3S41A

Glucokinase in complex with activator and glucose
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glucokinase
publication title Designing glucokinase activators with reduced hypoglycemia risk: discovery of N,N-dimethyl-5-(2-methyl-6-((5-methylpyrazin-2-yl)-carbamoyl)benzofuran-4-yloxy)pyrimidine-2-carboxamide as a clinical candidate for the treatment of type 2 diabetes mellitus
doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 176
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3s41A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3s41A01
5KPTA 5AQHA 3IFRA 2W41A 4LC9B 1WUAA 3VEYA 3VETA 3DXKA 3QFPA 3KZBA 1NGGA 1ZXOA 3R8EA 2HOEA 3VGLA 3J8AA 5BRFA 3ID8A 4CZGA 3W3DA 3ZEUA 3H6EA 4XH1A 3CJ7A 5EY4A 4CD3A 4IJAA 5AZIA 4CZIA 4JN4A 4MO5A 5AQKA 5EOYA 3ENHA 3DXMB 4A62A 4IZ9A 4H5WA 4DQ8A 4B1XB 1C0FA 2Q2RA 1K8KA 1KXPA 3O08A 3VOVA 5BREA 5LJWA 3M6GA 4A61A 4ISGA 1DEJA 1U6ZA 2WUSA 4O5FA 4AM6A 4FWRA 3W0LA 4FWQA 4AM7A 4DB3A 1MDUB 1JCFA 4BC4A 5BPLA 3DJCA 2QWPA 2VYPA 1GLAG 1HX1A 3CQXA 3KVGA 4BC2A 4ISEA 4WQ5A 4CD1A 3QB0A 3TPQA 4CZEA 4BRKA 3D2FB 4RCHA 3QDKA 4FWSA 3UKRB 2A42A 5AFUA 5TKYA 1JCEA 4WQ4C 3H45C 1DKGD 1X3MA 2P9LA 3FFKB 3MN5A 2EWSA 1U2VA 1YAGA 5AZJA 3FLCO 2E2OA 3ENOA 2Q97A 5KQDA 2NZTA 3ZETA 3ZX3A 1IG8A 4BR7A 1GLLO 3I8BA 1T6CA 4CZFA 1XQSC 1BO5O 3VERA 5JMVA 3VF6A 3IUCA 3I33A 5AFUH 3O6WA 3EO3A 4BRLA 1YUWA 4H0XB 1LOTB 5ADXA 3BUZB 4NO7A 4B1UB 1X3NA 4PKGA 5LJVA 4M7YA 4O8KA 3A5NC 4JD2A 3WQUA 3HM8A 1NWKA 5AQNA 3L4IA 4A2AA 2AA4A 4PL8A 3CQYA 3ZX0A 4I6MA 5E26A 2YJEA 2YHXA 4BRCA 5F2RA 2CH6A 3UE5A 2NLXA 2HF3A 3ATVA 2P9PB 1E4FT 3M3ZA 2DPNA 4BRGA 4BRNA 4HWIA 4BC3A 3GBTA 3GE1A 5AQVA 2GTDA 3SLCA 5AQGA 1E4GT 4QS8A 2P9KB 4RWTA 3LM2A 4L3QA 3AAPA 3LDQA 1SQKA 2VCPA 1ZC6A 3OHRA 2P9SA 1BUPA 3C7NA 3VPZA 1V4TA 4BR5A 2P9NB 3GDQA 3B8AX 5AQYA 3C0BA 2NRHA 2ZGYA 5AQSA 4YDUC 3CJBA 3EN9A 1WOQA 5CE3A 1HKBA 5B8HA 2V51B 2F9WA 3VGMA 2P9UA 1NGIA 3D7EO 4CBXA 3CJ9A 2YHYA 4JAXA 3U4LA 3VEVA 2E20A 2P9IA 2Q31A 3SMSA 3WXLA 5KQ8A 1TYQB 2A41A 1P8ZA 5JLHA 2KHOA 3AARA 3EL2A 5EX5A 3D2EB 3VEWA 5BRHA 3MK6A 5EVZA 2HF4A 5F1XA 3DXKB 3A5LC 3R6MA 4FL9A 3UB5A 5FPNA 3ULEB 3LDPA 3DXMA 1BA0A 3MN6A 5AQFA 5ELZA 1NGAA 4FWMA 3ZEUB 3TU5A 5AZIB 1BU6O 3WEEB 1NGCA 4H5VA 3MDQA 3QFUA 3A5OC 1KAYA 2BTFA 3FZFA 4QS9A 1NGFA 3GOIA 5AQPA 3MCPA 3FGUA 3BP8A 3GL1A 3WUHA 1NBWA 5LY3A 2CGKA 4K41A 1HLUA 1GLJO 4H0YB 1HKCA 5EXWA 3CERA 5FPEA 3HSCA 2PBDA 5AQUA 2FXUA 3FZKA 2GEMA 2AP1A 1HPMA 1XUPO 3WXIA 1C0GA 3KHYA 1GLCG 4Y0WA 2UYTA 3A8YA 5AQJA 4GY2B 3VEXA 2E1ZA 3UKUA 2D4WA 2V7YA 4BRPA 3FZMA 2YCHA 4CBWA 2P9LB 1Y64A 4C23A 3VGKA 1U2VB 5AZJB 3O1BA 3O4WA 2E1YA 3SMPA 3ZETB 3WT0A 3BEXA 3H46O 1QZ6A 1NMDA 4BRAA 3M1FA 4BQLA 1BA1A 2Q36A 4BRIA 1GLDG 5KPRA 2HMPA 3QBXA 1D4XA 2ASOA 1QZ5A 4IXCA 4BC5A 3DAWA 4CZMA 2QM1A 4H5RA 1HJOA 4B1ZA 4B1WB 2YJFA 1KAZA 2ASMA 2QWLA 3LL3A 4BG9A 4B1VA 4IJNA 2I7NA 3U9DA 4K43A 4XEIA 2GELA 2IIRA 1YXQA 1DGKN 3QICA 5E84A 3WXJA 3ATUA 4H0OA 5AQTA 2P9PA 2V7ZA 3QMLA 4I6MB 4JHDA 4RTFD 1EQYA 4GNIA 2D1KA 4WYBA 3BF3A 2E2NA 4CJ7A 3AAQA 1MWMA 4J8FA 2FSKA 4B9QA 3VESA 1CZAN 3S41A 4MLHA 1QQNA 3ZX2A 3LDLA 3O8MA 2BUPA 5AQIA 2QWMA 4BREA 2D0PA 4F9OA 2PAVA 5FPMA 4FSVA 3IDHA 4H03B 1H1VA 4BR2A 5BRDA 5AQMA 4WQ4A 1NGEA 2H3GX 4FWLA 1TUUA 3EZWA 1GLFO 4FWNA 4BRMA 3C7NB 4K42A 5BPMA 3HI0A 2Q0RA 1Q18A 1KAXA 3CJAA 1ESVA 4FWOA 4XH5A 4DCHA 4FWKA 2VWBA 4KBOA 3RSEB 3VEOA 1RFQA 1LCUA 3LDNA 5JLFA 4BVOA 4IO8A 1TYQA 2F9TA 4Z94A 4H5NA 2P9UB 1ATNA 2ITMA 3D2EA 4BR9A 1NLVA 1BWFO 3FZLA 4FO0A 4CZKA 3WQTA 2P9IB 4K25A 2FF6A 4M63C 2QW9A 3BF1A 2FLOA 3CI5A 2I7PA 3H3OB 3CETA 3ULEA 4BR0A 3FR0A 4FWPA 5FPDA 3MN7A 5I9EB 1SAZA 3H3NO 4CBUA 4BGBA 2QWNA 4DHYA 3O1WA 3WEEA 1K8KB 3EKSA 4H0PA 3A5MC 2ZWHA 2D0OA 2FSNA 3JXUA 3MMVA 4EHUA 4PL7A 2A5XA 4EHTA 2CH5A 3U9ZA 2CGLA 3CJCA 3H1VX 2ASPA 4CZLA 1SZ2A 3D2FA 4BROA 1ATSA 2YI1A 5AQRA 3UKRA 2E2PA 1BOTO 4BRDA 3LM9A 4QS7A 3CJ1A 1S22A 4H0VB 4CZJA 3VENA 2FSJA 4BVPA 4BG8A 2V52B 1R59O 1RGIA 1QHAA 1ZBSA 3O80A 3VF2A 4ISFA 2A3ZA 4FPAA 2QWQA 2IVOA 3CHWA 5AQLA 3MN9A 4EAHD 2QWOA 1MWKA 3H1QA 2E88A 2ZF5O 3GG4A 5BN8A 1RDWX 4M7XA 3HZ6A 4BQZA 3LDOA 5AQQA 4YDUA 3UKUB 2GWJA 2ZGZA 5AQOA 5AQXA 3WXKA 4XH4A 2E8AA 2A6AA 1GLEG 4FPBA 4EFHA 2A40A 4H5TA 3FZHA 4H0TB 1X9JA 1XC3A 2QXLA 1S3XA 4MO4A 3JS6A 1IJJA 1HKGA 1NGBA 2YHWA 3QBWA 4NB4A 4BR4A 5BPNA 5AR0A 3HTVA 1V4SA 2CGJA 5JICA 5BR9A 1NM1A 1Z05A 4JD2B 1BDGA 3F9MA 1NGDA 1JCGA 4B1YB 1GLBG 1NGHA 4HTLA 3CIPA 1TUYA 4E1JA 1HUXA 1ATRA 3VF4A 1NGJA 2IVPA 4WQ5C 3VEZA 3HBTA 3EKUA 1T6DA 3L0QA 1J6ZA 2P9KA 3P4IA 5AQWA 4PKHA 4JNEA 1OKJA 2OANA 4FOEA 1G99A 4JHDB 4EIAA 5ADXH 2P9NA 2W40A 3IMXA 4MLEA 3SK3A 3SJHA 1BG3A 2Q0UA 3G25A 1QQMA 2QWRA 3DWLA 4BRHA 4IWVA 4A2BA 1Z6RA 2P9SB 2IVNA 2J4RA 2E2QA 2FF3B 3A0IX 5AQZA 4CI6A 1T44A 5BN9A 4FOIA 4BGAA 3U8XA 2GUPA 4PKIA 3O5BA 1YVNA 2GWKA 1QQOA 4BRQA 1MA9B 4BRFA 3AY9A 3FE1A 5F0XA 3L6QA 4CZHA 2Q1NA 5KPZA 3R9PA 3RSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FM0A 1IBKK 2HMIA 3PY8A 1VSJA 1Q9XA 3RWUA 4LC9B 3DRPA 4AHRA 1NGGA 1ZXOA 3R8EA 2VG5A 4DTJA 3V4IA 3OYNA 4CEAA 3DOKA 1YTUA 3OYCA 3ID8A 4DS5A 3THXB 4JKFA 4CZGA 4E7HA 3ZT0A 1LAWA 3P83D 4IJAA 5AZIA 4CJ4A 3ID6A 1N6QA 1A5WA 4LF4K 3J81O 1J9AA 4KH6A 2Q2RA 3AVAA 1K8KA 1KXPA 5LJWA 4A61A 1DEJA 1KFDA 4JS4A 2QKBA 2B6AA 1JXBA 4YOTA 4CJTA 2P5GA 4E3SA 3VQ4A 4CJ5A 2HHQA 1MDUB 4LSLA 4JRQA 3KLGA 4BC4A 1RCHA 3DJCA 2VYPA 4F8RA 4BC2A 4CD1A 2Y1JA 3VQCA 4DR3K 4IDHA 3T3FA 1S9GA 2IOCA 3QB0A 3KKSA 4Z4GA 3AVIA 3QDKA 4WQ4C 3H45C 1JLAA 4KB0A 1X3MA 2KTQA 2EWSA 1U2VA 4CGGA 5BR8K 2E2OA 4IG0A 4FJJA 3M8SA 2IS3A 2Q97A 4LH5A 3I0RA 2RPIA 1K6YA 3ZX3A 1IG8A 3K9JA 3LAMA 4LD0A 2BDPA 2VQEK 2B4JA 3ZT1A 4Z4CA 4CEZA 4YOXA 3VF6A 4FLXA 4PQUA 4KPYA 3O6WA 4FK0A 4BRLA 1ASUA 4H0XB 4MDAA 1RBUA 2WBNA 1TKZA 4O8KA 4C1NK 4JD2A 1L3VA 3NFAA 1QSYA 3WQUA 2IAJA 1XNRK 4OKKA 4N41A 3HM8A 5GINA 3L4IA 3AO2A 2AA4A 4PL8A 4FLWA 1WSGA 3QEPA 5F2RA 4M3ZA 3N4PA 3ATVA 1E4FT 4KHUA 4BRGA 3IG1A 2GTDA 4JKEA 4FVMA 2F96A 4RWTA 3MX5A 4G9ZA 4DLGA 5CYQA 3OHRA 1SQKA 1ZC6A 5CZ2A 3C7NA 3KWGA 3ZSVA 3TANA 4ZTJA 4CF0A 5A2QO 2ZGYA 4DQIA 1TK5A 4M3RA 1HKBA 3THYB 1ILYA 3NF8A 2NRVA 4CF9A 3HYFA 4CBXA 4ID5A 4OGEA 3NGIA 3HO1A 2YHYA 3VEVA 3U4LA 3WXLA 2WC9A 1TYQB 4Z4IA 4CW7B 2ZQBA 5EU7A 3RTVA 3V9ZA 3VEWA 4CGFA 5JS2A 5CY4A 4ILHA 3OYLA 2G8UA 4YNQA 4JYAK 3ULEB 3DXMA 3MN6A 3ZEUB 3TU5A 5C2DA 4KREA 1I3AA 3MDQA 4NLBA 4IFEA 4CJUA 2O8EB 1ZBUA 1EXQA 3A5OC 4QS9A 3GOIA 3MCPA 4RW6A 4DV4K 3BP8A 1N33K 4IDKA 3AVMA 5LY3A 1IH7A 1BCOA 1KFSA 1GLJO 1HYZA 5JS1A 3TAQA 1HKCA 1TGOA 1ZYQA 4CFBA 4O55A 2YNIA 2PBDA 3RVCA 3O3GA 2YKMA 2GEMA 5JVHL 3C94A 2AP1A 3QNNA 4X64K 1U47A 3Q7CA 5FRNA 3MCAB 5AQJA 1T05A 4GY2B 2E1ZA 3UKUA 3HSTB 4BRPA 1QSSA 4DTRA 1N36K 3OJUA 3NDKA 1Y64A 3VGKA 3ZSOA 1RT5A 4YORA 4N47A 1U49A 1QTMA 3C6TA 4NCAA 2UUAK 1KVBA 3JYTA 3DLEA 1NMDA 4FJ7A 2ZE2A 4BQLA 4CCHA 4BRIA 4CHQA 3ZSWA 2HMPA 3D6RA 4CK1A 3QBXA 1D4XA 4BC5A 3DAWA 2JWLA 4DTMA 3V1OA 1YJNN 4KFBA 2XY6A 3LL3A 4DTUA 4B9NA 1HQEA 4IJNA 5LMUK 5M1PA 1Q9YA 1YVUA 1XC9A 3MXIA 1S6QA 3L3UA 5FDLA 4K43A 3QETA 3QICA 5E84A 3HPHA 4DR1K 1KLNA 4H0OA 5C24A 2P9PA 1SL2A 1ZBIA 4PHTX 2VWJA 3VTHA 3ZCMA 4M3WA 2I5JA 3VTIA 4JI6K 4DV0K 3J7ZO 2D1KA 3BGRA 2UXBK 2KZZA 4CHOA 1MWMA 4IO9L 3WNHA 3VESA 1K9MO 1IKXA 4FM2A 4F9OA 4CJSA 5I42A 4FWLA 4Z4HA 4I2PA 3CCSN 1LWFA 3HVTA 5BPMA 1S1WA 4LY7A 4XH5A 3JAMO 1RT6A 1WSFA 4DCHA 4CEOA 4FW2A 1C0MA 3NF6A 3VEOA 3K5NA 1VHXA 5JLFA 1D9FA 4CIGA 1N32K 4Z0UA 4AF1A 5C0YA 1BL3A 3R1XA 1KRPA 4BDPA 2JLEA 1HNWK 3BF1A 1YIJN 3V1RA 1M1KO 4O44A 4E0DA 5I9EB 4BGBA 4CF2A 3WNGA 3WEEA 3NF9A 3Q7BA 5HL7L 1K8KB 5E41A 1VQ5N 3THVA 3QNOA 4C8MA 4EHUA 1LW0A 4FJ8A 2CH5A 3CJCA 3H1VX 3HVRA 5H1SQ 1ATSA 2YI1A 1RNHA 3E1YA 3NF7A 1BOTO 3I8DA 4WFAL 4QS7A 1SKWA 5CYMA 3B6PA 1NMNA 1I94K 3VA0A 2V52B 4C1NI 3BDPA 1JXEA 1FKOA 4DSKA 2FBVA 2UUBK 4HHTA 1J5EK 2A3ZA 4LFCK 2G8IA 3CHWA 5AQLA 3MN9A 4DSLA 1QVFM 3PUFA 2B5JA 3H1QA 2E88A 5IWAK 1WSHA 4M3YA 3DLLL 2DTUA 1GOBA 5DM6L 3MXJA 3DLHA 5AQOA 1S1UA 1RTJA 4JS5A 4DFMA 4JK8A 4XH4A 3CD6N 4KAZA 2O8CA 1SKSA 1U4BA 4OVLA 3AV9A 3CCQN 1Q81O 1IJJA 1BQNA 1HKGA 4CFDA 1TK0A 2G8HA 1TV6A 4W5QA 3K58A 3QBWA 4NB4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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