2ZGYA

Parm with gdp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
molecule tags Structural protein
source organism Escherichia coli
total genus 102
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA01
1SZ2A 4H0XB 3H45C 2NLXA 1KAXA 3U4LA 4B1YB 1C0GA 1WUAA 3HBTA 3O1WA 3G25A 3MCPA 2E2QA 1BO5O 5AQRA 1BDGA 4XH5A 5AQFA 4AM6A 2CH5A 1E4GT 1DGKN 3AAQA 4CD3A 4QS8A 5JLHA 3DAWA 1HX1A 2E2NA 3DXKA 4BR0A 2DPNA 4IZ9A 2VWBA 2QWLA 3GL1A 3LM2A 4FL9A 4PKHA 5KQDA 2Q0UA 2Q31A 2E2OA 4BC4A 3FZLA 2GEMA 3BUZB 1BG3A 2GWKA 3VEVA 1OKJA 5BN9A 1NM1A 2E88A 5KPZA 4BRCA 5FPEA 3LDQA 4BRNA 2QWQA 3CJBA 5AQIA 3BF1A 4E1JA 3VEZA 3WT0A 2ASOA 4CD1A 2IVNA 3TPQA 3FGUA 2QWPA 3CJCA 1NGAA 3L6QA 3LDNA 3CI5A 4FWMA 3MN6A 4EHUA 4A2AA 3QMLA 1GLLO 3A5OC 2V7ZA 1ATRA 3EL2A 3QDKA 5AFUA 4IJNA 3H3OB 1LCUA 1IJJA 4BRDA 1QQOA 4YDUC 5EOYA 3QICA 2A42A 2CGKA 4CZFA 3DXMB 4FOIA 2Q36A 3D7EO 3ZX0A 5AQQA 3ZX2A 3EZWA 4IJAA 2F9TA 2ZF5O 3LDPA 3VGMA 3VEOA 1NGIA 5AQGA 1DKGD 2J4RA 2I7NA 3U9DA 3H6EA 4Z94A 3WXKA 1YAGA 4RTFD 4NO7A 5AQWA 3ULEB 1NGCA 4DHYA 2CGJA 3KZBA 1NLVA 2IVPA 5KPRA 3MK6A 4BRFA 3VEWA 4FWNA 3VF6A 4FWSA 3VOVA 4BVPA 4WQ4C 2ZGZA 4K41A 2H3GX 3W0LA 3UB5A 2V7YA 3CQYA 3KVGA 3GOIA 3VEYA 2ZWHA 3FZKA 2IVOA 2VYPA 4BRAA 4BRMA 4EFHA 3QBXA 4I6MB 4FWPA 3WXIA 4FSVA 3WUHA 2P9KA 3GG4A 3ZX3A 2P9KB 3GE1A 5F1XA 4GY2B 3UKUB 3SJHA 3EKUA 4MO5A 3B8AX 3ENHA 5AFUH 5LJVA 2ASMA 4H5NA 4CZIA 2D0PA 2E20A 2IIRA 4WYBA 4IO8A 3BP8A 3FZFA 5AQKA 3EKSA 4EIAA 1NBWA 4O5FA 5F2RA 3WEEA 3O4WA 4WQ5C 2YHXA 4FWRA 4CZLA 4KBOA 5BPNA 1GLJO 3O8MA 2P9LA 1YUWA 3WQTA 1U2VA 4BRIA 2P9LB 2A3ZA 2QWRA 1QQMA 2QM1A 5AQNA 4BRGA 5AQYA 3VGLA 3D2EA 2A41A 5AQXA 2WUSA 5FPNA 1YVNA 4CZKA 3SLCA 4CZEA 4Y0WA 4K43A 4XH1A 4L3QA 4JAXA 4BR4A 3EO3A 4BC2A 2VCPA 2CGLA 2NZTA 3FFKB 2HF3A 4BR9A 3CJ1A 3ZEUA 3JXUA 5AQOA 1XUPO 2E1YA 5EY4A 2P9PA 3VPZA 2YCHA 2P9IA 1MA9B 3DXKB 1QHAA 1SAZA 2P9IB 3O6WA 1RFQA 1ESVA 1EQYA 3CHWA 3J8AA 2CH6A 1J6ZA 4BRPA 3H46O 5BRHA 4LC9B 2HF4A 1RDWX 3LL3A 4F9OA 4K25A 3H1QA 4NB4A 3AAPA 4DCHA 1NWKA 3MDQA 1T6DA 2Q2RA 1R59O 1E4FT 4QS9A 4CBWA 3ZETA 2F9WA 4HWIA 2E1ZA 1MWKA 1BA0A 3W3DA 1BA1A 1HUXA 1GLEG 3IUCA 1X3NA 4A2BA 4DB3A 2A6AA 1TUUA 4BRHA 3IDHA 4JHDA 4B1WB 3LM9A 1BOTO 3DWLA 4MLHA 3VERA 3ENOA 3MN9A 4CZJA 3KHYA 3LDLA 5AR0A 2Q97A 1YXQA 3FZHA 3BEXA 3O1BA 5CE3A 4JD2A 4BREA 1GLDG 4QS7A 4AM7A 1WOQA 2A5XA 2UYTA 2FSNA 4BG9A 1Z05A 2GELA 3ATVA 2GUPA 3UKRA 4BG8A 3RSEA 4BRQA 5ADXH 1JCEA 2GWJA 3SK3A 2ZGYA 4ISFA 3UKRB 3RSEB 2ITMA 2QXLA 2W40A 4CJ7A 4H0OA 5BRDA 2HOEA 1HKGA 3HZ6A 5AQVA 4B1UB 3VF4A 2HMPA 2P9SA 2EWSA 2P9SB 3TU5A 3CJ7A 5E84A 4FWQA 4CBUA 2AA4A 3QFUA 1HPMA 2E2PA 5AQSA 1G99A 5BPLA 4CZGA 1NGHA 1XQSC 5F0XA 4YDUA 3D2FA 4K42A 1H1VA 4EAHD 4HTLA 1HJOA 2W41A 3D2FB 4O8KA 3A8YA 1NGFA 4FPBA 3VGKA 4C23A 3L0QA 3M3ZA 3S41A 1X9JA 3FR0A 5AQTA 3VF2A 3WEEB 2BUPA 3HTVA 5AQMA 2D0OA 1JCFA 3M6GA 4FWKA 4H0VB 3MMVA 1XC3A 1ATNA 1HKCA 1BWFO 1U2VB 3A5NC 5EX5A 4H5VA 4FPAA 4PL7A 4BR5A 1RGIA 2YJFA 4BQZA 3A5MC 2OANA 5BREA 1NGBA 1NGGA 5TKYA 4WQ4A 1C0FA 3D2EB 5BN8A 5JMVA 1T6CA 1NGEA 1D4XA 1HKBA 1V4SA 1Z6RA 4BR7A 2A40A 2QWOA 2YHWA 3GBTA 4A62A 3CERA 1GLFO 1ZC6A 2BTFA 4XH4A 1TYQA 4H0YB 3GDQA 4B1XB 5AQHA 3U9ZA 3O08A 2YJEA 5ELZA 3ZEUB 5JICA 1X3MA 2FSJA 1U6ZA 5EVZA 3SMSA 4PKGA 3WXLA 4PL8A 2GTDA 4H03B 2P9PB 2QWNA 4IXCA 4M7YA 1K8KA 3HSCA 4BC3A 4BVOA 5ADXA 1KXPA 4CZHA 1K8KB 4RWTA 2D1KA 1TUYA 3F9MA 1BUPA 4IWVA 3VEXA 4WQ5A 4H5RA 4FWLA 4M63C 1IG8A 5AZIA 3FLCO 3C7NA 2FSKA 5AZIB 5BRFA 3C7NB 3ID8A 3L4IA 2YI1A 1LOTB 3P4IA 5AQUA 3CJAA 4PKIA 2QWMA 1GLCG 4BRLA 2E8AA 1JCGA 3QB0A 2Q1NA 4BR2A 3ZETB 5LY3A 3U8XA 1MWMA 2QW9A 3FE1A 3M1FA 3H1VX 3VESA 1Y64A 4CI6A 4JHDB 4BC5A 4BQLA 1ZBSA 2PBDA 2AP1A 3C0BA 4MLEA 3LDOA 3HM8A 4XEIA 2P9UA 4B1ZA 4FWOA 3QBWA 1NMDA 1ATSA 3CETA 3R6MA 2P9UB 2V52B 4JD2B 5BR9A 1BU6O 2ASPA 4BROA 2I7PA 1ZXOA 5KPTA 5AQPA 3OHRA 3DXMA 4H5WA 1GLAG 1QZ6A 1SQKA 1KAYA 4B9QA 1GLBG 3UE5A 5AZJA 1CZAN 2D4WA 1QZ5A 5LJWA 5AZJB 4RCHA 4ISEA 2FLOA 1MDUB 3ULEA 2FF3B 4B1VA 4ISGA 4JN4A 3VETA 3H3NO 5AQLA 3BF3A 3ATUA 3I8BA 4M7XA 3A5LC 3I33A 2Q0RA 3MN7A 5E26A 3R9PA 1KAZA 5JLFA 4BRKA 5FPMA 1NGDA 3CJ9A 3SMPA 2V51B 2PAVA 1S22A 4FO0A 4I6MA 3CIPA 4EHTA 1DEJA 1NGJA 4BGBA 4CZMA 3O5BA 3VENA 1T44A 3IFRA 1P8ZA 4DQ8A 5KQ8A 3EN9A 3UKUA 3MN5A 5I9EB 5EXWA 2NRHA 4MO4A 3AARA 3JS6A 5FPDA 3WQUA 1V4TA 1HLUA 5AQZA 3IMXA 4FOEA 3FZMA 3O80A 4BGAA 2YHYA 2P9NA 3R8EA 4GNIA 4H0PA 2KHOA 4CBXA 5BPMA 3WXJA 2P9NB 2FF6A 4H5TA 3CQXA 5B8HA 3A0IX 5AQJA 1S3XA 3DJCA 4J8FA 1QQNA 1Q18A 3HI0A 2FXUA 3AY9A 1TYQB 4JNEA 4H0TB 4A61A 3QFPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ID6A 1T7PA 1XWLA 2O8EB 2HHSA 3LANA 1ASVA 2FBTA 5CYQA 4JKCA 5AQRA 4DU3A 5AQFA 2CH5A 1DGKN 3OBWA 4CD3A 5JLHA 1HX1A 4BR0A 2PFUA 1W97L 3TSUA 2GBZA 4PKHA 2Q0UA 2Q31A 2JGUA 1B9DA 4TSXA 3FZLA 3U6FA 4Z4CA 1BG3A 1OKJA 1U47A 5FPEA 1VRTA 1Q7YO 3CJBA 4AQYK 4FJ9A 2PYLA 3O4NA 3TPQA 2FBYA 1NGAA 2UXBK 4B8CA 1VQ4N 4DSLA 4FCYA 4K0KK 3NGIA 1RT4A 3A5OC 2V7ZA 3OYDA 4NCBA 4KH5A 3MAQA 5AFUA 3K2PA 4IJNA 3AVKA 1JLFA 2O8BA 1IJJA 1KRPA 4YDUC 3J7ZO 5EOYA 1OH5A 2KTQA 3THXA 2UUAK 4X64K 2CGKA 4CZFA 4J2AA 1QQCA 3DXMB 4FOIA 4KO0A 3ZX0A 4YOXA 1NOZA 1WN7A 5AQQA 2PY5A 4LSLA 3EZ5A 4NLCA 2X74A 3VGMA 1TVRA 1U04A 3H6EA 4DV7K 1YAGA 3LP0A 4RTFD 3CCSN 4NO7A 4CJTA 5AQWA 2CGJA 1VQ9N 2DFHA 2IVPA 3I0SA 3QINA 4MDAA 4FJXA 2NRRA 4FWNA 2ZGZA 3CXCM 2H3GX 2V7YA 3CQYA 4JS5A 3DI6A 3DRSA 1Q9XA 2VYPA 4BRMA 4JRQA 4EFHA 3QBXA 2QTDA 4YFUA 3HPHA 4I6MB 4FWPA 1LAWA 3WUHA 3B6OA 3GG4A 4GW6A 2X6SA 2P9KB 3SQ4A 4GY2B 3LZJA 3UKUB 4A57A 4FM0A 3ZT4A 1D8YA 4JKHA 4EIAA 3O4QA 3EKSA 1NBWA 3OS0A 1I39A 1VK0A 2HHXA 4FK0A 3KLGA 2NRZA 5BPNA 1GLJO 3AVNA 3N4QA 3DLGA 1ITGA 2P9LB 3HL8A 1HJRA 4DV3K 2NRVA 3PV8A 1J54A 2WUSA 3SAFA 4FXDA 1SV5A 3SLCA 4IBNA 3CC2N 3SJJA 4B08A 4L3QA 1KD1O 5JS2A 4BR4A 4CJWA 4BC2A 2VCPA 2FBVA 2NZTA 4YOUA 4WFNL 5C0YA 4ICLA 1QVGM 4M45A 2AJQA 3ZEUA 1X1PA 1JL2A 3JXUA 1FKOA 4YOVA 2P9PA 2P9IA 3AVBA 4JKFA 1BIZA 3VQ4A 4O8UA 1RTDA 3OJUA 3AGRA 2OCEA 4B3SK 3SQ2A 1ESVA 3HVTA 4HUFA 3CHWA 3J8AA 3E66A 3VN5A 2O4IA 4J2DA 5KTQA 4NXNK 4C1NI 1C0MA 2YV0X 3L2UA 2HF4A 1K73O 4F9OA 4K25A 5IT9O 3OYNA 3QO9A 2HW3A 3AAPA 1NWKA 3TARA 3VA3A 1R59O 1YTUA 4KAZA 3ZETA 4B9MA 3J7YP 1BA0A 4CIFA 1GLEG 4DB3A 5FLXO 1TUUA 3IDHA 1Q8IA 1NKCA 3LM9A 4PA1A 3THXB 3MN9A 4CZJA 1NJWA 1N5YA 4LF9K 3MXMA 3O1BA 3HYFA 4FLVA 4QS7A 2A5XA 4FJJA 4UQGA 3K5LA 4CJKA 1YJ9N 4L8RB 1Z05A 2GELA 5FDLA 2GWJA 3UKRB 4ISFA 4IEEA 4DV0K 2W40A 4CJ7A 2Z1GA 4Q0BA 3HZ6A 3I55N 3MECA 5AJ3K 3T69A 1REVA 3TU5A 1HNIA 2ZD1A 3NF8A 2KFZA 2D0AA 4ILJA 4CBUA 1J53A 4O0JA 3THWA 3AGKA 1BI4A 2JWKA 1HQUA 3ZT3A 4CZGA 1NGHA 1L5UA 3D2FA 1WAJA 1T03A 4HTLA 4CJ5A 4O8KA 4FPBA 4C1NK 5HRNA 3M3ZA 2KLAA 1RDAA 3OYIA 4HUEA 5CR4A 3B6PA 5AQMA 2D0OA 4FWKA 5DK5A 3G6EN 1N36K 3MMVA 1ATNA 1HKCA 4LF8K 5EX5A 1NMNA 3OS1A 3SNNA 3SQ0A 3CQ8A 1NK9A 3A5MC 1BQNA 3DMJA 4CEQA 2YNGA 1T3VA 2HMIA 4CHPA 2A40A 4YY3K 5J2MA 3CERA 1GLFO 3L8BA 1ZC6A 2BTFA 3F5TA 4XH4A 1C0TA 3AA2A 3NH1A 1S1XA 2YJEA 5ELZA 3ZEUB 1U6ZA 3DM2A 4PKGA 4E19A 4Q5VA 2QK9A 4H03B 1Y97A 2P9PB 1HNZK 3HRGA 4UY8O 4BC3A 4RWTA 2D1KA 4PQUA 4IWVA 4OVLA 2RF2A 3O3FA 3VQ5A 2RN2A 5M1NA 1I3AA 3C95A 4FWLA 5J2QA 3NVKA 1F21A 4X65K 2YI1A 2KKZA 5H1SQ 3LAMA 2QWMA 4BRLA 2E8AA 3ZETB 1VQKN 3KKSA 1EWQA 4GMJB 3KIOA 3M1FA 3AO4A 2DTUA 1EWRA 1CZBA 3L2VA 1QE1A 1ZBSA 3LDOA 3MWPA 4B1ZA 4FWOA 4AHSA 5D3GA 1KLNA 5KGXA 4DR1K 3RR7A 1A5XA 4KI6A 2ASPA 3L4QA 4BROA 2I7PA 4DV6K 5AQPA 4YOTA 4PWDA 1GLAG 1QZ6A 3NBPA 1KQSM 5KGWA 4CE9A 3J80O 2X78A 4IFVA 3QIPA 1ASWA 1GLBG 3ALYA 3UE5A 1L3TA 4DQIA 2D4WA 2VG7A 5AZJB 4RCHA 4B9UA 3M8QA 3QNOA 3ULEA 2FF3B 3SUNA 4ISGA 2DFFA 3VETA 5AQLA 3SUOA 4M7XA 3A5LC 4DQRA 3THWB 1TGOA 2OZSA 3L3UA 5E26A 1KAZA 1VSJA 5JLFA 2YNHA 4YOWA 4M3WA 3BY5A 3CJ9A 3SMPA 3L2QA 3CIPA 3C6AA 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1OH6A 3GOIA 1J5OA 1OH7A 3ZT0A 3CCRN 3HPOA 3FZKA 3V9SA 1FKPA 4CEBA 4FSVA 1IBKK 3KJVA 2P9KA 3QERA 4LFAK 4CK2A 3TABA 4LH4A 5F1XA 1TL3A 4A5AA 3AO1A 4MO5A 5LJVA 2IC3A 2IIRA 3HP9A 3J7AP 4IOXA 4O5FA 3TTDA 5F2RA 4OGCA 2YHXA 4KBOA 4DR3K 1RTIA 3O8MA 1RBUA 2BH1A 2P9LA 1YUWA 3WQTA 1U2VA 4GV3A 2A3ZA 3K9JA 4CF8A 2QWRA 5J1EA 1QQMA 2QM1A 3CC4N 4OKEA 5AQNA 4BRGA 4DUYK 3VGLA 4CJLA 3D2EA 1T05A 3U3YA 3IRXA 1EXQA 2OTJN 4JKGA 1YVNA 1XC9A 4OPKA 4M3YA 1CXUA 3CCQN 2HBMA 1KC8O 4XH1A 2XHBA 3MEEA 3OYCA 2HF3A 1YHQN 3CJ1A 2E6MA 3ULDA 5T7BA 1MU2A 2E1YA 4CERA 1VQ5N 3OVNA 3DXKB 4CK1A 1QHAA 1SAZA 1BGXT 4H4MA 2KQ2A 4DQPA 4EZ9A 5HRPA 4IG0A 1M90O 1EETA 3P39A 4F4KA 2O8FA 4BRPA 4DSIA 3ZSVA 3ZLJA 1EX4A 1KFDA 2DFEA 5BR8K 1W9HA 1G15A 1WSIA 2D0CA 2HNZA 2VG5A 2HVHA 3M8RA 2F9WA 3W3DA 1BA1A 3HSTB 2GV9A 3WNFA 1JJ2M 4CJUA 3QNNA 4JHDA 2D0BA 3DWLA 1JXBA 3V9XA 2VG6A 1QTMA 3VERA 3ENOA 2P5OA 5AR0A 3KK2A 4JD2A 4CF0A 1YJNN 1X9WA 4ELVA 2KZMA 4DV2K 2UYTA 3S3OA 4BG9A 1A5VA 3UKRA 4BG8A 4BRQA 1BISA 1JCEA 2WC9A 1BHLA 2NRWA 1VSHA 4C8OA 2QXLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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