3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
2QWRA 3TU5A 2ZWHA 2J4RA 5AQFA 2P9KB 2P9NA 4BVOA 3VF2A 3IUCA 3LL3A 1HKCA 3TPQA 1J6ZA 3QFUA 3I33A 3VEYA 1K8KB 1GLCG 4BRMA 4BGAA 5AQSA 5KPTA 1SQKA 2HF3A 4BRDA 2OANA 4QS9A 4EAHD 4B1VA 1Q18A 4O5FA 1T44A 4MLEA 1ZC6A 3LM9A 4WQ4C 3LDNA 2FXUA 3L4IA 5BREA 5CE3A 3DXMA 1QQMA 2QWPA 3SK3A 2QWOA 3DWLA 2V7YA 1RFQA 3AY9A 3UKUA 1T6DA 4BGBA 2P9SA 3GOIA 4CBWA 4WQ4A 1MDUB 3A5NC 3O5BA 1GLBG 1NGAA 4BR5A 3O80A 3CJ1A 1NBWA 1YVNA 3WT0A 2CH6A 4C23A 3ATUA 3ZETA 5BN8A 5AQWA 3UB5A 1R59O 2YJEA 1NGCA 2GWKA 2Q1NA 3O6WA 3CJ9A 4CZIA 2FSJA 3ZEUA 5BRHA 5AQVA 5B8HA 4RCHA 1MA9B 1ZXOA 3WEEB 2F9TA 2QM1A 2ASMA 4BRNA 3BEXA 4B1ZA 5AQTA 3CQXA 1KXPA 4BG8A 2V52B 5AR0A 2YHXA 3W3DA 2Q2RA 4M7XA 3SJHA 4QS7A 3H6EA 3MDQA 3D7EO 4H5RA 4AM7A 5AQZA 1E4GT 3GG4A 2NRHA 1LOTB 5AQOA 2QW9A 4CZLA 4CZEA 2V51B 4ISEA 5JLFA 1D4XA 3ENHA 4CZJA 3VEXA 4BRHA 4DCHA 2A42A 5FPDA 3QDKA 2Q0RA 4FWPA 4A2BA 3CJ7A 4XH5A 5BRDA 1HX1A 4RTFD 3MCPA 3JS6A 3A5MC 3LDOA 2QXLA 2KHOA 5KPZA 5AQJA 3VENA 1NGFA 4H5VA 3FZLA 4NO7A 4BRIA 3MN7A 5BRFA 1TYQB 1C0GA 2P9IB 4BRPA 4A61A 2P9LA 5AQPA 3WEEA 4K25A 4B9QA 2FLOA 3LDPA 1MWKA 4BR7A 3J8AA 2CGLA 5ADXH 3GL1A 1XQSC 2W40A 1DGKN 3CQYA 2P9PB 3VEZA 1V4TA 2E1ZA 3H1VX 4XEIA 4FWLA 1ATRA 1NGEA 1QZ5A 2VWBA 1JCGA 3VETA 2IVPA 3BUZB 3HTVA 4I6MB 4H5WA 1SAZA 2BTFA 1HLUA 3RSEB 3VGLA 1EQYA 1GLLO 1MWMA 3MN5A 4BRFA 4FSVA 3UKUB 2E88A 1GLFO 3FZKA 3EZWA 4KBOA 4BROA 3D2FB 3GE1A 2Q0UA 2QWQA 5BPNA 4FO0A 5LY3A 2QWNA 5E84A 1X3NA 2UYTA 3H3OB 1SZ2A 1XUPO 4BC5A 4IO8A 5BPLA 4BC3A 3VESA 4XH1A 1S22A 4RWTA 4BRKA 3BF3A 2CGKA 4K43A 2NZTA 4EHTA 3H1QA 1NLVA 5ADXA 4PL7A 4DHYA 2GELA 2D1KA 3EKSA 3CJAA 2H3GX 3ZETB 3SMSA 3FZHA 2EWSA 3ENOA 3ZEUB 2CH5A 4BVPA 5F1XA 1V4SA 3VPZA 4BQZA 1Z05A 4HTLA 4WYBA 3VGMA 1BO5O 3G25A 4F9OA 3GBTA 1QQNA 1RDWX 5AZIB 2P9LB 3CETA 2HOEA 3ZX0A 1JCEA 1ESVA 5EVZA 1JCFA 3MN9A 1ATSA 5AQXA 1BG3A 2IIRA 4JAXA 3S41A 1NWKA 3P4IA 5AQIA 3ZX3A 4B1XB 4JNEA 2YHYA 2HF4A 4CZFA 4ISFA 3ULEB 3U8XA 3VF6A 3U9ZA 4BR9A 3C7NA 1QHAA 2QWLA 3H3NO 4CD1A 5KQDA 2PAVA 2DPNA 3HBTA 2E8AA 3KHYA 4PL8A 3F9MA 5LJWA 4EFHA 3VGKA 2ZGZA 3L6QA 1WUAA 4CZKA 2FSKA 1LCUA 2VCPA 2YJFA 3EO3A 3FLCO 3A0IX 4IWVA 4JD2B 3HM8A 4BRQA 3QICA 4DQ8A 4EHUA 5TKYA 1YXQA 1TYQA 1NGBA 2ASOA 1BA1A 4FWQA 5EOYA 3KZBA 5AZJB 3M6GA 3HSCA 3A5LC 5ELZA 1Z6RA 3ATVA 1X3MA 5AZIA 2E1YA 1BDGA 4IJNA 1HJOA 3DAWA 1GLAG 5AQHA 4FOIA 2ITMA 4B1WB 1U2VA 4BR0A 4FWSA 1U2VB 4FWMA 2A3ZA 2ZF5O 1YUWA 3C7NB 4A62A 1QZ6A 3VEVA 1GLJO 3EL2A 2A5XA 4IZ9A 2W41A 3MMVA 1YAGA 2P9UA 3B8AX 3LDLA 1P8ZA 1HUXA 5BPMA 4NB4A 2IVNA 1BWFO 2F9WA 2VYPA 4GY2B 4HWIA 1DKGD 4JN4A 4WQ5C 1T6CA 3QB0A 2D4WA 1NM1A 4IJAA 3O4WA 1NMDA 2E20A 4YDUA 4O8KA 2ZGYA 3RSEA 1NGDA 5F2RA 3BP8A 4ISGA 2FSNA 5AQLA 4BR4A 4GNIA 1CZAN 5KQ8A 1IG8A 4BREA 3LM2A 3CIPA 5AQRA 4M7YA 5AQYA 3AARA 4MLHA 4B1UB 3L0QA 3O08A 3OHRA 4CD3A 3EN9A 4BG9A 5KPRA 3SMPA 4FPAA 2GUPA 3I8BA 2AP1A 2I7NA 1NGJA 4CJ7A 4LC9B 1KAXA 2E2OA 4PKHA 1XC3A 3H45C 3H46O 4PKGA 3WQTA 5AQMA 4H0VB 3O1BA 3CI5A 1TUYA 4Z94A 1KAYA 3BF1A 1KAZA 2P9PA 2YCHA 5BN9A 5JMVA 2E2QA 4K42A 4DB3A 1BU6O 3FE1A 4M63C 3CHWA 1NGGA 4FWOA 4BRAA 3IDHA 2Q97A 3D2FA 1ATNA 3DXMB 2P9UB 3MN6A 1BUPA 3WUHA 5FPMA 4BRGA 3GDQA 3KVGA 3IFRA 4FOEA 2P9SB 3DXKB 3ID8A 1GLEG 2I7PA 5AQUA 5AQNA 4BC4A 3UE5A 3WXKA 3AAPA 4Y0WA 5AFUA 4JHDA 4FL9A 4JHDB 4JD2A 3M1FA 1WOQA 3VOVA 2BUPA 3O8MA 1Y64A 5EY4A 1S3XA 3VEOA 2P9NB 2D0PA 3FZFA 2P9IA 3FZMA 4B1YB 4H0YB 3WXIA 2A40A 1OKJA 5FPNA 2Q31A 4MO5A 2A6AA 1RGIA 3QBXA 4H0PA 4BC2A 4AM6A 3DJCA 4FWKA 2YHWA 5I9EB 4I6MA 3HI0A 5E26A 1QQOA 2E2PA 2GWJA 5AQQA 4H5NA 3WQUA 1DEJA 5EXWA 4H0OA 5AFUH 4EIAA 4CZMA 4BRCA 2NLXA 4BQLA 2FF3B 2QWMA 3FFKB 1C0FA 2HMPA 2IVOA 3VEWA 3UKRA 3VF4A 3IMXA 2YI1A 4A2AA 5BR9A 3CERA 4CZHA 4CBXA 4QS8A 2A41A 4L3QA 2E2NA 3FR0A 1E4FT 3M3ZA 2WUSA 4H0TB 3VERA 4FWRA 4YDUC 3R6MA 4FWNA 3D2EB 3QMLA 4FPBA 1U6ZA 2D0OA 4BR2A 3D2EA 1HKGA 4CI6A 1K8KA 5AZJA 1NGIA 4XH4A 3U9DA 5JLHA 3QFPA 2V7ZA 3A5OC 3R9PA 2P9KA 3JXUA 1G99A 2FF6A 4MO4A 3W0LA 4E1JA 2CGJA 3AAQA 1GLDG 1X9JA 5JICA 4H0XB 3A8YA 3DXKA 2GTDA 3SLCA 1IJJA 1NGHA 4PKIA 3HZ6A 5AQGA 3C0BA 5F0XA 3LDQA 2GEMA 4H5TA 4K41A 1BA0A 5EX5A 3ULEA 3MK6A 3UKRB 2PBDA 5FPEA 4CZGA 4BRLA 1TUUA 4CBUA 3CJBA 2AA4A 3FGUA 3QBWA 4WQ5A 3WXJA 5AQKA 5LJVA 1HKBA 3ZX2A 3WXLA 1H1VA 3U4LA 1BOTO 4H03B 2ASPA 3CJCA 1ZBSA 1HPMA 3EKUA 2Q36A 4IXCA 4J8FA 3R8EA 3O1WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OGCA 3TU5A 2J4RA 4FJIA 2G8KA 4GKJK 4DTJA 4DR7K 5HRNA 2PYJA 3VF2A 3IUCA 1HKCA 3LDSA 3VEYA 4IOAL 4F2RA 3C6TA 4BRDA 2VQEK 2F8TA 4FK2A 4B3RK 3ZSXA 4DR4K 5E41A 4B1VA 3QIOA 1RBTA 4A59A 1T44A 4C8NA 1ZC6A 3DYAA 2PFUA 5M1QA 5CE3A 1KRPA 2RPIA 2QWOA 1TK5A 1ITGA 3DWLA 4E19A 1T6DA 2NRZA 4LSLA 4CBWA 5I3UA 3AO3A 1RBVA 4BR5A 4IG3A 3WT0A 5JS2A 1TL3A 1Q81O 3QNNA 3D45A 3RWUA 3V1OA 3OYIA 4F8RA 3CJ9A 4CZIA 4CE9A 2OZSA 3CD6N 4CW7B 2W00A 4IBNA 3BEXA 2BGGA 3QESA 4Y1DA 1BCMA 3LALA 2B6AA 1KLMA 4B1ZA 5AQTA 3NGIA 1KFDA 3CQXA 3G4SN 3I0RA 4DR6K 2DY4A 4BG8A 3P1GA 1YITN 3TSUA 1DTTA 2EX3A 3DLKA 4NLBA 4CERA 1KC8O 4QS7A 3D7EO 4W5QA 1E4GT 3AVJA 3OS0A 4E72A 4CZEA 4F2SA 1QE1A 2ITGA 3ENHA 3VEXA 4BACA 4YFUA 4A2BA 2ZD1A 5BRDA 4B8CA 2E5LK 3T7ZA 4I2QA 3A5MC 1DLOA 4DFKA 3E1YA 3I8DA 2P1JA 5KPZA 5M1FA 2C1IA 5GAGP 4NO7A 2ZJPL 4DFMA 3NVKA 1TYQB 3E9OA 4DQPA 4JV5K 1MWKA 5C42A 4CF2A 3J8AA 2CGLA 3AVHA 3NH1A 3GL1A 3NF8A 5CYQA 3PX0A 1XQSC 1ILYA 2W40A 1DGKN 2P9PB 3DLLL 1NOYA 4GV6A 3TABA 3WNEA 4KTQA 1RT1A 4FWLA 1ATRA 3KLFA 4N56A 3VETA 4KHSA 3J7AP 4I6MB 4JKFA 3RSEB 1GLLO 2QTDA 3MN5A 5FROA 4PUOA 2E88A 3SPZA 4CJ5A 3GE1A 2Q0UA 2B4JA 4TSXA 3O3HA 1FW6A 3H3OB 4BC5A 1XUPO 1S72N 1REVA 1GOCA 3VESA 4FJJA 1HRHA 1NLVA 1TKZA 4FZYA 2D1KA 3HP6A 3PO5A 1EP4A 3CG7A 4FLUA 3ZT1A 3V81A 1RNHA 4Z4IA 2EWSA 3ENOA 3ZEUB 1C1BA 1VQON 3SZ2A 1V4SA 1ASWA 1Z05A 4HTLA 4WYBA 3ZSQA 4F9OA 4W5RA 3GBTA 5M1OA 1SL1A 4JI5K 1SL2A 3C6HA 3NE6A 4IOXA 1W7AA 4JI8K 2O8EB 5AQXA 1BG3A 1WB9A 4YORA 4DTMA 1WAFA 2D5RA 5GIPA 2NRRA 3NGYA 4J2DA 3TI0A 1NJWA 3U9ZA 2RHKA 3T1YK 1QHAA 3H3NO 1RDAA 2DPNA 4E1MA 4DQRA 2GBZA 3KHYA 1QSSA 4FYDA 4JEPA 2P5OA 3CYGA 3THWB 1HYVA 4DQ8A 3CMAN 4IKFA 1YXQA 1VSJA 1HQEA 4ZHRA 1YTUA 1EKEA 3KZBA 4FJ9A 1JL1A 3M6GA 4OLAA 3HSCA 4CEOA 4WCEL 1J5EK 1WLJA 3LWMA 1X3MA 5AZIA 2R7YA 4DR1K 1XMOK 3DAWA 2QKKA 5AQHA 4FOIA 4B1WB 3SYZA 3MXMA 4DLEA 1C0UA 2ZF5O 3KTQA 4A62A 1YJNN 3MX5A 4KB1A 5C25A 4B3TK 4NB4A 1L3TA 2F9WA 5KRTA 1K8AO 3HYFA 2XY5A 5SWMA 3QB0A 4YDUA 2QI2A 3CM5A 4E7IA 1NGDA 5F2RA 4Y1CA 2FSNA 2NNWA 1W0HA 5KQ8A 4BREA 3SJJA 4KAZA 1LAVA 4NXNK 4B1UB 3VQ4A 4CJQA 4LY7A 4CD3A 3OJSA 4BG9A 4B3MK 3SMPA 4AHCA 1QVGM 4FPAA 3KKRA 2GUPA 3I8BA 4JI4K 1BIUA 1NGJA 5M1KA 1KAXA 1MU2A 3H45C 1QQCA 2NRTA 4DMNA 4H0VB 3SNNA 4CK1A 2ZQBA 1A5VA 1KAYA 3BF1A 2P9PA 4YNQA 5C10A 2IS3A 4R79A 3FE1A 1RDBA 3CHWA 4BRAA 3ZSWA 1QSYA 1UWBA 4AH9A 3MN6A 4DLGA 3WUHA 3C6UA 4Q5VA 4ICLA 3NCIA 1YJWN 1KFSA 3L2RA 2JLEA 3CC4N 4ZTJA 1RT4A 3ID8A 3Q7BA 3DRSA 5AQUA 2OPPA 2KKZA 3UE5A 1XI1A 4JI3K 2KZZA 4BWJA 3V9XA 3QEXA 4ILGB 3LPTA 3OS1A 2BUPA 1NJXA 3BZCA 3O8MA 3CYMA 2WTUA 1IH7A 2YHAA 1WSFA 5EY4A 1NNEA 4KHPK 1S3XA 2P9NB 4K8XA 1HNWK 2FC0A 1LAWA 3VQEA 3FZMA 3DLEA 4J2EA 2A40A 4A5BA 5FPNA 3QEWA 2NRWA 4H0PA 5DM7L 2HVHA 4BC2A 4B8AB 3DJCA 4JK8A 4Z4GA 5HOOA 1LV5A 4O55A 3AA2A 4JKAA 3QEIA 1IO2A 3LP2A 4JYAK 3NMUA 3J7ZO 4DF8A 4H0OA 3G10A 4M45A 4RW9A 4BRCA 1B9DA 4J2BA 1C0FA 3MCAB 1UA1A 4AHRA 1QVFM 3HL8A 3AVBA 4AF1A 4PWDA 4KHQA 4CZHA 2A41A 2E2NA 4GVMA 3KLEA 1K9MO 3RRGA 3NVMA 3AVAA 2I5JA 4FWNA 1N6QA 4FJNA 3QMLA 4O5BA 4BR2A 4C8KA 4ELUA 4CI6A 4FK4A 4CECA 4LF6K 5JLHA 3ZT4A 4M3YA 3ZCMA 3JXUA 4E1JA 4JKCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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