4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
1GLJO 2YCHA 1X3NA 2AP1A 2ZGZA 5B8HA 5BPMA 3M3ZA 3L4IA 1BDGA 4CZFA 2E2NA 3CERA 2IVNA 3CJ9A 4A2AA 2F9TA 3AARA 2IVPA 3VEXA 4IJNA 2QWMA 3O6WA 2CGLA 3C0BA 3FZMA 2P9NB 4FOIA 3IUCA 1ZC6A 4H0OA 3CQXA 4H5NA 3VF4A 2Q31A 5AZJB 2ZWHA 1X3MA 1R59O 4B1YB 1G99A 4B1VA 1MDUB 4IO8A 4C23A 2P9UB 3ZX0A 4I6MB 5AQNA 4FWLA 3D2EA 3O4WA 2GELA 1E4FT 1QHAA 4AM6A 5EXWA 1V4TA 3QICA 5BN9A 1NGBA 1TUYA 5KQDA 2CGKA 3D7EO 4CBWA 5LJWA 1GLEG 4CZEA 2GEMA 2P9PA 4H0XB 4H5WA 5FPDA 1GLBG 1NGDA 4Z94A 3ULEA 1ZBSA 2P9PB 4WYBA 4HTLA 1TYQB 1IG8A 3FGUA 3WXJA 3LL3A 3D2EB 5AQGA 4CZJA 2F9WA 3ZX2A 1NGGA 3ENOA 4K41A 1RFQA 5AQXA 2D4WA 3KHYA 1NGJA 2E2PA 4FWNA 4JAXA 5JICA 1NGAA 3I8BA 2FLOA 4BRIA 2Q36A 2P9KA 5AQVA 2BUPA 4BC4A 4BG8A 2NLXA 4MO4A 1Z05A 4FWQA 3GG4A 3J8AA 1KXPA 3O80A 3CIPA 3LDQA 1QZ6A 3GE1A 1ATSA 2CH6A 5F1XA 5JLHA 3HZ6A 1T44A 4QS9A 2QM1A 3A5MC 3BF3A 3EZWA 4CZGA 1NMDA 4HWIA 4MLHA 2QWRA 1RDWX 3VF2A 4O8KA 4JNEA 3VOVA 1BA0A 1BWFO 2D0PA 3C7NA 3LDOA 3W3DA 5F2RA 1JCGA 1BOTO 3I33A 1C0FA 2P9SB 4BVOA 3DXKB 1ATNA 5BN8A 3FR0A 2A42A 1E4GT 3SMPA 1V4SA 2HF3A 4EFHA 1GLDG 4FSVA 4BRCA 5BREA 5ADXA 1HKBA 4BGAA 3QB0A 1TYQA 1MWMA 3SLCA 3WXIA 4BRDA 4BR4A 1Y64A 4MO5A 2ZGYA 4B1XB 4DQ8A 1IJJA 3VEZA 4E1JA 4ISFA 2E1ZA 2P9SA 3H3OB 3M6GA 2YHYA 4BRMA 2OANA 3JS6A 4F9OA 4B1WB 5LY3A 2WUSA 1OKJA 1YUWA 1T6CA 4NB4A 2FSJA 2Q0UA 1DKGD 4Y0WA 3QBXA 3O08A 1GLFO 4H5VA 2A41A 2Q2RA 3GL1A 3WQUA 1X9JA 4XH4A 4CZKA 3EKUA 1LOTB 5AQSA 3HTVA 4PKGA 4DHYA 3JXUA 2E2QA 3ZETA 5F0XA 3QBWA 1U6ZA 3U9ZA 3SJHA 3VGKA 2QWLA 1QQOA 3CETA 4WQ4C 3GBTA 3VEWA 4FWKA 5EVZA 2V52B 2HMPA 3EO3A 3WUHA 1BA1A 3KVGA 3L6QA 4BR9A 3MN9A 3LM9A 5JLFA 1T6DA 4FWPA 4J8FA 2Q97A 3VEYA 3CJBA 2I7PA 4CZIA 3D2FB 4CI6A 3LM2A 3QMLA 1KAXA 4DCHA 4JHDA 2IIRA 5KPRA 1RGIA 1CZAN 2GWJA 2P9IB 2ITMA 4IJAA 1NGIA 3WEEA 2PBDA 2YJFA 1GLCG 1KAZA 4EHTA 2YI1A 3U4LA 4YDUC 2QXLA 3MN6A 2FXUA 2UYTA 3M1FA 3QDKA 4LC9B 3H46O 1HKCA 1S22A 2QWQA 4B1UB 3R8EA 3A5LC 5AQKA 5KPTA 1SQKA 3WT0A 3AAPA 1H1VA 3CJ1A 5AZIB 4H03B 5AQTA 1LCUA 2W40A 5ADXH 4BRQA 1HLUA 3ATVA 4M7XA 4B1ZA 3A5NC 4CZHA 3FZFA 1BUPA 1K8KA 4K43A 5AQOA 5LJVA 3BP8A 3CJ7A 3WEEB 4H0VB 5AQQA 5EY4A 3DAWA 3EKSA 4BRKA 3BEXA 1ESVA 5AZJA 2E20A 4I6MA 2W41A 5BPNA 3FZLA 1XUPO 3VESA 2BTFA 3GOIA 5I9EB 5KPZA 2D1KA 3U8XA 3A0IX 3ZEUA 2QW9A 4JD2A 1HUXA 4M7YA 5AQYA 3IDHA 3CI5A 2QWPA 3O1WA 4PKIA 1ZXOA 3WXKA 2QWOA 5AQMA 2ASPA 1P8ZA 4CZMA 2E8AA 1BU6O 3VGLA 2NRHA 4BGBA 4XH1A 2HOEA 5EOYA 3O8MA 3VPZA 3LDPA 2P9LB 3WQTA 1Z6RA 4XH5A 3MK6A 1NWKA 3F9MA 5E84A 3UKUB 5AQUA 2V51B 3AY9A 5AFUA 4ISGA 3ZEUB 1NBWA 2GTDA 2E1YA 3H45C 3MDQA 4EAHD 3DXKA 3MMVA 3CJCA 4BRGA 4M63C 3ZETB 3EL2A 1NLVA 1NGEA 4XEIA 4WQ5C 2P9UA 4BRPA 1SAZA 4BRAA 4BR7A 4WQ4A 4BRHA 3MN7A 1QZ5A 2D0OA 5AQLA 3SK3A 3HI0A 1KAYA 3R6MA 3ZX3A 2VCPA 4FWOA 3CJAA 3MN5A 3MCPA 1WOQA 3FLCO 4CBUA 4FOEA 2FF3B 3KZBA 1GLLO 1GLAG 3C7NB 3AAQA 4CBXA 1NM1A 3O5BA 4BC2A 3RSEA 4MLEA 3L0QA 2NZTA 5BRHA 3H1VX 3O1BA 5BPLA 2ASMA 4BVPA 1S3XA 5ELZA 4IXCA 5KQ8A 4A2BA 1XQSC 3A8YA 4CZLA 3IFRA 4FPBA 4H0PA 2AA4A 4BRNA 2CH5A 2V7ZA 4EIAA 1DEJA 1U2VA 2QWNA 4K42A 1HX1A 4K25A 4FL9A 4O5FA 4PL7A 1QQMA 4QS8A 5AR0A 3W0LA 4QS7A 3VEOA 3WXLA 3HSCA 3UB5A 2H3GX 3S41A 2P9KB 5AQHA 2Q1NA 4H0TB 3H1QA 3TPQA 2EWSA 5FPNA 3ID8A 4CD1A 5AFUH 4FPAA 4YDUA 4GY2B 1BG3A 2DPNA 5BRDA 3D2FA 3DXMB 3VGMA 3CHWA 4JD2B 3EN9A 5EX5A 4JHDB 1SZ2A 2A40A 1U2VB 1HPMA 1YXQA 5E26A 5CE3A 3QFUA 2FSNA 2YHWA 4A62A 4NO7A 5AQZA 3FZKA 3VERA 3VF6A 3TU5A 1XC3A 4BR2A 2P9LA 2I7NA 4BQLA 3ATUA 1BO5O 4BC5A 2ZF5O 3DWLA 3GDQA 5FPEA 2Q0RA 4FO0A 3UKUA 4BC3A 3DXMA 1DGKN 1NGHA 5FPMA 1YAGA 5BRFA 5AQWA 5BR9A 1HJOA 1Q18A 4PKHA 4EHUA 4A61A 4L3QA 3ULEB 3CQYA 2PAVA 4PL8A 3RSEB 3DJCA 1MWKA 1NGCA 5AQIA 3HBTA 2ASOA 4CD3A 3UE5A 1YVNA 4H0YB 2A3ZA 2GWKA 4RCHA 3VEVA 4B9QA 2YJEA 2V7YA 1TUUA 3B8AX 3FZHA 4IZ9A 4AM7A 3BUZB 5AQFA 4GNIA 4BQZA 3H3NO 4CJ7A 4BRFA 2VWBA 1HKGA 4H5RA 3ENHA 5AQPA 3G25A 2IVOA 4RWTA 1EQYA 2A5XA 4JN4A 2YHXA 2FF6A 3SMSA 5AZIA 1C0GA 2E2OA 2E88A 5TKYA 4IWVA 3A5OC 2FSKA 4KBOA 3QFPA 4BG9A 2GUPA 3VETA 4BR5A 1K8KB 4BRLA 3U9DA 1D4XA 1JCFA 3FFKB 3P4IA 3UKRA 4RTFD 5AQRA 4BROA 4WQ5A 2HF4A 5JMVA 4DB3A 2CGJA 3FE1A 2A6AA 2P9NA 1QQNA 3R9PA 4FWMA 1J6ZA 2P9IA 3VENA 1WUAA 1NGFA 2KHOA 3H6EA 4H5TA 1MA9B 3BF1A 4FWSA 3LDLA 2J4RA 3OHRA 3LDNA 1JCEA 3HM8A 5AQJA 4BR0A 4BREA 1ATRA 2VYPA 4ISEA 3IMXA 3UKRB 4FWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ENBA 4EP4A 4DV5K 1VSEA 1JLEA 5B8HA 3M3ZA 3L4IA 1BDGA 4CF0A 2HMIA 4JKFA 4A2AA 2OPPA 5JVHL 5GINA 3O6WA 3K57A 1N34K 2I5JA 1S1XA 2IAJA 4BWJA 2Q31A 1X3MA 1TKDA 1QSYA 1MDUB 4IO8A 3OYCA 4KO0A 3PY8A 3EE8A 2P9UB 3ZX0A 4CE9A 4I6MB 4FLWA 5AQNA 2G8UA 2GELA 1VQ4N 5KTQA 3AO2A 3QICA 2CGKA 3K9JA 1XNRK 4JI0K 5E41A 4M41A 3G6EN 3U3YA 3SYZA 3KK2A 4BDZA 4Z94A 4PQUA 1WSIA 3P39A 3AO5A 3DM2A 3PX4A 1IG8A 3FGUA 3D2EB 4MDAA 4DR3K 3ZT4A 1NGGA 2HHTA 4XIUA 3KK7A 3ZLJA 3VQ8A 5AQXA 4ILGB 1EKEA 4OKKA 4CIFA 1FK9A 3EE9A 3CC4N 3J7YP 1FXXA 2VG7A 3O3HA 2HNDA 4LH4A 2O4IA 5FDLA 2P9KA 1RDCA 5AQVA 1TKXA 3F2KA 2BUPA 3RWUA 4CHNA 4FWQA 4CIGA 4YOWA 3CIPA 4N56A 3OYKA 3SZ2A 1J5OA 1WN7A 4XJXA 4QS9A 2QM1A 3A5MC 1U04A 4CZGA 4B3SK 1NMDA 1KLMA 4RW6A 3O9RA 3M5RA 4JI1K 3L3UA 1BWFO 3C7NA 3W3DA 4QAGA 3OTOK 3DLGA 3RTVA 2XY6A 1Q9YA 1C0FA 4CHPA 3DXKB 5BN8A 2BDPA 4WF9L 4DFPA 1E4GT 5I3UA 2HF3A 4EFHA 1GLDG 3DRPA 4BRCA 4Z4HA 4YFUA 1LW0A 1KVAA 3WXIA 2O8FA 2YKMA 1C0MA 1VSDA 4BE0A 3TSUA 4R5PA 4BRMA 2FBYA 1OKJA 4JI5K 5LMNK 1QVGM 3VQ4A 2AJQA 2QXFA 1GLFO 2A41A 1YITN 2OZMA 3GL1A 4XH4A 4CGJA 3NFAA 1LOTB 3WNGA 3HTVA 4PKGA 4LFCK 3JXUA 3C94A 3L2RA 1KSPA 1IH7A 3PUFA 2QWLA 3O3FA 3N4QA 3N4PA 4NYFA 4WQ4C 5HLFA 5EVZA 2V52B 4FYDA 4LFBK 4DFJA 3THVA 1BA1A 3L6QA 4JS4A 3TTFA 5JLFA 4ID5A 4AHCA 3QIOA 1HPZA 4FWPA 3R1XA 4ELTA 4PY5A 1J53A 2I7PA 2E6LA 3D2FB 4B9NA 3LM2A 4DQQA 4DCHA 4DG1A 2IIRA 2P9IB 2ITMA 5C42A 4FZXC 2P1JA 4NCGA 1GLCG 4AHSA 4EHTA 2FXUA 2UYTA 4E1NA 3H46O 3NF9A 3SAFA 1HKCA 4ZTJA 2QWQA 5AQKA 1RDBA 2XY7A 3VA0A 3ZSRA 3LANA 2UUBK 2DFFA 5AZIB 1LCUA 1WBBA 2W40A 5ADXH 2WC9A 5M1NA 4DUZK 1BUPA 4FM0A 3NGZA 5AQQA 4AHRA 1ITGA 2HNZA 3CM5A 2NUBA 5AZJA 2E20A 5J2QA 4DFKA 2VG6A 2NRVA 1KFSA 1SV5A 2HW3A 3I0SA 4FJNA 3HPHA 4E7HA 3ZEUA 4CGGA 1L3VA 2QW9A 1HUXA 3NBPA 4DQIA 2QWPA 3C6AA 1HNXK 2XO7A 1VK0A 3SAHA 1VQ5N 3CMEN 2E8AA 3VGLA 4U67L 3P5JA 4JKAA 1RDUA 2KW4A 3LWLA 4CHQA 1RT5A 1NOZA 4YHHK 1RTJA 3WQTA 2WTUA 2HHUA 4C1NK 3ASMA 5AFUA 4ISGA 2E1YA 1VSFA 3MMVA 3CJCA 1HYSA 3ID6A 3LP3A 3AVHA 2NNWA 2YNIA 4XEIA 3EY1A 3MEDA 1SAZA 5HL7L 3V81A 4DTNA 2D0OA 3NAEA 3ZYYX 4OX9K 5GADP 1OH7A 2BANA 1YTUA 2QA4N 1KD1O 4E72A 4I2PA 4OPKA 4JI7K 4M3YA 1S1VA 1VQON 4FJKA 1J54A 3KLGA 2DY4A 2X6SA 3DOKA 3PSFA 5BPLA 4BVPA 5ELZA 5KQ8A 4F2RA 4A2BA 1RTIA 1YTAA 1BHLA 3A8YA 5GIPA 1KVBA 4AHTA 5DMRA 2HSTA 3IFRA 1B9DA 4FPBA 3E66A 4OO1J 1JXBA 2V7ZA 4DQPA 5HBMA 4FL9A 3CFOA 3WNHA 3K5LA 3CG7A 1HYVA 2HB5A 5AQHA 4KPYA 4CJUA 4CD1A 4A59A 3IRXA 4ELVA 5FRMA 3PV8A 4CJTA 5BRDA 1JXEA 2DPNA 3D2FA 3DXMB 3VGMA 3CHWA 4JD2B 4OVLA 4CFBA 3EN9A 2HBJA 5EX5A 1RT6A 4JHDB 4B9UA 1SZ2A 1U2VB 4B9MA 2X6NA 1HPMA 1YXQA 3ZT2A 3QFUA 3VERA 3FZKA 3VF6A 4BR2A 3OYEA 2RHKA 3RMAA 3AGRA 3KTQA 2D0AA 3GDQA 2Q0RA 3UKUA 3DRRA 1G15A 3V6DA 3SV3A 4IFVA 3P38A 4E7JA 3CFPA 3SUOA 4EHUA 4L3QA 3ULEB 4CJPA 4C8OA 2PAVA 3ISNC 4AH9A 1MWKA 3KK1A 3MXIA 2ASOA 3T1AA 3RR7A 2A1SA 3SQ1A 3VEVA 4RCHA 2W6KA 3FZHA 4OJRA 4DR6K 4DTUA 2O8BB 4EP5A 4BQZA 3CYMA 3H3NO 5HP1A 1VSLA 3TAEA 2VWBA 3ENHA 1ZBIA 3NF6A 4JKCA 4DTPA 4HHTA 3OYHA 2KKZA 4DF8A 1JLQA 3A5OC 3HVTA 1EWQA 1M1KO 2RPIA 2QKKA 1JCFA 1TL1A 2FBVA 3AVNA 3HT3A 1EP4A 2XY8A 3B6OA 3HPGA 3UKRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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