3LDLA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldlA04
3HM8A 3WXLA 4H5VA 1R59O 3VF6A 3VF2A 4BRDA 1KAXA 2YJFA 3WEEA 2A42A 3DXMA 1NGAA 1BU6O 4NO7A 2P9SA 2QXLA 5KQDA 4K42A 1DKGD 3WXJA 4JD2B 4I6MB 4LC9B 4A62A 3VOVA 4A61A 4BR5A 1TUYA 4CD3A 3QICA 5F1XA 1GLFO 1U6ZA 1RFQA 1MWKA 3A5NC 4JHDA 4CZJA 3BUZB 1JCEA 4GNIA 1Y64A 3AAPA 1J6ZA 4WQ5C 3W0LA 3MN6A 3ULEA 4BC4A 4CZGA 4PL7A 2KHOA 3JS6A 3ZX3A 2WUSA 3CQYA 5KPRA 3D2FA 1T44A 3EKUA 4B9QA 2HOEA 1NGCA 3CERA 5JICA 3SMPA 1RDWX 1BWFO 3WQUA 5FPMA 3RSEB 3LDLA 3ATUA 3CJ1A 4FO0A 1ZXOA 3FGUA 4FL9A 4FSVA 1GLEG 2F9TA 3ZX2A 2P9PB 1GLJO 1X9JA 3LDOA 3VEVA 5BRFA 5KPTA 2IIRA 4XH1A 2E8AA 3VGKA 4O5FA 1NGEA 4CJ7A 3ZEUB 3FZFA 1NGBA 3CETA 4PL8A 5CE3A 5LJVA 3DJCA 1CZAN 2FF6A 2D4WA 5FPDA 1YVNA 4QS9A 4BRQA 2E2QA 3U9ZA 5AZJB 2P9NB 1HX1A 3O08A 4BG9A 2ASMA 2E2OA 1ATNA 3VPZA 1YUWA 1LOTB 1MWMA 4L3QA 1NMDA 3J8AA 3CHWA 3JXUA 1ESVA 2J4RA 5AFUH 4IXCA 2VCPA 4ISEA 3MMVA 4BRIA 4BRLA 4BRMA 3FFKB 3DXKB 3KVGA 2ZF5O 2GELA 2NRHA 1SAZA 1HKCA 5BPLA 2E88A 2ASPA 3TPQA 3IFRA 1G99A 2QWNA 1GLAG 3EN9A 3GE1A 1TYQB 4FWQA 5AQJA 2P9IB 5KQ8A 2P9LB 4JD2A 4I6MA 1GLBG 3EO3A 3MCPA 3MK6A 1RGIA 4FWLA 3QB0A 2NZTA 1QZ6A 2E2PA 1QHAA 2GWJA 4QS8A 1NGGA 2YHXA 4EIAA 1C0FA 1NGHA 5FPNA 4J8FA 1EQYA 3FZLA 4ISGA 4FWRA 4H0OA 3CJCA 2QWLA 3BP8A 3VEXA 2FSJA 1NGFA 4BR7A 5JLFA 3TU5A 1YXQA 2CH5A 4FPAA 4JNEA 4BR4A 4IZ9A 5BN8A 2A41A 5KPZA 4IJNA 4XH5A 1MA9B 2Q0RA 1KAYA 3RSEA 3H6EA 3VGMA 3ID8A 5EX5A 5JMVA 2GUPA 1ATSA 5AQYA 5BN9A 3GOIA 4FOIA 2P9PA 4CBWA 3S41A 3EZWA 3VERA 3CJAA 1LCUA 4H0VB 2A6AA 5E84A 3FE1A 3KHYA 2QWMA 1WUAA 3SLCA 3ZEUA 5LY3A 3P4IA 3EL2A 3CI5A 2Q1NA 1HKGA 5AZJA 2QWQA 2P9NA 3GL1A 3IMXA 2GEMA 3O8MA 3QFUA 3QBXA 5AQUA 1JCFA 3GG4A 4H0PA 4MLHA 3WT0A 3HTVA 3ZETB 2QWOA 2E1YA 3UKRB 2I7NA 2FF3B 2YHYA 2QW9A 3EKSA 3UKUB 2UYTA 2Q97A 2Q0UA 4GY2B 3LL3A 4JAXA 3DXKA 3R8EA 4K43A 4DCHA 1U2VB 3OHRA 4CZHA 5AQWA 5BPMA 3QBWA 4QS7A 4M7XA 5LJWA 1XUPO 5AQFA 3D2EB 4O8KA 4BG8A 2VYPA 4E1JA 5BR9A 4BRCA 4FWMA 1JCGA 1TYQA 5AQTA 1T6DA 3HSCA 2P9IA 2P9LA 2ZGZA 3VEYA 2W40A 4DHYA 2E1ZA 3QDKA 1NM1A 3SJHA 2YI1A 3R6MA 2ZGYA 4WQ5A 3WQTA 2V52B 2HMPA 3MN7A 2HF4A 2Q31A 5TKYA 4BRKA 5F2RA 2ZWHA 3CJ9A 2YHWA 1IG8A 4H0TB 1IJJA 2ASOA 4K25A 4H0XB 4EHUA 4AM7A 4EFHA 1HUXA 3U9DA 3L4IA 2AA4A 5AQGA 5AQPA 5AQMA 3WUHA 4B1YB 4FOEA 2V7ZA 5BPNA 3HBTA 1NGJA 1C0GA 4BR2A 3KZBA 4HTLA 4KBOA 1ATRA 1Q18A 3ZX0A 4BRPA 5AQKA 4DB3A 4H5NA 5EY4A 4BVPA 4BRAA 1H1VA 5AQXA 2D0OA 4CZIA 3A5MC 3ENHA 3LM9A 4RCHA 5I9EB 3GBTA 4WYBA 4Z94A 4IWVA 3HI0A 2NLXA 3VEOA 1QQNA 5BREA 1TUUA 1D4XA 1GLCG 4CZLA 3H1VX 1BG3A 2HF3A 3VETA 4IO8A 3A8YA 5AQNA 2D1KA 3GDQA 4CBXA 2QWRA 3HZ6A 4M63C 2FSKA 4B1UB 4H5WA 2FSNA 5AQOA 4AM6A 4RWTA 3D7EO 2ITMA 4PKGA 4PKHA 1V4TA 5E26A 2IVOA 3BF3A 3M1FA 3O4WA 3O1BA 1NLVA 3QFPA 2VWBA 4CI6A 1QZ5A 4EAHD 5AQHA 4B1VA 3LDPA 3VF4A 1T6CA 3ZETA 4FPBA 4CD1A 2W41A 3UKRA 5EXWA 4MO4A 3LM2A 3AARA 2EWSA 3UKUA 1V4SA 1S22A 5EVZA 4BC3A 2P9KB 4WQ4C 2AP1A 2P9UB 5AZIB 5ADXA 3O1WA 4FWNA 2FXUA 1U2VA 3M3ZA 1E4GT 3H46O 2A40A 5FPEA 3C7NB 1HKBA 1ZBSA 4BRFA 3FZKA 3MN5A 3D2EA 1BA0A 1XQSC 4BC5A 5AQRA 3IUCA 3FZHA 3CJ7A 5JLHA 1OKJA 2CGKA 2Q36A 4FWSA 3FZMA 5AQQA 3I8BA 3U4LA 3MDQA 3H3NO 3B8AX 2E2NA 5BRDA 4HWIA 1K8KB 3W3DA 1BOTO 4B1XB 1S3XA 3LDNA 1XC3A 4BC2A 2E20A 3CIPA 1BDGA 4H0YB 3VEZA 4DQ8A 4BRHA 1BO5O 3O80A 3SMSA 2PBDA 4MO5A 3F9MA 3H45C 1NBWA 1SQKA 4WQ4A 3C0BA 5AQLA 2YCHA 5ELZA 4H5RA 1BA1A 2CGJA 5AQIA 3WEEB 3ENOA 3L6QA 4CZEA 3DXMB 4IJAA 2DPNA 3R9PA 1DGKN 3A0IX 2P9SB 5F0XA 1GLLO 2D0PA 3A5LC 5AQSA 3H3OB 4BGBA 4PKIA 4CZFA 3M6GA 2CGLA 2Q2RA 3DWLA 3AY9A 3A5OC 5AQZA 3I33A 2BUPA 4YDUC 4ISFA 3CJBA 4RTFD 3VESA 4B1ZA 3LDQA 4FWKA 4JHDB 5BRHA 3O5BA 4BR9A 1KAZA 3G25A 3O6WA 1ZC6A 2PAVA 1SZ2A 4CZKA 4M7YA 4C23A 1HPMA 1X3NA 1MDUB 2CH6A 3ULEB 2V7YA 4JN4A 4F9OA 4BR0A 3D2FB 1KXPA 4NB4A 1QQOA 3VENA 4BVOA 4BQZA 4BQLA 3WXKA 3UB5A 4CZMA 4K41A 1P8ZA 3QMLA 2P9KA 5AZIA 2P9UA 4H03B 5AR0A 2QM1A 1GLDG 4Y0WA 4A2AA 4XEIA 4BROA 1HJOA 2QWPA 3C7NA 1X3MA 3AAQA 4MLEA 1DEJA 2GTDA 2F9WA 4A2BA 3IDHA 4H5TA 2V51B 1BUPA 2OANA 4FWOA 4YDUA 4EHTA 1QQMA 5AFUA 1Z6RA 2A3ZA 3FR0A 3VGLA 1NGDA 5ADXH 5AQVA 3SK3A 4BREA 2BTFA 1HLUA 2GWKA 3FLCO 3U8XA 2I7PA 1K8KA 5EOYA 1E4FT 3VEWA 4B1WB 2IVPA 1YAGA 3UE5A 3WXIA 2IVNA 3CQXA 4BGAA 2A5XA 4BRGA 3L0QA 3H1QA 4FWPA 5B8HA 1NWKA 2YJEA 3BF1A 1WOQA 2FLOA 1NGIA 3MN9A 4CBUA 3DAWA 1Z05A 4XH4A 3BEXA 3ATVA 2H3GX 4BRNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HM8A 3WXLA 3VF6A 4DLEA 1NJWA 4CEBA 4DR2K 1RBVA 4Z4EA 1L3TA 3HJFA 1NGAA 3VQ5A 1BU6O 1T7AA 3OYKA 2QXLA 4TSXA 3KWIA 4DS4A 2KJAA 3BZKA 4O0IA 2KZMA 3RRGA 4FJJA 2ZD1A 1SL2A 4A61A 3VMFB 4BR5A 3ZT4A 4B9TA 3AO5A 4GVEA 1JXCA 3IG1A 4KHQA 4N5SA 5F1XA 1GLFO 1U6ZA 1MWKA 5C2FA 3A5NC 4JHDA 4MQ3A 4DSEA 3DLEA 1Y64A 1XMQK 3AAPA 1VQMN 4E72A 1J6ZA 4WQ5C 3W0LA 4BC4A 1DLOA 4ZTFA 4DV7K 5KPRA 1KVBA 2WONA 4IEIA 1WLJA 3D2FA 1FJGK 1T44A 3EKUA 2OZMA 2HOEA 1NGCA 3CERA 3DOLA 2ATQA 3SMPA 1RDWX 2OPRA 4Q5VA 3QESA 3ATUA 4NLCA 1X9SA 2HVHA 4X62K 3FGUA 1NPIA 4LF9K 2F9TA 3ZX2A 2I5JA 2P9PB 4BE1A 4CGHA 1X9JA 2Q3SA 4Q0BA 1Q9YA 4XH1A 3OS1A 1Q82O 3SI6A 3ZT1A 3F73A 3FZFA 2JWLA 5J2QA 1BCGA 4QS9A 2E2QA 5AJ3K 2P9NB 3T1HK 2ASCA 2E2OA 1ATNA 1RT4A 1YUWA 3VPZA 3S3NA 4FLXA 4CIEA 3E9LA 3NH2A 1ESVA 5C15A 2HW3A 1BK8A 5HRRA 1NRBA 1L3VA 2P5GA 4YHHK 2YEOA 1T7BA 3DXKB 2ZF5O 2ATBA 4DV4K 2NRHA 3ZLJA 2BGGA 4CJ3A 3EE8A 1G99A 1RDUA 1ZBFA 3G0ZA 4JYAK 2N69A 4CFDA 1WWNA 4AB0A 4KV8A 2E6LA 3GE1A 4B9VA 5C42A 4Z4GA 1TYQB 4NCBA 5AQJA 4Y1CA 3ZT3A 1GLBG 2YBRC 4CHPA 3MCPA 4DTRA 4BECA 4CJ4A 2E2PA 3L56A 3DI6A 1WB9A 1NGHA 5FPNA 2W6KA 3KJVA 4KREA 4CK3A 3ZYYX 3FZLA 4I7FA 3VN5A 4F2SA 3VEXA 1TVRA 3L8BA 2E3GA 1YT3A 4KTQA 4CJLA 3QNNA 1YXQA 3DRRA 3RR7A 4B8AB 4IZ9A 5BN8A 1UA1A 5KPZA 2O4GA 4B3MK 1MA9B 1KAYA 3RSEA 3H6EA 3TANA 3ID8A 4X66K 1IKVA 1S1UA 4B9MA 4FK4A 4J2DA 1KSPA 2P51A 4CBWA 3TABA 1VQ5N 2DFHA 4K8ZA 3C6UA 3SQ0A 2A6AA 1NU0A 1ZFUA 2R7YA 1HNIA 4KI6A 3QINA 4BDYA 3P4IA 3CI5A 1CXQA 2D5RA 2Q1NA 4CHZA 3GL1A 1OVYA 1VSHA 2A1RA 3HTVA 3AVGA 4KB0A 1GOCA 2I7NA 1WSIA 4M3WA 1VQ7N 3TAQA 2UYTA 2Q97A 3LL3A 1PX9A 5BR8K 3EZ5A 4DCHA 1QSLA 4OPKA 3OHRA 3OYGA 4CJUA 3SV4A 3DLHA 3ZSRA 5LJWA 5AQFA 2G8FA 4CF2A 1XMOK 3D2EB 5BR9A 4BG8A 2NY9X 3HXMA 5AQTA 2P9LA 3VEYA 2LY5A 2W40A 1U4BA 2HBKA 2Z1GA 2ZGYA 1VQKN 2OPPA 2HMPA 3MN7A 4ID1A 2Q31A 4BRKA 2IOCA 2G8IA 2ZWHA 2YHWA 5LMNK 1S1WA 4EHUA 4FJXA 4EFHA 1EWQA 5KRSA 3CCSN 5AQPA 4B1YB 2V7ZA 2XY6A 4O8UA 3UIQA 3DRSA 3HBTA 1NGJA 2OZSA 2G2KA 4NCAA 2YIOA 2BRZA 5SZTA 4BRAA 1H1VA 4CZIA 3ENHA 3GBTA 1WN7A 4GV9A 1N36K 2NLXA 4DFJA 3VEOA 1QQNA 3KP1A 3B6OA 3PY8A 3AVBA 4WE1A 3TAMA 1GOBA 3H1VX 4Z4CA 3LWLA 3PSFA 2Z1IA 3OS0A 2XO7A 3ULDA 4KO0A 1PTXA 4IOXA 1C0UA 3R2VA 2N2RA 2G8KA 5CHIA 2IDOA 1V4TA 4PKHA 4N56A 5E26A 3J7YP 1D8YA 3V9WA 4Z4FA 3O4WA 4FLVA 4AHUA 3QFPA 1MR4A 1T7EA 5AQHA 4FJMA 3H08A 1RDCA 2F7TA 3OYHA 1VQLN 1MYNA 2VWKA 4YORA 3UKRA 3OYMA 4G9ZA 3TAFA 1T8EA 4ILHA 4CCHA 1HYZA 1V4SA 1S22A 4M3YA 4BC3A 5AZIB 4FWNA 3PX4A 1HNXK 1Z26A 3S3OA 4LH4A 4JKEA 3C7NB 4CEZA 1HKBA 1ZBSA 2VG7A 4Z4HA 3MN5A 1WAFA 1XQSC 2QA4N 1B3CA 1W7AA 3IUCA 1IBLK 3BK3C 2BANA 4YOVA 4FWSA 3C6TA 4DFPA 3FZMA 4DQRA 3TAEA 4M3XA 2KYQA 3NF9A 2N2QA 3VQ8A 1NMNA 4XIUA 1W2BM 4HWIA 1J9AA 4YOTA 5JS1A 3CCRN 3CFRA 4B1XB 3NGZA 3LDNA 1CZ9A 2E20A 3TSPA 3HVTA 3MAQA 1U04A 5D3GA 1BRZA 2NRXA 2Y1JA 4BRHA 3SMSA 4OKJA 2F8TA 3L2QA 1U48A 3AVMA 1T7PA 1JLGA 5LMUK 1KV0A 3E9OA 5CYMA 3SQ2A 1SQKA 3K5LA 1NJYA 4O5BA 4CZEA 2DPNA 4HCCA 4FVMA 1DGKN 4CESA 2KFZA 2D0PA 3F2KA 5AQSA 3RRHA 4B08A 4FW1A 4E1MA 4PKIA 5HOOA 4FW2A 3VQEA 4JKGA 3NDKA 5KGXA 1I6GA 3I33A 1VSKA 2BUPA 4YDUC 4ISFA 4RTFD 4CEAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3HM8 A;  3WXL A;  3VF6 A;  4DLE A;  1NJW A;  4CEB A;  4DR2 K;  1RBV A;  4Z4E A;  1L3T A;  3HJF A;  1NGA A;  3VQ5 A;  1BU6 O;  1T7A A;  3OYK A;  2QXL A;  4TSX A;  3KWI A;  4DS4 A;  2KJA A;  3BZK A;  4O0I A;  2KZM A;  3RRG A;  4FJJ A;  2ZD1 A;  1SL2 A;  4A61 A;  3VMF B;  4BR5 A;  3ZT4 A;  4B9T A;  3AO5 A;  4GVE A;  1JXC A;  3IG1 A;  4KHQ A;  4N5S A;  5F1X A;  1GLF O;  1U6Z A;  1MWK A;  5C2F A;  3A5N C;  4JHD A;  4MQ3 A;  4DSE A;  3DLE A;  1Y64 A;  1XMQ K;  3AAP A;  1VQM N;  4E72 A;  1J6Z A;  4WQ5 C;  3W0L A;  4BC4 A;  1DLO A;  4ZTF A;  4DV7 K;  5KPR A;  1KVB A;  2WON A;  4IEI A;  1WLJ A;  3D2F A;  1FJG K;  1T44 A;  3EKU A;  2OZM A;  2HOE A;  1NGC A;  3CER A;  3DOL A;  2ATQ A;  3SMP A;  1RDW X;  2OPR A;  4Q5V A;  3QES A;  3ATU A;  4NLC A;  1X9S A;  2HVH A;  4X62 K;  3FGU A;  1NPI A;  4LF9 K;  2F9T A;  3ZX2 A;  2I5J A;  2P9P B;  4BE1 A;  4CGH A;  1X9J A;  2Q3S A;  4Q0B A;  1Q9Y A;  4XH1 A;  3OS1 A;  1Q82 O;  3SI6 A;  3ZT1 A;  3F73 A;  3FZF A;  2JWL A;  5J2Q A;  1BCG A;  4QS9 A;  2E2Q A;  5AJ3 K; 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