1LAWA

Stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by cavity-filling mutations within a hydrophobic core
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
b'MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYIRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by cavity-filling mutations within a hydrophobic core.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1lawA00
3QNOA 4QAGA 1ZBLA 4BE1A 3OYLA 4H4OA 3DRPA 4ELUA 3CFRA 4B9SA 1O1WA 4OGEA 4Z4FA 1VSDA 3QINA 1BL3A 1UAXA 4N56A 4O5BA 3DM2A 3L2VA 3CQ8A 1NK8A 4FJMA 3OVNA 2ATQA 3NF6A 2QK9A 3KK3A 3VQ4A 4CGDA 3KKSA 4CGIA 4RW8A 4CEOA 5C42A 3HPOA 1XHXA 1TAUA 3QIPA 3T1AA 4I9LA 4O0IA 4O44A 4BE0A 1ZBHA 4LD0A 2RKIA 3HP6A 4J2EA 3EZ5A 4Z0UA 3DMJA 3SUQA 3ITHA 1RT1A 3M8SA 3C94A 3LDSA 3SPYA 2G8WA 1S1VA 3H08A 4E7JA 3MXMA 2VWJA 3VQPA 1RDCA 3RMAA 3U6FA 4OKJA 3ASMA 3QNNA 3VQ9A 4HCBA 4RW6A 1Y97A 2VG5A 1RT2A 1YTAA 3AVAA 3NFAA 4CJLA 3OYHA 4JS4A 4DTPA 3LPUA 4FJLA 3QIOA 4CGJA 3PX0A 1J5OA 2D5RA 2EHGA 1QSSA 3QERA 3T19A 1BI4B 4EP5A 4DFKA 1J9AA 1HRHA 3AA5X 1WAJA 3DRRA 4CJQA 4O55A 4PA1A 2YNIA 1WSHA 2OPPA 3LPTA 4Q5VA 2P5OA 4B9VA 4M45A 5HRPA 1TAQA 3OYAA 1TK5A 3KTQA 3IS9A 4N41A 4FJIA 3HPHA 1IKVA 4CF1A 2E4LA 4FK0A 4CJVA 2HVHA 1TL3A 1CXQA 1CXUA 1HQEA 3ZT0A 1CLQA 1FKOA 1U49A 3JSMA 4ELTA 1EKEA 2XHBA 1X9SA 4KTQA 4GMJB 5CZ1A 1RDBA 1BI4A 3MXJA 2HHWA 3HPGA 4AHRA 1T7PA 1VSFA 4W5TA 1RBSA 3OYBA 3DLBA 1X9MA 4DWIA 3QO9A 4I9QA 3C6TA 5JS1A 3OYDA 1T05A 3NH1A 1NJYA 4N5SA 3SV4A 3MEDA 3DLGA 3HM9A 3TAFA 1WAFA 3K58A 3THVA 1Z25A 4B9TA 3O3FA 4JLHA 3B6PA 3HL8A 4E1NA 4KHWA 1QE1A 1BISA 1LWFA 1U48A 4KPYA 2FBVA 1QHTA 1D9FA 1JLQA 3HT3A 2F8SA 4BDYA 1L3TA 4Z4IA 4IDKA 2YKNA 5CYQA 4CHPA 4DF4A 4L8RB 1QQCA 4CIFA 4OLBA 2D0BA 3KD5E 3K5OA 3DLHA 4E0DA 3AVGA 4AHVA 1S5JA 2DFHA 2YHAA 3QEXA 3AVIA 3OJUA 3TABA 2GBZA 3DYAA 4M3RA 2HHQA 4CJKA 4EZ6A 3V81A 3LZJA 2FBXA 1VRTA 2YNGA 5EU7A 4CHNA 3K57A 2YHBA 4JRQA 1U4BA 4DFPA 4W5RA 2P1JA 1BCOA 1JLGA 4CJ3A 4NCGA 4FLWA 1Z26A 2X6SA 4CEBA 1RNHA 2G8HA 4FYDA 2GUIA 4OKEA 4CFAA 5J2NA 3PO5A 3QLHA 4RW7A 5KRSA 3M8QA 1ZBIA 1C1AA 1XWLA 3U3GA 3AVFA 3G0ZA 3LP1A 4CEEA 3TR8A 4ZTJA 3EYZA 3DRSA 4KKOA 1BCMA 5KRTA 4PWDA 3OYCA 1ZBFA 1C1BA 4Y1DA 4B08A 2OPQA 2YKMA 3MEGA 3WNFA 3OYEA 1UOCA 1VSLA 2Z1IA 1JLEA 1S6QA 3AVNA 3PV8A 2XRIA 3RR7A 3OYMA 3SZ2A 2Y1JA 5C24A 2HW3A 4HCCA 1RT5A 4DSKA 4IG0A 5FRNA 3LALA 4KB0A 4AHUA 3L2WA 3DLEA 4YNQA 3NHGA 3TWHA 1NKBA 1NK0A 4B3OA 5J2QA 4DTMA 1JL2A 1NJXA 2ZD1A 1FKPA 1KVAA 3IAYA 3RRHA 4ELVA 3VN5A 4MQ3A 2OYQA 4FM0A 4E7IA 3KJVA 4DTRA 1Q8IA 3EY1A 1WSIA 3FFIA 5E41A 3LWMA 4DFJA 1XC9A 4F3TA 1QSLA 4FK2A 1KLNA 1R0AA 3K2PA 4JS5A 4J2AA 4KI6A 3L2UA 1EX4A 4DMNA 3V9UA 1J54A 2P51A 2DFFA 2JLEA 4B8AB 4CJ4A 1ASUA 1S1XA 2BDPA 4M3YA 4KHYA 3CYMA 4CJSA 3RR8A 1LAVA 1S1WA 4KV8A 3KKRA 3VQDA 3ZCMA 2Z1HA 4CGHA 4CJTA 4CK1A 3KD1E 2GV9A 4HHTA 4DG1A 2E6MA 4E89A 1NK9A 1RBRA 1IKWA 3NDKA 3MECA 1NK7A 1S1UA 1RTDA 4CEQA 3TARA 4DTSA 1HPZA 3AVMA 4B9LA 3OS2A 1RT7A 2QXFA 1T03A 2ZQBA 2E6LA 3F9KA 5J1EA 2EX3A 4FLVA 3O4NA 3QEWA 3AO5A 1XI1A 4F2RA 3VQEA 3UIQA 1RILA 3VQ6A 4KFBA 3VQCA 3NH0A 4IBNA 1QTMA 2AJQA 2XY5A 4DLGA 4PUOA 3VA0A 1UWBA 3SQ0A 2KTQA 3LP2A 1WSJA 4WE1A 4H4MA 3L3VA 3K5MA 3CFPA 4CGGA 1D9DA 4IFYA 2G8KA 4J2DA 4BDPA 1NKCA 2DY4A 1JLFA 3RTVA 3PY8A 2I5JA 3K5NA 4HUEA 1N5YA 4CF0A 3AVBA 3I0RA 4J2BA 2HMIA 3ALYA 4FW2A 3F73A 3E01A 1VSHA 4BACA 3G10A 4HUFA 1MU2A 4KRFA 4E1MA 1LW0A 1RTHA 4RW4A 4M3UA 4O4GA 3NE6A 3ZT4A 1KCFA 1QS4A 2OA8A 5FRMA 4FM1A 1U04A 1YT3A 3PX6A 4CJWA 1IH7A 1FK9A 2ETJA 1I39A 2ITGA 3BDPA 5T7BA 4W5NA 4XIUA 1JLAA 1HQUA 3TI0A 3ZSVA 3QESA 4B9NA 3V1OA 1D5AA 1VSEA 3V1QA 3ZSQA 1IKYA 1SV5A 4RG8A 3OYFA 3NCIA 4KHSA 2G8IA 1CZBA 4OPJA 5HRRA 4BE2A 1VRUA 2FC0A 3ISNC 4C8NA 4FLUA 5I42A 4Z4GA 2FBTA 1CZ9A 3LP0A 1NOYA 4C8KA 4FJ5A 3OYKA 4DU4A 2IC3A 4BWJA 3QETA 5FROA 1X1PA 4W5OA 3KLIA 1RBVA 5HP1A 2P5GA 2DFEA 2F96A 3ZSZA 1IO2A 2HHSA 3NF9A 4OVLA 2HNZA 1YVUA 4GW6A 1VSKA 4KO0A 4FJNA 3HO1A 2KFNA 3L2RA 3IRXA 4NCAA 4I2QA 3D45A 4M3ZA 2KFZA 1C0TA 2O4GA 3TAPA 4FW1A 2VG6A 3VA3A 4FZYA 2Z1GA 4DQPA 4QOZB 3DOLA 1KSPA 2OZSA 2X6NA 4CIEA 3SUPA 2W42A 4CHQA 3VQ8A 1TKZA 2KZMA 4FCYA 5JS2A 1RDAA 2VG7A 3SQ4A 1S9EA 2Q3SA 4ZHRA 3M8RA 4K8ZA 3LAMA 2KQ2A 2OPSA 3OYJA 4JRPA 4FK4A 4AILC 1W0HA 3V9SA 1JL1A 3TAMA 4CJRA 1EETA 1ASWA 1K6YA 1YTUA 1RBUA 4DF8A 4EZ9A 5HBMA 1SUQA 3V9XA 3WNEA 3NGIA 2KZZA 2HHTA 1ASVA 3HP9A 4OPKA 4CFBA 4GVMA 4DS4A 1SKSA 4B9UA 3P5JA 2IS3A 2OPRA 5FDLA 1S1TA 1ITGA 4G1QA 4CEFA 1JXBA 1REVA 4KB1A 2YV0X 3HK2A 4DTNA 3OY9A 1LV5A 2XY7A 3OS0A 4CK2A 3D0PA 2PY5A 4NCBA 1DTTA 1GOCA 1JKHA 2G8UA 1BQMA 4LH4A 1BGXT 5CY4A 3ULDA 1EXQA 1TK0A 2RF2A 1G15A 3AA2A 2PYJA 4E19A 1UA1A 4KHNA 3OYGA 1BIZA 2NUBA 3HXMA 4F2SA 3HJFA 1KLMA 3LAKA 1X9WA 3AO3A 2OZMA 4DQIA 3HSTB 3TAQA 1L5UA 4FJ8A 1L3UA 3ZT1A 3KK2A 4FZXC 4IG3A 5KI6A 1DLOA 2KW4A 3S3MA 4C8MA 4DSEA 1RT3A 4FJHA 4M3WA 3QEPA 2FBYA 3C95A 1TK8A 3T3FA 4CGFA 2G8FA 1HYZA 3OYIA 1TVRA 4FJ7A 1KVCA 3KLHA 4N47A 3P83D 5D3GA 2X78A 4F3OA 4M41A 3L3UA 4R5PA 1RDDA 4DTUA 5CZ2A 1TKDA 1WNSA 2R7YA 3V9ZA 3KLEA 3RRGA 4ZTFA 2YNHA 1FXXA 4CEAA 4NYNA 5HROA 2IOCA 4PY5A 3V9WA 4M3XA 3RMCA 4I2PA 4MFBA 1Q9XA 4BDZA 3HYFA 1HMVA 2HB5A 3BGRA 4AHSA 4Z4CA 1JLCA 3SV3A 2HVIA 2ZE2A 3TANA 2VWKA 3LP3A 1RT6A 1JLBA 4CJFA 5HRSA 2X74A 1GOBA 4CJEA 3ZSRA 1NK5A 2B4JA 3MAQA 2F8TA 4CEZA 1VSJA 2HHXA 3DI6A 3HVRA 4LSLA 1SL0A 1A5VA 1J53A 1HJRA 4HVJA 2QKKA 3NBPA 4KAZA 2QKBA 1RTJA 4CF2A 3O4QA 2D0AA 4DQQA 4KTWA 2XY8A 3SNNA 4CHZA 4C8LA 5SWMA 2IGIA 3KLFA 1N6QA 4K8XA 1B92A 3ZT2A 3CM6A 1BHLA 4HUGA 4DQSA 1IG9A 4FXDA 4DS5A 3L2QA 1HNIA 3AVKA 4E3SA 1L3SA 4OJRA 4AH9A 3SCXA 4E7KA 2XY6A 3WNHA 1C0MA 1B9FA 3DLKA 4CFCA 4DU1A 1HYSA 1HNVA 3SYZA 4M3TA 2HNYA 5HRNA 2B5JA 1BQNA 3AV9A 1EP4A 2BANA 1C6VA 3U3YA 2HNDA 4FLZA 4Y1CA 3AVLA 4LY7A 3SPZA 1WSFA 3B6OA 2Y1IA 3SQ1A 3VQAA 1LWEA 3PX4A 4CIGA 3KLGA 4DSFA 4FJXA 4EP4A 1GOAA 1C0UA 5J2MA 1NOZA 4Z4HA 3PO4A 3NF8A 4B9MA 3AVJA 1UA0A 3MEEA 4CE9A 4RW9A 3CFOA 2WOMA 1TKTA 3I0SA 2LSNA 3NF7A 3LANA 4ID5A 3S9HA 3VQ7A 3AVHA 4CERA 4CECA 4FLYA 5KTQA 4PQUA 4DSLA 4H8KA 4CF8A 2G8VA 4CHOA 1JXEA 1RBTA 1A5WA 4CFDA 4W5QA 1NKEA 5KGWA 4FJ9A 1DTQA 1RCHA 4N76A 1WN7A 3V6DA 3O3HA 1ZYQA 3KIOA 5DMRA 2A1RA 1SKWA 3AO2A 3CM5A 1D8YA 2PZSA 2HHVA 1A5XA 3A2FA 1SKRA 5C25A 4KHUA 1IKXA 2A1SA 3QEIA 2D0CA 3IG1A 4B8CA 2DTUA 4Q0BA 4TSXA 3ZSOA 3PUFA 3K5LA 3LZIA 1I3AA 1VSIA 1TGOA 3LWLA 3MXIA 1T8EA 4Z4EA 1TL1A 3RMDA 3O3GA 4M42A 2PYLA 5DK5A 1XHZA 1SL2A 4LSNA 3NAEA 1QSYA 4IFVA 4UQGA 1NK6A 4FJJA 1WLJA 3S3OA 5KGXA 4DFMA 1NJWA 4YFUA 1SL1A 3K59A 3VQBA 1KTQA 1TV6A 3V4IA 1HYVA 1LW2A 3SI6A 1WSEA 3AO1A 1ZBUA 1S9GA 3V1RA 4FM2A 4FJGA 3CG7A 4CESA 4C8OA 2WONA 4E7LA 4FVMA 1NJZA 4CF9A 4CJPA 4I7FA 3VQ5A 4FLXA 4DQRA 3TAEA 3OYNA 4KHQA 4KTZA 3NH2A 2IDOA 4OKKA 2BE2A 1KFDA 4AHTA 4CHYA 4CJ5A 3OS1A 3L8BA 4F8RA 1BIUA 1TKXA 3AA3A 2RPIA 3NGYA 3VQQA 3SJJA 3AVCA 1LAWA 4ICLA 4DTOA 3KK1A 3SUOA 3AA4A 4DTXA 3S3NA 3ZSYA 1KRPA 4FJKA 4ID1A 1U45A 2JGUA 5SZTA 5K14A 1RT4A 3AO4A 3P1GA 3WNGA 4FLTA 5I3UA 1KVBA 4CJUA 3I8DA 1WSGA 4E7HA 3QEVA 2RN2A 1RTIA 3DOKA 4CCHA 4DLEA 5HLFA 3OJSA 3ZSWA 3ZT3A 4CK3A 4HTUA 3JYTA 3SQ2A 2B6AA 3C6UA 4BWMA 1B9DA 3SUNA 1W9HA 4DSIA 2BGGA 2HHUA 5CYMA 2IAJA 3NGZA 3TAGA 3RMBA 4KI4A 1KFSA 4LH5A 1U47A 4F4KA 4FZZA 1L3VA 1Q9YA 3M8PA 4OGCA 4KREA 4CEDA 1NK4A 4NYFA 4O0JA 2O4IA 3DLRA 1VSMA 4AHCA 4DTJA 4QCLA 2XO7A 4IKFA 1F21A 3HVTA 4OLAA 1LWCA 1S6PA 1VK0A 2Z1JA 1C1CA 4DU3A 4DSJA 3RWUA 5J2PA 2YNFA 3ZSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QNOA 4B3MK 4BE1A 4Z4FA 3QINA 4C23A 4N56A 3CQ8A 4FJMA 3NF6A 2QK9A 3KK3A 3EE8A 3VQ4A 3HPOA 3KKSA 1VQ8N 4BE0A 4LD0A 3HP6A 3T7ZA 3ITHA 3WT0A 4X65K 3FZHA 3CCSN 3MXMA 2P9PB 2VWJA 1RDCA 5EOYA 5AQXA 4H5NA 3O9RA 3SLCA 3QNNA 4RW6A 1YIJN 4C1NK 1ESVA 4JHDA 2ASMA 2VG5A 3MK6A 1L3VA 3OYHA 3LPUA 1QQNA 1J5OA 2D5RA 4KH4A 1ATNA 1R59O 3DRRA 4CJQA 4PA1A 2WC9A 2P9KB 3LPTA 2QI2A 3KTQA 3GE1A 3IS9A 3DXKB 3HPHA 3EO3A 2HVHA 1TL3A 1CXQA 4BR9A 1U49A 1Q82O 1X9SA 3MCPA 1BI4A 1T7PA 1X9MA 1GLJO 3NH1A 1XNQK 5ADXA 4XH5A 3OHRA 4UY8O 3TAFA 3VEVA 5C0YA 3B6PA 3HL8A 4H0OA 2UXDK 1QE1A 1T6CA 3ENBA 4KPYA 3AY9A 5FPEA 1L3TA 4O8UA 3C7NA 2YKNA 2FXUA 2YJEA 4DF4A 4L8RB 3THYA 5AQOA 4ILGB 4B9QA 4NXMK 3QEXA 3T69A 3AVIA 3TABA 4BRPA 3MX5A 1ZBSA 3LZJA 3MDQA 2HF4A 2YNGA 4JRQA 2P1JA 4NCGA 4X62K 3LL3A 3BY5A 4FYDA 3ATUA 3VMFB 4O5FA 4HWIA 4RW7A 1ZBIA 2PFUA 3JXUA 4CEEA 4EIAA 1M90O 3TR8A 4ZTJA 4KKOA 1MA9B 3OYCA 2OPQA 3MEGA 5AQFA 4CJ7A 3PV8A 1O13A 3OYMA 3SZ2A 1VQMN 5AQZA 2HW3A 4HCCA 2D0OA 3L2WA 3TWHA 1NK0A 2P9NA 3EEQA 4B3OA 4DTMA 1NJXA 1FKPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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