2P9NA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
415
structure length
397
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 397
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9nA03
3IDHA 1NM1A 4B1WB 3ATVA 4I6MB 3D7EO 1ATRA 2P9UB 3FLCO 1KAYA 2CH6A 5KPRA 3FZHA 1MWMA 5AQUA 1C0FA 4FWPA 4H0XB 3QDKA 3D2EA 4H0TB 1J6ZA 2Q31A 2E2OA 3LDLA 3IUCA 4B1UB 2GWJA 2E2PA 1ZBSA 4BC2A 4BQLA 4FSVA 2P9PB 4BRNA 3IFRA 2FF6A 4BVOA 2GTDA 4EFHA 4PKHA 2Q0RA 4FWNA 5EX5A 4RTFD 1IG8A 3ID8A 2CH5A 3BP8A 5LJWA 5FPNA 3LDQA 3O8MA 3ATUA 3QBXA 4JHDA 4PL7A 1WUAA 4JD2A 3HBTA 4WQ4A 1GLFO 3SJHA 3CERA 1Q18A 5AQVA 1WOQA 2P9LA 1TYQA 2J4RA 2CGKA 3ZEUB 4BRGA 3QICA 2YHXA 5BPNA 1CZAN 1MWKA 2ASMA 3SMSA 2FF3B 4NO7A 5ELZA 3ULEA 1LOTB 4ISGA 4A61A 2IVOA 2GWKA 4XH5A 3CIPA 3I8BA 3CI5A 4BG8A 5F0XA 3MN7A 1SAZA 1KXPA 3VGKA 2Q36A 1D4XA 4WQ4C 4J8FA 3BUZB 5ADXH 1ATSA 1YVNA 2UYTA 4BRCA 3UKUB 1T6CA 3M1FA 3UE5A 4FO0A 3WXLA 2VYPA 1DKGD 1HLUA 5KPTA 4M7YA 3BF3A 3FZMA 1NGJA 2BTFA 4FWKA 3FZKA 4H0PA 4WYBA 1U2VB 3A5OC 2FSKA 4H0OA 4DCHA 2QW9A 3F9MA 2NZTA 2CGLA 3W0LA 3U4LA 3O6WA 4BRMA 3D2FA 5AQWA 3S41A 2D0OA 4CZHA 4B1VA 3LDPA 3FZLA 4MO4A 4CZFA 1T44A 3DXMB 4HWIA 2P9SA 2QWNA 5BRFA 4H5NA 4KBOA 3OHRA 4PKGA 1RDWX 5E84A 3WEEA 2IIRA 4B9QA 5EOYA 1HKGA 1ZC6A 1GLDG 4CBWA 2GUPA 4BR5A 3H46O 3WQUA 4BRQA 4H0VB 3R8EA 4H5TA 5FPDA 3KZBA 3EL2A 4B1XB 5JLHA 2P9KB 3UKRA 4A2BA 1GLAG 5BRHA 5AQSA 4DHYA 3SLCA 1NGGA 1NMDA 3CJ7A 3LL3A 4A2AA 1X3NA 3JS6A 3FE1A 3C0BA 3B8AX 4ISFA 1BWFO 4QS7A 5AFUH 1TUYA 4GY2B 4LC9B 5JICA 5BPLA 2YHWA 3J8AA 1JCFA 2F9WA 4BRAA 1NGBA 2E2QA 3D2EB 2A5XA 1YAGA 4CZLA 4B1ZA 3C7NA 4IXCA 2YHYA 3O4WA 5AZJA 2QWMA 3RSEA 3FR0A 2E1ZA 4EIAA 1BA1A 2E88A 4DB3A 1NGCA 3LDNA 5JMVA 1NWKA 5AQHA 3H3NO 5AQFA 1BUPA 2P9IA 3AAPA 3VEWA 2P9NA 4H03B 4CZKA 2ZWHA 5BPMA 2ASPA 4M63C 2A6AA 4F9OA 1V4SA 4H5WA 1OKJA 1RGIA 1QQMA 4JHDB 4QS8A 1BU6O 4JD2B 4JN4A 4BROA 1C0GA 1TUUA 3L0QA 3ENHA 4CJ7A 2GELA 1DGKN 1TYQB 2P9LB 4CZIA 4BG9A 2FSJA 3FFKB 3ULEB 1HKCA 2IVPA 3DXKA 5AQXA 4FWLA 1MDUB 3EN9A 3GOIA 5TKYA 5AR0A 4EAHD 1QZ6A 3G25A 4JNEA 2IVNA 2EWSA 3EZWA 4HTLA 1X9JA 4BC4A 2P9PA 3FGUA 4JAXA 5AQGA 3U8XA 5AQQA 5LY3A 1LCUA 3MK6A 1U6ZA 2HOEA 5AQYA 2HF4A 4EHTA 3VPZA 1QHAA 5AQKA 3CQYA 4B1YB 1H1VA 2V51B 2YJEA 3A5NC 3A5MC 2ZGZA 3H1VX 3LM9A 5AQNA 3U9ZA 4BGBA 3HZ6A 4BRFA 1ZXOA 3O1BA 1EQYA 3VGLA 3ZX0A 3VETA 2W40A 3CJCA 3D2FB 1KAZA 3QBWA 1HJOA 2Q1NA 3CJ9A 1QQOA 3CJBA 3GG4A 4XH1A 2P9SB 4BR0A 4O5FA 2OANA 4FWQA 4YDUC 4E1JA 2ITMA 3WEEB 1YXQA 4AM7A 1BDGA 1DEJA 5BRDA 2F9TA 3DWLA 1V4TA 3ZX3A 1GLLO 3LM2A 4FPAA 4CD1A 5KQ8A 1Z6RA 3M6GA 4MLHA 2A42A 3UKRB 2QM1A 3A5LC 1GLBG 3VF4A 4QS9A 3WXIA 5EXWA 2V7YA 4BQZA 3R9PA 4PL8A 3MN9A 4K41A 2BUPA 4MO5A 1YUWA 2PBDA 3MN5A 3H45C 4BR7A 2D0PA 4FWRA 3CJAA 3L6QA 1XC3A 1S3XA 4XH4A 3VEXA 1E4FT 4EHUA 4BC3A 1NGHA 3EO3A 3VEYA 3C7NB 1G99A 3VEZA 4BRLA 3RSEB 1K8KA 2E2NA 2D4WA 5AZIA 4BR9A 4CD3A 5JLFA 1NBWA 4GNIA 4K42A 3MN6A 3GDQA 2PAVA 4C23A 2A41A 3BEXA 4IJAA 3BF1A 3GE1A 4MLEA 2E20A 4FL9A 4NB4A 2YI1A 3L4IA 3AY9A 3ZETA 2P9IB 3I33A 2V52B 2P9NB 1KAXA 5I9EB 4K25A 3CETA 5BREA 3O1WA 5KQDA 2E8AA 3CJ1A 1BA0A 3CHWA 1HKBA 2WUSA 3O80A 1Z05A 4FOIA 3WXKA 2A3ZA 4RCHA 1BOTO 3ENOA 3ZX2A 3LDOA 3R6MA 4BVPA 2I7NA 3VESA 4BRHA 3FZFA 3WXJA 3UB5A 5B8HA 3QFUA 2I7PA 5BN8A 3DXKB 2QWQA 3VEOA 3VOVA 1RFQA 4FWSA 4IO8A 3O5BA 2QWRA 4IZ9A 5AFUA 3EKUA 3WT0A 1BG3A 4I6MA 1S22A 3MMVA 4BREA 2P9UA 1XUPO 3VF2A 4RWTA 1IJJA 3IMXA 3VGMA 2VWBA 2ZGYA 2ZF5O 3O08A 2CGJA 4CZMA 4IWVA 2DPNA 1NGAA 5KPZA 4WQ5A 3VF6A 2HF3A 4ISEA 3VEVA 4Y0WA 1NLVA 4FWOA 1GLEG 4YDUA 1GLCG 2E1YA 1SZ2A 5FPEA 4FWMA 3DAWA 2ASOA 1JCGA 2FSNA 3GL1A 5FPMA 2QWPA 3WUHA 1BO5O 2W41A 5AQLA 3HTVA 1SQKA 2FLOA 3SK3A 3VERA 5F2RA 1P8ZA 2YCHA 4WQ5C 4BRIA 2H3GX 3MDQA 3A8YA 4L3QA 3ZEUA 1E4GT 5AQMA 5EVZA 3HI0A 4A62A 2VCPA 5CE3A 3QFPA 2A40A 3QMLA 4BGAA 3H6EA 1HUXA 1Y64A 2Q97A 4O8KA 4H5RA 5AQRA 4BR2A 2Q2RA 1T6DA 4BR4A 3U9DA 1HPMA 4BRKA 5F1XA 3JXUA 5AQIA 4H0YB 4IJNA 5E26A 3H3OB 2D1KA 5AQPA 2FXUA 2V7ZA 4BRPA 2NLXA 3UKUA 5BR9A 2QWOA 2KHOA 3WQTA 2YJFA 1K8KB 5AQTA 4CBUA 5AZIB 3KVGA 3MCPA 5ADXA 3KHYA 3W3DA 1ESVA 4DQ8A 1XQSC 1QZ5A 3TPQA 4H5VA 1NGEA 3HSCA 1JCEA 1U2VA 1MA9B 3HM8A 4K43A 2QWLA 1NGFA 1NGDA 5AQOA 5LJVA 4XEIA 1X3MA 3GBTA 2QXLA 5AZJB 4CBXA 3ZETB 3EKSA 1R59O 4CZJA 2NRHA 4FPBA 4CZGA 3DXMA 4FOEA 1NGIA 3M3ZA 4AM6A 3AARA 5AQJA 1GLJO 1HX1A 5EY4A 2AP1A 3QB0A 4BRDA 4M7XA 1ATNA 3SMPA 2Q0UA 3AAQA 4CZEA 2HMPA 5AQZA 3DJCA 4CI6A 2AA4A 2GEMA 2P9KA 3TU5A 3A0IX 5BN9A 4PKIA 3P4IA 3VENA 3CQXA 1QQNA 4BC5A 4Z94A 3H1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JS2A 1KAYA 2O4IA 2KFNA 4F2RA 4F3TA 1IKYA 3U3YA 2YNHA 3NH2A 3DI6A 4H0TB 4LF6K 2E2OA 3IUCA 3CCVN 1TK5A 1ZBSA 4BC2A 3SQ2A 3HP9A 4IDHA 4BVOA 2GTDA 4KHSA 1JXEA 4PKHA 3SI6A 3AA3A 1N32K 2Q0RA 2OPPA 1SL1A 2X6SA 1CXUA 2BE2A 4LFCK 2CH5A 2Q3SA 5CY4A 2JGUA 4FJ8A 1S1XA 3SJHA 4CGGA 4CIEA 5D3GA 5AQVA 1WOQA 1NJIO 2PFUA 3ZEUB 5A2QO 4QCLA 3OJUA 1MWKA 3SMSA 1JLAA 2HBJA 3V9SA 3QEXA 4I9LA 2OA8A 2GWKA 4BE7B 4CF8A 4BG8A 1IBLK 1OH7A 4JI6K 4DFKA 3SUPA 3THVA 3BZKA 3DLHA 2JWKA 3RMAA 1TV6A 4K8ZA 2UYTA 4KHPK 1QTMA 4DTPA 1T6CA 4YY3K 3NVKA 5HROA 1NGJA 3FZKA 1J53A 3E9OA 4H0PA 4WYBA 2D0BA 5T7BA 1QVFM 1CLQA 3F9MA 3W0LA 5AJ3K 5AQWA 3S41A 4CZHA 2UXCK 4B1VA 4BDZA 4CZFA 1T44A 3DXMB 2P9SA 2OPQA 2OCEA 4PY5A 1F21A 3OTOK 3DLEA 3OHRA 3AGRA 5EOYA 4BR5A 3H46O 4H0VB 1S1UA 3LP3A 1A5XA 3G4SN 4B1XB 3U6FA 3ZCMA 1NGGA 2YNFA 4FJXA 3J7AP 4DR4K 1UOCA 3D6RA 4GMJB 4IOCL 2ZM6K 4Z4GA 2O8CB 3FE1A 5TKWA 3C0BA 4ISFA 2VG7A 3O9SA 5AFUH 1TUYA 4GY2B 3EZ5A 1L3VA 4LC9B 5BPLA 1CZ9A 4CK1A 2F9WA 3AVNA 3RR8A 1FK9A 1NJXA 3AVKA 4IXCA 4FJKA 1EETA 4KKOA 2E88A 4W5OA 1Q86O 3LDNA 1IKWA 4KH6A 3CD6N 1NWKA 4FLUA 5AQHA 4ID1A 3QERA 4BACA 4QAGA 4CEFA 4BE0A 4H03B 3SQ0A 4CJLA 4F9OA 3KJVA 5KI6A 3TSQA 4IFYA 4JLHA 3SV3A 3SBGA 4E7JA 3H08A 3T1HK 4Z4IA 1KVBA 5LMUK 4CF1A 4M3TA 3Q7CA 1VSKA 4PQUA 4CZIA 5AQXA 2HVIA 3EN9A 3GOIA 5TKYA 5AR0A 1IO2A 4HTUA 4DU3A 3KLEA 1YHQN 1IV0A 1EO1A 3SV4A 4BC4A 4JKBA 3LPUA 1L3UA 3M8QA 1Q8IA 3NF7A 3FGUA 4LSNA 5K14A 2HHVA 4GV6A 1VSMA 3U8XA 4FJHA 3MX2A 3VQ8A 2HHWA 5AQKA 3CQYA 3ZSQA 2V51B 2YJEA 3A5MC 3I55N 3NE6A 3U9ZA 4WFNL 3EE8A 1EQYA 3HO1A 5M1PA 4MFBA 3ZX0A 4C8MA 3VETA 4HUEA 1KSPA 1B9FA 4FCYA 2P5OA 1HYZA 1ZBIA 3PSFA 4DF4A 2Q1NA 1NMNA 3CJBA 3N4PA 3V4IA 4KTWA 4BR0A 1WSJA 1TKXA 1TKTA 1C1AA 3RTVA 4X65K 4CJ5A 2F9TA 3CFRA 1I3AA 1V4TA 4OGCA 1UWBA 1IG9A 3HK2A 4CD1A 5KQ8A 3RVCA 3M6GA 3UKRB 1GLBG 4DF8A 4BQZA 4RW8A 3MN9A 4K41A 1RBUA 3P5JA 3MN5A 2OZMA 4BR7A 3ZSOA 2D0PA 4FWRA 2HVHA 4M3WA 3ZSRA 1BI4B 1LW0A 4YFUA 1YIJN 1S3XA 4JKHA 3ZLJA 2YHAA 1E4FT 4HUFA 4EHUA 4DUYK 4CESA 4M3UA 3C7NB 3THWB 4LH4A 4U67L 1RDUA 4YORA 3HPHA 1VQ8N 4CD3A 4CJ4A 5JLFA 1NBWA 4K42A 3MN6A 3EY1A 1D9DA 2HHSA 3BF1A 1YVUA 2YI1A 4CFAA 3I0RA 4H8KA 3EYZA 1BHLA 4LD0A 1WAFA 3QNOA 4IG0A 2V52B 1VQPN 4RW6A 1KAXA 1VSFA 4FLXA 3NF8A 5GIOA 5BREA 4JK7A 1BA0A 4B9SA 2WUSA 1HYVA 1WBDA 4RCHA 1BOTO 4FLVA 2VGNA 4OLBA 4BRHA 3VA3A 4W5NA 3L4QA 5HL7L 3DXKB 1EWRA 3LWLA 1GOAA 3DLGA 2O8FB 4FWSA 1D5AA 5DM7L 1A5WA 3EKUA 1S1TA 1S1WA 3JSMA 4I6MA 4JS5A 3E1YA 4CEDA 3KD5E 1IJJA 3VGMA 1RTHA 3KKRA 4E7KA 2ZF5O 3O08A 4JKAA 1NJWA 1J9AA 4DTNA 3V9ZA 2DPNA 1XHZA 1KLNA 2W42A 3VF6A 3HOTA 1X9WA 1O13A 2OPRA 1HRHA 4A59A 4DKWA 1NLVA 1UAXA 3SJJA 1GLEG 4Q0BA 5M1QA 1GLCG 2GX9A 4LF7K 4LSLA 4HVJA 3V1RA 4XJXA 3L3UA 5CZ2A 1N8RO 1S9EA 4J2DA 4IBNA 1QVGM 2NRXA 5M1KA 4DV0K 4I7FA 1OH5A 2W41A 3VERA 2G8WA 5DM6L 4B9UA 1XHXA 1VRUA 1Z25A 2VWKA 4JEPA 4BE1A 5SWMA 5C2FA 2IDOA 3TI0A 4L3QA 4F4KA 4M3XA 2KQ2A 3HI0A 4A62A 3QMLA 4BGAA 1L5UA 4FJ5A 5C15A 1HUXA 3OS2A 4E0DA 3K2PA 2Q2RA 4DR2K 4BR4A 4FLZA 1RTDA 2QEXN 5F1XA 3JXUA 5AQIA 3OBYA 3HL8A 4H0YB 4IJNA 5E26A 3H3OB 1KD1O 3KK7A 1KVCA 1RDAA 1BL3A 1JJ2M 2D1KA 5AQPA 4CGFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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