1NGB | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINQPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus	126
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngbA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngbA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngbA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngbA04

1QZ6A 4QS8A 3VEXA 3EZWA 4BC3A 4FOIA 2Q0RA 3ATVA 2FF3B 2VWBA 3DAWA 5EY4A 3C0BA 2E2QA 3MCPA 4FWSA 5KPZA 3WXLA 2IVPA 2CGKA 1C0GA 2YHWA 3LM9A 3ZEUB 3D2EA 3LDPA 4Z94A 3CETA 3QDKA 1D4XA 2Q0UA 3GG4A 3U9DA 1JCEA 3GOIA 4H5NA 4IZ9A 4IWVA 1HKGA 1YXQA 5KPRA 3ZX3A 4WQ4A 2IIRA 2CGJA 3ULEB 4EFHA 4AM6A 3A8YA 3O6WA 2FF6A 4EAHD 2VCPA 2HOEA 3UB5A 4JHDB 3B8AX 4JD2B 4BVOA 1S22A 3FE1A 1XUPO 3U9ZA 1GLEG 4BRQA 3VEZA 2P9IA 5BN8A 1QHAA 4IO8A 1JCFA 1TUYA 4CZGA 3CJBA 3IDHA 3SK3A 3GL1A 1C0FA 4CZEA 2QWLA 1V4SA 4XH5A 1SZ2A 4H5VA 4CZLA 3VGMA 3H46O 4BGAA 4BRGA 3U8XA 3JXUA 4M63C 1Y64A 5EVZA 1OKJA 4B1YB 2P9SA 2PBDA 3HZ6A 2A42A 3TU5A 4FWMA 2QWOA 4K43A 1U2VB 1Q18A 2V52B 5BRDA 3QBWA 1YAGA 2IVNA 3H1QA 1LOTB 3H3NO 4WQ5A 3RSEB 3DXKB 5JLFA 2FSKA 4H03B 5LJVA 2DPNA 4A61A 2HMPA 2V7ZA 3BUZB 4RCHA 5ADXA 4H0OA 3CQYA 5AQXA 1MDUB 3W3DA 3SLCA 4B1ZA 4H0XB 1NGIA 3LDLA 4BRIA 5BRFA 1ESVA 1ZXOA 2E20A 1BO5O 2BTFA 4DCHA 1NGBA 4B1VA 4H5WA 2WUSA 1NWKA 4JN4A 3SMSA 3HM8A 5AFUH 5KPTA 3FZFA 1BU6O 3VGLA 5BPMA 1X9JA 2HF3A 4EIAA 2ZF5O 1X3NA 4PKIA 1QQMA 4CD1A 3KZBA 5AQJA 4XH4A 2AA4A 1U2VA 1KXPA 4H0PA 1GLLO 4NO7A 3CJAA 4BGBA 4BR0A 1KAXA 1RGIA 3EN9A 3MN9A 2QWMA 3SMPA 1Z6RA 1ZC6A 1TYQB 1GLFO 4PKGA 4K25A 1EQYA 2YI1A 2P9UA 1RFQA 2P9LB 1HKBA 4BRHA 1S3XA 3D2FB 4GNIA 3C7NB 4BRKA 1QZ5A 1HKCA 3SJHA 4FPAA 4ISGA 3H45C 3O08A 2ASPA 3CJ7A 3L4IA 4I6MA 5EX5A 1YVNA 3O1WA 4FWPA 3CJ1A 3WXJA 1GLBG 1E4FT 4BRPA 5AQNA 5AQRA 3DXMB 3WT0A 3ZETA 4BR9A 4A2AA 5I9EB 5AQIA 4WYBA 3A5LC 2Q97A 3IFRA 2D1KA 3M1FA 2QM1A 4JNEA 3VETA 3FGUA 4B1XB 3O8MA 5LY3A 5E26A 1NGHA 3WEEB 4RTFD 4CZJA 3GE1A 3ID8A 3VF2A 1R59O 2EWSA 3VGKA 2GWKA 5FPEA 4HTLA 3H6EA 2E88A 1T6DA 5AZIA 3UKUB 4EHTA 3ATUA 4BVPA 4H0TB 3CJ9A 2FSJA 3IMXA 4F9OA 1WOQA 3UKRA 5BPLA 4FWLA 5E84A 3FZMA 3VERA 5AR0A 5AQZA 3ZX0A 4RWTA 3QFUA 2QWPA 2P9NB 3A5NC 3VEWA 3MN7A 4B9QA 4MO5A 5AQWA 3ZEUA 4CD3A 4PL7A 4O8KA 2P9PB 1SAZA 2CGLA 1NGDA 4YDUC 2PAVA 4BRCA 2BUPA 3L6QA 4JAXA 4A62A 2D4WA 4B1WB 4DHYA 3G25A 3S41A 3ULEA 1NM1A 3O1BA 1BA0A 4BRDA 3GBTA 4BG9A 1DKGD 5AQGA 3L0QA 4JHDA 4JD2A 1K8KB 4XH1A 5AZJB 5BN9A 3TPQA 4IXCA 1KAZA 4FSVA 4H0YB 3CHWA 3R8EA 2W40A 3CIPA 4FWNA 5FPDA 5FPMA 3WQUA 3BP8A 3CQXA 3AY9A 1NGCA 3QB0A 2ASMA 4HWIA 2P9PA 2P9KB 3F9MA 1J6ZA 3LDOA 3H1VX 4KBOA 2FXUA 5AQTA 2E1YA 2YHYA 4MO4A 4XEIA 1GLAG 3QMLA 2Q1NA 3J8AA 1LCUA 2YJEA 3O4WA 4K41A 5BREA 4FOEA 4FPBA 5AFUA 3VEVA 4C23A 3OHRA 3I8BA 4H5RA 2IVOA 3RSEA 3DXKA 4E1JA 4BQZA 3ENHA 1BWFO 4PL8A 3EKUA 3VESA 3DWLA 3KHYA 1GLJO 1ZBSA 2A6AA 5AQLA 3HBTA 5AQPA 1HJOA 4J8FA 2J4RA 3D2EB 5B8HA 1NGFA 1IJJA 4BRLA 4GY2B 1XQSC 5BRHA 4DB3A 5AQFA 1BDGA 1SQKA 3A5OC 3VENA 2GTDA 2Q2RA 4IJAA 4IJNA 2CH5A 4Y0WA 5F0XA 3MDQA 1TUUA 2GEMA 1KAYA 3MK6A 5F1XA 3FZHA 1ATSA 2D0PA 5JMVA 5AQQA 4FWOA 1MWMA 4FL9A 4FO0A 1RDWX 4BROA 3BEXA 4BR2A 4BREA 4PKHA 4ISFA 1E4GT 4CZFA 1BA1A 5JICA 4CBUA 3O5BA 4BR4A 2QW9A 2P9IB 2Q31A 1TYQA 3VPZA 5AQYA 5ELZA 3D7EO 2P9LA 2YHXA 1HPMA 3EO3A 3D2FA 1NGGA 2HF4A 3QICA 4K42A 4CI6A 3ENOA 3C7NA 4CBXA 1NGAA 4BR7A 4CZIA 2P9SB 1JCGA 4BC5A 3A0IX 3U4LA 2A41A 3MN5A 2YCHA 4H5TA 4CZKA 4WQ4C 1BUPA 4QS9A 5BR9A 3WXKA 2D0OA 2I7PA 1T44A 3DXMA 3HSCA 3WUHA 4BRNA 4FWRA 2ITMA 2NRHA 3LDQA 1BG3A 3VEYA 4MLHA 4EHUA 2H3GX 1U6ZA 2YJFA 2GWJA 5AQUA 3VOVA 4YDUA 1DGKN 1MA9B 3JS6A 1QQOA 3MMVA 2A3ZA 2F9TA 4MLEA 5KQDA 3WEEA 4FWQA 3EL2A 4BC4A 1DEJA 1NMDA 1HUXA 1NLVA 4AM7A 3VEOA 2QXLA 1V4TA 1NBWA 3AAPA 5LJWA 2FLOA 5AQSA 3EKSA 2OANA 2CH6A 3IUCA 3LL3A 3UKUA 3KVGA 3FLCO 1Z05A 4B1UB 4QS7A 4CBWA 2V51B 4BRFA 3R9PA 4BC2A 1ATNA 5AQHA 4DQ8A 1QQNA 2FSNA 3QFPA 2P9NA 3FFKB 5ADXH 2QWNA 4FWKA 3HI0A 1XC3A 1P8ZA 2UYTA 4M7YA 3R6MA 5AQVA 4WQ5C 3AARA 2KHOA 5AQKA 4H0VB 4A2BA 2QWQA 5BPNA 2GUPA 2V7YA 2E2PA 2F9WA 2AP1A 3W0LA 2P9UB 3M6GA 3CI5A 2ZGZA 1T6CA 3I33A 4BRAA 3VF4A 4BR5A 1IG8A 3ZX2A 2I7NA 1X3MA 4BQLA 2E8AA 5EOYA 1CZAN 3UE5A 1HLUA 2W41A 1MWKA 3QBXA 2ZWHA 3CERA 1K8KA 1GLCG 3HTVA 4I6MB 5AZJA 5AQMA 1H1VA 2A40A 3DJCA 5JLHA 4CZHA 5CE3A 1WUAA 5KQ8A 4LC9B 4BG8A 1YUWA 3FZKA 5F2RA 3ZETB 2QWRA 5FPNA 1GLDG 4O5FA 1NGJA 2ZGYA 3CJCA 3GDQA 3LM2A 4CJ7A 4BRMA 2VYPA 2E1ZA 3WQTA 2ASOA 2A5XA 3BF1A 2P9KA 5AQOA 3AAQA 2NLXA 2E2NA 4M7XA 4CZMA 1HX1A 5EXWA 3O80A 3FR0A 2Q36A 1G99A 3H3OB 3A5MC 2GELA 3P4IA 5AZIB 1NGEA 2NZTA 4L3QA 3BF3A 3FZLA 3VF6A 4NB4A 3MN6A 1BOTO 5TKYA 1ATRA 3UKRB 4ISEA 3WXIA 3LDNA 2E2OA 3M3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1BISA 1U49A 3E9OA 3KOXA 4FOIA 2EX3A 2FF3B 3VTIA 3AO5A 5EY4A 3C0BA 4B3TK 5GINA 4NYFA 3LM9A 4Z94A 3LDPA 1S6PA 1D4XA 5MLCQ 2YHBA 4M45A 2G8VA 3OYHA 1JCEA 4IZ9A 3OYNA 4IWVA 4DTRA 4FXDA 3ZT2A 1JLBA 4V19S 3AVLA 5DMRA 3LP3A 4FVMA 5E41A 4ELVA 2QEXN 3AVMA 3O6WA 4FJHA 3AV9A 3L4QA 3ZT0A 4JHDB 1S22A 3FE1A 4JKCA 3ZSQA 1GLEG 1IKXA 1VAZA 4BRQA 4CEQA 1JCFA 2LJ7A 2O8FB 1TUYA 1KRPA 4CZGA 4BDZA 3IDHA 3HYFA 3GL1A 5JS1A 2HNZA 4HHFA 2UU9K 2K35A 4B08A 1NJWA 4XH5A 1LAWA 3K5OA 2KZZA 3MXIA 2WOMA 2BANA 4BRGA 1POIA 3JXUA 4KRFA 4MDAA 1PE4A 4RW6A 2DFHA 4A5BA 3SUQA 1IBKK 4CEOA 3L56A 1FW6A 3TU5A 4CFDA 2I61A 4DTMA 1U2VB 4PY5A 4WFNL 1YAGA 4DSFA 1VHXA 3MEEA 3CYGA 4JLHA 2DPNA 3ULDA 4CERA 4H0OA 5AQXA 1MDUB 3O4NA 3W3DA 2WFBA 4C8KA 4B1ZA 3VMFB 3LDLA 3SNNA 5BR8K 4Z4GA 2PYJA 2BTFA 4DCHA 4IFVA 1NWKA 1GPSA 1RBVA 3ISNC 4JN4A 3MEDA 3SMSA 1WB9A 5AFUH 5KPTA 4EIAA 3MXMA 1VSKA 3HVRA 3O9SA 1QQMA 4HE7A 1LW0A 4CD1A 1Q9XA 1ASWA 4HUEA 5I42A 4CFCA 1C1AA 4B3MK 4H0PA 4OPKA 3DRPA 3CPWM 3GKUA 4IKFA 5M1NA 5C2DA 3DLRA 4JKFA 3MX5A 4YHHK 2KGQA 4I9QA 3AVBA 3C6AA 3NF7A 3I55N 1O13A 4BRHA 3O3FA 4FLYA 4DR5K 4W5QA 1CZ9A 3SI6A 2ZJQL 4W5TA 3SZ2A 1VQ8N 1BCMA 2GBZA 1IBLK 3KLHA 3HOSA 1XWLA 4FLXA 3H45C 3NCIA 1YVNA 3O1WA 1LQQA 3WXJA 1CN2A 4JRQA 1GLBG 1E4FT 3QEIA 2E5LK 4OVLA 5AQRA 3WT0A 3SBTA 3THWB 3TAQA 3LANA 4DFJA 3HPHA 3CCVN 1UA1A 3M1FA 4GV3A 4YOWA 4ILJA 1N5YA 3FGUA 4JI8K 4KREA 1ZYQA 3WEEB 5JENA 3NMUA 4CJ5A 3HRGA 4E7LA 4DMNA 5HRRA 3VF2A 4FJ9A 2GWKA 2X74A 1DQ7A 3DI6A 5AZIA 3U3GA 1T6DA 4BVPA 4CJWA 3CJ9A 4JI1K 1JL2A 5E84A 3FZMA 5AQZA 2ZD1A 3A5NC 5M1QA 3TR8A 4LF6K 1Q7YO 3ZSXA 5C42A 5JVGL 4GKJK 4PL7A 3G10A 4DTNA 3OYIA 4NYNA 4OPAA 4BRCA 2PAVA 5AJ3K 1G15A 3V9WA 4O0JA 3QESA 3SAGA 2HHXA 3E01A 4DHYA 5J2NA 4N41A 4CJ3A 3S3NA 4KYPA 5TKWA 3QIOA 4JI4K 4BRDA 2OPPA 2MZ0A 1L3SA 4JHDA 1K8KB 4XH1A 5AZJB 2I5JA 2W42A 2O8FA 1BIUA 1P90A 3CHWA 3AVIA 4AHRA 1BK8A 4OJRA 3VQ6A 5FPDA 5FPMA 3WQUA 1RT6A 3JSMA 3P38A 2G8UA 3AVCA 2P9KB 3NF6A 3LDOA 5KGXA 4DFKA 4JI2K 2QKKA 5AQTA 1HR0K 4JI7K 2YHYA 3DOLA 5BREA 3AVHA 4M3UA 4AQYK 1L4VA 4H5RA 1ZVGA 4DQQA 3RMAA 4B9NA 3KD5E 3CFPA 4YNQA 1HNZK 4BQZA 2N66A 3EY1A 3K59A 3G4SN 1HJRA 3KHWA 3HBTA 3K5LA 3KKRA 3N4PA 4E7KA 3CC4N 3DYAA 3E9LA 2HSTA 1NPIA 3OYKA 3HM9A 4GY2B 5AQFA 1VNBA 4CGDA 1IH7A 1D9DA 1SQKA 3AVAA 1ZUTA 4CIGA 1NG9A 2Q2RA 4CHQA 5F0XA 4KB0A 4Z4IA 3MK6A 1K73O 1T8EA 3O3GA 2JWLA 4MDBA 3TSUA 1MU2A 4PKHA 3AA3A 1C6VA 2IAJA 2WC9A 2FBYA 3EO3A 1NGGA 1E3MA 4AHUA 4K42A 4OX9K 2N2RA 4CBXA 1TKZA 3QLHA 4CZIA 4KB1A 2P9SB 3U4LA 3M8RA 1MR4A 4H5TA 4WQ4C 3IG1A 1JLAA 3SUOA 2HHQA 2I7PA 1T44A 3WUHA 3HSCA 3THWA 3BZKA 3KK7A 1VSLA 1VQNN 4LF7K 1SN4A 2H3GX 1T0ZA 3SUNA 5AQUA 4DV2K 4AHTA 3QETA 3OYLA 2A3ZA 3DRRA 4MLEA 1B9DA 4AH9A 4CJKA 3WEEA 1RBSA 4FWQA 4OPJA 1B7DA 3CC2N 1NBWA 5LJWA 2OANA 2CH6A 4RW9A 1I6GA 1HQUA 1Q9YA 4DR2K 3ZSVA 1T7PA 2FBTA 4PHTX 4BRFA 2KBKA 4M3RA 4TSXA 4FVUA 3BY5A 3QERA 4B3SK 5FRNA 4M3TA 4WQ5C 3T3FA 1L3TA 2QWQA 5BPNA 3VTHA 2F9WA 1ASVA 3TTCA 4JK7A 3CI5A 2ZGZA 3HK2A 1RTHA 4BRAA 4CGJA 5DM6L 1KC8O 4HCBA 3NGIA 1Z25A 5EOYA 2YX6A 1RT5A 4IOXA 1K8KA 5AZJA 3SPYA 4CHYA 3NAEA 4C8OA 1WLJA 3AO4A 5JLHA 4CZHA 4M3XA 5CE3A 4BG8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BIS A;  1U49 A;  3E9O A;  3KOX A;  4FOI A;  2EX3 A;  2FF3 B;  3VTI A;  3AO5 A;  5EY4 A;  3C0B A;  4B3T K;  5GIN A;  4NYF A;  3LM9 A;  4Z94 A;  3LDP A;  1S6P A;  1D4X A;  5MLC Q;  2YHB A;  4M45 A;  2G8V A;  3OYH A;  1JCE A;  4IZ9 A;  3OYN A;  4IWV A;  4DTR A;  4FXD A;  3ZT2 A;  1JLB A;  4V19 S;  3AVL A;  5DMR A;  3LP3 A;  4FVM A;  5E41 A;  4ELV A;  2QEX N;  3AVM A;  3O6W A;  4FJH A;  3AV9 A;  3L4Q A;  3ZT0 A;  4JHD B;  1S22 A;  3FE1 A;  4JKC A;  3ZSQ A;  1GLE G;  1IKX A;  1VAZ A;  4BRQ A;  4CEQ A;  1JCF A;  2LJ7 A;  2O8F B;  1TUY A;  1KRP A;  4CZG A;  4BDZ A;  3IDH A;  3HYF A;  3GL1 A;  5JS1 A;  2HNZ A;  4HHF A;  2UU9 K;  2K35 A;  4B08 A;  1NJW A;  4XH5 A;  1LAW A;  3K5O A;  2KZZ A;  3MXI A;  2WOM A;  2BAN A;  4BRG A;  1POI A;  3JXU A;  4KRF A;  4MDA A;  1PE4 A;  4RW6 A;  2DFH A;  4A5B A;  3SUQ A;  1IBK K;  4CEO A;  3L56 A;  1FW6 A;  3TU5 A;  4CFD A;  2I61 A;  4DTM A;  1U2V B;  4PY5 A;  4WFN L;  1YAG A;  4DSF A;  1VHX A;  3MEE A;  3CYG A;  4JLH A;  2DPN A;  3ULD A;  4CER A;  4H0O A;  5AQX A; 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1NGBA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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