3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
5BPLA 1BG3A 4CD3A 2YJFA 5KPTA 4BR5A 2P9PB 5AQUA 2P9SA 2A6AA 3BP8A 3SMSA 1U2VB 4I6MA 2HF3A 4M7YA 1EQYA 2EWSA 5LJVA 3SJHA 3H46O 1HPMA 2P9IB 4CZEA 1GLCG 1C0FA 2QWNA 2QXLA 5AQXA 2A41A 5E26A 4BC2A 4BR4A 1MWKA 2AP1A 3O5BA 3IMXA 4JHDA 4MLEA 3EL2A 3EN9A 1GLAG 3A5NC 3I8BA 1WUAA 4H5VA 5AQFA 3ZEUB 3DAWA 3AAPA 3HM8A 1QQOA 4HWIA 4BG8A 4FWLA 2A40A 3QB0A 5KPZA 2P9PA 4BRLA 1YAGA 3KHYA 5AQNA 3VOVA 4K25A 4FL9A 3EZWA 1BWFO 5JICA 1XUPO 1JCFA 2P9IA 2IVPA 5BN9A 3FZLA 1HKGA 3MN7A 1BA1A 4DHYA 3IDHA 3O80A 3WXKA 3H1VX 4BVOA 5FPMA 4Y0WA 5ELZA 5EXWA 1DGKN 1ZBSA 4MLHA 4CBXA 4RCHA 3EO3A 3WUHA 3FLCO 1K8KA 1NGDA 4DQ8A 3HZ6A 4J8FA 3R6MA 3MN9A 3ZEUA 2CGJA 5AQYA 2A42A 5AFUA 2ZWHA 3OHRA 4CZMA 3GL1A 4PKIA 4A2BA 2YI1A 5F2RA 5F1XA 5JMVA 4CZJA 4F9OA 4XH1A 2CH5A 3UKUB 1GLDG 2YHWA 5BPNA 2V7ZA 3U9DA 1X9JA 3ZX3A 4EAHD 2V7YA 1HUXA 1OKJA 2Q36A 3MN5A 2D1KA 4GY2B 1DKGD 1QQNA 3VERA 4H0VB 4NO7A 1GLFO 3VENA 3G25A 3B8AX 4EIAA 3F9MA 2IVNA 3WT0A 3SMPA 5AQPA 5AQTA 3LDPA 4RTFD 2DPNA 3CQYA 5EY4A 2GWJA 4WQ5A 5AQHA 1NGGA 3VGLA 2E2QA 2GEMA 3FFKB 5E84A 3MDQA 3H3NO 1ZXOA 5ADXH 4BRMA 5AQWA 4K42A 3KZBA 3UKUA 5AQRA 2I7PA 3O08A 3VEWA 1NGHA 3O8MA 1NLVA 2BUPA 1SAZA 2Q2RA 4QS9A 4C23A 1NMDA 3VEYA 1NM1A 1T6DA 2HOEA 3MN6A 3CJ7A 3VF4A 4O5FA 3AAQA 2FLOA 2ZGZA 1KAXA 3O1BA 4M7XA 4H5TA 2QM1A 1Y64A 1BU6O 4XH4A 3ULEA 4FOIA 5AQOA 2QWQA 4BGAA 2ZF5O 3VGKA 3ZX0A 3RSEA 2ASPA 1P8ZA 3BUZB 4CBWA 3M6GA 3UKRB 4BRNA 4IJNA 1IJJA 4H0PA 4AM7A 3A5LC 1NGAA 3LDLA 3DXMB 1KAYA 4XEIA 5AQQA 2NZTA 2CGKA 4EFHA 3D2FA 1D4XA 4WQ4C 3TPQA 4H0TB 1GLLO 2I7NA 3LDQA 2WUSA 1KXPA 4PL7A 5BRHA 4MO4A 4H03B 3GOIA 5AQIA 1K8KB 2FXUA 2CH6A 4CZLA 3R8EA 4CZIA 3QFUA 3GE1A 4A62A 3ZETB 4ISGA 3LDNA 4PKGA 5KQ8A 1LOTB 3FZFA 3M1FA 2P9KA 3LM9A 1S22A 3VF2A 3ATUA 3EKSA 4FPBA 2FF3B 2FF6A 1BOTO 2IVOA 3EKUA 4Z94A 3O1WA 3UKRA 4IJAA 3CJBA 3FR0A 1ATRA 3WQUA 3QBXA 4PKHA 3DXMA 1NGBA 4YDUA 4BRAA 2PAVA 4ISFA 1X3MA 2F9WA 5EOYA 5F0XA 3JS6A 1KAZA 4FOEA 3O4WA 1JCEA 2Q31A 4BRIA 3C0BA 3L6QA 3H3OB 4CD1A 2GWKA 3ZETA 3FZMA 3VESA 1HLUA 3DJCA 3S41A 4PL8A 1NWKA 3ENHA 3U9ZA 4E1JA 4GNIA 2V51B 1CZAN 3FZKA 3D2EB 3C7NB 4BC4A 2NRHA 1H1VA 5AQSA 3DWLA 1MA9B 1TYQA 3VEOA 3KVGA 4EHUA 4B9QA 1TUYA 2D0PA 3IFRA 4RWTA 4B1XB 4CBUA 2P9UB 4BGBA 2Q1NA 2ASOA 3D7EO 3HTVA 2E2NA 4IZ9A 2AA4A 1C0GA 3HSCA 3DXKA 2V52B 4B1WB 2YCHA 3FZHA 5EX5A 3ULEB 3CERA 5FPNA 3WXIA 5FPEA 4BG9A 4JN4A 1YXQA 3JXUA 4FWNA 4HTLA 3RSEB 3CI5A 3VEVA 3MK6A 1QHAA 4H0OA 2NLXA 1XC3A 3W0LA 4B1YB 4BQLA 4CZHA 2IIRA 3L4IA 3CQXA 4JD2B 4BVPA 5AZIB 4DB3A 5CE3A 2OANA 3D2EA 2Q0RA 3C7NA 4BRFA 3D2FB 3H6EA 5FPDA 4QS7A 2P9LB 1SQKA 4FWKA 2W40A 1Z05A 2W41A 2KHOA 3U8XA 3GG4A 3VETA 4BRGA 1XQSC 4BRDA 2P9UA 2H3GX 5AFUH 3LM2A 3U4LA 4A2AA 5LJWA 1BUPA 2QWRA 2YHYA 1BA0A 1Z6RA 3WEEA 2P9KB 1V4TA 3O6WA 3CJCA 1U6ZA 4DCHA 4WQ5C 3MMVA 4BREA 3LL3A 5BRFA 4IWVA 4BR2A 2GTDA 1YVNA 5B8HA 1V4SA 1X3NA 1HX1A 3LDOA 4BC3A 3BF3A 4IXCA 5TKYA 1GLBG 4JD2A 5AZIA 1HJOA 2P9NB 1NGEA 3W3DA 1NGJA 3HBTA 5AZJB 5KPRA 2BTFA 2P9LA 2QWMA 1E4GT 4CI6A 4H5WA 4FWMA 3A8YA 4BQZA 2VYPA 1BO5O 1RGIA 4FWOA 3ZX2A 4H0XB 4MO5A 3M3ZA 2ITMA 4WYBA 3SK3A 5KQDA 4B1ZA 3GBTA 4BR0A 1BDGA 1ATNA 4B1VA 4BR9A 3ENOA 4NB4A 3J8AA 5AR0A 2PBDA 2HMPA 4H5RA 2UYTA 1S3XA 3VEXA 1TYQB 5AQKA 4FWQA 2HF4A 2CGLA 2E1YA 3CETA 2YJEA 2F9TA 2P9NA 1SZ2A 5I9EB 4BRHA 3ID8A 5AZJA 2E88A 2FSJA 3HI0A 2E2OA 3AARA 3CJAA 1Q18A 3DXKB 3CJ9A 2GUPA 2QWPA 1T6CA 2QW9A 3H1QA 3QICA 4BRKA 4BROA 1U2VA 1G99A 2J4RA 4CZFA 3WQTA 2Q97A 2FSNA 4CZGA 4JNEA 5AQGA 4H0YB 4BRPA 1GLJO 1QQMA 2A3ZA 3VEZA 1GLEG 3WXJA 3QDKA 5BRDA 1RDWX 2D4WA 3A0IX 1LCUA 3CIPA 4YDUC 4K43A 4FSVA 5ADXA 2GELA 3IUCA 2VCPA 3CHWA 4BC5A 1QZ6A 1TUUA 3BEXA 1HKBA 4ISEA 3TU5A 4CZKA 3UE5A 2E1ZA 2A5XA 1HKCA 3QBWA 3H45C 2E20A 1YUWA 1NGCA 3WEEB 4FWRA 5BN8A 3ATVA 4IO8A 4QS8A 1QZ5A 4FWPA 1IG8A 3CJ1A 3P4IA 3GDQA 4H5NA 5LY3A 1MDUB 3MCPA 5EVZA 5JLHA 2QWOA 4L3QA 1NGIA 4KBOA 5BREA 5AQZA 2E8AA 4M63C 2FSKA 4B1UB 3BF1A 3FGUA 1WOQA 1RFQA 3R9PA 3VF6A 1R59O 2D0OA 3AY9A 3QMLA 1JCGA 5BR9A 1NBWA 1J6ZA 1ZC6A 2ZGYA 3WXLA 2Q0UA 3I33A 4O8KA 1T44A 2P9SB 4FPAA 4CJ7A 4FO0A 3SLCA 4I6MB 3A5MC 4FWSA 2YHXA 3FE1A 4XH5A 1ESVA 4A61A 2VWBA 4LC9B 3VPZA 4JAXA 4AM6A 1E4FT 3QFPA 3L0QA 2QWLA 5AQLA 1DEJA 5BPMA 1NGFA 3VGMA 4JHDB 4WQ4A 3A5OC 5AQMA 2ASMA 2E2PA 4BR7A 4BRCA 1ATSA 3UB5A 4K41A 4EHTA 4BRQA 5AQVA 5AQJA 5JLFA 1MWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BPLA 3QIOA 4CEOA 3TAEA 1VQLN 4DV3K 1K8AO 5KPTA 2XY5A 2YX6A 3HSTB 4B3TK 1U2VB 1R0AA 4M7YA 3SJHA 3TTDA 1S9GA 3L2QA 1HPMA 2P9IB 3ZT3A 1GLCG 2QWNA 3SZ2A 5AQXA 3A2FA 4Z0UA 3OW2M 5E26A 3Q7CA 2HBLA 4BR4A 3SV3A 4CCHA 1WSJA 3NBPA 3ZT2A 3PIOL 1GLAG 3C6UA 3PSIA 4H5VA 3I8BA 3DAWA 4RG8A 3HOSA 4ZTFA 1QQOA 3F73A 5KPZA 5IWAK 3KHYA 3J7AP 4K25A 4NYFA 1FJGK 1FKPA 1S6QA 2P9IA 3D6RA 4C1NK 4KTWA 4FJKA 3MN7A 1C0UA 3IDHA 5FPMA 3ITHA 3B6PA 5ELZA 1DGKN 4MLHA 4RCHA 4YOWA 1K8KA 2O8BA 3HZ6A 4J8FA 3KKRA 2A42A 1N32K 3OHRA 4CZMA 4JV5K 2A1SA 5JMVA 5F2RA 5F1XA 4BDZA 1OH6A 1JLFA 2R7YA 4NXNK 2C1GA 2CH5A 3UKUB 4KH4A 3CCSN 5LMUK 4CK1A 4CJKA 4BY9C 2YHWA 1XNRK 1REVA 4AH9A 4DTPA 3U9DA 1FW6A 1C1CA 1QE1A 4EAHD 1HUXA 1OKJA 2QA4N 2XY6A 3NGYA 1DKGD 4KHWA 3CC7N 1VQ7N 3OJSA 3VENA 4YOUA 1WSFA 2D0AA 4CEEA 3WT0A 4DF4A 3K9JA 4DQIA 1YJ9N 1KFDA 3OYKA 3CPWM 5HROA 2ZM6K 2HNZA 3VQ8A 3ENBA 4DFKA 3CCLN 1NGGA 3C6HA 4B9MA 4ELTA 1SKSA 5CYQA 5ADXH 3UKUA 3LP2A 2X74A 4E3SA 3ULDA 1VSDA 1C6VA 1ITGA 3U3GA 4JYAK 1ASUA 1VSEA 2NRXA 5J2NA 1G15A 2IDOA 3CCUN 3TSQA 1GOBA 3AAQA 2FLOA 2ZGZA 4BDYA 3PX4A 5I3UA 1BU6O 3ULEA 4FOIA 4MQ3A 5AQOA 4FJMA 4U7BA 4OX9K 4QOZB 4DSLA 4RW8A 3ZX0A 3RSEA 4OKEA 3CFPA 3UKRB 1RNHA 4BRNA 4IJNA 1IJJA 4H0PA 4AM7A 4W5RA 3A5LC 1QSLA 2Y1JA 1KFSA 1VQMN 5AQQA 4BACA 3D2FA 2HSTA 4H0TB 4A57A 1D9FA 2RN2A 1NNEA 2BANA 3RMAA 4DSFA 4PL7A 3V9XA 1JKHA 3GOIA 4A5AA 3OTOK 4CZIA 1S1XA 3QFUA 3GE1A 1JL2A 3ZETB 3PV8A 4ISGA 1HNZK 5KQ8A 5FROA 3M1FA 3MCAB 1GOAA 3VF2A 4IEIA 4KH6A 4WCEL 4YOTA 3EKSA 4DU1A 1JLBA 1Q8IA 5C12A 3I55N 1ZBLA 2G8UA 2IVOA 4FJ9A 4Q5VA 4JLHA 3THXB 3UKRA 3TTCA 3OYHA 1NGBA 4DFJA 4CEZA 3DI6A 3E9OA 4BRAA 1KVCA 1QVFM 4FJLA 3S3MA 2FBXA 5F0XA 2F9WA 3SAHA 4CF0A 4OJRA 4DV7K 4DQSA 3K5NA 4HHTA 3H3OB 3SI6A 2GWKA 5M1KA 3ZETA 2ZJQL 2E5LK 1HLUA 3DJCA 2XO7A 3U9ZA 1EX4A 4E1JA 1ZBFA 2HNYA 3E9LA 4B9UA 1TGOA 1P90A 3NF7A 3B6OA 2XRIA 5T7BA 4BE1A 3KLFA 1H1VA 3K59A 4OGEA 3QNOA 3THXA 3IG1A 1MA9B 3VEOA 3AVJA 4EHUA 4B9QA 1IBMK 3V1QA 4DS4A 2D0PA 3IFRA 3KLHA 4B1XB 3SUOA 3NCIA 2YHAA 3Q7BA 3CMAN 3WXMB 4DR1K 3KKSA 4FJIA 3KLGA 4B1WB 3HL8A 2YCHA 4KI6A 3CERA 3VN5A 3LWLA 1GOCA 5FPEA 5EU7A 1YXQA 4HTLA 4FWNA 3VEVA 3MK6A 1RTHA 3THYB 4H0OA 1NK9A 4JKEA 5GINA 3L4IA 4JD2B 1HQEA 4DB3A 1BCOA 4CHPA 1X9SA 2Q0RA 5J2PA 3H6EA 5FPDA 2O4IA 3P31A 2YKNA 3DLGA 3SQ4A 1Q81O 3S3NA 4BRDA 2KZZA 2H3GX 1HNVA 4A2AA 2QWRA 1Q9YA 2YHYA 2IOCA 3CCJN 3NH1A 3CCEN 3G4SN 3HPHA 4BREA 2O8FB 2ETJA 5B8HA 3THYA 2OA8A 4LFAK 4DWIA 3K9KA 4BC3A 4FYDA 1WBBA 5IT9O 4JD2A 1HJOA 3W3DA 1NGEA 1RT4A 4DQRA 4CECA 4YORA 1HYVA 3T19A 4DV5K 2BTFA 1HYSA 1BQNA 4CI6A 4FWMA 4FM1A 1XMOK 3A8YA 4FVUA 4KFBA 3CCQN 2VYPA 4FZXC 4DSJA 2HNDA 4E7LA 4MO5A 3SCXA 3BZCA 3M3ZA 2ITMA 2VWKA 4B1ZA 3KWIA 3QEPA 3KJVA 5TKWA 4KO0A 3HOTA 3GBTA 1CXUA 1ATNA 4B1VA 4BR9A 3ENOA 1KRPA 4E1NA 1K6YA 4JS4A 4N76A 3LP3A 4N47A 1S3XA 3DYAA 2O8FA 3VEXA 4L8RB 2DY4A 4B9VA 4I2PA 1BI4B 2HHHK 1BL3A 4HUGA 2CGLA 2E1YA 3MWPA 5SZTA 4FJXA 4ILJA 3H08A 4J2EA 3DLEA 4IEEA 4JS5A 3ZSZA 1KVAA 2WFBA 4H4MA 4BDPA 1TKZA 3CJAA 1MU2A 1Q7YO 5E41A 3K0SA 4CJFA 3CJ9A 2QWPA 4Y1DA 3AVNA 2Q97A 2UXCK 4JI6K 1RT1A 4G1QA 4GVMA 4BRPA 2B5JA 4GW6A 1RDBA 1Y97A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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