3BEXA

Type iii pantothenate kinase from thermotoga maritima complexed with pantothenate
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
MDPMYLLVDVGNTHSVFSITEDGKTFRRWRLSTGVFQTEDELFSHLHPLLGDAMREIKGIGVASVVPTQNTVIERFSQKYFHISPIWVKAKNGCVKWNVKNPSEVGADRVANVVAFVKEYGKNGIIIDMGTATTVDLVVNGSYEGGAILPGFFMMVHSLFRGTAKLPLVEVKPADFVVGKDTEENIRLGVVNGSVYALEGIIGRIKEVYGDLPVVLTGGQSKIVKDMIKHEIFDEDLTIKGVYHFCFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Structural basis for substrate binding and the catalytic mechanism of type III pantothenate kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Transferase
total genus 77
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2007-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bexA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bexA02
3I33A 2V7ZA 3VENA 1LCUA 3WXIA 2QW9A 1ZBSA 2QWRA 1XC3A 2CGKA 4XEIA 3TU5A 3VF2A 3CERA 4H5RA 4A61A 1QHAA 3VF4A 1Z6RA 3FE1A 4NO7A 4EHUA 3S41A 5BRDA 2ZGZA 4H5WA 2AP1A 3HI0A 1V4SA 1P8ZA 4H0TB 3VETA 1S3XA 4FWMA 4BGBA 4DQ8A 1X3MA 1NGHA 3MK6A 3A5MC 3CHWA 5F1XA 3LDPA 4KBOA 4JD2B 3H1QA 4PKGA 3IMXA 5AQVA 5AR0A 2W41A 4QS7A 3SK3A 4BRHA 2P9LA 2I7PA 4H5TA 3DWLA 2YHWA 4FWQA 4I6MA 3FZKA 3WUHA 5AQWA 3MN9A 1DEJA 3FZLA 4A2BA 4QS8A 2P9IB 1T6DA 2IVPA 3QB0A 4BG9A 3D2FA 2ASMA 4WQ5A 5AQTA 4AM7A 5AQQA 3IUCA 3A8YA 3MN5A 1JCFA 1E4GT 3CIPA 1KXPA 1BOTO 4FSVA 4BR2A 4FWPA 1WUAA 1GLAG 2A41A 4DHYA 3GDQA 3CJCA 4RTFD 4JNEA 1QZ5A 3HM8A 3QFPA 2PAVA 3DXMB 2P9KA 2QWPA 3GBTA 4XH5A 3CQYA 4A2AA 3LM9A 1U2VB 1GLBG 3ZETB 2P9SA 1YAGA 3KHYA 4BR4A 4QS9A 3VEVA 1QQNA 1QZ6A 1NGJA 4FL9A 4CI6A 1HJOA 5AQOA 5KQ8A 1NGIA 2QM1A 2E2PA 4HWIA 2ITMA 2GELA 4K41A 5LJWA 5KQDA 1GLEG 2F9WA 4EHTA 2P9LB 3BUZB 5BPMA 2PBDA 5E84A 1NGAA 3LL3A 3DXKB 4ISFA 1NLVA 5AQNA 1KAXA 2YHYA 3DAWA 5B8HA 3QBXA 2Q0UA 4A62A 4CZKA 3M1FA 5EVZA 4CZLA 1NGDA 2E2NA 2WUSA 3VOVA 1GLDG 4GY2B 4MO4A 5AQMA 1NGEA 4WQ4A 4BRLA 3U9DA 2F9TA 3VGMA 1BG3A 2P9KB 3M6GA 4PL7A 2YJFA 2E2QA 2I7NA 3VEYA 2A6AA 3P4IA 1HKBA 5EY4A 4FPAA 3W3DA 2HMPA 4BVPA 1H1VA 1YUWA 4GNIA 3JXUA 2KHOA 3ENHA 2UYTA 2BUPA 5ADXA 3TPQA 5EXWA 3AY9A 3O6WA 5ELZA 5AFUA 3QBWA 5F0XA 3C7NA 4B1WB 1X3NA 3O5BA 3ZEUA 3LDLA 4BRCA 2YI1A 3WEEB 5FPNA 2VWBA 4BC5A 1BDGA 4CBUA 4CD1A 3VEZA 5F2RA 4H0YB 1QQMA 5FPDA 4CZJA 4FWSA 3DXMA 1NGBA 3FLCO 3VGKA 1U2VA 3VEOA 3ZETA 4YDUC 1YXQA 4BC3A 3VEWA 3WQUA 4FWKA 3IDHA 1IG8A 1NBWA 4IJNA 4CJ7A 3H45C 3IFRA 1NMDA 4BR0A 1WOQA 2FF3B 3CJAA 4IWVA 3R6MA 3UB5A 4LC9B 2AA4A 3DXKA 3VEXA 2ZWHA 4FWRA 4BRMA 3A0IX 4BR7A 4B1VA 2QXLA 3CJBA 1U6ZA 2QWQA 2VYPA 3C7NB 2Q36A 3EL2A 5AQYA 3ZEUB 1GLFO 3UKRA 3ID8A 3LDOA 4XH1A 1NWKA 2E1ZA 5EX5A 5ADXH 1K8KB 4PKIA 4MLEA 5AQSA 4K25A 4BREA 2E20A 4L3QA 4AM6A 1BUPA 4ISEA 5AFUH 3B8AX 1OKJA 1V4TA 3FR0A 4K43A 4F9OA 3AAQA 3ZX2A 1ZC6A 5LY3A 4BRIA 4CZMA 3FFKB 4RCHA 2EWSA 4BC2A 4M63C 4EIAA 2GUPA 3ATUA 4BGAA 2FSKA 3BEXA 1SZ2A 1EQYA 4IJAA 5KPZA 5AZIA 1HX1A 3QFUA 1RDWX 3SJHA 4BRPA 1YVNA 1MA9B 2H3GX 4MO5A 4CZFA 1NGGA 1E4FT 1SQKA 2P9PA 5AQZA 3VESA 4BC4A 3AAPA 3L0QA 1NGCA 3ATVA 3WEEA 5AQHA 4K42A 1IJJA 1BU6O 2A3ZA 3CJ1A 3H3OB 3H1VX 3UKRB 1Y64A 1KAYA 5AZJB 1D4XA 2CH6A 2IIRA 3A5OC 3SLCA 4Y0WA 2A42A 5EOYA 1BA1A 5TKYA 2OANA 1BWFO 3G25A 3C0BA 3ULEB 3UE5A 4FO0A 2CGLA 1ATRA 2HOEA 3O1WA 4FWLA 4H0XB 4EFHA 5KPRA 4DB3A 4BQLA 3U4LA 3MN7A 3GG4A 2E88A 5BN9A 3UKUA 4B9QA 4WYBA 4BQZA 5AZIB 3CJ9A 3BF3A 3EZWA 5KPTA 1TUUA 1KAZA 3RSEB 2NRHA 2D4WA 2V7YA 2Q97A 2V52B 2VCPA 1J6ZA 4XH4A 3D7EO 2P9PB 2ASOA 2ZGYA 5AQFA 1QQOA 3D2EB 4BRAA 4RWTA 3O08A 1RGIA 2QWMA 1S22A 1R59O 2D0PA 2E1YA 4FOIA 4WQ5C 2FSJA 3W0LA 2GTDA 1HPMA 1K8KA 1Q18A 3MDQA 2V51B 5AQIA 4H0PA 1NGFA 3O8MA 2IVNA 2IVOA 3MN6A 2D0OA 3CI5A 1DGKN 2CGJA 4BROA 3GL1A 4CZHA 5AQPA 4FOEA 4BRQA 4FWNA 3H46O 2J4RA 2W40A 1T44A 3AARA 3FZMA 2P9UA 3VERA 1NM1A 3R8EA 1CZAN 3QMLA 1GLJO 3EO3A 2A40A 3UKUB 1JCGA 2FF6A 4C23A 5BREA 3QDKA 2Q0RA 2A5XA 3EKSA 3SMPA 4JN4A 2FLOA 4MLHA 4O8KA 4PKHA 2QWOA 3O4WA 4IXCA 1ESVA 5AZJA 5AQUA 3OHRA 5LJVA 5BN8A 1BA0A 3CETA 5E26A 4BG8A 4BRNA 4B1UB 3ENOA 4FWOA 5AQJA 2YJEA 4HTLA 2D1KA 4O5FA 3VF6A 4CBWA 3FGUA 1XQSC 3GOIA 2P9NB 4WQ4C 3ULEA 4BRFA 2NLXA 4ISGA 1HKCA 4CZIA 1GLLO 3EN9A 1XUPO 5FPMA 5BRHA 3L4IA 1JCEA 3F9MA 4BVOA 1T6CA 2GWJA 2QWLA 5JMVA 3LM2A 3BF1A 2YCHA 1LOTB 3O1BA 2GEMA 2P9UB 3A5LC 2HF3A 3RSEA 1SAZA 5CE3A 1RFQA 4BRGA 1MWKA 3HBTA 3U8XA 4E1JA 3L6QA 4IO8A 2ZF5O 3DJCA 2GWKA 3J8AA 2E2OA 4CZEA 4YDUA 4BR5A 1MDUB 3D2EA 5BR9A 1C0GA 1C0FA 4DCHA 2YHXA 3GE1A 4H0VB 5JLFA 2FXUA 3HZ6A 4B1XB 5BRFA 1GLCG 3WT0A 2NZTA 1MWMA 3LDNA 5AQKA 2Q31A 2E8AA 4CZGA 2QWNA 4BRDA 3WXJA 4B1YB 4JHDA 3CJ7A 4I6MB 3WXKA 2DPNA 3MMVA 1TYQA 1HLUA 3KZBA 4FPBA 4IZ9A 3A5NC 4H03B 3D2FB 3VPZA 3WQTA 3HTVA 5BPLA 5AQGA 1DKGD 3FZHA 1HUXA 3WXLA 2ASPA 5JICA 2FSNA 4M7YA 3ZX3A 4EAHD 2CH5A 3R9PA 5AQLA 1HKGA 2BTFA 3JS6A 3FZFA 1BO5O 3VGLA 4M7XA 5FPEA 5BPNA 4JD2A 1ZXOA 4Z94A 2P9SB 3QICA 2Q2RA 4B1ZA 4H0OA 3SMSA 3HSCA 4CBXA 3U9ZA 1TUYA 4BRKA 4H5VA 3ZX0A 4JAXA 3MCPA 3H3NO 4H5NA 5JLHA 4NB4A 1G99A 3H6EA 2Q1NA 3I8BA 2P9NA 3BP8A 5AQRA 5I9EB 1Z05A 1ATSA 2P9IA 3EKUA 2HF4A 3LDQA 5AQXA 3KVGA 4JHDB 4PL8A 1TYQB 3M3ZA 4J8FA 1ATNA 4CD3A 4BR9A 1X9JA 3O80A 3CQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3I33A 3HSTB 3Q7CA 4DSJA 3KKRA 1LCUA 2QW9A 3I0SA 4CK1A 1ZBSA 2CGKA 3VF2A 3MX2A 1BIUA 3MWTA 3C94A 3OYAA 2O8CA 3NFAA 3V9UA 1QHAA 4JI4K 3FE1A 2ZGZA 4X66K 3HI0A 1IV0A 1P8ZA 1S3XA 1X3MA 1NGHA 2YKMA 3MK6A 3CHWA 3DLHA 4HVJA 1LW2A 3H1QA 5AR0A 5AQVA 2P5GA 2P9LA 1WN7A 3TTFA 2YHWA 4WFBL 4FYDA 4I6MA 2YNHA 1YTAA 3ZSOA 1T6DA 3QNNA 2IOCA 5AQQA 2BDPA 1RCHA 1CXUA 1BOTO 4K8XA 2DFEA 4NCGA 4AHRA 4B9NA 4X64K 4FVUA 1A5XA 3HM8A 3VQ4A 5J2QA 4IOAL 3CQYA 3T19A 3LM9A 1FK9A 3MEEA 4DQPA 3ZETB 2P9SA 3R1XA 3QESA 4CHPA 3VEVA 1ASWA 1QQNA 4CI6A 4LSNA 1VQON 4CJ3A 4HWIA 2ITMA 3CFRA 4BE2A 5KQDA 3ZT3A 2F9WA 4EHTA 2RPIA 1NOYA 5E84A 2Z1IA 1EX4A 1TKZA 2F7TA 2NRRA 5AQNA 3AVMA 3THXB 2YHYA 3DAWA 3CQ8A 3QBXA 3OS2A 4A62A 4CZLA 4NXMK 4GVMA 2O8FA 2WUSA 3VOVA 4FVMA 4FJLA 4MO4A 5AQMA 1NGEA 3U9DA 2HVIA 3NGZA 1YI2N 2F9TA 1ASUA 3VGMA 3F2KA 1RNHA 1BG3A 2P9KB 4PL7A 1BHLA 1TKDA 3WXMB 2I7NA 3F5TA 3TAQA 5TKWA 3VQAA 1QVGM 4BVPA 1SL0A 4GNIA 3JXUA 3V1OA 1VSJA 1IKXA 1YF5L 2UYTA 5HBMA 5ADXA 4CK3A 3CC7N 5EXWA 4DTUA 3AY9A 1YJWN 3O6WA 5ELZA 4FZYA 3ZSWA 2F8TA 4FZZA 1NG9A 3VQBA 1Q9XA 3VEZA 1KTQA 4Z4GA 2BE2A 1HQUA 3K2PA 4E1NA 2DTUA 3DXMA 4OGCA 4ILJA 1VSMA 4CESA 1U2VA 1RTDA 3LPUA 3OVNA 4ID1A 3LWMA 3LP2A 5CHIA 4FWKA 1IG8A 4DTNA 4CJ7A 4FM1A 3IFRA 1WOQA 4W5RA 3SUQA 3R6MA 4O0JA 1BI4A 3UB5A 4CFCA 1EP4A 1KLMA 1N33K 3DXKA 4U67L 5SZTA 4FWRA 1JLCA 1RTHA 3A0IX 2QXLA 2QWQA 2VYPA 3CXCM 1N6QA 4ILHA 4J2BA 4YOXA 2I5JA 1N8RO 3UKRA 1YVUA 4XH1A 2VGNA 5J2PA 3V9WA 1K8KB 4KRFA 3QEWA 1WSGA 4NYFA 4KTQA 4BREA 4L3QA 4AM6A 2HHWA 3K0SA 4C8KA 3FR0A 4IOCL 3AAQA 3OY9A 3ZX2A 1ZC6A 3CCMN 2EWSA 3TTCA 1RT4A 2FSKA 3BEXA 4B9UA 2D0BA 1HX1A 4YOVA 3SQ1A 1YVNA 1UA1A 5IT9O 2H3GX 4FW1A 1RDCA 3VA0A 3T7ZA 4CZFA 4I2QA 2UXCK 1ASVA 1NGGA 1SQKA 5AQZA 3J80O 3L0QA 1VSFA 2NRXA 1U04A 1OVYA 4I2PA 3WEEA 2KKZA 1IJJA 1F21A 3TANA 2A3ZA 3CJ1A 5CZ2A 4GW6A 3SQ2A 2QEXN 4JI0K 1Y64A 1QHTA 1NJWA 4OO1J 2CH6A 3OS0A 4E7KA 5MLCQ 2A42A 5EOYA 3THWA 4FJGA 3LP1A 3O9TA 4M3ZA 4BDYA 4X65K 3G25A 5GADP 4FLXA 5HRSA 1ILYA 1WLJA 1W97L 3S9HA 4FJIA 1SL2A 1X9MA 4WYBA 2AJQA 2KZMA 5AZIB 3CJ9A 4LSLA 1JLGA 4F3TA 2R7YA 4XH4A 3CFPA 2HNYA 1YT3A 2ZGYA 4M45A 3MXMA 1HNXK 5AQFA 1QQOA 2UXBK 2QWMA 4WQ5C 3W0LA 4FJJA 1WBBA 2HHVA 3ISNC 3B6PA 4DSKA 2IVNA 1ZBLA 1HNZK 2E5LK 4CJTA 3NAEA 3BDPA 2CGJA 4FW2A 4CJLA 2D0CA 2VG5A 3U3GA 5AQPA 3DRPA 3V1RA 3H46O 3M5RA 3AARA 2P9UA 3VERA 3K58A 5C24A 3KLFA 4CJEA 5IWAK 2FF6A 3P83D 3NH2A 1HYVA 4WFAL 2OPQA 2D0AA 4J2AA 3KLIA 4JKHA 3KLHA 2XY5A 3SMPA 3QIPA 2A1SA 1NJXA 4LFAK 3O4WA 4DLGA 3OHRA 5LJVA 4X62K 2G8KA 1YJ9N 3CETA 5E26A 4BG8A 1HNIA 4OGEA 4UY8O 5AQJA 1FJGK 2D1KA 3O3GA 4KHPK 1T8EA 2B5JA 1IBMK 3GOIA 3PIPL 3QNOA 1RT3A 4JI6K 4CZIA 1GLLO 1NK4A 4DU3A 2HNDA 4DQQA 4NLBA 1RDBA 1RT1A 1KCFA 1LOTB 3O1BA 1VQLN 3VQ9A 4GKKK 4JKAA 5CE3A 1HJRA 1JLAA 4KKOA 3HOTA 4CZEA 4KHQA 1A5VA 1EETA 3AGRA 4BR5A 3CCSN 3TABA 3OYKA 3D2EA 1VK0A 3CFOA 4YOYA 5BR9A 3SV3A 1C0FA 1L3UA 2YHXA 3DI6A 3CD6N 3JSMA 3GE1A 1QSLA 2HBMA 4H0VB 1ZBUA 3KWGA 4B1XB 1TAQA 1MWMA 3LDNA 2UUAK 1T03A 1CZ9A 4DR6K 2PFUA 1VSHA 1YITN 4BY9C 4OX9K 4JHDA 4I6MB 2DPNA 3V9ZA 1HLUA 4FPBA 1VSKA 2HB5A 1IKYA 4DV7K 3PX4A 3WQTA 3HTVA 1OVQA 3RMCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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