1LAWA

Stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by cavity-filling mutations within a hydrophobic core
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYIRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by cavity-filling mutations within a hydrophobic core.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1lawA00
4I2PA 1UA0A 2ETJA 4E7IA 2VG7A 2YHBA 4M41A 3TABA 4FLUA 3VQ6A 2AJQA 4CF2A 2Z1JA 3K5NA 5FROA 2I5JA 1KTQA 3OJUA 5HRSA 2E6LA 2LSNA 3M8RA 3WNEA 4PUOA 2YNGA 1YTAA 4OJRA 4HUEA 3L3VA 1Q8IA 4JLHA 1NK7A 2RF2A 4CF9A 1WLJA 3HVRA 3OYIA 5CY4A 4CGJA 3K57A 3NF6A 3VA0A 5HRRA 5HP1A 3KD1E 1RCHA 3AA4A 1X9SA 1L5UA 3NE6A 4ELUA 3C94A 4B9LA 3HSTB 4B9TA 1BI4A 4YFUA 3OYEA 1DTQA 3NH2A 3O4NA 3ZT4A 3JYTA 4FCYA 1SKSA 3KJVA 3RMBA 1U48A 3HJFA 3I0RA 3OYGA 2IC3A 2ZE2A 3WNFA 1S1UA 4RW4A 1TKXA 2EX3A 2FBXA 4FW2A 2VG5A 2OYQA 3T19A 4J2EA 2B5JA 3M8QA 1RT3A 1Z25A 4CIEA 1JLAA 1HJRA 3KLFA 1U45A 1JLCA 2FBVA 2XRIA 1RDDA 3OVNA 1TAQA 2VWKA 3VQ9A 4M3WA 3G10A 3MEEA 4DQRA 1ASVA 3WNHA 4LH5A 4CK2A 3E01A 1TVRA 1D5AA 1IKYA 1WAJA 4CHYA 1KLMA 5K14A 4XIUA 1T7PA 3LWMA 3KKRA 3U6FA 1U49A 3ZT0A 3D0PA 3O3GA 1XHZA 4FM1A 1BI4B 3L8BA 4FJKA 1KFSA 1HRHA 1U47A 1QS4A 4Z4IA 4QCLA 3VQBA 2YHAA 4DU1A 3SQ1A 4LSLA 4HUFA 1VSEA 4FJLA 2QKBA 1NK4A 1BIUA 4WE1A 3VQDA 1R0AA 3LPUA 4CJEA 2HHVA 1NOZA 2HNDA 3DLRA 3OYKA 3TAPA 4B9NA 4OKKA 4N76A 1UWBA 3OYAA 1KVAA 3RMCA 5HBMA 1N5YA 1L3TA 2Q3SA 1IO2A 4CGDA 4OPKA 4CF8A 4KKOA 3VQ4A 4HVJA 3SQ2A 4EZ6A 1KLNA 3THVA 1T8EA 2P5GA 1WN7A 1LWEA 2ATQA 3DOKA 4FJ7A 4E7KA 1RDBA 2G8WA 2YV0X 3LP3A 3V9SA 1B9FA 1S5JA 4CF0A 4FK4A 2A1RA 3HP9A 4CJ3A 2BE2A 2FBYA 4DLEA 4I9LA 5CZ1A 3O4QA 1S1VA 4KO0A 3OYJA 3C95A 1ZYQA 4E0DA 3AVIA 3I8DA 3L2RA 4Z4FA 4DTMA 4CF1A 3C6TA 1KRPA 1IG9A 4M3YA 5C42A 4F8RA 1KSPA 3ZT3A 4CFAA 1HQEA 3AVNA 4E3SA 4MFBA 1W0HA 4W5RA 2YNFA 3AO5A 4N56A 2OPRA 3K5OA 2O4IA 3VQAA 3DLGA 1TAUA 4O5BA 3ZSQA 1UAXA 1EX4A 1O1WA 1JL1A 1GOCA 1QQCA 3DYAA 4B8CA 1TV6A 2X78A 3SUPA 3CFRA 1DTTA 4CJLA 4PWDA 3RRHA 1VSKA 3V1QA 3QESA 2BGGA 2NUBA 3NH0A 3OYFA 1CXQA 3D45A 1JL2A 4CEQA 4FJJA 1YT3A 5J2MA 4GW6A 4CEOA 1RTIA 3C6UA 2HHWA 2YNHA 4DTSA 2Y1JA 2Z1IA 3HYFA 4KTZA 1D9DA 1SKRA 3OYDA 5J2PA 4AHRA 4CEDA 3MAQA 1LWFA 4HCCA 3TAFA 3B6OA 3MEGA 3HO1A 4DSKA 3HPOA 2DFFA 3KLHA 2DFHA 3TAQA 2F96A 1ZBIA 3KD5E 3DLKA 3VN5A 1Z26A 4G1QA 3SCXA 3RTVA 3ZCMA 5I42A 2E4LA 3ZSZA 3IAYA 2HHUA 1EP4A 3V1OA 4DU3A 4CGIA 2P51A 3P1GA 1JXBA 4I2QA 3CM6A 3PX0A 4Y1CA 4KHWA 4CJKA 5C24A 1REVA 1RT2A 3SQ4A 3ZSXA 3FFIA 3LAMA 3VA3A 4DFPA 3CG7A 2VWJA 1T05A 4FJGA 3AA5X 1SL2A 4I7FA 1HPZA 4B8AB 4KB0A 2HNZA 4KTQA 4HUGA 1EXQA 4M45A 4AH9A 3KK1A 4OKJA 3DRPA 3SUQA 3QERA 1HYSA 2KTQA 3OYNA 4Q0BA 3HM9A 3SUOA 2B4JA 3K5LA 4KHQA 4E1NA 4CK1A 3U3YA 3EY1A 2X74A 3DLEA 4CFBA 3TAMA 4C8NA 3SZ2A 1NKBA 4CJUA 3SQ0A 3F9KA 5HRNA 1VRUA 4FLTA 1RDCA 3HPHA 4F4KA 4ZHRA 2DFEA 4KV8A 4OVLA 4F3OA 3VQ8A 4FLXA 1TKZA 3V6DA 3L2UA 2IDOA 2D0BA 4C8OA 1ZBFA 4W5QA 1J9AA 3ZSWA 4CGGA 3OYBA 4FLYA 3BDPA 4C8KA 1IH7A 4DSFA 4FZXC 1I39A 1QE1A 1C1BA 2IOCA 5KRSA 2ZQBA 3LDSA 4M3XA 4KI6A 3RR7A 1L3UA 3NF7A 3PX6A 1RILA 3AVCA 1BQNA 4LSNA 2ZD1A 4E7LA 4DTXA 1VSLA 3KK3A 3RRGA 3I0SA 3SPZA 2DY4A 4DMNA 4CHOA 1BIZA 1X1PA 2OZSA 3S3NA 4CECA 5C25A 3VQEA 2XY5A 1S9GA 1KFDA 1D8YA 4KHSA 4F3TA 1UA1A 1TKTA 1VK0A 3VQQA 3NDKA 1C0TA 4DU4A 3OYHA 1JKHA 3K58A 2BDPA 5SZTA 1WSJA 2F8SA 4QOZB 1ASUA 3VQ5A 4CJ4A 4E7HA 4B08A 2WONA 4MQ3A 1LV5A 1NOYA 2D0AA 1JLGA 3TAGA 3MXIA 4NCGA 3ZSVA 2BANA 2X6NA 3QO9A 1C0MA 1IKVA 1TL3A 4ZTFA 1TKDA 1W9HA 5J1EA 3NBPA 1RTHA 4O44A 3T1AA 3KLGA 4BE2A 2KFZA 5KI6A 4N5SA 3F73A 3U3GA 4DFJA 3ISNC 1WAFA 2G8HA 1RDAA 1S1TA 3KTQA 1IKWA 3KLEA 2G8UA 5CYMA 3ULDA 3NGZA 3NAEA 1RT1A 3PX4A 4PY5A 4CIGA 3OYLA 3QNNA 1QSYA 1HQUA 4AHVA 3M8SA 3MECA 5T7BA 4E1MA 4FZYA 3P83D 1QSSA 2O4GA 3AVKA 1G15A 3CQ8A 4N41A 1S1WA 3IS9A 3QINA 1WSFA 3LANA 3L2QA 3AO3A 3VQCA 1J5OA 4DFKA 1NJWA 2JLEA 5CYQA 4O0IA 4DTOA 3TI0A 2HHTA 4DS4A 3HL8A 1WSEA 2HB5A 2QXFA 4BWMA 3TARA 2KZZA 1YVUA 2D0CA 3B6PA 3LAKA 4JRPA 5KGWA 2HHXA 4EZ9A 5J2NA 1EETA 3EZ5A 4GMJB 3S3OA 1NK8A 4J2DA 5HRPA 4FJ9A 2XO7A 1WSHA 3RWUA 1NK5A 1RTJA 1CZBA 3KKSA 2Z1GA 4RW8A 4CK3A 3JSMA 4NCAA 2PY5A 3AA3A 4KFBA 1EKEA 2Z1HA 4IBNA 4M42A 1LW0A 1RNHA 4PA1A 4FM2A 3OS0A 2W42A 4B3OA 4RW6A 4IDKA 3NGIA 3QLHA 1VSJA 2ITGA 3NFAA 2XHBA 3CFOA 1U4BA 3O3FA 1X9MA 4CGFA 3T3FA 2HVHA 1KCFA 3PV8A 4FJ5A 4Z4GA 4NYNA 4DTUA 1RT7A 3DRSA 3L3UA 4AHCA 2F8TA 4HCBA 2IAJA 2HVIA 2PZSA 1B9DA 2VG6A 2KFNA 4CHZA 3QEWA 3UIQA 1FK9A 4KPYA 4KHYA 3SPYA 3TANA 3AO1A 1KVCA 3IRXA 1J53A 1HYVA 2P1JA 4GVMA 3QIPA 4H4OA 1XHXA 3LP0A 3IG1A 4DG1A 4IKFA 2JGUA 3CYMA 3QEIA 2DTUA 4CJFA 3KK2A 1HNVA 3KLIA 3KIOA 4CEFA 3LZIA 4BDZA 3G0ZA 2YKNA 4FYDA 3LZJA 4FLWA 2G8FA 1LWCA 2GBZA 2KZMA 1JLFA 4F2RA 4K8ZA 3HVTA 1SKWA 1CZ9A 3NHGA 4DS5A 5E41A 2GV9A 4R5PA 1N6QA 3EYZA 2WOMA 4DTJA 1BGXT 4FXDA 1BQMA 4E89A 3NF9A 4ICLA 3MEDA 4DFMA 3L2VA 3OYCA 1TK8A 2QK9A 4IG0A 1FXXA 5D3GA 4KRFA 3V81A 3AVAA 3QETA 3V9UA 1ZBHA 4IFVA 1S1XA 5I3UA 1TK5A 3V4IA 4HHTA 2X6SA 3ZSYA 4M3RA 1Q9YA 4FJ8A 1HYZA 4CJPA 2IS3A 4B9MA 3LP2A 4DLGA 1XC9A 4FVMA 1NK0A 2QKKA 4OGEA 4KHUA 3ITHA 3LP1A 4CHPA 3ZSOA 4W5OA 4CCHA 1A5XA 2KQ2A 2A1SA 4OLBA 4C8MA 3VQ7A 4KAZA 4H8KA 1QSLA 3AVFA 4Q5VA 4YNQA 1NKCA 3AO2A 4CERA 2FC0A 4O0JA 4C8LA 1HMVA 4OGCA 4BDYA 3ASMA 1S6PA 3AV9A 4O55A 4CFDA 4Z4CA 3O3HA 4W5TA 4E19A 1A5WA 4ELTA 4FLZA 1RBSA 1ZBUA 3WNGA 1WSIA 1TL1A 4CE9A 4RW9A 1CXUA 4F2SA 1GOBA 1WNSA 2Y1IA 4K8XA 3SUNA 1C0UA 4CGHA 2HW3A 1Y97A 4J2AA 1SL0A 2OPSA 4UQGA 4JS4A 1QHTA 4JRQA 3V1RA 5HROA 4KREA 2XY8A 3RMDA 1J54A 3RMAA 2RPIA 4NCBA 3AVHA 3MXJA 4LH4A 2E6MA 1FKPA 1QTMA 2G8IA 1KVBA 1I3AA 4DTPA 4IG3A 1VSFA 3MXMA 4EP5A 3HXMA 3K5MA 1SL1A 1LAWA 1JLEA 1RBTA 2EHGA 3SV3A 4CIFA 5FDLA 3S3MA 1TK0A 1FKOA 3DMJA 4KTWA 2YKMA 4AILC 2OA8A 1VRTA 5KGXA 4DF8A 3SV4A 3PY8A 4DSLA 3A2FA 1RBRA 3AO4A 1RT6A 2G8KA 4FM0A 3OS2A 4TSXA 4JS5A 4DQIA 1BL3A 3DLBA 3LWLA 2B6AA 3LPTA 3DLHA 4DQPA 4AHUA 4OLAA 3AVBA 4BWJA 2XY7A 3HT3A 4KHNA 4FK2A 1NJZA 1CLQA 3AVLA 1RT4A 4CJ5A 3DM2A 4DTRA 4IFYA 1C1CA 1XWLA 1BHLA 4FJIA 4Z4EA 3AA2A 3OS1A 1ZBLA 2RN2A 3L2WA 4CEEA 3PO5A 3HP6A 3P5JA 3DI6A 3CM5A 3QIOA 2HNYA 4DQQA 4KB1A 3NF8A 1YTUA 2XY6A 1ITGA 4DSIA 2GUIA 4EP4A 3VQPA 5JS2A 5EU7A 3BGRA 4DF4A 3PUFA 4Z4HA 3NH1A 4FJMA 3NGYA 4J2BA 4O4GA 1RBVA 3K2PA 3CFPA 5SWMA 1VSDA 3QEXA 4DQSA 2PYLA 4OKEA 4I9QA 4CHNA 1XI1A 4H4MA 1JLQA 4FJHA 1L3SA 4FLVA 1JXEA 3SJJA 3AVMA 4FW1A 1IKXA 1U04A 3ALYA 1NK9A 4CJVA 1VSMA 3S9HA 5DMRA 4Z0UA 3OY9A 4B9SA 4DWIA 5FRNA 4DTNA 3LALA 4DSEA 5J2QA 2HHSA 1DLOA 1X9WA 1NKEA 3QEVA 2PYJA 1A5VA 1NJXA 3M8PA 1S6QA 4CHQA 1Q9XA 1K6YA 4AHTA 2HHQA 4BE1A 5HLFA 1SUQA 4FJXA 3HPGA 1L3VA 1ASWA 3AVJA 2OZMA 1D9FA 4ELVA 1BCOA 3ZT1A 3DRRA 1S9EA 4Y1DA 4LD0A 4HTUA 4RW7A 2P5OA 4AHSA 3V9XA 4FJNA 2FBTA 4CJWA 3V9ZA 3RR8A 3SNNA 2RKIA 4CESA 4RG8A 3SI6A 4LY7A 1NK6A 3OJSA 1UOCA 4W5NA 4BDPA 3H08A 3ZT2A 4B9VA 1JLBA 4ID5A 5CZ2A 4CEAA 4M3UA 1TGOA 2D5RA 3ZSRA 1NJYA 4M3ZA 3DOLA 4KI4A 3NCIA 1RT5A 1LW2A 1BCMA 5KTQA 4DSJA 5FRMA 2OPQA 1VSIA 4E7JA 4CJRA 2HMIA 4M3TA 4ZTJA 1WSGA 3TR8A 4BACA 2OPPA 4B9UA 4L8RB 5DK5A 4FZZA 3AVGA 2R7YA 2G8VA 4CEBA 3V9WA 1RTDA 3TAEA 4CJSA 4CEZA 4CFCA 1C6VA 3K59A 4N47A 1RBUA 3QNOA 4OPJA 3HK2A 1B92A 2IGIA 2KW4A 3SYZA 1LAVA 3PO4A 4CJQA 4PQUA 4BE0A 1F21A 1T03A 1MU2A 4NYFA 4QAGA 3OYMA 4CJTA 3TWHA 1HNIA 4ID1A 1GOAA 4FK0A 5KRTA 1C1AA 5JS1A 3QEPA 1SV5A 2YNIA 1BISA 1VSHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I2PA 1Z6RA 2H3GX 2ETJA 3TABA 5GAHP 5AQHA 2AJQA 4CF2A 3MN6A 3K5NA 5BRDA 5JLHA 3CJCA 1NM1A 2LSNA 5HRSA 1YTAA 4HUEA 1Q8IA 4JLHA 5JVGL 5AZIA 4LFBK 4GV3A 3K57A 2QA4N 5HRRA 5HP1A 4JHDA 3M1FA 3H46O 3NE6A 4ELUA 1U6ZA 3C94A 3DXMA 1C0FA 1DTQA 4FCYA 4H0VB 3A5NC 3RMBA 3I0RA 2F4VK 3R3LA 5E26A 4RW4A 3WQUA 3EE8A 5AQJA 3U8XA 1HJOA 3M8QA 1BG3A 3THXA 1HJRA 3IMXA 1U45A 1TAQA 1ASVA 4BRNA 5HOOA 1TVRA 4JKAA 1IKYA 4Z94A 4IEEA 3O9SA 2QWMA 3H1VX 4FJKA 2QI2A 1N33K 2ZM6K 1QS4A 4Z4IA 1XUPO 5KPZA 4BY9C 4FJLA 4HUFA 1ATSA 3VQDA 5M1OA 1NOZA 2HHVA 3OYKA 3TAPA 4B9NA 4OKKA 4N76A 2F7TA 1N5YA 4CF8A 1KXPA 1NWKA 3VQ4A 4EZ6A 1KLNA 3FZLA 2P9IA 1YJNN 1LWEA 3DOKA 1Q86O 1ZBSA 4FJ7A 3CCMN 4C23A 3IFRA 3LP3A 3O8MA 1S5JA 4OX9K 2FBYA 4DLEA 2UXBK 4I9LA 5CZ1A 4X62K 3EKUA 4IO8A 4FWOA 3WXLA 3DXKB 3TSUA 4DTMA 4CF1A 4M3YA 1N32K 1IG9A 3UKUB 2O8EA 1NGHA 4W5RA 2OPRA 3K5OA 1TAUA 1NMNA 2P9IB 1VQ6N 1EX4A 1O1WA 1GOCA 1TV6A 4PWDA 4QS8A 2BTFA 2NUBA 3D45A 1JL2A 5EXWA 5J2MA 4GW6A 2YNHA 4KTZA 1D9DA 3C6HA 3P38A 4EIAA 1VQ7N 3MAQA 4HCCA 3TAFA 1WB9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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