4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
1NGGA 4CBXA 4A2BA 2P9SB 4H5VA 2F9WA 2YHYA 3I33A 4I6MB 5EXWA 1TUUA 2ITMA 5ELZA 5AQKA 3VEWA 3H45C 1RGIA 3M3ZA 4H5RA 5EX5A 1KAXA 3VOVA 3O1WA 1KXPA 3L6QA 1KAYA 2YI1A 5FPDA 4PL8A 2ZWHA 4H0VB 3CI5A 5F1XA 2IVNA 4BC3A 2VCPA 3M1FA 4B9QA 4K42A 2ASMA 1NGAA 3FFKB 1BO5O 1E4GT 2V7YA 2D0PA 3IFRA 4CZGA 3CJAA 5I9EB 3AARA 3MN7A 3VGKA 5AQSA 1D4XA 3DXMB 5AQRA 5F0XA 1GLCG 4WYBA 1MWKA 4FPBA 1JCGA 4BVPA 4MO4A 4IO8A 4BRCA 2FLOA 2NRHA 3LDPA 4K25A 4EAHD 3BF3A 1JCFA 4HTLA 4RWTA 5AQJA 4B1VA 4L3QA 1EQYA 3UKRA 1BOTO 4FO0A 3OHRA 1NGIA 3DXKB 3VEXA 1QHAA 5E84A 3ZX0A 4H5NA 3CQXA 2V51B 3WQUA 2P9LA 4CZHA 4Y0WA 3ULEA 2W40A 2V7ZA 3O80A 3SJHA 1JCEA 3VF2A 5JLHA 2QWNA 2NZTA 4DHYA 3VPZA 4BR5A 5KPRA 2E8AA 3HBTA 3WXJA 4H03B 2YJEA 4FWQA 1S22A 2I7NA 1RFQA 1MWMA 3HI0A 3P4IA 2P9IA 2NLXA 1LOTB 5JLFA 1YXQA 2V52B 3H6EA 4M7XA 4GNIA 1BU6O 3HTVA 3JS6A 5AQFA 2A3ZA 3WT0A 3A5NC 1MDUB 4BR2A 3ZEUB 3VF4A 1HUXA 3CHWA 4J8FA 4EHTA 1NBWA 2GEMA 4FPAA 3UKUB 4PKHA 1YUWA 1U6ZA 3EO3A 3HM8A 2A41A 2P9KB 3CJ9A 4FWSA 1NGDA 4XH4A 5AZIB 2DPNA 2QWMA 1WOQA 3G25A 3S41A 1XUPO 3FR0A 1BG3A 4AM6A 2IVPA 5BPNA 3WEEA 3A5MC 1OKJA 4B1YB 1SQKA 5E26A 3HSCA 3DXKA 4MLEA 3VGLA 2Q31A 3GBTA 2D1KA 3IMXA 5BRHA 4O8KA 4CZJA 3GOIA 3ZX3A 2BUPA 4H0XB 2ZGZA 3ZEUA 2QWPA 4ISEA 4DQ8A 3R9PA 3C7NB 3LDQA 2ASPA 3VF6A 2BTFA 2P9UA 4BC5A 3H1QA 3CJCA 4FOIA 3O6WA 2UYTA 2Q36A 2PBDA 4ISGA 2CGKA 2W41A 5AFUH 4PKIA 4H5WA 4BGBA 3MCPA 1T6DA 4MO5A 1J6ZA 1BWFO 2P9LB 3VEVA 2E1ZA 4NO7A 2Q97A 2E1YA 3D2FB 4A62A 5FPNA 1YVNA 4BR4A 3I8BA 5AQPA 4M63C 1GLAG 2QWRA 3MN6A 3TU5A 1C0FA 3SLCA 2FF6A 3FZHA 1ZXOA 4YDUC 4CD3A 4WQ5A 4BC2A 5AZIA 5CE3A 2YCHA 1X9JA 1Q18A 2Q1NA 1HX1A 1NGEA 3D2EB 4FOEA 1DEJA 2P9PB 2IIRA 4FWLA 3JXUA 3U8XA 2D0OA 4BRMA 2QM1A 2QWQA 3ATUA 2EWSA 5EY4A 1TUYA 2AP1A 5AQTA 1TYQA 2FF3B 4QS9A 3CETA 4CZEA 3GE1A 3LL3A 5KQ8A 1YAGA 4FWOA 4MLHA 2HOEA 4IZ9A 2YHXA 4PL7A 3ZETA 1QZ5A 5LJVA 4CJ7A 4FSVA 4FWPA 5AR0A 4BROA 2HMPA 3W3DA 1ESVA 4CI6A 1DGKN 4JD2A 4H0OA 1HKBA 3EKUA 4CZMA 5BPLA 2Q0RA 3WEEB 3EKSA 3AY9A 1ZBSA 1MA9B 4BQZA 4K41A 1NMDA 4Z94A 3L4IA 1U2VB 3DWLA 2QWOA 1NWKA 5AQUA 3U4LA 2E2NA 5F2RA 4C23A 5AZJA 4WQ4C 2E2QA 5AQLA 3ENOA 3FGUA 1U2VA 3MK6A 5BPMA 2P9PA 3C0BA 1NGHA 3FZLA 3D7EO 5AZJB 4FWNA 4CZFA 5JMVA 2F9TA 4H0YB 2AA4A 1HKCA 3A5OC 3CQYA 3VGMA 4BRDA 1KAZA 5ADXA 3CJBA 3MMVA 3DJCA 4CZLA 4O5FA 4BRFA 4XEIA 2VWBA 1NGCA 3UB5A 5BR9A 2CH6A 4XH5A 4GY2B 3UE5A 1QQMA 2Q2RA 3BUZB 5AQZA 1QQOA 4FWRA 1QZ6A 2HF4A 1GLEG 4BRAA 4PKGA 5AQXA 4RCHA 5AQHA 5JICA 5AQNA 4JN4A 1GLFO 3EN9A 4B1ZA 3MDQA 2KHOA 2YHWA 4QS7A 3LDLA 2HF3A 2GTDA 2A42A 1X3NA 4JHDB 1HKGA 1SAZA 5AFUA 4FWMA 4I6MA 2H3GX 5BN8A 1V4SA 3EL2A 4B1WB 3A5LC 3D2FA 1IG8A 1NGJA 1WUAA 2FSNA 2OANA 3H3OB 3DXMA 3QDKA 5TKYA 4E1JA 2YJFA 4IJNA 4BRPA 4H0PA 3VESA 4FL9A 3FZFA 3SK3A 3BF1A 3BP8A 2CGLA 1Z6RA 4JD2B 2E88A 4WQ5C 4JNEA 3VERA 1RDWX 4YDUA 5BRFA 2P9NB 3MN9A 2QW9A 3UKRB 5FPEA 4JHDA 2IVOA 3C7NA 4CZIA 1V4TA 4IXCA 4A2AA 4BR7A 2P9KA 1NGFA 1K8KA 4BRGA 3HZ6A 4XH1A 2ZGYA 4BC4A 3GDQA 3AAPA 5EOYA 4EFHA 2ZF5O 3CIPA 3VEZA 1C0GA 3VENA 3ZETB 1DKGD 4BR9A 3A0IX 1T44A 5KQDA 3O08A 3H46O 1HPMA 3J8AA 4HWIA 5AQVA 4BGAA 4DB3A 4RTFD 3VETA 5AQMA 3FE1A 4BRKA 2Q0UA 1XC3A 2GWKA 2GELA 2GUPA 1G99A 3QBWA 1CZAN 3VEYA 3GG4A 3RSEA 2J4RA 2QWLA 3RSEB 2CH5A 3L0QA 2E2PA 3LM9A 3W0LA 4FWKA 3O4WA 5AQGA 1ZC6A 2A40A 2FSJA 3KHYA 4DCHA 3FZMA 3ID8A 3KZBA 1HLUA 2P9UB 4BRNA 4CZKA 3LDNA 2GWJA 3QFPA 4EHUA 3SMSA 3BEXA 2I7PA 3M6GA 1TYQB 1K8KB 2E20A 3TPQA 5BN9A 4BVOA 5AQQA 1X3MA 3DAWA 4BR0A 3QICA 3UKUA 5ADXH 4BG9A 3H3NO 3U9DA 4F9OA 4KBOA 5BRDA 3FZKA 3H1VX 4ISFA 3ULEB 5BREA 4H5TA 3R6MA 1NGBA 3O1BA 3QMLA 3WQTA 4H0TB 4CD1A 3ZX2A 4EIAA 3IUCA 3WXIA 1ATNA 2P9NA 5FPMA 1LCUA 1T6CA 3VEOA 5KPTA 1R59O 2P9SA 1IJJA 3ENHA 3A8YA 1GLLO 5B8HA 1HJOA 1NLVA 4BRQA 4BRIA 4IJAA 2FXUA 3LM2A 4M7YA 4LC9B 3MN5A 4K43A 3QBXA 3GL1A 2CGJA 1Y64A 1Z05A 1SZ2A 3O5BA 3CJ1A 1ATSA 1GLBG 2FSKA 1S3XA 3U9ZA 4JAXA 4B1UB 3LDOA 3SMPA 1BA0A 4WQ4A 4BG8A 2WUSA 3ATVA 2ASOA 4QS8A 5EVZA 5LY3A 3WXLA 1GLDG 4BRLA 2P9IB 3CERA 3IDHA 1XQSC 3WUHA 3QB0A 4AM7A 1BUPA 2QXLA 3D2EA 3F9MA 4IWVA 5LJWA 3EZWA 4BQLA 3KVGA 5AQIA 1P8ZA 5AQYA 3B8AX 5KPZA 2D4WA 4B1XB 2E2OA 2VYPA 1E4FT 1BA1A 4CBUA 2A5XA 3FLCO 2PAVA 5AQWA 1GLJO 4BREA 3O8MA 4A61A 3QFUA 4BRHA 1ATRA 1H1VA 3AAQA 1BDGA 3CJ7A 5AQOA 1QQNA 2A6AA 4NB4A 3WXKA 3R8EA 1NM1A 4CBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGGA 4GKJK 4N76A 4R5PA 4K0KK 2YHAA 5EXWA 4CGGA 5ELZA 1B9DA 3NFAA 3H45C 4B3SK 3O1WA 3L6QA 1KAYA 2YI1A 1FJGK 4OPKA 3DLBA 5CYQA 4MDAA 1D8YA 4BC3A 3M1FA 4B9QA 4K42A 1JL1A 4DFKA 1KD1O 3MN7A 3VGKA 5F0XA 1MWKA 4FPBA 1WBBA 3PX4A 4BVPA 4MO4A 1S5JA 3LDPA 2B6AA 2VGNA 4DR3K 1A5XA 3BF3A 2QEXN 3VMFB 3DRPA 4FLVA 1K73O 1YF5L 4ICLA 1BI4B 4BE2A 3V9UA 4Q0BA 4FO0A 3LZIA 3VA3A 4E1MA 4B9NA 3NF9A 4DTSA 3CQXA 2V51B 2B5JA 4KH4A 4KHWA 5D3GA 3ULEA 4YHHK 2V7ZA 5DK5A 1JCEA 3V1QA 5JLHA 1SL1A 4DHYA 1S9EA 3CM6A 3O4QA 3HBTA 3IG1A 3CCEN 3WXJA 4CFCA 3DOKA 3M5RA 1S22A 1RFQA 1MWMA 2WOMA 3F5TA 3P4IA 5SZTA 3ZSRA 1YXQA 2V52B 3H6EA 4M7XA 4GNIA 5J2MA 3WT0A 1MDUB 1M90O 1XWLA 3VF4A 1RTIA 3TAQA 1RT3A 3C65A 3UKUB 4ELVA 3HM8A 1NJZA 2A41A 3CJ9A 4AHUA 3AGKA 4Z4IA 1Y97A 4LF9K 3VQQA 5M1OA 5HRRA 4FK2A 1XUPO 4DLGA 1RDAA 4YY3K 3RR8A 3O4NA 3CD6N 3K59A 4DS4A 3RMCA 4KTQA 4E0DA 4OX9K 1OKJA 2PZSA 4CK2A 3DXKA 2GBZA 4MLEA 4C8NA 2Y1IA 1KRPA 1VSIA 5BRHA 5JS2A 2E5LK 4DSFA 3GOIA 4M3ZA 4C8OA 1VSLA 3ZYYX 2HW3A 2QWPA 3SV4A 1W97L 1C1BA 1QSYA 3WNHA 4FJKA 2ASPA 3AO3A 4CECA 4BC5A 4DV6K 1SS6A 4CHNA 1XNRK 2YHBA 4F3OA 4FOIA 3O6WA 5E41A 1E3MA 1YT3A 2O8EB 3DLHA 4MO5A 2P9LB 4CHYA 1Q9YA 3D2FB 1W0HA 3LPUA 3MEGA 5FPNA 2FBXA 3ENBA 4IFVA 4CF2A 3TAEA 5AQPA 4DQPA 4DQQA 2IC3A 1B92A 2A1SA 3SLCA 4OKEA 3D0PA 4CIEA 1ZXOA 4YDUC 3TANA 2F4VK 4BC2A 1OVYA 2FBYA 1QVGM 2YCHA 5IWAK 3D2EB 1DEJA 3U8XA 5DMRA 3NAEA 1G15A 3ATUA 4B3RK 4FLTA 1TUYA 1NK9A 2AP1A 4KKOA 1IKVA 2JGUA 3CETA 3LL3A 3P38A 3T1HK 1YAGA 4FXDA 3E66A 5GADP 4QCLA 4CJKA 4IZ9A 1CXQA 1WAJA 4O5BA 5LJVA 4RW9A 2HBJA 2WC9A 4CJ7A 4BROA 4ID1A 1K6YA 3TABA 4DV5K 4H0OA 1HKBA 1TK5A 3EKUA 1WSEA 4WFAL 4LSNA 2ZE2A 4BQZA 1RDCA 4Z94A 3L4IA 1U2VB 2NRXA 3CFPA 2QWOA 5LMNK 2YNIA 1NJWA 4IDHA 4C23A 4KAZA 4CF8A 3D45A 3B6OA 2E2QA 3FGUA 3T1AA 2ZM6K 3M8SA 5JS1A 2P9PA 3C0BA 2KKZA 1NGHA 1JJ2M 3PO4A 5JMVA 1NKBA 2F9TA 4H0YB 4JRQA 4XIUA 3CQYA 3A5OC 3VGMA 4X65K 1BQMA 4BRFA 1RT2A 1NGCA 5BR9A 2CH6A 2O8FB 4XH5A 2VGMA 3BUZB 1RDUA 4NCAA 4O44A 3DM2A 4DSLA 1QQOA 1C0TA 1J5OA 3IAYA 1GLEG 3RMBA 3OYEA 3AO5A 3ZT1A 3CCRN 4FJNA 4JN4A 3MDQA 3E1YA 1CXUA 4CFDA 4BEBA 2HF3A 1JL2A 1HYSA 4JHDB 4W5QA 3HXMA 1RBUA 4YOTA 3CC7N 5C25A 4UQGA 5KRTA 3M8RA 3L8BA 4JI2K 4KPYA 3CMAN 2X6NA 4B1WB 2FSNA 1WUAA 3H3OB 3VTIA 4E1JA 4RW4A 3CF5L 1D9FA 4FL9A 3FZFA 3BP8A 4KH6A 3JYTA 4FW1A 3VERA 3V9XA 4OKKA 4DTPA 3PY8A 4KHNA 2LSNA 5FPEA 1J9AA 1RT6A 4JHDA 5KI6A 5M1KA 1Q7YO 3C7NA 4DLEA 4JKGB 4HCBA 4A2AA 4BR7A 2NRRA 3HZ6A 3THXA 2HNZA 4BC4A 4RW7A 3NF8A 3J7ZO 5EOYA 4EFHA 3HSTB 3AVIA 1RBRA 3OBWA 4CJLA 1DT9A 3NGIA 3K9JA 1T44A 5KQDA 3O08A 1HPMA 5AQVA 4MFBA 1VQ4N 4RTFD 3VQCA 1LW0A 3FE1A 2GWKA 2GUPA 1G99A 3VEYA 3RSEA 1REVA 2CH5A 1UWBA 4DU3A 3MEEA 5AQGA 2A40A 3KHYA 4DCHA 3ID8A 3LALA 4DMNA 2RN2A 4FLWA 1HLUA 3H08A 4OPAA 4BRNA 2GWJA 2D0AA 2ITGA 1JLCA 4JI6K 2I7PA 3BEXA 4DV4K 1TYQB 5JENA 1N33K 3CM5A 3TPQA 4NCGA 5GIOA 3AVKA 5GAHP 4KHQA 3L2QA 4Z4GA 4LFAK 4FZYA 2IGIA 3DAWA 3UKUA 5ADXH 3CCLN 4BG9A 2HBLA 1IBLK 4PY5A 4NXMK 4ISFA 4MDBA 3OYGA 4FVMA 3R6MA 3QMLA 3TAGA 4H0TB 4EIAA 1I94K 2HNYA 1U49A 3IUCA 3WXIA 1ATNA 1IG9A 5FPMA 5J2NA 3QINA 2G8HA 3ENHA 3ASMA 1C6VA 1XMOK 4BRQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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