The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
121
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structure length |
121
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Chain Sequence |
PASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAWRS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Nonstructural protein 1
|
| publication title |
A Transient Homotypic Interaction Model for the Influenza A Virus NS1 Protein Effector Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
34
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| structure length |
121
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| sequence length |
121
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-08-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3F5T A; 3RVC A; 2GX9 A; 2KKZ A; 3O9U A; 3M5R A; 3P31 A; 3EE8 A; 3OA9 A; 3O9R A; 3O9Q A; 3EE9 A; 4OPA A; 3KWG A; 3L4Q A; 3P39 A; 3D6R A; 2RHK A; 3KWI A; 3O9T A; 4OPH A; 3O9S A; 3P38 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RBR A; 1DT9 A; 3DRR A; 5EOY A; 5AQX A; 4I2P A; 4DSK A; 2NRZ A; 3TAG A; 3SNN A; 2CGJ A; 4FJ8 A; 2QWR A; 2VCP A; 1NGD A; 1EXQ A; 4JHD B; 2IVO A; 3GL1 A; 4WQ4 C; 1XI1 A; 4HUE A; 3DWL A; 3PY8 A; 1HQE A; 4JD2 B; 2A41 A; 2BH1 A; 4DR2 K; 3MEC A; 2RN2 A; 3CPW M; 4DQI A; 4DU4 A; 1YJN N; 2F9W A; 3D2F B; 1HKC A; 1RT1 A; 4JRP A; 1G15 A; 3QML A; 1YIT N; 4JEP A; 3KK1 A; 4FWN A; 1U48 A; 4XEI A; 4BRP A; 1IJJ A; 1L5U A; 4B08 A; 3TR8 A; 3F73 A; 4ISE A; 1LV5 A; 4DR5 K; 5FLX O; 2A6A A; 3OS1 A; 1FXX A; 4BGB A; 4CI6 A; 3WNG A; 1BO5 O; 4CJK A; 3AO5 A; 3V9Z A; 1NGB A; 4DUY K; 2KW4 A; 2VWB A; 3FZM A; 4CF2 A; 4M3Z A; 4B3O A; 4OVL A; 1TK8 A; 4M3R A; 3U6F A; 5M1K A; 3CJ1 A; 4DR3 K; 3P31 A; 2KFN A; 2F8S A; 4CZH A; 1HQU A; 4FO0 A; 4MQ3 A; 4CEC A; 2XY7 A; 3QIO A; 4YOX A; 4BRE A; 3I56 N; 1D4X A; 2O8F A; 1KVC A; 1W7A A; 2ZF5 O; 3L4Q A; 1HNX K; 2HHV A; 3CCU N; 4M3W A; 3K5M A; 2WOM A; 1B9D A; 5MLC Q; 2QK9 A; 2IVP A; 1K8K B; 1BUP A; 1J5O A; 3QO9 A; 1U45 A; 4IFE A; 2BUP A; 3GE1 A; 2ZM6 K; 2E1Y A; 3HVT A; 1R59 O; 5KRS A; 2O8D B; 2D0C A; 2P9S A; 1QTM A; 4HCB A; 4G9Z A; 4YY3 K; 4DCH A; 1U04 A; 5AZJ A; 1GOC A; 1K6Y A; 3O9S A; 1HJR A; 4KHN A; 4OGC A; 2UUA K; 4M45 A; 3ZCM A; 1EWQ A; 1U49 A; 5CY4 A; 5FRO A; 2KZZ A; 1I94 K; 3SK3 A; 3O4W A; 5EU7 A; 3NF6 A; 1VQO N; 4DTM A; 3FGU A; 3UKR B; 3LZJ A; 3J81 O; 4PKG A; 1V4S A; 3O3F A; 3C6H A; 3TAN A; 4MO5 A; 3AO1 A; 3G4S N; 1HUX A; 1X1P A; 5A2Q O; 4BR5 A; 3AVL A; 1MA9 B; 3DM2 A; 4B3R K; 2DFF A; 4HCC A; 2YNH A; 3PX4 A; 5CZ1 A; 5AQZ A; 4JD2 A; 3S3O A; 3AVF A; 1IKV A; 3AVH A; 2J4R A; 3OYG A; 4FXD A; 3THV A; 4ILJ A; 3D0P A; 2FXU A; 5BR8 K; 2UXD K; 3CFO A; 3SUP A; 4MLE A; 3QIN A; 4LSN A; 3NVM A; 2KHO A; 4IFV A; 1QQC A; 3LAM A; 3SMP A; 2AJQ A; 1JXB A; 2VG7 A; 4CGH A; 4E7J A; 2UUC K; 2QM1 A; 2HOE A; 3J7A P; 3PSF A; 1QE1 A; 4DR1 K; 3K5N A; 2OPR A; 4JI1 K; 1T8E A; 3R3L A; 1TGO A; 1NM1 A; 3QET A; 2OA8 A; 4PL7 A; 1TAU A; 1P8Z A; 3FR0 A; 3GOI A; 4A5A A; 4YFU A; 3OYA A; 5AQG A; 1ZBU A; 3DLG A; 1Y97 A; 3W3D A; 3OYB A; 1NJX A; 4DTX A; 1JCF A; 3TAB A; 1ZYQ A; 1I3A A; 2P9I B; 3VQA A; 1YXQ A; 2YKM A; 3CC2 N; 5IT9 O; 4EIA A; 5CE3 A; 2P9P B; 3HO1 A; 5I9E B; 4CZE A; 3J7Y P; 4NCA A; 4YOU A; 1JCE A; 5I3U A; 4CJV A; 4FJK A; 1JL2 A; 1K8K A; 4DQP A; 5IWA K; 3NAE A; 3SBT A; 3RRH A; 3NE6 A; 3CME N; 1JLF A; 4OPK A; 1L3T A; 2QWN A; 1NGJ A; 2WBN A; 4AHS A; 4DR7 K; 1O1W A; 3ID6 A; 4FJN A; 2XY8 A; 4KBO A; 2HMP A; 1QHT A; 2IIR A; 1HNZ K; 1RDD A; 4FOI A; 4CIG A; 2V7Y A; 2YJE A; 4BY9 C; 3U9Z A; 4NYF A; 1ITG A; 3HBT A; 1XC3 A; 3OYH A; 4CIF A; 1UA1 A; 1T7P A; 3EZW A; 3MN7 A; 1KRP A; 4CD1 A; 3K0S A; 1GLA G; 2QWM A; 3L3V A; 2HHW A; 4AHV A; 1JLG A; 4H5N A; 1OH7 A; 1BG3 A; 2BGG A; 5ELZ A; 4PWD A; 4O5B A; 3OYI A; 3MX2 A; 3NFA A; 3M8P A; 3H1Q A; 2HHX A; 1S22 A; 2HND A; 4LF9 K; 2KFZ A; 1FKO A; 3EN9 A; 3OYM A; 1T3V A; 2HMI A; 1LCU A; 4AHC A; 2F96 A; 1RIL A; 1CZB A; 1RBV A; 3G71 N; 3KK2 A; 4DV0 K; 4N76 A; 2A1R A; 4AIL C; 3V1Q A; 4IEI A; 3PO5 A; 4RW4 A; 4FLU A; 3LDO A; 1NLV A; 4RW7 A; 4DS5 A; 1NJZ A; 4H0V B; 3VEV A; 4KB1 A; 3C7N B; 5LMU K; 1L3V A; 2EHG A; 5F1X A; 3SV3 A; 1KLM A; 1BL3 A; 3U9D A; 5BPL A; 1Q82 O; 1XWL A; 3CCV N; 1WSI A; 1Q18 A; 4DTO A; 5FPD A; 4ZTF A; 4PKH A; 3WXK A; 4C1N K; 4CK3 A; 4E7L A; 2PZS A; 1WN7 A; 3KLI A; 3WUH A; 2VQE K; 3QEV A; 5E84 A; 3Q7C A; 4KTZ A; 3E9L A; 1D8Y A; 2VWJ A; 3ITH A; 4AM6 A; 3HI0 A; 1JLE A; 3WNF A; 2P9I A; 4F4K A; 4BDY A; 1P90 A; 1NMD A; 1WBB A; 5ADX A; 3H45 C; 2HNY A; 3AVB A; 4CJ5 A; 2E5L K; 1Q86 O; 4BR9 A; 4LF4 K; 3P83 D; 2JWK A; 4CE9 A; 3I0S A; 4BRA A; 3AO2 A; 3MN6 A; 3U3Y A; 1YVU A; 4B1W B; 4YDU A; 4HUF A; 2OPS A; 4E1J A; 4H0T B; 1QSY A; 4PHT X; 4M3T A; 1SQK A; 5FPE A; 5AFU H; 3CCE N; 3V81 A; 1QSL A; 1IO2 A; 2GWJ A; 2Q0R A; 4JI0 K; 3V9W A; 2QA4 N; 1HPM A; 3L2W A; 4CJQ A; 4Z4H A; 4DTR A; 4M7X A; 3R1X A; 2F7T A; 3K58 A; 1XNQ K; 3A5N C; 4CW7 B; 4B1X B; 4YOT A; 1NOZ A; 4OKK A; 4C8L A; 1YI2 N; 1EO1 A; 1N5Y A; 1ASW A; 2P9N A; 4FJH A; 3TU5 A; 3CXC M; 3ZT4 A; 3O4N A; 3FLC O; 5EY4 A; 5HRS A; 4FL9 A; 1NK8 A; 1HMV A; 3RR8 A; 1B92 A; 5CHI A; 1U6Z A; 2W40 A; 2PYJ A; 1T6D A; 1DLO A; 2W6K A; 3BGR A; 4WFA L; 3HRG A; 4Z4C A; 1YIJ N; 4OO1 J; 5CYM A; 1ILY A; 3HM8 A; 4FK4 A; 3NF7 A; 3HVR A; 4K8X A; 4BG9 A; 4BVP A; 2ZWH A; 2QWO A; 4PKI A; 4EZ9 A; 1N8R O; 3L2Q A; 3L2R A; 2F9T A; 1RGI A; 1GLJ O; 4FWP A; 3SAH A; 2P9L A; 2D5R A; 2QXL A; 1W9H A; 4AM7 A; 3K59 A; 4FJ5 A; 5JVH L; 4JKE A; 5CZ2 A; 3MX5 A; 4H4M A; 3OS2 A; 5TKY A; 4FPA A; 3TSQ A; 3VPZ A; 3C7N A; 4F3O A; 4CF9 A; 2IVN A; 4B9L A; 4FWK A; 2GTD A; 3MAQ A; 3AVM A; 5AQF A; 3JS6 A; 4CEZ A; 1D5A A; 2GUP A; 4LY7 A; 3D2E B; 4DF4 A; 3V1O A; 1CZ9 A; 4IBN A; 5AQJ A; 2IC3 A; 1D9F A; 2P9U B; 1J54 A; 1J53 A; 4FWL A; 3QEI A; 5J2N A; 4CJ7 A; 1NNE A; 2A42 A; 5JMV A; 2Y1I A; 3DRP A; 1KVA A; 2RF2 A; 3OYK A; 4Y1D A; 2HBL A; 2E4L A; 2I5J A; 5EVZ A; 3OS0 A; 1VQK N; 4DU1 A; 3RMD A; 3C94 A; 3H3O B; 1S72 N; 5BN8 A; 1SUQ A; 5GAG P; 4KHW A; 3T1H K; 2KTQ A; 1T6C A; 2OPP A; 1DTQ A; 5JLH A; 2HB5 A; 4KHU A; 3QBX A; 2QEX N; 3AVA A; 5KGW A; 4NCG A; 4WQ4 A; 3P1G A; 4CHY A; 1WOQ A; 4E0D A; 4H0P A; 2PYL A; 1ATS A; 3VQ5 A; 3AVN A; 4GVE A; 3KLG A; 3T1A A; 4EAH D; 2Y1J A; 4B9T A; 1JCG A; 3U3G A; 4ILG B; 2IS3 A; 5AQN A; 3ULE B; 3D6R A; 4YHH K; 3HXM A; 4DSE A; 4AH9 A; 1W0H A; 3O3G A; 3MXJ A; 3KKS A; 1KQS M; 3SBG A; 3R9P A; 3TAM A; 4BRQ A; 2E8A A; 3B8A X; 1GLC G; 2YHB A; 3H3N O; 3VF4 A; 1S6Q A; 3TTC A; 4CK1 A; 4DHY A; 4DTJ A; 5E26 A; 1KCF A; 4M7Y A; 1JXE A; 3CER A; 1HLU A; 3UKU B; 3SPZ A; 1NU0 A; 2DFH A; 3ZEU B; 4BC3 A; 2E6L A; 2WON A; 4ZHR A; 1SZ2 A; 3EYZ A; 4CFD A; 1U47 A; 2O8F B; 4ID5 A; 3I0R A; 1BA1 A; 4DTP A; 2YI1 A; 2VG5 A; 3ZT2 A; 3N4Q A; 1Z25 A; 4CBX A; 3UE5 A; 4H5V A; 1VQL N; 4C1N I; 2RE2 A; 3VA0 A; 1XUP O; 3B6P A; 3ATU A; 1RBS A; 1SL0 A; 5HRP A; 4MDA A; 4FK0 A; 2A40 A; 3C0B A; 1Z26 A; 3AVI A; 4N47 A; 4NLB A; 5DK5 A; 3CJB A; 2KKZ A; 2NRH A; 4L3Q A; 1NK7 A; 2QKK A; 1Q81 O; 4AQY K; 5GAD P; 3DI6 A; 1K9M O; 3CC7 N; 1RDW X; 1S3X A; 2P1J A; 4JKD A; 3L8B A; 1M90 O; 4XH1 A; 1LW2 A; 5SWM A; 4FWQ A; 2GUI A; 4NXN K; 3KJV A; 3NGY A; 1XHZ A; 2P9U A; 5CR4 A; 2ASO A; 3ZSO A; 3O9T A; 2ATQ A; 3SMS A; 3LWL A; 4N5S A; 4NO7 A; 2EX3 A; 4FK2 A; 3ZT0 A; 3HOT A; 4OGE A; 2ZQB A; 3AO4 A; 2I7N A; 3D7E O; 3BP8 A; 3W0L A; 1LW0 A; 2OTJ N; 2NRW A; 3CJC A; 3AA2 A; 1BCO A; 1HKG A; 3VER A; 2JLE A; 1RT6 A; 1NK9 A; 3KWG A; 3HP6 A; 1REV A; 4CER A; 4FWS A; 2XO7 A; 1EP4 A; 4IO8 A; 3BY5 A; 4JRQ A; 2E2P A; 5BPN A; 1VQ9 N; 3M1F A; 4CEQ A; 1ASU A; 3DJC A; 3VQ7 A; 4DR4 K; 3ULE A; 2WFB A; 1NJI O; 4FJL A; 5HRR A; 1BHL A; 2UU9 K; 1TL1 A; 1X9S A; 3UB5 A; 4J2D A; 2UUB K; 4IWV A; 3WXI A; 4KFB A; 4A5B A; 5F2R A; 4IKF A; 3SUO A; 3P4I A; 3VEX A; 3V9X A; 2A3Z A; 3L2U A; 3TPQ A; 3MEE A; 3OY9 A; 1QZ6 A; 3UKU A; 1W2B M; 3ZEU A; 5AZI B; 4FYD A; 2YNI A; 3GG4 A; 4O5F A; 2HHS A; 3AA4 A; 2Q3S A; 3NBP A; 1S6P A; 4DU3 A; 2UYT A; 3TI0 A; 1UA0 A; 5HLF A; 3RRG A; 2FLO A; 3PSI A; 3VQP A; 2ZJQ L; 1BDG A; 3J7Z O; 3LDS A; 4CHO A; 3UIQ A; 1VQ5 N; 5K14 A; 4LD0 A; 2XRI A; 4LF7 K; 1YT3 A; 3VQ6 A; 3BDP A; 4W5N A; 1QVF M; 4Z94 A; 3OBW A; 1S9E A; 3BZK A; 2O8B B; 4JK8 A; 2HBK A; 2YKN A; 5DM6 L; 1VQ8 N; 3RMB A; 3L0Q A; 4NXM K; 5LMN K; 3ASM A; 4CGJ A; 3TAR A; 2YHW A; 4BR7 A; 3WQU A; 2ZJR L; 3HT3 A; 3VOV A; 4WFN L; 5LL6 Z; 1HR0 K; 1VQ4 N; 1C0M A; 3PX6 A; 4C8O A; 3F5T A; 3O1B A; 2YCH A; 4UY8 O; 4B9Q A; 1HKB A; 5J2M A; 4DWI A; 4BC4 A; 2YNF A; 5HOO A; 3F9M A; 1TL3 A; 2BAN A; 3L2V A; 5AQM A; 2FC0 A; 4CJE A; 1IH7 A; 4GVM A; 2HVI A; 4LSL A; 5HRN A; 3HPG A; 2NRT A; 2D1K A; 4H0X B; 4BDZ A; 1G99 A; 3PIO L; 1GLF O; 5FRN A; 2ASM A; 2Q97 A; 3RMC A; 1MDU B; 4ID1 A; 3KIO A; 4M41 A; 3NH2 A; 4NYN A; 1RDA A; 4FZZ A; 5C2D A; 1TVR A; 4IZ9 A; 4CFA A; 1VQP N; 3CD6 N; 1RDC A; 4FLX A; 1K8A O; 3EE9 A; 4H5W A; 4HTU A; 1QQM A; 3VGM A; 1IKY A; 4LFC K; 4DSI A; 1ATR A; 1VSH A; 4YOW A; 3O5B A; 3WEE B; 3AAP A; 4KHY A; 2DPN A; 3OHR A; 5EX5 A; 4MDB A; 2OZM A; 3OYN A; 4J8F A; 1NOY A; 5LY3 A; 1DGK N; 1NWK A; 2HVH A; 2G8U A; 4CF8 A; 4DQR A; 3CET A; 5FRM A; 4FJ7 A; 1SL2 A; 4C8K A; 4FLZ A; 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5KGX A; 3A5L C; 1ESV A; 3RVC A; 3CQ8 A; 2P9L B; 3K2P A; 3TSU A; 3HPO A; 4R5P A; 4BRM A; 1RDU A; 2I7P A; 2KQ2 A; 3CIP A; 4FWR A; 1BCM A; 3FZK A; 5C25 A; 2Z1H A; 4O0I A; 3WEE A; 3OYL A; 4FJ9 A; 1DEJ A; 4FSV A; 2BTF A; 4YOV A; 4FLW A; 3HST B; 3NCI A; 4B3S K; 2PFU A; 4DSF A; 3Q7B A; 4H8K A; 4GW6 A; 3QNN A; 1T05 A; 4X65 K; 1S1W A; 1KD1 O; 5JLF A; 4PQU A; 3LM9 A; 1ZC6 A; 3M5R A; 3WQT A; 3QNO A; 4X64 K; 4HHT A; 4KRF A; 1H1V A; 1RTJ A; 1WSF A; 4HTL A; 3O9Q A; 3OYJ A; 3WXM B; 4DFJ A; 1LOT B; 4MO4 A; 3VF2 A; 3CI5 A; 1LWC A; 4DV2 K; 4PY5 A; 1ZBL A; 3P5J A; 4BR4 A; 5M1O A; 5AQV A; 5GAE P; 1TKX A; 5AQK A; 4BRH A; 3WXJ A; 3RR7 A; 4B1V A; 1FKP A; 3G10 A; 4CHZ A; 3SUN A; 2G8F A; 5M1Q A; 1VSD A; 1NGI A; 4CZG A; 4EZ6 A; 1YHQ N; 1GLD G; 2G8W A; 1C0U A; 1EWR A; 3ALY A; 3WT0 A; 2VWK A; 2OYQ A; 3M8Q A; 1XQS C; 5C24 A; 3SQ0 A; 3P39 A; 1SAZ A; 4JI5 K; 3ZLJ A; 1XC9 A; 1GOB A; 1KC8 O; 3VTH A; 4Q0B A; 1IG9 A; 4V19 S; 4BR2 A; 2CGK A; 3FFK B; 1IBM K; 1TYQ A; 4WFB L; 1GLB G; 3HM9 A; 2NZT A; 3NHG A; 1WSE A; 4H5R A; 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