1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
3ALYA 3U3GA 3OYDA 3KJVA 2HVHA 3SV4A 3ZT0A 5CYQA 1RT6A 3NH1A 1KLMA 1BIUA 1VK0A 1JL1A 3KK3A 3IAYA 4M42A 1X9SA 1JXEA 2OPPA 1NJZA 1S6QA 1J9AA 2ETJA 3ZT1A 3QEIA 3NHGA 3HP9A 2IGIA 1JLGA 1RBTA 2ATQA 4JRPA 2X78A 4Z0UA 3OYFA 2HB5A 3SCXA 4BDPA 5JS1A 4DTXA 2IC3A 3CFOA 4CFBA 3HPGA 3AO5A 3HPHA 3VQQA 1ZBLA 1X9MA 2G8KA 4N41A 4E19A 3NH0A 3M8SA 1VSFA 3AVJA 3BDPA 1HNVA 4OKEA 3U3YA 3K57A 4XIUA 3DLEA 3ZT3A 3VQ9A 4CGGA 2GUIA 4NCGA 2HW3A 4GMJB 4I2PA 2VG6A 4CJQA 1ASUA 4GW6A 4LH4A 3OYCA 3U6FA 3DLHA 4DQSA 4OLBA 3LAMA 1RTJA 2ZQBA 4DWIA 4RW8A 4KFBA 4FJKA 3LALA 4KTZA 1YTUA 4B9SA 4CEFA 1BQNA 3ITHA 1UWBA 3RRGA 4OVLA 2YHAA 3DLRA 4DTOA 2HHSA 3HJFA 3KK2A 1ASVA 3NGYA 1VSDA 3WNGA 5SZTA 3O3FA 1KRPA 4Z4HA 1A5VA 4KTQA 1NOZA 3HYFA 3T1AA 1D8YA 1ZBIA 4CF8A 1JLEA 3NE6A 4KHSA 3MXJA 1X9WA 4C8LA 4KHUA 4FZZA 1K6YA 2A1SA 4F2SA 4FLXA 2FC0A 4B8AB 3SPZA 3ZSWA 1QSLA 3HK2A 3V1QA 2X6SA 1ITGA 4CHPA 1RCHA 3RR7A 3SUOA 1WSFA 4M3TA 4ID1A 4RW7A 2QKBA 1JLQA 3KLEA 2KTQA 3V81A 4M3YA 1NJXA 1HYZA 1WAFA 5KTQA 1RT3A 4Y1DA 3M8RA 2FBTA 4DSLA 4KHYA 4DF4A 3D45A 3HT3A 1RT2A 3QEVA 3O3GA 1SL0A 2P5GA 2D5RA 3OYGA 3P1GA 3UIQA 1J54A 1B9FA 4AILC 3KD1E 4AHTA 1U04A 2HHWA 1LAWA 2JGUA 1RBRA 2X74A 2D0BA 4CGHA 4CFAA 3OYMA 3S9HA 2YNIA 5I3UA 1RT5A 3ZT2A 2HMIA 1VRTA 1NK0A 3JSMA 3A2FA 1HJRA 4FJ7A 3KKRA 4FW2A 2OPSA 2WOMA 3ZSXA 1Z25A 5CZ1A 1WSEA 4O0IA 3THVA 2XRIA 2XY8A 4CGFA 3KLFA 3LDSA 3RMAA 4AHRA 2O4IA 1I3AA 4I7FA 4JRQA 1XHZA 1YT3A 4R5PA 5FROA 4W5OA 2O4GA 2XY5A 1ZBUA 3NGIA 3NF9A 4BACA 1TK0A 4C8KA 1KVAA 2ZE2A 4MQ3A 1BL3A 4HHTA 3LP3A 1BCMA 4FLTA 2HNZA 3AO3A 4NYNA 2NUBA 4CEDA 4Y1CA 4KAZA 1NOYA 3PV8A 4FJGA 1S9GA 4DF8A 4CEQA 4F8RA 5CYMA 3NCIA 4CFDA 3ZSYA 4KO0A 4CJSA 4C8OA 3VQBA 2XO7A 3QESA 1CZ9A 3KTQA 1L3TA 1UAXA 4CGIA 2FBYA 3DI6A 3NF8A 4IG3A 3HXMA 4IFVA 1L3SA 3PUFA 1Z26A 2JLEA 3NH2A 3SQ4A 1TAQA 3K5NA 4FJIA 4ICLA 4J2AA 4CJFA 4CIEA 1CXUA 3OYAA 4FJJA 3IG1A 4LH5A 3HM9A 1HRHA 1NK4A 2AJQA 1WSIA 3MAQA 4M3RA 4B9TA 1A5WA 1RDCA 2BE2A 4CF0A 1J53A 1FXXA 1S1XA 4OPKA 5HP1A 1U47A 4M3XA 2Z1JA 4DQQA 1ZYQA 2G8HA 4ELVA 4FZYA 4DLGA 3ZSVA 4FJNA 1RTIA 4CESA 1TK8A 4F3OA 2HHQA 1WSHA 2YKNA 1VSEA 4IKFA 1IKVA 3ULDA 5KGWA 2G8IA 4KHNA 1LWEA 4I9QA 3DOLA 3KD5E 3T19A 3VQPA 4CEEA 1LW2A 1C1CA 2Z1HA 3RR8A 4FJ9A 4AHCA 5HLFA 1GOBA 4AHVA 2E6LA 4EP4A 4F2RA 2XY7A 2ZD1A 4W5TA 3TWHA 4CGDA 4E7KA 4FLZA 4KHWA 1C0UA 4E7HA 1TL1A 3F9KA 3HVTA 1ZBFA 3L2QA 3L3VA 1Y97A 4CJRA 4ELTA 4FVMA 5C24A 1CZBA 3NAEA 3EZ5A 1JL2A 4DQRA 4J2BA 5E41A 2OZSA 3ISNC 2XY6A 1HYSA 3L8BA 3ZSZA 3OJSA 3CG7A 3QINA 4PQUA 3QETA 2P51A 3K5OA 1U4BA 4K8XA 4M3WA 3HO1A 3CQ8A 1HPZA 4DSEA 3K5MA 3QIOA 1GOAA 1RBSA 1SKRA 3SQ2A 1N5YA 1L5UA 3PO4A 5FRNA 4IBNA 3SYZA 1NKEA 1UOCA 2QXFA 2A1RA 1XI1A 1U49A 1TV6A 3HSTB 4ELUA 3K58A 2KZZA 3OS2A 5FDLA 2G8WA 4C8MA 3RWUA 5KRTA 3AA5X 3IS9A 1SV5A 3LANA 3O4NA 3RRHA 2ITGA 4H4OA 2EX3A 1VSLA 5FRMA 4HTUA 1LW0A 4YFUA 3VQ7A 4OGEA 4CF2A 3OY9A 3L2UA 1QSYA 1S1TA 3VQ4A 3NGZA 1TKXA 2F96A 4Z4GA 3G10A 1RDDA 1BQMA 3I8DA 3SI6A 1WNSA 3PY8A 3DRSA 1GOCA 1KLNA 2G8VA 4OPJA 3K2PA 3LZJA 3V4IA 3V1RA 2OPRA 2DTUA 4DTRA 1T03A 3AVLA 3AVNA 1N6QA 4Q0BA 5HBMA 4CHNA 2OZMA 2E6MA 3JYTA 3LWLA 1ASWA 3DRPA 2DFFA 2WONA 4DFPA 1D9DA 4B9VA 4FJHA 5K14A 4KPYA 4PWDA 1G15A 3OYLA 3I0RA 4HUFA 4M41A 3ZT4A 3P5JA 3DLKA 4IFYA 5KRSA 3AVIA 4L8RB 3CM6A 3D0PA 4NCBA 3TAQA 3MXIA 1L3UA 3VQCA 3LAKA 3MEDA 2VWJA 3TAFA 2KFZA 4KREA 3QO9A 3SV3A 4BE2A 3AVCA 4Z4IA 1VRUA 4KV8A 3CM5A 1KFDA 1C0MA 1NKCA 1QSSA 4I2QA 3L2RA 1IKXA 3TI0A 3K59A 1TL3A 4E7LA 3OVNA 1QE1A 4AHSA 3C6UA 3VQ6A 4B9UA 4DQPA 1NK9A 3G0ZA 3NF6A 2X6NA 4CIGA 2PY5A 4BDZA 2HNDA 1B9DA 4JLHA 4DTJA 2BGGA 3QNNA 4DFKA 3C94A 1NK7A 2Y1JA 4CJKA 1TKDA 4CEZA 1LAVA 4F3TA 4DLEA 3VQ5A 4LD0A 2P5OA 3SQ1A 2G8UA 3DYAA 4F4KA 1QQCA 4FCYA 1HYVA 2B6AA 1BHLA 3TAEA 4Z4FA 3K5LA 3IRXA 4FLWA 4TSXA 4FW1A 3O3HA 4DSFA 1XWLA 3FFIA 4DFJA 2OPQA 4CK2A 4BE1A 3ZSOA 3DM2A 4J2DA 4DSJA 1QS4A 3OYHA 4CCHA 3OS0A 4E0DA 3CYMA 3KIOA 4H4MA 1KCFA 4CF9A 5HRPA 2R7YA 4DTMA 3PX0A 3SQ0A 4N76A 2F8SA 4KI6A 1Q9XA 2YNFA 1A5XA 5KGXA 3ZSQA 4LY7A 3LPTA 4CECA 4CE9A 4KI4A 1U45A 4FK0A 1LWCA 2Y1IA 3I0SA 2BDPA 1HMVA 3NF7A 2RF2A 3KLHA 4DTUA 4W5QA 3QEXA 1WSGA 5HRRA 3KK1A 4B9MA 4MFBA 4O4GA 4W5NA 4DQIA 2KW4A 1KTQA 3LP1A 5SWMA 4IDKA 1YTAA 2IAJA 3NDKA 4HCBA 1S1UA 2YNHA 4CJVA 4N5SA 1NK5A 1C6VA 2GBZA 3C6TA 5I42A 1SKWA 1BISA 1R0AA 1JLFA 4CJ3A 4FM0A 3SPYA 4FXDA 4J2EA 1DTTA 1MU2A 3AVFA 3KLIA 4BWJA 3WNFA 3AVKA 4N56A 3OYJA 2HHVA 2B5JA 3DLBA 3LZIA 3BGRA 1WLJA 3NBPA 4HCCA 3RTVA 5HRSA 2VWKA 3V6DA 3MXMA 3V9ZA 3LWMA 1BIZA 1NJWA 2IS3A 2KFNA 4BWMA 2Z1GA 1RDAA 4DTNA 1C1BA 1RBVA 3RMBA 1SL2A 4E7IA 1W9HA 3AVHA 4DMNA 3OYIA 4DU3A 4FJ5A 4O0JA 5CY4A 4FJMA 1T7PA 2BANA 3H08A 3TABA 3S3NA 1U48A 4CEOA 4CGJA 4FLUA 3P83D 3EYZA 3QLHA 1F21A 4B9LA 1UA0A 2HVIA 4QOZB 2FBVA 4PA1A 1TVRA 2OA8A 4NCAA 4CHOA 1VSKA 1IH7A 1W0HA 1KFSA 4FJ8A 4LSLA 4CHYA 3SNNA 3M8QA 3SUNA 3C95A 1NK8A 1SL1A 4EZ9A 3VQAA 4JS4A 1Q8IA 1CLQA 3L3UA 4AHUA 4Q5VA 4W5RA 2PZSA 2EHGA 4O5BA 4CJWA 4E1NA 3S3MA 1SKSA 1L3VA 2QKKA 4UQGA 5DK5A 1VSMA 4CHQA 2IDOA 2RN2A 3LP0A 3M8PA 4B08A 1NJYA 2DFEA 4O55A 3PO5A 3QEWA 4M45A 3HPOA 3CFPA 5HROA 4CJ4A 1REVA 4ZTFA 5D3GA 2GV9A 3AA2A 1WAJA 2D0CA 4OLAA 1QHTA 2W42A 4DSIA 1TGOA 4QAGA 3TANA 3B6OA 1D9FA 4OJRA 3V9UA 4EP5A 4PY5A 1RBUA 1LV5A 1S6PA 2DFHA 3B6PA 1FK9A 4CJTA 1FKOA 1HNIA 4CK1A 1J5OA 2PYJA 4B3OA 1FKPA 3DRRA 4QCLA 4HUEA 3AV9A 1UA1A 1BGXT 3NFAA 3HP6A 2KZMA 1EXQA 3AA3A 1RDBA 4FM1A 3RMCA 2B4JA 4OKKA 2D0AA 1ZBHA 2FBXA 4K8ZA 3VQEA 2HHXA 5J2NA 1KSPA 4BDYA 3OJUA 2YHBA 3EY1A 4KRFA 4O44A 4EZ6A 2Z1IA 3HL8A 4ID5A 4AH9A 3SJJA 3OYNA 3CFRA 1DTQA 5J2PA 4E89A 4FK4A 2KQ2A 1C1AA 4ZTJA 4DSKA 1CXQA 1YVUA 3TR8A 1IKYA 3S3OA 4B9NA 3VN5A 3VQDA 3LPUA 1BI4A 1JLAA 3VA0A 1IO2A 1DLOA 1X1PA 1JLCA 4DFMA 4DTPA 2VG5A 1NK6A 2OYQA 2E4LA 4DU4A 4BE0A 1RTDA 3AVAA 2HHTA 2RPIA 3V9WA 5DMRA 2YKMA 5HRNA 3T3FA 1HQUA 3TAPA 3L2WA 4FLYA 3KKSA 5EU7A 1BI4B 1KVCA 1WN7A 2I5JA 3AO4A 4CEAA 3OYKA 1JXBA 1RT7A 5JS2A 4G1QA 3AA4A 3WNHA 4FK2A 1HQEA 2P1JA 4CFCA 3QERA 4DS4A 1O1WA 3AVMA 3QEPA 1XC9A 4CJLA 1TKZA 2HNYA 4CK3A 3F73A 4FZXC 4PUOA 3TARA 4YNQA 4FJXA 1EP4A 3SUPA 1NKBA 4DU1A 4FYDA 4KB1A 4ZHRA 2QK9A 1EX4A 1VSJA 2VG7A 3MEEA 1TAUA 2LSNA 3L2VA 2DY4A 4RW6A 1TKTA 5CZ2A 1S9EA 4CJPA 3QNOA 1I39A 1VSIA 1JLBA 3MEGA 4GVMA 4KTWA 4M3UA 3AO2A 4CJUA 3E01A 4B8CA 4E1MA 4N47A 1TK5A 4OGCA 3O4QA 4WE1A 1QTMA 4RW4A 3TAGA 4H8KA 3HVRA 3TAMA 4DG1A 3OYBA 3V1OA 4FLVA 3KLGA 3AVGA 4KB0A 4M3ZA 2RKIA 1WSJA 5J1EA 4CERA 4IG0A 3OYEA 3V9XA 4DS5A 1Q9YA 2G8FA 1C0TA 1B92A 1RT1A 5J2QA 4Z4EA 3QIPA 4CF1A 3ZCMA 3LP2A 2XHBA 1T8EA 5KI6A 4E3SA 1BCOA 3PX4A 1JKHA 3SUQA 4KKOA 4CEBA 4RW9A 3OS1A 4E7JA 3ASMA 3WNEA 4RG8A 4LSNA 3DMJA 2PYLA 2YV0X 5J2MA 4HUGA 1KVBA 3ZSRA 4Z4CA 4DTSA 1S1WA 1EKEA 3MECA 1SUQA 1EETA 2IOCA 1XHXA 4JS5A 4FJLA 4NYFA 1RNHA 4CJEA 5T7BA 3VQ8A 3V9SA 4HVJA 3DLGA 4C8NA 4CJ5A 3SZ2A 1IKWA 4OKJA 4CIFA 5C42A 1VSHA 3AO1A 4KHQA 2HHUA 1RT4A 2Q3SA 2F8TA 1LWFA 1S1VA 4CHZA 4I9LA 4FM2A 5C25A 1D5AA 3AVBA 1S5JA 3VA3A 3DOKA 1IG9A 1T05A 1RILA 2YNGA 3RMDA 3PX6A 1RTHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ID8A 1Z6RA 4CZGA 4BR2A 3SV4A 1HNZK 1JL1A 3IAYA 4M42A 5AZIB 3ZT1A 3A5MC 5AQUA 2IGIA 3MWPA 4Z0UA 4DTXA 3CFOA 1YUWA 4BRLA 4LF7K 3J7ZO 3NH0A 5JVHL 3AVJA 3EL2A 4XIUA 3DLEA 5KQDA 1HR0K 3QMLA 3DLHA 1ASUA 4GW6A 1FW6A 1RTJA 4DWIA 4JYAK 2IVNA 3ATUA 2Q1NA 3ITHA 1UWBA 3DLRA 3HJFA 2P9PB 5SZTA 1KRPA 1HKGA 4FWMA 1NOZA 3T1AA 1ZBIA 2F4VK 3HRGA 3MXJA 4KHUA 2A1SA 3LL3A 3MX5A 3F5TA 2FC0A 4FLXA 3ZSWA 1WUAA 4YOVA 2X6SA 1T6CA 5DM7L 3D7EO 3WUHA 3RR7A 1WSFA 4ID1A 4RW7A 3R3LA 4RTFD 3KLEA 3V81A 1NJXA 4M63C 1WAFA 4Y1DA 3M8RA 4R79A 4DF4A 3D45A 4MO5A 4CVNE 1RT2A 3UIQA 1RBRA 4CGHA 4CFAA 3CCQN 1VRTA 1NK0A 1HJRA 3UE5A 4O0IA 2PYJA 1Z25A 2XRIA 3DXMB 3MMVA 1I3AA 4DV6K 4CJ7A 2I7NA 5FROA 2W6KA 3BP8A 2PBDA 1ZBUA 3O9SA 2HNZA 3SMPA 1NOYA 3PV8A 1I94K 3HI0A 4F8RA 1NGHA 4GKKK 2UUBK 4NLBA 3QESA 1BWFO 2UUCK 5JMVA 1VHXA 3CIPA 2A6AA 4IFVA 3PUFA 1Z26A 2YHYA 3SQ4A 1TAQA 3K5NA 4FJIA 4BR0A 4CIEA 4YDUC 4LH5A 1NK4A 1N33K 1A5WA 2WFBA 3MN9A 1RDCA 3N4PA 4WF9L 1J53A 1VAZA 4ELVA 1ZYQA 2JWLA 4H5WA 2HHHK 1YI2N 1WSHA 2BH1A 2GUPA 4IEIA 3ULDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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