3LM9A

Crystal structure of fructokinase with adp and fructose bound in the active site
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
294
structure length
292
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords fructokinase
publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 83
structure length 292
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2010-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm9A01
5AQLA 1G99A 1HKCA 3ZX0A 3RSEA 4B1XB 2ZGYA 4M63C 3VENA 1JCEA 3EO3A 4CI6A 3MDQA 1YUWA 1HLUA 5AZIA 3IUCA 4I6MA 3ATVA 3VF6A 4BRHA 1MWKA 2W41A 1T44A 5BN9A 1QQNA 2ZWHA 3A5OC 4BRGA 4NB4A 2E8AA 3L4IA 4H5VA 4IJNA 4HWIA 4A62A 4BR5A 3D2FB 4A2AA 5AQFA 5AQHA 1OKJA 3D2EA 4CJ7A 1Z6RA 1R59O 4BRQA 3ZEUA 3SLCA 3M6GA 2PAVA 5AQWA 1BG3A 4DHYA 4JD2A 5F1XA 4BRFA 4H5TA 3VEWA 4CZFA 1ZXOA 3FR0A 3MMVA 3LDNA 3LDQA 4B1YB 5AQGA 1SZ2A 4FSVA 4GY2B 4B9QA 1T6DA 4K43A 1QQOA 2FF3B 4B1UB 1NGJA 3VETA 3CERA 3KVGA 4CD1A 4EFHA 3DXMB 2D0OA 2P9SB 4NO7A 3WT0A 5JMVA 2I7NA 3CETA 3LDPA 5EOYA 2AA4A 3WQTA 1GLLO 4O8KA 4QS8A 4H0YB 4MLEA 4M7XA 1ZC6A 4XH1A 4JNEA 2E20A 5EXWA 3OHRA 3QDKA 3VGKA 4JN4A 2CGJA 4IWVA 2DPNA 3UB5A 4PKHA 4BR4A 3KHYA 4CZKA 1TUUA 3UE5A 2E2QA 3ENOA 4M7YA 3BEXA 2YHYA 2CH5A 3MN6A 3M3ZA 2V7YA 2P9NB 4H0VB 1IG8A 3QBWA 1DEJA 1NGEA 1U2VB 2P9UB 3HTVA 1BA1A 3DXMA 3W3DA 3A5LC 2ZF5O 4GNIA 4PKIA 1HKBA 2P9SA 4FPAA 3AARA 5BN8A 4H5RA 3VF4A 5AQSA 3CQXA 3H1QA 2Q0UA 3U4LA 3U8XA 3U9ZA 1X3MA 2IVOA 2A42A 4RTFD 2YJFA 1P8ZA 3FGUA 4BC3A 3LDLA 1NMDA 3QFUA 1E4GT 4FOIA 4FPBA 1K8KB 4FWKA 2VWBA 5JLHA 5AQMA 2YJEA 5ADXA 3SJHA 1HUXA 5ELZA 2GWKA 4H03B 4BR9A 3CIPA 4BREA 2GWJA 1C0FA 4B1ZA 2VYPA 5BRFA 3WUHA 1MDUB 5EX5A 5BPMA 5KPRA 4AM7A 2HF3A 2FLOA 4H0TB 3AAQA 3O1WA 3R6MA 5BPNA 2P9PB 3U9DA 2H3GX 2P9NA 3VESA 3HM8A 3DJCA 3ULEB 4CZGA 1U2VA 2P9UA 1WOQA 3H3NO 1ZBSA 3VERA 1X9JA 3O4WA 3ZETB 3I33A 2QW9A 4BRNA 3BF1A 3FLCO 3F9MA 4BC4A 3MCPA 4CBXA 5BR9A 5AFUH 3MN5A 5AR0A 3QICA 3QMLA 2ASMA 2P9KB 1K8KA 2Q97A 2QWQA 3CJ7A 1QQMA 1HX1A 2QWMA 3GL1A 1SQKA 5KQDA 2GEMA 5AQYA 5AZJB 3GE1A 1J6ZA 2CGLA 2KHOA 2Q0RA 4EAHD 4LC9B 3QBXA 1U6ZA 3O5BA 2W40A 1Q18A 4JAXA 1MWMA 3SK3A 3C7NB 2ITMA 1ATNA 2QM1A 2P9PA 5FPEA 3ULEA 3BF3A 5I9EB 1S22A 1GLFO 4K42A 4ISGA 4IO8A 3WXIA 3VEYA 3ZETA 4BR2A 2IIRA 4BR0A 3MN7A 3I8BA 1C0GA 5AQRA 3P4IA 4FWOA 4ISEA 1ESVA 1NBWA 4BRPA 2HOEA 1NGHA 2P9KA 3WEEA 3ZX2A 2D4WA 5BRDA 4WQ5A 2ZGZA 3QFPA 4H0OA 3FZKA 4BRCA 1JCFA 4FWMA 4H5WA 5AZJA 3FZLA 1YAGA 5F2RA 4PL7A 1BU6O 1D4XA 4DQ8A 4H5NA 2AP1A 3EL2A 3B8AX 5AQNA 3VEXA 3VF2A 4BG8A 1MA9B 3LDOA 3KZBA 5BRHA 5BREA 1HPMA 1RGIA 2FSNA 1ATSA 4FWQA 3C7NA 3VGLA 4A61A 3ENHA 2F9TA 3M1FA 3BP8A 4PL8A 4IJAA 3FZHA 4KBOA 3O80A 3CJAA 3H3OB 4RWTA 1SAZA 4XH4A 3H45C 5FPNA 5AQKA 2V51B 3FE1A 5B8HA 1HJOA 4BVOA 3R9PA 2UYTA 4CBWA 1RFQA 1RDWX 2PBDA 2BTFA 3FZFA 3O1BA 4E1JA 4BQLA 5JLFA 5E84A 4DB3A 1NGCA 3A8YA 5AQUA 4MO4A 5LY3A 3ATUA 3DAWA 5E26A 4BRAA 4YDUC 1GLCG 1ATRA 2E1ZA 1JCGA 1TUYA 1E4FT 4EIAA 4QS7A 2YI1A 2QWNA 2A6AA 2E2PA 1KXPA 3TU5A 2QXLA 3G25A 1GLBG 2J4RA 2E1YA 4FL9A 2E2OA 2QWOA 4EHUA 1NGIA 4JHDB 5AQTA 1GLDG 1NGFA 3VEZA 4FWPA 1NGAA 4QS9A 4CZLA 4A2BA 1KAZA 4HTLA 5AQVA 4BGBA 1BDGA 3WXKA 3LL3A 1H1VA 1XQSC 1X3NA 3S41A 1GLAG 2QWPA 2V52B 2NRHA 3ID8A 4Y0WA 3R8EA 3DWLA 3LM9A 1LOTB 2QWRA 3EZWA 5AFUA 3H6EA 1V4SA 4FWSA 4K25A 1GLEG 3IDHA 1QZ6A 1V4TA 3D7EO 2IVPA 2GTDA 3UKRB 2EWSA 4BG9A 5EVZA 5F0XA 3WEEB 3TPQA 3CJCA 3EN9A 3JXUA 4BRKA 1NLVA 3AAPA 2CH6A 2ASPA 2Q2RA 1S3XA 5AQQA 3W0LA 1GLJO 1KAXA 2VCPA 2HMPA 3VPZA 4B1WB 1TYQB 1QZ5A 4H0XB 4JHDA 4IZ9A 4RCHA 5LJVA 1T6CA 2Q31A 3UKUA 5CE3A 4BVPA 1Y64A 2D0PA 4YDUA 4CZEA 4PKGA 1NGBA 4FWNA 1BWFO 2YHWA 4MO5A 2Q36A 3GG4A 3C0BA 3VOVA 5FPDA 4Z94A 2A41A 2QWLA 4CZMA 2NZTA 3CHWA 3J8AA 4F9OA 3GBTA 3VEOA 2FSKA 5EY4A 2WUSA 4EHTA 3VEVA 3UKRA 3AY9A 3WXLA 2P9LB 1YVNA 2P9IB 3HI0A 3FFKB 2A3ZA 1BO5O 3L0QA 4DCHA 4BC2A 4B1VA 1BA0A 1CZAN 2YHXA 4AM6A 3SMPA 1QHAA 3EKSA 1DGKN 5KQ8A 4CZJA 1KAYA 1TYQA 3HZ6A 2YCHA 4BR7A 4BRDA 3EKUA 5AQZA 3H1VX 1DKGD 1XUPO 3JS6A 4FOEA 4BROA 4ISFA 3CJBA 2A5XA 5JICA 4BQZA 3QB0A 4WYBA 1NM1A 2OANA 4WQ4C 2E2NA 2NLXA 3O6WA 3D2FA 3BUZB 2A40A 3DXKB 4BRMA 3CQYA 3A5NC 3CJ9A 3HBTA 3ZX3A 5AQIA 4BGAA 3HSCA 2FF6A 3IMXA 3LM2A 3O8MA 2D1KA 4FWLA 4J8FA 5KPTA 2P9LA 2P9IA 4XEIA 4K41A 5KPZA 3GOIA 5TKYA 1XC3A 2HF4A 4IXCA 3IFRA 4BC5A 2IVNA 3MN9A 2BUPA 4XH5A 4CZIA 2CGKA 2F9WA 2E88A 3GDQA 1IJJA 1NGGA 5AQJA 2I7PA 4BRLA 3SMSA 4BRIA 2Q1NA 3RSEB 5AQOA 4C23A 3MK6A 1NWKA 5AQXA 1BUPA 4O5FA 5AZIB 2GELA 3DXKA 3FZMA 4FWRA 4I6MB 3UKUB 2FSJA 1LCUA 1WUAA 4H0PA 5AQPA 3L6QA 3WXJA 3CJ1A 3A0IX 4L3QA 4MLHA 5FPMA 4FO0A 5LJWA 1NGDA 5ADXH 5BPLA 3D2EB 2V7ZA 1HKGA 1Z05A 3ZEUB 3CI5A 4WQ4A 1EQYA 2ASOA 2GUPA 4WQ5C 1BOTO 3WQUA 3O08A 2FXUA 3H46O 4CBUA 4JD2B 3VGMA 4CZHA 3A5MC 1YXQA 4CD3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THWB 2DTUA 5J2PA 1T7PA 5CR4A 2ZJRL 3TAGA 3EO3A 3RR8A 4LF4K 3ATVA 3VF6A 3DLHA 3VA3A 4X62K 3TAPA 2IC3A 2KW4A 2ZWHA 3A5OC 3HP6A 4Z4HA 1S72N 4NB4A 3E01A 2FBYA 3PX4A 1OH5A 4BR5A 1YJWN 5DK5A 5AQFA 3K5NA 1W97L 4BY9C 3LP3A 1JLGA 5MLCQ 1R59O 4CGDA 4DTRA 5IT9O 1HQEA 2UXDK 3AVFA 4B3RK 3SLCA 2O8BB 5KGWA 5HOOA 3NFAA 4H5TA 3CC2N 3KK2A 3THWA 3F5TA 3LDQA 5GIPA 5AQGA 4GY2B 2YKNA 3V9ZA 1M90O 4O55A 2UU9K 2HHVA 5E41A 3MWTA 3EEQA 4AHVA 5J1EA 4CK3A 2P9SB 3BDPA 4X66K 4FK4A 3WQTA 2AA4A 4Q5VA 1GLLO 3OYEA 4H0YB 4M7XA 1XHXA 4XH1A 4JNEA 4LF6K 5EXWA 3AVAA 1R0AA 1BIUA 1ASWA 3KLGA 2G8FA 4JKFA 4DSFA 2O8BA 1QSLA 2BH1A 1VSLA 3KHYA 4CZKA 3UE5A 4E7KA 1HNWK 3ENOA 4M7YA 4FLZA 3AVIA 4OKKA 2CH5A 3E9PA 1KTQA 4ZTFA 4CCHA 2GUIA 4H0VB 3ZSXA 1Q9XA 3HK2A 4DU4A 2ATQA 1BA1A 2VG7A 3PO5A 2ZF5O 1WAFA 2P9SA 3O4NA 2OPRA 2KKZA 3PUFA 1FKPA 1VQNN 4CERA 1X3MA 1DTQA 1JLEA 2IVOA 2A42A 5AJ3K 3C6HA 2VWKA 3HOSA 4LFAK 2NRVA 3QFUA 3MEDA 3CCJN 1VSFA 3QIOA 4YOTA 5JLHA 4CEEA 5AQMA 1RT2A 2YJEA 1VRUA 1YIJN 1HUXA 3V81A 2RN2A 2FC0A 4RW7A 2E4LA 4M3XA 3ZSYA 3T3FA 4AM7A 2HF3A 3NCIA 3KKRA 1EKEA 4Z0UA 2PY5A 1NMNA 3HM8A 1LAWA 1RTJA 4CZGA 4DSLA 3SYZA 3U3YA 4C8MA 4CJEA 3QEXA 4FLUA 3OYLA 1JLBA 3CD6N 2RPIA 3NE6A 4BRNA 5CHIA 3VQ4A 3BF1A 4LFCK 1I94K 4BC4A 3G0ZA 3NAEA 4DU3A 4CHQA 4FJNA 3MN5A 4LD0A 4V19S 5CYMA 3CJ7A 1YTAA 3GL1A 4WFBL 3AVJA 4CVNE 1WBBA 4I9QA 5AZJB 3KD1E 1RT6A 1IV0A 4HUGA 1TL3A 3AVKA 2Q0RA 3OBYA 5DMRA 2ZM6K 3SPZA 4JI2K 3C7NB 4QAGA 1ATNA 5T7BA 4CJUA 1NG9A 3BF3A 2HNYA 1O13A 1X9WA 4K42A 4ISGA 4MDBA 4FJLA 2G8WA 4M3UA 3HT3A 1XNRK 1SKRA 5AQRA 4W5TA 1KRPA 3CMEN 1LWEA 4KO0A 4BRPA 1HYZA 2EX3A 3WEEA 3ZX2A 2OA8A 3CYMA 2XHBA 3PSIA 4WQ5A 3G4SN 4H0OA 3VQ5A 5AZJA 3FZLA 1N8RO 5GAGP 1YAGA 4ID1A 5F2RA 5KGXA 4H5NA 1SL1A 4NYFA 1KCFA 4KH5A 5AQNA 4CFCA 4EZ9A 3ZYYX 1ATSA 4FLXA 3C7NA 2F4VK 4A61A 2OPPA 2F9TA 4DQQA 2WBNA 1EX4A 1HPZA 3M1FA 4L8RB 1RT4A 1B92A 2HB5A 4KKOA 4CFBA 3LZIA 3VQAA 3CCLN 2YKMA 4FLWA 4IOAL 3TARA 4RWTA 1J54A 3KK1A 2V51B 5B8HA 4DTNA 4CHYA 1O1WA 4BVOA 2HHTA 2PBDA 2BTFA 3O1BA 2HBKA 4AILC 4BQLA 4IBNA 1NGCA 3D6RA 5AQUA 3AA3A 1VSHA 3T1YK 3SZ2A 1N36K 2UUBK 3CM5A 2GX9A 4IFYA 4E89A 4CJ5A 1Q82O 1IBKK 4QS7A 3DI6A 2WONA 2QKBA 1RDBA 3SPYA 1TKTA 4JKEA 3TU5A 2QXLA 3NVMA 4IKFA 2J4RA 2NRTA 2E1YA 4KHNA 4CJKA 1NGIA 1S9EA 4JHDB 1NGFA 3VEZA 1J9AA 1KFSA 1NJYA 1QVFM 4QS9A 4NXMK 3C6TA 2O4GA 1RBUA 4N5SA 5AQVA 4WCEL 4B3SK 3DLBA 4Q0BA 3S41A 1X3NA 4YOVA 2V52B 2NRHA 4KI6A 3P5JA 1GLEG 1VQON 4I2QA 3D7EO 4M3ZA 3UKRB 3ZSVA 5F0XA 1TKXA 1T3VA 3DYAA 1NLVA 1YT3A 3CM6A 2Q2RA 4FJ9A 3HYFA 4G1QA 1YJ9N 1KAXA 1S1VA 1QZ5A 4H0XB 4JHDA 3TWHA 3HVRA 1KLMA 3UKUA 4J2BA 2D0PA 3L3VA 2JLEA 4YDUA 4BDPA 4YFUA 4FCYA 3CCMN 3SUPA 2Q36A 4YOUA 4B3MK 2FBVA 3C0BA 3KIOA 3VOVA 5LMNK 4K8XA 5FPDA 2A41A 2QWLA 3ZCMA 2IAJA 3S9HA 4F9OA 3T69A 3VEOA 5C15A 3V4IA 3UKRA 3AY9A 2P9LB 3L8BA 1YVNA 2P9IB 3HI0A 2A3ZA 4DKWA 3L0QA 3B6PA 4DUYK 3LPUA 4B1VA 2YHXA 1FJGK 4NCGA 3EKSA 4FJ8A 1DGKN 4CJLA 4CZJA 3OW2M 1ZYQA 1KAYA 4JKGB 5SWMA 4LSLA 4JS4A 3NDKA 1DKGD 3O4QA 3AO4A 4BROA 3SAGA 3CJBA 3CMAN 3P83D 5KRTA 1VQMN 4WYBA 4CF8A 3O6WA 3BUZB 4C8KA 4ZHRA 4FZXC 4CHNA 1G15A 1P90A 4FXDA 5AQIA 1TV6A 4E3SA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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