4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
b'SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glucokinase isoform 3
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
4FWNA 1JCGA 1SAZA 1HKGA 2D4WA 3ID8A 1R59O 3DXMB 1BO5O 5BPMA 4CBWA 2GELA 1ZC6A 3MMVA 4BRHA 2YJEA 3UKRA 1GLJO 1BG3A 1TYQA 3ZEUB 2ZGZA 5AFUA 1HJOA 3QFPA 1Z05A 2ASMA 4Y0WA 3VEOA 3MDQA 4XH1A 3SLCA 3VETA 3WUHA 1QQMA 3M3ZA 3A5MC 1YUWA 1YVNA 1NGIA 3O6WA 4FPBA 1ATNA 5F0XA 1NGJA 3UKRB 3D2EB 5BRHA 5AQIA 1TYQB 4I6MA 1TUUA 4BRQA 4WQ5A 4H0OA 2QWPA 2QM1A 3FZLA 4JAXA 1BDGA 2ASPA 3QDKA 4XEIA 1ATRA 2FLOA 2GWKA 2UYTA 4M63C 4ISFA 1DKGD 3TU5A 4BGBA 4RTFD 5ELZA 4J8FA 3A5OC 1KXPA 1MWKA 3IUCA 5ADXH 2VYPA 4FWRA 3BUZB 1HX1A 3QBWA 1NBWA 4H0XB 4CZLA 4I6MB 2E20A 2P9KA 1HPMA 3D7EO 1BA0A 4CZFA 4M7YA 4JN4A 4CZEA 3BEXA 4MO4A 2QWNA 3QBXA 2Q97A 4BQLA 3ENOA 4MO5A 5ADXA 3H3NO 2D1KA 2YI1A 3ULEA 3VF2A 2ZF5O 1X3MA 4B1XB 2QWLA 3IMXA 1HUXA 2A42A 4PL8A 2P9KB 4B1WB 2YHWA 2YHXA 4IJAA 5EXWA 3VENA 3J8AA 4H5RA 2W41A 4H5NA 4IXCA 1NGGA 5AQGA 3BP8A 2FSNA 4BRNA 4EFHA 4H03B 3WXLA 1ATSA 4IJNA 3VGLA 4CJ7A 4Z94A 3JXUA 4BR5A 4H0TB 5BRFA 4CZHA 3O80A 3B8AX 3F9MA 2P9PA 3P4IA 5AQUA 4CZKA 2VCPA 4JD2A 3RSEA 2A41A 3O1BA 4M7XA 3VESA 4BRAA 2E1YA 4MLEA 3GL1A 3LDLA 3U8XA 5BPNA 2P9LA 2D0PA 3D2FB 1SQKA 3G25A 4FWQA 3CJ1A 3LDOA 1LCUA 3ATVA 5AQHA 1T6DA 3U9ZA 4CBXA 3ZETA 1ESVA 3HI0A 2IIRA 4DHYA 4EAHD 3EKUA 3SMSA 2HF3A 2QWRA 4JD2B 2E2OA 3CQXA 3CJ7A 2QWOA 3O4WA 3FLCO 5JICA 3H1VX 3HTVA 4CD1A 1NWKA 2EWSA 2WUSA 3CETA 4E1JA 4NB4A 3M1FA 5EY4A 4B1VA 2FF6A 3DJCA 1KAZA 4FOEA 4JHDA 5LJWA 3VERA 3WXKA 1K8KB 1XC3A 3AARA 2ZWHA 3H6EA 4A2BA 5AQWA 3S41A 3CJBA 2ITMA 5BPLA 2P9SB 3ENHA 4GNIA 3SJHA 4PKIA 1U6ZA 4H0VB 3A5LC 3BF3A 3VF4A 3CERA 4JHDB 5AQXA 2NZTA 2Q0RA 4EIAA 1NLVA 3QB0A 4K41A 1HKCA 4BVOA 4BRKA 2IVPA 3BF1A 4BR4A 1GLLO 1J6ZA 3O5BA 1XQSC 4WQ5C 1D4XA 3AY9A 4FWMA 2BUPA 3SK3A 1C0FA 4A2AA 4LC9B 3VPZA 1NGHA 4BR0A 4F9OA 5FPMA 4ISGA 1NM1A 4WYBA 3SMPA 1NGBA 3VEZA 3IDHA 3ZX3A 4FWPA 4FPAA 4EHUA 1IJJA 4DB3A 4BRDA 3I33A 4BROA 5AQKA 4CBUA 1P8ZA 3EN9A 2Q2RA 4FO0A 3FE1A 2QWQA 4FWOA 4QS9A 4HWIA 1NGEA 5AQTA 2CGJA 3C7NA 3GDQA 2A40A 1NGFA 5AQVA 5JMVA 2FXUA 3U4LA 3UE5A 1U2VA 1RDWX 3KVGA 5AQFA 4BG8A 1GLEG 4HTLA 3WEEA 4PL7A 2QW9A 5KPRA 5LJVA 4CD3A 5AZIA 3HBTA 3WXIA 3FGUA 4H5TA 3R6MA 4YDUA 1S22A 2FF3B 1RFQA 1HLUA 1NGAA 5AQNA 4B9QA 2CH6A 5E26A 1QQNA 3LDNA 5B8HA 1U2VB 5AZJA 5KPZA 3IFRA 3FR0A 4XH4A 3R8EA 4O5FA 3CHWA 2P9IA 4EHTA 5BR9A 3CIPA 3FZMA 2NRHA 4RWTA 2V7ZA 2H3GX 2P9NA 2BTFA 3ULEB 3DXKA 3VEVA 1SZ2A 3UKUA 4CZMA 1E4FT 5AQZA 3EKSA 2AA4A 5AQMA 4DQ8A 1ZXOA 3UB5A 3VEYA 1BU6O 1QZ6A 3WT0A 2V52B 4K25A 4BREA 4CI6A 4FOIA 3MK6A 4FWLA 2P9NB 1BOTO 1T6CA 2P9PB 5AQPA 1XUPO 4BRFA 3LM2A 4IWVA 3HM8A 3RSEB 5KQDA 1QZ5A 2HF4A 2QWMA 4BC4A 5FPDA 4NO7A 3L0QA 3WQUA 4BRMA 4DCHA 2P9LB 3ZX0A 3O08A 3FFKB 2A3ZA 5EVZA 3AAPA 3CJAA 4BRIA 2E8AA 3ZETB 1RGIA 4H0YB 2KHOA 2D0OA 3GBTA 3MN5A 4WQ4A 3OHRA 3WQTA 4K42A 4IZ9A 3KHYA 5F1XA 5AR0A 1V4SA 3FZFA 2P9UA 3MCPA 4MLHA 3DXMA 4BVPA 3FZKA 2A6AA 3VEWA 1MDUB 1GLBG 5JLFA 3H45C 2OANA 3GOIA 4BC2A 3ZEUA 3LL3A 1YXQA 2Q31A 5EX5A 1EQYA 5FPEA 4IO8A 1IG8A 4BG9A 1HKBA 1GLDG 3U9DA 4FWKA 1YAGA 3H46O 5BRDA 4H5WA 4CZIA 5AQLA 1JCEA 2P9UB 3L4IA 4B1YB 2V7YA 4KBOA 1BA1A 1G99A 3VF6A 4CZGA 1ZBSA 2GUPA 2PAVA 3W0LA 4B1UB 3D2EA 1C0GA 3QMLA 3H3OB 5AQOA 4BR9A 1NMDA 4A61A 2W40A 5EOYA 1KAXA 3CJCA 3GE1A 2YCHA 2HOEA 2QXLA 4PKGA 3DWLA 5AQJA 5AQYA 1TUYA 2NLXA 2CGKA 3VEXA 4BRCA 1CZAN 2PBDA 1DEJA 3EO3A 4QS8A 2DPNA 4FWSA 4O8KA 3LDPA 3CI5A 2Q1NA 3ATUA 5LY3A 3QICA 2HMPA 4XH5A 2CGLA 4C23A 1QHAA 1X9JA 2VWBA 3A0IX 4YDUC 1JCFA 2ASOA 5AQSA 3H1QA 3VGKA 4BGAA 5AQRA 2E2PA 1NGCA 3QFUA 2GTDA 1DGKN 5AQQA 3MN6A 2FSKA 1H1VA 5BREA 3O1WA 5BN8A 5I9EB 1Y64A 1Z6RA 3C7NB 4GY2B 3MN7A 2CH5A 2E88A 3W3DA 4K43A 1T44A 2YHYA 3AAQA 3EL2A 2AP1A 2E1ZA 2I7PA 5KQ8A 2IVNA 3WEEB 4ISEA 2FSJA 4BRLA 5AZIB 2YJFA 3KZBA 4BQZA 3ZX2A 3MN9A 4AM6A 1S3XA 1WUAA 1GLFO 2V51B 3R9PA 3TPQA 3VOVA 5BN9A 3VGMA 3LDQA 5JLHA 4A62A 1BUPA 5AZJB 1KAYA 1BWFO 1OKJA 2P9IB 1WOQA 4H5VA 3JS6A 5KPTA 1GLCG 3D2FA 3LM9A 4L3QA 3GG4A 1GLAG 3DXKB 4BR2A 3UKUB 2F9TA 2E2QA 3I8BA 1LOTB 2A5XA 3WXJA 1QQOA 1Q18A 5F2RA 4WQ4C 2Q36A 5E84A 4BRGA 4CZJA 2GWJA 4FSVA 5TKYA 4B1ZA 4BC3A 4QS7A 2I7NA 3HSCA 1X3NA 4PKHA 3A5NC 2F9WA 1K8KA 2Q0UA 2ZGYA 2J4RA 2IVOA 1MA9B 1V4TA 2E2NA 4JNEA 1E4GT 3A8YA 3DAWA 2P9SA 3CJ9A 3HZ6A 5AFUH 4BC5A 3EZWA 4AM7A 3L6QA 4RCHA 1MWMA 3O8MA 4H0PA 4FL9A 3CQYA 4BR7A 3M6GA 5CE3A 3FZHA 3C0BA 2GEMA 4BRPA 1NGDA 5FPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C8KA 1HYVA 2D4WA 3DXMB 1NKCA 4JKEA 3SYZA 1OH7A 3V4IA 1L3TA 1ZC6A 3MMVA 2YJEA 1OVQA 3TTDA 2O8DA 1GLJO 1TYQA 3ZEUB 3QFPA 4JEPA 2ZJRL 3P5JA 1FXXA 1VQLN 3MDQA 5M1OA 3IRXA 3M3ZA 5M1QA 5JS1A 3C6AA 4GKKK 1YVNA 3O3HA 3O6WA 1IBLK 4W5RA 2W6LA 5F0XA 1VQ5N 1RILA 2DY4A 5BRHA 2WC9A 4I6MA 3SPZA 4Z4HA 3TANA 2HBMA 4B9MA 4JAXA 2ASPA 2GWKA 3AVNA 2UYTA 3TU5A 4ISFA 4W5TA 1U04A 3KLHA 1KXPA 4DFJA 2G8FA 4MDAA 1IKWA 1MWKA 5ADXH 4KI4A 3K0SA 5JVHL 4FWRA 1DLOA 3V81A 4DQSA 1QTMA 3QBWA 4H0XB 3OYGA 3V1RA 1I3AA 3LAKA 3NAEA 3AVFA 3WNEA 1BA0A 2XY7A 1BIUA 4CJLA 4JN4A 2YKMA 3OYJA 1KSPA 3C95A 4CZEA 1M1KO 1ZBUA 4MO4A 4LF5K 2JGUA 4KHWA 3ENOA 1NK8A 4MO5A 4O8UA 3VF2A 3T1YK 1HUXA 3OBYA 3C6UA 4DR1K 1WSIA 2IDOA 1U4BA 3ZLJA 2BH1A 4IXCA 4JV5K 4BRNA 4EFHA 4IJNA 3VGLA 3JXUA 1VAZA 4H0TB 3HVRA 3KKRA 4CZKA 4IOXA 4JD2A 4KH4A 3RSEA 4M7XA 4FLXA 3LDSA 5IT9O 1TL3A 4MLEA 2QI2A 1J9AA 3TAFA 1NK0A 4B3RK 3JAMO 2D0PA 3D2FB 4DFPA 1XNQK 3LDOA 5AQHA 3EKUA 3SMSA 4CEZA 5GAGP 1RT7A 4CFDA 3O4WA 4I9LA 5JICA 2HW3A 3DRPA 3HTVA 1NWKA 1RDBA 1YT3A 5EY4A 3LAMA 3WXKA 3AARA 4YORA 1KLNA 3H6EA 3SQ4A 4JI3K 5C42A 2RPIA 3S41A 3CJBA 3K5OA 2P9SB 3C6TA 2UXCK 3P1GA 2EX3A 4CFAA 3PUFA 4PKIA 4U67L 3CERA 3QB0A 4K41A 3K5MA 3E1YA 3BF1A 1WLJA 4ID1A 3O5BA 4FWMA 3M8SA 3SK3A 4KAZA 1C0FA 1VRTA 4F9OA 5FPMA 3ZT2A 3SMPA 1YI2N 2QXFA 5M1PA 3CG7A 4E89A 3NF9A 4Y1CA 3ZX3A 1R0AA 4EHUA 2UXDK 1WSJA 2HHHK 3I33A 4DLGA 1HNXK 4JS4A 2Q2RA 3LP0A 4KFBA 3FE1A 1MU2A 5C2FA 4EZ9A 3CQ8A 1RT1A 4FWOA 1NGEA 2IS3A 1FW6A 3DLEA 5M1FA 3GDQA 1IKYA 5JMVA 4F4KA 5CYMA 4HTLA 2GBZA 3SNNA 4CD3A 5AZIA 4YDUA 3ZSZA 4CERA 2UXBK 4KTWA 4BE0A 4ELUA 4I2PA 5E26A 1KVAA 3ZSYA 3CMAN 1RBVA 1HYZA 3QO9A 5AZJA 3FR0A 4XH4A 4DV3K 4IO9L 4O5FA 3RMAA 2NNWA 3CHWA 4EHTA 2XO7A 1FKPA 2V7ZA 2BTFA 3HVTA 1E4FT 4DTXA 1BCOA 4DSIA 3O9RA 2KZMA 4OPJA 5AQZA 4HCCA 4DS4A 1T8EA 4DQ8A 5C2DA 3VEYA 5I42A 1QZ6A 3DLKA 2VG6A 4YOWA 4DR2K 3BY5A 4DF4A 1U47A 2GUIA 3MK6A 4AF1A 3NFAA 3V1OA 2VQFK 1Z25A 2P9PB 4WFNL 3LM2A 5KI6A 4IFYA 2HHQA 1QZ5A 4CHPA 4IKFA 4DSEA 1EWQA 1KTQA 1RCHA 4CJVA 3WQUA 5CZ2A 1RT6A 4KI6A 4LF9K 3AAPA 4ID5A 4BRIA 2O4GA 2O8EB 1XNRK 3ZETB 1TKXA 3CCJN 1SKWA 4H0YB 1ILYA 1Q86O 2JLEA 3MN5A 3AVHA 5JS2A 2A1RA 4IFEA 3NF6A 3DXMA 4BVPA 1QSLA 3FZKA 3QNOA 4R5PA 4M45A 3WNFA 3VQ6A 3IAYA 3ZEUA 2BGGA 3EYZA 2Q31A 1EQYA 4BG9A 1NJWA 1TK0A 5BRDA 4CZIA 1JCEA 5HRSA 3NF8A 5GIPA 2YNGA 4B1YB 1BA1A 3VF6A 1YF5L 1ZBSA 3W0LA 1RDDA 3QMLA 3H3OB 5AQOA 4BR9A 4E1MA 1M90O 4K8ZA 1N32K 1HNVA 1VSLA 5HROA 3OJSA 1ASUA 4LSLA 5C15A 2CGKA 1XC9A 3KLEA 2PBDA 4FXDA 3CMEN 1SS6A 1RBUA 1TL1A 2HMPA 1J54A 4B3MK 1NJYA 1QHAA 1X9JA 3OS2A 5JVGL 4E19A 3H1QA 2G8KA 4B08A 4BGAA 2XHBA 5AQRA 1NGCA 3QFUA 3NGIA 4FLUA 3MN6A 1VQ9N 1SL2A 3C7NB 4K8XA 3MN7A 3OYLA 1KLMA 1T44A 2YHYA 3HK2A 2IVNA 1EWRA 1RT5A 2E6LA 2EHGA 3L2VA 1S3XA 2GV9A 1JLQA 3VTIA 3PY8A 1KVCA 4CGFA 5C12A 1UWBA 3QIPA 2V51B 3CCRN 2QKBA 1C0UA 4DTMA 2HHXA 2G8VA 1VQMN 1BUPA 5CY4A 1BWFO 3SUOA 3THXB 3JS6A 1GLCG 2NUBA 2VG5A 3D2FA 1BCMA 3GG4A 1QS4A 3DXKB 4JK7A 1WBDA 3PIPL 3SUQA 1D9FA 3KD1E 4A59A 1W7AA 1WSFA 4J2DA 2F8TA 3NF7A 2ZJPL 2R7YA 4DFMA 3HM9A 1JXBA 3EE8A 4N76A 4WQ4C 1S5JA 3KK7A 1L3UA 3V9UA 3VQQA 5EU7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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