2P9NA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
415
structure length
397
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
molecule keywords Actin-like protein 3
total genus 123
structure length 397
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9nA03
5AQUA 3M3ZA 5AQTA 3VENA 4H0YB 4FOIA 5JLFA 4FWNA 3VEZA 1GLBG 2P9PA 3RSEB 4FL9A 1WOQA 1OKJA 4MLHA 4BROA 3LDLA 5BPLA 4FWQA 1S22A 3O6WA 1ATNA 4BRKA 3SLCA 4FWMA 3D2EA 4XH5A 3ZETA 3FR0A 4BR4A 2YCHA 2A42A 3QBWA 1HKGA 1NM1A 3A5MC 3W3DA 3I33A 4DHYA 3WEEB 1ATRA 4FOEA 3QICA 3SMSA 5AFUA 1HLUA 2YHWA 5AQHA 4BGBA 3AY9A 5BR9A 3VEYA 1V4SA 3R9PA 3SMPA 4PKHA 4HTLA 4CZLA 2V7ZA 3VF6A 5KQDA 1H1VA 1S3XA 1GLLO 1BG3A 4H5RA 4DCHA 3ENHA 4A62A 3R8EA 1XC3A 3LDNA 2NLXA 1NGHA 3S41A 3LDPA 2F9WA 3MMVA 2BUPA 2V7YA 3QB0A 4PL8A 1SQKA 1LOTB 1D4XA 4BRCA 3FZLA 5BRDA 3UB5A 4FWSA 1HUXA 1IG8A 2YHXA 1TUYA 2FSJA 5BREA 4CZGA 1U2VA 5AZJA 5AQWA 3BEXA 3FZFA 4H0VB 4NO7A 3FLCO 4CZEA 2Q0RA 2QWQA 4A2BA 3AAPA 1NGEA 3CJCA 4CZMA 4IO8A 1KXPA 2P9SB 3H3NO 3H46O 1RFQA 1QQMA 3IMXA 4E1JA 3BF3A 4CBXA 3O80A 4BVPA 3CQYA 3G25A 1C0FA 3HSCA 4BREA 1EQYA 4FO0A 3GBTA 3O1BA 3WXIA 4Z94A 4CZKA 4H0XB 5LJVA 3GE1A 5BN8A 1Q18A 3DXMB 2P9LB 5EY4A 3VGMA 1QZ5A 3QDKA 3MCPA 4RTFD 3H45C 4BR7A 1X9JA 1K8KB 1ZBSA 3SJHA 3BF1A 4CJ7A 3P4IA 3RSEA 4RCHA 5AZIB 3IUCA 1NGIA 1YVNA 4FWRA 3J8AA 3EKUA 5BRHA 5AQVA 2V52B 1T44A 2Q97A 3CHWA 2A6AA 3EZWA 4IJNA 4ISGA 5AQOA 5AQMA 3H1VX 3LL3A 3HM8A 4EIAA 5FPEA 4WQ5C 2WUSA 4BRNA 4BRPA 4DQ8A 3AAQA 5EOYA 5KPRA 4BRDA 4CD1A 2IIRA 3ZX0A 1SZ2A 1NGDA 3UKUB 3TPQA 1HKCA 4BR0A 5ADXA 1BOTO 2E20A 3WEEA 5BN9A 4BRFA 3VPZA 1P8ZA 3WQTA 3B8AX 1QHAA 5EXWA 2ZGZA 3HZ6A 3VERA 2Q2RA 3VGLA 3KHYA 3D2FB 3VESA 2HMPA 3OHRA 5AQIA 1YXQA 3ZX2A 5B8HA 1BDGA 1XUPO 3CIPA 4M7YA 3ZEUB 1XQSC 2I7PA 1YUWA 4O8KA 4EHTA 5AQSA 5AQZA 4BG9A 2ASMA 1MWKA 1GLAG 3H6EA 4H0OA 2BTFA 2AA4A 4QS8A 2D4WA 4H5TA 3KZBA 4MO4A 3ID8A 3QFPA 4WQ4A 2E2PA 4B1XB 4XH1A 3O5BA 1BO5O 3CI5A 4ISFA 4BVOA 1X3NA 2DPNA 2QW9A 3GDQA 3GL1A 3ULEB 1MA9B 3DWLA 4L3QA 1KAXA 5KQ8A 2GEMA 2HF4A 4CBUA 5BPMA 2V51B 4H5WA 3DXKB 4BC4A 1NGJA 2P9SA 3EO3A 2NRHA 1NGFA 2PBDA 3EL2A 3CQXA 4EHUA 1Z05A 2E2OA 3O8MA 4K41A 3ZX3A 5AQQA 5AFUH 5FPMA 4H0TB 1GLFO 2QWLA 3CETA 4IWVA 4WQ5A 3DXMA 1QZ6A 2P9LA 2VYPA 1E4GT 3BP8A 3A5OC 2P9NB 2A40A 1K8KA 2FXUA 1BA0A 4BQZA 1DKGD 1JCGA 2E88A 2GUPA 5AZIA 3FGUA 3H3OB 3L0QA 3O08A 3EN9A 4FPBA 1NLVA 3LM9A 2FSKA 2F9TA 5I9EB 3H1QA 3R6MA 3UE5A 4XH4A 1HKBA 3MN7A 2ZGYA 3IFRA 5F0XA 3VF4A 3UKUA 4Y0WA 3DJCA 4PKIA 4K25A 3VGKA 1IJJA 2CGJA 2E1ZA 3L6QA 2QWNA 3FFKB 1KAZA 3CERA 4WQ4C 1NGAA 1TYQB 2GWJA 5JLHA 5AQRA 2EWSA 3CJ7A 1U6ZA 2P9KB 1WUAA 3D2FA 4B1VA 2QWRA 5AQYA 4M63C 2W41A 3U4LA 2ZWHA 3WQUA 3VEWA 3ZEUA 2CGKA 4B1UB 4JHDB 2A5XA 3MN9A 4CZHA 1HX1A 3HTVA 5BRFA 4QS9A 1YAGA 4BQLA 2ASOA 2CGLA 2D1KA 4B9QA 2Q0UA 4DB3A 4BRLA 2Q36A 1NGBA 4JD2B 4BRAA 2QWPA 4A2AA 3O1WA 4WYBA 5BPNA 1NGCA 4AM6A 4BRMA 4IXCA 2YJEA 4H5NA 4IJAA 3ULEA 4AM7A 2A41A 5AQJA 3VEVA 4BRHA 3MN6A 5ADXH 1C0GA 2QWOA 3DXKA 3F9MA 1JCEA 5AQLA 4FWOA 3W0LA 1HJOA 4PL7A 3MN5A 2IVOA 5AQPA 1ZXOA 1NMDA 2A3ZA 3O4WA 4K42A 2P9IB 3M6GA 2GELA 3ENOA 4CD3A 2UYTA 2QM1A 3M1FA 3LDOA 5AQGA 4BC5A 1G99A 4BGAA 4BRIA 1GLEG 1V4TA 1NWKA 2P9UB 2P9NA 4F9OA 3D7EO 3VETA 5AQFA 5FPNA 4MO5A 3BUZB 3LM2A 1LCUA 5F1XA 4EAHD 3GOIA 2YHYA 4HWIA 1GLJO 3LDQA 1BU6O 2H3GX 3UKRB 1CZAN 1MDUB 4IZ9A 4PKGA 4H5VA 3WXJA 4J8FA 4BR5A 3A0IX 4JNEA 3GG4A 4B1YB 5AQKA 3JS6A 3CJ1A 4B1WB 5AQNA 4MLEA 5E26A 1GLDG 3CJBA 2AP1A 3EKSA 2FSNA 4LC9B 2QXLA 3VOVA 2CH5A 3KVGA 1DGKN 3FZMA 3SK3A 1TYQA 4NB4A 2VWBA 2GTDA 1DEJA 1ZC6A 2P9KA 3JXUA 2Q31A 4FSVA 5TKYA 1R59O 2KHOA 2FF3B 4EFHA 4BC2A 3WXKA 4RWTA 3WT0A 1BA1A 3CJ9A 4I6MB 2ITMA 3FZHA 3QFUA 2D0OA 4JHDA 3WXLA 2NZTA 4YDUC 3U8XA 4BRQA 2E8AA 3I8BA 4CBWA 2YJFA 4BRGA 2P9PB 3C0BA 4QS7A 1BWFO 5E84A 1RGIA 3QMLA 1ESVA 5F2RA 4JD2A 4C23A 3A8YA 4A61A 3WUHA 3MK6A 1QQNA 3HBTA 1ATSA 2YI1A 5AQXA 1J6ZA 2PAVA 3D2EB 3ZETB 3VEXA 4JAXA 2D0PA 5JMVA 3ATVA 5ELZA 2HF3A 2W40A 1NBWA 5LJWA 1KAYA 3C7NA 3VF2A 2E2QA 1MWMA 2GWKA 4BR2A 2J4RA 1SAZA 1X3MA 2VCPA 3AARA 2QWMA 3L4IA 2P9IA 4O5FA 2I7NA 5CE3A 3U9DA 4JN4A 1RDWX 3VEOA 3FE1A 5KPTA 4BC3A 3MDQA 2P9UA 4BG8A 2E2NA 3DAWA 4H0PA 3ATUA 3HI0A 2FLOA 3A5NC 2OANA 4XEIA 2IVNA 3U9ZA 3IDHA 5AR0A 4CZJA 3UKRA 5JICA 3FZKA 4B1ZA 4ISEA 2Q1NA 4FWLA 1Z6RA 4GNIA 2ASPA 4FWPA 1U2VB 4M7XA 5AZJB 3C7NB 4YDUA 1GLCG 4FWKA 3CJAA 3TU5A 2E1YA 5LY3A 2HOEA 2IVPA 5FPDA 4CZFA 4GY2B 5KPZA 4CZIA 4K43A 1HPMA 1NGGA 4KBOA 4CI6A 1E4FT 1TUUA 4BR9A 1JCFA 1BUPA 2CH6A 1Y64A 2ZF5O 5EX5A 1T6DA 3QBXA 1T6CA 4I6MA 4H03B 1QQOA 3A5LC 2FF6A 5EVZA 4FPAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JVGL 2VG6A 5H1SQ 5AQTA 4FOIA 3T1AA 1D5AA 4BE0A 5GINA 2HVIA 1WOQA 2HNZA 4NYNA 3DM2A 4FWQA 3THXA 2NNWA 1S22A 1VSIA 3O6WA 4W5NA 3P1GA 4C8MA 4CJUA 2BANA 4G1QA 3OJUA 3QBWA 1HKGA 1BIZA 3W3DA 3WEEB 4FOEA 2IC3A 4CGGA 2VGNA 4CGHA 5BR8K 2YHWA 1HPZA 5CR4A 5AQHA 4YY3K 2QK9A 3AY9A 4B9SA 1VSKA 2DFHA 4PUOA 4FJ5A 4PKHA 2V7ZA 1GLLO 3O3GA 2O8FA 1BG3A 4DSLA 2RN2A 3NCIA 1XC3A 3VQ6A 1CZBA 1WB9A 2NLXA 1ZBLA 4NCBA 3MMVA 3QB0A 1LOTB 4DQRA 2G8FA 4FWSA 1HUXA 1B9FA 4AF1A 5BREA 4JKGB 3KK7A 1GOAA 4CHQA 3V1RA 1R0AA 4I7FA 1XNRK 4IG0A 4DUYK 4YHHK 2QWQA 4H8KA 1P90A 4CZMA 4IO8A 4B08A 1KXPA 1VRTA 3HOSA 3H46O 4CHPA 4E1JA 3G25A 4FJIA 4BREA 1EQYA 3O1BA 3ID6A 5LJVA 3GE1A 4GVMA 4XIUA 1VSJA 2KLAA 3VGMA 1NJXA 1MU2A 3SAGA 2BDPA 1XWLA 1K8KB 1ZBSA 5FDLA 1HNWK 1NK6A 4B3TK 5C42A 2IS3A 1TL3A 3P4IA 3A2FA 3IKMA 4FK0A 1OH6A 4HUFA 5BRHA 2V52B 5FRNA 3CHWA 2A6AA 2FBYA 4IJNA 4WFNL 4CGIA 2E6LA 1WSIA 1RBVA 2HMIA 1HYSA 2P51A 4DQ8A 1WAFA 4JKHA 4CD1A 3ZSQA 3O9RA 1RT5A 3KLHA 3M8SA 2Y1JA 1HKCA 1P8ZA 3QNNA 3IG1A 3THYB 3PUFA 1QHAA 3V9UA 5EXWA 3HZ6A 2WOMA 1D9DA 4I2QA 3CCVN 1OH8A 4KV8A 3TAEA 3ZX2A 3ZYYX 1BL3A 3HPOA 2GV9A 1XUPO 3CIPA 2HHIA 1OVQA 3NGYA 1LWEA 4ELUA 4WCEL 2O8BA 1EO1A 2WFBA 4CFBA 5AQZA 2ASMA 3ZSOA 4CW7B 2BTFA 4JI8K 3LAKA 1XI1A 4BECA 1W97L 3OY9A 1BO5O 1HMVA 3S3OA 2DPNA 3Q7CA 3AO4A 3PIOL 4Z4IA 2KQ2A 3HSTB 5KQ8A 1RCHA 2HHSA 1S9GA 3KLFA 1KLNA 3DXKB 3EO3A 4O5BA 3EY1A 4BDPA 1Z05A 4PWDA 5AFUH 3O3HA 4LFCK 3AV9A 1YTUA 3CETA 4IWVA 3SYZA 3E66A 4DR4K 2P9LA 2YHBA 5M1FA 3FFIA 1E4GT 4H4OA 3A5OC 2XY8A 2A40A 3TABA 4O8UA 4BQZA 4E1MA 4B9NA 2ZJRL 1EP4A 1RT2A 3QNOA 5LMNK 5HLFA 1JXBA 3P39A 4QAGA 4HUEA 2OYQA 4DFPA 3L0QA 3LPTA 2Q3SA 3H1QA 2ZJQL 3HT3A 4FJKA 3D45A 3OYBA 4E7IA 3IFRA 2YV0X 5F0XA 1S1XA 4Y0WA 2ZJPL 3DJCA 4K25A 3VGKA 3O4NA 2CGJA 2HBKA 2E1ZA 3CM5A 3SNNA 3L6QA 2VG7A 3FFKB 3CERA 1TYQB 4FJ8A 4DSJA 5JLHA 1N36K 3O3FA 4JK9A 5CZ1A 1BISA 4DLEA 3D2FA 3CXCM 4AHUA 3U4LA 3NFAA 3AVKA 3MXJA 5HL7L 3SBGA 3VEWA 3ZEUA 2CGKA 1L3UA 4A59A 4O4GA 3DLLL 3QETA 4B9QA 2DFEA 4CFCA 3K9JA 5M1QA 4BRLA 4C1NK 4CHNA 2Y1IA 4JD2B 4A2AA 4FCYA 1S6QA 4AM6A 3S3NA 4AM7A 1OH5A 2A41A 2RKIA 3NF9A 3OYAA 4BRHA 1IKVA 4B3SK 2P1JA 3W0LA 4KHUA 1JCEA 3NH1A 1VQLN 5KGWA 2A3ZA 3ENOA 2UYTA 5AQGA 4FJJA 3AO2A 3SJJA 1YJWN 2HHTA 3LDSA 2P9NA 1T8EA 3PX0A 3LZJA 4F3TA 4X64K 4WE1A 5AQFA 4CJ3A 3PY8A 3CF5L 3CMAN 3SBTA 1BU6O 3OYHA 1CZAN 1MDUB 1A5VA 2HBMA 4N56A 4CCHA 4H5VA 4BACA 4LFAK 4J8FA 3RR8A 4JNEA 4K8XA 3GG4A 4FLXA 4GKKK 2UXDK 5AQNA 1ZBUA 3CJBA 4E3SA 1W7AA 4MDAA 4ELTA 1KRPA 1KQSM 3SK3A 4GV3A 1SKSA 3K2PA 3VQPA 1IBLK 3CPWM 1C1CA 1ILYA 1Q8IA 3LP2A 5IT9O 3AVAA 1R59O 5CY4A 4RWTA 1VQMN 3CJ9A 3OJSA 3FZHA 2G8HA 2E8AA 3K9KA 1M1KO 4DV3K 4OVLA 1BWFO 4ID5A 1LWFA 1RGIA 3OTOK 3S5TA 3SQ0A 1KVCA 3L2VA 2XY6A 1WBDA 4FVUA 3AVHA 4YOTA 3M5RA 1SL2A 1K6YA 2ETJA 3AGRA 4OPAA 4CECA 1NK4A 4DLGA 3ATVA 5ELZA 3HOTA 3OYCA 2G8IA 1LV5A 2XO7A 1IV0A 2J4RA 1S1VA 3QERA 4MDBA 2DTUA 3RMCA 1QS4A 4O0IA 4X62K 5CE3A 5GAEP 5C10A 4JN4A 3VQ8A 4KHWA 3VTIA 1JLEA 3MDQA 1ZBFA 2E2NA 4H0PA 4IEIA 2YHAA 2GX9A 3A5NC 3CYMA 4LF9K 4DV2K 4DQQA 4JKFA 2IVNA 3IDHA 4JI4K 3VQ7A 4B1ZA 2Q1NA 3K5OA 3G0ZA 3LWLA 4CGFA 3SPZA 2HBJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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