1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
5I42A 1U4BA 4LY7A 4RW8A 4CFCA 3QEWA 4DTPA 3MEEA 2ZQBA 3V9SA 3SQ2A 4EP4A 1DLOA 1JLBA 4W5TA 1T7PA 1JLCA 2QK9A 4CJWA 3KK2A 4JS4A 4FJJA 1ITGA 3OY9A 3F73A 3EY1A 3VQ7A 1JLAA 3NE6A 4KAZA 1WSGA 1WLJA 4I2PA 3WNHA 2G8UA 4FK2A 3C95A 3VQDA 1TGOA 4KHYA 4W5NA 1LWFA 3OYDA 3PX0A 1CZBA 1RT1A 1NKCA 1RTHA 3AVCA 4KKOA 4JRQA 4HTUA 5CZ2A 3ZCMA 4RW6A 4CE9A 3NDKA 4FLZA 3TARA 4F2SA 1WSEA 4L8RB 3P83D 4CF0A 3B6OA 4CECA 4FM1A 2X6SA 4FXDA 3E01A 4M3YA 1NOYA 4FLTA 4RW9A 4FLYA 1DTQA 5J2MA 2YNIA 3KKSA 1A5VA 4E7HA 4CJLA 4DTSA 3LP1A 3M8SA 3QEXA 1JLEA 3AV9A 2RPIA 4I9QA 1C0MA 2OPQA 3O3GA 2KFNA 1ASWA 5JS2A 3KK3A 3HVRA 2YNGA 2DFEA 3HP6A 3OYCA 3LWMA 4CF2A 3BGRA 1ZBUA 2E6MA 2IC3A 1RILA 3V1OA 3V6DA 5FRMA 3CFRA 4OLAA 4KRFA 1MU2A 5HROA 2KZMA 1C1AA 3L2UA 5E41A 3TR8A 3OYNA 4N76A 1YT3A 1G15A 4CFAA 1SL2A 4AILC 4B8AB 4FJ5A 4DWIA 4J2AA 1RT5A 3C6TA 1VRUA 4DTOA 1NOZA 5J2PA 1R0AA 4EZ6A 3OS0A 4BDYA 1RDDA 4CGHA 3NFAA 2XY5A 1JLGA 4LH5A 1L3SA 3RRGA 4FJXA 3AVBA 4E89A 3KTQA 2JGUA 4CF8A 3DRPA 3DLHA 4DSJA 1VSHA 1Z25A 3T19A 4OKEA 2WONA 4DTMA 3QINA 4PWDA 2OA8A 2Z1IA 3P1GA 4E7LA 3VQ8A 4DQQA 3TAEA 4ID5A 1LW0A 3K5NA 3FFIA 4W5RA 5FRNA 1S5JA 3HT3A 1VK0A 4B3OA 1TK8A 2OPRA 1UAXA 4B9TA 1C1CA 1W9HA 2XY8A 3CFOA 3MECA 3VN5A 3TAFA 3SCXA 1QE1A 3BDPA 1TVRA 3VA0A 3KIOA 5I3UA 5KGWA 2HHQA 1HYVA 1NKEA 4GVMA 1VSIA 4HUGA 1C0TA 1BCOA 2Z1GA 1VRTA 4DS5A 1HQEA 1JLQA 4FZYA 1X9MA 3OYIA 2KZZA 3PV8A 2IS3A 3AA2A 3T3FA 3SUQA 4O4GA 2EX3A 3DRSA 3MXIA 1HPZA 1HQUA 4OPJA 2F8SA 2QKBA 4B8CA 4BE2A 3G10A 3NH2A 3OYKA 3NF8A 3PX4A 3I0SA 1UA1A 4NCAA 1U47A 4ZHRA 5HBMA 4CK2A 3DM2A 2VG5A 3ZT3A 4W5QA 3K59A 3PUFA 4HHTA 3SV3A 5DK5A 1BCMA 3SJJA 3RR7A 4KFBA 4OGCA 4Z4GA 1IKYA 4LSNA 2LSNA 3NAEA 4OGEA 4B9NA 1SL0A 2FBVA 1KRPA 4NCBA 1WAJA 3L2WA 2A1RA 2PYLA 2DFHA 3K5OA 4M3RA 4AHTA 4CJEA 3DLRA 1IKVA 3ZSVA 4IFVA 1TKDA 1KFSA 1SKWA 5D3GA 3SUNA 2E6LA 3ZT2A 1X1PA 4CJPA 4DQSA 1ASVA 2AJQA 4DU3A 3TABA 2F96A 4BE0A 4FJGA 4CHQA 1WSJA 4CEDA 5C24A 4HCBA 1JKHA 3VA3A 1XHXA 4CHPA 4O5BA 4O0JA 4GW6A 2FC0A 1KCFA 4DLEA 4DSKA 3QETA 1Q8IA 1SKRA 4CGJA 2OZMA 4E0DA 4Z4IA 2IAJA 1J53A 4DQRA 3MEDA 1WSIA 3V9UA 4FK4A 3NF6A 4IG0A 3ZSXA 3NGIA 1L3TA 4F3OA 5CY4A 3SI6A 1HYSA 4CHZA 1KFDA 1QQCA 2DTUA 1GOBA 3RRHA 3K5MA 1C6VA 3LP2A 3OS2A 3L3UA 3JSMA 1QSLA 1CZ9A 3KLEA 3QNNA 5J2NA 1TK5A 2HHXA 1F21A 1QHTA 2VWKA 4RW7A 2BE2A 4DFMA 3TI0A 1VSLA 4ZTFA 4C8NA 5HLFA 5HRPA 4JLHA 2G8FA 4B9MA 3HJFA 2HVHA 2D0BA 4BE1A 1RCHA 3ZT4A 3DMJA 1HRHA 3AVKA 3HPOA 3QEPA 2XO7A 1RTJA 1EXQA 2FBYA 1T05A 2VG6A 3OJSA 4CJ5A 3ASMA 1BISA 4PA1A 2ITGA 4AHSA 3OVNA 5K14A 1KLMA 2OPPA 4DSFA 4FJNA 3WNEA 4CEEA 3RMAA 1W0HA 3HSTB 1QS4A 2OYQA 3DOLA 1RT4A 4CHOA 5KTQA 3PO4A 3I0RA 1JLFA 4CCHA 4CJSA 1WAFA 3D0PA 1RDAA 5C25A 1KVBA 4OJRA 3ULDA 4B9LA 3UIQA 1U48A 3VQ4A 1XI1A 1WN7A 4OLBA 2HHUA 3HM9A 4C8LA 2HW3A 1S1WA 1D9DA 3HL8A 1NJXA 1BI4B 3V9WA 3KLGA 1EP4A 3V1QA 4CFDA 3CFPA 4H4OA 1S1XA 1QSYA 2HMIA 4FJ9A 4AHVA 1SL1A 1TAQA 4M3XA 1LAWA 3LPTA 3M8PA 3AO1A 5SWMA 4B9UA 4DQPA 2ATQA 3S3NA 1RNHA 4FZZA 1TKZA 1RBSA 3CM5A 3NH1A 3MAQA 3DLGA 4Z0UA 4CJ4A 3RMBA 4LD0A 4CK3A 2Q3SA 4K8XA 2KTQA 5CYMA 4BWMA 1QTMA 3OYLA 4CGIA 3KLIA 4DLGA 3L2VA 1NK9A 4DU4A 1J9AA 4ELUA 1LWCA 1TL3A 3LAKA 4Q5VA 4FM2A 1L3UA 3OYJA 4M3TA 1A5WA 4HVJA 1YTUA 1S9EA 4CF9A 3ALYA 3DI6A 3O4NA 1HJRA 3HPHA 3B6PA 2YV0X 4OKKA 4CEAA 3DLBA 3AO5A 3VQPA 3ZSYA 1WSFA 3SQ4A 3IAYA 2IOCA 2W42A 4E19A 4M41A 4FLVA 4CJTA 4Z4HA 4KB1A 1BIUA 4KB0A 4J2BA 3SNNA 2ZE2A 4IKFA 4DTXA 2HNZA 2WOMA 5FDLA 4Z4CA 1IKXA 4FLUA 1N5YA 3IRXA 5T7BA 4B08A 3KKRA 2XY6A 1TK0A 4FK0A 2B6AA 4OPKA 2ETJA 1NJYA 2EHGA 3LANA 2HHSA 4NCGA 3K5LA 5HRSA 1HNVA 3O3HA 4EZ9A 3S9HA 4PQUA 1J54A 1RT6A 1C1BA 2FBTA 2KW4A 1SV5A 4CIEA 4UQGA 4DTRA 2RF2A 4BWJA 5KI6A 4AHUA 4HUFA 3RR8A 2YNHA 4AH9A 3HYFA 4EP5A 4CHNA 3EYZA 1VSEA 4CFBA 1B9FA 4FLWA 3TANA 1SKSA 4ELVA 4CEFA 1CXQA 1U49A 1YTAA 4O55A 4W5OA 1HYZA 4FJKA 3PX6A 5HRRA 5CZ1A 1S9GA 3OYMA 3L2QA 3VQAA 3KLHA 3QEIA 3JYTA 4QAGA 3NH0A 4DMNA 3RTVA 1ZBLA 4KI4A 1UA0A 4CHYA 1RBRA 3HP9A 1LWEA 1O1WA 1TKXA 3AO2A 1K6YA 4M45A 3C6UA 5HP1A 1KVAA 4FZXC 4KPYA 1LW2A 2ZD1A 4B9VA 3AVIA 4BACA 2HB5A 4CERA 1B9DA 2B4JA 1D9FA 3H08A 4AHRA 4GMJB 3AVLA 4RG8A 4KREA 1S6QA 4CEZA 4E7JA 4Q0BA 4IDKA 1NK0A 3P5JA 5DMRA 3ZSZA 2D0AA 1XC9A 4CJKA 3DYAA 4NYFA 3HVTA 3HPGA 2XRIA 3K58A 1IH7A 1U04A 3HXMA 2IDOA 1T8EA 3ZSRA 4J2EA 4MFBA 4IBNA 3SQ0A 3OYGA 3SZ2A 4FM0A 4MQ3A 3D45A 1ZYQA 2PY5A 3WNGA 1RT7A 1JXBA 5FROA 3IS9A 3QERA 1YVUA 1FK9A 2HHTA 4N41A 1NK7A 3KK1A 1TKTA 3SPYA 4CJ3A 4DF8A 5HRNA 4O0IA 4C8KA 4CGFA 3NGZA 4DFKA 1D8YA 1JL1A 1GOAA 3AVMA 3ZT1A 3V9ZA 3L8BA 3ZSQA 2R7YA 4IG3A 2E4LA 5SZTA 2YHAA 3KLFA 5KRSA 3OS1A 1GOCA 3QIOA 4CEBA 3LPUA 4BDPA 3AVHA 3SQ1A 4KHUA 1BI4A 4BDZA 1REVA 3SV4A 4DS4A 3S3OA 3WNFA 3OYEA 4FCYA 1T03A 2HHVA 1BL3A 4E3SA 3SUOA 2DFFA 4N56A 3TWHA 4DF4A 1VSMA 4YNQA 4PY5A 1Y97A 4CJUA 3CYMA 3AO3A 2P5OA 1CXUA 4KTWA 2PZSA 4FJIA 3V1RA 3DRRA 4AHCA 5J2QA 4KHWA 3PO5A 4KHQA 4CESA 4WE1A 4CJVA 3F9KA 3DLEA 2XY7A 1XWLA 2HHWA 3ZT0A 1EETA 2P5GA 4F4KA 1ZBFA 1BQNA 2YKNA 2X78A 2X74A 4DTUA 3TAQA 3QIPA 3QLHA 4I9LA 1NK4A 1KSPA 4CJFA 1I39A 4IFYA 4F2RA 4K8ZA 2JLEA 2HVIA 3OYHA 2PYJA 1ZBIA 3MXMA 4CGGA 3MEGA 4FW1A 4FYDA 3NGYA 5EU7A 5J1EA 3K57A 1WSHA 3ZSWA 3NF9A 3S3MA 3VQ5A 1ZBHA 1KTQA 1RDCA 5C42A 2O4IA 4ELTA 1IKWA 1Q9YA 3NF7A 2B5JA 2G8WA 1A5XA 3A2FA 4N47A 3V81A 2G8IA 1WNSA 3L3VA 3LP3A 5CYQA 3QEVA 1JL2A 2GUIA 4FVMA 3VQQA 2FBXA 2X6NA 1RT3A 1VSFA 2YHBA 3AA4A 1NK5A 1Q9XA 2P51A 3RMCA 4HUEA 2BANA 2I5JA 3KJVA 4CIFA 3T1AA 1S1VA 2F8TA 3U3YA 4RW4A 2VWJA 2O4GA 3TAGA 1RTDA 4TSXA 4OKJA 4FJ8A 1JXEA 3KD5E 4CK1A 4LH4A 4C8MA 3V9XA 1I3AA 1VSDA 2BDPA 1U45A 2KQ2A 1B92A 2QKKA 1ASUA 3DOKA 3HK2A 4KI6A 1D5AA 1BGXT 2BGGA 1RTIA 1EKEA 4HCCA 4KTQA 2YNFA 3U3GA 1BQMA 4KO0A 4OVLA 1S6PA 3K2PA 4I2QA 1UOCA 3ZSOA 4XIUA 4R5PA 3CQ8A 1NK8A 1N6QA 2HNYA 4ICLA 1QSSA 4CGDA 4N5SA 4M42A 3O3FA 2G8KA 3AVNA 1RBUA 3KD1E 4E1MA 1TL1A 4CF1A 3LWLA 1RT2A 1SUQA 1FKPA 3SPZA 3THVA 1L5UA 4O44A 3G0ZA 1VSJA 3OYAA 3IG1A 2D0CA 3M8RA 1J5OA 4F8RA 4KHNA 1CLQA 1NJZA 4H4MA 1X9WA 1TV6A 3SYZA 5KGXA 3V4IA 3SUPA 4CJRA 1RBTA 1LAVA 2A1SA 3ITHA 3AVJA 2XHBA 1C0UA 3OYBA 4JS5A 2OPSA 3AO4A 4FJLA 4Z4FA 4C8OA 1DTTA 4ID1A 4B9SA 4FJHA 4M3WA 4DTNA 1TAUA 2Z1JA 1S1UA 4FW2A 5KRTA 1NK6A 1Z26A 3LZJA 1HNIA 3QNOA 1NJWA 4DFJA 1X9SA 3AVGA 4YFUA 3OYFA 5JS1A 2Y1IA 3LAMA 4LSLA 3VQ9A 4DU1A 3ISNC 1BIZA 1L3VA 1IO2A 3PY8A 2OZSA 4M3UA 4Y1DA 4DSLA 4F3TA 4NYNA 3CM6A 3MXJA 2G8HA 4H8KA 4E7IA 1LV5A 4Z4EA 1KVCA 3LP0A 1RDBA 3VQCA 1FXXA 3LALA 4KTZA 3HO1A 1EX4A 3LZIA 1NKBA 3L2RA 2HNDA 3LDSA 2RKIA 1BHLA 2VG7A 3EZ5A 3AVFA 4DG1A 3QESA 3RWUA 4PUOA 2KFZA 4I7FA 1RBVA 4FLXA 4QCLA 2D5RA 4DQIA 4J2DA 3VQ6A 3AVAA 4DFPA 2RN2A 3DLKA 3VQEA 4E7KA 4Y1CA 3TAPA 4DTJA 2DY4A 4G1QA 4CIGA 3C94A 3M8QA 4CJQA 2GV9A 3O4QA 3TAMA 4CEOA 1IG9A 2IGIA 3AA5X 4M3ZA 4E1NA 3VQBA 2Z1HA 1FKOA 3I8DA 1S1TA 2NUBA 3NCIA 4DSEA 1VSKA 1UWBA 3NBPA 4FJ7A 1KLNA 4QOZB 4ZTJA 3CG7A 2QXFA 3AA3A 4FJMA 1XHZA 4KHSA 2YKMA 4CEQA 3QO9A 2Y1JA 3NHGA 2GBZA 2G8VA 4KV8A 1HMVA 3OJUA 3U6FA 4DSIA 2P1JA 3RMDA 4JRPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C10A 3QEWA 3SQ2A 4DTPA 4C1NK 1NLVA 1S72N 1SQKA 2O8EA 4CJWA 3KK2A 4FJJA 5AQIA 4EAHD 2HBKA 2F9TA 2AA4A 1WLJA 4I2PA 5BRFA 1IBKK 3VQDA 1XMQK 4KHYA 3PIOL 1NBWA 3HI0A 3THXA 3AVCA 4JRQA 4HTUA 4CE9A 2WTUA 4RW6A 4FLZA 1JCFA 1N8RO 2X6SA 1RDUA 2W6LA 5BRHA 1DTQA 3MMVA 5J2MA 1YJNN 4E7HA 5AQPA 4CJLA 3AV9A 3A5MC 2RPIA 5JMVA 4I9QA 3O3GA 4DUYK 1VQMN 3V6DA 1ZBUA 4KRFA 4OLAA 3CFRA 2KZMA 3L2UA 3OYNA 1YT3A 4EIAA 4B8AB 4FJ5A 5GIOA 3A0IX 4JHDB 3QICA 4JI2K 4EZ6A 3OS0A 1JLGA 4LH5A 4FJXA 3D2EA 3AVBA 4E89A 5C2FA 4ISGA 3KTQA 1VSHA 3SMPA 4DTMA 4PWDA 2YI1A 3I56N 1S3XA 4DQQA 3U8XA 2WFBA 1LW0A 3K5NA 3HT3A 4B3OA 3UKRA 3CMEN 2XY8A 3VN5A 3KIOA 5I3UA 3EKUA 3C6AA 4HUGA 4BRMA 2Z1GA 3CXCM 1JLQA 3B8AX 3OYIA 4IO9L 3CERA 3ENHA 3SUQA 4O4GA 4CZGA 2EX3A 2F8SA 4BE2A 1HKGA 4NB4A 3G10A 4MDAA 3PX4A 3CI5A 1BU6O 4IOCL 5HBMA 4CK2A 3DM2A 2VG5A 3BZKA 3ZT3A 3K59A 3SJJA 3RR7A 5DK5A 3LM2A 4Z4GA 2LSNA 3A5NC 1NGCA 1WAJA 1NMDA 2DFHA 2V7ZA 3K5OA 4CJEA 1IKVA 4IFVA 1TKDA 3OHRA 1KFSA 2E6LA 1TYQB 2D0OA 2GX9A 2F96A 2HSTA 3WUHA 4BRAA 5BPLA 5AR0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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