5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
b'AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
5TKYA 3LM9A 2H3GX 3ID8A 3EO3A 4JD2A 3LM2A 3L4IA 5AQHA 3DJCA 3HI0A 4CZEA 3C7NA 1HX1A 2BTFA 3VEVA 1BOTO 1S3XA 1TYQA 2FXUA 3AY9A 2E1ZA 3UKUA 4BRDA 4CZFA 4WQ4C 2GEMA 3KVGA 3FZLA 1KAYA 1SZ2A 4EHUA 2QWLA 3CQXA 5AQJA 2ZF5O 3VGKA 2QWPA 3H6EA 3TPQA 1G99A 4H5WA 2D4WA 3GDQA 1NM1A 3BUZB 4BR2A 2IIRA 1U2VB 1NBWA 2HF4A 2I7NA 2KHOA 1NGBA 4XEIA 4CZHA 3LDPA 4QS8A 1HJOA 2Q2RA 2VCPA 3FZMA 3R9PA 2W40A 4K43A 4A62A 5BRDA 2GELA 1RGIA 1ATNA 3CETA 4FWPA 2YHXA 4FPAA 5AQIA 4K25A 4MO5A 3VENA 3P4IA 3WT0A 1U2VA 3CQYA 2V7ZA 2YHWA 1NGGA 1Z6RA 3A5MC 1BWFO 3AAQA 5AQQA 4NB4A 2A42A 5AQOA 5AZJB 1NGIA 4IJAA 5AQTA 3QBXA 1HPMA 4BG8A 2E8AA 2OANA 3O1BA 4CZKA 5AQKA 2AP1A 3EL2A 4FL9A 4BGBA 3CI5A 4QS7A 1NMDA 2QM1A 4FWMA 3ENOA 5KPTA 2J4RA 4CD3A 2GWKA 3O8MA 1GLFO 3GOIA 5BN9A 2QWQA 3O4WA 3SLCA 5LY3A 3CIPA 4HWIA 3ZETA 5AZJA 1MWKA 4PKIA 3WXJA 1X3NA 2CH5A 1Q18A 3DAWA 3FLCO 4H0YB 3VETA 1HKCA 3JS6A 5BRHA 4C23A 1K8KB 3AAPA 4BRMA 4CBUA 1XQSC 1E4GT 3RSEB 4BVPA 4Y0WA 1QQMA 2P9IB 1NWKA 3FFKB 5ELZA 4DQ8A 1NLVA 2CGJA 4A2AA 3LDQA 1IG8A 4BRKA 1XUPO 2D0PA 3O80A 5EVZA 3HM8A 1T6CA 4I6MB 4BREA 1HKGA 3O5BA 4IJNA 1K8KA 3H3NO 4NO7A 3ULEB 3VEXA 2ASPA 4WQ5C 3GG4A 5KQ8A 5AQSA 1BDGA 1HUXA 3RSEA 3GL1A 1T6DA 1TUUA 4DHYA 2YHYA 1JCFA 2AA4A 4CBXA 5AQXA 5AZIB 1QQNA 4J8FA 2ASMA 4XH5A 5JLFA 4FSVA 4I6MA 1NGAA 1NGEA 4XH4A 1H1VA 2E20A 3ATUA 1C0FA 4WYBA 5KPRA 3ULEA 4RCHA 4B9QA 3A5NC 3UKRB 1NGHA 2Q0RA 4BRHA 3H3OB 1CZAN 3VGMA 4CZLA 5BRFA 1MWMA 1ATSA 3SMPA 3GBTA 5AZIA 5BPNA 3ENHA 1QZ5A 4ISGA 3O1WA 1QZ6A 1GLEG 1YAGA 2A41A 4H0PA 2VWBA 3CJ9A 1ZBSA 2FF3B 2BUPA 3C0BA 3MMVA 3W3DA 2EWSA 4BRLA 3SK3A 1U6ZA 5AFUH 4BROA 3L6QA 3I8BA 2YJFA 5LJWA 2QWMA 4DCHA 3EN9A 3KZBA 1NGCA 3A5OC 2HOEA 4FPBA 2QW9A 1EQYA 4MLHA 3U8XA 3QBWA 3WQTA 2YCHA 1IJJA 2I7PA 4Z94A 1ESVA 1E4FT 5AR0A 3ZEUB 3TU5A 3QDKA 3KHYA 4O8KA 2E88A 1D4XA 4CZJA 4H0XB 3FGUA 2FSKA 4FWOA 5JICA 2ITMA 2E2NA 3HZ6A 3D7EO 1KXPA 4H0VB 3QFUA 2P9KB 3GE1A 4BC2A 1LOTB 2E2QA 2D0OA 4A2BA 1GLLO 3FZFA 2UYTA 1KAXA 4WQ5A 3EZWA 4QS9A 3ZEUA 1TUYA 1XC3A 4BRNA 3LDNA 4BRCA 4RWTA 1OKJA 1HLUA 4M63C 4IZ9A 1KAZA 5F1XA 4FOEA 1SQKA 1HKBA 3DXMB 4FWNA 3WEEB 1ZXOA 1JCGA 4BC3A 5AQRA 1BUPA 4ISFA 4M7XA 5LJVA 2HMPA 2P9PB 2Q31A 3I33A 1P8ZA 4HTLA 3H46O 3VGLA 3U4LA 1ATRA 4K41A 1BA0A 4BQZA 5AQUA 4YDUC 2CGKA 1V4TA 3FZKA 3O08A 5EY4A 1Y64A 3IDHA 4PKHA 3ZX0A 3MDQA 4DB3A 4BRQA 3DXMA 3WEEA 4EHTA 3BEXA 3VEZA 4BRAA 3H1VX 3IFRA 5CE3A 3A0IX 4WQ4A 5E26A 5EOYA 2P9PA 4PL7A 4B1ZA 2Q1NA 4L3QA 4CZIA 3VPZA 3MN9A 5ADXH 3D2FB 5E84A 2Q0UA 2A40A 2GUPA 3A5LC 3J8AA 4JHDB 3FE1A 4MO4A 5AQNA 3VF6A 3DXKB 4CZGA 4FWSA 1LCUA 2P9IA 2A3ZA 2V52B 3HSCA 3SMSA 5KPZA 5AQMA 4B1VA 3M1FA 1BG3A 2ZGZA 4H0OA 3MN6A 4BRGA 3D2FA 4H0TB 2QWOA 4BR7A 1GLCG 3M3ZA 3U9DA 1NGDA 4JHDA 3G25A 2PBDA 4GY2B 2A5XA 3WXLA 4RTFD 1GLDG 5F0XA 3BF3A 2ASOA 5FPEA 5EX5A 4BRPA 4IWVA 3QMLA 2V51B 2Q97A 4B1XB 3CJBA 4FWKA 3R8EA 3CJ7A 1YXQA 1X9JA 4AM7A 5BPMA 2PAVA 3AARA 3JXUA 5JMVA 1C0GA 2ZWHA 3H45C 3UKRA 1R59O 2QWRA 4H5VA 1QHAA 3M6GA 2E1YA 3VEWA 4KBOA 2P9NB 1DGKN 2NZTA 1NGFA 2NRHA 4F9OA 3H1QA 3WUHA 2DPNA 3BF1A 5I9EB 2P9LB 4H5NA 2P9SB 2Q36A 2VYPA 5AQGA 3W0LA 3EKUA 4EFHA 4YDUA 4A61A 4BQLA 4CZMA 4JN4A 3CERA 3CJCA 3L0QA 5FPMA 4BR0A 4O5FA 3BP8A 4CJ7A 1BU6O 2ZGYA 3WQUA 4AM6A 2IVPA 3CJAA 2P9NA 4FOIA 3S41A 3MN5A 3HBTA 2P9LA 4FWQA 2E2OA 2P9SA 2FLOA 2P9UB 5AQZA 3QB0A 3ATVA 4CBWA 5AQLA 4BVOA 4H5TA 1BO5O 4BC5A 5FPNA 4BC4A 1BA1A 2IVOA 3DWLA 3CJ1A 4JNEA 5BR9A 5AFUA 2QWNA 3R6MA 5AQFA 1RFQA 3FR0A 2D1KA 5JLHA 2F9TA 4PL8A 1GLAG 3FZHA 2GWJA 4MLEA 2P9KA 3EKSA 3MK6A 3UE5A 4B1WB 3ZX3A 2P9UA 3D2EB 1YUWA 2NLXA 3ZETB 5BN8A 4IO8A 3MN7A 4BG9A 4K42A 1JCEA 3SJHA 4E1JA 3WXIA 2FSNA 3VEYA 2IVNA 1ZC6A 2GTDA 2HF3A 2QXLA 1YVNA 3ZX2A 5AQVA 3VERA 4BRFA 1NGJA 3VF2A 5AQPA 2E2PA 3IUCA 4PKGA 3D2EA 3MCPA 3U9ZA 5BREA 1Z05A 4B1UB 3F9MA 4ISEA 1SAZA 3B8AX 4LC9B 2FF6A 3IMXA 1X3MA 4GNIA 4BR9A 4H03B 2CGLA 3VF4A 4BR4A 5AQYA 5EXWA 4JAXA 4FWLA 3VEOA 3VESA 1MDUB 1S22A 1WOQA 1DEJA 5BPLA 2FSJA 3A8YA 2CH6A 4M7YA 3VOVA 4BGAA 2YJEA 4XH1A 1V4SA 2W41A 4IXCA 4BRIA 1MA9B 5FPDA 3HTVA 1WUAA 5AQWA 1RDWX 3O6WA 4CD1A 4EIAA 4B1YB 2F9WA 3WXKA 2WUSA 3UB5A 2V7YA 3DXKA 1GLBG 1DKGD 3LDOA 1GLJO 4CI6A 5F2RA 4JD2B 4FWRA 3OHRA 2A6AA 5KQDA 3C7NB 5ADXA 3QFPA 3QICA 5B8HA 1TYQB 3LDLA 1J6ZA 3LL3A 4FO0A 3UKUB 4H5RA 2YI1A 1T44A 1QQOA 3CHWA 4EAHD 4BR5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZTFA 4DQPA 4KH6A 1VK0A 3AVIA 5M1NA 3L4IA 1O1WA 3CMAN 4KPYA 1BIZA 3M5RA 2YIPA 4CZFA 4WQ4C 3KVGA 4KI6A 1XHXA 2G8FA 1KAYA 4C8MA 1NK5A 4JV5K 1NOYA 1GPTA 4EHUA 4QOZB 2QWLA 4PA1A 2ZF5O 3VQ9A 3HM9A 2WOMA 4FLUA 2IGIA 3IKMA 3TPQA 4CHYA 4H5WA 3GDQA 2LKBA 4B9TA 1SN4A 4CE9A 2GUIA 1LQQA 3B6PA 4CFAA 1U45A 4IFEA 3CD6N 2I7NA 4CCHA 1A5XA 3SUOA 4NCBA 4Y1CA 3LDPA 1T7BA 4QS8A 5I42A 1BHLA 3CETA 5K14A 3V9XA 1HNVA 3DMJA 1T7AA 2BRZA 2N2RA 3KC6A 4KHNA 4FJ7A 3AA4A 2B3CA 4YOXA 1CLQA 4FJXA 1U2VA 3CQYA 3C6UA 4CHNA 1RBVA 1IBKK 2P51A 4YHHK 3R1XA 3KOWA 2A42A 5AQOA 1WSJA 1NGIA 3NH1A 4FW2A 3QBXA 3QESA 2Z1GA 2O4IA 1HMVA 1ASVA 2QXFA 1K8BA 1Y97A 3NVMA 4FJ9A 2KPYA 2NUBA 3EL2A 4BGBA 4CFCA 4DF8A 1NMDA 4LF6K 4DSIA 4DTSA 1WNSA 5BN9A 2QWQA 3O4WA 3CIPA 1S1UA 3OTOK 4E1NA 3VA3A 5AZJA 2OTJN 3DOKA 2JWKA 4CJVA 3AO1A 3LDSA 1Q18A 5C15A 3CW4A 4IG0A 2W42A 4CJQA 2VWKA 4CHZA 1IG9A 3CCJN 1WBBA 3G4SN 1E4GT 5KK4A 1W9HA 4Y0WA 2OPQA 4BEBA 1NKBA 4LF9K 3LDQA 4KO0A 3DM2A 1OZZA 1JXBA 3BZCA 1OH5A 4JI0K 3HM8A 2KW4A 3CCMN 4BREA 4H4MA 4DU4A 4NO7A 4LH5A 2NNWA 2HSTA 4DSJA 4DLGA 5AQXA 5AZIB 4EP5A 4J8FA 5JLFA 2ASMA 5HP1A 4I6MA 2IAJA 4GV6A 1H1VA 4DV4K 2E20A 1FJGK 1JJ2M 1C0FA 4WYBA 1YI2N 5KPRA 5FRMA 2WC9A 3QETA 3OYBA 3NGIA 1ASUA 3KKSA 4OKEA 3GBTA 3SUQA 5BPNA 3KWIA 1QSLA 4LFAK 1SKRA 4DU3A 5M1QA 1YAGA 2A41A 4CK1A 3O9UA 3C94A 5HRNA 5J2MA 1ZBSA 3PSFA 2BUPA 4OKJA 2KBKA 3W3DA 3BGRA 1S72N 1U6ZA 5GINA 3KOYA 2O8FA 3L6QA 2NRRA 5LJWA 1BL3A 1CXUA 3EN9A 3KZBA 1D5AA 1D9DA 3CC2N 1T0ZA 3O3FA 3OS2A 4DQQA 4LSLA 2GV9A 3U8XA 3ZT0A 3QBWA 1RDUA 4DV3K 3THYB 1JLAA 2I7PA 3R3LA 3P38A 4JS4A 1VQ5N 1I94K 5IT9O 3B6OA 2Z1IA 3O9SA 4O8KA 3M8SA 3SQ1A 1N8RO 1D4XA 3E9OA 4JI1K 4DKWA 2N69A 1TI5A 3CFPA 4YOUA 3CF5L 4FWOA 2YNIA 1AHOA 5DK5A 2X78A 1FKPA 3KIOA 1XMOK 1N36K 1LOTB 3K5OA 3SCXA 2HHQA 3EZWA 5KRSA 1Q81O 1N4NA 3JAMO 4IO9L 4BRNA 3EYZA 4UAEF 4AILC 3CCRN 4M63C 2OZMA 3BDPA 3HSTB 4IZ9A 1PE4A 3DXMB 4X62K 4DLEA 5FRNA 4N76A 4HUFA 4B9MA 2Q31A 4WE1A 4M3UA 3HPHA 4JKHA 4V1DC 1OH6A 1P8ZA 4HTLA 3BY5A 3VGLA 1SV5A 1ATRA 2YBRC 1RNHA 4YDUC 1V4TA 4RW4A 3FZKA 3O08A 3PX0A 4BRQA 4CF8A 2DY4A 4F2RA 3H1VX 3A0IX 3OYIA 5EOYA 2P9PA 4PL7A 2Q1NA 1R0AA 4L3QA 4NLBA 4B08A 3VPZA 3EE9A 4DV1K 5HROA 5E84A 3AA3A 1CZBA 2A40A 3QNNA 3A5LC 4HCBA 4FJNA 4DR6K 4IBNA 1HNXK 5JVHL 3FE1A 2F8SA 3VF6A 4DFKA 3WNGA 2P9IA 1TL1A 2D0BA 3I56N 2A3ZA 3SQ0A 3KJVA 3SMSA 5KPZA 2LJMA 3OYLA 3M1FA 1BG3A 2XY5A 1NMNA 1BI4B 1KVAA 4H0OA 2X74A 4CGFA 4K8ZA 3D2FA 3C6HA 4H0TB 4CJUA 2QWOA 4DTXA 4GVMA 4E19A 2F96A 3G25A 4GVEA 3SBGA 4GY2B 3CCSN 1M90O 5IWAK 5HL7L 3BF3A 1P90A 2ATQA 5HLFA 2OTLN 3UIQA 3KK7A 2V51B 3TR8A 3CCUN 4B1XB 3DRRA 1HJRA 1X9JA 4AM7A 2KBJA 5BPMA 2PAVA 4ICLA 2UXBK 3AARA 3ULDA 3AVMA 3HOTA 2O8DA 4H5VA 1QHAA 4OJRA 1DGKN 3SQ2A 2HHTA 1B9DA 3IS9A 2DPNA 4CFDA 2VYPA 1O13A 1HQEA 3EKUA 2W00A 4EFHA 3TANA 3DYAA 1C55A 1WMTA 1KVCA 3QNOA 1C0UA 1LQIA 1JLQA 3L0QA 3ALYA 3O9TA 3WQUA 4AM6A 3F9KA 4CEDA 4NCAA 3CJAA 2P9NA 3TTCA 4E7JA 4FOIA 2BGGA 3ZSRA 1NG9A 2IOCA 1TGOA 4GV3A 4DUZK 3D45A 2E2OA 4JI4K 3CFRA 2P9UB 3ATVA 4CGHA 4BC5A 5FPNA 4W5QA 1EETA 1VRUA 2IVOA 4FJ5A 4U67L 1S6QA 4JNEA 4CJFA 4JKBA 4CJ5A 4JKEA 4PL8A 2DFEA 4BE2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ZTF A;  4DQP A;  4KH6 A;  1VK0 A;  3AVI A;  5M1N A;  3L4I A;  1O1W A;  3CMA N;  4KPY A;  1BIZ A;  3M5R A;  2YIP A;  4CZF A;  4WQ4 C;  3KVG A;  4KI6 A;  1XHX A;  2G8F A;  1KAY A;  4C8M A;  1NK5 A;  4JV5 K;  1NOY A;  1GPT A;  4EHU A;  4QOZ B;  2QWL A;  4PA1 A;  2ZF5 O;  3VQ9 A;  3HM9 A;  2WOM A;  4FLU A;  2IGI A;  3IKM A;  3TPQ A;  4CHY A;  4H5W A;  3GDQ A;  2LKB A;  4B9T A;  1SN4 A;  4CE9 A;  2GUI A;  1LQQ A;  3B6P A;  4CFA A;  1U45 A;  4IFE A;  3CD6 N;  2I7N A;  4CCH A;  1A5X A;  3SUO A;  4NCB A;  4Y1C A;  3LDP A;  1T7B A;  4QS8 A;  5I42 A;  1BHL A;  3CET A;  5K14 A;  3V9X A;  1HNV A;  3DMJ A;  1T7A A;  2BRZ A;  2N2R A;  3KC6 A;  4KHN A;  4FJ7 A;  3AA4 A;  2B3C A;  4YOX A;  1CLQ A;  4FJX A;  1U2V A;  3CQY A;  3C6U A;  4CHN A;  1RBV A;  1IBK K;  2P51 A;  4YHH K;  3R1X A;  3KOW A;  2A42 A;  5AQO A;  1WSJ A;  1NGI A;  3NH1 A;  4FW2 A;  3QBX A;  3QES A;  2Z1G A;  2O4I A;  1HMV A;  1ASV A;  2QXF A;  1K8B A;  1Y97 A;  3NVM A;  4FJ9 A;  2KPY A;  2NUB A;  3EL2 A;  4BGB A;  4CFC A;  4DF8 A;  1NMD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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