5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
2ZGZA 1BUPA 4CZIA 4XH5A 2QM1A 5AQNA 3GOIA 3O1WA 4PKIA 3H46O 1KAXA 3D2EB 2YJFA 4MO4A 3VEVA 3AY9A 4BRIA 2YHWA 4IJNA 3S41A 3FGUA 3GE1A 3MN6A 4EHTA 5BRFA 3L0QA 5ADXH 5AQFA 4H0TB 5AZJA 5BPNA 4FOIA 1KAZA 3CI5A 3VEOA 2P9LB 1H1VA 3J8AA 4Z94A 1D4XA 1DGKN 3QFPA 3UKUB 5F0XA 4JAXA 2PBDA 3MMVA 3O1BA 3GDQA 4FWOA 4XEIA 5AQMA 4WQ4C 2QXLA 1ZXOA 3ULEB 3ZX0A 4H5RA 1C0FA 3MN5A 4H0YB 3VOVA 1T6CA 1T6DA 1DEJA 4GY2B 1JCFA 4BVOA 1NWKA 1SAZA 1HX1A 3VPZA 4I6MB 1E4FT 2D0PA 3LDLA 4A62A 5AZIA 1X3NA 2FSKA 2GTDA 2GELA 4EFHA 5AQGA 3FZFA 5BN9A 5EOYA 4CZLA 4BC5A 1YUWA 2A42A 1TUYA 1S3XA 5BRDA 4L3QA 3WXIA 2E88A 2FSJA 3DXMA 1MA9B 2A5XA 2D4WA 1NGGA 3MN9A 3WXJA 2ASOA 2P9UA 4DB3A 2FLOA 4JNEA 3LM9A 3D2FA 1BG3A 4EAHD 4F9OA 1QQNA 1X3MA 2E2QA 1U2VB 1LCUA 1KAYA 2VCPA 3UKRB 4BRCA 4CZKA 3MCPA 4E1JA 1CZAN 3IUCA 3R6MA 3A8YA 3BP8A 1GLLO 1XUPO 3CETA 4BR5A 4M7XA 2WUSA 2FF3B 4BRLA 3FR0A 2P9IA 3JXUA 3ZEUB 4FWMA 3VERA 1X9JA 3QBWA 3CIPA 4CBXA 3F9MA 4BC3A 3MDQA 3HI0A 3CJ1A 5F1XA 3QICA 3LM2A 4IXCA 3A5NC 2Q0UA 1HKGA 1IG8A 2D1KA 5F2RA 3R9PA 1NM1A 2P9LA 3M1FA 4DQ8A 1EQYA 2HOEA 4LC9B 4PKGA 1YXQA 5AQXA 1Z05A 5JLFA 3DAWA 3EL2A 4BGAA 3VEWA 4FWSA 3VEYA 1Q18A 1BU6O 3TPQA 4MLHA 2I7NA 1NGBA 4IJAA 1BOTO 3WXKA 1BO5O 4FPBA 3C7NB 4JD2A 5E84A 1Z6RA 3EN9A 1HLUA 3O4WA 4I6MA 1JCGA 1BWFO 5JMVA 2P9PA 2E1YA 3BF3A 5AQWA 2CGLA 3VESA 4BRHA 1TYQB 3W3DA 4B1UB 4JHDB 5EX5A 3ATVA 2P9NB 4FWQA 2FXUA 5CE3A 5FPEA 4FWKA 4BR7A 3HSCA 5LY3A 1IJJA 1OKJA 3UB5A 3O6WA 5JLHA 1S22A 2HMPA 3L4IA 2VYPA 3MN7A 1GLJO 1ATRA 3CERA 2PAVA 1NGJA 3O08A 4M63C 2V7ZA 3LDQA 4HTLA 4GNIA 3H45C 4BR2A 3VGMA 1QQOA 2YI1A 3M6GA 5AQKA 3EZWA 4FWLA 4BRGA 5ADXA 3QFUA 3UKRA 4BQLA 3H3OB 3SK3A 3WT0A 1ZBSA 2BUPA 3CJ7A 3DXKB 4ISGA 1NGEA 4AM7A 4IZ9A 2ITMA 5KQ8A 2Q2RA 3GG4A 2E20A 3ZEUA 3FE1A 1NLVA 3ZX2A 3SJHA 4H0VB 1HPMA 2V51B 3D7EO 3ATUA 3G25A 1HJOA 4BREA 4BROA 2Q97A 2E2NA 2AP1A 3FZKA 4RCHA 4H0PA 5AQVA 3WQTA 3FZHA 3GL1A 1V4TA 2A6AA 4BGBA 3CQXA 1SZ2A 1BA1A 5BN8A 1ATSA 3H3NO 1QHAA 2A3ZA 3ZETB 3WEEA 1GLBG 4CZFA 3IDHA 5KPZA 3A5MC 2ASPA 3QMLA 2P9KB 2IVNA 4MO5A 4WQ4A 2V52B 3RSEB 4CZGA 4B1ZA 2D0OA 3A0IX 2I7PA 2P9SB 4RTFD 4WQ5C 3U9ZA 3ZX3A 1TYQA 4QS7A 1SQKA 4EIAA 2QW9A 5AQIA 5AR0A 5AQUA 1T44A 2YCHA 1MWKA 5AQQA 1ATNA 4BRQA 1Y64A 1KXPA 1WUAA 5KPTA 3D2EA 3VF2A 5EXWA 3CJAA 2E8AA 1GLAG 1NGFA 3CJCA 4K42A 3U4LA 4B9QA 3HZ6A 3O5BA 4A61A 3AAPA 3ENHA 4QS9A 1NGAA 3AAQA 3H1QA 2QWLA 5TKYA 5AQJA 3VENA 3EKSA 2KHOA 4BR9A 4FPAA 4RWTA 1GLFO 3UKUA 2CGJA 4YDUC 4WQ5A 5KPRA 2A40A 4FSVA 2YHXA 3ULEA 4H5VA 3DWLA 3FLCO 4CJ7A 2YJEA 1ZC6A 2HF4A 5AFUH 3BF1A 2E1ZA 2ASMA 3BEXA 4FL9A 5FPNA 4H03B 1NGCA 3SMPA 3L6QA 3WUHA 4EHUA 2QWOA 4H5TA 5AZIB 4AM6A 4XH1A 2ZWHA 5EY4A 3R8EA 1R59O 1V4SA 3U8XA 4BRPA 5EVZA 1U6ZA 2AA4A 4WYBA 4CZHA 4Y0WA 2GWJA 3I8BA 3SMSA 3UE5A 4BG9A 4CZEA 4MLEA 5E26A 5KQDA 1GLDG 4FWPA 4CBWA 3LDOA 3ZETA 1ESVA 5BREA 1C0GA 1QZ6A 2P9UB 4BRNA 4M7YA 3OHRA 4O8KA 3D2FB 4BRDA 5LJWA 2Q0RA 2VWBA 1U2VA 3JS6A 1QZ5A 4NO7A 4BRAA 3EKUA 3DJCA 2QWNA 2H3GX 3HTVA 4JN4A 1MDUB 3A5LC 4CD1A 3QBXA 2P9IB 4K25A 4CD3A 2YHYA 1BA0A 4KBOA 5ELZA 3I33A 3AARA 3FZLA 2BTFA 1BDGA 1K8KB 3O8MA 5AQOA 1GLCG 3O80A 4CZMA 4FOEA 4H0OA 2FSNA 1YVNA 4O5FA 4BR0A 5AQYA 4DCHA 3VGKA 5AQSA 2F9TA 3H6EA 4J8FA 1TUUA 5BR9A 1G99A 1WOQA 5AQLA 2Q31A 1NMDA 2EWSA 5AQPA 4A2AA 2QWRA 2GWKA 4JD2B 3KHYA 4PL7A 2ZF5O 3W0LA 3C7NA 2P9PB 4IWVA 1HKCA 3TU5A 4BC2A 4B1XB 3VF4A 3KVGA 1NGIA 4BRMA 3CHWA 4K43A 3KZBA 4JHDA 5I9EB 3WXLA 5BRHA 2QWMA 1RDWX 2P9NA 3LL3A 3VGLA 1RGIA 4DHYA 4PL8A 3VETA 2NZTA 2DPNA 3BUZB 3CQYA 2CH6A 3MK6A 3EO3A 3A5OC 3FZMA 5B8HA 2QWQA 2E2PA 4BQZA 1NGDA 1QQMA 4C23A 4CBUA 3GBTA 3P4IA 4HWIA 4H5WA 4ISEA 4FO0A 5AZJB 4NB4A 3U9DA 3LDPA 2CGKA 3IMXA 1P8ZA 3HM8A 3QDKA 2W40A 4PKHA 1E4GT 1HUXA 5BPMA 1GLEG 5LJVA 3DXKA 2W41A 1XC3A 2IVPA 4B1YB 4FWNA 1LOTB 4ISFA 1DKGD 2GEMA 4H0XB 3SLCA 4IO8A 4XH4A 5AFUA 2E2OA 1NGHA 5BPLA 1XQSC 2NRHA 2J4RA 1YAGA 2GUPA 1J6ZA 1K8KA 4BR4A 5AQTA 4K41A 2ZGYA 2IIRA 5FPDA 1MWMA 4BC4A 2HF3A 4BG8A 5AQHA 3VF6A 2QWPA 2IVOA 1RFQA 4BRFA 2FF6A 2V7YA 4QS8A 4BVPA 3ID8A 2NLXA 1JCEA 3QB0A 3VEXA 3CJBA 3VEZA 2OANA 4H5NA 3IFRA 3DXMB 3WEEB 4FWRA 4CZJA 1HKBA 3CJ9A 3C0BA 5JICA 4B1VA 2Q36A 4BRKA 5AQZA 5AQRA 4YDUA 2P9KA 3HBTA 3H1VX 2CH5A 2Q1NA 3RSEA 3ENOA 2F9WA 3WQUA 4CI6A 3LDNA 5FPMA 3B8AX 3FFKB 2UYTA 1NBWA 2P9SA 4A2BA 4B1WB 3M3ZA 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNIA 2ZGZA 1BUPA 2EX3A 2QM1A 1YF5L 2Z1GA 2WFBA 1XMOK 3P5JA 3NF8A 1RTIA 2HHUA 1KVAA 3SI6A 3VTHA 4DTUA 4K8ZA 5HL7L 1NK5A 2YJFA 1TAUA 2QKKA 3CPWM 4IOXA 3NGYA 3VEVA 1E3MA 2XRIA 4BRIA 4RW9A 4O44A 3LDSA 3L0QA 4TSXA 1ZYQA 2BRZA 3OYLA 2O8DB 3NGZA 1TKDA 3VQ7A 2OPSA 3C6HA 2QXFA 3VEOA 2P9LB 4IEEA 2G8FA 1WSHA 1MR4A 3UKUB 4JAXA 3O9QA 1CZBA 4HUFA 1HYZA 3CCMN 4EZ6A 5AQMA 3ZT4A 3ZX0A 4H5RA 1T6CA 2QI2A 1JLEA 5T7BA 1SAZA 1HX1A 2KBHA 1VQLN 1WSFA 3SCXA 4LF7K 2D0PA 3LDLA 4CW7B 3SQ0A 2MZ0A 1WBBA 2FSKA 2GTDA 4IBNA 3DLHA 3PO4A 4EFHA 1AHOA 4DQQA 3KTQA 3OYFA 3DI6A 1YUWA 2A42A 1N4NA 4IDHA 1S1TA 3NCIA 3E7UX 3WXIA 1X9MA 1HNXK 4CECA 4E19A 5LMNK 3NDKA 1J54A 2ASOA 4C8NA 2G8WA 3M5RA 4JNEA 3LM9A 3D2FA 1ITGA 4EAHD 1RDAA 1HQUA 4IOCL 4DV7K 1MU2A 1U2VB 4RG8A 4MQ3A 3UKRB 4CJPA 4E1JA 4DSEA 3KP0A 2KZZA 4BR5A 1XUPO 3QESA 2KQ2A 4BRLA 2OZSA 1N33K 2P9IA 2B4JA 1NKCA 1X9SA 1EWRA 5I3UA 1I6GA 4UJ0A 1JL1A 4B3MK 3IS9A 1L5UA 4KH6A 3DLLL 4Z4EA 3HI0A 4AH9A 1S6QA 1SL1A 3LP0A 4HHFA 3QICA 4ILJA 4X66K 4CJQA 3CCJN 4BWMA 1JXEA 3SPZA 2YNGA 2D1KA 5F2RA 4CJUA 4DQ8A 4DTNA 5JVHL 3RRGA 1K8BA 4V19S 4CK2A 4OKJA 2HHWA 1LQQA 4LC9B 2VG7A 4CGHA 1YXQA 4FK0A 5AQXA 3WNGA 2KFZA 4BGAA 3CCSN 3FFIA 1N32K 4DQPA 3TPQA 3BZKA 4B9UA 4DFKA 4CFBA 4IJAA 1BOTO 3WXKA 3C7NB 3HPOA 5E84A 4PUOA 3O4WA 1TL3A 1JCGA 2FBTA 2X6SA 4YORA 5M1OA 3HO1A 4CF8A 1TYQB 1YI2N 2P9NB 3NHGA 3AVMA 1VSIA 2PY5A 1SN1A 3TTDA 2WTUA 4BR7A 3HSCA 1OKJA 3L4IA 5KK4A 4W5NA 2YHAA 4G9ZA 3HP6A 1ATRA 2PAVA 3O08A 2V7ZA 3LDQA 4GNIA 1NJZA 3VGMA 3RMBA 3U3YA 3KLEA 2YI1A 3M6GA 4YHHK 1CHZA 3T1AA 3OYJA 3SF4D 2LR3A 1NPIA 1D5AA 4CFAA 1T7EA 5K14A 3JAMO 2Q3SA 3SBGA 1NGEA 4FK4A 4AM7A 3IAYA 1BCGA 4UAEF 1QQCA 3ZCMA 3ZX2A 3SJHA 3AVCA 3VQPA 2V51B 4CEQA 3KOWA 4I9QA 2W6LA 3O3FA 3OJUA 3ZT3A 3ULDA 3CW4A 2Q97A 4Q5VA 3NF6A 5AQVA 3HPGA 4B3OA 2NRWA 3TANA 2ETJA 5BN8A 1ATSA 3H3NO 5HROA 4FW1A 4Z4HA 4JK9A 2ASPA 2BGGA 2YNHA 2P9KB 3VQQA 5FLXO 3AO5A 4WQ4A 1VHXA 4QAGA 4B1ZA 2D0OA 4C8LA 4DSLA 5HRNA 1NK9A 3A0IX 3QIPA 3U9ZA 2OTJN 1SQKA 2QW9A 1JLQA 1TKTA 3SJJA 5SWMA 1T44A 4ZTJA 1HJRA 1LWEA 1GOCA 3NVKA 3K0SA 4CGDA 3O4QA 2LKBA 4DMNA 4GV6A 2I61A 3QNOA 4FVUA 2WOMA 3CJAA 4CJTA 3V6DA 3P38A 4EP5A 4A61A 3PIOL 4CJ4A 1BI4B 3OYEA 1DLOA 5E41A 2YKNA 3IRXA 4YNQA 2O8DA 1DTTA 3H1QA 3QNNA 3PUFA 4FPAA 3T3FA 2KTQA 1SL2A 2HBKA 5GAEP 4E72A 1NU0A 3UKUA 4FK2A 4FJNA 4ILHA 1RILA 3OYIA 1XMQK 2A40A 2JWLA 3M8QA 3P1GA 2UU9K 4JI8K 2HF4A 2ASMA 4R79A 4BY9C 1RTDA 4CHQA 1NGCA 3CCQN 3V9ZA 4ILGB 3JSMA 5AZIB 1NRBA 4XH1A 1R59O 4BRPA 2AA4A 4CZHA 5DMRA 3I8BA 3HPHA 1Q8IA 4CJFA 3UE5A 3HL8A 4FJKA 4B9VA 1RT6A 3KKRA 4DF4A 1GLDG 4IOAL 4CBWA 3LDOA 3LWLA 1T03A 4NXNK 1JZBA 1NJWA 2P5OA 4PWDA 3MX2A 5GAHP 2N2RA 2BANA 2YBRC 1VRUA 4KTWA 4JI7K 2VWBA 4FLYA 4YOYA 1U2VA 2VGNA 3I0RA 4CIGA 1RT1A 2LY6A 1L3UA 3HTVA 4FJ8A 4JN4A 1MDUB 2G2KA 4CD1A 2B5JA 1BA0A 3KKSA 3AV9A 1ICAA 5EU7A 4I9LA 3TAGA 3AO3A 3I33A 1O1WA 3TWHA 3KLHA 1BDGA 3O8MA 4CVNE 4H0OA 4FLUA 4O5FA 3VGKA 3E7RL 3KWGA 5FRMA 4BE7B 1ASUA 2F9TA 3QEVA 4DR7K 4J8FA 1IKWA 1RCHA 4OKKA 1SL0A 1EWQA 1PX9A 1WOQA 1HQEA 1SS6A 1N6QA 4X65K 3E9OA 1S6PA 4A2AA 4O0IA 1XRSB 2QWRA 3B6OA 1OH6A 3C7NA 2G8KA 1B7DA 2MBKA 3TU5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HNI A;  2ZGZ A;  1BUP A;  2EX3 A;  2QM1 A;  1YF5 L;  2Z1G A;  2WFB A;  1XMO K;  3P5J A;  3NF8 A;  1RTI A;  2HHU A;  1KVA A;  3SI6 A;  3VTH A;  4DTU A;  4K8Z A;  5HL7 L;  1NK5 A;  2YJF A;  1TAU A;  2QKK A;  3CPW M;  4IOX A;  3NGY A;  3VEV A;  1E3M A;  2XRI A;  4BRI A;  4RW9 A;  4O44 A;  3LDS A;  3L0Q A;  4TSX A;  1ZYQ A;  2BRZ A;  3OYL A;  2O8D B;  3NGZ A;  1TKD A;  3VQ7 A;  2OPS A;  3C6H A;  2QXF A;  3VEO A;  2P9L B;  4IEE A;  2G8F A;  1WSH A;  1MR4 A;  3UKU B;  4JAX A;  3O9Q A;  1CZB A;  4HUF A;  1HYZ A;  3CCM N;  4EZ6 A;  5AQM A;  3ZT4 A;  3ZX0 A;  4H5R A;  1T6C A;  2QI2 A;  1JLE A;  5T7B A;  1SAZ A;  1HX1 A;  2KBH A;  1VQL N;  1WSF A;  3SCX A;  4LF7 K;  2D0P A;  3LDL A;  4CW7 B;  3SQ0 A;  2MZ0 A;  1WBB A;  2FSK A;  2GTD A;  4IBN A;  3DLH A;  3PO4 A;  4EFH A;  1AHO A;  4DQQ A;  3KTQ A;  3OYF A;  3DI6 A;  1YUW A;  2A42 A;  1N4N A;  4IDH A;  1S1T A;  3NCI A;  3E7U X;  3WXI A;  1X9M A;  1HNX K;  4CEC A;  4E19 A;  5LMN K;  3NDK A;  1J54 A;  2ASO A;  4C8N A;  2G8W A;  3M5R A;  4JNE A;  3LM9 A; 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