The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule keywords |
16S rRNA
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| total genus |
28
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5BR8 K; 2UUC K; 4KHP K; 4LF4 K; 4DV3 K; 4DUZ K; 4X66 K; 4LF6 K; 4DV7 K; 4DV2 K; 4AQY K; 4JI7 K; 1N36 K; 2ZM6 K; 1XMO K; 4DR3 K; 1N33 K; 2UXD K; 2UU9 K; 4LFA K; 5FLX O; 4V19 S; 1I94 K; 4B3S K; 4DV6 K; 4YY3 K; 4JYA K; 4X62 K; 2HHH K; 1HR0 K; 1FJG K; 3J7Y P; 4JI5 K; 4JI2 K; 1IBM K; 4DUY K; 2E5L K; 4JI4 K; 5IT9 O; 4DR4 K; 4LF8 K; 5AJ3 K; 4GKJ K; 1HNW K; 3JAM O; 3J80 O; 4NXN K; 1N34 K; 4DV5 K; 4DV1 K; 4LF9 K; 4K0K K; 1HNZ K; 4NXM K; 4JV5 K; 1N32 K; 5LMU K; 1XNQ K; 1XNR K; 5A2Q O; 3OTO K; 4LFC K; 4DR6 K; 4JI8 K; 4DV0 K; 2VQF K; 1J5E K; 4JI3 K; 4DR7 K; 4JI0 K; 4GKK K; 3T1H K; 1HNX K; 1IBK K; 4DV4 K; 4JI1 K; 2UUA K; 4LF5 K; 5LMN K; 4DR5 K; 4LF7 K; 4CVN E; 4DR2 K; 4B3R K; 2UXB K; 1XMQ K; 4X65 K; 1IBL K; 2F4V K; 5LL6 Z; 4DR1 K; 4B3M K; 4LFB K; 5IWA K; 2UUB K; 2UXC K; 3J7A P; 3J81 O; 4X64 K; 3T1Y K; 4YHH K; 4OX9 K; 4CW7 B; 4JI6 K; 4B3T K; 2VQE K; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ4 N; 1RTJ A; 2P9S A; 4DUZ K; 2QWQ A; 4B8C A; 3TTC A; 1RIL A; 3BUZ B; 3NH1 A; 3NGI A; 3K5L A; 3NCI A; 2D0B A; 4LC9 B; 3BF1 A; 2XY6 A; 4U67 L; 2Q97 A; 1T03 A; 3OYF A; 4M7X A; 5FLX O; 3HPG A; 4DTX A; 4R5P A; 4GV9 A; 4M3U A; 3KD1 E; 4A61 A; 3CD6 N; 3SQ4 A; 4N56 A; 4CJE A; 1CZB A; 1HLU A; 3TSU A; 1GLF O; 3NGZ A; 4E0D A; 4K42 A; 1HQE A; 2P9I A; 4JKD A; 3FLC O; 4M3R A; 4ZTF A; 4B08 A; 2RN2 A; 1IV0 A; 1U2V B; 3TTD A; 4DTM A; 5AJ3 K; 2V52 B; 1YUW A; 4H8K A; 1TUY A; 4IZ9 A; 4ELU A; 1P8Z A; 3QFU A; 4BE2 A; 3A5M C; 1U6Z A; 3LZI A; 4EP5 A; 3VQ5 A; 1NKC A; 3V9U A; 1FK9 A; 4LF9 K; 1E4F T; 1VQ9 N; 4RG8 A; 2A1R A; 3VER A; 4J2E A; 4PKH A; 4FL9 A; 4KFB A; 5AQS A; 5C12 A; 1XQS C; 4O8U A; 1RDB A; 3T1H K; 3TAP A; 4DTR A; 1HNX K; 1NMN A; 2HBJ A; 3AVF A; 1VRT A; 4DFP A; 4PKI A; 3AY9 A; 5SZT A; 5JS1 A; 4CK3 A; 1KFS A; 4DF8 A; 3KK2 A; 4MO4 A; 2A42 A; 1HKG A; 3TAR A; 1U47 A; 1NBW A; 2EHG A; 1HPM A; 4I2P A; 4BVO A; 3DXK B; 3VQB A; 3D2E A; 3LL3 A; 3DAW A; 1X9M A; 4H0O A; 1C0F A; 3M3Z A; 4H0V B; 3OYJ A; 3VEV A; 2CH5 A; 2P9K A; 5TKW A; 1KRP A; 4X64 K; 4OGC A; 1YXQ A; 3SYZ A; 1ZBS A; 1L5U A; 1NJY A; 2E2O A; 4CJU A; 3DLE A; 4OPJ A; 1SL1 A; 5AR0 A; 2HHT A; 4DV3 K; 2G8K A; 3FZH A; 4H5T A; 3HVR A; 4B9T A; 1ZXO A; 4AQY K; 3VET A; 3D0P A; 4M3T A; 2G8I A; 3H1V X; 1YJW N; 1QVF M; 1SKS A; 2W42 A; 5C25 A; 2QK9 A; 4NLB A; 2ZD1 A; 5EX5 A; 3CHW A; 3CER A; 2ZGY A; 3DRS A; 3CXC M; 4FPB A; 4JHD A; 2O8D B; 3CFR A; 4W5N A; 4FLV A; 3RTV A; 4CZE A; 4B1Z A; 4W5R A; 3M1F A; 1K8K B; 1NG9 A; 1S6P A; 4JK7 A; 3R3L A; 2KFZ A; 4GNI A; 4CF9 A; 4NYF A; 1VSE A; 2OCE A; 3I8B A; 4HUG A; 1ATN A; 4BRN A; 3PV8 A; 3DOK A; 4QAG A; 3KTQ A; 2PAV A; 4MQ3 A; 3SLC A; 1XNR K; 4WQ5 A; 1BQN A; 3ZET A; 1VSJ A; 3OJU A; 1NGA A; 2NRV A; 5AQU A; 4GKK K; 3OJS A; 4LY7 A; 4DFJ A; 2F7T A; 1K9M O; 3D2F B; 3CMA N; 2FBY A; 2FBV A; 1RDA A; 1U2V A; 4B9V A; 4OKE A; 1LAW A; 3HTV A; 2D0P A; 4HUE A; 2JLE A; 3Q7C A; 4CVN E; 3CJ7 A; 4FJ8 A; 2QWO A; 2VWK A; 4RTF D; 1D9F A; 3ZEU B; 2RE2 A; 3EY1 A; 2A41 A; 4LH5 A; 3VQ7 A; 2F4V K; 2YV0 X; 3S9H A; 2Y1I A; 1RDW X; 1MA9 B; 3VA0 A; 3THW B; 1NGC A; 5DM6 L; 3ITH A; 3SQ0 A; 3HST B; 5AQQ A; 1Y64 A; 3JSM A; 3QB0 A; 2VG7 A; 4M45 A; 3VQ8 A; 1ESV A; 1EQY A; 4JS4 A; 3C7N B; 4C1N K; 1SL2 A; 3E66 A; 3NF8 A; 2KLA A; 3DXK A; 3EE9 A; 5C0Y A; 3QLH A; 4N76 A; 1N36 K; 3DXM A; 1O1W A; 3VEW A; 4BDP A; 2KHO A; 4FPA A; 4CHQ A; 2QW9 A; 3CQ8 A; 4FLZ A; 1HX1 A; 3ZX0 A; 4AF1 A; 4Y1D A; 2YI1 A; 4X62 K; 3AVK A; 1RDU A; 3QIO A; 2V51 B; 4DQS A; 3E1Y A; 5LJW A; 4CEB A; 1VSH A; 1GLC G; 1K8A O; 3OY9 A; 2QXL A; 2JWK A; 4KHQ A; 4CHY A; 3N4Q A; 3L6Q A; 3OYN A; 5KTQ A; 2XY5 A; 1SAZ A; 3G25 A; 2YCH A; 4FZX C; 3E9L A; 1C6V A; 4JKC A; 3TAB A; 4H5R A; 1HNZ K; 4O5F A; 1QHA A; 2YNG A; 4JV5 K; 4N41 A; 4CF0 A; 5ELZ A; 4CE9 A; 2YNI A; 4CZM A; 2VCP A; 2O8C B; 5EU7 A; 3VEX A; 4IFV A; 4CEF A; 1DGK N; 2VQF K; 5AQX A; 3MXJ A; 4DR7 K; 4WYB A; 3G71 N; 4CJ5 A; 4O4G A; 4PL8 A; 4RW6 A; 5FRO A; 5M1F A; 5M1N A; 1K8K A; 4FYD A; 3R9P A; 3NH2 A; 3CM6 A; 4DV4 K; 1DTQ A; 1HNI A; 2IVP A; 3R8E A; 4WE1 A; 4AH9 A; 3CCV N; 1R59 O; 3MMV A; 4DR5 K; 2IGI A; 4FJM A; 4DR2 K; 3B8A X; 3SMS A; 1ATS A; 3V9W A; 5BRF A; 3HL8 A; 2QKK A; 4BQZ A; 4X65 K; 4WFB L; 4TSX A; 1B92 A; 1NGD A; 4CBW A; 1RT5 A; 3VEY A; 3FFK B; 1TVR A; 3NF6 A; 3QDK A; 1HYV A; 2CGJ A; 3D2F A; 4DTS A; 2AJQ A; 1MU2 A; 4KHP K; 4IKF A; 4B9M A; 4DTN A; 1UOC A; 4CIF A; 4JKA A; 1L3S A; 3PLA A; 3TAQ A; 5HLF A; 1J5O A; 3ZEU A; 3DLB A; 1MWK A; 3RSE A; 2HVI A; 3MWP A; 4RW9 A; 4NCB A; 1U45 A; 4FJG A; 3THW A; 3F2K A; 4CCH A; 4DS5 A; 1LW2 A; 2E4L A; 1S1X A; 2DY4 A; 4BRF A; 3OYB A; 4CED A; 4E89 A; 4DFK A; 1KAX A; 3C7N A; 2P9N B; 4CES A; 2Q3S A; 1RT4 A; 3PX4 A; 4LF8 K; 4Z4F A; 3WNE A; 1VQO N; 4PKG A; 1J6Z A; 3CYM A; 1VQ8 N; 2OA8 A; 4HTL A; 1VAZ A; 4Z4I A; 2WBN A; 4PWD A; 5KRT A; 4HCC A; 4OLA A; 3QES A; 1M90 O; 4CHN A; 2P5O A; 3OS1 A; 2W41 A; 4GV3 A; 4ISF A; 1JCE A; 5KGX A; 4JEP A; 2PFU A; 1WBB A; 4CZL A; 2DTU A; 1BDG A; 4FJI A; 4JKF A; 5F1X A; 1VSF A; 2OZM A; 4QS9 A; 5LY3 A; 4DF4 A; 2ZQB A; 3S3O A; 1IBK K; 3KD5 E; 2RF2 A; 2H3G X; 4CIE A; 2OTJ N; 3L3U A; 4O8K A; 1BA1 A; 4FCY A; 5AQK A; 3DLR A; 2HHQ A; 4MDB A; 4CEZ A; 1QSY A; 3WEE A; 4FJX A; 3DLL L; 4GY2 B; 1T6D A; 1TK0 A; 4BGB A; 1Q9X A; 3CET A; 5BRE A; 3SUO A; 4W5T A; 3KIO A; 3CJA A; 2WUS A; 5CY4 A; 2UXC K; 3VA3 A; 1S1W A; 2NUB A; 1BU6 O; 4EIA A; 1OH7 A; 4M42 A; 2D0A A; 3SUQ A; 3OYK A; 3SUP A; 5C15 A; 3V4I A; 5TKY A; 2KZZ A; 3KKR A; 5BRD A; 1G99 A; 4CZF A; 1CLQ A; 4NB4 A; 4CEE A; 3I56 N; 1C0T A; 2VYP A; 1NWK A; 5BPL A; 4DV7 K; 3ZSW A; 3O1W A; 2QWR A; 1X3M A; 3K2P A; 5J2M A; 1TAQ A; 4KI6 A; 4FJL A; 1ZBU A; 4KHW A; 4DR3 K; 3LP3 A; 2HHV A; 3DOL A; 2BAN A; 4GMJ B; 4CGD A; 1L3V A; 4ICL A; 2HHH K; 4M3Y A; 2LSN A; 3ATV A; 1CZ9 A; 3EO3 A; 5AQF A; 4DUY K; 3IDH A; 4BRE A; 3PX6 A; 2E5L K; 2HBM A; 4E1J A; 3TAF A; 4B9Q A; 4NCA A; 3V81 A; 4H0X B; 4ID5 A; 3CG7 A; 5AQG A; 4YOR A; 3AA5 X; 4NXN K; 4BRK A; 1Z05 A; 2FLO A; 3L2U A; 3BDP A; 5M1P A; 4DTU A; 3QEI A; 3S3N A; 2I7N A; 1WSG A; 4IXC A; 2J4R A; 3WXK A; 2FBT A; 5AQW A; 2P9N A; 2IS3 A; 3VQE A; 1U49 A; 3KWG A; 1X1P A; 4CK1 A; 4K41 A; 4BDY A; 3RRG A; 2HMP A; 4I7F A; 3EZ5 A; 1IG9 A; 4A2A A; 4MLE A; 1LWE A; 4BRL A; 5HOO A; 2FSJ A; 4CFB A; 1NOZ A; 4KRF A; 4KBO A; 3WXJ A; 4ZHR A; 1RT6 A; 1JLB A; 2E6M A; 4FWO A; 1EP4 A; 1YI2 N; 1R0A A; 2E1Z A; 4B1X B; 2OPQ A; 4HTU A; 4J8F A; 4HCB A; 5LL6 Z; 4B3M K; 3H3N O; 5AQT A; 4CFC A; 5BPM A; 2HNZ A; 4IWV A; 4JN4 A; 4H0Y B; 1T3V A; 1EET A; 4F8R A; 4BY9 C; 1EXQ A; 3VF6 A; 2YHW A; 3V1O A; 1JLA A; 3BZC A; 1VQN N; 3A0I X; 4RCH A; 1NGB A; 1E4G T; 1WSJ A; 2ZJR L; 4H0T B; 4DTJ A; 5I9E B; 4YOT A; 4UQG A; 1VHX A; 1RBS A; 4CZH A; 4MLH A; 4CJL A; 4BAC A; 4H03 B; 5GIO A; 2VG5 A; 2UU9 K; 3QEP A; 4V19 S; 3KK3 A; 2HBL A; 2BDP A; 4I9Q A; 1JKH A; 1W0H A; 3NFA A; 4CJQ A; 4CJV A; 2CH6 A; 5CHI A; 3VTH A; 4QS8 A; 1NK4 A; 4IEE A; 4IFY A; 3KK7 A; 3CF5 L; 4WFA L; 4IOA L; 4JI5 K; 2FSN A; 4HUF A; 4LSN A; 3O9Q A; 4XEI A; 5IT9 O; 2EX3 A; 1NGE A; 1B9D A; 2OZS A; 4H5W A; 1TV6 A; 2DFF A; 4OPK A; 3GG4 A; 3JAM O; 3BZK A; 3NH0 A; 3OYI A; 3A5L C; 3O3F A; 4FK2 A; 4KRE A; 4BC3 A; 2F8S A; 1N32 K; 4FJN A; 3E01 A; 3ZET B; 3EZW A; 3CJ9 A; 5GAH P; 1BIZ A; 1TKZ A; 3SAF A; 2PY5 A; 2X6S A; 4CZG A; 3U3Y A; 3RR7 A; 3J8A A; 3V9X A; 4AM7 A; 5C2D A; 3CCR N; 1C1B A; 1BWF O; 2IOC A; 1WAJ A; 4YFU A; 1VQ5 N; 3OYH A; 4ILG B; 3VEO A; 4XH4 A; 3IAY A; 4RWT A; 1VRU A; 1I3A A; 3C6U A; 4CZJ A; 1X9J A; 5C10 A; 3NAE A; 3MCP A; 4Y1C A; 2ZGZ A; 1SZ2 A; 2HST A; 3PSF A; 4IOC L; 4YOY A; 3VF2 A; 5CZ2 A; 3K59 A; 1EO1 A; 1EWR A; 2D4W A; 4NLC A; 2E2Q A; 2IC3 A; 3AVG A; 3U9D A; 2O4I A; 1KXP A; 4CF1 A; 3FZL A; 2UUC K; 3AGK A; 4H5N A; 2O8E B; 4DU4 A; 4LF6 K; 3SJJ A; 4DSJ A; 3L4Q A; 4KH5 A; 1Q7Y O; 2D0O A; 4YOX A; 2OPS A; 5HRS A; 3HJF A; 3WT0 A; 3DXM B; 4C1N I; 3AAQ A; 3ZX3 A; 4FK4 A; 4F9O A; 2P51 A; 3LP0 A; 3JS6 A; 2QI2 A; 2WTU A; 1BG3 A; 1YF5 L; 4CI6 A; 4N47 A; 4EHU A; 5HBM A; 2G8W A; 3CI5 A; 3KVG A; 4BR9 A; 3NMU A; 4LD0 A; 3PIP L; 4K43 A; 3LDL A; 3LPU A; 4E1M A; 5J1E A; 1BO5 O; 1WSI A; 3OYA A; 3K58 A; 1ZBL A; 2XHB A; 3GDQ A; 2NNW A; 5CZ1 A; 1ATR A; 3DLG A; 5MLC Q; 3QEX A; 3P38 A; 4FWQ A; 4K25 A; 1VSI A; 1KCF A; 3K9J A; 1Z26 A; 4CHO A; 3JYT A; 2P1J A; 1ITG A; 4FLX A; 3ZSV A; 4DSL A; 4BR4 A; 3OTO K; 3ZSO A; 4A59 A; 2G8V A; 1WUA A; 1B9F A; 5BN9 A; 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4BRG A; 4CJ4 A; 1JCF A; 3CME N; 3ZT2 A; 1KVB A; 3NVM A; 3WNH A; 4CK2 A; 4KAZ A; 1J5E K; 3AVM A; 4CEA A; 5C24 A; 3SMP A; 2NZT A; 2EWS A; 3MAQ A; 2F9W A; 1BQM A; 4WQ4 C; 4M41 A; 2Z1G A; 3TWH A; 4WFN L; 4CD1 A; 3QO9 A; 4GVM A; 4BR5 A; 3D7E O; 1KD1 O; 2GWK A; 4JS5 A; 5EVZ A; 4ZTJ A; 3P83 D; 3FFI A; 3KKS A; 4EAH D; 3WEE B; 4B3R K; 3KLF A; 5M1K A; 2GV9 A; 3O9S A; 3ENH A; 2WC9 A; 3U4L A; 3LDP A; 4I9L A; 3CPW M; 2FF3 B; 3ISN C; 4F2R A; 3EYZ A; 2RKI A; 4BR0 A; 3QIN A; 2Q0R A; 3LM9 A; 3NBP A; 4WQ5 C; 3FGU A; 4BG9 A; 4JI6 K; 4CJW A; 2F8T A; 2GBZ A; 2VQE K; 4CFD A; 4YOU A; 4CGJ A; 2E6L A; 1NGI A; 2P9U B; 4BVP A; 3EN9 A; 4OJR A; 1HJO A; 1TUU A; 3D45 A; 4OKK A; 5C42 A; 1SKR A; 1BI4 A; 1Q8I A; 4B1Y B; 5JS2 A; 5FPD A; 2NRW A; 1JLG A; 4LSL A; 5CYQ A; 3OYC A; 1XI1 A; 3A2F A; 4FWM A; 3MXM A; 1YTA A; 1QVG M; 1VK0 A; 1W2B M; 4PQU A; 1TKD A; 4KTW A; 2P9P B; 1VSL A; 3NHG A; 4IJA A; 1TL1 A; 4IOX A; 3V1Q A; 3M8P A; 2ASM A; 2NRT A; 4DV6 K; 4JYA K; 5E41 A; 3EEQ A; 4Z0U A; 4C8K A; 3MX5 A; 3THX A; 4DU3 A; 3VOV A; 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