4ISEA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-4-oxoquinazolin-3(4h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
457
structure length
427
Chain Sequence
b'KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 163
structure length 427
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iseA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iseA01
2YJFA 1WOQA 5AQIA 3MDQA 3A5OC 1NGHA 4YDUC 1NGBA 1NGDA 4BC2A 2Q31A 3LM9A 3WXKA 2CH5A 1ATNA 3CJAA 2P9PB 2EWSA 5AQHA 1WUAA 1NMDA 3ENOA 4MO5A 4CBXA 1U6ZA 4QS8A 3EZWA 5F2RA 4H0YB 2QWOA 5AQZA 5FPNA 3U9ZA 4XH1A 3QB0A 3O1BA 5JLFA 5BRFA 1Z6RA 2V7ZA 3VGKA 4ISFA 3MN5A 3U4LA 2YI1A 3VEXA 1NGJA 4BR2A 4FO0A 5BN9A 1V4TA 5AFUH 3UB5A 4JD2A 4BG8A 5ADXA 2FXUA 2E88A 1DGKN 3UKRB 1D4XA 3GDQA 5CE3A 1X9JA 3A5MC 3EN9A 4H03B 4IWVA 2AA4A 1HX1A 3R6MA 1SZ2A 3HM8A 4FWSA 3VF6A 5KPTA 3VEWA 4KBOA 4FWLA 2FF6A 2QXLA 4XEIA 1LOTB 3VESA 2A42A 4H0PA 1MWKA 3S41A 3FZMA 2P9LA 2Q36A 4K42A 2ZGZA 3MN7A 4GY2B 3L6QA 2IVOA 4M7YA 3L0QA 3KHYA 1TYQB 3AAPA 3QFPA 2ITMA 2A3ZA 2W40A 3RSEA 3VEYA 3VEOA 5KPZA 3LDLA 3WUHA 1QZ5A 3DXMA 1RGIA 1BDGA 2Q97A 1GLBG 4CBUA 3HTVA 4WYBA 4FWRA 3VGMA 1NLVA 3IFRA 3ULEA 3JXUA 2HF4A 4ISGA 3R9PA 2Q2RA 5AQLA 3EKSA 3HSCA 4B1WB 3ID8A 3BF1A 4BRAA 1T6CA 2A40A 4GNIA 3BUZB 2I7PA 4CZMA 4H0VB 4O5FA 2P9SB 2CH6A 1R59O 3VEVA 3CIPA 1BUPA 2QWQA 3H46O 4CD3A 3ZX2A 5AQTA 2DPNA 3CJ1A 4FPAA 2E8AA 4A62A 4BRPA 1RDWX 2V52B 5AR0A 3VF4A 3WXJA 4CZEA 5BN8A 4B1ZA 5ELZA 4EIAA 3SLCA 4DQ8A 3R8EA 4B9QA 3QICA 1GLDG 1J6ZA 1Y64A 2UYTA 1T6DA 3C0BA 4CZHA 3VOVA 2HOEA 2FF3B 2P9LB 4IO8A 2QWLA 4XH4A 5BPMA 4FWOA 3U9DA 3WQUA 4CJ7A 3BEXA 4B1UB 3BF3A 4HWIA 2Q0RA 2FSJA 4WQ4C 3P4IA 1HLUA 1HPMA 3RSEB 3O6WA 3DXMB 4CZGA 5AZIA 2CGJA 2QWPA 3CHWA 3WQTA 3FFKB 5AQKA 4BRDA 1C0GA 1TYQA 4BRFA 3VF2A 5AQQA 3ULEB 1ATRA 5F1XA 1XUPO 2Q0UA 4FOEA 4BRQA 3H3OB 2VYPA 2YHYA 4WQ5A 3SJHA 3WEEB 5AQFA 3CI5A 1CZAN 5I9EB 5BREA 5AQPA 5BPLA 1GLJO 3MK6A 4MLEA 1H1VA 4NO7A 4H0OA 3GBTA 4BRGA 5AQSA 2ASOA 3H1VX 4DB3A 3G25A 3DAWA 2V51B 3H1QA 5AZJB 2GWKA 3H3NO 3MN9A 2V7YA 2VWBA 2P9IB 2P9SA 2Q1NA 4BVOA 2BTFA 4BRIA 4I6MA 1XC3A 1GLAG 1BWFO 5LJVA 2IVNA 2FSKA 4BQZA 4BRNA 4MLHA 4JNEA 5KQDA 4QS9A 1DEJA 1HJOA 4QS7A 4BGAA 3GE1A 3FZKA 4FSVA 4BR0A 4B1XB 3CJ9A 4IXCA 5AQWA 5LY3A 3VENA 3D2FB 4XH5A 1BU6O 1T44A 3W0LA 1G99A 3FE1A 4CZKA 1BOTO 2W41A 5AZIB 5TKYA 3I8BA 4J8FA 4K25A 2P9NA 2WUSA 4CD1A 1YUWA 4RCHA 4H5WA 4IJAA 3HZ6A 2ZGYA 2ZF5O 2ASPA 4BGBA 4AM6A 3KZBA 5AQVA 5AFUA 3O5BA 4Z94A 4RWTA 4K43A 4RTFD 5AQXA 1KAYA 3LL3A 1S22A 3H45C 1NGCA 4FOIA 4B1VA 4BREA 3GG4A 5BRHA 2P9UA 4BR9A 3WEEA 4BRKA 1MWMA 4F9OA 2FSNA 1RFQA 3GOIA 2GUPA 2A6AA 3ZX0A 3I33A 2E2QA 3SMSA 4L3QA 5E26A 4I6MB 4K41A 4H5TA 3ATVA 5AQUA 2I7NA 4BC3A 1YXQA 1GLEG 3ZEUA 2D0PA 1ATSA 3GL1A 3MN6A 5AQNA 1HKBA 5AZJA 4FWKA 4BG9A 2YHWA 4FWQA 2E2PA 2P9IA 5FPMA 1ESVA 2A5XA 3FGUA 4FWPA 4H0TB 4ISEA 2HMPA 4H0XB 5AQOA 3BP8A 4BRCA 3VGLA 5JMVA 2D0OA 4BR7A 2YJEA 4H5NA 2GELA 3MCPA 1KAXA 1Z05A 4HTLA 1OKJA 1S3XA 4A2BA 2GWJA 2CGKA 3CQXA 2E20A 3VETA 3D2FA 2P9NB 3CERA 1EQYA 3IMXA 3M6GA 1NGFA 5E84A 3QMLA 3ZETB 3M1FA 1K8KA 3CJBA 4IZ9A 5EOYA 2IIRA 3DXKA 3CJCA 2D4WA 4C23A 2BUPA 2ASMA 4AM7A 3OHRA 3O1WA 5BPNA 4BVPA 3DWLA 4WQ4A 2NRHA 4BC5A 4PKIA 2P9KB 3LDOA 2NLXA 1YVNA 2P9UB 1QZ6A 3A0IX 4EFHA 5ADXH 3LDNA 1SQKA 4CZIA 3AY9A 4YDUA 1QQOA 3VPZA 5BRDA 1NGEA 3M3ZA 2QM1A 4WQ5C 4IJNA 1ZXOA 5AQJA 3UKUB 1GLLO 4FWNA 1HKCA 3H6EA 2J4RA 1QHAA 2HF3A 1MDUB 2PAVA 3J8AA 3MMVA 3QFUA 4CZJA 3ZEUB 1YAGA 1NBWA 3U8XA 3VERA 5KPRA 4FPBA 2H3GX 1IJJA 3LDPA 3SMPA 2E1YA 4JN4A 3O4WA 4BR5A 1BO5O 1MA9B 3F9MA 4MO4A 4NB4A 1HUXA 4BROA 5AQGA 5LJWA 3QBWA 3O8MA 4H5VA 1BG3A 2D1KA 3WXLA 2KHOA 3SK3A 3O80A 1NGAA 4A61A 4EHTA 4BRLA 2OANA 4EHUA 1K8KB 4LC9B 4CZFA 3DXKB 5JLHA 3WT0A 5KQ8A 2F9WA 5EVZA 3C7NB 2QWRA 1E4GT 2AP1A 4FWMA 1XQSC 3ZETA 3FZFA 4H5RA 3W3DA 2QWMA 3LM2A 1GLFO 3FZHA 4PL7A 4Y0WA 1U2VA 3ENHA 1QQMA 4E1JA 3L4IA 2FLOA 4BC4A 3HBTA 2ZWHA 3D2EA 4B1YB 1JCGA 4PL8A 1SAZA 1E4FT 2P9KA 2E2NA 1X3NA 3JS6A 4M63C 3VEZA 5AQYA 4EAHD 3ZX3A 1DKGD 3IUCA 4JHDA 5EX5A 1JCEA 4DCHA 3EKUA 3AARA 3TU5A 3UKUA 2F9TA 3UE5A 3QDKA 2NZTA 4JAXA 5EXWA 3CJ7A 5FPEA 2YHXA 3FR0A 3FZLA 4A2AA 4BQLA 3HI0A 2PBDA 1NWKA 4CZLA 1BA1A 2P9PA 5FPDA 1HKGA 3FLCO 4DHYA 1KXPA 3QBXA 1KAZA 4JD2B 4M7XA 5BR9A 1GLCG 2A41A 4CI6A 3AAQA 3KVGA 2YCHA 3CQYA 5EY4A 3ATUA 1QQNA 4PKGA 4PKHA 2VCPA 3LDQA 2QWNA 5F0XA 1Q18A 4BRHA 1P8ZA 2GEMA 5AQRA 3B8AX 4BR4A 1U2VB 1ZC6A 1LCUA 2CGLA 3EO3A 3UKRA 1NGIA 1BA0A 1IG8A 1TUUA 3C7NA 3D7EO 2E1ZA 3D2EB 1NGGA 4O8KA 2E2OA 5JICA 1NM1A 3A8YA 1X3MA 1TUYA 3IDHA 5B8HA 3A5LC 3DJCA 3EL2A 1V4SA 1ZBSA 3A5NC 3CETA 2IVPA 4FL9A 1JCFA 4BRMA 3TPQA 3WXIA 1C0FA 3O08A 5AQMA 4CBWA 4JHDB 2GTDA 2QW9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MX2A 1HMVA 3F2KA 3KLIA 3MDQA 4NCAA 2JWKA 4YDUC 1IKYA 3WNFA 1NGDA 2Q31A 4Y1CA 4FXDA 2HHWA 1WAJA 2KZZA 1LW0A 2EWSA 4Z4IA 2Z1HA 3OYCA 2NUBA 5I3UA 1Z26A 4KREA 4H0YB 5FPNA 3ZSWA 2F8TA 3P38A 2UUBK 2V7ZA 3T19A 4FW1A 4N56A 4FO0A 3SYZA 3UB5A 3ZSRA 4ZTJA 4LFAK 3CMAN 3DLKA 2QEXN 1X9JA 4H03B 3E9OA 3R6MA 1SZ2A 4O44A 3ZYYX 3VEWA 3JYTA 3LWMA 4XEIA 4H0PA 3AVMA 3MXJA 3AVIA 4IG0A 1SL0A 1OVYA 4GKKK 4CESA 2IVOA 2X74A 4J2BA 1HNXK 3V9WA 2A3ZA 3RSEA 4DV7K 3B6PA 1YI2N 1QS4A 3SZ2A 4CBUA 4FWRA 4OKJA 3ULEA 2I5JA 4DTMA 5CZ2A 5FRNA 1VSFA 1RT2A 4F8RA 3HVTA 1T6CA 2OZSA 3CM6A 5C42A 4E7HA 4CZMA 4IKFA 2CH6A 4CGJA 4FLVA 1BUPA 1EP4A 2LSNA 4JKGA 4CGHA 3DLGA 4M3TA 3R1XA 4BRPA 4AHRA 5C2FA 1KC8O 1XMOK 3NF8A 3VF4A 2XHBA 4CZEA 5BN8A 4B1ZA 5J2QA 4DQ8A 4DS4A 1XWLA 3O9RA 1GLDG 1J6ZA 1Y64A 1ZBHA 3C0BA 4CZHA 3NE6A 3Q7CA 2HOEA 2P9LB 4CEBA 4ILGB 2QWLA 3WQUA 3TSQA 5KGXA 4CJ7A 2Q0RA 2HBKA 3SQ0A 1IO2A 4DWIA 1I39A 4JI5K 1HPMA 1NJIO 3DXMB 5AZIA 1RNHA 4A5AA 3WQTA 1NKCA 2ZM6K 1C0GA 3G10A 1IH7A 4DF4A 1ATRA 4CFCA 1IKWA 3NH2A 4WQ5A 3WEEB 1QVFM 4JV5K 4CJ3A 3L8BA 1OH8A 1J54A 3BDPA 3O4NA 3QETA 4H0OA 4ILHA 1ASWA 1N6QA 2ASOA 4FM0A 3H1QA 1NK9A 3NF7A 5AZJB 1T7PA 2V7YA 2VWBA 2XY5A 1WLJA 2XRIA 4BRIA 3O3HA 3H08A 3P39A 1GLAG 1BWFO 2HNYA 4BQZA 1TAUA 3IRXA 1GOAA 1HJOA 3TTDA 4YFUA 2XO7A 3W0LA 5T7BA 3CC7N 1JLBA 1BOTO 1SKWA 3NFAA 3G0ZA 2FC0A 3NCIA 5GINA 4CHZA 4DFKA 4CK1A 4IJAA 3OTOK 2ZF5O 2ASPA 4CEFA 1XNRK 3KZBA 3ENBA 5AQVA 4Z94A 3VA3A 4K43A 4RTFD 2PY5A 2OPPA 1S22A 1FKPA 5FDLA 4LSNA 4B1VA 4BREA 1K6YA 3T1YK 3CPEA 4BR9A 3CF5L 1ZBFA 4V19S 2YNHA 3P5JA 1LW2A 1MWMA 1C0MA 1TGOA 2FSNA 4IOCL 1RFQA 3GOIA 2XY7A 2GUPA 3UIQA 1JKHA 4X64K 1C1CA 4OPKA 4KPYA 4O5BA 3C6TA 1X9SA 4FJ7A 3AGRA 1KSPA 1GOBA 4H5TA 3ATVA 3THXA 1ATSA 1L5UA 3MN6A 1Y97A 4FLYA 1HNVA 2E2PA 4FWQA 5M1NA 3EY1A 2A5XA 3FGUA 1KFSA 3OYDA 1JLFA 4FJXA 1DTQA 3BP8A 4BRCA 4F2RA 3SAFA 2YJEA 1NNEA 4E1MA 1KAXA 1Z05A 1OKJA 1S3XA 1RBUA 2F7TA 4M41A 4CJQA 1X9WA 4A2BA 1HRHA 2YNGA 5C25A 5M1PA 1YITN 1L3VA 3M6GA 4WFAL 5KTQA 4YOWA 3KWIA 3DXKA 2O8EB 3CCLN 2D4WA 4CHPA 3O3GA 4GKJK 2G8IA 4DMNA 3DLRA 1KVCA 3MWPA 3DRSA 3U6FA 3SBTA 1YVNA 5C10A 4BDYA 2HW3A 3A0IX 5ADXH 1SQKA 3THWA 4CZIA 5JVGL 5HOOA 3S9HA 3CPWM 5BRDA 4E7JA 3VQQA 1RTHA 1Q86O 5HP1A 2JWLA 3CC4N 4DFJA 3DLLL 2PAVA 3J8AA 4BDPA 1VQ4N 3ZEUB 4FVUA 1G15A 3VERA 3M8PA 2O8CA 3SQ2A 2X78A 5KPRA 4XIUA 2ZJRL 5M1KA 2WONA 4OPHA 1HNWK 3QERA 1RT6A 4KFBA 3SMPA 1C0UA 4NYNA 4JI1K 2DFFA 1HUXA 3CFOA 2NNWA 3O8MA 3O3FA 3BZCA 3SNNA 1QHTA 1M90O 2OPRA 5LL6Z 5KRSA 1NGAA 4JEPA 3NMUA 5GIOA 4LC9B 2QK9A 2KW4A 5JLHA 2F9WA 5EVZA 4X62K 1K9MO 4FWMA 5J1EA 1XQSC 3CCQN 3ZETA 3W3DA 3LM2A 1Q82O 3E1YA 1FK9A 4PL7A 1E3MA 3MX5A 4FZXC 1IBMK 2OPQA 4LFCK 1T03A 1VAZA 2F4VK 4IOAL 4OLAA 4CFDA 1X1PA 3KK3A 1NKEA 3AA4A 3DM2A 3MEEA 3OJUA 3VTHA 1WBDA 1M1KO 4KO0A 3ZX3A 1LWFA 3I55N 1DKGD 3TAEA 2ZJQL 4DCHA 3TU5A 3UKUA 2F9TA 5CR4A 1RDBA 3CJ7A 5DK5A 5FPEA 1QSSA 1SS6A 4BQLA 4B08A 4IOXA 2P51A 1JLQA 4RW7A 5FPDA 3DLEA 1A5WA 2IC3A 2JGUA 1KXPA 3QBXA 4PY5A 1KAZA 2UXDK 3QINA 4M7XA 3ISNC 4CHNA 5BR9A 5IWAK 1GLCG 4E7IA 4CI6A 3WNHA 3AAQA 3KVGA 4CJTA 4KHPK 5MLCQ 1QQNA 5FLXO 3OY9A 1S9GA 4PKHA 4TSXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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