1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
1EP4A 1HQEA 1VSEA 3VQPA 4PWDA 2EX3A 4BDPA 5DMRA 3ZSYA 2A1SA 3AVAA 3LALA 2OPPA 3ZT4A 3IG1A 4PUOA 4GMJB 4DWIA 2VWKA 4F2RA 3V9UA 1ASVA 3DOKA 4DTPA 4O0IA 4BE0A 3ZT2A 2G8VA 4N56A 4EZ9A 3AA4A 3DLEA 4AH9A 4DSIA 3KLFA 1LW2A 3QIOA 2DTUA 2G8HA 4DSJA 1U48A 3TABA 2HW3A 3HSTB 4CJKA 1BISA 3OYBA 2XO7A 3KK3A 4MQ3A 2GUIA 2YNIA 1CXUA 3CG7A 4LD0A 3OYNA 4KRFA 1BQNA 1ASWA 3QO9A 1NK5A 4M3ZA 1C1BA 4FZXC 1LWCA 1NOYA 2GBZA 3K5LA 5KRSA 3OYFA 3NGIA 3ZCMA 3H08A 2YNHA 3TAGA 1NJZA 3KTQA 5JS1A 1RBSA 2EHGA 3V9SA 3CFPA 3HP9A 4DTSA 1LV5A 4DTOA 1FK9A 2KFZA 3MEGA 3HVTA 3JSMA 4KAZA 4RW7A 3ZSVA 2I5JA 1RBVA 4DTUA 4HUGA 1ZBUA 2KZZA 3ISNC 4DQSA 1N5YA 1RT3A 2ZD1A 2XY6A 1T05A 2E4LA 4DTRA 5J2QA 1XI1A 3PY8A 4FJGA 1IH7A 3SJJA 4HCCA 3D0PA 3QERA 3K5MA 4JS5A 1NK7A 3F9KA 5KI6A 3KK1A 4M41A 1U49A 3D45A 4CFAA 2HNYA 4CGDA 3DLHA 3NF6A 3ZSOA 3L2UA 1TKTA 4EZ6A 3SPZA 2YKMA 1KVCA 3HJFA 3QINA 3K5NA 3KKRA 2WOMA 5KGWA 4DSFA 1JXEA 1ZBLA 4FYDA 2A1RA 4F4KA 4KFBA 4KHWA 1NOZA 3KD1E 5EU7A 4QAGA 1KTQA 2ITGA 5CZ1A 2OYQA 1HPZA 1VSLA 4CERA 4EP4A 4FJ5A 3O3HA 1HNIA 3IS9A 3LP3A 1NKBA 2Q3SA 2WONA 3L2RA 4FLXA 4AHRA 1C6VA 3LP1A 4AHUA 3K58A 3AO5A 1S1VA 4RW9A 1N6QA 4Z0UA 2R7YA 2LSNA 1HRHA 4E7JA 5HP1A 3PUFA 3SQ2A 4Q5VA 1NK8A 1RTIA 4C8MA 3AA5X 3OY9A 1JLAA 3CQ8A 3QEVA 4C8OA 2DFFA 2XY7A 3WNGA 1UOCA 1IKYA 4B08A 3QEIA 4CHQA 2IDOA 4I7FA 3LP0A 1G15A 3BGRA 3VQ9A 1KRPA 4Z4CA 3MEEA 1QQCA 4FLWA 1FKPA 1KVBA 1GOAA 4EP5A 4DQQA 4M3XA 4KI6A 3TAFA 2HNDA 4E7KA 4KHNA 2E6MA 4B8AB 3KJVA 3KD5E 4ZTFA 4CEDA 2FC0A 4N5SA 4FZYA 1RTHA 1A5VA 3U6FA 4IG0A 2F96A 4DU3A 4FW2A 1B9FA 2Y1JA 1IG9A 1ZBIA 3DLRA 5FRMA 4DMNA 1JLBA 1RDDA 3CM6A 1O1WA 5I42A 1KVAA 5K14A 4CJTA 1C0TA 2FBTA 3O3FA 3OS1A 3TARA 3AVMA 3NF8A 4CHZA 3SV4A 4CJLA 2HHQA 1JLCA 1RDCA 3I0RA 4DTJA 2JLEA 3AO4A 1KLMA 3P83D 4E7IA 3SPYA 3HL8A 4B9MA 3AVKA 4YNQA 4O4GA 4FCYA 4KO0A 3ASMA 3IAYA 3KLIA 2IOCA 4W5OA 1CZBA 2IGIA 2QK9A 3K5OA 3VQ5A 4CFDA 4CF9A 4FK4A 3HPGA 1MU2A 3NGZA 2G8UA 5HRNA 1A5XA 1RBRA 2YV0X 1K6YA 3LZJA 2ZQBA 5HRPA 1B92A 1C1AA 2YHAA 4DLGA 4CHYA 4CJSA 2X6NA 3TAMA 1UA1A 3OYAA 3RMAA 1RT5A 4CGHA 4FM1A 3T3FA 1UWBA 2RF2A 1NK4A 3SQ4A 1FKOA 4LY7A 3L2VA 3VQ6A 4CJFA 3EYZA 5CZ2A 5J2MA 2DFHA 2OPQA 1X1PA 1SKWA 2O4IA 3SQ1A 1KSPA 4H4MA 3C94A 2P1JA 4OGEA 1YT3A 4CEQA 4BWMA 1T8EA 1T03A 4F2SA 5C42A 1VRTA 1WSHA 4Y1DA 5CY4A 4HVJA 3M8QA 1X9MA 1HMVA 1L5UA 2KZMA 2G8KA 4CJQA 3RRGA 4FJIA 1JLGA 2Z1IA 3P1GA 4OKKA 3QETA 1L3UA 2YHBA 2Y1IA 4ELTA 3QEPA 1NK0A 3OYHA 4AHSA 1S1UA 1CLQA 2GV9A 1KCFA 4W5RA 3NFAA 4M3UA 4ZTJA 1Y97A 3VQAA 1R0AA 2BGGA 4HUFA 4AHTA 5FRNA 1L3SA 1RT7A 3HVRA 3TI0A 5FROA 2B4JA 3VN5A 1RNHA 4NYNA 3S9HA 1TK0A 2DFEA 3L3UA 3EY1A 1RILA 1XHXA 4CJ5A 5T7BA 3QEWA 4J2EA 4FJLA 3V1OA 3VQQA 4FLZA 3ULDA 4CK3A 4FLYA 3U3YA 1X9WA 4NYFA 1NJXA 4ICLA 4E19A 2ZE2A 4RW8A 4Z4EA 4CJUA 2D5RA 1Q9YA 1BCMA 3DYAA 1J9AA 1I39A 1QS4A 2YNFA 4CJWA 1UA0A 2ETJA 1CXQA 3LWLA 1TV6A 4CJPA 2HHWA 2HHUA 3B6PA 2XRIA 3VQCA 5J1EA 4B9UA 1BCOA 3HK2A 1VSMA 4RW6A 1FXXA 3NF7A 1WN7A 4KB0A 2FBYA 3NE6A 1C0MA 4BE1A 2P5GA 4Z4GA 1HNVA 3AO1A 4FJXA 3VQ7A 4HUEA 2E6LA 4B8CA 1TGOA 1VSKA 4CIEA 3V4IA 4J2AA 4DU1A 1X9SA 3EZ5A 2PZSA 4KHYA 4BWJA 1HYVA 4JRPA 1TL1A 1U47A 1I3AA 4IFVA 3MXJA 4JLHA 3PX4A 4DQPA 4AHVA 1REVA 4KKOA 4LSNA 1VSFA 3ALYA 3NGYA 1DTQA 1TK8A 1Q8IA 2G8IA 2VWJA 4B9TA 3WNEA 4KREA 2Z1JA 3ZSQA 1SKRA 4FJKA 4PY5A 2HHXA 1LWFA 1BL3A 1C0UA 3CYMA 1W0HA 4G1QA 4DG1A 5SZTA 3SUQA 1T7PA 5FDLA 1J54A 1SL1A 4CFBA 3QNNA 3NHGA 3ZT3A 4CECA 5J2NA 3S3NA 3V9WA 1LWEA 1BIUA 4FJ7A 3SCXA 3DRRA 4JS4A 1VSJA 3P5JA 4O0JA 4E1MA 4TSXA 1RDAA 4RG8A 1BI4B 5CYMA 1CZ9A 2HNZA 2KFNA 4QOZB 1RT6A 2OPRA 3F73A 1JL2A 2HMIA 3HP6A 4DSKA 3AVLA 1U45A 4Q0BA 2IS3A 3LAMA 5HROA 4DSEA 4E7LA 1J53A 2DY4A 4I9LA 1HYSA 3DLGA 3L2QA 1S9GA 1C1CA 3AA2A 1ZYQA 1HQUA 4O44A 1KFSA 2HHVA 4IBNA 1NK6A 3TR8A 3SZ2A 1SL2A 4FM0A 1L3VA 3LZIA 1SL0A 4CF1A 4M3TA 1DTTA 3A2FA 4FJNA 4FK2A 4JRQA 4E1NA 4OKJA 5C24A 4E89A 3LANA 3OJUA 3RR7A 1WSGA 2PY5A 3SUOA 4B9SA 2OA8A 3FFIA 4FJ8A 4Z4FA 4ID1A 4BACA 2D0CA 3OYGA 1RDBA 1WSJA 3BDPA 4J2BA 3KLGA 2FBXA 4CJEA 1JXBA 2HVHA 3RMCA 3SNNA 1TK5A 4DQRA 3V1QA 4UQGA 1IO2A 4CHPA 5DK5A 3OYLA 3V81A 1RCHA 3AVHA 4CHNA 3QEXA 1WAFA 1WLJA 3DRPA 1S9EA 3VQDA 3VQ8A 1XWLA 3MAQA 5J2PA 4C8NA 2XY8A 1HJRA 5CYQA 1L3TA 1S1TA 3L8BA 4N41A 3PO5A 3OYMA 4CEAA 4Y1CA 2IAJA 3C95A 4FZZA 4CJ3A 1A5WA 4ID5A 1S5JA 4KTQA 1WSEA 1EX4A 1VSIA 4OJRA 3RRHA 1XHZA 4CEOA 1J5OA 3HXMA 4KHSA 2PYLA 4N47A 3OS2A 1RTJA 2QKBA 1IKVA 1UAXA 4KHUA 4OLBA 3C6UA 3HYFA 1F21A 1S1XA 4I2QA 3ZSRA 4DF8A 2BANA 3V9XA 4FJHA 4F3OA 4DU4A 4LSLA 5SWMA 5HLFA 1IKXA 5HBMA 3HPOA 4KPYA 4H8KA 4CE9A 3K57A 2D0AA 3RR8A 5KRTA 2ATQA 4KTWA 4OVLA 4CESA 3ZSWA 3T1AA 1SKSA 1RBTA 3AVCA 3NDKA 4KHQA 3ZT0A 3OYDA 3TAQA 1NKCA 4KV8A 3CM5A 4QCLA 1QSSA 1QSLA 2BDPA 3HT3A 3O3GA 3M8RA 3KK2A 4CF0A 4ELVA 4CF8A 3O4QA 4KI4A 1LW0A 3L3VA 4LH5A 4FJ9A 3QLHA 2XHBA 1D9FA 1RT1A 3LPTA 4DSLA 1BIZA 4DS4A 1JLEA 1BHLA 1NJYA 3K2PA 2Z1HA 4DFKA 3M8SA 3DLKA 3SYZA 1RT2A 1JKHA 2KW4A 1WSFA 2KQ2A 4OGCA 4FXDA 2HHTA 4FLUA 4GW6A 3V9ZA 3OYCA 4CF2A 1ZBHA 2QXFA 3PX6A 4O55A 2P5OA 3SUNA 4L8RB 4CK1A 5JS2A 5HRRA 1JL1A 3LPUA 3T19A 4E0DA 5D3GA 4K8ZA 2KTQA 1HYZA 3AA3A 3SUPA 1D5AA 3HM9A 4RW4A 3K59A 4FLTA 4DFPA 3PV8A 4CGIA 3RMDA 3VQ4A 3S3OA 3DLBA 2F8TA 2YKNA 4CIGA 2X78A 1RT4A 3VQEA 3JYTA 4CJRA 3V6DA 3TANA 4F8RA 4NCAA 4M3WA 3NH0A 1Z26A 1VRUA 1ASUA 3G10A 1VSDA 3AVBA 2VG5A 1TKXA 4NCGA 4AHCA 4BDYA 4CHOA 1KLNA 2B5JA 3MEDA 2BE2A 3RTVA 4CFCA 3LDSA 1JLFA 1EKEA 4OPKA 2FBVA 4GVMA 4ZHRA 4OPJA 3HO1A 3AVNA 1GOBA 2O4GA 4FJJA 3CFOA 4HTUA 4FLVA 3V1RA 1BI4A 3ITHA 1BGXT 2G8FA 3G0ZA 2OZSA 3L2WA 1QE1A 3OYKA 1TAUA 4R5PA 4DTMA 3DM2A 3QNOA 1BQMA 1Z25A 4CEBA 3PO4A 2P51A 4DS5A 3QESA 1S6QA 1U4BA 3SV3A 2AJQA 3PX0A 4ELUA 5E41A 3OS0A 4DQIA 2X74A 2OPSA 2D0BA 3ZSXA 2W42A 4FM2A 3KLHA 4E3SA 3I0SA 4CGJA 2NUBA 2Z1GA 3OYIA 4IDKA 3TWHA 4E7HA 1NK9A 4F3TA 3THVA 3C6TA 4MFBA 1RTDA 2F8SA 3AV9A 4W5NA 2RPIA 3NH1A 3OVNA 1TVRA 3IRXA 1NKEA 1ZBFA 3ZT1A 1KFDA 4M45A 4B9VA 1YTAA 2YNGA 3AO2A 4CCHA 2OZMA 4NCBA 3NH2A 1LAVA 3VA0A 1EETA 4B9LA 4DF4A 3E01A 4OKEA 1SV5A 3O4NA 4M3RA 3KKSA 3AO3A 4CGFA 3NBPA 1TL3A 4FW1A 4KTZA 4O5BA 4DLEA 1WAJA 2JGUA 1IKWA 1Q9XA 4M42A 5C25A 5I3UA 1WNSA 2HVIA 3DOLA 3DRSA 4BE2A 1JLQA 2X6SA 1U04A 3WNFA 1B9DA 1LAWA 1RBUA 3LAKA 1D9DA 2XY5A 4IKFA 4Z4IA 4CK2A 4I2PA 4CIFA 4CEZA 4W5QA 4YFUA 4DFMA 1VK0A 1TKDA 4N76A 1YTUA 3ZSZA 3AVFA 3M8PA 3MXIA 4HCBA 4KB1A 3VQBA 3HPHA 4PA1A 1WSIA 3OYJA 4DFJA 3QIPA 4AILC 2G8WA 2VG6A 4J2DA 5HRSA 3DMJA 1QSYA 3LP2A 4CJVA 1S1WA 5KTQA 4LH4A 1TKZA 4XIUA 4W5TA 4FJMA 3I8DA 4H4OA 3DI6A 2B6AA 3RMBA 3SQ0A 1VSHA 4HHTA 4IFYA 3NAEA 2RN2A 1TAQA 2VG7A 4FVMA 3MECA 4CGGA 3OYEA 4B3OA 1ITGA 4I9QA 1SUQA 1YVUA 1QTMA 4K8XA 4DTNA 2HB5A 4PQUA 1QHTA 1DLOA 2IC3A 4BDZA 4CEFA 4B9NA 4OLAA 3SI6A 4Z4HA 4C8LA 4FK0A 2QKKA 1W9HA 3AVGA 3NF9A 3CFRA 4CEEA 3NCIA 1D8YA 4DTXA 4WE1A 3KIOA 4IG3A 3AVIA 3AVJA 3TAPA 2PYJA 3LWMA 1EXQA 1S6PA 1NJWA 2RKIA 3B6OA 3KLEA 4M3YA 3TAEA 3U3GA 3RWUA 3VA3A 4CJ4A 1GOCA 3MXMA 1XC9A 4C8KA 3OJSA 3UIQA 5KGXA 3S3MA 3WNHA 2HHSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FOEA 3ZSYA 2A1SA 3OTOK 3ZT4A 4JKDA 4GMJB 2VWKA 3CPWM 1ASVA 1NJIO 1K8KB 2I7PA 5JLHA 4IJAA 4CZMA 4DSIA 2Q0RA 4DSJA 3TABA 2KHOA 2XO7A 4MQ3A 2GUIA 2ZF5O 1BQNA 5JVGL 3JXUA 3QO9A 1C0FA 1NGIA 2GBZA 3NGIA 4XH1A 3TAGA 2HBJA 5BR8K 3M3ZA 3QICA 5C15A 4DTOA 2KFZA 4JKCA 1NMNA 2D0OA 4HUGA 1NGDA 5EOYA 3VESA 1RT3A 1T05A 1XI1A 2A40A 5FPDA 4H0VB 4A61A 3LDLA 5KI6A 3M6GA 3KK1A 2FSNA 4FOIA 3NF6A 1KVCA 3HJFA 3L6QA 2WOMA 3KWGA 4FSVA 4FYDA 1ZBLA 4A5AA 4K25A 3MN9A 4B3MK 3VEXA 5DM7L 3VF2A 4QAGA 1XMQK 5CZ1A 1IBMK 2QM1A 1HNIA 4M7YA 4U67L 2WONA 3P38A 4FLXA 2YJEA 3WQTA 1N6QA 2NRWA 3U9DA 5AR0A 1RDUA 1NK8A 3AA5X 1HUXA 2GWKA 4EIAA 2XY7A 5AQSA 2VQEK 3QEIA 3ULEA 3LP0A 3F5TA 3Q7BA 1W97L 4IXCA 4CZLA 3SBGA 4EP5A 1NGFA 2UXCK 2HNDA 3LDOA 3KJVA 4CEDA 4FZYA 3TSPA 2ASOA 4M63C 3U6FA 2F96A 4DU3A 3SJHA 2P9PA 4RCHA 3VEZA 1O1WA 1ZXOA 4JI6K 5K14A 5AJ3K 3O3FA 3G71N 3TARA 3AVMA 3O9TA 3SV4A 4CJLA 1YJNN 3I0RA 4B9MA 4B1VA 1KLMA 3HL8A 2E5LK 4YNQA 4YY3K 4O4GA 3ASMA 5EXWA 2IOCA 2HBKA 3K5OA 4CZJA 3VQ5A 4FK4A 1MU2A 4H0TB 1RBRA 2WFBA 5HRPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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