1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
4DQQA 2VG5A 3HP9A 3KIOA 5C25A 3RR8A 4E1MA 1IKWA 4MQ3A 3QINA 1W0HA 1ITGA 4B3OA 3VQ9A 1O1WA 2Z1HA 4KO0A 5HRPA 4FLVA 1NK4A 2RKIA 2HHVA 4C8MA 4BDYA 3DLRA 4L8RB 1RDCA 1ZBUA 2JLEA 4Z4EA 3AVAA 4E89A 4B9VA 1BQNA 3UIQA 3SUPA 4KB1A 4E7JA 3OYKA 3M8RA 1JXBA 2DFHA 3O4QA 1VSFA 3VQ6A 2OPPA 3WNFA 4E3SA 3I0RA 1WLJA 1L3TA 2E6MA 4LH4A 4ELUA 3K5OA 1I3AA 1T8EA 1MU2A 2X6SA 4KHNA 4KI6A 4M3TA 4CF0A 1U04A 1C1CA 1RDDA 4O5BA 3CFRA 4W5RA 3CFOA 1JLAA 1HYZA 4FK2A 4CEOA 2HVIA 3HVRA 4LSLA 3L2QA 1RT6A 4LY7A 1RDBA 4FLXA 3NH0A 1ZBFA 4KAZA 1TKDA 3IRXA 5JS1A 1I39A 4FJ7A 2HHTA 3NF8A 3V1QA 2HNZA 3F73A 4DSEA 4CJSA 1GOBA 4CE9A 4CHPA 5HRSA 1JLGA 4B9TA 1TL1A 1J53A 1REVA 4EP4A 3OYCA 3LWMA 1KVCA 1LWEA 3VQDA 3OYEA 4AILC 1VSIA 1VRUA 3OYBA 2OZMA 2QXFA 1TKZA 4DQPA 3OYGA 1IH7A 2ZE2A 3NFAA 3PV8A 2HHUA 1EX4A 1VK0A 4Z4FA 4FJIA 1RT5A 3PX4A 2HW3A 4DTUA 2DY4A 4CK1A 1TV6A 4M3ZA 1S1WA 3LDSA 3OYMA 4J2EA 1S9GA 4PY5A 1JKHA 4J2DA 1EP4A 4E7KA 4HUGA 4JS5A 4I9QA 2Z1JA 3ZT1A 1D9FA 4DF8A 3QETA 4IKFA 2A1SA 3VQAA 3V81A 3SNNA 3NGZA 1JLBA 3SUOA 3QEXA 5FRMA 4HCCA 1ZBLA 4KI4A 3AO3A 3I8DA 4Y1CA 4FVMA 4HUEA 2O4GA 1T05A 2ITGA 3RRHA 3QESA 2XRIA 3P1GA 1UOCA 4IFVA 5HRNA 3OYNA 4DTMA 3OS2A 1WAJA 3OVNA 3KK2A 3SCXA 3P83D 2EHGA 2KZZA 1JXEA 3A2FA 3B6OA 4OKJA 2Z1GA 4ZTFA 4DTOA 3SI6A 2HHXA 1NOYA 4F2SA 1Q9XA 5FDLA 1RTHA 2P5OA 1D5AA 3L2UA 1TK0A 3T1AA 5JS2A 4DQSA 3VQEA 3VA0A 4OKEA 1HJRA 4FLUA 4ELVA 4DSKA 1U49A 1FK9A 3TWHA 4CK2A 3ZSWA 1VSHA 1RTDA 3MECA 4O0JA 4FJ9A 1DTQA 1BL3A 2OPRA 3AV9A 3AA4A 2WOMA 1KLMA 4CHNA 2ZQBA 3OYJA 3QNNA 4FJHA 3KLEA 2HB5A 4DFMA 4DSJA 4M3WA 4AHTA 1NK0A 2YNHA 3AVIA 4FW1A 1EXQA 4I9LA 4YFUA 3LPTA 1C0TA 2LSNA 2XO7A 4BDZA 1R0AA 3V1RA 2X74A 2HHQA 2IOCA 3EY1A 2XY5A 4JRQA 4M42A 4N41A 5HROA 2IS3A 3OYHA 4DSFA 3TANA 4FK0A 1NJZA 1J9AA 3VQ8A 4JLHA 1FKPA 1L5UA 3WNHA 5C42A 4DFKA 4DU3A 1XI1A 3LALA 1F21A 3U3GA 1KRPA 1RBRA 3DLEA 1DTTA 2XY7A 4CCHA 4RW9A 4FJKA 4CJTA 3TAGA 1RBUA 4CF2A 3K5NA 3SJJA 3ZT3A 3RTVA 4FJJA 1IKVA 4F3TA 3LWLA 2KTQA 2YNGA 4WE1A 4MFBA 5E41A 3ZSZA 5J2PA 4FM2A 4CEBA 1LAVA 3KLGA 1XC9A 1G15A 2X6NA 4AHVA 1L3UA 2DTUA 1U45A 4AHRA 1X9SA 1X9MA 4FJXA 1TKTA 3L2VA 3M8SA 1WSJA 4W5QA 4DS5A 4FK4A 3TABA 1QS4A 4N56A 1SL2A 2KFNA 1HMVA 2G8FA 3BGRA 2G8UA 2F8SA 5HP1A 3EYZA 3MXIA 1RCHA 4CEEA 3T3FA 4M3XA 1C1BA 3S3OA 3KD1E 4KV8A 3EZ5A 4DLGA 3TI0A 4KFBA 4OKKA 5J2QA 4R5PA 5HLFA 2FBVA 4FM0A 4FZXC 1T7PA 4DG1A 3L8BA 3CM5A 3MAQA 1BCOA 3CYMA 3MXMA 3VQ7A 3S3MA 2ETJA 4IG3A 3NHGA 4B9SA 4M3RA 4DF4A 3DMJA 4CJRA 2XHBA 3VQPA 3C95A 3FFIA 3HM9A 3ZT2A 4CJ5A 4CJQA 3V4IA 3OYAA 3V9UA 1ZYQA 4DTNA 4B8CA 1A5XA 4ZTJA 4E19A 4Z0UA 4N5SA 3G10A 3HYFA 1KVAA 1S1UA 1SUQA 3LZJA 3SV3A 1EETA 1L3VA 4CF8A 2O4IA 1QE1A 1WSGA 2RF2A 4G1QA 1JLFA 3SQ1A 4B9NA 2PYJA 4CJ3A 1KFDA 4XIUA 1LW2A 4CJKA 5FROA 1YTUA 3MEGA 5J2MA 3KK3A 4CF1A 3PX6A 1ZBHA 3D0PA 3G0ZA 3QEPA 1SL0A 3MEDA 2R7YA 3E01A 4CJWA 3VN5A 1TAUA 4HTUA 2QKBA 4DQIA 2DFEA 3SZ2A 4FJMA 2YKNA 4OLBA 2I5JA 3L3VA 3IS9A 1Z26A 4JRPA 5KGXA 4CJEA 4W5NA 3TAEA 2XY6A 3ZSXA 2JGUA 2YHBA 3IAYA 1Y97A 1NJWA 5C24A 3AVJA 3HPHA 4CFDA 1IKYA 4C8LA 1NK6A 2PYLA 4BACA 3NF6A 1BCMA 3AVLA 1WSHA 3HP6A 2BE2A 3VQ4A 1C6VA 1S6PA 1RTIA 3ZSVA 4CFAA 4Z4GA 4Y1DA 4CHZA 4CECA 3PUFA 3TR8A 2PY5A 4I7FA 5CYMA 1WSEA 1BI4B 2IAJA 4NYNA 5CZ1A 2OPSA 4CHQA 3KLIA 4F2RA 4DS4A 4DWIA 1NK5A 3DLBA 1LV5A 4CERA 3OS1A 3L2RA 4M45A 3K57A 3K5LA 4HCBA 3AO5A 1HRHA 4GVMA 3U3YA 3DLGA 4H4OA 4TSXA 5T7BA 4CHOA 3RMCA 4EZ9A 3KKRA 4RW6A 2WONA 3VA3A 2ATQA 5I3UA 3RMDA 1GOCA 4J2BA 4CJUA 3K58A 1GOAA 4DU1A 2G8WA 4DQRA 4FLWA 2AJQA 3LPUA 1W9HA 4AHSA 4KHSA 4NYFA 1S1TA 2D0BA 4Z4HA 1UA0A 1X9WA 1JLCA 1RT7A 4KHWA 1KVBA 1YTAA 4B08A 3AA2A 3LP1A 4CEZA 1NJXA 1CXQA 3AVHA 3K5MA 4PQUA 4IFYA 4FZZA 4RW4A 3KD5E 1ZBIA 4F4KA 4B9UA 4C8KA 4AHCA 4CFBA 3SUQA 4KHQA 2FBTA 1RT2A 4EZ6A 4KHUA 4DFPA 3DRPA 2Y1JA 1NK9A 2HNDA 4QCLA 3NBPA 4PWDA 5DMRA 2X78A 5KI6A 3AVCA 2F8TA 4FLYA 3DLHA 4AH9A 4I2QA 4EP5A 3SQ2A 1NOZA 4IBNA 1B9FA 3CQ8A 5KGWA 4CGFA 1X1PA 2KFZA 2HNYA 2VWKA 3DOLA 4CEFA 3HPOA 3V9XA 3KJVA 1TL3A 3AVMA 4FLZA 5KTQA 2G8VA 5FRNA 1LAWA 2ZD1A 1S5JA 1RT4A 3C6UA 1D9DA 3RWUA 3DOKA 1BHLA 4OJRA 2DFFA 3NDKA 3AVNA 1S9EA 5CYQA 4KTZA 2A1RA 3AO2A 1T03A 1LW0A 4CIFA 3P5JA 4OPJA 4DLEA 1WAFA 3QEVA 4BE2A 4E7IA 4FJ8A 2YV0X 3ZSRA 1U47A 3IG1A 1QQCA 3PO5A 3SQ4A 3QO9A 1VSKA 1JL1A 3DLKA 5DK5A 1RILA 4BE1A 4QAGA 1IO2A 1S6QA 4W5OA 3NH2A 3QEWA 4OGEA 3DM2A 3ZT4A 3WNGA 4K8XA 3I0SA 2GV9A 1TKXA 3V6DA 4CGHA 4HVJA 1KFSA 1UWBA 4GMJB 4OLAA 3VQCA 4H8KA 3CFPA 4CJLA 1BIUA 3BDPA 4NCGA 4ID1A 3VQQA 4N76A 4NCAA 1TGOA 3NGIA 4CHYA 3ULDA 2W42A 2FBXA 4GW6A 4FJGA 1A5VA 3NF9A 4DTJA 3AVBA 3MXJA 1VSMA 1SKWA 2YNIA 2VG7A 3U6FA 3KLHA 3RMAA 1B9DA 1RDAA 2E4LA 2P5GA 4CESA 4FW2A 2YNFA 3H08A 3JSMA 1KTQA 1HNIA 5SZTA 3NCIA 2Z1IA 4AHUA 3HXMA 2PZSA 1UA1A 4FJNA 2EX3A 4ID5A 1QTMA 4DSLA 1RT3A 2KQ2A 3OS0A 4CJPA 4CF9A 2NUBA 3C6TA 4KTWA 4RW8A 4ICLA 1SKRA 4CEAA 2E6LA 4YNQA 3JYTA 4FLTA 1XHZA 1N6QA 5HRRA 1NJYA 1XHXA 3AA5X 5CZ2A 3KKSA 3QEIA 3HO1A 3OYFA 3B6PA 2FBYA 3TAQA 1JLQA 1RBVA 1TVRA 4LSNA 1NK8A 4LD0A 4O0IA 3ASMA 3LP2A 4FCYA 2QKKA 4JS4A 1TK8A 3WNEA 3DI6A 1CXUA 3ZSOA 2OA8A 2HHSA 1NK7A 3NAEA 4CGIA 3OY9A 3QLHA 1L3SA 4KRFA 1S1VA 3CG7A 4DU4A 4M41A 5SWMA 2D5RA 1NKCA 3RRGA 2OYQA 3D45A 5I42A 2P51A 3AO1A 1ASUA 4Z4CA 3SPZA 4FYDA 4DFJA 3LAKA 1IKXA 4ZHRA 2G8HA 2HMIA 2B6AA 3VQBA 1FXXA 1B92A 4FZYA 3L3UA 5K14A 4B9MA 1YVUA 4BE0A 1WNSA 2RPIA 4UQGA 1U4BA 1J5OA 2G8KA 3KTQA 3HL8A 2P1JA 3T19A 3DRSA 1QSYA 1VSDA 1CLQA 5J2NA 4OPKA 4W5TA 1LWFA 1RBTA 4CIGA 4KB0A 4PUOA 3OJSA 4E1NA 4O4GA 4FJLA 3ZSQA 4CGDA 1ASVA 1VRTA 2B4JA 2D0CA 2Q3SA 3AVFA 2VWJA 4B9LA 4F3OA 1NKEA 3O3GA 1WSIA 4Q5VA 1CZ9A 1HNVA 1YT3A 4OVLA 3V1OA 3NGYA 3V9ZA 5J1EA 1C0MA 4IG0A 3O3FA 1Z25A 3SUNA 3HSTB 3M8PA 3QIPA 3OYDA 4HUFA 1QSSA 2GBZA 5KRSA 1QSLA 3MEEA 1VSLA 4KPYA 3KLFA 4PA1A 2BANA 5KRTA 3SV4A 3O4NA 3ZT0A 1BQMA 1Q8IA 2IGIA 2YKMA 1XWLA 3KK1A 4E7LA 1BISA 1HYVA 1BGXT 3PO4A 3OYLA 3RMBA 1BIZA 1ASWA 4C8NA 1TAQA 4CFCA 2HHWA 4CGJA 4Z4IA 1JLEA 4H4MA 3HVTA 2IDOA 4CJ4A 5D3GA 3LAMA 3SPYA 4DTSA 2BDPA 3F9KA 1KCFA 4CJVA 2KW4A 3V9SA 1VSJA 1SV5A 3V9WA 1HQEA 3O3HA 3C94A 1VSEA 2Y1IA 4RG8A 3L2WA 1NKBA 3PY8A 1A5WA 3QIOA 4FJ5A 4M3YA 4I2PA 1QHTA 3K2PA 1SL1A 4J2AA 1JL2A 3LZIA 2BGGA 4Q0BA 3VQ5A 4HHTA 1HPZA 3NH1A 4CK3A 3OJUA 3CM6A 3DRRA 4IDKA 4NCBA 3AVKA 3DYAA 2QK9A 3LP0A 4RW7A 2IC3A 1D8YA 3NF7A 2G8IA 5CY4A 3ISNC 1N5YA 4DTPA 2KZMA 1EKEA 4F8RA 4C8OA 4QOZB 3ZSYA 4DMNA 4DSIA 4CGGA 3OYIA 3K59A 3LP3A 1U48A 4KHYA 3HK2A 1WSFA 4K8ZA 2OZSA 1RBSA 3THVA 3AA3A 3ALYA 1S1XA 4FM1A 3S3NA 2OPQA 1LWCA 4CEDA 3QNOA 2RN2A 2F96A 3TAFA 4CIEA 3NE6A 1HYSA 1KLNA 4O44A 2D0AA 4FXDA 2GUIA 1UAXA 4LH5A 5HBMA 3HT3A 4E0DA 1HQUA 2XY8A 1C1AA 2HVHA 1FKOA 4B8AB 4KTQA 3ZCMA 4BDPA 4DTXA 1RTJA 3LANA 3PX0A 3SQ0A 4M3UA 1RT1A 2VG6A 1DLOA 3M8QA 4O55A 1BI4A 5EU7A 3HPGA 3AO4A 4CEQA 3S9HA 1K6YA 3TAMA 1WN7A 3QERA 1Q9YA 3TARA 3ITHA 1J54A 4E7HA 4ELTA 4BWMA 4KREA 1C0UA 2B5JA 2FC0A 1RNHA 3AVGA 1CZBA 3SYZA 1SKSA 4OGCA 4BWJA 4DTRA 4N47A 1IG9A 4KKOA 1KSPA 3HJFA 1TK5A 3RR7A 2YHAA 4CJFA 3TAPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HF4A 3KIOA 3RR8A 1IKWA 4H5VA 1NK4A 4KO0A 1X9JA 1OH8A 2UU9K 4B3MK 4L8RB 2VCPA 4E89A 3J7AP 4KB1A 3SUPA 1SZ2A 2DFHA 3O4QA 1VSFA 3VQ6A 5H1SQ 2E6MA 5C2FA 3THWB 1T8EA 2X6SA 4M3TA 2EWSA 2I7PA 3T1YK 3H6EA 4CEOA 3OBWA 1RT6A 4K0KK 4QS9A 4LY7A 1RDBA 5F1XA 1RDUA 4BR2A 4KAZA 1I39A 3V1QA 4CJSA 4EHUA 1P90A 5HRSA 3LWMA 5ADXH 3MMVA 3BZCA 3OYEA 4AILC 4JV5K 1VRUA 2QXFA 2V7ZA 3D7EO 4DQPA 3OYGA 1VK0A 4BRMA 4FJIA 1TUYA 1WBBA 1VQ6N 4CK1A 1TV6A 4RCHA 1S1WA 4J2EA 2IVPA 3HZ6A 3ENOA 3M5RA 3GE1A 4CBXA 4J2DA 4HUGA 1QVGM 1ZXOA 4BRQA 4JS5A 4I9QA 2Z1JA 3ZT1A 4X65K 3SNNA 3FGUA 1JLBA 4HCCA 1ZBLA 3NVMA 2O4GA 4ILGB 3P1GA 1TYQB 1SS6A 3SAGA 3OS2A 3KK2A 3P83D 3FZMA 3SLCA 3E66A 5CHIA 2BUPA 2P5OA 1VQPN 4JI0K 5JS2A 3VQEA 2QM1A 1QVFM 1FK9A 2P9UA 1NNEA 4NLCA 3ZSWA 2ASPA 3AA4A 4CHNA 4DSJA 4AHTA 1VQLN 5AQWA 3AVIA 4YFUA 4FSVA 4CW7B 2LSNA 4BDZA 4M42A 3OYHA 3TANA 4FK0A 4FWKA 1J9AA 1S22A 4K43A 4GKJK 1FKPA 2WUSA 4A2AA 3LALA 5GAEP 1QZ6A 3WEEB 5EY4A 4FJKA 2KHOA 1RBUA 3K5NA 3TAGA 3LWLA 4FWNA 3VGKA 4I6MB 5JVHL 3ZSZA 1XC9A 5KQDA 3KLGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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