEOA 5AQYA 3QBWA 4FSVA 3QDKA 1BUPA 4A2AA 5F2RA 3WXJA 3CQYA 3A5OC 1V4SA 2P9KB 2QWRA 2OANA 4H0YB 4KBOA 4CD3A 1NGFA 1XC3A 1GLFO 5JICA 2WUSA 4QS7A 3VEYA 4H5TA 1MA9B 4PL8A 1GLEG 2NZTA 1BWFO 1HJOA 4BR5A 4M7XA 3VGKA 5JMVA 4H5RA 4FWOA 2P9IB 3SJHA 3JS6A 5FPDA 1MWKA 1R59O 4H0TB 5B8HA 1ATSA 4FWMA 3TPQA 2IVNA 3WEEA 3BEXA 2P9NA 1HKGA 4FWPA 4MO4A 1S3XA 5TKYA 2E1YA 1K8KB 3ZETA 1X9JA 2EWSA 2FLOA 3H3NO 5KPZA 3WUHA 3O4WA 4K42A 4DCHA 5KQ8A 1TUYA 2A42A 3CJBA 4B1WB 1DKGD 3O6WA 5ADXH 3H1QA 2J4RA 3D2EA 3OHRA 1T44A 4A61A 1RDWX 3SLCA 3CJAA 5KPRA 4BR9A 2A5XA 2VWBA 5FPMA 5BREA 3CJCA 2E2NA 2P9UA 3FZMA 3HBTA 1Q18A 4BRHA 1QQMA 3BF1A 3DXKA 5BR9A 1CZAN 1NGDA 2ZGZA 3BP8A 2D0PA 4JHDB 1QZ5A 4XH1A 5AQWA 2A6AA 3QB0A 4HWIA 4BRNA 2YJFA 1NGHA 1C0GA 2E88A 2NRHA 4HTLA 5AZIA 5EOYA 1H1VA 4BRAA 1X3MA 1RGIA 2QWMA 1SZ2A 2DPNA 5F1XA 1IJJA 2FF3B 3MDQA 4BG8A 3LM2A 3EO3A 3J8AA 2CGLA 1YAGA 3ID8A 2QM1A 5BRDA 3QFUA 1NWKA 1Z6RA 3C7NA 1TYQB 4FWRA 4BRQA 5EXWA 4JD2B 5AQSA 2VYPA 4K41A 3DWLA 3FZLA 3I33A 4EHTA 1E4GT 1GLLO 4NB4A 5AFUA 3D2FB 1KAYA 1JCEA 4O5FA 1GLJO 3M6GA 3O5BA 2V51B 1ATRA 3SMPA 3O1WA 4BR0A 5E84A 4GY2B 3BUZB 3QICA 4BRGA 3EKUA 4AM7A 4B1ZA 3ZX2A 3DAWA 5FPEA 1XQSC 2IIRA 1V4TA 5AQKA 3TU5A 4IO8A 2FSJA 4H03B 4H5NA 1NGEA 1NGBA 3KHYA 3A5NC 3H6EA 2I7NA 4CJ7A 1BG3A 1RFQA 2CH5A 2CGKA 2YHYA 3ULEA 1BOTO 3MN7A 3GE1A 1NGAA 2ASMA 3ZX3A 3VEWA 3F9MA 3VESA 4BC2A 3O8MA 4BC4A 1U6ZA 4BVPA 3UKRA 4E1JA 2ASPA 2P9LA 3QBXA 4NO7A 4BC3A 1QQNA 1U2VA 3CHWA 5LJWA 2E8AA 3IMXA 5EX5A 4BRPA 4XH5A 4PL7A 4IZ9A 1S22A 3P4IA 4CI6A 5AZJA 4F9OA 4GNIA 4PKIA 2W41A 3D2EB 2YHXA 3M3ZA 1HUXA 4I6MA 5AQGA 3DJCA 3UKUA 2GWJA 4B1VA 5BN9A 2QW9A 1DEJA 4FOEA 1DGKN 1KAZA 3GDQA 2P9UB 4BRDA 1WUAA 4CZHA 3G25A 3WQUA 1GLCG 1SAZA 4BRMA 3MK6A 4CD1A 1LOTB 2GWKA 3GOIA 2E2OA 3RSEB 3HI0A 4B1XB 1HKBA 3A5LC 3KVGA 1NGGA 2ITMA 3H1VX 3MN9A 5AFUH 3SMSA 4A2BA 4M7YA 2W40A 3R6MA 3DXMB 3CJ7A 4BGAA 1GLDG 2P9KA 4CZGA 1NBWA 3AAPA 5BPNA 5AQTA 5AQFA 2GELA 2FF6A 2UYTA 2V52B 3D7EO 3ENHA 1BDGA 2ASOA 3HTVA 1MWMA 2HMPA 3FLCO 3B8AX 1HX1A 3CI5A 2F9WA 3LDOA 2FSKA 3WT0A 2Q31A 3ZEUA 2QWQA 3WXKA 3L0QA 4AM6A 2VCPA 2NLXA 2CH6A 3IFRA 2P9PB 5EY4A 4K43A 3LDPA 3EL2A 1QZ6A 4BG9A 4BRFA 4BROA 3LDNA 1K8KA 2A3ZA 5AQLA 4WQ4A 4FL9A 4WQ4C 4RTFD 1WOQA 3MMVA 2Q36A 2I7PA 4BRIA 3MN6A 3WXLA 2QWOA 1J6ZA 3IDHA 5FPNA 2AP1A 4BRLA 4BQZA 3CERA 3CQXA 3U4LA 3UE5A 5AQMA 3EKSA 2Q97A 3S41A 4CBUA 4JN4A 2GTDA 4BREA 2IVOA 3L4IA 4CZMA 2HF4A 2P9SA 1EQYA 4FPBA 3AAQA 4PKHA 3UB5A 5E26A 3O80A 3ULEB 1YXQA 3O1BA 4H0OA 5AQQA 5LY3A 3EZWA 1ATNA 4CZIA 3CJ9A 3FE1A 4DHYA 2E2PA 3CIPA 1ZC6A 5BN8A 4O8KA 3UKRB 2P9LB 4ISFA 2BUPA 3CJ1A 1U2VB 3AARA 4IXCA 4ISGA 1XUPO 2A40A 2GEMA 1P8ZA 3MN5A 3GBTA 5I9EB 1NGIA 4FWLA 2V7YA 3I8BA 3WXIA 5ELZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QK9A 3A5MC 3UIQA 2UXDK 4B9MA 3UKUB 2VWKA 4CEDA 1IG8A 2Q2RA 2HHVA 3ZSZA 4BGBA 2O4IA 1IBMK 4DV6K 4U67L 2RN2A 1BQMA 4BR4A 3TANA 1MU2A 1LWEA 3I8DA 2Z1JA 3IKMA 3QEPA 2E2QA 1OVQA 3FGUA 3VA3A 2FBTA 3ID6A 3RVCA 4FJKA 4L3QA 1VQ5N 4JS4A 4O55A 4H4OA 4I2PA 3VQ6A 2HBKA 3SUQA 3VN5A 4CZJA 2YCHA 3I55N 1KFSA 4FPAA 1K8AO 1EETA 2YKNA 3JXUA 2D0CA 3S3MA 4O5BA 4A5AA 4IG3A 5AQZA 3RRHA 1T3VA 1KXPA 3ENOA 3HL8A 4LSNA 3QEVA 3SK3A 1GLBG 1C1AA 4FWQA 3SBGA 4CEQA 3H45C 1YTAA 3BZKA 3OS2A 4IFYA 3THVA 4H0XB 3VQQA 2ZWHA 2OPPA 4FLTA 3LDLA 2IS3A 3AVCA 1LCUA 2YHWA 4MO5A 2EX3A 3KK1A 4FJHA 3C7NB 4KHWA 1CXUA 3O4QA 3FZKA 4DV5K 2FXUA 4E7KA 3K0SA 5GINA 4OKJA 5LL6Z 3OYFA 2X78A 4MQ3A 3KLEA 2QKKA 3ZSXA 2O8FA 3ITHA 3ZX0A 4NXMK 2HHWA 3U3YA 2YX6A 2I5JA 2Q0RA 4QS9A 1HYZA 2P51A 3O9RA 3T69A 1GOAA 3C0BA 1SKRA 3OYNA 3QETA 4JV5K 4BQLA 3R3LA 3A0IX 3AVJA 1YUWA 2PAVA 1QQOA 4WQ5A 3L6QA 3MXMA 3NH0A 4BRKA 3AY9A 3PV8A 3LL3A 2YJEA 3VGLA 3IUCA 3EN9A 2HHSA 2IVPA 1KRPA 1SL1A 4MLEA 1HKCA 3J7ZO 1NMNA 3GG4A 5BRFA 4JEPA 3VOVA 3HYFA 4M63C 2KZZA 4CBXA 5KGWA 1VQ7N 1HLUA 3MCPA 3VQ4A 3VF2A 3DLHA 3VQ7A 2HOEA 3VQPA 4CF9A 1HMVA 4E1NA 3MX5A 2KFZA 5AQRA 2Q0UA 3GL1A 1RT2A 3QFPA 5LJVA 3HVTA 3M8RA 4FWSA 4IJAA 3VETA 4OJRA 3HM8A 1VSDA 4KI6A 4BR7A 4DTXA 2Z1GA 3H08A 3K5LA 5FRMA 3NVKA 3BY5A 3D2FA 3VF6A 3HM9A 4BY9C 3D6RA 5F2RA 3RTVA 3CCVN 4H0YB 4F2SA 3AO1A 1XC3A 4MDAA 4KTZA 3EY1A 3AVAA 1O13A 4B8AB 4H5TA 1RTHA 3T7ZA 1BWFO 3THWB 4BR5A 2RF2A 4DV3K 4M7XA 5JMVA 4E7LA 4H5RA 3SPYA 1VSMA 1MWKA 2HB5A 5HRRA 1WSEA 2EHGA 2IVNA 1UA1A 3BEXA 3C6TA 4Z4HA 4FWPA 4AHCA 2IDOA 4X66K 1K8KB 3NMUA 4HHTA 1X9JA 3L2RA 5KGXA 2EWSA 4DTNA 3EE9A 4DQSA 3D45A 4OLBA 3H3NO 3WUHA 2FBYA 4K42A 1G15A 3MWPA 4DCHA 4N47A 2P1JA 1TUYA 1JLQA 4ELUA 4CFDA 4O8UA 1RDWX 3K5OA 3TSPA 2VWBA 4DTJA 5BREA 3PIOL 1WSGA 3HBTA 1VQ6N 1QQMA 3VQCA 2NRRA 4FVUA 3JYTA 3PO4A 2VG6A 2YNIA 4CW7B 1S9GA 3DI6A 3AVMA 2D0PA 3L2VA 4DLGA 1EWQA 2A6AA 3DLBA 3HP9A 3KTQA 1VQON 2NRHA 2PFUA 4O44A 2QTDA 4L8RB 1X3MA 2PY5A 2WTUA 3T1AA 3QNNA 4BG8A 1J53A 3J8AA 3ID8A 5HROA 1IBLK 3C7NA 5M1NA 4FWRA 1RT3A 2D5RA 4JD2B 3E9PA 2VYPA 4BWMA 4K41A 4CJWA 3DWLA 3I33A 4DF4A 4NB4A 4CJ3A 1Z26A 1JCEA 1RTIA 4C1NK 4O5FA 1BQNA 2DY4A 2V51B 4CJEA 1ITGA 4LH5A 5C2FA 3F2KA 3CYMA 1QVGM 2UUCK 3QICA 4BRGA 3EKUA 3TAPA 3QIPA 4YNQA 1VQ4N 4JRPA 3TTDA 4H03B 1NGBA 5FDLA 3KHYA 3H6EA 4JI6K 4BE7B 3I0RA 4LFBK 2YHYA 4GVEA 4B8CA 3O4NA 4ICLA 3ZT1A 1NU0A 1OH7A 4KB1A 4LF4K 2RKIA 3WNGA 5JENA 4NXNK 4DTOA 1U6ZA 4B3RK 3N4QA 1S1TA 3CQ8A 2ASPA 3QBXA 4BDYA 1TK8A 4BC3A 1KTQA 2DFFA 2OYQA 2E8AA 4OPJA 3IMXA 4RG8A 3VQ5A 1TKXA 4Z0UA 3KLGA 4PL7A 1YF5L 4IZ9A 4DUYK 2W41A 3D2EB 3NFAA 4B1VA 2GWJA 2HHHK 1RT4A 4YOWA 4R5PA 1N8RO 4DMNA 2NNWA 4JKDA 4JKGA 4W5QA 1WUAA 1QQCA 4CZHA 3WQUA 4Y1CA 4CD1A 3SQ2A 2NRZA 4OGCA 1RTJA 3HSTB 3RSEB 3HI0A 1A5WA 1IG9A 3A5LC 4KHUA 1UOCA 4B08A 4R79A 1LAWA 3SMSA 4E19A 1S5JA 3NGIA 4A2BA 2VWJA 4JI7K 1B9FA 1JXEA 4DQRA 3CJ7A 4DU4A 1X9SA 1NJIO 4B9TA 3L2QA 4BGAA 2OTJN 1GLDG 1ASUA 3CMEN 3KKRA 2E5LK 2FF6A 1DLOA 2O8EA 3D7EO 1BHLA 3ENHA 1BDGA 1VQLN 3MEGA 3ZSQA 4JI2K 3THWA 3LDOA 1RDDA 3OVNA 2FSKA 1X9WA 2O8DA 3M8PA 3O3GA 2IOCA 2Q31A 4KFBA 2QWQA 4BE1A 3L0QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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