1NGBA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINQPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
total genus 126
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngbA04
2QWOA 2CGKA 3OHRA 3MN9A 4BQZA 3DXMB 5AQJA 2Q1NA 3BEXA 1HJOA 2YJEA 1SQKA 1NBWA 3VGMA 3WXKA 5I9EB 2Q36A 2VYPA 3VERA 3UKRA 1H1VA 1NGJA 1X9JA 3HBTA 1HKGA 2QM1A 4JNEA 2D1KA 1Y64A 4RCHA 1R59O 1QZ6A 2Q0RA 4BG8A 4EIAA 1TYQA 3WUHA 5AQPA 4FWPA 4EHUA 1LCUA 2A41A 2W40A 4BRLA 2P9SB 2AP1A 4H0XB 2YHWA 1BDGA 4IJAA 1YVNA 2E1ZA 5AQWA 3D2EB 2Q2RA 3A0IX 1DEJA 5BPLA 5JLHA 2HF4A 1YUWA 3UB5A 3LM2A 2WUSA 3CQXA 3MN6A 3CHWA 4H5WA 4B1XB 4ISGA 5AZIB 4CBUA 2P9IB 4FWQA 2YJFA 1NGIA 1Z05A 5CE3A 2IVOA 3ENHA 3D2FB 4CZJA 3IUCA 4BRQA 5AQFA 1OKJA 2FSNA 4NB4A 3WT0A 4IO8A 1ATRA 3FFKB 5BPMA 3W3DA 2A3ZA 3O5BA 4RWTA 2ZGZA 2QW9A 4BRKA 5ADXA 3ZX3A 5LJWA 3BF1A 1HPMA 4BC4A 3MMVA 4FWOA 4CBXA 2YI1A 4Y0WA 1Z6RA 3MN5A 1DKGD 1V4SA 1P8ZA 3FE1A 2Q0UA 2HOEA 1ATNA 4H03B 4K42A 2GUPA 1JCFA 2V52B 2J4RA 1QHAA 4BRNA 4JAXA 5E84A 3KVGA 4CZKA 2V7YA 4A61A 5BRDA 2P9PB 4JHDA 4EFHA 1KAZA 3QFPA 4BRGA 3FZMA 4B1VA 4H0VB 3VEZA 1GLAG 4EHTA 5FPDA 3CQYA 4MLEA 4PL8A 4A62A 3CIPA 4QS7A 3ZEUB 4BR4A 4CD1A 3TU5A 5AFUH 4FSVA 4PL7A 3H3OB 1NGBA 3CJCA 3C7NA 2CGJA 3CJ7A 2ITMA 3UKUA 2ZF5O 3WEEA 3KZBA 1BUPA 3FR0A 2PAVA 1V4TA 4FPBA 3MCPA 4H5TA 3ZETB 3MN7A 2HF3A 5JLFA 1GLBG 4DHYA 4JN4A 3U9DA 1HLUA 1DGKN 4FWKA 1GLEG 3CJ9A 5AQRA 3A5NC 1G99A 2ASPA 4BREA 3QBWA 2QXLA 3AY9A 5E26A 2E2QA 5FPMA 4I6MA 3H46O 1JCGA 3J8AA 2A40A 5BREA 3QMLA 2AA4A 3L4IA 4DB3A 3QICA 2QWLA 3VEXA 3JS6A 3O6WA 3EO3A 3R6MA 5JMVA 4B1WB 4BVPA 3GL1A 2FSJA 3RSEA 1MA9B 2QWNA 3ATUA 3HSCA 1K8KB 4FO0A 4H0OA 3DXMA 3O4WA 4K43A 3R8EA 2PBDA 3O08A 3ID8A 3GDQA 2V51B 4JD2A 3AAQA 2GTDA 5AQUA 4H0TB 5EVZA 1C0GA 1MDUB 3WQTA 5AQMA 1C0FA 3EL2A 3AARA 3D7EO 3VF2A 5EY4A 3H45C 2E20A 3BUZB 2E8AA 4M63C 4E1JA 5KPRA 5AQHA 4BC3A 4RTFD 1QQOA 2NLXA 4H0PA 4BC2A 5LY3A 2P9SA 1T6CA 3DXKB 5AQVA 4K41A 3D2EA 1XQSC 2DPNA 3A5OC 2V7ZA 2E2OA 3ULEA 1YAGA 2UYTA 1CZAN 3HTVA 2F9WA 5KQDA 1GLDG 5FPNA 2QWQA 4XH4A 4PKHA 1ZXOA 1SAZA 3H1VX 5AZJA 2CH6A 5AZIA 2P9IA 4FWLA 4O5FA 2ZWHA 5AQXA 2A6AA 3D2FA 3VENA 4FOEA 2VWBA 3ATVA 4IXCA 4KBOA 4B1YB 3CJAA 4BVOA 2P9KB 2I7NA 2QWMA 1KAYA 3CI5A 4IZ9A 2QWPA 2P9UB 5AQNA 1NGDA 4BRHA 4DQ8A 1HUXA 1BWFO 2IVPA 3H3NO 3IDHA 5AQLA 4PKGA 1RDWX 1NGEA 2YHXA 1NWKA 5AFUA 1T6DA 1NGAA 2D4WA 3CERA 3WQUA 4M7YA 4BGBA 4CBWA 2P9LB 4CJ7A 4BG9A 5AQZA 4NO7A 1RGIA 1NGFA 5AR0A 4DCHA 2BUPA 4WQ4A 2VCPA 4HWIA 5F1XA 3CJ1A 5ELZA 1J6ZA 1NM1A 4WQ5C 3HZ6A 3LDNA 3VGKA 5KQ8A 3DWLA 3EN9A 5EX5A 4CZGA 1WOQA 2ASMA 2GWKA 3ZEUA 2GEMA 4XH1A 2Q97A 3GOIA 5AQTA 4BR2A 3UKUB 3U4LA 4IJNA 3QFUA 3A8YA 1MWMA 1ZBSA 3GBTA 3IMXA 2KHOA 2P9NB 4O8KA 3SJHA 3ZETA 2H3GX 1NLVA 5F0XA 1U2VB 3FGUA 4BRAA 3W0LA 5BPNA 1NGGA 3B8AX 3O8MA 1BOTO 3VGLA 5AQQA 1GLCG 3QBXA 4IWVA 1ZC6A 4BRPA 4BR7A 1HKCA 3KHYA 4CI6A 3FZHA 1EQYA 3A5LC 3UE5A 1ATSA 2D0OA 1E4FT 4FWRA 4WQ5A 4EAHD 4BGAA 3VPZA 4M7XA 3IFRA 3UKRB 1SZ2A 3LM9A 1S3XA 1HKBA 2YHYA 4YDUC 2Q31A 4FPAA 4GY2B 3H1QA 2FXUA 3VEWA 3WXIA 2E88A 2CH5A 1TUYA 2W41A 2ASOA 1GLFO 1K8KA 3SK3A 5KPZA 1BO5O 3SMSA 1TYQB 4BRMA 4JD2B 3GE1A 4BR5A 4AM6A 5EXWA 4FWSA 3M3ZA 5AQKA 5F2RA 3SLCA 4CD3A 2FSKA 3P4IA 3M6GA 3FZKA 4J8FA 1D4XA 4ISEA 1X3MA 3EKUA 3HM8A 3I8BA 2IVNA 1BU6O 5FPEA 5B8HA 3SMPA 3CJBA 2HMPA 3S41A 4L3QA 3QDKA 5AQOA 4XH5A 3GG4A 3DAWA 3ZX0A 3VEVA 1GLLO 4CZMA 3G25A 4A2BA 1YXQA 3WXLA 3DJCA 1ESVA 3DXKA 1JCEA 3ULEB 4F9OA 4ISFA 4YDUA 3WXJA 4XEIA 2IIRA 3EZWA 4FOIA 5BR9A 1KXPA 1S22A 4WQ4C 3L6QA 3LL3A 3VESA 5BRHA 5BN9A 1LOTB 5AZJB 3VF4A 1NMDA 4LC9B 4BQLA 3LDLA 3O1BA 4MLHA 1BG3A 2FLOA 2BTFA 3BF3A 4BRCA 4B1ZA 4BRIA 2GWJA 3VF6A 4H5NA 2YCHA 5LJVA 3AAPA 3CETA 5AQYA 4MO4A 3FZFA 3ZX2A 2GELA 1T44A 3FZLA 5KPTA 3MK6A 1X3NA 2P9KA 2D0PA 5BRFA 4BROA 4CZIA 2CGLA 1RFQA 2P9UA 1KAXA 3LDQA 3H6EA 1Q18A 1QQMA 1MWKA 3M1FA 1IG8A 1WUAA 4FWNA 4QS9A 4BRFA 2EWSA 1XC3A 2E1YA 4JHDB 4K25A 3C0BA 4AM7A 1QQNA 1NGCA 4C23A 2P9PA 4QS8A 2FF3B 4PKIA 3R9PA 4HTLA 5ADXH 1E4GT 5AQIA 2P9LA 1NGHA 4GNIA 2FF6A 2ZGYA 3L0QA 5AQGA 1U6ZA 3JXUA 3VOVA 2A5XA 4BRDA 4CZFA 3VEOA 3C7NB 3I33A 3U8XA 4B9QA 4CZLA 3WEEB 2E2PA 3U9ZA 4FWMA 3O80A 3HI0A 3LDPA 2OANA 3O1WA 4CZEA 4FL9A 4Z94A 5EOYA 4B1UB 5TKYA 3LDOA 3ENOA 2E2NA 2QWRA 3A5MC 3EKSA 4CZHA 4MO5A 3BP8A 3FLCO 5AQSA 4BR9A 2F9TA 1BA0A 1GLJO 4H5VA 2P9NA 1QZ5A 5JICA 4I6MB 3TPQA 1BA1A 4H0YB 1U2VA 4H5RA 1IJJA 2NRHA 2A42A 4A2AA 4WYBA 3F9MA 1TUUA 1XUPO 5BN8A 3MDQA 3VEYA 4BR0A 2I7PA 3QB0A 4BC5A 1HX1A 3RSEB 3VETA 2NZTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N47A 2I61A 4JKAA 1HJOA 3V6DA 2O8DA 3VGMA 1VK0A 2Q36A 2VYPA 3ZSXA 1KC8O 3PSMA 1NGJA 1KQSM 3TAEA 2G8HA 1T0ZA 3TAPA 3DLLL 4CF8A 3BY5A 1D8YA 4CJTA 3K9KA 4BG8A 4CK3A 3TANA 1NK8A 1RCHA 3QEWA 2VG5A 3WUHA 1XI1A 1VQLN 4BDYA 3DOKA 1R0AA 1B9DA 5C42A 1UA1A 4DTUA 1TL3A 4JKGA 4OKEA 3D2EB 4JS4A 1RBRA 4CGHA 4CEZA 4R5PA 3VQAA 3LM2A 2WUSA 1VQMN 4KREA 1PTXA 3CQXA 1XMQK 2KJAA 2X78A 1C1BA 3NBPA 5H1SQ 4B1XB 4CBUA 2P9IB 1WSGA 4XIUA 3KLEA 1NGIA 5CE3A 4EZ9A 3EEQA 3D2FB 4M45A 1BIUA 4J2DA 4DTXA 2YV0X 4B9NA 5BPMA 2D0BA 3KOYA 1C0TA 4BRKA 2YHAA 1ZUTA 3QEVA 5LJWA 3KK3A 2BH1A 4BC4A 2F8TA 3NGYA 3TARA 1W7AA 3I55N 3QETA 2Q0UA 1TK8A 1Q86O 4ELUA 3OS0A 1WN7A 1NJXA 2GUPA 1Z25A 4FZYA 1ZU3A 3VQQA 1RT4A 1VQ7N 5E84A 3KVGA 3JSMA 4JV5K 5HRNA 4A61A 3LP1A 4CGIA 4C8NA 3SAFA 1WWNA 3AA5X 4B3MK 4O55A 3L3UA 5D3GA 3FZMA 4B1VA 4DG1A 4H0VB 1GLAG 1OMYA 3O4QA 3CQYA 2IS3A 1Y97A 3CIPA 3ZEUB 3V9SA 1L3VA 4CK1A 4LD0A 4NXMK 4WFBL 3T19A 4AEIA 3CJ7A 2ITMA 5DM7L 2ZF5O 1B7DA 3WEEA 1JZBA 3QERA 2NY8X 4X65K 3O3GA 4E7LA 3MCPA 2X74A 3ZETB 3MN7A 3KC6A 4NCGA 3NVKA 4DTSA 1WBDA 1HLUA 4FWKA 1XNQK 3J7AP 3AO1A 4CHNA 1ILYA 2QXLA 3K5OA 3MAQA 5E26A 3ALYA 3L2WA 5FPMA 4I6MA 3NCIA 5IT9O 3O4NA 3OBWA 2XY5A 4OLAA 3NAEA 2A40A 5JS1A 2AA4A 3QESA 1A5XA 2OA8A 3KWIA 2QWLA 1NK6A 3JS6A 4FJ7A 2E3GA 1VSHA 4B1WB 2ZE2A 3RSEA 2O8EA 5MLCQ 4H0OA 4FLZA 3O4WA 3SQ1A 3U3GA 3L2UA 4W5RA 3I56N 3S9HA 4YHHK 3TSUA 4RW8A 1C0FA 3EL2A 3OJSA 3K2PA 4QAGA 4M63C 1WSHA 4MDAA 1NU0A 5KGXA 3LDSA 4H0PA 2NUBA 4BC2A 1A5VA 1NK9A 3NVMA 1U47A 3D2EA 1XQSC 3A5OC 3VA3A 4DMNA 2E2OA 3ULEA 2X6SA 2HHHK 4LSLA 1VRUA 2QWQA 4XH4A 4CHZA 3H1VX 1SAZA 4JKCA 2CH6A 4CJ4A 4B9LA 2P9IA 1QHTA 3RTVA 5AQXA 3D2FA 3HXMA 4FLTA 3THVA 4CGJA 4HHFA 2QWMA 3CI5A 3LANA 3ASMA 2MN5A 3PSIA 3MWTA 4DQ8A 4BDZA 3T3FA 1CZBA 1NGEA 3PIOL 5AFUA 1S72N 3KLIA 1T6DA 1BI4B 2K35A 4H4MA 4CFBA 3P1GA 1M1KO 3DLRA 1UOCA 4J2EA 4CBWA 3KOWA 2O8FB 4LH5A 1IBMK 1JLQA 2JWKA 4B08A 2BUPA 1RT6A 1WSFA 3CXCM 1BHLA 3OYIA 3RWUA 5ELZA 2KBKA 1IKXA 4YFUA 4IEEA 4WQ5C 2KGQA 3HZ6A 4KFBA 2R7YA 3V9XA 1DTQA 4CEAA 5EX5A 4E1MA 2ASMA 3ZEUA 2GEMA 3V9WA 1JLFA 3V9UA 3P31A 4BR2A 3UKUB 4JI8K 2GV9A 1KTQA 3L2RA 4JKDA 3DYAA 1RDDA 4E7IA 1OVQA 2P9NB 3ZETA 1UA0A 1LV5A 3Q7CA 4BRAA 4DF4A 1HYSA 5C25A 3B8AX 3O8MA 1BOTO 4FLVA 1ZC6A 4BRPA 1AYJA 2ITGA 4BR7A 2HHVA 5GIOA 4DLGA 3FZHA 3GKUA 4J2AA 3UE5A 3OYJA 1ATSA 2D0OA 3S3MA 2HNYA 1U04A 4WQ5A 4DQSA 3CCUN 1XNRK 3MX5A 2YNIA 5CZ2A 1QSSA 4YOWA 3M5RA 1TKZA 2N2QA 3ZSWA 3IG1A 2LR3A 1HKBA 4YDUC 4LF7K 1VQ9N 2FXUA 3WXIA 2E88A 2QI2A 1TUYA 2Y1IA 4WE1A 2KSKA 1KFDA 1VSFA 4JD2B 3DRRA 1NE5A 2X6NA 4NLBA 3VMFB 5J1EA 1LQHA 3LALA 4FWSA 1XHZA 2FSKA 3P4IA 1KSPA 3I8BA 3OYEA 3MWPA 3DOLA 2G8VA 1S1TA 1C55A 3WNEA 3SMPA 2XO7A 3CJBA 3PX4A 5C10A 4PY5A 3DAWA 4X64K 3G25A 4A2BA 3OYCA 1YXQA 4W5TA 3DJCA 1JL1A 3OYMA 1YJWN 4YDUA 4W5OA 4XEIA 3VQ4A 5JVGL 3HP6A 3OBYA 4AH9A 3J80O 1K9MO 3LL3A 1C1CA 3E66A 1B3CA 4FJKA 4KO0A 4BQLA 2HBJA 1Q8IA 4MLHA 3BF3A 4BRCA 1O1WA 4MQ3A 1VSIA 3SQ0A 3TI0A 3ZX2A 2GELA 4LF6K 1T44A 3FZLA 2OTLN 3AVJA 4ELVA 1NJYA 2YKMA 4BROA 4B3OA 4KI4A 1RFQA 3H6EA 4ID1A 2ZD1A 5J2PA 3M1FA 1N4NA 2ZJRL 2IAJA 3CW4A 1WSEA 3M8RA 3SPYA 3ZSQA 2OYQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4N47 A;  2I61 A;  4JKA A;  1HJO A;  3V6D A;  2O8D A;  3VGM A;  1VK0 A;  2Q36 A;  2VYP A;  3ZSX A;  1KC8 O;  3PSM A;  1NGJ A;  1KQS M;  3TAE A;  2G8H A;  1T0Z A;  3TAP A;  3DLL L;  4CF8 A;  3BY5 A;  1D8Y A;  4CJT A;  3K9K A;  4BG8 A;  4CK3 A;  3TAN A;  1NK8 A;  1RCH A;  3QEW A;  2VG5 A;  3WUH A;  1XI1 A;  1VQL N;  4BDY A;  3DOK A;  1R0A A;  1B9D A;  5C42 A;  1UA1 A;  4DTU A;  1TL3 A;  4JKG A;  4OKE A;  3D2E B;  4JS4 A;  1RBR A;  4CGH A;  4CEZ A;  4R5P A;  3VQA A;  3LM2 A;  2WUS A;  1VQM N;  4KRE A;  1PTX A;  3CQX A;  1XMQ K;  2KJA A;  2X78 A;  1C1B A;  3NBP A;  5H1S Q;  4B1X B;  4CBU A;  2P9I B;  1WSG A;  4XIU A;  3KLE A;  1NGI A;  5CE3 A;  4EZ9 A;  3EEQ A;  3D2F B;  4M45 A;  1BIU A;  4J2D A;  4DTX A;  2YV0 X;  4B9N A;  5BPM A;  2D0B A;  3KOY A;  1C0T A;  4BRK A;  2YHA A;  1ZUT A;  3QEV A;  5LJW A;  3KK3 A;  2BH1 A;  4BC4 A;  2F8T A;  3NGY A;  3TAR A;  1W7A A;  3I55 N;  3QET A;  2Q0U A;  1TK8 A;  1Q86 O;  4ELU A;  3OS0 A;  1WN7 A;  1NJX A;  2GUP A;  1Z25 A;  4FZY A;  1ZU3 A;  3VQQ A;  1RT4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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