The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
|
sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
28
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4DR2 K; 4B3M K; 4JI1 K; 1FJG K; 4B3R K; 2ZM6 K; 3J7Y P; 1N33 K; 4DV0 K; 5LL6 Z; 4LFB K; 1N36 K; 2HHH K; 4JI0 K; 4V19 S; 4DV2 K; 1IBK K; 5LMN K; 5IT9 O; 2UXB K; 3T1Y K; 1HNZ K; 2F4V K; 4DUZ K; 4KHP K; 4LF6 K; 1HNW K; 4JI7 K; 4DV3 K; 4DV1 K; 1XMQ K; 5BR8 K; 5IWA K; 1IBL K; 4B3T K; 2UUA K; 3J7A P; 4NXN K; 4DR1 K; 2UUC K; 3OTO K; 2E5L K; 4B3S K; 4DR3 K; 4LFA K; 1I94 K; 3T1H K; 3JAM O; 1IBM K; 2UXC K; 1J5E K; 1N34 K; 4GKJ K; 4JV5 K; 5FLX O; 4YHH K; 4X65 K; 4OX9 K; 4LF4 K; 1HNX K; 2UXD K; 2VQF K; 1XNR K; 4LF8 K; 4JYA K; 1XNQ K; 4DR7 K; 5AJ3 K; 4CVN E; 4JI5 K; 4NXM K; 4X62 K; 4JI4 K; 4LF7 K; 4JI8 K; 4JI2 K; 4LFC K; 4DUY K; 4DR4 K; 4JI6 K; 3J81 O; 4DV7 K; 4DR5 K; 4GKK K; 4DV4 K; 4DV5 K; 5LMU K; 4K0K K; 2VQE K; 2UUB K; 1HR0 K; 4DR6 K; 4LF9 K; 1XMO K; 4X66 K; 4LF5 K; 5A2Q O; 3J80 O; 2UU9 K; 4JI3 K; 4YY3 K; 4DV6 K; 4AQY K; 4CW7 B; 4X64 K; 1N32 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KKS A; 3JSM A; 1X9J A; 1JCF A; 1X9W A; 1RGI A; 1D9F A; 2HHQ A; 4DFJ A; 4TSX A; 3TAR A; 3WEE B; 2YI1 A; 3SV3 A; 4DTS A; 4NO7 A; 1U48 A; 3RMC A; 4B1W B; 3D45 A; 1BWF O; 3K57 A; 4Y1C A; 2QKK A; 3FZM A; 4DTX A; 2QW9 A; 1RT7 A; 4BR2 A; 3AVC A; 1VQK N; 3NGY A; 1YJN N; 3CXC M; 3QEX A; 4JKD A; 2QM1 A; 2Q31 A; 1A5X A; 2VGM A; 1D8Y A; 4HUG A; 4L8R B; 4B9M A; 2R7Y A; 1A5V A; 4HWI A; 2O8E A; 2JLE A; 4CJV A; 3THY B; 1RTH A; 1K73 O; 4CJ4 A; 2OCE A; 1VQ8 N; 4DQS A; 1LW0 A; 4N56 A; 3L2U A; 1IBL K; 2E20 A; 3KD1 E; 4DR1 K; 2ZGY A; 1EKE A; 2E5L K; 3UKR B; 4CEB A; 4B1X B; 3DXK A; 3CJ1 A; 1G15 A; 3CQ8 A; 4LFA K; 1RDU A; 2WTU A; 3BUZ B; 2JGU A; 1Z25 A; 3P5J A; 4CHN A; 2JWK A; 1NKB A; 2VG6 A; 1P8Z A; 1WNS A; 2ZWH A; 3BGR A; 4LC9 B; 2YNG A; 4BR0 A; 4NXM K; 4X62 K; 1S72 N; 3KHY A; 3AA3 A; 3V4I A; 1NK8 A; 3D6R A; 4EP5 A; 4N41 A; 3LAM A; 4YOY A; 3EEQ A; 5AZJ B; 4DSI A; 1HR0 K; 2P51 A; 3LZI A; 3OBY A; 3CQY A; 4KO0 A; 4O44 A; 5A2Q O; 5HRN A; 1KVB A; 3HPG A; 1TV6 A; 1BIZ A; 3EE8 A; 3VEY A; 4W5R A; 3KK3 A; 3NHG A; 4DTR A; 3AVB A; 1TKX A; 3L2W A; 4DG1 A; 3AAR A; 5AQM A; 2CGL A; 3QBW A; 4W5O A; 3ZSQ A; 2QWM A; 3THY A; 4CZG A; 3M8S A; 3FFK B; 3ZSV A; 3U9Z A; 4B1V A; 4FL9 A; 1GLF O; 4JKB A; 4JKC A; 1ZC6 A; 3CQX A; 3UB5 A; 1X1P A; 3FGU A; 4CIG A; 4A2A A; 1W2B M; 2BDP A; 2WC9 A; 1NKE A; 3VQ4 A; 2W41 A; 3JYT A; 3CM6 A; 5AQH A; 2HHV A; 3E1Y A; 3WNF A; 2ETJ A; 4AM7 A; 3VQC A; 5EOY A; 4I6M A; 4E1M A; 3LDQ A; 3LDP A; 4JRQ A; 1IJJ A; 1NNE A; 2XY8 A; 3VGM A; 2H3G X; 4O55 A; 2KKZ A; 4BGA A; 5JVH L; 1ZBF A; 4KH4 A; 2E6M A; 3K5N A; 5CY4 A; 4BRF A; 4FYD A; 3CCL N; 3HJF A; 5AZJ A; 3HPO A; 5HBM A; 3VEO A; 3MAQ A; 4BR5 A; 2BE2 A; 3V9X A; 1N34 K; 1ZYQ A; 3ZX0 A; 3I8B A; 3OS1 A; 5FLX O; 1XHZ A; 2O8B B; 5CR4 A; 3IDH A; 4MFB A; 4GMJ B; 4IG3 A; 4M41 A; 4Y0W A; 4BE0 A; 1L5U A; 4WYB A; 3NF8 A; 2E8A A; 2NRW A; 4WE1 A; 5AJ3 K; 4FM1 A; 1S5J A; 1EWR A; 4N76 A; 1ZXO A; 4DU1 A; 3LPT A; 3VQ9 A; 1B9F A; 4DUY K; 1BI4 A; 3VGL A; 4ISG A; 5DM7 L; 1U47 A; 4DTU A; 1NK6 A; 3NH0 A; 3QNO A; 2UYT A; 3VQQ A; 1HKG A; 2ATQ A; 4BRE A; 3ULE B; 3M8R A; 4A5A A; 3J80 O; 4OGC A; 4FM0 A; 2P9K A; 1NJX A; 4JI3 K; 3V6D A; 1QQO A; 3GDQ A; 4H0X B; 1S9E A; 1BUP A; 4X64 K; 1SV5 A; 4K42 A; 4YOX A; 1NJI O; 4FXD A; 1VSL A; 2KFZ A; 2Z1G A; 4HCC A; 4BR7 A; 2IIR A; 1SKW A; 1T44 A; 1K8K B; 5HRR A; 4QS7 A; 3IS9 A; 3WNE A; 1HJR A; 3H1Q A; 5M1O A; 4HUE A; 3M3Z A; 2RPI A; 2IAJ A; 4B1U B; 5JLF A; 3F73 A; 5AR0 A; 4ISE A; 3VER A; 5BN8 A; 5J2P A; 1J54 A; 1W0H A; 5AQR A; 2IC3 A; 2I5J A; 3TTC A; 4V19 S; 1B92 A; 4JLH A; 5I9E B; 1KC8 O; 1XC3 A; 3NF7 A; 3AVM A; 4ID5 A; 3SMS A; 5ELZ A; 2RE2 A; 3RRG A; 3CPW M; 1NGE A; 4DKW A; 4B9U A; 3LAN A; 4PKG A; 1XMQ K; 2O8B A; 3SPZ A; 1RBU A; 2HF4 A; 1TKT A; 3UKU B; 3MN5 A; 5KPT A; 1LV5 A; 4FWO A; 3ZT4 A; 4JS4 A; 3U3Y A; 3UIQ A; 4OGE A; 1IG8 A; 1VQN N; 2NRX A; 4A62 A; 3CMA N; 4IKF A; 4A2B A; 1SAZ A; 1UOC A; 2KLA A; 4AHV A; 2QTD A; 4JV5 K; 4CZK A; 1KCF A; 1C0F A; 1VSH A; 4NLC A; 3VPZ A; 3DLL L; 4X65 K; 1MWK A; 3AO4 A; 4GVE A; 2DFH A; 1E4G T; 4CGJ A; 3BZK A; 4ZHR A; 4LF8 K; 2WON A; 4BAC A; 1Q82 O; 2FSN A; 2D0O A; 2Q0U A; 3H08 A; 4G1Q A; 3MXI A; 3PX6 A; 4JI6 K; 3MXJ A; 2KHO A; 4DLG A; 1RFQ A; 4FVM A; 3O9S A; 4FLW A; 1IG9 A; 1NMD A; 5EU7 A; 3HBT A; 3EZ5 A; 1IKY A; 4IFE A; 4BWJ A; 4CHQ A; 2Z1H A; 5ADX H; 3MCP A; 1OH5 A; 5AQS A; 2YJF A; 4DR2 K; 1BOT O; 4B3M K; 2EX3 A; 3EN9 A; 5J2M A; 1JCE A; 1SQK A; 1FJG K; 3MXM A; 4E1N A; 4B3R K; 2ZM6 K; 5KQD A; 5TKW A; 3V9W A; 4AF1 A; 2P9U A; 4PY5 A; 1NK5 A; 2WBN A; 3E66 A; 3UKU A; 1QSS A; 4ILG B; 1WSH A; 3G6E N; 4CZH A; 1HUX A; 5HL7 L; 4GV9 A; 3CM5 A; 3IMX A; 3OYH A; 4Z4F A; 3WUH A; 3ZT1 A; 2ZJR L; 3OVN A; 4CGG A; 5TKY A; 1RTJ A; 3HI0 A; 1QTM A; 1NBW A; 1XHX A; 3HRG A; 4KHN A; 1CLQ A; 2HND A; 3SV4 A; 2PYJ A; 2ZE2 A; 3D7E O; 3RRH A; 3MEE A; 1DTQ A; 3L3V A; 1MDU B; 4HVJ A; 3ATU A; 3VEX A; 4E7H A; 3MEG A; 2QWQ A; 4H0T B; 3ZSX A; 1HYV A; 5BPM A; 3ENB A; 4PKH A; 4I9Q A; 4YOW A; 5J2Q A; 4NLB A; 3SI6 A; 2E1Y A; 1KAY A; 1O13 A; 4BRL A; 3TTD A; 1RBT A; 2D0C A; 2D0A A; 3G4S N; 4RW4 A; 3CPE A; 4HUF A; 2D0P A; 1I94 K; 4DWI A; 3GBT A; 3P4I A; 4AHS A; 3OYD A; 4FJJ A; 1JLG A; 2UXC K; 3A0I X; 4YHH K; 4OPK A; 4M63 C; 3AGK A; 1HKB A; 3AO1 A; 1HNX K; 1TK0 A; 2WFB A; 3WT0 A; 4CEZ A; 2PZS A; 3HK2 A; 2I7N A; 4PQU A; 4JI8 K; 4LFC K; 4RCH A; 2XY5 A; 3RMA A; 1RIL A; 2GV9 A; 4IJN A; 4ELT A; 3ZX2 A; 2YKN A; 2P9I A; 2YNF A; 3CFP A; 4DSJ A; 3HPH A; 4XIU A; 4CW7 B; 2GTD A; 1RBS A; 1VSK A; 1LAV A; 4RW7 A; 2IVN A; 3C94 A; 1HJO A; 3QB0 A; 4DTN A; 2PAV A; 3THX B; 4JS5 A; 1FKP A; 4A59 A; 4YOR A; 3O1W A; 2PFU A; 1VSJ A; 3I8D A; 1U49 A; 3D2F B; 3VQ7 A; 1S6P A; 5FDL A; 3NBP A; 3KLE A; 1QQM A; 3DXM B; 4DQI A; 1IBK K; 4CF8 A; 2YNH A; 5BRF A; 5C0Y A; 3C6T A; 3LP2 A; 3ALY A; 2B5J A; 4Z4E A; 3PY8 A; 1LAW A; 5ADX A; 2OPP A; 5KGW A; 3CF5 L; 1RT4 A; 3NH1 A; 4CEA A; 2ZGZ A; 4DSL A; 2QKB A; 5KQ8 A; 1S6Q A; 5B8H A; 3J7A P; 1DT9 A; 1EXQ A; 3MMV A; 4C1N I; 4CFB A; 1BDG A; 4HTU A; 1Q9X A; 5KPR A; 2W6K A; 3O3H A; 2XO7 A; 5SWM A; 4FJX A; 3WNG A; 4CF2 A; 3A5O C; 3CJA A; 4GKJ K; 2QWN A; 4IG0 A; 4BRD A; 1EWQ A; 1U45 A; 1V4S A; 2P1J A; 3NF6 A; 3U9D A; 4M3Y A; 4QAG A; 5JLH A; 2OA8 A; 3LDL A; 4WQ5 C; 1XNQ K; 3TAP A; 2D5R A; 5M1P A; 4R79 A; 2G8W A; 3F2K A; 5KI6 A; 1ESV A; 3ENO A; 1NK4 A; 2V51 B; 2ZJQ L; 4DV7 K; 1JLB A; 1QQN A; 1DKG D; 1S1T A; 3MN6 A; 2O8E B; 3SUN A; 1VHX A; 1RDD A; 2KZM A; 1VQ5 N; 4IFV A; 5C42 A; 5KGX A; 3DLG A; 4CZE A; 2F9W A; 3P38 A; 4ICL A; 4YNQ A; 3ID6 A; 3HO1 A; 4CFD A; 5GAE P; 4FW2 A; 1MU2 A; 1U4B A; 1HPM A; 3ZSZ A; 1GLJ O; 5BRD A; 1T3V A; 4MLE A; 4H5V A; 4JK8 A; 1VQ6 N; 4CI6 A; 1FK9 A; 1IO2 A; 4DTP A; 4FWQ A; 5AQT A; 2P9S A; 1OH7 A; 3HP9 A; 4BRM A; 4A57 A; 3O4Q A; 4Z4G A; 2YNI A; 5FPE A; 1S1U A; 2A1R A; 4JI0 K; 4XEI A; 4BWM A; 3CYM A; 2Q1N A; 3MN7 A; 4Z94 A; 1ATR A; 3QIO A; 4DUZ K; 1RDB A; 3OYM A; 3NMU A; 1NJZ A; 1KQS M; 3O5B A; 3PX0 A; 3HSC A; 5KRS A; 5C2D A; 4CJP A; 1JXE A; 4AIL C; 3KKR A; 2RN2 A; 3QIC A; 5EVZ A; 1K8A O; 2D0B A; 5C12 A; 3OYG A; 3ZEU A; 3F9K A; 1HRH A; 4MLH A; 4JKE A; 1JJ2 M; 3RMD A; 3KJV A; 3CER A; 1HNI A; 2HHT A; 3HM9 A; 3VQE A; 3ASM A; 4FJG A; 2HHS A; 3SZ2 A; 4HHT A; 4H5W A; 1P90 A; 4B3S K; 3VF2 A; 4BC2 A; 1YAG A; 5BN9 A; 1T03 A; 3ZCM A; 2NLX A; 4PHT X; 1NK7 A; 4CEO A; 3E9O A; 2FXU A; 4W5N A; 1SKS A; 4GW6 A; 1WOQ A; 2FBX A; 1I39 A; 1TYQ A; 4CVN E; 3D2E B; 4M7Y A; 4XH1 A; 5M1Q A; 4BG8 A; 1YVN A; 1S1V A; 3DOK A; 4DTJ A; 2E1Z A; 4CJF A; 2UUB K; 1KRP A; 1KVC A; 4DR6 K; 1WBD A; 2VYP A; 4X66 K; 1LWE A; 4PUO A; 1DTT A; 3KLI A; 4I6M B; 3JS6 A; 4KI4 A; 1QHT A; 1TAQ A; 3AVG A; 3ZSO A; 1BCM A; 2YX6 A; 2PBD A; 1SS6 A; 4IWV A; 2W42 A; 1NJY A; 1Z05 A; 4PWD A; 1YT3 A; 3WXM B; 1HQE A; 4BRA A; 3CME N; 3BDP A; 4FLT A; 5AQG A; 3MWT A; 3SUQ A; 2XY7 A; 4C8O A; 2QXL A; 1KXP A; 3QET A; 1L3U A; 2E88 A; 2HHH K; 3TAB A; 2HOE A; 1X3N A; 2QK9 A; 1F21 A; 4CIE A; 3AA5 X; 3WNH A; 5LMN K; 3DRP A; 3DWL A; 3BF3 A; 4EZ6 A; 3QFP A; 4FLY A; 2F4V K; 4CCH A; 1XWL A; 3TAM A; 3VEN A; 1BA1 A; 4ZTF A; 1BI4 B; 4JI7 K; 1WSJ A; 3LP3 A; 4FJ9 A; 4BC4 A; 4FJ7 A; 2VWJ A; 3O9T A; 5C10 A; 4KB1 A; 4OLA A; 4IJA A; 3O4N A; 2P5G A; 1CZ9 A; 3R3L A; 3HP6 A; 4JHD B; 2P9K B; 5GAD P; 3D2E A; 4BC5 A; 3S3M A; 3ZSW A; 1GLL O; 1NGA A; 3OTO K; 2HMP A; 1UWB A; 4BC3 A; 3CET A; 3G0Z A; 1NJW A; 1N5Y A; 4CZJ A; 3FZK A; 2OPS A; 3RTV A; 4EZ9 A; 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4KHS A; 5BRE A; 3P31 A; 4WFB L; 1NGI A; 3S41 A; 3JXU A; 3G25 A; 2IVO A; 4OVL A; 5BPN A; 4WQ4 C; 1VSI A; 3L0Q A; 1TK5 A; 1Q8I A; 3U6F A; 4N5S A; 1RT1 A; 5AQW A; 4BR9 A; 4DQP A; 3C0B A; 3LDN A; 4OPH A; 1BA0 A; 3EE9 A; 4PL8 A; 1L3V A; 1WN7 A; 2FSK A; 4KH5 A; 1VQ9 N; 1TVR A; 2P9U B; 4IDK A; 1BQN A; 2UXD K; 3NGI A; 2A1S A; 1CXU A; 3VQP A; 5MLC Q; 1IKW A; 4JKG A; 4E7L A; 1Z6R A; 3EKU A; 5AFU H; 3VQ6 A; 3MEC A; 5LMU K; 4O4G A; 3VES A; 3TAE A; 3L2R A; 2HMI A; 3FFI A; 4FPB A; 2YV0 X; 5HP1 A; 1YTA A; 3QEW A; 2KZZ A; 2BH1 A; 1XI1 A; 1ZBU A; 4QS8 A; 4B1Z A; 3PLA A; 3SK3 A; 3P83 D; 4FJN A; 4BRC A; 1TKD A; 3N4P A; 1ATN A; 4YDU C; 1O1W A; 1LCU A; 4FK2 A; 2IDO A; 4IOA L; 1RT6 A; 3G71 N; 3J7Y P; 1N8R O; 4FJ5 A; 2BTF A; 2YHY A; 4B9T A; 1X3M A; 4R5P A; 3NAE A; 3K2P A; 4Z4H A; 2DFE A; 3UE5 A; 4CEQ A; 3A2F A; 4O8K A; 3GE1 A; 3F9M A; 5F1X A; 1GOB A; 3DOL A; 1TGO A; 3E01 A; 3CJC A; 1C0G A; 2VG7 A; 1HPZ A; 4BE2 A; 3CC7 N; 4FJL A; 1TL1 A; 5CHI A; 2Q3S A; 5FPM A; 4KPY A; 2YHA A; 3LDO A; 3V1O A; 1ASW A; 4RW8 A; 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