1ILYA

Solution structure of ribosomal protein l18 of thermus thermophilus
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
RLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALALGIKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Thermus thermophilus reveals a conserved RNA-binding fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBOSOMAL PROTEIN L18
molecule tags Rna binding protein
source organism Thermus thermophilus
total genus 18
structure length 90
sequence length 90
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ilyA00
3CCSN 4WF9L 1KC8O 3DLLL 3CCEN 1Q7YO 3CC2N 3CCLN 1ILYA 4UY8O 3CMAN 5DM6L 2ZJPL 3CC7N 3I56N 1KD1O 1VQ9N 3I55N 4IO9L 1VQKN 1W2BM 1Q81O 3CCQN 1VQ4N 5GAGP 2ZJQL 5GADP 1YJ9N 1YIJN 1VQLN 4WFNL 3CXCM 1VQMN 1VQ5N 3CCVN 3CCMN 1M1KO 1VQ8N 5DM7L 3CMEN 3G71N 2ZJRL 3CPWM 1YJWN 1YJNN 1KQSM 5JVGL 2QA4N 3J7ZO 1YITN 1YHQN 1VQON 1N8RO 1K8AO 2OTLN 5H1SQ 4IOCL 3CCUN 5HL7L 1QVFM 4U67L 2QEXN 5GAHP 1QVGM 4WFBL 1JJ2M 1NJIO 4IOAL 3CC4N 1VQPN 1OVYA 1S72N 1M90O 3G6EN 3CF5L 3G4SN 1VQ6N 2OTJN 1Q86O 5JVHL 3CD6N 1VQ7N 4WCEL 1YI2N 3CCRN 3PIOL 3CCJN 1K73O 1VQNN 3OW2M 1K9MO 5MLCQ 1Q82O 3PIPL 4WFAL 5GAEP
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THYB 3C0BA 4GY2B 2HHXA 2A5XA 1KC8O 2YNIA 3CIPA 1NMDA 4BRMA 2FXUA 4JLHA 2VQEK 3CC2N 1GOAA 4B1ZA 3CMAN 1RCHA 3OYFA 1RDAA 3JAMO 4MO5A 3OY9A 1XNQK 4IJAA 4AHVA 3HVRA 2D0AA 1HKBA 1TYQA 3HP9A 1SQKA 3A5OC 3NGZA 3GOIA 2Q3SA 4H0PA 2XRIA 4EP5A 4CF2A 1TK0A 5BPNA 3EYZA 2ZD1A 1HNIA 4RW4A 4JKGA 3SK3A 4H5WA 2YCHA 1SL2A 5DMRA 4BR5A 3SBGA 3L4IA 4FCYA 3VENA 3O3GA 2B4JA 2ZM6K 1S1TA 1VQMN 1V4TA 4A2AA 1U49A 3CHWA 4KHSA 5ELZA 1L3SA 2AJQA 3MWTA 3TAPA 1XHZA 4M3ZA 3U8XA 2HVHA 3RMBA 3I0SA 4ELUA 2ZJRL 5BPMA 4B9NA 4YY3K 2PZSA 3K5OA 4CHOA 5C12A 1RT6A 3DLGA 3H3NO 4FM0A 3HK2A 3OYDA 2P9IA 4C8LA 5C15A 1U04A 4OPHA 4CJQA 4RW9A 2F9TA 5JICA 2RF2A 1JL1A 2Q0UA 3E66A 3MXJA 4DUZK 2JWKA 3NAEA 4DTJA 4F3TA 2IVPA 3NHGA 1IBMK 1T6CA 1ASUA 1T03A 2P9PB 1VQ6N 2O8BA 3ASMA 1W97L 4H0TB 4O0JA 5GIOA 3RSEA 4DCHA 1LAVA 3U3YA 1VQNN 2YHXA 4OPKA 5GIPA 4Q0BA 1JLBA 3H6EA 3OBYA 1RDWX 4F2RA 5EX5A 4EZ6A 3F2KA 2HB5A 4PY5A 2W6KA 3V81A 3D45A 3KVGA 2YJFA 1U48A 4W5QA 4DTNA 2P9KA 3L4QA 2OCEA 2HHVA 3HBTA 1FKPA 5KQ8A 1JKHA 4DV3K 1OH7A 3K5MA 1RT1A 3ZSOA 1NGAA 3AVAA 1ZBFA 3CM5A 4O44A 3CC7N 4KI6A 3I55N 4EIAA 3HSCA 2A6AA 5J2NA 3NDKA 5AFUA 1BWFO 2UXBK 1TVRA 3CCQN 2VQFK 5AQPA 4DQ8A 3VN5A 4CBUA 4H5TA 1NGDA 4CK1A 4BR9A 4LSNA 4WFNL 3DLKA 4BVOA 4JHDA 1XC3A 2IOCA 4FJJA 4FK0A 4E1JA 4DSEA 5KGXA 3N4QA 4AHRA 3M3ZA 5J1EA 2HHTA 2ZE2A 2IAJA 2KFNA 5IT9O 5JVGL 5AZIB 4JD2B 5HBMA 2KHOA 3WXMB 2GEMA 4CECA 1TV6A 2EX3A 4O55A 4M3YA 1NKCA 2XY8A 3KK7A 4OKJA 4H0XB 2QK9A 4H5NA 3LM2A 1TAUA 1VQPN 3KWGA 4BE0A 3MEDA 3I0RA 3LDQA 3AO3A 1N32K 3K59A 5M1NA 1GLBG 1WAFA 3DLHA 1KLNA 1UA0A 3S41A 1SKWA 4B9UA 4JI3K 4CESA 1QZ6A 1T3VA 5BRHA 1Q8IA 3LWMA 5HOOA 4CD3A 4O5FA 5BR9A 4H0VB 3V9WA 1A5WA 5AQJA 5JS1A 1W9HA 3O1WA 4BRKA 4N5SA 4GKJK 2E1YA 1HKGA 2YHBA 3QNOA 3M1FA 4WF9L 1IKYA 3UIQA 1DT9A 2O8DB 4E7HA 3DXMA 4ELTA 4JKHA 1NWKA 1BOTO 2DPNA 1EX4A 1WSIA 2IS3A 2X74A 4OJRA 4IFYA 5AQRA 3THVA 3QFPA 3SNNA 2BH1A 3LANA 3QEIA 4DFPA 5BPLA 1BQNA 1EKEA 4M41A 4X65K 4CGFA 1CXQA 4FO0A 2YJEA 2KQ2A 1RDDA 2E6MA 3HOSA 4A57A 3NGIA 2RHKA 2BE2A 2WUSA 1ATSA 2FLOA 4DLEA 4C23A 4LY7A 2WONA 4FJXA 3O5BA 4XH4A 4DV2K 3PLAA 2HHHK 5AFUH 3G71N 1RTJA 4FL9A 4YOUA 4DS4A 1E4FT 1UAXA 3BZKA 3S3OA 4B9TA 1ASVA 1DTTA 1NGJA 4DTSA 1E4GT 4ZHRA 4LH5A 1VSLA 1JJ2M 3OYNA 3NH2A 4A5AA 2NRXA 3M8SA 1Q9XA 1RBUA 3I8BA 4C8NA 2O4GA 4PUOA 3O9UA 3PO5A 3OS2A 4CJRA 3VA3A 1CZAN 4FJ7A 3SPYA 4WYBA 3VGMA 2NRWA 2B5JA 3ZETB 3ZT0A 1D4XA 2BUPA 4CZFA 4BR4A 1EQYA 3AA3A 2OPRA 3ZEUB 1IG8A 4BRGA 3QEVA 4CJWA 4E7JA 4F2SA 4B1XB 5GAEP 4NB4A 3TTCA 4CEFA 4F9OA 5D3GA 3AVKA 3K9JA 3KD1E 2OYQA 4RCHA 3CCLN 5LJVA 4M3XA 3LDPA 3TSUA 3VF6A 4Z4FA 2ZWHA 3CI5A 4FW2A 4QS8A 3I8DA 1TK5A 3NCIA 3ZSYA 4PA1A 4DSKA 2CH6A 5AQFA 4HCBA 4IKFA 3JYTA 1KD1O 1HPZA 2VYPA 4PKIA 4B1YB 4I6MB 3RRGA 4CE9A 3THYA 1GLFO 3R6MA 5CHIA 5GAGP 4JKEA 3VGKA 4DFKA 4KHPK 1RTIA 1BG3A 5BRDA 4DV4K 1HYSA 3IFRA 4LFCK 2XO7A 4CJLA 3TSPA 3VEYA 1KTQA 3P1GA 3KJVA 5H1SQ 3HOTA 4IOCL 2JLEA 1EWQA 1TAQA 4YDUA 3KLHA 3AAQA 4NXNK 5GAHP 3AA4A 5BN8A 4G1QA 4KH4A 4DR5K 4FOEA 1ZXOA 4BRPA 3D0PA 1KXPA 1NBWA 5AQOA 3U4LA 3WXJA 4C8KA 2KW4A 3VEOA 4CHPA 4I7FA 5KPZA 3A5LC 4KHYA 5BRFA 5JVHL 3NF7A 3VQEA 4BREA 2QWPA 2E20A 1NK5A 4KV8A 1I3AA 5A2QO 4AHTA 4Z0UA 1NOZA 3L0QA 3OYKA 1QQNA 2HBKA 1J5EK 3K2PA 2FSKA 3V9XA 3MDQA 3H3OB 2P9PA 3M8RA 5CY4A 3ITHA 1NGBA 3NVMA 3VQAA 2P9UB 2NZTA 3AVCA 4FWQA 4FOIA 1X1PA 3AV9A 4BRFA 4IXCA 1NJZA 3CJ7A 3PO4A 4DU4A 3HSTB 3V9ZA 5I3UA 3S3MA 4N47A 1Z26A 3QB0A 3MEEA 3ATUA 4NXMK 1BISA 1QS4A 3QO9A 4KKOA 2VWKA 5SZTA 5LMUK 4XH1A 4KAZA 3AGRA 1RT3A 4M3WA 3CJ9A 4BDPA 3SUPA 1ZBIA 3SCXA 3R8EA 1M1KO 3GBTA 3PSFA 3VF4A 3C95A 3VQPA 1KAXA 1U2VB 4O8UA 4QS9A 1HJOA 2JWLA 4ID1A 3QINA 3V1QA 4HVJA 3T1HK 2F8SA 4PQUA 3K0SA 1YHQN 3RR8A 4YDUC 3MN7A 3CETA 1WSEA 4LD0A 4DV5K 1RTDA 4JEPA 2EWSA 5HLFA 4NCBA 2XY5A 3V6DA 4JI7K 2G8KA 1RBVA 1RGIA 3NF6A 4JNEA 1VSDA 2HF3A 2IDOA 4CIEA 1LWCA 3CF5L 2G8VA 4FWLA 3IS9A 5AZIA 4JD2A 2J4RA 3BF3A 4DB3A 1W0HA 4HWIA 2V7ZA 3OYAA 5F0XA 3CCRN 2HOEA 2RKIA 4M3TA 1HJRA 4L8RB 2BDPA 4DQRA 1SS6A 4FJ5A 1NKEA 1F21A 3AO5A 1SKSA 4LF8K 1JLEA 4KB1A 5F1XA 5E41A 2NRVA 3RRHA 3CG7A 1CZBA 1IV0A 2E2PA 2HMPA 4K41A 4RW7A 4CW7B 2P51A 1KRPA 3DLRA 1C0TA 3TI0A 4CZLA 3OBWA 3BF1A 1T05A 1IKXA 3WQUA 5SWMA 1RBRA 3G25A 1YVUA 2GWKA 1HYZA 4GNIA 4JK8A 4DTXA 1VQ9N 2ITGA 5FLXO 2B6AA 2HNYA 2LSNA 4CEBA 2O8FB 1VQKN 2O8EB 3MWPA 1YUWA 3G0ZA 3AARA 1WN7A 1DGKN 1X3NA 3ZT4A 1HPMA 5C10A 4GVEA 2O8DA 2Q1NA 3P4IA 5FROA 5M1QA 3FZMA 1REVA 2YNFA 1GLAG 4WQ5A 4CBWA 2HHUA 1WBDA 4KH5A 1J5OA 3CMEN 1S9EA 3VMFB 4BGBA 1SKRA 1IBLK 5AJ3K 1YJWN 1ESVA 5AQZA 4FM1A 2QA4N 1XQSC 3IMXA 3LALA 3DLEA 3SJHA 4Z4CA 3D2FB 1KAZA 2QEXN 2F9WA 1X9WA 2VG7A 1ZBUA 3LP2A 4FZXC 3M8QA 1Y64A 2Z1JA 3R3LA 4DR4K 2ASOA 3AVFA 4DU3A 1BDGA 4CGIA 3QNNA 5C2DA 1RNHA 3VTHA 3TR8A 3F9KA 4MDBA 2H3GX 4FYDA 1TKDA 4FJKA 3AO1A 4DS5A 3M8PA 4DLGA 4YOYA 3C6AA 3TU5A 1Q9YA 3IRXA 2A42A 4HUEA 1IJJA 1BIZA 1NJXA 4UQGA 5HROA 4FLUA 1K73O 3OW2M 2KTQA 3VF2A 4E1MA 4B9MA 4AHSA 4CBXA 4CZMA 4CI6A 1FXXA 5KPTA 1ITGA 3VGLA 1OH5A 2XY7A 3A5NC 3NBPA 1NK9A 3ZSQA 4MQ3A 3PX0A 2E6LA 5KQDA 2P5GA 4EP4A 3K9KA 1TL1A 1DLOA 3HP6A 2GUIA 5KRTA 3ZETA 1DKGD 3J7AP 2BGGA 3QLHA 2DFEA 4CHZA 4B3RK 4DQPA 3SBTA 3H08A 4B3OA 3U9DA 3NVKA 3KK3A 3ZEUA 1OH6A 2ZGYA 3G10A 4DTUA 2FC0A 4I2QA 4H8KA 1JCFA 3C7NA 2F96A 4DSFA 1R59O 1W7AA 3IG1A 5AR0A 1SAZA 3LPUA 4DV7K 3C65A 4JRQA 4IDKA 1U47A 2NLXA 4RWTA 4MLHA 2CGKA 4XH5A 5EOYA 3CCVN 3BDPA 1LAWA 2Q31A 3O6WA 4RG8A 3FE1A 1X9JA 1OVQA 2NRZA 2X6SA 2Z1GA 4CEAA 2YI1A 1NGIA 2ITMA 3EE8A 4CFAA 1VAZA 3DWLA 4IEEA 3S3NA 4I6MA 4I9LA 1YJNN 3CFPA 4JKAA 3VTIA 1RT4A 3EKSA 4Z4IA 4HTLA 3WXIA 3PX4A 3SUOA 4BDYA 4K25A 2OZMA 1RT5A 4PL8A 4YORA 2VWJA 4BRNA 3CC4N 3KTQA 4CD1A 5HRNA 3CJBA 4ZTFA 3LZJA 3OYMA 1K8KB 3P5JA 4LH4A 3G6EN 3THWB 4Y0WA 4JK7A 3G4SN 4QS7A 4F4KA 2V7YA 1NG9A 1OKJA 3E01A 3O08A 4WCEL 2G8WA 3MMVA 1YF5L 4YOWA 1K9MO 4LFBK 4K42A 3LDOA 3N4PA 2P1JA 4BG8A 3LL3A 3K57A 4AHUA 4OPAA 3GL1A 2P9NB 3LAKA 3ZT2A 3TARA 4OKEA 5AQYA 4JN4A 4FLZA 3HM9A 4O8KA 4B3SK 2P9SB 1Z05A 3AVJA 1HNZK 4IFVA 1KVAA 4J8FA 3CCEN 1N5YA 2DTUA 4I2PA 4EZ9A 4GKKK 2FBXA 3SI6A 4IEIA 1S5JA 3KLGA 4ID5A 1N6QA 4BR7A 5C2FA 3T1AA 4CJ4A 4X64K 3QEPA 4EHTA 2IGIA 3D6RA 4CCHA 1RT2A 2RPIA 2QI2A 4Z4GA 3UKUB 1BI4B 4FWPA 4AQYK 2AP1A 3UKRB 2Z1IA 3VPZA 4FK4A 4GMJB 2GWJA 3B6PA 2P9UA 5FPEA 5HRSA 3RMDA 3WT0A 4CJTA 3DXKB 1O13A 2ZGZA 2DY4A 1VQ5N 3VQ8A 5TKWA 1GLJO 2KLAA 3KK1A 5KI6A 4YHHK 1GLCG 2D0CA 3SUNA 4LF9K 1S1XA 2FSJA 4M42A 4KTZA 1T44A 3OHRA 1KQSM 1HKCA 1BL3A 1N8RO 2E1ZA 1RILA 1UOCA 3AO2A 5FDLA 3MN6A 3WNHA 4KHQA 3SV3A 2O4IA 4BR0A 2QM1A 3DOKA 2PBDA 2FBYA 1U2VA 4BRDA 3AO4A 1ZYQA 4ILGB 5J2MA 2YNGA 3EZ5A 1ATRA 3MXIA 1ZC6A 4KRFA 3M5RA 4JI6K 4M3RA 4BWMA 2AA4A 3ID6A 2QTDA 1ZBLA 1A5XA 4CJEA 4O0IA 3MAQA 4R79A 1E3MA 3OTOK 4KHNA 3MCPA 1KFDA 3VETA 2Y1IA 2QWMA 1Q82O 2OPSA 1NK7A 5EXWA 3QETA 4JKDA 1JLFA 2QXLA 2QWQA 2W40A 5M1KA 4JK9A 3IUCA 1G99A 2YV0X 1VK0A 2G8HA 4HCCA 2GUPA 4IJNA 1S6PA 3HI0A 1J53A 4DR6K 2W42A 4FW1A 4W5NA 2E4LA 3V1OA 4M7XA 4IO9L 3ZX0A 5JS2A 1WSHA 4FJ8A 2D0PA 3O9RA 2ETJA 4BACA 3KD5E 3E9PA 3QDKA 4AF1A 4Z4HA 3IKMA 2A41A 1U6ZA 3VQ7A 3EY1A 3WXKA 4EAHD 3TAEA 4BRHA 1YIJN 5AQNA 1A5VA 3QIOA 4KHWA 3FGUA 3IDHA 4BE1A 1SL1A 4HHTA 3D2EB 3RTVA 5C24A 4IWVA 3EKUA 5LL6Z 1XNRK 3MEGA 2O8EA 2O8FA 3EEQA 2QKBA 4FJ9A 2Z1HA 4N76A 1T8EA 4FSVA 1VSFA 4IFEA 4BR2A 3DOLA 3FFKB 2CGLA 4WFBL 4M63C 1NJIO 4Z94A 4CF9A 4ILHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCS N;  4WF9 L;  1KC8 O;  3DLL L;  3CCE N;  1Q7Y O;  3CC2 N;  3CCL N;  1ILY A;  4UY8 O;  3CMA N;  5DM6 L;  2ZJP L;  3CC7 N;  3I56 N;  1KD1 O;  1VQ9 N;  3I55 N;  4IO9 L;  1VQK N;  1W2B M;  1Q81 O;  3CCQ N;  1VQ4 N;  5GAG P;  2ZJQ L;  5GAD P;  1YJ9 N;  1YIJ N;  1VQL N;  4WFN L;  3CXC M;  1VQM N;  1VQ5 N;  3CCV N;  3CCM N;  1M1K O;  1VQ8 N;  5DM7 L;  3CME N;  3G71 N;  2ZJR L;  3CPW M;  1YJW N;  1YJN N;  1KQS M;  5JVG L;  2QA4 N;  3J7Z O;  1YIT N;  1YHQ N;  1VQO N;  1N8R O;  1K8A O;  2OTL N;  5H1S Q;  4IOC L;  3CCU N;  5HL7 L;  1QVF M;  4U67 L;  2QEX N;  5GAH P;  1QVG M;  4WFB L;  1JJ2 M;  1NJI O;  4IOA L;  3CC4 N;  1VQP N;  1OVY A;  1S72 N;  1M90 O;  3G6E N;  3CF5 L;  3G4S N;  1VQ6 N;  2OTJ N;  1Q86 O;  5JVH L;  3CD6 N;  1VQ7 N;  4WCE L;  1YI2 N;  3CCR N;  3PIO L;  3CCJ N;  1K73 O;  1VQN N;  3OW2 M;  1K9M O;  5MLC Q;  1Q82 O;  3PIP L;  4WFA L;  5GAE P; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3THY B;  3C0B A;  4GY2 B;  2HHX A;  2A5X A;  1KC8 O;  2YNI A;  3CIP A;  1NMD A;  4BRM A;  2FXU A;  4JLH A;  2VQE K;  3CC2 N;  1GOA A;  4B1Z A;  3CMA N;  1RCH A;  3OYF A;  1RDA A;  3JAM O;  4MO5 A;  3OY9 A;  1XNQ K;  4IJA A;  4AHV A;  3HVR A;  2D0A A;  1HKB A;  1TYQ A;  3HP9 A;  1SQK A;  3A5O C;  3NGZ A;  3GOI A;  2Q3S A;  4H0P A;  2XRI A;  4EP5 A;  4CF2 A;  1TK0 A;  5BPN A;  3EYZ A;  2ZD1 A;  1HNI A;  4RW4 A;  4JKG A;  3SK3 A;  4H5W A;  2YCH A;  1SL2 A;  5DMR A;  4BR5 A;  3SBG A;  3L4I A;  4FCY A;  3VEN A;  3O3G A;  2B4J A;  2ZM6 K;  1S1T A;  1VQM N;  1V4T A;  4A2A A;  1U49 A;  3CHW A;  4KHS A;  5ELZ A;  1L3S A;  2AJQ A;  3MWT A;  3TAP A;  1XHZ A;  4M3Z A;  3U8X A;  2HVH A;  3RMB A;  3I0S A;  4ELU A;  2ZJR L;  5BPM A;  4B9N A;  4YY3 K;  2PZS A;  3K5O A;  4CHO A;  5C12 A;  1RT6 A;  3DLG A;  3H3N O;  4FM0 A;  3HK2 A;  3OYD A;  2P9I A;  4C8L A;  5C15 A;  1U04 A;  4OPH A;  4CJQ A;  4RW9 A;  2F9T A;  5JIC A;  2RF2 A;  1JL1 A;  2Q0U A;  3E66 A;  3MXJ A;  4DUZ K;  2JWK A;  3NAE A;  4DTJ A;  4F3T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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