2ZGYA

Parm with gdp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 102
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA01
4H0OA 3IDHA 1KAYA 2A42A 3ZEUA 2EWSA 1MWKA 3U8XA 4XH5A 3GOIA 2P9KB 4FWOA 4AM6A 1Z6RA 1HX1A 1EQYA 3H45C 4CZIA 5AR0A 3MN6A 3U9ZA 2P9UA 4IZ9A 2P9PB 4FOEA 3VF6A 3DWLA 4FPAA 4PKGA 4B1YB 4C23A 2PBDA 3WEEA 3LDPA 2ASOA 1C0GA 5ADXA 5LY3A 4F9OA 2NLXA 3P4IA 2P9NB 3FZMA 3CI5A 1QQOA 2V52B 1QZ6A 4XEIA 5BN9A 3WQUA 3VGMA 3W0LA 4GY2B 1NGGA 1GLDG 5JICA 4CBWA 3CERA 1V4TA 1X3MA 2Q97A 3MCPA 2ZF5O 1SQKA 2GWJA 1TYQB 1T6DA 1JCFA 5I9EB 2W41A 1Q18A 3LM9A 4ISEA 3M3ZA 2Q31A 5KPZA 4BC2A 3FGUA 4CZJA 2FSKA 5JMVA 3L4IA 5EXWA 1ATSA 4BQZA 1GLLO 2CGKA 2QWRA 3UB5A 3QDKA 2BTFA 3UKRB 3MMVA 5AQWA 2VWBA 4K43A 3CJ9A 4B1VA 1QQMA 3LL3A 4FWKA 3CQYA 5FPEA 1X3NA 1G99A 4BC4A 1YXQA 1XUPO 3EL2A 3H46O 3UE5A 4O5FA 1MA9B 4A2AA 2D1KA 4WQ5C 2P9NA 1ZXOA 3M6GA 2CH5A 1NMDA 4I6MA 4AM7A 4CZEA 2CGJA 3D7EO 4EHTA 3WQTA 5F2RA 3QFUA 4HWIA 4Y0WA 3SMSA 3TU5A 3H6EA 3KZBA 1MWMA 1IG8A 4IXCA 3AY9A 4WQ5A 1ZC6A 3CETA 3UKUB 1GLJO 5AQNA 4DCHA 1NBWA 1C0FA 1NGEA 1NWKA 3HI0A 4FWSA 5AFUH 2E1YA 2UYTA 3FLCO 4BR4A 4FWNA 3ZEUB 1OKJA 3QBXA 2FF3B 5KQDA 2D4WA 1KXPA 2AA4A 2P9SA 3CJ1A 3UKRA 2CH6A 2V7YA 1HKCA 4BC3A 2AP1A 3WXIA 3GL1A 3CHWA 2P9UB 4H5RA 1R59O 3R6MA 4QS8A 3VOVA 4BRMA 4BQLA 1Y64A 4FWLA 4BROA 2Q2RA 5JLFA 1HJOA 3ZX0A 5EOYA 3SMPA 3VEOA 3WEEB 2FSJA 2YI1A 5AQZA 5AQVA 5BRDA 5AQHA 3DAWA 2QW9A 2E1ZA 3H1QA 4JAXA 3UKUA 3LDQA 3VEVA 1ESVA 4JN4A 3CJ7A 4BRQA 4CZMA 3S41A 5BRFA 2QWOA 5BPLA 5AQKA 4A2BA 4RWTA 3A0IX 4JHDA 4YDUC 1LOTB 3FE1A 4J8FA 1BWFO 5F1XA 3R9PA 4MO5A 1BO5O 3L0QA 4M7YA 3HM8A 4MLHA 5AQYA 1JCGA 2HOEA 5AQLA 2KHOA 3I8BA 1NGCA 3GBTA 1BU6O 3H3OB 3SLCA 4BRNA 1ZBSA 3D2EA 2ZGZA 1QZ5A 2Q0UA 2VCPA 3WUHA 4DB3A 3O6WA 3A5MC 5FPMA 3IFRA 2Q36A 1GLCG 3QBWA 2ITMA 3VF2A 3CQXA 2YCHA 2GELA 3FZKA 4IO8A 2Q1NA 4BR9A 1WOQA 1CZAN 4I6MB 1J6ZA 1KAZA 3AAQA 2HMPA 5AQPA 1HPMA 3WT0A 1BA1A 2ZGYA 1V4SA 3KHYA 3BF1A 3EKSA 4EIAA 1HUXA 2I7PA 4M7XA 5TKYA 2FSNA 2VYPA 3BEXA 3OHRA 3VENA 4EAHD 3AARA 2A40A 4MLEA 3L6QA 4CZGA 3FFKB 1U2VA 1JCEA 3C0BA 4BRHA 2P9SB 3VF4A 3HTVA 5B8HA 5F0XA 4QS7A 4BGAA 4QS9A 3DXKA 4ISGA 4PKIA 4CBUA 4GNIA 1BA0A 3JS6A 5AQQA 2QM1A 4E1JA 5JLHA 3M1FA 2QWLA 1NGBA 1YVNA 3VGLA 5EVZA 3I33A 4BRFA 2E88A 1YAGA 4DQ8A 4CZLA 1GLAG 2YHXA 3LDLA 5AQTA 3F9MA 4H0VB 4PKHA 2YHWA 3O08A 4FOIA 5AQMA 2HF4A 5E84A 5AZIA 3VEYA 3VETA 4O8KA 3O1BA 3WXKA 3KVGA 3BUZB 1HLUA 4WQ4C 4XH4A 1P8ZA 4CZFA 3BP8A 4RCHA 4BRIA 1RDWX 1XQSC 3ATUA 1T44A 2QWNA 4JHDB 1IJJA 2Q0RA 2BUPA 1E4FT 3A5NC 5AQSA 4H0PA 3MN7A 3EKUA 4K25A 3LM2A 3VESA 3ZX2A 1DGKN 5AFUA 4A61A 3WXJA 4BRPA 2A3ZA 4CI6A 3D2EB 1RFQA 2FF6A 3AAPA 2YHYA 5AQJA 4IJNA 5LJWA 5ELZA 1HKBA 4H5TA 3O4WA 1S3XA 3VEXA 3HSCA 4CD1A 3O5BA 5AQIA 2E2PA 4FWRA 4ISFA 4BRLA 4FO0A 3ZX3A 3HZ6A 4BVOA 3GDQA 1NGHA 4CZKA 2PAVA 3O80A 4WYBA 3CIPA 2YJEA 2E2NA 1XC3A 4BR2A 5BREA 2QWQA 4JNEA 3QICA 3C7NB 2A5XA 3BF3A 5AQRA 1NGJA 3LDOA 5AZJB 2H3GX 2W40A 4H03B 5E26A 4A62A 5LJVA 1KAXA 1U2VB 3GG4A 4FSVA 4XH1A 3VGKA 1DKGD 4Z94A 3QB0A 3ZETA 1K8KA 4YDUA 4FWQA 2F9WA 1DEJA 3W3DA 4BVPA 1NGAA 3B8AX 3FZHA 1MDUB 4H0XB 4M63C 3DXKB 4BC5A 4B1UB 1GLBG 3SJHA 1Z05A 3CJBA 4JD2B 5ADXH 1BOTO 2P9IA 4BGBA 1ATNA 3A5OC 5KPRA 5BPNA 4RTFD 5AQGA 2GUPA 4PL8A 4B1XB 4BG9A 3C7NA 2I7NA 5AZIB 2FXUA 3DJCA 2E2QA 2ZWHA 3D2FA 3QFPA 1TUYA 1LCUA 5AZJA 5AQXA 2NRHA 4B9QA 1NM1A 1BG3A 2IVOA 4LC9B 3ULEA 1QHAA 3GE1A 5AQUA 2QWMA 3VEZA 3TPQA 4EFHA 5BN8A 4PL7A 1S22A 4BRCA 3RSEB 5CE3A 3JXUA 2V51B 4DHYA 3MN5A 4B1WB 2GEMA 3HBTA 3ID8A 1QQNA 3EO3A 4IJAA 3WXLA 4IWVA 5AQOA 2P9KA 4JD2A 4HTLA 2D0OA 3G25A 2J4RA 4K41A 4MO4A 4BR0A 4L3QA 2E8AA 4FWPA 4KBOA 4EHUA 3DXMB 2P9PA 3A8YA 3H3NO 2ASPA 3FR0A 4BRGA 2P9LB 4NO7A 5KQ8A 3A5LC 4BRKA 1WUAA 3U9DA 4B1ZA 4BRAA 1GLFO 3O8MA 2GTDA 4H5VA 1TUUA 4BR7A 3ENOA 3ENHA 2E20A 5FPNA 4H0YB 2WUSA 2A41A 2GWKA 3SK3A 1X9JA 2IVPA 3EN9A 2IIRA 3RSEA 4BREA 2IVNA 4BRDA 1SZ2A 1ATRA 1TYQA 2DPNA 2V7ZA 2QWPA 3U4LA 4CD3A 3FZLA 1GLEG 3J8AA 4WQ4A 5FPDA 1YUWA 2A6AA 5EY4A 1SAZA 3VPZA 4FL9A 1NGDA 3ZETB 1K8KB 2D0PA 2F9TA 4BR5A 3CJCA 5KPTA 4H5WA 3VERA 3O1WA 3IMXA 1T6CA 3ATVA 3DXMA 4FWMA 4FPBA 1D4XA 1NGFA 3LDNA 5BR9A 3R8EA 3QMLA 2P9LA 4CZHA 3H1VX 1BDGA 1RGIA 4CJ7A 1E4GT 3IUCA 2P9IB 3MN9A 1NGIA 5BRHA 4H0TB 5AQFA 3FZFA 1NLVA 2E2OA 2FLOA 1HKGA 2HF3A 2YJFA 2CGLA 3VEWA 3CJAA 2OANA 3EZWA 1BUPA 3D2FB 4NB4A 4H5NA 4CBXA 2ASMA 4K42A 1U6ZA 3MK6A 5EX5A 2NZTA 1H1VA 3ULEB 4BG8A 5BPMA 2QXLA 3MDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HYZA 3QEXA 4CFCA 3ZEUA 1OH5A 3L2RA 4ZHRA 3AA2A 1EETA 5C25A 3SJJA 3H45C 4CZIA 4PY5A 3AVJA 3MN6A 4WF9L 4C8KA 4LFBK 3CCLN 1RBVA 3KD5E 4JKAA 1HMVA 4B1YB 5CY4A 3NAEA 4LY7A 2ASOA 3G4SN 3V9SA 2NLXA 1HR0K 2ZJQL 3MEGA 1QQOA 4PUOA 4H4MA 1U47A 1JLBA 4KO0A 3CCQN 4NXNK 3CERA 1ILYA 3CYMA 1V4TA 1X3MA 2Q97A 1VQMN 1TYQB 5I9EB 3O3HA 1Q18A 3JYTA 3O9TA 3ZT0A 3LM9A 4HCBA 4JKGB 3M3ZA 4BC2A 1WSGA 3SBTA 1XC9A 3TAPA 2FSKA 1SL1A 4DV7K 3NGYA 3KWGA 1YTAA 2E4LA 2VG6A 4B1VA 5GAEP 3LL3A 1G99A 4BC4A 3UE5A 4O5FA 1MA9B 4IDKA 1ZXOA 1REVA 1NMDA 4FW1A 5C2DA 3WNEA 4IEEA 4CJ5A 3WQTA 5F2RA 3NBPA 3ISNC 3SMSA 1SL0A 2HHSA 4LF9K 2XO7A 4NCAA 4BDPA 2VGMA 4WQ5A 1ZC6A 5AQNA 2G8HA 1NBWA 4JLHA 5D3GA 1HYSA 3HI0A 4FWSA 2E1YA 4CGGA 4DTMA 2UYTA 3L4QA 3U3GA 1LW0A 3ZT2A 4FWNA 3VMFB 3DLHA 2AA4A 3CM6A 4MFBA 1FKOA 4CF8A 4CCHA 2V7YA 3K0SA 1KRPA 4CFAA 2W6LA 3VN5A 2AP1A 3WXIA 4DFKA 2HB5A 4LH4A 1R59O 4QS8A 1RILA 3K5NA 1HYVA 3AVMA 1HNXK 1JXEA 4IFEA 1TKZA 5AQVA 2NRVA 4JI0K 3AO4A 3V1OA 4EP5A 1W97L 2E1ZA 3H1QA 3QINA 4DG1A 2O8EA 4CE9A 4F8RA 3IAYA 2JLEA 1FJGK 3F2KA 3VEVA 3RMBA 4BRQA 4CF9A 4JK7A 4UQGA 3PX0A 3ZSRA 4A2BA 4JI7K 4E7IA 3L0QA 3HM8A 4MLHA 5AQLA 2UUCK 1BHLA 3MEEA 3CD6N 3OYFA 4JS5A 4BRNA 1BU6O 3ZSXA 3SQ2A 2ZGZA 3AA4A 1Q81O 1DTQA 1VQLN 4HTUA 4FJ8A 1B92A 1VQKN 1RBSA 3QBWA 2ITMA 4DR1K 1SKSA 1KSPA 3R3LA 3CQXA 4DV3K 3FZKA 4IO8A 3WNHA 4AHTA 1E3MA 2PY5A 4GVEA 2FC0A 2KZMA 3MWPA 1EXQA 1KD1O 3BY5A 4GVMA 5AQPA 2QXFA 3WT0A 1BA1A 5H1SQ 2ZGYA 2RF2A 1G15A 3EKSA 1HUXA 3U3YA 1KQSM 5TKYA 2XHBA 2YNFA 3PY8A 1NOZA 3L6QA 3UIQA 4YNQA 2HHTA 1ASVA 1U2VA 1JCEA 3TTFA 2HVHA 1WBDA 5B8HA 1X9WA 4FLTA 4KH6A 4QS9A 3M8RA 1BA0A 1TV6A 4O0JA 4DSEA 1NKBA 1YVNA 3KJVA 3VQBA 4KHNA 2G8WA 2WBNA 3DLRA 2HVIA 5K14A 1YAGA 1U48A 3LDLA 5AQTA 4H0VB 4MQ3A 4CGJA 2FBVA 4FOIA 5HROA 3PSIA 5KTQA 1BQMA 3WXKA 4WQ4C 3SPYA 1VSJA 3CC7N 3NHGA 4RCHA 4BRIA 2YNGA 1EP4A 3JSMA 1BGXT 3ATUA 2QWNA 1IKWA 1C1AA 3MXJA 2GUIA 1JL1A 4O4GA 3A5NC 1KVAA 4H0PA 1BL3A 3LM2A 3VESA 2X78A 3ZX2A 4JK9A 5AFUA 4BRPA 2FF6A 1BI4B 2B4JA 5SZTA 4E7JA 5C0YA 4Y1DA 2Q3SA 2HNZA 3B6PA 5M1QA 3Q7BA 4FWRA 4YOYA 4DU1A 3AA5X 1NGHA 4OVLA 2PAVA 3VA0A 3KD1E 4WYBA 3EZ5A 3ALYA 2D0CA 2Z1HA 4M42A 1UOCA 4CJTA 3PX6A 4CK3A 4AHVA 2A5XA 3DLGA 2QKBA 3NF7A 1NK5A 5E26A 3S3NA 4R5PA 1RBUA 5LJVA 5KI6A 4KFBA 4CHOA 1VQ5N 4N76A 3HVRA 2F9WA 3W3DA 4C8OA 1NGAA 3B8AX 5M1OA 1MDUB 4BC5A 2D0AA 4CJWA 3T3FA 4PA1A 4DQPA 3ZSZA 3CJBA 1HNIA 5ADXH 1UWBA 4BGBA 4GMJB 5C42A 2RHKA 4FZYA 4LFAK 4C8LA 4DR3K 3SUNA 1J53A 2YKMA 5E41A 4FCYA 2YHAA 1IBKK 3DJCA 4RW7A 4JI3K 1S1VA 4M3RA 4N47A 1KFDA 1VRTA 2IVOA 2UXBK 3LP0A 4CF0A 3E01A 4IFVA 3ULEA 2VWKA 5BN8A 3VEZA 4WFAL 1YJ9N 4FJ7A 4EFHA 4LF8K 4C8MA 3OYHA 4BRCA 5J2PA 3VTIA 2IGIA 3EO3A 2UXDK 1N33K 3WXLA 4NYFA 2ZE2A 2P9KA 1W9HA 3I0RA 4L3QA 2KFNA 4K8XA 4KBOA 2W42A 5JS1A 2P9PA 3A8YA 2ASPA 4CGHA 3T1HK 2P9LB 1IO2A 4I7FA 3A5LC 4BRKA 4B1ZA 1QS4A 4RG8A 4H5VA 5JS2A 1TUUA 3SI6A 4OJRA 3V81A 4DU4A 2Z1JA 3TAFA 2A41A 3EN9A 2OYQA 4AHCA 1S1UA 4BDZA 1GLEG 4WQ4A 1YUWA 3HL8A 4ILJA 4NLCA 3J81O 4CJ4A 4DF8A 4FL9A 4ELVA 4YFUA 4DTUA 3CMEN 1YT3A 3QEIA 1U49A 3O1WA 1QQCA 4CF1A 4OLBA 3LAKA 3LPUA 4FPBA 4LF6K 1NGFA 5GAGP 3R8EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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