3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
4O8KA 1YUWA 1GLAG 5BREA 2ZWHA 3H3OB 3QFPA 3M3ZA 3VGKA 4JD2A 3A8YA 2OANA 4CD1A 2F9WA 3O4WA 3DAWA 4AM7A 4B1YB 5I9EB 2P9LB 5JLFA 3G25A 4BGBA 3EO3A 4H0VB 3R9PA 2YHWA 3ZX0A 4BG8A 5BRHA 4FO0A 3VOVA 1U2VB 4H5WA 4CBWA 2YJFA 3EKUA 3F9MA 5F1XA 5JLHA 5AQZA 1TYQA 3FE1A 3A0IX 3HI0A 1QQMA 1JCEA 1IJJA 3TU5A 1NGGA 5EOYA 3FZKA 4DQ8A 3WEEB 3C0BA 4BR2A 1ATRA 3ID8A 4XH5A 2ASMA 1WOQA 5ELZA 2DPNA 3IMXA 1JCFA 1Z05A 2QWMA 3WXLA 2E2QA 4FWKA 1HJOA 1HUXA 3GG4A 2FXUA 4FWSA 3KVGA 1HX1A 3ZX2A 4K42A 1R59O 2QXLA 2A6AA 3MN5A 1J6ZA 5AQOA 2YHXA 1LCUA 1NGEA 4BR7A 4CZJA 3QDKA 3ULEA 2P9UA 1HKBA 3A5NC 4BQZA 2ZGYA 4MLEA 4BVPA 3CERA 4BR5A 3AAQA 4MO4A 2VWBA 2KHOA 4FWOA 4BR9A 1TYQB 1XC3A 3D2EA 4H5RA 2QW9A 3CI5A 3H46O 2E2NA 3CJCA 3QMLA 3RSEB 3VEOA 5AQRA 3BP8A 2W41A 4BC4A 3M6GA 3P4IA 1ATSA 4FWNA 2HMPA 3QBXA 5AQIA 1DEJA 3FR0A 1E4GT 2Q0RA 4RWTA 5ADXA 4LC9B 4GY2B 3UE5A 5JMVA 1JCGA 1X3NA 3S41A 3SJHA 4DCHA 5EXWA 2A40A 4JNEA 2YJEA 4WQ4A 3HTVA 3FZFA 4K41A 2D0OA 2CGKA 3WUHA 3B8AX 5BN8A 3HBTA 4FPBA 4CZHA 5EX5A 3W0LA 2P9SB 1BU6O 3FGUA 3O8MA 3CIPA 1NLVA 3IDHA 3JS6A 5FPEA 4DB3A 3MN6A 5AQQA 4WQ5A 3LDPA 4K25A 2P9IA 4YDUA 4XH4A 4CI6A 5BPMA 2IVPA 5AQPA 4CBUA 5LY3A 4BGAA 4A61A 4CZLA 1ZC6A 3O6WA 4PKHA 1YXQA 4H0YB 3ZEUB 4H0TB 2V51B 4A2AA 3R6MA 3VF6A 4CZGA 2Q1NA 4PKIA 3A5OC 2Q97A 4GNIA 3WEEA 1BDGA 1SZ2A 2F9TA 5FPMA 4BRCA 4E1JA 3L0QA 3A5LC 4CJ7A 1MWKA 3L4IA 1T6CA 3AARA 4CZKA 4H0XB 5AFUA 5AQGA 4BG9A 3M1FA 4BROA 5AQHA 2QWNA 1V4TA 4JAXA 1GLCG 3A5MC 2GWJA 2WUSA 3H3NO 2FF3B 1Q18A 2BTFA 4B1VA 1SQKA 4BQLA 3H45C 4BRKA 1U6ZA 5BN9A 3BF3A 1XUPO 3I33A 1OKJA 2NZTA 3UKUB 3VESA 3WXIA 4F9OA 3LDQA 2GUPA 3LM2A 3HSCA 4RCHA 4EHUA 5AQUA 2I7NA 2P9IB 5AQLA 4H5NA 4BC3A 1WUAA 1NGCA 1GLLO 4BRNA 4NO7A 3WT0A 3WXJA 3SK3A 2J4RA 4MLHA 4PKGA 5AZIA 3ZETB 1ATNA 1KAYA 1NGFA 1KAZA 1NGDA 4L3QA 3GL1A 1QQOA 4BRMA 3RSEA 1NGAA 1GLBG 4MO5A 1X9JA 1XQSC 2EWSA 4FWPA 4J8FA 5AQXA 4CBXA 2Q36A 4BRIA 4ISEA 4BR0A 4QS8A 2ZGZA 2ZF5O 4B9QA 2E88A 4A2BA 1LOTB 2VYPA 2NLXA 4HTLA 4B1UB 2P9SA 3VEXA 5KQDA 2FLOA 2Q31A 1ZXOA 3QB0A 3GOIA 2AP1A 2P9PA 3VEZA 4BC5A 1HKCA 4BRLA 5AZJA 3UKRA 4HWIA 5AZIB 1HLUA 3DXKA 4JN4A 4FSVA 3FZLA 3ZEUA 4BRHA 1RFQA 4B1WB 2UYTA 2PAVA 1Y64A 3EKSA 1C0FA 3HM8A 1D4XA 3MN9A 3BUZB 3VF4A 3VGMA 5AQNA 2QWPA 5EVZA 1NGBA 4BRGA 1RGIA 3U9ZA 2P9NB 4BRFA 5FPDA 2A42A 3WQTA 1NGIA 3LDNA 5AQMA 1MDUB 1BA1A 4CZFA 4XH1A 2FF6A 3SMPA 3WQUA 1KAXA 1S3XA 1H1VA 1SAZA 1BO5O 4FWLA 2D1KA 3O08A 3OHRA 2E1YA 2GWKA 3UKUA 4BREA 2IVNA 2H3GX 3L6QA 2ASPA 1QZ6A 3H6EA 3CQXA 1NBWA 3SLCA 3VENA 2P9PB 3CQYA 3U8XA 5AZJB 1MA9B 2QWLA 4H5TA 3UKRB 4FOIA 3BEXA 3LM9A 3DXKB 4IXCA 4PL7A 1C0GA 3LDOA 3IFRA 3AY9A 4O5FA 4QS7A 1EQYA 4FWMA 3ZETA 3O80A 3CJ7A 5BRFA 4M63C 4CZMA 5E84A 3GE1A 4WQ4C 1NMDA 4NB4A 2FSJA 4H0OA 3DWLA 3W3DA 2P9KB 3FZHA 4ISFA 4A62A 2FSKA 2Q0UA 5LJVA 2E20A 4IWVA 3UB5A 2HOEA 4WQ5C 1GLEG 1IG8A 2ITMA 5AQTA 3VEVA 4YDUC 1MWMA 3LL3A 5B8HA 5AQYA 2NRHA 5LJWA 1E4FT 2V52B 4Z94A 5F0XA 3ATUA 5TKYA 4M7YA 2A5XA 3C7NB 3VEWA 4EAHD 3H1VX 3VF2A 3CJBA 5BR9A 4H03B 3MN7A 4EIAA 1QHAA 2BUPA 1GLJO 2A41A 4DHYA 3MCPA 2YI1A 4IO8A 3VETA 2HF3A 3ENOA 4JHDA 3VEYA 3ATVA 3MK6A 1BUPA 1RDWX 2P9NA 3FZMA 5KQ8A 3FFKB 1G99A 1BA0A 5KPTA 5KPZA 3GBTA 2FSNA 3IUCA 1V4SA 3AAPA 3ZX3A 2CH6A 3U4LA 4BRPA 2D4WA 3DXMA 5BRDA 2E1ZA 1HPMA 4FWRA 4BVOA 3H1QA 3QFUA 3LDLA 4WYBA 2AA4A 3KHYA 4I6MB 5AQSA 3J8AA 3KZBA 3MDQA 3SMSA 5F2RA 2E2PA 3U9DA 1X3MA 2IIRA 3EN9A 3GDQA 4JD2B 5AQJA 4BRDA 1GLFO 5JICA 1CZAN 2QWQA 3MMVA 2ASOA 1YAGA 4ISGA 3VPZA 4JHDB 3VERA 1T44A 4K43A 4CZIA 2V7YA 3O1WA 1BOTO 3D2FA 5E26A 2GELA 1ESVA 3HZ6A 4CZEA 2YCHA 1TUYA 3QBWA 3R8EA 5AQFA 2CH5A 4EHTA 2P9KA 4PL8A 5AQKA 3BF1A 2QWRA 1DGKN 3DXMB 1P8ZA 3WXKA 4BC2A 1K8KA 4BRQA 2QM1A 4B1ZA 1NGHA 4M7XA 5ADXH 3EL2A 5BPLA 2PBDA 2V7ZA 1GLDG 5AQVA 4CD3A 2W40A 1NWKA 1NM1A 5FPNA 4H5VA 3CJAA 1BG3A 5CE3A 2Q2RA 3ENHA 1BWFO 3O1BA 4H0PA 4XEIA 3C7NA 2D0PA 3EZWA 3DJCA 4FPAA 2E2OA 3CJ9A 1HKGA 1KXPA 2CGLA 4IJNA 1DKGD 2HF4A 3FLCO 1T6DA 2GTDA 3ULEB 3D2FB 2P9UB 2QWOA 4AM6A 4IZ9A 2P9LA 4RTFD 2A3ZA 3CETA 3TPQA 3D7EO 3CHWA 4FL9A 5KPRA 4KBOA 1Z6RA 3I8BA 2CGJA 2YHYA 4EFHA 2E8AA 3D2EB 4FOEA 1U2VA 5AQWA 4QS9A 5BPNA 1QQNA 1TUUA 1K8KB 2IVOA 4C23A 4B1XB 3JXUA 3QICA 5AFUH 4FWQA 1S22A 5EY4A 1NGJA 3VGLA 3O5BA 5AR0A 1QZ5A 2VCPA 1ZBSA 2GEMA 4Y0WA 3CJ1A 4BRAA 1YVNA 4IJAA 4I6MA 2I7PA 4BR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BREA 4DTJA 3M3ZA 1Q7YO 3V6DA 4FYDA 1TAQA 3SI6A 1N32K 3VQ8A 3V9ZA 1REVA 5CZ1A 4CD1A 3DAWA 1QSYA 1OH8A 5JLFA 3G25A 3EO3A 1S6PA 3U3GA 3AVMA 3CM5A 3VOVA 1QE1A 1U2VB 3EZ5A 4KHUA 1TKXA 3TAGA 4I9QA 2B5JA 3F9MA 5F1XA 5JLHA 5IWAK 4NCAA 4RW6A 3MXIA 3V1RA 5CHIA 5FLXO 3D0PA 1QQMA 1JCEA 1TGOA 2WC9A 1NK9A 4JV5K 3C0BA 1ATRA 4XH5A 1KSPA 5ELZA 4BE7B 1A5XA 4J2AA 4DFJA 3VTHA 4CJWA 4CJTA 2QWMA 4GV3A 4IFYA 2DTUA 3WXLA 3AA4A 4LD0A 1U48A 2O8EB 3TTFA 4FWSA 1HX1A 3VTIA 3ZX2A 4K42A 4FVMA 4DTRA 2NUBA 4CHOA 3SAHA 5HP1A 3KLGA 4JI4K 1ZBFA 2QI2A 5M1KA 2UUCK 2P5OA 4BVPA 4F4KA 1RT2A 2G8VA 4DSLA 1IBLK 2VWBA 2KHOA 1SL1A 4FWOA 3RMDA 1XC3A 3D2EA 5C42A 5GINA 4BWJA 2QW9A 2E2NA 3CJCA 3QMLA 2WTUA 4EZ6A 4Z4IA 4RW8A 4CFDA 2W41A 4BC4A 2HVHA 3P4IA 3ZSVA 2QXFA 4BE0A 1JCGA 3C6AA 3S41A 1JLQA 3JSMA 5EXWA 2A40A 4WQ4A 2E6MA 4DQSA 2D0OA 1YJWN 1FXXA 4F8RA 3B8AX 1EETA 2VWJA 4GMJB 1NLVA 3RR8A 3MN6A 2IDOA 2A1SA 1J9AA 4IKFA 4YDUA 4XH4A 1N6QA 4GW6A 3KLHA 4HCBA 3O9UA 3LDSA 2IVPA 2G8HA 3L2UA 3O6WA 3AV9A 1OH6A 3VF6A 1RBTA 4CJRA 4CZGA 3A5OC 3SQ4A 3WEEA 4PUOA 1SZ2A 3G71N 4BRCA 3HK2A 3L0QA 1MWKA 1T6CA 4H0XB 4DTPA 4BG9A 4BROA 1VHXA 1A5VA 5M1PA 4CCHA 2FF3B 1BGXT 3MXJA 3H45C 4CK2A 4BRKA 1FK9A 2NZTA 3LDQA 2GUPA 1NJIO 4WF9L 1VQ9N 2I7NA 5AQLA 4H5NA 1W0HA 1ZBHA 1HYZA 3SK3A 3AVFA 2UXCK 4CGGA 1IV0A 1NOYA 1SUQA 4DV1K 3ZETB 3RTVA 2O8BB 3LZJA 3RSEA 1NGAA 1TKDA 1GLBG 1VQPN 1XQSC 1T7PA 3VN5A 4J8FA 5AQXA 3CFOA 4ZHRA 4BR0A 1QTMA 3PLAA 1S6QA 4KHSA 2ETJA 4AF1A 3ZT3A 4CFAA 4JI6K 1U47A 1VQ4N 4HTLA 3TABA 4KHQA 4Z4CA 3SBGA 3VEXA 5KQDA 4CEAA 4B9VA 1RNHA 2P9PA 3VEZA 4BC5A 5HLFA 3TI0A 1D8YA 3TAEA 3NF7A 1LWCA 4JN4A 3ZEUA 4BRHA 4PA1A 4H8KA 2UYTA 2PAVA 1IG9A 3O9SA 5DM6L 3VF4A 5AQNA 3U6FA 1EX4A 1HNXK 3IAYA 3CD6N 3VQAA 2P9NB 1YVUA 3WQTA 1SKWA 2NRWA 3LDNA 3PSIA 5LL6Z 1BA1A 3F5TA 1B92A 3P1GA 1XMQK 4E7JA 4FWLA 1RDDA 1RT1A 3F2KA 3O08A 2YNGA 2GWKA 2W6LA 3ZT1A 2IVNA 3KLEA 2Q3SA 1QZ6A 2P9PB 1U45A 4H5TA 1NKCA 2JLEA 1B9DA 4IXCA 4PL7A 4MDAA 1EQYA 2KZMA 4BE1A 1YHQN 3VQBA 5HRPA 4GV6A 4CZMA 4DU3A 2NRTA 3ZYYX 4WQ4C 4NB4A 4H0OA 2AJQA 1XHZA 2OA8A 2O4IA 3CCSN 1ASVA 2YKMA 4LF4K 4JKDA 3WNHA 3S9HA 2VG7A 3R1XA 3SUNA 2F8SA 3TAFA 3CYMA 3U3YA 5AQTA 3VEVA 4YDUC 1E4FT 5A2QO 1NK0A 4KFBA 5TKYA 3QERA 3VF2A 5BR9A 3OJUA 3IS9A 4FLTA 2C1IA 4KAZA 3QETA 1QSSA 2BUPA 1IBMK 2I5JA 3SQ2A 1UAXA 2A41A 2QKBA 4DFPA 3VETA 4IO8A 2HF3A 3ENOA 3H08A 3VEYA 3ATVA 3MK6A 1HYVA 1BUPA 5KQ8A 2IOCA 1VSEA 1C0TA 4KH6A 3AAPA 2VG6A 2GUIA 2CH6A 4Y1CA 3CC7N 2E1ZA 1J53A 4FWRA 4OPJA 4FM2A 4F3TA 3HVTA 2VQEK 4KTQA 1NJWA 4WYBA 4LF5K 1TVRA 2AA4A 3KHYA 1IKVA 4FJHA 3J8AA 3KZBA 3MDQA 3SYZA 3SMSA 3D6RA 4OPHA 3OYGA 3NF9A 2P1JA 3GDQA 5AQJA 4FW1A 4F3OA 1C0MA 2ASOA 3HO1A 4CZIA 1T44A 4KI4A 2QKKA 3O1WA 1ZBLA 1S9EA 2GELA 1CXUA 3LP3A 4CZEA 2YCHA 1TUYA 2RHKA 3HRGA 4W5QA 3CM6A 4PL8A 2YNFA 1M90O 4OO1J 3WXKA 4BRQA 4B1ZA 4M7XA 4M42A 3EL2A 2V7ZA 2Z1GA 1LW0A 3L3VA 3OS2A 1KQSM 4CD3A 1NK4A 3TAPA 4CHPA 4CJ5A 1NWKA 1NM1A 5CE3A 3EY1A 5D3GA 3O1BA 4Z4FA 1BL3A 4H0PA 4XEIA 4DMNA 3C7NA 3DJCA 3SAGA 3QEXA 4IJNA 2WONA 1HKGA 3MWPA 1LAWA 1O13A 3FLCO 1T6DA 4JS4A 3LPUA 4CHQA 4M3ZA 4Z4EA 3ULEB 4IG3A 1RT7A 2P9LA 4CHZA 4C8NA 4CEFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3KKR A;  3MCA B;  3OYJ A;  3RWU A;  1HPM A;  4EP5 A;  1SL2 A;  4CJF A;  4BVO A;  3KJV A;  1UA0 A;  1BIS A;  4DG1 A;  2E2P A;  4DR5 K;  3U9D A;  3NCI A;  2HHI A;  3LP0 A;  4JD2 B;  4BRD A;  3THW A;  2HNY A;  5JIC A;  3HXM A;  3AVJ A;  1TKZ A;  3MMV A;  1YAG A;  3J7Y P;  3VPZ A;  4K43 A;  2V7Y A;  1BOT O;  5C24 A;  3HZ6 A;  3R8E A;  1JLG A;  1N33 K;  2CH5 A;  2YV0 X;  2QWR A;  4A5B A;  1UWB A;  4FJN A;  2FBT A;  3A2F A;  2PBD A;  3I0R A;  4DR2 K;  1EWQ A;  3WNF A;  5AQV A;  2UUB K;  3CCL N;  4A5A A;  2W40 A;  4FJ7 A;  5FPN A;  3TAR A;  5AJ3 K;  4CIF A;  1BWF O;  1RTH A;  2OPP A;  1U4B A;  3ISN C;  1KXP A;  3THW B;  2HHH K;  4OLB A;  4YHH K;  2YKN A;  1DKG D;  2HF4 A;  1ITG A;  2P9U B;  4AM6 A;  3F9K A;  3QEV A;  1GOC A;  3SUQ A;  3OS0 A;  4FL9 A;  4KHN A;  4DV6 K;  4EFH A;  2CGJ A;  1UOC A;  2E8A A;  1U2V A;  4CF2 A;  4ELT A;  4DQI A;  3QIC A;  3G10 A;  3VGL A;  3VQD A;  1RTD A;  3BZC A;  3S3N A;  3CJ1 A;  2BDP A;  4HVJ A;  3CPW M;  4AHT A;  3E9P A;  2I7P A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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