5AQRA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 127
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqrA04
3U8XA 2BTFA 3MN9A 1E4FT 5LJVA 3VGKA 3M6GA 2CGLA 4CD1A 3CERA 1TUYA 4BRLA 2VYPA 4A2AA 1GLAG 4BG8A 1NWKA 4BREA 1K8KB 1NMDA 5FPEA 3VEXA 2A40A 4O5FA 4IJAA 4RTFD 4PL8A 3R6MA 5BRFA 4RWTA 3J8AA 3P4IA 4FWRA 2QWPA 4CZJA 4WQ5A 5AQHA 3L0QA 1QQNA 2PAVA 4XH1A 3BUZB 3QDKA 2YJFA 4PL7A 3VEOA 4H03B 4KBOA 4ISEA 5BN9A 2GELA 4RCHA 1J6ZA 5LJWA 2IVOA 4PKHA 1GLJO 4C23A 2P9KA 3VEVA 4BC2A 3WXIA 4K42A 3VESA 4XH5A 1QHAA 5AQKA 5JMVA 5JLFA 2ASPA 4H0OA 3FZLA 3MMVA 3TU5A 3MK6A 4CZMA 4EAHD 1JCFA 1U6ZA 3DXMA 3CQXA 4BRNA 3FLCO 4AM7A 1V4SA 4FWNA 2FLOA 2FSKA 1BOTO 4NB4A 3VGMA 1SAZA 4FWMA 3WEEB 5JLHA 2A6AA 5ELZA 4FL9A 4DQ8A 4CZGA 4BGBA 3FE1A 2NLXA 4M7YA 5FPMA 3SLCA 3EZWA 3C7NB 4FWPA 1SQKA 5AQTA 5ADXA 1Z05A 5LY3A 5AQRA 4HWIA 3AAQA 3QFPA 1TUUA 1TYQA 3DJCA 3QBXA 3UKUA 3H45C 3WXKA 4CZKA 2P9IB 4CBXA 1U2VB 3CJCA 1E4GT 2CH5A 2QWRA 1QZ5A 3CJBA 2NRHA 2FF3B 3BF1A 2A41A 4Z94A 3BF3A 3VF4A 4B1ZA 5BPNA 4JNEA 3SK3A 4A2BA 2GUPA 4MO5A 2YCHA 2H3GX 3MDQA 3UE5A 4LC9B 5TKYA 3HTVA 1KAZA 4BR2A 2ZWHA 3MN6A 5AQGA 2QWNA 4FWSA 5AQJA 1V4TA 1DEJA 4I6MB 1NGAA 2HOEA 5AFUA 4CD3A 3RSEA 5AZJB 3DXKA 4QS9A 5BR9A 3VETA 2HMPA 3F9MA 4IWVA 5AZIA 3ZEUB 3CJAA 4PKGA 1YUWA 1DKGD 3IMXA 2ZGYA 4BC5A 1ATRA 3VGLA 1BDGA 3A5LC 5EOYA 3AY9A 4BC3A 3HBTA 4H5TA 5CE3A 3CI5A 2P9SA 4NO7A 2P9SB 3QICA 1LOTB 2E2OA 1G99A 2YHXA 3U9ZA 4CI6A 3U4LA 4YDUA 1Z6RA 4XEIA 2Q36A 3EO3A 4M7XA 1QQOA 3B8AX 5AQFA 3OHRA 1RGIA 3ENHA 3R8EA 2P9UA 5KPZA 1D4XA 2OANA 2YHYA 1S22A 4H0VB 3WXJA 1YVNA 2CGKA 1ZXOA 4FWKA 4IJNA 5BRHA 2YI1A 3VEZA 4CZFA 3GG4A 3W3DA 3ZX0A 1QZ6A 4B1YB 3SMSA 5AFUH 1IJJA 2GTDA 2V51B 3O8MA 2J4RA 4BRHA 2E20A 1ZBSA 3VEWA 4JAXA 4EHUA 4MLEA 3W0LA 1U2VA 4BVPA 2QWQA 3HZ6A 5AQLA 5AQQA 1KAXA 2ASOA 2P9LA 2WUSA 1ESVA 1NGCA 3ATUA 4JHDB 3VF2A 4BRKA 3D7EO 4MO4A 3LDOA 4BRCA 5F2RA 5AZIB 2W40A 5ADXH 3EKSA 5BRDA 1GLCG 3IDHA 1YAGA 4BR5A 1HKCA 4BRPA 5F0XA 4EFHA 5FPDA 5KQ8A 1NGDA 3KHYA 1Y64A 4BRGA 5BREA 4B1UB 3QB0A 4FPAA 2AP1A 1NGIA 2E2QA 4K41A 3FZFA 5B8HA 2FSJA 3AAPA 1IG8A 3DXKB 4BRIA 1NGEA 1BG3A 1OKJA 3LDLA 3UKRA 4CZLA 4BQLA 3D2FB 1TYQB 4JN4A 1R59O 3MCPA 5JICA 4H0YB 5AQYA 2QWMA 1NGJA 1NGHA 2EWSA 4H5RA 2FXUA 3DAWA 4XH4A 4FPBA 1NGBA 3L4IA 1MDUB 3O08A 1ATSA 1HJOA 4FO0A 3CHWA 5EXWA 4BGAA 3O4WA 3HM8A 3MN5A 3M1FA 2P9PA 4BR4A 3O80A 1QQMA 2BUPA 3GE1A 3H1VX 4A61A 4F9OA 3O5BA 1GLEG 2D0OA 3G25A 4B1VA 2UYTA 2Q97A 5AQVA 3I8BA 4IXCA 5AQUA 1NGGA 2ITMA 2IVNA 3A8YA 5FPNA 3MN7A 5AQWA 4BR7A 4H0PA 3A5NC 4B9QA 4BRMA 4K43A 4FOIA 1NM1A 4EHTA 1GLLO 4H5VA 4M63C 3QBWA 2D1KA 3WEEA 4BC4A 2KHOA 3QMLA 2P9NA 2P9KB 4BRAA 3ZETA 2IVPA 3GBTA 4CBWA 3LDPA 3DXMB 1JCEA 4L3QA 2P9NB 4DB3A 3WXLA 3D2FA 2QM1A 3FZHA 2VCPA 3GOIA 3ID8A 2GEMA 3UKRB 2P9PB 5I9EB 2FSNA 2E8AA 4WYBA 4BVOA 3DWLA 4H5WA 3LDNA 5AQIA 1YXQA 1BO5O 4WQ4A 3IFRA 3O1BA 1H1VA 1GLBG 3WQUA 2HF4A 2Q31A 4JHDA 3IUCA 5AQSA 4GNIA 4CJ7A 1C0FA 3LL3A 1KXPA 4BROA 4CZHA 3ZX3A 1X3MA 3CIPA 3VF6A 4QS7A 3VERA 1T6DA 2I7PA 2CGJA 4DCHA 3EL2A 1K8KA 1HUXA 3FZKA 3ZX2A 1DGKN 5EX5A 2A5XA 3H6EA 2A42A 3EKUA 2HF3A 4HTLA 3H1QA 3WUHA 5EVZA 1JCGA 2P9LB 5AQNA 1NBWA 1BUPA 3A0IX 3CJ7A 4FWLA 4WQ5C 4A62A 2PBDA 1HKBA 4ISGA 3BEXA 3A5MC 4H0XB 4FOEA 3FR0A 4WQ4C 3D2EA 2QXLA 2E2NA 2FF6A 1XQSC 3KVGA 2ASMA 3O1WA 4QS8A 5AQOA 1HLUA 4FWQA 2E1YA 3LM9A 3VENA 2YHWA 4BRDA 5EY4A 4FWOA 5E26A 3ULEB 2Q0UA 3R9PA 3LM2A 2YJEA 4YDUC 4BR9A 4AM6A 1XC3A 3HI0A 5AR0A 5E84A 1RFQA 1SZ2A 1MA9B 2ZGZA 4ISFA 2E2PA 1RDWX 3SMPA 3ENOA 2CH6A 2QWOA 2P9UB 3VOVA 4J8FA 3VEYA 2IIRA 4BG9A 1HKGA 3AARA 5BPMA 3KZBA 3EN9A 4JD2A 4EIAA 1ATNA 2A3ZA 1NLVA 1BA1A 3FZMA 2I7NA 4CBUA 1GLDG 2QWLA 1HPMA 3CJ1A 4IZ9A 1CZAN 2ZF5O 3GL1A 4MLHA 3CQYA 5BN8A 3ZEUA 4IO8A 5BPLA 4H0TB 1X9JA 1NGFA 5AQZA 3JS6A 5KPTA 5AQXA 2Q1NA 5F1XA 2GWJA 3H3NO 1X3NA 3CETA 2F9WA 2V7YA 1KAYA 2AA4A 2V52B 3ULEA 3WT0A 3JXUA 2E88A 2F9TA 1MWKA 2GWKA 3QFUA 1T44A 4PKIA 4Y0WA 3SJHA 4B1WB 2D0PA 4O8KA 3LDQA 2D4WA 1BWFO 3FGUA 3CJ9A 3UB5A 4BRQA 3RSEB 5AQMA 3BP8A 2P9IA 4I6MA 3H3OB 4K25A 2DPNA 3C0BA 3UKUB 1T6CA 5KQDA 3O6WA 3I33A 5AQPA 2W41A 1XUPO 1C0GA 1P8ZA 3H46O 4JD2B 4H5NA 3C7NA 4GY2B 1LCUA 3L6QA 3VPZA 4DHYA 1S3XA 2QW9A 2Q2RA 2V7ZA 3U9DA 1HX1A 3FFKB 3WQTA 5AZJA 1GLFO 1WUAA 4BQZA 3GDQA 1Q18A 1ZC6A 4B1XB 4BRFA 4CZEA 4BR0A 3HSCA 4FSVA 2E1ZA 1MWMA 5KPRA 4E1JA 1EQYA 3TPQA 4CZIA 3A5OC 1WOQA 2Q0RA 3S41A 1BA0A 1BU6O 3D2EB 3ZETB 3M3ZA 3ATVA 2NZTA 2VWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G71N 1GOAA 1IO2A 4B08A 4DWIA 4AILC 1RBSA 4CD1A 3CERA 4NCAA 1SEGA 5I3UA 4BREA 4CGIA 2W6LA 4PQUA 4RTFD 4IG0A 3SV3A 5BRFA 1Q8IA 1VQKN 4RWTA 3L0QA 3QDKA 2F96A 1YTUA 1XWLA 4JI4K 1J6ZA 1RBUA 1WSGA 3SUOA 2Y1JA 4C23A 3NH1A 1NRAA 5AJ3K 3CXCM 2VQFK 3R3LA 4IFEA 3VESA 1Y97A 2YNGA 4QAGA 1NJYA 2YC1C 3LALA 1HJRA 5FRMA 4EAHD 1JCFA 2B68A 2PFUA 3CQXA 4AM7A 2LI7A 1GPSA 1W2BM 1BOTO 2RHKA 3E1YA 4OGCA 3WEEB 3QERA 5JLHA 2W00A 3ZSZA 5I42A 4OKJA 1BQMA 4M7YA 1VAZA 4FJIA 1LQQA 3CM6A 4MQ3A 1WAFA 1W7AA 1OMYA 4HWIA 3AAQA 3DJCA 1TYQA 3UKUA 1UA0A 2MZ0A 2E6MA 1E4GT 3CCVN 2CH5A 4DLEA 3NVMA 1FJGK 4A57A 4HTUA 1C0TA 3V6DA 3C6HA 4JNEA 3SK3A 1I2UA 2GUPA 4FJNA 2UXBK 4AHCA 3B6OA 3UE5A 1VRUA 5TKYA 5KI6A 5M1PA 5K14A 3CFRA 3MN6A 3NFAA 3HPHA 3NF8A 1QSYA 2HOEA 1PTXA 2XRIA 4CEOA 4EZ6A 3RSEA 4YOWA 4DR1K 4DQIA 1CHZA 3VETA 1ZVEA 4IWVA 1C1BA 2LKBA 3CJAA 1NKBA 2YX6A 4KTZA 4BC5A 3VGLA 4DKWA 2VWJA 1VNAA 3AA2A 2HSTA 3SZ2A 3OJSA 2KGQA 5BR8K 2OA8A 4H5TA 3CCUN 2P9SA 3E01A 4B3RK 1LOTB 4CI6A 3V1OA 4MDAA 2HMIA 4B9UA 5T7BA 3PSFA 3AVAA 4CGFA 3EO3A 1VQNN 1B92A 4CJEA 1QQOA 3TSUA 1NKEA 2OPRA 3R8EA 4H0VB 1S22A 1YVNA 3VA0A 5BRHA 4GMJB 3GG4A 3R1XA 3TR8A 5GIPA 1C0UA 3O8MA 3THWA 4CJLA 4JI3K 3THXA 2C1IA 1VSLA 5C24A 5JENA 3T1AA 4N76A 4N41A 3CC4N 1ZBSA 4RW4A 4JAXA 2NY8X 4MLEA 4EHUA 1U49A 4KV8A 1U2VA 4BVPA 2G8KA 3HZ6A 1YHQN 3AVCA 1ZYQA 4FZXC 2OYQA 2LY5A 2QI2A 4YNQA 3SPZA 3DOLA 1VSJA 4IOCL 3CPEA 5JS1A 5ADXH 3EKSA 3IDHA 1KTQA 4JK8A 3PSIA 1YI2N 5D3GA 2X74A 4DFJA 4HCBA 1NGDA 4JKEA 5BREA 4JI7K 4CEAA 4U7BA 3HO1A 3VQCA 2AP1A 3S3MA 4CHQA 2PY5A 1NGIA 2E2QA 1WBDA 5B8HA 1N8RO 1IG8A 1OKJA 1J54A 2P51A 4J2EA 4BQLA 4PA1A 2KJAA 4C8KA 3LAMA 4CW7B 2EWSA 1NGBA 1MYNA 3NH2A 3CHWA 4JI0K 5EXWA 2BRZA 3MN5A 3ASMA 2P9PA 2KTQA 3D0PA 3GE1A 3TWHA 4A61A 4B3SK 1JL2A 3G25A 4JK7A 4DR3K 3RTVA 3I8BA 1NGGA 3KLHA 2IVNA 3D45A 3A8YA 3LWMA 5FPNA 3MN7A 4BR7A 1VQ9N 2C1GA 1EXQA 4DFPA 1KFSA 1GLLO 2LSNA 3C65A 3QBWA 3WXMB 1KRPA 2DFFA 3VQEA 1A5WA 3OTOK 3I55N 1K8BA 3QMLA 4F3TA 2P9KB 1JKZA 2QA4N 4Q0BA 2NY9X 3ZT1A 3KLGA 1JCEA 1S1UA 4LFCK 3A2FA 1VSIA 4N5SA 4M3UA 4DB3A 3M8RA 1B3CA 2JLEA 1M90O 1UOCA 2P9PB 1JLFA 2GUIA 5LMNK 2WOMA 1BHLA 3IFRA 4B3TK 4IBNA 4C8MA 5M1KA 2UUAK 3HPOA 3QLHA 1B9FA 1QQCA 2HF4A 4JHDA 3DLBA 1C0FA 1KXPA 4CZHA 1TV6A 5GINA 4JV5K 1EO1A 1X9MA 4DR7K 1KQSM 2PYLA 3VERA 3QETA 1NJZA 4E72A 1UGLA 3HXMA 1FKOA 3FZKA 1VQ8N 2A5XA 3U3YA 4CF1A 3DYAA 4HTLA 5EVZA 1JCGA 2P9LB 2W6KA 4YY3K 1BUPA 3A0IX 4EP4A 1O13A 4DF8A 2WONA 1P00A 3CCRN 2PBDA 4F3OA 1NJWA 4X66K 5TKWA 1BI4A 4WFBL 2P1JA 2E2NA 3DOKA 1JLQA 1EWRA 1AYJA 1LAVA 3RR7A 3HRGA 5AQOA 1OH8A 4KTWA 4UADE 3MECA 2HBLA 3TSPA 4DLGA 1M1KO 2WC9A 1RT7A 3QINA 4YDUC 4V1DC 2YJEA 4OLAA 3OYIA 1SZ2A 3KOYA 4BE0A 4DV4K 3S3OA 2P9UB 3VOVA 4BG9A 3IKMA 4CGGA 1E3MA 4JD2A 3VQQA 4EIAA 1MR4A 3FZMA 3J81O 2I7NA 4JK9A 4FJLA 1GLDG 1HNWK 3SQ1A 1CZAN 4C1NI 3BZCA 1KVBA 2GL1A 4FLYA 4IO8A 1HQUA 4H0TB 4M3TA 1NGFA 4CGJA 1I3AA 5KPTA 3NCIA 5SZTA 1JLCA 5CY0A 2UXDK 4M41A 1X3NA 1JLEA 2V7YA 2O4GA 1MWKA 2GWKA 4Y0WA 1QS4A 4PKIA 2D0PA 1POIA 4I9QA 3HOSA 1FH3A 4DTOA 3CJ9A 3UB5A 4CJVA 3PX6A 2VGMA 5AQMA 4DTUA 4I6MA 1MU2A 3DLGA 4RW6A 1XHZA 2YHAA 3OYFA 1T6CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3G71 N;  1GOA A;  1IO2 A;  4B08 A;  4DWI A;  4AIL C;  1RBS A;  4CD1 A;  3CER A;  4NCA A;  1SEG A;  5I3U A;  4BRE A;  4CGI A;  2W6L A;  4PQU A;  4RTF D;  4IG0 A;  3SV3 A;  5BRF A;  1Q8I A;  1VQK N;  4RWT A;  3L0Q A;  3QDK A;  2F96 A;  1YTU A;  1XWL A;  4JI4 K;  1J6Z A;  1RBU A;  1WSG A;  3SUO A;  2Y1J A;  4C23 A;  3NH1 A;  1NRA A;  5AJ3 K;  3CXC M;  2VQF K;  3R3L A;  4IFE A;  3VES A;  1Y97 A;  2YNG A;  4QAG A;  1NJY A;  2YC1 C;  3LAL A;  1HJR A;  5FRM A;  4EAH D;  1JCF A;  2B68 A;  2PFU A;  3CQX A;  4AM7 A;  2LI7 A;  1GPS A;  1W2B M;  1BOT O;  2RHK A;  3E1Y A;  4OGC A;  3WEE B;  3QER A;  5JLH A;  2W00 A;  3ZSZ A;  5I42 A;  4OKJ A;  1BQM A;  4M7Y A;  1VAZ A;  4FJI A;  1LQQ A;  3CM6 A;  4MQ3 A;  1WAF A;  1W7A A;  1OMY A;  4HWI A;  3AAQ A;  3DJC A;  1TYQ A;  3UKU A;  1UA0 A;  2MZ0 A;  2E6M A;  1E4G T;  3CCV N;  2CH5 A;  4DLE A;  3NVM A;  1FJG K;  4A57 A;  4HTU A;  1C0T A;  3V6D A;  3C6H A;  4JNE A;  3SK3 A;  1I2U A;  2GUP A;  4FJN A;  2UXB K;  4AHC A;  3B6O A;  3UE5 A;  1VRU A;  5TKY A;  5KI6 A; 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