3J8AA

Structure of the f-actin-tropomyosin complex
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
367
structure length
366
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords tropomyosin alpha-1
molecule tags Structural protein/hydrolase
source organism Mus musculus
publication title Structure of the F-actin--tropomyosin complex.
pubmed doi rcsb
total genus 61
structure length 366
sequence length 367
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3j8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3j8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3j8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3j8aA04
4M7XA 4PKIA 3CJAA 4CZMA 1YVNA 2NRHA 3WXJA 1U6ZA 2FLOA 2Q0UA 1BU6O 3CHWA 4MLEA 2AA4A 5BRFA 5KQ8A 2UYTA 4PL7A 5CE3A 3EN9A 3JXUA 3R9PA 1NGCA 3IFRA 4XH5A 2FXUA 1HLUA 3WEEB 3M3ZA 3VEVA 2A5XA 1MDUB 3UKUB 4CZKA 1CZAN 4IWVA 5F1XA 4NO7A 4BVPA 3QMLA 4Y0WA 3ZEUB 5KPTA 4YDUC 3W0LA 2P9KA 2IIRA 3CI5A 4ISFA 2QM1A 2A40A 3MCPA 2IVNA 1BO5O 3EKSA 3TPQA 4BR2A 3KZBA 1GLEG 4H5NA 3LL3A 5JLHA 4HTLA 3R6MA 2YJEA 2ZWHA 5EOYA 5TKYA 3C7NA 3HM8A 4PL8A 1T6DA 1NLVA 4O5FA 3SJHA 5AZJB 3VPZA 2QWNA 3AY9A 3VESA 4B1ZA 4BRMA 5BPLA 2Q36A 3CJ7A 3GBTA 4BRGA 4I6MB 4BC4A 5BN9A 1SAZA 3IUCA 4MO5A 2P9SB 4C23A 2D1KA 4BQLA 4FWOA 4FWQA 4H0TB 3ATUA 1SQKA 4O8KA 1KAZA 3RSEB 5FPNA 2DPNA 3FZHA 4DCHA 4CZIA 2FSJA 2J4RA 2Q1NA 4FWKA 2P9IB 4H0OA 3CQXA 1U2VB 3WUHA 4BC5A 4CI6A 1NWKA 1DKGD 3LDOA 4BR5A 2E8AA 5FPEA 2YCHA 4PKHA 2BUPA 4BRCA 3I33A 4K43A 1GLDG 1BA0A 4CD3A 2KHOA 2IVPA 2YI1A 3LM9A 3FE1A 2A3ZA 3MDQA 2V52B 2GTDA 3A8YA 1YUWA 4K25A 4L3QA 3ZETA 1NGHA 4CBUA 5AQRA 5AQQA 1NBWA 3VEWA 1RFQA 2D4WA 2YHWA 3UKRB 4B9QA 5KPRA 3I8BA 3B8AX 4J8FA 2ASOA 1NGDA 4H5VA 1QZ5A 3MN6A 2VCPA 4AM6A 2YJFA 5AQXA 1TUUA 3O8MA 3VEZA 3GDQA 1QQMA 4BRNA 4BRQA 2ASPA 3VENA 3EKUA 3D7EO 4NB4A 2QWMA 3VEYA 2ASMA 3VGMA 1IJJA 4FWNA 4WQ5C 4JD2B 1EQYA 3UKRA 3WEEA 5KQDA 4H0XB 3R8EA 1LCUA 3VETA 5AR0A 4H0PA 5BN8A 1WOQA 4HWIA 4BRHA 2A41A 4JN4A 2QWOA 4H0YB 3WT0A 1BA1A 1C0GA 4IJNA 1X9JA 2E20A 2ITMA 1NGIA 4GNIA 2ZGYA 3KHYA 5EX5A 1IG8A 4WQ5A 1Z05A 5AFUH 3EO3A 3IDHA 3D2EB 2P9IA 2P9LB 2P9PA 3DJCA 5BREA 4ISEA 2P9UB 3BP8A 5E84A 5AQMA 5AQUA 5AQSA 2YHXA 4CZFA 1SZ2A 1H1VA 3CQYA 3AARA 4FWLA 2A6AA 3M6GA 3GOIA 4CBXA 1GLAG 1Y64A 3BF3A 4XH1A 3D2FB 1K8KB 3MN5A 3U8XA 5I9EB 3QBWA 1QQOA 4K41A 3ATVA 5AQIA 2I7NA 1U2VA 4A61A 2PAVA 2CGJA 1NM1A 1MA9B 3MMVA 2CH5A 3DWLA 3ZETB 4PKGA 5AQJA 4FPBA 1Q18A 4DQ8A 4Z94A 4BRLA 3U9ZA 3O5BA 3SLCA 2Q2RA 4BGAA 3WQUA 1QHAA 3WQTA 3TU5A 2E2NA 2NZTA 3VERA 4CBWA 1GLBG 2E1YA 2CGKA 3M1FA 1KXPA 5AQOA 3GL1A 3GG4A 3FR0A 3BUZB 4IJAA 1TUYA 1OKJA 3D2EA 4A2BA 5JLFA 4CZEA 2AP1A 1HX1A 3RSEA 4B1WB 1GLFO 4GY2B 3D2FA 3MK6A 1ATRA 2WUSA 4M63C 3O08A 1HPMA 4BRFA 4RTFD 2ZF5O 5LY3A 4WQ4C 5BRHA 4MO4A 4EFHA 1BG3A 4CZHA 2Q31A 3VGLA 4QS7A 2FSKA 4AM7A 1ZXOA 5AZJA 3FZKA 3H46O 2GUPA 3BF1A 3H6EA 3A5MC 4BR7A 2FSNA 4BR0A 5EY4A 2QWLA 2VWBA 3FZMA 2V51B 3ID8A 4DHYA 5BPMA 4H5WA 1ESVA 1ATNA 2E88A 5LJWA 2E2QA 1NGJA 2A42A 2CH6A 4LC9B 3VF6A 3CETA 3SMPA 4F9OA 3CJCA 4A62A 5AQTA 3FZFA 3SK3A 3ZEUA 4E1JA 1NGFA 1NMDA 3CERA 4H5RA 4DB3A 3VF2A 1BUPA 4RWTA 1NGEA 3JS6A 2QWPA 3QFUA 4A2AA 2H3GX 4B1UB 4BROA 3LDLA 3H1VX 3GE1A 5AQLA 1V4TA 5F2RA 5AFUA 1S22A 4CJ7A 1KAXA 3QBXA 5BRDA 3H3NO 4WQ4A 4H03B 3VF4A 3EL2A 2VYPA 1WUAA 1LOTB 3A0IX 2FF6A 1ZC6A 5JICA 5AQHA 4FSVA 3ZX0A 2PBDA 2Q97A 2P9SA 3CJ9A 2D0PA 4B1VA 4I6MA 3A5NC 3DXKA 3U9DA 1T44A 3HI0A 2QXLA 4BRPA 4H5TA 4JHDA 4ISGA 5B8HA 1V4SA 3J8AA 3O4WA 3U4LA 3C7NB 1MWKA 4EAHD 4BC2A 5AQZA 4QS8A 4B1XB 5AQGA 1K8KA 3LDPA 1HKCA 2HF4A 1KAYA 5JMVA 1X3MA 3H45C 3DXKB 3VEOA 3UB5A 3VEXA 3HZ6A 1S3XA 3WXKA 3DXMB 2W40A 3ULEB 3O1BA 1ZBSA 3H1QA 5AZIA 3VOVA 3A5LC 3CIPA 3ZX2A 3FLCO 1T6CA 1NGGA 4CZJA 4H0VB 1YAGA 1TYQB 2Q0RA 4BREA 5AQFA 2CGLA 5KPZA 5AQPA 1HUXA 1JCGA 1HJOA 2E2PA 4KBOA 2D0OA 5AQWA 3QB0A 4BR9A 2QW9A 3HBTA 2HOEA 2E1ZA 5BR9A 4M7YA 1GLJO 3SMSA 5FPMA 4QS9A 2HMPA 2W41A 4CZLA 4FWSA 5LJVA 3UKUA 1HKBA 3VGKA 1BOTO 3HSCA 3WXLA 3KVGA 3L4IA 2BTFA 2P9NB 3FZLA 4BG9A 3MN9A 1DEJA 2GWJA 4JNEA 1Z6RA 1RDWX 3ENHA 1X3NA 1DGKN 4JD2A 1ATSA 3EZWA 4BQZA 2P9NA 3P4IA 3CJ1A 4CZGA 5F0XA 4XEIA 4BGBA 2YHYA 2P9KB 1GLLO 4WYBA 5ADXA 3ENOA 1E4FT 2ZGZA 4FWMA 4BRDA 3F9MA 3ZX3A 5BPNA 1RGIA 3AAQA 5ADXH 2OANA 3L6QA 4YDUA 1MWMA 3IMXA 1TYQA 2F9TA 1YXQA 1C0FA 4JAXA 2HF3A 4XH4A 3LM2A 3WXIA 4JHDB 1G99A 3LDQA 1QZ6A 3AAPA 4FOEA 4EIAA 3QDKA 5AZIB 5AQNA 4BG8A 3ULEA 4BRIA 3LDNA 3O1WA 5EXWA 4IZ9A 4BRKA 3S41A 1JCFA 1P8ZA 3QFPA 3HTVA 4BRAA 4FPAA 2V7YA 3C0BA 1R59O 4B1YB 4MLHA 2GELA 4FL9A 4BVOA 3FFKB 2QWRA 2F9WA 2NLXA 4FWRA 4RCHA 3L0QA 3A5OC 1E4GT 2I7PA 2EWSA 1GLCG 3DXMA 3DAWA 4BR4A 4K42A 3G25A 1D4XA 3OHRA 4BC3A 3O80A 3H3OB 1BWFO 1NGAA 1XQSC 5E26A 2QWQA 3FGUA 2FF3B 1BDGA 2V7ZA 5ELZA 2P9UA 2E2OA 4EHUA 5FPDA 5AQKA 3BEXA 2GWKA 4FWPA 4CD1A 3W3DA 2P9LA 2P9PB 1JCEA 5AQVA 3QICA 5AQYA 1HKGA 3MN7A 4FO0A 2IVOA 3UE5A 3O6WA 4IXCA 4IO8A 1J6ZA 5EVZA 4EHTA 3CJBA 1NGBA 1XUPO 1XC3A 1QQNA 2GEMA 4FOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I9LA 1NG9A 1S6PA 4CE9A 2XY8A 3OTOK 2FLOA 4FM2A 1BHLA 1YHQN 4CVNE 2YHAA 3Q7BA 3TTDA 5FRMA 3SAHA 4FJ9A 2IS3A 1HNZK 2YNHA 3M3ZA 3VEVA 4WE1A 4DV5K 2A5XA 2O8CB 2VG7A 3UKUB 2O8EA 1RTJA 4IWVA 4NO7A 3OYNA 1QE1A 3HK2A 4A59A 5JVHL 1S1WA 2Q3SA 2OPSA 2G8WA 3CI5A 3MWPA 1YJ9N 2QM1A 2A40A 1QS4A 2IDOA 2IVNA 2JWKA 3MCPA 3OJSA 1BQNA 2NNWA 3KZBA 4FM1A 1OVYA 3LL3A 2ZWHA 1IKYA 4AHSA 1BIZA 1NLVA 4TSXA 3CCUN 4CCHA 1BQMA 2OPRA 4N56A 2Q36A 3TTCA 4IDKA 3M8SA 4H8KA 3S3OA 2UXBK 4MO5A 4I9QA 2P9SB 3HOSA 4C23A 2D1KA 3RMDA 4FWOA 4CIGA 5DM7L 3L4QA 3KKRA 3ZSZA 1JXEA 3T7ZA 2J4RA 3WNFA 4CEZA 3CQXA 1U2VB 4BC5A 4CI6A 4OGCA 3VA3A 3LDOA 3PSFA 3LP1A 5HP1A 2AJQA 4K43A 2KHOA 2IVPA 3AA3A 1CZ9A 4IOAL 4W5QA 2R7YA 3MDQA 4M3WA 5GAEP 3LP0A 3NCIA 3ZCMA 3ZETA 4DUZK 1IKWA 5AQRA 4H4OA 4O8UA 1VSMA 3VEWA 1N8RO 4G1QA 1BCOA 4B9QA 3I8BA 1YJWN 5KI6A 1NGDA 1N32K 4BDZA 1UA0A 3PO5A 3O8MA 3HP9A 3VEZA 1JLBA 2QKKA 3ISNC 4A5BA 4BRQA 3VENA 1S5JA 3SAGA 2P5OA 3QEVA 1IJJA 2F8TA 4H0XB 1LCUA 4HUEA 2VQEK 4UY8O 2HHXA 3VETA 4M45A 4IG3A 3OVNA 1SUQA 4B8AB 1S1UA 4GVEA 3DRPA 4DS4A 1WLJA 1IBLK 4X66K 2BH1A 3LANA 3VQQA 4H0YB 3WT0A 4E1MA 1HRHA 1WSFA 3E66A 4CHQA 3O3FA 2RF2A 1J5OA 1NKEA 4WQ5A 1Z05A 1ASWA 1WBDA 1VQ4N 3D2EB 5BREA 4ISEA 1UAXA 2P9UB 2JLEA 5AQSA 2YHXA 3CQYA 4BE0A 1RT3A 4JKDA 3KLHA 4JI5K 4CF9A 1NK4A 4BE1A 2WONA 1JL2A 1Y64A 3AVFA 3CFPA 1K8KB 4CJ3A 3CF5L 3QNOA 1RDDA 4JI6K 3ATVA 1VQON 3KLGA 4IO9L 2HHVA 1MA9B 5AQJA 4B9NA 4AHUA 3ZSXA 4CJLA 4Z94A 2OYQA 3U9ZA 5GIPA 4EZ9A 2Q2RA 1ZBFA 1QHAA 3WQTA 5C25A 4W5NA 4CBWA 2LSNA 4FJGA 3AVCA 3EE9A 1NJXA 3M1FA 4OVLA 1TGOA 3GG4A 4CJPA 4IJAA 1L5UA 1OKJA 1XMOK 5TKWA 1RTIA 3C95A 4U67L 3RSEA 4GY2B 3AVLA 3D2FA 3CC2N 1HYSA 2O4IA 1ATRA 1WSIA 3NHGA 4M3RA 4EP4A 4ELVA 4RTFD 2F4VK 4GKJK 1WSHA 4DSIA 1BG3A 4AM7A 1ZXOA 4CFCA 3FZKA 4CF1A 3QETA 3OS2A 4ELUA 3KK7A 4BR7A 3VQ6A 4DTNA 3FZMA 4FLZA 3QERA 1REVA 4DQQA 1ATNA 4KTQA 3I0RA 1Z25A 5LJWA 1NGJA 2A42A 4LC9B 4Z4EA 5KGWA 3SK3A 1OH8A 2FBTA 1NOZA 3CERA 3CCLN 4DB3A 4NYFA 1KSPA 4RWTA 3THXB 1DT9A 1XNRK 4E72A 2QWPA 3VQPA 3T1AA 2HMIA 2YNFA 1RDAA 5AFUA 4RW7A 3BGRA 2QXFA 4KI4A 1NJYA 3VF4A 3EL2A 1WUAA 1LOTB 5JICA 2Q97A 2E6MA 3CJ9A 2D0PA 4I6MA 3A5NC 3DXKA 2VG5A 3T69A 1VQ9N 2QK9A 4IG0A 2HNDA 3UIQA 1YJNN 1JLEA 1WBBA 3C7NB 1MWKA 4DWIA 4QS8A 5HRSA 4FJJA 5AQGA 5H1SQ 4KHPK 1K8KA 1K6YA 4AILC 3TAGA 4FVUA 1X3MA 3ZT0A 4ICLA 4DTSA 3DXKB 3VEOA 1S1TA 1LWCA 1S3XA 4FZYA 2W40A 3H1QA 1X9WA 4CGFA 3A5LC 4CGGA 1EX4A 3C6UA 3KD5E 1S1XA 3OYFA 1YAGA 3OYBA 4H4MA 4LF5K 1I39A 3NGZA 4DR4K 3QEWA 1HJOA 1VQMN 4KBOA 2D0OA 4G9ZA 4HVJA 4BR9A 3SQ1A 3HBTA 2HOEA 4M3YA 1NK6A 2E1ZA 4GW6A 4OKKA 4M7YA 3SMSA 4GMJB 4QS9A 2HMPA 2W41A 3EE8A 4FWSA 3H08A 1HKBA 4DFPA 1BOTO 5C15A 3O9UA 4RW9A 4NLCA 3FZLA 2WTUA 4C8LA 1DEJA 2HB5A 2HBJA 4JNEA 3TAQA 1OH7A 1RDWX 3ENHA 4DTRA 3BZKA 3KLFA 4JD2A 3VQ9A 2XHBA 1HNXK 1UA1A 1Q81O 5F0XA 2YHYA 2P9KB 4FJMA 2NRVA 3TANA 1RBSA 3LAKA 4DQIA 3SI6A 5FDLA 2ZJRL 3ZYYX 3HSTB 3AVIA 3U3YA 3IG1A 4FM0A 4CESA 4J2EA 4AHVA 4YOXA 2NRTA 1U4BA 4EIAA 4YHHK 5C2FA 5AZIB 1L3VA 4KH6A 3N4QA 4BRKA 3ID6A 2W6LA 1EKEA 4M3UA 1R59O 1TL1A 2GELA 4FL9A 4DU1A 3RWUA 3NFAA 1CXUA 3QESA 3RVCA 4DTXA 4FJXA 1L3SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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