1EO1A

Solution structure of hypothetical protein mth1175 from methanobacterium thermoautotrophicum
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MKIAIASSGTDLGSEVSRFFGRAPYFMIVEMKKGNIESSEVIENPSASASGGAGIRTAQIIANNGVKAVIASSPGPNAFEVLNELGIKIYRATGTSVEENLKLFTEGNLEEIRSPGSGRGRRRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title NMR Structure Determination and Structure-Based Functional Characterization of Conserved Hypothetical Protein MTH1175 from Methanobacterium Thermoautotrophicum
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
molecule tags Structural genomics
molecule keywords HYPOTHETICAL PROTEIN MTH1175
total genus 18
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02579 Nitro_FeMo-Co Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.130 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eo1A00
2RE2A 2QTDA 1O13A 1EO1A 2WFBA 2YX6A 1P90A 1T3VA 1RDUA 2KLAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FJGK 3VQ6A 2PZSA 4DFMA 4HHTA 3KKSA 3DLLL 3TSUA 3MXJA 2IIRA 3AAPA 3QNNA 5AQPA 3BY5A 1N8RO 2OYQA 2NLXA 4CJEA 3NBPA 4NO7A 5MLCQ 4DLEA 3OS0A 1RT5A 4Z4IA 1NK7A 4YHHK 1B9FA 2NZTA 4CK1A 4FM0A 3SAFA 5DM6L 4H0YB 5JS1A 4BC3A 4C1NI 2YNFA 1RNHA 2E88A 3SQ2A 5AQFA 4NLCA 1L3SA 3ZEUB 1NK8A 3BZKA 5GAEP 3VN5A 3S3OA 3SUOA 3MN7A 4ILHA 2RN2A 3LZIA 3ZETB 4GV9A 4R79A 1JLEA 3I8DA 1U48A 1NBWA 3VQ7A 1KVCA 2XY7A 5HOOA 5SZTA 3AGRA 1JL1A 2YV0X 3L2UA 3K5LA 3V6DA 1RT6A 3DRSA 2NRTA 4GV6A 1BDGA 3CC4N 2CH6A 2P9PB 1VSMA 4FWSA 4WQ4C 3M3ZA 4H0PA 4N56A 3H1VX 3CMAN 1SL0A 4MLEA 4BC5A 1SKWA 4GW6A 3SNNA 3I0RA 2RE2A 3HBTA 1KC8O 4I2PA 1TKDA 3JXUA 4TSXA 4KPYA 4DQ8A 4IDHA 1QSYA 4FLTA 3CM5A 3DLGA 5AR0A 3UE5A 1FKPA 1S9EA 1L3UA 2BUPA 4YORA 3ZX2A 1HJOA 3L2VA 4BRLA 3T19A 3V1OA 4CIEA 3V9XA 1MWKA 2EWSA 4E7IA 3RMCA 2EHGA 5HL7L 4CBWA 2HHXA 5DM7L 4CF8A 1RT7A 2QM1A 2O4GA 3MX2A 4EHUA 3H6EA 4CZJA 3V9UA 3KZBA 3NF7A 3TWHA 2YX6A 5KQ8A 1S1XA 2F8TA 5JLHA 3T1AA 1N34K 3AVFA 4BR0A 1CZ9A 3FFKB 1S72N 1EO1A 2NRVA 5AQXA 3KVGA 4CF0A 4ELUA 1RDCA 1VSKA 2QWLA 5KI6A 3O3GA 2QA4N 2KFZA 3K2PA 2QWPA 1N33K 3CCQN 4DKWA 5KRSA 5AZJB 4IEEA 4HTLA 1DEJA 3WQTA 3TANA 4FM1A 2V7ZA 2FLOA 4LSLA 3WQUA 5KQDA 4ELTA 1SQKA 1XWLA 1EX4A 5AQMA 3TPQA 4B1YB 2IVOA 4N47A 4BG9A 4CERA 4BGBA 3OYBA 3NCIA 3RR7A 1S9GA 3DXMA 2HHVA 4B9LA 1HLUA 2QWRA 3O1BA 2IAJA 3OYEA 2HW3A 3HL8A 3MX5A 3U3GA 2IC3A 4CJ5A 2I7PA 5KTQA 1Q81O 2G8IA 3JYTA 3DLBA 3NF8A 4I7FA 4BE1A 3VEOA 3HOTA 4QAGA 4F8RA 2O8EA 1Y64A 4HUGA 1XUPO 5AQKA 2EX3A 2BE2A 3LM9A 3TAFA 1NJZA 2HNDA 3ULEA 4AHRA 3SUPA 1BIUA 1BISA 1EWQA 1UWBA 1TKZA 4AHCA 3WXIA 3QB0A 5I42A 3WXLA 1L3TA 3AGKA 3M5RA 2NNWA 4FWQA 3F2KA 3CCMN 1WBDA 1RT4A 4LF8K 3CQ8A 2Q1NA 3DYAA 5LJVA 3DLRA 4H5WA 4DR5K 4U67L 4QS7A 5J2NA 1HYSA 4IWVA 3QEVA 4DS4A 5EXWA 1VQ8N 1OH7A 3KKRA 3LP1A 1JLAA 4M3YA 3QIOA 4DV0K 4FOEA 3AVHA 1A5XA 3O3FA 3ZT4A 4DUZK 4XIUA 4M3RA 3BGRA 3ZX0A 3OTOK 2IVPA 1U4BA 1U45A 2O8CA 1QSSA 4MDAA 4CEFA 3KK7A 4PQUA 3ZX3A 3CXCM 1NJYA 1C0MA 1S6QA 5C25A 3IMXA 2FBTA 4DTOA 4FW1A 1KVBA 4BC2A 4RW7A 4M41A 1GLEG 4BVPA 1C1AA 2PFUA 1BA0A 2X6NA 4JI7K 4DV7K 4E1JA 1JCGA 2E20A 2UUBK 2A1RA 1H1VA 3T1YK 4DTXA 3OYAA 4BROA 3AVNA 3CQYA 3VQ5A 4O5BA 5I9EB 1VQKN 1QE1A 3O9UA 5M1NA 4DUYK 1ILYA 4EZ9A 2PBDA 1K8AO 4CGDA 1C0GA 1EQYA 1HKBA 4OLBA 5LJWA 3HO1A 3AVBA 4HCCA 1JLFA 2D5RA 2WTUA 3MWTA 1VSFA 4B1UB 2YJFA 4Y0WA 1K9MO 4AHTA 4DR1K 1HUXA 4Z4CA 4JAXA 2UXDK 3HRGA 4LFCK 3ZYYX 3I0SA 3O9QA 4CD3A 3A0IX 2ASMA 1WAJA 2D0CA 4JKEA 4E89A 5AQGA 3AV9A 1RTHA 3FZKA 4JK8A 1DGKN 4FJHA 5LY3A 4WCEL 1VQNN 2G8FA 2IS3A 3HPHA 2E2QA 3RMBA 2Q2RA 5I3UA 3LP2A 1HMVA 2FF6A 1BOTO 2YKMA 4DF8A 4M3WA 3FZMA 4G9ZA 3SBGA 5BREA 3DXMB 1YXQA 4PUOA 1D9DA 4KTQA 4JKFA 4YOTA 4NCAA 5AFUA 2PYLA 1VSLA 3CERA 1GLAG 4C8LA 3ZEUA 4BC4A 4CEEA 3ATVA 4CIGA 1S6PA 5AJ3K 1MWMA 2OCEA 3T3FA 1GOAA 5BRHA 5H1SQ 4FJMA 1TGOA 4DQRA 4OX9K 3PV8A 4M42A 4W5QA 4UY8O 4CJ7A 3G25A 2E2OA 5C0YA 4FJIA 5AFUH 4BR5A 5KPZA 4CESA 3EZWA 1NJXA 2CGLA 4KKOA 3RRHA 1NKEA 1XNQK 5KPRA 1QSLA 3J7ZO 3DJCA 3GE1A 3KLGA 2KLAA 2VGNA 1Q8IA 1G15A 2OPPA 2Q0RA 4OKKA 2QWQA 1VQPN 4FXDA 1RT1A 2O8BB 4FLXA 3TAEA 4CJUA 4CFDA 4JYAK 5F2RA 1TK8A 3AVKA 3QBWA 3K9JA 2IDOA 3CJ7A 5KGXA 3HI0A 5CY4A 4KHNA 4PWDA 1QQOA 2ZJRL 1DKGD 2GBZA 3WUHA 4DU3A 5HRRA 2KZMA 3R6MA 4FPBA 5C2FA 2FSNA 5CR4A 3W3DA 3KD5E 3Q7BA 3VQ8A 4JHDB 3SLCA 1YI2N 4FK4A 2P9IB 4DV2K 4I9LA 3WEEB 4DR2K 5C15A 4OO1J 1X9WA 3CQXA 4FZZA 4QCLA 3QINA 4IOAL 1CXQA 2KTQA 5HRSA 1F21A 3RTVA 4DCHA 3DWLA 1TAUA 4XEIA 1U6ZA 2OPSA 2GV9A 1Q86O 1VQ5N 3E01A 3DMJA 3PX6A 3WEEA 3EKUA 3M1FA 2FBYA 3TTCA 3O4WA 3ZSZA 3SMSA 4KRFA 3RVCA 3ZSOA 3C6AA 2YHXA 3MXIA 4FJ9A 3ZCMA 3EYZA 2QKBA 3VMFB 4H0TB 3OYDA 4IEIA 1ZBUA 3UKUB 3C7NB 4DTSA 4DTPA 4LF4K 2P9LB 2BANA 4O55A 4MFBA 5BR9A 4AILC 3PLAA 3SUQA 3SPYA 3A5MC 4IO9L 3C95A 1D9FA 3K5MA 4ZTJA 1TV6A 4BR7A 3OS1A 1OKJA 2UXBK 4CHOA 2GUIA 4BE2A 4FYDA 1YVUA 4KB0A 4BRHA 3G71N 2JWKA 3ENHA 1KTQA 5C24A 1BO5O 1QZ5A 1OH5A 2O4IA 3VEWA 2NRWA 4CK2A 1WOQA 1W9HA 4JKGB 3VENA 5J2QA 3TTFA 3OJSA 4CEQA 1WB9A 2O8EB 4CZKA 5E84A 4ISFA 3KK1A 2ZE2A 4OVLA 2VG7A 4YOXA 4CGGA 3SQ0A 4OGEA 4CHZA 3KLFA 1QQNA 3P38A 4IFYA 4M7YA 3H45C 1LAVA 4JI4K 4DV6K 3LDPA 4KH5A 4E7LA 4V19S 4A61A 1RBSA 4NLBA 4EAHD 3V9ZA 4CHNA 4CGHA 3A8YA 4FWRA 4JKHA 3NDKA 1HRHA 3FE1A 3CMEN 4GY2B 3ENBA 2E2PA 4WF9L 3N4QA 1YTUA 2RHKA 4QS9A 2YNIA 3WT0A 3VA3A 4BQZA 1A5VA 3C94A 2X6SA 2XHBA 4LF6K 2ITMA 1FKOA 4B9UA 5M1KA 1LWEA 1VQ9N 3FLCO 3SUNA 4H0XB 1NLVA 1K8KA 4KI4A 1QQCA 1T6DA 2E6MA 4AM7A 3J81O 3L8BA 4H5NA 2AJQA 3DOKA 3DRPA 3I55N 4FWNA 1C0FA 3WXMB 1QZ6A 1U47A 3D7EO 1W97L 1QTMA 2ZGZA 5BPLA 4FJNA 4PY5A 5E26A 1VSHA 1KAYA 4M63C 3KJVA 3L6QA 1YTAA 4E7KA 1WN7A 3GG4A 4FWLA 4RW8A 5AZJA 4ELVA 4BRNA 2W41A 3VQPA 1KD1O 4RWTA 3VERA 4JK7A 1J6ZA 5CYMA 1ESVA 3S9HA 1TUUA 2OANA 3LDQA 3PSIA 4IKFA 1NGIA 4DU4A 3U9ZA 5BR8K 3TAMA 1NKBA 4DFJA 3THWB 1B92A 4HTUA 1GLFO 1X1PA 1BU6O 1HNZK 4YOWA 5C2DA 3QNOA 3MMVA 3F9KA 4MDBA 2G8WA 2HVHA 1ASUA 4B9TA 3T7ZA 2QI2A 1NWKA 2X74A 4W5TA 1P90A 4EP4A 1CZBA 3AVAA 1XI1A 4DSEA 3O3HA 1XMOK 1TUYA 3R1XA 3FZHA 1N5YA 3TAPA 3OJUA 1NK4A 4DQPA 3L4IA 2YJEA 4JNEA 4RCHA 3P31A 4JLHA 2PAVA 2YHBA 4KHYA 2FXUA 2WC9A 3IS9A 3NGYA 5HP1A 4IZ9A 3U4LA 2O8DA 3HJFA 3CPEA 1HPMA 3SJJA 4IO8A 3ZT0A 1J5OA 3MN5A 4JHDA 1JLGA 5JVGL 4YOYA 3AO3A 4PKGA 5GIPA 1VQ7N 1JJ2M 2FSJA 3D2FA 4FJGA 4M3XA 1WSJA 4I6MA 3VQAA 4WE1A 2W6KA 3O9TA 2A3ZA 2FC0A 4DMNA 4BVOA 3K58A 1V4TA 3RR8A 4J2DA 4CD1A 1ITGA 4PL7A 4CE9A 5HROA 1JLQA 3B8AX 3SZ2A 2Z1IA 2XY5A 5BN8A 1NOYA 1ZBHA 1WNSA 3CCUN 1JLBA 4LH5A 3NF6A 4FWPA 4DV1K 1EKEA 2HHUA 2H3GX 4YDUC 1BI4B 4CK3A 3KLEA 1DLOA 4H0VB 1VQON 4F3TA 3NGIA 3HSTB 3O8MA 4I2QA 2YI1A 4BRIA 3THVA 4BRCA 3WNHA 1HKGA 4FK2A 3CC7N 3RWUA 2UU9K 2WFBA 1RFQA 2JLEA 3L0QA 3MN6A 1I94K 3OBWA 4E7HA 1Q82O 1ASWA 1Q9XA 2CGJA 2KQ2A 1YJ9N 4OPAA 1L5UA 4A2AA 1YJWN 3QEIA 4H4OA 3CG7A 1T3VA 2PY5A 1N36K 3BF1A 4JD2B 1REVA 2UUCK 3AARA 3D2EA 3TABA 2QWMA 2QEXN 2GEMA 4MLHA 4WFNL 3J8AA 4CEAA 2Q31A 4ISEA 1O1WA 2YNGA 3DI6A 2BTFA 4KO0A 3ATUA 5KGWA 5M1PA 3A2FA 1YAGA 4C8MA 4M45A 3ULDA 5AZIA 4JS5A 4FLWA 1TK0A 3THXA 2VWJA 1E3MA 3VTHA 1BCOA 1L3VA 1TK5A 3OVNA 2V7YA 4CJVA 4HWIA 3VTIA 4F3OA 1XC3A 4HUEA 3MEGA 4E0DA 1IO2A 4L3QA 4CGJA 4E1MA 3TI0A 4O0IA 3I8BA 3OYKA 4FVUA 3W0LA 1NGEA 2P9NA 4Z4HA 4W5OA 1ZYQA 4Z94A 1NNEA 2A1SA 4E1NA 1I3AA 3IFRA 3CJ1A 3SQ1A 2ASPA 3NH2A 2Z1JA 5KPTA 1MU2A 5B8HA 4BRQA 1WLJA 3HXMA 3OYNA 1RDAA 5FRMA 2BGGA 3CFOA 5C12A 2ZQBA 3HVTA 3PY8A 1QVFM 4LF7K 4F2RA 4BACA 3BZCA 2F4VK 1R59O 5T7BA 1X3NA 4KB1A 3VESA 4CJ4A 3UKRB 5AQOA 4PA1A 4DFKA 1X9JA 1FW6A 4BY9C 5GIOA 2HBLA 4KH4A 1KFDA 3CJCA 1U04A 4H03B 3HM8A 1RGIA 4FVMA 1D8YA 5AQHA 2DTUA 5GINA 2E1ZA 3VQQA 3LL3A 4CZEA 4C8KA 1SV5A 2HMIA 3DLHA 1K8KB 3THWA 1HYZA 1X9SA 3RSEA 1ZC6A 3K0SA 4B08A 3TARA 4JK9A 5JVHL 2YCHA 4BDYA 1IBKK 4MO4A 4F9OA 3VEVA 4CEZA 5DK5A 3QMLA 2NUBA 1WSEA 4M7XA 4H4MA 4DTRA 2F8SA 3N4PA 2E2NA 3BDPA 4CJRA 4B3OA 4YNQA 1NKCA 3QEXA 4EFHA 3CCLN 1VK0A 4KTWA 3CJ9A 1C1BA 3AA5X 2YHAA 1X9MA 3O4QA 1KLNA 1NK5A 5EVZA 3WXKA 1IV0A 2OTJN 1LW2A 3ULEB 1BL3A 4JI6K 4A59A 5J1EA 2CH5A 4FJ8A 3QETA 1BIZA 3LP0A 1EWRA 3V9SA 2UXCK 2LSNA 4K42A 1S22A 4HUFA 1RDDA 5AQSA 4BQLA 3HM9A 5AQYA 3TSPA 4FW2A 4BGAA 3LDNA 2ITGA 2B6AA 5AQQA 1QHAA 4PKIA 5SWMA 4K0KK 4I6MB 2A6AA 3HP9A 4O5FA 4WFAL 4FJLA 5EY4A 4DSKA 4E7JA 2G8UA 4KHSA 4O4GA 5LMUK 4QS8A 2XRIA 1IG9A 2P5GA 1LOTB 3FGUA 1VQ6N 4N41A 4K25A 1RDWX 3CPWM 4BR2A 1Q9YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2RE2 A;  2QTD A;  1O13 A;  1EO1 A;  2WFB A;  2YX6 A;  1P90 A;  1T3V A;  1RDU A;  2KLA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FJG K;  3VQ6 A;  2PZS A;  4DFM A;  4HHT A;  3KKS A;  3DLL L;  3TSU A;  3MXJ A;  2IIR A;  3AAP A;  3QNN A;  5AQP A;  3BY5 A;  1N8R O;  2OYQ A;  2NLX A;  4CJE A;  3NBP A;  4NO7 A;  5MLC Q;  4DLE A;  3OS0 A;  1RT5 A;  4Z4I A;  1NK7 A;  4YHH K;  1B9F A;  2NZT A;  4CK1 A;  4FM0 A;  3SAF A;  5DM6 L;  4H0Y B;  5JS1 A;  4BC3 A;  4C1N I;  2YNF A;  1RNH A;  2E88 A;  3SQ2 A;  5AQF A;  4NLC A;  1L3S A;  3ZEU B;  1NK8 A;  3BZK A;  5GAE P;  3VN5 A;  3S3O A;  3SUO A;  3MN7 A;  4ILH A;  2RN2 A;  3LZI A;  3ZET B;  4GV9 A;  4R79 A;  1JLE A;  3I8D A;  1U48 A;  1NBW A;  3VQ7 A;  1KVC A;  2XY7 A;  5HOO A;  5SZT A;  3AGR A;  1JL1 A;  2YV0 X;  3L2U A;  3K5L A;  3V6D A;  1RT6 A;  3DRS A;  2NRT A;  4GV6 A;  1BDG A;  3CC4 N;  2CH6 A;  2P9P B;  1VSM A;  4FWS A;  4WQ4 C;  3M3Z A;  4H0P A;  4N56 A;  3H1V X;  3CMA N;  1SL0 A;  4MLE A;  4BC5 A;  1SKW A;  4GW6 A;  3SNN A;  3I0R A;  2RE2 A;  3HBT A;  1KC8 O;  4I2P A;  1TKD A;  3JXU A;  4TSX A;  4KPY A;  4DQ8 A;  4IDH A;  1QSY A;  4FLT A;  3CM5 A;  3DLG A;  5AR0 A;  3UE5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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