4FWSA

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with ctp
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Mechanistic features of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD): insights from kinetic and crystallographic studies.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Transferase
total genus 133
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2012-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwsA02
3M6GA 1GLAG 4I6MA 4RTFD 3I8BA 4XH5A 4GY2B 3SK3A 1BA1A 2ASOA 2HF3A 1XQSC 2DPNA 4MLEA 2Q31A 2QW9A 3FE1A 3RSEB 3VF4A 4BRNA 3A0IX 4PL8A 3WEEA 3ZX0A 1S22A 5KPRA 3M3ZA 4H0XB 3C0BA 1KAZA 5FPMA 2W40A 1NWKA 2V52B 1NGGA 3DXMB 1E4GT 4K42A 4FWMA 4JHDA 3F9MA 3TU5A 2P9PB 4BRCA 4JN4A 4Y0WA 4EAHD 5I9EB 3AAPA 2FSJA 3ENOA 2P9NB 2BTFA 4BRGA 3ZX3A 1HUXA 1BO5O 2W41A 1KAYA 2P9PA 1X9JA 4DHYA 3QBXA 5TKYA 3H6EA 1WOQA 4HTLA 5ELZA 2VYPA 3R8EA 1QQMA 1YUWA 1JCFA 3O1WA 3O80A 4FSVA 4BR7A 4BREA 1E4FT 3UKRB 4EHTA 3VEOA 1TYQB 3GL1A 5AQOA 4XH1A 1QHAA 3VOVA 1YVNA 3EKUA 3ID8A 1GLBG 2F9TA 3UKRA 3VF6A 2ASMA 4CI6A 3CJ1A 2E2OA 2P9SB 3D7EO 3ULEA 1T44A 2CH5A 3A5MC 3KVGA 4IZ9A 3VEXA 4B1UB 4L3QA 5CE3A 2YHWA 1NGAA 3BUZB 1T6DA 5JICA 3SMPA 3CERA 4RCHA 4B1XB 3B8AX 2P9SA 1WUAA 3QDKA 1SAZA 3CQXA 3BEXA 4ISEA 4JAXA 3VEVA 4FWNA 3CJBA 4CZFA 1C0FA 3D2FA 2E1ZA 4JNEA 5AQRA 3WXLA 4EHUA 3MCPA 1TUUA 1BDGA 1X3MA 2FLOA 4QS9A 3FZFA 3TPQA 1U2VB 3BP8A 2P9KA 3CHWA 3FFKB 3FGUA 4WQ5A 5EVZA 4O8KA 5EOYA 1C0GA 1CZAN 2D4WA 1BUPA 4QS7A 5AQWA 3CJ7A 4DCHA 3CIPA 4H5NA 3AY9A 4B1WB 1BOTO 1U2VA 2ZF5O 3HTVA 5BREA 3ATVA 3M1FA 5KQ8A 3SJHA 5AQYA 2H3GX 1DKGD 4AM7A 5LY3A 2A3ZA 1T6CA 3GBTA 4FWSA 3DJCA 1GLJO 4FL9A 3R9PA 4BR4A 3O5BA 3EN9A 3QMLA 2P9UA 5EX5A 3U9ZA 3CJCA 1XC3A 4MLHA 4BC5A 3LM9A 2P9LB 5BN8A 1IJJA 2YHYA 3CJ9A 1DGKN 1RFQA 3FZMA 4H0OA 4BQLA 4CZKA 2QWPA 3MK6A 1SZ2A 3FZHA 2AP1A 1KAXA 2QWMA 1GLEG 2IVNA 3O4WA 4FOEA 2Q0RA 5AFUH 2FSNA 3WXIA 1RGIA 4O5FA 4WQ4C 4BG9A 2ZGYA 3O6WA 5AQZA 3VESA 1TUYA 2NZTA 1ZC6A 4F9OA 3EZWA 5LJWA 3U4LA 1HJOA 3LDNA 3KZBA 3VPZA 1ZBSA 4BC3A 4MO4A 3RSEA 3U8XA 4J8FA 3HBTA 2GEMA 4H0VB 4IJNA 2OANA 1HKCA 2GUPA 2P9IB 3FZLA 4H5RA 3DXMA 2GWJA 3G25A 4WYBA 1MA9B 2I7PA 5AQSA 5B8HA 5KQDA 1QQNA 5AFUA 4B9QA 2A5XA 1BA0A 3IMXA 4ISGA 5FPEA 4BROA 4FWRA 3VETA 3DAWA 1DEJA 3GE1A 2D1KA 2HF4A 3GOIA 2P9NA 3VENA 3FLCO 4BRAA 2EWSA 4CBXA 4YDUC 4MO5A 3A5OC 4B1VA 3VERA 1NLVA 4CZIA 2ZWHA 4CBWA 4IJAA 3CI5A 2CH6A 2Q0UA 4BC2A 4FWQA 3WQUA 4NB4A 2IVPA 1MWMA 5AQQA 4XH4A 1MDUB 1NGCA 2YHXA 1NGIA 4H5WA 3L0QA 2J4RA 4WQ4A 1GLDG 1TYQA 4H0TB 1HPMA 4A61A 5BRHA 5LJVA 4CZMA 3HM8A 3IDHA 4CBUA 3QICA 5AQXA 3QFPA 1NGDA 1HKBA 4CD1A 2YJEA 4DB3A 4C23A 2FF6A 3A5LC 3W0LA 3A8YA 3H46O 5AQPA 4BRPA 4JD2B 1ATNA 1RDWX 2AA4A 3LDPA 3LDOA 3H1QA 3HI0A 3O8MA 4BRHA 2NLXA 1HX1A 1ESVA 2ITMA 2V51B 4ISFA 3H3NO 5ADXA 1OKJA 3HSCA 2PAVA 4JD2A 1NGJA 3WQTA 5AQGA 4B1YB 5JLHA 3WUHA 3I33A 5AQNA 3WXKA 5BRFA 4A2BA 2E1YA 3EKSA 3SMSA 4M7YA 2CGLA 1H1VA 4BC4A 4BQZA 3WXJA 3DXKB 2FXUA 3A5NC 4BRDA 5AR0A 4Z94A 4PKIA 5EY4A 3MMVA 4BRFA 2PBDA 4YDUA 4BGAA 4BGBA 4BRIA 5AQIA 3LDLA 3J8AA 3O1BA 2FF3B 3DXKA 4H03B 3MN5A 3UKUB 2A6AA 3D2EB 4CZJA 2YI1A 4PKHA 2WUSA 1QZ5A 3BF3A 1V4SA 2QWQA 5AQJA 2Q1NA 2IVOA 3S41A 3ZX2A 1GLLO 4IO8A 4BRLA 4DQ8A 2ASPA 2D0OA 1BG3A 3VEZA 2GELA 5BN9A 3MN6A 3MN7A 2P9LA 3CETA 5AQVA 3HZ6A 3QFUA 4IXCA 2A41A 3OHRA 4H5TA 4KBOA 2QWNA 1HKGA 4H0PA 5JMVA 1Z05A 2E2PA 2BUPA 1NM1A 4E1JA 1NMDA 5BPLA 1LOTB 4BG8A 4CD3A 2E88A 4K25A 3UE5A 5KPZA 1XUPO 5AQFA 3WEEB 1SQKA 3EL2A 4M7XA 3VF2A 1R59O 3VGMA 5EXWA 1JCGA 5JLFA 4JHDB 2YJFA 4AM6A 1Q18A 2YCHA 2QWOA 4M63C 4GNIA 5KPTA 3IFRA 2P9IA 5AQUA 4BR2A 4FPAA 1U6ZA 3JXUA 1JCEA 1NBWA 2IIRA 2Q97A 3H3OB 5BRDA 1Z6RA 3LM2A 2VWBA 4B1ZA 3VGLA 5BPNA 5E26A 3QB0A 4BRQA 2UYTA 4WQ5C 5ADXH 3JS6A 3AARA 3VEWA 3W3DA 2NRHA 3CQYA 2QWRA 1QQOA 2V7YA 4H5VA 4NO7A 1EQYA 3L4IA 3ZETB 3H1VX 3MDQA 5AQMA 5AQHA 5AQTA 4BR0A 4FWOA 4CZEA 1ATRA 3L6QA 3EO3A 2E2QA 2KHOA 3P4IA 3ULEB 3KHYA 3U9DA 3AAQA 1J6ZA 1YAGA 3ZETA 5F0XA 2F9WA 1NGBA 1IG8A 1BU6O 1HLUA 3WT0A 1GLCG 1ZXOA 2FSKA 4BR5A 1NGHA 2ZGZA 5E84A 5FPDA 3VGKA 4K43A 5F2RA 2HMPA 4FWPA 2CGKA 3LDQA 3D2FB 3MN9A 3DWLA 5FPNA 4EFHA 1X3NA 3QBWA 4IWVA 2P9KB 2VCPA 1MWKA 4K41A 1NGEA 4FWLA 4QS8A 5AZJB 3UB5A 4RWTA 1YXQA 2GTDA 1QZ6A 1KXPA 2D0PA 2I7NA 4BVPA 3FZKA 3SLCA 4FWKA 3VEYA 4H0YB 1K8KB 1LCUA 2QWLA 5AZJA 3ZEUB 4HWIA 2Q2RA 1ATSA 3GG4A 2QXLA 2HOEA 4FOIA 4FPBA 5AQLA 2E8AA 5BPMA 2GWKA 3CJAA 3R6MA 3C7NB 1NGFA 2E2NA 1S3XA 5BR9A 2P9UB 3UKUA 1K8KA 2Q36A 4BVOA 3H45C 3D2EA 5AZIB 3ZEUA 4XEIA 4A62A 1G99A 1V4TA 3LL3A 2CGJA 3GDQA 2A40A 4CZLA 4BRMA 2QM1A 4LC9B 3C7NA 1P8ZA 3O08A 4BR9A 4FO0A 4A2AA 3IUCA 4CZGA 5AZIA 2A42A 4BRKA 1Y64A 4PKGA 2V7ZA 5F1XA 1D4XA 3BF1A 1GLFO 4I6MB 1BWFO 3ATUA 5AQKA 4CJ7A 4PL7A 3ENHA 4EIAA 4CZHA 2E20A 3FR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O55A 3QNNA 4MDAA 3I8BA 4XH5A 3CXCM 1TV6A 3SK3A 2HF3A 2FBYA 1XQSC 2ZD1A 1WSJA 1RTDA 3RSEB 2RF2A 2HNYA 4CHZA 3MXMA 4KREA 3PIPL 5KPRA 4JS4A 4DR2K 3C0BA 4NCGA 2W42A 2V52B 3RWUA 1DTQA 1E4GT 5I42A 3F9MA 5J2MA 1HRHA 1NK6A 2P9PB 1TK0A 1J54A 3BY5A 5C2DA 3NDKA 4HUFA 3AAPA 4ELTA 4JI5K 1U47A 2P9NB 4WFBL 1KAYA 3P5JA 3SZ2A 5HL7L 3H6EA 1I94K 3R8EA 3U6FA 2O8CB 1QQMA 4FM1A 3UIQA 4CEAA 4FSVA 1JCFA 3V4IA 4DSIA 2YV0X 3NMUA 4BR7A 2IDOA 1E4FT 3L3VA 4FJNA 1ZBIA 5CYQA 4XH1A 3VOVA 1DT9A 1XI1A 4FJGA 4CJTA 2QKBA 4YY3K 2OYQA 3E9LA 3KKSA 4CI6A 1JKHA 3ULEA 1VSIA 4IZ9A 3J7ZO 4B1UB 4AHTA 1VRUA 1RTHA 4L3QA 2NRTA 3NH2A 5CE3A 1KVCA 1NGAA 4O0JA 3OYCA 1F21A 3QDKA 5GAGP 1KSPA 1VQPN 3CFPA 4CFDA 4GMJB 1NG9A 3D2FA 1NOZA 2UUBK 5AQRA 4EHUA 2W6KA 2NRRA 2FLOA 4DTPA 3FZFA 1Z25A 1QSSA 3FGUA 4Q0BA 4YOTA 3LAKA 4OKJA 1C0GA 3PO4A 1R0AA 1EETA 3CJ7A 3OYGA 3KTQA 4DSFA 3AY9A 1BOTO 1U2VA 2ZF5O 5SWMA 1HR0K 4Z4EA 3SJHA 1DKGD 1WSGA 2JWKA 4LH5A 2A3ZA 3ZSVA 4AM7A 4YHHK 1KC8O 4CJ4A 3NH0A 3L2UA 2HVIA 3DJCA 3TI0A 2OZSA 3O5BA 2DFEA 1ZYQA 2EX3A 2IC3A 2IS3A 2P9UA 4IEIA 3CJCA 3NCIA 1RNHA 3LM9A 5JVGL 3T1YK 5C10A 2P9LB 3NF9A 2EHGA 2PZSA 4RW4A 3I8DA 1RFQA 2UXDK 4DUZK 4CZKA 2QWPA 3SUQA 3OYNA 3MK6A 2HHVA 1HJRA 1SZ2A 1VQ8N 1SL2A 4Z4HA 5AFUH 3I55N 4NYFA 4O5FA 4BG9A 1G15A 2NZTA 4FLUA 1RT7A 3EZWA 3K9KA 5K14A 3ALYA 5LJWA 3CCSN 4JKEA 1S5JA 2O4GA 4JKBA 4YOUA 1IV0A 3KZBA 4CJRA 4BC3A 4CGIA 2VG5A 4C8MA 4DFMA 3TAMA 4KI4A 2GEMA 3QLHA 3L2QA 3PX0A 3OY9A 4B9UA 4Z4GA 2GWJA 4ID5A 2P5OA 4DKWA 3G25A 4WYBA 1QQNA 3SV4A 3PX6A 3IMXA 4E3SA 3VETA 1DEJA 5IT9O 3VENA 2O8EA 3VQCA 3L8BA 1EXQA 5JVHL 2OTJN 3A5OC 4B1VA 4OLAA 1SL0A 3LDSA 3VQ8A 3AVJA 4CBWA 4IJAA 4O8UA 5J2QA 1P90A 2CH6A 2Q0UA 3AO4A 4FWQA 4BC2A 4CEQA 1C6VA 1VK0A 2YHXA 4DQSA 4H5WA 3L0QA 1CXQA 5M1PA 4ZTFA 1VSEA 3VTIA 1TL3A 1KRPA 4A61A 3DRPA 3HM8A 3QICA 4DTMA 1L3SA 4DB3A 3W0LA 3H46O 4JKAA 3OYMA 4BRPA 1E3MA 1RT3A 3OYDA 3OYKA 1RDWX 4OJRA 4DQIA 2AA4A 4OKKA 3J80O 2UXCK 1HX1A 4FJLA 3O9SA 3H3NO 1OKJA 3K5NA 1W97L 4KV8A 3WUHA 3I33A 3EEQA 5J1EA 1QE1A 4A59A 3EKSA 3G0ZA 3TAFA 3MX2A 2BH1A 1GOAA 1VRTA 4M7YA 1VQLN 4OGEA 4BC4A 4BQZA 3WXJA 1MU2A 3DXKB 1S6PA 5FLXO 4B3OA 4DR6K 3MMVA 3QESA 1RTJA 1X9SA 4BGBA 4CCHA 2Z1HA 5AQIA 4LF8K 1Q7YO 3J8AA 3O1BA 4Q5VA 5GADP 1ZBLA 1YTUA 4CFCA 2YI1A 3CCQN 3V1QA 1YHQN 4FJKA 2IAJA 4UY8O 1S9GA 3O9TA 3ASMA 5AQJA 4EZ9A 4KRFA 3G6EN 2O8DB 4IO8A 4CEOA 4FVMA 2ASPA 3K2PA 5KRSA 5BN9A 1BI4B 3D45A 3MN7A 3CETA 5AQVA 4CE9A 3BZCA 4CJFA 1HNVA 3J7AP 2QWNA 1J9AA 3OYFA 3THWB 4KHNA 5GAEP 1NM1A 5SZTA 4JI8K 4K25A 3FFIA 1YT3A 1LW2A 1B9DA 1SQKA 5CZ1A 4EZ6A 3VF2A 3S3NA 1SKRA 3THYB 3VGMA 5EXWA 4DLEA 4W5NA 4CGGA 4DR3K 4B9TA 4V19S 5GINA 3JYTA 4CF0A 3F2KA 1JL1A 4CF2A 3CCVN 1ILYA 3ZLJA 1J53A 5GIPA 1D9DA 2A1SA 2P9IA 4E1NA 5AQUA 4GW6A 4I9LA 3J81O 4IKFA 2Y1JA 1K73O 2F96A 2HHHK 4LSLA 3EYZA 1WB9A 3SQ2A 4NYNA 3VQ6A 3KK1A 3OA9A 3K5MA 3RR7A 4DR1K 3MAQA 4U67L 1IBMK 4FJHA 1XNQK 2ETJA 5KRTA 2QWRA 1Y97A 4NCAA 1TKTA 3LALA 3H1VX 4WE1A 4PWDA 5AQTA 1ATRA 3L6QA 4WFNL 2E2QA 1VSDA 1L5UA 4RG8A 4CK2A 3KHYA 3ZETA 1YAGA 2KQ2A 3DOLA 1NGBA 3OTOK 3P39A 1SL1A 2HSTA 1ZXOA 4EP4A 5FPDA 1RT5A 3VQ9A 5F2RA 2RE2A 1NNEA 4X65K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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