1LAWA

Stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by cavity-filling mutations within a hydrophobic core
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYIRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
publication title Stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by cavity-filling mutations within a hydrophobic core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1lawA00
5JS1A 1XI1A 1D5AA 1NK8A 4CFAA 1IH7A 1S9GA 1FXXA 3E01A 1VSHA 5I42A 1SKSA 4KHSA 3OJSA 3M8QA 4CF0A 2HHXA 2KZZA 3EY1A 3CYMA 3HYFA 3SUOA 2QKBA 2IS3A 4C8KA 3NGZA 1QSLA 2P5OA 3L2VA 4QCLA 5C42A 3MXIA 4N76A 1NK0A 3D45A 3HP9A 2OPPA 4QAGA 4WE1A 5CYMA 3HSTB 4YNQA 3KJVA 1CZ9A 3NE6A 3RRHA 4DTMA 1BIUA 4CJRA 5KTQA 4BACA 2E6MA 3V1QA 3O4QA 4CJTA 4B8CA 2VWJA 3CFRA 5J1EA 3S3NA 4M3UA 3AVMA 2YNGA 5C25A 2KW4A 2A1RA 2XY6A 1UWBA 4DFMA 4KAZA 4FJ5A 4FJ8A 1RBTA 4W5OA 4E1MA 4CHQA 3RR8A 4FJJA 3K57A 1ZYQA 3SPZA 2HW3A 3OYHA 1UOCA 1R0AA 3VQDA 4FK0A 4CESA 4O44A 3NGIA 1JLFA 3C6UA 4AHTA 2X74A 2FBXA 3U3YA 4E7JA 1DTTA 1X1PA 4C8LA 1LAWA 3V6DA 3KD1E 4E3SA 2Z1IA 4DTNA 2PZSA 2PYJA 3HK2A 1Y97A 1VSDA 1WSGA 4PY5A 4M45A 4Q5VA 3H08A 4GW6A 3RRGA 2IOCA 3QERA 1HNIA 5JS2A 3NDKA 4FCYA 1HYZA 3V1OA 3OYEA 1JLCA 3BGRA 5CZ1A 3S9HA 3S3MA 4CGHA 3DLKA 1DLOA 4DSIA 4F8RA 1I3AA 3NH1A 1SL2A 4I7FA 4LD0A 1WLJA 3HVRA 1BGXT 1S1UA 1ZBUA 3B6PA 3T19A 3NF7A 4CEEA 2PY5A 4ID5A 4OLAA 4CEQA 3V9SA 3LDSA 1TKZA 3A2FA 4HHTA 4BDZA 4KHWA 2IGIA 2YNFA 4KTQA 3NH0A 1UA0A 3AVJA 3VQBA 4LH5A 4CECA 4FM2A 3QEVA 3ZSZA 4O0IA 4L8RB 2XY8A 5DMRA 1U47A 4LSNA 4FJGA 5J2PA 4BE1A 4KHUA 1BIZA 2RF2A 2BE2A 1CLQA 1TK8A 1VSJA 4E7HA 1LV5A 2HHSA 2YHBA 2YNHA 1HNVA 2X6NA 4RW7A 2WONA 2HNDA 4E7IA 4J2BA 3TR8A 1WSHA 3AVIA 4DSFA 3CM5A 3MAQA 4BWJA 4N56A 1RBVA 1YTAA 3OYMA 5I3UA 1S5JA 1L3TA 3QO9A 4W5QA 4PA1A 3DLEA 3VQ9A 2GBZA 1EXQA 1BQNA 1VSKA 2X78A 3TAGA 3ISNC 2HVIA 3SQ0A 2Z1HA 5KRSA 4F4KA 1QHTA 3QEPA 4JLHA 3EYZA 2E4LA 3AVAA 1C0MA 3SI6A 1NOYA 4R5PA 1NKBA 3RMCA 4CFCA 3TARA 3AA5X 1BHLA 2JGUA 2XY7A 2B4JA 2NUBA 2HNYA 3V9ZA 4FK2A 4CEFA 1SL0A 2F8SA 3KLEA 4CHNA 4FW2A 4CHPA 2Z1JA 3ZSOA 4FLZA 3TAMA 4FZZA 3I8DA 5K14A 1KVAA 2A1SA 1C1CA 4CFDA 3DLHA 4O55A 1U04A 4OVLA 4C8NA 3C6TA 3BDPA 4B9NA 4EP5A 4DWIA 4Z4GA 4RG8A 2HHTA 3L3VA 3RMDA 1BCOA 4FVMA 4Z4HA 1JL1A 1RCHA 3K2PA 3DYAA 1RBUA 4IBNA 4CEBA 2QKKA 3VQCA 3K5LA 2G8HA 3NF8A 5KRTA 4TSXA 1VSMA 3VQ5A 4CGJA 3F9KA 4KFBA 4CFBA 4DSEA 1KVCA 4CEAA 1B92A 4RW9A 5HP1A 1A5VA 3O3HA 4CGDA 4YFUA 1RTDA 4H4MA 3QEWA 1SV5A 4JRPA 4DU1A 4CGGA 4CF9A 1L5UA 2G8KA 2F8TA 1W9HA 4XIUA 3OYNA 2VWKA 4KRFA 4W5NA 1VK0A 4KREA 2LSNA 4OGCA 3ZSYA 4AHSA 2G8IA 4DTPA 3HO1A 4HVJA 4IDKA 4CE9A 1D9FA 1XWLA 4CEZA 3K59A 3P83D 3VA3A 2W42A 3DOKA 1VSIA 3OJUA 3CFPA 4FJXA 3ZSWA 1JLGA 3QIPA 4OGEA 4OPJA 1KFDA 3KK2A 1VSFA 5SWMA 3C94A 3DMJA 1JLEA 1ZBLA 3DLRA 4FJLA 4PUOA 3ZT1A 3L2UA 3MXJA 3PY8A 5KGXA 1WSJA 3AVLA 3PV8A 1F21A 1C0TA 3QETA 4AHUA 1RT7A 3OS0A 4FLUA 3V9UA 2DFHA 4I9LA 1HJRA 1K6YA 1RTHA 2B5JA 1FKPA 4CEDA 2X6SA 4CHZA 3HPOA 1L3SA 3DM2A 3PO5A 4DU4A 4CERA 1J9AA 3QEIA 4KHNA 4Y1CA 4JS4A 4BE0A 1QSYA 4KB0A 3LZJA 4KB1A 1X9MA 3MEDA 4ELUA 4M3ZA 4HCBA 2HHWA 3ASMA 1L3UA 1JKHA 2FBVA 4IG3A 1S1VA 3HM9A 3NCIA 3IRXA 1IO2A 1TAQA 4IG0A 3G0ZA 2QXFA 1JLQA 1CZBA 1DTQA 5KGWA 4CJ5A 3DLBA 4NYFA 2G8UA 5C24A 1WSFA 4W5TA 3KLGA 4DF4A 3SQ4A 1KVBA 3VQ7A 3TWHA 4H8KA 4LH4A 3O3FA 1IG9A 3VQQA 1TGOA 1TKXA 4KHYA 2O4IA 2PYLA 3HPHA 2HB5A 5HLFA 3QESA 4CCHA 2YHAA 3WNGA 3SYZA 1RDAA 1VSEA 3MECA 3LANA 3RR7A 1RILA 3SQ2A 2FBYA 4LSLA 1J53A 1GOAA 4CJ3A 4DMNA 3NBPA 3M8SA 4K8XA 5D3GA 4OJRA 4DQSA 3ITHA 4H4OA 1CXQA 1S9EA 4BWMA 4NCAA 4Z4FA 3V9WA 1S6PA 1KLNA 3IAYA 3AVBA 3L2RA 4DU3A 1REVA 2FBTA 2ZE2A 4B9MA 3LAMA 3TAEA 1U49A 1O1WA 3I0SA 4NCBA 3OYBA 3LPUA 1Q8IA 4DTJA 4EZ9A 3U3GA 3AA4A 5J2MA 3LP0A 4CJ4A 4OPKA 4CK1A 4DQRA 4PQUA 3DRPA 1RBSA 2D5RA 5FROA 4FLYA 3KKSA 2DFFA 1BQMA 4CF1A 3K5OA 4HUGA 1HRHA 4HTUA 4DS4A 2XO7A 2WOMA 4CEOA 3OYKA 1TVRA 4CGIA 3K5MA 4B3OA 3OYIA 3AO2A 2F96A 3SV4A 1FKOA 4IFYA 1JXEA 4DQIA 3O3GA 1TKTA 3OS1A 3IG1A 2I5JA 2FC0A 5CYQA 4CHYA 3V81A 1EETA 1KLMA 1QQCA 3VN5A 3V9XA 4KTZA 4E7LA 3C95A 4CGFA 3ZT0A 2KFZA 1IKVA 2D0AA 4Z4EA 2IC3A 1G15A 3PX0A 3L3UA 4NYNA 3VQEA 3T1AA 4DLGA 1RT5A 3L8BA 4I9QA 4CF2A 3HJFA 1BL3A 1JL2A 1WSEA 4N47A 3RMAA 3ZSVA 4EZ6A 4C8MA 1D9DA 4G1QA 4O0JA 1GOCA 4ZTJA 4KPYA 5FDLA 4FJMA 4Z4IA 3SQ1A 4RW4A 4ICLA 1NJXA 4NCGA 4AHCA 4GVMA 4UQGA 1T7PA 3TAFA 4ELVA 4CJPA 3QNNA 1IKWA 3S3OA 3K5NA 1RBRA 1S6QA 1NK7A 3DI6A 5J2QA 3UIQA 3OYGA 3AO1A 1Q9YA 2AJQA 2Q3SA 3HVTA 3ZCMA 4BDPA 1EX4A 1FK9A 3VQ8A 2D0CA 2G8WA 2HVHA 3LWLA 4CF8A 1SKWA 3V4IA 3T3FA 1WAJA 4M3YA 3CFOA 1TL3A 3TABA 2KZMA 3VQ4A 3NHGA 2P5GA 1QSSA 2B6AA 3OYJA 1SL1A 3RMBA 1QS4A 3KLHA 2ZQBA 4DFKA 4CIGA 5HRPA 4KHQA 3AO4A 1GOBA 2E6LA 3OY9A 1S1TA 3OYAA 4AHRA 3SNNA 1HMVA 2BGGA 1RTJA 4FW1A 3L2QA 3ZT3A 4HUEA 2KQ2A 4RW6A 4FZYA 3U6FA 4N41A 4M3WA 3PUFA 1CXUA 3LPTA 2DFEA 3OYDA 4FLVA 4JRQA 1WNSA 2ATQA 3L2WA 1WAFA 4HCCA 3LALA 2RPIA 3AA2A 1KCFA 4CJLA 2VG5A 3ZSXA 5KI6A 4DFJA 3V1RA 4CJUA 4DTRA 1L3VA 1IKXA 1J5OA 4DTXA 3KK3A 3QINA 4FJKA 5HROA 4FJIA 5CZ2A 4AHVA 3SUQA 3RWUA 1UAXA 2VG7A 4CJWA 4FXDA 3RTVA 2ZD1A 1RT3A 1RT1A 4O4GA 3NH2A 1XHZA 1B9FA 4CHOA 3KK1A 2OYQA 3OYCA 1U4BA 1EKEA 4F3OA 1RTIA 4B9LA 1VRUA 1ITGA 3WNHA 1U48A 5EU7A 4FYDA 1QE1A 4C8OA 4B9UA 5J2NA 1A5WA 1RT4A 3AVCA 1X9WA 3NGYA 2KFNA 1ASVA 2P51A 3QNOA 1HYSA 3QLHA 1S1XA 4MQ3A 3PX4A 3QEXA 2KTQA 3P1GA 3HT3A 4F2SA 2P1JA 4OKKA 4Z4CA 4E7KA 1HQUA 1TV6A 1QTMA 3LP2A 1HYVA 4GMJB 4DG1A 3HPGA 3ZT2A 1A5XA 3SCXA 3MXMA 3LWMA 1C1AA 2YNIA 4KKOA 2HHUA 5DK5A 1VRTA 3KIOA 3F73A 3AA3A 1LWCA 2Y1IA 1LAVA 3AO5A 3VQPA 1UA1A 3AV9A 1C1BA 2OZMA 1ZBIA 2DY4A 4F2RA 1RDBA 2GV9A 5E41A 3TAPA 3OS2A 1SKRA 4DSKA 4MFBA 5HBMA 3LZIA 3AO3A 5FRNA 4KV8A 4KI6A 2EHGA 1C6VA 4JS5A 4FJNA 4I2PA 1JLAA 2OPQA 3NFAA 3HXMA 1I39A 3TAQA 1RDDA 3FFIA 4B9TA 4B9VA 4E0DA 4DF8A 1C0UA 3NF6A 3AVHA 3HP6A 2GUIA 4B9SA 4Y1DA 4CJFA 1BI4B 2RKIA 4O5BA 4LY7A 3SV3A 4PWDA 2XY5A 1ASUA 4J2DA 4DS5A 1TL1A 4I2QA 4FJ7A 4QOZB 1XC9A 1J54A 3TI0A 1T03A 4M41A 2OZSA 1VSLA 1WN7A 3B6OA 3OYFA 1RNHA 3WNFA 2ETJA 1HPZA 3OVNA 1ASWA 3NAEA 1LW2A 4OKJA 4DFPA 1WSIA 2OA8A 2Z1GA 4N5SA 1NJYA 4CJEA 2BDPA 3P5JA 4CJKA 4DQPA 1NK4A 4FLTA 1YVUA 1KFSA 4IFVA 4J2EA 3DLGA 1SUQA 4CJVA 3EZ5A 4DTSA 2HHVA 4Z0UA 2HMIA 4EP4A 1NOZA 3JYTA 2ITGA 5HRRA 1NKEA 4E1NA 4E89A 2XRIA 2EX3A 1IKYA 4DLEA 3PO4A 4CJSA 3I0RA 4W5RA 1TK5A 3TANA 2YKMA 3MEGA 1T8EA 3ZSRA 1LW0A 3ALYA 2G8VA 1RT2A 3LP1A 3THVA 1YT3A 2XHBA 3M8PA 2VG6A 3KLIA 2O4GA 4DQQA 2Y1JA 1B9DA 4OKEA 5SZTA 1KTQA 3CQ8A 4FZXC 5HRNA 3DRSA 3JSMA 3PX6A 4K8ZA 2HHQA 1S1WA 3DRRA 1N6QA 1NKCA 2R7YA 3VA0A 1BISA 2IDOA 3CM6A 3KTQA 2JLEA 1JLBA 4ID1A 5HRSA 1RDCA 4E19A 3OYLA 4FJHA 4KO0A 2D0BA 3AVGA 1XHXA 1NK9A 4M42A 4CIFA 1YTUA 3AVNA 4Q0BA 1BCMA 4DTOA 2RN2A 4DTUA 1W0HA 4IKFA 2HNZA 1NJWA 4M3RA 3CG7A 5CY4A 1ZBFA 1T05A 3SZ2A 1Z25A 4CJQA 3VQAA 3MEEA 4KTWA 4DSLA 1NK5A 1KRPA 4AILC 4CK2A 4M3XA 1N5YA 4FK4A 1KSPA 3KD5E 2OPRA 3QIOA 1TK0A 1MU2A 3ZSQA 3HL8A 4F3TA 4CK3A 3KKRA 4HUFA 4FM1A 3D0PA 1NK6A 1RT6A 2G8FA 1Q9XA 3O4NA 2QK9A 3NF9A 1X9SA 1LWEA 5T7BA 2BANA 4FJ9A 3WNEA 2OPSA 1HQEA 4ELTA 2DTUA 4AH9A 4J2AA 1Z26A 1TAUA 4FLXA 2YV0X 3G10A 5FRMA 1LWFA 3VQ6A 3SJJA 1JXBA 3K58A 4DSJA 1TKDA 1EP4A 3SUNA 3ULDA 3AVKA 1U45A 4RW8A 1NJZA 3SPYA 1BI4A 1D8YA 4KI4A 3KLFA 3AVFA 3M8RA 4ZTFA 3ZT4A 4FLWA 1ZBHA 4CIEA 4B08A 4ZHRA 4M3TA 2YKNA 4FM0A 4OLBA 3LAKA 3IS9A 4BE2A 3SUPA 3LP3A 3DOLA 4BDYA 2IAJA 4B8AB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JS1A 1D5AA 4CFAA 1S9GA 1FXXA 5FPDA 1VSHA 3GBTA 1SKSA 3M8QA 1GLLO 5AQRA 4N76A 3MCPA 5CYMA 3VPZA 4BR7A 3KJVA 4PL8A 5FPMA 1P8ZA 3V1QA 2YNGA 3QFPA 4BG9A 4H5VA 4JI4K 3SAHA 4DFMA 4KAZA 4FJ8A 2GWJA 4W5OA 4FWKA 1UOCA 4CBUA 4FK0A 4CESA 3MX2A 4O44A 1JLFA 1SZ2A 4JI6K 3EE9A 5CE3A 3DXMB 1DTTA 4JKCA 4E7JA 1X1PA 4BG8A 1HNWK 3KD1E 3L6QA 4EFHA 4DTNA 3QDKA 1WSGA 2QA4N 3RRGA 2IOCA 3R8EA 5BRFA 3G71N 1DKGD 3BGRA 3CJAA 3S9HA 3MK6A 3SMPA 3G4SN 1SL2A 4LD0A 3HVRA 1S1UA 3T19A 3NF7A 4HHTA 4KH5A 4XH1A 5EY4A 1HPMA 3AVJA 3VQBA 4CECA 4FM2A 3QEVA 3QBWA 5F1XA 4OPHA 1MWKA 3THXB 3HRGA 1VSJA 2X6NA 3VF4A 2HNDA 4LF8K 1ATSA 1YTAA 1X3MA 3LL3A 4PA1A 4NLBA 3SLCA 1EXQA 1BQNA 2X78A 1MWMA 4JK8A 3KWGA 3EN9A 3ISNC 3LM2A 1QHTA 4F4KA 2ZJQL 3ZETB 1Q18A 3VEWA 2F9WA 2B4JA 4FK2A 4CEFA 2F8SA 2VQFK 4CHNA 4CHPA 3E66A 4FLZA 1NGBA 3ZX0A 4FZZA 3DLHA 1JJ2M 4BRNA 4C8NA 3C6TA 2UU9K 3BDPA 4EP5A 4B9NA 4Z4GA 1S22A 3J7AP 2HHTA 1ILYA 1BCOA 4E1JA 2D0OA 3VTHA 4CEBA 3NF8A 2W6LA 3FZFA 3VQ5A 4CFBA 2V52B 4DSEA 4A59A 4CEAA 1B92A 4RW9A 5AQYA 4FWQA 1A5VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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