2AP1A

Crystal structure of the putative regulatory protein
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
NAMYYGFDIGGTKIALGVFDSTRRLQWEKRVPTPHTSYSAFLDAVCELVEEADQRFGVKGSVGIGIPGMPETEDGTLYAANVPAASGKPLRADLSARLDRDVRLDNDANCFALSEAWDDEFTQYPLVMGLILGTGVGGGLVLNGKPITGQSYITGEFGHMRLPVDALTLMGFDFPLRRCGCGQMGCIENYLSGRGFAWLYQHYYDQSLQAPEIIALWEQGDEQAHAHVERYLDLLAVCLGNILTIVDPDLLVIGGGLSNFTAITTQLAERLPRHLLPVARAPRIERARHGDAGGMRGAAFLHLTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords putative regulator protein
publication title Crystal structure of the putative regulatory protein
rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Transferase
total genus 102
structure length 305
sequence length 305
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2005-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A02
1BU6O 4FWKA 4FSVA 3KHYA 5KQDA 1ESVA 4BRCA 4BRPA 3O80A 3LDQA 4A62A 4B1ZA 1GLDG 4IXCA 1P8ZA 2P9SA 3BF1A 3LM9A 3VERA 4H5WA 2ZGZA 2QWLA 3H3OB 3F9MA 3WEEA 3AAPA 1NWKA 3ID8A 5AQFA 3WT0A 4E1JA 1HUXA 2J4RA 3DXKA 3ZX2A 3BUZB 3UKUB 3HI0A 2VYPA 4FWSA 2AA4A 2QWPA 4A61A 3I33A 4FWLA 3WQTA 1NM1A 3DJCA 3G25A 2D0PA 2FSKA 4DCHA 3MN6A 1Z6RA 5AQRA 3M1FA 5F2RA 5LJVA 4JN4A 2V7ZA 2EWSA 1YVNA 3C7NA 2W40A 3IFRA 4XH1A 2YCHA 4B1YB 4CZEA 4ISFA 5AQUA 1BG3A 3A0IX 3QFPA 2HMPA 1HPMA 2HF3A 1U2VA 3GOIA 4FPAA 3MN5A 2QWMA 2QW9A 2UYTA 1GLEG 3FZKA 1GLFO 1BWFO 1ATSA 2P9UA 4JHDA 1G99A 3WUHA 2F9WA 4BRFA 3TPQA 1BA1A 4JD2B 3WXIA 5AQPA 1X3NA 3FGUA 1TUYA 3MCPA 4BR2A 5AQXA 3CJBA 2P9LB 4K25A 5E26A 1SAZA 3WQUA 5AR0A 2P9IB 4H0TB 4BRMA 3VPZA 2PAVA 3H6EA 3CI5A 2NRHA 1HLUA 1HKCA 2GELA 4AM7A 2P9PA 2Q2RA 2A41A 4YDUC 5BRDA 5AQHA 3VF4A 5KPRA 1E4FT 4BRKA 4BG9A 1XQSC 3HM8A 5ELZA 1YXQA 2VWBA 1NGFA 3DXMB 1HX1A 3CHWA 5CE3A 3H3NO 3LDPA 1Y64A 2DPNA 3ENHA 3ZEUA 4IJNA 1GLAG 4M7XA 2E20A 3VESA 4FOIA 4CZHA 1QQMA 1GLCG 2NLXA 4B1XB 4EFHA 1C0GA 3MMVA 1NGEA 4CBUA 3UKRB 4J8FA 4MLHA 3WXJA 1H1VA 3CJCA 1QZ5A 4CZJA 4H03B 4ISEA 3ULEA 3D2FA 3UE5A 3HTVA 2ITMA 1D4XA 5F1XA 1T44A 2I7NA 3CQYA 5EXWA 1WUAA 2FF3B 2AP1A 2QWNA 5JICA 3A5LC 4DHYA 2E88A 3L4IA 5ADXH 5BN9A 2A6AA 3FZMA 3R9PA 4EIAA 2CGKA 4WQ5C 1CZAN 2IVOA 3TU5A 3QFUA 3HSCA 4CBXA 1MWKA 4CD1A 1BDGA 2P9KA 4K42A 4BRQA 4B9QA 2ASOA 2ZF5O 3EN9A 4IWVA 2BUPA 4I6MB 1NGBA 4WQ4C 2W41A 5AQIA 2HF4A 4RTFD 4EAHD 4CZIA 2P9IA 5AQJA 2CH5A 3H45C 4IJAA 3ZX0A 3MN9A 2FLOA 2QWOA 2GWKA 3A5MC 1NGCA 4FOEA 5AQNA 4H0PA 3GDQA 1KAXA 4BC2A 1IG8A 1YUWA 2HOEA 5JMVA 1MA9B 1QHAA 2A40A 4FL9A 3SMSA 5FPDA 1XUPO 2Q97A 4Y0WA 5BREA 2E2QA 1OKJA 2Q0UA 3S41A 4A2AA 1YAGA 3RSEA 5AZJB 3R8EA 4FO0A 4XH5A 3ATVA 2Q0RA 5AQKA 3U4LA 1MDUB 2P9NB 3BEXA 4O5FA 1NLVA 3H1QA 4CBWA 3P4IA 4NO7A 1NGAA 1SQKA 2FSNA 3UKRA 2ASPA 3A5NC 1QQOA 3FE1A 3U9DA 5AFUH 4BRGA 4BRLA 3SLCA 2YI1A 5EVZA 4JAXA 1ZBSA 1C0FA 2IIRA 5AZIA 5BPMA 5I9EB 1IJJA 1ZXOA 4IO8A 1TYQA 2A42A 2YJEA 2CGLA 4QS9A 4BC3A 2E2OA 1K8KB 4L3QA 3UB5A 3QB0A 4H0XB 3LM2A 3QICA 1BOTO 5EY4A 3ZETA 4BROA 5KPZA 5AQWA 3D2EA 1RGIA 3MN7A 1NGHA 3FLCO 1QZ6A 4K43A 3VGKA 2D1KA 3VEXA 2VCPA 3GBTA 3MK6A 5LY3A 4GNIA 4BR5A 2WUSA 2YHWA 4O8KA 4NB4A 4XEIA 4FWNA 1LCUA 3O6WA 1NGJA 2OANA 3CJ1A 3M6GA 2P9SB 4RWTA 1SZ2A 2CGJA 2BTFA 4RCHA 4FWPA 3GE1A 3WEEB 3VF2A 4H5RA 4BRDA 4PKHA 3C0BA 1QQNA 5AQLA 3DXKB 3IUCA 3SK3A 1KAZA 4CI6A 3GG4A 1BA0A 3AY9A 3W0LA 2E2PA 3EKUA 4YDUA 3EKSA 3UKUA 3O5BA 3ENOA 1EQYA 4DB3A 5BRHA 4EHUA 1DEJA 3VEOA 1MWMA 3JXUA 2V7YA 2IVNA 4BRIA 4BGAA 4HWIA 5ADXA 3LL3A 1U2VB 5JLHA 1NGIA 3VEVA 4KBOA 2V51B 3CIPA 4BC4A 1DKGD 5AQZA 2IVPA 3A5OC 2YJFA 2P9UB 4JHDB 5BPNA 1GLLO 5FPNA 4H0OA 3SMPA 2E1ZA 2ASMA 3B8AX 3LDOA 4BR7A 1NGDA 3W3DA 4JD2A 5F0XA 2QXLA 3O8MA 1Q18A 1S22A 4AM6A 1DGKN 4H5TA 4BREA 1K8KA 3SJHA 2P9LA 3AAQA 4A2BA 3CJ7A 5B8HA 3EO3A 4C23A 1U6ZA 2P9PB 2FXUA 1S3XA 2KHOA 2I7PA 2Q31A 3VGMA 4EHTA 2A3ZA 1WOQA 4B1UB 2E2NA 4WQ5A 1KAYA 2GTDA 3GL1A 4PKIA 4PL8A 5EX5A 1NMDA 4JNEA 1KXPA 2YHXA 1J6ZA 3DXMA 4QS8A 3ZEUB 1NBWA 4BQLA 4CD3A 2E1YA 5FPMA 3MDQA 1R59O 4F9OA 5KQ8A 3OHRA 2FF6A 2Q36A 1LOTB 3QMLA 4WQ4A 2GEMA 1E4GT 4IZ9A 3CQXA 5TKYA 5AQYA 5BRFA 5LJWA 3D7EO 3CETA 4K41A 3FFKB 4BRAA 5AFUA 5BN8A 4CZFA 2ZGYA 3VF6A 4BRHA 4M7YA 1ZC6A 3BP8A 3QBWA 1GLJO 3A8YA 3LDLA 4PL7A 3ULEB 4BVPA 2D4WA 3D2FB 4B1WB 3VOVA 4H5NA 1X9JA 1HJOA 2F9TA 3H46O 1V4SA 4CZGA 3DWLA 3JS6A 1HKBA 2QWQA 1V4TA 4MLEA 1JCEA 1HKGA 3CJAA 3IDHA 4MO5A 5AQQA 2QM1A 5BR9A 3EL2A 4CZMA 4LC9B 4H0YB 2A5XA 4BGBA 4BR9A 4H0VB 1RDWX 3IMXA 1RFQA 2NZTA 5AQSA 2V52B 3O1BA 2P9KB 4BC5A 4BG8A 5KPTA 4BR0A 1XC3A 3HBTA 5AQMA 5JLFA 3WXLA 1TUUA 4QS7A 1GLBG 3L0QA 4I6MA 1BUPA 4FWMA 2GUPA 3QBXA 1ATRA 4BVOA 3WXKA 3LDNA 2CH6A 3VENA 3KZBA 1T6DA 1BO5O 1Z05A 3QDKA 4FPBA 4Z94A 2D0OA 4BQZA 5E84A 2E8AA 5AQTA 3VGLA 3U8XA 3AARA 3EZWA 1JCFA 5AQGA 3RSEB 4B1VA 3I8BA 1JCGA 2ZWHA 3FZHA 4MO4A 1T6CA 3VETA 4WYBA 5AZJA 4M63C 2H3GX 3C7NB 1NGGA 2GWJA 3BF3A 2QWRA 3R6MA 2P9NA 4ISGA 4CJ7A 3L6QA 4PKGA 3FR0A 5BPLA 5AQOA 5EOYA 3ATUA 1X3MA 3O08A 2PBDA 3CJ9A 3J8AA 4FWOA 3FZLA 5AZIB 3FZFA 4CZLA 2Q1NA 4BR4A 4H5VA 1TYQB 3M3ZA 3CERA 4GY2B 4BRNA 4HTLA 3O1WA 4FWQA 3H1VX 1ATNA 3VEZA 3ZETB 3VEWA 3VEYA 3ZX3A 3U9ZA 3DAWA 4DQ8A 2YHYA 5FPEA 3D2EB 4XH4A 5AQVA 4CZKA 3KVGA 3HZ6A 2FSJA 3O4WA 4FWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YNGA 1VQLN 3SV4A 4FJMA 3ZT3A 4Z4FA 2BGGA 4BRCA 4B1ZA 3MEDA 4CJVA 4CEAA 2HHUA 3H3OB 3OA9A 3F9MA 1NWKA 3ID8A 3OTOK 1QVGM 4E1JA 2D0CA 2VG5A 3DXKA 3HI0A 4FWSA 4G9ZA 4FWLA 4CHQA 1SKRA 2HHQA 3KTQA 2BE2A 4CE9A 3AVJA 3C7NA 4CESA 3IFRA 4B1YB 2YCHA 4CIEA 1VSMA 3MXMA 1C1AA 2HMPA 1U2VA 4FPAA 4Z4GA 2UYTA 1GLEG 1WB9A 3J80O 2O8DA 4DTXA 5KTQA 4BDZA 4B9NA 3J7YP 1BA1A 1TUYA 3MCPA 2QTDA 2P9LB 4KHSA 5JVGL 3RMCA 1WSEA 1SAZA 5M1PA 5CR4A 4YOVA 4H0TB 3KWIA 5T7BA 3CI5A 2QXFA 2Z1JA 4NXNK 2Q2RA 4M3ZA 5J2MA 4KAZA 1WSFA 3VF4A 4DSIA 4KRFA 3E1YA 5ELZA 3V1OA 4KPYA 2O8CA 4JI3K 3DXMB 1IG9A 4R5PA 3TTDA 3H3NO 1X9MA 4OLBA 2UXCK 2DPNA 4PA1A 5LMNK 4IJNA 3BZCA 2ETJA 3VESA 1QQMA 2NLXA 4CEOA 4EFHA 1LAWA 3MMVA 3UKRB 5KGWA 1EKEA 4CFDA 3MXJA 3SUOA 3CJCA 4H03B 3NBPA 4ISEA 4FM1A 4C8NA 3HTVA 1T44A 5EXWA 1G15A 5CZ1A 2FF3B 5HRPA 2AP1A 2QWNA 4HUFA 4DHYA 1GOAA 2FC0A 2Z1GA 3S3MA 3FZMA 4EIAA 3VA3A 1A5VA 1YIJN 4WQ5C 4KV8A 4A59A 2ITGA 5SWMA 3NVMA 3S3OA 4K42A 1ZBIA 3EY1A 4I6MB 4CF9A 5AQIA 3F73A 3G0ZA 2HF4A 4RTFD 2NRTA 5FLXO 2IDOA 2P9IA 3P83D 4IJAA 3ZX0A 4NLBA 4CECA 1KCFA 4FOEA 3RR8A 1U47A 1KAXA 3NCIA 1VK0A 4JI8K 4YHHK 2D0BA 3WNHA 4BC2A 4FM2A 1TL3A 2HOEA 5JMVA 1QHAA 4H4MA 5FPDA 4UQGA 4LF5K 1OKJA 3THYA 3VQDA 3AO3A 1YAGA 2O8EB 4EP5A 3OYCA 4LF8K 3NH0A 2Q0RA 4DR3K 4ZTJA 2X74A 4AF1A 3HSTB 1RDDA 2QKBA 1XC9A 4JKGA 4IFVA 1NGAA 1SQKA 1VSLA 2ASPA 4DTJA 1RDCA 3U9DA 3CMEN 5AFUH 4BRGA 3SAHA 3CM6A 3MEEA 4ID1A 2IIRA 3O4QA 5AZIA 3DRSA 3OYEA 2D5RA 2HHWA 4LD0A 2QEXN 2GUIA 3HRGA 2HBKA 5JVHL 4A57A 2CGLA 3QNOA 1RT4A 4DWIA 4H0XB 4JKFA 3HL8A 4FJ5A 1NG9A 1IBKK 4YOWA 3QEXA 1YI2N 4DFMA 5KPZA 4KHPK 5AQWA 1DLOA 2FBXA 2RHKA 3WNGA 1RTDA 4O0IA 4GVMA 2XO7A 2YHWA 4O8KA 4DR7K 4DMNA 1S9EA 2OANA 2EX3A 2WTUA 2P9SB 3V1RA 4I9QA 1SZ2A 2CGJA 4RCHA 4KH6A 3GE1A 2F8TA 4XIUA 3PSFA 2WC9A 4H5RA 5DM6L 2YNFA 4PKHA 3C0BA 1RDAA 4FJ7A 1ZBHA 3OY9A 2W6KA 4N47A 3GG4A 4CHZA 3AVAA 2E2PA 3TAQA 3ENOA 3DYAA 4BWMA 4JI0K 5BRHA 3OYBA 3MX2A 3OJSA 3OS2A 3TAPA 3VQPA 2XY8A 5CZ2A 1J5OA 3CC2N 4W5QA 4HWIA 5JLHA 1S5JA 1X1PA 4DQRA 5CY4A 4CFCA 3ZT2A 3OBWA 2P9UB 4GV3A 1HNVA 4B9VA 4ILJA 2E1ZA 3B8AX 2QKKA 1KTQA 4F4KA 3LDOA 1NGDA 1J54A 4CGDA 1K9MO 2DTUA 4CJUA 4NYFA 3TTCA 5J1EA 2QXLA 4JS5A 1K8KA 2KW4A 3CJ7A 5K14A 5HRNA 5B8HA 1BGXT 4C8LA 4DR2K 2OA8A 4C23A 1Q82O 3LP1A 2P9PB 2FXUA 4BDYA 2Q31A 4IDKA 5TKWA 4WQ5A 3L2VA 2G8IA 2IC3A 2HNYA 1Q9XA 4KTWA 4RW8A 4FJIA 3SBTA 1J6ZA 4M3TA 3CC7N 2HHHK 3O9QA 4BQLA 4DKWA 4CD3A 5FPMA 2ZD1A 5GAEP 2ZJRL 4FVUA 3THXB 1T7PA 4K41A 1HNZK 4I2PA 5BN8A 1UAXA 4CZFA 3SCXA 3VF6A 4M7YA 3QBWA 3VQAA 3LDLA 4JKHA 4PL7A 2D4WA 4B1WB 2VWJA 3CCRN 1V4SA 4CZGA 3T7ZA 1HRHA 2YV0X 3EE9A 3N4PA 2UXDK 4OLAA 4FLZA 2QM1A 3EL2A 4LC9B 4LF4K 2RE2A 2ATQA 1LAVA 4H0VB 3HK2A 1RDWX 1VAZA 2PZSA 4OKKA 3LAKA 5AQSA 3C6HA 3VTHA 1VRTA 4E7KA 3ZLJA 5KPTA 1TVRA 1S6PA 1YHQN 5JLFA 2NUBA 4MQ3A 1JLGA 1GLBG 4CJTA 1BUPA 3F5TA 3ZT4A 4BVOA 3WXKA 3HT3A 1Q7YO 1E3MA 1T6DA 4C1NK 4JLHA 4FPBA 3EZWA 1JCFA 4Z4EA 1JCGA 2QA4N 3RRGA 1XMQK 3M8QA 1NGGA 2QWRA 2P9NA 3B6OA 3L6QA 3FR0A 2BH1A 3D45A 5EOYA 4DV4K 4C8MA 3ATUA 1N5YA 2E6LA 1QSLA 3SYZA 4CJLA 4FWOA 1W2BM 3J7AP 2UUBK 3RTVA 3MECA 4R79A 3L2QA 3D0PA 5SZTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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