1U2VA

Crystal structure of arp2/3 complex with bound adp and calcium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
418
structure length
402
Chain Sequence
MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-Related Protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 402
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1u2vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1u2vA04
3EKSA 1R59O 2E2OA 2F9WA 2VYPA 2YJFA 1GLJO 1QZ5A 3EL2A 3EN9A 3FE1A 4ISFA 3VEZA 3A5NC 3UKRA 3FZLA 4I6MA 4BC5A 1KXPA 4YDUA 5BREA 4BRIA 2NRHA 3IMXA 4HWIA 4BRFA 4A61A 1YAGA 2A40A 4YDUC 3DXMB 5AQFA 2H3GX 2E8AA 4FWRA 5AQKA 3CJAA 3HTVA 3MMVA 3VF4A 3VPZA 5AQGA 2E88A 3LDNA 1Z6RA 1GLCG 2V51B 3ENOA 3M3ZA 3VF6A 4CBUA 4QS7A 3SLCA 3O5BA 4K41A 5KPTA 4FWSA 1IJJA 2V7ZA 3HI0A 4AM7A 4IWVA 4RCHA 1NWKA 4XH5A 4MO5A 3W0LA 1ZBSA 4IZ9A 1D4XA 4JAXA 4M7XA 4L3QA 1J6ZA 3BEXA 1QHAA 2ZF5O 2P9LB 3QMLA 3WQTA 3U8XA 4B1ZA 4H5VA 4B1UB 1TYQA 2D4WA 1BO5O 2ZGZA 3H3OB 3SMSA 1S3XA 1NGDA 1T6CA 4BREA 4WYBA 3F9MA 1GLEG 3RSEA 4FL9A 3AAQA 4BGBA 5BN9A 1Y64A 2CH5A 3CQXA 2FLOA 1X3NA 2YHYA 4FPAA 3FZFA 1TUYA 4FWPA 5F2RA 2D0PA 4FWKA 4IJNA 1KAXA 1S22A 3QFPA 1SQKA 5EXWA 1T44A 2Q31A 4BRQA 2YJEA 2GELA 3CHWA 3R9PA 4BC4A 1TYQB 5KQ8A 3FZKA 5F1XA 2Q1NA 2QM1A 3O08A 4A2BA 3O1BA 3VGKA 1HJOA 1IG8A 4PKIA 1KAYA 5AR0A 2NZTA 3U9DA 1ATNA 3QICA 2GWJA 3QB0A 2PBDA 4H03B 5AQJA 3VF2A 2I7PA 4JNEA 4BR2A 1ATRA 3VESA 5AQMA 3TPQA 4PL7A 3ZEUA 3M1FA 3VEWA 5JLHA 1E4FT 4EAHD 5BPLA 1SAZA 5TKYA 2OANA 1DEJA 5BPMA 2IVNA 4CZEA 2QWRA 4LC9B 3HM8A 4EHTA 5ADXA 3J8AA 4CZIA 5KPRA 4XH4A 4FWLA 4BVPA 1MA9B 4Z94A 1HKBA 2P9IB 4BRMA 3VEOA 2A41A 1Q18A 3QBWA 4K25A 2EWSA 3GL1A 4CZHA 3D2FA 3WT0A 1DKGD 5KQDA 3CQYA 2A42A 1ESVA 3IFRA 2GTDA 4HTLA 2DPNA 4EFHA 3ZEUB 1V4SA 3WXKA 4WQ4A 1NBWA 2GUPA 3ATVA 4H0YB 4XH1A 4CZKA 2Q0RA 1H1VA 1RDWX 4WQ4C 3H1QA 3KVGA 3KHYA 4BQLA 5AZIB 3D7EO 3LDOA 2YHWA 3LDLA 1YVNA 3L6QA 1NGIA 4H5RA 3BF1A 3UB5A 3VENA 5FPNA 3L0QA 3O1WA 2FSNA 5B8HA 4BRPA 5AQOA 5AQLA 4BRAA 3LM9A 4M7YA 5FPDA 3H6EA 2BTFA 1X3MA 1OKJA 3AY9A 1BG3A 4BRLA 5AZJA 3MN6A 3TU5A 4QS9A 3UE5A 3C7NA 3ULEA 2GWKA 3FFKB 3O8MA 1GLDG 2ITMA 4I6MB 1P8ZA 2Q2RA 3R6MA 3AAPA 4BR5A 3WEEA 2NLXA 3GE1A 5AQTA 2FXUA 5FPEA 3ZX3A 2E1YA 3LM2A 2A5XA 3SJHA 3FZMA 3BUZB 5AQZA 3UKRB 3KZBA 2ZWHA 4H0TB 3G25A 4RWTA 3JS6A 3DXKA 4DQ8A 1ZXOA 5AQRA 4A62A 4BR7A 4EIAA 3CJBA 2Q97A 5LJWA 4F9OA 1JCFA 5AZJB 1XC3A 2FSKA 3QFUA 1BWFO 3JXUA 3O6WA 1ATSA 1WOQA 3L4IA 3CI5A 2QWPA 4H0XB 1QZ6A 2P9SA 1EQYA 3SK3A 2E2QA 2KHOA 2E2NA 3IUCA 5AQHA 2AA4A 5CE3A 3I8BA 2ZGYA 2VCPA 4NB4A 1WUAA 3A8YA 3QDKA 4DHYA 3FR0A 3MN5A 4H5TA 3LDQA 1YXQA 3VETA 4O8KA 5JICA 3DXKB 5EOYA 2P9PA 1DGKN 1QQMA 2W40A 2P9UA 4CBWA 3QBXA 4CJ7A 1QQOA 5EVZA 4NO7A 4H0OA 2P9NA 2P9SB 4BRCA 4B1YB 1GLAG 3B8AX 3I33A 3CJ9A 4RTFD 4FWQA 3CJCA 3RSEB 3GG4A 3FZHA 1C0FA 2QXLA 4CD1A 1K8KA 2QWMA 4FOEA 4PKHA 2IIRA 4BR0A 3DWLA 4CZMA 4FO0A 4O5FA 3VEVA 5AFUA 1MDUB 3C0BA 2V7YA 3FGUA 1JCGA 4J8FA 3BF3A 3IDHA 4IO8A 3ZETA 5F0XA 3CJ1A 5AQSA 3WQUA 2P9KA 3HSCA 2ASPA 3S41A 1C0GA 2ASOA 5FPMA 4CD3A 5BN8A 1MWMA 3UKUA 1T6DA 1ZC6A 4BR4A 3D2EA 3MDQA 3H46O 2GEMA 3ENHA 2E20A 4GY2B 5JMVA 4BC3A 5AQUA 3U9ZA 3CIPA 4MO4A 1G99A 5E26A 2ASMA 4CBXA 3DJCA 2I7NA 3MN7A 5EY4A 4BG8A 4DB3A 1GLLO 3MCPA 1HX1A 1HKCA 5AQVA 2QWLA 3SMPA 4B1WB 2AP1A 4IJAA 1HLUA 1NGGA 5BRDA 3A5MC 1GLBG 3CJ7A 2FSJA 3O80A 4JD2A 1LOTB 5BPNA 2Q0UA 5ADXH 1NGBA 1XQSC 1TUUA 2BUPA 3DXMA 3MN9A 1SZ2A 4GNIA 4E1JA 1MWKA 1YUWA 1BUPA 3P4IA 3CERA 1XUPO 3VGLA 4BGAA 5BRHA 4IXCA 1NGFA 1NGHA 3D2FB 4EHUA 3EO3A 4FWMA 3A5OC 4C23A 3WUHA 1Z05A 2FF6A 4PL8A 4ISGA 4M63C 2YHXA 4CZLA 1KAZA 1NLVA 3HZ6A 5JLFA 2D1KA 1BU6O 2QW9A 1NGCA 2A6AA 3EZWA 3MK6A 1CZAN 4JD2B 4CZJA 3U4LA 2P9LA 4DCHA 2F9TA 3LL3A 3WXIA 3EKUA 4B1XB 1GLFO 2WUSA 4BVOA 4H5NA 4BRHA 4K43A 2E2PA 1QQNA 2CGJA 4CI6A 1U6ZA 2V52B 1RFQA 4CZFA 2YCHA 3O4WA 4MLHA 4WQ5A 2J4RA 1NGJA 4CZGA 5KPZA 4WQ5C 3C7NB 3ULEB 4KBOA 1JCEA 4XEIA 1RGIA 2IVPA 4MLEA 3A0IX 1HPMA 3AARA 5ELZA 3WEEB 1X9JA 4BRNA 2E1ZA 1HKGA 3ID8A 3WXLA 4B1VA 5AQWA 3A5LC 2QWOA 4B9QA 4FWNA 4FSVA 3GBTA 3WXJA 4FWOA 3VEXA 5E84A 4BG9A 3H45C 2QWNA 1V4TA 3R8EA 1BDGA 4QS8A 3BP8A 5AQXA 1NM1A 1NMDA 5LY3A 2A3ZA 2HMPA 2Q36A 4Y0WA 3GOIA 5I9EB 4FOIA 2PAVA 2YI1A 4BRKA 3M6GA 5AQPA 1LCUA 3VOVA 2HOEA 5AQIA 4AM6A 3FLCO 2P9PB 2QWQA 2HF3A 4JN4A 5AQYA 1U2VA 2P9UB 3CETA 2P9IA 5AQNA 4BRGA 4BC2A 2D0OA 5LJVA 5BRFA 3ZX0A 4K42A 2P9NB 4JHDA 2CGKA 4FPBA 3H1VX 3VEYA 4H5WA 1E4GT 4H0VB 3VGMA 1K8KB 4BROA 2UYTA 3OHRA 5AZIA 4BRDA 5AQQA 5BR9A 3W3DA 5AFUH 2HF4A 2FF3B 3H3NO 3ZETB 2P9KB 1NGEA 3DAWA 1U2VB 2CH6A 2W41A 4PKGA 3LDPA 2CGLA 4A2AA 2VWBA 1BA1A 3UKUB 4BQZA 1BA0A 3HBTA 3ATUA 3D2EB 4JHDB 4BR9A 3GDQA 1HUXA 4ISEA 4H0PA 3VERA 2IVOA 5EX5A 1NGAA 3ZX2A 1BOTO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YORA 3SYZA 3EKSA 5GAHP 1YVUA 4JKHA 3LPTA 4KI6A 3DMJA 3CFPA 1W0HA 5HROA 3EN9A 4NXNK 4CJEA 3QESA 1HPZA 1EKEA 2PYJA 1JKHA 1ITGA 4NLCA 3J7ZO 2NRHA 1IKXA 4HWIA 4BRFA 3K9JA 3AV9A 5AQFA 3SUPA 3JSMA 3M8QA 3M8SA 1NKEA 1U4BA 4FVUA 3VPZA 1VK0A 3G71N 1GLCG 4B9LA 3VF6A 4CBUA 3TAFA 4LFCK 1IJJA 1DLOA 3CCLN 1NWKA 4KH6A 4QOZB 1J6ZA 2YNIA 3RR8A 4Q5VA 3N4QA 3SPYA 3NBPA 4B1UB 1TYQA 2F8SA 3C95A 4O0JA 3SMSA 2G8WA 1T6CA 4DLEA 4WYBA 4CJPA 3F9MA 4F2SA 3CCVN 3OBWA 4M3WA 3QLHA 5BN9A 1NKCA 4BE1A 4G9ZA 2FLOA 4DTXA 3FZFA 1VQ8N 1TUYA 1ZBIA 3SNNA 1RILA 1WNSA 4IJNA 4RW4A 4N5SA 1SKSA 1LWEA 1S22A 4IOCL 1T44A 4BRQA 4FYDA 3HYFA 4HVJA 2QM1A 2YHAA 1VQ9N 3O1BA 3OYJA 3TSUA 1VQON 4WE1A 3ZSXA 3RRGA 2PBDA 2OPRA 3OBYA 4NYNA 3NF7A 4CJTA 4BR2A 2ZJRL 5JLHA 4EAHD 2XY5A 5TKYA 1RT3A 2X6SA 4YOUA 5BPMA 3KK2A 2ATQA 4CZIA 4FJHA 1VQ4N 1GOBA 3TTDA 1RT6A 4BVPA 1MA9B 3J7AP 4BRMA 3VEOA 5GAEP 4CF9A 2C1IA 1N8RO 5GIOA 2EWSA 1IKYA 1DKGD 5KQDA 4CGGA 3LWLA 4GV6A 2DPNA 4B3SK 4CW7B 4GW6A 3KWIA 1K8AO 1WSGA 3WXKA 3OYKA 3ATVA 4JKDA 1SKWA 4B9TA 4BQLA 5IWAK 3LDOA 1IBLK 4E89A 3O9RA 3WNHA 3C6HA 4FZZA 2WC9A 5CYQA 4JI0K 1OH8A 5AQOA 4O8UA 4BRAA 4ILGB 5FPDA 3F9KA 3V1RA 4CCHA 3CYGA 3F2KA 5A2QO 4DV6K 1X3MA 3OW2M 1B9FA 1BG3A 4BRLA 4CF1A 3DOLA 5AZJA 3ZT2A 1JJ2M 2PFUA 2RKIA 4JKGA 3UE5A 2GWKA 1GLDG 2YV0X 3O9UA 5CZ2A 3MECA 2ITMA 4I6MB 4BR5A 2HHQA 3TSPA 3WEEA 1YI2N 3GE1A 2E1YA 3LM2A 3T19A 3KZBA 4LF9K 2NRRA 4EP5A 1XHZA 1P90A 5AQRA 4JI1K 1RNHA 4A62A 4BR7A 4EIAA 1UA1A 4OO1J 1TKTA 4F9OA 5C2DA 4FLZA 3DLGA 3WNGA 1VSHA 3TR8A 1ATSA 1WOQA 4H4MA 4DV2K 4DTUA 2E2NA 2ZQBA 1FXXA 3NGZA 2VCPA 3QDKA 3FR0A 4H4OA 3HPHA 3MN5A 4H5TA 1SUQA 4O8KA 4E7IA 1L3VA 1Z26A 3ALYA 3DXKB 5EOYA 4B3RK 1DGKN 1WN7A 4CJRA 1U49A 4X66K 1QQOA 5EVZA 4Q0BA 1RBSA 2RHKA 4OPJA 2IC3A 2XY7A 2OCEA 4CJWA 3RSEB 3CJ9A 4A5BA 5DK5A 3CJCA 4CGJA 3ZSWA 1DTQA 2QXLA 4CD1A 1K8KA 3KKSA 4V19S 1T3VA 3I8DA 3DWLA 3OYDA 5AFUA 1MDUB 4FJJA 1CZBA 4IEEA 2V7YA 5K14A 4LF5K 3IDHA 2O8DA 5AQSA 1D9DA 3PLAA 2XY8A 2ASPA 3S41A 2ASOA 3HVRA 3CPWM 3SUQA 3THXB 4FJ9A 4KKOA 2HHVA 1T6DA 1ZC6A 3MDQA 3IAYA 3LWMA 2E20A 5JMVA 1I94K 3ZSVA 4CEDA 4KTWA 3CIPA 2KQ2A 2ASMA 4CBXA 3ASMA 3OTOK 5EY4A 4AQYK 4DSJA 3AO4A 4KO0A 1RT4A 2QWLA 2AP1A 1VQLN 4DFJA 1REVA 2BE2A 4JI4K 1RTHA 4M3YA 4CEEA 1VSKA 3NE6A 3BGRA 4KV8A 2FBYA 1YF5L 3L3UA 4GNIA 1MWKA 1EETA 1YUWA 2O8CB 3VGLA 1X1PA 3NDKA 1XNQK 4CEAA 1HQEA 3AA2A 3A5OC 3V9SA 4BACA 1Z05A 2FF6A 2G8IA 5HLFA 4ISGA 2YHXA 3L2VA 3CCQN 1IKVA 4QAGA 1KAZA 4CK1A 4IOAL 4AHCA 1O13A 3CYMA 1NGCA 4JD2B 1RTDA 1OH5A 1CZAN 4UQGA 3L3VA 4O55A 2YX6A 3A2FA 3SQ0A 3JAMO 1B92A 1IG9A 2WBNA 4DU3A 5J2MA 4BVOA 4M42A 4YNQA 3HJFA 4K43A 3HOSA 3SCXA 2E2PA 1EP4A 4JS4A 4CHNA 4JK7A 3CM6A 4CZGA 3K5LA 1RTJA 3C7NB 3ULEB 1XC9A 4KBOA 3SAGA 3ENBA 2Y1JA 3AARA 2IDOA 4LH5A 4MFBA 4RW8A 4JI7K 2LSNA 4DR4K 3PY8A 4OVLA 1X9WA 1B9DA 2BANA 1RCHA 5C0YA 3PUFA 4DSKA 1IBKK 2GUIA 2Q3SA 3WXJA 4FWOA 4FJMA 2YNGA 3LAKA 5E84A 1YJNN 3H45C 4CHOA 1VQNN 4QS8A 3BP8A 1VQKN 4BY9C 2HMPA 4OPAA 1HNWK 4Y0WA 2RE2A 4NLBA 4DR7K 3AVFA 5I9EB 4DF8A 3WNEA 5AQPA 4CIEA 1TVRA 1LCUA 3OVNA 1HNIA 4JEPA 3VOVA 5MLCQ 2HOEA 5GINA 1EXQA 4AM6A 4ZTJA 3V9WA 2KZMA 1VQMN 2ETJA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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