1U2VA

Crystal structure of arp2/3 complex with bound adp and calcium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
418
structure length
402
Chain Sequence
MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-Related Protein 3
publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 402
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1u2vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1u2vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1u2vA04
4CI6A 1XC3A 5AQLA 4BRCA 3FLCO 2A6AA 2YI1A 4B1XB 3MN5A 4CBXA 2E88A 3VESA 1QQNA 3LDQA 1NGEA 5F2RA 5BPNA 2IVOA 2GEMA 3O8MA 3UE5A 3UKRA 4O5FA 3KVGA 3BF3A 2A42A 3WXIA 1GLJO 5AFUH 5KPZA 3EKUA 3EN9A 1ATSA 2A3ZA 2E1YA 3GG4A 3FGUA 3FFKB 3FE1A 3VEZA 3DXMB 3H45C 1S22A 2FSJA 4FO0A 2QWQA 2FF6A 3AARA 1NGJA 3CJ9A 5AZJB 1ATNA 1ZC6A 3M1FA 4PKHA 5F1XA 3C7NA 3VPZA 1RFQA 2E1ZA 5AQSA 3DXKB 5AQIA 5AQGA 5EOYA 1BA0A 3CI5A 3FZFA 3WEEA 3CETA 3HZ6A 4FWNA 4E1JA 2I7NA 1LCUA 2V7YA 2V7ZA 2YHWA 1YAGA 3B8AX 3J8AA 4QS9A 3DAWA 3ZX2A 5JLFA 3LM9A 4JHDA 1DGKN 5LY3A 1JCGA 2UYTA 2P9IA 3FR0A 1XUPO 1TYQB 3QFPA 4H03B 2AA4A 2E2PA 3ZETA 4EIAA 3UKUB 2YJEA 5AFUA 4RTFD 1QZ5A 3WQUA 2IVNA 4JAXA 2QM1A 4PKGA 2ASMA 2P9NA 4RWTA 3CIPA 3ULEB 1KAZA 5KPTA 2GTDA 3SMPA 2NZTA 4JNEA 5AQKA 4ISEA 4FWMA 5FPMA 3S41A 3VEVA 3L4IA 3ZEUA 4BRDA 4C23A 2E2QA 3U9DA 1KAYA 4FL9A 2ZGZA 3O80A 4CZEA 2HF3A 2W40A 3VGLA 4CZJA 5AQUA 3SJHA 4BVPA 3I33A 4NO7A 4CZIA 1XQSC 5JLHA 4H0PA 4K43A 3A5NC 3VF6A 4I6MB 5AZIA 2Q31A 5CE3A 3IFRA 5AQXA 2IIRA 1U2VA 3CJCA 1HX1A 3WXJA 4BRFA 1Q18A 3LM2A 4EFHA 3UB5A 4FOEA 3KZBA 4BRLA 5B8HA 1GLFO 3H3OB 4BC5A 2ZWHA 3D2FB 1YUWA 4BRIA 4FSVA 4AM7A 4H5NA 2V52B 2H3GX 1K8KA 2PBDA 4CD3A 1RDWX 3U9ZA 5AQYA 1D4XA 4CBWA 2W41A 3CERA 4A2BA 5BN8A 2FF3B 4BGAA 4BC2A 3L0QA 3QMLA 3KHYA 3O08A 4BR9A 3ATVA 4DCHA 2ZGYA 4BC4A 3WXKA 2BUPA 1BU6O 3O4WA 3FZHA 4GY2B 5AQOA 1HLUA 2D1KA 4K25A 2J4RA 5BRHA 5EXWA 1HKGA 4DHYA 4EHUA 4EHTA 4H0OA 3MMVA 4M7XA 2D4WA 3ATUA 1RGIA 1NGBA 3BEXA 1DEJA 1KXPA 2V51B 2P9KB 4BREA 4ISFA 4H0XB 5LJVA 3GBTA 4BRQA 2P9LA 4BQLA 3U4LA 3G25A 3BF1A 3BP8A 4BR7A 4FWOA 5AQZA 1HJOA 4FWRA 2Q2RA 5AZJA 1NGAA 2P9UB 2E8AA 5BN9A 3VENA 3M3ZA 2Q1NA 2DPNA 1IJJA 3EZWA 5AQFA 2AP1A 1JCEA 3W3DA 3WUHA 2YCHA 1OKJA 1Y64A 4JD2A 4BVOA 3SMSA 3FZLA 4CZMA 4QS7A 2A41A 1GLLO 3D2EA 3MN9A 3RSEB 1SAZA 4BC3A 3AAPA 1P8ZA 3QICA 1Z05A 3TPQA 4WQ4C 2WUSA 4YDUC 1X9JA 4CZKA 3R8EA 4B1VA 2QW9A 2NRHA 5LJWA 2GUPA 5AQHA 2CGKA 2P9PA 4MLEA 4Z94A 1QZ6A 2P9SA 2D0PA 2KHOA 3LDNA 1U6ZA 1HPMA 3UKRB 3JS6A 4WQ5C 5FPDA 3QBXA 4FWSA 2ASOA 4BRNA 1HKCA 1ESVA 1QHAA 2VWBA 1NGGA 4H5RA 2FSNA 3CJ1A 1C0GA 1LOTB 3EKSA 4J8FA 5EY4A 4FWKA 4KBOA 5ADXH 5BRFA 3CQYA 1ZXOA 4CZHA 4CZFA 4IJAA 1E4GT 4FWQA 4B1WB 5AR0A 4BRPA 4WYBA 1NGHA 2Q0UA 3ZX3A 2OANA 3C7NB 4BR2A 3P4IA 4CBUA 5AQWA 3WEEB 1SZ2A 3DJCA 4QS8A 2VCPA 3HSCA 3IDHA 2NLXA 4XH1A 2F9WA 1NGFA 4JHDB 3A8YA 4IXCA 4H5TA 2P9IB 3LDOA 5AQTA 1NGDA 3IUCA 3VGKA 3ZETB 2ASPA 1H1VA 2QWNA 1S3XA 3JXUA 4ISGA 2A40A 2D0OA 3VF2A 3MDQA 3I8BA 1GLBG 1WOQA 2P9NB 1QQOA 2Q36A 1HKBA 5I9EB 3GL1A 2ITMA 3VOVA 3H46O 2YHXA 1NGCA 4H0VB 4CD1A 2CGJA 4BR5A 5BRDA 4HTLA 1BA1A 3SLCA 2HOEA 4BRKA 5BPMA 3QBWA 3O5BA 5AQQA 4BROA 3LDPA 3A5MC 3BUZB 2FLOA 1NLVA 4BRHA 5FPEA 4FPBA 5ELZA 1C0FA 4MLHA 2QWOA 3DWLA 1NWKA 2GWJA 3A5OC 3FZMA 1GLDG 1NM1A 2EWSA 4BR4A 3EO3A 1J6ZA 4AM6A 1WUAA 1U2VB 4FPAA 1MA9B 3VGMA 4LC9B 4L3QA 1T44A 3L6QA 4H0TB 3C0BA 3VF4A 4PL7A 2QWLA 3DXMA 1HUXA 3QFUA 5AQJA 2CH5A 3D7EO 5E26A 3FZKA 1K8KB 3VEYA 4A61A 2HMPA 3RSEA 3HBTA 3M6GA 5KPRA 3WT0A 1BO5O 4O8KA 2ZF5O 4WQ4A 1ZBSA 3AAQA 2QXLA 3DXKA 4YDUA 1V4TA 1EQYA 4BGBA 3HI0A 4FWLA 2QWMA 2QWPA 3R6MA 3WXLA 5JMVA 1KAXA 1BOTO 5FPNA 4BR0A 2I7PA 3AY9A 4BG8A 4B1UB 1V4SA 4FOIA 4K41A 4WQ5A 3VEOA 5AQPA 3O6WA 1MWMA 4JN4A 4BRAA 3CJBA 2E2NA 1TYQA 5TKYA 2Q0RA 3OHRA 3H6EA 4GNIA 2QWRA 3UKUA 4K42A 4IZ9A 2P9LB 3VEWA 4A2AA 3A0IX 3ULEA 5AQVA 4RCHA 3U8XA 3CJ7A 3A5LC 5EX5A 2HF4A 2FSKA 5JICA 3VERA 1BUPA 2F9TA 1X3NA 4FWPA 4BG9A 3GDQA 4B1ZA 4CZGA 1MDUB 4MO5A 3VETA 1IG8A 3IMXA 4JD2B 1YXQA 4H5WA 4HWIA 3D2EB 3TU5A 3H3NO 2BTFA 3CQXA 4H0YB 1NMDA 5BPLA 1NBWA 3HTVA 4PKIA 1ATRA 1Z6RA 3LDLA 4I6MA 4H5VA 1TUYA 3QDKA 4B1YB 1GLEG 5KQ8A 1BG3A 3HM8A 1GLCG 2P9PB 3ZX0A 3W0LA 2P9SB 4B9QA 4BQZA 2YHYA 3H1QA 3GOIA 3MN7A 2PAVA 5E84A 4M63C 3H1VX 3MK6A 3D2FA 1TUUA 3ENOA 2YJFA 3MN6A 4IO8A 4XH4A 2GELA 4XH5A 3CHWA 3MCPA 3O1WA 4MO4A 1JCFA 2E2OA 4CJ7A 5AQMA 5ADXA 1YVNA 1E4FT 4DB3A 5F0XA 2VYPA 4Y0WA 1R59O 1QQMA 3EL2A 3O1BA 3QB0A 4CZLA 4EAHD 5BREA 2CH6A 2A5XA 5BR9A 3ZEUB 3R9PA 4IWVA 3ENHA 3ID8A 3F9MA 1DKGD 2Q97A 1BWFO 1GLAG 4NB4A 3VEXA 4DQ8A 1X3MA 2FXUA 4IJNA 4PL8A 4BRMA 2P9KA 5EVZA 1G99A 1SQKA 2CGLA 1T6DA 5AZIB 3LL3A 1NGIA 2IVPA 3WQTA 5AQRA 3SK3A 1BDGA 4M7YA 2P9UA 1T6CA 4F9OA 5AQNA 5KQDA 1CZAN 4XEIA 1MWKA 3CJAA 2GWKA 2E20A 3GE1A 4A62A 4BRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSXA 5GAHP 2Z1IA 1GOAA 1RILA 1B9FA 3I0RA 3VESA 1JJ2M 2UUBK 2LSNA 3K9JA 4W5RA 3RMAA 3UKRA 3O3HA 2QK9A 2UXDK 3S5TA 4PWDA 1YTAA 4I7FA 1ASVA 4CHYA 3EN9A 4O0IA 4DV3K 1NK8A 3VQEA 1D9DA 4DR7K 3FGUA 3QEVA 3O9SA 3VQBA 3VEZA 3NGIA 3H45C 1VSLA 3HJFA 4Y1CA 4W5OA 1RTJA 1U47A 4FO0A 4OPAA 4KTZA 1NGJA 1VHXA 3CJ9A 4DTPA 4CJ4A 1ZC6A 1QQCA 4C8NA 1NOZA 3M1FA 4PKHA 4YOWA 4LFAK 1XWLA 4CHNA 1BA0A 3FZFA 1UA0A 3L4QA 3I55N 1ZBHA 4K8XA 2O8FB 5H1SQ 1TKZA 4O4GA 1I3AA 3KKSA 4QS9A 4CJRA 4DV0K 1DGKN 5DM7L 4CFDA 3FR0A 5HROA 5BR8K 2E2PA 3ZETA 1D5AA 2O4GA 3UKUB 3HVRA 4HUFA 3S3NA 1XI1A 2VWKA 2F96A 2F4VK 3IG1A 1W97L 4BE2A 3TAFA 4RWTA 1EWRA 4DFKA 3V9XA 2GTDA 3U6FA 3AA2A 1KC8O 3SMPA 2NZTA 5CYQA 3CCUN 1RNHA 4CJ5A 1SL1A 4FWMA 4IBNA 2HHSA 5FPMA 4F3OA 4AILC 2YV0X 5A2QO 3BZCA 3U9DA 3SJJA 4CZJA 3HM9A 3DLEA 5CZ2A 3SJHA 4CF0A 2UUAK 1XQSC 4OKJA 3M8RA 3LP2A 3WXMB 4F4KA 4RW8A 4GV9A 5AZIA 1TL1A 2VGNA 2Q31A 3K5OA 4PUOA 1BCOA 3K9KA 1HQEA 3CJCA 5C24A 4CEFA 4F2SA 4HUGA 2HSTA 1NG9A 4HVJA 2G8VA 4C8LA 1Q18A 3LM2A 4AQYK 1HR0K 2RHKA 3MCAB 1BIZA 1YIJN 2E6LA 4FSVA 2XY7A 2ZJQL 1K8KA 3SQ0A 5HP1A 1D4XA 4CK3A 3L8BA 3CERA 4FM2A 4B8CA 3CCQN 3L0QA 3O08A 1N32K 4OJRA 4BR9A 2O8CB 4DCHA 4BC4A 1C0UA 1S9GA 1IBLK 3O4WA 4B9LA 3DLKA 2J4RA 1HKGA 1JLGA 2D4WA 1RGIA 3BEXA 4WF9L 4AHCA 4DWIA 3CFPA 3O9QA 2P5OA 4ISFA 4JKHA 1W7AA 5FROA 3OYEA 2F8TA 4DUYK 2P9LA 4U67L 3G25A 3KLEA 2WOMA 4ICLA 4Z0UA 2KFZA 1HJOA 3DYAA 3NCIA 2Q2RA 5AZJA 1QTMA 2E8AA 4KHYA 3M3ZA 1IJJA 2AP1A 4DTJA 3LPTA 3DLGA 1WBBA 1T3VA 2YNIA 5J1EA 2D0BA 4DKWA 3HPGA 1YJWN 3THYA 3OA9A 1D9FA 3RVCA 4JI8K 3QNNA 3Q7BA 3AAPA 3TTCA 1Z05A 3F73A 3TPQA 4KTWA 4YDUC 2QA4N 2GUPA 1ZYQA 2YNFA 2CGKA 3SAGA 1RTIA 4Z94A 1U6ZA 3UKRB 3AGRA 4CK1A 4WQ5C 3F5TA 4WFNL 4DS4A 4B3RK 2VWBA 4E7HA 1VRUA 4H5RA 3VQ6A 1XNQK 2FSNA 4J8FA 2YNHA 4FWKA 5ADXH 3KD5E 3CQYA 4CZHA 1VQLN 4IJAA 1FKPA 4ELTA 3DLBA 1HRHA 5AR0A 4CJKA 1NOYA 1LWFA 1VAZA 4FLTA 4B3MK 2Q0UA 5LMNK 2OANA 2DFEA 1VSFA 1EKEA 3ZT4A 4M3ZA 4B3SK 2IOCA 2E4LA 4QS8A 3IDHA 1ASWA 4MFBA 4BY9C 1DLOA 1VK0A 3VN5A 2F9WA 1G15A 3QLHA 2Z1JA 1YJ9N 4G9ZA 4OGEA 4H5TA 5AQTA 3VGKA 3ZETB 4FJ8A 2ITGA 4B3OA 1LWCA 4WE1A 4O5BA 1F21A 3KWGA 3VF2A 1GLBG 3F9KA 1EETA 4CEZA 4FVMA 1CXUA 2Q36A 3TI0A 1HKBA 1KQSM 3GL1A 4CHOA 1VQ6N 1S1XA 5M1OA 1VSJA 4FK2A 3VOVA 3H46O 4RW7A 4JRPA 4HTLA 2HOEA 4BRKA 4KTQA 4CFBA 1DTQA 3O5BA 4BROA 3LDPA 2G8UA 2WC9A 3BUZB 5KRTA 2X78A 4B3TK 2FLOA 1QE1A 2VG7A 2P5GA 3K59A 4FPBA 1HYSA 4C1NI 2GWJA 4AHUA 4AM6A 4E89A 5HL7L 3SQ1A 4CK2A 4F8RA 4M41A 3L6QA 3AVIA 4H0TB 1VSIA 3KK2A 5J2PA 3G0ZA 2OPRA 2QWLA 5GADP 3N4QA 3FZKA 2F7TA 3OS0A 3OVNA 1K8KB 3VEYA 4U7BA 4FJ5A 4QAGA 4A61A 2HMPA 3AVMA 1BO5O 4FJIA 4WQ4A 1ZBSA 3AAQA 2QXLA 3MXJA 1QVFM 3CCSN 3CMAN 2QWPA 3R6MA 3WXLA 4R5PA 1ITGA 4BR0A 3IRXA 3SAHA 4LSLA 1BI4B 2PYLA 5EU7A 4JN4A 4BRAA 2KFNA 1A5VA 2E2NA 3SAFA 3HL8A 4FXDA 4OLAA 3VTIA 4QCLA 3VQAA 4CJVA 4IFEA 4GMJB 4BDPA 3K57A 2P9LB 4A2AA 3MXIA 3K5NA 4DTSA 4Z4GA 5AQVA 4RCHA 3F2KA 3L2VA 4KI4A 1VSHA 3VQCA 4B1ZA 3VETA 4XJXA 3NE6A 4H5WA 3DLHA 3THYB 3TU5A 1NMDA 4M45A 4EP5A 3NF7A 1NBWA 4I6MA 3QDKA 2O8DB 3PIPL 1WSEA 4E7IA 5TKWA 1GLCG 4KRFA 3ZX0A 3GOIA 5E84A 4B9MA 3DI6A 4M63C 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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