2RN2A

Structural details of ribonuclease h from escherichia coli as refined to an atomic resolution
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
b'MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural details of ribonuclease H from Escherichia coli as refined to an atomic resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1992-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2rn2A00
3VQQA 4CJQA 4OGEA 3OS2A 4CEOA 4DQPA 1S1UA 1ASUA 4I2QA 1T7PA 3KTQA 4MFBA 4AHCA 1C0UA 4E7IA 2B4JA 1QSSA 3PO5A 1KFDA 3K59A 4GW6A 4K8ZA 3L2QA 2OYQA 1L3UA 2DFFA 5EU7A 3SQ1A 1U04A 4M45A 2FBVA 3ZCMA 3JSMA 1JXBA 4E7KA 1NKBA 1B9DA 5KGXA 3VQEA 4DTMA 3AA3A 3K2PA 1IKVA 3MXJA 4FM2A 4DQSA 1U4BA 3DOKA 3L2UA 4HUFA 1RTHA 4KTWA 4Z4FA 3VQBA 4E1MA 5KI6A 3TAEA 5J2NA 1S6PA 3RR7A 4QOZB 4DSLA 5FRMA 4FLZA 3ZT3A 3HPHA 1XI1A 4FJNA 1NK5A 4FK0A 3QNOA 1XHZA 4DQQA 1S5JA 1ZBLA 2ZQBA 5C25A 5K14A 3SQ0A 1CXUA 1JLCA 2YKNA 1K6YA 1I39A 1SKRA 3NF6A 3FFIA 2OA8A 2R7YA 4NCAA 3ZT2A 1JLGA 1J5OA 2PY5A 3PV8A 2HB5A 4M3RA 2ZE2A 4QCLA 1TL3A 2P51A 4K8XA 1S9GA 3ZT4A 3S9HA 1SL1A 1HQUA 1BGXT 1S6QA 3TAQA 4CK1A 1RNHA 2P5GA 1S1XA 3QIPA 3QINA 3AO5A 4CFBA 1WSHA 3NFAA 5C24A 3OYLA 3ZSWA 1WNSA 3BGRA 3V81A 4ICLA 4B3OA 4FYDA 4CEDA 3MAQA 1SV5A 4BE0A 3H08A 3AO2A 4B9NA 2YNHA 4LSNA 1VSJA 1LV5A 3KK1A 3L2VA 3TR8A 1LAVA 3EYZA 3L8BA 2W42A 3K58A 2XY7A 1QQCA 1Y97A 3KJVA 1LWCA 4B9UA 1ZBUA 5C42A 4CGFA 4DF4A 1D9FA 1BIZA 2LSNA 3RMAA 3V9UA 4F4KA 4B9TA 3NH0A 1ZBHA 2KZMA 1S1WA 3ULDA 4IFVA 3RTVA 4L8RB 1Q9XA 4DTUA 1JXEA 3CM6A 2E6LA 2QXFA 3ITHA 4ID1A 3AVMA 1EP4A 3OYMA 2Y1JA 4M3TA 3DYAA 1NK4A 1R0AA 1GOCA 2XY8A 3NH2A 4CJRA 3LAKA 3OS0A 3VQ6A 2VG5A 2XY6A 1X9MA 2HHSA 4PWDA 3C6UA 3NE6A 4M3YA 2HVHA 3K5NA 1HQEA 4J2BA 3MXMA 4CF0A 4CK2A 1IKXA 3OYHA 3IRXA 3CYMA 2G8HA 4DFMA 1SKWA 3T1AA 3AO3A 4F2RA 3QNNA 3AVLA 4FXDA 3QEIA 2OPSA 2O4IA 2IS3A 3HVTA 4CGDA 4ELUA 4CF9A 3OYIA 4ZTJA 3KK2A 4M3UA 4AH9A 4C8MA 1HYVA 3HM9A 3O4QA 1BISA 4C8NA 4CJTA 1BCMA 4FLYA 3SUQA 2JLEA 1HMVA 3VQCA 4CFCA 1EX4A 2P1JA 3WNHA 3HT3A 2E6MA 4E89A 3V1OA 3DRRA 3G0ZA 4H4OA 4JS4A 1TVRA 4LD0A 3CQ8A 3MEDA 2YNFA 4Y1DA 4Z4EA 3IS9A 2HHXA 1NJXA 3HPGA 1XC9A 1KLMA 2Z1GA 3AVFA 4E1NA 3CM5A 3DLGA 1RCHA 2Z1IA 5CZ2A 4E7LA 1F21A 4DSEA 3NGYA 1TKTA 3SYZA 3LDSA 3PX0A 1X1PA 1NK6A 4OLBA 2HHVA 2PYJA 3C6TA 3OJUA 1UWBA 4M41A 1NK0A 4FZYA 3QEVA 4FW2A 3ISNC 4DTJA 4Z4HA 4DFJA 4EZ9A 4OKEA 1W0HA 1RDDA 1LWEA 3DMJA 1BQNA 3TAGA 3C95A 4ZTFA 4FJIA 1C1BA 3ZSQA 3AVGA 3M8PA 4O44A 2Z1JA 2HNZA 5HP1A 3OVNA 2D0BA 3A2FA 3ZT1A 3VQ5A 1KFSA 3G10A 4CJLA 3NCIA 3SCXA 1GOBA 3V9ZA 1JL1A 1RDCA 1BI4A 3LP2A 3U6FA 1FK9A 4W5OA 4DTSA 4FZXC 1FKOA 3KD5E 1RBTA 4RG8A 3KIOA 5CYQA 1NKEA 2YHAA 2HNDA 4CGIA 4CJVA 4DWIA 1B9FA 1RT5A 1MU2A 4FJMA 1VSFA 3OJSA 3LP0A 4BDPA 4ELVA 3I0SA 5FDLA 4E0DA 2VG6A 3AA5X 2KW4A 1IH7A 4N5SA 3M8SA 4KFBA 1X9WA 1RTDA 3QEWA 2WONA 1LWFA 4M42A 5J2MA 3RMBA 4FJHA 3AA2A 3O3GA 3VQDA 2RF2A 5DMRA 4M3ZA 3T19A 4BDYA 4KO0A 4CGJA 3LZIA 4B8AB 1TK0A 1WN7A 1RT6A 2XY5A 1L5UA 2KFNA 4IBNA 1U47A 4UQGA 1EETA 4NYFA 4OPKA 2PZSA 1NKCA 1HNIA 2JGUA 4CECA 3EZ5A 3SI6A 1SL0A 1Q9YA 5SZTA 4CCHA 4KHYA 1X9SA 1VSKA 4BWMA 3RRHA 4J2EA 3QERA 2VG7A 2RN2A 1J53A 4OGCA 1W9HA 2FBTA 4DS4A 3LP3A 3ZSZA 2P5OA 2G8IA 4HCBA 1NK7A 4CF1A 5HROA 2X6SA 1TAUA 3DM2A 3AVAA 1ZBIA 2KZZA 3V1QA 1RT7A 4HVJA 4KTQA 1YT3A 4CFDA 1VK0A 3EY1A 3VQPA 2D0AA 4DFKA 1Z25A 2A1SA 3KLEA 3HP6A 1RTJA 1WSFA 3LWLA 2BANA 4NCGA 3RWUA 3P83D 4OVLA 4HCCA 3ZSRA 1IKWA 2XO7A 4MQ3A 3OYCA 4YFUA 3TI0A 3AVNA 4O55A 3RMDA 1TKZA 4RW8A 3NF9A 1HPZA 3KK3A 4J2AA 4CHYA 1CXQA 5HLFA 3UIQA 2F8TA 1ITGA 2OZSA 1NJYA 4CHPA 1B92A 1ZBFA 1U45A 4Z4GA 2FBXA 4H4MA 2B5JA 4FCYA 4W5NA 3SV3A 3KKSA 3MECA 3VA3A 3ALYA 3V1RA 4W5RA 3ZT0A 4DFPA 5JS1A 3O4NA 4HHTA 4KRFA 2KQ2A 1SKSA 4Q5VA 1L3SA 3NAEA 2PYLA 3LP1A 4CJKA 3D0PA 3KKRA 3KD1E 1WSEA 2I5JA 3CFPA 4FJ7A 2DY4A 3LAMA 3V4IA 1VSHA 1RDBA 3HP9A 4TSXA 5SWMA 3L2RA 2HHQA 1QHTA 4DSIA 2HVIA 3VQ7A 4DU1A 3F73A 3TAPA 1DTQA 3HYFA 4CJFA 1DTTA 4IFYA 1UAXA 4FJJA 2Q3SA 4C8KA 2G8FA 3BDPA 3ZSXA 2KTQA 3P1GA 1JL2A 1FKPA 3AO1A 4B08A 3O3FA 1DLOA 5CZ1A 1JLEA 2DFHA 2ETJA 1WSJA 3DLHA 1ASVA 1LW2A 1VSLA 4CEFA 3VQ8A 2G8WA 1JKHA 4LH4A 3SQ4A 2WOMA 4CJSA 1SL2A 1NK9A 4Z4IA 3DLBA 3NGIA 3U3GA 1LW0A 3QETA 3ASMA 3E01A 2YNGA 1JLQA 5T7BA 3OYAA 2FC0A 4E3SA 4B9LA 5KRSA 4O5BA 3SJJA 1CZBA 1NOZA 1HNVA 4J2DA 4PY5A 3QIOA 4KREA 3WNGA 4CHQA 5CYMA 3QEPA 1LAWA 4DS5A 3TANA 2Z1HA 1T03A 4IDKA 4CEBA 4Z4CA 5JS2A 3THVA 2X78A 1BHLA 1VSEA 4IG0A 2IC3A 4CHZA 1U48A 2HMIA 3VQAA 4IG3A 4CHOA 3LPUA 2BGGA 2QK9A 4FLVA 3SZ2A 3NF8A 2BDPA 4B9VA 1HYSA 1FXXA 3DLEA 3OYFA 1KVBA 4N41A 4Q0BA 2HHUA 4CEQA 4DTXA 1N5YA 3K57A 4OLAA 1BIUA 3AO4A 4CJ5A 1TK8A 4ZHRA 1KVAA 3RMCA 3QO9A 4EP4A 4DU4A 4RW4A 4F2SA 3TAFA 4LH5A 3TABA 1GOAA 1BQMA 3SUNA 1Z26A 1BI4B 1ZYQA 3JYTA 4CF8A 1QSYA 4ELTA 4IKFA 3HO1A 1HRHA 3HL8A 1VSDA 3L3UA 3SPYA 2VWJA 1U49A 1C0TA 3K5MA 3MXIA 1RBVA 3AVBA 1RILA 3D45A 1IKYA 2OPRA 3ZSYA 2HNYA 4F3OA 3AA4A 4KB1A 4N47A 4FJ8A 1RBUA 4BACA 1UA1A 4DTPA 4FJ5A 3VQ9A 1S1TA 1D5AA 3V6DA 4DSJA 3AVKA 1RT3A 3SQ2A 1JLBA 4KHUA 4CE9A 3DOLA 4BE2A 4AILC 1YTAA 3I8DA 4HTUA 4DQRA 1RT2A 1TV6A 4AHUA 4CIEA 4CEZA 3NGZA 1Q8IA 2X6NA 4FK2A 3B6PA 4OKJA 2FBYA 4E7JA 3C94A 4CGGA 3SUPA 4KAZA 3LANA 4CESA 2AJQA 3S3NA 4JRPA 4GMJB 4G1QA 4AHTA 2G8UA 1XHXA 2F96A 5HRSA 3OYKA 2YHBA 4LSLA 3HXMA 4FM1A 3DRSA 3IAYA 5HRPA 3V9XA 1RT1A 4I2PA 2YKMA 4H8KA 4KI6A 3NHGA 3NF7A 4BE1A 1C1AA 1J9AA 4KHQA 4FM0A 4FW1A 4CERA 3DLRA 4NYNA 1XWLA 4F3TA 2HW3A 3CG7A 4RW9A 4AHRA 2IAJA 4HUGA 1CLQA 3RRGA 2DFEA 3OYDA 3TAMA 3V9SA 3VN5A 1KCFA 1KVCA 4CEEA 2DTUA 3SV4A 2HHTA 4FLWA 3OY9A 4KTZA 4B8CA 4O0IA 4HUEA 2F8SA 2D5RA 2BE2A 1KLNA 3PO4A 4YNQA 5KRTA 1CZ9A 3ZSVA 1RBRA 3AVIA 3AV9A 2EX3A 2RKIA 3M8RA 2GBZA 4OPJA 2OPQA 4O4GA 3SNNA 4KHWA 1WSIA 1VSIA 1WSGA 1L3TA 3VQ4A 1RBSA 2X74A 4R5PA 4FVMA 4DLGA 5I3UA 3AVCA 1YTUA 1EKEA 4F8RA 3HVRA 3MEEA 4Z0UA 1T8EA 4CJ4A 1NOYA 1KSPA 1HYZA 5HRRA 4BDZA 4DF8A 1N6QA 1IG9A 2QKBA 4KV8A 1S9EA 3S3OA 4OJRA 4CEAA 4PA1A 2XHBA 1NK8A 4N76A 1KTQA 4N56A 2ZD1A 1KRPA 5FROA 3LZJA 5J2QA 1D8YA 3OYJA 4JS5A 4FJGA 4FJ9A 1TK5A 4FJLA 1ASWA 3PX6A 4KHSA 1I3AA 4FLXA 4Y1CA 4DU3A 1WLJA 4CHNA 3RR8A 4FJXA 1J54A 3DI6A 1BCOA 1HJRA 2Y1IA 4C8LA 1A5WA 3LWMA 4CIFA 2GUIA 4ID5A 1G15A 3WNEA 1BL3A 3PY8A 4M3XA 4KHNA 5HRNA 5I42A 4EP5A 4C8OA 3DLKA 1WAFA 4DTRA 4AHVA 3O3HA 4I9LA 1YVUA 2B6AA 2XRIA 3M8QA 4E19A 3OYEA 3QESA 1NJWA 4CK3A 1TKXA 2D0CA 3QLHA 5J1EA 4DMNA 4DLEA 4CF2A 4CJUA 4W5TA 4KKOA 3IG1A 3KLGA 3NDKA 2YNIA 4B9MA 4W5QA 1QTMA 4KB0A 1WAJA 4FK4A 3L3VA 1QS4A 2ITGA 1O1WA 3NBPA 4M3WA 2G8KA 4CJPA 3LPTA 2GV9A 4DTOA 1VSMA 2OZMA 2IGIA 5CY4A 1S1VA 3TARA 1EXQA 4FZZA 3CFOA 5E41A 3WNFA 4QAGA 4BWJA 1UOCA 3KLHA 2VWKA 2IOCA 3TWHA 3U3YA 1A5XA 4I7FA 1UA0A 3AVJA 2NUBA 4RW6A 4FLUA 3K5OA 4KI4A 1A5VA 1IO2A 3KLIA 1JLAA 4EZ6A 3SPZA 4DTNA 1QSLA 2EHGA 3B6OA 2G8VA 4NCBA 4CJWA 4CJ3A 4CFAA 4KPYA 1TGOA 3CFRA 3AVHA 1C1CA 4XIUA 4DSFA 3K5LA 2OPPA 3OYGA 3I0RA 3HPOA 1RTIA 1REVA 2QKKA 3F9KA 3PUFA 4GVMA 1C0MA 3KLFA 4JLHA 5DK5A 1TAQA 1T05A 2E4LA 2IDOA 2KFZA 3V9WA 5D3GA 5J2PA 5HBMA 3L2WA 4DSKA 3T3FA 3PX4A 2RPIA 3OS1A 4I9QA 3HSTB 4O0JA 1D9DA 3MEGA 4FLTA 2ATQA 1VRUA 3HK2A 3DRPA 4B9SA 3P5JA 1RT4A 4RW7A 3HJFA 3ZSOA 1C6VA 1VRTA 3LALA 4CJEA 4PUOA 1L3VA 5KGWA 4CIGA 4E7HA 4JRQA 1NJZA 4DQIA 4WE1A 3QEXA 5FRNA 2O4GA 3OYBA 5KTQA 3OYNA 4DG1A 1QE1A 1TKDA 4FJKA 3SUOA 1JLFA 4OKKA 4PQUA 4CGHA 3NH1A 1RDAA 2A1RA 4LY7A 2HHWA 1SUQA 3VA0A 3S3MA 4AHSA 1TL1A 2YV0X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VEOA 1NJIO 4H5NA 1ASUA 1K73O 1C0UA 4E7IA 2B4JA 1W97L 3MWTA 3K59A 4GW6A 4KH6A 3MX5A 1U04A 3HRGA 2FBVA 3ZCMA 3E1YA 4DTMA 2W40A 3AA3A 3K2PA 1IKVA 1TUYA 4DQSA 3CMAN 4KTWA 3K0SA 1NGCA 4Z4FA 3VQBA 4E1MA 4FWOA 2ZJPL 3FZLA 2A6AA 3RR7A 4B3TK 1S5JA 3O6WA 1ZBLA 5K14A 1JLCA 2R7YA 3P31A 1NM1A 2BH1A 2PY5A 4JI2K 4M3RA 1NG9A 2UXBK 4BY9C 4PKHA 1HQUA 3CJCA 1Q86O 5F2RA 2P5GA 1S1XA 1D4XA 5C24A 3EN9A 5BN9A 2P9UB 3ULEA 4X62K 3MN7A 4B9NA 1QQMA 2YNHA 5C10A 3L2VA 4BR7A 4LFBK 1IBMK 3K58A 3QBWA 3MX2A 3THXA 1C0FA 4B9UA 4DF4A 4ISEA 1BIZA 2LSNA 3V9UA 2KZMA 3Q7BA 4FWPA 3LDPA 4GKKK 3SAHA 1XNQK 3ITHA 5BN8A 2NRRA 4M3TA 2XY8A 4LF9K 4WQ4A 2VG5A 2XY6A 1X9MA 2HHSA 4DKWA 4CK2A 3CYMA 4DFMA 4F2RA 1VQKN 4FXDA 4JKCA 2OPSA 4JHDB 4DR5K 5HL7L 3KK2A 2FSKA 4H5VA 4RWTA 3O4QA 4FLYA 1HMVA 3O9UA 4CZGA 1OH5A 2E2OA 2P1JA 3WNHA 1G99A 4ILHA 2E6MA 1VQ7N 4DV3K 4DR6K 4LF7K 4H4OA 5TKYA 3C6HA 3CQ8A 3MEDA 4KBOA 2RHKA 3MN5A 4DCHA 1QVFM 5AQIA 4E1NA 3CM5A 2Z1IA 3CXCM 2W6LA 3UKUB 3NGYA 3R3LA 4YOTA 3LDSA 2HHVA 1X1PA 2VCPA 4FSVA 2PYJA 3E9OA 1J6ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VEO A;  1NJI O;  4H5N A;  1ASU A;  1K73 O;  1C0U A;  4E7I A;  2B4J A;  1W97 L;  3MWT A;  3K59 A;  4GW6 A;  4KH6 A;  3MX5 A;  1U04 A;  3HRG A;  2FBV A;  3ZCM A;  3E1Y A;  4DTM A;  2W40 A;  3AA3 A;  3K2P A;  1IKV A;  1TUY A;  4DQS A;  3CMA N;  4KTW A;  3K0S A;  1NGC A;  4Z4F A;  3VQB A;  4E1M A;  4FWO A;  2ZJP L;  3FZL A;  2A6A A;  3RR7 A;  4B3T K;  1S5J A;  3O6W A;  1ZBL A;  5K14 A;  1JLC A;  2R7Y A;  3P31 A;  1NM1 A;  2BH1 A;  2PY5 A;  4JI2 K;  4M3R A;  1NG9 A;  2UXB K;  4BY9 C;  4PKH A;  1HQU A;  3CJC A;  1Q86 O;  5F2R A;  2P5G A;  1S1X A;  1D4X A;  5C24 A;  3EN9 A;  5BN9 A;  2P9U B;  3ULE A;  4X62 K;  3MN7 A;  4B9N A;  1QQM A;  2YNH A;  5C10 A;  3L2V A;  4BR7 A;  4LFB K;  1IBM K;  3K58 A;  3QBW A;  3MX2 A;  3THX A;  1C0F A;  4B9U A;  4DF4 A;  4ISE A;  1BIZ A;  2LSN A;  3V9U A;  2KZM A;  3Q7B A;  4FWP A;  3LDP A;  4GKK K;  3SAH A;  1XNQ K;  3ITH A;  5BN8 A;  2NRR A;  4M3T A;  2XY8 A;  4LF9 K;  4WQ4 A;  2VG5 A;  2XY6 A;  1X9M A;  2HHS A;  4DKW A;  4CK2 A;  3CYM A;  4DFM A;  4F2R A;  1VQK N; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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