5AQRA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 127
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqrA04
1NGJA 2P9NB 3BUZB 4B1VA 3JS6A 1S22A 5KPZA 3D2EB 4BRMA 3I8BA 4QS8A 2IVPA 4FWKA 3U9ZA 2QWRA 4FPAA 1U2VA 5EXWA 4JN4A 2H3GX 4BC3A 2FXUA 2ASPA 2QWLA 4O8KA 3SMSA 5AQZA 2NLXA 5AQIA 2WUSA 4EAHD 1BA1A 5AQLA 1X3NA 2PAVA 4FO0A 2V52B 2BTFA 3O1WA 1V4TA 3OHRA 4FOIA 4F9OA 3LDNA 3WXJA 4NB4A 2V7ZA 4H5NA 4K41A 4BC5A 4BR4A 4FWRA 5AQUA 4CZKA 4CD3A 3VOVA 4A61A 2CGKA 2D4WA 1G99A 2Q2RA 1GLLO 4AM6A 4EHTA 3WXLA 3ZX2A 1DGKN 3HI0A 3BEXA 5F2RA 1X9JA 1TUUA 3VEZA 3MDQA 1BDGA 2J4RA 4FSVA 1D4XA 3DXMA 4CJ7A 4IZ9A 4BRLA 4BVOA 3FZMA 3VF6A 2ZGZA 4MO4A 2E8AA 1T6DA 1XC3A 4MO5A 3VEYA 3VGKA 4XEIA 5AQSA 3FZFA 5FPDA 3L0QA 3C0BA 3GOIA 4E1JA 4CZHA 3QFUA 4BRFA 3J8AA 2ZF5O 1NGHA 1NGIA 1MDUB 1E4FT 4IO8A 1YVNA 3U8XA 4PKIA 1HUXA 5F0XA 4GNIA 3D2FA 1ATNA 1ZXOA 4C23A 3D2FB 3HSCA 2I7NA 3CJ7A 3ENOA 4XH5A 2IVNA 1BA0A 2P9KB 3CHWA 2E2NA 1ZBSA 3SK3A 4K25A 4MLHA 3WT0A 3BP8A 4BC4A 4B1YB 3LL3A 2UYTA 2A5XA 4CBXA 4AM7A 4PL7A 3B8AX 4I6MB 1MWMA 2P9IA 2P9IB 3UKUB 3VEOA 5BR9A 2QXLA 3WEEA 3ENHA 4DB3A 4PKHA 4RCHA 2AP1A 4BRQA 3GBTA 3LDLA 3R6MA 3G25A 4BREA 1MWKA 4BR9A 2A3ZA 3M1FA 3VETA 4A2AA 1HPMA 2FSNA 3CJCA 3QFPA 2Q1NA 2ASOA 3AAQA 3H1VX 2V7YA 3AAPA 4M7YA 1KAZA 4BRHA 3IFRA 3HM8A 2P9LA 3FZHA 3D7EO 4IWVA 3CJBA 4KBOA 3CIPA 4FWSA 2FSKA 3MN7A 1QQNA 3QBXA 1RGIA 5AQHA 1GLFO 3WXKA 1U2VB 2P9PA 5JLHA 5AZJA 3O80A 1C0FA 5AZJB 4YDUC 4BRDA 4WQ4C 4CZMA 2D0PA 3HBTA 2CGLA 3WXIA 1E4GT 1X3MA 1BU6O 1HX1A 2Q0UA 4BGAA 3VF4A 2E2PA 5JLFA 1HJOA 3C7NA 3CJ9A 4JAXA 3C7NB 3MMVA 5BREA 3GL1A 3UKRA 3MN5A 3DAWA 4ISEA 1T6CA 5JMVA 5AQKA 4H0PA 2CGJA 4K43A 3O8MA 3H46O 3LDOA 3EL2A 3VEVA 2QM1A 4BR0A 3P4IA 2YHXA 5I9EB 4H0TB 4EIAA 4EFHA 3VEXA 1NBWA 1Z6RA 3VENA 2QWMA 1TYQA 1WOQA 5BRHA 5AR0A 3O1BA 1TYQB 3O4WA 3EZWA 1SAZA 3CQYA 4H03B 5AQWA 1GLDG 2Q0RA 3KHYA 3QDKA 4JD2A 3DXMB 3A8YA 3O08A 4JD2B 5KPRA 3HTVA 1GLJO 1SQKA 4CZEA 3FZLA 3QBWA 1BUPA 3VGMA 1Y64A 4GY2B 3WUHA 2HF3A 4M7XA 3CETA 2D0OA 4JHDA 5AQRA 4B1UB 5JICA 5AQVA 4O5FA 4FPBA 5AQFA 3LM9A 4Y0WA 3IUCA 4EHUA 1QZ5A 3SJHA 1HLUA 4B1ZA 1BOTO 4DCHA 4BR2A 1RFQA 2FSJA 3ZEUA 5EY4A 2E20A 2A6AA 1NLVA 5FPEA 3FGUA 1YUWA 5BRDA 5BRFA 4A62A 4K42A 4IJAA 2P9UA 3BF3A 4PL8A 5BPNA 3VGLA 3RSEA 5CE3A 3AY9A 3RSEB 3ULEA 1LOTB 3S41A 1OKJA 1ESVA 4BQLA 4BQZA 3A5LC 3DWLA 4FWPA 4YDUA 2OANA 1NMDA 2ASMA 1ATSA 4WQ4A 5AQGA 3FFKB 5AFUA 3H3OB 3TU5A 3WEEB 4FWNA 4CZJA 1T44A 3F9MA 4NO7A 2F9TA 3WQUA 1HKBA 4JNEA 3CI5A 5EVZA 4CD1A 2Q36A 3SLCA 3A5MC 3CJ1A 4H0OA 2HOEA 2E2OA 5AQPA 1BG3A 4BR7A 5AQMA 2E1YA 1YXQA 2HMPA 4BRNA 5ADXA 2ITMA 5LJWA 1R59O 2P9LB 4FWOA 4J8FA 1U6ZA 1P8ZA 3I33A 1C0GA 4H0VB 5AQTA 1J6ZA 4B1WB 4RTFD 5LJVA 3A5OC 4H5TA 4FWLA 1Z05A 4CI6A 2QWPA 3O6WA 4BG9A 3MN6A 2W41A 1QQMA 5AQXA 4MLEA 4FWQA 1QHAA 2P9SA 3M3ZA 2P9PB 4BGBA 2P9SB 3VEWA 1YAGA 5AZIA 2P9NA 4FL9A 3DJCA 5AZIB 3LDQA 5AQYA 5AQOA 3R8EA 3CERA 4IXCA 5FPMA 4DQ8A 3D2EA 2DPNA 2YHYA 2QW9A 1JCGA 1NM1A 2GUPA 3IMXA 1WUAA 2NZTA 1QZ6A 2Q97A 3ZETA 1ATRA 2QWNA 3ZETB 1Q18A 2NRHA 3EO3A 3ZX0A 4CZIA 2A40A 3BF1A 3UKRB 3W0LA 1RDWX 3W3DA 5KQDA 1MA9B 4HWIA 2AA4A 3EKSA 2GELA 2E2QA 4B1XB 3U4LA 2GEMA 4BRGA 3LM2A 4RWTA 1NGBA 5ELZA 3MCPA 4BG8A 1DKGD 4CZGA 4H5WA 4WQ5A 3KZBA 2QWOA 3GG4A 1NGAA 2F9WA 2I7PA 2HF4A 4CZLA 1SZ2A 1IG8A 2FLOA 1BO5O 5AQJA 2FF3B 2V51B 1KAXA 4BR5A 3QMLA 3FE1A 1ZC6A 4BRKA 2YI1A 3UB5A 4FOEA 1JCFA 2A41A 3UE5A 1XUPO 3L6QA 4BVPA 3HZ6A 4BRIA 4BRCA 5KQ8A 2QWQA 4CBUA 1KXPA 4JHDB 4LC9B 3ATUA 3L4IA 4L3QA 3VF2A 4M63C 3DXKA 2CH6A 4BRAA 1TUYA 5FPNA 3DXKB 4XH1A 3ATVA 4CBWA 1NGCA 3WQTA 1NGEA 3VPZA 1KAYA 3LDPA 2GWKA 3GE1A 2E88A 4H0YB 5BPLA 1NGFA 3ZEUB 3KVGA 1IJJA 2D1KA 3QB0A 4H0XB 4HTLA 1NGGA 3VERA 5B8HA 3O5BA 4FWMA 5AFUH 2ZGYA 2VCPA 1EQYA 2KHOA 5EX5A 2P9UB 5E26A 3VESA 3H3NO 3AARA 4WQ5C 3QICA 3ULEB 1XQSC 5TKYA 1GLBG 3ID8A 2ZWHA 1NWKA 1LCUA 5AQQA 1CZAN 4BC2A 5KPTA 4B9QA 5AQNA 3U9DA 2E1ZA 2BUPA 4A2BA 3CQXA 5ADXH 3A0IX 1V4SA 5BPMA 2P9KA 2W40A 3H1QA 4DHYA 3ZX3A 2PBDA 5LY3A 4BROA 1GLAG 4H5RA 4QS7A 4Z94A 2IIRA 3FZKA 4I6MA 3SMPA 1NGDA 4IJNA 3H6EA 1JCEA 3UKUA 2A42A 4CZFA 4H5VA 4WYBA 1DEJA 3R9PA 3IDHA 1H1VA 5BN9A 3M6GA 2VYPA 4XH4A 3TPQA 3JXUA 4PKGA 1HKGA 3EN9A 2YCHA 3GDQA 2EWSA 5E84A 2IVOA 4ISFA 4BRPA 4ISGA 3FLCO 1QQOA 4QS9A 5F1XA 2GWJA 2YHWA 3CJAA 1BWFO 1K8KA 5BN8A 1K8KB 3MK6A 5EOYA 1S3XA 1GLEG 2VWBA 2Q31A 3A5NC 3MN9A 1GLCG 3H45C 3FR0A 1HKCA 2GTDA 2FF6A 2YJFA 2CH5A 3EKUA 2YJEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGJA 3V81A 3NGYA 2HHVA 1Q82O 5KPZA 4DV7K 5CYMA 1N4NA 4OPHA 4OGEA 3J7AP 4JN4A 3OYEA 3CCQN 4PQUA 2E3FA 3SAGA 2LT8A 4HUEA 1N32K 1N36K 4O8KA 1A5WA 5AQLA 1X3NA 5A2QO 2PAVA 3SUOA 3OHRA 4FOIA 4LH5A 4F9OA 1WB9A 3LDNA 3WXJA 3ZT2A 4WFAL 1JJ2M 5I42A 3KP1A 3DLHA 1VQ4N 1CZ9A 2PYJA 3KLHA 4CZKA 3TWHA 3VOVA 4A61A 2DY4A 2D4WA 4E7HA 1XRSB 2C1IA 2GL1A 1BCGA 1T8EA 1T7AA 1FKOA 3AO1A 1W7AA 1BCMA 2Z1IA 2XY7A 2B3CA 1ZYVA 1X1PA 5DK5A 4M3WA 4Z4EA 1X9JA 3I55N 1DT9A 3MDQA 4LF6K 4CGGA 4CJ7A 4IZ9A 4BVOA 1BQMA 3JYTA 2XY5A 3FZMA 1DTQA 4MO4A 3VF6A 4W5OA 1T6DA 1XC3A 4J2EA 4IFVA 3ZCMA 1O1WA 4Q0BA 2KZZA 4CZHA 4BRFA 4FM0A 4HUFA 2WFBA 4K8ZA 1CHZA 3C94A 4TSXA 3CQ8A 3OYHA 4CJPA 1SN4A 3S5TA 3F5TA 3MECA 1DJTA 2GX9A 3AGRA 2PFUA 4GNIA 4CK3A 2W42A 1ZXOA 4HHTA 3LAMA 2YIOA 2I7NA 2IS3A 4UJ0A 2G2KA 2O8CA 2IVNA 1BA0A 3CHWA 2E2NA 4PHTX 4FJKA 3G6EN 1L3UA 3SK3A 4B8CA 3DI6A 2ZJPL 5GINA 4CHYA 2LY5A 4I6MB 2P9IA 2P9IB 3UKUB 4F4KA 4N5SA 1NKEA 3G10A 5HRSA 3ENHA 5GAHP 3K5OA 3OYAA 3GBTA 4V19S 3LDLA 4FLZA 2KBHA 4HCBA 5HP1A 3VETA 1HPMA 3DOKA 4NCAA 3NMUA 3CJCA 1Z25A 1RBRA 3AAQA 3HXMA 3SV4A 4DWIA 2IAJA 4CJEA 3CYMA 1ZVGA 2V7YA 3QNNA 4JLHA 4BRHA 3SV3A 1Q81O 3KLFA 4I7FA 3V9WA 3D7EO 4ILGB 4LFAK 1KRPA 4KTQA 1RTJA 4ZTJA 3SBTA 1QQNA 3RR8A 2NRWA 1RTIA 2XY6A 1XC9A 4FJ8A 3OBYA 2P9PA 2G8WA 2G8FA 1FW6A 3P83D 3TSQA 1ZYWA 1C0FA 1YF5L 4LF7K 1REVA 1TAQA 4F3TA 4JKCA 4BRDA 2BE2A 2JGUA 4WQ4C 4LD0A 4CJLA 4CZMA 4DS5A 1QSLA 3HBTA 4FK0A 3WXIA 3QLHA 4CERA 1X3MA 4K8XA 4AAZA 2WC9A 4BGAA 1S1TA 2E2PA 4DQQA 3C7NA 3CJ9A 3SUQA 3C7NB 4JS5A 3UKRA 3MN5A 3DAWA 5JMVA 3ZT0A 1JLEA 4LF5K 2ATBA 4GVMA 5SZTA 3EL2A 2QM1A 4BR0A 3P4IA 1Z26A 2YHXA 4F2SA 4EFHA 3VEXA 4J2AA 2OTJN 1TGOA 4CF0A 2F8SA 5AR0A 4W5QA 4GMJB 1SAZA 4ELUA 2YV0X 3QIPA 3AA3A 5FROA 3WNHA 2RHKA 4DR3K 1JXEA 3ZSYA 3C65A 1JLCA 3DXMB 3K57A 4M42A 4KO0A 1SEGA 1Y64A 3MEGA 4GY2B 3M8QA 4KB1A 3AVHA 2DFHA 5AQFA 1JL2A 4B9NA 1I2VA 1S1WA 4CECA 4EZ9A 2X74A 1IKWA 4AHUA 1T0ZA 3SJHA 1RBUA 3KK2A 4IEIA 2FSJA 3ZEUA 3CF5L 5KGXA 1HNIA 3IS9A 4DTNA 4B9VA 3AVCA 3FGUA 1YUWA 2OPRA 3CD6N 4BE0A 2E2FA 1HQEA 4K42A 3C6AA 3L8BA 2KPYA 3CCJN 4H8KA 4DQPA 1OKJA 4E89A 4E1MA 4FK2A 3CC2N 3UIQA 3AA4A 5AQGA 3FFKB 4CIEA 2A1RA 1T44A 1QHTA 4AHTA 4JNEA 4FM1A 5EVZA 4CD1A 4CJSA 3CJ1A 1L5UA 1NJWA 3OYCA 4DSLA 4JKEA 4MQ3A 5J1EA 3VQ9A 2QA4N 1U45A 3O9RA 2HMPA 3THWA 4QOZB 5LJWA 1R59O 2P9LB 4FWOA 3OJUA 4J8FA 4CHQA 3I33A 3ALYA 4GW6A 1XMQK 4NCBA 2K35A 4CI6A 4BG9A 3MN6A 5CR4A 3ZT1A 4X66K 4MDBA 4M3TA 4YORA 4GV6A 4E7KA 3L4QA 1QHAA 2O8BB 3CG7A 3M8PA 5J2NA 3QEXA 1YAGA 3QIOA 1IKYA 2UU9K 3HPHA 4DV3K 4UY8O 2P51A 5AZIA 4IDKA 2P9NA 1OMYA 5AZIB 4DUZK 3JSMA 2NNWA 5AQOA 2P5GA 1WBBA 3NH0A 4PWDA 1NM1A 3IMXA 3Q7BA 3ZETA 2NZTA 1QZ6A 2XO7A 4BACA 3QNOA 1ZBLA 1ATRA 2YC1C 3ZETB 1S6PA 2A40A 2NRTA 5HROA 4B3RK 2VG7A 4YOUA 2LJ7A 3W3DA 3EKSA 1C1BA 3ZSWA 1OH7A 1LV5A 2GEMA 4BRGA 5H1SQ 2WOMA 3I56N 3E9PA 3ZSZA 1LWFA 4I9LA 4CEQA 4U67L 1KLMA 1NGAA 1IKXA 2F9WA 2HF4A 4CZLA 3SBGA 3KOWA 1BO5O 4GKJK 2YHBA 1HNZK 2V51B 2A7TA 3L3VA 1TKZA 1ZC6A 1X9MA 3UB5A 1JKZA 2A41A 1KSPA 5C0YA 3UE5A 3LP2A 1X9WA 3L2WA 4KHWA 3HZ6A 3NVMA 4BRCA 4BECA 3DYAA 1KXPA 4YOXA 1VQMN 2KLAA 4JHDB 3ATUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NGJ A;  3V81 A;  3NGY A;  2HHV A;  1Q82 O;  5KPZ A;  4DV7 K;  5CYM A;  1N4N A;  4OPH A;  4OGE A;  3J7A P;  4JN4 A;  3OYE A;  3CCQ N;  4PQU A;  2E3F A;  3SAG A;  2LT8 A;  4HUE A;  1N32 K;  1N36 K;  4O8K A;  1A5W A;  5AQL A;  1X3N A;  5A2Q O;  2PAV A;  3SUO A;  3OHR A;  4FOI A;  4LH5 A;  4F9O A;  1WB9 A;  3LDN A;  3WXJ A;  3ZT2 A;  4WFA L;  1JJ2 M;  5I42 A;  3KP1 A;  3DLH A;  1VQ4 N;  1CZ9 A;  2PYJ A;  3KLH A;  4CZK A;  3TWH A;  3VOV A;  4A61 A;  2DY4 A;  2D4W A;  4E7H A;  1XRS B;  2C1I A;  2GL1 A;  1BCG A;  1T8E A;  1T7A A;  1FKO A;  3AO1 A;  1W7A A;  1BCM A;  2Z1I A;  2XY7 A;  2B3C A;  1ZYV A;  1X1P A;  5DK5 A;  4M3W A;  4Z4E A;  1X9J A;  3I55 N;  1DT9 A;  3MDQ A;  4LF6 K;  4CGG A;  4CJ7 A;  4IZ9 A;  4BVO A;  1BQM A;  3JYT A;  2XY5 A;  3FZM A;  1DTQ A;  4MO4 A;  3VF6 A;  4W5O A;  1T6D A;  1XC3 A;  4J2E A;  4IFV A;  3ZCM A;  1O1W A;  4Q0B A;  2KZZ A;  4CZH A;  4BRF A;  4FM0 A;  4HUF A;  2WFB A;  4K8Z A;  1CHZ A;  3C94 A;  4TSX A;  3CQ8 A;  3OYH A;  4CJP A;  1SN4 A;  3S5T A;  3F5T A;  3MEC A; 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