4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
1V4SA 2E2OA 2PBDA 5JICA 4FWKA 4EHUA 2I7NA 4FPAA 1DGKN 2IIRA 2GUPA 3MN6A 3CJ1A 4M7XA 5B8HA 4GNIA 3CIPA 2ASOA 3IUCA 4XH1A 1EQYA 3HM8A 4FWQA 2E2PA 3BP8A 5BREA 4PKHA 4FL9A 4H0XB 3I8BA 2P9LA 4B1UB 4A62A 1S22A 2CGLA 1QQNA 5KPRA 1Q18A 2DPNA 1QQMA 1MWMA 4E1JA 3WEEA 3QDKA 5LJWA 1KXPA 1HKGA 3F9MA 4B1WB 4QS8A 3JXUA 4L3QA 5AQQA 2PAVA 4JD2B 4ISEA 1Z6RA 4FSVA 2CH6A 4MO4A 4PL7A 3L0QA 5BR9A 3BUZB 2YHYA 3UKUB 3IDHA 5AQYA 4JHDA 2WUSA 3FZKA 3DJCA 1X3MA 4IJAA 4C23A 3D2EA 4B1ZA 3DXKB 3VEOA 3M1FA 3MN7A 3LDLA 3EL2A 3P4IA 4XH5A 2P9NA 1SQKA 2QWQA 1BWFO 2Q97A 5BRDA 2QWLA 3S41A 3L4IA 4FPBA 5AQLA 5CE3A 3ZX3A 3M3ZA 3SLCA 1T44A 3EKSA 4FWMA 1DEJA 1H1VA 4J8FA 2ZGZA 3C7NA 4BC4A 5EOYA 5AQJA 2IVOA 1G99A 3AAQA 5AQRA 1GLBG 5AZIA 3VENA 5AFUH 2GELA 3VF4A 3FZLA 5AQSA 2P9LB 3R9PA 4CZFA 1IJJA 1WUAA 1LCUA 2D4WA 4H0OA 3WEEB 3FZMA 3BEXA 1YAGA 2A5XA 4BRLA 5EXWA 4O8KA 5AQZA 5ADXA 3VEXA 1NBWA 2FF6A 1HUXA 5BN9A 2CGJA 2FSJA 4PKIA 2QWPA 3QMLA 3RSEA 4JHDB 2D0PA 3CJ9A 1HPMA 1T6CA 1XQSC 1YXQA 3D2EB 3SK3A 2F9WA 1WOQA 3CJBA 1ESVA 4BRFA 3ULEA 2P9NB 1C0GA 3EN9A 3CJCA 2YHWA 3VPZA 5TKYA 5E26A 4BC2A 3VEYA 2V51B 3AY9A 3JS6A 1NGBA 3DWLA 4CI6A 3C7NB 1BU6O 2J4RA 3O8MA 2V7YA 5AZIB 3IMXA 3VGMA 1T6DA 1BG3A 3A5LC 3HZ6A 2YJEA 4K25A 2HF4A 4JD2A 4Z94A 4CZLA 4MLEA 3H3NO 4CZJA 2GWJA 4PL8A 4XH4A 4DCHA 3I33A 1BUPA 3ID8A 3EZWA 4YDUC 3L6QA 1QZ5A 3CQYA 4BR0A 5AQTA 3KVGA 2HOEA 2IVPA 3EO3A 3VGLA 3RSEB 1C0FA 4BR5A 1ZBSA 1BO5O 4DB3A 3GG4A 2A41A 4A61A 2ITMA 5AQXA 2Q2RA 3BF3A 5EVZA 4CD3A 4CBUA 1ATRA 3O1WA 3ENHA 3ULEB 5AQNA 4EHTA 3QB0A 3WXJA 3QFUA 1BA0A 4BC5A 5FPDA 5F0XA 1X3NA 2Q31A 1GLDG 3H6EA 4CZKA 3G25A 4H03B 2D0OA 4BC3A 2YJFA 4M63C 4BROA 3FZFA 4WQ5A 2AP1A 1RFQA 3ATVA 3GDQA 3W3DA 1NGIA 4K41A 4BR4A 2A40A 2CH5A 4BQLA 3HBTA 3MN5A 1LOTB 1JCFA 4IZ9A 3SJHA 2CGKA 3O80A 2ZF5O 2UYTA 1GLFO 1RDWX 1NGHA 2YI1A 4CZHA 4BREA 1GLLO 3MDQA 3TPQA 3MK6A 4CZEA 5ADXH 2W41A 2A42A 5LJVA 3WXKA 4HTLA 1QZ6A 3DXMA 1JCEA 1Z05A 3LDPA 4I6MA 3U8XA 1MA9B 4QS7A 3VETA 3ZEUA 5AQHA 1X9JA 4ISGA 1GLCG 3D2FA 3WXIA 1J6ZA 1GLEG 4FO0A 1MDUB 2QXLA 3BF1A 3WQTA 1HX1A 4HWIA 3UE5A 4BRCA 4FWLA 2GTDA 5BRHA 4BR9A 3LDOA 3GL1A 2V52B 2FLOA 2P9PA 1E4FT 4FWPA 4A2BA 2FXUA 2P9UA 4QS9A 2V7ZA 4GY2B 4K42A 3H1QA 4EFHA 1NGAA 4WQ4A 4PKGA 3U9ZA 3MCPA 2A6AA 1CZAN 4LC9B 2NRHA 4K43A 1BA1A 4DQ8A 1IG8A 2QWRA 3A5NC 3M6GA 1GLJO 5AQUA 2BTFA 4FWSA 2VCPA 2FF3B 2HMPA 4BG9A 4CBWA 3FE1A 4WYBA 5JLHA 3FGUA 3LM2A 5BRFA 3DXMB 4BGBA 3CJAA 4I6MB 5AQPA 1HKCA 3ZEUB 3AAPA 2OANA 3ATUA 3MN9A 1NM1A 1R59O 3CI5A 3CJ7A 2E88A 2EWSA 3D2FB 5BPLA 4IO8A 5AQIA 5AQOA 4BRIA 3HSCA 1GLAG 1JCGA 4EIAA 1NWKA 2Q1NA 4FWOA 1XUPO 3VOVA 4FWNA 3A8YA 1P8ZA 4JNEA 2Q36A 2NLXA 1NGDA 5KPZA 3O08A 1NGEA 2E20A 2P9PB 4H0PA 3KZBA 4A2AA 4BR7A 5BPNA 4O5FA 5F1XA 2P9UB 3HI0A 4AM6A 2Q0RA 4H0VB 3VF2A 5AR0A 3MMVA 1XC3A 4H0TB 3SMSA 5LY3A 1U6ZA 1KAXA 3WUHA 4CJ7A 4H0YB 3O1BA 3H3OB 2H3GX 4BRKA 1ZXOA 5BPMA 2ZGYA 2P9KA 5FPNA 3W0LA 3A0IX 1K8KA 2I7PA 3CQXA 2KHOA 3O6WA 1NGFA 1OKJA 2E8AA 2VWBA 4EAHD 1QQOA 4ISFA 3H46O 3CHWA 3WT0A 4H5RA 2ZWHA 1NGJA 1D4XA 4IJNA 2YCHA 1BDGA 1NGGA 3QICA 4JN4A 3H1VX 5JMVA 2A3ZA 1TUYA 3UB5A 1RGIA 3FZHA 4B1VA 3VEVA 3EKUA 1U2VB 1Y64A 3FLCO 5KPTA 1TYQA 4KBOA 3LL3A 4FWRA 1KAYA 2P9SA 3GOIA 3OHRA 2QWMA 3U4LA 3H45C 2W40A 1NGCA 3VEWA 1TUUA 4XEIA 4NB4A 4WQ5C 3UKRB 3A5MC 3J8AA 4AM7A 2NZTA 1BOTO 3O4WA 4CZIA 4BVOA 4CD1A 4BQZA 3IFRA 2QM1A 2E1YA 5EY4A 1S3XA 3QFPA 3WQUA 1ATSA 2QW9A 2P9KB 3LDNA 4FOEA 4H5NA 4JAXA 4DHYA 5BN8A 2E2NA 1K8KB 5ELZA 2FSNA 4H5TA 4BRHA 3HTVA 5AQFA 3WXLA 2Q0UA 5KQDA 4B1YB 1MWKA 1E4GT 5AQVA 4CZGA 3QBWA 5AQMA 1ZC6A 2P9IA 5AQWA 4BRPA 4BRGA 4B1XB 4BRQA 5JLFA 3FFKB 5E84A 3QBXA 4H5WA 5F2RA 4BRAA 4MO5A 5AZJA 4RWTA 4NO7A 4FOIA 1SAZA 2HF3A 2ASPA 4BRDA 4BG8A 3DAWA 1TYQB 2P9SB 2E1ZA 4MLHA 2AA4A 3ZETA 2D1KA 4CZMA 4RTFD 4F9OA 4BGAA 3GE1A 5AQGA 1HLUA 3AARA 3ZX0A 2IVNA 1YUWA 2YHXA 4M7YA 5AQKA 3ZX2A 5I9EB 1NLVA 3TU5A 3R6MA 5AFUA 1HKBA 1DKGD 4Y0WA 3FR0A 3C0BA 2ASMA 3KHYA 2GWKA 4YDUA 3O5BA 4BVPA 5EX5A 4CBXA 3VEZA 4BRMA 4RCHA 1NMDA 2F9TA 3LDQA 4WQ4C 1SZ2A 4H5VA 3R8EA 2E2QA 1YVNA 3CERA 4B9QA 5FPMA 4BRNA 1V4TA 1U2VA 2FSKA 4BR2A 2P9IB 3A5OC 3U9DA 5FPEA 3ENOA 3SMPA 5KQ8A 1KAZA 3VESA 3GBTA 5AZJB 3VF6A 1HJOA 3VERA 3LM9A 3UKRA 3UKUA 4IXCA 2VYPA 3D7EO 2QWOA 1ATNA 3VGKA 3CETA 3ZETB 3DXKA 2GEMA 2BUPA 3B8AX 1QHAA 2QWNA 4IWVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WTUA 1QE1A 2I7NA 1WLJA 4FPAA 1DGKN 3TARA 4CF1A 3NH0A 2KKZA 3I55N 1D9FA 3C65A 3OS2A 2ASOA 4FLXA 4XH1A 1KVAA 2E2PA 4FL9A 1VQ9N 3TAEA 4U7BA 2CGLA 1FKPA 1QQMA 3P1GA 3WEEA 1NK9A 1BIZA 3MX5A 5AQQA 4JV5K 4DLGA 4JD2B 1KC8O 4E7IA 4ZTJA 4PL7A 2F96A 4CHZA 4CF2A 1N33K 2O8FA 2VG7A 2WUSA 4DSEA 3G4SN 4IO9L 3D2EA 4B1ZA 4CJFA 1NK5A 4DQIA 2O8DB 2P9NA 4Y1CA 3E01A 3S41A 1RDAA 1LWCA 4B9LA 3EKSA 3V81A 2IVOA 1G99A 3AAQA 5AQRA 1GLBG 5AZIA 3VENA 4KKOA 1VQ4N 5HL7L 5CZ1A 3VF4A 5AQSA 2P9LB 3R9PA 1NK4A 4B9UA 2D4WA 4H0OA 4MDAA 3MXIA 4CJVA 4BRLA 5AQZA 3DRPA 1NBWA 3O3GA 3J7AP 4PKIA 4RW7A 2QWPA 3HP9A 5TKWA 3RSEA 4LH5A 4CHQA 3QESA 3KLGA 5I3UA 1EWQA 1HPMA 3M5RA 4FJLA 1J53A 4J2AA 1EKEA 2KZZA 4BRFA 4F2SA 5SZTA 2JWLA 1ZBLA 1X9SA 2YHWA 3VPZA 5E26A 5JVHL 1UA1A 3VEYA 5GIPA 4LF4K 3DWLA 4CI6A 4J2EA 1A5WA 4DR4K 4DUYK 4JI3K 1O13A 3VGMA 3J81O 1T6DA 3OYKA 1QSYA 4K25A 2HF4A 1BI4A 2KW4A 3H3NO 3IRXA 4LH4A 4HUEA 3SAFA 1KQSM 4FW2A 4DCHA 4DQRA 2C1IA 3EZWA 1QZ5A 3CQYA 3KKSA 1ITGA 3CCEN 4BR0A 5AQTA 3OYDA 4XIUA 1WBBA 1S9GA 2IVPA 3EO3A 4BR5A 5HRRA 1ZBSA 1T3VA 3AO1A 4A61A 4CJSA 3Q7CA 3EE9A 4IOCL 4CD3A 2BH1A 2P1JA 1ATRA 3ULEB 3ENHA 4FJHA 3MEDA 4IG0A 3AVIA 5F0XA 1XC9A 4CEQA 3G25A 4H03B 3HM9A 1ZBIA 3M8QA 4CESA 4JRQA 5KGXA 4BROA 4CGGA 1BIUA 4QCLA 3JSMA 2E5LK 1VSDA 1RFQA 3GDQA 1Y97A 3M8PA 3W3DA 4K41A 4C1NI 4B9NA 2XRIA 4DV5K 4BR4A 2A40A 4HTUA 2B6AA 4BDYA 3MN5A 1KLNA 3K2PA 2CGKA 2HHXA 1KVCA 1NKCA 2OCEA 4BREA 3MDQA 3TPQA 2YX6A 1ILYA 2W00A 1GOBA 1N8RO 3WXKA 3K5NA 2NRXA 3AO4A 3VQEA 1X9JA 1GLCG 3D2FA 5EU7A 1J6ZA 3C6UA 1MDUB 3DYAA 2QA4N 1Z26A 2XY5A 3PY8A 3VQQA 3UE5A 4O5BA 4BRCA 4DU4A 5FROA 2Z1HA 1RDUA 3GL1A 3FFIA 2FLOA 3O3HA 2P9UA 2D5RA 3F9KA 4M41A 2NRRA 3P39A 1WBDA 1NGAA 4IOXA 4WQ4A 1KFSA 4JS4A 3Q7BA 1BHLA 2NRHA 1BA1A 3LALA 1IG8A 3ALYA 2QWRA 1TK5A 3A5NC 2E6LA 5AQUA 1NK7A 4KREA 1RT3A 2BTFA 3NH1A 5HBMA 2FF3B 2BGGA 4FJIA 2HMPA 4DU1A 4WYBA 4G9ZA 3AVHA 4B9MA 3LM2A 4OVLA 4I2PA 3DXMB 4BGBA 4RW9A 3KLHA 4LF8K 1YTUA 5HLFA 3OYHA 1R59O 1WAJA 5JS1A 2LSNA 4CHNA 2DY4A 3V9WA 4JKAA 3HSCA 3ASMA 1NWKA 1VRTA 3VOVA 4ZHRA 4DV7K 4DSLA 4E1MA 1WSIA 4AF1A 3MEGA 3D6RA 2A1RA 1L3SA 5F1XA 3KZBA 5BPNA 1VK0A 4AM6A 4H0VB 1XC3A 3PV8A 1FJGK 1C0MA 4LF7K 4YNQA 1FK9A 4CJ7A 4DUZK 4BY9C 3O1BA 3M8SA 4BRKA 1SKWA 3CCUN 4JYAK 5FPNA 3SPZA 1TAUA 4JI2K 1K8KA 2I7PA 1YJWN 2KHOA 3O6WA 3HP6A 1RDCA 2A1SA 3LANA 3MXJA 4B8AB 4EAHD 4ISFA 3H46O 2ZWHA 1D4XA 1LW2A 2HNDA 3OA9A 3CYGA 1R0AA 1DTTA 3OYMA 4FZYA 4B1VA 1OH8A 3AV9A 3C6TA 3EKUA 3N4PA 4WFNL 2P5OA 4FWRA 3OTOK 3OHRA 3H45C 1N36K 3DLHA 2OPSA 4DFJA 4NYNA 1SKSA 4HCCA 4M3YA 3UKRB 3V9ZA 1BOTO 4BVOA 5C0YA 1D5AA 2QM1A 1VSHA 5EY4A 2QW9A 4CFBA 1OVQA 4FOEA 4LFAK 4JAXA 4DHYA 2E2NA 3LP0A 4DTUA 5ELZA 4CGHA 4NCBA 1J9AA 2NUBA 1RT1A 1B9FA 4A5BA 3WXLA 4AH9A 2W42A 1E4GT 1XWLA 4CZGA 3QBWA 4BRPA 2P9IA 5AQWA 1REVA 1T7PA 5E84A 3SUQA 2FBYA 2XY7A 4CEDA 4FK2A 4DQPA 2ATQA 5F2RA 3IG1A 2IOCA 2FBXA 4FOIA 3S9HA 1F21A 2ASPA 4F3OA 4O0JA 3OYGA 1TYQB 3ZT3A 3S3NA 2RE2A 5M1OA 2P9SB 1CZBA 2VWJA 2X6SA 1K73O 3K9JA 1VQKN 5DM6L 4KH6A 3VTIA 2IVNA 1YUWA 3ZX2A 1C6VA 1NLVA 3R6MA 1HKBA 3WXMB 3THWA 1DKGD 3FR0A 3C6AA 4RW4A 3KHYA 1JJ2M 4YDUA 4CBXA 3RMCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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