4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
2GWKA 4CZEA 4B1ZA 1QHAA 1U2VB 3CQYA 3DXKB 3S41A 4BG9A 4EAHD 5BR9A 2I7PA 3ZEUA 5ADXA 2QWMA 3CJ1A 3LDOA 3WQTA 2CGJA 5EXWA 1HKBA 3IMXA 5LJVA 3CHWA 4FSVA 3C0BA 3IDHA 4FPAA 3EL2A 3SMSA 2ASPA 3A5LC 4F9OA 3C7NA 5BPMA 4FWKA 5EOYA 2HMPA 5TKYA 1U6ZA 1ATNA 3L4IA 4H0YB 4BR5A 4A2BA 4BRAA 1SZ2A 2BUPA 1ZXOA 4FWOA 5BRFA 2P9PA 3H6EA 2E8AA 3QDKA 3IFRA 3VOVA 1GLLO 1J6ZA 2QWLA 3B8AX 2WUSA 2ZWHA 5AQXA 3ULEB 3WQUA 5AQLA 3EKUA 3WXKA 1RDWX 4L3QA 3CJCA 3RSEA 3VEOA 1QQMA 2ZGYA 4QS9A 5B8HA 3R8EA 1IG8A 3VERA 4BRHA 2HOEA 5EX5A 2GWJA 1Y64A 1K8KB 1JCEA 1TUYA 3JS6A 2W40A 5AQNA 5JICA 1XUPO 4JNEA 1GLJO 5ELZA 3RSEB 1HX1A 3MN9A 4FWSA 2VCPA 3LDPA 4WYBA 1ZC6A 2Q2RA 4EHTA 4I6MB 4Z94A 3HI0A 3QBXA 4H5VA 4BRMA 3LM9A 1GLEG 5AFUA 5CE3A 1SAZA 3IUCA 1MWMA 1OKJA 3FFKB 4JD2A 3WEEA 4BR7A 4FO0A 1NGGA 3JXUA 3UKRA 2FF3B 4H0OA 3GG4A 3R9PA 5AQSA 1NGCA 3WUHA 3BUZB 3O5BA 3UKUA 4FOEA 4WQ4C 4CZFA 1DEJA 1Q18A 3WT0A 4GY2B 4BRCA 1JCGA 1SQKA 4H5WA 4A61A 1NLVA 5LY3A 1NGJA 2P9IB 3CETA 1S22A 5AQRA 4IZ9A 1BA1A 3UKRB 5AZJA 4AM7A 4H5RA 3FLCO 4XH5A 3UKUB 3VEWA 4BVOA 4BC2A 2NZTA 3VEZA 3DXMB 2FXUA 2Q0UA 1QQNA 2F9WA 1E4GT 3BF1A 4BRNA 2HF4A 1NBWA 3QFUA 2YJEA 1DGKN 3A8YA 3GOIA 3H3NO 4B1YB 4BRKA 1NGHA 3FE1A 4JN4A 2Q0RA 3EKSA 4BC4A 3FZMA 5JLFA 3H46O 4B1UB 2QWQA 2P9KB 2I7NA 4CJ7A 1HKCA 3SMPA 4BC3A 2QWOA 1GLDG 4CD3A 5AFUH 3VEXA 2W41A 3CJBA 3VEYA 4AM6A 2P9LB 2P9NA 5AQKA 2FSNA 5AR0A 1H1VA 3SJHA 3D2FA 3O08A 4RWTA 2E1ZA 1KAYA 2V7YA 1T44A 2IIRA 3P4IA 1T6CA 3GBTA 3O4WA 5KQ8A 1GLCG 3ENHA 4BR2A 1P8ZA 3FZHA 5AQYA 3QFPA 3BF3A 1RFQA 1ZBSA 5EVZA 3A5MC 4BVPA 3KVGA 4LC9B 2P9NB 4NB4A 4PL8A 5AQGA 1QZ5A 4FWPA 3LDLA 3ZEUB 4CZMA 5BREA 4GNIA 2V51B 2E2PA 1ATSA 4E1JA 1GLAG 4BGAA 3U9ZA 1Z05A 1ESVA 4WQ4A 3DWLA 2YI1A 1BWFO 3VGMA 3O1BA 1BUPA 2V7ZA 3H1QA 1MDUB 3C7NB 3WXIA 2F9TA 5AQVA 1C0GA 3VF6A 4CZJA 2FSJA 2E2OA 2E20A 4CD1A 5AQOA 3HTVA 2OANA 4WQ5C 1QZ6A 2QW9A 1E4FT 2PBDA 5BPLA 5BRHA 3KHYA 3KZBA 3MK6A 5BN8A 1HLUA 2P9PB 4BRGA 2QM1A 1BU6O 3WXJA 3ZX2A 3FGUA 3MDQA 3AAQA 1NGFA 2IVNA 3D2EA 2DPNA 4Y0WA 1KAZA 1MWKA 5FPNA 5ADXH 2CGLA 2A40A 2QWPA 2ASMA 4YDUC 4CZGA 4BC5A 4JHDA 1LCUA 3UE5A 4CBWA 4J8FA 3D7EO 5AZIA 4B1VA 3MN7A 4IO8A 3FZLA 3U4LA 4PKGA 3D2EB 1WUAA 2Q31A 3MMVA 4H0PA 3VESA 4XH1A 5E26A 2J4RA 3QMLA 3VENA 2ZGZA 3I33A 1BG3A 4JHDB 4RCHA 3TU5A 4EHUA 1C0FA 4DQ8A 1XQSC 3A5OC 4BRIA 5AZIB 4HTLA 4FL9A 1NGIA 3DJCA 1LOTB 1KAXA 4BRQA 2AP1A 3ATUA 5AQJA 5FPEA 5JMVA 1QQOA 2P9UA 3LM2A 4JD2B 2UYTA 3I8BA 4XH4A 3WEEB 3VGLA 4FOIA 4CBXA 2D1KA 3CJ9A 2Q1NA 1G99A 3MN5A 3FZKA 1X3NA 3U9DA 4PL7A 4H03B 5KPTA 4CZIA 1ATRA 2YHYA 3R6MA 4FWNA 2YJFA 3W0LA 1BA0A 2H3GX 3EO3A 3QBWA 4M63C 4PKIA 4H0VB 1HPMA 2P9UB 3CIPA 1DKGD 3TPQA 5AQFA 4WQ5A 4MLHA 5AZJB 3O8MA 5F0XA 2VYPA 3HZ6A 3M1FA 4HWIA 3U8XA 1NMDA 2Q97A 5LJWA 2D0PA 2FF6A 2CGKA 2HF3A 1V4TA 3F9MA 3ENOA 2PAVA 3O1WA 4A62A 3MCPA 3LDNA 3BP8A 3VF2A 4FWLA 1MA9B 2A41A 4QS7A 1V4SA 4YDUA 2ZF5O 2Q36A 4BRFA 2D0OA 3ZX0A 3MN6A 4CZKA 3QICA 1NWKA 2P9SA 1NGDA 1YUWA 4B9QA 2YHXA 4BR4A 3SK3A 2GELA 2BTFA 3D2FB 4BR9A 4IJNA 3DAWA 3GL1A 5JLHA 1X3MA 3CQXA 4ISGA 1BO5O 3O80A 4BROA 5AQZA 3CERA 2GUPA 5KQDA 2P9SB 3HSCA 2KHOA 2YCHA 4IWVA 3H3OB 1YAGA 3H1VX 4EIAA 3M6GA 5KPZA 3ULEA 4CBUA 2VWBA 1NGBA 1YXQA 3LDQA 3VPZA 3VEVA 4EFHA 4DCHA 2A6AA 5F1XA 2A3ZA 1WOQA 3L6QA 4M7XA 3J8AA 1YVNA 4MLEA 1S3XA 4BRPA 4O5FA 2QXLA 4JAXA 2ITMA 3VGKA 2FSKA 1EQYA 1D4XA 1XC3A 1K8KA 2A42A 5AQPA 4BRDA 5EY4A 1NGEA 2D4WA 4B1XB 3LL3A 4H5TA 5I9EB 3AY9A 4CI6A 4ISFA 1RGIA 5AQUA 4PKHA 3QB0A 4I6MA 3WXLA 3ZX3A 4FPBA 5AQIA 2YHWA 4K43A 4K42A 1X9JA 3M3ZA 2E1YA 4BGBA 3BEXA 1JCFA 2A5XA 5KPRA 1GLBG 3GE1A 3L0QA 3W3DA 4B1WB 2GEMA 5AQTA 2QWNA 3AARA 4BREA 3EN9A 1KXPA 4BG8A 2AA4A 1NGAA 5F2RA 2E2QA 4FWQA 3VETA 4KBOA 4QS8A 3OHRA 4BR0A 3ATVA 4XEIA 4BQZA 1NM1A 5AQHA 2IVOA 1R59O 3O6WA 4H0XB 3GDQA 2EWSA 2FLOA 2P9IA 4K41A 2E88A 3AAPA 1CZAN 3FR0A 1BDGA 4MO4A 4FWRA 2QWRA 5FPMA 2V52B 5AQMA 4M7YA 4DHYA 5BN9A 3DXMA 1GLFO 3SLCA 5BPNA 2IVPA 5AQQA 4A2AA 1TYQA 3FZFA 4H5NA 2NRHA 3EZWA 4BRLA 3CI5A 1HKGA 1Z6RA 3ID8A 1IJJA 5FPDA 3A5NC 5AQWA 3ZETA 1T6DA 4MO5A 3CJAA 3A0IX 1HJOA 4DB3A 2P9KA 4NO7A 1BOTO 1TYQB 3HBTA 4BQLA 2GTDA 4O8KA 5BRDA 1U2VA 3DXKA 4ISEA 2P9LA 3CJ7A 2NLXA 3ZETB 4IXCA 4CZLA 3VF4A 1HUXA 2CH6A 4IJAA 4RTFD 3G25A 2ASOA 1TUUA 5E84A 4CZHA 3HM8A 4FWMA 3H45C 4C23A 4K25A 2E2NA 4H0TB 2CH5A 3UB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GWKA 1SKWA 2G8FA 3AO4A 3SBTA 1TKZA 4O0IA 3O9TA 5BR9A 3ZEUA 2QWMA 4AF1A 2QTDA 1SKRA 1BGXT 5EXWA 4FSVA 3IDHA 4FPAA 4YOXA 4ZHRA 1NK9A 3SMSA 1X9WA 3LWMA 1VSKA 4B3RK 1FXXA 5EOYA 1YITN 1U6ZA 4H0YB 3AVFA 3HP6A 2ZJQL 3O9SA 4BRAA 3HVRA 4A57A 3MWTA 1WBDA 4O5BA 3AO5A 2G8VA 4Z4EA 3IFRA 3SQ0A 1J6ZA 3TTDA 2WUSA 3MCAB 4DSIA 3OYGA 3EZ5A 3OBWA 2XO7A 2PFUA 4BWJA 1VQ6N 3C6HA 3LDSA 1RT7A 4L3QA 3RSEA 3VEOA 4QS9A 5B8HA 2YNIA 1FW6A 3V6DA 3THWB 2VG7A 4FVMA 1HYSA 3V9SA 1IG8A 4CIEA 4DR4K 4ILHA 2IAJA 3ZSRA 4N56A 2XHBA 1TK8A 1C0TA 3NVMA 1K8KB 1JCEA 2B4JA 1TUYA 2QA4N 4DR3K 3JS6A 3VQDA 2QK9A 3KKSA 4LF5K 4JNEA 1GLJO 4F2SA 4YOVA 4KHQA 3QINA 2I5JA 2VCPA 3LDPA 2P5GA 1ZC6A 3AVBA 2HHSA 5JS2A 1M1KO 2IGIA 1D8YA 3AVMA 1W97L 2YKNA 3D6RA 3HI0A 3QBXA 3MEGA 3LM9A 1KCFA 4FJIA 3IUCA 4CFCA 3FFKB 2PZSA 4BR7A 3WEEA 3KLEA 4JI2K 1RT3A 3O9UA 3UKRA 3E9PA 1JLEA 4DF4A 3UKUA 4FOEA 4JLHA 2LSNA 4IFYA 1JCGA 3NAEA 1SQKA 4XIUA 5GAEP 1O1WA 2DFFA 1NGJA 2VQEK 3CETA 4IFEA 4AHTA 4IFVA 4CJPA 2ZM6K 4CJQA 1W2BM 4F2RA 3DMJA 4BC2A 1IG9A 1S1TA 2HHXA 2F9WA 1E4GT 4A5AA 3A8YA 2Q3SA 3MAQA 3FE1A 4JN4A 2Q0RA 4FLVA 4BE7B 1NJXA 2NRXA 4O55A 2QWQA 4CJ7A 2QWOA 1QE1A 1GLDG 4CD3A 2HHQA 5AFUH 2UUBK 3VEXA 2W41A 3CJBA 3CCUN 2Y1IA 3CD6N 3E66A 3BZKA 1LWCA 2FSNA 2FBXA 4FJLA 3SJHA 1WSHA 1CZBA 3Q7BA 4HUGA 1KAYA 3KK7A 4KHPK 1U4BA 1T44A 1RDAA 5KQ8A 4BR2A 4OGCA 3BF3A 1J9AA 1I3AA 5EVZA 4GV3A 2HHWA 1N6QA 4FM1A 4FWPA 3LDLA 4CZMA 5BREA 4YOUA 1XNRK 5JVGL 2V51B 1ATSA 4JYAK 2RN2A 1ESVA 3F9KA 4IDKA 4BACA 4TSXA 3WXIA 4CHYA 3F5TA 3KLGA 2F9TA 4E7LA 4ILJA 3S3OA 2W6KA 4DTXA 4F3TA 3P1GA 1W9HA 5AQOA 2VWJA 4FM2A 2BGGA 1NG9A 3OYBA 2QM1A 4JK7A 1NJZA 1BU6O 4F8RA 4Y1CA 3FGUA 3AVIA 1KFDA 1VRTA 3AAQA 1NGFA 2IVNA 4I7FA 3TAFA 4PUOA 4OLAA 1VQLN 1S1XA 1RT2A 1Q82O 4J2BA 3VQPA 4DWIA 5I42A 2QWPA 3AO1A 1C0MA 4OKJA 1VRUA 2YNGA 4CBWA 3D7EO 4NXMK 4B1VA 3MN7A 1BCMA 4PKGA 4CGIA 4JKEA 3NVKA 3VESA 3QMLA 3VENA 4DR6K 1RT6A 1HQUA 4L8RB 3TU5A 2P51A 3AO2A 1XQSC 3DLGA 3T1AA 4BRIA 3V9UA 1NGIA 3ATUA 2O8CA 5FPEA 5JMVA 3LWLA 5DMRA 4XH4A 2UYTA 1YTAA 3CJ9A 2WTUA 4KI4A 4FJMA 1X3NA 3V1OA 4HCCA 4H03B 4UY8O 2P1JA 1CLQA 3AVHA 4OGEA 2YJFA 3W0LA 1BA0A 2H3GX 4JS5A 3L2QA 3RMCA 2O8EA 4DQPA 1HPMA 3IS9A 2G8HA 3RVCA 5AQFA 4WQ5A 4MLHA 4YHHK 2W6LA 1S1WA 2VYPA 5F0XA 3M1FA 3O9RA 2Q97A 4FW2A 5M1KA 4IO9L 4DV4K 3DLEA 1CXQA 3MCPA 3LDNA 4KAZA 5J1EA 3M5RA 4FWLA 1MA9B 2A41A 4CHPA 4DF8A 1V4SA 2OPPA 2Q36A 4BRFA 2D0OA 4I2PA 3TABA 3QICA 3K0SA 1L3VA 3NGYA 1NGDA 3LALA 1W0HA 4DFPA 1DT9A 1YUWA 3THXA 2OPSA 2YHXA 4BR4A 2GELA 4X62K 4PA1A 4FW1A 4F4KA 3OYIA 3DAWA 3ASMA 4ISGA 2YKMA 3KKRA 1WSIA 1X9MA 5KQDA 1EETA 2P9SB 4DR2K 4DTJA 1L5UA 2RE2A 3VQ6A 5GAHP 3TAGA 4CBUA 3LPTA 2VWBA 1BI4B 2NRWA 3OYLA 1L3TA 4NCAA 4BDPA 3VEVA 4EFHA 1WSFA 1ZBLA 1WBBA 1HQEA 1WOQA 4KHYA 2QXLA 3I0SA 4CF0A 4JAXA 4F3OA 4JKHA 4JKCA 5FRNA 1HYZA 5EY4A 3ALYA 4B1XB 3J80O 1FJGK 2DY4A 4X65K 2OZSA 3AO3A 1RDCA 4M3ZA 3WXLA 3ZX3A 3OYAA 4HCBA 4K43A 1X9JA 1UOCA 3KD1E 4DUYK 3CC2N 4FLUA 4DTOA 2A5XA 1QSSA 3KK3A 4FVUA 4OO1J 4JI3K 2JWLA 1FKPA 3GE1A 3L0QA 3K5LA 2GEMA 1RBUA 2ZQBA 4BG8A 2AA4A 4ID5A 4RW9A 3UIQA 4JKFA 5F2RA 3TWHA 4FWQA 3VETA 4N47A 4KBOA 2FC0A 4LD0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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