2YHWA

High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA02
4BR0A 4BRCA 4BRMA 2A3ZA 4FWKA 1XUPO 1Z05A 3BF3A 5AZJA 5EX5A 3MDQA 4XH4A 3QICA 4H5WA 5AZIB 4EIAA 4RCHA 4A61A 4NB4A 3VESA 3KZBA 3OHRA 5FPMA 3O1BA 4BVOA 3FE1A 3UB5A 1NGGA 4FWNA 4BR9A 3H45C 2DPNA 4ISGA 4FL9A 5BREA 2P9LB 4FOIA 2P9UA 5BN9A 4BGBA 3DAWA 4FWQA 4ISFA 1BU6O 2GEMA 3ATUA 3M6GA 3SJHA 2QWRA 3FFKB 3A8YA 1NGFA 1S22A 1T6DA 5F2RA 3AAPA 1T44A 5AQNA 2FF3B 3QBXA 3FZMA 2Q0UA 4CD1A 1SQKA 4DHYA 3CJBA 2BUPA 4BG9A 2AA4A 3IDHA 5BR9A 1ESVA 2J4RA 1KXPA 1BOTO 2P9IA 4K25A 4JD2A 3CJ7A 1ATRA 1C0FA 4O8KA 4RTFD 2HF4A 3LM9A 4B1XB 3ZX0A 1NMDA 3C7NB 3M1FA 2YHXA 5F1XA 4QS7A 2I7NA 2QM1A 2FSJA 5LY3A 1K8KA 1E4FT 2CGLA 3LDQA 4M7XA 4XH5A 1DGKN 2NRHA 3RSEB 2D0PA 5AQGA 4WQ5C 4MLEA 2FSKA 4AM7A 4BRQA 3EL2A 3DXKA 5AQZA 3EN9A 2EWSA 3ZX2A 1BA1A 3EKUA 5AQTA 5BRHA 2GELA 2OANA 3GOIA 1GLBG 1U6ZA 3VGLA 5KPTA 2PBDA 3VEXA 4FWOA 1KAZA 1BUPA 2Q31A 1V4TA 3LDNA 3WUHA 1QQNA 3UKUA 3GDQA 2E1ZA 2AP1A 1TUYA 5AZIA 4BREA 3GBTA 1QQMA 4PL7A 3VETA 3M3ZA 2I7PA 3DWLA 1H1VA 1G99A 3ULEA 2W41A 4B1UB 3A0IX 4FOEA 1JCFA 2A5XA 4B1WB 2D1KA 3MMVA 3CHWA 1NM1A 3LDOA 1RGIA 5BPLA 3VGKA 1GLDG 3QB0A 2P9UB 3FZHA 3QFUA 3VEVA 1LOTB 2YJEA 4BRAA 1NGEA 1WOQA 4L3QA 5F0XA 4B1VA 3U4LA 2A40A 4PKIA 2IVNA 3ATVA 3WXLA 2P9KB 3VEWA 3LL3A 1J6ZA 3ENHA 3VEZA 4B1ZA 4YDUC 3C0BA 4A2AA 2A6AA 5E84A 3QMLA 4CZKA 1MA9B 2E8AA 2HOEA 1QQOA 3ID8A 4BR2A 4XEIA 3GE1A 4FPBA 1X9JA 3U9ZA 4BRGA 4YDUA 1BG3A 2D0OA 3DXMA 2IVOA 3FR0A 4FWSA 4B1YB 3R8EA 2CGKA 5FPEA 3R9PA 4PL8A 5AQKA 2P9IB 2V52B 3HTVA 4IJAA 5JLHA 3VF6A 5AQUA 2YJFA 4F9OA 1Y64A 2FF6A 1MWKA 3O80A 3ZEUB 4FWMA 5AQYA 3WEEA 5EVZA 3WEEB 4BR4A 3D2FA 2Q97A 4K41A 2D4WA 2W40A 3D2FB 4EHTA 3VEYA 2NZTA 3UE5A 4BROA 4I6MB 3ZETA 4BRDA 3CJCA 5AZJB 3R6MA 4BC5A 3IMXA 3L0QA 4O5FA 4JNEA 5JMVA 3GG4A 1YAGA 1GLFO 4Z94A 2CGJA 5AQOA 3ZX3A 3AARA 2FXUA 3BP8A 3HBTA 1GLLO 5E26A 5AQPA 1NLVA 3H1QA 5AQMA 4BRIA 3DJCA 1JCGA 3CERA 2E2NA 5KQDA 2GTDA 5B8HA 3MN6A 2P9KA 2ZWHA 2P9PA 1OKJA 3H46O 2PAVA 4B9QA 2ZGYA 5BRDA 4FPAA 4H0YB 1X3NA 4FWPA 2V51B 4CJ7A 3LDPA 2P9NB 1ZC6A 5AFUH 2GWKA 1HKBA 3CJAA 5AQRA 3HI0A 4H5NA 4BQLA 4BR5A 1R59O 3VERA 1HKCA 2QWNA 3O6WA 4KBOA 3W0LA 3VPZA 2V7ZA 3S41A 5BN8A 4BC4A 1BDGA 1ATSA 1HLUA 4JHDB 4BC2A 1MWMA 2E2PA 3CQXA 3GL1A 2Q1NA 4CBWA 4FSVA 3EKSA 2Q0RA 4H5VA 1BO5O 2QWQA 3A5MC 2YHWA 3VENA 5FPNA 3O1WA 1WUAA 3D2EB 3FLCO 3HSCA 5AQXA 3L6QA 4BRHA 1DKGD 2P9NA 1GLEG 3O8MA 4CBXA 4CBUA 4IO8A 3AY9A 3CJ9A 4I6MA 4NO7A 3A5LC 4BGAA 1BWFO 5AQFA 5ADXH 1Z6RA 1HX1A 4EAHD 3LM2A 4H5TA 5EXWA 4EHUA 5JLFA 3JS6A 3C7NA 2P9LA 2Q36A 3P4IA 3WXJA 3HM8A 3VEOA 1XQSC 2QWLA 4BC3A 3O08A 2A41A 3L4IA 1YVNA 4H0TB 4H03B 2QWOA 3MN5A 3VOVA 5AQIA 4BRPA 3ZETB 3ULEB 2KHOA 1JCEA 1EQYA 2BTFA 3EZWA 1NBWA 3O4WA 3SK3A 4CD3A 4H0PA 4JD2B 4BG8A 4BRNA 1YUWA 1QZ5A 4BR7A 4FO0A 4HWIA 3F9MA 1NWKA 1NGCA 1GLAG 3UKUB 5CE3A 4A2BA 4XH1A 4CZIA 2E20A 3UKRB 2VWBA 5ELZA 1V4SA 1HPMA 4PKHA 4WQ4A 2P9SB 4ISEA 3A5OC 1NGHA 3FGUA 1TYQB 3QDKA 3H3OB 1DEJA 3UKRA 4LC9B 1HKGA 3W3DA 1NGJA 4MO4A 1Q18A 2E88A 1QZ6A 2FSNA 4RWTA 4BQZA 3G25A 3QBWA 3U9DA 3SMSA 4JN4A 3B8AX 1ATNA 2ZGZA 1NGDA 4GY2B 2ASPA 3WXIA 4DQ8A 3D2EA 4FWLA 4M63C 5I9EB 3I33A 2UYTA 3VF2A 5BPNA 2YI1A 2F9WA 3KVGA 2VCPA 3BUZB 1NGBA 5BPMA 4H0OA 4WQ4C 1U2VB 5AQHA 1RFQA 4EFHA 3FZLA 3FZKA 2E1YA 5LJWA 2WUSA 4BVPA 1GLCG 3VGMA 4BRLA 3AAQA 3I8BA 3BF1A 4CZEA 5ADXA 1KAYA 2ZF5O 4A62A 1QHAA 5KPRA 4C23A 4CZMA 1XC3A 2Q2RA 4E1JA 1SAZA 3MN9A 3VF4A 3CETA 3RSEA 2V7YA 4J8FA 5FPDA 1TUUA 4QS8A 1SZ2A 2GWJA 5AR0A 1HUXA 5AQSA 4CI6A 4K43A 4PKGA 4H0VB 2CH5A 3MK6A 2GUPA 3H3NO 2FLOA 4IXCA 3A5NC 3WQTA 2QWMA 4WYBA 3FZFA 4CZGA 1HJOA 2ASMA 1CZAN 2QXLA 2ASOA 4CZLA 2E2QA 2P9SA 4HTLA 3WT0A 3IFRA 2NLXA 3TU5A 1MDUB 3BEXA 2E2OA 3ENOA 2HMPA 1D4XA 3CIPA 2A42A 3TPQA 3DXKB 5LJVA 4IWVA 2YCHA 3ZEUA 5BRFA 3EO3A 5AQJA 3IUCA 4BRFA 2H3GX 2QW9A 3CI5A 3J8AA 1KAXA 2ITMA 3MCPA 4K42A 3KHYA 3O5BA 4DB3A 1T6CA 3SMPA 3MN7A 3HZ6A 2CH6A 4Y0WA 5AQVA 3CQYA 2YHYA 5EY4A 4JHDA 3DXMB 4H0XB 5AQLA 5KPZA 1S3XA 4JAXA 4AM6A 1RDWX 1YXQA 1P8ZA 4IZ9A 4IJNA 5TKYA 3SLCA 1ZBSA 4GNIA 4DCHA 1BA0A 2F9TA 3QFPA 3H6EA 5KQ8A 5JICA 3JXUA 3WXKA 5AQWA 4MO5A 2QWPA 3LDLA 1X3MA 5AQQA 5EOYA 4CZJA 3H1VX 4H5RA 1GLJO 2VYPA 3D7EO 3CJ1A 3WQUA 5AFUA 3U8XA 1TYQA 1ZXOA 4BRKA 4M7YA 1LCUA 4FWRA 4QS9A 1C0GA 4WQ5A 4MLHA 1K8KB 1IJJA 1IG8A 1NGIA 1U2VA 2IIRA 2HF3A 2P9PB 1E4GT 2IVPA 1NGAA 4CZFA 4CZHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR0A 1I39A 4KFBA 3QLHA 4WFAL 4E0DA 4FWKA 3BF3A 3DLRA 3C6TA 1YJNN 4JEPA 4BDPA 4XH4A 1C1BA 4MQ3A 3QICA 4WCEL 3HOSA 3MWPA 1U45A 4DSKA 1WSGA 2YHBA 4FJ9A 2O8CA 1HNXK 2PY5A 3CCQN 3UB5A 1NGGA 1L3TA 3H45C 3AVMA 5BREA 4BGBA 3TSQA 3LWMA 1IKWA 4FWQA 1WBDA 3ATUA 3CM6A 3SJHA 2QWRA 4ELTA 1NGFA 1DTTA 5F2RA 2ZD1A 3AAPA 4FLUA 2OPQA 1OH6A 5SZTA 4JI1K 3FZMA 4KHWA 3TAPA 1KRPA 3JYTA 4E7HA 4KAZA 4JRPA 4BG9A 1HQUA 3IDHA 4CF9A 1NOZA 1I94K 4M42A 4DU4A 3SUNA 1ATRA 4FK0A 3FFIA 3OYAA 3D6RA 4RTFD 3CMAN 3LM9A 3E1YA 3ZSXA 4OPKA 3M1FA 4QAGA 5H1SQ 4KKOA 3J80O 5HOOA 1KVAA 3M8RA 5LY3A 3V9SA 1K8KA 3QEPA 4B9VA 1E4FT 4RW6A 4KTQA 4M7XA 2NRHA 5FDLA 4CIGA 4MLEA 4BRQA 4JS5A 4M3UA 2EWSA 5AQTA 4JKGB 4DR6K 3GOIA 5LMNK 2WFBA 3VGLA 1EKEA 2HHHK 5I3UA 4FLVA 2Q31A 1D8YA 4BE0A 1QQNA 1YHQN 1S1TA 3IS9A 2AP1A 5AZIA 3AVFA 2VG5A 2E6MA 1QQMA 3THXB 4FLYA 1L3SA 2I7PA 4YOUA 1H1VA 3ULEA 4KO0A 3A0IX 3L8BA 4GMJB 4F4KA 1DT9A 1VQKN 1VSLA 3LDOA 1XHXA 1TKDA 4WF9L 4YOTA 1WNSA 2IAJA 2YHAA 3JSMA 4LF7K 4BRAA 3L3VA 4BACA 4HCBA 3AO1A 4L3QA 5F0XA 4FZXC 3U4LA 1WLJA 2A40A 3WXLA 3NFAA 1VQLN 1RDUA 1J6ZA 3NH1A 4CEOA 5J2NA 3CYMA 5E84A 3UIQA 1QHTA 2HOEA 2RHKA 3OYEA 1JLBA 1O13A 3GE1A 3U9ZA 2AJQA 1BG3A 4Z4HA 1P90A 3MWTA 1IV0A 1RILA 1JJ2M 4BDYA 3R8EA 3LP3A 4AHRA 4DG1A 3TABA 3ZSYA 1NKCA 1JXEA 3C95A 3SV4A 4F9OA 3KWGA 3VMFB 2FF6A 4DTUA 3T1HK 1MWKA 3ZYYX 5LMUK 4HTUA 4FWMA 4M3XA 2Z1JA 4OKKA 4DU3A 4DFKA 3WEEB 3CPWM 2WOMA 4EHTA 3VEYA 3ITHA 3HXMA 4CESA 1HNZK 3UE5A 4X62K 1QTMA 3KK1A 4DV3K 1VQ7N 3ZETA 4BRDA 3V4IA 2VG6A 1KCFA 2ZJRL 4ZTFA 3L0QA 4FJJA 4CHQA 3QETA 1RDDA 1YAGA 4CCHA 2D0BA 3DLBA 4NLBA 2O8EB 3BP8A 3HBTA 1GLLO 5AQPA 2HNZA 4OO1J 4AF1A 3MEEA 4JI0K 4JKEA 4DV2K 4W5QA 2PAVA 4B3MK 3P31A 3QEIA 1LWCA 4KHQA 2V51B 1ILYA 4JI5K 1GOBA 3LDPA 2VG7A 4NYFA 1FXXA 4KTZA 3EYZA 4E19A 1ZC6A 5GIPA 3BDPA 3HI0A 3PO4A 4YNQA 1U4BA 3O9QA 2Q3SA 1R59O 3Q7CA 4KBOA 4FJKA 1BDGA 4KV8A 4JHDB 4BC2A 1MWMA 3CC4N 1Q81O 4DSEA 1NKEA 4DQIA 3CCEN 2VGNA 4LFCK 3KLGA 1T05A 4H5VA 4ILGB 3SUPA 2FBXA 4V19S 5FROA 3HPHA 3TTDA 3ZT3A 1J5OA 3AVNA 3L6QA 4CBUA 4I6MA 1QVGM 1IKYA 5AQFA 1VSEA 3HPGA 3LALA 2QXFA 2VQFK 5C0YA 1I3AA 4DR5K 5EXWA 4H5TA 2P9LA 3MCAB 4IG0A 3P4IA 3OTOK 3HM8A 3VEOA 3LP2A 2OTLN 1HNWK 3CCLN 3L4IA 5CZ2A 4B3OA 3U3YA 3PX0A 4H0TB 1QS4A 4DV6K 4E7KA 3IKMA 2KW4A 4CJLA 4DSJA 3EZ5A 2HHUA 1MU2A 5C24A 3KD5E 3ULEB 3CD6N 4K0KK 1EQYA 1JCEA 3EZWA 1NBWA 3O4WA 5HRNA 1T3VA 3NF7A 1SUQA 4CJRA 2OZMA 1WN7A 2YV0X 1LW0A 4JI6K 1ASWA 4Y1DA 5CE3A 2OCEA 1VQPN 4KTWA 4RG8A 5ELZA 4DTRA 1HPMA 1IKVA 4WQ4A 3SQ4A 4AHCA 3A5OC 4DTNA 3FGUA 4YOYA 4CJWA 3EE9A 1FJGK 3UKRA 4LC9B 4J2EA 1Q18A 2E88A 3T19A 4NCBA 4NCAA 4I7FA 4FJXA 2HNYA 2GUIA 3G25A 5J2QA 1QSLA 3DMJA 1NGDA 2ASPA 4CJ5A 2UYTA 3TAFA 4CFDA 5BPNA 1LAWA 1LAVA 2F8SA 1Q9XA 4WQ4C 3RVCA 3WNEA 1U47A 4E3SA 3IAYA 4EFHA 3I56N 4E89A 2HHVA 4M45A 3VGMA 3SNNA 3ALYA 4YOXA 2UXBK 2KKZA 4CECA 2P51A 1TVRA 4A62A 4DQSA 2RPIA 4OGEA 5KPRA 4CGIA 4C23A 3L2VA 2FC0A 1A5WA 1UA1A 3CETA 3MAQA 3T3FA 4B9TA 2V7YA 4FW2A 4J8FA 5FPDA 3PX6A 3WNGA 5AR0A 3T7ZA 3ZT1A 1VQ5N 3OYMA 2O8BA 4PKGA 4KI6A 4H4OA 4F2RA 1O1WA 4DQPA 2FLOA 3ZT2A 3B6PA 3AO4A 3CCJN 4HUGA 1T03A 3A5NC 3WQTA 2QWMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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