3LM9A

Crystal structure of fructokinase with adp and fructose bound in the active site
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
294
structure length
292
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords fructokinase
publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 83
structure length 292
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2010-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm9A01
4JD2B 4BRHA 2P9SB 2ZF5O 3SK3A 5BPMA 4BQLA 5AZJB 3VEVA 3ATUA 3O5BA 5ADXA 1U2VA 5EX5A 4BRIA 3O1WA 3I33A 1NGEA 1QQNA 4CZHA 4RCHA 3ULEB 5KQDA 3ZX2A 4EHTA 4FWMA 2IVOA 1NGIA 3ZETB 2V7YA 3MN5A 5EVZA 5AFUA 1JCGA 2E8AA 1JCFA 4FWPA 5AQNA 3VGLA 4BRAA 2ASMA 1HKGA 3EN9A 4YDUA 2IVPA 5BRDA 1RFQA 5BN9A 5FPDA 3H6EA 3TU5A 1Z05A 3JS6A 4CZLA 3FZLA 4GNIA 3DWLA 3D7EO 4B1XB 5FPNA 4BRKA 5AZIA 2ZWHA 1ZXOA 3KVGA 3DXMB 2Q31A 2DPNA 4H0TB 3L6QA 1TUYA 4H0YB 1MWMA 3WXKA 4BRDA 5AQOA 3A5OC 4WYBA 4PKHA 2A41A 2FF3B 2CGJA 2Q1NA 3ZX3A 3VGMA 1BDGA 1MWKA 2P9LB 3R9PA 1TUUA 3WQTA 3B8AX 4FSVA 1GLCG 1MDUB 1DGKN 3H1QA 4RWTA 3QICA 1ATRA 1TYQB 1X3NA 3BP8A 4IXCA 3IDHA 2D0PA 3D2FB 3CETA 3D2EA 2EWSA 4B1YB 4FPBA 3O80A 5AQIA 3QDKA 2IVNA 2UYTA 4MLEA 3J8AA 2HF3A 3H3NO 1YUWA 3LDLA 2PBDA 3WUHA 1D4XA 4H5WA 3EKSA 4FO0A 3ENHA 1V4SA 3CHWA 4K43A 2E2OA 4IWVA 4Y0WA 3LM2A 5ELZA 4IO8A 1WUAA 1GLAG 4ISFA 4EAHD 4CZIA 2VYPA 1HX1A 2YJFA 4A62A 3CERA 3BUZB 3P4IA 4HWIA 4CBXA 3G25A 4B1UB 4B1WB 3ZEUB 4H5VA 4JD2A 2P9SA 2YHXA 4BR0A 1HKBA 5AZJA 4I6MB 1NGFA 2P9KB 3MN7A 3QBWA 1E4FT 3MK6A 4BRCA 2P9UB 3MDQA 3SLCA 2F9TA 3ULEA 3VEYA 2YI1A 3BF1A 2NZTA 3WXJA 3ZETA 4M7XA 1MA9B 5BPLA 4PL7A 3SMPA 2Q2RA 5AQGA 4NB4A 1HUXA 4EIAA 3SMSA 3LL3A 3FE1A 4DHYA 1RGIA 4A61A 3MMVA 3FGUA 4HTLA 4DB3A 3UKRB 4O5FA 5B8HA 3C0BA 5KPZA 3DXMA 3UE5A 4BREA 4CZFA 4LC9B 3EL2A 4MO5A 3VENA 1ATNA 5CE3A 4B9QA 3QBXA 4FWSA 2HMPA 1BOTO 1DEJA 4K42A 3VEZA 2E2NA 3CJAA 3VETA 5KQ8A 4FPAA 1BA0A 4FWKA 3GBTA 2QWLA 5AQKA 2BUPA 1LCUA 1NM1A 1ZBSA 2P9LA 5AQYA 5AQMA 4C23A 2A5XA 1KAYA 4WQ4C 1QZ6A 3JXUA 3LM9A 3H1VX 4JN4A 3WEEB 2A3ZA 1TYQA 3A5LC 1R59O 4ISGA 3GG4A 4BR2A 5I9EB 3D2FA 1IJJA 2YJEA 4CD1A 2Q0UA 5F1XA 4H03B 2YHWA 4M63C 3W0LA 1XC3A 1U6ZA 3AY9A 2CGKA 3A0IX 4JHDB 2ITMA 3QB0A 3BEXA 3VOVA 3HZ6A 4AM6A 5AQPA 3A8YA 1T6DA 3GDQA 4XH4A 1OKJA 3HI0A 3H3OB 1JCEA 1T44A 2FXUA 4XEIA 3H45C 2GEMA 5TKYA 1J6ZA 4H0XB 2V7ZA 1SZ2A 3ZEUA 3S41A 1HJOA 5EY4A 3ZX0A 1C0FA 1BO5O 4H5TA 4CI6A 3CQXA 3SJHA 1BA1A 2P9KA 4DQ8A 2P9UA 5FPMA 3C7NB 2E2QA 4BC2A 1H1VA 3FZFA 2I7PA 2YCHA 1NGGA 2HF4A 3FLCO 5LY3A 1GLLO 5E26A 4BVOA 1K8KB 1ZC6A 3U4LA 3CIPA 5LJVA 4FWLA 3VESA 1LOTB 4J8FA 3UKUB 3O08A 1NGBA 3IUCA 5BN8A 2NRHA 4BG8A 4EFHA 1ATSA 2P9NB 2V51B 2D0OA 1IG8A 3UKRA 1NGHA 4WQ5C 4FOEA 4QS9A 4BR5A 5AQXA 1G99A 1KXPA 3A5MC 4CZKA 1P8ZA 3FFKB 4FWQA 3FZHA 4WQ5A 2ASOA 2E88A 3RSEB 4BR4A 4EHUA 2AP1A 4BGBA 2I7NA 4BR7A 4FWNA 1S3XA 2QWRA 3IFRA 3GE1A 3CJ7A 5KPRA 3AAPA 4NO7A 1YAGA 3O4WA 4BQZA 4KBOA 3W3DA 2P9PB 1QQMA 4O8KA 3GOIA 3WEEA 3LDPA 4QS7A 4B1ZA 3QMLA 3U9ZA 4A2BA 1QHAA 2HOEA 1V4TA 1NMDA 1S22A 2D1KA 4BROA 4H5NA 2A42A 3MN6A 4QS8A 2NLXA 5AQUA 5F0XA 3AAQA 4AM7A 2E2PA 3L4IA 5JICA 1WOQA 4JHDA 1KAZA 2AA4A 1NGAA 4BVPA 2IIRA 5AQQA 4GY2B 1E4GT 2WUSA 4BRPA 3HBTA 3M6GA 3DJCA 4H0VB 5FPEA 4FOIA 2QWQA 3EZWA 2ZGZA 2W41A 2QWMA 4K25A 5AQLA 2V52B 4MO4A 1Q18A 4BR9A 3VEOA 3HM8A 4BGAA 2GTDA 3DXKB 2BTFA 4WQ4A 5AR0A 1EQYA 4XH1A 3VF4A 1X3MA 4YDUC 3WQUA 4JNEA 3VPZA 3R6MA 4BC3A 3O1BA 4BRNA 2P9IB 2QM1A 1C0GA 4H0OA 2QWOA 5BRFA 5F2RA 5JLFA 3CJ9A 3WXIA 4L3QA 3WT0A 3C7NA 5BRHA 3QFPA 1GLDG 3DAWA 3CJCA 1ESVA 3LDQA 5KPTA 2Q97A 1K8KA 3FR0A 5AQWA 3MCPA 1GLEG 4IJAA 5AQHA 3LDNA 3UKUA 3O8MA 3VF6A 1NGDA 2P9NA 2Q0RA 4IZ9A 3U9DA 1U2VB 2A40A 1YVNA 3ATVA 4CZJA 1DKGD 5EOYA 4E1JA 2QWPA 3HTVA 3CJ1A 4FWOA 2PAVA 3KHYA 2GWKA 2GELA 4PKIA 3M3ZA 3H46O 1HPMA 3L0QA 4CD3A 4CZGA 3VEWA 4CZMA 1GLBG 2E1ZA 3UB5A 2ASPA 4I6MA 3IMXA 3RSEA 2CH5A 4XH5A 2OANA 4BRFA 3M1FA 2YHYA 4JAXA 4RTFD 2QWNA 3U8XA 2FF6A 1BUPA 1XQSC 4BG9A 2VWBA 1BG3A 4IJNA 3GL1A 4BC4A 5LJWA 1SAZA 5AZIB 2J4RA 3OHRA 1SQKA 3CQYA 4K41A 4CZEA 4BRLA 2E20A 3VERA 2A6AA 2P9PA 4PL8A 3VF2A 2D4WA 3A5NC 5JLHA 1NGCA 1QQOA 3LDOA 4FWRA 1HLUA 3I8BA 1GLJO 1X9JA 5AQJA 3WXLA 3VEXA 1NLVA 2CGLA 1NBWA 4A2AA 2W40A 4B1VA 3VGKA 2FSKA 2ZGYA 5E84A 4CBUA 2VCPA 3TPQA 1HKCA 2FSJA 5BPNA 5AQZA 2QXLA 1Y64A 5AQVA 1T6CA 5BREA 1RDWX 2FLOA 2E1YA 2F9WA 4FL9A 4DCHA 2FSNA 5AQRA 1XUPO 4H5RA 4BRQA 3FZKA 3D2EB 4ISEA 3R8EA 4MLHA 3CI5A 1YXQA 3EO3A 5JMVA 4H0PA 4M7YA 5BR9A 4BC5A 4BRMA 4CBWA 1NWKA 1QZ5A 3CJBA 2KHOA 3DXKA 2CH6A 4PKGA 1BWFO 3ID8A 4Z94A 1BU6O 4F9OA 2P9IA 3MN9A 3HSCA 3O6WA 1CZAN 2H3GX 3FZMA 5AQTA 3ENOA 4CJ7A 1NGJA 2QW9A 5ADXH 2GWJA 4BRGA 1KAXA 3EKUA 3QFUA 1GLFO 3F9MA 5EXWA 2GUPA 5AFUH 1Z6RA 3BF3A 3KZBA 5AQFA 5AQSA 2Q36A 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O9SA 1A5XA 3SK3A 1SL0A 3O5BA 3TSQA 4IDKA 1NGEA 1EWRA 2QI2A 4B3OA 3ZETB 5FLXO 3MN5A 4KH5A 1JCGA 4DV5K 1JCFA 4FWPA 4BRAA 3QERA 2QKKA 3EN9A 4E1MA 5BN9A 2WOMA 5FPDA 1Q86O 3TU5A 4CF2A 4LF7K 3VTIA 3OW2M 4CZLA 1NK5A 3HRGA 3RRGA 5AJ3K 4JLHA 1I3AA 1S6QA 4GNIA 4KHSA 4U7BA 3VQCA 4B1XB 1TK0A 4K8XA 1ZXOA 1BHLA 1N32K 3KVGA 4CHYA 2O8CB 3NGIA 4DLEA 1VSKA 4DR1K 1TUYA 2HSTA 4H0YB 3WXKA 1CLQA 3DM2A 2Z1GA 4BRDA 4FVMA 1N36K 3ZSVA 2IAJA 4WYBA 3TABA 5HBMA 3KLGA 3QEXA 2FF3B 3JSMA 2CGJA 3ZX3A 4IFVA 2KFZA 3QIOA 3D45A 3TAQA 1RBVA 4O8UA 1FW6A 1CZ9A 2LSNA 2PFUA 4CIEA 5DMRA 2HBJA 3CM5A 1Q9XA 3H1QA 4RWTA 3OJUA 3HJFA 1ATRA 4CEDA 3E9LA 4CCHA 4CEQA 5AQIA 2G8KA 4MLEA 2UYTA 3KLIA 1RBUA 1XNQK 3CFOA 4CEOA 1D4XA 1EETA 3VA3A 3ENHA 4I9LA 4H4MA 2E2OA 3RTVA 3LM2A 4IO8A 3T7ZA 2UUBK 3P1GA 1N34K 4NCGA 4A62A 4Q0BA 1GOCA 2D0AA 1UA0A 5C2FA 3CERA 3E9PA 4HWIA 3V6DA 4B1WB 4JKAA 5LMNK 1C1AA 2YHXA 4BR0A 1NGFA 4GV6A 3MN7A 3RMBA 4B3SK 1E4FT 4DSIA 4KTZA 3MK6A 1HR0K 3LP2A 3SLCA 4LH5A 3KLEA 2F9TA 3BF1A 2NZTA 4LH4A 3ZETA 1HJRA 4M7XA 5BPLA 4PL7A 2JLEA 1Q82O 1KSPA 1B92A 3VN5A 4FJXA 4NXMK 2Q2RA 5AQGA 1ILYA 4DFJA 3LL3A 3HK2A 4CFAA 1RGIA 3SQ1A 3MMVA 4HTLA 3UKRB 4Q5VA 1RCHA 2W42A 3CCMN 5J2MA 2O8CA 4BDZA 4ELUA 3TI0A 1BCOA 4FJ8A 3SJJA 1XHXA 2ZJPL 5CE3A 2Y1IA 1VQ6N 3AVFA 3LP0A 1BOTO 4IDHA 3C65A 3CJAA 4OO1J 3VETA 3M8RA 4FWKA 3GBTA 2DTUA 1ZBSA 3OJSA 3AVKA 4MDAA 2YHBA 4ELVA 1KAYA 1D5AA 5KGWA 2RF2A 3H1VX 5C10A 4E0DA 4WE1A 5I9EB 2UUCK 3VQ6A 1NJYA 4JI6K 1NKCA 3NF9A 3HXMA 4DV0K 1U6ZA 3AY9A 1NOYA 3C94A 1BISA 4CF0A 3E1YA 5KRTA 3THYB 4YOWA 4FYDA 4CJPA 3SPZA 3A8YA 1RDDA 3VMFB 3VQ5A 3DRSA 1VQ4N 4IEIA 2ATQA 3H3OB 4I2QA 1JL2A 3C95A 2FXUA 4AQYK 2GEMA 4C8MA 1OH7A 1J6ZA 3JAMO 3CCQN 4JS4A 4OPKA 3SBTA 5EY4A 2FBYA 4CJRA 4H5TA 1NOZA 4LY7A 4CI6A 3CQXA 3MX5A 4M3UA 2IS3A 4JS5A 2FBTA 1HNWK 1HRHA 2I7PA 1NJIO 2OYQA 2ETJA 5GAHP 1HQEA 3U4LA 2OTJN 1KC8O 4J8FA 3O08A 1G15A 4KV8A 1T3VA 2JWKA 4ID1A 3UKRA 1NGHA 5CHIA 3CQ8A 1TK8A 4QS9A 4KI4A 3OY9A 3HSTB 2P1JA 4IFYA 3DLHA 1G99A 2E4LA 4KTWA 3A5MC 3TWHA 3OYJA 4DR3K 1P8ZA 4FWQA 4OLBA 2O8FB 3NAEA 4CJWA 2PYLA 1RBSA 1K8AO 3NBPA 4BGBA 3ZT0A 1S3XA 3GE1A 1SL2A 4FJHA 3CJ7A 4NO7A 2NUBA 4H8KA 4KAZA 1QQMA 4O8KA 3K9KA 4B3TK 1ZBHA 2KKZA 2PY5A 1S1XA 1QHAA 4CHNA 1V4TA 4KB1A 3ZSRA 3AGKA 4FLXA 4Z4HA 3CCUN 3MN6A 2NLXA 5F0XA 3T3FA 4DUZK 3L4IA 1ZBIA 3OYEA 3PV8A 2AA4A 1NGAA 1CZBA 4CEEA 5AQQA 5I42A 4GY2B 2WUSA 4BRPA 5FPEA 1BQNA 3AVCA 4FOIA 1J5EK 1UA1A 2W41A 4RW4A 3LZIA 4GW6A 3SUOA 3LAMA 5AQLA 2WBNA 1QQCA 2G8FA 2V52B 2PYJA 1Q18A 3MXJA 4BR9A 5AR0A 4ZTFA 3VF4A 4XH1A 1X3MA 4YDUC 4KFBA 4FLVA 4DR4K 1KVAA 3R6MA 2KZMA 3M8QA 3F9KA 4BRNA 2P9IB 4NYNA 4FLWA 1VQ5N 3AA4A 3CJ9A 1VQ7N 4L3QA 5M1PA 4J2BA 4EP4A 2Z1HA 1BGXT 3KWIA 3OYAA 5GINA 1W7AA 4DU3A 3SUQA 4JI0K 4IJAA 4AHUA 3LDNA 5M1QA 4HUFA 1TKXA 4E7IA 4IZ9A 2IC3A 3ATVA 3HVTA 1NJWA 2PAVA 1XC9A 2X6NA 3QEWA 3M3ZA 3H46O 3L0QA 4CD3A 4CZMA 4FJ9A 2E1ZA 3OTOK 2O8FA 4M3WA 3HL8A 2OANA 5K14A 1RT2A 4RTFD 4F4KA 1ZYQA 4PQUA 2NRXA 4N76A 4DTJA 3GL1A 1RT4A 3OHRA 1TL3A 4K41A 4M3YA 4BRLA 1QQOA 3LDOA 1CXQA 1HLUA 4LSLA 2FBXA 1QSSA 4DQPA 4CJ4A 1L3VA 3V1RA 3O4QA 1HNIA 1D9FA 2O4GA 3AO4A 3MEGA 3VGKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3TR8 A;  5DM6 L;  1BUP A;  3OYH A;  3MEE A;  2KZZ A;  1VHX A;  1VRU A;  1IH7 A;  3NGY A;  4IJN A;  3SUP A;  5HP1 A;  1SQK A;  3CQY A;  3HT3 A;  4E3S A;  2P9P A;  3VF2 A;  2D4W A;  3A5N C;  3QEV A;  4M3T A;  4FWR A;  2P51 A;  4DTP A;  1VSF A;  3VEX A;  3KIO A;  2A1R A;  5JS1 A;  4H4O A;  4KKO A;  4FJG A;  5E84 A;  4CBU A;  2ZJR L;  1HKC A;  3VQ4 A;  4OKJ A;  2O4I A;  1RIL A;  5BPN A;  1HYS A;  5AQZ A;  2RPI A;  2QXL A;  5BRE A;  3ULD A;  1I39 A;  2QTD A;  5MLC Q;  4FL9 A;  2OTL N;  3I56 N;  5AQR A;  4BRQ A;  4H5R A;  4ID5 A;  3AVM A;  3FZK A;  4MLH A;  4H0P A;  5BR9 A;  4BRM A;  4OGC A;  4Z94 A;  1HNX K;  1XMQ K;  4LD0 A;  3E66 A;  3MN9 A;  4LF9 K;  1UOC A;  4CJ7 A;  5AQT A;  4HCC A;  3CC7 N;  1NGJ A;  3DOK A;  3AGR A;  3RR8 A;  3WXM B;  3HO1 A;  4BRG A;  4X64 K;  3F9M A;  2GUP A;  4BWJ A;  2HVI A;  3KZB A;  5AQF A;  1RTI A;  4DSF A;  3ZSY A;  4ILH A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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