2ZGYA

Parm with gdp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 102
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA01
1NGJA 2A6AA 3CJAA 1QQMA 2GWJA 3HI0A 3ID8A 4FWSA 1KAXA 3F9MA 2E2NA 4CZJA 3WXIA 4C23A 1TYQB 2I7NA 1GLCG 2A40A 4XH5A 3MN6A 4BR7A 3ATVA 3UB5A 3VF6A 1OKJA 2QWOA 3WXKA 5ADXH 2ZF5O 4JAXA 4PL7A 3P4IA 4JHDA 3TPQA 4E1JA 4FWKA 3ENOA 2P9IA 2J4RA 3VERA 4CJ7A 2ZGYA 4BRLA 5AQWA 1X9JA 2QWQA 3GBTA 4FPBA 1JCFA 1SZ2A 4PL8A 1TUYA 1WOQA 3C7NB 2NRHA 3EZWA 5AQGA 5E84A 2CGJA 1D4XA 4Z94A 5BRHA 3BP8A 3A5MC 3GE1A 2UYTA 3D7EO 1KAZA 4BRMA 3IMXA 2V7ZA 2FSKA 1NGHA 2Q31A 3H3OB 4H0PA 3R6MA 4IXCA 3SLCA 3IUCA 4PKIA 3O08A 1SAZA 4JN4A 3CQYA 4WYBA 4BVPA 5AQUA 3CQXA 3H6EA 3JXUA 3AARA 4FWNA 3DXKB 3O5BA 4H0OA 3U9DA 3WEEA 4B1ZA 5JICA 1YAGA 4FWLA 4WQ4A 1EQYA 4JD2A 3ULEB 4I6MA 3EN9A 5LJWA 2GEMA 3JS6A 1IG8A 1TUUA 3QDKA 3VOVA 4B9QA 5KPTA 2A3ZA 1BOTO 4GY2B 2CH5A 3QBXA 2P9UB 3ZETA 4BRQA 2GUPA 4QS7A 3VEVA 4Y0WA 4CBXA 3MCPA 3H45C 3LDLA 5F1XA 3WXJA 2ASMA 2NZTA 4BRCA 2E20A 3D2FA 2YHYA 5BN9A 4AM7A 1KAYA 4DHYA 3LDOA 4ISGA 1Z6RA 4RWTA 1ZXOA 1R59O 2OANA 1U6ZA 2P9LB 4IWVA 4CZFA 5KQDA 4BQLA 4FL9A 4ISFA 5KQ8A 3WQTA 1HUXA 4GNIA 3IDHA 4BRDA 1RGIA 4DQ8A 5BRFA 3M1FA 1ATRA 3VF4A 5AQKA 4H5NA 2QXLA 2P9PA 1Z05A 3W3DA 4A61A 3O1BA 3VENA 3VEYA 4FWRA 2GELA 4K42A 2AA4A 2YHWA 5ELZA 4BGBA 5AQMA 3GL1A 5AQYA 1C0GA 2P9IB 5AFUH 2YJEA 1GLFO 1QQOA 3VEOA 4XEIA 5EXWA 5AQJA 3FZKA 3FZFA 3MN7A 4WQ4C 3LDQA 3AAQA 3CJ7A 2ZGZA 3O80A 3LDPA 3VGKA 3SMPA 2VYPA 3VEWA 3QFPA 1HKBA 1GLBG 2YI1A 2GWKA 1SQKA 5FPMA 4CZKA 5LY3A 3C0BA 2QWNA 3L6QA 3DXMB 1YXQA 3EKUA 1KXPA 4QS8A 5F0XA 5AQFA 5AQSA 5BPMA 1E4GT 3MK6A 3WEEB 5AR0A 3L0QA 4H0VB 2E2QA 5AQVA 4FWOA 5F2RA 4JD2B 3UKUA 3RSEB 3ZX2A 4PKHA 3U8XA 3DAWA 4NB4A 3H1VX 3O8MA 1NGIA 2ZWHA 3BF3A 3FZMA 2QW9A 3M3ZA 4RTFD 5LJVA 1BO5O 4JNEA 4BG8A 3L4IA 3ENHA 4A2BA 2DPNA 4QS9A 3ZETB 2F9TA 1T6CA 3CHWA 2A41A 4BGAA 1MDUB 2GTDA 1XUPO 1DKGD 4M63C 4CZIA 5BRDA 3D2EB 3A5LC 3D2FB 3U4LA 4FWMA 4YDUA 4WQ5A 3M6GA 4H0YB 3LM9A 4BRNA 2W40A 1K8KA 2P9SA 1J6ZA 3AAPA 2A5XA 2FSJA 5AQPA 3BUZB 2CH6A 1HPMA 2F9WA 2QWRA 2HF3A 2Q36A 4CZGA 3UE5A 3CERA 2I7PA 1H1VA 1QZ5A 4KBOA 1NWKA 2YJFA 3A8YA 2Q0UA 2IVNA 2P9PB 1BG3A 4BR4A 2CGKA 1MA9B 2IIRA 1RFQA 3DJCA 3HTVA 3H3NO 5EVZA 5JMVA 5FPDA 4M7XA 1GLLO 1GLEG 2V52B 3EO3A 1NBWA 3GG4A 1NGBA 4B1UB 1X3MA 4EHUA 1QQNA 4BR0A 5AQZA 3FZHA 1BDGA 1NGCA 2P9NA 3CJBA 3BF1A 5KPRA 1BU6O 3HBTA 4L3QA 2W41A 5AQNA 4BC2A 3CIPA 4BRHA 4H5VA 1P8ZA 4BC4A 4BR5A 4CBWA 1ZC6A 5KPZA 4FO0A 1U2VA 1ATNA 4BRAA 4IJNA 1HLUA 1GLDG 2ASPA 1YVNA 4A2AA 2VWBA 3O1WA 2IVOA 4ISEA 4B1WB 3HSCA 3HM8A 4IJAA 3O4WA 1JCGA 1HKGA 2P9KA 1NM1A 4K25A 4M7YA 1ZBSA 3BEXA 4IO8A 4JHDB 4H5TA 2FF6A 5E26A 4MO4A 2CGLA 5JLFA 1NGFA 2VCPA 1GLJO 4BREA 1CZAN 1NMDA 2HOEA 1WUAA 3WQUA 4EIAA 4YDUC 4CI6A 4WQ5C 3SJHA 3CJ1A 3WT0A 5AZJA 3UKUB 2NLXA 4MO5A 2ITMA 1S22A 1Y64A 3GDQA 4MLEA 2D4WA 5AQQA 4J8FA 4H0TB 4F9OA 2QWLA 4EHTA 1BA1A 4HWIA 5EOYA 5AQOA 4LC9B 3VGMA 4XH4A 1HX1A 5FPNA 2BUPA 5AQRA 4BC5A 1G99A 2A42A 4BG9A 3QFUA 2YCHA 2AP1A 2E88A 4DB3A 3QBWA 5BN8A 2V51B 2HF4A 5FPEA 4O8KA 2FLOA 3ZEUA 4BRIA 3UKRA 2Q0RA 2E8AA 5JLHA 2QWPA 2P9SB 2V7YA 2QWMA 3MDQA 1ATSA 1HKCA 2Q97A 3KZBA 4I6MB 1MWKA 4BROA 3FE1A 4H0XB 3SK3A 4CD1A 1DEJA 1HJOA 5BPNA 3FR0A 2KHOA 3FLCO 5I9EB 1QZ6A 4PKGA 3ZX3A 3A0IX 3LM2A 3A5OC 4BRKA 1BUPA 5BPLA 5AZIA 2Q1NA 3LDNA 3FGUA 1NGGA 3ZX0A 1GLAG 5AFUA 1RDWX 4BC3A 3VESA 5EX5A 1IJJA 4FWPA 3I33A 2D1KA 2P9NB 2HMPA 3I8BA 1S3XA 1NGDA 4FOIA 2E1YA 1BWFO 1U2VB 1DGKN 1V4TA 1MWMA 3VGLA 3WXLA 1NGEA 1TYQA 4B1XB 1LCUA 3HZ6A 3TU5A 1ESVA 4H03B 4NO7A 3WUHA 2E2OA 4BQZA 3G25A 3EKSA 3MN9A 2QM1A 3SMSA 3DXMA 2P9KB 5AQLA 3CJCA 1LOTB 5ADXA 3OHRA 2E2PA 4BVOA 1BA0A 3U9ZA 1T44A 4A62A 4EFHA 2PBDA 1XQSC 1V4SA 3FFKB 2BTFA 2E1ZA 3RSEA 3R8EA 3H46O 2PAVA 5BR9A 3VEZA 3FZLA 4RCHA 5EY4A 1NGAA 5AZJB 3C7NA 4CZEA 3KVGA 1NLVA 3W0LA 3J8AA 3H1QA 3QB0A 4BRFA 3EL2A 2D0PA 3AY9A 4K43A 2IVPA 4CZLA 1XC3A 2H3GX 5BREA 3D2EA 3O6WA 3MMVA 4AM6A 4HTLA 4CZMA 1E4FT 3VEXA 4FWQA 4FPAA 4EAHD 3DXKA 1T6DA 3R9PA 2FXUA 3VF2A 2D0OA 4FSVA 2FSNA 5TKYA 4FOEA 3ZEUB 5AQHA 3UKRB 3ULEA 3QMLA 1YUWA 4BRPA 5CE3A 3KHYA 4MLHA 4DCHA 3A5NC 4B1YB 3VETA 4CBUA 3DWLA 4BRGA 3QICA 2EWSA 2ASOA 4XH1A 4H5RA 4IZ9A 3ATUA 2P9UA 2Q2RA 3CETA 2FF3B 4O5FA 3VPZA 3GOIA 5AQTA 2WUSA 4BR9A 4CD3A 1C0FA 5AQXA 5AZIB 4H5WA 1X3NA 4BR2A 5B8HA 3B8AX 3LL3A 4CZHA 1Q18A 5AQIA 3CI5A 2P9LA 2YHXA 3MN5A 3IFRA 4B1VA 3CJ9A 1JCEA 1QHAA 1K8KB 4K41A 3S41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JEPA 3AA5X 3HK2A 4MDAA 3HI0A 2GWJA 3CPEA 3WXIA 3PUFA 3R1XA 5GAEP 4YHHK 1LWEA 2A40A 3MN6A 4WFBL 4Z4IA 1QQCA 1C1BA 1RTDA 3F2KA 1IV0A 4JHDA 4CEOA 4YOUA 3ZSVA 4E1JA 2FBVA 5J1EA 1D9FA 3ENOA 4FJIA 1ILYA 2J4RA 2R7YA 2ZGYA 4CF0A 3MXJA 2G8IA 2QKBA 4DUYK 4DTXA 4PUOA 1JKHA 1X9JA 3C6TA 4LF7K 2F8SA 2IOCA 4Z4EA 4FJHA 2ZQBA 2CGJA 3L4QA 1D4XA 1BQNA 2VGMA 3HXMA 3CC2N 2IAJA 3BP8A 2PY5A 5IWAK 4H4MA 2Z1GA 3IMXA 4H0PA 3SLCA 3O4NA 1C0UA 3LWMA 4QOZB 1SAZA 3L2UA 1HMVA 2OPQA 5D3GA 5AQUA 3H6EA 3JXUA 5KRTA 1BI4A 2X6SA 3DXKB 3O5BA 1OH5A 1BCMA 3DLBA 1EQYA 3ZSWA 1WSIA 1D8YA 3ULEB 2B6AA 3JS6A 1IG8A 1TUUA 3QDKA 1NG9A 3ZSYA 2A3ZA 3K58A 1BOTO 1NOZA 4LFCK 1QSLA 4CEZA 4QS7A 5HRSA 3VEVA 3OYDA 4Y0WA 2OTLN 1BCOA 4PA1A 4DV5K 4CBXA 1TKDA 3H45C 3SV4A 3QEVA 4FK0A 4C1NI 3V1OA 1KAYA 2Z1IA 3LDOA 3CCEN 1XNRK 1EP4A 4C8LA 2O8BB 3DLHA 3HP9A 1NNEA 1NJIO 1HUXA 4BDZA 4ZTFA 3IDHA 3PO4A 4LFBK 5JS1A 4DQ8A 1ATRA 3VF4A 3G0ZA 3PX0A 4H5NA 4F2RA 4DR2K 3VQ7A 1HNVA 3M8QA 5ELZA 2G8UA 3HSTB 2P9IB 3K5LA 5AFUH 4CF1A 2OZSA 3VEOA 4GV3A 4JV5K 1BISA 3V1QA 1RT2A 2O8DB 3NF7A 4XEIA 5EXWA 4I2QA 4O0JA 3FZFA 4WQ4C 3LDQA 2ZGZA 3OYNA 3CCLN 5M1OA 3LDPA 3ZT3A 2I5JA 2VYPA 3L2WA 4IEEA 4DSIA 3MX5A 2XY7A 1JLGA 2KZZA 1GLBG 2YI1A 1SQKA 4DV7K 4M3RA 3NBPA 4CHPA 3C0BA 3T1HK 2QWNA 1CXUA 3K59A 2NRXA 1VQKN 1KXPA 4HUEA 5TKWA 5F0XA 5AQSA 3DLGA 3L2VA 5AR0A 3L0QA 4F3TA 3HOTA 3KK1A 1D5AA 4OVLA 3DAWA 3ZYYX 1NGIA 3CMAN 4DU1A 3L4IA 4JI5K 4CEBA 2VQFK 3RTVA 2DPNA 1HJRA 2F9TA 1T6CA 4Z0UA 1CXQA 1RBTA 5SZTA 1RBVA 3E66A 5MLCQ 1NU0A 1CZ9A 3D2FB 3ZT1A 5M1KA 2UXBK 2VG5A 4DSKA 3LZJA 4ID5A 3L3UA 2IS3A 4CFAA 1K6YA 1S1VA 2HHWA 2A5XA 2FSJA 2FC0A 2F9WA 4OKEA 3OYLA 4CZGA 5LMUK 2HW3A 4IG0A 1A5XA 1RT5A 4IFEA 3VQ6A 2YJFA 4CF9A 3JAMO 2P9PB 1BG3A 4CFCA 2CGKA 1MA9B 1RFQA 3DJCA 3KLIA 4O44A 1B92A 5JMVA 4Q5VA 1GLLO 1VHXA 2F4VK 1QVFM 3NCIA 1JLFA 3OS0A 3LPUA 2VGNA 4BR0A 4RW8A 3FZHA 1BDGA 3KLGA 3CJBA 5KPRA 5C42A 1VSMA 5AQNA 4PWDA 3CIPA 3V6DA 2JGUA 4CGGA 3ASMA 4BC4A 4BR5A 4CBWA 3K57A 1ZC6A 3EYZA 3VQ5A 1U2VA 1RNHA 1ATNA 1SUQA 3BZCA 4CJ3A 1HYSA 5I3UA 2ASPA 4RW6A 1CLQA 3OJUA 3FFIA 1NKCA 2VWBA 2IVOA 1UOCA 5T7BA 4F8RA 3CFPA 4NXNK 1TVRA 3P1GA 4FLTA 3G6EN 3NE6A 3T7ZA 1NJWA 3KD1E 2CGLA 1RDUA 2OCEA 3THXB 1CZAN 1NMDA 2HOEA 4EIAA 4B9UA 2KFZA 1TGOA 4WQ5C 3WT0A 4KH4A 2NLXA 2ITMA 2NRVA 5AQQA 2E4LA 4F9OA 3SV3A 1YT3A 1REVA 4LC9B 1Q81O 1HX1A 5FPNA 3VQ9A 2BUPA 4FJLA 1RBRA 2DFFA 1VRUA 2XHBA 3M8SA 4N76A 1G99A 5HP1A 3QFUA 5BN8A 3HOSA 4O8KA 4CFBA 3F9KA 3NDKA 2D0BA 3SNNA 2P9SB 1HKCA 3S3NA 1NJYA 4I6MB 4FJNA 5JVHL 2XO7A 3FE1A 4CEDA 3SJJA 2KHOA 4B9TA 3PSIA 3FLCO 2D0CA 3AVHA 4DV3K 3A0IX 4JI2K 4AHRA 3SBGA 1L5UA 4BRKA 1BUPA 1JLQA 1NK8A 5AZIA 1TK0A 5AFUA 1RDWX 1HNXK 1C1AA 2W6KA 3NVKA 3ZCMA 4GKJK 3I33A 2D1KA 1NJZA 2HMPA 3TAMA 1ASUA 4DV1K 3QINA 4FJ5A 1NGDA 2VQEK 2E1YA 4FJJA 1V4TA 1YI2N 1VQ8N 1N32K 3I0RA 3WXLA 3C6AA 3ZT2A 2HBMA 4BACA 4BDYA 3OYMA 4H03B 3WUHA 2FBYA 4CJLA 3CMEN 2P9KB 4C8MA 4FJ7A 5ADXA 4YOVA 3BZKA 3ENBA 4E1NA 1VQ5N 1BA0A 1JLCA 3ZT0A 1YJNN 3FFKB 4M3ZA 3RMAA 2HBKA 4KAZA 5BR9A 3VEZA 3FZLA 4RCHA 5EY4A 5AZJB 4HTUA 2DFEA 3VQEA 4NYFA 3KVGA 1NLVA 4WFAL 3W0LA 4BRFA 3A2FA 2G8FA 4K43A 5LL6Z 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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