3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
5BREA 3WXKA 2H3GX 2P9SA 3AAPA 3GOIA 3QFPA 3C7NA 4K43A 1SQKA 1ZBSA 1TUYA 2PAVA 3HI0A 4WYBA 3A0IX 4FWPA 3VERA 3FZHA 4BRQA 2Q2RA 3KZBA 1E4GT 4MO4A 4WQ5A 5ELZA 5AFUH 4YDUA 5TKYA 4BR4A 4BREA 2VCPA 5JMVA 2P9KA 3U4LA 2BUPA 1HX1A 1ZC6A 2Q97A 1XC3A 3ZEUA 4BRDA 1X9JA 2BTFA 2ZGZA 4CZHA 5BPMA 1HLUA 3VPZA 5EY4A 5F0XA 2YHYA 5F1XA 4O5FA 4PKIA 4B1VA 3FLCO 4BQZA 2FF3B 3BP8A 3JXUA 5ADXH 3EZWA 3U9DA 3WEEB 5AQQA 4BR2A 2P9UA 3W0LA 1WUAA 3B8AX 4PL8A 4FSVA 4B1YB 1YUWA 4CZJA 1NWKA 1J6ZA 4WQ5C 3LDOA 4YDUC 4CD1A 4AM7A 4I6MB 2V7ZA 4IJAA 4BG9A 2WUSA 1NMDA 4EHTA 3JS6A 4H0YB 2A6AA 2P9NB 3VEWA 4CBWA 4EFHA 5AQXA 3UE5A 3VESA 3CQYA 4FWOA 4FPBA 4BR5A 2CH6A 1KXPA 1U2VA 3AY9A 3FZMA 1NGFA 3O5BA 3D2FB 3HTVA 2QM1A 2QWQA 3J8AA 3O08A 4CBUA 4FWMA 2F9WA 1KAYA 3GG4A 4DQ8A 2A42A 2FSNA 3EO3A 1NGDA 5AR0A 4CZKA 3MK6A 2E88A 2KHOA 4FWSA 3VGKA 4H0TB 1SZ2A 3DAWA 3RSEB 1V4SA 1C0FA 3VEVA 2QWRA 3H3NO 3WQUA 5JLHA 3W3DA 1G99A 2P9SB 2CGKA 4QS8A 3SK3A 3C7NB 1BU6O 2YHWA 3VEZA 3FFKB 4CI6A 3EL2A 5EOYA 3R6MA 3O80A 4BC4A 5BPNA 4FL9A 1QZ6A 4H0VB 3H1VX 1RGIA 2I7NA 4BROA 4NO7A 4F9OA 3CETA 4B1UB 1S3XA 3FR0A 3H45C 2IVOA 5E26A 2FSKA 4FWKA 5AQMA 3SLCA 2P9KB 2A5XA 4IJNA 4BRCA 2QWOA 3ZEUB 1MWKA 4XEIA 5AQYA 5AZIA 3SMPA 4BRLA 3P4IA 1IG8A 2E20A 3QICA 1DEJA 3ATUA 2GEMA 3WUHA 3QB0A 1GLLO 3HZ6A 3A8YA 1WOQA 2D0OA 4LC9B 3I33A 1HJOA 3QBXA 2P9UB 1P8ZA 1NLVA 1EQYA 4BC2A 2E2OA 2YHXA 3A5NC 3VEYA 5AQTA 4ISFA 5AZJA 4WQ4A 3FGUA 1Q18A 3M6GA 3ZETA 4O8KA 5AQWA 1U6ZA 2DPNA 5BN8A 1DKGD 2GUPA 3VF6A 4Z94A 3CJ7A 4H5TA 3ZX0A 1NGAA 1BUPA 2Q36A 5AQFA 1YXQA 3AARA 2J4RA 3ATVA 3TU5A 5KPZA 3HM8A 1KAXA 3H6EA 5AQSA 1U2VB 2Q0UA 1JCFA 1C0GA 4M63C 1JCEA 2D4WA 1KAZA 4HWIA 4BRAA 5AQHA 3VGLA 3CJCA 4A61A 4CZEA 3QBWA 4FWRA 4WQ4C 2CGJA 4QS7A 1HPMA 2QW9A 2FXUA 3U9ZA 1V4TA 4BR7A 2V51B 3MN9A 4CD3A 1X3NA 2A41A 1TUUA 5FPNA 2ZF5O 1NM1A 3CI5A 3GL1A 4BRNA 4C23A 5E84A 3A5MC 3M3ZA 4FWQA 5AQPA 4DB3A 1GLFO 2NRHA 1X3MA 3D2EA 1NGGA 1Y64A 3AAQA 4HTLA 1HKCA 3ULEA 5BRHA 1SAZA 4J8FA 4H5RA 5AQGA 1GLJO 4K25A 3O4WA 2AP1A 4RWTA 2GTDA 3LDPA 4M7YA 2D0PA 1OKJA 4BRPA 3L4IA 1RDWX 2EWSA 4H0OA 3S41A 2UYTA 4CZGA 3L6QA 2F9TA 1ESVA 4CZIA 4FPAA 2FF6A 4L3QA 1GLEG 3SJHA 1MDUB 3H46O 5AZIB 3MCPA 1BA1A 5EXWA 3FZFA 1NGCA 1E4FT 3QMLA 2ASOA 5EVZA 5BR9A 3CQXA 1ZXOA 5JLFA 3IDHA 4M7XA 3KHYA 4FWLA 5I9EB 3IMXA 3FZLA 4BRKA 3U8XA 2CH5A 3LDNA 3GDQA 5AZJB 4BRHA 4H0XB 3CJ1A 3IFRA 4H5WA 3R8EA 4GNIA 3ZETB 2GWJA 1QZ5A 2I7PA 2CGLA 2E2NA 2QXLA 4EAHD 2YJFA 4JHDA 3F9MA 4A2BA 2PBDA 3LM9A 1T6DA 4E1JA 2P9PA 3UB5A 4CJ7A 1GLDG 4H0PA 3C0BA 4BRIA 5LJWA 3DXMA 3HSCA 2QWPA 3O8MA 2GWKA 1DGKN 1BDGA 2ASPA 4AM6A 1NGBA 4KBOA 1TYQA 2E1ZA 4QS9A 2P9LA 1MWMA 4MLHA 2VWBA 3LL3A 3FE1A 4Y0WA 1HKGA 4H03B 4K42A 4CZLA 1GLAG 1JCGA 3H1QA 3D2EB 3HBTA 3O6WA 4B1ZA 5CE3A 4RCHA 3BF3A 4GY2B 3ULEB 3VGMA 4JD2A 5BPLA 2YCHA 3SMSA 3ZX3A 4B1WB 1QHAA 2P9IA 3UKUA 4DHYA 3ENHA 3DXKA 1BA0A 2V52B 2YJEA 3WT0A 2FLOA 3VEOA 2E8AA 2QWMA 5AQUA 5AQKA 3MN5A 4BGBA 2E2PA 1BOTO 3IUCA 3VEXA 1ATSA 1HUXA 2IVPA 1S22A 1IJJA 2FSJA 4BRMA 1ATNA 3WXIA 5KQ8A 5AQIA 4NB4A 4BR9A 3H3OB 3L0QA 3CJBA 5AQRA 1K8KA 3R9PA 4FOIA 1LCUA 3CERA 1YVNA 3EKSA 3MN7A 3WQTA 1H1VA 4JN4A 5FPMA 4MO5A 1D4XA 1T44A 2E1YA 3UKRA 4BVOA 4JHDB 3LDQA 2P9PB 1R59O 4MLEA 4BRFA 2HOEA 2W41A 5F2RA 5JICA 2HF3A 3DXMB 3VENA 4EIAA 5AQVA 4ISGA 3CIPA 5EX5A 4PKGA 3KVGA 1GLCG 1GLBG 1T6CA 2ZGYA 5AQZA 4B9QA 1QQMA 4PKHA 4A2AA 4IWVA 5AQOA 3WXLA 2ZWHA 2IIRA 4CZFA 1RFQA 1NBWA 3G25A 3BUZB 5KPTA 4DCHA 5LY3A 1Z05A 2QWLA 1TYQB 2YI1A 3M1FA 2P9LB 3CJ9A 4BRGA 4XH4A 1BG3A 1ATRA 5BRFA 3DJCA 1QQNA 3ZX2A 5AFUA 4RTFD 2E2QA 2Q0RA 1BWFO 3VOVA 4BGAA 3FZKA 2HF4A 1NGIA 2Q31A 1NGJA 4XH1A 2QWNA 1HKBA 3O1WA 4H5VA 4JD2B 2W40A 4FWNA 4IO8A 2ITMA 4BVPA 2IVNA 3I8BA 4FOEA 4IZ9A 2NZTA 3DWLA 3GE1A 4XH5A 4EHUA 3MMVA 5FPEA 3VF2A 3QFUA 2P9IB 1QQOA 3UKUB 4BC5A 4IXCA 3DXKB 2ASMA 5ADXA 5AQNA 3EKUA 2V7YA 3D7EO 1Z6RA 2A3ZA 5LJVA 3ENOA 3ID8A 3WEEA 1BO5O 5FPDA 3O1BA 4K41A 3WXJA 2OANA 2HMPA 5AQLA 4BQLA 5KQDA 3BF1A 4H5NA 4FO0A 4I6MA 2AA4A 2GELA 2VYPA 4CZMA 3A5OC 3TPQA 5BN9A 1K8KB 3VETA 3A5LC 4A62A 2Q1NA 4JNEA 2P9NA 5AQJA 3MN6A 4BC3A 3CHWA 3LM2A 4PL7A 4ISEA 3QDKA 3OHRA 1CZAN 3UKRB 2NLXA 1NGEA 3CJAA 5BRDA 1MA9B 3D2FA 3EN9A 3BEXA 3VF4A 3MDQA 1LOTB 2A40A 4BG8A 4B1XB 1YAGA 4CBXA 1XUPO 3GBTA 4JAXA 5B8HA 2D1KA 3RSEA 1NGHA 4BR0A 3LDLA 5KPRA 1XQSC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BREA 1P90A 4CK3A 3TAGA 3VA3A 1IH7A 2VGNA 3OYKA 2FBYA 1QVGM 4CJRA 2PAVA 4JI1K 1J5OA 3IKMA 4CK1A 5M1NA 4BRQA 4CFAA 3KZBA 4MO4A 3JSMA 4BR4A 4YDUA 1U48A 1WLJA 4UQGA 5BR8K 2BANA 5DM7L 3U4LA 3RMBA 4B9TA 4FJJA 3NVKA 1K73O 2Q97A 3K9JA 3O9RA 4AHSA 2BTFA 4OKKA 2HNYA 3VPZA 3KK2A 2YHYA 2D5RA 4KHYA 4CW7B 3CD6N 4KKOA 2HHWA 1TL1A 3EZ5A 1KC8O 3QIPA 1N33K 4JKDA 2IAJA 4RW9A 1LAVA 1BIZA 4DSJA 4CZJA 3CMEN 4CD1A 4AM7A 4DTXA 3G4SN 4BG9A 3K58A 3AO3A 4EHTA 2OCEA 2QI2A 1NJYA 2P9NB 3S3OA 1QTMA 4CBWA 4EFHA 1BISA 4O0IA 3UE5A 5GAEP 3CQYA 4LF9K 4CVNE 2CH6A 4M3UA 2KTQA 1LW0A 1FJGK 1QE1A 3AY9A 2JLEA 1VK0A 3O5BA 4DQPA 2QM1A 4HUFA 1S6PA 4CBUA 2F9WA 4E7KA 4CJEA 3OYNA 2A42A 1R0AA 5AR0A 4CZKA 5CYMA 2KHOA 4ID1A 1SZ2A 3CCLN 4NLBA 1C0FA 2QWRA 4E1NA 2P5GA 2XO7A 1G99A 1B9DA 3SZ2A 4FJIA 4Z4GA 2YHWA 5AJ3K 3ZSWA 4BC4A 3O4NA 4NO7A 2UXBK 4ILGB 5CZ2A 4B1UB 1OVYA 2OA8A 1RDUA 3FR0A 5E26A 2P9KB 2A5XA 5GIOA 3ZEUB 1K8AO 1KTQA 5AZIA 4BRLA 3SUQA 4K8ZA 2ITGA 3HZ6A 3A8YA 4FJNA 1G15A 2D0OA 1ZBIA 2DTUA 4JKBA 4JRQA 3L2QA 1VSIA 1P8ZA 3I55N 2QA4N 5AQTA 3M6GA 4NCAA 3V1RA 2PY5A 1NK5A 2DPNA 1DKGD 1K6YA 2GUPA 4Z94A 3ZCMA 2W00A 4H5TA 3ZSQA 5AQFA 5FRMA 3AARA 4JKHA 4C1NK 1KVAA 2J4RA 1X9SA 1EP4A 3KK1A 4DQSA 1KAXA 2HBMA 2HBJA 2KFNA 2DFEA 3OYMA 3VQAA 1C0GA 2ZJQL 3L8BA 1B92A 5AQHA 1NMNA 3QBWA 4CIFA 2VGMA 3ENBA 1W0HA 4F3TA 3AVKA 4OPAA 2FXUA 3U9ZA 2V51B 5C15A 4U7BA 1X3NA 2ZF5O 3CI5A 3GL1A 4NCBA 1HYSA 5E84A 3L2RA 3CM6A 3A5MC 3M3ZA 1SUQA 4DB3A 3QEPA 3OS2A 4BE1A 1O13A 1NGGA 3J80O 4ID5A 5H1SQ 4KH5A 1GLJO 3NF6A 4CJLA 4E7JA 4IFYA 3L2UA 2Z1IA 4BRPA 1WBDA 4OGCA 4H0OA 3S41A 2UYTA 3L6QA 3K59A 1CLQA 1ESVA 4O55A 4FPAA 3SJHA 1GLEG 4KB1A 4W5QA 3PUFA 3CCMN 1BA1A 2YX6A 4OPHA 4EP4A 2QKBA 5EVZA 5BR9A 3OS1A 3V6DA 1ZXOA 3IDHA 4M7XA 1HQEA 3IMXA 3FZLA 3U8XA 4I9QA 3JAMO 1NJIO 4ELVA 3GDQA 4JKGB 3R8EA 2W6LA 4CERA 3ZETB 1QZ5A 2I7PA 1ITGA 4CJFA 4EAHD 2YJFA 1HNZK 4JHDA 1BCOA 4CEBA 1VRTA 1XNRK 3C0BA 4BRIA 3KIOA 4CHOA 4FM1A 2QXFA 3VA0A 3H08A 4DR7K 3CYMA 4PQUA 2QWPA 3CCEN 1T05A 1W2BM 4WF9L 1UOCA 4CEFA 1NGBA 4IG3A 4QS9A 4I2QA 4DFMA 2P9LA 1MWMA 3T3FA 1YIJN 2Y1IA 2DFHA 3DM2A 1TL3A 3FE1A 3SUNA 3F5TA 3HVTA 5MLCQ 3DLRA 4K42A 4F2SA 3NBPA 3O6WA 4CJWA 5CE3A 3BF3A 4GY2B 3LP2A 2OZSA 2OPPA 1RTHA 1BI4A 4FK0A 4B1WB 4A5AA 1DTTA 1BCMA 1BA0A 1K9MO 2OZMA 4LF6K 1KCFA 1J53A 3NH2A 1S1VA 3TAPA 2C1GA 1YT3A 1YF5L 3VEOA 2E8AA 4HHTA 4OO1J 4N5SA 1FKOA 1YITN 1XHZA 2ZJPL 3CF5L 1ASUA 3TI0A 3UIQA 2IVPA 4DUZK 3QEIA 3OBWA 3E9PA 4BRMA 4R5PA 4KRFA 4CJSA 3SCXA 1K8KA 5CY4A 3CERA 4AILC 4GKJK 3EKSA 3MX2A 1LWFA 4JN4A 1M90O 2O8BA 1D4XA 1T44A 4BVOA 3ULDA 1N8RO 3LP0A 2P9PB 4LFAK 4BRFA 5JICA 2HF3A 3OYFA 3DXMB 4DS5A 4B3MK 3CIPA 1KFSA 4PKGA 3KVGA 3KKSA 1GLCG 5AQZA 3K0SA 1Q82O 2HHIA 2O8FA 1QQMA 3BY5A 2ZWHA 1HYVA 3C65A 4QCLA 3NH1A 3G25A 2IS3A 2EHGA 4DCHA 1UA0A 1ZBLA 3OYJA 1TYQB 4DFKA 5C25A 4FK2A 3CJ9A 3MECA 1QSSA 2P5OA 3O9QA 4KHPK 1RBVA 1CXQA 4OVLA 3ZX2A 1NK0A 5AFUA 3O3GA 4RTFD 4DMNA 5KRTA 5KGWA 4LF7K 3FZKA 3I0RA 1Q86O 1NGIA 2NRZA 4EP5A 2JGUA 1VSKA 4MDBA 4XH1A 2QWNA 5J2NA 3DMJA 3O1WA 3HXMA 2W40A 4FWNA 3I0SA 2IVNA 4EHUA 4IZ9A 4LH4A 3RMAA 3VF2A 2W6KA 4BC5A 2P9IB 1QQOA 3UKUB 3NHGA 2HBKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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