3S41A

Glucokinase in complex with activator and glucose
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Designing glucokinase activators with reduced hypoglycemia risk: discovery of N,N-dimethyl-5-(2-methyl-6-((5-methylpyrazin-2-yl)-carbamoyl)benzofuran-4-yloxy)pyrimidine-2-carboxamide as a clinical candidate for the treatment of type 2 diabetes mellitus
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 176
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3s41A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3s41A01
4A2BA 3QICA 4BQZA 4Y0WA 2A5XA 1HKGA 3CQYA 3O6WA 4RWTA 1NBWA 3WUHA 4H03B 4JAXA 1GLDG 1MDUB 3IFRA 4BR5A 1OKJA 4CBWA 5BR9A 5FPMA 2I7PA 5FPNA 4Z94A 1ZBSA 3WEEA 4BRPA 4XH5A 1ZXOA 2IIRA 4DCHA 4CZGA 2D0PA 1HLUA 4XH4A 4K42A 1WOQA 2ZF5O 3CJAA 1CZAN 4BRGA 4RTFD 1NWKA 4FWLA 3FZKA 4BC3A 3FZLA 3H46O 2YI1A 3BEXA 1J6ZA 1GLJO 1U6ZA 4FWQA 4IO8A 5AQLA 4CZLA 2P9PB 3P4IA 2A3ZA 1R59O 4H5VA 4MLHA 4YDUC 1RFQA 1S3XA 2V52B 4WQ4C 4BRAA 3MN6A 3O08A 4CZIA 4CZMA 1NGCA 4H5NA 3WXIA 1HKBA 4CZHA 2QW9A 4BRLA 5AQVA 1DEJA 1KAZA 4BRKA 4DQ8A 1ATNA 2YHXA 3GE1A 3QMLA 4H0VB 1T6CA 2I7NA 3O4WA 5LJVA 2A6AA 3SLCA 2NZTA 2IVPA 2V7YA 1BA0A 5E26A 1NGDA 3QB0A 2E2PA 4RCHA 4H5RA 5AQWA 3VOVA 5AQXA 5AQQA 4BC2A 4GNIA 2E2OA 3A8YA 5JMVA 1GLLO 2CGJA 4IWVA 2CGLA 2VYPA 3CQXA 4M7XA 2BUPA 4BRCA 2GWKA 2E88A 3QFUA 1U2VB 1ATRA 3RSEB 4BR0A 1SAZA 4B1YB 4IZ9A 4HWIA 2FF6A 2PBDA 1YVNA 2GUPA 3R9PA 5BPLA 3QBWA 3A0IX 2P9KA 2QWOA 2E2QA 5EY4A 4BRIA 4FL9A 2Q1NA 2HF4A 4B1XB 1SZ2A 5AQMA 2P9PA 4MO5A 3HBTA 5F2RA 4FPAA 3HZ6A 3CJ9A 1QHAA 5FPDA 2F9WA 3DXMA 5AQSA 4A62A 1NGHA 2VWBA 3LDOA 1DGKN 4BVPA 3CERA 3ATUA 5KQDA 2FSKA 2P9NB 1MA9B 1KAYA 1NGFA 2PAVA 1TUYA 4O8KA 5AZIB 3J8AA 4A2AA 3VENA 2Q0UA 3U8XA 5AQTA 1NMDA 3VEOA 2AP1A 3VF2A 3FGUA 4L3QA 5FPEA 2QWRA 1QZ5A 3VGMA 3O80A 4BR4A 3VETA 3BF3A 2CH5A 2E8AA 4XEIA 5BRFA 1ESVA 5AQKA 3LDLA 3H6EA 1C0GA 2WUSA 1YUWA 4EHUA 2YJEA 3LDQA 3H3NO 2OANA 1E4FT 4H0XB 3KZBA 1NGGA 1KXPA 1Q18A 3EO3A 4MO4A 3ENHA 2VCPA 2ITMA 3ID8A 3FZFA 4EIAA 2E1YA 4PKIA 3ZEUB 1JCFA 3DXKB 1XC3A 1G99A 3GG4A 4FWPA 1MWMA 1WUAA 4ISFA 2YHYA 1TYQB 2E20A 4BRFA 3CETA 2E1ZA 5LJWA 3DJCA 2FLOA 5AQJA 4FOEA 3VERA 5ADXH 1RDWX 2Q2RA 3R6MA 2HF3A 3SMPA 4O5FA 1QZ6A 1X3NA 3CJBA 5CE3A 2HMPA 4GY2B 4HTLA 4H0YB 3EKSA 2BTFA 3HTVA 4BGAA 4BRQA 5KQ8A 3VEWA 4B1WB 5JLHA 3EKUA 5BRDA 5I9EB 1SQKA 1T6DA 4BG8A 4CJ7A 4JN4A 4PL8A 3TU5A 4J8FA 1NLVA 3FFKB 3CJ1A 4WYBA 3O1WA 3U4LA 3MN9A 3UB5A 1NGAA 5E84A 2FSJA 4K41A 2Q0RA 2V51B 2A41A 1JCGA 3D2EB 2P9UB 1GLAG 2HOEA 4FWSA 4JD2B 3M6GA 3O1BA 1C0FA 5F1XA 3BUZB 3VESA 3WXKA 3LM2A 4CZKA 3ZEUA 4CZJA 3UE5A 3DXKA 3JXUA 4NB4A 3L6QA 5ADXA 4FSVA 1XUPO 2ASPA 3AARA 2QWQA 5EX5A 3ZX0A 2FXUA 3CHWA 3FZHA 3MN7A 4FWKA 3M3ZA 2W41A 1HKCA 5B8HA 3O5BA 3MCPA 3FE1A 5LY3A 3GOIA 2IVNA 5AQPA 3ZX3A 1BUPA 1GLFO 3ZETB 4YDUA 5AR0A 1NGIA 1BDGA 3KHYA 2CGKA 2UYTA 4AM7A 4CZEA 3AAPA 2YCHA 3VEYA 5BPMA 3ULEB 1QQNA 2P9IB 4JHDB 4WQ4A 1KAXA 4NO7A 3CI5A 2AA4A 4ISGA 4CI6A 4LC9B 2ZGYA 3GL1A 3D2FB 3QBXA 2FF3B 3LDNA 5JICA 5AQYA 3U9DA 1LOTB 4H5WA 3BF1A 3VEZA 3AY9A 4PKGA 4BREA 3EL2A 2ZWHA 1Y64A 4PL7A 3A5LC 4FWNA 5AQHA 1YAGA 3H45C 1HX1A 4B1VA 3S41A 4KBOA 2QWPA 1IG8A 4F9OA 5AQFA 1BA1A 2GTDA 3EN9A 4M63C 3H1QA 3KVGA 3FR0A 3A5OC 1HPMA 3D2EA 4BR7A 2P9UA 5AQUA 1Z05A 5JLFA 3DAWA 5EXWA 3UKUB 2D4WA 2E2NA 3CJCA 4JD2A 3GBTA 1Z6RA 1U2VA 3C0BA 2CH6A 3RSEA 3BP8A 4FPBA 3WT0A 4MLEA 3VF6A 3AAQA 5AFUA 4H0OA 4WQ5C 3C7NB 2FSNA 4BROA 4I6MB 1HJOA 1MWKA 5AZJB 1BWFO 3QFPA 1X3MA 1S22A 2GELA 2NLXA 3EZWA 4CD1A 3HM8A 4BC4A 1BG3A 3TPQA 3ATVA 5BRHA 2Q31A 5AQZA 1LCUA 5EVZA 1GLCG 1GLEG 4ISEA 5KPRA 5BN8A 4IJAA 3ZX2A 4DHYA 3ZETA 3LM9A 4QS9A 3SMSA 2EWSA 2P9KB 3ULEA 4CD3A 2P9IA 4JHDA 4A61A 3ENOA 4AM6A 2P9NA 3A5NC 4IJNA 3QDKA 3D2FA 3F9MA 4BRMA 3WXJA 5AZIA 1P8ZA 3UKRB 3D7EO 4CZFA 1QQOA 4BRHA 1YXQA 4BC5A 1T44A 2A40A 4EHTA 4C23A 3IDHA 1X9JA 4BR2A 3DXMB 1NGBA 3CIPA 1RGIA 1BOTO 2D0OA 4FWOA 1JCEA 4IXCA 4EAHD 3IUCA 2KHOA 3L4IA 3W0LA 2QM1A 2QWMA 4FWMA 2P9SB 3U9ZA 1IJJA 5AQNA 2QXLA 2P9LB 5AQRA 2IVOA 2ASOA 3MK6A 3OHRA 3MDQA 1TUUA 1K8KB 3UKUA 2NRHA 4B9QA 1NM1A 5BN9A 1EQYA 2D1KA 1QQMA 4B1UB 3HI0A 4CBUA 4H5TA 2F9TA 1DKGD 4WQ5A 2W40A 3LL3A 3C7NA 4QS7A 3VGKA 4BRNA 3GDQA 3WQTA 4I6MA 5KPTA 3W3DA 4BGBA 5AZJA 1TYQA 3MN5A 3SK3A 2DPNA 1HUXA 3WXLA 1BO5O 1GLBG 5AQOA 1E4GT 3WEEB 5KPZA 4JNEA 2GWJA 2QWNA 2ZGZA 4H0TB 5AFUH 3CJ7A 4XH1A 3VEXA 3L0QA 3I8BA 4BG9A 1V4TA 4PKHA 4FWRA 4DB3A 2QWLA 3I33A 4EFHA 2YHWA 4K43A 3WQUA 3FZMA 5BPNA 5BREA 3VPZA 3FLCO 4BR9A 1BU6O 5AQGA 3LDPA 2YJFA 3A5MC 4FO0A 3H1VX 4K25A 1V4SA 3UKRA 1XQSC 3HSCA 3H3OB 3IMXA 2ASMA 3JS6A 3R8EA 5AQIA 2Q97A 3VGLA 1ATSA 1NGEA 1D4XA 3VF4A 4CBXA 4BQLA 2A42A 4B1ZA 4H0PA 4FOIA 2H3GX 4M7YA 2J4RA 4BRDA 2Q36A 3SJHA 4QS8A 5EOYA 3O8MA 5TKYA 3B8AX 1NGJA 5F0XA 2P9SA 3VEVA 4BVOA 4E1JA 3M1FA 2GEMA 2V7ZA 2P9LA 3DWLA 5ELZA 3MMVA 3G25A 1K8KA 1ZC6A 1H1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W97L 3OYDA 3BY5A 4IEEA 3O6WA 4RW9A 2ZM6K 3ALYA 2YKMA 1KVCA 4QAGA 4K8XA 4I9QA 4H03B 4CK3A 1C0MA 3NFAA 4E19A 1IKVA 4BACA 4XH5A 3KLGA 3DLLL 3HVTA 5C12A 4CZGA 4IBNA 1HLUA 5I42A 3CG7A 4KHSA 2ZF5O 3CJAA 3MEEA 4RTFD 3OYBA 3FZKA 4BC3A 3FZLA 3H46O 4YOUA 4CF8A 1DT9A 3EYZA 4B9UA 3TSUA 4JKBA 5C2FA 4A59A 1BI4A 1BQNA 4IOAL 2P9PB 3KD1E 1R59O 4H5VA 4MLHA 4YDUC 1RFQA 5KTQA 3RRGA 2ZJPL 4BRAA 2RPIA 4OKKA 3SQ4A 3WXIA 3QNNA 2O4IA 1NKEA 1TAQA 1KAZA 3L2UA 4FJKA 4N47A 3VQ6A 4CHOA 1QHTA 5C42A 3SYZA 3GE1A 3QMLA 3HRGA 4AHTA 4CIGA 3R3LA 4H4MA 1T6CA 3THXA 3P1GA 3TARA 2V7YA 1BA0A 2VWKA 4CW7B 3NH0A 4DFMA 4M3UA 4OPKA 4HCBA 4FVMA 3TTCA 4CHQA 3CPWM 4BC2A 4ELUA 2E2OA 3E9OA 4KPYA 3V1QA 4NXMK 2CGLA 2VYPA 3CQXA 5CR4A 2QA4N 2E88A 1U2VB 4CF0A 4B1YB 3KK2A 3OYFA 2F7TA 1ZBIA 3R9PA 3QBWA 3V9ZA 4F2SA 3TI0A 3DLRA 4JI3K 5JVGL 1LV5A 2WTUA 1W2BM 1TK5A 4BRIA 2O8EB 3EZ5A 1LWFA 4C8KA 1FK9A 3HJFA 4B1XB 1XI1A 5AQMA 2O8BA 3AV9A 3CCEN 4M3YA 3J7ZO 4A62A 1DGKN 3ATUA 3BGRA 3N4PA 3V9SA 1KAYA 1SKSA 4CHZA 4OGEA 4N41A 3ASMA 5EU7A 3TAPA 2Q0UA 4BY9C 4W5RA 3U8XA 1B92A 2FBXA 1ASVA 4CGIA 3OJSA 4DV2K 5FPEA 2QWRA 3VGMA 4BR4A 4B3RK 2CH5A 2E8AA 4KH4A 3LALA 5CZ2A 5AQKA 2OA8A 4B3OA 1C0GA 4EHUA 2YJEA 4CF9A 4Z4GA 3DOLA 3H3NO 3VQ7A 3KZBA 3PIPL 1EP4A 1KXPA 1Q18A 1T3VA 2ITMA 1YJWN 2NUBA 3FZFA 3ZEUB 5D3GA 2RHKA 1JCFA 1XC3A 2X6NA 3GG4A 2IGIA 3EY1A 2NRVA 1TYQB 1FW6A 3J7AP 2E1ZA 3DJCA 2HB5A 3LPUA 1RTIA 2RF2A 4CEFA 4FJ9A 3G10A 4OJRA 4NYNA 3BDPA 3CJBA 3MECA 2HMPA 2O8DA 4HTLA 1TKTA 4DQQA 4H0YB 3EKSA 4OVLA 1DTQA 5M1PA 1BQMA 5KQ8A 4FW1A 5FROA 4DU1A 3NVMA 2HNZA 4F2RA 1SQKA 4DTMA 3EE8A 4BG8A 2QKBA 4M3WA 4DR6K 1VSEA 3CJ1A 3OS2A 4B3SK 4WFAL 4DTXA 4TSXA 1NGAA 1P90A 5E84A 3OS0A 2Q0RA 2A41A 4DR2K 3D2EB 1HYVA 2P9UB 2OCEA 4F8RA 1BIUA 2GUIA 1QVGM 4JLHA 3M6GA 3O1BA 5F1XA 3BUZB 4E7HA 3LM2A 4YOTA 4CZJA 1Q9XA 3CPEA 3DXKA 3JXUA 2YKNA 5ADXA 5K14A 1XUPO 4MQ3A 4JKGA 2W41A 1HKCA 2PZSA 1A5WA 3O5BA 5HRNA 1EX4A 5H1SQ 4LF5K 3I8DA 4EZ6A 4GV3A 5HL7L 3DLBA 5LY3A 1X9WA 2G8HA 3GOIA 3WNHA 3ZX3A 3HPGA 4EZ9A 3L2RA 2VWJA 1GLFO 3ZSWA 1BDGA 3KHYA 2CGKA 1IV0A 1SS6A 4K8ZA 3AAPA 4C8MA 1QQNA 4JHDB 1VSHA 4NO7A 4CJUA 4CI6A 3NCIA 1JLQA 4AH9A 4R5PA 3M8RA 2FF3B 4CF1A 1QE1A 4DTJA 1LW2A 1U45A 1LOTB 2Z1HA 1IKWA 2OPRA 1MU2A 3VEZA 2DTUA 3CC2N 3EL2A 2ZWHA 2DFHA 3A5LC 5AQHA 1YAGA 4IG3A 1IG8A 5GINA 1IO2A 2XO7A 1NU0A 3EN9A 4E7JA 2AJQA 3HP6A 1K73O 4LSNA 3A5OC 1HPMA 1Z05A 4KRFA 4B3TK 5JLFA 3K9KA 3CFOA 2HBJA 4JD2A 3PUFA 3WT0A 3AAQA 4DUYK 3N4QA 1L3TA 1Q9YA 3C7NB 3O4QA 4FJ7A 3DLGA 1B9FA 5AZJB 4HUEA 4FW2A 1X3MA 4YHHK 1S22A 2E6MA 5DMRA 5HROA 2UXCK 3ATVA 2VG5A 2Q31A 1HPZA 1HNWK 4JRPA 4KHYA 5EVZA 5HOOA 4KHPK 3AVCA 3ZX2A 1QSYA 3THYA 3VQQA 1I3AA 2EWSA 3ZSZA 2P9KB 1VRTA 1BCOA 4GVMA 1HQUA 4CHPA 1YJNN 4LF4K 4BRMA 3WXJA 4CJWA 4GW6A 3P39A 2ZE2A 1I39A 4BRHA 1Q82O 5KGXA 5HBMA 3PX4A 1XNRK 2JWKA 1X9JA 4WE1A 4CF2A 4BDZA 1QS4A 3V9UA 3CIPA 1LW0A 4FJGA 1REVA 3SV4A 1VSIA 1NKBA 1NOYA 4PWDA 2I5JA 4KREA 2QM1A 3K9JA 3TSPA 3WXMB 3G4SN 3OYHA 4CEQA 2NRHA 2W42A 1NK8A 4B1UB 3KKRA 1TAUA 3HI0A 5J2MA 1L3SA 2F9TA 1DKGD 4WQ5A 1VQPN 1XNQK 2G8UA 3LP2A 2R7YA 4BGBA 4CEBA 4CJ4A 1JXEA 2DPNA 2NNWA 3T1AA 3WXLA 1BO5O 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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