1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
3AVGA 2HHSA 3TR8A 1T7PA 1RDBA 1NKEA 1JLEA 1JLCA 1HNIA 4DFMA 1QSYA 3OJSA 2BGGA 3CM6A 1KCFA 4E0DA 3I0RA 2NUBA 4FLVA 3KD1E 4E1NA 4KTQA 5JS1A 1UWBA 3ZSQA 4DFJA 1IG9A 2G8VA 3OS0A 2OZMA 2E6MA 3SUQA 2I5JA 1T8EA 4AHTA 1TKDA 1QSSA 4DWIA 1BIZA 3KLIA 2PY5A 2ITGA 4DTOA 2XY6A 2JGUA 4KHWA 4CGJA 4NCBA 3C6UA 3P83D 1DLOA 4B08A 3DYAA 4XIUA 1QSLA 4FM2A 1X9MA 4KRFA 4KREA 2YHAA 4HCCA 4FJ9A 1JL2A 2HHVA 1U48A 1HPZA 1BL3A 4KAZA 1ASVA 3AA3A 4NCGA 4RW4A 5CZ2A 4EP5A 2G8WA 4ELUA 4M45A 3AA4A 4FLXA 3RMBA 2FBTA 2OPPA 3VA0A 5HROA 4M3XA 4CGIA 1VSKA 1RT3A 4R5PA 3HYFA 2OPSA 3KTQA 3K5MA 2YNFA 5C42A 3IG1A 4ZHRA 4CGFA 1VSDA 3SUNA 2PYLA 3VA3A 4I7FA 1RILA 4NYNA 4PWDA 4DG1A 4DFKA 3AV9A 1WSHA 1RT2A 3KK1A 2D0CA 2DY4A 1ZBIA 4Z4FA 4FJGA 3K58A 1N5YA 3OYLA 4YNQA 4F3OA 1O1WA 3K5LA 1U47A 1QTMA 4Y1CA 1JLBA 2B6AA 5J1EA 5HRSA 4Z4EA 3E01A 3SI6A 4I2PA 4M3UA 3LP2A 4CIEA 4DMNA 1X9SA 5SZTA 4HUEA 3LP0A 4OPKA 4Q0BA 3C6TA 4CCHA 2XY8A 2XO7A 1NKBA 3DOLA 2QXFA 5FDLA 4CJVA 4E19A 4AH9A 1D9FA 4B9VA 1RBTA 4CJQA 4E3SA 4CIFA 3OJUA 5I3UA 1SL0A 1MU2A 3MXJA 2QKKA 3KD5E 3S3NA 1REVA 1RDDA 1IKWA 4AHSA 3L8BA 3AVMA 3NGZA 1RDCA 4FLYA 3PX4A 3RR8A 4CE9A 4DTPA 1QS4A 2G8HA 2X6NA 1KRPA 1JL1A 3QETA 2HHXA 1UAXA 4CERA 4O44A 4CESA 4B9LA 2P5GA 2KZMA 5KTQA 3K2PA 1RBUA 5CYMA 4YFUA 3SQ2A 1NOZA 2FBVA 3PO5A 1RBVA 2HB5A 2X74A 2X78A 3PX6A 3RMDA 3ASMA 4FK2A 4G1QA 4HTUA 4OKEA 3QEXA 3F9KA 1RTDA 4Z0UA 1A5WA 3KJVA 1NK9A 4FM1A 3SUOA 1TVRA 3SUPA 3L2UA 4J2DA 1SV5A 1QQCA 3I8DA 1HNVA 4CEEA 4FLTA 2G8KA 3SPYA 1LW2A 4CJFA 4KB0A 3AVIA 1FKPA 3LAMA 1TAQA 4KV8A 4UQGA 5KI6A 4FJNA 4CEFA 1IH7A 3ZT0A 1BIUA 3LANA 2RF2A 3S3OA 3VQQA 4CJ3A 4DLEA 4DTXA 1KVBA 4CK2A 3QEPA 3DRPA 4DU4A 2QKBA 3AVFA 3VQ8A 4CJTA 3TAGA 3PO4A 2D5RA 4C8NA 2YKMA 4JLHA 3ZSZA 4CJLA 4BDPA 1GOCA 4PUOA 3F73A 3RRHA 4KI4A 2WONA 3O4QA 4CFAA 4CJWA 1WSIA 3QLHA 4BE2A 4CEAA 4CHYA 4DTJA 3ZSVA 1RBSA 1TKXA 1S9EA 4EZ9A 1XHXA 3KKRA 3ZT3A 2Y1IA 4AILC 1SKSA 4B9SA 4I9LA 1U4BA 4FJMA 3V9UA 1ZBHA 2A1SA 3OYAA 1NJZA 3U3GA 4KO0A 4CHOA 5CYQA 1N6QA 4EZ6A 2OPQA 1IKVA 4FYDA 3G0ZA 5J2NA 4KB1A 4CEQA 3LALA 4DQRA 4KFBA 3VQ7A 1Q8IA 1RBRA 4CJPA 3EZ5A 2A1RA 3K5OA 3L2VA 4H8KA 2EX3A 4AHVA 3S9HA 4FZXC 4J2EA 3HJFA 4LY7A 3ULDA 1LW0A 4IBNA 1KFDA 3IRXA 3ZSOA 4GMJB 1BI4A 3PV8A 2Z1GA 3ZSRA 3DLHA 1IKYA 1D5AA 3LWLA 1RT5A 3OYGA 4DF4A 3V81A 3OYIA 3KLEA 1FKOA 3SV3A 3SQ1A 2PZSA 2HHTA 1VSEA 1U45A 3CFPA 4Z4GA 2VG6A 1BHLA 3A2FA 3OS1A 4HVJA 1WNSA 4CFBA 1FXXA 3NGIA 4DTMA 3C95A 1U49A 4CHZA 1TV6A 1C0UA 1S1WA 2YNIA 5T7BA 3DLGA 4K8ZA 2R7YA 4L8RB 4N41A 3D0PA 4FK0A 4Z4IA 3HPGA 1VRTA 1BCMA 3K57A 4B3OA 1LAVA 3AO1A 1K6YA 3CG7A 4IKFA 3ALYA 1SL2A 2Z1IA 3AO3A 2BDPA 3DLEA 1TAUA 4CGGA 1JLFA 4RW9A 4CJEA 4FVMA 3LPUA 2G8IA 4ELVA 1HYVA 4N56A 3OYFA 3O3HA 4IG0A 2B4JA 5K14A 4W5QA 3LDSA 1RCHA 4O55A 4FW1A 2XRIA 4FLUA 2DTUA 1TL1A 1S1UA 2KW4A 1ASWA 2OYQA 3KLHA 1HMVA 4C8MA 2VWKA 3LP3A 3V9ZA 3AA5X 3MXIA 4LSNA 1CLQA 4E7LA 3ZT4A 3VQAA 1TKTA 2YNGA 4OKKA 1ASUA 3TANA 2P5OA 4CF2A 1W9HA 4FJLA 2IOCA 3TAQA 1ZYQA 3IAYA 4BACA 1Y97A 4BWJA 3TWHA 3JYTA 1Q9XA 2OA8A 2HW3A 1L3VA 1T03A 4Y1DA 3T19A 3QO9A 1JKHA 5KRTA 4OLBA 4DSJA 3AVHA 4JS5A 5C24A 1YTAA 2ETJA 5C25A 1A5VA 4OJRA 5HP1A 4FJ7A 4M42A 1B9FA 4M3ZA 3AVJA 3OS2A 4F4KA 1W0HA 1CZBA 4Z4CA 3QEWA 1EP4A 3LAKA 3B6PA 3NF6A 2XY7A 1RT7A 4ZTFA 1XHZA 3AVCA 5E41A 4W5TA 3DOKA 4O0JA 1J53A 4N5SA 1HQUA 3KK3A 4E7HA 5DK5A 1C1BA 1B9DA 3QIPA 1UA1A 2HNYA 4O0IA 1IKXA 3VQBA 1WSGA 4W5RA 4CGHA 1S5JA 3V9XA 3P5JA 3NH2A 1HYSA 1X1PA 3BGRA 4IFYA 3OYDA 1J5OA 1DTQA 2AJQA 3NFAA 3EYZA 4CJUA 3SQ0A 4CK3A 4PY5A 5CZ1A 3KKSA 4BE0A 1BGXT 4B9TA 1NK5A 4RW8A 3O4NA 1WLJA 3FFIA 1JXEA 2G8UA 4FJ8A 1WAFA 1BISA 3U6FA 3V6DA 1NJYA 1A5XA 4LSLA 1S1XA 5HRRA 2DFFA 3HL8A 4CHPA 1FK9A 1C1CA 4ICLA 4B8CA 4OPJA 1WAJA 4E7KA 4HUFA 1VSLA 4CF9A 1ZBFA 1TKZA 3HPHA 4DF8A 3OYEA 3JSMA 3I0SA 5J2QA 1VSJA 4FZYA 4KHSA 4DSKA 4OGCA 4DQIA 4DFPA 3ZSXA 3SCXA 1VSIA 1VSFA 4I9QA 1LWFA 1JXBA 1J9AA 5DMRA 3VQEA 1Z26A 4LD0A 4FM0A 4C8LA 4J2BA 5J2MA 3SNNA 2IDOA 4TSXA 3V9WA 2BE2A 3S3MA 3RRGA 2HHWA 3SPZA 4C8KA 5D3GA 2VG5A 4KHQA 3VN5A 3ZSYA 4CECA 4CF1A 3C94A 2E6LA 3AVKA 1TGOA 3HO1A 4FXDA 1HJRA 3NH1A 4W5NA 3BDPA 1TK0A 4DS5A 2GUIA 2GV9A 4JRQA 4CF0A 3QNOA 1HQEA 2F96A 4OKJA 3V1OA 1RTJA 4B9NA 3ZT1A 1IO2A 1RTIA 3OYCA 4FLZA 2X6SA 2YNHA 3DI6A 4FW2A 3NF8A 2OZSA 4O5BA 4LH5A 3LZIA 3MAQA 1EXQA 4M3YA 4HUGA 2F8TA 3OYBA 4DSEA 5EU7A 2OPRA 2WOMA 4NCAA 1JLGA 5HLFA 3ISNC 1RDAA 1KLNA 2YKNA 4KHYA 2HVIA 2IS3A 3RTVA 3HVTA 4M3RA 3HPOA 3T3FA 3HVRA 4KHUA 4DLGA 4J2AA 2B5JA 4ID5A 3SZ2A 3ZT2A 3QESA 3VQ6A 3B6OA 1I39A 2RPIA 2HVHA 3TI0A 1C1AA 3VQCA 1B92A 3DRRA 3WNGA 1KLMA 1T05A 2E4LA 3P1GA 4I2QA 3NH0A 1XI1A 3PX0A 1KTQA 1BQNA 1EKEA 3K5NA 3V4IA 3OYHA 1KVCA 3ITHA 1DTTA 2IC3A 4B8AB 4CFCA 4Q5VA 1L3SA 4E89A 4KTWA 3LZJA 3L3VA 2Y1JA 3D45A 1UA0A 1WSFA 1NJXA 5FRNA 3ZCMA 1F21A 5KGWA 2HNZA 1JLQA 3HSTB 4PA1A 3ZSWA 4B9UA 2ZD1A 4RW6A 2IAJA 1BQMA 4E7IA 1SKRA 3DLBA 4CEBA 4DQQA 4JS4A 1S1VA 1TL3A 3VQPA 1WSEA 3AO2A 3MECA 1NK6A 2XY5A 3NDKA 1X9WA 3G10A 4FJHA 1KVAA 4CEZA 4CHQA 4LH4A 1LV5A 4F2RA 1L5UA 3AVAA 3O3GA 1XWLA 4HHTA 2LSNA 1S6QA 5CY4A 2ZE2A 1Q9YA 4FJ5A 1CZ9A 4N47A 1NKCA 3SYZA 1BI4B 2D0AA 3AVLA 4H4MA 3V1QA 3KK2A 3TAPA 3KLGA 2FC0A 1ZBLA 1C6VA 1D8YA 1U04A 4C8OA 1RTHA 2Q3SA 1S6PA 1TK8A 1YT3A 4CK1A 1R0AA 2VWJA 5KRSA 3NGYA 4E7JA 2D0BA 3V9SA 3LP1A 1YVUA 2W42A 1NK4A 4IDKA 3HXMA 4HCBA 1YTUA 4GW6A 2YHBA 4FCYA 3AO4A 3HT3A 5KGXA 3UIQA 2KFZA 2QK9A 3AO5A 1RNHA 2FBYA 1KSPA 4K8XA 3NF7A 1CXUA 1NK0A 2ATQA 1GOAA 4AHRA 4CJSA 4OVLA 3DMJA 3KLFA 3OY9A 3WNHA 4O4GA 1ITGA 4CIGA 4OLAA 3PY8A 2Z1JA 4BDZA 2VG7A 3OYNA 2P51A 3DRSA 4ID1A 4DTRA 3CFOA 5SWMA 1WN7A 2RN2A 3HK2A 4NYFA 1HYZA 2BANA 5I42A 1VSHA 1J54A 4FLWA 1TK5A 4QCLA 4CEDA 4QOZB 3M8SA 4M3WA 4OGEA 3AA2A 3VQ9A 2F8SA 5FRMA 1XC9A 1L3UA 4M3TA 3OYMA 4CJRA 4AHUA 3RWUA 4BDYA 4EP4A 3QEVA 1SUQA 1RT4A 4RG8A 3TARA 3PUFA 3IS9A 3CYMA 3VQ5A 3HP9A 3RMAA 1SL1A 4RW7A 2DFEA 1RT6A 2DFHA 4BWMA 1HRHA 5HRNA 4CJ4A 3MEDA 1LWCA 4DTSA 4M41A 3OYJA 4CJKA 3TAEA 4DSIA 2O4IA 3NHGA 1S1TA 3O3FA 4W5OA 2HNDA 3H08A 4MFBA 2KZZA 3WNEA 4IFVA 2GBZA 2Z1HA 1CXQA 1QE1A 2KTQA 3VQDA 4F2SA 4BE1A 4DTNA 1UOCA 3OVNA 3U3YA 3QIOA 2KQ2A 4F8RA 3WNFA 1SKWA 4KHNA 4KKOA 3NE6A 5HBMA 5JS2A 1VRUA 4QAGA 1I3AA 2YV0X 2EHGA 2RKIA 3DLRA 3MEGA 3TAMA 4CF8A 4E1MA 3VQ4A 2HHUA 1NOYA 3V1RA 3KIOA 3M8QA 5HRPA 1VK0A 4F3TA 4FZZA 3QEIA 3K59A 4B9MA 3TAFA 4N76A 2HHQA 4FJXA 3M8PA 1C0TA 3L2QA 2O4GA 3RMCA 3MXMA 1D9DA 2HMIA 1NK7A 4Z4HA 4DS4A 4PQUA 3HP6A 3SQ4A 2JLEA 1LAWA 4MQ3A 4CJ5A 4DSLA 2IGIA 1VSMA 3L3UA 4DTUA 1WSJA 4ZTJA 4GVMA 4IG3A 4ELTA 2KFNA 3NCIA 2P1JA 4DSFA 1BCOA 1EX4A 3QINA 1JLAA 3MEEA 5FROA 3NAEA 1L3TA 2G8FA 4DQPA 4KPYA 1EETA 3NBPA 3LPTA 3M8RA 3SJJA 4CGDA 3QNNA 4FJIA 1S9GA 4DU1A 3LWMA 3DLKA 3EY1A 2XHBA 3SV4A 2ZQBA 3AVNA 2PYJA 4FJKA 4CHNA 3HM9A 1QHTA 3OYKA 3TABA 1GOBA 1RT1A 3RR7A 4CFDA 3CFRA 3L2RA 4WE1A 4H4OA 4KTZA 1Z25A 5J2PA 3QERA 1KFSA 4DQSA 4DU3A 3NF9A 4CEOA 4JRPA 1ZBUA 4FJJA 1LWEA 3DM2A 3T1AA 3AVBA 2FBXA 3THVA 3CQ8A 1NK8A 1C0MA 4AHCA 4FK4A 1NJWA 3CM5A 3L2WA 1G15A 4KI6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DR4K 2FSJA 1HNIA 4DFMA 1QSYA 3OJSA 3CF5L 2JWLA 3G4SN 1ILYA 4E1NA 3ATVA 4KTQA 4EHTA 1UWBA 4DFJA 2OZMA 2E6MA 5BREA 2QWMA 1U6ZA 3L6QA 3VTIA 5GIOA 3KLIA 5LMNK 4CGJA 3C6UA 5BN9A 3THXB 2O8CA 4FJ9A 2V7YA 2HHVA 3CJ1A 3CPWM 4RW4A 4RCHA 2G8WA 4DKWA 3AA4A 1YJ9N 2OPPA 5HROA 4MDAA 1HNWK 1VSKA 1RT3A 4R5PA 2HF4A 4WFAL 3K5MA 4CD3A 3L4QA 1BOTO 5C42A 3IG1A 2H3GX 3SUNA 4I7FA 4NYNA 4DG1A 1NU0A 4L3QA 1WSHA 2D0CA 4J8FA 2VWBA 4ILJA 3OYLA 4YNQA 4F3OA 1O1WA 1QTMA 2B6AA 2NZTA 1GLBG 5HRSA 5H1SQ 3SI6A 3MMVA 3BF3A 5M1KA 4H0PA 4OPKA 4Q0BA 2E88A 4EHUA 3DOLA 4E19A 4PHTX 1YJNN 3A8YA 5AQIA 3LL3A 4CJQA 1SL0A 3WXKA 4PKIA 1RDDA 4AHSA 3NGZA 1RDCA 3PX4A 1QS4A 2ZJRL 2E1YA 2G8HA 1VAZA 1JL1A 1KRPA 3QETA 4JNEA 3FZMA 1Z05A 2P5GA 4JD2B 5CYMA 1NOZA 3PX6A 2X78A 3D2FA 3CI5A 4M7YA 4JI1K 3J7ZO 2HBLA 4B1ZA 3HZ6A 3QEXA 3CMEN 3WEEB 3ULEA 5BPMA 3OBWA 1QVFM 3L2UA 1BDGA 4LC9B 1QQCA 3T7ZA 3SPYA 4FWRA 1IH7A 3ZT0A 4CJ3A 4BQZA 4DTXA 4CK2A 3DRPA 3TAGA 5LL6Z 3NMUA 5FPDA 2D5RA 4H5WA 3ZX0A 3QFPA 3A5NC 4BDPA 3F73A 3RRHA 2WONA 4U7BA 2GTDA 4CHYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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