2ZGYA

Parm with gdp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
total genus 102
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA01
4B9QA 3U8XA 3SLCA 3O1BA 3VEXA 5AQGA 4DCHA 4F9OA 4BQZA 1JCGA 5KQDA 4Y0WA 2WUSA 5I9EB 5JLFA 2P9SA 3O4WA 1BU6O 3ZETB 3DJCA 3FZHA 4CD1A 1YUWA 4FWLA 4CZKA 1S3XA 3IMXA 1ZBSA 3FZKA 3CETA 1C0GA 3O5BA 3F9MA 2D0PA 4FOEA 1ZXOA 4B1XB 4BG9A 2CGKA 2CGLA 2P9LB 2QM1A 5AZJA 4PL7A 1NM1A 5AZJB 3I33A 2ASOA 3J8AA 4JHDB 5E84A 4BGBA 5AZIA 5AZIB 4KBOA 4FSVA 3HZ6A 5AQQA 4RTFD 3O08A 4H5NA 4IWVA 4B1YB 3GDQA 4BR2A 4EHTA 2Q31A 2FF6A 3WXJA 4CZHA 4BRDA 2W41A 4GY2B 3MDQA 2PBDA 3GG4A 2F9TA 4FWKA 2E88A 4ISGA 5BRFA 3ID8A 1XQSC 4NB4A 3ULEB 3H3NO 3BUZB 5BPMA 3LL3A 3MN6A 3H3OB 1Q18A 4QS9A 2P9KA 1HKGA 1DGKN 4FPAA 3L6QA 3MN7A 4PKHA 2ZGYA 1DEJA 1ATSA 2YJEA 3GE1A 4M7YA 4BR7A 1GLLO 4BG8A 3QBWA 4YDUA 4XH1A 4JAXA 4BRHA 4BRNA 4JN4A 1NLVA 3JS6A 4BRMA 1JCFA 1HUXA 3ENHA 3M3ZA 4JD2B 4EHUA 1J6ZA 3VEZA 3FZFA 4GNIA 1GLCG 2OANA 4H5VA 2GWJA 1LOTB 5BN9A 3HI0A 2ZF5O 1YVNA 2YHXA 4XH5A 2Q1NA 4BRFA 3A5MC 5BR9A 3ZEUA 5CE3A 4H0VB 4MLHA 2A5XA 4A2BA 1KAZA 4K42A 1GLEG 4IJNA 1ATNA 1LCUA 3W0LA 2P9KB 1R59O 3DXKA 3H45C 3M1FA 5FPDA 3LM9A 2ZGZA 1BOTO 2YJFA 4XH4A 1Z05A 4BC3A 1HKBA 1GLDG 2GWKA 4HWIA 2A6AA 1S22A 3LM2A 4QS8A 3BF3A 3HSCA 1XC3A 3SK3A 5JLHA 1TUUA 2NLXA 2HMPA 2IIRA 3VF2A 4B1ZA 4I6MB 3VEYA 5FPEA 2AA4A 3H1QA 4EFHA 4PKGA 1QQOA 3D2FB 5AQYA 1NGDA 2DPNA 1NGJA 3VF6A 4MO4A 2D1KA 3D2EA 2V51B 3HM8A 2FXUA 3S41A 4BR5A 4BC2A 1KXPA 3SJHA 2Q0RA 3A8YA 2NZTA 3VGMA 4DB3A 5LY3A 3IDHA 3WEEA 2YI1A 3LDNA 4JHDA 5AR0A 1NGBA 2PAVA 2YHYA 5F1XA 2HF4A 4WQ4C 1DKGD 1BA0A 4BRKA 1GLAG 3M6GA 3EKSA 3TU5A 2Q2RA 3CJ1A 4BVPA 4IXCA 2P9NB 5F2RA 2P9IA 2QWRA 2P9IB 3VF4A 4BC4A 4CBWA 4CZGA 5AQWA 1HX1A 1K8KB 5JICA 3B8AX 4FL9A 3ZX3A 1NGGA 3LDQA 2D0OA 5AQZA 4EAHD 4MLEA 4L3QA 1QQNA 5AQHA 3WQUA 3CQYA 3TPQA 5AQRA 4XEIA 2HF3A 4MO5A 4CZJA 4CBXA 1HJOA 1KAYA 3ZX2A 1GLBG 2P9LA 3QICA 4AM6A 3A0IX 3QB0A 2AP1A 4H0YB 2P9PA 3VEVA 5ELZA 4E1JA 3VENA 5AQFA 3KZBA 1NGEA 3U9ZA 4BRLA 4Z94A 1U2VB 3CJ7A 4BRIA 1X3NA 2E20A 2P9SB 3EN9A 3ZEUB 4BR0A 3H6EA 3CJCA 2FSNA 2Q36A 4EIAA 4BQLA 4AM7A 1NWKA 1X3MA 2E1ZA 4FOIA 4FWOA 2ZWHA 4BR4A 1U6ZA 4FWNA 5JMVA 4BROA 2QWOA 4K41A 3QDKA 3UKRB 2IVNA 3UKRA 3RSEB 3WQTA 3VEOA 3CERA 1QQMA 1OKJA 3A5OC 3O6WA 4IZ9A 4FWMA 3U4LA 2W40A 2ASPA 1HLUA 2P9NA 4FWSA 3VETA 1BA1A 4BRAA 5BPNA 4HTLA 5EOYA 1MA9B 3ATVA 3AAQA 5EX5A 1GLFO 4LC9B 3OHRA 1NGAA 3W3DA 3H46O 3R6MA 2FF3B 2E2NA 3WT0A 3CJ9A 3FZLA 1YAGA 4RCHA 1QZ5A 2D4WA 4BRQA 3SMSA 1RGIA 1WOQA 3G25A 5AQIA 3VERA 4CBUA 3AAPA 2KHOA 4FWRA 2H3GX 4H03B 4IJAA 3VEWA 4H5RA 4PL8A 3MCPA 4WQ4A 1ATRA 4WYBA 3FR0A 4JD2A 1Z6RA 2YHWA 5AQLA 1H1VA 4H0OA 3EL2A 3WUHA 1QZ6A 3DAWA 4CI6A 3DXMB 3WXKA 2CH5A 1QHAA 5KPRA 4B1UB 2VWBA 5ADXA 2Q0UA 3I8BA 4FWPA 1EQYA 3U9DA 1NGHA 2A42A 1MWMA 1X9JA 3MN9A 3BF1A 1CZAN 5EVZA 2IVOA 3C7NA 4B1VA 2QWPA 3WXIA 2VYPA 4H0PA 3A5LC 5TKYA 4BVOA 5FPMA 3QMLA 4CZMA 5KQ8A 1ZC6A 2HOEA 1T6DA 2BTFA 2GELA 5E26A 3QFPA 3ATUA 2QW9A 2P9PB 1RDWX 3LDPA 5FPNA 4BR9A 5ADXH 3HBTA 3UKUB 3BP8A 4WQ5A 4BC5A 4H5WA 5F0XA 2GTDA 3SMPA 3O1WA 2V7YA 3ENOA 4BRPA 1YXQA 4BRGA 2QXLA 1NGFA 5AQTA 3CI5A 4YDUC 1KAXA 2CGJA 3LDOA 1SQKA 3WEEB 4CD3A 2P9UB 4IO8A 3CQXA 3QBXA 3QFUA 1MDUB 3FGUA 3DXMA 2ITMA 5LJWA 2QWNA 1IJJA 1BG3A 5AQUA 4B1WB 3ZX0A 2EWSA 5AQVA 4H0TB 3LDLA 4FWQA 4CZLA 5BPLA 4FO0A 4ISEA 1HKCA 3VGLA 2E2OA 2E1YA 1TUYA 3GL1A 1BDGA 2FSJA 4WQ5C 5AQXA 5BN8A 1NGIA 3JXUA 3R8EA 1E4FT 3UKUA 3ZETA 1WUAA 3D2FA 4QS7A 5EXWA 4A61A 4O5FA 3GBTA 3GOIA 4ISFA 4M7XA 2QWMA 3D2EB 3L4IA 4K25A 5AQPA 1V4SA 3DXKB 4H0XB 4C23A 1SZ2A 3FE1A 5AQSA 1JCEA 4CZIA 4JNEA 2QWQA 1GLJO 2E2PA 4DQ8A 3FLCO 2A3ZA 2ASMA 3VGKA 3AARA 4CZFA 3O80A 3CIPA 4H5TA 1U2VA 1V4TA 2BUPA 5BRDA 4A62A 5AFUH 1Y64A 2CH6A 2I7NA 1NGCA 4RWTA 3KHYA 3HTVA 3MK6A 1K8KA 3ULEA 4BREA 3MN5A 4BRCA 2E2QA 4NO7A 2GUPA 4O8KA 2QWLA 3VPZA 2V52B 3C7NB 4M63C 5AQOA 3L0QA 5BREA 3VOVA 5KPZA 1E4GT 2P9UA 3KVGA 5B8HA 3DWLA 5AQNA 2FSKA 4BGAA 5EY4A 1BUPA 5KPTA 3AY9A 2A41A 3C0BA 5AQJA 2I7PA 2VCPA 3CHWA 1D4XA 2UYTA 1BWFO 1RFQA 5AFUA 5BRHA 4A2AA 1HPMA 3VESA 1NMDA 4I6MA 3CJAA 4DHYA 3P4IA 3UE5A 1SAZA 3EZWA 2V7ZA 4CJ7A 3EO3A 1T6CA 1NBWA 3UB5A 3IUCA 3FFKB 3EKUA 2A40A 4K43A 3WXLA 4FPBA 3BEXA 1G99A 2IVPA 4PKIA 1C0FA 2GEMA 1ESVA 5AQKA 1MWKA 3FZMA 5AQMA 3MMVA 5LJVA 1T44A 1TYQA 1BO5O 1TYQB 2Q97A 1IG8A 3IFRA 3CJBA 2FLOA 2E8AA 3O8MA 2F9WA 2J4RA 1P8ZA 3RSEA 3D7EO 2YCHA 3H1VX 3R9PA 2NRHA 4J8FA 3A5NC 1XUPO 4CZEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CESA 4KO0A 2VWKA 4BE0A 5KRSA 4CEZA 3OYCA 3TAPA 1NK0A 4LFAK 5AQGA 3G10A 4M42A 3KLEA 5KQDA 1K73O 3DLEA 3O4WA 1BU6O 3ZETB 1NK7A 3FZHA 4CD1A 1XI1A 1HQEA 4FWLA 4CZKA 1S3XA 3IMXA 4DWIA 3FZKA 4FOEA 1ZXOA 3JSMA 2CGLA 3AO3A 3HOSA 4YOXA 4PL7A 4HUEA 1TK5A 3I33A 3SI6A 4NXNK 2HBKA 5M1FA 4BGBA 1JL2A 5E84A 2RHKA 3MXMA 1OH5A 5AZIA 5AZIB 3OYDA 4KBOA 4J2BA 1Q7YO 4H5NA 4JKFA 4B1YB 4BR2A 4EHTA 3B6OA 4CZHA 4BRDA 2KZZA 4LF9K 3C6UA 2I5JA 2F9TA 1L3UA 3S3MA 3ULEB 5T7BA 1CZBA 3RWUA 1X1PA 3LL3A 2YNGA 3H3OB 1OH8A 2P5OA 2ZM6K 4BY9C 3RR7A 3CCQN 1RTJA 3TABA 4PWDA 4PKHA 4B9UA 3V9WA 2ZE2A 3LZJA 2QK9A 1NMNA 4BR7A 4CIEA 1WBBA 4CJEA 1E3MA 3QBWA 3HK2A 1N6QA 3FFIA 4OLBA 1Z25A 4BRMA 3OYMA 2F96A 1JCFA 3IKMA 4JD2B 2WOMA 4DF8A 1J6ZA 4O0JA 4NYNA 3NGIA 2GWJA 2P51A 2ZF5O 2Q1NA 4CGIA 4DR3K 5M1KA 1HJRA 1VQ6N 4NCBA 3NFAA 1D8YA 4A2BA 2QKBA 1JLCA 1GLEG 4IJNA 5CZ1A 3ASMA 3M1FA 4B9LA 2ZGZA 1TAUA 1C1BA 1BOTO 4DV0K 1HNIA 4IBNA 4CJLA 4I9LA 1GLDG 3CCUN 1L5UA 1N36K 3ZSWA 1EO1A 3LANA 2A6AA 2VGMA 5HROA 2HMPA 2X74A 4CF0A 3Q7CA 3E9LA 4IDHA 4DU3A 1QQOA 2HB5A 4DTOA 3T3FA 3V6DA 5AQYA 4FW2A 2HNDA 1NGJA 3VF6A 4DR1K 4DF4A 2D1KA 2E6LA 3O4NA 4NLCA 4OVLA 3S41A 2UUBK 2ITGA 2IAJA 4BACA 3IDHA 4DUYK 4JYAK 2YI1A 3TAGA 5F1XA 1T05A 2HF4A 4WQ4C 4DTSA 1XMQK 4BRKA 3DYAA 1WSJA 5LMNK 3HPGA 2OZSA 4OPKA 1JJ2M 4IXCA 2P9NB 3CCMN 1TKDA 2P9IB 4X65K 2QTDA 1S5JA 1SKSA 3HP9A 2QXFA 1NGGA 1T7PA 3NCIA 5CY4A 2D0OA 4MFBA 3OS0A 4CJUA 4CEDA 3HT3A 4CJWA 4FK2A 1IV0A 2HF3A 3KLHA 4KPYA 4GVEA 5JS2A 4LY7A 3KK2A 1YTAA 4DMNA 3LPTA 4AM6A 3DLKA 3A0IX 4JKBA 3QB0A 3CFRA 4Z4IA 3ZT4A 2GUIA 1TL1A 5HRNA 4CJTA 4Z94A 4LF5K 4BRIA 1X3NA 4BR0A 4FJMA 3HXMA 2FSNA 1X3MA 2E1ZA 5JMVA 3T7ZA 1VQ4N 3IS9A 2G8UA 3ZSYA 4WFAL 2QWOA 3MXJA 4K41A 3QDKA 4FJ5A 3C6AA 3UKRB 1D9FA 3E01A 2O4GA 2OA8A 3VEOA 3CERA 2XY8A 4FWMA 4CGDA 5GIPA 1HLUA 4DR2K 1RNHA 5BPNA 1JLQA 3AGKA 1X9MA 3AAQA 1NJZA 1GLFO 1RT5A 3P5JA 3Q7BA 3W3DA 2FF3B 4YHHK 3NMUA 2FBVA 4RCHA 2D4WA 1LWEA 1FKPA 5AQIA 4CBUA 3AAPA 2KHOA 1T03A 2VWJA 1IO2A 4PL8A 3G6EN 1ATRA 2YHWA 2VQEK 3VQAA 1C0UA 3OW2M 1XWLA 2BDPA 4CI6A 2QA4N 1Q9YA 4CHOA 4KREA 2A1RA 1SV5A 4N47A 1EQYA 2QEXN 3CCRN 3BY5A 2A42A 1ZBHA 3ZSXA 4YOTA 3THXA 3O9UA 3WXIA 4O8UA 1W97L 4BVOA 4ILJA 4JI4K 4CZMA 1C0MA 3WNEA 5KQ8A 2GELA 3QFPA 4FM1A 1K8AO 4AHTA 3OBYA 4DQIA 2NRRA 3SQ1A 4DFKA 5ADXH 5DMRA 1K9MO 1KRPA 5D3GA 2WC9A 1KFSA 2X6SA 4H5WA 2GTDA 2YNFA 3ZSVA 3SMPA 4JRPA 4FZZA 1JLEA 3C6HA 1YXQA 2Z1JA 3CI5A 3IG1A 3V9UA 1S72N 4C8NA 4DV7K 3L2QA 2VG7A 1MDUB 1M1KO 5LJWA 4JEPA 1YF5L 4JI6K 4V19S 3ZX0A 2O8FB 3CCLN 4FWQA 3CC4N 3LP0A 1BHLA 3SPZA 2E1YA 3C6TA 1TUYA 3V9ZA 3GL1A 3KLIA 1Q9XA 4WQ5C 5BN8A 1C1AA 2OPRA 1TKZA 3F2KA 2GX9A 3TTFA 3D2FA 4QS7A 3ULDA 5I3UA 1ZYQA 3GBTA 1OVYA 4ISFA 3L4IA 1WNSA 3K2PA 1WSFA 3DXKB 1SZ2A 5M1PA 2KQ2A 4W5TA 3AO4A 3LP2A 2QWQA 3FLCO 1IH7A 3VGKA 1VQ5N 3F73A 3AARA 2PY5A 4CZFA 1BCOA 3O80A 1U49A 1U2VA 2BUPA 4A62A 5AFUH 3M8QA 4ZHRA 1NGCA 3HTVA 3KHYA 2OPQA 3HL8A 4NYFA 3QINA 3CF5L 5J1EA 2BGGA 2E2QA 2GUPA 4K0KK 4ILGB 4FJHA 4LFCK 4LFBK 3VOVA 2G8IA 4FYDA 1E4GT 2P9UA 4BGAA 4K8ZA 3U6FA 1TKXA 1BUPA 1VRTA 5KPTA 3VQBA 4C1NI 3C0BA 4CEEA 1VSDA 4CGJA 2JWLA 4MQ3A 1BWFO 4FLVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5C2F A;  4PY5 A;  3EEQ A;  4B9T A;  4A59 A;  3KKR A;  5DM7 L;  1RT4 A;  4EP4 A;  3LP1 A;  1A5V A;  4H5T A;  5SZT A;  3F9K A;  1Y64 A;  4B8C A;  2I7N A;  3OVN A;  4F3T A;  3KK7 A;  1U4B A;  3VQ5 A;  2GBZ A;  3ZT1 A;  4NO7 A;  3EE8 A;  2O8E B;  4O8K A;  3DLB A;  3VPZ A;  2V52 B;  3R3L A;  3ZT3 A;  4JI8 K;  4CFD A;  5KPZ A;  5B8H A;  5AQN A;  2FSK A;  4FJG A;  3CC2 N;  3K5M A;  2G8V A;  2A41 A;  2Z1G A;  3AA2 A;  3NF7 A;  3NBP A;  4E7I A;  3OBW A;  1W2B M;  3LAK A;  1D4X A;  1U04 A;  1WAF A;  2XY6 A;  5AFU A;  5BRH A;  1HPM A;  3VES A;  4I6M A;  3CPW M;  4DHY A;  4CW7 B;  3P4I A;  3NHG A;  3ISN C;  3IUC A;  3JAM O;  2BE2 A;  4K43 A;  1YI2 N;  3J80 O;  3WXL A;  4W5O A;  1ESV A;  1JLG A;  5AQM A;  4DTU A;  1BO5 O;  1S1U A;  4N56 A;  4ID5 A;  3EYZ A;  1ASV A;  3O8M A;  3PX0 A;  2J4R A;  3D7E O;  4IG0 A;  4FLT A;  3PSF A;  4O0I A;  2NRH A;  4J8F A;  4YOW A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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