1NGB | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINQPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism	Bos taurus
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
total genus	126
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngbA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngbA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngbA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngbA04

3A5NC 2FF6A 5AQOA 1DKGD 5FPEA 3S41A 2HMPA 2P9KA 4CZKA 5AQKA 1NGGA 3U4LA 2YCHA 3MCPA 3WQUA 2P9SB 3GE1A 3O1BA 4BRCA 1YVNA 3A5LC 1TUYA 4JAXA 2NRHA 1ATNA 1MDUB 2VWBA 3FE1A 4H5RA 1JCGA 1T44A 1X3NA 3QBXA 4IJAA 3FFKB 3U9DA 3CJ1A 4EFHA 2A6AA 1QQNA 4H5VA 3BP8A 3IDHA 1NGJA 4B1XB 1WOQA 4FPBA 2YHYA 3LDQA 3WQTA 1HKBA 3O5BA 1KAXA 3VEYA 4BR2A 3D2EB 2Q97A 4BRKA 4CZJA 3FLCO 3HBTA 1BG3A 1NM1A 4FWMA 3VEXA 3ZETB 5AQSA 2D0PA 1GLBG 1DGKN 3QBWA 3UKUB 3J8AA 5AQXA 3VEWA 3IFRA 4H5TA 2GWKA 5BRFA 1K8KB 2E2NA 4BC5A 2I7NA 3SJHA 4BRGA 4CZMA 4DQ8A 1HLUA 1MWMA 2ZWHA 4RWTA 4CZIA 3H46O 1CZAN 4CZHA 3CI5A 1MWKA 2YJFA 3FR0A 3LDNA 2IIRA 2IVNA 1GLCG 2P9LB 2Q36A 2YI1A 2CH5A 3O08A 2V52B 1S3XA 3DXKB 3VF4A 3GDQA 5F0XA 5AZJA 1NGHA 2FSNA 4PL8A 2QWOA 4FL9A 5AQTA 3FZMA 3VGLA 3EKUA 1LOTB 1QHAA 1X9JA 3F9MA 3H1VX 5AR0A 3H3NO 4FWNA 2P9UB 1RDWX 1NMDA 3QMLA 3FZLA 1JCEA 5EOYA 4BRPA 1NBWA 4GNIA 5FPMA 2D1KA 5JICA 2Q0RA 3I8BA 4IO8A 3M6GA 4L3QA 2ZGZA 1T6CA 3WXJA 4BRIA 3HI0A 1MA9B 3U9ZA 5EVZA 5AQWA 3H6EA 2WUSA 4HTLA 3G25A 4CBWA 1ATSA 1QZ6A 3WEEB 2FSKA 2E2QA 4FSVA 3O1WA 4BR5A 2P9PB 1NWKA 3O8MA 4H03B 4BC3A 1KXPA 3HZ6A 2E88A 2VCPA 5BREA 3CJCA 4CJ7A 5EX5A 2P9KB 1D4XA 5E84A 2KHOA 1ZXOA 1BO5O 4BR0A 3U8XA 2A42A 3R6MA 3VERA 4A2BA 4I6MA 2AA4A 4A62A 4M7YA 5TKYA 4JN4A 4BC4A 3QDKA 3VETA 2F9WA 4IZ9A 4F9OA 4B1UB 2D0OA 3RSEB 4H0PA 4BRQA 1V4TA 3LDLA 1BDGA 5KPRA 4WQ5A 2A5XA 5AQRA 1X3MA 3CERA 4YDUA 4JD2B 3CHWA 3AAPA 2QXLA 4WQ4C 4BQLA 5AQLA 4A61A 2QWMA 1U2VA 2GTDA 4FWLA 1GLEG 4XH1A 2A3ZA 3AY9A 1EQYA 2E2PA 4XH5A 4B1WB 5BN9A 1IG8A 4BVPA 4Y0WA 3CJ9A 3ENHA 5EY4A 5AQYA 5F1XA 2E1ZA 5AQGA 4CI6A 3WUHA 1T6DA 3HM8A 4IWVA 4B9QA 4NB4A 3IUCA 3A5MC 3MDQA 4BRMA 2P9IA 2OANA 3EO3A 3QB0A 1RFQA 4CBUA 3QICA 3DXMB 4MO4A 4BRHA 3UKRA 2YHWA 3VEVA 3BUZB 4QS9A 4EHTA 3MMVA 4M63C 2ASOA 3MN5A 1KAZA 1HKGA 3H3OB 1HKCA 3EKSA 3D2FB 3H45C 3LL3A 4MLHA 5JLFA 3P4IA 5CE3A 4H0XB 1YUWA 4FOIA 2VYPA 4BRDA 3A0IX 3CQXA 1R59O 3SMPA 3GBTA 3DJCA 5FPNA 4BC2A 2GEMA 4FWRA 2ZF5O 4BR9A 2YHXA 1BWFO 4H0YB 1YXQA 3B8AX 2E20A 2W40A 4BG9A 1BOTO 3VF2A 5AQZA 3SK3A 3VGKA 3D2EA 3M3ZA 3WT0A 4MLEA 2V7ZA 3VEZA 3BF1A 2J4RA 3ZETA 3TPQA 5AQIA 4QS7A 4CD1A 3BF3A 1BA1A 4BGBA 3QFUA 3FZKA 4B1VA 4BVOA 1Y64A 3ID8A 4EAHD 2FXUA 4Z94A 1DEJA 2QM1A 4FO0A 5BRDA 4HWIA 5LJWA 1H1VA 4QS8A 4BROA 1GLLO 1K8KA 3BEXA 5AQFA 3ATVA 2PBDA 4AM7A 4K42A 4BRNA 4IJNA 4I6MB 1KAYA 2HF3A 3JXUA 4BRFA 3C7NB 2ASPA 1SQKA 1GLFO 4RCHA 5KQ8A 4PKIA 2FF3B 1ATRA 3MN7A 4YDUC 4EHUA 2P9LA 3FZHA 1NGAA 4E1JA 3VEOA 1Z6RA 5BPLA 3DXKA 1NGFA 3O4WA 3SLCA 4J8FA 3HSCA 2HOEA 3AAQA 4CZEA 3DWLA 1BA0A 4FWOA 5JMVA 4ISEA 3LDPA 3AARA 1GLAG 4IXCA 2GWJA 5AZIA 3L6QA 4CD3A 2P9NA 2E8AA 4JHDA 1RGIA 5ADXH 4K25A 4C23A 1LCUA 3JS6A 5AQPA 5FPDA 3D7EO 4AM6A 3ENOA 4BRAA 2BUPA 4JNEA 4DHYA 3MN6A 3VENA 3CJAA 3L4IA 2BTFA 3TU5A 4CBXA 3R8EA 2QW9A 1ZBSA 3KHYA 5BPNA 1HPMA 3GG4A 4KBOA 1BU6O 1S22A 1TUUA 3SMSA 2P9IB 4K43A 3ULEA 4CZFA 4O8KA 2H3GX 1TYQA 2Q2RA 2GUPA 4BQZA 2P9PA 2EWSA 5AFUH 2Q1NA 4H0TB 3L0QA 4PL7A 1BUPA 1E4FT 3W3DA 3EZWA 4DCHA 5LJVA 1QQOA 4FOEA 3WXIA 4H5WA 5BR9A 4A2AA 1NGEA 3ZX2A 2FLOA 1HJOA 5KPZA 4EIAA 3FGUA 2CGLA 2ASMA 4BR4A 5E26A 1QZ5A 3CQYA 5BRHA 5AQUA 2QWQA 5EXWA 3CIPA 4MO5A 3VPZA 4DB3A 3ATUA 4XEIA 1JCFA 2QWLA 3GOIA 5JLHA 1V4SA 3ZEUA 1SAZA 4O5FA 3A5OC 2CGJA 4LC9B 1NGDA 3RSEA 2Q0UA 3ZX0A 3FZFA 4RTFD 4BG8A 2QWNA 3WXKA 3KZBA 2PAVA 3CJBA 2P9SA 5AZJB 3O6WA 2FSJA 1QQMA 4JD2A 4B1ZA 4FWPA 3LM2A 5B8HA 4NO7A 2D4WA 3QFPA 2GELA 2QWPA 1C0GA 3VOVA 5ADXA 5AQMA 2QWRA 5I9EB 4WQ4A 2HF4A 1C0FA 2V51B 4H0VB 1GLJO 1HX1A 3IMXA 4FWSA 5BN8A 3LM9A 5AQHA 1NLVA 3VGMA 3M1FA 4B1YB 3DXMA 2YJEA 2DPNA 5AFUA 1U6ZA 3W0LA 3I33A 1P8ZA 5LY3A 4CZGA 2CGKA 1OKJA 1XC3A 4ISFA 3UKUA 3A8YA 3UB5A 3VF6A 2E2OA 3D2FA 1YAGA 5AZIB 1Q18A 4H0OA 1G99A 2P9NB 4GY2B 4JHDB 4BR7A 3KVGA 2UYTA 4PKHA 5KPTA 3UE5A 1E4GT 3CJ7A 4BGAA 1WUAA 2I7PA 4WQ5C 2CH6A 3LDOA 5BPMA 2W41A 5AQQA 2IVPA 1NGIA 5AQJA 1HUXA 2E1YA 3O80A 4FWKA 3H1QA 4BREA 2V7YA 3WXLA 4FPAA 1GLDG 4XH4A 2ZGYA 2NZTA 5ELZA 3ULEB 5KQDA 5AQNA 1SZ2A 1TYQB 1U2VB 2F9TA 3CETA 3MK6A 4WYBA 2P9UA 2AP1A 2IVOA 4CZLA 5AQVA 3DAWA 3MN9A 2NLXA 3ZX3A 1NGCA 1ZC6A 1IJJA 1XQSC 3HTVA 2A40A 1NGBA 3GL1A 3R9PA 3OHRA 3C0BA 4FWQA 3EN9A 3EL2A 2Q31A 5F2RA 1J6ZA 4PKGA 2ITMA 4K41A 4ISGA 1Z05A 4H5NA 4M7XA 1XUPO 3WEEA 4BRLA 2A41A 3VESA 3C7NA 3UKRB 3ZEUB 1ESVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3A5NC 4E7KA 1U47A 3VA3A 1FW6A 1DKGD 3G4SN 2HMPA 3I8DA 4AH9A 1NGGA 3K57A 3MCPA 2UU9K 5C10A 3O1BA 3E9OA 3A5LC 1E3MA 1TUYA 2NRHA 1ATNA 2VWBA 1T44A 3OVNA 2UUBK 4E7LA 3FFKB 3TAMA 2XY5A 4LF5K 2LI7A 4DR5K 2HVIA 4BY9C 5JS1A 3RMBA 1NGJA 4DUYK 1Q7YO 4FPBA 2YHYA 3LDQA 3O9UA 2E3GA 1IKXA 3CFOA 3OS2A 3O5BA 5CY4A 3TI0A 3T69A 3VEYA 4IFVA 1OH6A 3D2EB 2Q97A 4GKKK 2RN2A 4BRKA 3FLCO 3HBTA 3VTIA 3VEXA 4RW6A 1VQMN 3VQDA 5KRTA 1JL2A 2Z1HA 3DLGA 1HR0K 4DTMA 4DQRA 1I6GA 3V9ZA 1XHXA 1ZBLA 3J8AA 1KVBA 1IBKK 3VEWA 2P5OA 3IFRA 1FH3A 2B5JA 3MWPA 1K8KB 1UWBA 1RDCA 4BRGA 1S72N 4LY7A 3R1XA 2VGNA 2QK9A 4DQ8A 1MWMA 1B7DA 1SN4A 4IFYA 4CZIA 1NJWA 3H46O 5J2MA 1IKVA 1NRAA 3GKUA 3LDNA 1GLCG 4B8AB 3NH2A 2IGIA 2V52B 3DXKB 3LP2A 2W42A 4MQ3A 4RG8A 4RW4A 3GDQA 4Z4HA 5F0XA 5AZJA 1NGHA 5JVHL 1OZZA 3E66A 3VGLA 1SKRA 3H3NO 4AHUA 4J2BA 1NMDA 2HBJA 5CHIA 3TABA 4BRPA 4OX9K 3OYKA 4GNIA 2VWJA 2D1KA 4AHSA 1VQ4N 3NBPA 4IO8A 4L3QA 3T19A 2IS3A 4JI6K 3THWB 2VQFK 5EVZA 5AQWA 4DR1K 1M1KO 1ATSA 3WEEB 2YIPA 4KHNA 2AJQA 2N69A 1FXXA 4W5QA 2HB5A 3THYB 4BECA 3O8MA 3VQ9A 3E01A 1BI4B 1ASUA 2F4VK 5EX5A 1VQ7N 2XY6A 3NF7A 1TK8A 1ZXOA 5JVGL 1BO5O 3D0PA 1P90A 4CF2A 1NK8A 3ZSWA 2ZQBA 4I6MA 4FK0A 3CMEN 4M7YA 3RRGA 4CF1A 1JZAA 2ZE2A 4FJGA 4IZ9A 1HNXK 3U3YA 1LV5A 1W97L 1V4TA 2OTLN 1CXUA 1SUQA 4YDUA 2KFNA 4JD2B 1RT2A 3CHWA 1RBTA 4WFNL 3AAPA 2PYLA 4R5PA 4BQLA 3CD6N 5AQLA 3OYMA 2QWMA 4FJMA 2YNFA 4FWLA 3HVRA 3RVCA 3QNOA 3S9HA 3P1GA 2HW3A 4Y0WA 4LFCK 1VQ8N 2K35A 2HSTA 3ENHA 4CEEA 3ZSQA 4AILC 5F1XA 5AQGA 4N56A 3WUHA 4IWVA 3NCIA 4FLWA 1O13A 1RT7A 3V6DA 3KK1A 4ZTFA 3NHGA 1RILA 4MO4A 3NH1A 2YHWA 3OYJA 1JLAA 1KV0A 3PX4A 3KOWA 4EHTA 2I5JA 2ASOA 4KRFA 4O0JA 1ITGA 1HKCA 3AVBA 1JKHA 3H45C 1VQNN 4WFAL 3IKMA 4H0XB 4O55A 4BRDA 4DLGA 3A0IX 3CQXA 1IH7A 4WE1A 2VY6A 4CJWA 1L5UA 5FPNA 4BC2A 2BANA 4FWRA 3PV8A 2ZF5O 4B3TK 4ILGB 4B9UA 4BWJA 2YHXA 1EETA 2HHSA 1CLQA 3HYFA 3ZT0A 5LMNK 1I2VA 2G8WA 1D8YA 2D56A 4LH5A 1DQ7A 4BG9A 4GVMA 3VF2A 5AQZA 4Y1DA 2NRTA 1ZU3A 3WT0A 2KFZA 3DRRA 4CFCA 3BF1A 2BRZA 2E3FA 4CIGA 3P38A 4QS7A 3BGRA 3HT3A 1QSSA 1ZVEA 4RW7A 4BVOA 3PLAA 5BRDA 4KREA 2HHTA 1P0AA 5LJWA 3KLHA 4Q0BA 1H1VA 3KK2A 3ZSVA 3DOKA 4H8KA 5AQFA 4B8CA 4K42A 2KBHA 1B9DA 4Z4GA 4KTWA 4B3RK 2ASPA 4C8MA 2I61A 3LWLA 2X6SA 1ATRA 1TV6A 3MCAB 3MN7A 3EZ5A 3G6EN 3S3NA 2P5GA 3R2VA 4FLYA 1Z6RA 1NK7A 1NGFA 4CQKA 3HSCA 1BA0A 3KLFA 1VQON 4IXCA 3QO9A 4E89A 4CD3A 2E8AA 3QNNA 2VWKA 3NGYA 4CHOA 1WB9A 5AQPA 5M1NA 4BRAA 3TAPA 3VENA 5HROA 3L4IA 1G15A 1JLBA 3KHYA 4GVEA 1HPMA 1S1XA 4M45A 1XMOK 4HHTA 3KWIA 2P9IB 3ULEA 3ZSRA 3CM5A 4W5NA 3ZT3A 3V9WA 1HRHA 4CFAA 3KKRA 5AFUH 2NY9X 3O4QA 1T1TA 1I2UA 3K9JA 2ZJRL 3MXJA 3OTOK 1VQLN 2O4GA 2QA4N 2HHQA 4A2AA 1S1UA 3LAMA 4BE7B 2SN3A 5GIPA 1JLCA 4EIAA 4AB0A 2YNGA 3ENBA 5AQUA 2LSNA 2QWQA 2XO7A 4MO5A 2D0AA 4AHRA 3T3FA 1LW2A 4FZZA 1SAZA 3M8QA 1KLNA 3T1HK 4BDYA 4LC9B 3HO1A 4LSNA 3KZBA 3CJBA 5GIOA 2ASCA 2G8HA 2QXFA 3LM2A 1T7EA 4KHPK 3F5TA 3PO5A 3ZSXA 1KRPA 2HHIA 5ADXA 4BE0A 5AQMA 5I9EB 4H0VB 3OYIA 4J2DA 1AHOA 3C6HA 1HNIA 1HPZA 3NAEA 3NF6A 3M1FA 4AAZA 1RTJA 1VSIA 3CQ8A 2KKZA 4O0IA 1KVAA 1PX9A 1U48A 4M3YA 1U6ZA 1YIJN 3CC2N 1HJRA 2P51A 1N6QA 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1BRZA 3OJSA 1O1WA 5BRFA 1TK5A 1C1BA 3SJHA 4LD0A 1SL0A 4F4KA 1L3UA 1HLUA 2ZWHA 3I0SA 4B9SA 1YJ9N 2P1JA 4JK9A 3IAYA 2GMOA 4IG3A 4DQQA 1DLOA 3K5LA 4X62K 3KLEA 1ILYA 3AVNA 1S3XA 1TI5A 4CJ3A 2G8FA 4CGHA 3ISNC 3SQ2A 1X9SA 4W5OA 1QTMA 5I3UA 4OKKA 2FSNA 2QWOA 5AQTA 1L4VA 3HRGA 5AR0A 1RDWX 3V1QA 4DQPA 3J7ZO 3SAHA 3OW2M 4FYDA 3T7ZA 3QEVA 4M3WA 1BGXT 1W7AA 1Q81O 5FPMA 4DV6K 2YBRC 3I8BA 1ZBFA 2ZGZA 1T6CA 1VRTA 1S1VA 4BRIA 3G25A 4CHNA 1QZ6A 1NJIO 2E2QA 2O8DA 3O1WA 2B3CA 1WNSA 5C2DA 1UAXA 2ITGA 1T0ZA 2E6MA 2XRIA 1TKTA 3HZ6A 3ULDA 2E88A 1M90O 3LAKA 3CJCA 1T3VA 1YT3A 3DYAA 2NRVA 3MXMA 4DF8A 3KWGA 4BR0A 3U8XA 4KHYA 1VQPN 3QETA 4A62A 2PY5A 4HCBA 3CM6A 3VETA 2F9WA 5KI6A 5CY0A 1SL1A 4BEBA 3RSEB 4H0PA 1Z26A 1TK0A 3MEDA 1BDGA 5KPRA 3M8PA 5IWAK 3TAGA 2OCEA 2A5XA 5AQRA 4OJRA 5HP1A 1TL3A 1D5AA 1VSKA 4CGJA 4DF4A 1U2VA 4XH1A 1GLEG 4BE1A 2NRZA 3AY9A 4FJ9A 2HBMA 4XH5A 5JS2A 4OLAA 3LZJA 3I0RA 3CJ9A 3PSMA 5EY4A 1NPIA 2LKBA 3K2PA 3EE9A 3HOTA 4BE2A 4CHPA 2NRXA 4NB4A 2BH1A 1QVGM 2OPPA 3O3FA 5M1OA 2OANA 3VQ8A 3OYDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A5N C;  4E7K A;  1U47 A;  3VA3 A;  1FW6 A;  1DKG D;  3G4S N;  2HMP A;  3I8D A;  4AH9 A;  1NGG A;  3K57 A;  3MCP A;  2UU9 K;  5C10 A;  3O1B A;  3E9O A;  3A5L C;  1E3M A;  1TUY A;  2NRH A;  1ATN A;  2VWB A;  1T44 A;  3OVN A;  2UUB K;  4E7L A;  3FFK B;  3TAM A;  2XY5 A;  4LF5 K;  2LI7 A;  4DR5 K;  2HVI A;  4BY9 C;  5JS1 A;  3RMB A;  1NGJ A;  4DUY K;  1Q7Y O;  4FPB A;  2YHY A;  3LDQ A;  3O9U A;  2E3G A;  1IKX A;  3CFO A;  3OS2 A;  3O5B A;  5CY4 A;  3TI0 A;  3T69 A;  3VEY A;  4IFV A;  1OH6 A;  3D2E B;  2Q97 A;  4GKK K;  2RN2 A;  4BRK A;  3FLC O;  3HBT A;  3VTI A;  3VEX A;  4RW6 A;  1VQM N;  3VQD A;  5KRT A;  1JL2 A;  2Z1H A;  3DLG A;  1HR0 K;  4DTM A;  4DQR A;  1I6G A;  3V9Z A;  1XHX A;  1ZBL A;  3J8A A;  1KVB A;  1IBK K;  3VEW A;  2P5O A;  3IFR A;  1FH3 A;  2B5J A;  3MWP A;  1K8K B;  1UWB A;  1RDC A;  4BRG A;  1S72 N;  4LY7 A;  3R1X A;  2VGN A;  2QK9 A;  4DQ8 A;  1MWM A;  1B7D A;  1SN4 A;  4IFY A;  4CZI A;  1NJW A;  3H46 O;  5J2M A;  1IKV A;  1NRA A;  3GKU A;  3LDN A;  1GLC G;  4B8A B;  3NH2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1NGBA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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