The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
28
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HHH K; 3T1Y K; 4NXM K; 2UXC K; 1N36 K; 1HNX K; 4GKK K; 4JI1 K; 2VQF K; 2UUC K; 4B3T K; 4LF7 K; 4YY3 K; 1XMO K; 1N32 K; 4JYA K; 4DV7 K; 4DR7 K; 5A2Q O; 4DV4 K; 1I94 K; 4YHH K; 4DR6 K; 2UUB K; 1HR0 K; 4OX9 K; 5LMU K; 3J80 O; 3J7A P; 2F4V K; 4B3R K; 5LL6 Z; 4DR4 K; 1XMQ K; 4DR2 K; 4LF9 K; 4X65 K; 2ZM6 K; 4X66 K; 1N33 K; 2UUA K; 4LFB K; 4JI4 K; 4GKJ K; 1IBK K; 2VQE K; 4LF5 K; 3OTO K; 4DV6 K; 4B3M K; 1HNZ K; 4AQY K; 4JI2 K; 5BR8 K; 1XNQ K; 1IBL K; 2E5L K; 4DR5 K; 4K0K K; 4JI3 K; 4LF4 K; 4JV5 K; 4JI8 K; 3J81 O; 4DV3 K; 1J5E K; 2UXB K; 1XNR K; 4DV5 K; 5IWA K; 4DV1 K; 5AJ3 K; 5FLX O; 4B3S K; 4CVN E; 4DUZ K; 4KHP K; 4LF8 K; 5IT9 O; 4CW7 B; 4JI6 K; 5LMN K; 4LFC K; 4JI7 K; 1HNW K; 4DUY K; 4DR3 K; 3T1H K; 4X64 K; 4LF6 K; 2UU9 K; 1FJG K; 4DV2 K; 4X62 K; 4JI0 K; 3J7Y P; 4DV0 K; 4JI5 K; 2UXD K; 4V19 S; 1IBM K; 4LFA K; 3JAM O; 1N34 K; 4NXN K; 4DR1 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HHH K; 2YJF A; 3AVF A; 2P1J A; 3O3G A; 2GUI A; 5M1Q A; 4YY3 K; 3S9H A; 3A5O C; 4JD2 A; 3SQ2 A; 4BWM A; 1ZXO A; 4YNQ A; 4IOX A; 2E2O A; 3ULE B; 1C1A A; 5BR9 A; 3D0P A; 3MWT A; 3TPQ A; 4R79 A; 3WXM B; 1YUW A; 3P5J A; 4IO9 L; 3V4I A; 5KPT A; 3D45 A; 1YF5 L; 4CBX A; 2XO7 A; 5LMU K; 1Q8I A; 1NOY A; 2V7Y A; 4DTO A; 4EP5 A; 3CJ7 A; 1XI1 A; 4LF9 K; 3SJH A; 3RRH A; 1HNI A; 3HPO A; 2P9U A; 1D4X A; 3FFK B; 3CCQ N; 4RW8 A; 3CJA A; 1VAZ A; 2BDP A; 4FJ9 A; 3VQD A; 4F4K A; 2ASP A; 2Y1I A; 3OTO K; 1M90 O; 3CCM N; 4CJK A; 5M1O A; 1JLF A; 4FJI A; 1K6Y A; 4B9L A; 2VCP A; 4H0X B; 4JI8 K; 1SZ2 A; 4AHV A; 4JKA A; 4FVM A; 2IIR A; 3T69 A; 3M5R A; 4DV1 K; 1RTH A; 3H45 C; 4HCB A; 1QS4 A; 4BR2 A; 3OS2 A; 3V9S A; 2A1R A; 3WT0 A; 5KGX A; 4W5T A; 2O8B A; 3QEX A; 3LAN A; 3O9U A; 2A40 A; 1XC9 A; 2F96 A; 4JHD B; 2FLO A; 1S9E A; 1WB9 A; 4KTW A; 3CXC M; 1DEJ A; 3HK2 A; 2W6K A; 4AHU A; 1I3A A; 3VEV A; 4A5A A; 4J2A A; 4NYF A; 5LJV A; 5DK5 A; 5M1P A; 1VQN N; 2QWM A; 4IFY A; 1ZBU A; 2RE2 A; 3E66 A; 3QIP A; 4WQ5 C; 3OYC A; 3OY9 A; 5HL7 L; 3ZT1 A; 3QLH A; 1BL3 A; 4CZH A; 4HWI A; 4NXM K; 4FLZ A; 4Z4C A; 5GAG P; 2F8S A; 4FM0 A; 3ZSY A; 1NBW A; 2KFN A; 1NJY A; 3DLH A; 2WBN A; 4CD1 A; 3ZX2 A; 4M3R A; 4DR7 K; 3W3D A; 3KLH A; 3KIO A; 1VQ7 N; 2E6L A; 4CF0 A; 1NKC A; 1QSL A; 2DFF A; 3QET A; 1HRH A; 4RWT A; 4JKC A; 2YHX A; 3CMA N; 4DLE A; 5KI6 A; 4DQQ A; 4F3O A; 2F7T A; 1VSL A; 3UKR B; 2FF6 A; 3ZX3 A; 4B1Z A; 4UQG A; 3CFP A; 3VTI A; 2YKN A; 5CHI A; 2OZM A; 1XHZ A; 4ELU A; 4KHU A; 4DR4 K; 3THW B; 1VRU A; 3AO2 A; 3P38 A; 4FPA A; 3W0L A; 3QES A; 2I7N A; 4PL8 A; 5AQV A; 1N33 K; 3NGZ A; 3EE8 A; 3L2W A; 4R5P A; 1LWF A; 2ZJQ L; 3VQ9 A; 2VGN A; 4FOI A; 2E6M A; 1MWK A; 2O8F B; 3CPW M; 4WQ4 C; 2Q0R A; 1M1K O; 4DB3 A; 1ESV A; 1D9F A; 1GLJ O; 3JSM A; 1KVB A; 3BZK A; 3K5M A; 4FO0 A; 1BI4 A; 4CD3 A; 4M45 A; 4OJR A; 4KI6 A; 3LWM A; 3DXM A; 5IT9 O; 3AVJ A; 4H0P A; 3L2U A; 4H5T A; 5KPZ A; 4W5Q A; 4O5F A; 2QWL A; 5C15 A; 3TAE A; 4L8R B; 3DOL A; 3SAF A; 3NH1 A; 1QVF M; 1YAG A; 4I7F A; 5FRN A; 1NJX A; 4Z4I A; 1NGF A; 5SZT A; 2GX9 A; 3OYA A; 2P9L B; 4Q0B A; 4ELT A; 1VSK A; 4NB4 A; 4YOY A; 4B9Q A; 5FPE A; 3CD6 N; 4ID5 A; 3THV A; 4CZK A; 2ETJ A; 1N36 K; 1VHX A; 2EHG A; 3HZ6 A; 1R0A A; 3TU5 A; 3HI0 A; 1ATR A; 4W5N A; 1HPM A; 1SUQ A; 3HT3 A; 3O3F A; 4BRL A; 1C0U A; 2AA4 A; 1QSS A; 3SPY A; 4AHT A; 3EKS A; 4DG1 A; 4JD2 B; 3I0R A; 2WOM A; 1LAW A; 2HBM A; 3TAB A; 3VQP A; 3OBY A; 4I2P A; 4YOV A; 3SK3 A; 3K59 A; 4K41 A; 3MXM A; 4FJ8 A; 1ZBF A; 1D8Y A; 1KSP A; 2ZE2 A; 3E9O A; 2A41 A; 3L3U A; 3VQ8 A; 4GW6 A; 1RTJ A; 3VEN A; 4BRF A; 1RT6 A; 4KRE A; 4FJ7 A; 1DTT A; 1NGE A; 3CF5 L; 4CGH A; 1WSE A; 1KD1 O; 4DR2 K; 3CG7 A; 4FJK A; 4X65 K; 1BU6 O; 4DFJ A; 1K8K A; 3L4Q A; 3F9K A; 4CZI A; 1J5O A; 4DQP A; 4N5S A; 4N47 A; 1O1W A; 3AAP A; 4BRA A; 1VQK N; 2P9U B; 2VQE K; 3NF9 A; 4LF5 K; 1GLC G; 3CQX A; 5TKW A; 4DSE A; 4BGB A; 4LH5 A; 4IG0 A; 2BH1 A; 4OPJ A; 2LSN A; 2Q97 A; 5E26 A; 4M7X A; 4JV5 K; 3L6Q A; 3AVB A; 3K9K A; 5AQZ A; 4NCB A; 3LP2 A; 4BRK A; 2OTJ N; 2GEL A; 5KGW A; 2PY5 A; 1VSE A; 1VSF A; 2NUB A; 4ILH A; 3I8D A; 2JWL A; 1TKT A; 2Z1I A; 3VOV A; 5C2D A; 3F73 A; 1P8Z A; 2PYL A; 1CZ9 A; 3VET A; 4E89 A; 4JI6 K; 4WQ5 A; 1ITG A; 2VYP A; 4DMN A; 4JI7 K; 3OYB A; 1NGB A; 2QI2 A; 2ZGZ A; 3H3N O; 3O8M A; 1YI2 N; 4C8L A; 4ZHR A; 3CHW A; 1NWK A; 4JI0 K; 1S1T A; 5F1X A; 3NDK A; 4M3W A; 3NF7 A; 1BQM A; 3DRR A; 4K8Z A; 3TSQ A; 4RG8 A; 4JNE A; 5CZ2 A; 4F2S A; 3AVA A; 3O4W A; 4BC4 A; 1SAZ A; 2GWK A; 3OYF A; 1HYZ A; 2O8E A; 3LDL A; 4GKK K; 2YNF A; 2VQF K; 2D4W A; 5HOO A; 2E2Q A; 1KC8 O; 2NRX A; 3OYJ A; 5FDL A; 2RF2 A; 2VWB A; 5M1K A; 3LP1 A; 5A2Q O; 5GIN A; 4DTP A; 2IAJ A; 3KLF A; 1W0H A; 2IVP A; 2E8A A; 4DFK A; 3SCX A; 4YOT A; 1CXU A; 1RDC A; 2RHK A; 3VQ4 A; 4CI6 A; 3OS0 A; 4OX9 K; 5HP1 A; 4Y1D A; 1NU0 A; 5CR4 A; 1G15 A; 3LWL A; 3WQT A; 3Q7C A; 4IOC L; 5C2F A; 1MWM A; 1HLU A; 1ATN A; 3LAK A; 5KTQ A; 3AVN A; 1SKR A; 1VSD A; 4B9N A; 5J2M A; 2QXF A; 2F9W A; 3QNN A; 3ZSX A; 3UIQ A; 4FWR A; 4F2R A; 3KK3 A; 1EET A; 1WAF A; 5HLF A; 4C8K A; 2HW3 A; 4ICL A; 5JLH A; 3U8X A; 3MEE A; 2E2N A; 4YOW A; 4CER A; 5EX5 A; 4E7H A; 1UA0 A; 2FSN A; 1TVR A; 3CJ1 A; 2Q1N A; 1O13 A; 3K0S A; 4LF4 K; 1T6C A; 1JLA A; 4J2E A; 2I5J A; 3CYM A; 4YDU A; 1C1C A; 4H5V A; 3VA3 A; 5M1F A; 3H1V X; 3AV9 A; 5AQX A; 5KRS A; 4A61 A; 4L3Q A; 1B9D A; 1T03 A; 4BRQ A; 1L3U A; 4KV8 A; 4OKE A; 3DM2 A; 4H0T B; 1BI4 B; 4OKK A; 4Z0U A; 5AQP A; 5AJ3 K; 3HJF A; 1TGO A; 4DSF A; 1KAY A; 4BR0 A; 3BZC A; 3M8S A; 3DXM B; 4WE1 A; 1A5V A; 5HRR A; 3NCI A; 1GLF O; 3CC7 N; 3ZT4 A; 2HST A; 2UU9 K; 4CHQ A; 1HQE A; 2VGM A; 3OJS A; 3J7Y P; 4HTU A; 2HMP A; 2UXD K; 1NK5 A; 1RDU A; 3R3L A; 1IG9 A; 3O6W A; 4NXN K; 4MO4 A; 4FVU A; 4BC2 A; 4F9O A; 1NGD A; 2HBJ A; 3C6A A; 4CFD A; 5AZI A; 4JS5 A; 1CLQ A; 2HNZ A; 5BRF A; 2ZQB A; 4KHW A; 2NRV A; 1LW0 A; 1YTU A; 4BRC A; 5GAE P; 4E7J A; 1H1V A; 4BDZ A; 2QKB A; 3G10 A; 1KFS A; 3EE9 A; 4FLT A; 4CJ5 A; 3FGU A; 3U9D A; 2Z1H A; 3J7Z O; 3E9L A; 4PQU A; 5FPD A; 1Z05 A; 1JLB A; 2CGJ A; 3HOS A; 3J7A P; 4H0V B; 3K2P A; 3UKU A; 1S1W A; 4FYD A; 4CEA A; 3VGL A; 4WCE L; 4CJU A; 3G71 N; 1X3M A; 2X6S A; 3VEW A; 1QQM A; 2A5X A; 1RBT A; 4KH6 A; 4FWO A; 4M42 A; 2E4L A; 3ZEU A; 4C1N K; 2RN2 A; 5BN8 A; 3OVN A; 4FM2 A; 1TK0 A; 1K8K B; 3M8Q A; 1YJN N; 4A2A A; 1VSI A; 3IFR A; 4Z94 A; 3IS9 A; 4PKI A; 4KHS A; 4M3T A; 3SBT A; 4HVJ A; 4IZ9 A; 3NF8 A; 1L5U A; 2BAN A; 3AA5 X; 3BF1 A; 3CCS N; 4DS5 A; 3C6H A; 4M63 C; 3DAW A; 4HUE A; 4KRF A; 3CCL N; 3UB5 A; 4LD0 A; 1X9J A; 1RBV A; 2NRW A; 3TAG A; 1RT4 A; 2KTQ A; 2HHW A; 4XIU A; 1TUY A; 4CF2 A; 3NH2 A; 4KB0 A; 4NYN A; 4CVN E; 3SQ4 A; 1D5A A; 3MN9 A; 4CW7 B; 3O9Q A; 4N56 A; 1ASW A; 4CJT A; 1GOC A; 4E1J A; 4CGJ A; 1SS6 A; 4FSV A; 3NVK A; 4KHQ A; 4PY5 A; 3BEX A; 4CGI A; 4FWP A; 1Q9Y A; 3VQ5 A; 1NJW A; 1L3T A; 2F8T A; 2Z1J A; 1NK4 A; 4KPY A; 4DV0 K; 3LZJ A; 4O55 A; 3ZT0 A; 4EFH A; 2E88 A; 4M41 A; 3O1W A; 2D0A A; 3ISN C; 3VQQ A; 3WXL A; 3HPG A; 4CE9 A; 1WBD A; 1VK0 A; 3V1O A; 3SI6 A; 1WN7 A; 1OH5 A; 3SUN A; 1WNS A; 2YCH A; 4GV9 A; 4JI1 K; 4PHT X; 1K73 O; 2FC0 A; 4LF7 K; 2O8E B; 2NLX A; 3BY5 A; 3TI0 A; 2BGG A; 4IG3 A; 3P1G A; 2G8U A; 3GBT A; 4YOU A; 4B9S A; 1UWB A; 1JLE A; 3EYZ A; 4Z4E A; 3NGI A; 1ATS A; 4EHU A; 4B3O A; 3OS1 A; 3RSE A; 3OW2 M; 1SL0 A; 4CHN A; 2ATQ A; 3ENB A; 2OA8 A; 1ASV A; 3FR0 A; 5AQI A; 1FK9 A; 5LY3 A; 1EO1 A; 4EZ9 A; 3D7E O; 3OYI A; 4K42 A; 4DTM A; 4LH4 A; 1KRP A; 3QDK A; 1V4S A; 4DTX A; 4FK2 A; 1ZBS A; 4A62 A; 1K9M O; 2E2P A; 1CZA N; 2QM1 A; 5BRE A; 4IFE A; 5HRP A; 1JL2 A; 3AGK A; 4CEB A; 4KAZ A; 3PV8 A; 1IBK K; 4HUG A; 4XH5 A; 3OA9 A; 5AQO A; 4KTQ A; 2O4G A; 4JKE A; 3ZSW A; 3D2E A; 2HHU A; 5AR0 A; 4JI3 K; 4B9U A; 3CQ8 A; 3THY A; 3GG4 A; 3U6F A; 3ENH A; 3QEW A; 1YIT N; 1RT2 A; 1KQS M; 1ZBH A; 4KHP K; 1IJJ A; 2ZF5 O; 1U4B A; 4N76 A; 3ASM A; 1IV0 A; 4C1N I; 2PZS A; 5FPN A; 5FRO A; 4O5B A; 3WXK A; 5GIO A; 5LMN K; 4NLC A; 3IMX A; 3SUO A; 1U6Z A; 5F2R A; 2XY8 A; 3HSC A; 4ILJ A; 1B9F A; 1QE1 A; 4H0O A; 2QKK A; 4FWN A; 4E3S A; 4QS7 A; 2IVN A; 3AO3 A; 1HJO A; 5JIC A; 4DQS A; 4W5R A; 2IDO A; 2HHQ A; 5ELZ A; 3JAM O; 3KK2 A; 3HST B; 1BA0 A; 5AQL A; 1LOT B; 4BC3 A; 2YKM A; 3PIO L; 2D0P A; 1KLN A; 4FJ5 A; 3NAE A; 3T1A A; 1NGA A; 1QHA A; 3AVM A; 2OAN A; 1C0M A; 4JYA K; 2GEM A; 3UE5 A; 5AQT A; 3SNN A; 3AA4 A; 5AZI B; 4DV7 K; 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2IVO A; 4H8K A; 4DR1 K; 1NGH A; 1REV A; 3WNH A; 3ALY A; 1RBS A; 3QIO A; 1RT1 A; 4OKJ A; 4YDU C; 1YTA A; 2FBV A; 3DRP A; 2YNI A; 4FW1 A; 2OPQ A; 1IKV A; 4QS8 A; 1GLL O; 1GLD G; 2YHW A; 3IG1 A; 5AZJ A; 5GIP A; 3OJU A; 3CCR N; 3TSU A; 2YX6 A; 3AVL A; 3OYM A; 1FXX A; 3MEG A; 5EVZ A; 5FPM A; 3AA3 A; 3QEP A; 3V1R A; 3CC4 N; 3V6D A; 3RSE B; 3RMD A; 1V4T A; 5JMV A; 4FWS A; 3L4I A; 1GOA A; 1Y64 A; 1FKP A; 3T3F A; 1YVN A; 5H1S Q; 2O4I A; 1HKB A; 4BRH A; 1VQ6 N; 1WSF A; 2JGU A; 3AGR A; 1BCM A; 2Z1G A; 3WNE A; 3VF2 A; 4I9Q A; 4JI4 K; 3CME N; 3SQ1 A; 2A6A A; 4DCH A; 3L0Q A; 4BRN A; 4PKH A; 4CIF A; 2GV9 A; 4JK8 A; 3O1B A; 2YI1 A; 4BRG A; 1QHT A; 4DR5 K; 4DF4 A; 5JVG L; 1IO2 A; 1U45 A; 1BIU A; 3I8B A; 4FWM A; 2B4J A; 3D2E B; 4IFV A; 4FK0 A; 2D0C A; 2XY6 A; 3THY B; 4FJL A; 3WQU A; 3CM6 A; 3TTD A; 3ZYY X; 3WNG A; 1SL2 A; 5HRN A; 3CFR A; 2HB5 A; 2NRH A; 3TWH A; 1WSG A; 4JK9 A; 1TYQ A; 3B8A X; 4CEZ A; 4U67 L; 1J9A A; 3SUP A; 4BRE A; 3J8A A; 4I2Q A; 5AQQ A; 3I33 A; 5M1N A; 5CE3 A; 1SKS A; 4GV6 A; 1HQU A; 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