1NGBA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINQPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
total genus 126
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngbA04
4H0XB 3FZKA 1DEJA 3GBTA 2FSJA 5KQ8A 5AQOA 3C7NB 3VEOA 4BVPA 4MLEA 3VEVA 4AM7A 5EOYA 3UKRB 1WOQA 1D4XA 2HF3A 3FZHA 1NGBA 3VF6A 2VYPA 3AAQA 1U2VA 3GOIA 4H0PA 4E1JA 3ATVA 4CI6A 1RFQA 2YHYA 5TKYA 4XH4A 1X3NA 2GTDA 2IVPA 3VPZA 5BRDA 4FWNA 3AAPA 4BQLA 3HBTA 4QS7A 3WEEA 4PL7A 1BDGA 4BRAA 1GLEG 3ULEA 2E2NA 5AQKA 2A41A 4M63C 1T44A 1JCEA 4B1VA 1JCGA 4FWPA 3GL1A 3H45C 4JHDB 3FLCO 1LOTB 1NMDA 4IO8A 2ASMA 2F9TA 2ZGYA 5AQLA 4I6MA 4BR7A 3VF4A 1BOTO 1ATRA 4PKGA 3LDQA 5AZJB 2E2QA 2ITMA 3FZLA 3DAWA 3UE5A 5BN8A 2P9SA 5AQSA 3KVGA 2YJEA 3EN9A 4IWVA 4H03B 3D2EB 2FXUA 1XC3A 3CERA 4BGAA 3VERA 2V51B 1ESVA 2IVOA 3MN7A 4CBUA 3KZBA 3VEWA 5KQDA 1WUAA 2E2PA 3I8BA 5I9EB 5AFUA 1TUYA 3O4WA 2H3GX 3CJ1A 4RTFD 3HSCA 4XH1A 4BQZA 4BG9A 1V4TA 5EVZA 1U6ZA 4F9OA 1ZC6A 3TPQA 3KHYA 4KBOA 3CJ7A 3WUHA 2GEMA 2ZWHA 1GLBG 3MCPA 2VWBA 1LCUA 3MN6A 1HX1A 4BGBA 3O6WA 4B1WB 2QWPA 3VEXA 4NO7A 2P9UA 1TUUA 3U9ZA 3A5OC 3LL3A 3I33A 5JLFA 1BUPA 4LC9B 4FOEA 4AM6A 1HPMA 1TYQB 2YJFA 4JD2B 4JAXA 4FL9A 1NGAA 2Q0UA 4FWKA 3QDKA 4FSVA 4L3QA 1QHAA 2QW9A 1QQOA 4ISFA 3EKSA 4Z94A 1HKBA 1GLCG 2V52B 1MWKA 3O08A 3FZMA 2IVNA 3IDHA 3FE1A 3D2FB 4YDUA 3D7EO 3WXKA 3ZEUB 2FF3B 3B8AX 2YI1A 4B1ZA 3EO3A 3VF2A 1YUWA 5AQUA 2A6AA 3IMXA 3QB0A 3LDNA 4WQ4C 3S41A 2QXLA 2E8AA 5JICA 2WUSA 4BR5A 2P9IB 1QQMA 3ZX3A 5AQIA 3VGMA 4EIAA 2FSNA 3DXMB 4O5FA 4BREA 3LDOA 1ZBSA 5LY3A 1YVNA 1GLFO 5AFUH 3CETA 3C7NA 3U8XA 4BC2A 3QBWA 4CZGA 1S22A 4CD1A 1BA1A 3UKRA 4IJAA 3WXJA 4CZEA 2A40A 3SMPA 4A2BA 1H1VA 4PKHA 3ZETB 1K8KA 5BR9A 1NGEA 1J6ZA 2BTFA 4CBWA 1BU6O 4XH5A 4BRDA 4BRHA 5AQJA 2ASOA 3HTVA 2AA4A 5E84A 1OKJA 3GDQA 4WYBA 3R9PA 4BRNA 3MMVA 1S3XA 2D0PA 1NGIA 4A61A 2P9KA 4QS9A 3AARA 3H3NO 4CJ7A 1NGFA 4QS8A 1U2VB 4DQ8A 3AY9A 2UYTA 3OHRA 1V4SA 4FWSA 3G25A 1IG8A 3WXIA 1RGIA 2NRHA 3HM8A 1HUXA 5KPTA 2E88A 1Z05A 3VOVA 2CH6A 3EKUA 3JS6A 4JHDA 4BRFA 1MA9B 5AQPA 5JMVA 3FGUA 5FPNA 2W41A 2Q0RA 5AZJA 1ATSA 1BO5O 3O1WA 1E4GT 3R8EA 2D0OA 4BR2A 2KHOA 4H5TA 3D2EA 2P9LB 5BPLA 2NLXA 1Q18A 4CZHA 2ZGZA 4FOIA 2A42A 2YHWA 4GNIA 1SZ2A 2Q1NA 2Q36A 1NGGA 5EXWA 4HTLA 5ADXA 4FO0A 3CJBA 3VGLA 2P9SB 2I7NA 4K43A 1ZXOA 5AQWA 5BN9A 1Z6RA 2P9PB 1HKCA 3MN9A 3VEZA 3O80A 4EFHA 4BC4A 1BG3A 1NM1A 3W0LA 5LJVA 2E2OA 3W3DA 3EL2A 5ELZA 1HLUA 5AR0A 1NWKA 4FPAA 5F1XA 2CGKA 3RSEA 4YDUC 5AQGA 4A2AA 4FWOA 5AQFA 4JN4A 1NBWA 4M7XA 4MO5A 4BRCA 4BRLA 3QICA 3L4IA 2FF6A 3QFUA 2V7ZA 1TYQA 1DGKN 4H5NA 4JD2A 3CJAA 5AZIB 3DXKB 3ATUA 2J4RA 3ENHA 3O8MA 4PKIA 4WQ5A 4CZLA 5BRFA 5F0XA 3A5NC 3VEYA 4CZFA 3ENOA 5AQYA 2VCPA 1R59O 3D2FA 3U9DA 3WQTA 1KAXA 3VENA 4CD3A 3UKUB 4DCHA 3L0QA 4K41A 3ZEUA 4K42A 4EHTA 3DJCA 3HZ6A 1T6CA 4DB3A 2CGLA 4EHUA 2QM1A 4J8FA 5AQHA 4H5RA 4BR0A 3IUCA 4FWQA 3BUZB 2PAVA 3LM9A 3WQUA 3SJHA 4NB4A 2IIRA 3JXUA 4B1UB 5AQNA 2A5XA 3H1QA 3DXMA 5EY4A 4BC5A 4Y0WA 4B9QA 4H0TB 4FWLA 3P4IA 4CZKA 2DPNA 3SLCA 1DKGD 4IZ9A 4A62A 2P9NB 5FPEA 3ZETA 2A3ZA 3VESA 4CBXA 1C0GA 3L6QA 2GELA 4HWIA 1YXQA 3BF1A 4B1YB 3O5BA 3LM2A 2ASPA 1KAYA 2OANA 2GWKA 5AQTA 5CE3A 5AQRA 2GWJA 4MLHA 1GLDG 1EQYA 4RWTA 3CQYA 1K8KB 4WQ4A 3FZFA 1JCFA 4PL8A 4B1XB 4BRGA 3IFRA 2V7YA 2HOEA 4BRIA 5EX5A 2HF4A 1QZ6A 3VGKA 5AQZA 4H0YB 5AQMA 1NLVA 3ID8A 3WEEB 3H3OB 2QWNA 2Q31A 4CZJA 2P9KB 3ULEB 2E1ZA 1QQNA 2D4WA 3J8AA 2FLOA 3A8YA 1MWMA 5AQVA 5E26A 1QZ5A 3LDLA 4H0OA 4ISGA 2PBDA 5AQQA 1MDUB 3DWLA 4BRQA 3GG4A 1IJJA 2EWSA 3M3ZA 3QFPA 3QMLA 3F9MA 2W40A 1P8ZA 3HI0A 2P9LA 3A0IX 3CJCA 5FPMA 4MO4A 3EZWA 1HJOA 2FSKA 3R6MA 1GLLO 4O8KA 4BVOA 4I6MB 3BF3A 4DHYA 4BR9A 2E20A 1C0FA 2NZTA 2Q97A 4EAHD 2F9WA 1G99A 1E4FT 3U4LA 5BPNA 1NGHA 1HKGA 3CQXA 4ISEA 2CGJA 2P9PA 4RCHA 2ZF5O 1Y64A 3QBXA 3UB5A 1T6DA 3CI5A 4FWMA 3BEXA 1KAZA 4WQ5C 1ATNA 3H6EA 2AP1A 3LDPA 5F2RA 5FPDA 3CJ9A 3SK3A 1GLAG 3MN5A 4CZMA 3FR0A 4BG8A 3M1FA 2QWQA 4XEIA 4FPBA 1BA0A 3A5LC 5LJWA 2HMPA 1X3MA 3WXLA 1NGCA 2YCHA 1BWFO 2QWMA 5AZIA 4K25A 2CH5A 3DXKA 5KPZA 4M7YA 3BP8A 4H5VA 3CIPA 3SMSA 3H1VX 1XQSC 4GY2B 2P9UB 1SQKA 3GE1A 3TU5A 3RSEB 1GLJO 3MDQA 4BRKA 5B8HA 1CZAN 2I7PA 4BC3A 3UKUA 1NGJA 5BREA 1NGDA 4C23A 2D1KA 4BROA 1SAZA 4H0VB 5JLHA 3ZX0A 1YAGA 4JNEA 1XUPO 3CHWA 2QWRA 5BPMA 2YHXA 3O1BA 2BUPA 2P9IA 3A5MC 4CZIA 3ZX2A 3H46O 2GUPA 4BRPA 3M6GA 3MK6A 4H5WA 1KXPA 4BRMA 3FFKB 5BRHA 3WT0A 5ADXH 4IXCA 1X9JA 2E1YA 5AQXA 3VETA 2QWOA 2QWLA 5KPRA 3C0BA 4IJNA 4BR4A 4FWRA 2P9NA 1RDWX 2Q2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RN2A 4CECA 5GAGP 4DR2K 3J81O 1T7PA 2P5OA 4BVPA 2B4JA 3OYMA 4NLCA 5EOYA 3VF6A 3AV9A 2D56A 2KQ2A 3MWTA 5CZ1A 2JWKA 1TK5A 1VSHA 4RW9A 4B9SA 5KRSA 1LWCA 5TKYA 1X3NA 5LMNK 4PA1A 1JKHA 3J7AP 3K58A 1NNEA 4CJ4A 3WNGA 1BDGA 3BGRA 3DOLA 3V1OA 2E2NA 3ZT1A 5AQKA 3OYEA 5K14A 1X9WA 4TSXA 1WAJA 1SL0A 1JCEA 2NRVA 1IKYA 1LOTB 4R5PA 2ZGYA 4LFAK 1ATRA 4PKGA 3LDQA 3TSQA 2ITMA 3DAWA 3UE5A 4C8KA 5BN8A 4FZYA 3RMCA 2O4GA 3ZCMA 3KD5E 1FH3A 3IS9A 1C1CA 2LSNA 4CJQA 4X62K 4LSLA 1BL3A 2A1RA 4ID5A 4J2BA 3MN7A 2DFEA 4FK2A 3NH0A 5KQDA 3M8PA 5FRMA 4G1QA 1NJIO 1TUYA 4JYAK 1B3CA 1VQ8N 2H3GX 4LD0A 3CPWM 3BZKA 1RDUA 3CJ1A 3L56A 3HPHA 4KH6A 4RTFD 4JKGB 3QEIA 4IDKA 4FLYA 3SYZA 1S1XA 3PX4A 4KBOA 3CJ7A 3SBTA 2G8WA 4FXDA 4PUOA 1RTJA 4V19S 1WT7A 1C0TA 5DM6L 2ZWHA 3MN6A 2UU9K 4BGBA 5MLCQ 3L8BA 4GVEA 4B1WB 1KFDA 3VMFB 3SQ1A 4CCHA 4NO7A 4LF9K 4LFCK 1TUUA 3U9ZA 1N36K 4OPAA 1PTXA 1BUPA 4FOEA 1XMOK 1HPMA 1ASVA 4JD2B 4B3RK 4FL9A 1T0ZA 2Q0UA 4FWKA 4W5OA 2QK9A 1QQOA 3NVMA 3RR8A 2PZSA 2V52B 4N76A 1IKXA 4BACA 1VAZA 1MR4A 3ZSOA 4YDUA 3P38A 4W5NA 3MEDA 4CJKA 2KBJA 3ZEUB 2FF3B 4H4MA 4HCBA 1W97L 3EO3A 4LH5A 5AQUA 5D3GA 2A6AA 3IMXA 4K8ZA 2OPSA 3S41A 5JICA 2E8AA 2WUSA 4CK3A 1D9FA 1VQ6N 1NRAA 3CQ8A 1QQMA 2OPPA 5CY4A 2FSNA 4O5FA 3VQEA 3G10A 4CK2A 1YVNA 3CETA 3C7NA 4CK1A 1BHLA 3KLGA 4BC2A 2PY5A 4CZGA 1S22A 1BIZA 3HYFA 1RILA 5CYMA 3SMPA 2HHQA 1H1VA 4JK8A 4PKHA 2YHAA 3LP2A 4ICLA 4DSEA 2JGUA 4XH5A 4FZZA 2AA4A 1OKJA 3GDQA 4WYBA 1JLQA 2D0PA 4OPJA 3AARA 4QS8A 2HBJA 3OS0A 1L3VA 2UYTA 3OHRA 1V4SA 1C1BA 1IG8A 3WXIA 1RGIA 1T1TA 3D6RA 1HR0K 2NRHA 3HM8A 1HUXA 3N4QA 3JYTA 3EKUA 4CF8A 3QIPA 3JS6A 4IEIA 3NH2A 3FGUA 1UA0A 4WFNL 5AZJA 3NF7A 1ATSA 1NU0A 5KI6A 2QXFA 1QHTA 3QEXA 3D2EA 2P9LB 4FJKA 2YHBA 5BPLA 1YJNN 3C6TA 1TGOA 3PSIA 4CZHA 4FOIA 2HB5A 1LQIA 2Q36A 3KK3A 4HCCA 5EXWA 1W9HA 1WNSA 5ADXA 4AHSA 1CXUA 3VGLA 1RT5A 4KYPA 3RVCA 5AQWA 3TR8A 4DFPA 3CD6N 1S6PA 3DRSA 3W3DA 4KTWA 1VQ9N 4OKKA 5ELZA 1HLUA 3NBPA 3J7YP 2P1JA 5AR0A 1NH5A 1WN7A 1NWKA 5F1XA 4YDUC 1C6VA 4FWOA 4M7XA 2XHBA 3L4IA 3QFUA 4LF5K 1DGKN 1NMNA 3S3MA 4CEAA 5HRNA 1JLBA 3ENHA 3IG1A 4CZLA 3A5NC 5JS2A 4YOVA 4FM0A 1T7AA 3ENOA 4LF6K 3TWHA 3TTFA 3KK2A 4CF1A 3D2FA 3VENA 4CD3A 2LJMA 5T7BA 3L0QA 4EHTA 1LW2A 4IO9L 3DJCA 4DSJA 4JRQA 4DB3A 3AVBA 4Z4EA 5TKWA 3LWLA 5JENA 1WWNA 4KHYA 4CGFA 4A57A 4BR0A 4W5RA 1O1WA 4FLZA 3UIQA 3LM9A 1HRHA 2YV0X 4N47A 5M1NA 3DXMA 5EY4A 3DM2A 4BC5A 3TABA 4IFEA 3K5MA 1UOCA 3G4SN 5HLFA 3D0PA 4FWLA 3QO9A 3P4IA 1N4NA 2JLEA 2DPNA 3RMBA 2X74A 4CQKA 4IZ9A 5FPEA 3ZETA 4CE9A 4PQUA 2UXCK 1C0GA 2LT8A 5C2FA 3OTOK 2D0BA 4B1YB 3LM2A 1CN2A 3O4QA 2E6MA 3SUPA 5CE3A 4ZHRA 5CHIA 4CJ3A 1JCFA 3S5TA 4B1XB 2HOEA 1QZ6A 5AQZA 1DQ7A 2G8KA 4FJLA 3H3OB 3CYGA 4ILGB 4ZTJA 3PY8A 1RDBA 2E1ZA 1QQNA 2D4WA 2FLOA 1MWMA 5E26A 4MDBA 2BE2A 3R3LA 3CW4A 1YJ9N 2GMOA 3OYIA 1VQ4N 3HI0A 3CJCA 3CCVN 5FPMA 4KHNA 1NOYA 4MO4A 1I94K 2XY6A 3R6MA 4JI6K 4B08A 4EAHD 2F9WA 1E4FT 1CLQA 3CCUN 1Z25A 1S72N 3O9TA 3OYFA 4YORA 1HNVA 5BPNA 4HTUA 1NKBA 4ISEA 1C0UA 1VSEA 3F73A 3QEPA 1T6DA 1VNBA 2YILA 3CI5A 4HVJA 1LQQA 1VQLN 1IV0A 3SPZA 3WNHA 4LF4K 5F2RA 3CG7A 1GLAG 4BWJA 1JLCA 5EU7A 3DLHA 4E89A 1I39A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2RN2 A;  4CEC A;  5GAG P;  4DR2 K;  3J81 O;  1T7P A;  2P5O A;  4BVP A;  2B4J A;  3OYM A;  4NLC A;  5EOY A;  3VF6 A;  3AV9 A;  2D56 A;  2KQ2 A;  3MWT A;  5CZ1 A;  2JWK A;  1TK5 A;  1VSH A;  4RW9 A;  4B9S A;  5KRS A;  1LWC A;  5TKY A;  1X3N A;  5LMN K;  4PA1 A;  1JKH A;  3J7A P;  3K58 A;  1NNE A;  4CJ4 A;  3WNG A;  1BDG A;  3BGR A;  3DOL A;  3V1O A;  2E2N A;  3ZT1 A;  5AQK A;  3OYE A;  5K14 A;  1X9W A;  4TSX A;  1WAJ A;  1SL0 A;  1JCE A;  2NRV A;  1IKY A;  1LOT B;  4R5P A;  2ZGY A;  4LFA K;  1ATR A;  4PKG A;  3LDQ A;  3TSQ A;  2ITM A;  3DAW A;  3UE5 A;  4C8K A;  5BN8 A;  4FZY A;  3RMC A;  2O4G A;  3ZCM A;  3KD5 E;  1FH3 A;  3IS9 A;  1C1C A;  2LSN A;  4CJQ A;  4X62 K;  4LSL A;  1BL3 A;  2A1R A;  4ID5 A;  4J2B A;  3MN7 A;  2DFE A;  4FK2 A;  3NH0 A;  5KQD A;  3M8P A;  5FRM A;  4G1Q A;  1NJI O;  1TUY A;  4JYA K;  1B3C A;  1VQ8 N;  2H3G X;  4LD0 A;  3CPW M;  3BZK A;  1RDU A;  3CJ1 A;  3L56 A;  3HPH A;  4KH6 A;  4RTF D;  4JKG B;  3QEI A;  4IDK A;  4FLY A;  3SYZ A;  1S1X A;  3PX4 A;  4KBO A;  3CJ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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