3LDLA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldlA04
1P8ZA 1C0FA 1U6ZA 4CBXA 3O8MA 3EN9A 4HTLA 2P9UB 1GLJO 3HTVA 1DGKN 5BRDA 4K25A 5BRFA 5AQTA 2A6AA 3O80A 1JCGA 3UKUB 3D2EB 4AM7A 3SLCA 1NGBA 2QXLA 1S3XA 3G25A 3U8XA 5KPRA 5TKYA 4BRPA 4BRGA 3VEYA 4CZHA 3DXKA 2P9PA 1ESVA 4DCHA 3BF1A 3KZBA 3GBTA 4BRCA 2QM1A 1TYQA 1BO5O 1NGJA 1KAYA 2I7PA 3VPZA 3DXMA 2E88A 4B1UB 1WOQA 3D7EO 3D2FA 3GL1A 2Q0UA 4H0XB 1BDGA 4FWNA 5AQGA 1YUWA 2I7NA 1BUPA 5AQVA 2VYPA 4FWOA 3WEEA 4BVPA 4BVOA 3DAWA 3KVGA 1CZAN 2FXUA 2HMPA 3QB0A 4GNIA 3CJ7A 4EAHD 5BPMA 1NGAA 4Y0WA 3VESA 4CZEA 4BC2A 1T6DA 3JXUA 4CI6A 4BRKA 3W3DA 1HLUA 3SK3A 4H5WA 1XC3A 5AQFA 1X9JA 3FGUA 3CETA 4FSVA 3FZLA 4QS7A 4F9OA 3A0IX 4O8KA 4IZ9A 3ZX3A 3UKRB 4BRQA 5BRHA 4NB4A 2Q2RA 4MLHA 2YHWA 4BR4A 1K8KA 2Q0RA 2D0OA 3VGMA 3O1WA 4H5NA 4JHDA 4B1XB 2E20A 3WXLA 3DWLA 4XH5A 3VENA 4CZJA 2J4RA 3KHYA 2A42A 3SMPA 2A3ZA 2CGLA 1DKGD 5AQMA 4MO4A 3FFKB 2QWLA 1X3MA 3CJ1A 5JLHA 4BC4A 3RSEA 5KPTA 3H46O 3HI0A 4Z94A 1T44A 5AZJA 2F9TA 4EHTA 1WUAA 3QBXA 2ZF5O 5FPDA 3FZMA 5FPMA 4BG9A 1ATNA 1TUUA 1ZC6A 1MWMA 1SQKA 4FPBA 4BRFA 2QWQA 2YJEA 4E1JA 1GLBG 5F0XA 2P9UA 3EZWA 4B1VA 3MCPA 3R6MA 3TU5A 3UKUA 3D2EA 1LCUA 3ZEUA 3H1VX 4FWPA 1IG8A 4PKGA 1NWKA 1RGIA 4FL9A 5AFUH 5AFUA 3O08A 1NM1A 1X3NA 3R9PA 3CIPA 3O4WA 3LDQA 2V7YA 1XQSC 2GUPA 3ENHA 3CJBA 2A40A 3M1FA 3MN9A 3WQUA 3ATUA 3LDLA 4RTFD 4CD1A 2P9KB 3AAPA 4WQ4C 2D0PA 3VOVA 1HPMA 2HOEA 2P9NB 3W0LA 1SZ2A 1KAZA 5F2RA 5BPNA 4CZFA 3FZHA 3VEWA 3O6WA 4WQ4A 4XH1A 3WQTA 3C0BA 4FO0A 4DB3A 2CH6A 2WUSA 1U2VA 3VF4A 3MK6A 3GOIA 4BRLA 1KXPA 4WQ5C 5KQDA 2UYTA 3LM9A 5AQIA 1XUPO 2FLOA 4CBWA 3U9DA 5AQYA 5LJVA 2QWRA 4PL7A 3FZKA 1HKGA 5BR9A 3VETA 4IXCA 3HZ6A 3QFPA 2CH5A 3ZETA 2P9IB 4WQ5A 4L3QA 3UKRA 3MN7A 3ENOA 4BG8A 4H5TA 1Q18A 3U4LA 1NGCA 1MDUB 4JD2A 4BREA 2FF6A 3UE5A 2IVOA 4FOIA 3H3OB 4M63C 2ZGYA 4BROA 4FWRA 4M7XA 2QW9A 2P9LB 5AQWA 4PKHA 3VERA 4B1WB 3LDOA 1QHAA 2QWOA 3FR0A 4M7YA 2GEMA 2ITMA 1HKCA 2GWJA 3R8EA 1Y64A 4XEIA 4FWSA 1QZ5A 3LL3A 3C7NA 4BR2A 5F1XA 3ULEB 5AQZA 4CZGA 2IVNA 1BOTO 1NGIA 4H0OA 1RDWX 2E2OA 3OHRA 2Q31A 3FE1A 4H0YB 1JCEA 2YI1A 4WYBA 5EX5A 4I6MA 1YXQA 3L6QA 2W40A 2ZGZA 4FWMA 2KHOA 4RCHA 1QQOA 2A41A 2QWMA 5AQNA 3DXKB 4MO5A 5BN8A 2P9PB 3VGKA 4QS8A 4GY2B 3VF2A 3BUZB 1Z05A 5ADXH 5ADXA 4XH4A 3IUCA 1GLLO 1IJJA 2YHXA 4CZMA 4ISGA 5JLFA 3D2FB 4LC9B 4HWIA 3FLCO 2HF4A 2YJFA 5CE3A 4J8FA 3MMVA 4CBUA 1S22A 4A2BA 2P9KA 3AAQA 3WUHA 4BRNA 3CQXA 1T6CA 3WEEB 4CZKA 3EKUA 5BPLA 3CJCA 2P9NA 3LDPA 1BA0A 1Z6RA 3AY9A 4BR9A 1YAGA 1GLAG 3B8AX 4JAXA 5AQQA 3QBWA 3FZFA 3A5MC 5E26A 2PAVA 4FWKA 1QZ6A 3EKSA 5EY4A 4H5RA 1NMDA 3ZX2A 3L4IA 5AZIB 1V4TA 2V7ZA 2NLXA 4DQ8A 1G99A 2W41A 5EOYA 3EL2A 3I33A 2FF3B 4BRIA 4FPAA 2A5XA 3QDKA 5AR0A 1DEJA 1BA1A 1K8KB 3QMLA 2ASOA 2PBDA 1ZXOA 4JHDB 1HJOA 1ZBSA 4QS9A 3AARA 5KPZA 1OKJA 3GE1A 3HM8A 3CHWA 2GTDA 3H3NO 3M6GA 4H5VA 2NRHA 5AQKA 3MDQA 3VF6A 3EO3A 4BQZA 2P9SB 4CD3A 2ASMA 2P9LA 4H0VB 1GLDG 3A8YA 3BF3A 5I9EB 2DPNA 3RSEB 4K42A 1ATRA 1HUXA 3ATVA 3ZX0A 1RFQA 5LY3A 3O5BA 4A61A 3ULEA 2AP1A 4NO7A 5AQJA 1NGHA 1YVNA 2HF3A 2E1ZA 2V52B 2H3GX 4PKIA 5EVZA 4YDUC 5AQRA 3HBTA 4BR0A 2D4WA 1E4FT 4BRDA 3I8BA 3WXIA 2VCPA 5JMVA 2QWNA 3ZEUB 1MWKA 3MN6A 4YDUA 5AQXA 2VWBA 1HX1A 4EIAA 4A2AA 4PL8A 4IJAA 5AQLA 4BRHA 3GG4A 4BRAA 4BGAA 3UB5A 3SMSA 4BRMA 5AQUA 1E4GT 2V51B 1BU6O 3A5LC 3SJHA 5AQSA 4K41A 3H45C 3VEOA 1NBWA 3J8AA 1MA9B 3S41A 4BC3A 1H1VA 1KAXA 3VEXA 3IMXA 4JN4A 1U2VB 3CERA 4H03B 2ASPA 2CGJA 2GELA 3WXJA 4B1YB 1V4SA 3IDHA 1TYQB 5BN9A 2E2NA 5AZIA 1C0GA 1BWFO 1QQNA 1NGGA 2AA4A 2OANA 3DXMB 3LDNA 2ZWHA 3ZETB 4B9QA 3BEXA 5B8HA 3QFUA 1GLEG 3F9MA 5E84A 1D4XA 5AQOA 4H0TB 1BG3A 1LOTB 4JD2B 2Q36A 4CJ7A 4KBOA 3A5OC 4A62A 1QQMA 1HKBA 2Q1NA 5LJWA 3TPQA 5FPEA 1EQYA 4ISEA 2D1KA 4EFHA 4CZLA 5FPNA 2IIRA 1JCFA 2Q97A 4H0PA 2P9SA 4K43A 3BP8A 4IWVA 4BR7A 3C7NB 3CQYA 4MLEA 2E8AA 3JS6A 3A5NC 5KQ8A 2E2PA 3IFRA 3MN5A 3ID8A 1GLCG 1SAZA 4BR5A 4DHYA 5AQHA 4IO8A 2BTFA 2YHYA 3CI5A 4BQLA 3CJAA 4I6MB 5BREA 2F9WA 3U9ZA 4BC5A 4B1ZA 5EXWA 3VGLA 3WXKA 1TUYA 3CJ9A 2P9IA 3GDQA 1R59O 3LM2A 1GLFO 3VEVA 2EWSA 3HSCA 3H6EA 2E1YA 4C23A 4ISFA 2BUPA 3QICA 4FWQA 4AM6A 4JNEA 2FSNA 3DJCA 4EHUA 4O5FA 2E2QA 2QWPA 4CZIA 3VEZA 5AQPA 4FOEA 5JICA 2YCHA 3WT0A 4FWLA 4IJNA 2CGKA 4RWTA 2FSJA 3P4IA 1NGDA 1J6ZA 5AZJB 1ATSA 3L0QA 2FSKA 1NLVA 3M3ZA 2NZTA 4BGBA 1NGFA 2GWKA 1NGEA 3H1QA 3O1BA 5ELZA 2IVPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ5N 1SN4A 2OTLN 2B3CA 1XRSB 4KH6A 3EN9A 1B9DA 3KWIA 3OTOK 4OKKA 2HBKA 1B92A 3UKUB 1NJIO 2BGGA 2QXLA 1S3XA 5KPRA 2IC3A 5TKYA 4EP5A 3VEYA 2LI7A 1AYJA 4CZHA 4DV0K 2P9PA 1CXQA 3KOYA 3DI6A 2O4GA 1VNBA 3HPOA 3NCIA 1KAYA 4FZYA 1KQSM 2C1IA 4K8ZA 3LP0A 4CVNE 3PX6A 4B9UA 1C0MA 1ASWA 1VSJA 3D7EO 4DQSA 3CFPA 3V1QA 2VWKA 5FRMA 2DY4A 1BUPA 4FWOA 4BVPA 1RCHA 3MXJA 3VQ8A 3THXA 2EX3A 2XY8A 4BVOA 5KRSA 3KVGA 1NKBA 4GNIA 3CJ7A 2KYQA 2FBVA 3VESA 1XWLA 1KD1O 4IOAL 1SEGA 3JXUA 2G2KA 4DQIA 1NRBA 3EZ5A 4DUYK 1JXBA 2G8UA 2QXFA 5AQFA 2D5RA 3CETA 3T1AA 1S6QA 3A0IX 4O8KA 3I56N 5CYMA 3ZX3A 4BRQA 4BWJA 4F3TA 2Q2RA 2KTQA 3KKRA 4BR4A 4DS4A 1K8BA 3TSQA 4JHDA 3NVMA 3EY1A 1C6VA 3CCJN 4KTWA 4FJIA 2G8WA 3WNHA 4CZJA 3VTIA 2A42A 3UIQA 4KB1A 4FJJA 4NYFA 3K2PA 1T1TA 2CGLA 5AQMA 4X64K 3EE9A 3FFKB 4OGEA 4WFAL 1HRHA 3LAMA 4CHPA 4CHOA 3HI0A 4Z94A 1T44A 5AZJA 4DU3A 1WB9A 1DTTA 4BE1A 5FPDA 5HLFA 5FPMA 4CJSA 3CQ8A 4BG9A 4FPBA 3OJUA 4DV3K 1C0UA 2UXDK 1QVFM 1WAFA 1VRUA 4CERA 1PTXA 4JKEA 3ZT0A 5M1OA 1MR4A 3TAPA 4RG8A 1LCUA 2NY8X 2HVHA 4FWPA 2K35A 2IAJA 1IG8A 4DTNA 4FL9A 3O08A 4CQKA 1VSDA 3SPZA 4HCCA 1XQSC 3E66A 3ENHA 2ZJRL 3SUOA 3CJBA 3WQUA 3MN9A 5JS1A 4E3SA 1NKEA 2LKBA 1J53A 3BZCA 1U48A 1JLBA 4MDAA 2E0HA 3C6TA 4WQ4C 3JSMA 3BK3C 5IWAK 3VOVA 4FJNA 2HOEA 1TKXA 1JXCA 5JVHL 1VHXA 3VEWA 1NJWA 3WQTA 1WLJA 2RN2A 4DV1K 4DB3A 3VF4A 4EZ9A 4AQYK 2I61A 1KXPA 1JXEA 1NK0A 4NXNK 4BE0A 4JK7A 2VQEK 4CBWA 2N69A 5AQYA 4PL7A 3FZKA 1BISA 1HKGA 4IXCA 3LZJA 4L3QA 3UKRA 2KSKA 4H5TA 1Q18A 1Q8IA 2JWKA 3CPWM 1NGCA 1RDUA 4JD2A 2FF6A 2YC1C 1K6YA 2IVOA 4FOIA 3H3OB 4CIEA 2JDQD 2ZGYA 4AHRA 4BROA 3SI6A 1NKCA 4FWRA 3CW4A 1WAJA 4RW4A 3QETA 2P9LB 3E9OA 4PKHA 4B1WB 3VERA 4LH4A 4C1NI 1HKCA 4BECA 3FFIA 2HBJA 3LL3A 3VMFB 1VQKN 1ZYWA 4GV6A 2FBTA 3MX2A 4H0OA 2E2OA 3OHRA 2NRWA 5HRPA 4M3XA 3DRPA 4EP4A 1K8AO 2VGMA 4WYBA 2OPPA 2GUIA 5HL7L 4PHTX 4RCHA 1HJRA 1OVYA 3DXKB 2KJAA 4MO5A 4FM1A 4E0DA 4CJTA 4FK4A 4R79A 1YI2N 1NK8A 2VGNA 1W97L 4DTOA 3O9UA 2ZD1A 4CZMA 2Q3SA 5KK4A 5JLFA 3D2FB 2XO7A 1U45A 1SKRA 2NRXA 4HHFA 1N36K 2HF4A 1YTUA 3VQ4A 3MMVA 2P9KA 1PE4A 3WUHA 5J2NA 3EYZA 4W5OA 3CJCA 2P9NA 3WNEA 1BA0A 4JRPA 1TAUA 1IBKK 1GLAG 3B8AX 1IH7A 2WOMA 4JK8A 3A5MC 3HSTB 5EY4A 3DM2A 5C0YA 5TKWA 5AZIB 1GOAA 3OS0A 2NLXA 4DQ8A 3KLFA 2ZQBA 4JS4A 2KBHA 1U04A 1WN7A 3ZYYX 4FPAA 3QDKA 2X78A 3VTHA 1N32K 1K8KB 4JKGA 2PBDA 1BIUA 1ZBSA 4LY7A 3OYEA 4DR6K 3BY5A 3VQPA 3ZLJA 3H3NO 4HUEA 4H5VA 1AHOA 2NRHA 3VF6A 1IO2A 4BQZA 2ASMA 1LAVA 3KP1A 2VQFK 3PIOL 2E6MA 3RSEB 4GKJK 2YIOA 4K42A 1HUXA 3ZX0A 3CFOA 2YEOA 4A61A 1NGHA 1ZBIA 1GOBA 1YVUA 5KGWA 3OBWA 5HBMA 3HBTA 4BR0A 1E4FT 1NPIA 3I8BA 4JI4K 2O8BB 2A1RA 5JMVA 3ZEUB 1LWCA 1MWKA 2WC9A 1NMNA 3HM9A 4A2AA 4OPHA 4FW2A 4WCEL 3AVGA 4BE2A 2NY9X 3SJJA 4BGAA 1T0ZA 3SMSA 4BRMA 4DU1A 3AVAA 3AO4A 4DR2K 2HBMA 2D0BA 1ILYA 5GIPA 1XNQK 4DLEA 5BR8K 4B9VA 1BQNA 4BC3A 4OPAA 3IMXA 2EHGA 4W5RA 2ASPA 2CGJA 2YKNA 3KOZA 2GELA 3WXJA 1VQMN 1N4NA 1V4SA 5BN9A 2E2NA 3MEEA 2QA4N 4ELUA 1BWFO 1NGGA 3LDNA 1UAXA 1EP4A 4B9QA 4DSIA 3P38A 2YBRC 3F9MA 1D4XA 1YIJN 5C10A 5AQOA 4LF7K 1EO1A 4KBOA 4B3MK 3RR8A 3VN5A 2Q1NA 2N66A 4FLXA 4CFBA 3U3GA 5FPEA 3BZKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VQ5 N;  1SN4 A;  2OTL N;  2B3C A;  1XRS B;  4KH6 A;  3EN9 A;  1B9D A;  3KWI A;  3OTO K;  4OKK A;  2HBK A;  1B92 A;  3UKU B;  1NJI O;  2BGG A;  2QXL A;  1S3X A;  5KPR A;  2IC3 A;  5TKY A;  4EP5 A;  3VEY A;  2LI7 A;  1AYJ A;  4CZH A;  4DV0 K;  2P9P A;  1CXQ A;  3KOY A;  3DI6 A;  2O4G A;  1VNB A;  3HPO A;  3NCI A;  1KAY A;  4FZY A;  1KQS M;  2C1I A;  4K8Z A;  3LP0 A;  4CVN E;  3PX6 A;  4B9U A;  1C0M A;  1ASW A;  1VSJ A;  3D7E O;  4DQS A;  3CFP A;  3V1Q A;  2VWK A;  5FRM A;  2DY4 A;  1BUP A;  4FWO A;  4BVP A;  1RCH A;  3MXJ A;  3VQ8 A;  3THX A;  2EX3 A;  2XY8 A;  4BVO A;  5KRS A;  3KVG A;  1NKB A;  4GNI A;  3CJ7 A;  2KYQ A;  2FBV A;  3VES A;  1XWL A;  1KD1 O;  4IOA L;  1SEG A;  3JXU A;  2G2K A;  4DQI A;  1NRB A;  3EZ5 A;  4DUY K;  1JXB A;  2G8U A;  2QXF A;  5AQF A;  2D5R A;  3CET A;  3T1A A;  1S6Q A;  3A0I X;  4O8K A;  3I56 N;  5CYM A;  3ZX3 A;  4BRQ A;  4BWJ A;  4F3T A;  2Q2R A;  2KTQ A;  3KKR A;  4BR4 A;  4DS4 A;  1K8B A;  3TSQ A;  4JHD A;  3NVM A;  3EY1 A;  1C6V A;  3CCJ N;  4KTW A;  4FJI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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