4FWSA

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with ctp
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Propionate kinase
publication title Mechanistic features of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD): insights from kinetic and crystallographic studies.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 133
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2012-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwsA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwsA02
2ZGZA 4AM7A 4BC4A 4CZIA 1NGCA 1ATSA 2ZWHA 1P8ZA 4Y0WA 1WOQA 3IUCA 4MO5A 4GY2B 4BRQA 4FPAA 4NB4A 2CGJA 1NLVA 4H0YB 2D4WA 1E4FT 3M3ZA 1KXPA 1D4XA 4FWNA 4E1JA 3AY9A 5AQZA 5E84A 2CGLA 4BRMA 2QWLA 5BN9A 1GLDG 3GL1A 3MK6A 5ELZA 1Q18A 1E4GT 1NGEA 3A5LC 4CZLA 3WXLA 4BC3A 3CJ7A 3O80A 4H5TA 1X3MA 3MMVA 1BOTO 4BC5A 4CZHA 3VGLA 1QZ6A 3CJBA 1SZ2A 3MN5A 2QWRA 3H45C 2PAVA 5BRDA 5AQHA 1GLBG 2P9IA 1BA1A 4BRAA 5JLFA 1XUPO 3FFKB 2EWSA 2A41A 5ADXA 1V4SA 2A42A 2DPNA 2Q36A 4BRLA 3H3NO 2HF3A 5AQKA 2UYTA 1DGKN 3CI5A 3UKUB 1H1VA 2V7ZA 2P9IB 3ZEUA 3CERA 3UKRB 3GOIA 3ENOA 3A5OC 3EO3A 4BRGA 4DCHA 3EL2A 5BPMA 1ZC6A 4ISEA 4BR9A 2P9UA 4WQ5C 2NRHA 4EIAA 1EQYA 1GLFO 4MLEA 3S41A 2P9NA 3WUHA 3CQYA 1IJJA 2W40A 4WQ4C 4FL9A 2J4RA 1ZBSA 4FWRA 5ADXH 5BREA 4DB3A 4B1UB 3FZLA 1GLAG 1BA0A 5AQIA 2W41A 3WT0A 5FPEA 1HKCA 5AZIB 4BRIA 4BRDA 4CZEA 3D2FA 1NMDA 2P9UB 2CGKA 3CQXA 5E26A 3MN6A 5AQFA 5KPTA 3FR0A 5EVZA 3QBXA 4I6MB 3VEXA 1BWFO 2P9KB 1NGGA 3O4WA 3O8MA 3ZETA 5JICA 4M7YA 3VGKA 2FF3B 3D2FB 3GG4A 1QQOA 3FLCO 1NGBA 3LDOA 2FF6A 2NLXA 2QWNA 3I8BA 3R6MA 1HX1A 2CH6A 3LM2A 3ZETB 4FWSA 5AFUH 2F9TA 3LDPA 3GDQA 5AQXA 1OKJA 4JD2A 4EAHD 3HM8A 2P9PB 5EOYA 4CZMA 4BRKA 2IIRA 3CETA 3UE5A 2YI1A 2BUPA 3KHYA 1HPMA 3L4IA 3WQUA 5KPZA 4CI6A 3MN7A 3W3DA 4IXCA 3A5NC 4JNEA 3BEXA 2AA4A 4BRHA 3AARA 4IWVA 3SLCA 1R59O 4O8KA 1ZXOA 2QWOA 1NGJA 1XC3A 1RFQA 4CBWA 4PL8A 2E1YA 4Z94A 4L3QA 3MCPA 3P4IA 4BC2A 3WXJA 1CZAN 2Q0UA 1TYQA 2VYPA 3BF3A 4BR7A 3L6QA 3C7NA 1RGIA 4JN4A 5AQJA 5I9EB 2A6AA 1U2VA 1JCFA 3JS6A 3H3OB 5KQ8A 4J8FA 2E20A 4RCHA 2D0OA 4H5VA 5AQYA 3SMSA 1GLEG 4ISFA 5AQWA 3F9MA 3H1QA 3C7NB 5BPNA 2GWKA 3LDNA 5BRFA 1NGFA 1JCEA 2NZTA 5AQRA 1GLLO 1LOTB 4EFHA 3I33A 5AQPA 4FPBA 4FWKA 1K8KA 3DXMA 4CZGA 4RTFD 3VENA 4FO0A 2AP1A 1X9JA 2KHOA 1MWMA 1YUWA 3FGUA 3CHWA 1U6ZA 4GNIA 4HTLA 4YDUC 4CBXA 5AR0A 2V7YA 1S22A 3KVGA 2Q31A 2IVOA 1QQNA 3DXMB 5AQVA 2E1ZA 2GEMA 3QDKA 2Q1NA 1HUXA 4QS9A 5EY4A 4AM6A 5KPRA 3GBTA 2H3GX 2E2PA 1HJOA 4MO4A 4IJNA 3FZFA 4H5RA 4QS8A 4B9QA 3U4LA 3EKUA 4K43A 3DXKA 3VOVA 4M7XA 2FSKA 2V51B 3HSCA 4CD1A 2GWJA 5AZJA 4WQ4A 4K42A 5AQMA 2BTFA 4BVPA 1ATRA 3ZEUB 5AQGA 4H0XB 4BVOA 4PL7A 3QFUA 3DXKB 5LJWA 2FLOA 1LCUA 3ATUA 3EKSA 3HI0A 4BRFA 1RDWX 3VEYA 4BG8A 3H1VX 2GELA 5TKYA 4NO7A 2YJEA 2P9NB 4B1XB 1DKGD 1BG3A 5AQOA 3D2EA 4IZ9A 2ASPA 4H0TB 3HTVA 4H03B 4B1VA 1BDGA 5AQTA 1J6ZA 2VWBA 4LC9B 3ULEA 3WEEA 2E2QA 3FZKA 2FSNA 1Y64A 4C23A 4CJ7A 4B1YB 3QBWA 5F1XA 2CH5A 3D2EB 2QM1A 4MLHA 4BQLA 5LJVA 1HKBA 5AQQA 3VEWA 2YJFA 4H0VB 3LDLA 5AQUA 1MWKA 3QICA 3VF4A 1BO5O 3ENHA 3BF1A 2HOEA 5F0XA 3LM9A 4QS7A 1HKGA 1T6CA 4RWTA 5BPLA 3HZ6A 4A62A 4JHDA 2V52B 2I7NA 3R9PA 4M63C 4CZKA 1DEJA 2P9SA 5LY3A 4JD2B 1SAZA 4BREA 1V4TA 1YVNA 4FWOA 4K25A 4PKHA 3TU5A 2OANA 3VF2A 3BUZB 1Z05A 2P9SB 1TUUA 4IO8A 3AAPA 4XH1A 1T44A 2QWPA 3FE1A 3IMXA 2I7PA 2YHXA 3FZHA 4FWPA 4XH5A 4EHTA 3O5BA 2YHWA 4BR5A 3C0BA 2Q2RA 3CJ9A 1TUYA 4H0OA 3LDQA 1NWKA 2Q0RA 2D1KA 3J8AA 2GTDA 1TYQB 4B1ZA 3ID8A 3VERA 4WYBA 3L0QA 1U2VB 4XEIA 2QWQA 2PBDA 1MA9B 4B1WB 5JMVA 1QQMA 2F9WA 3VESA 4BQZA 2E8AA 4BROA 3MDQA 2FSJA 1HLUA 2ZF5O 3SJHA 1SQKA 2A5XA 4YDUA 3LL3A 5F2RA 3O08A 3WQTA 5AQNA 5B8HA 4BR4A 5AQSA 3AAQA 2P9LA 4FOEA 1ATNA 4F9OA 1K8KB 3W0LA 3VGMA 3VF6A 4BRPA 4IJAA 1XQSC 3VEVA 1S3XA 2HMPA 3TPQA 3VETA 3ZX3A 1X3NA 2P9LB 3FZMA 4BR0A 2E2OA 1BUPA 3A8YA 3EZWA 3O6WA 2ZGYA 3UKUA 4WQ5A 3CJ1A 3QFPA 4BGBA 2FXUA 3VPZA 3UKRA 3O1WA 1C0GA 3M6GA 1NGIA 5BR9A 4ISGA 1KAYA 4CZFA 3CIPA 4BG9A 3WXIA 4XH4A 4EHUA 3R8EA 1KAZA 1NGHA 1NGAA 2HF4A 5AZJB 3KZBA 3ATVA 3WXKA 4HWIA 5EX5A 3SMPA 5AZIA 1ESVA 4A2BA 5BRHA 2YHYA 4FOIA 4BRNA 1MDUB 2QWMA 3IFRA 3A5MC 1NGDA 4I6MA 5AQLA 5BN8A 2P9KA 3U9ZA 1G99A 2QXLA 1YAGA 3UB5A 5JLHA 3D7EO 3VEOA 1WUAA 1Z6RA 3H46O 1IG8A 4PKGA 3M1FA 4H5WA 5FPDA 5AFUA 3MN9A 4BGAA 3VEZA 3G25A 3WEEB 3O1BA 2ITMA 3ULEB 4FWMA 3RSEA 2E88A 3DWLA 4BRCA 4CZJA 4FSVA 4A2AA 5KQDA 1T6DA 2E2NA 2IVNA 3JXUA 1GLJO 3U9DA 3U8XA 1JCGA 2P9PA 3CJCA 3RSEB 4KBOA 3IDHA 3B8AX 3DJCA 2ASOA 5FPNA 1QZ5A 2QW9A 4JHDB 1GLCG 2ASMA 2IVPA 3EN9A 4H5NA 2A3ZA 2VCPA 1QHAA 3ZX2A 4A61A 3DAWA 3ZX0A 3OHRA 3QMLA 4BR2A 4K41A 5FPMA 4O5FA 2YCHA 4JAXA 2GUPA 3SK3A 1C0FA 2WUSA 3CJAA 1BU6O 4CD3A 3HBTA 4H0PA 3QB0A 5EXWA 1YXQA 3A0IX 4CBUA 5CE3A 3BP8A 1NBWA 1NM1A 3GE1A 4FWLA 3H6EA 2Q97A 2A40A 4FWQA 4PKIA 2D0PA 4DHYA 4DQ8A 1KAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G4SN 4A59A 3LWLA 1J5OA 4LF8K 3HJFA 1ATSA 3C6AA 4CGJA 4IFEA 4BE1A 4B3SK 3BDPA 4GY2B 4DSJA 5AJ3K 1NOZA 4FPAA 4NB4A 2CGJA 4O5BA 4LFCK 1RBUA 3KKSA 3QINA 3KIOA 1E4FT 4CCHA 1KXPA 3AVLA 4FJGA 5E84A 4YORA 3SUPA 5BN9A 1QQCA 2QWLA 1C1AA 3GL1A 1E4GT 1F21A 3AGKA 3MEGA 4DFKA 4LF9K 3E9PA 1BOTO 4KHUA 4Y1CA 3MN5A 3RMCA 3HYFA 4NCAA 5J2PA 2GUIA 1BA1A 4BRAA 1WSGA 3TANA 4H4MA 2DPNA 3TAMA 3THWA 3RMDA 3CI5A 4KAZA 2E4LA 3UKUB 4M41A 2UUCK 2HVIA 5D3GA 5M1PA 4PHTX 2P9IB 2KFNA 4RW4A 3CERA 3VQ7A 5HRRA 3A5OC 3K5MA 1W2BM 3EL2A 1ZC6A 2P9UA 3S41A 4O0JA 3CQYA 1IJJA 4Z4HA 1RDCA 2QA4N 1C0UA 3DOLA 1TGOA 4DB3A 1GLAG 2OPRA 4BRIA 5AZIB 4B9LA 4FJ9A 4B3RK 2NRVA 1EO1A 3NHGA 4OGEA 5AQFA 3MN6A 5KPTA 2HMIA 3ZETA 3HRGA 1RDUA 4DU3A 4GV6A 3AO1A 4N56A 2XY5A 4DR2K 4DU4A 3SV4A 2YX6A 3R6MA 1D9DA 2O8BA 2Q3SA 1HX1A 3K2PA 1WB9A 3M8RA 4FWSA 5AFUH 3GDQA 5AQXA 3G0ZA 4IG3A 4EAHD 4GVEA 2YKMA 1QVGM 3SZ2A 2XY7A 5EOYA 4B3OA 3NMUA 5HP1A 2BUPA 2FBXA 3KHYA 1UA1A 3TTFA 4X65K 4IXCA 1LWEA 3EY1A 4B08A 4OKJA 3AARA 1VQMN 3ZT1A 3TSPA 2O8EB 1R59O 4CEDA 2KQ2A 2QWOA 5GIPA 1OH7A 1BCOA 3EE9A 3HT3A 1YVUA 1KQSM 3A2FA 3OBYA 4Z94A 3E9OA 4E7LA 3MCPA 1VSEA 4BC2A 3CC2N 1KRPA 4BR7A 3L6QA 2HHHK 2ZE2A 4KPYA 4A57A 1VAZA 1KSPA 1U2VA 1JCFA 3M8QA 4FK4A 3H3OB 5KQ8A 3NAEA 2IOCA 3OYFA 5AQYA 3F9MA 3H1QA 3THXA 3TAPA 5BRFA 2BGGA 2AJQA 2B5JA 3QETA 2DTUA 4JI6K 4EFHA 1D5AA 3I33A 4FPBA 2YHBA 2YNHA 1VSJA 1FW6A 2GV9A 4CJ5A 3TSQA 2BDPA 1X9JA 1BCMA 3L3UA 1DLOA 3KLGA 3F2KA 4FK0A 2Q31A 1RBRA 1QQNA 2HVHA 3I56N 3V1QA 2E1ZA 3SAFA 4JEPA 5M1FA 2X6SA 3GBTA 2Y1IA 2E2PA 1HJOA 4RG8A 4CEOA 2KKZA 1NMNA 1KTQA 4H5RA 1NK6A 1QSYA 4JKGA 3U4LA 1S72N 3C94A 3DXKA 4K43A 1KLNA 2D5RA 1U04A 3U6FA 3THWB 3HSCA 2GWJA 4K42A 2IS3A 2OCEA 3OW2M 1T7PA 1T03A 3CCEN 5AQGA 4BVOA 4FLUA 3QFUA 4CF9A 2XRIA 4CK3A 2D0BA 3EKSA 3ATUA 4BRFA 5HL7L 2IC3A 4BG8A 3H1VX 3D2EA 4IZ9A 2ASPA 3HTVA 1RT2A 3AVGA 3QEWA 3T7ZA 1EWQA 1HYZA 2FSNA 4CJ7A 4DR5K 3BZCA 3QBWA 1KVCA 4BWMA 4FVMA 2ZJPL 4MLHA 3MEDA 1XNQK 4I9QA 1TAUA 1N6QA 2PY5A 3LDLA 1NK4A 2YNFA 3V9SA 1MWKA 3VF4A 1L3TA 1JLCA 1Y97A 5BPLA 3HZ6A 4MDAA 1ZBLA 2YKNA 4CZKA 4M3TA 1WAFA 2DFHA 1VSFA 4MDBA 1V4TA 4JV5K 4FWOA 4BWJA 3LDSA 2O8CA 4PKHA 4IKFA 3P31A 1YHQN 3LAMA 4DTXA 1SL2A 4QOZB 1Z05A 1RT5A 1KD1O 4IO8A 3Q7BA 2NRZA 1T44A 1X1PA 1P90A 2QWPA 3FE1A 1CZ9A 4DQSA 2YHXA 4OLAA 4BR5A 2Q2RA 3CJ9A 3PUFA 4N47A 1IKYA 1GOAA 3EEQA 4H0OA 4YNQA 3HM9A 1C1BA 2Q0RA 3J81O 4E89A 4FLWA 2KZZA 4GV9A 1JLEA 4V19S 4DV3K 5J1EA 5DM6L 4C1NI 4CERA 2F8TA 1U2VB 3MWPA 2QWQA 2KTQA 1NK9A 4OLBA 2F9WA 4B9VA 1RBVA 4DTRA 4LY7A 1HLUA 2ZF5O 3V6DA 2OYQA 2A5XA 3LL3A 3O08A 3Q7CA 5AQSA 4CHYA 1U47A 3AAQA 4FOEA 4KFBA 3OS1A 3CG7A 2DFEA 4W5OA 1X9WA 1VSDA 1XQSC 4W5NA 3J7ZO 1S3XA 2UU9K 2JWKA 2P51A 3VETA 3ZT0A 5CY4A 1NJWA 4BR0A 2E2OA 4DTJA 1BUPA 1YITN 3O6WA 1IKVA 4JK9A 3J80O 3R1XA 3SQ2A 5H1SQ 1RT4A 5J2QA 3RRGA 3EE8A 3UKRA 4ICLA 2I5JA 4CJQA 3SQ4A 3ZSYA 4FZZA 4HCBA 4IFVA 3CIPA 3T19A 3WXIA 3VQ9A 4C8LA 1VRTA 3NF6A 3S3MA 2VG6A 3R8EA 2NRTA 3E66A 4DSFA 3TARA 3WXKA 4HWIA 1CXUA 4BRNA 1VSMA 4DSEA 3LP0A 5BN8A 2P9KA 1G99A 1Z6RA 1KVBA 3H46O 3M1FA 1JLQA 4JKDA 3ITHA 3G25A 2ITMA 4FWMA 1M1KO 4DFJA 1VQNN 4FSVA 4A2AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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