1ILYA

Solution structure of ribosomal protein l18 of thermus thermophilus
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
RLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALALGIKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords RIBOSOMAL PROTEIN L18
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Thermus thermophilus reveals a conserved RNA-binding fold.
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Rna binding protein
total genus 18
structure length 90
sequence length 90
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ilyA00
4IOCL 3J7ZO 5GAHP 3CCMN 2OTLN 5HL7L 5MLCQ 4WCEL 1VQ6N 3PIOL 5DM7L 1KQSM 1VQNN 1VQ9N 3CCJN 3OW2M 1S72N 1YJ9N 3CD6N 5GAGP 3CCSN 4WF9L 1VQLN 1M90O 1K9MO 1KD1O 1VQKN 3I55N 3I56N 3CMEN 3CPWM 5JVHL 1VQON 1VQ7N 1VQ5N 1VQ8N 4WFNL 3CF5L 1M1KO 2OTJN 2ZJPL 1YJWN 2QA4N 2QEXN 1YJNN 1Q7YO 3CCLN 3CCEN 5JVGL 5H1SQ 1YIJN 1VQ4N 1YITN 1W2BM 1Q86O 3G6EN 1VQMN 1Q82O 1NJIO 1Q81O 4WFAL 1JJ2M 2ZJQL 1QVFM 1QVGM 1VQPN 3CC2N 4IOAL 1YHQN 3CC4N 1ILYA 3CXCM 5DM6L 1K73O 5GAEP 3G71N 4UY8O 3CCQN 5GADP 1KC8O 4U67L 1K8AO 1N8RO 3CCRN 4WFBL 3CCUN 3CCVN 4IO9L 3PIPL 3G4SN 1OVYA 1YI2N 3DLLL 2ZJRL 3CC7N 3CMAN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK8A 4CK2A 4XEIA 3DWLA 1JLEA 1S5JA 4FJXA 1KQSM 3V9ZA 4CGDA 4KHYA 2QW9A 4EHTA 1KFSA 2VCPA 5FDLA 1EQYA 1NJYA 1IKVA 4HVJA 1IBMK 1XHXA 5D3GA 1WSIA 2G8UA 4E1NA 3SK3A 2E4LA 3OYIA 4DV5K 4CEQA 5FPNA 4PL7A 2GV9A 2WBNA 1L3SA 4HCBA 1VQ8N 1Q8IA 4CBUA 2Z1HA 3NH1A 3BF1A 3LM9A 2XO7A 3NBPA 3ULEA 2FF6A 1WBBA 4GY2B 3KK2A 3AY9A 2DPNA 3EZWA 1I39A 3ENOA 3H1QA 4M3YA 4C1NK 4OVLA 4CZMA 3D45A 4IZ9A 3O9UA 1YF5L 5M1OA 3ENBA 4FOIA 5AQWA 1VSFA 4DF8A 2AP1A 1W2BM 4V19S 3HP6A 1CZAN 4WQ4C 4XH1A 1QQOA 3R9PA 1Q81O 3JXUA 1JJ2M 2F96A 4B9NA 4RG8A 2BUPA 5AFUH 1IKYA 1TKTA 2Q3SA 1ILYA 4OPAA 3MECA 4DTUA 3FLCO 1NLVA 4QS7A 4A61A 3SV3A 4CZIA 3HM8A 1N5YA 1S9EA 1KTQA 1HUXA 4DTPA 3RVCA 4UY8O 2UU9K 1IKXA 1IH7A 2RKIA 1JKHA 4RCHA 3DI6A 3K9KA 5JS2A 2D0PA 4IFYA 5J1EA 1GLDG 3DLRA 5JLHA 5KQ8A 3OYJA 3PIPL 3CM6A 1XI1A 1NOYA 3GG4A 4B3RK 5LMNK 3DXMA 4DU1A 2HW3A 4IKFA 3VESA 4IG3A 5AZJA 4X65K 4J2DA 4Z4IA 1IKWA 1ATNA 3THXB 2FLOA 4BWJA 4FZZA 4LY7A 4K43A 1Q18A 2YKMA 4M42A 2O8CA 4O0JA 5AR0A 4QAGA 3VQ9A 1X3NA 1RFQA 3ZSXA 2HHHK 1HJRA 1HR0K 3WEEB 3SJHA 3WNFA 3KKRA 1YTAA 4CESA 3J7AP 3QBXA 3VN5A 1RDUA 4DR4K 4M3ZA 3AO1A 4B9MA 1TGOA 2A41A 4M7XA 3U8XA 3CPWM 4FZYA 5AQOA 4B9QA 3O4WA 3KLHA 4O55A 3QESA 3KK3A 2XRIA 4JKHA 1VSKA 4FJIA 3ZSQA 3EYZA 1X9WA 1XNRK 4CHQA 1BIZA 3V1RA 2QXFA 1M1KO 3NGIA 1C6VA 1RTHA 1C0UA 4FJ9A 2F9TA 2XY5A 4DUYK 2Q2RA 2BE2A 4OKJA 1NGEA 3LAKA 1KXPA 3WT0A 3QEVA 3W3DA 3PLAA 3D6RA 4I9LA 4M7YA 3RR8A 4B1YB 3TANA 5KGXA 1T8EA 5AQIA 3VQEA 2OPRA 3A5OC 1Y97A 3K5LA 1VSMA 1J5OA 4HHTA 3QO9A 4CW7B 3BP8A 4CF8A 4FVMA 2E1ZA 3BZKA 3VF2A 4ELUA 2G8VA 3CQ8A 3G71N 2QK9A 1NK4A 4BVOA 3NF7A 4W5TA 4YHHK 4B1ZA 3DLBA 2X6SA 4ILHA 4DG1A 3ZEUB 4RW9A 2E1YA 1HMVA 3JAMO 4BC2A 4CF9A 1RDCA 5BN8A 4YY3K 3HRGA 4WE1A 2E5LK 5BRHA 3SMPA 3T3FA 1BOTO 3OYHA 2GWKA 4YDUA 4CGIA 1WSGA 1TAQA 3PO5A 3KWGA 2WFBA 3DLEA 4HWIA 4WQ4A 3KHYA 4C23A 5ADXA 5HRSA 3HVRA 4BE2A 4MO4A 4OX9K 1X9SA 1P90A 4M3RA 5E41A 4FM2A 4QS9A 3OYDA 2CH5A 2IC3A 1GLAG 2RHKA 1VRTA 3LDSA 3RTVA 4DTXA 5AQGA 4FJNA 3HO1A 3AVJA 2HVHA 4H4MA 4BRFA 3ZSRA 4RW4A 3SJJA 2KZZA 1U47A 3NMUA 5LJVA 2J4RA 3C0BA 4DR1K 3FZKA 3R6MA 2ZJPL 2Y1JA 1T6DA 3K2PA 3OJUA 4FLYA 5FPDA 4LH5A 1YAGA 4CERA 1HYSA 4BGBA 3QIOA 1HKCA 4A2BA 4N76A 3FZLA 2KFZA 4KREA 5C2DA 3RMCA 1D9DA 4N47A 5KRTA 3DMJA 3CFRA 2F4VK 4G9ZA 3ALYA 4E7HA 4JKFA 3AAPA 2A40A 3AVBA 3OYCA 4YOXA 4HCCA 4CEDA 4OKKA 5C10A 4IJAA 3Q7CA 1TL3A 3SAFA 3CXCM 4N56A 3ZSVA 2ZM6K 2P5OA 3C6HA 3K0SA 1JL2A 3L3UA 2QKKA 4F3OA 4LF7K 1REVA 3VQ5A 2HNYA 1BISA 3LDQA 4FJLA 2YNFA 3O3GA 4IDHA 2YX6A 1TL1A 5BRFA 1N8RO 5DK5A 1TKZA 3VETA 3IAYA 3H6EA 3M3ZA 4CJ7A 3NH0A 3VF6A 2ZE2A 4AHTA 5IWAK 1V4TA 2NRZA 3MEGA 3AA4A 3T7ZA 4DV6K 2X78A 3IDHA 1NKEA 4J2AA 5EY4A 1WN7A 2QTDA 3VQ7A 2AA4A 3VF4A 4DV1K 1QSYA 3ID6A 3N4PA 5BN9A 3KD1E 2OPQA 5HBMA 3SQ2A 1U2VB 1NJWA 3IRXA 3T1YK 3NF6A 4CIGA 4RTFD 3HM9A 4CJPA 1EXQA 2F9WA 1K9MO 3C65A 2EX3A 3PSIA 4OGCA 3I55N 3OTOK 3CMEN 4DR5K 4B1UB 3BUZB 2G8IA 3HK2A 4JKAA 1VQ5N 2D0AA 4KB1A 1R0AA 1J54A 1YXQA 4BR2A 3D2EB 2D1KA 4KTZA 1GLEG 4KTWA 4M45A 1U4BA 2OTJN 1RTJA 1TUYA 5HOOA 1RDAA 2NNWA 3ITHA 1YT3A 3S3MA 4DS5A 3SQ0A 3C94A 4KHWA 3V9WA 2HF4A 3SCXA 4I9QA 1VQMN 3MN6A 5HRPA 3QIPA 4H03B 4HTLA 4J8FA 3WXMB 1Q82O 3A2FA 4CCHA 2V7YA 3S41A 5I9EB 1QVFM 4WQ5C 4XH4A 2IAJA 4ELVA 1NGHA 2HHQA 3CJCA 3PV8A 2I7NA 1D5AA 3CC4N 3F2KA 2KFNA 1XHZA 4GV6A 2QWOA 1VAZA 3H1VX 5GAEP 4CZFA 1NJXA 4L3QA 2E2PA 4FZXC 1VRUA 2GUPA 3CI5A 4FJJA 2E2NA 2O8DB 4KHUA 4I2QA 5CZ1A 1N32K 4RW7A 3SUOA 2PYJA 2FBVA 4FW1A 2NUBA 5CYQA 4NXMK 4CJLA 3SQ1A 3VQCA 4I7FA 1HYVA 5M1QA 3VQ8A 3RMAA 2NRVA 4KRFA 1RBUA 5CZ2A 1C0GA 1B9DA 1NK6A 1IJJA 5M1PA 2D5RA 4AHRA 5GAHP 4EIAA 3K57A 3MXIA 4B3OA 1VQNN 2ZGZA 3LDNA 4CHNA 2YNIA 5CY4A 4BWMA 1YJ9N 1RT7A 4LFCK 1M90O 3L8BA 4BRDA 3L2VA 2BDPA 4LF9K 2YHAA 3THWA 3UIQA 2P9UA 5KPTA 3UKUB 4CK3A 4ID1A 1C0FA 3FE1A 4CD1A 4RWTA 3ZT2A 3EE9A 4JHDB 5HP1A 2FBYA 5BR8K 1QSSA 2VG6A 4RW8A 2BGGA 4KB0A 2GELA 2LSNA 3VQPA 4DSEA 2NRRA 1S22A 5BPLA 4IO8A 5HRRA 2UUCK 2QA4N 3VTHA 2UUBK 3U9DA 3L2QA 4CJWA 4JEPA 4CGGA 1XNQK 1WSJA 4B8AB 3CJ7A 2GX9A 2GTDA 1R59O 5BRDA 4F2SA 3DM2A 1WSHA 5T7BA 3TAQA 3CERA 4JRPA 2HHUA 1C0TA 1YVNA 2DFEA 4W5OA 1NGDA 5AQPA 4WFAL 4CJFA 4FWSA 2IVOA 1WSEA 3KZBA 4JLHA 3SUPA 1E3MA 1CLQA 4FYDA 3ZT1A 4CBWA 4C1NI 4FK0A 5FRMA 2A5XA 2O8EB 2W42A 1JCFA 3VEOA 2UXBK 3L6QA 4OJRA 3KLIA 4W5RA 4DTJA 1KLMA 1QQNA 4DF4A 1KC8O 1IBKK 3L4IA 3WNHA 2ZD1A 3V9UA 1IO2A 3QINA 3O4QA 4CECA 5M1KA 3PSFA 3HXMA 4NCGA 3DLGA 1HNWK 4GNIA 3TAMA 3SYZA 2Q31A 2X74A 4CJ4A 3LPTA 1U2VA 3DLLL 3IMXA 2ZGYA 4LF5K 4QOZB 1G99A 4FO0A 1MWKA 5J2PA 4DTOA 1LCUA 3P1GA 3T19A 1S3XA 3O9RA 5LL6Z 3CD6N 2G8FA 1HKBA 4K42A 3VERA 4WQ5A 5M1NA 3RSEB 1NK0A 1BCMA 3NVKA 3D2EA 4NYNA 4O8UA 3MN9A 4QS8A 2D4WA 4DR2K 4LSNA 5AQHA 1KCFA 3E66A 2DTUA 1U6ZA 3GL1A 4WFNL 3ZETB 3O1WA 3VQAA 3ZX2A 2P9PB 1A5XA 1IG8A 4NCAA 3VENA 4DU4A 2E88A 3HJFA 2DFHA 1DLOA 4JKCA 4DCHA 3HI0A 1XQSC 4JKEA 1JLBA 2P9SA 1S1UA 3CCEN 3CCLN 3ZSOA 3OVNA 3QLHA 4AF1A 4L8RB 3FR0A 5C24A 4JYAK 1HPZA 3CQXA 1ASUA 4IWVA 4DQIA 3ZCMA 3IKMA 4FWKA 2ZJQL 3QNNA 5AZIB 4OO1J 1QVGM 2OZMA 1VQPN 1I3AA 1KFDA 3QDKA 4CJKA 2F7TA 5C2FA 1Y64A 3M8QA 4YDUC 3ZSZA 4B1VA 4F3TA 2VQFK 2O8DA 4CJTA 1HQUA 4BR9A 3C95A 5LMUK 3CCQN 1SKWA 1KAYA 3G0ZA 1K8AO 2OZSA 4Q0BA 5SZTA 5AQNA 4IDKA 1JXEA 5KPZA 3TR8A 1GLBG 1QHTA 3WNEA 1TAUA 2A1SA 3VQBA 4DSLA 3PUFA 1LW2A 3AO5A 4PWDA 3D0PA 4H0PA 1J53A 4FLUA 1V4SA 1N6QA 1T44A 4JI6K 4DHYA 3C6AA 3B6PA 4F8RA 3KJVA 4XIUA 1TKDA 3OW2M 3C7NB 1EO1A 3MX5A 3MXJA 4KKOA 4CHZA 1NMDA 4Y1DA 4DFPA 3LP3A 3V81A 4JV5K 4IEIA 1LAVA 3DLHA 2QWPA 3MCPA 5FLXO 1XMOK 4JHDA 3AVIA 4FLZA 2YNGA 1HLUA 1ASWA 4JKGB 4MQ3A 1TKXA 4JI7K 3CM5A 1XC3A 1H1VA 3O9TA 3AVLA 3S3OA 4DTNA 3L3VA 2D0CA 3GOIA 4DV2K 3ATUA 4KTQA 2HBMA 4A2AA 1XMQK 3LAMA 3VEVA 1YJWN 3VEYA 2GWJA 1HNIA 3VMFB 1QS4A 4FSVA 5AQFA 5AQVA 1KRPA 4DQPA 4N5SA 3CJAA 4OLAA 1C0MA 1YITN 3EKUA 4CEOA 4KHSA 4PA1A 1NGAA 2QWLA 2B5JA 5ELZA 4J2BA 4FWOA 4B9SA 2O8FA 1NJIO 2YKNA 1TYQA 4B9UA 1LAWA 4FLWA 1DTQA 3RRGA 3LP1A 4FLXA 1EKEA 1U49A 2O8EA 1TUUA 4LH4A 5AFUA 4JI2K 4AHUA 3AARA 4CFBA 1N36K 1ESVA 2VYPA 5FROA 3LDPA 1IV0A 4BRGA 3FZHA 2JWLA 3K58A 1BL3A 1SL0A 4U67L 4CGHA 5IT9O 4BREA 1QQMA 5ADXH 3SUQA 3CCRN 4CF2A 4WFBL 4MLEA 4DQQA 1QE1A 1ZBLA 3NE6A 2HNZA 2Z1GA 3THVA 5EVZA 3DAWA 3OYEA 4CZGA 4BRLA 1SKRA 4JI4K 3LP2A 2XY7A 4H5TA 4ZTFA 1DEJA 1MU2A 4AHCA 3OYLA 1YUWA 4DV3K 2ZQBA 3RSEA 1OH7A 1G15A 4BC3A 4CJUA 1J6ZA 2V51B 4DV7K 3OYNA 2OYQA 3EL2A 4AM7A 4B3TK 3J7YP 3ZETA 4FW2A 3F9MA 2PZSA 4GMJB 4XH5A 2P9PA 1L3TA 2PYLA 4KV8A 1T05A 4I2PA 3VQ6A 1HNVA 2PBDA 4BRKA 3LP0A 4YOUA 4CEBA 1NWKA 1BDGA 1HPMA 4PKGA 2W40A 3SQ4A 4HTUA 3FFIA 3GDQA 4LSLA 1YJNN 2A1RA 4BC4A 4K0KK 4DR6K 4H4OA 3U3GA 5C42A 4JAXA 2ZWHA 2VG7A 3LDLA 1S6PA 3O1BA 3AA5X 3QBWA 5AZIA 2GEMA 3FZMA 4CZKA 2P9LB 2YCHA 4F4KA 4BDYA 4B9TA 3BF3A 3D2FB 4R79A 3LANA 3ZT0A 1K8KB 4DFMA 1YHQN 4O4GA 4LD0A 4YOYA 3TTDA 3MK6A 3KD5E 3PX0A 2UXCK 3K5NA 1RILA 1B9FA 2HHTA 2Z1IA 4E89A 5AQKA 1BI4B 3MN7A 2E6LA 3WXJA 1FKOA 4KO0A 3OJSA 4NXNK 3I8DA 3KK1A 3M5RA 4KH4A 3CCUN 4H0OA 4JK9A 3CQYA 4A57A 1SS6A 3TI0A 3EEQA 3BGRA 5F1XA 4DQRA 1JCGA 1YI2N 4KI6A 3MXMA 3NVMA 3EZ5A 3O80A 3AGRA 4IOCL 4CEFA 1S1VA 3CCMN 5AQZA 5HL7L 2OTLN 1ATSA 4WCEL 4FM0A 4AILC 2OPPA 4DQSA 4BRNA 4CVNE 3SAHA 4NLCA 3UKRB 2HBLA 4JKGA 3THXA 1VQKN 2YHXA 3LALA 2Q0RA 2Z1JA 3HVTA 5AQQA 1NJZA 2QXLA 4CFDA 4MFBA 5CR4A 3VEWA 3WEEA 4M3WA 1RCHA 3DRPA 4EZ9A 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1WB9A 1LWCA 1BIUA 2E20A 4G1QA 1BA0A 3SNNA 1BI4A 3KVGA 2ZF5O 3I8BA 5AQJA 4CBXA 1ZBUA 4GW6A 3L2RA 4GVMA 2FBTA 3CHWA 3ENHA 3WUHA 4CF0A 4CEZA 4DKWA 1LOTB 4YOVA 2CGJA 1RNHA 5LJWA 4NCBA 4E19A 1NGFA 2IS3A 4JKDA 3ZT4A 3MDQA 4CK1A 4DR7K 4BGAA 4ILGB 1FJGK 1OH8A 2NZTA 4E1MA 2A42A 2FBXA 1NKBA 1T6CA 1SUQA 2Y1IA 5BPNA 4DSIA 4IXCA 2D0OA 3BZCA 4LC9B 2G8WA 3TPQA 4CIEA 4BRHA 3ASMA 2YHYA 4C8LA 1S9GA 1ITGA 3CYMA 5EU7A 1NK9A 1YTUA 3JS6A 1VQLN 4OLBA 3I33A 4NB4A 4M3TA 1W9HA 4K41A 3E9PA 1SV5A 1S1WA 3IS9A 2ITGA 5KTQA 3VEXA 1WUAA 5AQYA 1CZBA 1NM1A 1RT3A 1S6QA 2QWNA 5KQDA 4CD3A 2QI2A 3BEXA 2XHBA 4JI8K 4X64K 4W5NA 4CHPA 3AAQA 3TAPA 4EHUA 3RMDA 1NG9A 1VSDA 2JGUA 1XWLA 1JLCA 2P9IA 2O8BA 1BGXT 4E7KA 1HQEA 2HOEA 3TU5A 3ZSWA 3A5MC 3M1FA 1NGCA 1HNXK 4B3SK 4BRAA 1IG9A 3TAFA 3WXKA 3TSQA 2Q36A 3V1OA 4CJEA 2VG5A 4DMNA 5CHIA 4DQ8A 3SUNA 3OBWA 1BWFO 2CGLA 2HMIA 2P9KA 3J80O 2A3ZA 5AQTA 5BR9A 4BE0A 3QEIA 3G25A 1W97L 3P5JA 3U9ZA 2HHWA 5FPEA 4CJQA 3B8AX 2FF3B 3TSPA 3AVMA 4DV0K 3NCIA 5C25A 4JD2B 1JXBA 3LDOA 3I0SA 2KQ2A 1OKJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4KHQ A;  4E7I A;  3VQD A;  4YNQ A;  4Y1C A;  3SPZ A;  4KPY A;  4HUF A;  2HHS A;  1ZBI A;  3CFP A;  3R1X A;  1HYZ A;  3R3L A;  3S9H A;  4ISE A;  4CHO A;  4FVU A;  1KSP A;  2I7P A;  1GLL O;  1WSF A;  3HP9 A;  2VGN A;  5JIC A;  1Z25 A;  1C1A A;  1KVB A;  3ATV A;  4CIF A;  4R5P A;  2QWM A;  4IO9 L;  2IDO A;  4BQZ A;  1NGJ A;  2IIR A;  4FWL A;  2HVI A;  2YHB A;  3KLG A;  3G4S N;  4BR7 A;  4IEE A;  2FXU A;  4FL9 A;  5AQL A;  3A5N C;  3RWU A;  2ASP A;  2QWR A;  4DTS A;  4BRP A;  1B92 A;  3AVK A;  2AJQ A;  4CFC A;  4CE9 A;  3AVA A;  3DXM B;  3SBG A;  1NGG A;  1X1P A;  1WOQ A;  5AZJ B;  3OYF A;  5AQX A;  3OYB A;  2X6N A;  2YJE A;  1S72 N;  3DOK A;  5GAG P;  1S1X A;  2O8C B;  3A5L C;  1MA9 B;  4EP4 A;  4JKB A;  3J8A A;  2KZM A;  3CJB A;  2JWK A;  3GBT A;  4YOR A;  1SAZ A;  3B6O A;  3OS1 A;  1TK5 A;  5F2R A;  3ZT3 A;  4DFK A;  4KH6 A;  4HUE A;  3N4Q A;  3QFU A;  4TSX A;  4DSF A;  4FWM A;  3M6G A;  4FM1 A;  3CF5 L;  1VSJ A;  3UKR A;  4EZ6 A;  1BHL A;  2NRH A;  4AHV A;  1Z26 A;  4FJ7 A;  2O8F B;  3NAE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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