3J8AA

Structure of the f-actin-tropomyosin complex
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
367
structure length
366
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/hydrolase
source organism Mus musculus
publication title Structure of the F-actin--tropomyosin complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords tropomyosin alpha-1
total genus 61
structure length 366
sequence length 367
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3j8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3j8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3j8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3j8aA04
3ZETA 3L4IA 3O8MA 3ZEUB 4I6MA 2CGKA 3SMPA 3ZX2A 1ZBSA 3D7EO 2D1KA 1K8KB 2P9NA 2D0OA 1E4GT 3C0BA 5BPMA 5F1XA 3VGLA 1U2VA 2CGJA 3FGUA 2EWSA 3CQXA 3D2FB 4BRGA 1KAYA 2UYTA 2IVNA 4K42A 3QDKA 1XUPO 3MN6A 3O1BA 4A62A 3A8YA 4MO4A 2YHWA 3QFUA 4XH1A 4DQ8A 1T6CA 5AQNA 4CZHA 4FWNA 2P9UB 4BRDA 1HLUA 3DJCA 3D2EB 4BR5A 3FFKB 4B1VA 5AQFA 3H46O 4H0YB 5CE3A 4JN4A 1NGEA 2HF4A 5AZIA 1HX1A 3U9DA 1BUPA 5AQYA 3WXIA 2W41A 4WQ4A 4BG9A 4CZEA 4CZIA 5E84A 3DXMB 4FWPA 2J4RA 5AQKA 2P9SB 5BRFA 1MWKA 4CD3A 2E20A 4JD2A 5AQIA 2I7PA 3C7NB 1X3NA 3VEVA 4CBWA 2NLXA 2BUPA 1NWKA 5ADXA 3U4LA 3WXLA 2H3GX 3EO3A 1ZC6A 4FWOA 5I9EB 2ASOA 2Q36A 2VCPA 1BOTO 1R59O 2OANA 2P9IA 4B1WB 5BPLA 3UKRA 3GOIA 3GE1A 1LOTB 1QQNA 4C23A 1Z6RA 5FPEA 4BR2A 2IIRA 5AQMA 4DHYA 2E1ZA 2QWLA 4BR4A 1GLLO 1ZXOA 2P9LA 1TYQB 2ASPA 4CZKA 1GLBG 3QICA 4BR7A 4XH5A 2DPNA 1EQYA 1BU6O 3F9MA 4RTFD 4F9OA 4BGAA 4EIAA 2D0PA 1NGDA 1D4XA 4IXCA 4WQ5A 3SJHA 3M3ZA 4WQ5C 1SQKA 1T44A 4FWLA 3R8EA 3CIPA 2P9PA 4FPAA 2V7YA 4Y0WA 3VEXA 4CD1A 4DB3A 4GNIA 4ISFA 3BF3A 3LM2A 2CH5A 4CBUA 4H0XB 5KPZA 5AQHA 3RSEA 4BG8A 1ESVA 3ENHA 3JS6A 3L6QA 2E2QA 1IG8A 5AQUA 3H1QA 5BN8A 4BC3A 5BRDA 2ZWHA 2KHOA 4PKIA 2Q31A 4BQZA 5EX5A 5FPNA 3W0LA 3H3NO 3ZETB 2QXLA 3KHYA 4I6MB 3BP8A 4BRLA 5AZJA 2P9NB 2ZGZA 4CBXA 1IJJA 3FZKA 3CETA 1NGGA 2QWPA 2E88A 2FSNA 3HSCA 4A61A 3QMLA 1P8ZA 1U2VB 2PBDA 1WUAA 2P9KB 3IUCA 1WOQA 4BRMA 4AM7A 1G99A 4BRNA 4BVPA 4FOIA 1J6ZA 3SK3A 3MN7A 3VESA 2Q97A 5AR0A 4H0VB 4EAHD 1HUXA 3CI5A 3ZX3A 1S3XA 2AA4A 3EL2A 2FSJA 3MMVA 4FPBA 3IFRA 3O08A 4CZLA 3AAQA 2A6AA 3IMXA 5AZIB 1DGKN 5LJVA 2E8AA 3CJAA 4EHTA 2I7NA 4IJAA 3WT0A 4E1JA 1TUUA 1CZAN 1YUWA 1BG3A 3CQYA 3BEXA 3HBTA 4H0TB 3LDLA 1GLJO 1NBWA 2QWRA 3FZMA 3MN5A 1QQOA 4FWKA 3QFPA 3AY9A 1GLAG 1NGIA 4JD2B 5KQDA 3VF4A 2GUPA 4ISEA 3WQUA 1BWFO 2YJFA 4B1UB 3AARA 4H5RA 3I8BA 3ZX0A 4H5WA 3H1VX 1BA1A 1JCGA 3FZFA 2P9IB 1T6DA 3UKRB 3IDHA 2ZGYA 3CJ1A 4M7YA 4GY2B 2W40A 5LY3A 5B8HA 4BC5A 5AFUA 2P9LB 2E2NA 3ID8A 5JLHA 3L0QA 3H45C 4PKGA 1U6ZA 3UKUA 3EN9A 1Q18A 3HI0A 2QM1A 4BR9A 3O6WA 2A40A 3A0IX 4FO0A 5BRHA 3CERA 3DXMA 3VERA 4CZFA 4MLHA 4B1XB 3WXJA 3CHWA 4H03B 3KVGA 2D4WA 3ULEB 4FOEA 4WYBA 1HPMA 3C7NA 1Z05A 3VEYA 4FWQA 2P9PB 4KBOA 4M7XA 5AQZA 3VENA 4CJ7A 4FSVA 1YVNA 2YHYA 1DEJA 5AQOA 4JNEA 4XEIA 1NM1A 4A2BA 4QS7A 2A41A 5FPDA 3RSEB 4FL9A 3CJBA 2VYPA 4BRHA 3G25A 1SAZA 5KPRA 1KXPA 1V4SA 1KAZA 1TUYA 3MK6A 2HOEA 2Q0RA 1RDWX 4H5VA 5F2RA 1X9JA 2NZTA 2GWJA 4JHDA 3TU5A 2BTFA 5AZJB 3DXKA 3VF6A 2AP1A 3WEEB 4BRCA 1QZ5A 4BRKA 3FZLA 4H5TA 3ATUA 5AFUH 3FLCO 3UB5A 3A5LC 1QQMA 3MCPA 4NO7A 2QWMA 3I33A 4BC2A 3R6MA 3VOVA 4IO8A 5TKYA 5JICA 4RCHA 5AQPA 4BGBA 2E1YA 3W3DA 2ZF5O 5AQQA 5EXWA 2F9TA 3DAWA 1MWMA 4IZ9A 4PL8A 3LDQA 4NB4A 1OKJA 3VEZA 2QWNA 4CI6A 5BN9A 5KQ8A 1S22A 3EKSA 3LDPA 2YHXA 5AQLA 4YDUC 1YAGA 1C0GA 1NGJA 5AQSA 4FWRA 1X3MA 2A3ZA 5AQWA 2ASMA 1JCFA 3GL1A 4QS8A 2E2OA 2Q0UA 2E2PA 1QHAA 3B8AX 4JAXA 4BC4A 4EFHA 3HM8A 1HKGA 4BRQA 1QZ6A 1E4FT 3U8XA 3ZEUA 1BO5O 2P9KA 2YI1A 1GLFO 1NGBA 1K8KA 4B1YB 3A5OC 3VEOA 5AQXA 3TPQA 4DCHA 3LDOA 3D2FA 5AQVA 2FXUA 2HMPA 3HZ6A 1ATRA 4H5NA 4FWSA 2GEMA 3VGMA 2FSKA 4B9QA 1H1VA 1JCEA 2YJEA 3GBTA 1C0FA 3P4IA 3O80A 4BROA 4K25A 4FWMA 2GELA 1MA9B 5AQGA 2P9UA 5EVZA 2Q2RA 3LDNA 4QS9A 3VETA 3J8AA 3UKUB 2QWQA 3D2EA 4L3QA 1KAXA 2QW9A 4MLEA 2CH6A 2F9WA 4O8KA 4K43A 4WQ4C 3A5NC 1LCUA 1SZ2A 2CGLA 4AM6A 1ATNA 2A42A 4BRPA 2QWOA 3CJ9A 5BPNA 5JMVA 3EKUA 1YXQA 4B1ZA 1RGIA 3VEWA 1BA0A 2P9SA 2IVOA 5EOYA 4BRFA 4O5FA 1V4TA 3WQTA 1Y64A 4RWTA 4CZGA 3LL3A 4K41A 2IVPA 4IWVA 5AQJA 3A5MC 3R9PA 3MDQA 5BR9A 3QBWA 3GG4A 2WUSA 3ATVA 2V52B 3O1WA 2HF3A 3OHRA 2FF3B 1MDUB 1GLDG 2V51B 3FE1A 2ITMA 4HWIA 2A5XA 3JXUA 2NRHA 2PAVA 2V7ZA 3CJCA 3EZWA 3UE5A 4CZJA 4LC9B 4JHDB 5AQTA 1TYQA 4J8FA 3DXKB 3KZBA 4BR0A 3O5BA 1DKGD 1ATSA 3ULEA 2FF6A 3U9ZA 1NMDA 3SMSA 5JLFA 2YCHA 5LJWA 4H0OA 4XH4A 4BVOA 1NGHA 3H3OB 3BF1A 1GLEG 1XC3A 3WXKA 3AAPA 1NGFA 5FPMA 1GLCG 4BQLA 3M1FA 4H0PA 3ENOA 2GTDA 1HKBA 2VWBA 2GWKA 5EY4A 4BRAA 3LM9A 5KPTA 5BREA 3DWLA 4BRIA 4EHUA 3SLCA 4A2AA 4PKHA 5ADXH 2Q1NA 3BUZB 3QB0A 1HJOA 3WUHA 3HTVA 3O4WA 4HTLA 4PL7A 3CJ7A 2FLOA 3M6GA 4ISGA 3S41A 5AQRA 1XQSC 4M63C 5ELZA 3VF2A 3FZHA 5E26A 1RFQA 3MN9A 4Z94A 5F0XA 4MO5A 1NGAA 1NLVA 3FR0A 3H6EA 4IJNA 4YDUA 4BREA 4CZMA 3VGKA 1HKCA 3QBXA 1NGCA 3WEEA 3GDQA 3VPZA 1BDGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WAJA 3MX5A 4I6MA 3LPUA 1E3MA 4AHTA 3TAGA 4BE7B 3QO9A 1UA0A 3TARA 3VGLA 3FGUA 3RR7A 2HHQA 3CC4N 1BGXT 4K42A 1XUPO 3THYB 3VQDA 2IGIA 3MN6A 4DV1K 5SZTA 3NVMA 4RW4A 4F3OA 4CIEA 4DQ8A 5SWMA 1RILA 1BCMA 4FWNA 2P9UB 1W9HA 2VGNA 1HLUA 4R5PA 2EHGA 3FFKB 3H46O 4H0YB 1I39A 5AZIA 3CMEN 1HX1A 3U9DA 3KJVA 4CEFA 1TKTA 3A2FA 3DXMB 1L3TA 3HL8A 2O8FB 4FWPA 3KLEA 2P9SB 3L3UA 5BRFA 1MWKA 4N5SA 3NH1A 4YFUA 3VEVA 4IEIA 2NLXA 2BUPA 3MECA 4E1MA 2F8TA 5GINA 1Q9XA 1XHZA 3ITHA 3EO3A 1WSHA 4OPKA 4KB1A 1BOTO 4JI0K 3C65A 1YI2N 1LOTB 1QQNA 4C23A 1KTQA 1XI1A 5FPEA 2IIRA 5AQMA 2ZE2A 2QWLA 4BR4A 5HRNA 4B3OA 1ZXOA 4KTZA 1EWQA 3P31A 5M1OA 1GLBG 3QICA 1JL1A 3SI6A 2DPNA 1BU6O 3T7ZA 3CC2N 1RBVA 4CEDA 1NGDA 5A2QO 4LD0A 1VRTA 3J7YP 3U6FA 4FWLA 3R8EA 4Y0WA 2P9PA 1WNSA 3IRXA 1NK4A 5KGWA 4IOCL 4DB3A 1QHTA 3Q7CA 3G4SN 4JI4K 2YHAA 1Q81O 3O9UA 5MLCQ 2Q3SA 3KK2A 1RDAA 4IG0A 1ESVA 3ENHA 1VSJA 1NK5A 2G8FA 4CHZA 1VRUA 4A59A 2HBJA 3I0SA 1NK6A 3T1YK 4PKIA 2Q31A 5EX5A 3H3NO 2OPPA 3L2WA 1SS6A 3MWTA 2HBKA 4F3TA 2HHWA 3BP8A 1S9GA 1J53A 2HHXA 4HUGA 1IJJA 3WXMB 3FZKA 2AJQA 2E88A 4A61A 3PLAA 3BZKA 3HPHA 4DTPA 1P8ZA 1U2VB 1WUAA 3K9JA 1EXQA 4R79A 4DF8A 1S1VA 1SV5A 1W2BM 4CJKA 3P83D 3SK3A 1QE1A 3SUOA 1JLAA 4BDPA 1S1TA 1Q86O 4H0VB 3E01A 2C1IA 1I94K 1VK0A 3OYBA 4FJGA 4FJ5A 4PY5A 1VAZA 4FPBA 3IFRA 3WNGA 3AAQA 2OYQA 3OYDA 2UUCK 5LJVA 2E8AA 4EHTA 1IBMK 3V9SA 4B3TK 2GUIA 1L3VA 4DFJA 3DLBA 1TUUA 1YUWA 2WFBA 3LDLA 1TVRA 2JLEA 4FWKA 1GLAG 3SAFA 4TSXA 2GUPA 3OJUA 2KW4A 1QSYA 2OPQA 2QTDA 3V1RA 3AARA 4H5RA 3ZX0A 4DWIA 3IS9A 1C1AA 3ZSYA 4C1NI 2YNIA 1JCGA 3LWMA 1T6DA 5C2FA 3LWLA 4CFBA 3CJ1A 4BWMA 3SV3A 1EP4A 1K73O 3TABA 3EE9A 3AO2A 1TGOA 1YHQN 5M1FA 1U6ZA 4LH4A 3AVCA 2O8EA 1XWLA 3O3GA 5BRHA 3CERA 3DXMA 3VERA 2O8FA 4U67L 3HVRA 4CIFA 4M3XA 3ULEB 2D4WA 3H08A 3LAMA 4KBOA 3MEEA 4CGHA 3CG7A 2HVIA 1YVNA 2YHYA 1BCOA 3L2RA 4JNEA 1YVUA 4QS7A 4JKGA 3CYGA 2A41A 5FPDA 3T1AA 2B4JA 1QTMA 4W5TA 4DV3K 5HRPA 2W00A 1HNXK 3G25A 1RTHA 1YTAA 3ZT2A 3AVBA 3ZT0A 3MK6A 4KH5A 5C24A 5HL7L 1RDWX 3ULDA 3HVTA 4DV4K 4RW6A 1X9JA 2XY7A 2E4LA 4I7FA 2BTFA 3DXKA 3KLGA 3AVHA 4OO1J 1DTTA 2YKNA 2LSNA 2W42A 3SCXA 3VA3A 3VTIA 1QQMA 1RT5A 3K58A 2D0AA 3LALA 3MCPA 4NLCA 3I33A 4NO7A 3D6RA 2FBXA 2HSTA 5AQPA 2ZF5O 5AQQA 5EXWA 2F9TA 1N8RO 2WC9A 3V1QA 4BE2A 4PL8A 4NCGA 1J54A 2QWNA 3TANA 2KTQA 4O0IA 1U45A 4KRFA 1RTDA 3M8SA 4KHSA 3SQ4A 3CM6A 3SQ0A 3HT3A 3PO4A 1UAXA 5CZ1A 3ZLJA 1KFDA 1Q8IA 4KHNA 2DFFA 1EETA 4DR7K 2P5GA 2E2PA 4JAXA 1WSEA 1QZ6A 1E4FT 3ZEUA 2JGUA 4LF5K 1NK0A 4IEEA 1YJ9N 4FVMA 2FBYA 2KFNA 3E9LA 2DFHA 4B1YB 2ETJA 4AHVA 2QKBA 4RW7A 1RT6A 3SAGA 4F8RA 3D2FA 2FXUA 2HMPA 1ZYQA 4DTJA 4FWSA 3VGMA 1YJNN 3DLRA 1ASWA 1BISA 4NLBA 2ZJQL 2X78A 4JKFA 4OKJA 2WONA 1TK5A 3BY5A 4Z4IA 1VQ7N 2Q2RA 1LV5A 1TKDA 4L3QA 3I0RA 4MLEA 2CH6A 3THXA 2VWKA 4KO0A 3VQ4A 4K43A 4CHQA 1LCUA 1SZ2A 1NK7A 3R1XA 1ATNA 2A42A 2HBLA 3TAEA 2YX6A 4DR4K 3VEWA 4CE9A 1A5VA 4BRFA 3P1GA 4J2EA 4B9VA 4XJXA 3LL3A 2IVPA 1HNIA 3HXMA 3A5MC 4J2AA 3OYNA 3GG4A 2WUSA 3VN5A 3OS2A 4EP4A 2V52B 3RMAA 1NNEA 2HBMA 2FF3B 4CJ4A 4CJUA 1MDUB 2V51B 4FLZA 2RPIA 2NRHA 2QEXN 2PAVA 4W5RA 3CCMN 1Q82O 1TV6A 2E6MA 3OYCA 4X62K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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