2YHWA

High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA02
4EAHD 2P9KB 3EZWA 3KHYA 2ZWHA 1J6ZA 1Z6RA 4BR5A 3WT0A 1QQOA 3O80A 3DAWA 3R6MA 3CIPA 4CZFA 2Q1NA 2P9KA 3ATVA 2CGKA 4RCHA 5AQGA 4M7YA 1WOQA 2Q97A 4BROA 3QBXA 1TUYA 5JLFA 4FOIA 3RSEB 4JNEA 5AQXA 5BRHA 4B1WB 4CZHA 2E2PA 5BR9A 2IVOA 4PKIA 1QQMA 5AQJA 3IMXA 2GEMA 2E1YA 4PKHA 5AQMA 5ADXA 3RSEA 4CZJA 1EQYA 5AQKA 2IVPA 3O1WA 3HTVA 1SAZA 2Q31A 2ZF5O 4FL9A 1NGEA 2GELA 3U4LA 3BF1A 1KAZA 3MMVA 4FOEA 3H1VX 2P9SB 3HM8A 4CZKA 1NM1A 3U9DA 3SLCA 1GLLO 4H0XB 4A2BA 1TUUA 2P9SA 1JCEA 1MA9B 5B8HA 3LDLA 3LM2A 3FZLA 3DXKB 4XH4A 3DJCA 4GNIA 4DB3A 4RTFD 3LL3A 1V4TA 5EVZA 4BC3A 1E4FT 1RGIA 3DXKA 3OHRA 1NMDA 1BOTO 1U2VB 2E2NA 2EWSA 3QB0A 4B1VA 3VOVA 1RFQA 5EOYA 5AZJB 2P9NB 1YAGA 3ENOA 5AQNA 3FR0A 1NBWA 3CETA 3CJAA 5FPNA 3UKRB 4DCHA 1U2VA 2CGLA 2GUPA 2QWLA 5KPTA 5AZJA 2P9NA 4H0YB 1BUPA 4WYBA 3UKRA 2E2OA 3MN6A 3IUCA 3VPZA 3O1BA 4FPAA 2ASMA 3BP8A 4BRIA 1T6DA 3WXIA 4BRFA 1ESVA 5AFUH 3O8MA 3SJHA 1ATNA 4CBXA 1C0GA 3FZMA 5E84A 1KAYA 1QZ6A 3WUHA 2FSNA 1WUAA 3D2EB 1XQSC 3HZ6A 5BPMA 3WQTA 4MLEA 4FWLA 4AM6A 1GLDG 4BC2A 5FPEA 2QM1A 2P9IB 3MCPA 3R9PA 4DHYA 1JCGA 5EY4A 4IJNA 4NO7A 3D2EA 2YHWA 1GLEG 3FZFA 4BQZA 1XUPO 3H1QA 2P9IA 2FLOA 1IJJA 4CD3A 2AA4A 2NRHA 1LOTB 1T44A 3GDQA 3AAQA 4FWMA 4MLHA 3FE1A 2GWKA 3H6EA 1YXQA 2P9UB 5AQFA 2NLXA 3J8AA 4FWRA 4NB4A 1JCFA 3DXMB 5LY3A 2ZGYA 3GOIA 4H0TB 3LM9A 3VEZA 4E1JA 4ISFA 2P9UA 5BREA 2FF6A 3JS6A 4BRKA 2FSKA 1U6ZA 2QWNA 3DXMA 4BRHA 1GLCG 4H0PA 3FFKB 1QHAA 2BUPA 5BRDA 2YHXA 1BWFO 2ASOA 4YDUA 3C7NB 1BG3A 4RWTA 1XC3A 3LDPA 2QWQA 3VETA 3CJCA 2CGJA 1BA1A 4KBOA 5AQOA 2A3ZA 3ZX0A 1T6CA 1Y64A 5LJWA 5KQDA 2GTDA 3C7NA 1ZBSA 4BRCA 4BRPA 5KPRA 4JD2B 1NGAA 2VWBA 4WQ5C 1SZ2A 1HUXA 1HX1A 4FWNA 4EFHA 2V52B 1NGDA 5BN9A 4CZMA 4JD2A 2YHYA 3VGKA 4BG8A 3ATUA 2F9WA 4YDUC 3O5BA 2I7PA 1GLBG 4ISGA 3CJ9A 3GG4A 1TYQB 2D0OA 1HJOA 3EO3A 1GLJO 1IG8A 3A5LC 4BR0A 3M1FA 2W41A 4C23A 5AQZA 5I9EB 3TU5A 1D4XA 1TYQA 2J4RA 5KPZA 2CH6A 4QS9A 5BPLA 3QFUA 3ID8A 4H03B 4CZGA 1X3NA 4IO8A 2V7YA 5AFUA 4IZ9A 4J8FA 5AZIB 1BDGA 2CH5A 1S3XA 3CHWA 3I8BA 2IVNA 5AQIA 3CJBA 4PKGA 3VEVA 1KXPA 3IFRA 2YCHA 5AZIA 3EL2A 3VESA 2A40A 3U8XA 3MDQA 4DQ8A 3UE5A 5KQ8A 2HMPA 2A5XA 3EN9A 3FLCO 3G25A 4XH1A 5CE3A 1G99A 4Y0WA 3QFPA 1DKGD 4LC9B 4B1YB 1LCUA 4FWKA 1MDUB 3QICA 1S22A 3WXKA 3M6GA 2QWPA 4BRLA 1HPMA 2PAVA 1NGCA 5BPNA 4HWIA 4O8KA 4BRDA 3FGUA 5AQLA 3TPQA 3VGLA 5AQWA 4BR9A 1OKJA 4PL7A 3GBTA 4AM7A 3IDHA 2YI1A 2QWOA 2HF4A 3VGMA 3M3ZA 1V4SA 2E88A 2PBDA 5LJVA 4HTLA 2D4WA 5ADXH 2A41A 3QBWA 3L0QA 4B1ZA 4BQLA 3R8EA 2FSJA 4EIAA 3MN7A 3D7EO 3SMSA 3LDOA 3WEEB 3CQXA 5EXWA 4MO5A 1NGBA 4M7XA 5AQVA 3VENA 4CBUA 5AR0A 3WEEA 5F1XA 4CZEA 3L6QA 1BA0A 2VYPA 4FWQA 3UKUB 4MO4A 3BEXA 1C0FA 1RDWX 3AAPA 4O5FA 5FPDA 3O6WA 4H5NA 4JAXA 3U9ZA 4BR7A 1X3MA 4CZLA 1HKCA 5JLHA 2YJEA 4JHDB 3UKUA 4BR2A 3H3OB 2Q0UA 4FPBA 4K42A 3VEOA 5AQHA 1GLFO 2KHOA 2D1KA 3B8AX 3KVGA 1Z05A 4JHDA 4A62A 3WQUA 3QMLA 1QQNA 4BG9A 5JICA 2HOEA 1CZAN 5AQUA 2D0PA 3P4IA 5F0XA 4CBWA 4A2AA 4CJ7A 2V51B 3ULEB 3ZETB 3I33A 2DPNA 1MWMA 4M63C 3JXUA 3CQYA 3L4IA 4IWVA 2Q2RA 2YJFA 3HI0A 3ULEA 3ZETA 4BVPA 2E8AA 2AP1A 3SMPA 2BTFA 4B1XB 4BRGA 2WUSA 1HKGA 4JN4A 1MWKA 3KZBA 4EHTA 3A8YA 3AY9A 3O4WA 5F2RA 5FPMA 4H5TA 2GWJA 2P9PB 3MN5A 2V7ZA 3W3DA 1ZC6A 4FO0A 4FWSA 5AQTA 1Q18A 3FZKA 2P9PA 1R59O 2ZGZA 4A61A 1GLAG 3H3NO 4PL8A 3A5OC 3D2FB 4BRMA 5JMVA 1NGFA 2FF3B 3C0BA 3CI5A 3GE1A 2NZTA 3WXJA 2H3GX 2ITMA 2Q36A 5ELZA 3VEWA 4H5WA 3D2FA 4H5VA 3BUZB 4B1UB 1X9JA 1H1VA 1NGIA 2IIRA 5AQYA 4K41A 3EKSA 4QS8A 2F9TA 1DEJA 3VF4A 2A42A 1NGGA 4XEIA 1BO5O 1NWKA 4BRNA 3DWLA 2QW9A 3FZHA 3ENHA 4CI6A 1YVNA 4B9QA 3LDQA 1NGJA 5AQRA 1BU6O 1KAXA 3AARA 4IJAA 1NGHA 4K25A 5BRFA 3CJ7A 2QXLA 1E4GT 3LDNA 3GL1A 3H46O 3S41A 4FWPA 4FWOA 4GY2B 4BC5A 3A0IX 2E20A 4I6MB 3VEXA 2ASPA 3WXLA 4I6MA 2FXUA 2P9LB 3CJ1A 3VERA 2OANA 5AQQA 3MN9A 2HF3A 3BF3A 4BGBA 3HSCA 1ATSA 2P9LA 4BGAA 2UYTA 1HKBA 4L3QA 4BVOA 4CD1A 5TKYA 4BC4A 2QWRA 5AQPA 4FSVA 4XH5A 2VCPA 1NLVA 3ZEUB 3QDKA 4WQ4A 3A5MC 3CERA 3W0LA 4BRAA 3VEYA 1HLUA 5AQSA 3VF2A 2A6AA 4BRQA 3ZEUA 3A5NC 3ZX2A 3VF6A 3H45C 1YUWA 4H0VB 2E2QA 4ISEA 3ZX3A 1SQKA 2E1ZA 3HBTA 1ZXOA 3O08A 4H5RA 4IXCA 3MK6A 4BREA 2QWMA 5EX5A 1QZ5A 4WQ4C 2I7NA 5E26A 4K43A 3EKUA 1K8KB 2Q0RA 4Z94A 3F9MA 2W40A 4QS7A 1DGKN 3UB5A 4WQ5A 4H0OA 1P8ZA 1K8KA 1ATRA 5BN8A 4CZIA 3SK3A 4EHUA 4F9OA 4BR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F2SA 1YIJN 4DSJA 4JRQA 3EZ5A 4LSNA 1UA0A 1Z6RA 1KVBA 3SUNA 3DAWA 2Q1NA 1NU0A 2P9KA 3ATVA 1WN7A 3E1YA 5AQGA 4DV1K 2RE2A 2YKNA 1XC9A 3KK7A 5JLFA 4CJ5A 4JNEA 3A2FA 1Z26A 4WFBL 4GV6A 5BR9A 4JI3K 2D5RA 2GEMA 5ADXA 3DMJA 3CC4N 5AQKA 3SV4A 3O1WA 4DUZK 3HTVA 4MFBA 1XMQK 2NRWA 4B9LA 4FL9A 3U4LA 2XY5A 3H1VX 2GBZA 1XHXA 3OYNA 4CZKA 1NM1A 3U9DA 3LWLA 3SLCA 4H0XB 1Q8IA 4ID1A 3OYKA 2P9SA 4KHQA 1MA9B 4XH4A 1QSYA 3G6EN 1TKTA 2OPRA 1MU2A 3WNHA 3E01A 3P1GA 4LF8K 3DXKA 3OHRA 1NMDA 1ZBIA 4M45A 3TSPA 2E2NA 4KKOA 4RG8A 1LV5A 2P9NB 3ENOA 3HP6A 4H4MA 3SUOA 3CJAA 1U2VA 2NRTA 3NE6A 2DY4A 4GKJK 3NFAA 1RBRA 4H0YB 3DLEA 3QO9A 1SKRA 3UKRA 3RR8A 2HNDA 3HYFA 1SUQA 4HUFA 3IUCA 3O1BA 3TANA 5JS2A 3BP8A 1XI1A 1T6DA 2RPIA 3QETA 4B3OA 2O8FB 4TSXA 3NGIA 3RVCA 4FM0A 1XMOK 3ZLJA 1J5OA 1Q86O 1JL2A 4JYAK 4CJUA 4C8LA 3D2EB 3SAHA 4E19A 3OS1A 4MLEA 4ELTA 5FPEA 1GLDG 1D9FA 4DHYA 4DF8A 3R3LA 1A5XA 4K8XA 3Q7CA 1IJJA 4JKEA 3KLHA 2RHKA 3DOKA 3C6UA 1T44A 3AAQA 4FJ5A 3J7AP 1YXQA 5AQFA 1DT9A 3KKSA 4FWRA 3AVNA 2ZGYA 2HB5A 3P31A 4C1NI 4E1JA 3K5NA 4CIGA 5T7BA 1U6ZA 2QWNA 1SS6A 4BRHA 4HHTA 4H0PA 4KH5A 3FFKB 3CCUN 4CF9A 1YJWN 2BUPA 5J2QA 3JYTA 1X9SA 5HRRA 2O8CB 3CJCA 2CGJA 1U45A 4NLCA 5AQOA 4CHOA 3OYGA 4GV3A 1Y64A 4FK4A 2UXCK 1UWBA 4BRCA 3SAGA 4FZZA 4DF4A 1VSEA 2PY5A 4DMNA 4JD2B 4LF7K 2Z1JA 4YOVA 2VWBA 2HHSA 4DR6K 1HX1A 4FWNA 1VRUA 3THYA 1RDDA 4AHCA 1YTUA 4GMJB 3J81O 5HRNA 4BG8A 3F2KA 3O5BA 2O8DB 3L2VA 4JI7K 1QSLA 2YX6A 5KTQA 1NJWA 3PUFA 1Q81O 3KWGA 3HO1A 3TU5A 3OYDA 1D4XA 4MQ3A 3QFUA 3J80O 4H03B 1IV0A 5AFUA 2BGGA 4E3SA 3PX4A 1WSHA 1NK0A 3SAFA 1IH7A 4JKAA 3PV8A 2IVNA 4PKGA 3VEVA 2YCHA 3VTHA 2HSTA 3E9LA 2QA4N 3LAMA 3ZT2A 4B3RK 3NF9A 1TKXA 5KQ8A 1HNWK 3LDSA 3OJUA 3EN9A 3G25A 4XH1A 3L8BA 3QFPA 4LFBK 1RCHA 4LC9B 4O8UA 2XRIA 4JKHA 1S22A 3CD6N 1N36K 2QWPA 3K9JA 2PAVA 2KFZA 4DFJA 3THVA 4HWIA 4O8KA 1N32K 3VQQA 4W5QA 3TPQA 4CJLA 4C8NA 3VGLA 3QERA 4FJJA 3D0PA 3DLRA 4FZYA 4B8CA 2BDPA 3ZSYA 4B9VA 3Q7BA 1QVGM 4A5AA 3CQXA 1QE1A 1Q82O 1L5UA 2UUAK 4KRFA 1S6QA 4DR1K 4M7XA 4CBUA 4CGFA 5SWMA 2ZQBA 3WEEA 5GAGP 3MXMA 5A2QO 5CZ2A 3L6QA 2Y1IA 1BA0A 2VYPA 1RBSA 1BL3A 5GADP 4CECA 4O5FA 1JKHA 1RDWX 3O9TA 4KTWA 5FPDA 1YJ9N 4BR7A 1X3MA 4CHNA 5JLHA 1TK8A 1VSJA 3LALA 2KQ2A 3C94A 2Q0UA 4FPBA 1NG9A 5AQHA 3KKRA 2HNZA 1NK4A 2A1RA 4WE1A 1QQNA 5JICA 4DU3A 1ZBLA 1CZAN 5AQUA 1YHQN 4DQIA 5HP1A 3NGYA 3MXJA 5E41A 2XY6A 3TAQA 4CHQA 3ZETB 2E4LA 2W6KA 3ZT4A 1HMVA 4O4GA 2PYLA 2KZMA 3S3OA 5J1EA 1ASUA 4LY7A 1T8EA 4DR5K 3SMPA 2BTFA 4B1XB 4CGDA 4LSLA 1LW0A 1QS4A 3SPYA 1VSLA 4EHTA 3A8YA 5M1NA 3T69A 3O4WA 4M3TA 5F2RA 2GWJA 3HXMA 1HNZK 1ZYQA 2V7ZA 4FO0A 3CPEA 4FWSA 4FLVA 1CLQA 3CC7N 2P9PA 3FZKA 1R59O 3KJVA 3NCIA 3D2FB 4BRMA 1NGFA 4FM1A 2NRZA 4FZXC 4DWIA 4DLEA 2JWLA 2JGUA 1X9JA 4DSFA 3AV9A 4AILC 4DQSA 1FK9A 1H1VA 4AF1A 4O0JA 2VGMA 3EKSA 4QS8A 1DEJA 2A42A 4DR3K 1QTMA 3OW2M 3P39A 3PIPL 4IOXA 5GIOA 3DWLA 3TAMA 1KFDA 3ENHA 4CI6A 4HUEA 3ZSRA 4Y1CA 4JI1K 3WNEA 4DFKA 4KI6A 1XNQK 3M8PA 4IJAA 1IBLK 2QXLA 2KW4A 2KLAA 3H46O 4NCGA 4BC5A 1VSHA 4CHPA 3V1OA 3ZCMA 4CF2A 1NKEA 4IBNA 3ZT3A 3PY8A 3WXLA 1HYVA 4ZTJA 3NH1A 4KHWA 1S6PA 1T7PA 3LAKA 5C12A 4GV9A 3VQPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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