5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
1BOTO 4M7YA 2E1ZA 3MMVA 4RTFD 2E2NA 5ADXH 3QFUA 1G99A 1T44A 3AAPA 1C0FA 1NMDA 2Q2RA 2ZGZA 3ATUA 3I8BA 4CD1A 4IJAA 1TYQB 3QFPA 3O08A 3O8MA 4BRGA 2QW9A 2ASMA 1J6ZA 1GLEG 3VETA 1U6ZA 1KAYA 2I7PA 2Q0RA 4BGAA 1K8KB 4CBXA 3ZX2A 1GLAG 1Y64A 4BGBA 1HJOA 1HX1A 3F9MA 1NGGA 3L6QA 2A42A 2V7ZA 3BF1A 4WYBA 2NZTA 4C23A 1X3MA 2ZF5O 4H0XB 3MN5A 3U9ZA 1BUPA 2VCPA 4BG8A 3MDQA 3R8EA 5BN8A 4MLHA 1NGDA 2KHOA 2I7NA 2P9UA 3A5LC 3RSEB 1BDGA 1HLUA 5AQPA 2QWPA 4H5TA 4H5WA 4IWVA 4H0VB 4K42A 3VEWA 2H3GX 4B9QA 5JICA 3FLCO 5BR9A 4BROA 3VERA 1HUXA 5LJWA 1HKBA 5AQSA 4GNIA 4B1WB 3UKRB 3H6EA 4MO5A 5BRHA 1NWKA 5AQUA 1NGIA 4ISGA 3TU5A 4XEIA 2FLOA 2A41A 5E26A 3L0QA 5AQWA 5AQTA 5AQZA 1E4GT 2P9LA 1TYQA 4H0YB 2CGJA 4K25A 2V52B 4DHYA 3H45C 3TPQA 4BC2A 3HSCA 3DXKA 4WQ5A 3ENHA 5AQGA 5AR0A 3UB5A 3FZKA 1NGAA 3IMXA 3CJAA 3SLCA 3H1QA 1JCFA 5JMVA 2BUPA 1ESVA 2A40A 4O5FA 3WEEB 5BN9A 3O80A 3ULEB 3H46O 3EKUA 4BRHA 1V4TA 3C7NB 5BPMA 2GELA 3A5OC 5AQFA 3VF4A 4BC3A 3WT0A 2F9TA 3GG4A 1ZBSA 2NRHA 5KPRA 3O1WA 1BA1A 2QWMA 4M7XA 1ATNA 4CZHA 3IFRA 2QM1A 5JLFA 4ISEA 2V7YA 3ZX3A 3UE5A 3UKRA 1XC3A 4BC4A 2AP1A 1BA0A 4WQ5C 1GLDG 2E20A 2P9UB 5AQYA 3BF3A 1NGEA 2D1KA 2FSJA 5BPLA 2CH5A 3AARA 3R6MA 4FO0A 5BPNA 4CZFA 4A62A 4FOIA 3DXMB 3VEOA 3M6GA 3VF6A 3D2FA 1Z05A 3MCPA 1RFQA 3H3OB 2J4RA 1IG8A 4EHTA 3FZHA 1Z6RA 3SK3A 2W40A 1DGKN 2GEMA 1TUYA 4BR2A 4K43A 2P9LB 4I6MB 3P4IA 4XH5A 4CBWA 1GLJO 1LCUA 2GUPA 4WQ4A 3LDLA 1MDUB 1YAGA 3D2EB 3GE1A 2A3ZA 3DXKB 4IO8A 2Q36A 4MO4A 2GWJA 2ASPA 4DQ8A 5AQHA 3WEEA 4BVOA 3D7EO 3ULEA 4JN4A 5AFUA 3C7NA 3EN9A 4IZ9A 3CQYA 3GDQA 3HZ6A 3VF2A 4KBOA 1R59O 4FOEA 3VEYA 2WUSA 5AQOA 4IJNA 2E2PA 2QWRA 3S41A 5AQVA 3QICA 1LOTB 2E88A 1WUAA 2D0PA 1T6DA 4FWOA 3FZFA 1EQYA 3CJ9A 3SMPA 2QWLA 3A8YA 3DXMA 4WQ4C 4NB4A 2Q0UA 2GTDA 3VOVA 5BREA 1OKJA 4CBUA 1NM1A 5E84A 3FR0A 3G25A 4A61A 3ID8A 2FSNA 2YHXA 5ELZA 1GLFO 3ZEUA 3CI5A 3DAWA 1HKGA 3KHYA 2Q1NA 3HM8A 1YUWA 1RDWX 3MN6A 3MN7A 3D2FB 3CJ1A 1XQSC 4I6MA 1GLLO 3W0LA 3LDNA 4FL9A 5AZJA 5F2RA 5AQXA 5KPZA 1NGFA 2P9IB 4YDUC 4CZLA 5EY4A 3D2EA 4BR7A 4XH1A 1TUUA 2VYPA 1QQNA 2ZWHA 4FWLA 2FXUA 3LL3A 4FWQA 4PKIA 4B1VA 4PKHA 4RWTA 4CD3A 4L3QA 4MLEA 2CH6A 5AQKA 4K41A 3U9DA 4CI6A 3LDQA 5AQNA 1NGCA 4F9OA 3LDPA 2CGLA 1S22A 4IXCA 2HF4A 1P8ZA 4BRPA 3DWLA 5FPEA 5B8HA 4H0OA 1ATRA 5AZIA 2QWQA 3I33A 5EOYA 3CERA 1U2VB 4EIAA 1BU6O 3VPZA 3AAQA 3MN9A 2YI1A 2HOEA 4BRKA 4BRAA 5CE3A 5AFUH 4BVPA 3H1VX 4XH4A 4BR0A 3A5MC 3VGMA 3L4IA 2YCHA 4FWPA 2E8AA 3U8XA 3CQXA 5TKYA 3WXLA 3O1BA 2QWOA 4PL7A 2PBDA 2P9PB 2FSKA 3EZWA 5F1XA 2HF3A 1E4FT 2PAVA 4O8KA 3HTVA 1KXPA 3KZBA 4M63C 3CIPA 2ZGYA 3QB0A 4JD2B 3B8AX 4H5VA 1SAZA 1IJJA 2P9IA 1YXQA 3ZEUB 3WUHA 3J8AA 3FFKB 2A5XA 1ZC6A 4DCHA 1SZ2A 4BQLA 5BRDA 2GWKA 3WXIA 4JHDA 1HPMA 2P9SB 3DJCA 5AZJB 4BC5A 3HI0A 2IIRA 3VEXA 4DB3A 2IVNA 2IVOA 2W41A 4H03B 4FWNA 4JNEA 1JCGA 1NBWA 3SJHA 5KQDA 5KQ8A 2CGKA 1KAZA 2FF6A 4B1ZA 3A5NC 3VENA 4CZEA 4LC9B 4EHUA 1CZAN 4BRIA 3LM2A 4BRCA 4BREA 1MWKA 3FZLA 2ASOA 1U2VA 3EL2A 2P9KB 4H5NA 3VEZA 3JS6A 4BG9A 2QWNA 3JXUA 1X3NA 3BUZB 5EX5A 4BRMA 3CJ7A 2HMPA 5AQMA 4FPAA 4YDUA 4BRFA 5AZIB 5FPNA 4BQZA 3BEXA 1MWMA 4AM7A 1QQMA 4GY2B 3QMLA 3LM9A 4HWIA 3GL1A 1V4SA 3BP8A 3CETA 3VGKA 2P9PA 2IVPA 4B1YB 4EAHD 2YHYA 1QQOA 3EO3A 1D4XA 1QZ5A 3EKSA 3H3NO 1GLCG 5AQLA 3WQTA 4A2AA 3AY9A 4JD2A 3ZX0A 5AQRA 3WXKA 4E1JA 2P9NB 3VESA 4Z94A 1BWFO 4FWMA 3HBTA 2D4WA 1Q18A 4PL8A 2FF3B 3LDOA 5FPDA 1BG3A 3CJCA 1JCEA 2F9WA 5F0XA 4BR4A 4BR5A 1GLBG 1DEJA 3SMSA 3A0IX 1XUPO 2YHWA 3OHRA 5ADXA 2BTFA 2P9SA 4A2BA 2YJEA 5JLHA 3GOIA 3M1FA 5EXWA 5LY3A 3QDKA 4H0TB 1HKCA 3UKUA 3CHWA 1QZ6A 2D0OA 3IUCA 1T6CA 1RGIA 4QS7A 4ISFA 1BO5O 2Q97A 1X9JA 3O4WA 4JHDB 4NO7A 3R9PA 3FZMA 1H1VA 4CZIA 2AA4A 3FE1A 3MK6A 4RCHA 4FWSA 3FGUA 1QHAA 3ATVA 4FSVA 3ZETB 2E1YA 3U4LA 3IDHA 2P9KA 5AQIA 5EVZA 4FWKA 4J8FA 1ZXOA 1NGJA 3ENOA 1K8KA 4FWRA 3M3ZA 1NLVA 3O6WA 2VWBA 4PKGA 3KVGA 2V51B 3GBTA 3VEVA 2NLXA 4B1UB 2YJFA 3VGLA 5I9EB 1KAXA 4H5RA 1S3XA 2A6AA 3CJBA 2E2QA 2P9NA 4CZGA 1MA9B 4B1XB 3QBXA 3RSEA 1DKGD 1NGHA 4BRQA 5AQQA 2E2OA 4CJ7A 1SQKA 5AQJA 5FPMA 4BR9A 2EWSA 3O5BA 3W3DA 1YVNA 3WXJA 3WQUA 5BRFA 4CZMA 4QS9A 2ITMA 4CZKA 5LJVA 2Q31A 4Y0WA 4FPBA 1WOQA 3C0BA 4CZJA 4H0PA 1ATSA 4BRNA 4BRLA 4BRDA 1C0GA 4EFHA 4AM6A 3QBWA 2OANA 3ZETA 1NGBA 2DPNA 4QS8A 2UYTA 2QXLA 5KPTA 4JAXA 4HTLA 3UKUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V1RA 2E1ZA 1SNBA 4FM1A 1ASVA 1C0FA 2Q2RA 3ZSYA 1YT3A 4CHQA 1M90O 5GIPA 1NH5A 3E01A 2X74A 2LKBA 1TYQB 3O8MA 5CYMA 3OYIA 2ASMA 1U6ZA 3THWA 4DLEA 2B4JA 3MWPA 3OYLA 1BGXT 3S3MA 4FJNA 3DLEA 4W5NA 3E7RL 1DT9A 1ZYVA 4LH5A 3QNOA 3J81O 1S1XA 3MN5A 3KLHA 3HL8A 1SKRA 1NGDA 2E3FA 3T69A 4CERA 2RE2A 1I6GA 2D56A 1OH5A 5M1FA 4H5WA 5GIOA 5JICA 5FDLA 2RHKA 3FLCO 5DK5A 4BROA 2GX9A 2VG5A 2HHHK 2B68A 3UKRB 3F9KA 4WE1A 3L3VA 3QNNA 5BRHA 1NWKA 4G9ZA 2N69A 5AQUA 1EX4A 1U04A 1VQ4N 2FLOA 3MXIA 4WFNL 1VSMA 2A41A 5AQWA 3FFIA 1NE5A 1MU2A 2LJ7A 4DR1K 4JI1K 4YFUA 4K25A 4CJRA 3L2UA 3TPQA 3CCLN 5GAEP 3JSMA 4M3TA 4I9QA 2E6LA 2P51A 2ATBA 4M3ZA 3C65A 1ZVEA 4XIUA 3KC6A 3CM5A 2VQFK 1KTQA 3CJAA 4BDPA 3ZSVA 5CY0A 1EXQA 4YHHK 2JDQD 5LMNK 3U3GA 3K2PA 3THWB 3OYMA 1TKDA 4BE7B 4JRQA 2A40A 2WFBA 3B6PA 1UOCA 4O5FA 3SQ2A 2LI7A 1O13A 2NRVA 4M45A 1QSLA 4N47A 5KPTA 1BMRA 3NH2A 1S1UA 4UY8O 1EO1A 2LT8A 3IG1A 1TK5A 1S6PA 1U4BA 2QKKA 3VF4A 4WF9L 4M3XA 1FH3A 1NJWA 4B9TA 4ISEA 2BRZA 3RRHA 4OO1J 3UE5A 4BC4A 5FROA 5AJ3K 1GLDG 2E20A 5AQYA 3V9ZA 4A62A 1BCGA 1JXBA 1IKWA 2QA4N 3VEOA 4N76A 4Y1CA 4ILGB 3D2FA 4IEEA 1Q81O 1XNRK 3MCPA 2ZE2A 3KP1A 4B8AB 4KH4A 2XO7A 5M1QA 4CVNE 1C6VA 2A7TA 3Q7CA 4K43A 4CBWA 1DLOA 4RW6A 3PX0A 2F4VK 2YHAA 3M8PA 2GUPA 2G8KA 1MDUB 1YAGA 4DR6K 3OS0A 2A3ZA 3ZCMA 2A1RA 3C95A 4MO4A 1VQ5N 2OTLN 4BVOA 4FXDA 3J7ZO 4IDKA 1PE4A 4O5BA 3NHGA 1C56A 1Q86O 3EN9A 2KFZA 3CQYA 3GDQA 3VF2A 4KBOA 1HR0K 4JKCA 5JVGL 3RMBA 4CEAA 1TI5A 4FOEA 1NMNA 3AVNA 1IBKK 4IJNA 2QWRA 3JAMO 1NU0A 2RKIA 3DLLL 2E88A 2UUBK 4KI4A 2KZZA 1EQYA 2KW4A 1J53A 3SV3A 3DXMA 3L8BA 4CK2A 3EE8A 4KI6A 3AO5A 3C6AA 1NM1A 5HOOA 1S1VA 5CYQA 1T3VA 2FSNA 1WN7A 4YORA 1YJWN 4Z0UA 1OH6A 3O9UA 3CYMA 1BCMA 5C15A 3VQBA 1HKGA 2O8CB 3KHYA 4DTJA 1UAXA 4I6MA 3D2FB 3KK3A 3SQ1A 4JK7A 4CEOA 3W0LA 4DF8A 1XC9A 5AZJA 5CZ2A 3AVFA 3KLFA 3NF8A 1X1PA 1S9GA 4YDUC 2F96A 3SQ4A 1LQHA 2HBJA 4PKIA 4B1VA 2W6KA 3D45A 3MX5A 4MLEA 1D8YA 5AQKA 1T8EA 3U9DA 3DOKA 4DTNA 3K5NA 5AQNA 2VQEK 3VQ4A 3LDPA 4FJKA 4G1QA 1S9EA 4GMJB 1S22A 1J54A 3HPHA 4ZHRA 2DY4A 1I6FA 1RTJA 3L2VA 2QWQA 3C94A 3KTQA 2HHXA 3CERA 2ZM6K 1QQCA 1BI4A 5J2PA 1KFSA 4YY3K 1BRZA 1IH7A 4FJMA 2OA8A 4CQKA 2NNWA 5JS2A 1ASUA 3R3LA 4CJTA 4Z4HA 4BVPA 5JVHL 3VGMA 4MDBA 2PYJA 2E8AA 1F21A 3EY1A 4PL7A 2P9PB 3OYAA 3D6RA 4JI7K 5F1XA 2HF3A 3P83D 4H4MA 3VQEA 1E4FT 4DS5A 2PAVA 3CC7N 3HTVA 2YILA 4DV0K 4JI5K 3KZBA 2O8EA 1JXCA 1IJJA 4FJ9A 1YXQA 4F3OA 1RDAA 5KGWA 3OYDA 2YNHA 3K59A 1ZC6A 4DCHA 3SZ2A 2DFFA 4W5TA 3MEEA 4FJIA 2A1SA 3AGKA 1HPMA 1LWCA 5KTQA 2BGGA 5AZJB 1J5EK 2IIRA 2I5JA 2IVNA 1WBBA 1NBWA 5KQDA 3Q7BA 2CGKA 5C2DA 2I61A 1Z26A 3IS9A 2EHGA 2KLAA 4BRCA 2YC1C 4CEFA 3THYB 4H5NA 4BG9A 3BUZB 4LF8K 5EX5A 4BRMA 4IOAL 4RG8A 4E7LA 4CJQA 4BQZA 5FPNA 4ICLA 3BEXA 4KB1A 4AM7A 3ASMA 2MN5A 2KPYA 2Z1GA 3VQQA 4B9LA 2KSKA 1QZ5A 3EKSA 4X65K 1YF5L 1C0MA 4A2AA 4JD2A 4YOWA 4E1JA 4DF4A 1FKPA 3VESA 3C6HA 1BWFO 1T1TA 3HBTA 3SI6A 4FLZA 2FF3B 1RT2A 4DQRA 3THVA 4BR5A 1KQSM 1GLBG 3V9WA 4CCHA 1W2BM 5GAHP 4E0DA 1W9HA 2P9SA 2Q3SA 4IFEA 5JLHA 4KAZA 2X6NA 3ZLJA 3QDKA 3AO1A 3AVHA 4FM2A 5J2MA 3MX2A 1QZ6A 3IUCA 3P38A 4FLWA 3R9PA 3O4WA 4OPHA 3AVJA 3FZMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3V1R A;  2E1Z A;  1SNB A;  4FM1 A;  1ASV A;  1C0F A;  2Q2R A;  3ZSY A;  1YT3 A;  4CHQ A;  1M90 O;  5GIP A;  1NH5 A;  3E01 A;  2X74 A;  2LKB A;  1TYQ B;  3O8M A;  5CYM A;  3OYI A;  2ASM A;  1U6Z A;  3THW A;  4DLE A;  2B4J A;  3MWP A;  3OYL A;  1BGX T;  3S3M A;  4FJN A;  3DLE A;  4W5N A;  3E7R L;  1DT9 A;  1ZYV A;  4LH5 A;  3QNO A;  3J81 O;  1S1X A;  3MN5 A;  3KLH A;  3HL8 A;  1SKR A;  1NGD A;  2E3F A;  3T69 A;  4CER A;  2RE2 A;  1I6G A;  2D56 A;  1OH5 A;  5M1F A;  4H5W A;  5GIO A;  5JIC A;  5FDL A;  2RHK A;  3FLC O;  5DK5 A;  4BRO A;  2GX9 A;  2VG5 A;  2HHH K;  2B68 A;  3UKR B;  3F9K A;  4WE1 A;  3L3V A;  3QNN A;  5BRH A;  1NWK A;  4G9Z A;  2N69 A;  5AQU A;  1EX4 A;  1U04 A;  1VQ4 N;  2FLO A;  3MXI A;  4WFN L;  1VSM A;  2A41 A;  5AQW A;  3FFI A;  1NE5 A;  1MU2 A;  2LJ7 A;  4DR1 K;  4JI1 K;  4YFU A;  4K25 A;  4CJR A;  3L2U A;  3TPQ A;  3CCL N;  5GAE P;  3JSM A;  4M3T A;  4I9Q A;  2E6L A;  2P51 A;  2ATB A;  4M3Z A;  3C65 A;  1ZVE A;  4XIU A;  3KC6 A;  3CM5 A;  2VQF K;  1KTQ A;  3CJA A;  4BDP A; 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