The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| total genus |
28
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LF9 K; 4LFA K; 2E5L K; 3T1H K; 4OX9 K; 4B3R K; 3J7Y P; 4X65 K; 1N34 K; 4JI2 K; 4B3S K; 4DUZ K; 5IT9 O; 1XMO K; 4DV7 K; 1N33 K; 4YY3 K; 4V19 S; 1IBM K; 5LMU K; 3J81 O; 4DV3 K; 2UXC K; 3JAM O; 1XMQ K; 2HHH K; 4LF8 K; 4B3M K; 1XNR K; 2ZM6 K; 4AQY K; 4CW7 B; 4X64 K; 2VQE K; 4K0K K; 4NXN K; 4DV0 K; 2UUB K; 4LFC K; 3J80 O; 5FLX O; 4JI7 K; 4DR6 K; 4DV4 K; 4YHH K; 5IWA K; 3T1Y K; 2F4V K; 3OTO K; 1HNX K; 5LL6 Z; 1IBL K; 4JV5 K; 4KHP K; 2VQF K; 4DR1 K; 1I94 K; 4DV2 K; 4DR7 K; 4LF6 K; 2UXD K; 5A2Q O; 4LF5 K; 4GKJ K; 4X66 K; 1IBK K; 4DV6 K; 1HNW K; 3J7A P; 4LFB K; 5AJ3 K; 4JI3 K; 1HNZ K; 4JYA K; 4JI1 K; 1N32 K; 4JI4 K; 4NXM K; 4B3T K; 4LF7 K; 4DR5 K; 2UU9 K; 4JI0 K; 2UUC K; 4JI5 K; 4LF4 K; 4CVN E; 4JI8 K; 1FJG K; 4DR4 K; 4DUY K; 5LMN K; 5BR8 K; 4DV5 K; 4X62 K; 1J5E K; 4DV1 K; 1XNQ K; 4DR2 K; 4DR3 K; 4GKK K; 2UUA K; 1N36 K; 2UXB K; 4JI6 K; 1HR0 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AP1 A; 1NGF A; 3I55 N; 1NOZ A; 2EX3 A; 5ADX H; 2P5O A; 4DSL A; 2QXL A; 3TSQ A; 5DMR A; 5M1K A; 2X74 A; 1ZBI A; 2KZZ A; 4E19 A; 5AZJ A; 3ZEU B; 3QEV A; 1RDD A; 1YHQ N; 2FXU A; 4CER A; 4M63 C; 4CZG A; 1NKC A; 4BRC A; 2IIR A; 5HBM A; 3T7Z A; 4OLA A; 1NJX A; 2P9P B; 3ZSO A; 1NOY A; 4JK8 A; 4EIA A; 4IJN A; 3ULE B; 4B1W B; 1XI1 A; 3OYF A; 4CHQ A; 3TAQ A; 1F21 A; 1NGC A; 4WE1 A; 1BIU A; 5JS1 A; 4FJN A; 3NGY A; 3FE1 A; 3FLC O; 3VF6 A; 2V7Z A; 2H3G X; 1YVN A; 3P31 A; 3KWI A; 2ZWH A; 3HT3 A; 4AIL C; 1SKS A; 1E4F T; 5ELZ A; 4KHP K; 4IKF A; 2LSN A; 3H46 O; 1KD1 O; 3THW B; 3PLA A; 4RTF D; 3CFP A; 4E1M A; 1KAX A; 3LP0 A; 3SBT A; 3HM9 A; 2AA4 A; 4B1V A; 1HNZ K; 1RCH A; 2IGI A; 1VRT A; 3AA3 A; 1BCO A; 3K9K A; 4JYA K; 3KLI A; 4DTO A; 1N32 K; 4QAG A; 2QM1 A; 1NGJ A; 1W2B M; 3C6A A; 4C1N I; 3U3Y A; 3ZYY X; 4EP4 A; 1KCF A; 3QBW A; 4DTP A; 1C0F A; 1TL1 A; 4WF9 L; 1KXP A; 4DF8 A; 4CZI A; 3KIO A; 2DFH A; 1WLJ A; 3ZT4 A; 1U6Z A; 2HB5 A; 5AFU H; 4FZX C; 5FPD A; 3HOT A; 4HHT A; 3MCP A; 4LY7 A; 1OH6 A; 3BY5 A; 3LP2 A; 1NGE A; 3NH2 A; 3C7N B; 4CFD A; 3OYD A; 1MWM A; 3O4N A; 4B1Y B; 3KHY A; 3MN6 A; 3JSM A; 4KBO A; 2KZM A; 1T44 A; 4M41 A; 2HNY A; 1SL0 A; 2FSJ A; 3NH1 A; 2GWJ A; 1YTU A; 2GUI A; 1S1V A; 1RBT A; 3TWH A; 3ZT3 A; 4BDZ A; 3TR8 A; 4M3X A; 4F9O A; 2O4I A; 5KGW A; 1HKB A; 1OH7 A; 4DSE A; 5LMU K; 4K41 A; 3K58 A; 2BAN A; 5JS2 A; 1TKD A; 4CF2 A; 3BP8 A; 4BVP A; 4CEA A; 3AO3 A; 3U9D A; 1T05 A; 2HBJ A; 4Z4C A; 4OPH A; 2ZM6 K; 4QS7 A; 5AQS A; 2HHV A; 3SAF A; 1S72 N; 4DFP A; 2E20 A; 2P1J A; 5FPM A; 1VQ6 N; 3H3N O; 3MED A; 4FLU A; 3VQQ A; 3AVM A; 2YHX A; 1E4G T; 4AHR A; 5FLX O; 1XHX A; 2E88 A; 3SZ2 A; 3BF3 A; 4O5F A; 3ZET B; 3THY B; 3HSC A; 3L6Q A; 2AJQ A; 4AM7 A; 5LL6 Z; 4CFB A; 1XUP O; 1B9D A; 4OPA A; 3ZT0 A; 4DS5 A; 2D0B A; 2CH5 A; 1NMD A; 4BC5 A; 4JKH A; 5A2Q O; 3DLR A; 1NK6 A; 1JKH A; 3BDP A; 4QS8 A; 1GLE G; 4DKW A; 3KVG A; 3IRX A; 1RBU A; 4A2A A; 3THV A; 2WBN A; 3J8A A; 1QVF M; 4CHY A; 2YNG A; 4C8O A; 4FWP A; 1VAZ A; 4NO7 A; 4CE9 A; 3CYM A; 3IDH A; 1P8Z A; 4M42 A; 3ZT1 A; 3ID6 A; 1IG8 A; 3OJS A; 1S1X A; 3AVL A; 3KTQ A; 3AY9 A; 2QKB A; 1GLL O; 3QEP A; 2FSK A; 3VTI A; 5J1E A; 4DSI A; 5AQR A; 3C6U A; 4CJU A; 3LZJ A; 2W42 A; 4BG8 A; 2IVP A; 4M3T A; 4DV1 K; 1S1U A; 1IKW A; 2HST A; 4M7X A; 2Z1J A; 5CZ2 A; 3DJC A; 4A5B A; 4JK9 A; 4LSN A; 3NGZ A; 1XHZ A; 4CK2 A; 3VQA A; 3EE8 A; 5H1S Q; 5C42 A; 1LWC A; 4DHY A; 3I0S A; 2QWP A; 1K73 O; 1JXB A; 4CD3 A; 3CF5 L; 3P38 A; 3OJU A; 4M3U A; 4GVM A; 5BRH A; 1FKO A; 1TKX A; 3N4P A; 3NF6 A; 5GIP A; 3AVC A; 3QIC A; 5FDL A; 4CW7 B; 3A5O C; 1NM1 A; 4CGD A; 3G4S N; 3MXM A; 1NK7 A; 2KHO A; 3S9H A; 1RDU A; 1RDC A; 5KPZ A; 1U49 A; 1SV5 A; 2DPN A; 1ASW A; 1ITG A; 4NLB A; 1Q86 O; 1HKG A; 3AVA A; 4JV5 K; 4E89 A; 3MMV A; 3E9O A; 2I7P A; 3GDQ A; 2Z1H A; 2PBD A; 3VQC A; 4IEE A; 1JXE A; 3L2U A; 3DLH A; 1BL3 A; 4N5S A; 2CGK A; 2Z1G A; 4JI3 K; 2KKZ A; 3KJV A; 2IC3 A; 4FM1 A; 3RR8 A; 4FK4 A; 2GX9 A; 1CXQ A; 2A6A A; 4IOX A; 2YKN A; 4OKK A; 5KI6 A; 3NH0 A; 2E2N A; 1KC8 O; 2E2Q A; 4BY9 C; 3O4Q A; 1D4X A; 4JD2 B; 4CK3 A; 3C6H A; 1Q7Y O; 5AQF A; 4NCG A; 1XQS C; 3O8M A; 3SMS A; 2F9T A; 3KLH A; 4KHW A; 4JI5 K; 2E2P A; 1TK0 A; 1RGI A; 5C10 A; 3KWG A; 2QWR A; 5KRT A; 3VGK A; 3QES A; 1YUW A; 2GTD A; 2W6K A; 3O9R A; 3QFU A; 3DM2 A; 4IWV A; 4DU3 A; 1K9M O; 1D9D A; 5AZI B; 3SMP A; 4Q0B A; 1LAV A; 5J2N A; 3FZM A; 1WSF A; 1BIS A; 3NGI A; 4EHT A; 3THW A; 1BA1 A; 4JI2 K; 2FBX A; 4FJG A; 1MU2 A; 2XHB A; 4DTJ A; 4B08 A; 4DSF A; 2OCE A; 5AQW A; 2W6L A; 4QOZ B; 2HND A; 1YF5 L; 3H45 C; 1JLG A; 4Z4I A; 4CK1 A; 4MDA A; 4CJE A; 2GBZ A; 1QVG M; 1IKX A; 5ADX A; 3EY1 A; 1RBS A; 1U48 A; 1V4T A; 3D2E B; 2ZGZ A; 2HHQ A; 2O4G A; 3MX5 A; 3NF8 A; 2ZF5 O; 4Y0W A; 3QO9 A; 4RW7 A; 3QB0 A; 3OY9 A; 2D5R A; 3C7N A; 3PX6 A; 3T1Y K; 4FJI A; 2ZJQ L; 3MEG A; 4IXC A; 4JS4 A; 4E7K A; 3OTO K; 4KTW A; 2X6N A; 3FFK B; 3NFA A; 4JKD A; 2BDP A; 1SKR A; 1A5W A; 2VQF K; 1Z6R A; 1LOT B; 4MLH A; 4DR7 K; 3DRP A; 4JHD A; 3B6O A; 1FKP A; 1TYQ A; 2G8W A; 4CEF A; 3HYF A; 3OYG A; 4JHD B; 1TUU A; 3VEY A; 3DWL A; 1Q9X A; 4HTL A; 4CD1 A; 4YOT A; 3L2W A; 1XC3 A; 2VWK A; 3V1R A; 2BH1 A; 2NRV A; 3L4I A; 2QWL A; 3KKR A; 4YOY A; 3O9Q A; 3AVJ A; 1X9J A; 3JS6 A; 1X3M A; 2XY8 A; 2G8K A; 1JL2 A; 5AQI A; 1WN7 A; 5AZJ B; 2FC0 A; 3VN5 A; 4AF1 A; 3SV3 A; 1VK0 A; 3TPQ A; 3DMJ A; 3HP6 A; 3SUP A; 1BU6 O; 2F7T A; 3SJH A; 1TK8 A; 5CYM A; 3KD1 E; 2WFB A; 3SAH A; 2QTD A; 3MN9 A; 1VSJ A; 4JKB A; 3G6E N; 1W0H A; 3DXK A; 4IEI A; 4H0P A; 1T3V A; 1WSH A; 1TL3 A; 2YNH A; 3GE1 A; 1YJW N; 4E7J A; 4DFM A; 4GV9 A; 2HVH A; 3TTF A; 2DY4 A; 3P39 A; 2G8V A; 1DT9 A; 3MAQ A; 2YJF A; 4B3R K; 1C0U A; 4CED A; 3GBT A; 1X9M A; 3KKS A; 5AQY A; 4LH5 A; 5E84 A; 3OYA A; 1S3X A; 1GOB A; 4DV7 K; 1B9F A; 5B8H A; 3TAN A; 1VHX A; 3CG7 A; 3JYT A; 4EZ6 A; 1Y64 A; 4C23 A; 3R1X A; 1SS6 A; 4JRP A; 3O08 A; 4BRG A; 4BR0 A; 1Z05 A; 4LF8 K; 3VEV A; 3SLC A; 4HVJ A; 1OVQ A; 4CZK A; 1L5U A; 3PX4 A; 4B8A B; 3VGL A; 4ICL A; 1ZBF A; 2XY5 A; 2QWN A; 3P83 D; 4CGF A; 3IMX A; 2CGL A; 1ZBL A; 4DR6 K; 3A5M C; 5C15 A; 3VEW A; 3O1W A; 1RDW X; 5BN9 A; 4CZE A; 1RTH A; 2RE2 A; 4RW4 A; 1Z25 A; 1L3V A; 4Z94 A; 1S6P A; 4U7B A; 4W5N A; 4LH4 A; 1JCE A; 2DFF A; 4DV2 K; 3QDK A; 4J2B A; 3K5O A; 2QWQ A; 4G9Z A; 5AQM A; 1NJY A; 3HST B; 3PX0 A; 2FSN A; 3RMD A; 3T19 A; 5EOY A; 4HWI A; 1BCM A; 4HUG A; 2YNF A; 4BRA A; 1O1W A; 1S1W A; 2YV0 X; 4ILJ A; 4TSX A; 3SCX A; 1ZYQ A; 5AQU A; 3CHW A; 4CF9 A; 5EVZ A; 2XY7 A; 2F8S A; 3OW2 M; 2PYJ A; 1C0M A; 4JNE A; 2V7Y A; 1VQN N; 3NF7 A; 1RBR A; 2Q2R A; 5AQV A; 1S1T A; 4GMJ B; 3NE6 A; 1S22 A; 4DCH A; 1M90 O; 4OLB A; 5CZ1 A; 3A5L C; 4N56 A; 2NZT A; 3ATV A; 2NRH A; 1DLO A; 3CJ1 A; 4ELU A; 4CEQ A; 4JKG A; 1U04 A; 4C8M A; 3M8S A; 4FZZ A; 1G15 A; 3K0S A; 3LZI A; 5D3G A; 4F3T A; 3MWP A; 4JKG B; 4W5O A; 1RTJ A; 4GY2 B; 3AVK A; 4BC2 A; 1YIJ N; 4KH6 A; 1QE1 A; 3CCV N; 3CCM N; 3M1F A; 1RT4 A; 3OHR A; 1WUA A; 5JLH A; 3PO5 A; 1O13 A; 4DQR A; 2YNI A; 3CXC M; 2IAJ A; 4O8U A; 2P9S B; 2O8F B; 2OPR A; 5EX5 A; 4KI4 A; 4CJP A; 3ZSW A; 3DI6 A; 3O9U A; 1NGI A; 4BRE A; 4FOE A; 2HBM A; 4N76 A; 3E9L A; 2E8A A; 3H6E A; 3RRH A; 1XMQ K; 3SPZ A; 3AA4 A; 1NKE A; 4FVU A; 2P51 A; 5GAH P; 3CCL N; 1GLC G; 4FW2 A; 3CER A; 3FZH A; 4DG1 A; 1XNR K; 4CHN A; 4DTU A; 1NG9 A; 3OYJ A; 4K0K K; 5KRS A; 2YHW A; 3SQ1 A; 2VYP A; 2UUB K; 3B6P A; 3HVT A; 3VQ7 A; 3LP1 A; 1MDU B; 4JI7 K; 2P9U A; 3CM6 A; 4CF1 A; 2P9L B; 4DV4 K; 1SL2 A; 3UB5 A; 4XEI A; 4PY5 A; 3QML A; 5I9E B; 2IVN A; 3MCA B; 1HX1 A; 2NRT A; 4Z4H A; 4FXD A; 1T8E A; 4Z4G A; 3L4Q A; 1D9F A; 4W5Q A; 3CC7 N; 5C0Y A; 2HF3 A; 2XO7 A; 4GKJ K; 1TUY A; 3V9U A; 1HNW K; 3OBY A; 4KH4 A; 1KTQ A; 1IKV A; 4JI1 K; 3AO5 A; 3LAK A; 3ZET A; 3THY A; 3WXK A; 3U6F A; 3EE9 A; 2J4R A; 1S6Q A; 5CR4 A; 3OYB A; 3RMA A; 1L3T A; 4DSK A; 1EO1 A; 3IKM A; 3HVR A; 3CJB A; 1OH5 A; 3NVK A; 3I8B A; 1T6C A; 5AQP A; 2VGM A; 3K2P A; 1KLN A; 1UA1 A; 4F3O A; 2A1S A; 4DU1 A; 4AHV A; 1W97 L; 1C1C A; 4YDU A; 3I8D A; 1QQN A; 5BRD A; 3AAP A; 1NJW A; 2OTL N; 1YAG A; 1NK9 A; 3R9P A; 2I7N A; 1VQ4 N; 3K59 A; 2I5J A; 3OA9 A; 1NGA A; 4WFN L; 4WQ5 C; 4CJT A; 1U47 A; 5BPN A; 2Q97 A; 3RSE A; 4DTS A; 3G0Z A; 1NGB A; 3FFI A; 3CCU N; 4R5P A; 3CC4 N; 3VF4 A; 2HMI A; 3LP3 A; 1XMO K; 3C94 A; 2OZS A; 4F2S A; 4DWI A; 4FVM A; 3SUQ A; 5T7B A; 2IOC A; 5HRS A; 2HHW A; 2HMP A; 3WXM B; 4O8K A; 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1FW6 A; 1HYS A; 4RW8 A; 1J53 A; 1UOC A; 3KD5 E; 3M8R A; 1KVB A; 4B9U A; 4FLW A; 4AHS A; 1QHT A; 5LY3 A; 2UXC K; 4IOC L; 4GV3 A; 1WB9 A; 4BRM A; 1LW0 A; 1T03 A; 4QCL A; 1QHA A; 4IZ9 A; 3ASM A; 4YNQ A; 3S3N A; 3V1O A; 2OPS A; 4DV0 K; 5BPM A; 5BN8 A; 4B9M A; 2ETJ A; 4CGG A; 1HMV A; 3DLK A; 4ISE A; 1VQ5 N; 1A5X A; 3CET A; 4YHH K; 3HI0 A; 1YJN N; 1NK5 A; 3W3D A; 5CY4 A; 1HNX K; 4DFK A; 2OAN A; 4DR1 K; 1GOC A; 5C2D A; 3QEI A; 4XH4 A; 4NCA A; 1BIZ A; 4E1N A; 3A0I X; 3KK3 A; 3AVB A; 3CJ9 A; 3UIQ A; 4IFE A; 4W5R A; 4LFB K; 3LPT A; 3OYM A; 3QNN A; 3P1G A; 2QWO A; 3AA5 X; 3LDO A; 1VSM A; 1KAZ A; 3C95 A; 3LDN A; 1HNI A; 2RF2 A; 4FJ7 A; 3SUN A; 5FRM A; 3BGR A; 4JI0 K; 3AVF A; 3H1V X; 3F9M A; 3OBW A; 1MA9 B; 1S9E A; 3KLE A; 3DLG A; 3TAE A; 4H5N A; 4QS9 A; 1H1V A; 4HCB A; 3FGU A; 2WUS A; 1VSD A; 3PSI A; 3CJC A; 4LC9 B; 3IS9 A; 1U2V A; 4BVO A; 2YJE A; 4Q5V A; 2P9I B; 5GIN A; 3E9P A; 3I56 N; 1YIT N; 5EU7 A; 2UXB K; 1N36 K; 3V9W A; 3L2Q A; 2ASO A; 4LFA K; 2E5L K; 3VEO A; 3VEX A; 1EXQ A; 4KH5 A; 3F2K A; 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