4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
molecule keywords Glucokinase isoform 3
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
5AQIA 4BR4A 5EY4A 5AZJA 1LCUA 3L0QA 1SZ2A 5AQYA 4H0YB 3FZLA 4A2BA 4EHTA 4JD2B 4CZFA 1KAXA 4KBOA 3VEVA 5EX5A 1ATSA 4RWTA 3QBXA 4JAXA 5AZIB 3S41A 4CZEA 3IMXA 4B1VA 4B9QA 2QWOA 1R59O 4H0PA 3WT0A 2ASMA 3ULEB 4FWNA 3A8YA 4DQ8A 4I6MA 3UKUB 1XUPO 4H0TB 4IO8A 3U8XA 4BG8A 3QDKA 1X9JA 2A42A 1YAGA 1WOQA 5KQ8A 2YJEA 3EKSA 3GE1A 3OHRA 5FPEA 3UKRA 3RSEA 4BRKA 2HOEA 4XH4A 3M1FA 2GEMA 3MDQA 4BRGA 1MWKA 3LDOA 3H1VX 1YXQA 1BA0A 2E2QA 3WEEB 4EAHD 2I7NA 2YI1A 4J8FA 1ATRA 4BRIA 2KHOA 5TKYA 2Q31A 1BWFO 4F9OA 4BC2A 4A61A 1QQOA 2YHYA 3A5MC 1HUXA 2FXUA 2AA4A 2Q2RA 1DEJA 3WQUA 5AQFA 4RTFD 1SQKA 3SMPA 4CJ7A 3ATVA 3TPQA 3DXMA 3FGUA 4FPBA 1GLAG 3G25A 3LM9A 1NGIA 2E8AA 3H6EA 2IVOA 4BRHA 4FWRA 2P9IA 3C0BA 1QZ6A 4QS7A 3LDPA 1C0FA 1QQNA 2A40A 3QFUA 3CHWA 2GUPA 2WUSA 2A3ZA 5AQVA 1IG8A 3MK6A 5EXWA 5BPLA 2IVPA 3SJHA 3C7NA 4C23A 4MO5A 4WQ4C 1HKBA 1NBWA 1U2VA 4PKGA 3R8EA 5KPZA 2HF3A 1JCGA 3W3DA 2FSNA 2P9KB 4BC5A 4FWLA 2ZGZA 3CQXA 5LJVA 1ESVA 5LY3A 1U6ZA 2P9UB 5FPNA 4LC9B 2V51B 4BRFA 4CZJA 3FR0A 1GLBG 5AQSA 4BR0A 2Q97A 3QBWA 1V4SA 4FOEA 3ZETB 3CERA 4BRNA 4JHDA 4MLEA 1QQMA 4M63C 1RDWX 5AQRA 4BQLA 2I7PA 5BN9A 2GWJA 3EL2A 4M7XA 4BG9A 5FPDA 3VEZA 1TUUA 3VOVA 2A5XA 1K8KA 1GLEG 4FSVA 5EOYA 4IXCA 1SAZA 3DAWA 1Z6RA 4GNIA 1Y64A 3FZMA 2YJFA 2P9NA 1HKGA 5JMVA 4H5NA 5JLFA 4HWIA 2GTDA 1HPMA 2QM1A 1NGCA 1S22A 4CI6A 3I8BA 5AQHA 1BG3A 4H5RA 1X3MA 3BEXA 3VF6A 2IIRA 3LDNA 5LJWA 3H1QA 2CH6A 3UKRB 4BVPA 2QWMA 1NGDA 1NGFA 2CGLA 2D1KA 2HF4A 4FO0A 2F9WA 1ZXOA 3VF2A 2QW9A 3CJ9A 5AQOA 2GELA 1H1VA 5BREA 4XH5A 1XC3A 3SK3A 3ZX3A 4CD1A 2VWBA 4MO4A 3A5NC 3U9ZA 4K41A 2VYPA 1DGKN 1T6CA 4H5WA 4BVOA 2IVNA 1BDGA 4EFHA 1HKCA 4BRPA 1NGGA 3D2EB 4BC3A 1RFQA 2E1YA 4WQ5A 3WQTA 1WUAA 1NMDA 1CZAN 1NM1A 2A41A 4FWMA 1TYQA 4L3QA 2YHXA 2W41A 5AQJA 4QS9A 4Z94A 3R6MA 4Y0WA 3ZX0A 5BN8A 4ISEA 3WUHA 3HZ6A 4CZKA 2Q0RA 4H5TA 5FPMA 5ADXH 3VESA 2QWNA 4YDUC 5AQTA 3WXKA 3A5LC 4M7YA 4WQ4A 4BQZA 4CBUA 5B8HA 3VGLA 4BGBA 4EHUA 5KPTA 3C7NB 2E1ZA 2V7ZA 4GY2B 2J4RA 3HSCA 4FWPA 3MN6A 4A62A 4JD2A 3H45C 3J8AA 3SLCA 5ELZA 5AZIA 4AM6A 4CZMA 5BRDA 1NWKA 4FL9A 1TUYA 3ULEA 2CGKA 1YUWA 3CJBA 5ADXA 3UKUA 1NGBA 2E88A 5E26A 2NLXA 3BF1A 3GDQA 3FE1A 3VEWA 5AQGA 4BR2A 4JHDB 1IJJA 3O80A 1RGIA 4BR7A 4BREA 3VGKA 3ZEUB 3DXKB 3CI5A 3VF4A 3B8AX 3O4WA 3QICA 2FLOA 1J6ZA 1ZC6A 2D0PA 5KPRA 5I9EB 3CJAA 3KHYA 3M3ZA 5AQXA 3WXLA 4H03B 1HX1A 1LOTB 2QWLA 4PL8A 3VEOA 5JICA 3A5OC 4FWOA 4K25A 3L6QA 3D2FA 3EKUA 3R9PA 3ENOA 2E2PA 3O5BA 2ZF5O 3HTVA 5BRFA 4EIAA 3QFPA 2FSJA 2P9LA 4B1YB 4BRLA 3EZWA 1NGHA 5F2RA 5AZJB 3QB0A 4JNEA 3MMVA 1GLCG 4IJNA 1KAYA 2FF6A 2YHWA 1E4GT 4PKHA 1QZ5A 1C0GA 2E20A 2ZGYA 3IUCA 4O8KA 3H3OB 2E2NA 5BR9A 1E4FT 2P9SA 1NGEA 3JS6A 3BF3A 4I6MB 1S3XA 4FWKA 3MN9A 4RCHA 1NLVA 4BRAA 4H0VB 4H0XB 3BUZB 1BA1A 1OKJA 3CJ1A 4BRQA 4B1XB 1KXPA 3RSEB 1GLJO 1JCFA 4XEIA 1DKGD 2PAVA 3CQYA 3LL3A 2P9KA 1NGJA 3O1WA 3LDLA 4IZ9A 2P9UA 1ZBSA 2NZTA 4DB3A 2ASOA 4BR5A 4CZGA 3O8MA 5JLHA 5EVZA 2QWRA 3CJ7A 4FWQA 4PKIA 5AQMA 1XQSC 3FZFA 3ID8A 1JCEA 1BUPA 2ASPA 4H5VA 2NRHA 4K42A 1T44A 2P9PA 5AQQA 3FFKB 4NB4A 1ATNA 3FZHA 1V4TA 3DXMB 3BP8A 4AM7A 5AFUA 3EN9A 5F1XA 5AQPA 2W40A 1MA9B 1T6DA 4HTLA 5AQLA 3CETA 2QWQA 1P8ZA 2GWKA 4B1WB 3ATUA 2UYTA 3MCPA 1MDUB 3VEYA 4A2AA 2QWPA 1D4XA 2P9IB 4BC4A 1EQYA 3GBTA 3WXIA 1Q18A 5AQWA 3VEXA 4CZIA 3ZX2A 3JXUA 4MLHA 2V7YA 3HI0A 4H0OA 4CZHA 3AARA 1U2VB 4BROA 3U9DA 1GLDG 3CJCA 5AQUA 4BRMA 3A0IX 3FLCO 5AQZA 3DWLA 4ISFA 4JN4A 3HM8A 3QMLA 3HBTA 5BPNA 3KVGA 3I33A 2Q0UA 2D0OA 3ENHA 3UB5A 3D2FB 4ISGA 1Z05A 4FWSA 4O5FA 3D2EA 3FZKA 4BR9A 1HJOA 1X3NA 2AP1A 2V52B 2P9LB 1HLUA 4XH1A 4WQ5C 2FSKA 2H3GX 3H3NO 3WEEA 3L4IA 2Q1NA 2EWSA 2HMPA 2ITMA 3H46O 1YVNA 2A6AA 1BU6O 3CIPA 1K8KB 5AQKA 3EO3A 3VETA 2VCPA 4CD3A 3LDQA 3U4LA 3MN5A 2D4WA 2P9SB 3W0LA 2P9NB 3O1BA 4BRCA 2CGJA 1GLFO 3M6GA 5AQNA 4BRDA 3AY9A 2PBDA 4CBWA 3KZBA 4CBXA 2ZWHA 3VGMA 4B1ZA 5CE3A 1MWMA 4PL7A 4IWVA 3GG4A 2E2OA 2QXLA 5BPMA 2Q36A 2FF3B 3AAQA 3AAPA 5BRHA 3P4IA 1BOTO 1GLLO 4DHYA 3VENA 4BGAA 4CZLA 3D7EO 3IDHA 3WXJA 3VERA 5F0XA 4K43A 3ZEUA 3DXKA 2P9PB 2YCHA 3SMSA 2CH5A 3VPZA 3IFRA 4B1UB 2BTFA 4NO7A 3F9MA 3TU5A 4E1JA 5AR0A 3GL1A 4IJAA 2BUPA 4QS8A 5KQDA 4FPAA 2DPNA 4DCHA 3MN7A 3O08A 1G99A 5AFUH 2OANA 1TYQB 3DJCA 3O6WA 4FOIA 4WYBA 3UE5A 2F9TA 3LM2A 4YDUA 3ZETA 1NGAA 5E84A 3GOIA 1QHAA 1BO5O 1KAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Q5VA 2RN2A 4E7JA 1RBUA 1W7AA 2E5LK 1U49A 3E66A 4NYNA 4H0YB 5M1FA 4ELVA 2A1RA 1LWCA 1Q8IA 3VEVA 3SQ4A 2OYQA 1O1WA 5LMUK 4CZEA 3IMXA 4C8OA 3VQ7A 4CFAA 4LF5K 4I6MA 2VWJA 3THVA 3CC7N 4KRFA 1JJ2M 3VQQA 4BG8A 3KLGA 2A42A 3CM5A 2D5RA 3NGYA 3GE1A 3RSEA 1VSHA 3KK2A 3M1FA 3HOTA 1MWKA 3LDOA 4BE1A 2F8SA 3OY9A 1VQ4N 3WEEB 2FBTA 2I7NA 2QTDA 2YI1A 4M3XA 4ILGB 4BRIA 4OLAA 2I5JA 3LZIA 4YOWA 1HUXA 2QK9A 1EP4A 3RWUA 1DEJA 3O4QA 1ZBFA 5AQFA 5LL6Z 4DQSA 1L3SA 3L3UA 3S3OA 2AJQA 1WN7A 4FLUA 3CPEA 4DV1K 3V9SA 3RMBA 3NVKA 3SBTA 3O9SA 4FWRA 1OH5A 4B08A 4NCGA 4ZTFA 2O8EB 1VSEA 5C12A 4RW6A 3TAEA 1RBTA 2YNGA 4BWMA 4CJWA 1U48A 3WXMB 4DMNA 5AQVA 1FKPA 1KQSM 3MK6A 1HPZA 5EXWA 4NXNK 2IVPA 3C7NA 4JKEA 1C0UA 1U2VA 1CLQA 5KPZA 1Q9XA 2HF3A 3W3DA 1YI2N 2P9KB 1O13A 4A5AA 4BC5A 4PUOA 3CQXA 5LY3A 4LC9B 4CZJA 3RMCA 4GVEA 3TABA 3K59A 4F4KA 4FOEA 1S9GA 1RBSA 3ZETB 1T8EA 3LPTA 4MLEA 1SV5A 3AO4A 1QQMA 1UWBA 3IS9A 4CHPA 4O5BA 2JWKA 2O8DA 3AA2A 1TUUA 1QQCA 3NF6A 4C8MA 3K5OA 4FSVA 4OGCA 4CJRA 4GNIA 1Z6RA 1NJIO 4LD0A 4HHTA 1VSFA 4CJKA 4KI4A 1L3UA 3IAYA 1S22A 5AQHA 1X3MA 3LANA 3RR8A 3TI0A 1SL0A 2QWMA 1NGDA 3OYCA 3VF2A 4DSKA 4CJSA 2X6NA 4Z4FA 1HNWK 4MQ3A 4FK0A 5BREA 1D9FA 1XC3A 3SK3A 4DU3A 2VWBA 3PUFA 1JXEA 3O9QA 2VYPA 1VSJA 3RRHA 1DGKN 4JKHA 4EFHA 3ALYA 2F96A 4FJ8A 3C6HA 5J2QA 4YHHK 1LW2A 4FJ7A 1CZAN 4BDZA 2A41A 3ZSOA 4IFEA 5HBMA 1KLMA 3EE9A 5AQJA 3NBPA 4LSLA 4ISEA 4LY7A 1BCMA 4E7IA 3MECA 5JS1A 2O8BB 1WSGA 4H5TA 5ADXH 4AF1A 4YDUC 2YKNA 3WXKA 3A5LC 4CBUA 5B8HA 3SQ2A 3G71N 4ELUA 5KPTA 2E1ZA 4GY2B 3I0SA 3AO2A 4AQYK 2UUBK 3L2WA 1TUYA 2CGKA 1YUWA 3N4PA 1JLFA 1S1TA 2LSNA 3L2QA 1L3VA 2RHKA 4HTUA 2NLXA 1IKXA 4KTZA 4KHQA 3VEWA 4JHDB 3EY1A 2HNYA 3OS0A 2HBKA 3O80A 2DFFA 3CXCM 1RGIA 3HOSA 3F9KA 3CI5A 3VF4A 3B8AX 4KREA 2FLOA 1ZC6A 3V1RA 5KPRA 2ZJQL 4BDPA 3S3NA 1N33K 2UXBK 3CJAA 5JVHL 5AQXA 1HX1A 2QWLA 4CGFA 4PL8A 1UOCA 3A5OC 5FLXO 5C25A 3R9PA 3DRSA 4CF1A 2NNWA 4CF0A 3QNNA 3I0RA 3RMAA 1S6PA 1VSLA 4M3YA 2P9LA 3AA5X 5F2RA 3WNFA 3MMVA 4ILJA 4IJNA 1QTMA 2YHWA 3HYFA 5KTQA 1VQ8N 4DQIA 4U67L 1QZ5A 1RT1A 3IUCA 2O8EA 4O8KA 3B6OA 3O9RA 1WSJA 3CCQN 5C42A 1YVUA 4W5TA 4RW7A 1FJGK 4H0VB 4DR4K 3CJ1A 4E3SA 3HP9A 1GLJO 1JCFA 4XEIA 2ZJPL 2P9KA 2YHBA 1Z26A 2ZQBA 4XIUA 3LDLA 4IZ9A 3VA0A 2NZTA 3G4SN 3AVJA 2HVIA 5EVZA 1MU2A 4FWQA 4PKIA 1SUQA 1XQSC 3E9LA 3FZFA 5KI6A 1CXQA 2DFHA 4UY8O 2NRHA 3SBGA 2O8FA 1HNVA 4NB4A 1V4TA 4CFDA 5FDLA 4DU4A 3EN9A 3LALA 4O55A 5F1XA 2W40A 3T1HK 3K5MA 3THWB 1TKXA 4A2AA 1QS4A 3P83D 4KFBA 1I39A 1WSHA 2QWPA 4LF7K 2P9IB 4BC4A 1EQYA 4DTPA 1VK0A 3GBTA 3WXIA 2FBYA 3TSQA 4CZIA 3CC2N 3HSTB 2QA4N 5MLCQ 3D45A 4H0OA 3AARA 4BROA 3U9DA 3CJCA 2VQEK 3O3GA 3CG7A 3PSFA 4YOTA 3FLCO 2GBZA 3NH0A 3HBTA 3I33A 3C65A 3UB5A 4RW4A 3D2FB 4ISGA 4FWSA 1QVFM 4F3TA 3D6RA 3FFIA 4BR9A 3MAQA 5CZ2A 4M3ZA 1HQEA 1HLUA 4WQ5C 2FSKA 4JI8K 4FZXC 3H3NO 4JRQA 4DSFA 4KH6A 4A59A 3AVGA 3CCLN 2WOMA 3KKSA 2O8BA 4CESA 3MN5A 2D4WA 3W0LA 1OVQA 4BRCA 3SI6A 4JI0K 4FLYA 2CGJA 5AQNA 4JKCA 1RTJA 4JKGB 2PBDA 4O0IA 3J7YP 2ZWHA 1NKCA 4ICLA 4B1ZA 4OLBA 1N32K 3NF7A 4IWVA 1VRUA 2QXLA 1NJYA 5BPMA 4DWIA 2Q36A 2JLEA 4CJ4A 2FF3B 4DTRA 5EU7A 4FJJA 3AAPA 1UAXA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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