4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase isoform 3
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
1H1VA 1BOTO 3ZX2A 5AZJA 3MN5A 3VGLA 5AQHA 4BVPA 5BPLA 1QZ5A 3C7NA 4FWSA 1QZ6A 2FF6A 4O8KA 5AQXA 4BR7A 4BR5A 4RCHA 1Z05A 4CZFA 1C0GA 3DXKA 5LY3A 3VGKA 1ZC6A 1MDUB 1MWKA 3ENOA 3A5LC 4MLHA 4BQZA 3EZWA 2Q0UA 2QW9A 5AZIA 4WQ5A 3O5BA 3JS6A 2P9NB 3WEEA 5BR9A 2FSKA 1GLJO 1HX1A 4NO7A 4I6MA 3R8EA 2E88A 4EHTA 5ELZA 5AQQA 3I8BA 1GLAG 5BN9A 1E4GT 2P9NA 4I6MB 2E2NA 2Q1NA 2AA4A 2P9LA 3BF1A 4K43A 4JAXA 3ATVA 3O6WA 4IJAA 4PKHA 5B8HA 3AY9A 3CJ9A 4BRIA 2Q0RA 3H45C 5AQWA 4FO0A 4BC3A 3A5OC 2DPNA 5FPEA 3CQXA 4XH4A 3FLCO 3GOIA 3U4LA 4IXCA 3TPQA 3WXIA 5BPMA 4YDUC 1HJOA 2FF3B 5AQJA 4BGAA 3DXKB 4FPBA 3DXMB 3M1FA 2WUSA 3FFKB 3KVGA 3LDLA 5F0XA 2A3ZA 2Q31A 5AQUA 5KPTA 1NGCA 5CE3A 5AQTA 1DEJA 4CJ7A 4EHUA 3GL1A 4IO8A 1CZAN 5EVZA 1EQYA 3WUHA 5AQVA 2Q36A 1X3NA 3IDHA 4O5FA 4CZEA 4A62A 3CJ7A 4CBXA 4CBWA 3ATUA 4NB4A 3VGMA 2E20A 4FWPA 5BRFA 4JD2B 2IVOA 5AFUA 3BEXA 3QFUA 4FWRA 2E8AA 2W40A 5EY4A 1WUAA 1E4FT 1BUPA 5BPNA 3LM2A 3G25A 5E26A 5BRHA 3FGUA 3U8XA 2FXUA 1T6CA 2E2QA 4BC2A 4FWOA 2F9WA 4BVOA 1QQOA 4Z94A 1NWKA 4H0TB 1MWMA 2ASOA 3FE1A 4FL9A 1KAYA 3W3DA 3GBTA 2VYPA 2QWMA 3C0BA 5E84A 4BR0A 4BG9A 3VF2A 5AQKA 1QQNA 1NGIA 4BG8A 4BRGA 4JHDA 3VF6A 2A6AA 4K41A 4ISEA 4M7XA 3H1VX 1TYQB 2AP1A 2YHYA 4BRQA 3M3ZA 4GNIA 2GEMA 3CI5A 2E1YA 3CHWA 5BRDA 4CZLA 4FWNA 3ZEUA 1KAZA 1Z6RA 2GWJA 1HPMA 1JCGA 4B1XB 1S22A 4M7YA 3H3OB 3GE1A 2QWPA 5AQZA 5F2RA 3U9DA 5AQGA 2IVPA 4JNEA 5EX5A 4AM6A 2CGJA 2YHXA 3DAWA 3UB5A 4DHYA 2FLOA 4H5NA 3IUCA 2NZTA 1U6ZA 1NGEA 2V7ZA 3D7EO 2HMPA 3HZ6A 2ITMA 3A0IX 3R9PA 3VESA 3LDQA 3UKUB 1BA1A 1RGIA 1TUYA 3A5NC 1BO5O 3O4WA 3O08A 1NM1A 3WQTA 4BROA 1YXQA 5AQFA 4CZGA 2QWRA 4BRKA 2ZGYA 3BUZB 4ISGA 2YI1A 4A2BA 4KBOA 4YDUA 5I9EB 1ATRA 1YVNA 2BTFA 2PAVA 3SMPA 2YJFA 3CJBA 3FZKA 4FSVA 2IIRA 4H03B 1HUXA 4H0YB 3IFRA 1Y64A 4B1VA 5KPRA 3QMLA 3GDQA 3WXLA 1ESVA 2QWLA 1K8KB 3O8MA 4FPAA 5FPDA 1SAZA 2I7NA 3UKRA 1XQSC 3A5MC 4XH5A 4DB3A 4HWIA 3MDQA 3R6MA 3L4IA 4PKIA 1GLLO 3VOVA 3C7NB 2QWOA 3F9MA 1WOQA 2A5XA 2V7YA 3MN6A 4K25A 4CZIA 1NBWA 1V4TA 2HF3A 3QICA 1ATNA 4B1UB 4CI6A 3SMSA 2FSJA 4EIAA 1U2VB 3O1WA 3W0LA 3ID8A 1JCEA 1NGBA 3LM9A 2I7PA 3WXKA 3MCPA 2NLXA 2KHOA 2D4WA 1BG3A 3H6EA 3JXUA 3UKUA 4LC9B 1BWFO 3EKSA 3VEZA 1LCUA 4BQLA 2QWQA 4BRMA 2GWKA 2ZGZA 3A8YA 2Q97A 3J8AA 3ULEB 1GLCG 4BRAA 2HF4A 2P9IB 4MO5A 1KAXA 1LOTB 1V4SA 2FSNA 1GLFO 5AZJB 2PBDA 5JICA 3WEEB 2NRHA 3WQUA 2E1ZA 5AQPA 3QBWA 4GY2B 3FZHA 5KPZA 3TU5A 1HKCA 4B9QA 4BGBA 5JLHA 3EL2A 3H46O 5ADXH 1DKGD 4F9OA 2CH5A 2GELA 3HSCA 4B1ZA 2P9SA 4BRDA 2ZF5O 3ULEA 5AQLA 4BRFA 3ZX3A 2GUPA 3IMXA 4CZMA 5EXWA 2YJEA 4WQ4A 4IWVA 3SK3A 4XEIA 1J6ZA 3ZX0A 3ZETB 3VEVA 1T6DA 2YHWA 3DJCA 3EO3A 1OKJA 1MA9B 3CJCA 4K42A 1U2VA 2YCHA 3U9ZA 4H5RA 3WT0A 5JMVA 4C23A 1TUUA 4PL7A 3SLCA 3I33A 1GLEG 4WQ5C 4A61A 2P9SB 4L3QA 1QHAA 2P9IA 1RFQA 4JD2A 4HTLA 4ISFA 1K8KA 1NGHA 3QDKA 5FPNA 1BA0A 5AQNA 3VPZA 3RSEB 4EAHD 3D2EA 5F1XA 2HOEA 3VETA 1YAGA 1NGFA 3KHYA 1XUPO 4IZ9A 5FPMA 4RTFD 1GLDG 4FOEA 3WXJA 2V51B 4A2AA 3DXMA 1NMDA 4CD1A 4CZJA 1NGDA 5AQIA 4E1JA 2D0OA 4PL8A 1X9JA 1YUWA 4BR9A 3H1QA 4JN4A 4BRCA 1BU6O 2P9KA 5AFUH 1Q18A 4BR4A 3UKRB 1RDWX 2CGKA 2D1KA 2J4RA 4FWLA 4H0PA 1ZBSA 1DGKN 2ZWHA 3OHRA 4H0XB 4DCHA 4B1YB 4RWTA 3GG4A 4H5TA 1HLUA 2P9LB 4CD3A 2P9KB 3FZFA 3AAPA 1P8ZA 1X3MA 2F9TA 3L6QA 3CJ1A 5AQMA 3VERA 3HBTA 1D4XA 4BRNA 1S3XA 4IJNA 4H5VA 5BREA 3D2FB 1BDGA 1ZXOA 1SQKA 2CGLA 1NGGA 4J8FA 2EWSA 3FR0A 3KZBA 4BREA 1T44A 1R59O 2P9UA 3VEWA 3MK6A 3ENHA 3RSEA 2QXLA 1IG8A 2P9UB 4H5WA 3VEYA 3L0QA 5AQOA 3VEOA 1JCFA 3BF3A 3MN9A 4FWKA 3VENA 1SZ2A 4H0VB 5KQ8A 4PKGA 1KXPA 4QS8A 2OANA 4BC5A 3D2FA 3CERA 3LL3A 3O1BA 5TKYA 5AQYA 2CH6A 5KQDA 4MLEA 3QBXA 5AQSA 3BP8A 3AAQA 3H3NO 5ADXA 3S41A 2W41A 5AZIB 4QS9A 3EN9A 3UE5A 4DQ8A 4BRPA 3D2EB 3ZEUB 2VCPA 4B1WB 3EKUA 2E2PA 4FWMA 5EOYA 1QQMA 4M63C 1IJJA 1ATSA 2A41A 3VEXA 5LJVA 3FZMA 4CZKA 4FOIA 4CZHA 1TYQA 5LJWA 2D0PA 5JLFA 3CJAA 4JHDB 3LDPA 3SJHA 2IVNA 2UYTA 4EFHA 4Y0WA 3AARA 1GLBG 4XH1A 2P9PA 4BRHA 4BR2A 3M6GA 1C0FA 2E2OA 4QS7A 3HI0A 5AR0A 4WYBA 3ZETA 4H0OA 2A40A 3B8AX 3MMVA 2QM1A 3FZLA 2H3GX 4MO4A 1XC3A 3VF4A 3CETA 2QWNA 3HM8A 4AM7A 4FWQA 2ASMA 1NGAA 2GTDA 3QB0A 4BC4A 1NLVA 3HTVA 1G99A 2VWBA 1NGJA 2BUPA 2Q2RA 3MN7A 3LDNA 3P4IA 3CQYA 5AQRA 2A42A 4BRLA 3O80A 2P9PB 2V52B 5BN8A 1HKGA 2ASPA 3LDOA 3DWLA 3QFPA 4WQ4C 4CBUA 3CIPA 1HKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DFEA 4BVPA 5BPLA 1KD1O 2F7TA 4FWSA 4KTZA 4BR7A 1I94K 2OCEA 1NK9A 4CZFA 3RRHA 4FLZA 1REVA 4CF8A 4DV4K 1LAVA 2RHKA 4DTPA 3EZWA 2HBKA 3ASMA 1BIZA 5AZIA 2VG7A 1TGOA 3ID6A 3JS6A 2Z1JA 3WEEA 2NRTA 1GLJO 1L3TA 2GX9A 3V1OA 3PX0A 4EHTA 4GW6A 4CJWA 4E7KA 2HBMA 3OJUA 2O4IA 1KC8O 3ENBA 4JAXA 1IH7A 4R79A 4AHCA 4BC3A 3A5OC 1R0AA 3PSIA 5FPEA 4BDZA 3CQXA 1N8RO 3FLCO 3N4QA 3GOIA 3ZSZA 3TPQA 3WXIA 3QLHA 2FF3B 1UA0A 1VQNN 1OH8A 1Y97A 4B9VA 3OS1A 1DEJA 3CC4N 1EWRA 1CZAN 1EQYA 3WUHA 4BE0A 1U04A 5AQVA 1RT3A 5HRPA 3MX2A 5JVGL 4A5BA 4FK4A 4A62A 4IOXA 1QSSA 4CBXA 4CBWA 4ZTJA 2E20A 3D45A 5GAEP 3LWLA 5LMUK 4CECA 3G6EN 4IFEA 3TSPA 2FC0A 2W40A 5EY4A 3LM2A 4OGEA 2FXUA 2E2QA 4FWOA 5CHIA 3CF5L 4CFBA 1XNRK 3NVKA 5DK5A 3V9WA 3K0SA 4JKDA 5HRSA 2ASOA 5DM7L 2YKNA 1KAYA 2HHUA 2QWMA 5E84A 3CM5A 4HHTA 5AQKA 1NGIA 1A5XA 4JHDA 4BY9C 2A6AA 2XRIA 1HR0K 3C6AA 3NCIA 2HSTA 3CI5A 3CHWA 5C42A 1KVAA 3HOSA 4KREA 3HK2A 2RF2A 1KAZA 1TAUA 2O8CA 1S22A 1QSLA 1OVYA 4AM6A 3SJJA 2CGJA 1HRHA 4U7BA 1RBTA 3UB5A 1TKXA 4GV3A 3IUCA 2V7ZA 2HMPA 2RN2A 3A0IX 3S3MA 3O9TA 1BA1A 4J2EA 4NCGA 1RGIA 1N36K 2OTJN 3A5NC 4PHTX 5DM6L 1NM1A 3E9OA 4LF4K 5CYQA 3OYDA 3HVRA 5AQFA 2QWRA 2FBYA 3LPTA 4JV5K 3DLGA 4ISGA 2YI1A 5H1SQ 1D5AA 3BGRA 4IBNA 4FZYA 4YDUA 5I9EB 4WFBL 3O3FA 3CJBA 4LF8K 1RDBA 4H03B 3Q7BA 4DMNA 3ISNC 3IFRA 4LSLA 1NK7A 4JKGA 4DV2K 2PYJA 3HSTB 4WF9L 4CVNE 3OYGA 3A5MC 4XH5A 3F2KA 1VRUA 2AJQA 3R6MA 5CZ2A 3C7NB 4CF0A 4Q0BA 1UA1A 3F9MA 3DLHA 4YOWA 1RTHA 4OPKA 4HCBA 1NJYA 1Q9XA 4O5BA 3QICA 4KHPK 1U2VB 3O1WA 1JCEA 4CGIA 4Z4GA 2HNDA 1NG9A 4GKKK 2XY8A 3H6EA 1U48A 4LC9B 4LFCK 5D3GA 3QEXA 3EKSA 3KKRA 3VEZA 4Z4FA 4O55A 2QWQA 1WAFA 2GWKA 4BE2A 3CCSN 1LWCA 4KAZA 3N4PA 1LOTB 3PSFA 5K14A 2QXFA 2KFZA 1VSHA 3WEEB 2NRHA 3WQUA 5AQPA 2QTDA 3FZHA 3THWB 3TU5A 4JI2K 3NDKA 1RBUA 3A2FA 3EL2A 3H46O 5ADXH 4CHQA 2IAJA 4A57A 3HSCA 4B1ZA 3DRSA 3K57A 4BRDA 3ULEA 4AHVA 4HTUA 5AQLA 4LY7A 2GUPA 1KLNA 1Q7YO 4WQ4A 4DTNA 2E5LK 4XEIA 3ZETB 3VEVA 3DJCA 4DLGA 4F2RA 1JLEA 4B8CA 3LP1A 1SKWA 1N5YA 4K42A 1U2VA 1ILYA 3U9ZA 5HROA 4H5RA 5JMVA 2DFFA 3LZIA 4QCLA 2YHBA 1W7AA 1JXBA 1RBVA 4A61A 1KRPA 2KZZA 3UIQA 3VQDA 2OPPA 2VQEK 5DMRA 2W6LA 5GIOA 3KTQA 2HHXA 1TKDA 1N33K 5FDLA 3KD5E 2HOEA 3ULDA 4RW9A 1NGFA 1J5EK 2NRVA 1XUPO 5FPMA 1DTQA 4FOEA 5AJ3K 3I8DA 3SI6A 4CGJA 1NMDA 1SS6A 4AH9A 4CD1A 2YNHA 2LSNA 1EWQA 4LF9K 1Q8IA 1VQ6N 4BR9A 1VQON 4LF5K 1Q18A 4IFVA 2NNWA 3F9KA 1Q81O 4PA1A 4LFAK 4EZ6A 4X65K 4ILJA 3HJFA 1UWBA 3OHRA 4FJ7A 3SV4A 3LDSA 4ID5A 4RWTA 4BDYA 3HVTA 1HLUA 3THWA 1BQNA 2P9KB 3AAPA 2F9TA 4FJ9A 4K8ZA 4IJNA 3CMEN 4JS4A 2KTQA 4IO9L 2HW3A 1BDGA 1ZXOA 1SQKA 2CGLA 2Z1HA 2NRZA 3K58A 3QIOA 4CIGA 1QTMA 1RNHA 4BREA 1R59O 2P9UA 3BDPA 2KZMA 3DLRA 3K2PA 4CW7B 4JRPA 3VENA 4FJGA 4PKGA 4QS8A 3D2FA 4KB1A 3CERA 5TKYA 4CEZA 3ZLJA 5GAHP 3M8QA 4I7FA 1K8AO 4MLEA 1BHLA 1FW6A 3JYTA 3H3NO 4DTRA 3HO1A 5J2QA 4DS5A 4DQ8A 5M1OA 3OYMA 1W9HA 4YY3K 4ELVA 1ASVA 3VQ8A 4FWMA 4EP5A 1IJJA 2A41A 5FLXO 5LJVA 3I55N 3VQPA 4FOIA 2NUBA 5LJWA 1S1VA 2D0PA 5JLFA 3SBGA 3S9HA 4YOUA 1RT2A 4FVMA 3EY1A 3B6PA 4DR1K 4FZZA 2F8TA 3ZSVA 4ILHA 2XO7A 1C0FA 2E2OA 3ZT1A 5AR0A 2OZMA 1T05A 2BE2A 3MMVA 4H0OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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