4ISEA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-4-oxoquinazolin-3(4h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
457
structure length
427
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
total genus 163
structure length 427
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iseA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iseA01
2GWKA 3MN7A 4CBXA 3VENA 3LM2A 2FF3B 3EO3A 2V7YA 3QBWA 3CQYA 1BA0A 3RSEA 4MLHA 4BRAA 1NMDA 2WUSA 2Q31A 4K25A 2P9IA 2P9LB 2P9SA 3ATVA 3HZ6A 3U9DA 3CJCA 4BR2A 1SZ2A 2FLOA 1DKGD 5LJVA 3VESA 4BRDA 4JHDA 2IIRA 1SQKA 3MCPA 2I7PA 4JN4A 1NGDA 3A5LC 2A3ZA 4CBUA 2P9IB 3W3DA 2Q36A 4CZFA 3M1FA 4MLEA 5BREA 2ITMA 3R8EA 3G25A 5AQIA 1BO5O 3MMVA 4BC2A 1MWKA 2Q97A 3FGUA 2PBDA 4QS7A 3CJ7A 3LL3A 2P9NA 3WXLA 4B1XB 2YHYA 2YCHA 4BRMA 3TPQA 5AQRA 5FPNA 1HKBA 1NM1A 4BRNA 4BC5A 2I7NA 2IVOA 3L4IA 4H0OA 4CZHA 3L0QA 4FPAA 4ISEA 3VERA 4HTLA 1BG3A 4H5WA 4IWVA 5AQOA 2E8AA 2P9KB 5KPRA 1NGJA 3S41A 1ZC6A 4XEIA 4BR7A 4EHUA 2P9PB 4FWRA 3H46O 4GNIA 4CJ7A 1U2VB 3D2EA 3GE1A 3CQXA 3UE5A 3UKUB 4C23A 4DCHA 1XC3A 2ZGZA 3A5OC 4BRCA 4BQLA 1Z05A 4FWLA 3D2EB 3DXKB 3WEEB 1E4FT 3LDPA 4M7XA 2W41A 4A2BA 4AM6A 3U9ZA 2VYPA 5ADXH 3L6QA 1LCUA 2E2PA 3FZMA 5B8HA 1HKGA 1NWKA 3VEYA 4BVOA 4FWPA 2AP1A 1U2VA 1NLVA 5AZJB 4FWKA 2YJEA 3H1VX 4GY2B 5AQJA 1WOQA 1BUPA 1K8KB 2E2QA 3ULEA 3FZFA 1QHAA 3VEVA 1BU6O 3DWLA 4IJAA 3A5NC 1GLAG 1WUAA 1MWMA 1BDGA 2IVPA 3SK3A 2VCPA 3ZETA 4B1YB 3VEOA 1C0FA 2E88A 1ZBSA 2VWBA 1X9JA 5BN8A 3DJCA 1T44A 3OHRA 2V52B 4WYBA 4H0PA 3SLCA 4B1ZA 2HMPA 5JICA 4IXCA 4BGBA 2GTDA 5FPMA 1BOTO 1LOTB 4YDUC 4BG9A 3FLCO 1T6DA 1NGAA 3KVGA 4BR5A 4BQZA 2HF3A 2Q0RA 1Q18A 3IMXA 2FF6A 5AQYA 1NGCA 1U6ZA 4LC9B 2QXLA 5EX5A 5JLHA 1Z6RA 3FR0A 3ZEUA 4NO7A 5BPLA 4ISFA 5KQDA 1R59O 5AFUH 1S22A 2A5XA 4H0TB 5EXWA 4WQ4C 1HKCA 4M7YA 4WQ5C 1QQMA 1YXQA 4FOIA 3H3OB 3QBXA 3U4LA 5BRFA 3WQTA 3CJAA 5AQGA 4BGAA 5AQXA 4DB3A 1K8KA 5KPZA 5AQVA 3H1QA 2V7ZA 5AQTA 2NLXA 1D4XA 2P9KA 4DHYA 3CJ1A 1GLDG 4BVPA 3VOVA 3HSCA 3MK6A 3QDKA 4PKHA 3IDHA 3LM9A 5F1XA 3ZETB 2Q2RA 1MDUB 3C0BA 1H1VA 1S3XA 3O1WA 2GEMA 4KBOA 5CE3A 1NGBA 4BRQA 1RGIA 3H45C 1SAZA 3FFKB 3KZBA 3O6WA 3WEEA 1DEJA 2A41A 4PKGA 5TKYA 3ID8A 3KHYA 3CERA 3EL2A 4JHDB 1C0GA 4MO4A 2E1YA 2AA4A 1ZXOA 3O80A 5AZJA 3VEWA 4H5RA 2Q0UA 1KXPA 1X3NA 4CBWA 3GOIA 3QFUA 5KQ8A 3BP8A 1TUUA 1JCFA 5AQZA 1HLUA 2HOEA 2YHWA 5AQHA 3VGMA 2D1KA 3HTVA 4K43A 3B8AX 3CIPA 2A40A 4B1WB 3P4IA 3D7EO 4XH4A 4CI6A 2CH5A 3LDOA 2D4WA 4CZEA 3ENOA 3MN6A 3O08A 4EAHD 4I6MA 4M63C 5F0XA 2PAVA 4H5TA 3EN9A 3CJBA 2E2OA 4EFHA 2HF4A 1GLCG 2UYTA 2QW9A 3WT0A 2J4RA 4F9OA 2QWQA 4CZIA 1CZAN 5AQMA 3AARA 3EKSA 1TYQA 1GLJO 2D0PA 1IJJA 4AM7A 4BRLA 2P9SB 5AQSA 3UKRA 3EKUA 5BN9A 1TYQB 3LDLA 4BR4A 2A6AA 3M6GA 4BRFA 2H3GX 4B1UB 1RDWX 1YUWA 4K42A 3MDQA 5AQKA 4B9QA 5LJWA 2FXUA 3UB5A 4I6MB 2E2NA 2P9PA 1JCGA 3GG4A 3CI5A 3F9MA 1RFQA 3FZKA 1NGGA 1T6CA 3VGLA 4FWNA 4E1JA 3R6MA 4FWMA 2E1ZA 1G99A 2YI1A 1BWFO 3FZHA 3QFPA 3A8YA 4BRKA 4BRGA 3VEZA 4FSVA 5AZIB 3I8BA 3VETA 2GUPA 3LDNA 1J6ZA 4H5NA 5AQQA 3AY9A 3ZX2A 1QQOA 1NBWA 3O1BA 4L3QA 4K41A 5AR0A 1E4GT 3VGKA 4FL9A 4O5FA 5EOYA 5AZIA 2QWRA 4XH1A 4BC3A 3ZEUB 1ESVA 4CZKA 2ASOA 5FPDA 3AAPA 3H6EA 3WXJA 1QZ6A 2BTFA 3ULEB 3SJHA 3FE1A 2CGJA 4JNEA 5BR9A 3QMLA 3CJ9A 4BRPA 2P9NB 4FPBA 3VPZA 4PKIA 1QZ5A 3HBTA 4YDUA 4PL8A 3JXUA 1XUPO 2P9LA 4Y0WA 3WUHA 2IVNA 3VF4A 2QWOA 3C7NA 5KPTA 3BF1A 5AQPA 3SMSA 3I33A 1GLEG 1HPMA 3BUZB 1YAGA 4DQ8A 3GDQA 5AFUA 3WQUA 3UKRB 4QS8A 1NGIA 4EHTA 1GLLO 2F9WA 3LDQA 1HJOA 3M3ZA 4BC4A 2V51B 4NB4A 4FO0A 5AQFA 5BRHA 4JD2A 3D2FB 3VF6A 4IO8A 2DPNA 4IZ9A 5AQNA 5EY4A 3DAWA 5ADXA 4CZMA 2ZGYA 4RWTA 3ZX3A 1V4SA 2GELA 1IG8A 4CZJA 5E84A 3DXKA 3U8XA 2CGLA 4ISGA 1XQSC 2YHXA 2QWPA 4BRIA 3BEXA 1TUYA 2CH6A 1X3MA 2E20A 4CD3A 3C7NB 1HUXA 1EQYA 2QWLA 1MA9B 2ZF5O 5FPEA 3ATUA 3ENHA 1Y64A 3O8MA 5E26A 3ZX0A 2W40A 2Q1NA 2EWSA 4H03B 4WQ4A 2NRHA 2GWJA 3IUCA 4WQ5A 5I9EB 2F9TA 4MO5A 5AQWA 1V4TA 3SMPA 3FZLA 5JLFA 4QS9A 4Z94A 4FOEA 1NGFA 3DXMA 3TU5A 2QM1A 5AQUA 4BR9A 3IFRA 3JS6A 4IJNA 4J8FA 4B1VA 4H5VA 4O8KA 4FWQA 1HX1A 1ATSA 1BA1A 3QB0A 4A2AA 4CZGA 3EZWA 4RCHA 2ZWHA 2FSJA 2QWNA 3DXMB 1KAXA 3UKUA 2KHOA 3GL1A 3GBTA 2ASPA 2BUPA 1QQNA 2QWMA 4JAXA 1OKJA 1GLFO 3H3NO 1KAYA 1ATNA 3AAQA 3WXIA 1DGKN 4A62A 4BROA 4XH5A 3VF2A 3CETA 4H0XB 5BRDA 5EVZA 5BPNA 1JCEA 3HI0A 4FWSA 4EIAA 1NGEA 3VEXA 2YJFA 4PL7A 3WXKA 4BREA 3A5MC 3RSEB 2D0OA 3A0IX 2ASMA 4BRHA 4FWOA 1NGHA 3BF3A 3D2FA 2P9UB 3W0LA 4H0VB 5AQLA 2FSNA 2OANA 3CHWA 3QICA 3R9PA 4H0YB 4BG8A 4CD1A 1KAZA 2A42A 2FSKA 1GLBG 2P9UA 3HM8A 3O4WA 4CZLA 1ATRA 3MN9A 1P8ZA 4JD2B 4BR0A 3MN5A 1YVNA 2NZTA 5ELZA 4A61A 4RTFD 5JMVA 5LY3A 3J8AA 5F2RA 3O5BA 5BPMA 2CGKA 4HWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IG9A 3IS9A 4CBXA 3CG7A 5I3UA 3VENA 3EO3A 3QBWA 4W5OA 1C1BA 1KQSM 4FW2A 1RT3A 1NMDA 2WUSA 4K25A 2P9IA 2VGNA 3NH0A 1TL1A 3HZ6A 3U9DA 3DLHA 1DKGD 4JS4A 3VESA 3TWHA 2D0BA 3ENBA 2IIRA 3SBGA 4LF5K 1YTUA 3TAQA 3A5LC 2YNGA 1TK8A 3W3DA 4M3TA 3MEDA 2Q36A 4CZFA 4MLEA 5BREA 1NKBA 4IFEA 4NCAA 4Q5VA 1MWKA 3CJ7A 2KLAA 4BRNA 4KTZA 4KKOA 2IVOA 3ZSWA 3CC4N 3L4IA 4KH4A 5KI6A 2XRIA 3QIOA 3L0QA 1REVA 1J53A 3VQQA 5GAGP 5KPRA 4KFBA 4XEIA 4EHUA 1EO1A 1HNVA 1XHZA 3D2EA 3CQXA 3S3MA 3UKUB 1K73O 3J7ZO 4CJ5A 2ITGA 3D2EB 1RTDA 3DXKB 4YORA 5GIOA 1ILYA 1RT5A 4JK8A 3U9ZA 5ADXH 3C65A 5FRMA 4CFAA 3L6QA 3VEYA 4BVOA 4FWPA 3CMAN 1NLVA 5AZJB 1VSMA 1X9MA 1CXQA 1EETA 4LF7K 4LH5A 1J54A 3DYAA 4IFVA 5C10A 1QHAA 2DFEA 5FLXO 3A5NC 1RDCA 4KHNA 4TSXA 4CJ3A 4OLBA 1G15A 2VCPA 1EXQA 5HRPA 2VWJA 4DV2K 2E88A 1ZBSA 1X9JA 3L2RA 3OHRA 2V52B 1YJWN 1BQNA 4OGCA 1KRPA 3ZLJA 1XNRK 3WXMB 4BGBA 5FPMA 2O4IA 4YDUC 1BCMA 3FLCO 4FVUA 1OVQA 2HF3A 2Q0RA 4CW7B 4R79A 1CLQA 5AQYA 1L3VA 3CCEN 4F3TA 5FROA 3FR0A 3VQ8A 3ZEUA 5BPLA 1BI4B 1R59O 1C6VA 3OBYA 4B9VA 3D6RA 4O4GA 1L5UA 4DV7K 2HHXA 4O55A 3T69A 1TAQA 2KKZA 1JLBA 3WNEA 1TVRA 5I42A 3H3OB 2FBTA 3QBXA 3EEQA 5BRFA 1VQ7N 4DR2K 3THXA 3NF8A 4FLYA 4BGAA 3SAHA 4CJRA 4GV6A 5KPZA 1TKDA 1M1KO 3OYMA 5AQTA 4DTRA 4RW4A 1JLGA 3N4QA 1RILA 3EE8A 3MK6A 3QEPA 1K9MO 3RVCA 1U04A 4DR1K 5T7BA 3HXMA 1MDUB 4KBOA 3C0BA 3ZT1A 1S3XA 1ASVA 4DQSA 4ID5A 4CJSA 1L3UA 2F4VK 1TV6A 3U3YA 1RT2A 3HM9A 3LZJA 4KB1A 3O6WA 3WEEA 4DV6K 2G8WA 4CEOA 4M3XA 2O8EB 3DLLL 5HP1A 4DUZK 4KI4A 3CERA 4CIFA 4MO4A 3WNFA 3WNHA 4H5RA 1KLNA 1X3NA 4IEEA 4CBWA 2G8VA 3LDSA 1QS4A 3NE6A 1JCFA 1XI1A 1SL1A 4KHWA 1FKOA 3VGMA 2D1KA 3VMFB 3B8AX 4JRQA 4B1WB 3AVBA 3ZSQA 3P4IA 1RBSA 1S6PA 3LDOA 1YF5L 1B9DA 3NH2A 4FK4A 3NGYA 4CIEA 1S1UA 1IKXA 3THYA 3SNNA 4I2QA 3QINA 3EN9A 3CJBA 2BANA 4KV8A 2OYQA 2VQEK 1N32K 2UXCK 3ZSRA 1S1WA 3MAQA 1VQ4N 4F9OA 1CZAN 4DSLA 3M5RA 4ID1A 3AARA 3EKSA 2HNZA 4DG1A 3Q7CA 3EY1A 4ZTFA 4CHZA 1SKRA 4N56A 3DLEA 4OKJA 3AVAA 4BR4A 1VSHA 2A6AA 3M6GA 3BGRA 1HPZA 4ZTJA 3G6EN 1VQ5N 3PSFA 4JK7A 1YUWA 1S9EA 2YKMA 3OW2M 4DSEA 2HBKA 3P39A 4RG8A 4CGHA 5AQKA 4B9QA 3VQ6A 2G8IA 3SUOA 4A59A 2P9PA 4AHTA 2YKNA 4AHCA 4WE1A 3ZYYX 3FZKA 3RR7A 1T6CA 4JI2K 1JLEA 4FLXA 4EZ6A 5H1SQ 4B3OA 1TL3A 2ZJQL 3SI6A 4ZHRA 3NFAA 1C0MA 1Q86O 4OPHA 1W2BM 4B9MA 5AZIB 5M1OA 5AQQA 1UAXA 1QQOA 2RHKA 2IDOA 4JKDA 3SPYA 1E4GT 4CJWA 4GV3A 3VGKA 4YY3K 4DQQA 1S72N 5HL7L 4A5AA 1NNEA 1ESVA 3WXJA 5JS2A 5KRTA 1QZ6A 4LF9K 3ULEB 4B3SK 4CHOA 3KKSA 3S3NA 4EP5A 4BACA 4MDAA 1HYZA 4KH6A 3VPZA 4JLHA 4CFCA 1XUPO 5C24A 2RKIA 2P9LA 4JKBA 3VF4A 2QWOA 4DR5K 3HP9A 3BY5A 3E01A 1HPMA 4X64K 1YAGA 4H4OA 3WQUA 4QS8A 1NGIA 4C8MA 4FJHA 4EHTA 3CFOA 1HJOA 4BC4A 3PO4A 3CQ8A 3OYEA 3KLFA 4F4KA 4FJ8A 1A5XA 4GW6A 3CC2N 4CCHA 2UXBK 3KIOA 3ZX3A 4R5PA 4CZJA 1OH7A 3K58A 4C8OA 3F73A 2CGLA 4LF4K 3NVKA 1XQSC 2QWPA 5HRNA 2X78A 3SUQA 4CD3A 3C7NB 1HUXA 3I0RA 1DTTA 3N4PA 3RMDA 2DTUA 2XY8A 4YOUA 4H8KA 4H03B 1HMVA 1UWBA 4WQ5A 1IH7A 2BDPA 4CF0A 4JS5A 5AQWA 1VRUA 3P5JA 3MECA 1NGFA 5JVGL 4BR9A 4CFBA 4J8FA 1X9WA 1LWEA 4H5VA 1ATSA 1BA1A 3EYZA 3MWTA 1HJRA 5KRSA 3HOTA 4M3UA 5CY4A 3SZ2A 1EX4A 2QWNA 1KAXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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