3S41A

Glucokinase in complex with activator and glucose
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Designing glucokinase activators with reduced hypoglycemia risk: discovery of N,N-dimethyl-5-(2-methyl-6-((5-methylpyrazin-2-yl)-carbamoyl)benzofuran-4-yloxy)pyrimidine-2-carboxamide as a clinical candidate for the treatment of type 2 diabetes mellitus
doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 176
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3s41A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3s41A01
2A40A 3D2FB 1NGCA 2UYTA 2A41A 3VEVA 3L0QA 5AR0A 4CZEA 4PKHA 4BG9A 2GEMA 2QXLA 4LC9B 1Q18A 3VESA 3LDPA 4CZKA 5E84A 1YAGA 1GLFO 4XH5A 1HX1A 4JD2B 4CZMA 4A2AA 4E1JA 3L4IA 3ENOA 2A6AA 2V52B 3VETA 3WXLA 2Q1NA 3MN9A 2E8AA 4DCHA 5BPLA 2CGJA 3ENHA 4FWPA 5AQYA 3A5MC 3VEXA 4ISFA 2YJEA 3M6GA 2BTFA 4RWTA 3H3OB 3GOIA 4B1WB 3VF4A 3EO3A 2V51B 3EKSA 3ZX0A 1IJJA 2P9SB 2ZGZA 4F9OA 5AQZA 4AM7A 3VOVA 2AP1A 2FF3B 3DXMA 3MMVA 3O5BA 4WQ4A 2J4RA 2V7YA 5BN8A 1ATSA 1E4GT 4BC5A 1ATRA 2D0OA 3I33A 2P9NA 3A0IX 3FGUA 2P9KA 3H1VX 1NGBA 1BA0A 1V4SA 2QW9A 2VWBA 3MN6A 4FWSA 5AQVA 5AQQA 1ZBSA 4K43A 3FZLA 4WQ5A 1DEJA 3AARA 3R9PA 3VEZA 1NGFA 1GLLO 3HI0A 4XEIA 1TYQA 1ESVA 1RDWX 1T6CA 5LJWA 3S41A 4ISEA 3ZETB 4A62A 1SQKA 3FZKA 2FF6A 1G99A 1S3XA 3M1FA 2ASPA 4H0OA 1C0GA 3HZ6A 2OANA 2NZTA 1BA1A 3ZETA 4O8KA 2VYPA 1S22A 1QQNA 2E2NA 4H5TA 3CETA 3LM9A 1KXPA 3LDLA 5AQXA 4Z94A 1RFQA 5KPTA 5AQIA 2NRHA 1C0FA 1KAYA 4BRHA 1JCGA 5KPRA 3AY9A 4EHUA 3M3ZA 4RTFD 3DXKB 4H03B 2P9KB 4CZLA 1WUAA 1CZAN 3GBTA 3ID8A 3J8AA 3EKUA 3VPZA 4BQZA 3VEOA 2WUSA 5AQTA 4B9QA 4BROA 3U9ZA 2P9LA 4IZ9A 1U6ZA 1QQOA 2V7ZA 1U2VA 4MLHA 5LJVA 3DXMB 4CBUA 4H0TB 4FPAA 4AM6A 1HKCA 3H46O 5E26A 2P9SA 3B8AX 5KQ8A 3JS6A 4B1VA 4CD3A 3WQUA 4BRLA 2YHWA 1GLJO 4FWKA 3VF6A 5AQFA 2GUPA 3LDOA 2GTDA 5AQKA 1QQMA 4JAXA 5BRDA 3HTVA 2E88A 4BR0A 1NBWA 2QWQA 3LL3A 4RCHA 2EWSA 5AQPA 3W0LA 1NM1A 2PBDA 4BGBA 3QBXA 3C7NA 4JD2A 4B1ZA 1GLDG 3GE1A 2QWMA 1LCUA 4H0XB 2ZGYA 4J8FA 4BRMA 3FZHA 4B1YB 2W40A 3GG4A 3CJ9A 1BOTO 4A61A 4CBWA 4BVOA 3TU5A 3L6QA 1X3NA 4IWVA 4BC4A 2D0PA 3ATUA 3H3NO 2A5XA 2E2OA 5AZJB 4EIAA 1NGHA 5EY4A 4JHDB 5AQOA 3WT0A 3ZX2A 3BP8A 5AZIB 3WEEA 1HJOA 4FWMA 4YDUA 2CH5A 5AQMA 3BEXA 4BRCA 1HKBA 5FPEA 5BR9A 3D2EB 5AFUH 3IDHA 4K25A 3GDQA 4M63C 4BVPA 2GELA 3BF1A 1ATNA 4EHTA 4DB3A 2HOEA 4I6MB 2D1KA 2QWOA 1XC3A 1K8KB 2CGLA 4FL9A 2VCPA 3GL1A 1X3MA 3RSEB 3CQXA 5AQHA 2P9IA 5BREA 3ATVA 2GWKA 5ELZA 4Y0WA 1NGGA 4B1XB 1DGKN 2Q2RA 4FWNA 1BU6O 4JN4A 4FOEA 5LY3A 4FWQA 3ZEUB 3CIPA 4XH1A 5F1XA 3UE5A 2YHXA 5ADXA 3QFPA 3VGKA 5I9EB 3EL2A 4CD1A 2QM1A 3BF3A 1JCEA 1DKGD 4C23A 3UKUB 2I7NA 4BRGA 3R6MA 5BRFA 4IJAA 2FLOA 4MO4A 5JLFA 1HPMA 4MLEA 3QDKA 2E20A 2FXUA 5BPNA 2CH6A 4CZFA 5AQRA 1BUPA 2P9UB 4CZJA 1RGIA 2F9WA 2KHOA 4BRAA 1Z6RA 4FSVA 4K41A 1XQSC 1Y64A 1QZ5A 4FO0A 4JNEA 2P9IB 2W41A 4H0PA 3R8EA 1NGAA 1NWKA 3RSEA 4ISGA 3IUCA 3MN7A 4FWLA 3UB5A 3VEYA 1BWFO 3VEWA 3SLCA 4CJ7A 2GWJA 3MK6A 1NGDA 2IVNA 4FOIA 4H5WA 2Q36A 2I7PA 1GLBG 3IFRA 1SAZA 3D2EA 3O80A 2Q0RA 2HF4A 1NLVA 1BG3A 4BRNA 3KHYA 1MWKA 1NGEA 4WQ4C 3G25A 3HSCA 3A5NC 3UKRB 2QWPA 3SMPA 4K42A 4JHDA 3U9DA 3CJBA 1WOQA 5BRHA 5AQLA 5JLHA 5AZJA 1ZXOA 1EQYA 4PKGA 2ZF5O 3O8MA 1MWMA 1XUPO 4GNIA 2ITMA 1T6DA 4FPBA 5EOYA 3LM2A 4EFHA 4BRDA 1GLAG 3FZMA 3ZX3A 3A5OC 1V4TA 5FPDA 3CJCA 1ZC6A 5CE3A 3C7NB 3MDQA 2P9PA 2DPNA 3OHRA 1NGJA 4H0VB 3A5LC 5JMVA 4BR2A 3P4IA 3H45C 3MCPA 3F9MA 3ULEA 2ZWHA 3VERA 1GLEG 3HM8A 1QHAA 4BG8A 3SK3A 3ULEB 2IVOA 4H5NA 3VGMA 3A8YA 3SMSA 3FLCO 2QWNA 3HBTA 1HLUA 2QWRA 5JICA 2Q97A 2P9PB 5AQNA 4BQLA 4BREA 4BC3A 4HWIA 4NB4A 4PL8A 3WXJA 2BUPA 4CBXA 2PAVA 3IMXA 4BRIA 1U2VB 2A3ZA 5F2RA 3CQYA 4B1UB 1Z05A 3QFUA 4IJNA 2P9LB 3CJAA 2HF3A 1JCFA 3DWLA 4CZIA 4BRPA 4FWRA 1P8ZA 3D7EO 5AQUA 3VENA 1YUWA 2IIRA 3DXKA 4QS7A 3O4WA 3QMLA 3DAWA 4BR7A 1HKGA 3BUZB 4BRQA 1BDGA 4DQ8A 3UKRA 1YVNA 2YHYA 5EXWA 1E4FT 3LDNA 3WQTA 3H6EA 3QBWA 5EX5A 3O1BA 1KAZA 4WQ5C 3MN5A 4FWOA 3CI5A 2NLXA 3FZFA 4DHYA 3CHWA 4H0YB 5KQDA 5AFUA 3AAPA 3VGLA 3O6WA 4CZGA 3FE1A 1TYQB 5AQJA 5AQWA 1IG8A 2YCHA 4PKIA 5ADXH 1HUXA 1SZ2A 1NGIA 2A42A 2FSKA 1QZ6A 3DJCA 1MA9B 3H1QA 4IXCA 5BN9A 1KAXA 3FR0A 5FPNA 2FSNA 4BR5A 1X9JA 3U4LA 2E1ZA 4GY2B 4QS9A 3O1WA 2Q31A 3C0BA 3LDQA 4EAHD 2P9UA 2YI1A 3W3DA 1BO5O 4PL7A 3O08A 3JXUA 4MO5A 4WYBA 2D4WA 1NMDA 5BPMA 2P9NB 1LOTB 4IO8A 3WXKA 4O5FA 4BR4A 4M7XA 3AAQA 2E2PA 3QICA 2E1YA 5F0XA 2ASMA 3UKUA 1GLCG 3SJHA 4NO7A 5FPMA 2E2QA 2H3GX 4H5RA 1TUYA 2HMPA 3ZEUA 1TUUA 2CGKA 4YDUC 2ASOA 3WUHA 5TKYA 4CZHA 2FSJA 4CI6A 4H5VA 4BRFA 4XH4A 1H1VA 4HTLA 3TPQA 5AQGA 4L3QA 1T44A 3U8XA 1K8KA 2AA4A 1OKJA 2IVPA 4BRKA 4I6MA 5B8HA 2YJFA 3FFKB 1R59O 5KPZA 3EZWA 1YXQA 4KBOA 2Q0UA 2QWLA 3VF2A 4A2BA 4BGAA 3I8BA 5EVZA 2F9TA 3D2FA 5AQSA 3KVGA 1MDUB 3QB0A 3WXIA 3EN9A 5AZIA 3WEEB 4BC2A 4BR9A 3CJ1A 4QS8A 3CJ7A 4M7YA 1D4XA 3KZBA 1J6ZA 3CERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CPEA 4WFBL 3D2FB 1NGCA 2EHGA 3L0QA 4DR6K 5AR0A 3T69A 4PKHA 4CZEA 3NF8A 4CEEA 3NMUA 4BG9A 3CCJN 2GEMA 1T03A 2F8TA 2QXLA 4CZKA 2I5JA 4XH5A 4F3OA 2HHWA 1E3MA 4E19A 4A2AA 3VA3A 3QEXA 3ENOA 5KGWA 2A6AA 1TL1A 2CGJA 5AQYA 2RN2A 2VWJA 4B9SA 5CYQA 1NJIO 3J81O 4DQQA 1KD1O 1L3UA 3ITHA 4YFUA 3ZSOA 4B1WB 3V4IA 4LD0A 4DQIA 2WC9A 4OLBA 2J4RA 4OKEA 4DS5A 3QLHA 1L5UA 3KWIA 2P9NA 3HK2A 1W97L 4YOUA 4N56A 3SV4A 3FGUA 4YOVA 1JL1A 2P9KA 4CGJA 1WSJA 1QSSA 5CZ1A 1TKDA 3SJJA 1EETA 3PV8A 5FDLA 3OYAA 1RDWX 2YNIA 3OYMA 4DTOA 2HHHK 1S3XA 1EO1A 4LY7A 4FJNA 3ENBA 3OVNA 1C0GA 1LWEA 3HZ6A 4C8KA 1B9DA 3ZETA 1BA1A 4O8KA 1QQNA 2FBTA 3O9SA 1KXPA 1T8EA 2X6SA 1YJ9N 1Q82O 3NGIA 4DQRA 2GX9A 4X66K 1BQNA 3J80O 4CZLA 4I9LA 1WSHA 2HHTA 1A5VA 2ZM6K 4TSXA 3VPZA 2VG7A 4B9QA 4BROA 3U9ZA 1VHXA 4DV0K 2V7ZA 3G71N 2YHAA 3DXMB 4CBUA 4AM6A 4IEEA 4FJHA 4KH5A 4F2SA 4NYFA 1VQLN 4GV3A 4CJTA 5H1SQ 3A2FA 4EZ6A 4GW6A 1EXQA 1EWQA 4JK7A 3L2UA 3WQUA 3S3OA 2YHWA 1GLJO 5AQFA 1NK7A 3ZYYX 2VQEK 2NUBA 4CCHA 1NJXA 4KPYA 1Y97A 1N33K 5BRDA 1C1CA 3BDPA 3OW2M 2P1JA 4BR0A 4KB0A 3LL3A 4RCHA 3BY5A 3E9LA 3W0LA 3QBXA 4JD2A 3EEQA 4OX9K 1LCUA 1HNZK 1NOYA 3T1AA 4B1YB 3CJ9A 4A61A 3QIOA 1YVUA 3TU5A 4LSNA 1X3NA 2D0PA 1S1WA 1QVGM 2A5XA 2E2OA 5M1FA 4FLYA 5FRMA 1NMNA 5AZJB 4CEZA 1Q7YO 1YJWN 3N4PA 3AO3A 4JHDB 4DQSA 3WT0A 3CMEN 3ZX2A 3BP8A 4M3UA 4BDPA 4Z0UA 4CF0A 4YDUA 5AQMA 1HKBA 3L3UA 3BGRA 3D2EB 1RT3A 4JKBA 3C6UA 4BVPA 4X64K 2HHSA 1XC3A 1K8KB 4E7IA 1VQON 4FL9A 3GL1A 3ZCMA 5HBMA 2WBNA 2OTLN 5BREA 2DTUA 1IKVA 2JLEA 3RWUA 4KHQA 2XHBA 3FFIA 4LH4A 3LAKA 4FJKA 4IOXA 1DLOA 1WSEA 1VSIA 3DLKA 3SI6A 4B3SK 2E4LA 1HYSA 3QFPA 3VGKA 3TSPA 5I9EB 5C0YA 1JCEA 2WOMA 1DKGD 2YKNA 2UXBK 4JK9A 2I7NA 4BRGA 1S6PA 4W5OA 3HPGA 4IJAA 4MO4A 5JLFA 4MLEA 4NXMK 4CZFA 3CQ8A 3AVLA 5KI6A 2KHOA 4K41A 4FM1A 2XY6A 3TI0A 3VQCA 5CZ2A 4FJMA 1NGAA 1NWKA 4ISGA 3IUCA 1FXXA 1SV5A 1VQ9N 1OH6A 3UB5A 4CJVA 3VTIA 3OYCA 3SLCA 2HBJA 4CJ7A 2W6LA 3KLGA 3RRGA 4K8ZA 1XMQK 3O80A 3LWMA 4OPAA 4BRNA 3VMFB 3DM2A 3KHYA 1MWKA 4RW8A 4WQ4C 3G4SN 1C0MA 3HSCA 1K8AO 1LW0A 3C95A 3AA5X 3SMPA 4K42A 3CJBA 3HOTA 3TR8A 5AQLA 3R1XA 4Z4HA 4Z4GA 1VRTA 4FM0A 2ZF5O 4R79A 4DU3A 3T1YK 1TGOA 1T6DA 3RTVA 4DTMA 5BR8K 4PWDA 1YTAA 4H0VB 3E9PA 3A5LC 1R0AA 3ALYA 4BR2A 1TVRA 3P4IA 3ULEA 3VERA 1GLEG 3AO2A 3ULEB 3VTHA 4H5NA 4IDHA 3VGMA 2QWNA 1TAUA 2Q97A 3PIOL 3JSMA 3TABA 2NRWA 4BREA 4NB4A 4PL8A 4JI8K 2BUPA 4WF9L 2PAVA 3IMXA 4BRIA 2A3ZA 4JRPA 4B1UB 1Z05A 3TTFA 3DI6A 3QNOA 1JCFA 1S1XA 4B9VA 1QHTA 1P8ZA 3VENA 4BACA 3HJFA 4B3RK 1IV0A 4OJRA 2D0CA 4QS7A 3O4WA 3E01A 3IKMA 3UKRA 1YVNA 4GVMA 1HMVA 2FBVA 3ZLJA 4DV6K 1K73O 3CM6A 3O1BA 3ZSXA 4N41A 3MN5A 4DSKA 3KTQA 3FZFA 4DHYA 4J2BA 3DRRA 5AFUA 3T19A 3FE1A 4LF6K 4KRFA 5ADXH 1NGIA 4ZTJA 1JLCA 1WN7A 1LW2A 3U3GA 1OH5A 1GOBA 3K5LA 2QKBA 4IXCA 1L3SA 4FJLA 5FPNA 1X9JA 2E1ZA 1C6VA 2XO7A 4JKEA 1GOCA 4DTSA 2O8EB 4MO5A 2D4WA 2P5OA 4CJWA 1LOTB 1G15A 2E5LK 4O5FA 1KVAA 4M7XA 3AAQA 3QICA 1VQPN 4LFAK 1QVFM 3V81A 2RPIA 3V1RA 4CJQA 3TAQA 3SJHA 1SUQA 2WFBA 3O4NA 4W5RA 3VQPA 2CGKA 1VQMN 1QE1A 3WUHA 4JI4K 3AVBA 1UA1A 4MDAA 3CMAN 3JYTA 4C1NI 4XH4A 4PQUA 3TPQA 4M42A 1K8KA 1OKJA 1CLQA 2KZMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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