The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| molecule keywords |
16S rRNA
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| total genus |
28
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LFA K; 4JV5 K; 4DR1 K; 4DR7 K; 1XNQ K; 4DV4 K; 1I94 K; 4V19 S; 3OTO K; 4CVN E; 1HNW K; 3T1Y K; 5IT9 O; 3T1H K; 4LFC K; 2UUA K; 2HHH K; 1IBL K; 4DUY K; 1IBM K; 1IBK K; 5FLX O; 4LF8 K; 1HR0 K; 5A2Q O; 2UXB K; 4CW7 B; 1XMQ K; 4X64 K; 3J7A P; 4JI7 K; 2ZM6 K; 4NXN K; 4LF7 K; 4B3R K; 5LMN K; 4DR4 K; 4DR3 K; 4X66 K; 4KHP K; 4DV1 K; 4DV0 K; 1J5E K; 4JI8 K; 4JI0 K; 2F4V K; 5IWA K; 4LF5 K; 4DR2 K; 4DR5 K; 2UXD K; 2UUC K; 4JI6 K; 4B3M K; 1HNZ K; 2VQE K; 2E5L K; 4LF9 K; 4JI3 K; 3J7Y P; 4DV2 K; 4X65 K; 1XMO K; 4DV3 K; 3JAM O; 1N32 K; 2UUB K; 3J81 O; 4B3S K; 4B3T K; 4JI4 K; 4DV7 K; 4DR6 K; 4GKJ K; 4LFB K; 1HNX K; 5LMU K; 1N33 K; 5AJ3 K; 4OX9 K; 4JI5 K; 4X62 K; 4LF6 K; 4JYA K; 4JI1 K; 4DUZ K; 4LF4 K; 5BR8 K; 4DV6 K; 4YY3 K; 4DV5 K; 2UU9 K; 4GKK K; 5LL6 Z; 1N36 K; 4K0K K; 4YHH K; 1XNR K; 1N34 K; 4JI2 K; 4AQY K; 1FJG K; 4NXM K; 3J80 O; 2UXC K; 2VQF K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KK3 A; 1HKC A; 5BPN A; 1IH7 A; 3CCR N; 3ENO A; 3SQ0 A; 3CG7 A; 3OYG A; 4V19 S; 1KD1 O; 1K8K A; 2WFB A; 3MWP A; 1SV5 A; 2D0B A; 3ID8 A; 1UAX A; 4CFC A; 4O8U A; 1IBM K; 5AQY A; 3C6T A; 1TL3 A; 4C8M A; 4JRQ A; 2B5J A; 4CW7 B; 2E6L A; 4HHT A; 3L3V A; 1UWB A; 4IG0 A; 4F2S A; 4CES A; 5GAD P; 4BGB A; 3WT0 A; 2H3G X; 2IGI A; 2RF2 A; 4A5A A; 2D0C A; 4JLH A; 3O9U A; 1J54 A; 4FM0 A; 1NGB A; 3A5L C; 3RTV A; 4FWS A; 1S6Q A; 3THY A; 1BA0 A; 4J8F A; 3TTC A; 3CME N; 3UKU B; 5LJW A; 4O5F A; 2PAV A; 3ATV A; 3AO1 A; 5JS1 A; 3BZK A; 5JVG L; 1MDU B; 4YOV A; 3ZSR A; 4M3Y A; 3LP3 A; 2UXD K; 1JKH A; 4BC3 A; 1RTD A; 1QZ6 A; 5BPL A; 4CJE A; 4FOE A; 1B9F A; 2G8I A; 3SBG A; 5HBM A; 1DGK N; 3EKU A; 3O3H A; 3WXJ A; 3U6F A; 4FK4 A; 2P9N A; 3CET A; 3LP0 A; 4FJH A; 5B8H A; 3K5L A; 5LMU K; 2YJE A; 3NF6 A; 3ZET A; 2G8F A; 3HP6 A; 5I9E B; 4ISF A; 4BWJ A; 1GLB G; 4CJP A; 1U6Z A; 4Y0W A; 3O4W A; 1QZ5 A; 2A3Z A; 3K0S A; 2E2P A; 4JD2 A; 2E4L A; 4BR0 A; 4O44 A; 3TSU A; 3SUN A; 4FCY A; 4FW1 A; 3OYK A; 1WSH A; 1Y97 A; 1A5W A; 1C1C A; 3VOV A; 4AM7 A; 1GLD G; 1N36 K; 4K0K K; 3DOK A; 4FWQ A; 2P9S A; 3LM9 A; 2O4I A; 3K5M A; 4IO9 L; 1BI4 A; 3VQA A; 4JN4 A; 2GX9 A; 4NXM K; 1NJX A; 3OA9 A; 3DLH A; 2VQF K; 3AVF A; 1KVC A; 1C0F A; 1C6V A; 1DTQ A; 1JCF A; 2QWM A; 3MEG A; 5AQT A; 3VQ5 A; 1JLC A; 2OAN A; 2Q0R A; 2NRT A; 2OCE A; 1GOB A; 1WSF A; 4PKG A; 4L3Q A; 1CZB A; 1U4B A; 2FBV A; 3C6A A; 5KGX A; 4IZ9 A; 3DM2 A; 4IFV A; 3MN9 A; 4XH5 A; 3ZET B; 1W0H A; 3AVH A; 4WF9 L; 4B3R K; 4DF4 A; 2V52 B; 4DR3 K; 3BF1 A; 1RCH A; 2HHU A; 4JKG A; 4CFD A; 4GV9 A; 1K8K B; 5AQL A; 1L5U A; 5CYM A; 3NH0 A; 3A2F A; 4BAC A; 2CGL A; 5CY4 A; 4BE1 A; 4BE2 A; 3TAM A; 3WQT A; 4JI6 K; 1K9M O; 4BR4 A; 1WBB A; 1YJ9 N; 3WXK A; 3TAE A; 4FWR A; 1C1A A; 3QEP A; 1HYS A; 1VSE A; 3AA5 X; 4L8R B; 4FWM A; 2QM1 A; 4Z4E A; 4DR6 K; 2XHB A; 1EKE A; 4GKJ K; 3A0I X; 3ZT0 A; 4BRO A; 4C1N I; 3I0R A; 3CCJ N; 4X62 K; 2W6K A; 1KAY A; 4YOT A; 2A5X A; 1K8A O; 4E7K A; 1BA1 A; 4CJ3 A; 4YY3 K; 4JRP A; 3S9H A; 3KKR A; 1NK0 A; 3KK7 A; 2IAJ A; 2FF6 A; 4DSE A; 4CJL A; 3FFI A; 2OZM A; 1J9A A; 1X3M A; 3THW A; 2OTL N; 1RDB A; 4KHS A; 5FPE A; 3LL3 A; 3FLC O; 2YNF A; 4AQY K; 3JXU A; 1Y64 A; 5KI6 A; 1UA1 A; 4FLZ A; 1JJ2 M; 4YDU A; 2QK9 A; 4I9L A; 3TU5 A; 3LZI A; 4NLB A; 3L2U A; 3DWL A; 4G9Z A; 2NRH A; 4M63 C; 2KZM A; 2X6S A; 3VPZ A; 2GEM A; 2G8U A; 3PX0 A; 5DK5 A; 3M8Q A; 2JWL A; 5AQF A; 4DU3 A; 4FZX C; 1U47 A; 5FRN A; 1XHX A; 1FKP A; 1RIL A; 4BRI A; 3QIN A; 1SUQ A; 4KRE A; 4DS4 A; 1J5O A; 2E1Z A; 4DV0 K; 3OYJ A; 4B8A B; 1OH6 A; 2VWK A; 1NU0 A; 4J2D A; 3G71 N; 2IDO A; 3HP9 A; 1ZXO A; 4CFB A; 3LDL A; 5AFU A; 4CGF A; 4I6M A; 5K14 A; 4O0I A; 3SPZ A; 1P90 A; 1QS4 A; 2A40 A; 3ZSV A; 4UY8 O; 2IS3 A; 3SK3 A; 4FXD A; 4OPJ A; 5HRR A; 3KLE A; 3ZCM A; 3IG1 A; 2FBY A; 1RBU A; 4KV8 A; 1IG9 A; 3OYD A; 3NVM A; 3QB0 A; 3VET A; 3PSF A; 2FBT A; 3SUQ A; 1EXQ A; 4J2E A; 3EZW A; 4FW2 A; 3P83 D; 4OGC A; 3GL1 A; 1TVR A; 4CGG A; 3LAM A; 3SNN A; 3CD6 N; 3O4N A; 4Z4G A; 4IKF A; 3OS2 A; 5DMR A; 5FRM A; 2DTU A; 3MX5 A; 4GNI A; 5LL6 Z; 3VTH A; 4GVM A; 5TKW A; 1Z26 A; 1Q9Y A; 4XIU A; 4WQ4 A; 3G4S N; 3F5T A; 1RBT A; 3G25 A; 4BG9 A; 3OVN A; 4B1W B; 2YNG A; 3FGU A; 4DLG A; 5C0Y A; 4CJ5 A; 2IVN A; 3QIC A; 4CI6 A; 1WAJ A; 3TR8 A; 5F0X A; 4JV5 K; 4MDB A; 3NCI A; 3OYC A; 4JKA A; 2NUB A; 3VQ4 A; 2P5O A; 2E6M A; 1EX4 A; 4FWL A; 1WAF A; 2NRR A; 1FW6 A; 1RDU A; 4DSK A; 4IJN A; 4IFE A; 3QES A; 5FPN A; 2QWQ A; 4K8Z A; 2GV9 A; 1MWM A; 3P31 A; 5KTQ A; 4IEI A; 1VQP N; 4KHU A; 3DRP A; 1QQN A; 4MO4 A; 3OYH A; 3I55 N; 3T3F A; 4CJU A; 4CJW A; 1IJJ A; 4EZ6 A; 2QWO A; 1E4F T; 2D0P A; 4KFB A; 1BO5 O; 4PKI A; 2HHT A; 3IS9 A; 4C23 A; 1GLC G; 2ZD1 A; 1CZA N; 5AQI A; 1D5A A; 1CXU A; 3QEI A; 1W9H A; 2P9P A; 1ZBI A; 3AVI A; 1ATS A; 1HQE A; 2HST A; 4B1V A; 1S1W A; 3V6D A; 4FJI A; 3VEW A; 3M3Z A; 3NF9 A; 1NJZ A; 3RMB A; 1HNZ K; 1VQ4 N; 2VQE K; 5MLC Q; 3ZT1 A; 1MU2 A; 2OYQ A; 4FJM A; 1T6C A; 1VSL A; 1S1U A; 4DTR A; 5BPM A; 3OY9 A; 3CXC M; 3CER A; 1I3A A; 1HKB A; 2UUB K; 4FWO A; 4W5R A; 4ZTF A; 4FSV A; 3ZX3 A; 2EHG A; 2A41 A; 4M3W A; 1EQY A; 3ZEU B; 4DTJ A; 4QS9 A; 1NKB A; 4CFA A; 2HW3 A; 1LAV A; 3PIO L; 2YHW A; 5HL7 L; 4M7Y A; 4RWT A; 3KD1 E; 4O4G A; 4A2B A; 2ITM A; 4KKO A; 1TKT A; 5LJV A; 3IAY A; 5AR0 A; 5AQR A; 1NKC A; 1KCF A; 1QSL A; 5H1S Q; 3AVG A; 3PX6 A; 1D4X A; 5KPZ A; 3HVR A; 2YX6 A; 3V1O A; 5KPT A; 4RW9 A; 3SQ2 A; 5GAE P; 3OYE A; 3IMX A; 4F2R A; 4YOR A; 3VEV A; 4NCA A; 2KTQ A; 4H0O A; 3T1Y K; 5E41 A; 2OA8 A; 3C94 A; 1JLE A; 3HRG A; 3AY9 A; 4LFC K; 1TAU A; 1W2B M; 1RBR A; 3IUC A; 4JD2 B; 2Z1H A; 4DUY K; 2I7N A; 3CCV N; 1R59 O; 4CEO A; 1RT5 A; 3SI6 A; 3L2W A; 1EO1 A; 3ZEU A; 3WXL A; 4CJT A; 2RHK A; 3T19 A; 3TAN A; 3AA4 A; 4WQ4 C; 1VQ9 N; 1VSJ A; 4IG3 A; 5JMV A; 4NYN A; 4HTL A; 3M1F A; 5AQH A; 3HM9 A; 2DFH A; 1IKV A; 3WQU A; 1QSS A; 5CR4 A; 3MN7 A; 4OGE A; 2KQ2 A; 2ATQ A; 3M8R A; 4N76 A; 2D0O A; 1LWC A; 2IVP A; 1LW2 A; 4CHN A; 4BRD A; 3QLH A; 3CC7 N; 4H0P A; 4B3M K; 4Z4H A; 2E5L K; 2HMI A; 1KXP A; 4H0Y B; 4DSJ A; 3I33 A; 1XWL A; 4ELT A; 3PLA A; 3MED A; 2QWP A; 4DV3 K; 5C25 A; 1VQ7 N; 2O8E B; 4LD0 A; 3JAM O; 1N32 K; 4KHN A; 1NKE A; 1F21 A; 3F2K A; 1BI4 B; 1Z6R A; 4WQ5 C; 4LFB K; 4J2A A; 1IG8 A; 4BRQ A; 2ZE2 A; 4PL7 A; 3MMV A; 3PO4 A; 4CGI A; 3OS1 A; 4DTO A; 4HCB A; 3TWH A; 4KAZ A; 5AQM A; 2BDP A; 4WCE L; 3QEW A; 1KSP A; 1BU6 O; 3LM2 A; 3O9Q A; 1VHX A; 5M1O A; 3VGL A; 1TYQ A; 3DXK B; 2QKK A; 2FBX A; 4C8L A; 3KLF A; 3DJC A; 3ZX0 A; 2YV0 X; 3G0Z A; 3TAG A; 3H08 A; 1N34 K; 3KD5 E; 5AZI A; 3RR8 A; 1ITG A; 2ZJP L; 1SAZ A; 3ATU A; 2EWS A; 1X9W A; 1RBS A; 2QI2 A; 3HPG A; 3PIP L; 4PWD A; 1T3V A; 2Q31 A; 4CIE A; 3HTV A; 2O8C B; 2G8V A; 2OTJ N; 1S9E A; 3TTF A; 2HHH K; 2GBZ A; 1VQK N; 2Q2R A; 4ISE A; 4B1Y B; 3C6U A; 3Q7C A; 4FVU A; 1WSE A; 1IKX A; 3EE8 A; 4EIA A; 1JXB A; 3A5O C; 2E2Q A; 3UB5 A; 1SZ2 A; 5AZJ A; 5CYQ A; 4KTW A; 4M3T A; 1ZBH A; 4DQI A; 4K42 A; 1RT2 A; 1S9G A; 2O8F A; 3AVL A; 1X1P A; 2ETJ A; 4RW6 A; 2WC9 A; 4BR7 A; 3AV9 A; 3L2V A; 5AQN A; 3BF3 A; 4KBO A; 3NGY A; 3VER A; 3IDH A; 2ASM A; 1SKW A; 4IOA L; 1VRU A; 3UKR B; 2UUC K; 2QWR A; 1HYV A; 3JS6 A; 4FJ8 A; 3D7E O; 2O8D B; 1OVQ A; 1LWF A; 2P9U A; 3I0S A; 4E7H A; 4DS5 A; 4BVP A; 4CEB A; 5FRO A; 2B6A A; 2FLO A; 3ZT3 A; 2F8S A; 4CHY A; 3K5O A; 4PL8 A; 1L3U A; 1FK9 A; 1ZC6 A; 1G99 A; 4CF8 A; 4YDU C; 4HVJ A; 3OYL A; 2PYL A; 3CHW A; 4CJS A; 1Z05 A; 4N56 A; 3H46 O; 3OYF A; 1O13 A; 4FLW A; 2P9I A; 3CFR A; 2P5G A; 2KW4 A; 3LDN A; 4GY2 B; 4JI1 K; 3VA0 A; 3VES A; 5HRS A; 4QCL A; 3P5J A; 3QBX A; 1XI1 A; 3E9O A; 2GWJ A; 3O5B A; 1QSY A; 2P9N B; 3RRH A; 3DLL L; 3G10 A; 3L3U A; 3M5R A; 2O8B A; 4ILH A; 4DFP A; 5AZI B; 1GLF O; 3KK1 A; 3AA2 A; 4LH5 A; 4FZY A; 4DCH A; 4HUF A; 4CK3 A; 3AO4 A; 4WYB A; 5EOY A; 2ZGZ A; 4BR2 A; 1WBD A; 2E2N A; 2XY6 A; 4O55 A; 4DU4 A; 2NRW A; 4GVE A; 4DFK A; 4DKW A; 1JL2 A; 3C0B A; 3C7N B; 3MXM A; 4BDY A; 2JLE A; 1YAG A; 5IT9 O; 5AQX A; 4BQL A; 3V9X A; 1KLN A; 1GLE G; 3V1Q A; 3ZT4 A; 5AQO A; 5LY3 A; 4JEP A; 1H1V A; 3T1A A; 4H5W A; 1IBK K; 2W6L A; 5JVH L; 1JLA A; 2P9P B; 4O0J A; 5A2Q O; 1HNV A; 1RT6 A; 3BZC A; 2KHO A; 3KWI A; 3F73 A; 1FKO A; 4KTQ A; 2HOE A; 1WLJ A; 4DB3 A; 2WBN A; 3M6G A; 1DEJ A; 4F9O A; 4LF7 K; 2QTD A; 1SQK A; 4JHD B; 3ISN C; 3K5N A; 3CCQ N; 4DR4 K; 2V7Y A; 2VG6 A; 3V9W A; 2A1R A; 1D9D A; 2O8C A; 3CJA A; 1NLV A; 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2KLA A; 3D2E B; 1YIJ N; 4CGD A; 4FO0 A; 1HX1 A; 3LDO A; 4KTZ A; 4X66 K; 3UKR A; 4FLT A; 4CK2 A; 1IO2 A; 4FLV A; 1RDW X; 1X3N A; 3VEY A; 3MWT A; 3HYF A; 3P39 A; 5AQZ A; 5BN8 A; 5IWA K; 4YOW A; 3NVK A; 1WOQ A; 3K57 A; 3CC2 N; 3S41 A; 1C0U A; 4YOU A; 4H0X B; 4NO7 A; 1JLQ A; 4IO8 A; 1ATR A; 3HVT A; 4LF9 K; 4JI3 K; 5FDL A; 1TV6 A; 3R9P A; 4DV2 K; 4QS8 A; 3NBP A; 1B92 A; 4B1Z A; 1ILY A; 1BWF O; 3VQ6 A; 3J81 O; 3QEV A; 4B3S K; 5GAG P; 2PFU A; 4DTN A; 5HRP A; 5C24 A; 4B9Q A; 3DOL A; 4XH1 A; 4IBN A; 2BUP A; 1BQN A; 5F2R A; 1HMV A; 3HO1 A; 2NLX A; 4B8C A; 3HPO A; 4DSL A; 1XUP O; 2YNI A; 4FJL A; 4LF4 K; 3RRG A; 5BR8 K; 3TAF A; 1KFD A; 1VSK A; 2VWB A; 3I56 N; 1VQO N; 3HJF A; 2HF4 A; 4YOX A; 3MAQ A; 3EN9 A; 4DFJ A; 3FFK B; 3A5N C; 4QAG A; 5BRD A; 1BIZ A; 3THX B; 2ZWH A; 3DXM B; 1LW0 A; 1QHA A; 2BH1 A; 3CJB A; 5M1Q A; 2ZGY A; 4B08 A; 2V7Z A; 5C12 A; 2QA4 N; 3N4P A; 1OH5 A; 2DY4 A; 4XEI A; 2RN2 A; 4ICL A; 5AQP A; 2YHB A; 1TK5 A; 4JK7 A; 4LSL A; 1NBW A; 1OH7 A; 4OPA A; 5C10 A; 4JKG B; 5FPM A; 3NAE A; 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