4BC4A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
525
structure length
525
Chain Sequence
b'RRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 181
structure length 525
sequence length 525
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A01
4A62A 3CJ9A 4B1UB 4LC9B 4DQ8A 4B1VA 5BN8A 2ZWHA 2WUSA 3DJCA 4K42A 4FWPA 5KQDA 4BRPA 3AY9A 1ATRA 4BREA 1GLEG 3CHWA 3VGKA 3QFUA 2HF4A 2QWLA 1ATSA 2W40A 1C0GA 4H0YB 4JD2A 5I9EB 3O4WA 3CIPA 4XH4A 2F9WA 3MN7A 2QWMA 1HPMA 1RDWX 4BQZA 1S3XA 3H45C 3FE1A 3VEVA 4FWOA 2UYTA 2E1ZA 3J8AA 2Q0UA 4FWNA 4FWMA 4F9OA 1YXQA 4EAHD 3D7EO 2J4RA 4MLHA 1ZBSA 5JMVA 3B8AX 1NGGA 4H0TB 3A8YA 2GWJA 1XQSC 4EHUA 5LY3A 4E1JA 2D0PA 2FLOA 1NGCA 4XH1A 3UKRB 1ZXOA 3UKUB 1KAZA 5ADXA 5BPNA 3BF3A 3KHYA 3WXKA 1NGHA 3QICA 5BPMA 1DEJA 4H0VB 1IG8A 3M1FA 3O80A 1KAYA 3UB5A 3TPQA 3HM8A 5AQLA 1BWFO 3U4LA 1U6ZA 3VOVA 4CD3A 2YJFA 2I7PA 4FPBA 4AM7A 3JXUA 1IJJA 3ENOA 3S41A 2YJEA 5CE3A 3O8MA 2AP1A 3ID8A 4BC4A 2E1YA 5EX5A 3FR0A 3MCPA 3I8BA 3AAPA 2A6AA 2P9KA 2GTDA 4BRMA 1T6DA 5KQ8A 3GG4A 5BR9A 3CQXA 2FSNA 1R59O 3CERA 2GWKA 3W0LA 2HOEA 1NGEA 2V51B 3WXJA 5LJWA 1BA1A 1S22A 3WXLA 3C7NB 3DAWA 3IUCA 3P4IA 5BRDA 2QXLA 3DXKB 2P9IB 3U8XA 2E2NA 2ASMA 2E2QA 2CGJA 3MN9A 3A5NC 5AQQA 5JICA 3ZETB 1U2VB 2VCPA 3MN6A 4BC2A 1BO5O 4CZHA 1QZ6A 3I33A 5AQYA 2P9LB 1SZ2A 3VF2A 3C0BA 4JAXA 1YUWA 4WQ5C 4B1XB 2NLXA 2NZTA 3CJ7A 4BR7A 5FPMA 3MMVA 2IVPA 3UKRA 3UE5A 3VPZA 4BRHA 4CZJA 4EFHA 3LDPA 2P9UA 3WQTA 2Q36A 3CJ1A 4HTLA 4BRCA 4CZLA 3A5OC 4Z94A 2Q31A 1K8KB 1NM1A 1LCUA 1NMDA 3ENHA 4B9QA 4BRIA 3QDKA 4K41A 4AM6A 5AQUA 2PAVA 3IDHA 1NGJA 4GY2B 2P9PB 2YCHA 5BRHA 4H0PA 4CZEA 4JHDB 4BC3A 1V4SA 3FFKB 2ITMA 2CH5A 3O08A 1Z6RA 4PL8A 4M7YA 4KBOA 4BRLA 1ZC6A 1WOQA 3BP8A 2FF6A 5JLHA 4ISEA 3SK3A 4PKHA 2YHXA 5AZJB 1GLCG 2Q0RA 2HF3A 3VGLA 2ZF5O 1TYQB 4H5RA 3LDNA 5AZIB 2IVOA 5AQJA 3VGMA 4H0OA 3GE1A 4BR2A 2W41A 4H0XB 2P9NB 2P9SA 3GOIA 3G25A 2QWQA 1T44A 5AQKA 4CZIA 1E4GT 5AR0A 5JLFA 5KPZA 1QHAA 2FSJA 1NBWA 2A5XA 3EKSA 4H03B 1Q18A 1OKJA 3W3DA 3EL2A 4GNIA 4K43A 4BGAA 3ULEB 2QWRA 3CJBA 2E8AA 4IWVA 1MWKA 4BRFA 5KPTA 2ASOA 2ZGZA 3QBXA 1BUPA 3SLCA 4PKGA 4BR9A 1TUYA 3EN9A 2V52B 3H1VX 1EQYA 4FOIA 4WQ5A 1X3NA 3D2EA 5AQIA 4MO5A 5AQSA 2E2PA 4DHYA 5AFUH 4BR0A 2Q2RA 4FWKA 3EZWA 2QWPA 3SMPA 5BPLA 1QZ5A 4ISGA 4CD1A 4HWIA 2QWNA 3O5BA 5E26A 2Q97A 3LM9A 4CZKA 1K8KA 3VF6A 1Y64A 1YVNA 4QS7A 4O8KA 3WEEB 3ZEUB 2PBDA 2E20A 3WQUA 3BUZB 3SMSA 5AQRA 1GLLO 3LDOA 2P9PA 2GUPA 4BG8A 3M3ZA 1E4FT 5AQOA 4QS8A 3D2FB 1GLDG 4JHDA 4PL7A 1NWKA 4L3QA 4B1WB 2A40A 4FSVA 1JCFA 1NGIA 1ATNA 4A61A 2AA4A 4XEIA 4BRQA 3ATUA 4XH5A 4JN4A 5BREA 4H5NA 2BTFA 4CI6A 1WUAA 4FWSA 3L0QA 5AZIA 2Q1NA 3DXMB 5AQMA 3U9ZA 2HMPA 1J6ZA 4FWLA 4IZ9A 2P9NA 3VENA 4CBUA 4BRNA 2E88A 5AQTA 4CJ7A 5AQHA 4BC5A 5AQFA 4BG9A 2QWOA 3HZ6A 3IFRA 4MLEA 3VEOA 3AARA 3HSCA 1QQOA 1QQMA 3ULEA 3WEEA 3UKUA 4BVPA 3H6EA 1GLJO 3CJAA 1SAZA 2CGLA 4BVOA 4IXCA 2VWBA 4H5WA 1Z05A 4A2AA 1TUUA 2E2OA 5FPNA 4K25A 1NGDA 3R6MA 4Y0WA 5AQPA 2GELA 3BF1A 4B1ZA 3H46O 4IJAA 5AQZA 1V4TA 4RTFD 1HKBA 3FZLA 3QBWA 3L6QA 4ISFA 3ZEUA 2OANA 4DCHA 3U9DA 3ATVA 4M63C 4BRDA 3HTVA 4FOEA 2P9KB 3M6GA 4B1YB 1C0FA 1NGBA 5BRFA 3ZX0A 5BN9A 3D2FA 5AFUA 5LJVA 1RFQA 2IVNA 3WT0A 4CBWA 4I6MB 4QS9A 3VESA 5FPEA 1H1VA 3QMLA 3A0IX 3C7NA 1DKGD 3JS6A 4H5VA 3RSEB 3DXKA 1BOTO 1BA0A 3A5MC 3CETA 5B8HA 1BU6O 2P9IA 2F9TA 1MA9B 3FGUA 3FLCO 4O5FA 4WQ4C 5F2RA 3DXMA 3ZETA 1NGFA 1NLVA 1U2VA 3H3OB 3TU5A 2D4WA 1JCGA 3MN5A 2KHOA 4CZMA 3O1WA 2P9LA 5AQXA 5EVZA 3FZFA 5AQWA 5AQNA 5KPRA 1HJOA 1KXPA 3R8EA 1DGKN 2I7NA 4PKIA 1P8ZA 2FF3B 4EIAA 3LL3A 2FXUA 1X9JA 3VEXA 4J8FA 3H3NO 4MO4A 4YDUC 2P9UB 4BR5A 3VETA 4BGBA 4CZGA 4FO0A 4CBXA 2D1KA 1KAXA 1CZAN 4IJNA 5E84A 3AAQA 4CZFA 2YHWA 2NRHA 2QM1A 4A2BA 3LDQA 1HKCA 1HX1A 2VYPA 1G99A 5EOYA 3OHRA 3MK6A 4NB4A 4H5TA 3VF4A 3WXIA 3EKUA 1NGAA 2BUPA 5FPDA 1JCEA 2V7YA 4C23A 2EWSA 1BDGA 3GBTA 4IO8A 1ESVA 2CH6A 2CGKA 3KZBA 3O6WA 4FL9A 3QFPA 1SQKA 1GLFO 1YAGA 5AZJA 1BG3A 1LOTB 2YHYA 1MWMA 4JD2B 5F1XA 1HUXA 5ADXH 1TYQA 4DB3A 3CQYA 1HLUA 3ZX2A 3VEZA 4FPAA 2A3ZA 2A41A 2IIRA 2P9SB 4EHTA 4I6MA 4JNEA 2DPNA 3O1BA 3CJCA 4BQLA 3MDQA 3RSEA 3VEWA 1XUPO 1QQNA 3BEXA 1D4XA 1T6CA 4BRAA 4WQ4A 3F9MA 3IMXA 2D0OA 2FSKA 2ZGYA 3H1QA 4BRGA 3VEYA 4WYBA 5EXWA 4NO7A 4BR4A 3HBTA 5F0XA 4RWTA 1RGIA 3LM2A 4FWQA 3ZX3A 3GL1A 3FZKA 3LDLA 2ASPA 2H3GX 4M7XA 4FWRA 3FZHA 2A42A 3DWLA 3D2EB 5AQVA 2GEMA 5AQGA 3WUHA 1MDUB 3EO3A 3VERA 3HI0A 3KVGA 5ELZA 3R9PA 2QW9A 1GLAG 3A5LC 5EY4A 2YI1A 4RCHA 1X3MA 3L4IA 4YDUA 4BROA 3GDQA 4BRKA 3QB0A 2V7ZA 1HKGA 1GLBG 3SJHA 3FZMA 1XC3A 3CI5A 5TKYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B1UB 1ASVA 2B4JA 3RMCA 5BN8A 3QEVA 4CEDA 3AY9A 1ATRA 3OA9A 4R5PA 3ZSVA 2ITGA 5M1KA 3KK3A 1P90A 3CHWA 4H4OA 4JK8A 1C0GA 4CERA 3PIPL 1NJZA 4JD2A 3OYHA 4HHTA 1D9FA 2BGGA 3KD5E 2UXDK 2F9WA 4CF1A 3J7YP 4W5QA 4DTXA 4BQZA 2BE2A 3I8DA 4FCYA 2WC9A 2Z1JA 3FE1A 3H45C 2UYTA 3J8AA 4DR1K 1KRPA 1NJYA 2J4RA 4CJ5A 2BDPA 3A8YA 2O8FA 4E1JA 1SL2A 2FLOA 5HL7L 1KVCA 1JLBA 3BF3A 1XWLA 1NMNA 1T3VA 1IG8A 3O80A 3BDPA 4DV5K 4FYDA 1SUQA 4CHZA 2O8BA 4M45A 4FZZA 3TARA 2RN2A 4CJTA 4CJ4A 4B9LA 3VOVA 4CD3A 2PFUA 1SL1A 3A2FA 4AF1A 2F8SA 3K5OA 4KTZA 3WNHA 1WNSA 3T7ZA 2QTDA 3MEGA 1JLQA 3F9KA 4QAGA 3S41A 3LP2A 2YJEA 1HNZK 3O8MA 5IT9O 1RT6A 1RDAA 4DTSA 4MQ3A 1CXQA 3TSQA 2E1YA 1ZBIA 5DM6L 2OYQA 3MCPA 4FJJA 2P9KA 4BRMA 4F2RA 1R59O 4WFBL 5GIOA 1NGEA 2F8TA 1S22A 3OS0A 3IUCA 4Y1CA 3DXKB 3CC7N 3U8XA 2D0CA 4CHOA 4J2EA 4KHNA 2O4GA 1DT9A 3A5NC 1RT1A 4CJKA 5JICA 3AA4A 2G8HA 2VCPA 4FJGA 1BO5O 3AA2A 1IKXA 4CZHA 1IG9A 4KHYA 2P5GA 4DR7K 2W6LA 3HO1A 3SI6A 3KK2A 2KQ2A 5HBMA 3U3GA 3OYLA 2RF2A 4B1XB 3CJ7A 4IDKA 4WCEL 4B8AB 4AHCA 3MMVA 4BRHA 3UE5A 3OS2A 2OZMA 4LF7K 1XNRK 3C95A 2A1SA 3CF5L 3CJ1A 3JAMO 1NM1A 4G1QA 3HSTB 4B9QA 3K57A 5J2NA 4AM6A 3M8RA 1LAWA 5M1QA 3F2KA 1YVUA 3O9QA 4H0PA 4CHQA 3THWB 1EKEA 4CK1A 1HR0K 1YIJN 4JHDB 2ITMA 3K0SA 3O08A 5E41A 1Z6RA 4PL8A 1VRUA 4JKAA 4DSLA 3VQPA 1HYVA 2KTQA 3SUPA 2FF6A 1B9DA 4ISEA 2VWJA 2B5JA 5AZIB 4CJLA 3LDNA 1QSYA 5AQJA 4KI6A 4H0OA 3QIOA 3SUQA 2P51A 3VQQA 4H0XB 3DLLL 3GOIA 5KTQA 4RG8A 2EHGA 2QWQA 4DSJA 1E4GT 3THXB 2FSJA 3OJSA 3EKSA 1Q18A 1OKJA 3EL2A 4E1NA 1VQ5N 4BRFA 5KPTA 5C0YA 1RBSA 1VRTA 1BUPA 4C8LA 1IKYA 3F73A 1KSPA 5HRSA 4BR9A 4DV7K 1TUYA 3PSFA 1HNVA 1EQYA 1S6PA 3ZSZA 4OPKA 4CECA 2DFEA 3CG7A 2OPPA 3K9JA 4KRFA 4MO5A 5GAHP 5AFUH 4BR0A 2Y1IA 2QWPA 1NNEA 3E1YA 4CHNA 1ZYQA 4CD1A 4HWIA 2QWNA 3K2PA 2IS3A 3AVBA 3VF6A 2A1RA 1YVNA 3ZEUB 4J2DA 1SL0A 2HVIA 3HPGA 2P9PA 2HHHK 1NKEA 4QS8A 4PL7A 1NWKA 1IH7A 3NDKA 5C25A 4B1WB 4X62K 2A40A 3RVCA 2ZQBA 1WLJA 1ATNA 4A61A 2AA4A 4U7BA 4E7LA 4LF8K 4XEIA 3WNFA 3G4SN 4DUZK 1CLQA 4F4KA 3M8PA 1WAJA 5HRRA 2BTFA 2RE2A 1WUAA 2AJQA 5AQMA 1QVGM 2G8FA 1J6ZA 4FWLA 4IZ9A 1KC8O 4BDYA 2YHAA 3RRHA 3IFRA 4MLEA 3VEOA 4I2PA 1NK7A 3DLHA 4CCHA 3IAYA 1C6VA 4LF5K 5CR4A 3H6EA 3CJAA 4DV4K 3ENBA 4CJSA 3VA0A 4M3XA 1HNWK 2YX6A 4CJWA 1YTUA 2OZSA 4YNQA 1N32K 4KREA 4CGGA 4J2AA 3HPHA 2E2OA 3LALA 3E9PA 3LP1A 2UXBK 3OYMA 4DQIA 4PY5A 2GUIA 1V4TA 3T19A 3AVHA 1Q8IA 3FZLA 3KD1E 3L6QA 4CEAA 3MAQA 2OANA 4Z4IA 4JKHA 3DM2A 4JLHA 1C0FA 1NGBA 1TK5A 1LWEA 3UIQA 1NK5A 4KHSA 1RFQA 4QS9A 1JXEA 5FRNA 3PLAA 3K5LA 4JRPA 3JS6A 3RSEB 4JKFA 1BOTO 3R3LA 3A5MC 3CETA 3EY1A 1BU6O 3QNNA 1EWQA 2F9TA 3PSIA 3VN5A 3ZT2A 3FGUA 2OTJN 4LF9K 3ZCMA 1RCHA 3ZETA 1U2VA 4I9LA 3TU5A 2D4WA 1JCGA 3OYBA 1QSLA 3CCUN 3MN5A 3NH0A 1N34K 3O1WA 2P9LA 2OTLN 1NK4A 4F8RA 1JLAA 1HJOA 2X6SA 1KXPA 3HP9A 1W0HA 3S3OA 3VEXA 2NNWA 4BGBA 2HNYA 5CYQA 4FO0A 4CBXA 3TANA 5CY4A 4IJNA 3AAQA 3RMDA 1WB9A 1RTJA 3TTDA 4Q5VA 5EOYA 3OHRA 3MK6A 2X74A 3SCXA 4FK0A 3VF4A 3WNEA 3O4NA 3OJUA 4KO0A 3AV9A 3EKUA 4B3TK 4E89A 3MWPA 2BUPA 1A5WA 1C0TA 1RDCA 1RBTA 4C23A 2EWSA 3S9HA 1Y97A 3AO3A 2OCEA 3QETA 1IV0A 3NF8A 2O8EB 1U48A 3SBTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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