4ISEA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-4-oxoquinazolin-3(4h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
457
structure length
427
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 163
structure length 427
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iseA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iseA01
1NGHA 3KVGA 2HF3A 3VGMA 4I6MB 3P4IA 1BU6O 5AQXA 5AQVA 3UKUA 4E1JA 5JLHA 1IJJA 3A5NC 2CGJA 2V52B 2P9SA 4ISFA 4M7YA 3F9MA 3MK6A 4BRNA 4FWOA 3TU5A 3VOVA 1QHAA 3H6EA 3CJ1A 4EHUA 2QWQA 4EFHA 1T6CA 3UKUB 5KPZA 3VGKA 1RFQA 5BRFA 1CZAN 2P9SB 3WEEA 3QFPA 1QQNA 4AM7A 1ZBSA 4GNIA 2E8AA 2GUPA 5AQLA 2I7PA 1TYQA 5EX5A 1Z05A 5FPNA 1SZ2A 1GLBG 4FWLA 3WEEB 2P9IA 4DB3A 4BRQA 1Q18A 3S41A 3L0QA 4FWSA 4BRDA 3CJ9A 2P9LB 3ZEUA 1TYQB 3VPZA 4QS8A 4WYBA 4MO5A 2P9IB 2YJEA 2F9TA 4B1ZA 1IG8A 1JCGA 2J4RA 3WXKA 4BRMA 1GLLO 1GLJO 4BVPA 2ZF5O 3U9DA 4M7XA 3CJ7A 4BREA 5ADXA 2FF6A 2GTDA 1ZC6A 3CI5A 1BDGA 1NWKA 3MN6A 1HUXA 3WQTA 4H0XB 3FZHA 2IVPA 3MN9A 2BUPA 4IXCA 1WOQA 4B1UB 3I33A 3LDQA 4FWMA 3H45C 1HKCA 2E1ZA 5AZIB 3VEWA 4BQLA 1H1VA 3QMLA 3HZ6A 3H3NO 4PL8A 5EY4A 3WXJA 4BGBA 3QBWA 5AQHA 4DHYA 3D2FA 3UB5A 3O1BA 1R59O 1XUPO 2A40A 2A5XA 1LCUA 5EXWA 4K42A 3D7EO 5AQKA 5FPDA 5BN9A 4CZLA 4H0TB 5BPNA 4H0OA 4CJ7A 2NRHA 2CH6A 5AQFA 4BRGA 5BPMA 4DCHA 1Y64A 3C0BA 3JXUA 3DAWA 3EL2A 2I7NA 3QB0A 1X9JA 4FO0A 2Q97A 4A61A 2FF3B 2ZWHA 3CETA 1KAYA 2QWRA 3H1QA 4XEIA 5AQZA 3VF4A 4DQ8A 2F9WA 3O1WA 3UKRA 5F2RA 4A2AA 4H0VB 1HPMA 3ENHA 1E4GT 4FPBA 3U9ZA 1YUWA 5AQGA 2KHOA 1ATSA 2Q0UA 2QWLA 3UKRB 4MLHA 1NMDA 3VETA 1BA0A 4CZJA 3KHYA 3CQXA 3LDPA 1C0FA 1HX1A 4F9OA 4HWIA 2E20A 3VENA 1V4TA 2BTFA 4CZGA 4MO4A 1SQKA 3U8XA 1S22A 5FPEA 3ATUA 3HSCA 4I6MA 1GLCG 5ELZA 5FPMA 3I8BA 2A42A 3BF3A 3VF6A 4BRLA 5AQMA 1P8ZA 4AM6A 2YJFA 2P9PA 1ESVA 4JAXA 3M1FA 3SJHA 2ZGZA 2ZGYA 3MN7A 2EWSA 1KAXA 3O08A 4H5VA 2W40A 2P9PB 2OANA 4HTLA 4JN4A 3L6QA 2Q1NA 4WQ4A 3FZFA 2E1YA 5F0XA 1NGJA 1BUPA 3ULEA 3DXKA 3QICA 4CD3A 1QQMA 3A5MC 3WQUA 2P9LA 3LDNA 4BC5A 4FWKA 4RTFD 4H0PA 4B1YB 5LY3A 4K43A 2VCPA 3ULEB 3DXKB 3BF1A 3AY9A 5TKYA 4KBOA 1OKJA 4B1VA 3A0IX 4H5WA 1BWFO 3IUCA 4CZKA 4NO7A 4ISGA 1T44A 4YDUA 2QM1A 1ATNA 2FSKA 4EAHD 1HLUA 2V51B 3A5OC 3A8YA 4FL9A 3MDQA 4BRCA 4H5TA 3O80A 5AQNA 1QQOA 1NGEA 2CH5A 4FWQA 3MMVA 4CD1A 3TPQA 2Q36A 2FLOA 4BRAA 2VYPA 3R6MA 4FOIA 2HF4A 4H03B 2E2QA 1KXPA 4JHDA 4IJNA 4QS9A 4BR2A 1U2VA 3DXMA 3JS6A 1YVNA 3UE5A 5AZIA 1RDWX 1Z6RA 4CBUA 3AAQA 3A5LC 3CERA 4PL7A 2QWNA 2FSNA 5KQDA 4JHDB 3DWLA 3EN9A 1U2VB 2GWKA 3VEVA 5BRDA 3DXMB 5AZJB 3LDLA 3VERA 4BVOA 2QWMA 1HKBA 3BUZB 1SAZA 1BO5O 4FSVA 1NLVA 4BRHA 4M63C 2PAVA 5LJWA 4XH1A 3GG4A 3GE1A 3R9PA 3G25A 1D4XA 1DEJA 4PKHA 5BREA 3L4IA 3DJCA 3FR0A 5AQSA 2QW9A 1XC3A 5E26A 1NGDA 1LOTB 1NM1A 4CI6A 1YAGA 3ZX0A 3FZKA 3W0LA 3EO3A 4BC4A 5AQUA 4BRIA 4WQ5C 3ZETA 1NBWA 3IDHA 3CHWA 5AR0A 2FXUA 4FWNA 2IIRA 5BN8A 2AP1A 1BG3A 3WUHA 4BC2A 5AQIA 2D0PA 4A2BA 2E2NA 3R8EA 4L3QA 2WUSA 3ZETB 4NB4A 4MLEA 3O4WA 1DKGD 5BR9A 5BPLA 3WXIA 2A41A 4CZEA 3QBXA 4PKGA 3FGUA 4H5NA 3CJAA 2YCHA 3VEYA 3IFRA 1G99A 3MCPA 5LJVA 4FPAA 4BR7A 1J6ZA 4B1XB 2AA4A 3D2EA 5JMVA 3SMPA 3H1VX 4RWTA 3CQYA 3FE1A 2Q31A 5F1XA 4CBXA 4C23A 3GDQA 1BOTO 3D2EB 1U6ZA 1WUAA 1NGIA 4CZIA 1K8KA 2CGLA 3MN5A 1X3NA 4YDUC 3EKUA 1X3MA 3O6WA 4PKIA 2D0OA 3FZMA 1MDUB 2GWJA 1HJOA 1NGFA 2Q2RA 3AARA 3CJCA 2W41A 4K41A 2YHXA 1K8KB 4IWVA 3ATVA 2E88A 2IVOA 1JCFA 5AFUH 1MWMA 1QZ5A 1RGIA 3BEXA 4LC9B 1XQSC 1TUUA 4QS7A 4BC3A 5E84A 4CZFA 2E2OA 3RSEB 1QZ6A 3SMSA 1HKGA 3J8AA 1YXQA 2VWBA 3AAPA 3B8AX 2ASMA 5AQJA 3WT0A 4CZHA 3W3DA 4BG9A 4H5RA 2E2PA 2QWPA 4K25A 4BG8A 3H3OB 4BRFA 3M6GA 1GLDG 1T6DA 3ENOA 2A3ZA 3CIPA 5AZJA 2ASPA 1NGBA 4B9QA 4BQZA 5KPTA 4EIAA 5AQOA 2UYTA 2FSJA 3HI0A 3EZWA 1BA1A 2ASOA 2NZTA 4BRPA 1NGCA 3ZEUB 1S3XA 2PBDA 2H3GX 3HM8A 4IO8A 4BR0A 1C0GA 2GEMA 1GLAG 3VEXA 5AQWA 1NGGA 3U4LA 1TUYA 4RCHA 3ZX3A 2D4WA 2P9UA 5B8HA 3H46O 5BRHA 3GOIA 5JLFA 4CBWA 5JICA 4IZ9A 4BROA 3C7NA 3FFKB 4CZMA 3LM9A 1EQYA 2P9UB 1KAZA 2CGKA 1ZXOA 5EOYA 4IJAA 2YI1A 2HOEA 1V4SA 4B1WB 3O5BA 3SK3A 3C7NB 4FWPA 4XH5A 4BR4A 2QWOA 3SLCA 4Z94A 1E4FT 5CE3A 2A6AA 3LDOA 1DGKN 4H0YB 2NLXA 3D2FB 3HTVA 2QXLA 3FLCO 1ATRA 5AFUA 5AQRA 2V7YA 5AQPA 3LL3A 2ITMA 4A62A 3VF2A 4O8KA 2DPNA 2GELA 1GLEG 2D1KA 2YHWA 2V7ZA 3GBTA 3HBTA 5KQ8A 4BR5A 1GLFO 2P9NA 3FZLA 3KZBA 4J8FA 5AQTA 3VEZA 2YHYA 4WQ4C 1MA9B 5ADXH 3EKSA 2Q0RA 4EHTA 3CJBA 5AQQA 4FOEA 1NGAA 5EVZA 3GL1A 2HMPA 4XH4A 2P9NB 3VESA 3O8MA 4BGAA 3IMXA 4BRKA 3VEOA 3WXLA 1JCEA 4JD2A 4JNEA 4FWRA 2IVNA 4Y0WA 3ZX2A 5AQYA 5I9EB 4O5FA 2P9KA 3BP8A 3M3ZA 3QFUA 3QDKA 4JD2B 3ID8A 3VGLA 4BR9A 5KPRA 4ISEA 4GY2B 3LM2A 2P9KB 3OHRA 4WQ5A 1MWKA 3RSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VGMA 3MXMA 1ASWA 3VGMA 4I6MB 3PO4A 2HHVA 2HVHA 1GOBA 4E1JA 3UKUA 5JLHA 1S9EA 2P9SA 4E7KA 2BANA 3MK6A 4M7YA 3VOVA 2RKIA 4DFMA 1S1WA 3DLGA 2QWQA 5KPZA 3VGKA 2UXBK 3R1XA 2VG6A 4AM7A 4DQRA 2E8AA 2GUPA 3TARA 4M3RA 3PY8A 3C6AA 5EX5A 1ITGA 4JK9A 3WEEB 4DB3A 2HVIA 4BRQA 3S41A 3L0QA 1W97L 4FWSA 2BE2A 3L3VA 1KCFA 1C0MA 4H4OA 4BRDA 1NJXA 2NRZA 1RT5A 5KRTA 4WYBA 1LWEA 2I5JA 4MO5A 3NGYA 1BCOA 4YNQA 2ATQA 4NXNK 4KH4A 3V1QA 3G6EN 1KVCA 3CJ7A 4BREA 1JXBA 1QHTA 4A57A 1L3VA 2HW3A 4BE2A 1KVBA 3DM2A 3MN6A 2RF2A 2HNDA 2OTJN 3ZSVA 4LF4K 4EZ9A 4DU4A 4KHWA 2RN2A 3TTCA 3T7ZA 1HKCA 3I0RA 4BQLA 1H1VA 2IDOA 3NCIA 1KTQA 1U47A 2IAJA 3UB5A 1R59O 2VGNA 3J7ZO 2A40A 3MX5A 1JXEA 4J2BA 4CEBA 4HUGA 3K58A 4CZLA 4H0TB 1YIJN 3VN5A 4H0OA 1NJZA 4CJ7A 1NJWA 4CGDA 2KZZA 5BPMA 1HMVA 4KH6A 4DCHA 2HMIA 4IDHA 1LAWA 4IG0A 2YKMA 1TVRA 2I7NA 2Q97A 5HRSA 1I39A 1KAYA 1RT1A 2QWRA 4JK7A 3K59A 4FVUA 5AQZA 5HRRA 4LF9K 4FLUA 4DTUA 4CGFA 3O1WA 4WFAL 3ZT3A 2VWKA 4B3RK 3ENHA 1ZBIA 1VSJA 4GVEA 4MLHA 1WSEA 3VETA 5HBMA 3WNEA 3SAHA 4WCEL 3DLHA 1RBRA 1YI2N 5J2MA 4IDKA 4AHTA 4CZGA 3U8XA 2UU9K 4JI5K 1HQEA 3EE9A 3ATUA 2KKZA 2E4LA 3DOKA 1TK5A 3VF6A 1SKWA 3AVIA 3LDSA 4CJSA 4FLYA 2P9PA 1UOCA 4DTRA 3THWA 1D9FA 3ZSZA 3N4PA 2BH1A 4MDAA 4H5VA 3AO2A 3FFIA 4OPHA 4KHYA 3THXA 4KHQA 2Q1NA 3DLBA 1BQMA 4HVJA 3QICA 4F2SA 4CD3A 1QQMA 3WQUA 1G15A 3MEEA 2ZQBA 4H0PA 4G1QA 4CK2A 2LSNA 2D0AA 4N47A 4Z4HA 4B08A 1WSIA 5TKYA 4KBOA 1OKJA 3OVNA 4B1VA 3OJSA 4JI8K 3NF7A 2QK9A 4ISGA 1T44A 3OTOK 3A8YA 2FBVA 3MDQA 4B9SA 4H5TA 3O80A 3SBGA 5AQNA 1BI4A 2IS3A 4RW7A 1CXUA 2HF4A 4CE9A 1Y97A 3VQ9A 4JHDA 4DV4K 1U2VA 4CJUA 4FM0A 1CZBA 4LY7A 1QVGM 3E9OA 3EN9A 2GWKA 5BRDA 3VEVA 2QKKA 3K9KA 3DXMB 3NGIA 1NU0A 3VERA 4KREA 4DFKA 1NLVA 3CCVN 1X9SA 2PAVA 4XH1A 3G25A 1KVAA 1DEJA 4GVMA 3L4IA 5J2QA 2F7TA 4RW9A 2QW9A 4DV2K 5HROA 1SUQA 4DFPA 4CI6A 1KFDA 3TTDA 3W0LA 3EO3A 2YHAA 3QEPA 4QOZB 4KFBA 4B9LA 1C6VA 3N4QA 3VTHA 4AHCA 1D9DA 1NBWA 3VQBA 1JJ2M 1VSIA 2FXUA 1XC9A 3AV9A 5BN8A 2O8FA 1BG3A 3WUHA 3TANA 4IFEA 3T69A 3R8EA 3SNNA 3ZETB 4FZYA 2UUCK 3NH0A 3O4WA 2E6LA 4I9LA 2A41A 4CZEA 4M41A 3S3MA 2YCHA 3VEYA 1SL0A 4C8LA 4JKGA 4DR6K 1G99A 3HP6A 4FXDA 3H1VX 1RNHA 4ELUA 5KGWA 3P31A 4AH9A 4CERA 4YOYA 4GKKK 5M1KA 4C23A 2DFHA 2GUIA 3RMCA 3D2EB 3P39A 5M1OA 1O1WA 3WNFA 1VSKA 3S9HA 1X3NA 4LFAK 1WAJA 2P5GA 5GIOA 1MDUB 1IO2A 2GWJA 4FM1A 1NGFA 3AARA 3CJCA 4K41A 1K8KB 1JCFA 2DFFA 4B9UA 5D3GA 4QS7A 5T7BA 2D5RA 3SUOA 5HLFA 4FVMA 1QZ6A 2WOMA 3NHGA 2G8KA 1B92A 1J9AA 1VQNN 4CHQA 1HKGA 4DSKA 1VQON 1RDDA 2VWBA 2ASMA 5AQJA 4BWMA 1OVQA 4DV5K 3C6TA 4GV3A 3QEVA 2PFUA 3H3OB 4Z4FA 3EE8A 4RW8A 3M6GA 1KLNA 1KFSA 2A3ZA 4DQSA 3DRSA 3M8SA 3QO9A 5AZJA 1FW6A 4B3SK 4B9VA 4B9QA 4BQZA 2ETJA 1YF5L 5AQOA 3E01A 2UYTA 4B9MA 4IOCL 1VSFA 2ASOA 3ZSWA 2E5LK 3V9XA 4N41A 1TAUA 4I7FA 3LZJA 2H3GX 4YFUA 3HM8A 5IT9O 5C25A 4FJ7A 5DM6L 3SCXA 3VEXA 1NGGA 3U4LA 3S3OA 4JV5K 3AVBA 2D4WA 2XHBA 3OYJA 4GV6A 2OZMA 5KTQA 4CBWA 3DI6A 4IZ9A 5CZ1A 4BROA 1VRUA 3VQEA 1ZXOA 5EOYA 3F73A 4ILJA 3O5BA 4BE0A 4O55A 2OA8A 3KIOA 3SLCA 3D6RA 1DTTA 4CIGA 4CHZA 1TKXA 1NK9A 4CFCA 1A5VA 3O3GA 3NDKA 3J7YP 2O8EB 4O8UA 4A62A 1Q82O 2KFNA 3AVNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LZI A;  4DV1 K;  1Q7Y O;  3C7N A;  4E7J A;  3KLG A;  2P9U B;  4JKB A;  2QEX N;  2HOE A;  1V4S A;  2X6S A;  3Q7C A;  1BCM A;  3SK3 A;  1XWL A;  4XH5 A;  4DR1 K;  2OPQ A;  1VHX A;  4Z94 A;  3KK7 A;  3SZ2 A;  3OYF A;  3F5T A;  5CE3 A;  2A6A A;  1DGK N;  3LP3 A;  1YJW N;  2HNY A;  4H0Y B;  3D2F B;  2QXL A;  1ATR A;  3KLE A;  4AQY K;  1IKV A;  5AQR A;  4OO1 J;  5GAD P;  2V7Y A;  2QTD A;  4FCY A;  4KH5 A;  4AHV A;  1RT4 A;  2DPN A;  2D1K A;  4B3T K;  1XMQ K;  4M3U A;  1W7A A;  4YY3 K;  2YHY A;  1MA9 B;  3DLE A;  4EHT A;  5EVZ A;  4E1N A;  1S1V A;  1SKR A;  3O8M A;  3IMX A;  4BRK A;  4KO0 A;  2UXC K;  4DSL A;  3NMU A;  4JD2 A;  4JNE A;  4FWR A;  4CEF A;  4U7B A;  4TSX A;  4X66 K;  3SAG A;  3OYG A;  2WC9 A;  1CXQ A;  4I9Q A;  3M3Z A;  3QFU A;  1QSL A;  3B6O A;  4GY2 B;  1XMO K;  2Z1G A;  1KC8 O;  1XHX A;  1LWC A;  1QS4 A;  4DTN A;  1MWK A;  3H08 A;  3V9Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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