3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
5AZIB 1OKJA 4RWTA 3HM8A 3VEVA 3SJHA 2P9PA 5TKYA 4B1YB 1XUPO 3O6WA 1YUWA 4BG8A 1D4XA 3QBWA 5BR9A 3VGKA 5BRFA 2ASOA 3S41A 4MLHA 3UKRA 3ENOA 3ZETB 4BRIA 5AQVA 4M63C 3TPQA 1GLJO 2PAVA 4H0XB 2E2PA 5B8HA 2P9LA 3D2EB 4FOEA 5AQNA 2P9SB 4BC2A 2AP1A 1Y64A 2I7PA 1Z6RA 1QZ5A 3VEWA 4BRPA 2V7YA 3DJCA 2E1YA 3IMXA 4IXCA 3VETA 1T6DA 2I7NA 2ZWHA 2H3GX 2ASPA 3O5BA 4MO5A 4CD1A 4H5RA 5KPTA 4CZGA 4FPAA 5BRHA 4F9OA 4C23A 4EFHA 4O5FA 2BTFA 3LDLA 2P9KB 4H0TB 3ZX0A 4IJAA 4CZEA 5I9EB 4IO8A 1YAGA 4CD3A 3CHWA 3WXLA 2V52B 1H1VA 4BRAA 3CJ9A 5JLHA 4QS7A 4EAHD 2E8AA 1HUXA 3I8BA 3O8MA 3M1FA 4FWOA 3WQUA 2IIRA 3BUZB 1RDWX 3MN5A 5LJVA 2NRHA 3U9ZA 2Q36A 4BGAA 3H46O 4IJNA 3LDQA 3O4WA 4CBUA 2FF6A 1TYQB 2E2QA 4Y0WA 3WQTA 1BO5O 5JICA 3VENA 4A61A 2ITMA 4FWRA 4H0VB 1V4TA 3BF3A 4JHDB 3VOVA 1HKBA 5EXWA 4BG9A 4FWMA 4JAXA 3QBXA 4J8FA 1GLFO 3CQYA 4FOIA 3I33A 5JLFA 3CJBA 4ISGA 4AM7A 1T6CA 4JD2B 2A42A 5EOYA 2P9PB 4H5WA 1HKGA 3LL3A 1NMDA 2DPNA 2QWNA 4H03B 4O8KA 5FPMA 3UKRB 1NGCA 2QWQA 3A5NC 4RCHA 3FZHA 4DHYA 3FZKA 1QQOA 4BRNA 4PKHA 3QDKA 3U8XA 5AR0A 4BR4A 4M7XA 2V7ZA 4BROA 4BGBA 3LDPA 4B9QA 1X3NA 5BN8A 2QWPA 2GWKA 2FSNA 2D0OA 4HTLA 3WXIA 1GLLO 1U6ZA 1MA9B 3R8EA 4PKIA 3M6GA 4YDUA 1TUUA 3RSEA 4EHUA 5AQUA 4BR7A 2P9IA 1R59O 2F9TA 4PL8A 1GLEG 1BOTO 3LM9A 3WXJA 4CZMA 2W40A 1YXQA 3EL2A 3F9MA 3AAQA 1BWFO 1G99A 3VF6A 3LM2A 5F1XA 1SZ2A 3D7EO 2ZF5O 3IUCA 5AQJA 4DB3A 3BEXA 4WQ5C 4K42A 3G25A 5BN9A 1NBWA 4M7YA 4BRQA 1U2VA 1MDUB 3MDQA 4BRMA 1KAXA 5KQDA 2E1ZA 3FZMA 4FWQA 2E2OA 3DAWA 3FR0A 3CJCA 4EIAA 3HTVA 4H5NA 5E26A 1WOQA 3O1WA 4FWPA 2W41A 4I6MB 5AQTA 3EKSA 4FWKA 1GLAG 2YHWA 5BRDA 4B1ZA 3WUHA 4H0YB 3P4IA 2A41A 5KPRA 5ADXA 3EN9A 3R6MA 4BVPA 5BPLA 1BA1A 2GUPA 4DCHA 4LC9B 3D2FA 1BG3A 2CGLA 3ATVA 4BR5A 4PL7A 1EQYA 1RFQA 4AM6A 4CBWA 3VEYA 2CGJA 4BRHA 1JCGA 5LY3A 2Q1NA 1NGAA 1ATSA 2P9UB 3WEEA 3BF1A 1E4FT 4NB4A 1QQNA 4WQ4C 1NGBA 3MN6A 1ZXOA 4FWLA 3VGLA 3ID8A 4BC4A 3CI5A 1CZAN 4A2BA 1NM1A 2OANA 3U9DA 3H6EA 5AQIA 4CBXA 5BPNA 3GG4A 4JD2A 5FPEA 2ZGZA 4L3QA 2V51B 1BDGA 5JMVA 1HPMA 1T44A 2IVPA 3AAPA 3DXMA 3LDNA 4XH4A 3SMPA 1DGKN 3CQXA 3RSEB 2J4RA 1NGEA 3B8AX 1KXPA 3FZFA 2QWLA 2P9IB 4H5VA 5AQKA 3M3ZA 4CZHA 4BREA 4H0OA 5AQOA 4BQZA 3FZLA 3QMLA 4B1WB 2GEMA 4FPBA 4A2AA 3DXKB 2VCPA 1NGDA 5EVZA 3VERA 4CZJA 4FL9A 4K41A 3VF2A 1IJJA 3U4LA 1BA0A 4JNEA 4HWIA 5AFUH 3O80A 3FE1A 3H1QA 1QQMA 3TU5A 3CJ7A 1U2VB 5BREA 4H5TA 2YI1A 3SLCA 1MWMA 3UKUA 3GL1A 5AQPA 3H3OB 1TUYA 2P9LB 3SMSA 1V4SA 3C0BA 4JN4A 1P8ZA 2AA4A 3VEOA 5FPDA 5F0XA 3ULEA 1QZ6A 3A8YA 3A5LC 5AQSA 3D2FB 3VPZA 3H3NO 4DQ8A 2FSJA 1MWKA 5E84A 4BRFA 1NGIA 3HI0A 4FSVA 4IZ9A 2NLXA 3WEEB 1GLDG 1SAZA 2Q31A 3QFPA 2FXUA 1WUAA 4MLEA 2GELA 4BC5A 1Q18A 2A5XA 3KZBA 2VYPA 3KVGA 3L6QA 3KHYA 4RTFD 4BRDA 2YHXA 2WUSA 3GBTA 3VESA 4BC3A 3HZ6A 4QS8A 3MMVA 1RGIA 2QM1A 1IG8A 4XEIA 3UB5A 1QHAA 1NGGA 4FO0A 3L4IA 3A0IX 3ZEUA 3CJ1A 3SK3A 4K43A 5AZJA 3IFRA 3ZX3A 4Z94A 1LOTB 3DXMB 4BRCA 2CH6A 4E1JA 1XQSC 3GOIA 1HKCA 2FLOA 4BR2A 1DKGD 1ZC6A 1J6ZA 3CIPA 2NZTA 2HF3A 3CETA 1DEJA 1HLUA 1X3MA 3CJAA 5AQWA 1ATNA 5AQXA 3C7NA 3MN7A 4FWSA 3W0LA 2D1KA 3ZX2A 3R9PA 1KAZA 2QWMA 3HBTA 3WT0A 2E20A 3A5MC 1JCEA 5F2RA 2EWSA 3A5OC 4A62A 1KAYA 4ISFA 3QFUA 3VEZA 3LDOA 2P9NA 4WQ5A 3IDHA 3UE5A 4NO7A 5AQMA 3H1VX 3VF4A 3UKUB 1K8KA 1Z05A 2ASMA 2YCHA 5AQZA 1NGFA 3ENHA 3GDQA 2QWOA 4K25A 3W3DA 2FSKA 4B1VA 3ULEB 2D4WA 3JS6A 2HMPA 3BP8A 5EY4A 3EKUA 3QB0A 3OHRA 4QS9A 5AZIA 1NWKA 5AQYA 5AQHA 4GNIA 3JXUA 4H0PA 2E88A 3H45C 1S3XA 4ISEA 4XH1A 3CERA 2E2NA 2YHYA 3MCPA 3DWLA 2CGKA 3FFKB 2CH5A 5LJWA 1ESVA 2Q0UA 3ZETA 2QW9A 3MK6A 2YJFA 5AQFA 3O08A 1BU6O 3MN9A 2VWBA 4KBOA 1NGHA 4WQ4A 4CJ7A 3D2EA 4I6MA 3AY9A 3EO3A 4BVOA 2P9SA 3QICA 2HF4A 1NGJA 4YDUC 3J8AA 3ZEUB 5KQ8A 3VEXA 5ELZA 2IVNA 5AZJB 4CZIA 4BRGA 1HJOA 1HX1A 2BUPA 2PBDA 2QXLA 3GE1A 2ZGYA 1ATRA 2IVOA 3FLCO 4BR9A 3WXKA 2P9UA 1S22A 4WYBA 4BRLA 4CZKA 1XC3A 2D0PA 2YJEA 2P9KA 4CZLA 1C0GA 4GY2B 4BRKA 2HOEA 2UYTA 1YVNA 4PKGA 3ATUA 3C7NB 2Q97A 3O1BA 3EZWA 2A40A 4EHTA 1JCFA 1E4GT 1LCUA 4XH5A 5AQQA 3VGMA 5KPZA 3L0QA 2A6AA 1GLCG 1X9JA 5FPNA 1BUPA 5AQRA 5BPMA 2A3ZA 2KHOA 2Q0RA 1GLBG 5EX5A 3AARA 2FF3B 1ZBSA 5AQGA 1TYQA 2F9WA 2GTDA 2P9NB 4FWNA 5ADXH 4CI6A 5AQLA 4JHDA 3FGUA 4B1UB 5AFUA 1K8KB 4IWVA 1NLVA 3HSCA 4BR0A 4B1XB 4BQLA 2GWJA 4MO4A 1SQKA 2Q2RA 4CZFA 5CE3A 2QWRA 1C0FA 3DXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RWTA 4DUYK 4DWIA 3QBWA 1EETA 2HW3A 3ULDA 3D6RA 5FRNA 5BRFA 1OVQA 2ASOA 4MLHA 3S41A 3UKRA 3ZSZA 1FW6A 3ZETB 3DLBA 1KRPA 2KFZA 2PAVA 2E2PA 3ZYYX 4CJEA 1BHLA 4TSXA 5B8HA 3D2EB 3O9UA 2Z1GA 1NMNA 4CJQA 3QEIA 5LL6Z 2AP1A 1Y64A 4CGIA 3C6AA 4JI3K 4FJXA 2HBJA 3VETA 2KZZA 4OLAA 1T6DA 4I7FA 5M1KA 4B8AB 4MO5A 2E4LA 5BRHA 4F9OA 4DLEA 2DTUA 3DLLL 2P9KB 4B8CA 4CHYA 1L3UA 1VSMA 5I9EB 5JS2A 3WXLA 2V52B 4LFAK 4EAHD 3I8BA 2E5LK 1VQ9N 3WNHA 3OYAA 3BZCA 1RDCA 2UXBK 1RDWX 3O9QA 4E7JA 3U9ZA 1KFSA 3O4WA 2NRRA 1W7AA 1RBVA 2E2QA 4Y0WA 3VENA 4CJLA 1HQUA 1VSKA 4H0VB 3VOVA 4JI5K 4FWMA 3QEPA 4YOUA 3CQYA 4CFBA 1BCMA 1REVA 5M1QA 2F96A 4ISGA 4OPKA 4DTOA 1RNHA 4W5OA 4JD2B 3Q7BA 2W6LA 4CF1A 1NK7A 3O9RA 1SKWA 1HKGA 3IS9A 2YNFA 3AA3A 3MXJA 4H03B 4CEFA 3L3VA 3K5MA 5FPMA 4E89A 5E41A 4N76A 1RBSA 3QO9A 5M1NA 1C1AA 4PY5A 5AR0A 4BR4A 2VGMA 3OYDA 4CJ3A 5CY4A 4DQSA 4BROA 2OZSA 1VSIA 3THXA 4J2AA 5BN8A 4DTSA 3L2VA 4Q0BA 3E9OA 3F5TA 3IAYA 3K5OA 1U6ZA 1EWRA 4YY3K 1EKEA 3OJUA 4KHWA 3M6GA 4DSEA 4E1MA 4CHZA 1KCFA 1ASVA 5AQUA 4FW2A 5C24A 2W40A 2A1SA 3F9MA 4YOTA 3AAQA 3LM2A 4Z4CA 3OYLA 3D7EO 1JLCA 3PSFA 2ZF5O 3KIOA 5AQJA 3RRHA 4DB3A 3BEXA 4WQ5C 2XY6A 4NCAA 1XHXA 2JLEA 3G25A 2JWKA 4DTMA 1D9DA 4JI6K 4DV1K 3D0PA 3MDQA 4MQ3A 3N4PA 2W6KA 1F21A 1WSFA 4Z4HA 2E1ZA 3AVJA 3FZMA 2HHXA 3CJCA 3CFPA 5E26A 2W41A 5EU7A 4ZTFA 4FWKA 4CVNE 5BRDA 4B1ZA 3V6DA 1UA1A 4HCBA 3WUHA 4WF9L 1K9MO 4KHYA 1VK0A 4JKFA 1ITGA 3R6MA 4FJGA 5BPLA 1X9WA 1Q9XA 4LC9B 2C1GA 1X1PA 3DM2A 4BR5A 4AM6A 1EWQA 4CEOA 2P9UB 2XHBA 3T1YK 4KKOA 4KRFA 4OPJA 4FJLA 4WQ4C 4KH5A 3QLHA 2HHTA 4CHOA 1T05A 1BISA 2NRVA 3ID8A 4JK7A 4LF7K 4KI4A 2ZQBA 3U9DA 3G4SN 2Z1HA 4CBXA 1Z25A 3GG4A 5BPNA 5JVGL 4FK0A 1BDGA 4G9ZA 4I9LA 1Q8IA 1HPMA 1K6YA 3T69A 2BGGA 2IVPA 3AAPA 4XH4A 5HOOA 2ZJPL 4E0DA 2J4RA 3B8AX 3HL8A 3FZFA 2P9IB 3E01A 4CZHA 3J80O 2C1IA 4H0OA 4NLBA 5IWAK 4B1WB 2HHSA 4LFBK 4WCEL 2RN2A 5EVZA 3TANA 3WNEA 5JENA 1WSHA 1HQEA 3VF2A 1BA0A 4JNEA 5AFUH 3KLFA 3O80A 3H1QA 4IOAL 3VQQA 2YKMA 1SS6A 3OVNA 1YIJN 1NU0A 2Q3SA 1LW2A 2FC0A 4KHQA 1V4SA 4JN4A 4FJ5A 1P8ZA 3KWIA 3RMDA 4CGHA 3NF9A 4RW8A 3A5LC 1QSSA 4M3TA 2YX6A 4CFAA 4DQ8A 4E7IA 3ITHA 1IKWA 4F2SA 5E84A 1NGIA 3HI0A 4IZ9A 4DS5A 4JS4A 2HHUA 5CYQA 1WUAA 2WFBA 4FVMA 3WNFA 4IEIA 2QKBA 4YFUA 3KHYA 4DKWA 2YHXA 2WUSA 1U49A 4QS8A 1HR0K 1KQSM 4KTZA 3MMVA 5GAGP 1RGIA 2PYLA 3CD6N 4XEIA 3VQ4A 4CJKA 3L4IA 3V4IA 3ZEUA 4MDBA 3SPYA 1TK5A 2HVHA 4XJXA 4BE1A 3ZX3A 1HJRA 4FM2A 3SQ1A 4BRCA 4KH4A 4KI6A 2FLOA 4C8MA 4DTJA 1YJ9N 1J6ZA 5DK5A 1DEJA 1X3MA 5C10A 4CHNA 4F3TA 1D9FA 1ATNA 3NF6A 3C7NA 3MN7A 4FWSA 1BI4A 3V9WA 4FVUA 3SUPA 1KAZA 4DS4A 3HBTA 4BACA 1WAFA 4DU1A 2EWSA 2HNDA 3V9UA 4CEAA 4DQPA 3UE5A 3K57A 4OJRA 1BQNA 4E7LA 1K8KA 4YORA 4O0IA 5AQZA 4C1NI 2IDOA 3W3DA 3J7AP 2D4WA 2VG5A 4ZTJA 3CCLN 2HMPA 5EY4A 2NRWA 3VQ5A 2UUAK 3C94A 1N34K 5AZIA 1NWKA 4CW7B 2YKNA 2QTDA 2BH1A 1Q86O 3THYA 4CJPA 3T3FA 4JK9A 3JXUA 1D8YA 3P39A 3WXMB 4K0KK 1L3VA 2YHYA 3MCPA 3DWLA 1JXBA 2CGKA 2CH5A 5MLCQ 1VQMN 1TK8A 1VQ7N 2O8EA 1BU6O 2OTJN 2VWBA 3RR7A 1TV6A 1T8EA 4X66K 2O8BA 1HYZA 3OS2A 5AZJB 4DV5K 1ZBIA 4DSFA 4BRGA 4CGFA 1RDDA 1R0AA 3KD1E 3OYCA 1JLBA 3DLRA 3FLCO 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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