4HTUA

Structure of 5-chlorouracil modified a:u base pair
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
EEIIWESLSVDVGSQGNPGIVEYKGVDTKTGEVLFEREPIPIGTNNMGEFLAIVHGLRYLKERNSRKPIYSNSQTAIKWVKDKKAKSTLVRNEETALIWKLVDEAEEWLNTHTYETPILKWQTDKWGEIKADYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
source organism Bacillus halodurans
publication title Structure, stability and function of 5-chlorouracil modified A:U and G:U base pairs.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease H
total genus 43
structure length 134
sequence length 134
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2012-11-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4htuA00
4FJKA 4C8LA 4E0DA 2E6MA 1UWBA 4CHZA 3L2VA 1W9HA 1UA0A 1RNHA 3ZSYA 3AVNA 3RTVA 1WSIA 2D0AA 2HNDA 3QEPA 4FJ8A 4M3XA 1L3UA 1NK5A 2EHGA 3NF8A 5DK5A 4E7KA 4NCAA 1HPZA 5J1EA 3S3NA 1RBTA 2A1RA 2YHBA 2XRIA 3WNEA 2OYQA 1WSHA 3CFOA 4F3TA 1A5WA 2W42A 3ISNC 3B6OA 3O4QA 1SUQA 3LAMA 1IKVA 2ETJA 4CFBA 5C24A 4OLBA 2QK9A 3DYAA 1J5OA 1B9DA 4NYNA 1DLOA 4DTJA 2HHSA 4KRFA 4N76A 3M8QA 3KD1E 3OS2A 4B8CA 4J2AA 3L2UA 1LW0A 1S6PA 3RRGA 1SL0A 3AVKA 3L3VA 4FVMA 2QKBA 4FLZA 3SYZA 3KJVA 5CYQA 3M8RA 4B9TA 3KKRA 1KLNA 3V4IA 4CESA 1QSYA 3RWUA 4DSFA 3RR8A 3HO1A 3HYFA 3BDPA 3MEEA 1DTQA 5HBMA 3HSTB 5SZTA 1WSJA 4ELTA 2DFEA 3AVLA 4CJQA 4CJSA 3OYKA 4FJLA 4LH5A 1TL1A 1A5VA 3T1AA 3ZSRA 4BDZA 4FW2A 1LWFA 1KRPA 3P1GA 4BWJA 4LH4A 4OPKA 3V9SA 1TKZA 3QETA 3TAEA 1SL2A 1Q9YA 1Z25A 2YV0X 4CK3A 1RDAA 1KSPA 3VQ8A 4KAZA 3I0RA 2HHXA 5D3GA 3MXMA 3IG1A 4FYDA 2ITGA 3AA4A 1VSKA 3LPTA 5JS2A 1IO2A 1C0TA 2B4JA 3IRXA 4AHCA 4CGIA 2ATQA 4CJTA 3K5MA 5I42A 4C8KA 1QS4A 4FZXC 3AA2A 3OJUA 4DTUA 3QNNA 3OS1A 4M3UA 1Q9XA 4DSIA 4F4KA 3MECA 3LP2A 4B9UA 1U47A 4FJNA 4DQQA 3IAYA 4FLWA 3H08A 4FLXA 4EP5A 2XY5A 4DU1A 4KTQA 4M3RA 4OKEA 4KHWA 1QSLA 4CJVA 3MEGA 1T03A 3WNFA 1SKWA 4FZYA 1TL3A 5HRNA 3TAQA 2DY4A 5JS1A 1S9GA 4HUFA 4C8NA 3AVGA 1EP4A 2OPQA 4HTUA 1RILA 2E4LA 4KKOA 3HVRA 1N5YA 2PZSA 4IDKA 3TAFA 1RBSA 4M3ZA 3NFAA 4QOZB 4HUEA 3TARA 1HJRA 1LAVA 4KTZA 1BI4B 3RMCA 4FK2A 2IC3A 4BE2A 3CYMA 3NGIA 1ASVA 5KGWA 1HNVA 3NGZA 1JL2A 4DTSA 2YNHA 3KLHA 1U45A 4OPJA 5EU7A 2D0CA 1Y97A 4OGCA 5T7BA 1X9MA 4DTPA 3HK2A 1TKDA 4DMNA 1VK0A 4CHPA 3K58A 1HRHA 2BDPA 3VQ6A 2ZD1A 4CJ4A 4JRPA 1U4BA 3KD5E 1X9SA 4FJMA 3VQBA 4KREA 4CJ5A 3HPGA 5CY4A 4FM2A 3V9WA 5J2PA 2FC0A 2VWJA 4KPYA 3SUQA 3O4NA 3LPUA 2DFFA 2HMIA 4I2QA 3QEVA 1X1PA 2O4IA 2G8VA 4OKJA 3CM5A 1LWEA 4E3SA 1BCOA 4KHQA 3DRPA 3VQAA 3RMBA 2G8HA 4L8RB 1VSJA 3OYGA 3DI6A 4FM1A 3LWLA 5C42A 2BGGA 3QEXA 3L8BA 4RG8A 4KO0A 3OYCA 2OA8A 1J54A 1SV5A 4Y1DA 4B3OA 2RKIA 1L3VA 1FK9A 4FJHA 4KHUA 2Z1GA 4E1NA 3NHGA 4CJUA 2DFHA 4KHYA 4ELUA 1U04A 4I2PA 4CF8A 3SZ2A 3SQ2A 1QQCA 4TSXA 1S1UA 1JLFA 2RN2A 4CJEA 4M3WA 4CGHA 1TKXA 2KW4A 3WNHA 4EZ6A 4CE9A 4DQIA 3LP3A 4DU4A 3AO5A 4Z4EA 1RT5A 4CGDA 1BQMA 2WONA 1VSIA 3AO3A 4R5PA 3D0PA 2D5RA 3QEWA 3ZSZA 3AVJA 4CIGA 3AVIA 4O5BA 3SV4A 4W5OA 4AHRA 1NJXA 3M8PA 2HHTA 1RTIA 4AH9A 5CYMA 2XY7A 1UA1A 4CJWA 1C1BA 4Z4GA 4RW6A 1EXQA 4JLHA 4FLTA 3SUOA 3SI6A 4KHSA 1BISA 1CZ9A 3LZJA 1QE1A 1UOCA 4DS5A 1KTQA 2HB5A 2FBTA 3VQEA 3PX0A 4YNQA 4C8OA 2VG6A 4KHNA 1HYSA 4FJ9A 1CXQA 3MEDA 1LV5A 3OYLA 4FK0A 2IAJA 3TWHA 4H4MA 3OYHA 1SKRA 4LY7A 4FM0A 1S1WA 2GBZA 3VQ4A 1U48A 2YNFA 4KV8A 4HCBA 1WAFA 3QINA 3L2RA 3V6DA 3S3MA 1EETA 3U3YA 4KB0A 2HHWA 4I7FA 4CF2A 3L2WA 1VSLA 1BIZA 3LALA 4Y1CA 4AHVA 2XO7A 3V1QA 3MXIA 1RCHA 4FLUA 4KTWA 2P5OA 4CIFA 3NH0A 3AA3A 4Z0UA 4CEZA 4CJPA 3OYBA 3V1RA 2HHUA 4F2RA 2KFZA 4DWIA 1NK6A 1QSSA 4BDPA 4ID1A 2HVIA 2X78A 5J2NA 2EX3A 4FW1A 2PYLA 3DRSA 5KRTA 1TAQA 2G8KA 3O3FA 4M41A 1BQNA 1CXUA 4DQSA 3L3UA 4W5RA 3OY9A 3NE6A 4DSJA 4F3OA 3RMAA 1NKCA 1BGXT 1QHTA 3OYDA 3D45A 3G0ZA 2XY6A 4CF9A 5J2MA 3ASMA 3SQ4A 1WSEA 1NK9A 4OLAA 2YNGA 1C0MA 1BCMA 4O55A 4BDYA 1Q8IA 2IGIA 2KTQA 2KZMA 1T8EA 5KRSA 1MU2A 1WSFA 2FBVA 5HLFA 3V81A 4Z4HA 4H8KA 4JS5A 4I9QA 3DLEA 3ULDA 3EY1A 1RTJA 4F8RA 1RBRA 4E19A 4E1MA 1K6YA 1LAWA 1S1XA 3LZIA 4DLGA 3KLEA 2Z1IA 3I8DA 1RDBA 4CEAA 4HUGA 3KLIA 1JLCA 1XHXA 2P51A 4AHUA 1GOBA 4DSLA 3PX4A 3HP6A 3P83D 1W0HA 1ZBHA 3O3HA 3F9KA 3QESA 1NJZA 2Q3SA 2KFNA 1JXEA 3K57A 1L3TA 3M8SA 3ZT4A 1C1CA 1DTTA 4UQGA 3DLGA 4CK2A 4DTOA 4KFBA 3SNNA 3AVBA 1XWLA 1S1VA 3ZSOA 3OYJA 1L3SA 4FCYA 3TAMA 1LW2A 5KI6A 4DSKA 3DLHA 4CJFA 2RF2A 4O4GA 4F2SA 2OPPA 1A5XA 1BIUA 4CF1A 3QNOA 1JLEA 4RW8A 3ZT0A 1NKBA 1ZBIA 4CJ3A 2P5GA 4W5TA 2IOCA 4DQRA 4J2EA 1WLJA 3OYIA 2HVHA 4DTXA 4YFUA 1TK5A 4E7HA 1KVAA 2FBXA 3AA5X 4M3TA 2RPIA 3MAQA 3RRHA 5I3UA 4N47A 5FROA 1TAUA 2BE2A 1HQEA 3KIOA 1KFDA 4BACA 2JGUA 3VA3A 1JLBA 1JXBA 3LAKA 4LSNA 3ZSVA 1ASUA 3QERA 2YKMA 1GOCA 4DTMA 3IS9A 4NYFA 3KLFA 4CFDA 1F21A 1IH7A 4HVJA 1WSGA 2HNYA 3ZSWA 3HJFA 4GW6A 4RW9A 5KGXA 3AO4A 4J2BA 4J2DA 3AVCA 4FLYA 4CK1A 3FFIA 3VQDA 5E41A 3E01A 2X74A 3THVA 3L2QA 4PWDA 3P5JA 3QLHA 4B8AB 5HRPA 2IDOA 3OYMA 3C95A 4CEEA 2B5JA 2E6LA 4XIUA 4M3YA 4Z4FA 3LWMA 1UAXA 3SUNA 4DLEA 3AVHA 3V1OA 5FRMA 2Z1JA 2XHBA 1J9AA 1WAJA 4IG3A 4W5QA 1YVUA 4CJLA 1NJYA 5KTQA 2G8FA 1EKEA 1J53A 1YTAA 2YNIA 3NBPA 3CFRA 3K5OA 3DLBA 4O0IA 4I9LA 1KVCA 3SPYA 3HL8A 2ZQBA 4IBNA 3SV3A 3QEIA 4CECA 1JKHA 2NUBA 1VSEA 3NDKA 3NCIA 2PY5A 4CFCA 1JLGA 2ZE2A 2G8UA 2Y1JA 4B9VA 4FZZA 4M42A 4Q0BA 1HYVA 3OYEA 3QO9A 4CGGA 4IG0A 1VRTA 2X6SA 4DFPA 4FJGA 1D5AA 3S3OA 1NJWA 2GUIA 2I5JA 1TKTA 3VQ9A 1IKXA 4G1QA 4AHTA 4B9NA 3PX6A 4DQPA 3I0SA 1I3AA 1G15A 4LSLA 4DU3A 4DF8A 4ZTJA 1L5UA 3AV9A 4CEQA 2P1JA 3LDSA 1RDDA 3PO4A 4IFYA 4NCGA 4CJKA 3ZSXA 3TAPA 5HRSA 1LWCA 4CJRA 3JSMA 4K8ZA 4QAGA 4CEDA 4ZTFA 4EP4A 3NAEA 1TK8A 4EZ9A 4H4OA 1TGOA 4O0JA 4CGJA 3SCXA 4Q5VA 1JLAA 2VWKA 4GVMA 4CHNA 3K2PA 2Z1HA 2AJQA 4JRQA 1ZBUA 3K5NA 4ZHRA 3LANA 4OVLA 1BHLA 3ITHA 4K8XA 1XHZA 5C25A 3ALYA 4B08A 3HPHA 4M45A 3PV8A 4RW4A 5SWMA 1SKSA 4E7LA 2KQ2A 1C0UA 3KK2A 1B9FA 1ZYQA 1TV6A 1NKEA 3CG7A 4CGFA 3HP9A 2G8WA 2PYJA 4HHTA 2WOMA 3NF6A 3V9XA 3U6FA 3KK1A 1U49A 5K14A 2IS3A 4CIEA 4FJIA 3MXJA 1T7PA 4PA1A 4ICLA 1SL1A 4KI4A 5FRNA 2VG7A 4MFBA 3NH2A 3CQ8A 5DMRA 2GV9A 1FKOA 1KCFA 5HRRA 1CZBA 4CERA 2LSNA 3DM2A 4B9MA 2D0BA 4CHYA 2KZZA 3V9UA 3HVTA 1NK8A 3KTQA 3VQ5A 2F8SA 1VSFA 4DF4A 4BE0A 5CZ2A 4AHSA 4DFJA 1NK4A 2QKKA 3VA0A 1I39A 3B6PA 4E7JA 2HNZA 1RBVA 1O1WA 4OGEA 3HM9A 1D8YA 4OJRA 4MQ3A 3AVAA 1ASWA 1IG9A 1HQUA 1S6QA 1JLQA 2B6AA 2XY8A 4DFMA 1HNIA 4CHOA 4ELVA 1Z26A 1RT6A 2VG5A 3OVNA 3VQCA 3QIOA 1YT3A 2QXFA 1S1TA 3DOKA 3OYAA 1HYZA 3DLRA 4N56A 4DFKA 1NOZA 4FJJA 3ZSQA 3T3FA 2O4GA 3OJSA 3NH1A 4W5NA 4CF0A 1IKYA 3CFPA 1EX4A 1T05A 2F8TA 4PY5A 3VN5A 1ZBFA 4Z4IA 3TR8A 5FDLA 5CZ1A 1S9EA 1JL1A 3KKSA 4BWMA 2YHAA 4CFAA 4AILC 2X6NA 3RMDA 3SJJA 1XI1A 4CEFA 4FXDA 4LD0A 3JYTA 3F73A 3PO5A 2DTUA 3K59A 3BGRA 4KB1A 3RR7A 3K5LA 1TVRA 2YKNA 3NGYA 1ITGA 1REVA 3AO2A 2R7YA 1C1AA 3KLGA 3UIQA 4CEOA 2HHVA 1RBUA 1FKPA 1VRUA 2OPSA 4ID5A 3DOLA 3V9ZA 4PUOA 4CEBA 3ZT2A 3HPOA 1NK7A 3HT3A 4FJXA 2HW3A 4QCLA 3VQPA 1ZBLA 4E89A 3SQ1A 3C6TA 1VSMA 3U3GA 2BANA 3AO1A 1R0AA 5J2QA 3OYNA 1RTDA 2HHQA 1TK0A 1VSDA 3ZT1A 2JLEA 3TANA 4DTNA 4N5SA 1RT1A 1NOYA 4FJ5A 1KFSA 1FXXA 1GOAA 1WN7A 4DS4A 3VQ7A 3O3GA 4CCHA 4NCBA 1RTHA 1BI4A 4PQUA 1WNSA 3LP0A 3PUFA 2Y1IA 2F96A 4FJ7A 3OYFA 2OPRA 3TABA 2A1SA 4B9SA 3LP1A 4WE1A 2OZSA 3NF9A 3WNGA 3EYZA 4E7IA 2FBYA 3DMJA 4N41A 1YTUA 4GMJB 1N6QA 1RT3A 3ZCMA 3A2FA 3SPZA 3C6UA 3TAGA 4Z4CA 1D9DA 4O44A 1D9FA 4B9LA 4FK4A 4HCCA 3ZT3A 4FLVA 3CM6A 3VQQA 3SQ0A 3DLKA 3QIPA 3S9HA 1QTMA 2OZMA 4OKKA 3SUPA 1NK0A 1RT7A 4IKFA 1RT4A 3DRRA 5HROA 1S5JA 3PY8A 4DSEA 1IKWA 1VSHA 4DTRA 1C6VA 4IFVA 3AVMA 1XC9A 4BE1A 1BL3A 3HXMA 4JS4A 1RT2A 4C8MA 3AVFA 1RDCA 3T19A 3TI0A 1X9WA 1HMVA 3KK3A 4RW7A 4CHQA 5HP1A 4DG1A 3NF7A 3OS0A 2G8IA 3G10A 1KVBA 3EZ5A 4KI6A 1B92A 1KLMA 1CLQA 3C94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UWBA 3O80A 3CCRN 2D0AA 4L3QA 4FJ8A 3I8BA 2ZWHA 2EHGA 3NF8A 1HPZA 3S3NA 3WNEA 3CFOA 3CCJN 4F3TA 2W42A 4BRQA 4CFBA 1SUQA 2ETJA 5C24A 4RWTA 5GADP 4XH1A 1WBBA 4BQZA 1B9DA 2P9IA 4JEPA 2HHSA 4N76A 2P9LB 5ELZA 4J2AA 4H0YB 3L2UA 1LW0A 4FVMA 1HNXK 3SYZA 3WXMB 3O08A 1KLNA 1QSYA 4DSFA 4UY8O 4ELTA 4CJQA 1ILYA 3GOIA 1KRPA 2YX6A 3TAEA 4DV6K 1SL2A 1NGAA 2E88A 4KAZA 3I0RA 3IG1A 2WUSA 1VSKA 3SBGA 2FSJA 4AHCA 3D7EO 4CJTA 4L8RB 4DHYA 3AA2A 4M3UA 4F4KA 3OTOK 4KTQA 2V52B 3BF3A 2CGLA 1VQ6N 1T03A 1SKWA 3TAQA 4R79A 5DM6L 1S9GA 3AVGA 4HTUA 4BREA 2PZSA 4KKOA 3HVRA 5JMVA 4JNEA 1RBSA 2A5XA 3VEYA 4BRLA 4HUEA 3TARA 2BTFA 2YJEA 1FW6A 4DCHA 2V7ZA 3MN9A 4FK2A 4WQ4C 2IC3A 4ILGB 4JI7K 5ADXA 3CXCM 2YNHA 4OPJA 3M3ZA 3P31A 3C65A 5EU7A 2W6KA 4MDAA 1NNEA 4DTPA 3E9LA 2NRHA 4DMNA 2CGKA 4CJ4A 4FJMA 1U4BA 3KD5E 1X9SA 3TTFA 4M7YA 2P9PA 3GDQA 1KC8O 3SUQA 2HMIA 3MN6A 4I2QA 5FPDA 2UYTA 3WXLA 2P9KA 2NRXA 5IWAK 4FM1A 5C42A 4BG8A 2BGGA 4RG8A 3TSQA 2OA8A 3DJCA 1J54A 2YHWA 3E1YA 2RKIA 4Y1DA 3VEVA 4FJHA 4KHUA 1GLFO 4IOCL 4E1NA 1X9JA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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