1LAWA

Stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by cavity-filling mutations within a hydrophobic core
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYIRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by cavity-filling mutations within a hydrophobic core.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1lawA00
1QSYA 3OYEA 3AVFA 4JLHA 3OYGA 2OYQA 1VSDA 4WE1A 4LD0A 4M3XA 3AA5X 4DMNA 1TKXA 3NF6A 2Y1IA 4Q5VA 4EP4A 4DU3A 1NK4A 4FLXA 1R0AA 4UQGA 3SYZA 4OPKA 3ZSZA 3KLFA 2OZMA 4KB0A 5FRMA 1UAXA 1W0HA 5J1EA 4CECA 1BCOA 1L3UA 1C1AA 4CJSA 1L5UA 2PZSA 1VSKA 4E7LA 4F4KA 2X6SA 4CEBA 1VSMA 4M3UA 4CGDA 5EU7A 3AA2A 3DLEA 1RBSA 1NOYA 4B9VA 1U45A 3ZT4A 2G8HA 4J2AA 1JLCA 3V6DA 4Z4FA 2JLEA 4DSKA 4LH4A 2HHUA 4KFBA 4DQIA 3WNHA 3V9UA 3B6PA 3OYJA 2IOCA 1ASWA 1TKDA 3KK2A 4RW4A 5I3UA 3ZSWA 3F9KA 4N41A 4F2RA 2HVIA 1W9HA 3OYBA 1HJRA 5SWMA 2RKIA 2OZSA 1C6VA 1NK0A 1L3TA 1F21A 3SQ1A 1D9DA 4HTUA 4DTRA 1RDCA 4HCCA 4O0IA 4E7JA 1S1XA 1HMVA 4OKEA 3TWHA 3PX0A 1N6QA 4FJNA 3KKSA 4ZTJA 4H4MA 3SUNA 1IO2A 3SV4A 3KD1E 2VG5A 3ITHA 4M42A 4RG8A 4CJQA 3HJFA 1WN7A 4E7IA 1NK7A 1L3SA 4OGCA 4FJLA 3K57A 1NK8A 3DM2A 1CXUA 1UWBA 3OYAA 4FM2A 3OJUA 3L2RA 3MXMA 3S3MA 1YVUA 3ZSQA 1T05A 1ASUA 1NJWA 3HPHA 1LV5A 2YNHA 4ICLA 1WSEA 3NH0A 3ZSVA 4CJ3A 3SQ0A 1SKRA 2ZE2A 2Q3SA 3T1AA 4PWDA 4BE1A 1RBRA 3RR8A 4RW9A 1VSLA 4DTUA 3QEVA 1WSHA 3L3UA 4BDYA 3SUOA 4E0DA 1HNIA 2E4LA 4GW6A 4CF0A 2FC0A 4KHNA 1LW2A 1ZBIA 3PV8A 4IFVA 4CF9A 3K5MA 1IKVA 3IG1A 3P83D 1RT7A 1IH7A 5D3GA 5T7BA 4HUGA 1B9FA 2A1SA 3F73A 4O44A 3SUQA 3L2UA 1S1VA 3KLIA 4CGFA 2BE2A 4K8ZA 1S6QA 3RR7A 4AHVA 3AO4A 4CGHA 4CJ5A 3V9WA 3VN5A 2E6LA 2RPIA 1DTTA 4CERA 4DLEA 3U6FA 4DQPA 5FROA 2HHSA 3AVMA 1BGXT 4JRQA 1VSJA 2XY8A 4JS4A 4MFBA 1I3AA 1DLOA 3U3YA 1RCHA 3TAGA 3M8SA 4O5BA 1T03A 2RN2A 3IS9A 1G15A 2G8UA 4KKOA 4OJRA 3VQ7A 4M41A 3ULDA 2OPPA 4N47A 3I0SA 2OPQA 4BACA 4QOZB 2ITGA 3AO3A 3IRXA 1N5YA 3RMCA 1X9WA 4CEOA 2KFNA 3KLEA 3VQDA 3S9HA 3QETA 2XY5A 2E6MA 4EZ9A 1JL1A 1RBUA 4FVMA 4DQSA 3KIOA 1WSIA 3OS1A 4DG1A 3QERA 1UOCA 1HPZA 4O55A 1J5OA 3AVAA 1MU2A 4OGEA 4CJKA 4HCBA 1C1BA 3HSTB 3NAEA 2IDOA 3LANA 4YNQA 2YKNA 2FBYA 4F2SA 4KAZA 4CJ4A 1S1WA 3ZSOA 1LAVA 4O4GA 4CFAA 4FLZA 4O0JA 4FXDA 3VQBA 5C24A 3AO5A 4M3RA 2Z1JA 1ITGA 4FJHA 3TAMA 2F8TA 2GV9A 3CFPA 2XO7A 1LWCA 3C95A 1RT5A 1C0TA 3OYDA 4FM0A 1L3VA 3OYKA 4KREA 1BCMA 3DLGA 1D8YA 5J2NA 4KO0A 2A1RA 1VSFA 2YHAA 4DFMA 3V1OA 4W5TA 4G1QA 4DU1A 2QKBA 3PUFA 4CEDA 3CFRA 3DOLA 5HBMA 3B6OA 4CHNA 3O4NA 3PX4A 1TAQA 4KHSA 3KJVA 1KVAA 4AHCA 4CJRA 1Q9XA 4ID5A 4JS5A 4E1NA 2OPRA 2HHXA 1REVA 3WNGA 4Z4CA 2R7YA 4DU4A 1Q9YA 3SNNA 4DSFA 3QESA 3VQ5A 4F3TA 4CFDA 3KK3A 3SV3A 3NH2A 1JL2A 4FLWA 2XY6A 5KI6A 3O4QA 4CESA 1TKTA 4Z0UA 4KHQA 1BI4A 1LAWA 1QSSA 5HP1A 1JLEA 3FFIA 4DWIA 4NCBA 1LWFA 4IBNA 3AA4A 3OVNA 3QEIA 2IAJA 3TABA 2DY4A 3P1GA 3AVBA 4KHWA 3JYTA 5CYQA 4FJJA 1HYVA 1S6PA 4R5PA 4CJFA 3OYIA 1ZBLA 4N5SA 4DFJA 4FW2A 5CY4A 4I9LA 1HQUA 4B9MA 5HRNA 4CGGA 3MXIA 1BIZA 5CZ2A 3QNNA 2OA8A 3DI6A 1TL3A 4FCYA 4J2EA 3RMDA 3LP0A 3P5JA 4EZ6A 4Z4GA 3OS0A 2DFFA 2HNYA 3A2FA 3MEEA 4NYFA 4BE2A 4FK2A 1QTMA 4FJ8A 3K5NA 3HM9A 1VSIA 4KRFA 1U04A 4AHUA 2RF2A 4B9LA 2HMIA 3CYMA 3V9SA 3QLHA 4NCGA 2EHGA 4JRPA 2LSNA 4FLTA 1WSGA 2O4IA 5J2MA 2P1JA 3U3GA 5E41A 1Z25A 3BGRA 4Z4HA 1BL3A 2P51A 3M8QA 1VK0A 4PQUA 1S1TA 2PYJA 2WONA 2FBTA 1NJXA 1EKEA 1RT2A 1ZBFA 3VQEA 3ZT0A 4FZYA 4CK3A 3EY1A 3AVLA 3AV9A 1D9FA 4CIGA 2X78A 4CEQA 1CZBA 1TK5A 4XIUA 4DSLA 1TGOA 3WNEA 1BI4B 4FJKA 1U48A 4KI6A 5HRRA 3ZT1A 3O3HA 3AVJA 5CYMA 4FW1A 4CEZA 1QSLA 3OYLA 3LZIA 1U49A 4FJ7A 3VQ9A 3DLRA 4CGIA 3NF9A 5HROA 5KGWA 3T19A 3SQ2A 1UA0A 3LP2A 4FLUA 1TK0A 3TR8A 3SQ4A 4FZXC 1TAUA 3OYMA 3DMJA 2FBVA 3HYFA 3CFOA 1RT4A 4DSEA 1GOCA 3LP1A 3OJSA 4M3TA 3NGYA 2XRIA 3BDPA 2KTQA 2KQ2A 2Z1HA 3L2QA 4E7HA 2HB5A 5I42A 3VQ6A 1NK9A 1FKOA 3NF8A 3QIPA 2Y1JA 4B9TA 2O4GA 1NK6A 4B8AB 3OY9A 4HHTA 1NJZA 1C0MA 3D45A 2VG6A 4CJWA 1IKXA 3EYZA 1JXBA 1XWLA 4I2QA 3K5OA 3M8RA 3TAEA 4DTPA 3UIQA 3LALA 4DLGA 2QXFA 4YFUA 3VQAA 4N56A 1RDBA 4KTWA 4ELVA 2YNGA 2ATQA 3RRGA 2VWKA 1QE1A 5DMRA 5K14A 3ZSYA 4CHOA 3LWMA 4KPYA 4AHTA 2KZMA 1ASVA 4KV8A 4L8RB 4FJ9A 2BGGA 2KZZA 3AO2A 4FJXA 1A5WA 4ZTFA 3V1RA 1RBTA 3V81A 1JLQA 3C6TA 1JLAA 2HHWA 3K58A 1YTAA 4DTJA 3RRHA 3JSMA 2GBZA 1EXQA 4C8LA 1JLBA 3LAMA 3VQCA 5SZTA 4DF4A 1BQMA 3AA3A 3AVGA 4NCAA 2Z1IA 2DFEA 3PO4A 1JLFA 4B9UA 4F3OA 4FK4A 1JLGA 3MEGA 5C42A 2D0CA 2WOMA 4HUFA 1VSHA 3NE6A 3S3OA 3T3FA 4PY5A 4ELTA 1CXQA 1XC9A 1KTQA 4RW8A 1BISA 3ASMA 4AHSA 5C25A 3E01A 4QCLA 4CFBA 2BANA 1U47A 3G10A 4GVMA 3MEDA 1S9EA 4CF2A 3EZ5A 1YTUA 3KLGA 2VWJA 4KB1A 4FLVA 1RTJA 1EP4A 1TKZA 3HO1A 1SUQA 3SI6A 3TAQA 3QIOA 4CHZA 4DTOA 3O3GA 4I9QA 2HVHA 2HW3A 4QAGA 4KI4A 3HVRA 4IDKA 5KRSA 3NCIA 1HRHA 3QEXA 3CM6A 3HK2A 2HNDA 4PUOA 1LWEA 1LW0A 4Y1DA 4W5OA 3KTQA 4E19A 4HUEA 3HP9A 1KFDA 3DYAA 3I8DA 1WSJA 4BE0A 3MECA 1IKYA 4CE9A 3NF7A 1FK9A 4Z4IA 5JS1A 3SJJA 4FJMA 1WAJA 3K2PA 3LP3A 3L2VA 4CHYA 4ZHRA 4CJEA 3IAYA 4M3WA 2D5RA 2ZD1A 1T7PA 3KKRA 4CF1A 3NH1A 3HXMA 2W42A 1RTDA 4E89A 4OKJA 4J2BA 3AVNA 4DFKA 2B6AA 1HNVA 1Q8IA 3LPTA 3QINA 1NKCA 4B3OA 4MQ3A 3SCXA 2G8VA 4OLBA 1JXEA 5HRPA 4C8MA 4N76A 2HHVA 1KSPA 1K6YA 2PY5A 3DRRA 4IG3A 1XHXA 4CJTA 3KLHA 4RW6A 1A5VA 1VRUA 1RDAA 1HYSA 4F8RA 2XHBA 3SZ2A 4DS4A 3CG7A 4CF8A 4W5NA 4FLYA 5JS2A 4M3ZA 4KHYA 1TL1A 1QQCA 2OPSA 4E3SA 1ZBUA 3ZT2A 2IGIA 3HP6A 3RMBA 1NKEA 3HL8A 1RT6A 1KCFA 3RTVA 1B92A 3QNOA 2HHQA 4DQQA 2KFZA 3H08A 1NOZA 4AILC 3OYNA 3ALYA 4CEFA 4CIFA 3DRPA 1TV6A 2ZQBA 2YNIA 4H4OA 4CEAA 4OPJA 1IG9A 3AVIA 4BDPA 2G8IA 5FDLA 3ISNC 3ZT3A 2KW4A 5KRTA 1NK5A 1B9DA 1YT3A 3DLHA 2AJQA 3LPUA 3PX6A 1S5JA 4DF8A 5HLFA 3C94A 2G8FA 4CHPA 4W5RA 4H8KA 3MXJA 1VSEA 3L3VA 1KVBA 1T8EA 3LAKA 2DFHA 5KTQA 4B9SA 3PY8A 1ZYQA 4CJUA 1QHTA 3DLKA 1BHLA 4CK2A 2G8KA 3NFAA 1A5XA 1I39A 2IS3A 3VQPA 4W5QA 2VG7A 1WAFA 2F8SA 4E1MA 2X74A 1C1CA 3LWLA 4DQRA 4C8KA 3HT3A 4CJVA 3PO5A 1SKWA 4HVJA 3SUPA 1IKWA 4I7FA 3TAFA 1S1UA 3KD5E 4M45A 2X6NA 2B5JA 3QO9A 1RDDA 3DRSA 4DTXA 1SKSA 4FJIA 4E7KA 2YHBA 3G0ZA 2D0BA 3SPYA 1NKBA 3VA3A 3RWUA 2QK9A 1X1PA 4IFYA 4LH5A 3MAQA 4FZZA 3AVHA 1D5AA 1EETA 1CLQA 3L2WA 2NUBA 2ETJA 4J2DA 3VA0A 2BDPA 1KFSA 3V4IA 1BQNA 1KLMA 4Q0BA 4GMJB 1O1WA 3NHGA 1UA1A 1VRTA 4RW7A 1EX4A 3WNFA 1KLNA 3LZJA 1SL0A 3ZSXA 5J2PA 1BIUA 1FKPA 1JKHA 1SL1A 2B4JA 1C0UA 4FJ5A 4KTQA 3CM5A 3VQ8A 1U4BA 1XI1A 1FXXA 4BWJA 4KHUA 4CHQA 4DTNA 1ZBHA 4AH9A 4K8XA 1XHZA 4PA1A 4DSJA 2IC3A 3V9ZA 1HQEA 3QEWA 4B9NA 4FM1A 4I2PA 3RMAA 4IG0A 4CEEA 3HVTA 4EP5A 2QKKA 2EX3A 4DS5A 3D0PA 1WLJA 3LDSA 4DTMA 5J2QA 3THVA 1RTIA 4Y1CA 4CFCA 3AVKA 3ZCMA 3OYHA 3SPZA 4OVLA 3AO1A 5CZ1A 3VQ4A 1X9MA 3NDKA 2I5JA 2FBXA 1X9SA 1RBVA 1SL2A 1RILA 4FYDA 4DFPA 1RT1A 2XY7A 1SV5A 4LSLA 1TVRA 1Z26A 3DOKA 3VQQA 2YNFA 3HPOA 4FJGA 4B8CA 3K5LA 1WNSA 3S3NA 4CJPA 2PYLA 3CQ8A 2HHTA 3KK1A 1KRPA 4DSIA 2YV0X 2Z1GA 1GOAA 3K59A 1RNHA 1Y97A 2HNZA 1TK8A 1J54A 2YKMA 3NGZA 3L8BA 4CK1A 3TANA 1J53A 3V1QA 4CCHA 1RTHA 2D0AA 2G8WA 3QEPA 2DTUA 3V9XA 4BWMA 3C6UA 2GUIA 4DTSA 3M8PA 4LY7A 4C8OA 4M3YA 2F96A 5DK5A 3NBPA 4AHRA 5HRSA 2P5OA 4FK0A 1WSFA 5FRNA 4CIEA 2P5GA 4LSNA 4B08A 4C8NA 3O3FA 1QS4A 4Z4EA 4OLAA 4ELUA 5KGXA 3NGIA 3TAPA 3DLBA 3OYCA 4IKFA 1S9GA 3I0RA 3TARA 1RT3A 4TSXA 4NYNA 3ZSRA 1DTQA 4ID1A 1J9AA 3HPGA 2JGUA 4OKKA 3TI0A 1HYZA 1GOBA 3OYFA 1NJYA 1CZ9A 4BDZA 4KTZA 3AVCA 3OS2A 4CGJA 1KVCA 4CJLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JLHA 3M1FA 1VSDA 1U2VA 1K8KA 3AA5X 3U4LA 4FLXA 4IZ9A 4OPKA 4U7BA 1UAXA 5J1EA 4U67L 1C1AA 2O8BA 4F4KA 1IBLK 4CGDA 4OX9K 2P9NA 5EU7A 1V4SA 3DLEA 1NOYA 4FVUA 3ZT4A 4DSKA 3J81O 1YJNN 2WC9A 3WNHA 3B6PA 4DR1K 1ASWA 3SMPA 2O8CA 3KK2A 4RW4A 3D6RA 2RHKA 1W9HA 5M1NA 2PBDA 5SWMA 4BRCA 3WEEA 4DTRA 2QWOA 3TWHA 3PX0A 4GVEA 4ZTJA 3SUNA 3ITHA 4RG8A 4CJQA 3HJFA 5C2FA 4OGCA 3TSPA 3ZEUB 3DM2A 3EZWA 3L2RA 1YVUA 3VGLA 1WSEA 4ILJA 4CZIA 5AQSA 3PLAA 3AGKA 2Q3SA 4BE1A 1NU0A 2ZJPL 1VQPN 3L3UA 2E4LA 4CF0A 1N33K 4CF9A 1IKVA 3IG1A 3FLCO 1VQ8N 1IH7A 5D3GA 5T7BA 4HUGA 3A5NC 1S1VA 3KLIA 4KH6A 1Y64A 1S6QA 4B1VA 4RCHA 4BGAA 4JRQA 2J4RA 2VQEK 4JK7A 1I3AA 3TAGA 4BRNA 3NVKA 2RN2A 1NGFA 4OJRA 3TSUA 3I0SA 4HTLA 1W7AA 1XUPO 2OPQA 3SAGA 4QOZB 2ITGA 5EX5A 2P9IB 1N5YA 3I8BA 3VGMA 3OTOK 1SQKA 5MLCQ 4NXMK 2E6MA 1RBUA 3THXA 3OS1A 1J5OA 4OGEA 1KAXA 1J5EK 2YKNA 2FBYA 4CJ4A 4JI2K 4FXDA 2WBNA 2Q0RA 3VQBA 4GV6A 4B9QA 3TAMA 5LY3A 2XO7A 3ENBA 1NGEA 2ZJRL 3TSQA 3FR0A 1ZC6A 3DOLA 4CHNA 3O4NA 4DV6K 2HHXA 4Z4CA 3QESA 4CFDA 3KK3A 3SV3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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