2AP1A

Crystal structure of the putative regulatory protein
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
NAMYYGFDIGGTKIALGVFDSTRRLQWEKRVPTPHTSYSAFLDAVCELVEEADQRFGVKGSVGIGIPGMPETEDGTLYAANVPAASGKPLRADLSARLDRDVRLDNDANCFALSEAWDDEFTQYPLVMGLILGTGVGGGLVLNGKPITGQSYITGEFGHMRLPVDALTLMGFDFPLRRCGCGQMGCIENYLSGRGFAWLYQHYYDQSLQAPEIIALWEQGDEQAHAHVERYLDLLAVCLGNILTIVDPDLLVIGGGLSNFTAITTQLAERLPRHLLPVARAPRIERARHGDAGGMRGAAFLHLTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Crystal structure of the putative regulatory protein
rcsb
molecule keywords putative regulator protein
total genus 102
structure length 305
sequence length 305
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2005-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A02
1HKCA 3O8MA 3D2EA 1MWMA 1IG8A 2ZF5O 3A5NC 2GUPA 3VERA 4BRKA 2QWNA 2AP1A 4O5FA 1ZBSA 4H0PA 4BRLA 3ZX2A 4BVOA 4BR0A 3FGUA 3KHYA 3H1VX 2Q0UA 4CZHA 2OANA 2P9IB 2BTFA 4CBWA 3HSCA 3P4IA 1HJOA 1YUWA 1CZAN 3SMSA 3EO3A 3FFKB 1QZ5A 3C0BA 3EKSA 4WQ4C 2P9PA 1DGKN 3AAQA 4HWIA 2A41A 4AM6A 4BRNA 1TUYA 2E2QA 2E1ZA 3H6EA 5EOYA 4IZ9A 2P9LB 5KPTA 1XQSC 4CBXA 1YXQA 4LC9B 1RFQA 1P8ZA 1HKGA 1KAZA 2P9NB 3ULEB 3VGLA 3FZHA 3VGMA 1QQOA 2Q36A 4CZLA 4CI6A 4CZFA 3QICA 3QBXA 5CE3A 3FZFA 3I8BA 1BUPA 1MDUB 2CGKA 2QWQA 3VEXA 3O80A 4CZKA 3GOIA 3WXJA 1BG3A 5BRDA 4F9OA 4B1YB 3EZWA 4B1ZA 4O8KA 3VF2A 1GLEG 2FF6A 3DXKA 3OHRA 5AQIA 3MDQA 3UKUB 3ZETB 5ADXH 1GLAG 1S22A 3FZMA 1BA1A 3D2FB 1U2VB 1Y64A 5JLHA 3M1FA 1XC3A 4EIAA 4H5VA 5E84A 3ENHA 1H1VA 2FSKA 5AZIB 4IXCA 5BN9A 1ZXOA 3VEOA 3QB0A 4FWMA 1JCFA 4M63C 3M3ZA 2FLOA 3DWLA 4YDUA 3VEVA 5FPMA 3WXIA 2P9UB 3CJAA 1NGFA 3F9MA 2BUPA 3ATUA 4QS9A 3GE1A 3HZ6A 3W0LA 2QWMA 4H0XB 2V52B 3GDQA 1K8KB 5F0XA 2Q97A 2YHYA 4B1VA 3LDLA 2A42A 4CZMA 3TU5A 1GLBG 2NRHA 4HTLA 2E8AA 3H3NO 3QMLA 5ELZA 4NO7A 4BGAA 1G99A 4H5NA 3FZKA 1E4GT 5EXWA 3DXMA 3MCPA 4WQ4A 3FLCO 2ZGYA 4H03B 2D0PA 4E1JA 3ULEA 2E20A 3H46O 4IO8A 3GBTA 2I7PA 2H3GX 4FWLA 2IVNA 3CI5A 2CGLA 3HBTA 2QWRA 1NGCA 3CJBA 4CZEA 5AZJA 4H0YB 4FWPA 3LM9A 1TYQB 5LJWA 3BF3A 3VENA 3MK6A 3WXLA 5KPRA 3IFRA 4BGBA 1EQYA 4EHUA 3KVGA 2P9SA 2A40A 4Y0WA 1C0GA 5F1XA 3ATVA 3EKUA 5AQFA 1NGBA 1X3NA 2AA4A 3GL1A 2GWKA 1U2VA 3LDNA 4H5RA 5AFUH 1RDWX 4BG9A 2FSNA 3QDKA 1J6ZA 4YDUC 4A62A 4FWRA 3WT0A 3LL3A 3SLCA 3ENOA 4C23A 1BU6O 3CETA 3UKRB 2Q2RA 3TPQA 4EFHA 4A2AA 1NMDA 1QQNA 4MO4A 1QHAA 4K25A 5AQZA 4BC4A 3U9ZA 4B1XB 1ZC6A 4FWQA 5AQLA 2NZTA 3A5LC 3FE1A 5LJVA 2HMPA 1NGHA 4XH5A 4CJ7A 5EX5A 3WUHA 3VEZA 4BRAA 5KPZA 1GLDG 3RSEA 4BQZA 3JS6A 2FSJA 4JN4A 4I6MB 3VPZA 3A0IX 2D1KA 1YVNA 1LOTB 2QW9A 3QFPA 3QFUA 4WQ5A 3VESA 3CHWA 3IUCA 3S41A 4JHDB 2CH6A 5ADXA 4B1WB 2PAVA 5TKYA 4DQ8A 2A6AA 5B8HA 4FWOA 2A5XA 3WXKA 5AQOA 4H0VB 4IWVA 3WQTA 2GWJA 5AQQA 3VETA 1DKGD 3DAWA 4ISFA 4QS8A 2P9KA 2QWPA 3L6QA 2KHOA 1NWKA 3R9PA 1NGDA 3LDOA 4XH1A 3M6GA 2CGJA 3HM8A 1QZ6A 3VGKA 2YI1A 1NM1A 2QM1A 3BP8A 2E2PA 3BEXA 3H45C 5AQGA 3O08A 3WEEB 2ASPA 4Z94A 4H5TA 4RTFD 5FPNA 4DHYA 4BC3A 3UKRA 2IIRA 2P9IA 4CZGA 4NB4A 2V7ZA 5AQPA 2GELA 3VF4A 4BRMA 3ZX3A 4FPAA 4BVPA 4ISGA 1E4FT 1ATSA 2D0OA 2PBDA 2ASMA 3BF1A 2YHXA 4RCHA 2ITMA 1QQMA 1BDGA 1NGEA 4I6MA 4WQ5C 4FPBA 3BUZB 1V4SA 3MMVA 1GLCG 4EHTA 1S3XA 3MN7A 3FR0A 2I7NA 2P9LA 3CIPA 4BRPA 3ZEUB 1NLVA 1HPMA 5AR0A 3IDHA 1ATRA 5AQNA 2P9NA 1ATNA 2D4WA 5AFUA 2GTDA 3GG4A 2VCPA 1Z6RA 2YCHA 3UB5A 1X3MA 2E2OA 4PL7A 2P9PB 2Q31A 1T6CA 1TUUA 2E1YA 3CJ1A 4FOIA 2DPNA 4FWKA 2QXLA 3MN5A 4IJAA 4PKHA 1T44A 5AQJA 1HUXA 3R8EA 3VEYA 3UKUA 2VYPA 4FOEA 3ZETA 1RGIA 3O1WA 4PKIA 2HF3A 3VOVA 3D2FA 3L4IA 3L0QA 4H5WA 5FPDA 5JLFA 5E26A 3CJ9A 4CZJA 4BRHA 2HOEA 3JXUA 1WUAA 5AZIA 1DEJA 4BR4A 2V51B 1HX1A 3U8XA 4PL8A 2IVOA 4BRGA 4EAHD 2P9UA 2QWLA 3SJHA 3DXKB 4K42A 4DB3A 1T6DA 1NBWA 4CD1A 5BPLA 4BR7A 3SMPA 5AQXA 2A3ZA 3R6MA 1K8KA 4DCHA 3AY9A 4FWNA 4H0OA 3U9DA 2Q0RA 1D4XA 1SAZA 5BREA 3C7NB 2WUSA 4JD2B 1R59O 4M7YA 4BR2A 1OKJA 5I9EB 5BN8A 3ZEUA 5AQHA 2E2NA 1X9JA 1YAGA 1Q18A 4RWTA 1ESVA 3O1BA 2CH5A 2UYTA 1U6ZA 3AAPA 5BPMA 5LY3A 1KAYA 4CZIA 4BREA 3O5BA 3CJCA 4XEIA 3ZX0A 3O6WA 1TYQA 3CERA 1BOTO 2FXUA 5KQ8A 2J4RA 4AM7A 5BPNA 3EL2A 4H0TB 2YJFA 3LDPA 3W3DA 3DXMB 5AQSA 1NGJA 2EWSA 1JCGA 1HLUA 2ZGZA 5JICA 5AQVA 4PKGA 2ASOA 5AQKA 1NGGA 3SK3A 4BRCA 5KQDA 1MWKA 5AQUA 2F9WA 3UE5A 4BR9A 1XUPO 3MN9A 5AQWA 5JMVA 3DJCA 5FPEA 5AZJB 5BRHA 1WOQA 3AARA 3IMXA 4WYBA 3KZBA 3ID8A 3HI0A 4M7XA 2P9SB 4XH4A 1MA9B 3D7EO 5BRFA 3VEWA 4BRIA 4GNIA 3D2EB 4MLEA 4K43A 1GLJO 2VWBA 4L3QA 5EY4A 5AQYA 4J8FA 1KAXA 4CD3A 3C7NA 4JD2A 3WQUA 4BRDA 4B1UB 4QS7A 1BO5O 2NLXA 5F2RA 1HKBA 2F9TA 3CQYA 4K41A 3I33A 4MO5A 4JHDA 3FZLA 5EVZA 4FSVA 2YJEA 3LM2A 5BR9A 5AQRA 1GLFO 4BC5A 4FO0A 4BRFA 1IJJA 3A5MC 3O4WA 1BWFO 4ISEA 3J8AA 2YHWA 3VF6A 3RSEB 3CJ7A 3G25A 3A5OC 2IVPA 4JAXA 2HF4A 4BRQA 1GLLO 1C0FA 2FF3B 1V4TA 3HTVA 4MLHA 3H1QA 2W40A 1LCUA 2QWOA 1NGIA 3B8AX 4CBUA 3U4LA 5AQTA 4GY2B 4B9QA 1SQKA 3WEEA 4IJNA 2ZWHA 4FL9A 2GEMA 4KBOA 5AQMA 1SZ2A 2W41A 4BROA 2V7YA 2E88A 4BR5A 3QBWA 3MN6A 4FWSA 3LDQA 1KXPA 2Q1NA 3CQXA 1BA0A 3A8YA 1JCEA 4BQLA 4A61A 2P9KB 4BC2A 4BG8A 3EN9A 4JNEA 4A2BA 1Z05A 3H3OB 1NGAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THWA 1CXUA 4ILJA 2GUPA 3VERA 2QWNA 1ZBSA 3VA3A 4CEQA 3ZX2A 2YX6A 4CFDA 3KHYA 2BANA 4CK3A 2O8FB 3P39A 2HHVA 4N41A 3CD6N 3M8SA 1CZAN 4LH5A 4Z4HA 4FYDA 4E19A 2X78A 3AVJA 3C0BA 4E1MA 4JI4K 1YJWN 1RTJA 4WQ4C 4V19S 2O8DB 4AM6A 4RW7A 4WCEL 1TUYA 2E1ZA 1U49A 4YY3K 2D5RA 3RTVA 5KPTA 5M1NA 4KB0A 5JS2A 2QTDA 3SBGA 1WLJA 3THXB 3VGLA 3VGMA 4O44A 3HXMA 4KHWA 1B92A 1FKOA 2XHBA 3K5MA 4CI6A 4CZFA 5HRSA 2ZM6K 1KSPA 3AVNA 1FK9A 1BUPA 1MDUB 4YHHK 4HVJA 3SQ0A 5BRDA 3EZWA 4ZHRA 3DXKA 3MDQA 1TAUA 1S22A 3T1YK 1ASWA 1TAQA 1BA1A 1U2VB 1BIUA 1H1VA 2FSKA 3B6PA 3DWLA 5LMNK 3WXIA 2QI2A 2P9UB 2OTJN 3AA5X 2BUPA 2F8SA 3MXMA 3NDKA 2A42A 3TU5A 1GLBG 2QKKA 3H3NO 3V9UA 1G99A 4ZTJA 1EP4A 4ILHA 1IBKK 4BWJA 4J2DA 1TKZA 2ZGYA 3HL8A 4M45A 2E20A 3H46O 2I7PA 1J5OA 4KRFA 2H3GX 1HR0K 4CEZA 2CGLA 1LAVA 1OH6A 1UOCA 4PWDA 3BZKA 4BWMA 2OPPA 3BF3A 2G8VA 4BGBA 2RE2A 4CGHA 2UXCK 1REVA 3DM2A 5AQFA 1NGBA 4JK8A 1J9AA 4B8CA 1WSFA 3ZT4A 5C42A 4E7HA 4BG9A 4CIGA 3RRHA 3KK3A 2O8CB 3QDKA 1J6ZA 4B3TK 2UUAK 1EX4A 1VAZA 3CETA 1IKXA 2Q2RA 3OYCA 1QQNA 4RW4A 4W5OA 4K25A 1HJRA 3U9ZA 4B1XB 4FWQA 4JI7K 3FE1A 4FLWA 4HUFA 1Z25A 1NGHA 4CJ7A 4DTJA 1GLDG 4BQZA 5C24A 2FSJA 1D9DA 3C6AA 2HBLA 3VPZA 3A0IX 1RDAA 4LSNA 4AILC 3V1QA 3NF8A 3HP6A 4FLXA 3VESA 4JHDB 4M41A 3U3YA 1KVAA 5B8HA 4CHPA 3C6UA 3WXKA 4IFEA 5AQOA 1YIJN 3WQTA 2VG7A 3DLEA 2GWJA 4B3OA 3VQ4A 4ISFA 4QS8A 4KI4A 2QWPA 4FZXC 4CJFA 5DK5A 3OYDA 4ILGB 4CEBA 3F2KA 2YI1A 4NCAA 4B08A 4PHTX 4JLHA 3VQ8A 3I0RA 4DHYA 3UKRA 3BZCA 3RMBA 4QCLA 2P5GA 4FVUA 4XIUA 1HYSA 3T69A 2IIRA 2P9IA 5AQPA 3KLIA 3T1HK 3THYB 1E4FT 3D6RA 4CJKA 3OYNA 1BQMA 3THWB 1JKHA 2YHAA 4DUZK 1BDGA 3SAFA 1IH7A 3OYIA 1JXEA 4I6MA 2P5OA 3MMVA 4JI6K 3SNNA 2PYJA 3HP9A 3MX5A 3RMAA 3RR7A 4H8KA 4DQIA 3ZEUB 4JKDA 5AQNA 3SV4A 3RMDA 4B9TA 3IKMA 1CZBA 1K8AO 2QA4N 1VSDA 4DMNA 3WNHA 2E2OA 5T7BA 2Q31A 1NJZA 1C1CA 1HYZA 4B9MA 2E1YA 3CJ1A 5KTQA 4E7JA 4FWKA 2QXLA 2UXDK 3CCRN 3V9ZA 4DSKA 3BGRA 4JKGB 1VSKA 3K5NA 1HUXA 1QSSA 4FOEA 3ZETA 3KWIA 4PKIA 4MFBA 1B9FA 3OYLA 3CCMN 2WFBA 5FPDA 5E26A 4CJUA 4BRHA 2HOEA 4GMJB 1WUAA 1YHQN 5KI6A 4BR4A 3U8XA 3T7ZA 1VQNN 3LPUA 1VQ6N 3AVAA 3Q7BA 4JS5A 4BY9C 3SJHA 5BR8K 3DXKB 5J1EA 4DB3A 3J7AP 1S9EA 4CD1A 1O1WA 5K14A 3CG7A 3SMPA 5AQXA 3R6MA 1K8KA 4DCHA 1TKDA 4KFBA 4FWNA 3WNEA 2Q0RA 1GOBA 1NK6A 5BREA 3C7NB 4IDHA 4DWIA 3QEXA 4RW9A 4BR2A 4DV5K 1T7PA 2E2NA 3TSQA 1G15A 2HHSA 4DSIA 3QEVA 4FJIA 1OH7A 5LY3A 1KAYA 4IOCL 1XHZA 3O5BA 1BISA 3HVRA 4KH4A 3CERA 1BOTO 3DOKA 2FXUA 5KQ8A 3PY8A 1NKCA 2J4RA 1C1BA 4OPAA 3C6TA 1BHLA 3W3DA 2NUBA 5AQSA 3MX2A 2EWSA 3K9JA 2ZGZA 4ID1A 1JLEA 4PKGA 5AQKA 4BRCA 4ELTA 4ELVA 1MWKA 2F9WA 3ZT0A 3MN9A 5JMVA 4JKHA 3CFRA 1VQ8N 4LF6K 3PX0A 3IMXA 2HMIA 3F9KA 3SPYA 4IKFA 1NK7A 4W5RA 4WFAL 4C8NA 2BDPA 4CGGA 1MA9B 3ALYA 3D7EO 3VEWA 4J2BA 3N4QA 4GNIA 3TSPA 2VWBA 1W7AA 3DRSA 4CK1A 4Z4EA 4IFYA 5FDLA 3QINA 4A57A 5GIOA 2G8HA 4CD3A 4OX9K 3V9SA 4CGDA 4B1UB 1ASVA 2F9TA 4MO5A 3CMAN 1RILA 2YJEA 3PIOL 5AQRA 1L3SA 2EX3A 4FJLA 3LANA 1KLNA 4DR6K 1BWFO 3PUFA 3O9RA 3J8AA 2DTUA 5I3UA 3CJ7A 4KHQA 2IVPA 3P31A 4CHZA 3JAMO 3NGIA 3ZT1A 3NAEA 3I56N 1VRTA 1M1KO 3HTVA 4MLHA 3H1QA 4CEFA 3M8QA 4DTMA 1JLGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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