4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
1HUXA 4BRFA 4FL9A 3JS6A 4EHUA 1RGIA 3J8AA 1J6ZA 1T44A 5AQRA 4BVPA 4BGBA 2Q2RA 2CGKA 4EIAA 2P9NB 1HKBA 3IMXA 5TKYA 4MLHA 4A61A 2FSJA 3DXMB 3QICA 3FZKA 3H3NO 3CETA 4FSVA 3UKRB 3FZHA 3BEXA 4WQ4A 1ATRA 4EFHA 1KAZA 1QQNA 3WXLA 3FZFA 5AR0A 2CH5A 4BC4A 5EXWA 1TUYA 3LDPA 1E4FT 4H5RA 3WEEB 5KPRA 3AY9A 3WQUA 5AZJA 4FWKA 1NGJA 2QM1A 4I6MB 4CZJA 1JCGA 4FWRA 1WUAA 3G25A 1C0GA 3GOIA 5AQYA 1EQYA 4H5NA 1LCUA 1G99A 2BTFA 3WT0A 5FPEA 4WYBA 4JD2B 3VENA 2IVOA 3ULEA 3ZX2A 3QDKA 3IFRA 5EY4A 2ITMA 3RSEB 3KZBA 4PL8A 2P9PA 3D2EB 5AQTA 1K8KB 5AFUH 4CBXA 2D1KA 3BUZB 4PKHA 2D0PA 2F9WA 4CZLA 4BROA 1Y64A 4XEIA 3EZWA 3VESA 4BRPA 2FLOA 4M7YA 4CJ7A 2PBDA 3LM9A 4CZHA 3HI0A 2P9UB 4H0TB 3HM8A 2YJEA 3UKUA 4XH4A 3QFUA 2E2OA 3FLCO 1MA9B 2HF4A 5JICA 4BRLA 1MDUB 5KQ8A 4A2AA 3EKSA 2P9KA 3VGLA 4A62A 3AARA 4BRKA 2YCHA 4BR0A 1CZAN 3HZ6A 3A5OC 5AQQA 4O5FA 4IO8A 4ISEA 2Q31A 4CBWA 2F9TA 5FPNA 3VF4A 4BQZA 3GBTA 4IJNA 4EHTA 1SQKA 3WEEA 4CZKA 1BU6O 1GLFO 4BRQA 3FZMA 4Y0WA 4I6MA 1HKCA 4FO0A 1U2VB 3ATVA 5AQWA 4FWNA 5JMVA 1HPMA 4JD2A 4BR5A 1TUUA 2QXLA 3A5LC 1QZ6A 3BF1A 1S3XA 2V52B 5B8HA 5AQFA 4MLEA 5ADXA 2E2PA 4CD3A 4FWLA 4BC3A 2PAVA 3SJHA 3CJBA 5JLFA 3QBXA 3WXKA 3I8BA 4PKIA 3SLCA 2P9IB 4QS7A 1GLEG 5AQMA 2E1ZA 4BVOA 3O1BA 2P9UA 3H1VX 4ISGA 3CERA 3IUCA 2E20A 3EO3A 4PKGA 3TU5A 4KBOA 1GLBG 5EVZA 3TPQA 3FGUA 3BF3A 3VEVA 4H0XB 3VF6A 3M1FA 1HKGA 1R59O 4CZIA 3WQTA 4H5WA 5AQJA 4GY2B 1DGKN 4BR9A 1BA0A 3KHYA 4FWMA 2WUSA 1V4SA 1BDGA 3U8XA 3O1WA 4JNEA 5CE3A 3O8MA 3GE1A 1QZ5A 2ZGYA 2VYPA 4QS9A 1HJOA 3UE5A 4GNIA 2D4WA 4H0YB 1X3MA 1YUWA 1OKJA 2A6AA 4E1JA 3VEYA 4FPAA 4WQ5C 1E4GT 5ADXH 2A3ZA 4YDUC 1BO5O 4HWIA 4CZMA 4BRIA 2QWMA 3SMSA 3DXKB 4BREA 3VGKA 4BR2A 4L3QA 2HOEA 4H0OA 3W0LA 2YJFA 1GLDG 3ENOA 3H1QA 3GL1A 2A41A 5JLHA 2VCPA 2P9SB 4NB4A 3A5MC 3B8AX 5AQHA 4H0VB 4O8KA 3ID8A 3AAQA 4XH1A 5FPMA 3SK3A 4B9QA 3L6QA 1NGDA 1BUPA 5AQSA 1HLUA 5EX5A 4FWSA 3VPZA 5BRFA 4EAHD 3ZETB 1NGEA 4HTLA 3A0IX 5FPDA 4BGAA 1ZC6A 2P9LA 1MWMA 4BR7A 4CD1A 2E1YA 5AZIB 4BG9A 3FE1A 5BPLA 1P8ZA 3ZEUB 4CI6A 3O6WA 1XUPO 4BRMA 5BN8A 4B1WB 1V4TA 2A40A 1JCFA 1NGAA 5F2RA 3O08A 2QWQA 3H46O 2P9NA 1DKGD 2FSKA 3DXMA 3QBWA 4K25A 1BOTO 4A2BA 4QS8A 3UKRA 2IVPA 1GLCG 2NLXA 5BRDA 5E84A 1LOTB 4B1VA 5AQZA 4MO4A 4BRGA 4BRAA 2FSNA 3VGMA 5AQPA 2DPNA 2ASPA 3ATUA 3C7NB 1SZ2A 2IVNA 4PL7A 3CQYA 1MWKA 3R9PA 5KQDA 1BA1A 3O80A 1X3NA 5BR9A 1TYQB 3CHWA 1BG3A 3RSEA 2GTDA 3D2EA 2CH6A 3C0BA 1K8KA 1IJJA 3OHRA 3ZX0A 5F0XA 2A5XA 5LY3A 1XC3A 3D7EO 1YXQA 1NBWA 1GLJO 3AAPA 3VEWA 3L0QA 4B1ZA 2YI1A 1YVNA 1NGIA 5AQIA 2GUPA 1ZBSA 3CJ9A 4RWTA 2CGLA 2H3GX 4IWVA 4AM6A 4ISFA 3VETA 4DB3A 1ZXOA 4K42A 4CZFA 1GLLO 2I7PA 3S41A 4WQ5A 4J8FA 5LJVA 1NGCA 2FF6A 4CZEA 4YDUA 3U9ZA 4FWPA 5BPMA 1NGFA 3QFPA 5AZJB 2W41A 5AQOA 2NZTA 1HX1A 2GEMA 4RCHA 2E2QA 4DHYA 2D0OA 1JCEA 2QWLA 5BN9A 3SMPA 3DJCA 2YHYA 3MN5A 1H1VA 1ATNA 2Q1NA 2ZF5O 5AQLA 5AQXA 4NO7A 3VERA 4DQ8A 3O4WA 3C7NA 3KVGA 3O5BA 2KHOA 3ZX3A 1T6DA 4H5TA 2HF3A 3L4IA 4M7XA 2Q0RA 1U2VA 3CQXA 4BRHA 4H03B 4RTFD 3U9DA 1TYQA 2YHWA 1XQSC 4H5VA 3W3DA 1NGGA 3UKUB 3FFKB 4M63C 4XH5A 2A42A 1SAZA 3VEOA 1Z05A 5F1XA 3I33A 4FPBA 1U6ZA 3CIPA 2YHXA 4BC5A 1D4XA 4K43A 3CJAA 2P9KB 2P9IA 3HTVA 4JHDB 2ZGZA 3QB0A 3EKUA 3HSCA 3BP8A 3GDQA 3DWLA 5BPNA 4IJAA 2Q36A 3A8YA 3UB5A 2ZWHA 4H0PA 2AP1A 1WOQA 4FOIA 5E26A 1BWFO 3FZLA 4BR4A 2E88A 2AA4A 3CJ1A 3MK6A 3DAWA 4BRCA 4LC9B 3CJCA 5BRHA 2Q97A 3IDHA 5AQUA 3ENHA 5ELZA 3VEXA 3LM2A 3LDNA 3LDOA 4C23A 1KAYA 3CJ7A 3MN7A 4WQ4C 5AQKA 4BRDA 3F9MA 4BQLA 2J4RA 5AQNA 2V7ZA 2ASOA 3FR0A 1T6CA 3DXKA 2QWNA 4CBUA 1YAGA 3H45C 3MN6A 3WXJA 1GLAG 4CZGA 2QW9A 2NRHA 3EL2A 3LDLA 2P9SA 4BC2A 1QHAA 2W40A 1NLVA 1KAXA 1RDWX 2EWSA 4JHDA 1NGHA 2QWRA 3D2FB 3M6GA 3CI5A 3WXIA 4IZ9A 4B1YB 2E2NA 3LL3A 1QQOA 2VWBA 3JXUA 4FWOA 5KPTA 2Q0UA 4AM7A 4B1XB 3ZETA 2V51B 2ASMA 1NGBA 4FOEA 3VEZA 2QWOA 2BUPA 2OANA 4BG8A 3MN9A 4K41A 5AZIA 2I7NA 3LDQA 1Q18A 2GWJA 2UYTA 3VF2A 3WUHA 3GG4A 4MO5A 4BRNA 5KPZA 3ZEUA 1S22A 4F9OA 3MCPA 1NMDA 2QWPA 1ESVA 5AQGA 5AQVA 3VOVA 3M3ZA 3R8EA 3A5NC 3U4LA 2GWKA 5I9EB 5LJWA 3H6EA 1RFQA 4JN4A 4FWQA 2E8AA 2FF3B 1NM1A 3R6MA 3P4IA 3EN9A 4IXCA 4B1UB 1C0FA 3ULEB 2CGJA 2HMPA 3QMLA 5EOYA 1KXPA 1DEJA 2V7YA 2P9PB 3MDQA 2FXUA 1Z6RA 3H3OB 3HBTA 1QQMA 2P9LB 1NWKA 2GELA 3D2FA 1IG8A 2IIRA 1ATSA 4DCHA 4Z94A 5AFUA 5BREA 1X9JA 4JAXA 3MMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SQ2A 4EHUA 4DR4K 3J8AA 5FRNA 5AQRA 5GAGP 4EIAA 1QHTA 2P9NB 3BZKA 3IMXA 1SV5A 4O0JA 3NF6A 3FZHA 3CYGA 3BEXA 1QQNA 4BC4A 4CJWA 4ZHRA 3I8DA 1TUYA 3BDPA 4FK0A 4H5RA 2XHBA 3R1XA 1HQUA 2HHQA 1Q7YO 1DLOA 4CZJA 3WT0A 4IBNA 5C10A 1RDCA 3ULEA 4DS4A 3QDKA 3IFRA 1F21A 5EY4A 3V1RA 3RSEB 3THYA 3V9XA 1M90O 3BUZB 3O9SA 5C2FA 3I0RA 2YV0X 2F9WA 4CZLA 1WSFA 4BROA 2O8CB 1TK8A 2RKIA 4XEIA 1Q86O 2FLOA 4Z4CA 3MAQA 3LDSA 1XMOK 2JWKA 3LP3A 1NKEA 2WONA 4PWDA 1OH7A 3HM9A 2E2OA 3FLCO 2FBVA 2OZMA 4JI2K 2HF4A 4AF1A 4CFBA 3SUQA 3BY5A 4KHWA 1MDUB 4ELUA 2P9KA 3VGLA 4BR0A 3V81A 1M1KO 3EE9A 4G1QA 1YJNN 4XIUA 4O5FA 3THWB 4ISEA 5DMRA 1B9FA 3SCXA 5FPNA 1S9GA 3HXMA 1BU6O 3BGRA 4TSXA 3OYBA 1YI2N 3CC7N 3AA2A 1HKCA 1WSJA 2HHIA 1U2VB 3CCUN 3ZLJA 4FWNA 2BANA 5JMVA 1HPMA 4JD2A 4KV8A 4NCAA 2FBXA 4BR5A 1QZ6A 2HNYA 2G8VA 3SV4A 3VQQA 1XWLA 3OJUA 1NMNA 5AQFA 4CEZA 4KTQA 5ADXA 5CHIA 3HOSA 2XRIA 4DQPA 3C6AA 4JV5K 1FKOA 1LWEA 1W0HA 3CJBA 4DTPA 3WXKA 4DV0K 2E1ZA 3MX2A 4AH9A 1KFSA 2YKMA 2O8FB 4I2PA 1WNSA 4HUGA 3TPQA 4FJMA 3BF3A 3CD6N 3CFRA 2X6SA 4GY2B 1DGKN 4BR9A 2F8SA 3KHYA 1BIUA 5C24A 2WUSA 2BH1A 1V4SA 3U8XA 1JL2A 2YNHA 3O1WA 1D9DA 1KVBA 5CE3A 2IOCA 1CZBA 2OTLN 1RDUA 4FLVA 4DF8A 2D4WA 3PIOL 1X3MA 3AO5A 3DOKA 5C12A 4E1JA 1OKJA 1WLJA 4MFBA 1NJIO 1RTHA 4DV3K 1HRHA 2A3ZA 4HWIA 4Y1DA 3CFOA 3VGKA 3LPTA 3L3VA 3L2UA 1GLDG 3TTFA 3GL1A 2A41A 1YF5L 1B92A 1DTTA 3AA3A 3AVNA 4OVLA 3MEGA 3CPWM 5M1FA 3DM2A 5AQHA 4O8KA 3SK3A 3AAQA 1VSJA 1W9HA 3L6QA 4HVJA 3EYZA 5AQSA 2QKKA 2HB5A 1HLUA 4B9TA 2QXFA 4UY8O 2D5RA 4FLZA 4E7KA 4CEOA 3A0IX 3C6TA 4DTRA 4CK3A 1MWMA 4BR7A 2VWKA 3AVIA 2E1YA 4I2QA 4BG9A 5J2MA 4B8CA 3SZ2A 4CI6A 3O6WA 5BN8A 3AGRA 4XJXA 1WSHA 3RMBA 1BIZA 1NGAA 3B6PA 3J7ZO 5M1KA 3KTQA 1IBLK 1KLMA 3QBWA 2GX9A 3OBYA 4QS8A 4BACA 3KD5E 3ZT4A 2NLXA 2JLEA 1Y97A 1I39A 3E66A 1LOTB 3NGZA 3ZT0A 1ITGA 4FJKA 3VGMA 4M42A 3ATUA 3AVBA 3OYDA 3E1YA 3R9PA 4U67L 2Z1GA 4FVMA 4N56A 1EP4A 3OY9A 3O80A 3TSUA 5BR9A 3CHWA 4FJJA 1NJXA 3RVCA 3PV8A 2GTDA 2CH6A 3C0BA 1K8KA 1NG9A 4FM1A 2X74A 4O5BA 3TR8A 3CPEA 3ZSWA 4DV5K 4JI7K 1YXQA 1NBWA 3K58A 2B4JA 4J2BA 5SWMA 3KK2A 1C1CA 1RTJA 4NLBA 1NGIA 2HW3A 1LW0A 4W5QA 1T05A 3WNEA 3T3FA 2CGLA 2H3GX 4DB3A 2YNIA 3AVJA 3QNOA 3RMAA 1ZXOA 4CIFA 4CEBA 3S41A 1WN7A 4WQ5A 4J8FA 4OKEA 4OPHA 1RT1A 2GUIA 2FF6A 2RPIA 2O8BB 1NNEA 4FWPA 1KD1O 3KLHA 1VQ8N 2NZTA 1HX1A 1JLCA 2E2QA 4DHYA 4RG8A 3V9UA 4LFAK 1IKYA 3DJCA 3QLHA 5AQLA 3CCJN 4DQ8A 3KVGA 3ZX3A 4H5TA 2HF3A 2D0BA 2D0AA 4BRHA 4RTFD 1LW2A 1YTAA 3THXB 4FK2A 1HPZA 2F7TA 1BQMA 4AQYK 3V4IA 4W5NA 4XH5A 1KVAA 1L3SA 4FPBA 4CEAA 5IWAK 4K43A 3SJJA 3MWPA 1VQ9N 3HJFA 4CGIA 3EKUA 3BP8A 4CGDA 5FROA 4JI1K 4H0PA 2VG7A 3N4QA 3OYHA 3L2QA 4CVNE 3RMCA 2E88A 3IAYA 2QI2A 3K9KA 4FJ7A 3NBPA 3EY1A 1WSEA 4LC9B 3V1QA 5ELZA 1MU2A 3LM2A 3AO2A 3LDNA 2HHVA 3K2PA 3LDOA 4JKBA 3EE8A 4WQ4C 4DTUA 3I55N 1VHXA 4CGJA 4M3UA 4CHYA 3SYZA 1RBVA 4CF9A 2HHUA 3KJVA 2V7ZA 2O8DA 4JKHA 3L2WA 4B3MK 2QWNA 3RR8A 3H45C 3SAHA 3V6DA 5C2DA 3MN6A 1X9MA 1DT9A 3CCVN 3DLGA 3LAMA 3VQ6A 3NCIA 2W40A 4JLHA 3IKMA 3SUOA 1HNZK 1RDWX 4JHDA 1NGHA 1JLBA 4IDHA 4IZ9A 4B1YB 3LL3A 2FBTA 5KPTA 5KGWA 4AM7A 3ZETA 4BDZA 4LFBK 1S1TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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