2P9KA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp and crosslinked with glutaraldehyde
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
411
structure length
393
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
molecule keywords Actin-like protein 3
total genus 126
structure length 393
sequence length 411
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9kA03
2YHXA 4MLEA 1TUUA 4M7YA 1ATNA 2A5XA 3C7NA 2P9UB 2VCPA 1OKJA 4DQ8A 3KVGA 4BRNA 2E2QA 3M3ZA 5KPZA 3VEWA 2W41A 1K8KB 1NGHA 1NWKA 3GBTA 3EKUA 3D2EB 4FWSA 4FOEA 2QXLA 3MMVA 2P9LB 4QS7A 4EHTA 5AQHA 5JLFA 3GDQA 3H1VX 2HF3A 5AZIA 5AFUH 3U9ZA 1HUXA 3EO3A 4MO5A 1NGIA 3ZETA 3CQYA 3VGLA 2FSNA 3U9DA 1NGBA 5BREA 4A2AA 5BN8A 4I6MA 4M7XA 3EKSA 4IJNA 4RTFD 3CJAA 1GLCG 3ATUA 2QWOA 3VESA 3VEXA 4MLHA 5E26A 3ULEB 4FWNA 4CZJA 3OHRA 3MN7A 5AQVA 1MWMA 2IVOA 3BF3A 3O4WA 2CGLA 3VF4A 2BTFA 1J6ZA 3CIPA 2AP1A 1T6CA 5BRDA 3DAWA 3VENA 4BVPA 3MN6A 2Q0RA 2I7NA 4BGBA 2P9SB 5JICA 1QQNA 1HJOA 1E4GT 2P9UA 4BRCA 3AY9A 3ENHA 1X3NA 2V52B 1LOTB 2VWBA 3CQXA 5AQQA 3M1FA 3CJ7A 1SZ2A 1K8KA 4FO0A 3R6MA 3D2EA 3KHYA 1HLUA 3HZ6A 2E2PA 1Y64A 2P9LA 3VEZA 4BR2A 3QBXA 3U4LA 4BRDA 3DXKB 3VF2A 4CZIA 4Z94A 1X9JA 1IG8A 4BG8A 1Q18A 4E1JA 3VEVA 3A0IX 3UKRB 4B1VA 2GELA 1V4SA 1NBWA 2Q97A 4B1XB 3W0LA 3WQUA 4FWOA 2J4RA 2GUPA 1MDUB 2FF3B 2P9NA 3SK3A 3SLCA 3ULEA 3H3NO 3CETA 4B1WB 1BWFO 1ZC6A 3QMLA 2QWPA 1T6DA 2GWJA 2QM1A 2ZWHA 4H03B 4AM6A 2GEMA 2V7ZA 5FPNA 2HF4A 4B1YB 3FR0A 3H45C 2YJEA 1TYQB 3O80A 4AM7A 1IJJA 4H0TB 2P9SA 2FF6A 4L3QA 3WXKA 3P4IA 3U8XA 2H3GX 1GLBG 5BN9A 2P9PA 4CZHA 4DHYA 4JD2B 4BG9A 2AA4A 1HKGA 4H5VA 5ADXH 1TUYA 1NLVA 2ASMA 3W3DA 3A5LC 4NB4A 1BO5O 3FZLA 5EVZA 1MA9B 5BRHA 2P9IB 3A5NC 4H5NA 3DXKA 1HX1A 1KAXA 4WQ5A 2A40A 3L0QA 5AZJA 2YI1A 3L4IA 4BRQA 4FOIA 4GY2B 4M63C 1XQSC 4WQ4A 3O8MA 4Y0WA 5FPMA 3C0BA 1BUPA 4CZEA 4B1UB 5EOYA 5KPTA 3IMXA 3GE1A 4K25A 2KHOA 2NLXA 2Q1NA 4H0XB 1GLJO 1NGJA 1KAYA 3CJ1A 2CGJA 1U6ZA 3MN5A 4CZMA 1GLAG 1XUPO 3LM2A 1U2VB 4BVOA 1WOQA 2CH5A 1BDGA 3H6EA 4FWQA 2D4WA 3HTVA 4BR0A 1P8ZA 1TYQA 2GWKA 3VPZA 5KQ8A 3IDHA 3BP8A 4KBOA 3FFKB 2FLOA 4CJ7A 2CH6A 4BRAA 3LDQA 1WUAA 4C23A 2WUSA 2P9KB 4K41A 2QW9A 5BR9A 3M6GA 4BQLA 2A3ZA 5CE3A 4YDUA 5AQYA 4XH5A 3ZEUB 2P9IA 4BREA 5AQUA 1D4XA 1BOTO 3EN9A 3TPQA 3JS6A 3VF6A 4JAXA 3D2FB 3RSEA 4BRHA 1QZ5A 3AARA 1S22A 2A6AA 5AQIA 1NGDA 3MDQA 3H3OB 2HOEA 5AQJA 2NRHA 3VOVA 2W40A 5EXWA 5F2RA 5AQMA 4DCHA 4B9QA 4CZFA 4QS9A 3I8BA 1QZ6A 2PAVA 3J8AA 2IVNA 1SQKA 1BA0A 4FL9A 1YUWA 1RDWX 3S41A 3HI0A 4ISFA 3FZHA 3WEEB 3IFRA 4BRKA 1QQMA 3AAQA 2YHWA 4RCHA 5AR0A 3VGMA 2V51B 4BR4A 4WYBA 1NGEA 2Q0UA 3VEOA 3R8EA 2P9KA 3D7EO 4EAHD 3HSCA 2D0PA 2IVPA 2CGKA 3WXIA 4NO7A 3GL1A 2GTDA 3ID8A 1LCUA 5AQXA 4H0YB 2ZGYA 1NMDA 4BRIA 3BF1A 3SMSA 3CERA 3H1QA 1X3MA 5AQGA 4QS8A 4IJAA 1V4TA 3DJCA 2ITMA 3D2FA 4EIAA 2QWRA 5AQKA 4PL8A 3SMPA 3ATVA 4H0OA 3WUHA 5EY4A 4BRFA 5AQTA 4FWRA 3QFUA 4FWKA 2QWLA 2E1ZA 3WQTA 5LY3A 2QWMA 1QQOA 5AFUA 4B1ZA 1BU6O 5E84A 3KZBA 4PKIA 5JLHA 5AQFA 3WT0A 3L6QA 3G25A 2D0OA 2I7PA 3F9MA 3QICA 4IZ9A 4A2BA 1ZBSA 3ZETB 4BC5A 5ELZA 3ZX0A 3UKRA 5KQDA 1SAZA 4XH1A 5BPNA 3UKUB 4IXCA 3LM9A 1YAGA 5TKYA 3FE1A 1ATRA 5FPDA 1BA1A 4H0PA 4ISEA 3GOIA 5AQSA 4FSVA 4BROA 3LDOA 4IWVA 4PKHA 1R59O 3FGUA 4H5WA 2FXUA 4JHDB 4F9OA 5AQZA 2E2OA 1RGIA 2EWSA 5AQRA 4CBWA 5F1XA 4CD3A 4BR7A 1H1VA 5AQWA 4WQ4C 2IIRA 4FWPA 3EL2A 4HWIA 1XC3A 1JCFA 4BQZA 2ASPA 1C0FA 4BRGA 1Z05A 4H5TA 1KXPA 2A42A 3CI5A 2F9TA 1CZAN 5BRFA 1GLEG 2Q2RA 4JD2A 4MO4A 3R9PA 4RWTA 4BRLA 1ZXOA 5JMVA 4A62A 3ZX2A 1RFQA 4FPAA 2VYPA 2ZF5O 2FSJA 1DKGD 4H0VB 3QB0A 1T44A 3LDNA 2QWNA 4HTLA 4CBUA 3LL3A 4O8KA 2PBDA 3UKUA 4BRPA 3UE5A 3B8AX 3MN9A 4H5RA 2P9NB 4CBXA 4YDUC 2UYTA 3HM8A 1NGFA 3CJBA 4FWLA 3EZWA 3VGKA 4EFHA 4JHDA 5AQOA 1U2VA 3CJCA 4PKGA 3TU5A 2YHYA 1DGKN 4LC9B 4BRMA 3O1WA 2D1KA 3IUCA 3FZFA 3VEYA 4O5FA 3WXJA 1C0GA 1NM1A 3CHWA 1NGGA 1HKCA 3A8YA 4CD1A 5ADXA 3O5BA 3A5MC 2P9PB 2QWQA 4K42A 3VETA 3ENOA 4GNIA 2NZTA 2BUPA 2Q31A 1HPMA 4FWMA 1YVNA 4BR9A 4XEIA 2YJFA 5I9EB 1ATSA 2FSKA 1KAZA 3BUZB 3QBWA 3I33A 4FPBA 3ZEUA 5AQPA 2DPNA 3O08A 4BGAA 3DXMB 1EQYA 2E2NA 2ASOA 3FLCO 5AZJB 4JN4A 3UB5A 5BPMA 1E4FT 3VERA 4BR5A 2F9WA 3O6WA 3CJ9A 4CZLA 5AQNA 3SJHA 3HBTA 1GLLO 3C7NB 4CZKA 4EHUA 4BC3A 2E8AA 5AQLA 4BC2A 1S3XA 3O1BA 4CI6A 1DEJA 3FZKA 3QFPA 1GLFO 4IO8A 5LJWA 1JCEA 4DB3A 5LJVA 2V7YA 4J8FA 4JNEA 1Z6RA 2E88A 5BPLA 4K43A 1NGAA 2YCHA 5AZIB 3LDPA 4A61A 3DWLA 3LDLA 1MWKA 3MCPA 5F0XA 3H46O 3A5OC 2OANA 3WEEA 4ISGA 5B8HA 2Q36A 3AAPA 3BEXA 4I6MB 3GG4A 3JXUA 3MK6A 4XH4A 1JCGA 1YXQA 2E20A 1QHAA 2HMPA 4PL7A 4CZGA 3WXLA 5EX5A 2E1YA 3QDKA 4WQ5C 2A41A 3ZX3A 3FZMA 3DXMA 4BC4A 5FPEA 1GLDG 3RSEB 1G99A 2ZGZA 1ESVA 1NGCA 1BG3A 5KPRA 1HKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGDA 4M7YA 3OYBA 3C7NA 1QVGM 2P9UB 2VCPA 4I7FA 2E2QA 4DTOA 3C6HA 3VEWA 3ZLJA 1N5YA 3GBTA 1S1WA 4LSLA 3D2EB 4FWSA 4CFBA 3MXIA 4QS7A 3GDQA 4YOTA 3H1VX 4I2PA 1RDAA 3C95A 3WNFA 2HVIA 5AZIA 5AFUH 4CEFA 3U9ZA 5C2DA 4MO5A 3L3VA 1D8YA 3CFOA 2C1IA 4IEIA 3KK2A 3DLRA 4M7XA 2QWOA 3EE9A 4NXNK 3VEXA 4M3XA 4CZJA 3OHRA 1KD1O 1KVAA 4CE9A 1WSJA 4DR3K 2IVOA 2CGLA 4DLGA 4CJ4A 4FVUA 4KTZA 1J5EK 3IRXA 4O44A 4BGBA 3ULDA 5IWAK 1HNVA 2VGNA 1E4GT 2P9UA 4BRCA 3D6RA 1OH7A 3ENHA 1LAWA 2VWBA 5AQQA 4YNQA 4U7BA 3CJ7A 1L3UA 4WCEL 3SBGA 3D2EA 3KHYA 2DFHA 1HLUA 1Y64A 3AVLA 1C1BA 3TSQA 2F4VK 1L3TA 5AJ3K 4H4OA 4A5BA 1ZBUA 1Q18A 4E1JA 4DFJA 1UOCA 2GELA 1JXBA 2GV9A 2HVHA 4DF4A 1NBWA 4WF9L 1VSFA 3W0LA 4FWOA 2J4RA 4LFAK 3SAGA 1UAXA 4KB1A 3K5OA 4B1WB 1RTDA 3QMLA 4LF6K 1S1TA 4Z0UA 2QM1A 4B1YB 3H45C 4CGJA 3QO9A 3VQAA 4GV3A 1IKXA 3J7YP 4FJHA 1QTMA 5HRPA 4E7LA 4DR5K 1NK6A 2H3GX 4AQYK 3T19A 4CZHA 2Y1JA 4JI2K 1Q9XA 3QETA 1RDBA 3CYMA 4BG9A 1HKGA 4F3OA 5ADXH 2QKKA 4FJXA 4DV6K 4NB4A 4N56A 3FZLA 2P9IB 3A5NC 3ZSVA 1KAXA 4OKEA 2YI1A 1LV5A 2BANA 2FBXA 4GY2B 4WQ4A 4UY8O 3F73A 4PA1A 3HP9A 2WC9A 2W42A 2KHOA 5J2MA 1GLJO 5CY4A 1NGJA 4GMJB 4CZMA 1U47A 3NF6A 4BVOA 3LPUA 3LP1A 1BDGA 1NOYA 1TV6A 3K58A 2X74A 1I94K 3NAEA 1BHLA 5KQ8A 3OS2A 4CHNA 2CH6A 2D0AA 3LDQA 1U48A 2NRWA 2WUSA 2HHSA 2OYQA 5M1OA 5BR9A 5DMRA 4DSLA 4BQLA 2A3ZA 1VSJA 4YDUA 1BCMA 4XH5A 3SUQA 3K5LA 2P9IA 4BREA 3JS6A 3QINA 3OW2M 1TGOA 1ITGA 3ITHA 2JLEA 3D2FB 4BRHA 4YHHK 1X9MA 1TAUA 1QZ5A 4JK9A 4CJRA 3ZSQA 5AQIA 4J2AA 1RT4A 3J7ZO 1NGDA 1WSFA 3H3OB 1XHXA 3VOVA 1UA1A 1U49A 3DLEA 3NCIA 4CZFA 5M1PA 2HBKA 2UUAK 4EP4A 1TK8A 3AVKA 1YIJN 2G8VA 4KV8A 1YUWA 1MU2A 4IFEA 5C12A 3OYEA 1NKCA 3FZHA 3P1GA 1D9DA 4BRKA 4RCHA 5AR0A 3VGMA 4I9QA 3VQBA 4BR4A 4ILHA 1KC8O 3D7EO 1S1UA 2HBJA 1I3AA 2D0PA 2IVPA 4FW1A 4M3ZA 3ID8A 4BRIA 1NMDA 3KLFA 3SMSA 3K5MA 4DV5K 3D2FA 4NLCA 1SUQA 3T69A 2X6SA 3PSIA 4BRFA 1ASUA 3PIOL 4FWRA 4FWKA 4RG8A 2E1ZA 3CYGA 3WNGA 1BU6O 3AVJA 3DRPA 5E84A 4PKIA 5JLHA 4X66K 3I8DA 5AQFA 3WT0A 3L6QA 4OX9K 2XRIA 4EZ9A 5J2NA 2D0OA 5GAEP 1B9FA 1XNRK 5GAGP 4JI1K 1IBLK 3OYJA 2D0BA 4AH9A 4YOYA 3ZX0A 5KQDA 1SAZA 3UKUB 3AVBA 3LM9A 2WBNA 1NMNA 1BA1A 1K6YA 4ISEA 5KGWA 3VQDA 2KLAA 3GOIA 1VQPN 3ZSOA 3O3FA 5SWMA 2YNGA 4M3YA 2FXUA 3H08A 4JHDB 3OS1A 5AQZA 2PY5A 4CBWA 1RGIA 5AQRA 5E41A 3M8QA 3SQ1A 1YT3A 4OGCA 4DSFA 5AQWA 4WQ4C 4FWPA 3K0SA 2EX3A 3EL2A 3RR7A 2YKNA 1BCOA 4H5TA 4AHUA 1BGXT 4KKOA 2KQ2A 3L2VA 4U67L 3K57A 2Q2RA 3CCVN 3C65A 4C8MA 4ILJA 3P5JA 3OVNA 4JKFA 3I56N 4A62A 4FPAA 5KRTA 1SKSA 4ICLA 2FBVA 4M3WA 4CBUA 3LL3A 3V1QA 4FJ7A 3UKUA 4DQPA 2KKZA 3B8AX 3MN9A 1NJYA 2P9NB 4YDUC 1RTIA 2ZM6K 1RCHA 3U3GA 3HXMA 5KI6A 3CJBA 4W5TA 4FWLA 3OTOK 3VGKA 1IV0A 4JHDA 2PYJA 4BDYA 5AQOA 1U2VA 1L3VA 4KI4A 4PKGA 4FW2A 2QKBA 2YHYA 4IO9L 3O1WA 2KZMA 5KGXA 3TAGA 1FJGK 1C0GA 3AA5X 1N8RO 3A8YA 3V1RA 3HK2A 1IKYA 4KREA 3A5MC 4BDPA 3J81O 2D5RA 1D9FA 4Z4HA 1RT6A 1EO1A 3IKMA 4DU1A 5I9EB 4CFAA 1T05A 4OKKA 2FSKA 1KAZA 3QBWA 4CEEA 5C10A 2DPNA 3O08A 3DXMB 3KLGA 4JV5K 4KH4A 1F21A 3O6WA 4H8KA 5JS1A 3CJ9A 4CZLA 5AQNA 3SJHA 3QERA 4CJFA 4EHUA 1DTTA 1W9HA 4TSXA 1S3XA 2O8BB 1DEJA 3QIPA 4O8UA 1LW0A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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