3LDLA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 114
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldlA04
1MDUB 4H0TB 3MN6A 2P9UA 1LCUA 3H3OB 2QWRA 1D4XA 4AM6A 3ULEA 4JN4A 1WUAA 5EVZA 4BRHA 4GNIA 3KHYA 2AP1A 3CI5A 5E26A 4H5WA 4A62A 3VENA 1Y64A 2FLOA 3ENHA 1DGKN 4IWVA 2Q2RA 2ASPA 1QZ6A 3DJCA 2CH5A 2I7NA 1J6ZA 1HLUA 1ZXOA 4RTFD 4EFHA 5F0XA 2GELA 2V7YA 1HJOA 5AQXA 1IJJA 1T6CA 1ZC6A 2NRHA 2E8AA 3LM9A 3SJHA 2IVOA 4K43A 3O5BA 4A61A 3UKRB 3MN7A 4H0OA 1IG8A 4FWPA 5AQOA 2QWQA 3M1FA 3O8MA 3FZHA 1NLVA 2NLXA 3IDHA 3VEVA 4H5TA 2UYTA 1K8KB 3L0QA 4IXCA 3R6MA 3VERA 1C0FA 4BRFA 5BRFA 4H03B 3A8YA 5AQJA 3UKUA 3KVGA 2W40A 3U9ZA 3B8AX 1NGHA 4B1UB 4JAXA 1YAGA 1CZAN 3A5MC 2ASOA 2FSNA 3FZFA 3O08A 3ZX2A 4WQ5A 2CGKA 3EZWA 2E1ZA 2P9NA 3CJAA 3JXUA 4BRQA 2ITMA 4CZEA 3AY9A 5AQLA 1BG3A 4CBWA 2P9PB 2HOEA 4BREA 3CERA 3HI0A 3WUHA 4BRGA 3HBTA 3A5LC 4DHYA 1T6DA 3IUCA 1BA0A 4B1WB 4BR9A 3C7NA 1BA1A 2YJEA 3ENOA 1NGAA 3IMXA 4FWNA 1XUPO 2A6AA 3CQYA 3MDQA 2IVNA 5FPEA 2GEMA 4BVPA 4CZMA 4CZLA 3H45C 3ZETB 1BO5O 3QB0A 2P9IA 2CH6A 3M3ZA 5E84A 1E4FT 3ZEUA 5AQRA 2P9SA 4CZJA 3QDKA 4E1JA 3CJBA 2P9LA 3JS6A 5AZJB 5AQGA 2D1KA 1GLLO 4FWKA 4ISEA 4BRLA 5AZIA 2YCHA 4CD1A 3D2EB 3LM2A 5I9EB 1JCGA 4M7XA 2P9UB 3U4LA 5FPMA 4BROA 3ULEB 4FWQA 3WEEA 3BUZB 3VPZA 1Q18A 3D2FA 5AFUH 2Q0RA 1C0GA 3EKSA 3KZBA 1Z6RA 4CZKA 3I8BA 3CJ7A 2J4RA 4H0XB 2BUPA 4CI6A 4H5VA 5AQNA 4MO4A 5ADXH 3DXMA 2Q31A 3CJ1A 2GWKA 4F9OA 1GLCG 4C23A 4BR7A 1MWMA 4Y0WA 5AR0A 4RWTA 2V7ZA 2YHYA 4FPAA 4YDUC 5AQMA 4BG8A 4YDUA 4JNEA 1NGEA 2Q1NA 2YHXA 5F2RA 3AARA 3M6GA 3W3DA 4B1ZA 4NO7A 1G99A 2A41A 4CD3A 3F9MA 4QS8A 4O5FA 3EN9A 4WYBA 1GLEG 3EO3A 2KHOA 1HKCA 1KXPA 4GY2B 3UKUB 1S22A 3U9DA 3TU5A 1Z05A 2QWPA 5EXWA 4I6MA 5KPZA 1V4SA 2ZGYA 4Z94A 4H0VB 1JCEA 3O1BA 4BVOA 3WT0A 1SZ2A 2D0OA 2P9NB 3RSEA 3W0LA 4IJNA 2QWLA 1OKJA 4A2AA 4QS9A 2NZTA 3WXJA 4B1YB 3A5OC 1ATRA 5TKYA 3O80A 5AQSA 2HF4A 2HMPA 3CJ9A 3VF6A 3FLCO 3D7EO 3QBXA 2VYPA 1QQMA 5EX5A 3VF2A 1KAYA 3WXIA 4FOEA 4M63C 4PKIA 2D0PA 4CZGA 3UE5A 3FGUA 3G25A 2P9KA 3C7NB 1GLFO 1TYQA 4L3QA 1NGJA 3QFPA 2FSKA 4BRNA 1U6ZA 3IFRA 2P9IB 4BRPA 4RCHA 4HTLA 3ZEUB 2E2QA 2P9SB 2QW9A 5AQPA 1ESVA 2P9LB 1NGFA 3C0BA 5AQUA 4O8KA 3R9PA 5AZIB 1GLBG 1GLJO 4FL9A 1BDGA 1X3NA 2ASMA 2FF6A 4NB4A 4FWSA 2IIRA 4XH4A 3WEEB 4BG9A 4BRCA 3D2FB 2DPNA 4H0YB 1GLDG 2Q36A 3OHRA 4LC9B 3WXKA 3WQUA 5BN8A 2FF3B 3VEWA 3R8EA 3GBTA 4PL8A 3J8AA 4K42A 3VGKA 3I33A 1LOTB 1MWKA 3DXMB 3UB5A 4IJAA 4M7YA 2VCPA 3FZLA 1X3MA 3SLCA 1R59O 3O4WA 5JLHA 3DWLA 4MLEA 4BR0A 5AQWA 1NGCA 4IO8A 4EAHD 1U2VA 2QWOA 5EOYA 1V4TA 4JHDA 5KPRA 3WQTA 1ATSA 3SMPA 5BRDA 2E2NA 1QQOA 1GLAG 5BR9A 2V51B 1HKGA 3MMVA 2F9TA 4I6MB 3BEXA 4B9QA 2D4WA 3QICA 4FWOA 4BRIA 5JLFA 4ISGA 3A0IX 3DAWA 3LDOA 3RSEB 3SMSA 1P8ZA 3LDNA 5KQ8A 5LJVA 4EHTA 2CGJA 1YUWA 1WOQA 4CZFA 4BR4A 3VEXA 1DEJA 2GTDA 3P4IA 2QWNA 3FR0A 4CZHA 2H3GX 2YI1A 5AQTA 3MN5A 1NWKA 1NGGA 5F1XA 2QM1A 2QWMA 3ATUA 3FFKB 3BF1A 4BRKA 3AAQA 2P9KB 3BP8A 1TYQB 4PKGA 1BWFO 4FWLA 5AQQA 3O1WA 2IVPA 2PAVA 3H3NO 4CJ7A 2CGLA 3GL1A 1HPMA 1BUPA 3GG4A 3MN9A 3VF4A 4BC4A 3VEZA 3BF3A 3GE1A 1QZ5A 3ZX3A 1SQKA 1H1VA 1XQSC 1QQNA 3CIPA 3H1VX 3DXKA 4FWRA 3LDQA 3QFUA 4BRAA 3LL3A 1T44A 4IZ9A 5ELZA 4JD2A 1NGBA 4DCHA 5BREA 1HKBA 5FPNA 3VETA 5JICA 1HX1A 2QXLA 3VGMA 3LDLA 4HWIA 4KBOA 5B8HA 4H0PA 1NGDA 2GWJA 3WXLA 3MK6A 1E4GT 2ZWHA 1RDWX 3VGLA 4EIAA 4BC3A 1BOTO 1TUYA 5AQZA 4CBXA 5LY3A 5AQHA 1YXQA 1RFQA 4FOIA 2BTFA 3ATVA 2A3ZA 3L6QA 2V52B 1MA9B 3H1QA 4XH1A 4BR5A 2GUPA 1TUUA 1JCFA 4PKHA 5KPTA 3GOIA 4CBUA 1U2VB 3ZX0A 5BN9A 5AFUA 2A42A 1YVNA 2E2PA 3HZ6A 2E88A 4JHDB 5KQDA 1NBWA 4BC2A 3CQXA 5CE3A 1EQYA 3HTVA 3QMLA 2WUSA 2ZGZA 2OANA 2ZF5O 5FPDA 4MO5A 4FWMA 3EKUA 3MCPA 2E2OA 5ADXA 2W41A 3AAPA 4PL7A 3ID8A 4WQ5C 1ZBSA 1DKGD 5AQKA 4AM7A 1SAZA 2I7PA 4FO0A 1HUXA 2A40A 3FZMA 4H5RA 3UKRA 1KAZA 4XEIA 2VWBA 4B1XB 1K8KA 4K25A 3VESA 2EWSA 2AA4A 5AQVA 4ISFA 2F9WA 2E1YA 1NMDA 4MLHA 4FSVA 3LDPA 4CZIA 1NM1A 5AQIA 3CETA 3QBWA 5BRHA 2YHWA 3U8XA 4BGBA 3H46O 1BU6O 5EY4A 4BGAA 1RGIA 2A5XA 3VOVA 3H6EA 4BQLA 1S3XA 1X9JA 2PBDA 2YJFA 3L4IA 2Q97A 4BRDA 4DB3A 2E20A 2P9PA 3DXKB 4BR2A 1KAXA 3EL2A 4B1VA 3CHWA 2FSJA 4JD2B 3FE1A 5BPMA 1ATNA 2FXUA 5AQFA 3VEYA 4EHUA 4BC5A 4K41A 3A5NC 1QHAA 3FZKA 1XC3A 4BQZA 5JMVA 2HF3A 5AQYA 4FPBA 3HM8A 1NGIA 5BPLA 3ZETA 3CJCA 3O6WA 4DQ8A 4XH5A 3TPQA 3VEOA 4J8FA 5BPNA 3SK3A 4WQ4C 4BRMA 4H5NA 4QS7A 4A2BA 3S41A 4WQ4A 5LJWA 5AZJA 3GDQA 3HSCA 3D2EA 2Q0UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M3XA 1VQ4N 1VQ6N 4CJWA 3JYTA 1LCUA 2QWRA 4U67L 4BRHA 4JKGA 2B68A 4BWMA 3SQ4A 4CGDA 1NKCA 1Q82O 3ENHA 3L3UA 1SKSA 2Z1GA 3CYGA 1QTMA 2D0AA 4IFEA 1QZ6A 4RW7A 4CFCA 1SKWA 2HHIA 1RT3A 2I7NA 1J6ZA 4I2QA 3ZT2A 1HJRA 4E7IA 5KGXA 1HR0K 1HJOA 3KP1A 2XY8A 5AQXA 1RNHA 4DQIA 2NRHA 3OYMA 3SJHA 1P00A 2IS3A 3NCIA 3UKRB 5CR4A 1L3SA 4M3UA 3I8DA 4FWPA 3M1FA 2QWQA 2ETJA 2NLXA 4AH9A 3SBTA 4H5TA 4H4MA 5HRPA 4DV4K 4LF9K 3OA9A 1C0UA 3TAGA 3SUPA 3LAKA 4C1NK 3RR7A 1C0FA 1C0TA 2HSTA 4LSLA 4H03B 1B9DA 4A59A 2GX9A 3UKUA 3U9ZA 3K57A 1NJIO 2OPQA 1YAGA 2E6LA 3LP3A 3A5MC 2ASOA 1R0AA 1RDBA 3ZX2A 4JYAK 2O8DA 4BRQA 2LSNA 3AY9A 2ZJPL 4EZ9A 5AQLA 1JKHA 4IG0A 3M5RA 2WFBA 2P9PB 3WUHA 2P51A 4BRGA 1KFDA 2KFZA 1C56A 1LAVA 1TI5A 1X9MA 4HTUA 3OJUA 1BA0A 3SUOA 2NUBA 2E2FA 3KK7A 3VQEA 4A5BA 1NGAA 3SCXA 4FWNA 3MDQA 3I55N 3O4QA 3DOKA 1A5VA 4TSXA 3HPHA 3L2QA 4PQUA 5E84A 4CZJA 2P9LA 4OGCA 5AZJB 4ISEA 3HM9A 4E7HA 4CD1A 3LM2A 4WE1A 4ELVA 4BECA 3BDPA 5SWMA 3ULEB 3V1RA 2F8TA 4DR4K 2HBMA 3BUZB 4CJLA 2VGMA 4PY5A 4DTSA 1T7EA 5GAEP 2Q0RA 3EKSA 1W2BM 3CM6A 3I8BA 3B6PA 4IOAL 4FLUA 4H0XB 4GVMA 1YTAA 1ASWA 2IC3A 4CF9A 3P38A 4UQGA 3NH1A 5CY4A 4FJ8A 3TANA 1BCGA 4RW8A 4F9OA 4K8XA 4BR7A 1MWMA 4Y0WA 4OO1J 3VQ5A 1VSHA 3K5NA 4RWTA 3V9XA 2V7ZA 1JL1A 1B7DA 2MN5A 3ZSQA 3M6GA 4G1QA 2G8IA 3W3DA 2A41A 1D8YA 4CD3A 4FJNA 3ZT3A 1BIUA 4W5QA 4QS8A 1ZVGA 3F2KA 4YFUA 4CFBA 4KFBA 3U3GA 1GLEG 4X62K 1TKDA 1KXPA 4KTWA 1S22A 5BR8K 3TU5A 2QWPA 3TTFA 2KBJA 1V4SA 2OA8A 4H0VB 3F9KA 4CF8A 4KAZA 1LWCA 3WT0A 1SZ2A 4KHNA 4ID5A 2P9NB 4FYDA 3RSEA 1N36K 1HMVA 2F7TA 3A5OC 1ATRA 3O80A 2HMPA 1TAQA 4JI8K 4Z4GA 2B5JA 3M8SA 3DLEA 4BY9C 3KIOA 3KWGA 3WXIA 4DR3K 3UE5A 4CCHA 5FRNA 4LSNA 3OYNA 2OZSA 3SV4A 1S72N 1BL3A 1WMTA 3NDKA 2G8VA 2P9IB 4KI4A 4RCHA 4FJ5A 1WBDA 3ZEUB 4CJ3A 2QW9A 4FZZA 3MECA 5AQUA 3PX4A 1GLBG 1LW0A 4FL9A 1BDGA 2ASMA 3CMAN 4FWSA 1TKTA 2IIRA 3CCEN 3CG7A 1JLGA 1B9FA 4H0YB 3AO2A 3F5TA 1WWNA 1ITGA 5BN8A 4CJ5A 3VEWA 4OPKA 1W9HA 3GBTA 2NRZA 4DSFA 4ZTFA 3VQAA 1RBSA 3I33A 2YKNA 3OYEA 4HCCA 3T19A 2HHWA 4J2EA 3DXMB 3DLRA 4IJAA 1T03A 4M7YA 1RT4A 2JDQD 3FZLA 3VTHA 4GKJK 3SLCA 1R59O 4W5NA 3TSQA 1RCHA 1YTUA 4BR0A 1QSSA 3S9HA 1NGCA 4OPJA 4QOZB 2QWOA 5HOOA 4CFAA 4DV3K 1VRTA 3F73A 3O3HA 3QNNA 2P1JA 4YOWA 1ATSA 3OVNA 1IBKK 4J2BA 1GLAG 4ID1A 1TL1A 4C8NA 2W6KA 3MMVA 4E1NA 1WNSA 2E0HA 4W5TA 3QICA 1NG9A 1VSLA 3VQ9A 3A0IX 1QSLA 5LJVA 4I7FA 1S6PA 3G0ZA 4EHTA 2CGJA 4CEQA 1Q7YO 4YOXA 2DY4A 1Y97A 3IRXA 1ZUTA 3P4IA 3FR0A 3CCVN 4DTJA 2FBTA 4CZHA 2H3GX 2HMIA 1D9FA 1TKXA 1EP4A 4BRKA 4ZTJA 3BF1A 3ZT4A 3AAQA 4LD0A 1TVRA 4LF7K 1WSEA 1TYQB 1T3VA 4PKGA 4DSEA 3QNOA 2KSKA 1BWFO 5AQQA 3O1WA 4CHZA 3CC2N 3H3NO 5CZ1A 4JKDA 4CJ7A 4LY7A 2CGLA 3GG4A 4IOCL 4J2AA 4JV5K 3E1YA 4WFAL 2G8FA 2O8BA 1SQKA 1XQSC 3N4QA 4BRAA 4W5RA 4RG8A 2G8WA 3CFRA 3T1YK 3R3LA 1JLCA 1HKBA 5CHIA 2HNZA 1POIA 1UA1A 5HRNA 3RMBA 3LDLA 4CF1A 4NYFA 2I61A 4KBOA 4N56A 4JS4A 3KOYA 2GWJA 3WXLA 1RTDA 2OPPA 4Z4EA 3MK6A 4FLXA 1E4GT 2ZWHA 4BC3A 1BOTO 4E19A 5AQZA 4DU3A 1TK0A 1RFQA 3RR8A 2RE2A 2O4IA 3SF4D 3L6QA 1MA9B 3H08A 4MDBA 1TUUA 2VQFK 2KFNA 1F21A 5SZTA 3KKSA 4DR7K 1N5YA 1I94K 2UXBK 1ASUA 4ILHA 3ZX0A 5LMNK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M3X A;  1VQ4 N;  1VQ6 N;  4CJW A;  3JYT A;  1LCU A;  2QWR A;  4U67 L;  4BRH A;  4JKG A;  2B68 A;  4BWM A;  3SQ4 A;  4CGD A;  1NKC A;  1Q82 O;  3ENH A;  3L3U A;  1SKS A;  2Z1G A;  3CYG A;  1QTM A;  2D0A A;  4IFE A;  1QZ6 A;  4RW7 A;  4CFC A;  1SKW A;  2HHI A;  1RT3 A;  2I7N A;  1J6Z A;  4I2Q A;  3ZT2 A;  1HJR A;  4E7I A;  5KGX A;  1HR0 K;  1HJO A;  3KP1 A;  2XY8 A;  5AQX A;  1RNH A;  4DQI A;  2NRH A;  3OYM A;  3SJH A;  1P00 A;  2IS3 A;  3NCI A;  3UKR B;  5CR4 A;  1L3S A;  4M3U A;  3I8D A;  4FWP A;  3M1F A;  2QWQ A;  2ETJ A;  2NLX A;  4AH9 A;  3SBT A;  4H5T A;  4H4M A;  5HRP A;  4DV4 K;  4LF9 K;  3OA9 A;  1C0U A;  3TAG A;  3SUP A;  3LAK A;  4C1N K;  3RR7 A;  1C0F A;  1C0T A;  2HST A;  4LSL A;  4H03 B;  1B9D A;  4A59 A;  2GX9 A;  3UKU A;  3U9Z A;  3K57 A;  1NJI O;  2OPQ A;  1YAG A;  2E6L A;  3LP3 A;  3A5M C;  2ASO A;  1R0A A;  1RDB A;  3ZX2 A;  4JYA K;  2O8D A;  4BRQ A;  2LSN A;  3AY9 A;  2ZJP L;  4EZ9 A;  5AQL A;  1JKH A;  4IG0 A;  3M5R A;  2WFB A;  2P9P B;  3WUH A;  2P51 A;  4BRG A;  1KFD A; 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