2ZGYA

Parm with gdp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
b'MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 102
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA01
3HZ6A 1K8KA 1GLCG 1HPMA 1SAZA 4O8KA 2H3GX 2F9WA 2P9SB 3VF2A 3DXMA 4BRDA 5ADXA 1BUPA 4L3QA 3C0BA 4FWOA 4K43A 4XH5A 5KQDA 1S22A 3S41A 4XEIA 2FXUA 1TYQB 3WXKA 1WUAA 4CZMA 3H45C 4BRHA 3ENOA 3D2EA 1ZBSA 4RTFD 3WEEB 4FPAA 5AQRA 2PAVA 5JICA 3VESA 5FPDA 4H5NA 2P9UA 4XH1A 2YJEA 5AQVA 2QWQA 1P8ZA 2A40A 1U2VB 4EAHD 5F1XA 3EZWA 4BRQA 4I6MB 3J8AA 3ID8A 3C7NB 4HTLA 4CD1A 4H0VB 3KHYA 2QWRA 4H5WA 2GELA 3MK6A 4FOEA 1MDUB 2FF3B 3U9DA 1NGAA 3GOIA 2P9LA 4ISFA 4K25A 3I8BA 1BG3A 3IMXA 4PKIA 1ESVA 4WQ4C 4IJAA 4LC9B 4B1YB 1IJJA 3AY9A 2YJFA 4FWNA 1WOQA 5AR0A 5AQGA 4FSVA 4MLEA 2F9TA 4CZGA 4E1JA 5BN8A 2ZF5O 1NGJA 3HI0A 3UKRA 3IFRA 5AQUA 5AQWA 3FLCO 3A8YA 3H3OB 2A5XA 3A5MC 3CJ1A 4JD2B 3VERA 1SQKA 2YCHA 3EKSA 1HUXA 3BEXA 3DJCA 3FZLA 2FSKA 1V4TA 2VCPA 5AQIA 5AZJB 2DPNA 2ASOA 3O4WA 5AFUH 1RFQA 1MWMA 4K42A 1YAGA 1NMDA 3BF3A 4BRIA 4CI6A 2P9KA 1NGHA 3LDLA 4BC4A 4Z94A 3UE5A 3FR0A 3VEWA 2GWJA 5BRHA 4AM6A 5EX5A 4DB3A 4WYBA 3B8AX 3W3DA 3AAPA 5LJWA 1HKCA 1V4SA 5AQPA 3I33A 4ISEA 2YI1A 2Q0RA 5TKYA 1X3MA 5BRFA 5JMVA 1LOTB 2CH6A 1GLLO 3ULEB 5AZIB 3O6WA 3EKUA 3FZKA 2FSJA 3ZETB 4BR4A 3DWLA 1XUPO 3MN9A 1ATRA 4B9QA 2IIRA 3U4LA 3JS6A 2E1ZA 3R9PA 4BG8A 3IUCA 3CI5A 1J6ZA 4BR5A 4JHDB 3VGLA 3CJCA 3RSEB 4FWSA 4BRPA 5BRDA 4IWVA 2P9NB 5AQSA 4FO0A 1YXQA 4CBUA 3WQUA 3CIPA 2UYTA 2P9SA 2P9IB 3VEOA 2VWBA 4F9OA 4YDUA 3FZHA 3SLCA 2YHXA 2E20A 4XH4A 4A61A 1TYQA 2QWNA 4H0OA 3HSCA 4BRNA 1YVNA 1T44A 1BWFO 4BGAA 1SZ2A 3JXUA 4H03B 4M7YA 3WEEA 4H5VA 1NGIA 3TPQA 1Y64A 2IVNA 2NLXA 1S3XA 2ASMA 4WQ5C 4CZIA 2CGJA 3M6GA 4JNEA 2AA4A 4M7XA 1D4XA 2QWOA 5AQTA 4PL7A 1GLFO 1MWKA 1U2VA 1BU6O 4RCHA 3IDHA 4CJ7A 4I6MA 2QWMA 1X3NA 2Q2RA 3C7NA 4DCHA 1XC3A 2CGKA 2W41A 3CJBA 4IZ9A 2AP1A 5EXWA 4FWLA 3LDPA 3ZEUB 2QXLA 3WT0A 3LM9A 4GNIA 5JLFA 5LY3A 5BPMA 3UKUB 1QHAA 1HLUA 2YHYA 4BC3A 3QICA 3QB0A 2E8AA 1JCEA 1QQOA 5FPMA 3VEVA 3HBTA 3MN5A 4H0PA 3SMSA 5EY4A 2ITMA 1BOTO 1NGEA 3O5BA 4H0XB 4EHUA 2HOEA 3D7EO 1GLEG 3AAQA 3M3ZA 1R59O 3BUZB 4FPBA 5AQFA 4FL9A 4GY2B 4BR2A 3CJAA 4NB4A 3VGMA 1KAZA 2CH5A 2D1KA 4MO4A 1Z05A 1BA0A 3O08A 4JD2A 1TUUA 5AQZA 5AZJA 2V52B 3WXLA 3CJ9A 2NZTA 3BP8A 4C23A 3R8EA 4HWIA 1ZXOA 1ATSA 4FWQA 3MDQA 3UB5A 4B1UB 4DHYA 3A5OC 5AQYA 2GUPA 2BTFA 4FWRA 4QS7A 3TU5A 3VEXA 2QWLA 4BR7A 4H5RA 3DAWA 3D2FB 4BRKA 4EIAA 2KHOA 3GG4A 1IG8A 5LJVA 1NBWA 4A2BA 1QQMA 1HKBA 3FFKB 1NGBA 3O80A 4H5TA 3QBXA 5BR9A 1BDGA 4CZHA 5I9EB 4H0YB 1LCUA 3L0QA 2FLOA 5AQLA 1E4GT 3ULEA 4BVOA 5JLHA 1JCGA 5AZIA 5B8HA 3WXJA 3ZETA 3WQTA 2PBDA 2I7NA 2ZGZA 3A5NC 4FWPA 3FE1A 3WUHA 4A2AA 1EQYA 3WXIA 3VPZA 4JHDA 2E1YA 1DKGD 1HKGA 3RSEA 2CGLA 5KPRA 1NLVA 1YUWA 2P9NA 5AQJA 2D4WA 2P9IA 2A6AA 4CZKA 2HF3A 1QQNA 5ELZA 4IJNA 3M1FA 4BRGA 4CZEA 4IXCA 2Q31A 1KXPA 1GLBG 5AQNA 1QZ5A 4QS9A 2FSNA 2QW9A 5E84A 4IO8A 3QMLA 3QFUA 4BGBA 4BVPA 3CJ7A 3CQYA 3VENA 4PL8A 3VEZA 1T6DA 4B1WB 1JCFA 1GLAG 3KZBA 5BN9A 3DXKB 4BROA 1NGCA 2D0PA 3QFPA 1H1VA 1OKJA 3H3NO 4O5FA 4BRLA 2E2QA 2V7YA 3LDOA 4KBOA 2IVPA 3ZEUA 3A0IX 3LDQA 4EFHA 5F0XA 3W0LA 5KPTA 5KPZA 3H6EA 2VYPA 3UKUA 3GDQA 3EN9A 4CBXA 4M63C 2P9PB 3EO3A 5E26A 4B1VA 3VGKA 1RDWX 4YDUC 3MMVA 5ADXH 1ATNA 2Q0UA 2HF4A 3H46O 1K8KB 3CHWA 4EHTA 3R6MA 3DXMB 3VF4A 3LL3A 4FOIA 4K41A 4JAXA 1DGKN 5AQQA 3H1QA 4WQ4A 3FZFA 1X9JA 1HJOA 3HTVA 3CERA 4J8FA 4CBWA 4NO7A 4FWKA 3O8MA 3O1WA 2I7PA 1BO5O 3D2EB 4H0TB 3CQXA 5BPLA 4BREA 4BRFA 3CETA 2Q1NA 5AQHA 1E4FT 1GLJO 4BR9A 3P4IA 1QZ6A 4BG9A 1RGIA 2P9UB 2E2NA 4MO5A 2FF6A 4BRCA 2A41A 3LDNA 3H1VX 2QM1A 3FZMA 2NRHA 5EVZA 1C0FA 1ZC6A 3KVGA 4QS8A 2GWKA 4PKGA 3QDKA 3D2FA 3ATVA 5AFUA 2GEMA 3ATUA 1NGDA 4A62A 4BRAA 1CZAN 2P9LB 3OHRA 2V7ZA 2J4RA 4B1ZA 2A3ZA 3SK3A 4BQLA 5FPNA 2E88A 2WUSA 2Q97A 3MN6A 4PKHA 3BF1A 2OANA 2W40A 3MCPA 4B1XB 4Y0WA 3MN7A 4BRMA 5KQ8A 3UKRB 1HX1A 2EWSA 4AM7A 4JN4A 1MA9B 1DEJA 1T6CA 2HMPA 2D0OA 4DQ8A 1GLDG 1XQSC 1NWKA 3F9MA 2V51B 3L6QA 2ASPA 3SJHA 3ZX0A 5AQXA 1C0GA 3U9ZA 1NGFA 2P9KB 3O1BA 1KAXA 3ZX3A 2BUPA 2E2PA 5FPEA 4CD3A 3GL1A 3L4IA 5BPNA 2IVOA 5F2RA 2ZWHA 2E2OA 2QWPA 1KAYA 3HM8A 4BR0A 3QBWA 5AQOA 3ZX2A 1Q18A 4BQZA 3DXKA 2A42A 3A5LC 3VOVA 4BC2A 4ISGA 4WQ5A 4CZJA 3GBTA 4CZFA 3LM2A 3AARA 3GE1A 4MLHA 3FGUA 3EL2A 1NM1A 3SMPA 5CE3A 2Q36A 2YHWA 1NGGA 1BA1A 5AQKA 3U8XA 5BREA 1G99A 1Z6RA 2GTDA 2ZGYA 3ENHA 5EOYA 2P9PA 1TUYA 4BC5A 3G25A 1U6ZA 5AQMA 3VF6A 3VETA 3VEYA 4FWMA 4RWTA 4CZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E3SA 1GLCG 4IDKA 1DTQA 2F9WA 2YKNA 3ZSXA 3DXMA 4FYDA 5I3UA 4K43A 1S22A 2FXUA 1WUAA 1U04A 3IS9A 3ENOA 4V19S 1N6QA 4C8LA 4DTNA 2PAVA 3VESA 4E0DA 2NRZA 4CJSA 4GKJK 4JV5K 1VSIA 1BHLA 4FJXA 4EAHD 3T1HK 4I6MB 3ZYYX 2FC0A 4HUFA 1T03A 3O3HA 4DFJA 2G8FA 4NCGA 1BIZA 3KHYA 3VQ5A 2KW4A 4O0IA 3CCLN 2RE2A 1Z26A 3MK6A 5MLCQ 3E9PA 3U9DA 4G9ZA 3OYIA 4PKIA 3KWGA 1W97L 3DM2A 1HR0K 4LC9B 5HOOA 2XHBA 3NCIA 1WOQA 1NK0A 3RTVA 1UOCA 4CZGA 3TAEA 1HNWK 5BN8A 2ZF5O 1NGJA 1FK9A 3HI0A 2HHVA 3IFRA 3DOLA 5H1SQ 1NJXA 3SV4A 1C1CA 2A5XA 4JD2B 3VERA 3DRRA 4IBNA 3DJCA 3G6EN 4DQSA 2DPNA 3DRPA 3ENBA 3BF3A 4B8CA 4BRIA 2P9KA 3LDLA 3AO2A 3ID6A 3UE5A 1HMVA 4AHRA 4RW9A 1Q7YO 3HP9A 4FK4A 1VQKN 2GWJA 3LP0A 1TVRA 3LPTA 3PUFA 1NK9A 5DK5A 3B8AX 3RVCA 3W3DA 1YJNN 3P39A 3TAQA 1HKCA 1V4SA 5AQPA 3I33A 2HBMA 3E9OA 4RW8A 1X3MA 1IV0A 2BE2A 3ULEB 4LF9K 3ZETB 3G4SN 4BR4A 4C8MA 4CIEA 4DR5K 4CJ3A 1VQ8N 4Z4CA 2IIRA 4FLUA 3P83D 2ZQBA 4IFEA 4IWVA 5AQSA 4CHOA 2PFUA 4DV3K 1UA0A 2P9IB 1XI1A 2VQFK 4W5QA 4UQGA 4XH4A 3THXA 3LPUA 1TAQA 1TYQA 2QWNA 1J54A 3DYAA 2UUBK 1RBSA 3VQEA 1BWFO 4LD0A 3L2VA 4H03B 3VQDA 4J2AA 2JGUA 1BI4A 4H5VA 3CD6N 2Z1JA 3TPQA 2IVNA 3CC4N 3DI6A 3M6GA 5AQTA 2YV0X 2AA4A 4M7XA 2QWOA 4PL7A 1U2VA 3T1YK 2GX9A 2F7TA 3THWB 3HVRA 1FW6A 4FW2A 2Q2RA 3VA3A 3CC2N 4DU3A 1N32K 2AP1A 3ZEUB 4FLZA 3LM9A 4GNIA 5BPMA 1Y97A 2YHYA 4BC3A 1JLQA 5C2FA 2WTUA 1XMOK 2D0CA 4YOVA 5JVGL 1KSPA 1MU2A 3MN5A 3RMBA 3SMSA 4BDZA 1BOTO 1DT9A 4B9LA 4EHUA 4CF9A 3AAQA 5GAEP 2YNIA 2UUAK 3S3NA 2PZSA 5KGWA 4BR2A 1NJYA 4NB4A 3ALYA 3T7ZA 3VGMA 1CZBA 4DU1A 4JKGA 2GUIA 5SWMA 5FRMA 3O08A 1TUUA 5AQZA 5AZJA 4DV5K 3WXLA 2P5GA 3NGZA 3TARA 3O9TA 2O8FB 1ZXOA 4FWQA 3AVLA 4B3SK 3MDQA 4E19A 5C10A 1VQ5N 4QS7A 1Q81O 3TU5A 3P5JA 3D2FB 3GG4A 1JLFA 1NBWA 2GV9A 3QBXA 5BR9A 4N41A 2O8BA 1T3VA 4H0YB 3L0QA 5AQLA 3DLEA 1JCGA 4OJRA 5AZIA 5LMNK 4LFBK 1QVGM 3CQ8A 5M1QA 2ZGZA 2ZD1A 2NRWA 3WUHA 4A2AA 1EQYA 1GOBA 4IDHA 3WXIA 4AHVA 3TR8A 4H8KA 3AGRA 3QO9A 1Q9YA 1HKGA 4JI5K 2CGLA 3ZT1A 5KPRA 1NLVA 1RDUA 1IO2A 2P9NA 2ZM6K 1ZBUA 2QXFA 3MCAB 1NK6A 4DQQA 3Q7BA 3T1AA 1NKBA 1GLBG 5AQNA 3THYB 2QW9A 4JI8K 5JS2A 4BVPA 4BGBA 4DKWA 3VTHA 4KREA 2IS3A 3VQQA 3M8SA 1IBMK 3CQYA 3VENA 3PV8A 2G8IA 2VG5A 4DSKA 3AVBA 1T8EA 5BN9A 1NOZA 3DXKB 1VQMN 4CHQA 1NGCA 3QFPA 1H1VA 1XHZA 3IRXA 4EZ9A 1WAJA 1WSIA 2IVPA 3NE6A 5F0XA 3AO5A 4HTUA 4WFAL 3H6EA 3UKUA 1T05A 4X65K 1HPZA 3CCJN 4M3TA 3KLEA 4M63C 3EO3A 5E26A 1BGXT 3VGKA 4YDUC 1S6PA 3MMVA 1HNXK 3NH2A 1ATNA 1XHXA 1VSFA 5E41A 3CHWA 2UUCK 2YKMA 3TABA 4R79A 1KD1O 4JAXA 3H1QA 4B9TA 3D45A 3HTVA 1X9JA 4CBWA 3QNOA 3CERA 4J8FA 4JI7K 3ZSWA 1KRPA 3J7ZO 4Y1DA 4M3YA 4IOCL 1SUQA 4BRFA 1RBTA 1C6VA 4YOXA 1M1KO 4MQ3A 1RGIA 2HHHK 2E2NA 4MO5A 3K9JA 4FM0A 1YJ9N 3LDNA 1LAVA 4O55A 3PO4A 2NRRA 1L5UA 3WXMB 4KHQA 4BWJA 3OYLA 2DY4A 5GINA 3HVTA 2OCEA 4DS5A 1IBKK 4RG8A 4JI0K 2P9LB 2VGNA 3OHRA 4OX9K 4CK1A 1FKPA 1X9WA 3I56N 3ZT2A 3CFPA 1BQMA 2P51A 2HHWA 2WUSA 1RBVA 1X9SA 3BF1A 3J7YP 1Q9XA 4DWIA 3MN7A 5GADP 4DSEA 4BRMA 2OTJN 4DF4A 4YOUA 5C24A 4JN4A 3VN5A 4DTRA 4GV9A 2O8DB 3TWHA 3PX4A 3OYJA 3L6QA 1WBBA 3SJHA 2OPRA 2XY5A 3U9ZA 2R7YA 3CF5L 1NGFA 3AVGA 4RW7A 4DU4A 4F4KA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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