5AQRA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqrA04
2HMPA 4QS7A 4FWLA 2CGLA 4IXCA 3WT0A 1ATSA 3VETA 3DJCA 4FWSA 3VGLA 5AQIA 3MMVA 3SMPA 2CGJA 3ZX3A 1OKJA 5EVZA 2FXUA 1NGDA 2QM1A 2YI1A 1QZ6A 4BGBA 3MN6A 2QWPA 4Y0WA 3GE1A 4CD1A 3ZX0A 5AQPA 3CERA 3LL3A 1HLUA 1YVNA 5FPNA 3EL2A 1YUWA 2AP1A 2QWQA 3U9DA 1NMDA 3H6EA 3FZHA 1U2VB 4ISEA 3TPQA 1NGJA 4BG8A 5LY3A 2P9NA 4BR4A 4I6MA 5CE3A 2ASMA 3VEVA 4BVOA 4BRCA 2Q36A 5AQZA 3M1FA 5AQUA 3VEOA 2A5XA 2E8AA 5LJWA 3O5BA 4FWOA 1ZXOA 5F0XA 3C0BA 3RSEB 2DPNA 4H5RA 2P9KA 2VWBA 3M6GA 3ATUA 3A8YA 3LDOA 2ZGYA 3GBTA 2HOEA 3SMSA 2P9PA 5AR0A 1HKCA 4NB4A 2V52B 4YDUC 5B8HA 3ZEUA 5EX5A 4CZHA 1D4XA 2CGKA 1T44A 4B1UB 4RCHA 4H0YB 3FE1A 3A5LC 1JCEA 2YHXA 5EOYA 1C0GA 2NZTA 3DWLA 5BRDA 5KPTA 4RWTA 2YHYA 2P9IA 1ZC6A 4XH1A 2QW9A 3D7EO 1XQSC 3O4WA 4H0PA 2IVOA 3MCPA 2GUPA 3H1QA 3DAWA 4CZFA 2QXLA 1SAZA 3O08A 1MWMA 1NGBA 3ENOA 3QBWA 4A62A 1BG3A 2P9LA 3C7NA 4PL8A 4O5FA 4CZMA 5KPZA 4A2BA 4BR2A 3ULEB 4MLEA 4BRHA 2WUSA 4L3QA 5AFUA 3J8AA 1QQMA 1G99A 4CI6A 3L4IA 3R6MA 3VEWA 4O8KA 3VEXA 2Q2RA 1T6CA 4IZ9A 5E84A 5KQ8A 3QMLA 3BF1A 5LJVA 1WOQA 3ZETB 2EWSA 3O1WA 4FWNA 5JLHA 4B9QA 3IFRA 1RFQA 1BA1A 2F9WA 4FL9A 1T6DA 4PKGA 3CJBA 2QWRA 3U8XA 2A42A 1R59O 5AZIA 2P9SB 3ZX2A 1U6ZA 1YXQA 3UKRA 1QZ5A 1HKGA 1K8KB 5JICA 5JMVA 5KPRA 4J8FA 4A2AA 1GLFO 2Q31A 4BC5A 3UKUA 3F9MA 3OHRA 4BRKA 3VF2A 3UB5A 2CH5A 3MK6A 3VGMA 4F9OA 3JS6A 3WXLA 3A0IX 2E2PA 3DXMB 3CJCA 3SK3A 3WEEA 4Z94A 2E20A 2E2OA 3IMXA 3HSCA 4BQLA 4E1JA 4WQ4A 2KHOA 3FZMA 2Q0UA 1YAGA 5EY4A 4JD2B 1QQOA 1NGCA 3GOIA 2A40A 3O8MA 2I7NA 1MWKA 5AQXA 4B1YB 1NLVA 4M7XA 4BC4A 3LM9A 4BR7A 2D0OA 3R8EA 1GLLO 3A5OC 1EQYA 3I8BA 1S22A 3LDLA 2W40A 4EAHD 3FZFA 4BRIA 3B8AX 3QDKA 2IVPA 2QWOA 4XH4A 2P9UB 2VCPA 4IJNA 4PKIA 3BEXA 3CJ7A 1GLDG 1NGHA 3D2EA 3VEZA 2QWLA 2A41A 1ATNA 1LCUA 4DB3A 3VERA 5BN8A 2ASOA 3DXKA 4JN4A 5AQNA 3SJHA 3W3DA 4CBWA 4JAXA 4BR5A 1NGFA 4PL7A 4JHDA 5BREA 4H0OA 4FOIA 2FF6A 2GTDA 3EN9A 3HZ6A 4ISFA 2GWJA 2QWMA 3GG4A 3D2FA 5ELZA 3EKUA 1GLCG 2HF4A 1KAYA 4MO4A 1KXPA 4XH5A 2ASPA 1TUUA 5AQGA 2P9NB 4I6MB 5BR9A 5AQHA 4ISGA 4WYBA 2I7PA 4CBUA 2Q97A 1X3NA 3LM2A 1DKGD 5AQYA 4WQ5A 2ZWHA 3EKSA 4H0TB 5BPNA 3S41A 4CZJA 2VYPA 3AAPA 3QICA 3MN5A 2P9KB 3CQYA 4FWQA 3W0LA 4BQZA 5AQTA 4CZIA 2Q1NA 2P9PB 4AM7A 1NGAA 2E2QA 3ZEUB 3QBXA 3H1VX 3ID8A 3ENHA 4H5VA 4NO7A 4HWIA 3MDQA 4BGAA 4RTFD 2YJEA 1V4SA 5I9EB 2D1KA 5AQWA 4BG9A 4H0VB 2GELA 3LDQA 2P9IB 3H3OB 4B1WB 2F9TA 3FLCO 5AQQA 1TYQA 1DGKN 2YHWA 3A5NC 3FGUA 3U4LA 4CZEA 4EHUA 5AZJA 4BC3A 4FPAA 3CQXA 3VF4A 3H46O 3WXKA 3BF3A 1QQNA 2E2NA 4DCHA 3VGKA 4CBXA 2FSJA 4QS9A 3VF6A 1BDGA 3FFKB 4PKHA 3WUHA 3WQUA 1HUXA 1ATRA 5AQMA 3H45C 2P9LB 5EXWA 3C7NB 4GNIA 3TU5A 3UE5A 2OANA 3VENA 3O6WA 4H0XB 1IG8A 1Q18A 3IUCA 4M63C 2AA4A 4BR9A 4CJ7A 3EO3A 4CZGA 1RGIA 4BRGA 1E4FT 4B1VA 3R9PA 3I33A 1BA0A 5AQJA 3CJAA 1P8ZA 3SLCA 5FPMA 3IDHA 2ITMA 4EFHA 1HPMA 4BROA 1NWKA 3U9ZA 2V7YA 5AZIB 3UKRB 3JXUA 4LC9B 3QFPA 1LOTB 4BRAA 4BVPA 3CI5A 4BRPA 4BRLA 3FR0A 4BRQA 5BRHA 3UKUB 3EZWA 2QWNA 1HJOA 2V7ZA 3FZLA 3VEYA 4IJAA 5JLFA 1U2VA 2FLOA 4H03B 4MLHA 4B1XB 4WQ4C 1MA9B 2ZF5O 3WEEB 3HI0A 3MN7A 4FOEA 5AQVA 1Z05A 2E1ZA 5AQRA 3VESA 4CZLA 5ADXH 1ESVA 2IIRA 1MDUB 3BUZB 5F2RA 5ADXA 3RSEA 2UYTA 3WXJA 1NBWA 3A5MC 1QHAA 2YCHA 4XEIA 2YJFA 4H5NA 4BRNA 4K25A 2D4WA 3AY9A 5BRFA 4FPBA 4EIAA 4MO5A 1NGEA 4BRFA 1GLAG 4YDUA 2FSKA 2H3GX 2FSNA 3HBTA 4K41A 5BN9A 1GLBG 1SQKA 3D2EB 2W41A 4K42A 3LDPA 3O80A 1JCGA 3G25A 4IWVA 3DXKB 1DEJA 1TUYA 4CZKA 3HTVA 1ZBSA 4FWMA 1SZ2A 4CD3A 1S3XA 3O1BA 3AARA 1NM1A 2J4RA 4FWKA 1GLEG 3VPZA 2A6AA 4JHDB 1J6ZA 2D0PA 4K43A 5E26A 4DQ8A 2IVNA 3H3NO 3VOVA 5AQLA 4JNEA 2CH6A 3D2FB 2ZGZA 4GY2B 4BC2A 1CZAN 2E1YA 3FZKA 1XC3A 3KHYA 3P4IA 4HTLA 3WQTA 3ULEA 2GWKA 3KVGA 3GDQA 3CJ1A 4WQ5C 1BUPA 1X9JA 1BOTO 4BRMA 5AQSA 1GLJO 3WXIA 1V4TA 1IJJA 3MN9A 1KAXA 4BR0A 4H5WA 5BPMA 1RDWX 4IO8A 1WUAA 2FF3B 2GEMA 1E4GT 3ZETA 3CIPA 5KQDA 3AAQA 1HX1A 5FPDA 4C23A 1Y64A 3KZBA 4M7YA 1JCFA 3ATVA 5AFUH 1HKBA 2P9SA 5AQFA 4B1ZA 4FSVA 2PAVA 1KAZA 1BO5O 1K8KA 2HF3A 2BUPA 5BPLA 4KBOA 3CJ9A 4EHTA 5FPEA 3BP8A 1TYQB 3GL1A 2E88A 3QFUA 3HM8A 1H1VA 5AZJB 5AQOA 3M3ZA 4FO0A 5F1XA 3DXMA 3LDNA 1BU6O 1X3MA 4DHYA 2PBDA 2A3ZA 2NRHA 4BRDA 4FWPA 1C0FA 4AM6A 4H5TA 3L0QA 4JD2A 1XUPO 4QS8A 2NLXA 4BREA 3CHWA 2V51B 2Q0RA 4A61A 1NGGA 3QB0A 4FWRA 1Z6RA 1BWFO 2P9UA 5AQKA 3L6QA 5TKYA 3CETA 1NGIA 2BTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK4A 1XHZA 4CJTA 2A1RA 2P51A 5EVZA 1BL3A 2FXUA 3AVLA 4DTNA 1X9SA 3HT3A 5FRNA 4Q5VA 1RTHA 1WSFA 1IH7A 3MX5A 3V9WA 4JS4A 3AV9A 1JZBA 3ZX0A 4B9NA 4E1NA 3LL3A 1HLUA 3EL2A 2GV9A 4JRPA 4DR7K 3BY5A 2QWQA 3LP0A 2KZMA 3U9DA 4HVJA 3K5MA 1VSMA 2DFEA 5HRPA 1RT4A 2JLEA 3D45A 1HNXK 3HOTA 2F4VK 4ISEA 1U2VB 3HPHA 4X65K 4DV1K 2KFZA 2P9NA 4BR4A 4IEIA 1QSYA 2ASMA 2G8UA 4BVOA 1FKOA 1K8AO 3VTHA 4K8ZA 1I3AA 3F5TA 3E01A 1KQSM 1T7PA 4CCHA 3O5BA 4AHTA 4CIFA 4HHFA 1NK5A 3RSEB 1JXCA 4CJRA 2DPNA 4H5RA 2VWBA 3ATUA 3A8YA 2XY5A 3SMSA 5AR0A 2KKZA 1NG9A 5B8HA 5GINA 4CJSA 2KZZA 3AA5X 2RN2A 4A5AA 1WSHA 4DR1K 1TK0A 5AJ3K 3FE1A 3A5LC 1WSEA 3L2VA 3DWLA 2YHYA 2P9IA 3ULDA 1ZC6A 4XH1A 1RTIA 1NE5A 2IC3A 2HB5A 2GUPA 2KW4A 3NH0A 2QXLA 3HVRA 1RBUA 3L56A 5GIPA 4RG8A 4FJ9A 1BG3A 4CIGA 2ZM6K 1N36K 4YOXA 3TANA 4O5FA 1EKEA 3OYMA 4C8KA 2Y1IA 2D0AA 4DSFA 4BY9C 3L4QA 2IAJA 4M3TA 4L3QA 5AFUA 3AVMA 4CI6A 4DU3A 3AA2A 4FM1A 3KWIA 4FLVA 3R6MA 4HCBA 4O8KA 2Q2RA 5E84A 3AA3A 2DY4A 3DI6A 1VSHA 5KQ8A 3BF1A 4OGCA 1JLBA 3DOLA 2G8WA 1ICAA 4DQSA 1RFQA 2OA8A 2F9WA 2N2RA 3CJBA 2QWRA 3U8XA 3DLLL 1R59O 3K5LA 4IEEA 3UKRA 4OPAA 2NRZA 4A2AA 3THYA 3PSMA 4DFJA 3V9UA 2ETJA 1KTQA 1BI4B 1LW2A 3K9JA 3VGMA 4DKWA 3ZSWA 3DXMB 3CJCA 1SV5A 3WEEA 4Z94A 2E20A 4UY8O 4BEBA 3HSCA 3KHWA 4H4OA 4FJGA 4LF6K 1WAFA 5FDLA 2LKBA 2Q0UA 4JS5A 4DFKA 3TAGA 3THWB 3GOIA 4J2EA 2G2KA 3VQ7A 1TK8A 2OZSA 3ID6A 1SN4A 3PSFA 1NLVA 3LM9A 2D0OA 3A5OC 4B3OA 2P1JA 4CF2A 1S22A 3LDLA 3ZSZA 4E1MA 2W40A 3B8AX 4CERA 2YHAA 5LL6Z 2P9UB 2VCPA 2YX6A 3TWHA 2FBVA 1MR4A 3D2EA 3NCIA 1ATNA 4DB3A 4F2SA 4B3RK 1S9GA 1OMYA 1TKDA 3SJHA 2HMIA 1NOYA 3IRXA 4E3SA 4FVUA 3V4IA 1C1AA 3E7RL 4CFBA 3PX6A 1NGFA 5BREA 4FOIA 1QQCA 2HVIA 3GG4A 3EKUA 1GLCG 1KAYA 4B9MA 4DQQA 3L3UA 3O9RA 3I0RA 1WSGA 2YIPA 1ZBIA 3ASMA 1TUUA 5BR9A 4FJMA 4DV2K 1B9FA 4JKAA 4YOVA 3SQ1A 2Q97A 3VQ5A 1EWQA 3KP1A 2D0BA 3JSMA 3CPEA 3KJVA 2UUBK 4CZJA 1HRHA 3QICA 1B92A 2IDOA 4I2QA 2O8CB 3OYCA 4DV6K 4FWQA 5C10A 2MZ0A 5AQTA 1EX4A 1U49A 1NK7A 1NKCA 3NGYA 1BHLA 4Z4GA 2P9PB 4AM7A 4UAFE 2GBZA 2HNYA 4X64K 2NY9X 3QEPA 4BGAA 3DRPA 1V4SA 3LPTA 3CYMA 2D1KA 4H0VB 2ATBA 1DGKN 4CEAA 4Z4FA 4EHUA 4BC3A 4CEDA 1F21A 3H46O 1LWEA 4M45A 4KHWA 4U7BA 2JDQD 3VF6A 3CM5A 1WNSA 3L3VA 3WQUA 3AVKA 4JKGB 3O9TA 5EXWA 3PX4A 3C7NB 2O8FB 3KLFA 4LH4A 5C24A 2KFNA 3MCAB 3OS0A 3KK1A 3IUCA 4N41A 3DOKA 2OTJN 4CJQA 1YJWN 1NPIA 4BECA 1RTDA 1XMOK 1VQMN 1VSLA 4CGGA 3E9LA 3LPUA 1VQ8N 5C42A 4KTQA 3F9KA 1X9WA 1QHTA 1NJXA 3VA3A 4KH4A 2QKKA 1GOCA 3SPZA 3PO4A 4BE7B 4LC9B 1TAQA 5GADP 1Z25A 2OYQA 2D0CA 2ATQA 1DLOA 3CI5A 1S9EA 3EZWA 3S5TA 3C6HA 2XY8A 1HQEA 4KKOA 2C1GA 3C95A 3V9SA 1XWLA 3ZT3A 1VQLN 4R79A 5AQVA 4KB0A 3PLAA 2E1ZA 3VESA 4CZLA 5ADXH 2IIRA 4FJIA 4E7IA 4FVMA 2YNIA 5ADXA 2UYTA 4F3OA 1C56A 1NBWA 1VQ7N 1L3SA 3J7AP 1JLGA 3CC4N 4K25A 3ZSVA 3NHGA 2P5OA 3I56N 4BRFA 4QAGA 2GMOA 3NAEA 4DR2K 4YDUA 2UXCK 1X9MA 4O4GA 4DR5K 1UAXA 2H3GX 3HBTA 3QNOA 1GLBG 4NCAA 3WNEA 1BISA 2R7YA 4Z4CA 3LP2A 1WWNA 4J2AA 1SZ2A 4CD3A 1S3XA 3GKUA 2J4RA 1BIZA 1U47A 1T7BA 3VOVA 3SV3A 1ZU3A 5AQLA 3D2FB 3OYDA 1RDCA 3TSUA 1CZAN 3VQ9A 4BACA 2XY6A 4C8OA 2KBJA 2GX9A 3AGRA 3WXMB 4KHQA 1KD1O 4CF8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NWK A;  3U9Z A;  2V7Y A;  5AZI B;  3UKR B;  3JXU A;  4LC9 B;  3QFP A;  1LOT B;  4BRA A;  4BVP A;  3CI5 A;  4BRP A;  4BRL A;  3FR0 A;  4BRQ A;  5BRH A;  3UKU B;  3EZW A;  2QWN A;  1HJO A;  2V7Z A;  3FZL A;  3VEY A;  4IJA A;  5JLF A;  1U2V A;  2FLO A;  4H03 B;  4MLH A;  4B1X B;  4WQ4 C;  1MA9 B;  2ZF5 O;  3WEE B;  3HI0 A;  3MN7 A;  4FOE A;  5AQV A;  1Z05 A;  2E1Z A;  5AQR A;  3VES A;  4CZL A;  5ADX H;  1ESV A;  2IIR A;  1MDU B;  3BUZ B;  5F2R A;  5ADX A;  3RSE A;  2UYT A;  3WXJ A;  1NBW A;  3A5M C;  1QHA A;  2YCH A;  4XEI A;  2YJF A;  4H5N A;  4BRN A;  4K25 A;  2D4W A;  3AY9 A;  5BRF A;  4FPB A;  4EIA A;  4MO5 A;  1NGE A;  4BRF A;  1GLA G;  4YDU A;  2FSK A;  2H3G X;  2FSN A;  3HBT A;  4K41 A;  5BN9 A;  1GLB G;  1SQK A;  3D2E B;  2W41 A;  4K42 A;  3LDP A;  3O80 A;  1JCG A;  3G25 A;  4IWV A;  3DXK B;  1DEJ A;  1TUY A;  4CZK A;  3HTV A;  1ZBS A;  4FWM A;  1SZ2 A;  4CD3 A;  1S3X A;  3O1B A;  3AAR A;  1NM1 A;  2J4R A;  4FWK A;  1GLE G;  3VPZ A;  2A6A A;  4JHD B;  1J6Z A;  2D0P A;  4K43 A;  5E26 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NK4 A;  1XHZ A;  4CJT A;  2A1R A;  2P51 A;  5EVZ A;  1BL3 A;  2FXU A;  3AVL A;  4DTN A;  1X9S A;  3HT3 A;  5FRN A;  4Q5V A;  1RTH A;  1WSF A;  1IH7 A;  3MX5 A;  3V9W A;  4JS4 A;  3AV9 A;  1JZB A;  3ZX0 A;  4B9N A;  4E1N A;  3LL3 A;  1HLU A;  3EL2 A;  2GV9 A;  4JRP A;  4DR7 K;  3BY5 A;  2QWQ A;  3LP0 A;  2KZM A;  3U9D A;  4HVJ A;  3K5M A;  1VSM A;  2DFE A;  5HRP A;  1RT4 A;  2JLE A;  3D45 A;  1HNX K;  3HOT A;  2F4V K;  4ISE A;  1U2V B;  3HPH A;  4X65 K;  4DV1 K;  2KFZ A;  2P9N A;  4BR4 A;  4IEI A;  1QSY A;  2ASM A;  2G8U A;  4BVO A;  1FKO A;  1K8A O;  3VTH A;  4K8Z A;  1I3A A;  3F5T A;  3E01 A;  1KQS M;  1T7P A;  4CCH A;  3O5B A;  4AHT A;  4CIF A;  4HHF A;  1NK5 A;  3RSE B;  1JXC A;  4CJR A;  2DPN A;  4H5R A;  2VWB A;  3ATU A;  3A8Y A;  2XY5 A;  3SMS A;  5AR0 A;  2KKZ A;  1NG9 A;  5B8H A;  5GIN A;  4CJS A;  2KZZ A;  3AA5 X;  2RN2 A;  4A5A A;  1WSH A;  4DR1 K;  1TK0 A;  5AJ3 K;  3FE1 A;  3A5L C;  1WSE A;  3L2V A;  3DWL A;  2YHY A;  2P9I A;  3ULD A;  1ZC6 A;  4XH1 A;  1RTI A;  1NE5 A;  2IC3 A; 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