4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
3VENA 4H0PA 5AZIA 3IFRA 4BGAA 1S22A 2YHWA 3CJ7A 1C0FA 3HZ6A 4BG8A 3LDNA 5B8HA 4A2BA 5AQPA 1NGDA 1Y64A 4FWSA 4BG9A 1HPMA 5BN8A 3UKUB 4CZFA 2QWPA 4ISEA 3SJHA 4FSVA 2OANA 4JHDA 3EO3A 1V4TA 3VETA 2FXUA 4NB4A 3GDQA 5BPNA 1TYQB 4H5NA 3VGLA 4PKHA 1U2VB 3HTVA 5AQYA 2E1YA 2ASMA 2YHYA 3MN9A 1Q18A 1XQSC 2A6AA 4H5RA 3M3ZA 4CZHA 4BREA 4FOIA 4L3QA 4QS7A 1T6DA 4JN4A 3H1QA 1CZAN 4BC2A 2E20A 1X9JA 3KVGA 1MWKA 4BR9A 4FWOA 1T6CA 3CJ1A 3O4WA 5BN9A 3VF4A 5KPRA 1JCGA 1GLCG 4XEIA 2FSJA 4QS8A 2DPNA 3FZLA 5AZJB 3U9DA 1K8KA 3VEZA 2Q31A 3LDPA 4F9OA 3H45C 1Z6RA 2FLOA 1E4FT 1LCUA 5AQUA 3ZETA 4FPAA 4BQLA 4EHTA 1E4GT 4CD3A 5EXWA 5AQJA 2P9KB 1SQKA 1QZ5A 3DAWA 4B1ZA 3GBTA 2V51B 2CH6A 5AR0A 3ZEUA 3CJAA 3WQUA 1DGKN 2PAVA 2VYPA 3VPZA 2FSNA 1HJOA 3FR0A 5TKYA 3C7NA 2YCHA 4M7YA 5JLHA 3MN5A 4BQZA 1QZ6A 3A5NC 4WQ4C 3WXJA 5AQKA 4MLEA 4A61A 2P9UB 1Z05A 4B9QA 4I6MA 2GTDA 2GUPA 4BR4A 3ENOA 3SMSA 4IXCA 3AAPA 4GNIA 3LDQA 3U4LA 3ATVA 3D2EB 4DHYA 5AQOA 1J6ZA 4MO5A 1GLEG 4PKGA 5AQMA 3WEEB 3F9MA 1YXQA 4JD2A 3H6EA 2D1KA 1ATNA 4BRDA 2CGJA 1BO5O 3RSEB 1YAGA 5BRFA 4JAXA 5F0XA 3C0BA 2D0OA 2GELA 2E1ZA 3VEXA 4CJ7A 1HKGA 1NGAA 1JCEA 5AQSA 1GLAG 3HSCA 4BRPA 4HTLA 3DXKB 5KQ8A 3MK6A 4AM7A 1NMDA 2V7YA 3WT0A 3FZHA 2P9LA 4K41A 4CZGA 3GG4A 2QWRA 3UKRA 3DXMA 1RGIA 3DWLA 2I7PA 4PKIA 1GLDG 1NGEA 1MWMA 2P9KA 4WQ5C 3AARA 4HWIA 4IWVA 2BUPA 2P9SB 3M1FA 4LC9B 3EKUA 4BGBA 3QBWA 1RDWX 2ZWHA 3LDOA 5AQWA 2E2NA 5FPDA 2HMPA 3QFPA 1KAZA 2E2OA 1NLVA 2HF3A 3ID8A 3O80A 1KAXA 2A42A 3QFUA 2Q97A 5E26A 3ENHA 5AQZA 3WUHA 3W0LA 1NM1A 2J4RA 2P9NA 5AQNA 3I8BA 1D4XA 1ZXOA 1QQMA 4ISFA 3O08A 3U9ZA 4M7XA 5JLFA 3R6MA 4IO8A 1ZBSA 1C0GA 5FPNA 3ATUA 4BC4A 4JNEA 5LJWA 3BUZB 4CZJA 2IIRA 4RTFD 3IDHA 5AQTA 5F2RA 3HM8A 1V4SA 3R9PA 4A62A 3WXIA 3L6QA 4BC3A 2QWLA 4BRCA 4EAHD 3CI5A 3A5OC 2P9IA 2QM1A 5LJVA 3VOVA 3H1VX 3WXKA 5ELZA 2FF6A 3O8MA 4PL7A 4WQ4A 5BPLA 2E88A 2ASPA 3KHYA 3IMXA 4EIAA 4H5VA 3B8AX 3A0IX 4CZLA 3UB5A 3VEOA 2ITMA 2P9SA 3D7EO 5JICA 4DCHA 1U6ZA 2ZGZA 1WOQA 4H5TA 3LL3A 3WQTA 1HKBA 3CJ9A 4AM6A 2A5XA 2YJFA 4MLHA 4H0VB 1NBWA 1QQNA 4CD1A 5AQXA 2E2QA 4H0TB 3A8YA 3W3DA 3I33A 4BRFA 3QICA 5KPTA 2PBDA 3VF6A 5KPZA 2QWNA 3BP8A 5AQQA 4RWTA 3HI0A 3TU5A 2NRHA 3MN6A 1X3MA 3WXLA 4FWMA 2HOEA 4BVOA 2H3GX 3AAQA 3UKUA 1TUUA 3HBTA 2AP1A 5AQFA 3L4IA 3ZX0A 4K42A 3VEWA 4XH5A 1XUPO 3D2FB 1TYQA 2ASOA 4H03B 2WUSA 1U2VA 3CHWA 5E84A 2A40A 2VCPA 1MDUB 3JS6A 4CBWA 3BEXA 3VEYA 2CH5A 2I7NA 1GLLO 4WQ5A 3ZX2A 4BRQA 3SK3A 4NO7A 2QWOA 4RCHA 5AQLA 4CI6A 1JCFA 2GEMA 3FZMA 3S41A 2KHOA 3JXUA 1NGHA 4H0XB 4IJNA 3VGKA 2P9PB 4FWQA 4IJAA 1NWKA 4DQ8A 4A2AA 4FL9A 3TPQA 5AZIB 1HX1A 2A3ZA 2IVNA 3H3NO 3SMPA 3H46O 1DEJA 5AZJA 4XH4A 2EWSA 4BRLA 2D4WA 3VEVA 1BUPA 3UE5A 1GLJO 4XH1A 1HUXA 2Q0RA 5F1XA 3SLCA 4BROA 4JHDB 2YJEA 3MDQA 4CZIA 5BRHA 3BF3A 4YDUC 3FFKB 1P8ZA 4BR0A 2QXLA 3MMVA 1G99A 4FO0A 4DB3A 4BC5A 4O8KA 4J8FA 4K25A 3O1BA 2D0PA 4EHUA 2F9TA 3CIPA 1BDGA 5FPEA 3ZX3A 2P9UA 3BF1A 3VF2A 4FWPA 1LOTB 3A5LC 2E2PA 5BPMA 4FOEA 2QWQA 3QMLA 1KXPA 4B1UB 4BR2A 2FSKA 3D2EA 4FWLA 4ISGA 1K8KB 4FWKA 1SAZA 2BTFA 4BRKA 3WEEA 3H3OB 3ZETB 1QHAA 1TUYA 1WUAA 5CE3A 1H1VA 3CETA 3RSEA 4H0OA 4CZMA 2QW9A 1IG8A 3O6WA 4BRAA 3L0QA 2Q1NA 2NLXA 4CBXA 3OHRA 3ZEUB 3DXKA 2Q36A 3O1WA 3M6GA 3MN7A 5BRDA 4B1YB 5LY3A 4MO4A 4FPBA 3C7NB 1NGIA 3QB0A 4E1JA 2V52B 4BRMA 1YVNA 3QDKA 1HKCA 5AQVA 4Y0WA 4PL8A 5AQIA 3GOIA 1R59O 3ULEB 4I6MB 3G25A 2VWBA 1ZC6A 1ATRA 3GE1A 4BR7A 1XC3A 5AQGA 4B1WB 3P4IA 2F9WA 5AQHA 1QQOA 3A5MC 2V7ZA 4CZEA 1HLUA 3FLCO 4JD2B 3QBXA 4M63C 5I9EB 3IUCA 3R8EA 3EKSA 4CZKA 3LM9A 4QS9A 2Q2RA 4C23A 5FPMA 2CGKA 1DKGD 4FWRA 1RFQA 1YUWA 4H5WA 3GL1A 2YI1A 2GWKA 2YHXA 1SZ2A 1KAYA 3CQYA 5EX5A 4EFHA 2HF4A 3AY9A 2P9LB 1GLBG 3DXMB 3UKRB 1NGJA 3VERA 4YDUA 2W41A 2ZF5O 1GLFO 4O5FA 3FGUA 3O5BA 4FWNA 1BA1A 3FZFA 4CBUA 4Z94A 5EVZA 3CERA 4GY2B 4B1VA 1IJJA 1MA9B 1BWFO 2A41A 4BR5A 3VESA 4H0YB 3FE1A 1BG3A 3ULEA 3VGMA 4BVPA 5AFUA 2NZTA 1T44A 2AA4A 1BA0A 2P9NB 1S3XA 4BRHA 5EY4A 5JMVA 2W40A 1NGFA 5KQDA 2FF3B 3EL2A 2QWMA 2Q0UA 1X3NA 5EOYA 3U8XA 4B1XB 5ADXA 3MCPA 1NGCA 1ATSA 5BREA 1ESVA 2IVOA 4BRIA 2P9IB 3EN9A 5AFUH 3KZBA 2E8AA 3D2FA 3LDLA 1NGBA 3FZKA 3EZWA 4BRNA 1BU6O 4KBOA 4BRGA 2IVPA 3CQXA 1OKJA 3J8AA 1NGGA 4WYBA 2ZGYA 2GWJA 3DJCA 1BOTO 4IZ9A 3CJCA 2UYTA 5AQRA 1EQYA 3CJBA 5ADXH 3LM2A 2P9PA 4K43A 5BR9A 2CGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BGXT 3VENA 4H0PA 4C8NA 3AA4A 1C0FA 2DFFA 4LD0A 4OGEA 3HK2A 1HPZA 1Y64A 5BN8A 1IKXA 4CZFA 4ISEA 5JVHL 4MDAA 1EX4A 2ATQA 4OPKA 2FXUA 3OYAA 4J2BA 3GDQA 5BPNA 4AHSA 1BIZA 1TYQB 3VGLA 3CC7N 4FJLA 4JK7A 1U2VB 3HTVA 2E1YA 2ASMA 4CJ3A 1P90A 4H5RA 1XWLA 3AO4A 5M1OA 4BREA 1NJWA 3MEDA 5CZ2A 2PY5A 3IG1A 4JN4A 4LFAK 1HMVA 4BC2A 1XHZA 1MWKA 2ETJA 2VG5A 3HOSA 3VF4A 5KPRA 1JCGA 4LF8K 2IGIA 1U48A 4LF7K 3K5OA 1U4BA 5AZJB 3U9DA 3AO3A 2XY8A 3VEZA 5JVGL 4LF4K 2Q31A 3CCSN 3KD5E 4CEBA 2YNHA 1LCUA 4EHTA 3ZETA 2OA8A 3BY5A 3Q7BA 3L2QA 4DR4K 4OJRA 5EXWA 2HVIA 1KLMA 4JK9A 3OBWA 2IDOA 3M8SA 2Z1GA 3DAWA 2V51B 2CH6A 5AR0A 1EO1A 3WQUA 2HHQA 1GOAA 4HTUA 4FM1A 1ZBIA 3NCIA 2YCHA 4M3ZA 1FJGK 1QZ6A 1KCFA 3WXJA 4CJTA 2XY5A 3KK2A 4B9QA 4FW1A 4DFMA 4WF9L 1YHQN 3Q7CA 2GTDA 2GUPA 1HNZK 1IV0A 4DU1A 4KHSA 1MU2A 1NG9A 2HNDA 4FJHA 1A5XA 1T3VA 1Y97A 1FKPA 2B6AA 3HP9A 4DUYK 4CK3A 2VG6A 4PKGA 3C6AA 5AQMA 4F3TA 1HJRA 4IO9L 2WC9A 1ATNA 4BRDA 3C0BA 1HKGA 1JCEA 2O8EA 1NK9A 3MK6A 4AM7A 4Z4FA 3AVMA 4DV5K 4K41A 4EZ6A 4ZTFA 4CW7B 1RT2A 4KH4A 3WNHA 4IKFA 4LC9B 2P9SB 3LDOA 5AQWA 3SV3A 4LH4A 4E7IA 4DR1K 3TSPA 2A42A 3THXA 4FVUA 5KI6A 5AQZA 4R5PA 1HNXK 2O4IA 4CEOA 3OJUA 4E3SA 3W0LA 2J4RA 1D4XA 2KFNA 2HBKA 2NNWA 3U9ZA 3QNNA 3D0PA 1ZBSA 3SPYA 3ALYA 1LWCA 3H08A 1RT4A 4J2AA 3BUZB 3AVJA 4HVJA 3K2PA 1JLAA 2KZZA 1YTAA 3SQ0A 4E7KA 2YKNA 5J2MA 3CI5A 3A5OC 2Z1HA 5LJVA 4DLEA 1W97L 4A5AA 2FF6A 1RDBA 4WQ4A 3TTDA 4B3MK 3BGRA 4H5VA 4DQPA 2B4JA 3VEOA 3NMUA 1RT6A 1WAFA 1W0HA 4O0IA 2ZGZA 1VQ8N 1WOQA 2RF2A 3NHGA 4KPYA 5CR4A 1HKBA 3CJ9A 3LWLA 3K59A 4H8KA 4H4OA 4DF4A 5M1FA 3CCVN 3A8YA 4BRFA 2NRRA 5KPZA 2PBDA 3SUNA 3O9SA 5AQQA 1BISA 3TU5A 1CZBA 3VQ7A 5CY4A 2F7TA 1WSHA 3ZT1A 3HBTA 3DOLA 5J1EA 1SL1A 1IKVA 5C2DA 4XH5A 4ID1A 4IOCL 3DLRA 1EWRA 4JK8A 1RNHA 5C42A 3JS6A 3I55N 1KVCA 4JI8K 3C6TA 2CH5A 2I7NA 4BRQA 4DS5A 3SK3A 4FM0A 1C0MA 4DTSA 5AQLA 4M42A 1JCFA 1TL3A 2GEMA 3ZSZA 1RT3A 3OA9A 3S41A 3EE8A 2NRXA 4C8KA 4IJNA 4W5TA 4DR7K 4B9NA 4DQ8A 4LF9K 3TPQA 5AZIB 1HX1A 4DTMA 3L8BA 2ZJPL 4BRLA 4E1NA 1KQSM 4M3YA 4YFUA 1LW0A 4B9MA 3S3OA 3SLCA 2YJEA 1TVRA 2YHBA 1Q86O 3LP2A 3RMDA 4DSLA 4FO0A 4QCLA 3M8PA 4J8FA 4K25A 1TKZA 3AO5A 3CIPA 4FLWA 4BACA 4CF8A 2P9UA 4BE0A 3VF2A 1LOTB 3RMBA 4N56A 3JSMA 3QMLA 2VWJA 4BR2A 4KREA 2FSKA 3D2EA 4ISGA 4FWKA 4BRKA 4FZYA 3NH1A 3KLGA 1QHAA 4AQYK 4DSKA 1VQNN 3KKRA 1NOZA 3RR7A 3NVMA 2QW9A 3WXMB 3O6WA 3CPWM 1KVAA 4K8XA 3RMAA 2NLXA 3OHRA 3DXKA 3MEGA 4UQGA 5LY3A 2O8FA 1UAXA 3QO9A 3AO1A 2W6KA 4DS4A 3S5TA 4BRMA 3QDKA 3C94A 1NJXA 1KD1O 3GOIA 4DV4K 1R59O 4DSFA 4I6MB 3G25A 3HT3A 2VWBA 4DFPA 4CVNE 1IBMK 1LW2A 3SQ2A 1B9DA 4E7JA 5AQGA 3NFAA 1QQOA 3A5MC 1TKDA 3T7ZA 3BDPA 4ELTA 4W5OA 1HLUA 4JD2B 3IUCA 3EKSA 1QSLA 1WSFA 3LM9A 4QS9A 4FZXC 3SJJA 4JLHA 2CGKA 4LFCK 4FWRA 1RFQA 1YUWA 4H5WA 5FDLA 2YHXA 1WSGA 5C24A 2P1JA 3CQYA 4AHTA 2E6MA 4FM2A 2HF4A 4CJUA 1M90O 3KD1E 3NBPA 3VERA 1S1UA 3NF9A 4YDUA 3OYLA 3C95A 5GIOA 1GLFO 4CF1A 4O5FA 3FGUA 3VQPA 3O5BA 3ZLJA 3FZFA 4CBUA 3TSUA 1VQON 4CE9A 3CERA 4GY2B 1MA9B 4BR5A 1CXQA 5J2PA 3FE1A 3RRGA 3SPZA 4BVPA 3JYTA 5AFUA 3CCQN 3VQCA 3CF5L 4BRHA 2NRWA 4IFYA 4RW8A 4B08A 4CGJA 1NGFA 1WN7A 4CJFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4DSI A;  4JI1 K;  3P4I A;  3T19 A;  4OPJ A;  4F2S A;  4CED A;  3FLC O;  4CER A;  4M63 C;  3K5N A;  3LAL A;  2Q2R A;  1VSH A;  2HHI A;  1XC9 A;  2G8U A;  5FPM A;  1DKG D;  2W42 A;  1EWQ A;  4JKG A;  3VQD A;  2ZM6 K;  4LF6 K;  1KAY A;  3OY9 A;  5EX5 A;  4B9T A;  3V9U A;  3OS2 A;  1NGJ A;  1TK0 A;  2G8I A;  1CZ9 A;  1DTQ A;  5KTQ A;  2ZF5 O;  3F5T A;  2ZQB A;  4FWN A;  4NXM K;  1Q9Y A;  4JYA K;  4N5S A;  5KRT A;  1TAU A;  2A41 A;  2FC0 A;  4KTQ A;  1JKH A;  3VES A;  4H0Y B;  2YNI A;  2D0A A;  3CQ8 A;  3QLH A;  2NZT A;  1WSE A;  2GV9 A;  4DV2 K;  2P9N B;  2G8W A;  3NF8 A;  1C1C A;  2W40 A;  2JWK A;  4DSJ A;  4CEC A;  1S6P A;  1X3N A;  3KLI A;  1N36 K;  3KLE A;  1NGC A;  1ATS A;  3TAQ A;  3CG7 A;  3J7Z O;  3B6O A;  4BRI A;  3KKS A;  2P9I B;  3EN9 A;  3LDL A;  2E8A A;  4DV3 K;  2O8D B;  4JKH A;  1X1P A;  4NCG A;  3CYG A;  4JI3 K;  2YX6 A;  4BDY A;  1W2B M;  1NGG A;  4JI6 K;  4DR3 K;  1BOT O;  1S6Q A;  3NGZ A;  3CM5 A;  1TK5 A;  2P9P A;  4N47 A;  4CF0 A;  1SL2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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