1NGBA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINQPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 126
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngbA04
3FGUA 3EL2A 3UKRA 1X3NA 4H5VA 2P9NB 3LDOA 1GLFO 3HZ6A 3DAWA 4Y0WA 3SLCA 2Q0RA 1GLCG 1NBWA 4NO7A 3CERA 4RTFD 4A62A 2NLXA 4IJAA 3DXMA 4BRCA 2EWSA 2P9SA 5BRDA 5AQJA 4CZIA 1NGIA 2QWNA 4BR9A 1TYQA 2Q2RA 3TU5A 3HBTA 4EFHA 3H6EA 1TUUA 1E4GT 1MDUB 3C0BA 2GTDA 4BGAA 4JHDA 1HPMA 1NM1A 2BUPA 1WUAA 3S41A 2FLOA 2CGKA 3D2FB 2P9UB 2Q36A 2QM1A 3RSEA 5KQ8A 1BU6O 4FPBA 1BA1A 1XQSC 3KHYA 4E1JA 1X9JA 2YI1A 2E8AA 4H5RA 1QQNA 5AQTA 3VF4A 3LL3A 4RCHA 2FSJA 4BRFA 4BRQA 5AQRA 1BUPA 3M6GA 4FWPA 4IWVA 1BDGA 2D0PA 4CZGA 4H5WA 1ATNA 4I6MB 3VEYA 3W0LA 5AQQA 1ZC6A 3WUHA 5BPMA 3QBWA 4A61A 2P9NA 2HMPA 3BF1A 4EAHD 3KVGA 2H3GX 1S22A 3MK6A 3QDKA 3AARA 1S3XA 2D0OA 3O5BA 4WQ5C 2FF6A 3EO3A 2UYTA 4CD1A 5AFUH 1H1VA 2W40A 4CZLA 4FWSA 5ELZA 2Q31A 5ADXH 4MO5A 3UKRB 4CZMA 4FWKA 2WUSA 3EKUA 4DHYA 2A40A 3LDQA 1QZ5A 4CBUA 3JXUA 1KAYA 4H5NA 1HKCA 3DXMB 3D2FA 5EY4A 5EVZA 2P9SB 2P9UA 3A0IX 4CBXA 1GLAG 1TYQB 2IVNA 2IVPA 1GLLO 3CJ9A 5BPLA 4H0PA 3L6QA 1HUXA 1MA9B 3WXJA 5FPEA 4WQ4A 3BP8A 3MDQA 3SK3A 1SQKA 1GLJO 3UB5A 2A41A 3CJ1A 3A8YA 1HX1A 4B9QA 2E2OA 3VERA 3U9ZA 3RSEB 3A5OC 3DWLA 4I6MA 2E2PA 4H0XB 4H0YB 4FPAA 4DCHA 1JCEA 5EXWA 1HKBA 2VWBA 3AAQA 5AQVA 5TKYA 3M3ZA 5B8HA 3VOVA 2P9IB 5AQPA 1IG8A 4K25A 2KHOA 3UKUB 2V7ZA 5AR0A 2PBDA 1BWFO 1D4XA 3CI5A 3OHRA 3ZX3A 5FPNA 3CJCA 3EKSA 3FZFA 4BRAA 5AQYA 5I9EB 5AQLA 2ITMA 3ZX0A 1NWKA 4B1VA 1GLDG 2D1KA 1RFQA 1C0GA 2ZGZA 3IDHA 3I8BA 3I33A 4H5TA 1E4FT 4H0VB 5BPNA 3A5MC 2Q1NA 3FFKB 4JAXA 3U9DA 4QS8A 3VETA 1OKJA 3QFPA 4YDUC 4BQZA 2DPNA 4CZJA 5BREA 5LY3A 3WQTA 3VF2A 1MWMA 2VYPA 1NLVA 4FWMA 3SMSA 3VGLA 5FPMA 3EZWA 1T6DA 2QW9A 3MN5A 4BRNA 5AQZA 3BUZB 4FO0A 1CZAN 1JCGA 4FOEA 3TPQA 4QS9A 3IUCA 1TUYA 4BQLA 4K43A 3ZX2A 5JICA 3WXIA 3H3OB 2NRHA 2Q97A 2I7NA 3FZHA 4PKIA 3FLCO 3DXKB 1HLUA 2YHYA 3GBTA 2ZF5O 4FWRA 2E2QA 1QHAA 4AM6A 4JN4A 2CGJA 2P9IA 4XH1A 4IXCA 2J4RA 4EHUA 3O8MA 4BVPA 3UKUA 3LM2A 1T6CA 2YJEA 3G25A 3MN9A 2YHXA 3LDPA 3GG4A 2QWQA 2FF3B 4J8FA 3ENHA 3QBXA 2FXUA 1ESVA 1Z05A 2F9TA 5KQDA 1U6ZA 3SMPA 3WT0A 4BRLA 1NGAA 3P4IA 3O6WA 5F0XA 5JLFA 1GLBG 3VEZA 2F9WA 4B1UB 1V4TA 3R6MA 3GOIA 4BR4A 3B8AX 3VEOA 3HTVA 1XUPO 3BF3A 2CGLA 3U4LA 5AQGA 4RWTA 1KAZA 4M7YA 4HWIA 3LM9A 5E26A 4CZEA 1YVNA 2A5XA 3WXLA 1SAZA 2P9PB 4AM7A 1G99A 3O1BA 3SJHA 3CQYA 2NZTA 5AQKA 4FSVA 2FSKA 2GEMA 4CBWA 5F1XA 3H46O 3H1QA 4CI6A 3AY9A 3EN9A 1EQYA 3DXKA 2FSNA 3WQUA 4PL7A 5JLHA 1YAGA 4BR5A 5BN8A 5LJWA 3FZKA 2E1YA 1U2VB 5KPTA 2HOEA 1BA0A 4O8KA 4XEIA 4MO4A 3CJAA 2IIRA 4LC9B 1X3MA 3CETA 2VCPA 1NMDA 4ISGA 2A3ZA 4BRKA 3QFUA 4CZHA 4BRGA 4PL8A 1YUWA 2HF4A 2E2NA 1ATSA 1V4SA 3KZBA 4FWNA 1K8KB 4BG8A 4IJNA 2Q0UA 1NGCA 4FWOA 4H0TB 1JCFA 3UE5A 4MLHA 3H45C 2CH6A 5F2RA 4BRMA 3QMLA 3FE1A 3C7NA 5AQUA 1RGIA 1HJOA 2YCHA 4HTLA 4B1XB 5AQXA 4BG9A 4WQ4C 1QQOA 2A42A 4DQ8A 4BRIA 2QWPA 2P9PA 4MLEA 2P9KB 4IZ9A 4ISFA 2GUPA 5AFUA 1NGFA 3CQXA 4DB3A 4BROA 4CD3A 4XH4A 5E84A 4BR7A 5ADXA 4NB4A 2QWOA 3CJBA 4WYBA 1LCUA 2GWKA 3WEEB 2OANA 4CZFA 2P9LB 3ENOA 3MMVA 3VF6A 4BR2A 3GE1A 5BR9A 4A2BA 3JS6A 5FPDA 4BRDA 3AAPA 4H0OA 1U2VA 3VPZA 1BOTO 3LDNA 3ZEUB 3FZLA 3MN6A 3VGMA 4BVOA 3VGKA 3VEXA 1NGGA 1T44A 1J6ZA 3H3NO 5AQOA 4ISEA 1C0FA 1K8KA 3ULEB 4K42A 2AA4A 2I7PA 1DGKN 2CH5A 3IFRA 4XH5A 3F9MA 2V7YA 4JNEA 3IMXA 4BGBA 2ZGYA 4IO8A 1QZ6A 3ATVA 3HSCA 4CZKA 3H1VX 5AQWA 3HI0A 4WQ5A 5AZIB 1YXQA 3VENA 3ID8A 5EOYA 5AQIA 3CHWA 4BC2A 4BC3A 2AP1A 2QWMA 1RDWX 5KPZA 1XC3A 5AQMA 3D7EO 4EIAA 1NGJA 5JMVA 3GDQA 5BRFA 1NGBA 1ATRA 2P9KA 3ZETB 2HF3A 1DEJA 2QWRA 4BRHA 3VESA 1KAXA 3D2EB 5BN9A 1WOQA 2ZWHA 4L3QA 2QXLA 5AZJB 2PAVA 4FL9A 4PKGA 3A5LC 3C7NB 3CIPA 3WEEA 2P9LA 4JD2B 1QQMA 1BG3A 4F9OA 4KBOA 3U8XA 2ASMA 3A5NC 4BC4A 2BTFA 4EHTA 4B1YB 3BEXA 4Z94A 3ZEUA 3O08A 4BR0A 4B1ZA 4M63C 1NGHA 2V52B 2E88A 3FZMA 4GY2B 4H03B 5LJVA 1SZ2A 3DJCA 5BRHA 2V51B 3O1WA 2D4WA 3ULEA 4FOIA 4BREA 4FWQA 1GLEG 1DKGD 2IVOA 1P8ZA 4BRPA 2A6AA 3HM8A 3LDLA 1ZBSA 5AZIA 4QS7A 4K41A 3L4IA 5AQHA 2YHWA 3R9PA 3MCPA 2YJFA 3W3DA 4GNIA 3ZETA 5AQSA 3MN7A 4JHDB 3ATUA 1R59O 4C23A 2ASOA 1Z6RA 3D2EA 5AQFA 1LOTB 5AQNA 3J8AA 3VEWA 5AZJA 3R8EA 2E20A 3VEVA 5EX5A 3GL1A 2W41A 3O80A 4JD2A 4FWLA 5KPRA 1Y64A 4YDUA 4BC5A 2QWLA 2E1ZA 3WXKA 1IJJA 1NGDA 1KXPA 1BO5O 1NGEA 4B1WB 2ASPA 3O4WA 5CE3A 3L0QA 4PKHA 3QB0A 3FR0A 2GWJA 4O5FA 3M1FA 4A2AA 3CJ7A 4M7XA 2GELA 4CJ7A 1Q18A 3QICA 1ZXOA 1MWKA 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PX9A 3TWHA 4CERA 4YY3K 5FRNA 4GW6A 1TAUA 1ZBHA 3SLCA 4QCLA 2NLXA 4IJAA 1NRAA 3DXMA 3AO4A 1XI1A 3NBPA 2FBYA 3O3GA 5LMNK 1RTDA 4BR9A 3T1AA 2YILA 2Q2RA 4E7HA 3O3HA 2LJMA 3AA3A 1E4GT 3G6EN 3CM6A 4W5OA 4B3SK 1WUAA 3TR8A 3P5JA 4DF8A 3OYJA 3NGIA 1L3TA 4JI0K 5KQ8A 1IKXA 1GOAA 3VQPA 3KP0A 4JI3K 4WFBL 4DS5A 3V6DA 5M1QA 3J7AP 1QQNA 3VF4A 3OYGA 1RBRA 3LWMA 1BUPA 3AVGA 4I2QA 2KPYA 1VK0A 4CZGA 4B3TK 1NK8A 4H5WA 1ATNA 1FKOA 2HB5A 1T7AA 5AQQA 1UA0A 3AVIA 1ZC6A 4DSLA 5BPMA 4GV3A 2WOMA 4DTRA 5KTQA 2HMPA 1LWEA 3HVRA 4NYNA 4CGFA 3KVGA 4KI4A 3O5BA 2D0OA 3AVLA 1SV5A 4CVNE 2VG7A 1TL3A 5AFUH 4CD1A 1T05A 4CZLA 1XMQK 4DLEA 5KGWA 4IOXA 1CLQA 1K8BA 4MO5A 1CZ9A 1B3CA 4M3RA 1C1CA 2KTQA 1YT3A 1XRSB 4HUEA 2GL1A 2UUAK 4YORA 3JXUA 1KAYA 4DS4A 1EKEA 4JI1K 2HMIA 3LPTA 4R79A 4X66K 3RTVA 3RMBA 3SUOA 4B08A 1S1UA 2NRRA 1VRUA 5FPEA 1UGLA 3IRXA 1BQNA 3MDQA 5TKWA 3SK3A 3TTDA 3CJ1A 5M1FA 1X9WA 1ITGA 3RR7A 4PA1A 3RSEB 1NU0A 3DWLA 4KHYA 1NK4A 3CCVN 1DLOA 4C8OA 2E2PA 3R1XA 4H0YB 4FPAA 2OZSA 4E3SA 1JCEA 5EXWA 1FJGK 4UAEF 3LZIA 1WSFA 5AQVA 4Z0UA 4CFBA 2PY5A 4K25A 3UKUB 5AR0A 3CI5A 3SI6A 1OVQA 3ZX3A 3CJCA 3EKSA 5AQYA 5I9EB 5AQLA 1VNBA 1KV0A 1JZAA 1VSHA 1UA1A 1HJRA 3VQAA 4DTXA 3PO4A 4N5SA 4FJXA 4YNQA 1RFQA 1I2VA 4XIUA 1DQ7A 4DSFA 3TAPA 1RBSA 3HP9A 3OYIA 5GINA 1RDCA 3KKSA 3U9DA 1OKJA 1T7BA 2JDQD 4DSJA 4NXMK 2A7TA 1N33K 4CGJA 3VF2A 2VYPA 3SMSA 3VGLA 4CJSA 3BUZB 4OGCA 4BWMA 4JI6K 3K59A 3CF5L 4BDPA 4FOEA 4QS9A 2IOCA 3CPWM 2OPPA 4M3ZA 1JLAA 4DTUA 1ASWA 2MBKA 2HBJA 3GBTA 3VQDA 1U04A 3BGRA 4JKBA 2YNGA 4XH1A 3WNHA 4IXCA 4DSKA 1XWLA 4BVPA 3UKUA 4M3YA 1T6CA 3L2QA 2YX6A 4F4KA 2YJEA 3MN9A 3GG4A 4IG0A 2QWQA 3SQ1A 3ZSZA 3DLKA 4E7KA 3L2RA 4DFKA 1P0AA 1SKSA 4AHVA 2FXUA 2F9TA 2QTDA 4KTQA 3WT0A 3TAFA 4BRLA 2LT8A 2EHGA 1KLNA 4N76A 3TTFA 4AHCA 4EZ9A 3T3FA 5F0XA 1QTMA 5BR8K 1GLBG 3VEZA 2E3GA 2RN2A 1DT9A 4BE2A 4LD0A 5AQGA 4OPAA 3G71N 3CCLN 4JS4A 4CZEA 4X62K 4FW2A 2A5XA 5HROA 3L3VA 4CJEA 4AM7A 3CQYA 2NZTA 4JK8A 4B9LA 3S3OA 4FSVA 3C6UA 2B5JA 4M3XA 4CHYA 4CJLA 3AY9A 1EQYA 3AO1A 1T8EA 3H08A 2G8VA 4DV2K 2YC1C 1YAGA 2YIPA 4BR5A 5JS1A 5KPTA 1JLQA 1EX4A 2F8TA 4O8KA 4FJLA 2IIRA 4LC9B 3CETA 3IG1A 3Q7BA 1JZBA 1KLMA 4ISGA 2A3ZA 1C55A 1T1TA 2ATQA 1ATSA 4HTUA 1JLFA 1V4SA 3HPGA 3M8PA 4W5QA 3KZBA 4FWNA 1S1WA 4IJNA 3PSIA 1TK0A 3THXB 2IDOA 3OYCA 2GV9A 2X6SA 2F7TA 3OYEA 4MQ3A 4MDBA 1PE4A 5F2RA 4BRMA 3K2PA 2LI7A 2WC9A 3O9RA 4XJXA 2YCHA 3LAKA 3CC2N 5AQXA 4BG9A 1RT4A 4CEBA 1NK7A 2A1SA 2P9KB 3QIOA 4XH4A 1AYJA 4EP5A 4BR7A 1WBDA 1VAZA 3CJBA 3KLGA 2M8BB 1LCUA 4AB0A 2VWJA 3OS2A 3KOZA 4IFYA 3ENOA 3DRRA 3GE1A 1XHZA 4GV6A 3JS6A 1EP4A 1L5UA 5FPDA 3TTCA 4H0OA 3CCSN 4MDAA 4E89A 3FZLA 3MN6A 4CEFA 3KWIA 3H3NO 3K9JA 4B9MA 2LSNA 2HNDA 4BEBA 4JI5K 3LP3A 5AQOA 2XRIA 4ISEA 3DM2A 4CFDA 3K0SA 3HPHA 4JKAA 4Q5VA 4DU3A 1I39A 4K42A 2AA4A 2I7PA 3IFRA 1BMRA 3VQ5A 2GX9A 3F9MA 3IMXA 3C6TA 3SCXA 2IC3A 1B92A 2NY9X 4IO8A 1YJNN 2YIOA 3H1VX 2AJQA 1W9HA 4CJ3A 1XNRK 5EOYA 4FK4A 4DV7K 1BI4B 2VG5A 3KK2A 4JYAK 1NGBA 1ATRA 2P9KA 3ZETB 1JKHA 1HR0K 1VQ6N 1LQIA 1DEJA 3VQCA 2G8HA 3VESA 5BN9A 4L3QA 3LP1A 5AZJB 5IT9O 1NRBA 1TK5A 3CIPA 3C7NB 3AVFA 4IKFA 4JKHA 4F9OA 3U8XA 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4A5BA 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1PX9 A;  3TWH A;  4CER A;  4YY3 K;  5FRN A;  4GW6 A;  1TAU A;  1ZBH A;  3SLC A;  4QCL A;  2NLX A;  4IJA A;  1NRA A;  3DXM A;  3AO4 A;  1XI1 A;  3NBP A;  2FBY A;  3O3G A;  5LMN K;  1RTD A;  4BR9 A;  3T1A A;  2YIL A;  2Q2R A;  4E7H A;  3O3H A;  2LJM A;  3AA3 A;  1E4G T;  3G6E N;  3CM6 A;  4W5O A;  4B3S K;  1WUA A;  3TR8 A;  3P5J A;  4DF8 A;  3OYJ A;  3NGI A;  1L3T A;  4JI0 K;  5KQ8 A;  1IKX A;  1GOA A;  3VQP A;  3KP0 A;  4JI3 K;  4WFB L;  4DS5 A;  3V6D A;  5M1Q A;  3J7A P;  1QQN A;  3VF4 A;  3OYG A;  1RBR A;  3LWM A;  1BUP A;  3AVG A;  4I2Q A;  2KPY A;  1VK0 A;  4CZG A;  4B3T K;  1NK8 A;  4H5W A;  1ATN A;  1FKO A;  2HB5 A;  1T7A A;  5AQQ A;  1UA0 A;  3AVI A;  1ZC6 A;  4DSL A;  5BPM A;  4GV3 A;  2WOM A;  4DTR A;  5KTQ A;  2HMP A;  1LWE A;  3HVR A;  4NYN A;  4CGF A;  3KVG A;  4KI4 A;  3O5B A;  2D0O A;  3AVL A;  1SV5 A;  4CVN E;  2VG7 A;  1TL3 A;  5AFU H;  4CD1 A;  1T05 A;  4CZL A;  1XMQ K;  4DLE A;  5KGW A;  4IOX A;  1CLQ A;  1K8B A;  4MO5 A;  1CZ9 A;  1B3C A;  4M3R A;  1C1C A;  2KTQ A;  1YT3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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