2RN2A

Structural details of ribonuclease h from escherichia coli as refined to an atomic resolution
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
publication title Structural details of ribonuclease H from Escherichia coli as refined to an atomic resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1992-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2rn2A00
3S3NA 4AHSA 4M3RA 5KRTA 4FZZA 1BQNA 4ZTFA 4W5RA 4O0IA 3LZJA 3AA5X 4BDPA 4KB1A 1XHXA 2EHGA 3ZT4A 3TAFA 2FBYA 3CG7A 1B9DA 3TWHA 3KJVA 1QSLA 1XI1A 5FRNA 1EETA 1YVUA 1K6YA 1S9GA 4JLHA 1ZBIA 4CJLA 3L8BA 4NCBA 4W5TA 1TK5A 5C25A 4FM0A 3L2QA 3HK2A 3QEVA 1C0TA 3ISNC 1JLGA 3ZT3A 3V9WA 4IFYA 1WAJA 4K8ZA 1B9FA 4FW1A 3OY9A 5C24A 3HL8A 4AH9A 3V6DA 4BACA 2G8WA 1CXUA 3HPHA 1LV5A 3SUOA 3K59A 1J9AA 3NDKA 4KHNA 2PYLA 5KI6A 1QSYA 1WNSA 3PUFA 3OYIA 3JYTA 4KFBA 4DQQA 3QEXA 4B9MA 4FZYA 4C8NA 2Z1JA 4HCCA 1ASUA 1B92A 1RDCA 1EP4A 3CYMA 4Z4IA 2HHXA 3FFIA 3KD1E 4RG8A 1GOBA 1C1BA 1KVAA 3LALA 3NBPA 4YNQA 1RTDA 4DTPA 2HHQA 3VQ4A 4FM1A 3HO1A 3P1GA 5CYQA 1TL1A 4LH5A 1RBTA 4DF8A 1I39A 5DMRA 4JRQA 3QEWA 1BI4A 2YKMA 3SUPA 4CGFA 1RT4A 2P5OA 5HRNA 3ASMA 1BCOA 4AILC 4O44A 4CJSA 3D0PA 1N6QA 3A2FA 1G15A 1S5JA 2O4IA 3AA2A 3RR8A 3ZT2A 4N41A 2AJQA 2X78A 2HNDA 4RW8A 1KSPA 3RTVA 5FROA 5JS1A 4CIFA 2X6NA 4DLEA 4B9UA 4EZ9A 3AVHA 4ELVA 4KHSA 5DK5A 4M3WA 4DG1A 2OA8A 3SUQA 3NGIA 4NYNA 2Y1IA 1KLNA 1NKEA 4OGEA 1SUQA 1IKXA 3LPUA 4ID5A 1S6QA 4RW6A 3NGYA 4CEBA 3DOKA 4CFBA 1U47A 1X9SA 4DSJA 2A1RA 3OYMA 4KHQA 2DFHA 3F9KA 4AHCA 3KLIA 4CJWA 3HVRA 3SZ2A 1UAXA 1JXBA 4NCAA 4H4OA 3HJFA 4CFDA 4KHWA 4DSEA 2YKNA 3TAPA 3K5MA 4FLWA 4ID1A 3TARA 4CEAA 4OKJA 4I2PA 3C6UA 4DSFA 2KTQA 2YNIA 1HNIA 1U45A 4M3XA 4CEQA 4IDKA 3QIPA 4FVMA 5CYMA 1HQEA 4CJTA 4DFPA 3QNNA 3CQ8A 1YTAA 3KK1A 4LH4A 4OJRA 4CERA 3AVMA 1HYSA 4AHVA 2G8VA 2G8IA 2RKIA 3VQ5A 5SZTA 1HJRA 3L2VA 3M8QA 1T05A 2W42A 3S3OA 3ZSXA 4AHTA 3OJSA 1KTQA 4BE1A 5J1EA 1BQMA 3QEIA 2XY7A 1HNVA 3NH2A 4FLYA 1WSFA 4Z0UA 4HCBA 4K8XA 4C8KA 1IKYA 4DSIA 4KTQA 3TABA 4KHYA 3HPGA 1VRTA 1KLMA 3PV8A 3QESA 3HSTB 4DTMA 1JLCA 4M42A 1S6PA 3QLHA 2IGIA 2VWJA 3AVCA 2HHWA 3SCXA 3SQ0A 1WLJA 4DSKA 1VSKA 1JLQA 4F3OA 3U3YA 1RBSA 4E1MA 5HBMA 3DLRA 3OYBA 3ULDA 4E7JA 1VSJA 4LY7A 2FBXA 1JXEA 1RILA 2OPSA 3M8SA 4FLXA 4DQPA 1JL2A 2HVIA 4G1QA 1NK5A 1SL2A 4E0DA 2RF2A 3PX6A 4CHYA 4CF0A 3NF9A 4YFUA 4J2EA 3VQEA 1JL1A 3ZSWA 3BDPA 4KRFA 3OS0A 1Q9XA 4CJKA 3OYGA 4QOZB 2OPQA 3LP1A 2JLEA 4DS5A 1NK0A 3NHGA 3O3GA 3C94A 3TI0A 3AVFA 3ITHA 2KFNA 4DTNA 3K5OA 1BI4B 4M3YA 1I3AA 1TKXA 2RPIA 3NH1A 3HT3A 4BE0A 4GVMA 1KFSA 4CGJA 3K5NA 1N5YA 3DRSA 4FJJA 2KZMA 4F8RA 2PZSA 1NKBA 4FJLA 2XRIA 1DTTA 4DSLA 4CEZA 2F8TA 1C6VA 1WN7A 4DWIA 2XY5A 4RW9A 1SKRA 4W5NA 4FJMA 4KTZA 3VA3A 2HHTA 3VQBA 5KRSA 3VQ9A 3ZSOA 1IKVA 2NUBA 3SUNA 1TV6A 4Z4HA 4RW4A 3KLHA 2ETJA 1ASVA 1TGOA 3OS1A 1WSGA 2P51A 1WSJA 3NCIA 1J53A 4CCHA 3IG1A 5J2NA 4PUOA 5J2QA 3HXMA 3V9ZA 4ZTJA 4FYDA 1NKCA 5J2PA 1L3SA 3VQDA 4DTRA 3EZ5A 4B9VA 3KD5E 4B3OA 5HRSA 2D0CA 3MAQA 3K2PA 3MECA 3ZSQA 3AVGA 1NK9A 1R0AA 5JS2A 1YTUA 3ZCMA 4OGCA 3OJUA 4H4MA 4J2BA 4FW2A 4N76A 1VRUA 2DY4A 1WSEA 4FZXC 4O55A 4C8LA 1CLQA 1RBVA 4CF8A 1KFDA 3AO3A 4E7IA 3QNOA 4DQRA 4CJ5A 1ASWA 3V81A 4FJ5A 1QSSA 1DTQA 3LP2A 4M3UA 1TKDA 3DLHA 2EX3A 4CHZA 4OPJA 4E3SA 5J2MA 1KCFA 2ITGA 3AVBA 3KIOA 2I5JA 3TAMA 4ELUA 3H08A 1RBRA 3DOLA 3RR7A 3VA0A 4O4GA 4F2SA 4FJIA 4DU4A 3NF7A 3NF8A 4I7FA 3KK3A 4LSNA 4CF1A 4HUGA 4KO0A 4C8MA 3RMAA 4GMJB 4E19A 1X9MA 3OYKA 4FJHA 4MFBA 1TK0A 2YHAA 3WNHA 4GW6A 4CEFA 2B4JA 3WNGA 1VSFA 3D45A 4JS5A 4BDZA 1NOZA 3OYEA 1RT6A 3T1AA 4B9TA 4Y1DA 2HHSA 3V9UA 2OPRA 3LP0A 4I2QA 4RW7A 3VQCA 4MQ3A 3NH0A 1S1WA 3SQ2A 5CZ2A 1QS4A 4CJ4A 3VQ6A 2VWKA 2YNGA 3IRXA 1QE1A 1HPZA 1RDDA 3QERA 1IG9A 4FXDA 3DI6A 4FCYA 3THVA 4FJ9A 1Z25A 4M41A 1WSIA 4CHQA 3VQ7A 2XY6A 3AVLA 4E89A 3PX4A 2FC0A 3VQ8A 1VSHA 4B9NA 3RWUA 3L2WA 2IS3A 1XHZA 1FKPA 4E7HA 1JKHA 3AVNA 4HUFA 1ZBHA 2FBTA 1GOCA 3MEGA 3I8DA 4CIGA 1SL0A 4CHNA 1ZBUA 4W5OA 3EYZA 2OZMA 1MU2A 2YNHA 1D5AA 1W0HA 3ZSYA 3WNFA 3TANA 3CM6A 2E6LA 2OZSA 5CZ1A 3ZSVA 3O4QA 3OYDA 2G8KA 4O5BA 3O3HA 4F2RA 3M8RA 4DTSA 4FJ7A 3O3FA 1HQUA 2XHBA 3TAEA 1RBUA 4M45A 3KK2A 4FLVA 4DQSA 3U6FA 3KLFA 4CGHA 4EP5A 3V1RA 2OYQA 1VK0A 4BWJA 4CIEA 1WSHA 5I3UA 4HVJA 1RT7A 4OVLA 3KTQA 2BGGA 2PY5A 4M3ZA 1BISA 1S1UA 4CHPA 5C42A 3K57A 1TKZA 1SL1A 1X9WA 3LWLA 3L2UA 1A5XA 1HYVA 1D8YA 2WONA 1S1TA 1YT3A 4C8OA 1ZBLA 1O1WA 4CF9A 1TVRA 1NK7A 1D9FA 2YV0X 3OYNA 2Q3SA 3CFRA 4J2AA 5D3GA 1L5UA 2OPPA 1F21A 4DF4A 2DFFA 3RRGA 5KGXA 2HB5A 3ALYA 3U3GA 3UIQA 1BHLA 3VN5A 3JSMA 4IKFA 5K14A 2KZZA 1Y97A 3RMCA 3LP3A 1NK4A 1LAVA 3AA3A 1W9HA 3EY1A 4HUEA 4KI6A 4CFCA 1HYZA 2QK9A 1JLEA 4DLGA 3KLGA 4HHTA 2BANA 4CGDA 2P5GA 1BCMA 5T7BA 2HW3A 3LWMA 1NK6A 1EX4A 3CFPA 3OYLA 4CEDA 1SKWA 3V9SA 4QCLA 4FK0A 3B6OA 1NJYA 4OLBA 4CE9A 3L2RA 2D0BA 1UA1A 1Z26A 3LAMA 1WAFA 4HTUA 1TAQA 4F4KA 4B8AB 4DFJA 3KKRA 3AA4A 4IFVA 4OLAA 1QHTA 3C6TA 4R5PA 1IKWA 4KKOA 4DTJA 4OKKA 4JS4A 4OPKA 3AO4A 1UWBA 4IG0A 3ZSZA 1U48A 1QTMA 2BDPA 1RTHA 3LPTA 3RMBA 2KFZA 5HRPA 4DQIA 1JLFA 4CK3A 3PY8A 2F96A 3SV4A 4UQGA 4CEEA 3HPOA 3VQAA 3MXIA 4EP4A 3AV9A 2DFEA 2IDOA 3SJJA 3SYZA 3S3MA 1NJXA 1LW2A 4J2DA 2G8FA 3HYFA 3DMJA 1BL3A 3T19A 1RT3A 4FK2A 4BDYA 4CEOA 4FLUA 4I9QA 4Y1CA 2BE2A 2RN2A 3NE6A 1LW0A 4L8RB 3HVTA 4KI4A 3LZIA 2O4GA 1JLAA 1VSMA 5CY4A 1U49A 2IOCA 3G0ZA 2KQ2A 4H8KA 2G8HA 2JGUA 4OKEA 4FLZA 2D0AA 4M3TA 1CZ9A 3B6PA 4CK2A 4DTUA 4IG3A 4BE2A 3WNEA 4CJEA 1RNHA 1UA0A 2HNYA 2B6AA 3P83D 1T03A 4Z4GA 2HHVA 1FK9A 3DM2A 2YNFA 3MEDA 1HRHA 1S9EA 3M8PA 1S1VA 3AO2A 3OVNA 3NAEA 4Z4EA 1SKSA 5EU7A 3QETA 3QINA 3IAYA 4DU3A 4DTOA 3PO4A 2WOMA 1C0UA 2P1JA 2QXFA 4N47A 4CJQA 3G10A 3AO1A 4CJRA 1RTJA 1ZYQA 1TL3A 1U4BA 2Z1IA 1D9DA 4CJFA 3AVIA 3NF6A 1KRPA 2E4LA 3V4IA 2E6MA 1J5OA 1REVA 2ZD1A 3SQ4A 3RMDA 4PQUA 3OS2A 1VSDA 3CFOA 4AHRA 3OYHA 1RT2A 4BWMA 1U04A 5HLFA 1EKEA 3ZSRA 3SV3A 3IS9A 4LSLA 3V9XA 1KVBA 2YHBA 3AVAA 1BIZA 2FBVA 1HMVA 3OYAA 3K58A 4KHUA 4DS4A 4CECA 2X6SA 4ELTA 4FJKA 3C95A 4QAGA 4CGIA 3OYCA 4FLTA 3DRPA 4FK4A 3DLEA 3E01A 3V1OA 3MXMA 1FXXA 1L3UA 3DLBA 3AVJA 3ZT0A 4DFMA 1LWCA 4N56A 4KV8A 1C0MA 1A5WA 1RT5A 3CM5A 4Z4FA 2HHUA 5FDLA 1VSEA 3AO5A 2LSNA 3AVKA 1UOCA 4NCGA 4DMNA 3SNNA 4EZ6A 2IAJA 2GUIA 2X74A 1JLBA 3QEPA 2QKBA 4F3TA 2VG5A 2Y1JA 3TR8A 4ZHRA 4TSXA 4KREA 4LD0A 2XO7A 2PYJA 3LAKA 5SWMA 4CHOA 4N5SA 3P5JA 1DLOA 1CXQA 4AHUA 4DTXA 4E7KA 1A5VA 3MEEA 4CK1A 2R7YA 2F8SA 4CJVA 1NK8A 4FJGA 1IH7A 1RTIA 2Z1GA 3NFAA 3KLEA 1QQCA 2KW4A 2QKKA 4DU1A 1L3VA 1LAWA 4KPYA 1TAUA 3ZT1A 2GV9A 4B9LA 3L3UA 5HROA 2VG7A 1T8EA 4IBNA 2D5RA 1XWLA 3DLKA 3I0RA 2ATQA 1RDAA 4Z4CA 1VSLA 2Z1HA 4KTWA 3SPZA 2VG6A 2B5JA 3DRRA 1LWEA 4CJPA 4XIUA 3LDSA 3LANA 2XY8A 4O0JA 3L3VA 4DFKA 4PY5A 1VSIA 3OYJA 1CZBA 1GOAA 1X1PA 1LWFA 4JRPA 1NOYA 5FRMA 1J54A 3PX0A 4B9SA 3KKSA 1S1XA 4CJ3A 1TKTA 1T7PA 3V1QA 4CGGA 3QO9A 3F73A 4PWDA 4I9LA 2HVHA 3MXJA 4Q0BA 3HP9A 1C1CA 3S9HA 3DYAA 2IC3A 4B8CA 1TK8A 4CESA 3O4NA 4FM2A 4CJUA 3T3FA 4PA1A 1Q8IA 3BGRA 5HRRA 3TAGA 1ITGA 3OYFA 2HMIA 4E7LA 1NJWA 1RDBA 3I0SA 1BGXT 1FKOA 4FJNA 1IO2A 5KGWA 1BIUA 3SPYA 3SI6A 4CF2A 4B08A 3VQQA 3VQPA 1KVCA 4ICLA 4W5QA 1RCHA 4KB0A 1L3TA 4E1NA 4CFAA 2ZE2A 2GBZA 3RRHA 3DLGA 3HM9A 1SV5A 1C1AA 2HNZA 1RT1A 3K5LA 1EXQA 1XC9A 4FJ8A 3TAQA 5I42A 1ZBFA 3QIOA 5KTQA 4KAZA 3HP6A 2G8UA 4WE1A 3PO5A 4FJXA 2DTUA 4Q5VA 3NGZA 4NYFA 5HP1A 3SQ1A 2ZQBA 1NJZA 2A1SA 1Q9YA 5E41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AHSA 2Q0RA 5C2DA 4KB1A 4G9ZA 3CCRN 2EHGA 4XH5A 1VQ5N 1DKGD 2VCPA 2GWKA 1K6YA 2PBDA 3HK2A 2VYPA 3VEVA 3HRGA 3WQTA 3V9WA 3GDQA 4IFYA 4JKFA 1SAZA 3M1FA 4AH9A 4BACA 1W97L 3HPHA 3K59A 1J9AA 1O13A 3CJAA 3JS6A 3NDKA 4KHNA 4KFBA 4B9MA 4C8NA 4Z4IA 3KD1E 2V52B 1KVAA 4O8KA 1YUWA 1H1VA 3HO1A 1N8RO 5E84A 4KH4A 5AQVA 3QFPA 5AQJA 5HRNA 4BC2A 5AQZA 4I6MB 1SZ2A 2CH5A 4Z94A 1KQSM 2AJQA 3ULEB 4CIFA 3C6AA 4AM7A 4CBWA 1BDGA 5DK5A 1E3MA 3U8XA 3SUQA 4E1JA 4DV6K 1NKEA 4OGEA 4MLEA 4ID5A 3PSFA 4DSJA 1UAXA 5M1NA 1X3NA 1QQNA 3D2FA 4DSEA 5BRFA 4WCEL 2QI2A 4OKJA 3E9PA 4M3XA 4CJTA 3AGRA 1HQEA 5CYMA 2HHHK 3QNNA 4BRFA 3VF4A 4LH4A 4OJRA 4CERA 5AQRA 3VEXA 1Q86O 2G8VA 2O8BB 3VQ5A 5SZTA 1YJWN 4AHTA 5AQGA 1KTQA 2UXCK 5J1EA 3QEIA 1HNVA 1BWFO 5FPMA 2I7NA 4DSIA 2IVOA 3HPGA 1VRTA 4H0PA 4I6MA 3QESA 1S6PA 2IGIA 2AP1A 3SCXA 1VSKA 1YJ9N 4A2BA 3BP8A 3U3YA 3PIOL 3SBTA 4E7JA 2UYTA 1JXEA 1JL2A 4G1QA 4BRCA 1SL2A 1YJNN 4E0DA 2HF3A 3PX6A 4JHDA 4CHYA 3TSUA 3CMAN 1JL1A 1Q9XA 1S22A 4CJKA 4QOZB 2V51B 5TKWA 4BR0A 1NK0A 2DPNA 3O3GA 3AVFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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