1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
1ZBHA 1ASVA 2GV9A 2XY5A 1Q8IA 1YT3A 4FLXA 5C24A 1G15A 2EHGA 1SL0A 1VSMA 1C0MA 4DF8A 4FXDA 5K14A 3HP9A 4FZZA 3G10A 3KJVA 3EZ5A 1A5VA 4E7JA 1BISA 3AVIA 4AHSA 4O0IA 4FJIA 2GBZA 1WSHA 2PYJA 4Z4FA 2A1SA 1UA1A 4CJLA 4KHYA 1W9HA 4FYDA 1UAXA 3SQ0A 4F3TA 2ETJA 2WOMA 1FK9A 1HQUA 2YNHA 2ZD1A 4IBNA 4OVLA 4AHRA 4R5PA 2XRIA 3NGIA 4FLYA 4DTPA 3MXMA 1KLNA 3M8PA 2OPRA 1HJRA 4B9UA 3OY9A 2IDOA 2QKKA 1BIZA 2BE2A 4FW2A 4E89A 2O4IA 4DLGA 1RNHA 2JLEA 3K59A 3EYZA 1RTHA 3QINA 1TV6A 4DS5A 1A5WA 4CHPA 4ZTFA 3G0ZA 3NH2A 1TVRA 1TGOA 4HHTA 4BDYA 3LALA 2PYLA 3VQ9A 1X9SA 2OPSA 4BACA 1QSLA 1KVBA 3O4NA 5CYQA 1C1BA 3VQ5A 1XC9A 4N76A 4BE1A 1TKXA 3KLIA 2XY8A 3OYNA 3CYMA 1JLFA 3MXIA 1EETA 1S1WA 3EY1A 1KLMA 3TARA 1JXBA 2NUBA 5KRSA 1J54A 2B5JA 5JS1A 3AVFA 4CF1A 3CG7A 1BCMA 1XHZA 3PY8A 2E6LA 1GOCA 1RT4A 4QAGA 3QEPA 1S1VA 2ZQBA 3VQ6A 4E1NA 4E7KA 3VQ8A 4AHVA 4BE0A 1RTJA 2BGGA 1T7PA 5D3GA 1BI4A 4ELUA 3ULDA 3TAQA 4CCHA 2G8IA 3DMJA 4FJGA 4Q5VA 4FJ9A 1FXXA 5SWMA 1LAWA 3HYFA 4CFDA 1SL1A 1T03A 3KLEA 5J2NA 5HRPA 3LWMA 3DRRA 1LWEA 4DQPA 4KRFA 1LAVA 3KK1A 1HPZA 3DLEA 3L2VA 5CY4A 4DMNA 4XIUA 3PX0A 4AHTA 4AHCA 2A1RA 4RW8A 3C6UA 1U48A 4E0DA 5CZ2A 1Z25A 4MFBA 4CGJA 3LP1A 4E19A 3KKSA 3HXMA 3NAEA 4NYNA 1NK8A 3LAKA 2HHUA 4TSXA 1N6QA 1KVCA 2IS3A 4M42A 3T1AA 3RMBA 1NKEA 4DWIA 4FLUA 4Z0UA 4N56A 3D45A 1RTDA 3KD5E 3F9KA 4J2BA 4LY7A 4KV8A 4CF9A 4FLWA 5C42A 1L3SA 1RT6A 3K58A 2KFZA 3SYZA 3NDKA 2VG6A 3QEVA 3SQ1A 2QXFA 1VSEA 4W5TA 3V9XA 3ZSQA 3LP3A 1RDDA 1S1TA 3NGZA 3HM9A 3QERA 1WAJA 4IFVA 2Z1HA 3CM6A 4KHWA 3ZT1A 1ZBIA 3L3UA 3RTVA 3B6PA 3ZSVA 4I2PA 4FJ8A 1NJWA 1RBUA 5KGXA 1LV5A 1FKOA 1QSYA 4NCGA 5JS2A 3BDPA 3AVNA 4CJRA 3MEDA 4CJPA 3OYMA 2G8UA 3IG1A 4LSLA 5E41A 4BE2A 2DFFA 1WAFA 1XWLA 1F21A 1U04A 2D0AA 3AA2A 4JLHA 4RG8A 3WNGA 4CK1A 4N5SA 3AV9A 4CGGA 4UQGA 2OZMA 2HHXA 3AVGA 4CEFA 3KLHA 1NJZA 4BDPA 3DYAA 4EZ6A 2HNZA 4I9LA 1QE1A 1RT1A 4M3TA 1T05A 4YNQA 1HYSA 4DSJA 3ZT0A 1JLAA 3VN5A 4RW7A 5C25A 5HRRA 4DTRA 4CHNA 1DTQA 1WNSA 3C94A 3PX6A 3RRGA 1I3AA 3V9SA 3RWUA 1ZYQA 1U49A 1RT5A 1RT2A 4HCBA 3NBPA 4G1QA 4NCAA 4KHQA 4M3WA 1TK0A 3I0SA 4KKOA 4CF2A 3MAQA 2VWJA 4DS4A 4DTMA 4EZ9A 3V4IA 1J5OA 3VQ4A 1YTAA 1LW0A 2XHBA 3NH1A 1B92A 3DRSA 3LDSA 2B4JA 2ATQA 3QEIA 1S5JA 3K57A 3HPGA 2HVIA 2E4LA 3O3FA 1XHXA 4JRQA 1DLOA 3KK3A 3ZT2A 1WSGA 4ID1A 4W5QA 3QETA 1NK4A 2DY4A 3LANA 3OYCA 4YFUA 1IH7A 2DFEA 2YNGA 3SQ4A 3M8QA 3TANA 3ALYA 3NFAA 3NE6A 1QS4A 3MEEA 3TAMA 1C6VA 4O5BA 3ZSXA 3SPYA 1QSSA 4FK2A 4FZYA 4DQIA 4KFBA 3OS2A 4DU1A 5HP1A 1VSDA 3HK2A 4FK0A 4LD0A 2X6SA 1K6YA 1RBRA 4NYFA 1BCOA 4FVMA 2P1JA 4DTXA 2G8VA 2OYQA 4Z4GA 1HNIA 4MQ3A 3OYLA 1SV5A 4FJ5A 4E7HA 3U6FA 1U47A 4HUFA 1ZBLA 1ZBFA 3V1OA 4OPKA 4CE9A 2F8SA 3NF7A 1BQNA 2D0BA 1RILA 3M8RA 4CJVA 3KTQA 2KQ2A 4N41A 3SNNA 1WSFA 3E01A 2P51A 1X9WA 3HVTA 4CIEA 1WSIA 4FM0A 4QOZB 1ASUA 4OLAA 3WNFA 1Z26A 1NK5A 2OZSA 1L3UA 2HMIA 3RRHA 5J1EA 4FJNA 1SL2A 1HNVA 1LW2A 4CFBA 3VQBA 2Y1IA 5FROA 3ZSZA 1BQMA 3NF8A 1TAQA 1ITGA 1U45A 4B9SA 4DSIA 2DFHA 3LWLA 2KTQA 1KCFA 4J2AA 4B9TA 3ZSWA 2QKBA 5HBMA 2KZZA 4ZTJA 3AA3A 1KVAA 4CJTA 3JYTA 4KREA 1S9EA 4DFPA 4CJWA 4FM1A 1HQEA 4DF4A 3HPHA 3VQQA 3AVMA 3U3YA 1GOAA 1O1WA 4FZXC 3VQDA 2D0CA 3WNHA 4CFCA 1C0UA 4C8OA 1JLBA 1RBTA 2YHBA 4OKEA 3U3GA 4PA1A 4KHSA 3VQPA 3LP2A 4RW4A 1L5UA 3C6TA 4DTUA 4KB1A 3DOKA 4CJFA 1N5YA 4FJMA 1LWFA 1J9AA 1Y97A 1Q9YA 1KFDA 3ZSYA 4CGDA 2G8KA 3CFPA 4GVMA 3SUQA 1EX4A 3DLKA 4AH9A 3RMCA 2RKIA 4Z4CA 1IG9A 1NOYA 4IKFA 3HPOA 1VSFA 3PO4A 3S3MA 4KHNA 2FBTA 1QHTA 4CK3A 1CZ9A 3VQEA 1KTQA 3TI0A 3OYFA 4EP5A 4DSEA 2HW3A 3DLHA 3V1QA 1NJXA 4I7FA 3HT3A 5HROA 4KHUA 4M3XA 4B9MA 2PZSA 3QO9A 4PUOA 1TKZA 4FJLA 4KTWA 2IC3A 2D5RA 3OYKA 1S9GA 4FM2A 4OKJA 3HVRA 1BGXT 4J2EA 1X9MA 4FJJA 4DFJA 5KTQA 2Z1JA 3DRPA 5FDLA 3HP6A 1CLQA 2BDPA 5T7BA 3ZT4A 2IGIA 1BIUA 5KI6A 4FCYA 1B9DA 4I9QA 1BL3A 4RW9A 3OYJA 4C8LA 1RDCA 1YTUA 1L3VA 2RF2A 3KLFA 3OYAA 1EXQA 4CFAA 3V9ZA 1Q9XA 3OJUA 1HYZA 1VSJA 1LWCA 1ZBUA 4WE1A 1HRHA 3SJJA 1WLJA 3RMDA 2EX3A 4OJRA 4BWMA 3OYEA 4FJ7A 1UWBA 4O55A 1RTIA 3V1RA 4JS5A 3O3HA 3IAYA 4DTOA 3AO4A 2YKNA 2XY6A 4B3OA 1RCHA 2OA8A 3JSMA 4CJEA 4HVJA 4KO0A 4GW6A 4N47A 2ZE2A 3TAFA 1VSHA 3PUFA 3TAPA 3S3OA 2JGUA 3LAMA 3B6OA 3DOLA 4C8NA 2F96A 5HLFA 3VA0A 3ZSOA 3UIQA 2LSNA 5HRSA 4J2DA 4O4GA 1NOZA 2OPPA 1JLQA 4H4OA 2P5GA 3CQ8A 4DQQA 1TKDA 4IFYA 3SUOA 1L3TA 4CERA 2ITGA 4CIGA 2VWKA 4DG1A 1JL1A 3AO5A 4DQRA 5I42A 4DSKA 2O4GA 3SZ2A 1SKRA 4JS4A 1SKSA 1B9FA 4Z4EA 3CFRA 3VQAA 4CJSA 5EU7A 1ASWA 1YVUA 5SZTA 2G8WA 2E6MA 1TAUA 1HYVA 1D8YA 3K5NA 1KRPA 4KTQA 4PQUA 4FJXA 5FRNA 4OLBA 5FRMA 4W5NA 3K2PA 3CFOA 4IDKA 4CHQA 1C1CA 2FBYA 4Q0BA 1RDAA 3OS1A 1A5XA 4EP4A 3L2WA 1CZBA 2YHAA 3SCXA 3CM5A 3V6DA 1D9DA 2G8HA 2DTUA 3HL8A 4FJKA 2YKMA 4RW6A 4CGHA 3OYBA 1DTTA 3IRXA 4Y1CA 2KW4A 4CHOA 4ELVA 3KK2A 3TAEA 5I3UA 4GMJB 4M3YA 2XO7A 2F8TA 3RMAA 2HHVA 3NF6A 4CGIA 4FLVA 3KIOA 4IG0A 4ICLA 1JKHA 4JRPA 4KI6A 1S6QA 5KRTA 3ZT3A 1RBSA 2I5JA 3P5JA 4W5RA 2FBVA 3L2RA 1VK0A 3WNEA 1NKCA 2HHQA 3AVKA 4Y1DA 4FLTA 3FFIA 4AHUA 1RDBA 4B08A 4CGFA 3L8BA 3DI6A 4CJKA 3QESA 1NK6A 3HSTB 4O44A 3I8DA 1IKVA 3QNOA 3NCIA 3QIPA 4HCCA 4B9LA 3O3GA 3T19A 4CF0A 4M3ZA 1VSIA 1TK5A 4CIFA 1IKWA 3ZSRA 3BGRA 4CJUA 1T8EA 4K8ZA 3DLRA 1WSJA 1TL1A 1SUQA 4NCBA 1JL2A 3I0RA 1I39A 2HNDA 2X74A 3DLGA 2KZMA 1VRUA 1FKPA 2YV0X 4CJ3A 1NK0A 1BI4B 3KKRA 3VQCA 3HO1A 2HB5A 3TR8A 4IG3A 3AVBA 3P83D 3VA3A 4QCLA 1X1PA 3OYGA 4HUGA 1NK7A 2IAJA 3AO2A 4DTSA 4KTZA 4B8AB 3AVCA 3K5OA 4HTUA 1SKWA 3KD1E 4LH5A 3OS0A 1BHLA 4OGEA 3V81A 4F2RA 3SPZA 1D9FA 3PO5A 2W42A 3M8SA 4F8RA 3PV8A 4ID5A 2X78A 1IKXA 1C1AA 1RBVA 3AO1A 1U4BA 2GUIA 1C0TA 4CHYA 3K5LA 4DLEA 3LPUA 1EP4A 2R7YA 3SV3A 4E3SA 2WONA 1CXQA 2YNFA 3MECA 2X6NA 3PX4A 4C8MA 2PY5A 4CESA 4W5OA 2YNIA 1NKBA 4HUEA 3SUNA 5CYMA 4E1MA 3NH0A 3RR8A 1HMVA 4DTNA 4FJHA 3C95A 2OPQA 3QIOA 4L8RB 2RPIA 1TK8A 1JLGA 4DU4A 4KB0A 3QNNA 4CEZA 3AA5X 4CEBA 1W0HA 4FLZA 3KLGA 2HHTA 4F4KA 4B9NA 1MU2A 1UOCA 3A2FA 2G8FA 4CK2A 1REVA 1RT7A 1RT3A 3AVJA 4C8KA 5KGWA 4CEOA 3AO3A 4BDZA 4CEAA 1VSKA 2B6AA 2Z1IA 3NGYA 3SV4A 3T3FA 2Y1JA 3OVNA 3TAGA 1S1UA 1QQCA 3D0PA 4DFMA 1R0AA 2KFNA 4CEEA 4DU3A 3QEXA 4OPJA 1CXUA 4O0JA 3LP0A 3IS9A 4CJ4A 3V9WA 2FBXA 4B8CA 3OYDA 3ZCMA 4CECA 3LZJA 4M3UA 3L3VA 1S1XA 3SI6A 4DQSA 2HHWA 4KI4A 1JLEA 5J2MA 1VSLA 1JXEA 1NK9A 3V9UA 4DSFA 3ASMA 3H08A 1TL3A 4AILC 3MXJA 1NJYA 4ELTA 3QEWA 4DSLA 3TWHA 3S9HA 3NF9A 4OKKA 1GOBA 3SQ2A 4F3OA 1EKEA 2Q3SA 4E7LA 1S6PA 5J2QA 5DMRA 4H8KA 3LPTA 1JLCA 2RN2A 4M41A 3K5MA 4PY5A 1KFSA 2P5OA 1D5AA 3NHGA 3ITHA 3OJSA 4CJQA 1IO2A 3DM2A 2VG7A 3P1GA 4H4MA 1WSEA 4M3RA 3AVHA 4OGCA 2HHSA 5J2PA 2Z1GA 2XY7A 5CZ1A 4CF8A 3OYHA 3LZIA 1WN7A 3HJFA 4M45A 3AVAA 4LSNA 3L2UA 2HVHA 2HNYA 1J53A 3VQ7A 4PWDA 3ISNC 4CHZA 4ZHRA 3DLBA 4KAZA 1UA0A 4FW1A 3TABA 3THVA 4LH4A 4BWJA 4KPYA 1QTMA 3AVLA 4Z4IA 2IOCA 3AA4A 2QK9A 2BANA 3RR7A 5DK5A 5HRNA 3MEGA 1TKTA 3OYIA 3L2QA 4K8XA 4F2SA 1IKYA 1VRTA 1KSPA 4I2QA 1XI1A 2FC0A 4DTJA 4B9VA 4Z4HA 3S3NA 4CJ5A 4E7IA 3QLHA 2VG5A 4CEDA 4CEQA 3O4QA 3F73A 3SUPA 4DFKA 4FK4A 2AJQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PAVA 4GY2B 2GV9A 1YT3A 5FPEA 3H46O 5C24A 1VSMA 4DR7K 3HP9A 4AHSA 1YITN 2GBZA 5HOOA 1WSHA 2A1SA 2P9UA 3K0SA 4KHYA 2A40A 1MWMA 2KKZA 2WOMA 1YIJN 1HQUA 2ZD1A 2YNHA 4DV7K 4FLYA 4DTPA 3CMEN 3NGIA 1KLNA 2OPRA 4DCHA 3MDQA 3VTIA 1BUPA 4FW2A 4BR7A 2O4IA 3K59A 2JLEA 4K42A 1RTHA 1OKJA 3CCSN 3G0ZA 4XH4A 1TGOA 4HHTA 1X9SA 2OPSA 3O9UA 3THXB 1C1BA 4N76A 2NRHA 5ADXH 3CYMA 3EY1A 4BGAA 5KRSA 3RSEA 1HJOA 3AVFA 4MLHA 3CG7A 2GEMA 3PY8A 3VQ6A 1NJIO 4E7KA 4AHVA 5D3GA 2ZF5O 3O9SA 3TAQA 3DMJA 4Q5VA 1FXXA 4DHYA 2V51B 3D2FB 4CFDA 1LWEA 4IJAA 4DQPA 2QA4N 3DLEA 4DMNA 2WFBA 3PX0A 4RW8A 4E0DA 1IV0A 1Z25A 1T6CA 4E19A 4ISEA 4TSXA 3A5LC 1N6QA 1DGKN 4BQLA 1NM1A 4F9OA 3RMBA 4DWIA 4DV6K 4FLUA 4Z0UA 2Q36A 5AJ3K 2CH6A 4CF9A 2GELA 1L3SA 3CC7N 2UXCK 1G99A 3CCRN 2KFZA 2P9KB 3LDPA 3NDKA 3QEVA 4BG8A 3FZFA 5AQNA 5CHIA 3NGZA 3HM9A 3QERA 4IFVA 1ZBIA 3FFKB 1E4FT 1X9JA 1RBUA 1NJWA 4FWRA 3Q7BA 1QSYA 1XMQK 4BG9A 3H1QA 2G8UA 4CJRA 3IG1A 5JMVA 5E41A 4BR9A 4BE2A 1W7AA 1N34K 1W97L 2D0AA 1X3MA 4N5SA 4H0VB 5AQRA 4BDPA 1XC3A 4PL7A 1RT1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4E7L A;  1S6P A;  5J2Q A;  5DMR A;  4H8K A;  3LPT A;  1JLC A;  2RN2 A;  4M41 A;  3K5M A;  4PY5 A;  1KFS A;  2P5O A;  1D5A A;  3NHG A;  3ITH A;  3OJS A;  4CJQ A;  1IO2 A;  3DM2 A;  2VG7 A;  3P1G A;  4H4M A;  1WSE A;  4M3R A;  3AVH A;  4OGC A;  2HHS A;  5J2P A;  2Z1G A;  2XY7 A;  5CZ1 A;  4CF8 A;  3OYH A;  3LZI A;  1WN7 A;  3HJF A;  4M45 A;  3AVA A;  4LSN A;  3L2U A;  2HVH A;  2HNY A;  1J53 A;  3VQ7 A;  4PWD A;  3ISN C;  4CHZ A;  4ZHR A;  3DLB A;  4KAZ A;  1UA0 A;  4FW1 A;  3TAB A;  3THV A;  4LH4 A;  4BWJ A;  4KPY A;  1QTM A;  3AVL A;  4Z4I A;  2IOC A;  3AA4 A;  2QK9 A;  2BAN A;  3RR7 A;  5DK5 A;  5HRN A;  3MEG A;  1TKT A;  3OYI A;  3L2Q A;  4K8X A;  4F2S A;  1IKY A;  1VRT A;  1KSP A;  4I2Q A;  1XI1 A;  2FC0 A;  4DTJ A;  4B9V A;  4Z4H A;  3S3N A;  4CJ5 A;  4E7I A;  3QLH A;  2VG5 A;  4CED A;  4CEQ A;  3O4Q A;  3F73 A;  3SUP A;  4DFK A;  4FK4 A;  2AJQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2PAV A;  4GY2 B;  2GV9 A;  1YT3 A;  5FPE A;  3H46 O;  5C24 A;  1VSM A;  4DR7 K;  3HP9 A;  4AHS A;  1YIT N;  2GBZ A;  5HOO A;  1WSH A;  2A1S A;  2P9U A;  3K0S A;  4KHY A;  2A40 A;  1MWM A;  2KKZ A;  2WOM A;  1YIJ N;  1HQU A;  2ZD1 A;  2YNH A;  4DV7 K;  4FLY A;  4DTP A;  3CME N;  3NGI A;  1KLN A;  2OPR A;  4DCH A;  3MDQ A;  3VTI A;  1BUP A;  4FW2 A;  4BR7 A;  2O4I A;  3K59 A;  2JLE A;  4K42 A;  1RTH A;  1OKJ A;  3CCS N;  3G0Z A;  4XH4 A;  1TGO A;  4HHT A;  1X9S A;  2OPS A;  3O9U A;  3THX B;  1C1B A;  4N76 A;  2NRH A;  5ADX H;  3CYM A;  3EY1 A;  4BGA A;  5KRS A;  3RSE A;  1HJO A;  3AVF A;  4MLH A;  3CG7 A;  2GEM A;  3PY8 A;  3VQ6 A;  1NJI O;  4E7K A;  4AHV A;  5D3G A;  2ZF5 O;  3O9S A;  3TAQ A;  3DMJ A;  4Q5V A;  1FXX A;  4DHY A;  2V51 B;  3D2F B;  4CFD A;  1LWE A;  4IJA A;  4DQP A;  2QA4 N;  3DLE A;  4DMN A;  2WFB A;  3PX0 A;  4RW8 A;  4E0D A;  1IV0 A;  1Z25 A;  1T6C A;  4E19 A;  4ISE A;  4TSX A;  3A5L C;  1N6Q A;  1DGK N;  4BQL A;  1NM1 A;  4F9O A;  3RMB A;  4DWI A;  4DV6 K;  4FLU A;  4Z0U A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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