4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glucokinase isoform 3
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
1K8KA 3DXKB 4CZGA 3FZFA 3O1BA 2V51B 4I6MA 5AQPA 4BROA 3B8AX 3HI0A 3CHWA 3VEZA 3CQYA 4MLHA 1ZXOA 1YVNA 2E88A 5AZJB 1JCGA 1IJJA 3MDQA 4FWOA 4DCHA 1GLAG 3KZBA 3GOIA 3O08A 5AQVA 3VF2A 2P9SB 1MWKA 2ZWHA 5KQDA 4AM6A 3ZX2A 5AQWA 2Q0UA 1T6DA 3H1QA 4CBUA 2FLOA 2GELA 4HTLA 5AQSA 4XH1A 4FWKA 4H0PA 5ELZA 4EAHD 3MN7A 5FPEA 1SAZA 1Z6RA 2E2OA 3IUCA 3D2EB 4FPBA 3HSCA 4JHDB 4J8FA 4XH4A 3IDHA 2Q0RA 3JXUA 3SK3A 4K25A 1E4GT 1NGDA 3UB5A 5AQNA 4BGAA 4H5NA 3A8YA 3O4WA 5EY4A 2DPNA 2A40A 2FF3B 4YDUA 5AQGA 4CBWA 5LY3A 2KHOA 3MCPA 3VEYA 5AFUA 5AQOA 2CH6A 4BRLA 2FSJA 1JCEA 1HJOA 1NGAA 4RCHA 4WQ4C 3MN9A 5AQLA 2AA4A 1ZC6A 3C0BA 2QM1A 4WYBA 1GLEG 1T6CA 3CERA 4PL8A 4FWMA 4AM7A 5AQRA 2A3ZA 1Y64A 3ENOA 5I9EB 4PKGA 5BRDA 3GE1A 5AR0A 1NMDA 3VGKA 3EO3A 3A5LC 2ZF5O 3IFRA 1K8KB 3MN5A 1BA0A 1BDGA 3MK6A 2V7YA 4I6MB 2P9NB 3W3DA 1XC3A 4Z94A 2W40A 2BUPA 3GDQA 3SLCA 3GBTA 3FE1A 2W41A 4H5TA 4B1YB 1MA9B 1NGEA 2H3GX 4HWIA 3WUHA 2FXUA 3FZKA 4FWRA 3WEEA 3EKSA 4BRMA 2HMPA 3R8EA 3O80A 2OANA 2NZTA 3AAQA 4CZEA 3L4IA 4CZFA 3LL3A 3AARA 2QWOA 3A5MC 3MMVA 2WUSA 3H6EA 2GUPA 3O1WA 4K42A 1R59O 3O8MA 4BRAA 3FR0A 5JICA 3QBXA 1KAXA 4JD2A 1NGJA 1ZBSA 4DB3A 3ZEUB 3WXIA 3W0LA 1QHAA 2V52B 4ISEA 3SJHA 2VWBA 3WT0A 4DQ8A 1WUAA 3VOVA 3LDPA 4IWVA 1TYQA 4B1ZA 3CETA 3EZWA 4M63C 5JMVA 3VETA 5AQMA 4FOIA 2VYPA 4BVOA 4RTFD 3DJCA 1NLVA 4CD3A 4LC9B 2YHWA 1GLLO 1HX1A 1KAZA 4IXCA 4H0XB 1EQYA 3UE5A 3CQXA 3ZX0A 4BR2A 3WXKA 4FL9A 3ZETA 3HTVA 2P9IA 3R6MA 4QS8A 2GWJA 3EKUA 5AQYA 2YHYA 5KPZA 2CGJA 2J4RA 2Q1NA 2P9KB 5AQQA 5FPDA 4CZJA 2ITMA 2BTFA 3TU5A 4GNIA 1YUWA 4FWPA 2YJEA 4XEIA 4BRHA 5LJWA 4H03B 5BPNA 3U9DA 2EWSA 3QICA 3VGLA 1XQSC 3WXLA 4BRIA 5F2RA 1NWKA 3HZ6A 4FWNA 4B1UB 5AQTA 1QZ5A 2A6AA 4CZMA 2P9LB 5F1XA 1U2VA 3H46O 1GLJO 3WEEB 1U6ZA 3CJAA 4H5RA 4BRQA 4XH5A 2QWLA 5AQZA 5BRFA 5AZIA 3R9PA 3LM9A 5ADXA 4FPAA 3LDNA 4BG8A 3ID8A 2QWMA 3UKUA 5BPMA 4O8KA 2CH5A 2GWKA 2QWRA 4JNEA 5JLFA 2IIRA 4B1VA 3LDQA 3UKRB 5E84A 4C23A 1NGCA 4FWQA 4H0OA 3H3OB 2P9UA 1T44A 3VERA 2D0OA 3FZMA 3KVGA 3RSEB 2FSKA 2V7ZA 4H0TB 4DHYA 2D0PA 1TYQB 3D7EO 4FOEA 4CZKA 1NGBA 1NGIA 3M6GA 1LOTB 1MWMA 2P9PA 3LDLA 3DXKA 2ASOA 1ESVA 3H3NO 1NGGA 3SMSA 2NLXA 1HKCA 2GTDA 4JN4A 4YDUC 4BC3A 4H0VB 5AZJA 1RDWX 2QWQA 3A0IX 3ZETB 2HF4A 1QZ6A 2NRHA 1GLBG 2P9IB 2QWPA 4BRPA 1V4TA 3VEWA 2E1YA 3CJ7A 3I33A 2P9SA 2PAVA 4WQ5A 5F0XA 5KPTA 1MDUB 2ZGZA 4QS7A 4Y0WA 4BRDA 2A41A 3S41A 4IJAA 1RGIA 1X9JA 4FO0A 4GY2B 3WXJA 1G99A 3CIPA 3H45C 5FPNA 3SMPA 3VF6A 4BR5A 4RWTA 1U2VB 2I7NA 2FF6A 1SQKA 5BPLA 2E20A 1BG3A 4BQZA 4CJ7A 5AQJA 3EL2A 5BREA 3J8AA 2HF3A 3UKUB 4BVPA 4M7XA 4A61A 4H0YB 4PL7A 3C7NA 2IVNA 3F9MA 2AP1A 1KAYA 1TUUA 5AQFA 2E2QA 3VEVA 3JS6A 1IG8A 2P9UB 3L6QA 2YJFA 2D4WA 1BWFO 3VGMA 3CI5A 4FWSA 3TPQA 3IMXA 5KPRA 1RFQA 3ATUA 3AAPA 1HKGA 4F9OA 2I7PA 3O5BA 4H5WA 3KHYA 2ASMA 1X3NA 2A5XA 3LM2A 5CE3A 2ASPA 4KBOA 4A62A 4MO4A 3VEOA 4CD1A 4B9QA 3G25A 4K43A 5ADXH 2UYTA 3VESA 4FWLA 1GLFO 2P9PB 1XUPO 2YCHA 4EIAA 3BF3A 3EN9A 3OHRA 2P9NA 2FSNA 2YI1A 1NM1A 5AFUH 1HPMA 4L3QA 1X3MA 1E4FT 1J6ZA 1GLCG 4A2AA 4BG9A 4B1XB 3L0QA 5AQKA 3VENA 5EX5A 2YHXA 3ZX3A 3QFUA 1NGFA 1ATSA 3D2FA 3LDOA 2QW9A 3A5NC 5E26A 5AQXA 3ULEA 1CZAN 4M7YA 1SZ2A 3BP8A 4IZ9A 3DXMA 3U8XA 4WQ4A 3HBTA 3U9ZA 3VF4A 4NO7A 3QMLA 1S22A 3CJBA 4BC4A 2CGLA 2QWNA 3A5OC 4JAXA 1TUYA 4NB4A 1YXQA 4BREA 2PBDA 1S3XA 3U4LA 4E1JA 1HUXA 3WQTA 3QB0A 5JLHA 4JD2B 5KQ8A 3CJ1A 1JCFA 2Q97A 1Q18A 3BF1A 3DAWA 4BRKA 3DWLA 3ZEUA 4CI6A 2E2PA 5EXWA 2ZGYA 4CZHA 4K41A 2F9WA 4EHTA 3MN6A 3BUZB 3FZLA 4BRCA 4A2BA 2GEMA 3I8BA 3FLCO 2IVOA 5BR9A 3C7NB 5BN9A 3FGUA 5BN8A 3O6WA 1BOTO 1H1VA 5TKYA 2E8AA 4BC5A 5EVZA 2F9TA 2Q2RA 2VCPA 4PKIA 3VPZA 4BR4A 4BRFA 3QDKA 1V4SA 1QQNA 1BUPA 5LJVA 4ISFA 5AQHA 4O5FA 3M1FA 1P8ZA 4H5VA 3CJCA 4BRNA 3QBWA 3M3ZA 3VEXA 1GLDG 2P9KA 4CZIA 4ISGA 3GG4A 2Q36A 1YAGA 3ATVA 5BRHA 4CBXA 4BR9A 5AQUA 4BRGA 1ATNA 2E1ZA 5EOYA 1NBWA 1OKJA 1DKGD 1KXPA 4FSVA 2Q31A 1ATRA 1C0GA 2E2NA 1WOQA 3H1VX 3D2EA 2P9LA 4JHDA 4PKHA 4QS9A 2CGKA 1Z05A 2D1KA 1QQMA 4BC2A 3AY9A 3D2FB 1BA1A 1D4XA 4IO8A 5AZIB 3ULEB 2A42A 1HKBA 3ENHA 3DXMB 1DGKN 3WQUA 3FFKB 3GL1A 4BQLA 1HLUA 5FPMA 4BR7A 4MLEA 4WQ5C 5B8HA 3UKRA 3BEXA 4B1WB 1C0FA 4EHUA 4BGBA 5AQIA 3P4IA 4MO5A 1NGHA 1BU6O 1DEJA 3RSEA 3CJ9A 4BR0A 4IJNA 3FZHA 3HM8A 2IVPA 2HOEA 1BO5O 4EFHA 1LCUA 1QQOA 3QFPA 4CZLA 2QXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O1BA 2V51B 4I6MA 4DU4A 3CHWA 3CQYA 4MLHA 1Q9XA 4OPKA 1ZXOA 4FWOA 1GLAG 3KZBA 1J5OA 2F4VK 1Q82O 3VQ8A 3SAHA 4Z4HA 3QIPA 2P9SB 1MWKA 5HRPA 5KQDA 4AM6A 5C25A 5JVHL 2JWLA 4XH1A 4H0PA 1VQKN 5ELZA 4JRPA 3CMEN 3HSCA 5C2DA 4XH4A 2QTDA 1NK8A 4PWDA 4HTUA 3IDHA 3JXUA 4KPYA 3SK3A 1E4GT 1I94K 4JI5K 4H5NA 2XY6A 5GAEP 1SUQA 2E6LA 2E5LK 1RDDA 3VEYA 3TAPA 3OJSA 2VG6A 1N5YA 1N32K 1NGAA 4WQ4C 5AQLA 1ZC6A 3AA2A 1HNZK 3AGRA 3L2QA 4CJVA 4FXDA 2IDOA 1VSIA 3KK2A 3NH2A 1JXEA 1VSHA 1QTMA 1YJWN 3EO3A 2ZF5O 3U3GA 3MN5A 3MX5A 4B08A 5JS1A 1BDGA 1QS4A 4HVJA 2V7YA 3QNNA 3EE9A 2P9NB 3VTHA 4U67L 1OH5A 2A1SA 4DTOA 1IKXA 1VAZA 3FE1A 5C42A 4CEAA 3K5NA 3IRXA 2AJQA 4WF9L 4FWRA 1EETA 4AH9A 1D9FA 2IAJA 3SCXA 2BH1A 4W5TA 4FCYA 4ZTJA 4OO1J 3R8EA 2NZTA 3L2VA 4CZFA 3LL3A 1RNHA 2QWOA 3H6EA 4M42A 2GUPA 1R0AA 1NU0A 1LWFA 1KQSM 4BRAA 3HVTA 1S6QA 1ZBSA 3HO1A 2Q3SA 3WXIA 3V9UA 1TL3A 3OJUA 1U47A 3IS9A 4ISEA 3WT0A 3VOVA 2WONA 3K59A 1TYQA 4DTRA 4M63C 4CF0A 4CGJA 1ZBUA 4A57A 2VYPA 4BVOA 4RTFD 3DJCA 1NLVA 5GAGP 4CD3A 3OYMA 3ZT4A 5IT9O 1KAZA 3CCEN 1VSEA 4CGFA 5HROA 3OTOK 3F73A 4GV9A 4FYDA 4CJUA 3OYBA 2P9IA 2GWJA 5AQYA 3TARA 4M41A 4Y1CA 2ITMA 2BTFA 3I0SA 4YNQA 3TU5A 1TV6A 4XEIA 2YKMA 4DU3A 3P31A 3LWMA 2DFHA 3QO9A 5BPNA 4GW6A 4A5AA 3MEDA 4OPAA 4BRIA 3VN5A 2G8VA 3DOLA 3V81A 3DRRA 1O1WA 2G8FA 3BZCA 3THYB 4FZXC 1U6ZA 3CJAA 3E9PA 2QWLA 5AZIA 4DV7K 1C1BA 2Z1IA 3ID8A 3VTIA 1RBRA 1YJ9N 1K9MO 4B9SA 4JRQA 5C10A 3LP3A 4KH5A 4MFBA 2GBZA 3LDQA 3UKRB 4C23A 2NNWA 2HHSA 4N76A 4LH5A 1T44A 3R3LA 3KLHA 4CGGA 3LZJA 2D0OA 2HHQA 3KVGA 3RSEB 4JKAA 1NOYA 4H0TB 3T19A 5DK5A 1P90A 3WNEA 3D7EO 5CY4A 4W5RA 2PY5A 4DS5A 3OY9A 4FOEA 4DV3K 3BDPA 4JKEA 5FROA 3QLHA 1LOTB 3AGKA 2P9PA 3HL8A 4IFYA 3H3NO 3SMSA 3NAEA 4NYNA 2EX3A 2IGIA 4A59A 1RDWX 3KWIA 3NH1A 3RMCA 2KFNA 3E9OA 4E3SA 1GLBG 3SI6A 5CZ1A 1V4TA 2E1YA 4KB0A 1YTUA 2VWJA 1Q8IA 2Y1JA 4KHPK 5MLCQ 5F0XA 1JLQA 3CCJN 4DR7K 1A5WA 4Y0WA 3PIPL 3KLIA 4H4MA 3DLHA 3SMPA 5DMRA 3J7YP 3NF6A 2F8SA 4FZYA 4F8RA 4I2QA 2W6LA 1U49A 1EKEA 1BG3A 4BQZA 1L3VA 4NCAA 4YORA 2HF3A 5KRTA 4A61A 2DFEA 4H0YB 4UY8O 1NKBA 4YOTA 5AQFA 3RMAA 4KRFA 3VQBA 1IG8A 2P9UB 1FJGK 3E1YA 3LP2A 3CI5A 3IMXA 1RFQA 2YHAA 4PY5A 2X6SA 4RG8A 3O5BA 4CHYA 1IV0A 1BL3A 4I9QA 1WSFA 4CJ4A 4FLZA 2A5XA 1KVBA 4KBOA 2PFUA 1S9GA 4OLAA 2OYQA 2UUBK 2X78A 3O3FA 4K43A 3HOSA 4FJIA 2NRZA 4FWLA 4NCBA 1UWBA 2YCHA 3EN9A 4I2PA 1RT1A 5GIOA 3AVBA 4AHCA 2YI1A 4YOUA 2EHGA 4NYFA 4A5BA 1X3MA 4YFUA 1J6ZA 1X9SA 4B1XB 1BI4B 4OVLA 4FK4A 3MX2A 5M1PA 1KFSA 3SUPA 1E3MA 2YHXA 4JI6K 3QFUA 1NGFA 4DQPA 5E26A 3DYAA 5KTQA 3ENBA 5HP1A 3C6AA 4WQ4A 3SPYA 3U9ZA 1RBTA 3OYCA 1S22A 4DFKA 4FM1A 1HYSA 1EWQA 3AO1A 4DQRA 4BREA 2QXFA 1IH7A 4FM0A 5KQ8A 3CJ1A 2Q97A 1Q18A 3DAWA 1HYZA 3DWLA 3SAGA 1NKCA 2ZGYA 3THWB 1C0TA 2F9WA 3ZCMA 3OYIA 3BUZB 4BE1A 4BRCA 1C1AA 2GEMA 3I8BA 5BR9A 4DV1K 1GOBA 4KTZA 1A5XA 1CXUA 3FGUA 3OYKA 3SJJA 5BN8A 4HCBA 3U3YA 3F9KA 3MECA 1QSYA 4M3RA 2FBVA 3S9HA 2YNFA 4CEDA 3DI6A 2HHWA 4GKKK 3TSPA 3QDKA 1V4SA 4OGCA 4HUEA 1BUPA 4DV6K 2Y1IA 2ZJRL 3P1GA 1SL1A 3CJCA 4Y1DA 1GLDG 5SWMA 4ISGA 4FLYA 5HRRA 4ILHA 5BRHA 1JLCA 2W6KA 4CBXA 2OCEA 3OYDA 2G8IA 4BRGA 4LY7A 1RT4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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