2YHWA

High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA02
1R59O 3VEXA 2HF3A 4CD3A 3UE5A 1QZ6A 3O5BA 3VOVA 4HWIA 2GTDA 1LOTB 3WQUA 4MO4A 3WXKA 4CZEA 1G99A 2ASOA 4BC2A 4I6MA 1TYQB 4JHDA 1BG3A 3HI0A 2BUPA 1GLDG 2Q1NA 3GG4A 4E1JA 4A2BA 4H0VB 5KPZA 1CZAN 3IFRA 4H5RA 5AFUH 1NGGA 4CZGA 3SK3A 3G25A 5AQJA 4BG8A 5LY3A 1X3MA 4BQLA 5KPTA 1YVNA 3VPZA 2Q0UA 2HMPA 3MCPA 4CZLA 4DCHA 4O5FA 1QHAA 2VWBA 3EKSA 4XEIA 4JAXA 3WQTA 2P9IB 3D2EB 5AQZA 1TUYA 5EY4A 1GLAG 3L0QA 1C0GA 1JCFA 4A2AA 1RDWX 3A8YA 3HSCA 3O1WA 2V51B 5AQNA 1NGAA 1MWMA 3H3NO 1GLFO 1ESVA 2ZF5O 1T6CA 3CHWA 3CJAA 4BRHA 5BR9A 3U9DA 2AA4A 3MN9A 1SZ2A 3IMXA 3ZX0A 4H0PA 3M6GA 1S3XA 1IG8A 3H1QA 1YXQA 2D0OA 4DQ8A 1K8KB 3GL1A 3KZBA 3D2FA 3U8XA 1S22A 4A61A 3C7NB 1EQYA 3HTVA 4ISGA 3CJCA 3UKRB 3DXKA 3CIPA 4M7XA 2P9IA 3LDLA 1H1VA 3GOIA 3A5MC 3OHRA 1Z6RA 3DJCA 2P9UB 2GELA 1BO5O 3ENOA 4IJNA 3VEYA 4BVOA 3GBTA 2E2PA 4LC9B 4BC4A 4BROA 3GE1A 4FWSA 1NGEA 5AQUA 2A5XA 4XH5A 4XH1A 1QZ5A 3VERA 2FXUA 4Y0WA 1NGJA 4NO7A 1DEJA 1NGIA 3U9ZA 4IO8A 4GY2B 1HUXA 3J8AA 5AQSA 3MMVA 3TPQA 2ASPA 4I6MB 4BRAA 3QBWA 3FGUA 2YJFA 3QMLA 1GLEG 1QQOA 3VGLA 2P9SA 5JMVA 5F2RA 3WXJA 2Q0RA 3AAPA 4CBUA 4EFHA 5LJVA 2E1YA 5B8HA 1ZBSA 2V52B 1NBWA 1U2VB 3VETA 5AQIA 3VENA 1V4SA 3CQXA 3H46O 3ATVA 5AQKA 3ID8A 3D7EO 2H3GX 2E2QA 4JNEA 3CJ1A 4BRKA 4FWQA 4BRGA 4BGAA 4FPBA 1WUAA 2V7ZA 4BR2A 3KHYA 4BR7A 4CZKA 2I7NA 4EHUA 5BPNA 1U6ZA 4C23A 3UB5A 1GLBG 5AQWA 4B1VA 2NRHA 3MDQA 3WUHA 5F0XA 2CH6A 5EXWA 2YI1A 2QWMA 3D2FB 4ISEA 3CQYA 3LM2A 4BVPA 5BPMA 1J6ZA 3LDNA 5AFUA 3F9MA 4H0XB 1BA1A 1NGDA 4J8FA 4FWMA 4BGBA 2BTFA 1U2VA 3DXKB 3H1VX 3VEVA 1D4XA 5EX5A 4MO5A 4H0YB 1DGKN 2I7PA 4KBOA 2QWNA 1KXPA 3IUCA 1T44A 5AQPA 1HKBA 1NMDA 1NLVA 4K43A 2DPNA 3ENHA 2ASMA 2GWKA 3ATUA 3O8MA 3ULEA 4BG9A 2QWPA 1C0FA 3B8AX 3VGKA 4BREA 2YJEA 2W40A 3FZMA 3BUZB 4B1UB 5AQHA 2Q2RA 3JS6A 2KHOA 2QWOA 2F9TA 1ATRA 5FPDA 3VGMA 1XUPO 5AQGA 3ZEUA 3HM8A 4B1WB 4RTFD 2IIRA 4CZMA 4H03B 1OKJA 2UYTA 2FSJA 1X3NA 1X9JA 4HTLA 3O6WA 4QS7A 1P8ZA 3A5LC 1GLLO 3WXIA 2Q97A 4BRFA 3A5OC 4H0TB 4AM6A 4A62A 2QW9A 2QXLA 4BR9A 3L4IA 2P9SB 2IVNA 2GUPA 3O80A 4YDUA 5BRDA 5JICA 4Z94A 4BRNA 5ELZA 5AQQA 5KQDA 2E20A 1KAZA 3TU5A 3WT0A 2YCHA 4MLHA 3SLCA 5KPRA 4AM7A 3FE1A 2VYPA 1HLUA 3O08A 3RSEB 2E2OA 2P9NB 4DB3A 4K42A 3BP8A 5EOYA 3AY9A 3W3DA 4FOIA 3WEEA 1YAGA 3QDKA 2A41A 5E26A 4FO0A 3SJHA 1GLCG 4EHTA 5AQYA 4IZ9A 4JN4A 3FFKB 1V4TA 2ZGZA 3ZETA 1ZC6A 4K25A 4PKGA 1Z05A 1T6DA 2ZWHA 3R6MA 5AQMA 3HBTA 4CZFA 4YDUC 4B1XB 2CGLA 3FZKA 2W41A 2EWSA 2P9PB 4BR0A 2Q31A 3O1BA 3ZX3A 1QQNA 1MWKA 1NGHA 3H3OB 5BRFA 3QICA 5KQ8A 4BQZA 5CE3A 1WOQA 4MLEA 1KAYA 3EO3A 4O8KA 4DHYA 5FPEA 5ADXH 3RSEA 1XC3A 4H5VA 4CBXA 3VF4A 3P4IA 2P9NA 3WXLA 4F9OA 2QWQA 3VF2A 1SAZA 1BU6O 5BPLA 4PL7A 1YUWA 3DXMB 5AQTA 4B9QA 4EAHD 3HZ6A 1E4FT 1NGFA 2GWJA 1MDUB 2QWLA 3KVGA 3M3ZA 1ATSA 3S41A 3IDHA 2FSNA 2VCPA 2P9KA 3ULEB 4FWOA 3SMSA 3AAQA 5FPNA 4CZHA 3LM9A 2IVPA 2IVOA 2D0PA 1BWFO 3EZWA 3H45C 2P9PA 4FWPA 3W0LA 1JCEA 3FZLA 4BR5A 3R9PA 3LDQA 3ZEUB 2QM1A 3I8BA 4WQ4C 4FOEA 1HX1A 4PKIA 3LDOA 4K41A 5LJWA 2D4WA 1SQKA 2PBDA 2D1KA 2Q36A 1GLJO 3L6QA 4H5NA 2P9LB 3A0IX 3DXMA 4RCHA 4FSVA 4IJAA 2A42A 4H5TA 4BRDA 5BRHA 3R8EA 1BDGA 4BRIA 2E88A 2E1ZA 3MN7A 5JLFA 1BA0A 3C0BA 4WQ5A 1E4GT 1NWKA 5AQXA 2J4RA 2A40A 5FPMA 3VEWA 4JD2A 4L3QA 4BC3A 4BRCA 1KAXA 3JXUA 2YHYA 3FZHA 4H5WA 3BF1A 4B1ZA 5EVZA 1HPMA 3A5NC 4XH4A 3U4LA 4GNIA 1BUPA 3FR0A 2CGKA 1XQSC 2CGJA 2HF4A 3LL3A 4NB4A 4BC5A 1TYQA 3WEEB 4PL8A 2OANA 3BEXA 2AP1A 2P9LA 3CETA 1IJJA 3AARA 5E84A 5BN8A 4H0OA 3VF6A 3DAWA 3O4WA 5AQLA 3ZETB 5AQRA 4QS9A 1NGCA 3ZX2A 2CH5A 1Y64A 3LDPA 1DKGD 5TKYA 3CJBA 3VEZA 1HJOA 4BRMA 2FSKA 3MN5A 1TUUA 4WQ5C 1ZXOA 1ATNA 3CI5A 5F1XA 3MN6A 3EL2A 1RFQA 3D2EA 4CD1A 4IXCA 1HKGA 5JLHA 3EKUA 5BREA 1NM1A 2E2NA 5AZJB 4PKHA 5AR0A 5BN9A 5AZIB 2QWRA 2V7YA 2NZTA 1MA9B 4CBWA 4CZJA 2GEMA 1RGIA 1LCUA 4BRQA 2FF6A 2ZGYA 4M7YA 3VESA 4EIAA 3QB0A 3FLCO 4FWLA 5AQFA 2ITMA 3M1FA 2P9KB 3CERA 3I33A 3UKUB 2F9WA 1K8KA 1HKCA 4BR4A 1Q18A 3QFPA 2YHWA 5I9EB 3C7NA 3MK6A 2WUSA 2FLOA 2PAVA 5AQVA 4WQ4A 1JCGA 2A3ZA 3UKRA 3SMPA 4CI6A 5AQOA 4RWTA 2E8AA 4BRLA 3QFUA 4ISFA 3CJ9A 4FWNA 4JHDB 5AZJA 4B1YB 3QBXA 3BF3A 5AZIA 4CJ7A 4WYBA 2P9UA 4FL9A 3VEOA 4IWVA 3FZFA 5ADXA 1QQMA 4BRPA 4FPAA 4CZIA 2HOEA 3CJ7A 4M63C 4QS8A 2FF3B 4FWKA 1BOTO 3DWLA 1NGBA 3GDQA 2A6AA 4FWRA 2NLXA 2YHXA 3UKUA 3EN9A 4JD2B 3H6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJJA 4CJ5A 4OGCA 1QZ6A 3RTVA 4DS4A 3ZSVA 5GAEP 4DTNA 3HPHA 3VOVA 2GTDA 2FBXA 2IDOA 3WQUA 2W42A 4CZEA 1I39A 3OY9A 1HYVA 2ASOA 5KTQA 1QVFM 1BG3A 2O8FA 2VQFK 4A5AA 1GLDG 4A2BA 5DMRA 3IFRA 3NH0A 3SK3A 3SUNA 3LZIA 4R5PA 4BG8A 2KZMA 4CF8A 4BQLA 3HVRA 1KCFA 1YVNA 2WTUA 3VPZA 4DFMA 2HMPA 5CYQA 1VSIA 1VQNN 4H4OA 4XEIA 1TUYA 5GIOA 1QSLA 2GUIA 4A2AA 1Q86O 2ZJRL 4O0JA 3L4QA 1MWMA 1KC8O 5J2NA 1ESVA 3ZYYX 1VSFA 4JYAK 3CHWA 3NF7A 3U9DA 2HNYA 3LAMA 3AVMA 4F8RA 1SZ2A 3U6FA 3M6GA 1IG8A 3H1QA 4Z4HA 3CM5A 3LWMA 1RTDA 3P1GA 3D2FA 1EQYA 1XI1A 3DXKA 3HRGA 3LDLA 1H1VA 3GOIA 1N6QA 4FZYA 1W7AA 1KRPA 1Z6RA 3DJCA 3G71N 5FRMA 5BR8K 1IBLK 1BO5O 4IJNA 4NXNK 4M42A 5HRPA 3F2KA 2O8EA 4H4MA 3TAGA 4LC9B 4BC4A 4BROA 4FWSA 5IWAK 2O8DA 2A5XA 3ZT0A 2Y1JA 3VTIA 2FXUA 4YOUA 4AHTA 4JI4K 4FJ7A 4NO7A 1T8EA 3C6AA 3RVCA 1NGIA 3S3MA 1RCHA 2WBNA 5AQSA 4PHTX 3AVKA 3CG7A 3P38A 1S9GA 3OYIA 1WAFA 1QSYA 3MWTA 4BRAA 3TI0A 3WNFA 3AVFA 5GAHP 1GLEG 2F96A 4B8AB 3VGLA 3ITHA 3WXJA 3Q7CA 4DUZK 4CBUA 4EFHA 2O8BB 5D3GA 3DLGA 4KHYA 4DLEA 5B8HA 1BI4B 2V52B 1NBWA 1U49A 1HYSA 4LH5A 1U2VB 2NRZA 3TTCA 2QK9A 1SS6A 1DTTA 1V4SA 3ATVA 3CQXA 5AQKA 3V81A 1C6VA 4BDZA 1D5AA 4BRKA 2NRXA 1YJWN 4BGAA 2AJQA 1YI2N 1WUAA 2V7ZA 4CZKA 4EHUA 2HBLA 4BR7A 3PV8A 3CD6N 2I5JA 3B6OA 1TAQA 1GLBG 1T05A 4B1VA 1S6QA 4BY9C 5F0XA 4F2SA 2QWMA 3LM2A 1VSEA 4BVPA 5BPMA 1J6ZA 3A2FA 4BGBA 2BTFA 3R3LA 4LFCK 5HOOA 1NK9A 2X78A 3VQPA 1RDAA 3OW2M 1QS4A 1RBVA 4H0YB 4FJ9A 4KBOA 2P5GA 1X9SA 4DU1A 1KXPA 5HRRA 1UA1A 2UXCK 1VQ4N 2DPNA 4LF9K 3ATUA 3I55N 4CGGA 1VQ8N 3E01A 1NK7A 2W40A 5FPDA 3HL8A 1HNWK 3KKRA 1QHTA 1VQ9N 4O55A 2KLAA 3KJVA 1HR0K 4CZMA 4K8XA 3CFRA 3VA3A 1X3NA 4HTLA 4YORA 3CCJN 3WXIA 1Q81O 3H08A 3G4SN 1U04A 3LALA 4BR9A 2KW4A 4YDUA 3L4IA 2YX6A 4CGDA 4Z94A 3IKMA 4WFNL 4KHUA 2OZSA 3WT0A 4M3XA 5FLXO 4AM7A 3FE1A 4FYDA 2E4LA 1HRHA 1HLUA 3ZSWA 4E7HA 4B9VA 3L2WA 4JI8K 4K42A 4HUFA 3PIPL 4KHNA 3AY9A 1VSHA 4E19A 1E3MA 3WEEA 1TVRA 4E3SA 4C8OA 2BDPA 4FO0A 1QE1A 5C12A 5AQYA 3FFKB 3OYMA 4K25A 2ZM6K 1ZBIA 4HHTA 1S1WA 2OA8A 2ZWHA 4B1XB 4I2PA 2A1RA 1RNHA 3V1RA 4BR0A 1A5XA 4C1NI 3O1BA 1MWKA 5TKWA 2P51A 4BQZA 5CE3A 3ISNC 4MLEA 1D9FA 5FPEA 4CJPA 3RSEA 1XC3A 4CBXA 5KI6A 3IRXA 4B9SA 1BU6O 4PL7A 5AQTA 1R0AA 3NH1A 3KVGA 3M3ZA 1ATSA 1OH7A 4RW9A 5CZ1A 2VCPA 3LWLA 2HHWA 1KVAA 2P9KA 3ULEB 3TANA 4OJRA 4CZHA 3FFIA 3AO4A 3LM9A 2IVPA 2IVOA 3IS9A 4AILC 4N76A 1BWFO 3EZWA 5KRSA 4N5SA 3H45C 4FWPA 4CESA 3OYBA 3PUFA 1XMOK 3R9PA 4WQ4C 3VN5A 1G15A 2FBYA 2ZD1A 4PKIA 4LF8K 1NJYA 4K41A 2D4WA 2Q36A 3CFPA 3A0IX 4FJXA 3DXMA 4RCHA 2A42A 3CPEA 3V4IA 3S9HA 2YKMA 3C94A 1BDGA 2E88A 3MN7A 2HVIA 5AQXA 3THXA 4OKKA 5FPMA 5M1OA 3HM9A 1HJRA 3E66A 3DLLL 1LV5A 4BWJA 3VQ6A 4CJVA 4KO0A 4AHVA 2YHYA 4CERA 4H5WA 3NAEA 3BF1A 4BE1A 4QOZB 4DR2K 4XH4A 3T1HK 3KD1E 4W5OA 4BDYA 4DSJA 3FR0A 4CCHA 2CGKA 1W9HA 2CGJA 4NB4A 4BC5A 1TYQA 2HHXA 3BEXA 2P9LA 5E84A 5BN8A 3WNGA 4CEBA 3O4WA 4KI4A 3ZSXA 4CHOA 4QS9A 1NMNA 1WBDA 2IC3A 2CH5A 4QAGA 2Z1GA 5TKYA 3PSIA 2VWKA 4BRMA 3MN5A 4CF1A 1VQLN 2WFBA 2Z1JA 4JK7A 4KHWA 1ATNA 3T3FA 3MN6A 4DR7K 3D2EA 1T03A 4CD1A 4IXCA 4DV4K 5HLFA 1EO1A 2ZJQL 5BREA 4YOYA 5CHIA 5AZJB 3AGRA 2V7YA 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1RILA 2KTQA 2P9IA 2G8VA 3KLGA 4HCCA 3O9QA 2ZQBA 3TAQA 3OHRA 4N56A 1M1KO 1W0HA 4X66K 3HK2A 2QXFA 3DI6A 4CEFA 3GE1A 1NGEA 5AQUA 3TTDA 5M1FA 1QZ5A 4CJWA 3AA3A 2F8TA 3TSQA 4DMNA 5K14A 4GY2B 4DTOA 3SPYA 4ELVA 3O9RA 1YTAA 1IV0A 5SZTA 3MMVA 5J1EA 4N47A 3TPQA 2VWJA 4FXDA 1XHZA 3FGUA 4DWIA 1SL1A 4CK3A 3J81O 3CFOA 4CIFA 2F8SA 1DLOA 3LP0A 2P9SA 4I7FA 3MECA 5F2RA 4E1NA 5MLCQ 4OKJA 5LJVA 4M45A 1ZBSA 2BANA 4DV3K 4KTZA 3T7ZA 4J2AA 3AGKA 3LZJA 3DLHA 3H46O 2R7YA 3ID8A 3DLEA 1I94K 3CJ1A 4DV1K 2DFEA 4FPBA 4BR2A 3KHYA 2BGGA 1U6ZA 2JWLA 1LAVA 3UB5A 2P1JA 3SQ1A 3Q7BA 3MDQA 5EXWA 1RT2A 2IGIA 1ZBFA 1Q82O 5EU7A 4JK9A 5AFUA 3CPWM 1BA1A 4J8FA 4FWMA 4OGEA 3H1VX 5C2DA 1HNXK 5C10A 4YNQA 3O3GA 1N5YA 1DGKN 2I7PA 3ZSZA 4KH4A 2QWNA 4LF6K 1T44A 3OBYA 5AQPA 4DTJA 4CJRA 1NLVA 4F2RA 5FRNA 1NU0A 1KSPA 4GV6A 2ASMA 1T7PA 2GWKA 4BG9A 5C25A 1C0FA 2YJEA 3FZMA 3BUZB 1WSFA 2F9TA 3SAFA 1S72N 3VGMA 1Z25A 4B1WB 2HHTA 3KKSA 2E6MA 1C1AA 3RWUA 4H03B 2FSJA 4E7LA 2A1SA 4EP5A 1WSGA 4OPAA 4AM6A 1VQKN 1NJWA 1YITN 1S1VA 4G1QA 2LSNA 2D5RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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