3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
2Q97A 3D2EA 4H0TB 3VF2A 4CD1A 4CZJA 2D0OA 1K8KB 5B8HA 2YJFA 5KQDA 2ASPA 1D4XA 5AR0A 5I9EB 2VWBA 1Z6RA 1HKGA 1ZBSA 3DXMB 4DHYA 1K8KA 3KVGA 2GTDA 2VCPA 2ZGYA 3VF4A 1HX1A 2A41A 1IG8A 4PKHA 4BR7A 1NLVA 5TKYA 4XH4A 5AQLA 3VEXA 2HMPA 5AQGA 3DXMA 5AZJB 3QDKA 5AQWA 4BR4A 2PAVA 4DB3A 4QS7A 1RDWX 3LDNA 2F9WA 2GWJA 2E8AA 2EWSA 2FF3B 3QICA 3QBWA 3SK3A 5AZJA 2ZGZA 3U4LA 4BC2A 4FOEA 1YUWA 4A62A 5FPNA 2IVOA 3TU5A 2A40A 2ITMA 3VOVA 3SMPA 4FWSA 4FWQA 4BROA 1Q18A 4IO8A 3ZX0A 4BR0A 1J6ZA 4CZEA 1YVNA 1BA1A 3GE1A 5BPNA 4BRLA 2E20A 1DKGD 2V7YA 3O5BA 2QWNA 2QWOA 3CQXA 4DCHA 4HWIA 3H3NO 2AP1A 2GELA 1HLUA 4XEIA 4H5NA 1NGIA 1ZC6A 1T6DA 2FLOA 4FWKA 3F9MA 4C23A 2NLXA 3CQYA 4CBWA 3ULEB 3U9DA 3GL1A 3AY9A 3FZHA 4O8KA 3FFKB 4BVOA 2BUPA 3C7NB 4FPBA 2ASOA 2Q0UA 1BU6O 5AQVA 3ULEA 3VGKA 2E2NA 2IVNA 2OANA 1QHAA 5AFUH 1NBWA 1SAZA 3C7NA 3DWLA 2P9NB 2P9SB 2Q36A 3MK6A 1QZ6A 3BEXA 2IIRA 3EL2A 3L6QA 4H0XB 2ZWHA 4FWLA 4B1VA 4ISFA 3R6MA 1YXQA 1ESVA 1V4SA 4FWNA 5BREA 2P9SA 5AQSA 4ISEA 3VEZA 5JLHA 4B1UB 3LM2A 3HI0A 4BRNA 1HUXA 4B1WB 4QS9A 3L0QA 4BR5A 5E84A 1NGBA 1LCUA 3QBXA 1V4TA 1DEJA 3CJ7A 4H03B 4O5FA 2E1YA 1HPMA 1ATNA 3UE5A 4CZKA 4IWVA 4BRKA 1HKBA 3ENOA 3MN9A 2J4RA 3LDLA 4B1XB 4M63C 5AQXA 5BN8A 2FSNA 4EHTA 3GBTA 3CI5A 3CJ1A 3I8BA 4PKGA 4Z94A 1QQMA 3D2EB 5BN9A 3FE1A 4MO4A 5AQYA 2D1KA 2BTFA 1MDUB 3FLCO 1IJJA 3BF3A 3C0BA 3LDPA 4JAXA 1BDGA 5AQZA 3UKRB 1KAYA 2A6AA 4CD3A 4A2AA 3BP8A 3MN5A 5ADXH 3QFPA 4EHUA 1T44A 1C0FA 2F9TA 4PL8A 3WXIA 4BC5A 1ATSA 4B1ZA 4FWRA 1ATRA 2E2OA 3CJBA 3I33A 2DPNA 3UKRA 3VEWA 3WQUA 2A3ZA 5EX5A 1SZ2A 1NGAA 3W3DA 4MLHA 3H1VX 5FPMA 3EO3A 2FF6A 2NRHA 3R9PA 2Q1NA 4BRDA 3HTVA 3LL3A 2QWMA 3G25A 4RWTA 2P9KB 3VGLA 4JN4A 4JNEA 3FZMA 1QQNA 1TUUA 2HF4A 1QZ5A 2YI1A 4FWMA 4RTFD 3U8XA 1XC3A 4YDUC 2P9KA 3M6GA 4CZIA 2FSKA 4J8FA 2YHXA 3A5MC 2P9PB 5FPEA 1GLLO 2YHYA 4A2BA 4BGAA 1S22A 4DQ8A 4FOIA 2CH6A 2P9PA 2CGLA 4RCHA 5BRDA 4CJ7A 3ZEUB 2I7PA 4IXCA 3S41A 2D0PA 1NGCA 3QFUA 2E2PA 3EN9A 4BRIA 4K43A 1NM1A 4MO5A 5AQIA 2FXUA 1E4FT 1BA0A 1NGHA 3O4WA 4AM6A 4BRFA 1YAGA 1ZXOA 3ZEUA 3IMXA 3GG4A 2ZF5O 1SQKA 4M7YA 4WQ4A 4NB4A 4BR9A 4F9OA 3FGUA 4FSVA 4H5RA 3ID8A 3KZBA 3L4IA 5AQOA 2QW9A 4XH5A 4JD2B 4EAHD 3W0LA 3WXKA 3MCPA 1QQOA 4IZ9A 3UKUB 2IVPA 4FPAA 5AQFA 2QWLA 4PL7A 4JD2A 1XQSC 4BG8A 1JCEA 1OKJA 5AZIB 1GLEG 5BPMA 1E4GT 2Q31A 3UKUA 2P9LB 2ASMA 3CJAA 2P9UB 3O1WA 4GY2B 3A5LC 5AZIA 4BQLA 2W40A 3JS6A 4CBXA 4EIAA 4MLEA 2Q0RA 1GLAG 1MWKA 4KBOA 4WYBA 1CZAN 2QM1A 2P9LA 4H0PA 2V52B 4BRAA 2P9UA 5EOYA 3O08A 3A5NC 4AM7A 5LJVA 1BOTO 3BUZB 4K41A 1G99A 1MA9B 4FO0A 4H5VA 3VF6A 3HZ6A 2PBDA 3HBTA 3CIPA 2H3GX 1NGJA 3MDQA 3O80A 5EXWA 4I6MB 2GUPA 3JXUA 4FWOA 3MN7A 5BR9A 1X3NA 2NZTA 2P9IA 2D4WA 2V7ZA 4WQ5C 1R59O 3VESA 5KPZA 4HTLA 3AAPA 3AARA 3IUCA 3ZETB 5AQJA 3H1QA 4I6MA 3D2FB 2V51B 3FZFA 3KHYA 3MMVA 1U6ZA 4IJNA 2FSJA 3OHRA 1JCGA 3WT0A 1TYQB 5LJWA 1XUPO 2VYPA 3H6EA 3ZETA 5KQ8A 3WUHA 3D2FA 2QWPA 3H46O 4L3QA 5AQNA 1NMDA 4IJAA 5JMVA 3ZX2A 4YDUA 3R8EA 4NO7A 1TYQA 4E1JA 5BRFA 4K42A 3WQTA 3WEEB 4BC4A 4BRMA 5JLFA 4CZHA 3DXKB 3AAQA 1GLCG 4PKIA 5EVZA 2Q2RA 3CJ9A 3WEEA 1BWFO 3DAWA 5BPLA 4BRHA 2UYTA 3QMLA 3M1FA 3BF1A 4H0VB 3VERA 3DXKA 4A61A 2YJEA 3IDHA 1KAZA 2A5XA 4CZFA 3H3OB 4BRPA 2AA4A 4GNIA 3SJHA 2QWRA 2KHOA 5F1XA 3A5OC 3ENHA 1T6CA 3VEYA 3M3ZA 4H0YB 4EFHA 5AFUA 4CI6A 3MN6A 3ZX3A 4CZLA 1BUPA 3SMSA 3VGMA 1BO5O 1GLDG 3ATVA 3FZLA 3CHWA 1C0GA 3WXJA 3WXLA 1GLFO 5LY3A 1Y64A 1P8ZA 3VEOA 2E1ZA 5EY4A 4BRCA 2YCHA 3D7EO 5KPRA 4BVPA 1HJOA 4K25A 3SLCA 4JHDB 5ELZA 1LOTB 3O1BA 4BREA 2I7NA 2QXLA 2W41A 1NGGA 1X3MA 3O6WA 4JHDA 5AQTA 5KPTA 1RGIA 3CERA 2E88A 1KAXA 4H5TA 4B9QA 1EQYA 1S3XA 3DJCA 3A8YA 3B8AX 3CJCA 5AQPA 2GWKA 5AQUA 4BRGA 1NGFA 1GLBG 3CETA 3FR0A 3LDQA 4CZMA 5FPDA 3RSEB 2GEMA 5AQMA 3A0IX 4BC3A 4LC9B 3P4IA 4CBUA 3GDQA 5ADXA 3GOIA 2QWQA 3LM9A 4WQ5A 2CH5A 3RSEA 4BR2A 4WQ4C 3UB5A 3VPZA 2CGKA 3U9ZA 4BG9A 2P9IB 3QB0A 4Y0WA 3EKUA 2P9NA 1GLJO 4BRQA 5AQHA 1NGEA 1BG3A 1MWMA 4QS8A 3H45C 4ISGA 4XH1A 5BRHA 3O8MA 2CGJA 5E26A 5F2RA 4FL9A 4BGBA 4B1YB 2HF3A 1WOQA 5F0XA 2A42A 4H5WA 5AQRA 1X9JA 2YHWA 2HOEA 1U2VB 4FWPA 5AQKA 3HSCA 3LDOA 3J8AA 4M7XA 3IFRA 3VEVA 1WUAA 4CZGA 1NWKA 1KXPA 2WUSA 3HM8A 5JICA 4BQZA 1TUYA 3EKSA 4H0OA 2E2QA 1U2VA 5CE3A 3VENA 1Z05A 5AQQA 3ATUA 1JCFA 3VETA 1RFQA 1HKCA 1H1VA 1DGKN 3TPQA 1NGDA 3FZKA 3EZWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0TB 1BIZA 1XMQK 4CJFA 3M8QA 4EP4A 4IFYA 3AVJA 1EX4A 2YJFA 1Q82O 3CMEN 4M42A 5AR0A 4HCCA 4Z4CA 4AHCA 4DSJA 4Y1DA 4JYAK 3S3NA 4A5AA 2ZGYA 5CZ1A 2AJQA 4NYFA 3VQ9A 3VN5A 5AQLA 4ILGB 2HMPA 3DXMA 3SZ2A 5AZJB 3J81O 3E9OA 4BR4A 4Z4IA 3L2QA 3U3GA 3OYAA 3AVFA 3O3HA 3TARA 2GWJA 2EWSA 3QBWA 2ZGZA 3U4LA 4M3TA 4OPJA 4BC2A 1JLEA 4LF9K 5C15A 1C0TA 5FPNA 1JL2A 3MCAB 3HOSA 4WFBL 2A40A 3C6AA 3D0PA 1RTIA 4IO8A 3ZX0A 4FK4A 1BA1A 3KD1E 4FLZA 3ZYYX 1C1CA 3DLEA 4AF1A 1Q7YO 1DKGD 4DV0K 4DCHA 4E7LA 5LMUK 4QCLA 4CJKA 1DTTA 2WOMA 2AP1A 3VTIA 3AVNA 4WE1A 1EO1A 4XEIA 1LW2A 1NGIA 3QNOA 1T6DA 3F9MA 2W42A 2O4GA 4CK1A 2GX9A 2G8VA 1ZYQA 1LAWA 4CFBA 4RW8A 3C7NB 2QA4N 1BU6O 3ULEA 3VGKA 4OLBA 3OVNA 1SAZA 3KK3A 3V9UA 4GKJK 4QOZB 2P9NB 2P9SB 3O9SA 4M41A 1SUQA 3L6QA 1IKWA 2YV0X 1VSFA 4H0XB 4CCHA 4FJ5A 4FWLA 1RT6A 3PO5A 2O8FA 4B1VA 3TAQA 3PX6A 1TV6A 4XJXA 1RDDA 3V1RA 4B9VA 4WCEL 2NRTA 1T03A 4B1WB 3L8BA 3M5RA 3DYAA 3JAMO 2HHWA 4Z4HA 2KZZA 4H03B 4CHOA 2E1YA 3ZT0A 1HPMA 4JI7K 1C1BA 3JSMA 4X64K 4IWVA 1HKBA 4PHTX 4B9NA 4AHRA 2J4RA 3LDLA 3PIOL 4E7KA 3V9SA 4FM2A 3SNNA 3DRPA 3CI5A 3I8BA 3KLEA 1QQMA 5GIOA 4AH9A 5AQYA 4I9LA 4OJRA 4FJNA 1VQLN 2BTFA 3CCUN 5J2NA 3K5OA 3G71N 1IJJA 1CZ9A 3C0BA 4X65K 4JKHA 4CK3A 3AO2A 3V1QA 2QK9A 3AO5A 2Z1GA 3BP8A 3MN5A 4A2AA 5ADXH 3HM9A 1S1UA 3P5JA 1VQ9N 1C0FA 3ZCMA 3HVRA 4Z0UA 4FZZA 3H08A 1J9AA 1U04A 4Q5VA 3AVCA 1FW6A 1IBMK 2D0AA 1SZ2A 1JLBA 2O8EB 4MLHA 1Z26A 5FPMA 1OVQA 2Q1NA 4BRDA 4KHYA 4JS4A 2QWMA 1L3VA 4E0DA 1VSIA 1J53A 5GAHP 4ID5A 4JN4A 4JNEA 2ITGA 3HYFA 3ZT3A 5I42A 2HHIA 4FWMA 1XC3A 3C94A 2P9KA 4CEZA 1VAZA 2P9PB 4IBNA 4LF6K 4U67L 4A2BA 4KH6A 3PV8A 1TL3A 2UUAK 3LALA 2BDPA 4JKCA 4RCHA 1KVCA 1VQKN 2PYJA 4E7JA 4CJ7A 2I7PA 4IXCA 4CEDA 3CCEN 2D0PA 2BH1A 3ZSXA 3EE9A 2E2PA 1K6YA 1E4FT 3AO1A 4BRFA 2YHAA 1Z25A 1ZXOA 1UOCA 3IMXA 5CR4A 2ZF5O 1TKZA 4WQ4A 4HUGA 4NB4A 3ZT4A 4BR9A 2PYLA 4FJGA 4KHWA 4DV7K 4M3ZA 2DFFA 1MU2A 1VRUA 2IC3A 1RDBA 1UA1A 3S3MA 2IVPA 5AQFA 3ZSVA 1C0UA 3G10A 3HJFA 3AA4A 1JCEA 1OKJA 5HRPA 1QE1A 3VQ8A 1EWQA 2OTJN 2Q31A 2ASMA 3MXMA 3CFRA 2UXBK 4DR7K 3O1WA 4BWMA 1W2BM 1ZBHA 5AZIA 1VSJA 1OH6A 1NJWA 4IFVA 3AA3A 3OYHA 4MLEA 2QM1A 4BEBA 2P9LA 1HQUA 3EYZA 4BRAA 1QHTA 5EOYA 2I5JA 3O08A 5LJVA 3NAEA 3NE6A 3NMUA 4FO0A 5C0YA 1K73O 4AILC 3AVHA 3HBTA 2ZJRL 4H4MA 2H3GX 3AO3A 4W5NA 3MDQA 4FLXA 3CFOA 3HPHA 2ZD1A 5EXWA 3TAFA 3DMJA 2GUPA 2Y1IA 3JXUA 3MN7A 5BR9A 2NZTA 1IH7A 5SWMA 4YOWA 4ELTA 2Z1JA 3H1QA 4FJLA 3T7ZA 4HTUA 1HNWK 4O5BA 2D0BA 3L3VA 3SJJA 2VG5A 1C1AA 1J5OA 1LV5A 3NGIA 3THYA 3WT0A 1TYQB 1BIUA 4B9MA 1S6PA 5FDLA 3TSQA 4L3QA 4DU4A 1NMDA 4IJAA 1WB9A 2WONA 1EWRA 3LPUA 3R8EA 4FZYA 4E1JA 3WQTA 4FJXA 4BC4A 3LP1A 4AHTA 2HHVA 2D0CA 1X9MA 4CZHA 1NNEA 3EEQA 4DV2K 4E7HA 1I94K 1N6QA 5KGXA 2Q2RA 5BPLA 3WEEA 2XRIA 3I55N 4YOUA 1RDUA 3QEXA 4F4KA 3QMLA 4IKFA 2R7YA 3VERA 4A61A 1KAZA 2A5XA 3QIOA 1RT3A 3RRHA 3SI6A 4GNIA 5J1EA 1CLQA 4N56A 4IG3A 3VEYA 5AFUA 4CHPA 4OGCA 4CF9A 4BE7B 4DTRA 2P51A 1BO5O 3ATVA 1GLFO 2G8HA 1DT9A 3VEOA 5EY4A 4LF8K 1WLJA 3D7EO 5KPRA 1VSHA 3T19A 4BVPA 2A1SA 4FJIA 5ELZA 4O55A 1JLQA 1GOBA 1IO2A 1LOTB 3E1YA 3VQBA 3O1BA 2I7NA 2YNHA 4UY8O 1YJWN 3AGRA 1GOCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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