2AP1A

Crystal structure of the putative regulatory protein
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
NAMYYGFDIGGTKIALGVFDSTRRLQWEKRVPTPHTSYSAFLDAVCELVEEADQRFGVKGSVGIGIPGMPETEDGTLYAANVPAASGKPLRADLSARLDRDVRLDNDANCFALSEAWDDEFTQYPLVMGLILGTGVGGGLVLNGKPITGQSYITGEFGHMRLPVDALTLMGFDFPLRRCGCGQMGCIENYLSGRGFAWLYQHYYDQSLQAPEIIALWEQGDEQAHAHVERYLDLLAVCLGNILTIVDPDLLVIGGGLSNFTAITTQLAERLPRHLLPVARAPRIERARHGDAGGMRGAAFLHLTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the putative regulatory protein
rcsb
molecule keywords putative regulator protein
molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 102
structure length 305
sequence length 305
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2005-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ap1A02
4H5RA 1MDUB 2P9SB 5AQYA 4CZHA 1R59O 3AARA 3I8BA 4BC5A 3H1VX 1YUWA 3MDQA 1HUXA 5EXWA 1RDWX 5AZIA 2I7NA 2KHOA 2QM1A 2YHYA 2A40A 2GEMA 3VF2A 2V7YA 1TUYA 2Q2RA 3D2EA 4JN4A 4XH1A 1BA0A 3VEZA 3ULEB 3WXJA 5I9EB 5KPRA 3LDPA 5AQRA 4BROA 2FF6A 1BU6O 2IVOA 3BEXA 5TKYA 1H1VA 5B8HA 4PL7A 3CJAA 2V51B 4B1XB 4WQ4A 3GDQA 3LM2A 4IJAA 5BRHA 2E88A 3QMLA 1HKCA 3ZX2A 3VGMA 4FWSA 3JXUA 4FPBA 2ASPA 2A5XA 3H45C 1RGIA 2YJEA 3TU5A 2P9UA 2CGKA 5CE3A 3R8EA 4IZ9A 3CHWA 1CZAN 2I7PA 1U2VA 3HZ6A 2OANA 1TUUA 1K8KB 1KAYA 2DPNA 4H0XB 4BC2A 4H0PA 4BG9A 4BC3A 1NGCA 4BGBA 3W0LA 5AQNA 1X3NA 3C0BA 4H5WA 1ZC6A 1WUAA 4EIAA 2VCPA 4EHUA 5LJVA 1HX1A 3VEOA 2J4RA 1JCEA 2D0PA 5BN8A 4H5TA 3CI5A 3HBTA 1YVNA 3IMXA 3SMPA 1NGAA 4RWTA 3WEEA 1HKBA 3CJ1A 4JHDB 4I6MB 2P9KB 3R9PA 1OKJA 1NGBA 1ATNA 4FPAA 4EFHA 4BRCA 1DKGD 1BOTO 4RTFD 1XC3A 4BQLA 1ESVA 3A5MC 1NGIA 2Q1NA 2F9WA 4FO0A 5KPTA 5AQXA 4HTLA 1BG3A 3MN9A 2ASOA 4BRDA 2V7ZA 4WQ4C 3VGKA 1NGFA 5AZIB 1NGEA 5ELZA 2PBDA 3WXKA 5E26A 1GLDG 3VF6A 3M3ZA 3ENOA 3O1WA 2FXUA 4BVOA 4BR2A 1U6ZA 1Q18A 1QZ5A 3A0IX 3CQYA 2FSJA 3LL3A 3CJCA 3FGUA 4DQ8A 3CETA 4FL9A 4CZJA 3FE1A 4DHYA 2AP1A 5AQOA 4BRMA 3IUCA 5FPEA 3KHYA 4BG8A 1NGDA 3GG4A 4NB4A 2QWNA 4XEIA 4DB3A 2P9UB 2UYTA 3CJ7A 1ZBSA 2CGLA 5AR0A 4BRPA 4JD2A 1U2VB 1ZXOA 4MO4A 4GY2B 4B1WB 3CJ9A 4JAXA 1E4GT 1QZ6A 4FWLA 2HMPA 4C23A 3VF4A 1WOQA 1T44A 3DXKA 4ISGA 2W40A 3AY9A 2IVNA 5E84A 2GTDA 1GLBG 3RSEA 2YHWA 5AQZA 1MWMA 4RCHA 2P9PA 5AQGA 3WEEB 1C0GA 4BR5A 4PKIA 3O4WA 4QS9A 1BUPA 5F0XA 1X3MA 2AA4A 1TYQA 4BQZA 2D4WA 1JCFA 2E2NA 2ZGZA 1SQKA 4PKGA 3VEVA 2QWQA 4WYBA 3IDHA 3CJBA 1GLJO 2A6AA 4CZGA 5AQVA 1RFQA 5BRDA 5BPMA 2Q31A 2WUSA 3UKUA 1XUPO 4BRAA 3C7NA 2QWLA 4GNIA 2FSNA 1BO5O 2HOEA 4YDUA 2P9IA 3A8YA 3KVGA 2ZF5O 3FZMA 4FWRA 3VENA 1QQNA 1Y64A 5AQTA 5KQ8A 3VOVA 5AQHA 4E1JA 3D7EO 5BR9A 2HF4A 4HWIA 1S22A 3B8AX 4H0YB 3FR0A 3H3OB 1P8ZA 2QWPA 3AAQA 3QBWA 3O80A 4FWPA 1NLVA 2P9NA 4AM6A 4KBOA 1ATSA 3EKSA 5AQMA 3ZX0A 3IFRA 4IJNA 1BDGA 2YI1A 3GBTA 3FZHA 2Q97A 4K43A 1KAZA 3HI0A 5AQIA 2ZGYA 3MK6A 4BRLA 4Y0WA 3EO3A 3EL2A 1NBWA 4BRFA 1GLCG 2ITMA 4JD2B 1GLAG 4BRNA 3GOIA 1NGGA 2CGJA 2NRHA 5AQJA 2Q36A 3MMVA 4J8FA 3VGLA 1LCUA 3ZEUA 1HJOA 3BF1A 3DXKB 1V4SA 2V52B 3MN6A 3O08A 3CIPA 3TPQA 1NGJA 3BUZB 3MCPA 3U4LA 4CJ7A 4H5VA 4CZFA 3A5LC 2BUPA 3ID8A 1YXQA 3ENHA 1ATRA 3RSEB 4F9OA 1SAZA 4EHTA 1S3XA 3WXIA 3HM8A 1E4FT 5AQPA 1G99A 3DXMA 4K41A 2P9PB 2E2PA 4YDUC 3BF3A 4BRHA 3FFKB 3QFUA 3D2EB 1TYQB 3QFPA 3FLCO 1MA9B 4ISEA 3UKRA 2D0OA 3EZWA 3VETA 3UE5A 4H0TB 4B1YB 3M1FA 4B1VA 3QB0A 5LJWA 1X9JA 3UKUB 4QS7A 4K42A 2E1YA 2FLOA 3EN9A 4H03B 2A42A 4A61A 3DJCA 1NMDA 2P9IB 3FZLA 4ISFA 4O8KA 3ZETA 4M7YA 4FOIA 3ZX3A 4PL8A 1KAXA 1MWKA 1GLLO 4A2AA 3LDOA 3AAPA 5AFUH 3R6MA 4L3QA 3UB5A 3WXLA 5EOYA 2A41A 1QHAA 3VEYA 3W3DA 4CZLA 2QXLA 2P9NB 4NO7A 4EAHD 4M63C 1V4TA 2YCHA 4MO5A 4FWQA 3ATVA 2P9LA 4FSVA 4MLEA 3FZKA 2IIRA 4AM7A 4DCHA 4BC4A 4BR9A 2GUPA 3BP8A 2ASMA 1HLUA 2VYPA 2CH5A 2P9KA 2D1KA 3H6EA 1C0FA 4BRGA 3WQUA 5AFUA 3OHRA 5EY4A 4CBUA 5F2RA 1GLFO 4CZIA 2Q0RA 4FWKA 3ZEUB 5KQDA 4FWOA 2E2QA 5BRFA 3QBXA 2H3GX 4BREA 1D4XA 2GWJA 3U8XA 3O6WA 4CBXA 3VEXA 2VWBA 4MLHA 3DAWA 2ZWHA 3SJHA 3QICA 2FSKA 3WUHA 1IG8A 5JICA 5F1XA 3S41A 4BVPA 3DXMB 2W41A 4H5NA 3A5NC 2Q0UA 3CERA 4B1UB 1NGHA 3DWLA 3SMSA 4IWVA 1Z6RA 3L0QA 5ADXH 1IJJA 3UKRB 4BRKA 3D2FA 4FOEA 2IVPA 2EWSA 5LY3A 3VESA 5BPLA 5AZJA 5FPMA 1HKGA 3ATUA 4BGAA 1XQSC 4XH4A 3FZFA 4K25A 4JNEA 3SK3A 5JMVA 3EKUA 3H1QA 3ZETB 4PKHA 3LDNA 3LM9A 4O5FA 3H46O 5AQLA 2YJFA 1NM1A 4CBWA 2E8AA 3I33A 1HPMA 4IXCA 1T6DA 2P9SA 3O1BA 5AQFA 1Z05A 1JCGA 5ADXA 2F9TA 1KXPA 5AQUA 4WQ5A 3WQTA 3VEWA 3QDKA 2P9LB 4BRQA 3U9ZA 4BRIA 3P4IA 3L6QA 2A3ZA 2QWOA 3ULEA 4Z94A 2E20A 1NWKA 3H3NO 4A2BA 2NLXA 1BWFO 4BR0A 3G25A 1EQYA 2FF3B 3M6GA 4FWNA 5KPZA 1LOTB 5EVZA 4QS8A 4BR4A 5BPNA 5FPNA 2E1ZA 5BN9A 3JS6A 2QWRA 4BR7A 5JLFA 1GLEG 2PAVA 4IO8A 2YHXA 5JLHA 4CZKA 1QQMA 1BA1A 3MN5A 4H0VB 1SZ2A 3C7NB 5BREA 1T6CA 4B9QA 2GWKA 4B1ZA 3HSCA 3LDLA 5AQSA 4LC9B 2HF3A 3HTVA 1K8KA 3SLCA 3VPZA 3O8MA 3F9MA 3MN7A 4A62A 5AQQA 4H0OA 5EX5A 1J6ZA 3D2FB 3U9DA 4CD3A 1DEJA 3GE1A 2BTFA 2GELA 3LDQA 5AZJB 4CZMA 5AQWA 3GL1A 3VERA 1QQOA 3KZBA 4WQ5C 4M7XA 2CH6A 3CQXA 3L4IA 1DGKN 3WT0A 3A5OC 5FPDA 4CZEA 2QW9A 4JHDA 4XH5A 4I6MA 4CI6A 4CD1A 2QWMA 5AQKA 2E2OA 3O5BA 1YAGA 3J8AA 2NZTA 4FWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B6AA 2P9SB 1R59O 3WNFA 4BWJA 3DLHA 3ZT1A 3CCMN 5J2PA 1RDWX 4B3MK 2I7NA 5KTQA 1NJWA 1EO1A 2YHYA 2YNIA 1TKXA 4XH1A 3VEZA 2UXBK 4DV5K 5KPRA 4BROA 2FF6A 3CJAA 4WQ4A 3P5JA 5BRHA 4BE0A 3ZX2A 3IS9A 3OJUA 5DMRA 4FPBA 2WONA 1X9SA 3H45C 1YJWN 2YJEA 3TU5A 5CE3A 3CHWA 4X64K 4KHSA 1KAYA 2DPNA 4H0XB 3CFPA 2KLAA 4H0PA 1VQ6N 2O8DA 3B6OA 4WFAL 1U48A 4IKFA 1WUAA 4EIAA 3QERA 2D5RA 4B3SK 1ZBHA 4CK2A 1EX4A 1IBKK 3SMPA 5GAGP 3CJ1A 4CJEA 4JHDB 4I6MB 1ZBFA 4W5OA 1NGBA 3G4SN 3L2RA 4BRCA 4R79A 1XC3A 3RMBA 3DI6A 1NGIA 3L2VA 2ZM6K 4IFEA 5KPTA 5AQXA 4DFJA 1JLBA 2V7ZA 4OKJA 4WQ4C 3VQ8A 1NJZA 3K5OA 1J53A 4BWMA 5AZIB 2NRXA 1UWBA 1GLDG 2F96A 3WNHA 3O1WA 4CJQA 2EHGA 3OBWA 3KLGA 2W6LA 4FJJA 3O4QA 3V1RA 4K8ZA 1U6ZA 2YHBA 3HJFA 3LL3A 4M45A 3CJCA 3T3FA 2RE2A 3DMJA 3QETA 1N5YA 3CF5L 3HM9A 4JV5K 4DHYA 2AP1A 4BRMA 4FM0A 4CJTA 4BG8A 5FRNA 4G9ZA 2QA4N 1UAXA 2UYTA 1VQMN 3CJ7A 4HTUA 4F2SA 4B9TA 3O9UA 4KI4A 3VN5A 4U67L 4JD2A 4PHTX 1U2VB 1ZXOA 4GY2B 3V1OA 2WBNA 4C23A 4CF2A 4C1NK 4ELVA 1KFSA 3AVMA 2W40A 1ZBIA 1TK8A 2VQFK 2IVNA 5E84A 3EYZA 4KFBA 2YHWA 3ID6A 3HPOA 4E1NA 4KTQA 1BQMA 4CF9A 1RBUA 1LV5A 1OVQA 4RCHA 4FK4A 3O3HA 1M1KO 5AQGA 1K6YA 1C0GA 4E89A 5F0XA 4FJ7A 1X3MA 4IBNA 1VQ9N 3I0RA 3CC7N 4DF8A 2HHTA 3CJBA 3PX0A 1CLQA 2YKMA 2A6AA 3VQ9A 4KHPK 5BPMA 1N32K 2WUSA 4OVLA 3UKUA 2BDPA 5GIOA 1EP4A 3LP3A 2JWLA 3CCVN 2ZF5O 4DTRA 1QQNA 5KQ8A 4GW6A 5JVGL 3P39A 4E1JA 3C95A 1YJ9N 1GOCA 2GX9A 2HF4A 4GKJK 4HWIA 1T8EA 4H0YB 3AVGA 3H3OB 2NNWA 1P8ZA 1S9GA 4E7HA 3L8BA 4E3SA 3SQ1A 1OH8A 3HK2A 3AAQA 4KH6A 1NLVA 4AM6A 4KBOA 3DRRA 3QESA 3IFRA 4IDKA 1BDGA 2YI1A 3FZHA 5IT9O 3AVCA 5AQIA 4BRLA 4KKOA 3G10A 3IG1A 1EXQA 1IBMK 1GLCG 5M1QA 1YI2N 2B4JA 3PIPL 1ZBLA 4GVEA 4JKFA 3GOIA 4DUYK 4DSFA 4NYFA 4N47A 4KREA 4U7BA 3OY9A 4DV4K 3MMVA 4J8FA 3THWB 3M8QA 2X74A 2V52B 3IRXA 4C1NI 2ZQBA 1NGJA 4H5VA 2BUPA 4B8CA 1JLCA 1SKRA 1SAZA 4EHTA 3FFIA 3DXMA 4CJFA 3OS0A 1ZYQA 1C0TA 3FFKB 4R5PA 4X65K 4JK9A 4HCCA 1MA9B 4Z0UA 4E1MA 1WLJA 3OA9A 4LFCK 3EZWA 3VETA 1Z25A 4YOUA 3V9UA 2Z1GA 4CEBA 2O8EB 2E1YA 2FLOA 3EN9A 4H03B 4A61A 4KRFA 4O8KA 4DSIA 4EP4A 4FOIA 3T19A 3U3GA 3TAEA 4B3TK 1MWKA 4ZTJA 1GLLO 4A2AA 4CEFA 3ZSOA 3RRGA 3O3GA 3CXCM 4RW4A 3UB5A 4DU1A 3WXLA 1SS6A 1JLQA 2A41A 1EETA 3K9JA 3W3DA 2VWJA 4CJPA 4OPHA 3A2FA 3ATVA 4FSVA 3LP0A 2UUBK 3BP8A 3C94A 3SCXA 4JI6K 3DLRA 2UUAK 2UUCK 2VYPA 2CH5A 1EKEA 4OKEA 3L2UA 4TSXA 3MXMA 3HSTB 3PSIA 1VQON 5HBMA 2OPSA 3NF7A 3HP9A 3DLLL 1XHZA 3AVNA 1W97L 2YHAA 5GADP 4FWOA 2E2QA 5BRFA 4CFDA 1NK0A 1D4XA 3M8RA 1RT3A 1ASUA 3SJHA 4LFAK 3VMFB 3WUHA 3V1QA 4DS4A 5C2FA 4JI7K 4H5NA 4ILJA 2VGMA 3CCLN 4B1UB 1NGHA 1RTDA 3SMSA 3THYB 3KWGA 3D2FA 5HRSA 4DLEA 3CG7A 2EWSA 3T7ZA 5M1FA 1ILYA 4F3OA 1C6VA 4BGAA 3PO5A 3FZFA 4DR2K 1RTJA 2ZJPL 3P1GA 1VQ4N 3TTFA 5D3GA 3MECA 4ELTA 4FJ8A 4DR5K 2YJFA 3NBPA 2HVIA 5SWMA 4IXCA 3I33A 4DR1K 1JXEA 3TSQA 2P9SA 1SKSA 4C8OA 1Z05A 3RR8A 3HL8A 3OYBA 4F2RA 1L3TA 3BDPA 1KRPA 1D9DA 4IO9L 2P9LB 4BRIA 3THXB 3CFRA 3OYNA 4CCHA 3CPEA 3RWUA 4IEEA 2YKNA 3L6QA 5C42A 2A3ZA 1IH7A 3H3NO 5H1SQ 4C8MA 3UIQA 1DLOA 2XY5A 3TANA 4X66K 4AHUA 5EVZA 4BR4A 4EP5A 3G71N 5BPNA 2E1ZA 3OYLA 1GLEG 3PO4A 4A5BA 1BA1A 1SZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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