1LAWA

Stabilization of escherichia coli ribonuclease hi by cavity-filling mutations within a hydrophobic core
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYIRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Stabilization of Escherichia coli ribonuclease HI by cavity-filling mutations within a hydrophobic core.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1lawA00
4YFUA 3KK3A 1U4BA 4FJLA 4QOZB 4KKOA 4RG8A 4Q0BA 1KCFA 1BISA 2HW3A 2D5RA 4CK1A 1X9WA 1FXXA 2Q3SA 3JSMA 1IH7A 1D5AA 4GMJB 3V9UA 1T8EA 3OS0A 3UIQA 3L2UA 1C0TA 3MXJA 3ZSVA 4K8ZA 5J2MA 1O1WA 2FBXA 3KTQA 4W5TA 3TARA 4LSLA 4PQUA 1WSHA 1NK5A 4M3TA 3DRPA 3HP6A 4TSXA 3NH2A 1KVCA 3L8BA 1LV5A 4DFPA 4CEZA 4NCBA 4DTNA 1LAVA 4FM0A 1FK9A 3TWHA 3ZT2A 3SPYA 3EZ5A 4ELVA 4B9UA 4FZXC 2RPIA 5CZ2A 1RDBA 4BE1A 1NJYA 1S9EA 1SKWA 4EZ6A 3KLFA 4DTOA 1Y97A 3SPZA 2PYJA 4FJ5A 3HK2A 5JS1A 3V1RA 1YVUA 4Z4HA 4CJLA 3QLHA 1VSEA 4HCBA 3NF8A 3C6TA 3OS1A 3HXMA 1NKCA 3K58A 4DSLA 3ZT3A 3RRHA 2O4IA 2KZZA 3LAMA 3OJSA 4PUOA 3S3OA 1RNHA 1HNVA 1UA0A 2Z1JA 1HYZA 5D3GA 3KLGA 3NGIA 3RMDA 4LH5A 1VK0A 1J54A 3MEEA 3DYAA 1IKYA 3AO5A 2HHUA 1LAWA 1KLMA 3T1AA 1MU2A 3QNNA 1D9FA 1K6YA 4CEFA 4OVLA 1RDDA 3HO1A 1KVBA 3AVNA 3RRGA 2ZQBA 3QO9A 1W0HA 3BGRA 4M3UA 5KTQA 2HMIA 1S1XA 3VQ4A 5C42A 3LP1A 1REVA 5E41A 4N56A 4FJIA 5HRPA 1SL1A 4I9QA 4PWDA 2P51A 4CEQA 3AO2A 4CFAA 1WAFA 1VSFA 1FKPA 3O4QA 5T7BA 1SKRA 1QSLA 1Q9XA 1NJXA 1ASUA 1BGXT 1EXQA 4CF8A 4CJVA 4DMNA 4DF8A 1NJZA 4RW8A 1RT6A 3HT3A 4BDYA 3LP2A 3K59A 4XIUA 3HM9A 1KFDA 1VSJA 4BWJA 3VQQA 1JLQA 1ZBFA 1S1TA 2ITGA 3RR8A 4CHZA 4DFMA 2YV0X 4DU1A 1C1AA 3AVJA 4LSNA 1RDCA 3HVTA 4ICLA 4R5PA 4B8AB 1BQNA 4O5BA 2R7YA 3KLEA 4F4KA 4FZYA 4FJKA 1HMVA 3O3FA 3U6FA 3CYMA 3QERA 4KI4A 1QE1A 1NOYA 3QESA 4EZ9A 4H8KA 4CEOA 3VQ6A 3DLGA 3QINA 4DQRA 4DTXA 4FJ7A 3H08A 1WSIA 4B9SA 1A5WA 1JXBA 2HB5A 5HLFA 4KREA 2I5JA 3PO4A 2JGUA 1RTIA 3WNEA 4CHYA 3NBPA 3BDPA 4CK2A 2HVHA 3SV4A 4E7IA 4KV8A 3VQPA 4AH9A 3KK2A 1KRPA 4FJ8A 2BANA 4KTZA 1D8YA 3NH1A 1HRHA 3V9WA 1JLGA 1RTHA 3MXIA 1SKSA 4F2RA 4HVJA 4DF4A 2F8SA 1ZBUA 4PA1A 1R0AA 1G15A 2DFHA 2RN2A 3M8RA 4KTQA 4AHSA 3KIOA 3V9SA 2G8KA 3KLHA 4DSIA 3VN5A 2AJQA 1S1UA 4FJNA 1BHLA 4BDZA 3VA0A 4KRFA 2ATQA 5I3UA 4IBNA 4DS5A 2Z1GA 1QSYA 3P1GA 1QS4A 3I8DA 2RF2A 1TL3A 3C6UA 3AVIA 1J53A 3AVLA 3ZSZA 1DTTA 3B6OA 2XHBA 1GOCA 3PX0A 4FJ9A 1UWBA 4FM1A 3SYZA 3SQ1A 1EP4A 2HNZA 2YNHA 4CHNA 4PY5A 1JLAA 4MFBA 3QETA 4E7HA 3U3GA 4AHUA 4FVMA 1UOCA 1B92A 2Z1IA 3LZJA 3M8PA 4E7JA 1CXUA 4DU3A 5EU7A 4E0DA 2F8TA 4CEDA 5KRTA 2HHWA 3DM2A 2X6SA 3C94A 4O4GA 2X6NA 2D0AA 2G8WA 2HNYA 3DI6A 5CY4A 4CEBA 3THVA 2D0CA 5CYMA 3NH0A 2A1RA 4F8RA 3EYZA 1RDAA 1WSEA 1HYVA 3TAFA 2OPRA 3M8QA 3G0ZA 2G8IA 4O44A 3DLHA 3VQ8A 4DQIA 4CGJA 3S3MA 1KSPA 2XY8A 2PZSA 4M3RA 4O0IA 4Z0UA 2WOMA 2YKNA 4DSJA 1J9AA 4N47A 3OYFA 4HHTA 3HL8A 3OVNA 4KAZA 1WSJA 1TK0A 4CJWA 4W5QA 2VG7A 4OLBA 4OLAA 1LWCA 4NCGA 3RR7A 3SCXA 1L3UA 4BACA 1GOBA 1HQEA 3V81A 1LW0A 4DSEA 4FXDA 3C95A 4M3WA 4JLHA 3VQBA 3LAKA 4DFKA 1JLEA 4B9LA 1T03A 4M3XA 3QEWA 4IFYA 1HYSA 1NK8A 2LSNA 4ZHRA 4BDPA 1BIUA 5HBMA 1SV5A 3AO4A 1WAJA 3HSTB 1Q9YA 1T7PA 4H4OA 1TGOA 1BI4B 3TAPA 3OYKA 1YT3A 3LZIA 2BGGA 3E01A 3KKSA 4CFCA 1RBSA 4OGEA 1Z26A 1X9SA 3ZT1A 4CJSA 3ZSQA 2HVIA 2XRIA 1JL1A 3KJVA 1KTQA 1LWFA 5J1EA 3ZSOA 3CM6A 3ASMA 3TAMA 2X78A 3VQ7A 1TV6A 4CIGA 2B5JA 5CYQA 4CJTA 4FM2A 2OA8A 4O55A 4OGCA 1BCOA 4FCYA 4W5NA 3HP9A 3QIPA 2IOCA 3A2FA 3AO3A 3PUFA 3CFPA 3V9XA 3VQEA 5HRNA 3OY9A 3NGYA 3QEVA 1L3TA 3DLBA 3TANA 2GV9A 5FROA 2ZE2A 4CK3A 4CJUA 4LY7A 3TAEA 2P5OA 3KKRA 5K14A 1U49A 1KFSA 3VQ5A 4H4MA 3T19A 4RW4A 1RT5A 2F96A 1YTAA 4E1MA 4CJ5A 5J2QA 1Q8IA 4FLTA 2XY5A 3G10A 3HVRA 3LALA 4QCLA 4AHRA 3AVBA 3CQ8A 4KPYA 3QNOA 2O4GA 4CJ3A 3AA5X 2QKKA 3HYFA 1ASWA 3K5NA 3RMCA 4JRQA 1DLOA 1U47A 1L5UA 3ITHA 2BDPA 1JLCA 2VG6A 4BE2A 4Z4GA 3OYGA 2KTQA 4CJQA 4B08A 2HHQA 1RTJA 1IKVA 4GVMA 3FFIA 3OYMA 1A5VA 3D0PA 3TI0A 1RT7A 4M3YA 4CJ4A 4FW2A 3P5JA 4FLVA 2WONA 1VRTA 1UA1A 4W5OA 4DQQA 3IS9A 2QK9A 4BWMA 4LH4A 1CXQA 3O4NA 2HHVA 3AVGA 4HTUA 4C8LA 3AA2A 4FLWA 1VSDA 3LP3A 1NK9A 4KHUA 3SUNA 4FK0A 3QEPA 1JLBA 1XI1A 4CHOA 4CGHA 3HJFA 1EX4A 2X74A 3U3YA 1BCMA 1QHTA 2W42A 4J2BA 2DY4A 3CFOA 1QTMA 4OKKA 4CHQA 4F3OA 4WE1A 1U48A 2YNIA 3DLKA 3WNFA 4CF9A 4I2QA 3SUOA 2OZSA 3NE6A 1JKHA 4M3ZA 3SJJA 3DOKA 4KFBA 4CCHA 1TKXA 4K8XA 4Z4EA 4JRPA 1C1CA 4KO0A 4KHYA 3JYTA 4DTSA 2KZMA 1EKEA 2A1SA 4AILC 4AHCA 3NCIA 4FLYA 3S3NA 1S9GA 4CESA 5KGWA 1QSSA 4KB0A 4KB1A 5I42A 3ZT4A 1RT1A 1VSHA 4CFDA 2VWJA 1IG9A 1VRUA 1TKDA 1BQMA 2XY6A 4AHVA 1IKWA 2E6LA 1UAXA 1CZ9A 2KQ2A 3P83D 3PX6A 3NHGA 4NYFA 5HROA 3RMAA 1FKOA 3NFAA 1A5XA 3VQDA 3CG7A 4DTPA 5FDLA 1RT4A 1C6VA 3LPTA 4Y1CA 4C8NA 2JLEA 3DRSA 4GW6A 4EP4A 1IO2A 1IKXA 3T3FA 4KHSA 2D0BA 3AO1A 2RKIA 4YNQA 3SZ2A 3TAQA 1S6QA 4N41A 5FRMA 1WSGA 1RBRA 4DFJA 1L3VA 4NYNA 3LP0A 4N76A 1J5OA 4OPJA 4E7LA 2HHXA 2HNDA 4B9TA 4CJPA 3D45A 5HP1A 3ZSYA 1X9MA 5SWMA 1YTUA 4F3TA 1HNIA 1TKTA 3KD1E 3SNNA 5J2PA 3LWMA 1TL1A 3L3VA 3WNHA 3DMJA 3VQ9A 1KVAA 2GBZA 4CERA 2VWKA 2BE2A 5C25A 3CFRA 1RTDA 3K2PA 2IC3A 4E89A 3V4IA 3ULDA 1JL2A 1XHXA 1EETA 3SI6A 3V6DA 5SZTA 3RMBA 4QAGA 3NF7A 3AA4A 2PY5A 2DFFA 1ASVA 4UQGA 3MEDA 1KLNA 3SUQA 1BIZA 4B9NA 1NKBA 2FC0A 1RILA 3OYHA 3ZCMA 5HRSA 3L2WA 4FLXA 4DQSA 3KK1A 4DTJA 2E6MA 4CJRA 1S5JA 1TVRA 3F9KA 4HUFA 1XWLA 3OJUA 4DTMA 3NF9A 3MXMA 1ZBLA 3IG1A 4CJFA 3OYBA 4CHPA 4HUGA 5C24A 1I39A 1Z25A 1HPZA 3DLEA 4CGIA 4CE9A 3LDSA 4CJEA 4DQPA 4KHQA 4B3OA 4FJJA 4CF2A 1LW2A 2FBVA 1NK6A 4DTRA 4FJXA 1CZBA 4FLZA 1RT3A 1NOZA 3MECA 1ZYQA 4CEEA 2Y1JA 3CM5A 1HQUA 2YHBA 3HPOA 3F73A 1TKZA 3OYNA 3K57A 1TAQA 5HRRA 1C1BA 1N5YA 3PX4A 4RW7A 3LANA 4CEAA 4DU4A 3QEXA 2G8FA 2OPPA 3RWUA 1NKEA 4Z4FA 4Y1DA 3QIOA 3I0SA 4FW1A 3K5LA 3OYAA 4M42A 4I9LA 4DSKA 4E19A 4JS5A 5KRSA 3V1OA 4L8RB 4IG3A 2XY7A 4FZZA 1XHZA 4DTUA 1HJRA 2QXFA 3ISNC 4KI6A 3AVHA 1VSIA 1WSFA 1RBVA 4BE0A 4FK2A 4Z4IA 3ZT0A 2OYQA 3AV9A 1RBUA 3SV3A 1NJWA 3OYEA 3KLIA 4C8OA 1L3SA 4FYDA 4Q5VA 3DRRA 4OKJA 4W5RA 3QEIA 4DWIA 1U45A 1VSMA 3SQ4A 4M45A 3TAGA 2KFNA 4B8CA 1QQCA 2FBYA 4I2PA 4C8MA 4ELUA 3AVFA 1I3AA 3OYIA 3V1QA 2OPSA 3OS2A 2VG5A 4E1NA 4FLUA 2YKMA 1S1WA 5KGXA 3K5OA 1BI4A 2NUBA 1BL3A 2YHAA 3MAQA 3SQ2A 4FJHA 3L2RA 3L2QA 3ZSWA 3SQ0A 4DG1A 3HPGA 2DTUA 4OKEA 3IAYA 3M8SA 3NDKA 3EY1A 3NAEA 2KW4A 3ZSXA 1T05A 3ALYA 3DOLA 4IFVA 1TK8A 1D9DA 1W9HA 2B4JA 4CJKA 2XO7A 4J2DA 4ELTA 1S6PA 4HUEA 4DLEA 3NF6A 4IG0A 3AVKA 1XC9A 1NK4A 2OZMA 5DK5A 2ZD1A 4DLGA 3AVMA 3HPHA 1S1VA 3L3UA 4CF1A 3VA3A 4G1QA 3OYCA 4JS4A 1CLQA 4O0JA 4ZTJA 4LD0A 1F21A 4DSFA 2HHSA 4NCAA 1TAUA 1GOAA 4CECA 2FBTA 3I0RA 1RT2A 3WNGA 3NGZA 2OPQA 3O3GA 1SL2A 4F2SA 2KFZA 1LWEA 4MQ3A 1NK7A 1WN7A 3LPUA 4C8KA 2EX3A 1B9FA 3OYLA 1N6QA 2EHGA 3AVAA 4DS4A 5JS2A 1VSLA 3VQCA 3PV8A 4ID1A 2IGIA 4CF0A 4CIEA 1TK5A 4CGGA 4IKFA 3K5MA 4FK4A 4ZTFA 4E7KA 1ZBIA 2GUIA 3MEGA 1JXEA 1RBTA 2G8UA 1JLFA 1VSKA 3V9ZA 1B9DA 3L2VA 4KTWA 2QKBA 4B9MA 4M41A 3VQAA 1U04A 3B6PA 5J2NA 3OYJA 1WLJA 1WNSA 4IDKA 4N5SA 4CGDA 2Z1HA 3PY8A 4FJMA 3IRXA 3S9HA 5KI6A 3AA3A 4J2EA 3SUPA 2ETJA 5FRNA 2DFEA 4E3SA 3LWLA 1C0UA 2HHTA 1ZBHA 1ITGA 1X1PA 4ID5A 1DTQA 4CIFA 4EP5A 1RCHA 4OPKA 3PO5A 2YNFA 1SUQA 4J2AA 2PYLA 4AHTA 4HCCA 5CZ1A 5DMRA 3OYDA 3O3HA 4RW6A 2IDOA 2B6AA 2G8HA 3ZSRA 2E4LA 2P1JA 3TR8A 4CFBA 4Z4CA 1SL0A 3KD5E 4KHWA 4OJRA 4CGFA 2P5GA 3AVCA 2YNGA 3TABA 3RTVA 4KHNA 2IS3A 3DLRA 4I7FA 4FJGA 2IAJA 1NK0A 4B9VA 4RW9A 1C0MA 2G8VA 2Y1IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YFUA 3KK3A 4FJLA 4QOZB 4BR0A 4DR5K 4KKOA 1LCUA 1BISA 1NGDA 2D5RA 1FXXA 3HM8A 3JSMA 3FGUA 3UIQA 1C0TA 3MXJA 5J2MA 1XUPO 3TARA 3DRPA 3VGKA 4JEPA 5BRDA 4NCBA 1LAVA 3ZT2A 3SPYA 1P8ZA 1NJYA 1T6CA 4EZ6A 1Y97A 3SPZA 1YVUA 4BRNA 4Z4HA 1TYQA 1VSEA 1Q7YO 3C6TA 3OS1A 2VCPA 4OPAA 3ZT3A 4H0YB 3PIPL 4EFHA 3ID8A 1YHQN 4PUOA 4GKKK 1VK0A 4YY3K 3VGLA 1N34K 3EL2A 1WBBA 4PHTX 1MU2A 1C0GA 4CEFA 4OVLA 1JJ2M 2ZQBA 1W0HA 3BGRA 1YJWN 4FJIA 1REVA 2P9IA 4L3QA 4PWDA 2P51A 4CFAA 1NJXA 4IO8A 3CPWM 1ASUA 1EXQA 3O9SA 4DMNA 4BR9A 3K9KA 4PL8A 2ZGYA 3R3LA 5AJ3K 3MMVA 1VSJA 4BWJA 3KWGA 4OPHA 3MN6A 2ITGA 4A61A 1OVYA 2YV0X 4DU1A 1C1AA 4DV1K 3AVJA 3HVTA 4ICLA 4R5PA 1BQNA 4O5BA 3KLEA 1SZ2A 1QE1A 3QESA 4EZ9A 4MDBA 2AP1A 4H8KA 3VQ6A 4DQRA 4DTXA 1WSIA 4B9SA 1A5WA 1EWQA 1JXBA 4WYBA 5HLFA 2JGUA 4DR3K 3J7ZO 3BDPA 3SV4A 4KV8A 2PBDA 3VQPA 3KK2A 3KZBA 4FJ8A 2BANA 5FRNA 4Y0WA 4F2RA 4BRGA 1QQNA 4DF4A 5AQFA 2RN2A 4KTQA 3V9SA 4KHPK 3J7YP 4BDZA 3VA0A 1X9JA 1W7AA 5I3UA 2WTUA 3VGMA 3AVLA 3B6OA 1NBWA 4AQYK 1NGIA 4B1YB 2YNHA 1JCFA 1JLAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5H1S Q;  4FLU A;  1S1W A;  3ULE A;  3K5O A;  1BI4 A;  4YDU A;  4FJH A;  3HPG A;  4OKE A;  3IAY A;  2KW4 A;  3ZSX A;  4IFV A;  3CCR N;  1TK8 A;  1W9H A;  4ELT A;  3AVK A;  1XC9 A;  3L3U A;  4G1Q A;  5GIN A;  3P38 A;  4JS4 A;  4LD0 A;  4DCH A;  4DSF A;  2HHS A;  1GOA A;  3O3G A;  3NGZ A;  2QWM A;  4F2S A;  4LFC K;  1R59 O;  1WN7 A;  5GAE P;  5FPN A;  4IOC L;  2EHG A;  3AAR A;  1VSL A;  3L4I A;  3CC7 N;  4ID1 A;  1TK5 A;  1QZ6 A;  4JNE A;  4CGG A;  4IKF A;  3K5M A;  3MEG A;  1JLF A;  1VSK A;  1VQN N;  4H5N A;  4YHH K;  3K9J A;  1SS6 A;  3B6P A;  3OYJ A;  5M1Q A;  4IDK A;  3FR0 A;  4FJM A;  3S9H A;  5EY4 A;  3AA3 A;  5AQY A;  5M1K A;  1C0U A;  2HHT A;  4JKG B;  1RCH A;  1VQ6 N;  4AHT A;  4CBX A;  2V51 B;  4RW6 A;  4NXM K;  2E4L A;  3VTI A;  4B1Z A;  3TR8 A;  4CFB A;  5I9E B;  3TAB A;  2ASO A;  2IS3 A;  4FJG A;  4GVE A;  2IAJ A;  1NK0 A;  1YJN N;  2Y1I A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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