3J8AA

Structure of the f-actin-tropomyosin complex
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
367
structure length
366
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/hydrolase
molecule keywords tropomyosin alpha-1
publication title Structure of the F-actin--tropomyosin complex.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 61
structure length 366
sequence length 367
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3j8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3j8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3j8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3j8aA04
4CZHA 2E1ZA 4JNEA 5AQYA 1SZ2A 1K8KA 4H5RA 1HKCA 5KQDA 4BRAA 3AAQA 4H0YB 2VCPA 1C0FA 4J8FA 2D0OA 5AQHA 3ATUA 2FSKA 1ZXOA 3CJCA 4PKIA 5B8HA 1IG8A 5EX5A 4CD3A 1YUWA 5FPMA 3ID8A 5E84A 3O80A 2GUPA 2GWKA 2YHWA 3WXKA 4A62A 1ATRA 5KPZA 5EXWA 2QWQA 2GELA 2P9PB 4WQ4A 1BWFO 2V7ZA 4BRDA 3UKUB 5FPDA 5AQFA 3HZ6A 3VOVA 3LM9A 4H5NA 3ULEA 3BF1A 3SMSA 2QWMA 1LOTB 4BRFA 3SMPA 3CQXA 5AQRA 4GNIA 3L4IA 2AP1A 3FZKA 1XC3A 4IJNA 4BC4A 3OHRA 5CE3A 5AQPA 2E8AA 4C23A 5JMVA 3LDQA 3WUHA 2V51B 2WUSA 4XH5A 4IXCA 3KZBA 4CZIA 1HJOA 3WEEA 2QWOA 2YCHA 2IVPA 1K8KB 3MK6A 3QMLA 4FWKA 4HWIA 4Y0WA 3L0QA 5KPTA 4FL9A 5AQKA 5LJWA 2GTDA 4KBOA 3HTVA 2PBDA 1JCEA 3ENOA 4RWTA 1X3NA 1NGCA 2ZGZA 1DKGD 2ZF5O 3BF3A 3ZEUA 3S41A 1NGAA 3D2EA 4H5VA 4WQ5C 2UYTA 3AY9A 2D1KA 3J8AA 1DEJA 2I7PA 4BR9A 1BA1A 4IO8A 3R6MA 4IWVA 4FWMA 4L3QA 1BG3A 4FPBA 2IVOA 1NGFA 3DJCA 2ASOA 3WXLA 4FOIA 3VPZA 4MO5A 3FGUA 3GDQA 3H3OB 3DXMA 1QQMA 5AZIA 2CGKA 5JICA 2A41A 5FPEA 2NRHA 2E88A 2A42A 5LY3A 4CZKA 4BC5A 3BUZB 1GLLO 2HF3A 2P9KA 3GL1A 4QS8A 4BRCA 2F9WA 3A5OC 4DCHA 1ESVA 4BR5A 5FPNA 1NMDA 3F9MA 1U2VA 5BRHA 1P8ZA 5KQ8A 3H1VX 3KHYA 1S3XA 1T6DA 3GG4A 2AA4A 4BR2A 1KXPA 2E2PA 3ZX0A 3TU5A 1E4GT 3WEEB 1TYQB 3LDNA 1GLCG 5JLHA 5AR0A 4CBUA 2BUPA 4H5TA 1BU6O 3I8BA 4MO4A 2FF3B 3A5NC 1NWKA 4GY2B 4CZMA 1MDUB 5AZJB 4BREA 4MLHA 2E2QA 3QBWA 2ZWHA 5BRFA 3EKSA 5BPMA 4QS9A 3ZEUB 3D2EB 1GLBG 3L6QA 1JCFA 1KAZA 3BEXA 3H6EA 4FWQA 5EY4A 4BQLA 2DPNA 3RSEA 4BQZA 2E1YA 2QWPA 3QBXA 2QM1A 3VF4A 4LC9B 5AQIA 1HX1A 4BRPA 2IVNA 3CIPA 5AQJA 2NLXA 2Q31A 3DXMB 4I6MA 4PKHA 5AZIB 3CJ7A 4CZLA 1ATSA 4MLEA 1RGIA 3QFPA 3IDHA 2P9UA 3I33A 3U8XA 3P4IA 2P9KB 3LDLA 5AQVA 3MN6A 1R59O 2ASPA 3MDQA 2QWRA 1U2VB 3A0IX 4B1XB 3R9PA 2OANA 3JS6A 1GLAG 4FO0A 1OKJA 1V4TA 1E4FT 1NGHA 1NGGA 1T6CA 4FWSA 2P9IB 2FXUA 1ATNA 3D2FA 4JHDA 4O5FA 3ZETB 2E20A 1YXQA 2D4WA 3UB5A 1HKBA 4FSVA 5ADXA 2A3ZA 2IIRA 4M7YA 1QQOA 3IMXA 3WQTA 4BRNA 3EZWA 3TPQA 5BPNA 4RTFD 2VWBA 3ZX2A 1WOQA 2P9LA 3G25A 4BRGA 3KVGA 5F2RA 4FWPA 2E2OA 3ZX3A 1GLJO 3VGMA 2ZGYA 1X9JA 4YDUC 4F9OA 2YJEA 4H0OA 1RFQA 3M1FA 3QFUA 4WQ5A 4BG9A 2A6AA 2QWNA 3RSEB 4CI6A 2FSNA 1HPMA 4JD2A 3WXJA 2ITMA 3VF6A 3LDOA 4BC2A 1TUUA 4ISEA 5E26A 1QQNA 3U9ZA 4CD1A 1NGIA 3FZHA 3IUCA 2GWJA 4BRKA 1ZC6A 3O4WA 3FFKB 3BP8A 5LJVA 3IFRA 1QZ5A 2P9UB 4FWRA 3DAWA 3MMVA 2W40A 1KAYA 4A2AA 5AQUA 5TKYA 5ADXH 4CJ7A 4BRLA 3ULEB 4FWOA 4EIAA 3VGKA 2VYPA 2E2NA 3EKUA 2A5XA 2ASMA 4M7XA 2CH5A 3VGLA 4JN4A 3WXIA 5AQXA 4A61A 4CZJA 5KPRA 2P9NA 3GE1A 2YI1A 2D0PA 2YJFA 4BRIA 3R8EA 4XH4A 3D2FB 5AFUH 3WQUA 4H0TB 4CZGA 5BRDA 4FWLA 3U9DA 4PKGA 3CJAA 3QICA 3CETA 2HOEA 5EVZA 2HMPA 3HBTA 4BC3A 3VESA 2P9LB 4H0PA 1HKGA 3B8AX 1XQSC 1SQKA 3H45C 3CI5A 4HTLA 3GBTA 3H46O 4BVPA 1Z6RA 1JCGA 3C7NA 4H03B 1QHAA 4JD2B 2FLOA 4B1UB 3UKRA 2QXLA 4CBXA 4K43A 3LM2A 5I9EB 1RDWX 3M3ZA 2V7YA 4B9QA 3VEOA 3MN5A 3UE5A 1QZ6A 2YHXA 4BG8A 2Q0RA 1GLEG 3FE1A 5AQGA 4CBWA 3HM8A 1D4XA 3FLCO 3M6GA 4B1YB 2Q97A 3A8YA 3CERA 2CGLA 4Z94A 2P9NB 3JXUA 4BRQA 5ELZA 3MCPA 2P9SA 3LL3A 3O1BA 3A5MC 3FR0A 4K41A 3VEVA 4H5WA 2F9TA 2Q2RA 4CZFA 3ENHA 4A2BA 4QS7A 2GEMA 3H1QA 2A40A 3DXKA 2V52B 5AQQA 4JAXA 4EHTA 5BREA 4BVOA 3MN9A 1NGEA 4BR0A 4FPAA 3QB0A 1MWMA 1Z05A 4YDUA 3SJHA 3C7NB 3SLCA 4RCHA 4WQ4C 3VEWA 4IZ9A 4EAHD 4BR4A 4BGBA 2I7NA 2CGJA 4K42A 4EFHA 3D7EO 1U6ZA 5BPLA 3CJBA 3UKRB 5AQLA 4H0XB 5BR9A 2QWLA 3O5BA 3GOIA 3EO3A 3VERA 1GLFO 1YVNA 3CQYA 5AQSA 1MWKA 4B1VA 1NBWA 4E1JA 5AFUA 1Y64A 3W3DA 2PAVA 3VENA 1WUAA 1H1VA 1V4SA 2YHYA 2EWSA 4PL8A 2Q1NA 2Q36A 4BROA 1TUYA 3C0BA 4DHYA 1TYQA 2J4RA 4EHUA 4I6MB 1KAXA 1GLDG 2Q0UA 4DB3A 5EOYA 3U4LA 3VEXA 3O8MA 4NO7A 1NLVA 3EL2A 4H0VB 1G99A 3QDKA 1CZAN 4B1ZA 5AZJA 2P9SB 4NB4A 3VETA 1DGKN 5AQTA 5AQOA 5BN9A 3SK3A 2W41A 3FZMA 3HSCA 4B1WB 2NZTA 1LCUA 2FF6A 3DXKB 1C0GA 4JHDB 1EQYA 1NGDA 4AM7A 2KHOA 5BN8A 4AM6A 4ISGA 4ISFA 3CJ9A 4XEIA 1BA0A 3CJ1A 1HUXA 3VEZA 4FWNA 3DWLA 3FZFA 4M63C 2QW9A 3O6WA 3HI0A 1J6ZA 3EN9A 1BDGA 4CZEA 1XUPO 1YAGA 3AARA 2BTFA 5F1XA 1T44A 2P9PA 4IJAA 3AAPA 4FOEA 3UKUA 4BRMA 1X3MA 4PL7A 1Q18A 4XH1A 1NGBA 5AQWA 4BR7A 1NGJA 3ATVA 5JLFA 5F0XA 2H3GX 3O1WA 1S22A 3W0LA 3H3NO 2HF4A 1BO5O 4WYBA 3LDPA 4O8KA 1MA9B 4DQ8A 3MN7A 3VEYA 4K25A 3VF2A 3FZLA 1SAZA 5AQZA 5AQMA 2P9IA 1HLUA 2CH6A 3ZETA 3A5LC 2FSJA 1BOTO 3WT0A 3O08A 4BGAA 1ZBSA 1NM1A 1BUPA 1IJJA 5AQNA 4BRHA 3CHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3R3LA 1K8KA 1HKCA 4BRAA 2XRIA 4BE0A 3HT3A 4K0KK 4H0YB 2VCPA 4WE1A 2JWKA 3SUPA 3LALA 4FJKA 2XHBA 1ZXOA 4IDKA 3SUNA 4K8ZA 3QINA 4FJ7A 1TGOA 1A5VA 1WAJA 2YNGA 4KPYA 3CFPA 5FPMA 1SL1A 4K8XA 4C1NK 2YHWA 3HJFA 1M90O 5KPZA 1HJRA 1J9AA 2GELA 3RRGA 3B6PA 2IGIA 2V7ZA 3MWPA 1NK8A 3HVTA 3OYJA 1ZBIA 4JYAK 1HYSA 4CECA 4DUYK 2OZSA 4RW9A 4EZ6A 4CIGA 3L4IA 3MEGA 3M8RA 3ZYYX 4B9VA 4O0IA 2E8AA 1JLEA 2NRXA 4FVMA 3NGIA 2HHXA 3WUHA 2V51B 4CF1A 4DS4A 4J2BA 2O8BB 3KZBA 4EP4A 3LPUA 2IVPA 4FWKA 3HP6A 1C6VA 3DLLL 4Y0WA 2OZMA 5I3UA 2GTDA 5HRNA 4DKWA 4N5SA 4DSJA 3RMBA 1JCEA 4A5BA 3ENOA 1K8AO 3C6TA 1X3NA 1EP4A 4FJJA 1LWCA 1NGAA 3KLHA 3KTQA 4PQUA 3K5LA 5LL6Z 1DEJA 4JKHA 1C1CA 2RHKA 2P1JA 4AF1A 4CJEA 4LF9K 5DM6L 2ZJPL 3SCXA 4NYNA 3RR7A 4KB1A 4MO5A 3FGUA 4FLYA 4IG0A 3H3OB 3JAMO 3DXMA 2A41A 2NRWA 1JL1A 3CM5A 4OPJA 3AO2A 4DCHA 3EEQA 1EO1A 4E3SA 2QEXN 3KIOA 4HUFA 3P39A 3DLBA 1SKSA 1GLCG 1T05A 1VQON 5M1NA 2BUPA 2UXCK 3I8BA 3QEPA 1NWKA 4BE2A 4R79A 3THXB 3WNFA 1B9FA 1T03A 4KI6A 1MDUB 1HR0K 4AHSA 4BREA 3CYGA 2YX6A 4CJQA 1NK0A 4DTXA 1QVGM 1RTDA 4DQIA 1KLMA 1VSFA 4QS9A 3D2EB 4CIEA 3NVKA 3L6QA 4E7KA 4JK9A 5HBMA 2DPNA 4B8AB 3S5TA 2QM1A 4LC9B 3ZSWA 4F2RA 4I6MA 3CCVN 1YTUA 5AZIB 3AVIA 4ID5A 2XY6A 2Z1JA 4MLEA 2HBMA 4NLCA 5GIPA 4BE1A 3NAEA 4CGFA 4BY9C 4EP5A 3TTDA 3EE9A 1OVYA 2QWRA 1U2VB 3A0IX 4B1XB 4CIFA 2G8WA 1S5JA 1RTJA 4KHSA 3UIQA 1GLAG 2Q3SA 2NNWA 4FWSA 1EWQA 3D2FA 3TWHA 3ZETB 3J7AP 3NBPA 1YXQA 4FSVA 2A3ZA 3IMXA 3WQTA 3OYGA 4DSEA 1U04A 5KTQA 4FWPA 3VQ4A 4ILJA 1J5EK 4B3SK 4IOXA 1XI1A 4NCBA 3NF6A 3NF8A 4MQ3A 4DSFA 1RFQA 1UOCA 3DI6A 4BG9A 2A6AA 3RSEB 2ITGA 4YHHK 3HSTB 2KTQA 4ELTA 3ALYA 3ZSVA 3VF6A 3LDOA 3OS0A 4BC2A 4ISEA 3U9ZA 3CFRA 4CD1A 3AO4A 1S9GA 3FZHA 3IUCA 3LDSA 1ZC6A 3O4WA 3FFKB 3BP8A 2AJQA 3SUQA 3MMVA 2W40A 2QI2A 5ADXH 2ETJA 4CJ7A 3B6OA 2HSTA 3F2KA 4EIAA 1NKBA 3MWTA 4WFAL 3CCLN 2A5XA 1SUQA 2ASMA 2CH5A 3VGLA 1VRTA 2X6NA 5AQXA 3GE1A 2YI1A 4B08A 3QNOA 3HOSA 5BRDA 4FWLA 4KREA 3CJAA 4BWJA 1JJ2M 3HBTA 2O8CA 4Q0BA 2P9LB 3I0SA 4KHWA 4J2AA 3CI5A 3VQEA 5C2DA 2G8FA 3K9KA 1LAWA 1N33K 4FM2A 4DR2K 2ZJRL 3THWA 4DSIA 3BDPA 4W5OA 1JCGA 2RN2A 4Y1DA 3AA3A 1NK6A 3TANA 1J54A 4H8KA 4CBXA 4K43A 4M3UA 1HNIA 5K14A 3IS9A 2P5GA 3MN5A 1IH7A 2YHXA 2Q0RA 1VHXA 3K2PA 4MFBA 4LF4K 3QLHA 4CJUA 4M3WA 1X9SA 1HYZA 3TI0A 4DS5A 2D0BA 1L5UA 1O13A 4W5RA 5HRRA 4FYDA 1JLAA 3DOLA 4OVLA 1S1WA 1SV5A 2F9TA 4QS7A 3H1QA 3BGRA 3OYIA 3PLAA 4BVOA 3OW2M 3G0ZA 1S1XA 2O8DB 4DG1A 1IBLK 3Q7BA 1U48A 1MWMA 2ZE2A 3MEDA 2YV0X 3T7ZA 3VEWA 4C1NI 3SAHA 4BR4A 3OYCA 4BGBA 4CJ3A 4FLWA 4JKEA 3TAEA 3OYHA 4E1JA 1GLFO 4JRQA 4B1VA 5CR4A 3J81O 1ZBHA 1H1VA 2GUIA 1NMNA 2Q36A 2A1RA 5M1PA 4JI0K 3P31A 1GLDG 2Q0UA 4DB3A 3D6RA 3PIPL 1Q9XA 3C94A 4OKJA 3VEXA 3O8MA 2JWLA 2OCEA 2P5OA 3QDKA 4DV0K 4B1ZA 4ICLA 5AQTA 3L2RA 5AQOA 5M1KA 4FVUA 3G6EN 1IV0A 2Z1IA 4N41A 3MX5A 1LWEA 3LZJA 4NCAA 1C0GA 1NGDA 1UAXA 1U4BA 4E0DA 4AM6A 2D0AA 3CJ9A 4YOYA 1BA0A 2HVIA 1KSPA 2PZSA 3LP1A 4C8KA 3VEZA 3FZFA 2QW9A 1RT7A 4M3RA 1BDGA 4CZEA 1XUPO 4F4KA 5F1XA 2P9PA 2HBLA 3UKUA 5GIOA 4BRMA 1RBUA 4PL7A 1QTMA 1RILA 5F0XA 4HCCA 4GMJB 1S22A 3W0LA 1WSJA 2HF4A 1BO5O 3V1OA 4O8KA 4GV3A 3E01A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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