4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase isoform 3
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
3CJ1A 2E8AA 1NGJA 5AZJB 3MN7A 5BREA 5AQXA 4A2BA 2VWBA 1CZAN 3O6WA 2Q31A 3VEXA 4FWPA 2QWOA 3F9MA 3R6MA 2P9IA 3JXUA 1IJJA 5BPMA 3A8YA 4BGBA 5E26A 1BDGA 3HBTA 4JD2B 4FO0A 2QWPA 4O5FA 3A5MC 5EX5A 4BC2A 2Q2RA 2P9SA 3WQUA 5FPNA 5AQUA 3LDQA 3LM9A 4FOIA 4PL8A 4WQ4A 3G25A 2HMPA 3U4LA 1XC3A 3WXJA 2KHOA 2I7NA 4EAHD 2CGLA 1X9JA 4H0PA 1ATSA 3D2FB 3CJ9A 3A0IX 2QM1A 5BR9A 3H1VX 4ISFA 1Z6RA 3CJBA 3O80A 1J6ZA 4XEIA 2Q0UA 3MK6A 1BWFO 1GLEG 5I9EB 2W41A 3A5OC 2BUPA 2ASMA 3VEWA 5LY3A 3CQXA 3D2EA 2CGJA 4A61A 3VEZA 2Q1NA 2NZTA 4C23A 3LL3A 5AQMA 4CI6A 2D4WA 4NO7A 1LCUA 4FSVA 4BC5A 4CZFA 3U8XA 1WOQA 5EXWA 2HF3A 4FL9A 3BEXA 1T6CA 5ADXH 4RCHA 2A40A 3ZETA 1TUYA 1Y64A 3O4WA 3VF6A 2ITMA 2V7ZA 3AARA 3CJAA 4MO5A 3W3DA 1E4FT 4FPBA 1D4XA 1QQMA 2FLOA 1NGEA 3CETA 5BRFA 4LC9B 3MN5A 3CI5A 5BRDA 5F2RA 3FZLA 3IDHA 3VERA 4GY2B 3H45C 3TU5A 1GLDG 3DWLA 2QWLA 1U2VA 1TYQA 2Q97A 3HI0A 4WQ5C 1NGIA 1E4GT 4BRLA 1GLBG 5AQIA 4F9OA 5AZIB 4IJAA 3WT0A 2FF3B 2CH5A 4CD3A 3UKRA 3IFRA 1GLCG 3RSEB 4DB3A 4FWQA 2OANA 2P9NB 4PL7A 3DJCA 5AQRA 3ZX2A 3LDNA 4K41A 4JHDB 2CH6A 1QZ6A 4BR5A 2IVPA 5AQHA 3SMSA 3UKUB 2FXUA 4CJ7A 3C7NA 3LDLA 2AP1A 4FWOA 3QFUA 3VGMA 2Q0RA 2GELA 3D7EO 3R9PA 4CZLA 4IO8A 4FPAA 3VEVA 4H0YB 4H5RA 1TUUA 5AQQA 2P9IB 2FF6A 3CQYA 3WXIA 5BN8A 3QBWA 3ENOA 2VCPA 3JS6A 5JLFA 3A5LC 3FR0A 4QS7A 5F0XA 4NB4A 3I33A 5AQYA 2YHXA 1BG3A 4BRKA 4CZKA 1NM1A 4RWTA 1YVNA 3WEEA 4EHUA 1YAGA 3DXKA 4A62A 5KQDA 4BRIA 4IZ9A 4BR0A 5F1XA 3B8AX 1X3NA 4BRFA 2P9KA 1SAZA 4K25A 3SMPA 3A5NC 3O5BA 2YHWA 3VPZA 4CBUA 5AQWA 2NRHA 2EWSA 1KXPA 3WXLA 5BRHA 1HUXA 3QB0A 5AQKA 3GL1A 4EHTA 3D2EB 3FZKA 4I6MB 4XH5A 3U9ZA 3VF2A 2QW9A 3ULEA 4FOEA 4XH4A 3M6GA 3L4IA 2VYPA 3P4IA 4BRNA 4CD1A 1MDUB 1ZBSA 4E1JA 2F9WA 3VEYA 2YJEA 1K8KA 1NGAA 5LJVA 2E2PA 5LJWA 5JMVA 5AQVA 3SK3A 3ZETB 4YDUC 1EQYA 3SJHA 1DKGD 4CZMA 4JN4A 1V4SA 4M7XA 1JCGA 3ZEUA 2P9PA 1NGDA 2IVNA 3QMLA 4JD2A 2QXLA 5FPMA 3BP8A 3VENA 3VETA 2ZGYA 1OKJA 1U2VB 1ATRA 1NGGA 3I8BA 3TPQA 1GLJO 4WQ4C 2QWQA 4ISGA 3H46O 3WUHA 2QWNA 3VGKA 3WXKA 5B8HA 3UKRB 4H0OA 2PBDA 4MLHA 3ID8A 1QQOA 3R8EA 2FSKA 2YJFA 4BROA 4BR4A 4M7YA 4B1XB 4BC3A 1DEJA 2Q36A 4PKHA 3EN9A 2A5XA 2P9UB 2YCHA 4IJNA 5EY4A 1NGHA 2GUPA 2IVOA 4BG8A 3EZWA 3C7NB 4M63C 4B1ZA 2AA4A 3CHWA 4DCHA 1T44A 3HM8A 1BUPA 3KZBA 3FZFA 3MN9A 5AQNA 1MWKA 1XQSC 4B1UB 4CBXA 4FWRA 1RFQA 4H0TB 1NBWA 3FE1A 2A3ZA 4FWSA 4BG9A 1KAYA 3DXMA 2NLXA 1YXQA 2QWMA 2E2OA 4Y0WA 3HSCA 4HWIA 3BF1A 2E1ZA 3HZ6A 4K43A 4B1WB 2I7PA 4EFHA 5AQFA 4BRMA 1HX1A 3H3OB 5AQLA 5KPZA 1NGBA 2GEMA 5AQPA 1G99A 2D0PA 1JCFA 1XUPO 3DXKB 3EL2A 3IUCA 4CZJA 3VEOA 3EO3A 4PKIA 4B9QA 4BGAA 1GLLO 3UE5A 4H0XB 5AQOA 4BR2A 2P9SB 1ESVA 2P9KB 3AAPA 3H3NO 4BRGA 1SQKA 5AQTA 1V4TA 1IG8A 3RSEA 4B1YB 2GWKA 1SZ2A 1X3MA 1ZC6A 2ZF5O 4XH1A 3UB5A 2HOEA 2V52B 3QBXA 1NLVA 3O8MA 4BREA 2QWRA 2PAVA 3ATUA 3ULEB 1HKBA 3H1QA 1KAZA 2P9LA 2E88A 4H0VB 3OHRA 4AM7A 2FSNA 3KVGA 1K8KB 3MDQA 3ENHA 4PKGA 4BVOA 2E2QA 4BRCA 4BVPA 2GWJA 1GLFO 5AQZA 3ZX0A 4CZGA 1P8ZA 2D0OA 3L6QA 1DGKN 4IWVA 3VGLA 3SLCA 4YDUA 2A41A 4KBOA 4H5WA 3AAQA 5AFUH 3BUZB 3ZEUB 1NMDA 4CBWA 2P9PB 4CZEA 5AFUA 1HJOA 5JICA 4BRHA 4B1VA 4RTFD 4BQZA 5AZJA 2YHYA 3M1FA 5E84A 1T6DA 3GDQA 1R59O 2D1KA 5BPLA 5BPNA 2A6AA 4Z94A 5KPTA 5EOYA 3HTVA 1RGIA 4BQLA 2ZWHA 1QQNA 2ASPA 5FPDA 1S3XA 1BU6O 3IMXA 3DAWA 3FZMA 1NGCA 3FZHA 4BRQA 4FWMA 4JNEA 1TYQB 1HKCA 4HTLA 1NWKA 2E1YA 1JCEA 3ATVA 5BN9A 4WQ5A 2A42A 2H3GX 4BRPA 2V7YA 2ZGZA 3L0QA 3C0BA 1KAXA 3CJCA 3QFPA 4I6MA 4IXCA 4BC4A 1QHAA 1Z05A 2ASOA 3BF3A 3VF4A 3D2FA 4MO4A 3GG4A 1C0GA 1S22A 3KHYA 2UYTA 3EKSA 1U6ZA 4CZIA 3EKUA 4L3QA 3FGUA 4DQ8A 4EIAA 4CZHA 5EVZA 2FSJA 1HKGA 1MA9B 3DXMB 4FWKA 4ISEA 2CGKA 5ADXA 4O8KA 2HF4A 2WUSA 3O08A 5AR0A 1QZ5A 2YI1A 3MCPA 4MLEA 2E20A 4A2AA 3LDOA 1BA1A 1H1VA 3LM2A 4BR7A 3H6EA 3CERA 5KQ8A 1ZXOA 3J8AA 4J8FA 3VESA 1BOTO 2GTDA 3U9DA 4DHYA 3LDPA 5KPRA 1MWMA 4FWNA 3W0LA 4H5TA 5JLHA 1BA0A 3MN6A 3MMVA 1ATNA 5TKYA 5CE3A 2BTFA 3GBTA 4QS9A 1C0FA 4FWLA 1YUWA 3GE1A 2DPNA 4K42A 1RDWX 3WEEB 3WQTA 2P9UA 3QICA 2E2NA 3VOVA 3ZX3A 4BR9A 2P9LB 1LOTB 4BRAA 5AZIA 1WUAA 4AM6A 5FPEA 2IIRA 1BO5O 4H03B 3GOIA 3QDKA 2W40A 5AQGA 3S41A 2P9NA 5AQJA 1HPMA 5ELZA 4WYBA 5AQSA 4GNIA 4H5NA 2J4RA 2V51B 4JAXA 3O1BA 1NGFA 4JHDA 2F9TA 3FFKB 1HLUA 3FLCO 3O1WA 3UKUA 3CJ7A 4H5VA 3AY9A 1Q18A 3CIPA 1GLAG 4BRDA 4QS8A 3M3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VG5A 3MN7A 3D45A 3C6UA 3O9TA 3AV9A 2VWBA 3C65A 2PYJA 3MX2A 5FDLA 4BDYA 2Q31A 3VEXA 4FWPA 4Z4HA 5J1EA 3QETA 3R6MA 3JXUA 1C0UA 3J7AP 5BPMA 4BGBA 5E26A 4MDAA 2UUCK 4CGGA 3HBTA 3K5NA 4BC2A 1BGXT 3HP9A 5AQUA 1OH5A 2XRIA 3WNEA 4FOIA 3CFRA 4WQ4A 3G25A 3SUQA 4OX9K 2I7NA 3ALYA 4DTJA 2CGLA 1X9JA 4H0PA 3LZIA 3PIPL 2KW4A 4AH9A 3D2FB 3HK2A 4DTSA 3TSQA 4M3YA 4ILHA 4ISFA 4YHHK 1J6ZA 3Q7CA 3VTIA 3KLHA 3O4NA 4DTXA 1VSMA 3RMDA 1X1PA 1GLEG 1GOBA 2W41A 2RHKA 4IFVA 3VEWA 5HLFA 1NK9A 4A61A 4F4KA 1HQEA 3LL3A 5DM6L 4FK4A 2IC3A 4YOVA 2D4WA 5KGWA 1OVYA 4LSLA 3DLBA 1WOQA 1L3SA 1FKPA 1T6CA 5ADXH 4RCHA 3ZETA 1Y64A 5C15A 4DU1A 4KH4A 4FJLA 1P90A 4LC9B 3MN5A 2XY8A 3CI5A 1SL1A 1BIUA 2QWLA 3HOSA 2D0AA 1TYQA 5M1PA 1LWCA 4E89A 3KD5E 4ELTA 1GLBG 4JV5K 4GKJK 3L2VA 3K0SA 3V1RA 2FF3B 3WT0A 4DQSA 1T03A 1KQSM 3IFRA 3OYDA 3RSEB 4DB3A 4KV8A 1QSYA 2KFNA 3AO1A 3L2UA 4AQYK 3VQ8A 5J2PA 1NU0A 3DJCA 5AQRA 4YOYA 4E0DA 3LDNA 1N8RO 4K41A 4LSNA 1TK5A 4BWJA 4OPAA 4FLXA 3LDLA 3LANA 3BDPA 3AO5A 1L3TA 4IFEA 1OVQA 2GELA 4HUFA 2HSTA 3D6RA 3VEVA 4EP5A 4CERA 4J2AA 5AQQA 3LZJA 3ZT3A 5J2QA 4NCBA 3ASMA 2IAJA 2O8CA 2KZZA 4ZTJA 1VSJA 3AA3A 1RDCA 1C1CA 5J2NA 1REVA 1NG9A 3PO4A 3MCAB 3VQCA 3JS6A 2HB5A 4GV9A 2G8FA 2IGIA 1JXBA 3CFOA 4NB4A 3I33A 2YHXA 1BG3A 4BRKA 2DFHA 4CZKA 3O9RA 1U4BA 4B9MA 3DXKA 3WXMB 4WFAL 4DFMA 5SZTA 4IEIA 1X3NA 1UA0A 4C8MA 3ZSYA 4O0JA 3O5BA 1DT9A 5HBMA 4CK2A 4AHRA 3QNOA 4JKGA 3VPZA 4QAGA 4CBUA 3SUOA 3TAQA 5DK5A 1TL3A 3WXLA 4AHTA 3QB0A 3GL1A 4EHTA 4XH5A 4XH4A 5LL6Z 1IKYA 2VYPA 3P4IA 4CD1A 1ZBSA 4F2SA 3F73A 3NFAA 4DV4K 1IBLK 2Z1IA 5C2DA 3SUPA 4FLWA 4KFBA 3OBWA 1XHXA 3KK3A 1TK8A 3SAHA 4WCEL 1I94K 4FJXA 1CZBA 3RRGA 4CEZA 1ASWA 2NRRA 3QMLA 4CK3A 4B3TK 3L2RA 3DMJA 3VETA 4YY3K 1EWRA 2F96A 1BHLA 3LPTA 2HBLA 2Y1IA 3KLGA 4ISGA 4M3XA 3VGKA 5B8HA 4H0OA 1L3UA 2FSKA 4ZHRA 2YJFA 3SPYA 4M7YA 2NRXA 2ITGA 4CJVA 3EN9A 2YCHA 3DLEA 4IJNA 2GUPA 2IVOA 3R1XA 4O4GA 4B1ZA 2AA4A 3O3FA 1BUPA 1RBUA 4KKOA 5JVGL 1XQSC 4B1UB 2D0CA 1RBVA 5IWAK 3KWGA 3MX5A 4FWSA 1OH8A 4FVUA 3ZT0A 4BG9A 1W9HA 3P5JA 1S6PA 3CXCM 2QWMA 3NAEA 1HRHA 3HSCA 4HWIA 3HZ6A 1J54A 4K43A 3CQ8A 2XO7A 3KKSA 4EFHA 4CJ4A 3QO9A 1QSSA 4R79A 4BRMA 1HX1A 4OKKA 4G1QA 3ZCMA 3IRXA 5AQPA 4DV0K 3SZ2A 1XUPO 1VSHA 1NJXA 3VEOA 4PKIA 3RR7A 2YHBA 4B9QA 3EE8A 1RNHA 1WBDA 1RTJA 3AAPA 1WSEA 4BRGA 1W0HA 3OYEA 3EE9A 2FC0A 3V9XA 1NKEA 3G71N 4IFYA 1EXQA 4J2EA 2ZF5O 1ZBUA 4FK2A 4CEDA 4JKFA 3P1GA 2V52B 1WSGA 1DLOA 4CF2A 3SQ1A 5I42A 2QWRA 2PAVA 3OYHA 1HKBA 1KAZA 4CJKA 4H0VB 4MQ3A 3CCSN 3ENHA 2GWJA 4RG8A 4CZGA 4HCCA 3M8PA 5HOOA 4YDUA 2A41A 2WBNA 5K14A 4DLEA 3QERA 1JL2A 1RT6A 2P9PB 3OYKA 1HJOA 5JICA 1RDUA 4B1VA 3K58A 1Q82O 1T6DA 3GDQA 1R59O 2D1KA 1Z25A 4HHTA 5BPLA 3KLIA 4HUEA 1XMQK 1N33K 4W5NA 2HHUA 3THWB 3AO4A 2FBTA 3TAEA 4LH5A 1EX4A 3OS0A 1NGCA 1KVCA 1VQ6N 4BRQA 1VQ5N 4FWMA 2HVHA 4HTLA 1NWKA 3ZSRA 2ZGZA 1NJYA 1YVUA 3CYMA 1KAXA 4I6MA 2W6LA 4M45A 2NRVA 3VF4A 1L5UA 4MO4A 2OZMA 4JKHA 1XNQK 1TK0A 1NNEA 4CCHA 3V81A 4L3QA 3FGUA 4Q5VA 4LF9K 3CPWM 1K73O 2FSJA 4RW4A 1MA9B 4IOXA 3SPZA 4PUOA 4UY8O 3NH0A 4H4MA 4MLEA 3HVRA 3CCRN 3HPHA 4A2AA 5TKWA 1H1VA 2HNDA 4CEFA 3K57A 3NE6A 3VQEA 5KQ8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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