3FGUA

Catalytic complex of human glucokinase
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
454
structure length
447
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 178
structure length 447
sequence length 454
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fguA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3fguA01
2FF6A 3QBXA 4F9OA 2P9SB 2CGLA 4FPAA 5TKYA 3O8MA 4CZGA 3A5NC 3CJ1A 2CH5A 4MLHA 2F9WA 2V7ZA 2PBDA 1MDUB 3EN9A 1GLDG 2V7YA 4GY2B 4BRMA 5AQZA 1RDWX 3EKUA 1TUYA 4WQ5C 1ZBSA 4BRGA 4L3QA 1T44A 1SZ2A 1P8ZA 4CZJA 2A42A 4BVOA 4C23A 3L6QA 5BRFA 2HF3A 3GDQA 4HTLA 2ZWHA 5AQKA 4PL7A 3W0LA 3HM8A 4IO8A 3A5LC 2P9LB 3QFPA 1S22A 4A2AA 4JNEA 1SQKA 1GLAG 4K25A 5AZJA 5AQHA 4BR4A 1EQYA 1TYQB 3GL1A 2AP1A 3CQXA 2D4WA 3GG4A 4CD1A 3LDQA 4BR7A 3VERA 2ITMA 4A2BA 4BRAA 3S41A 2Q2RA 1HJOA 2WUSA 5AQRA 4BR9A 1XQSC 4FOIA 3SJHA 2E88A 1V4TA 4IZ9A 5AQJA 4EAHD 4MLEA 4FPBA 4EFHA 1NGJA 2GWKA 1BU6O 2HOEA 4GNIA 1WUAA 4IWVA 3ZEUA 2YHYA 3AAQA 3AY9A 5AQLA 4FWMA 5ADXH 3BEXA 1C0FA 4YDUC 2E2PA 2QW9A 3CJ7A 1HPMA 3SMPA 1HUXA 2ASOA 3QB0A 2E1ZA 2I7NA 1JCEA 1TUUA 1BA1A 5KPZA 2P9NA 4B1VA 3O08A 3CJAA 3I33A 3LDNA 3WXIA 3HBTA 3UKUA 3ZETA 5EXWA 1YAGA 1Y64A 3VENA 1Q18A 3RSEB 3D7EO 4CZLA 1HLUA 4BRLA 3UKRB 4DB3A 2V51B 1OKJA 3BF1A 3MDQA 3FFKB 3H1QA 3MCPA 2ASPA 2IVOA 1R59O 2P9KB 1E4GT 1QZ6A 4HWIA 3EZWA 4CBWA 1BO5O 3LDPA 2QXLA 2A5XA 3WQTA 1JCGA 3WEEB 2GELA 5B8HA 2FSJA 1BG3A 5I9EB 3R8EA 1NGGA 4NO7A 3U8XA 2CGKA 4CZHA 4EHTA 5KPTA 2V52B 2NLXA 1ATNA 4H0TB 4H0OA 3IDHA 4FWPA 3ULEB 2FF3B 5BN8A 1NGDA 5FPEA 1QHAA 5E84A 3ID8A 5AFUA 4CJ7A 3O5BA 3CETA 3VEOA 1HX1A 3CJCA 5BN9A 3G25A 4BQZA 1HKGA 2IVNA 1KAZA 4DQ8A 4CZIA 3JS6A 4JD2B 3VGKA 1YVNA 3VESA 3VEWA 4BR2A 2CH6A 4BVPA 5AQGA 1NGCA 3L0QA 3ZX0A 3A5OC 4BGBA 3C7NB 4H0PA 4DCHA 2YHWA 3IFRA 4WQ4A 4CZFA 3IUCA 5EVZA 4EIAA 4FWRA 2A41A 4FWLA 1QQNA 3TPQA 3MK6A 3DXKA 2P9PB 4JHDB 3DWLA 4I6MB 4H03B 5LY3A 2OANA 3TU5A 3D2FA 4O5FA 1NGAA 3GBTA 3KVGA 2A6AA 3O6WA 4BRCA 4CZEA 1MWMA 4CBXA 3A5MC 3QFUA 5JLFA 1Z05A 5FPMA 4BREA 1BOTO 1NGFA 2QWPA 3CERA 4IJAA 2Q1NA 2QWOA 3U4LA 3W3DA 3EKSA 3GE1A 2VYPA 3WXLA 1NMDA 1V4SA 3CHWA 2FXUA 2E20A 3BUZB 5AQYA 4Y0WA 2Q97A 5AR0A 2P9IB 5AZIA 4BRFA 2D1KA 4BRHA 3DXMB 3F9MA 4BRIA 1NGEA 3C0BA 3FZKA 2Q0UA 3VF2A 5EOYA 4BROA 3LDLA 4Z94A 3P4IA 2QWNA 2QWQA 5AQFA 3D2EB 4IXCA 4M63C 3VGLA 4PL8A 4FL9A 2QWRA 3H46O 4CI6A 5ADXA 5AQUA 1DEJA 1U2VB 2P9SA 4K43A 4PKGA 3ZX3A 1BDGA 1X3MA 3O1BA 3EO3A 5CE3A 3WQUA 1NGBA 4BRNA 1X9JA 4MO5A 4BGAA 4MO4A 3HZ6A 1NGHA 3HI0A 2YCHA 4BR0A 4QS7A 3FGUA 3IMXA 5BPNA 2GEMA 2IIRA 3ZX2A 3L4IA 4JN4A 2UYTA 3H45C 1XUPO 3ENOA 4RWTA 4PKIA 2AA4A 2P9LA 1K8KB 3ENHA 3LL3A 2E1YA 1U6ZA 1XC3A 2P9UB 2HMPA 3CI5A 5EX5A 1TYQA 2H3GX 1T6DA 4XH5A 4WQ4C 3VF4A 4JAXA 2A3ZA 1QZ5A 2QWLA 3FZMA 3DJCA 3WT0A 4M7YA 4PKHA 3U9ZA 5LJWA 2GTDA 3OHRA 2W40A 2ZF5O 2ZGYA 1CZAN 5AQMA 1D4XA 5BPMA 3FZLA 1JCFA 4BQLA 4QS9A 2E2QA 3VEYA 3MN5A 5BRHA 3ATVA 2NZTA 4H5WA 3KZBA 2FSKA 4ISEA 3QDKA 4B1UB 1YUWA 2PAVA 4H0XB 1RFQA 3FZHA 3M1FA 2YJFA 3SLCA 1ATSA 3VPZA 5AQSA 4B9QA 1NLVA 3QBWA 1GLBG 1MWKA 4QS8A 5FPDA 5AZJB 1KAXA 5JLHA 3GOIA 1GLEG 1H1VA 4AM7A 4FWNA 1GLCG 2D0PA 5AQPA 1ESVA 2ASMA 3LM2A 3R6MA 4FSVA 5F2RA 5AQVA 2W41A 5AQQA 4B1WB 3VF6A 1IG8A 3RSEA 4H0YB 3UKRA 3O1WA 1GLLO 2IVPA 3LDOA 4FWKA 2E2OA 4BR5A 5KPRA 2E2NA 3ZEUB 4ISFA 5KQ8A 1DGKN 3VEXA 2P9KA 4B1YB 3M3ZA 1NM1A 2Q0RA 2GUPA 4H5NA 4BC5A 5AQNA 3WEEA 3ATUA 4BC2A 2YJEA 5FPNA 5AQXA 3BP8A 3VEVA 5BR9A 1ATRA 4FWOA 5JICA 4FO0A 1ZXOA 2QM1A 3ULEA 2P9NB 1WOQA 3M6GA 3VEZA 2Q31A 3QMLA 3VOVA 3UKUB 4DHYA 4M7XA 3ZETB 4CZMA 4CBUA 2FSNA 2GWJA 4JD2A 5AQIA 4XH1A 1KAYA 4BC3A 3QICA 1J6ZA 5KQDA 4BRDA 4K41A 2YHXA 2EWSA 3C7NA 3KHYA 4B1ZA 3FLCO 2KHOA 1GLJO 3I8BA 1YXQA 4AM6A 1LCUA 3CJBA 5BREA 2Q36A 2ZGZA 2NRHA 2P9PA 4JHDA 3AARA 4I6MA 5E26A 4IJNA 2BTFA 1C0GA 3WXKA 5AQTA 3FZFA 1T6CA 4J8FA 3MN7A 4A61A 4CD3A 2CGJA 3VGMA 4H5VA 1NGIA 2VCPA 4K42A 3H3NO 3LM9A 4O8KA 4WQ5A 4A62A 1KXPA 1G99A 4FWSA 2A40A 3A8YA 1MA9B 5LJVA 1ZC6A 2I7PA 3UE5A 3SK3A 1BUPA 3DAWA 1QQMA 4BRPA 2P9IA 3HTVA 2E8AA 4RTFD 3DXMA 4BRKA 1GLFO 4ISGA 3MN6A 4E1JA 1DKGD 1Z6RA 2VWBA 3MMVA 3CJ9A 1IJJA 3O4WA 4BG9A 5AQWA 4WYBA 5F1XA 2BUPA 1E4FT 1BA0A 2D0OA 1SAZA 3D2EA 4XEIA 3DXKB 3EL2A 4EHUA 5EY4A 1S3XA 3CQYA 3FR0A 1U2VA 3H3OB 4LC9B 2J4RA 3D2FB 4H5TA 3JXUA 3B8AX 1QQOA 4XH4A 3R9PA 3H1VX 3UB5A 3WXJA 5BPLA 4H0VB 4RCHA 4NB4A 2QWMA 1NBWA 5BRDA 3O80A 3A0IX 1HKBA 3FE1A 4B1XB 4CZKA 2FLOA 3AAPA 4YDUA 3HSCA 1RGIA 3WUHA 4BC4A 3J8AA 2DPNA 4FOEA 5AZIB 1HKCA 3U9DA 4BRQA 1K8KA 3VETA 1X3NA 2P9UA 4H5RA 3SMSA 4KBOA 5AFUH 1BWFO 1LOTB 2YI1A 3BF3A 1NWKA 5ELZA 4BG8A 2F9TA 2HF4A 5F0XA 3CIPA 5JMVA 3H6EA 3MN9A 5AQOA 4FWQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSIA 2FF6A 4AHTA 4AILC 4NCBA 4CZGA 3A5NC 5HRNA 3I56N 4MLHA 1MDUB 2V7YA 3ZT3A 4DSLA 3HO1A 1RDWX 1T8EA 1VQKN 1HNXK 2JLEA 1T44A 1SZ2A 1P8ZA 4CZJA 4DQRA 1RNHA 4KTZA 3SAGA 4BVOA 3L6QA 4O8UA 2JWKA 3PUFA 2Y1IA 3GDQA 1QVGM 2ZWHA 2O8CA 5AQKA 3DRSA 4FLTA 3HP6A 4HCCA 2PY5A 1Q82O 1S22A 4PQUA 2ZJPL 1EQYA 1QTMA 3CQXA 4CD1A 3PSFA 4W5TA 4BR7A 2IC3A 3DRPA 5M1QA 4FVUA 3S41A 4CFBA 4FCYA 3S3NA 3OBYA 1XQSC 4FOIA 1SL0A 2E88A 1T7PA 3NGYA 1LWEA 3G0ZA 4DFPA 3LAKA 4FPBA 4E0DA 1TAUA 1RTHA 1VAZA 3SQ0A 4B9MA 2HOEA 1BU6O 1WUAA 5KRTA 3ZEUA 1IKWA 1T05A 1F21A 2KFZA 3RTVA 1C0FA 1REVA 3MX2A 4YDUC 3O9SA 3V9ZA 3CJ7A 1XWLA 5TKWA 4CIFA 5C12A 2NRWA 2I7NA 5H1SQ 1VK0A 4LF7K 1BA1A 1BISA 4B1VA 3BZKA 4PHTX 3O08A 1JL2A 3LDNA 2QKKA 3QIOA 3E9LA 1Y64A 4JKGA 4YFUA 4OGEA 1NKCA 1HLUA 4BRLA 3SV4A 1C1AA 2V51B 4X62K 1SKWA 4FLVA 4Z0UA 3MDQA 4BDPA 3CQ8A 4YOWA 2ETJA 2ASPA 3THXB 3QIPA 2OA8A 2IVOA 2W6KA 2P9KB 1E4GT 2YHBA 3EZWA 2R7YA 4DTSA 2RPIA 2FSJA 4JKBA 4CZHA 2CGKA 1X9MA 1ATNA 5J2NA 3ZYYX 2NNWA 1RTIA 3IDHA 4H0TB 5C24A 1NGDA 3KWIA 5FPEA 3EEQA 3O5BA 4CF8A 3JYTA 4UY8O 5MLCQ 4B3RK 3G25A 1IG9A 4KI6A 2IVNA 1HNZK 3E66A 5CYMA 4DV3K 3C6AA 2CH6A 3SQ1A 3T1YK 1NGCA 1QHTA 4LSNA 3ZX0A 1M90O 2HVIA 1BL3A 4W5OA 5FROA 4B9NA 1XHXA 1JXEA 2YHWA 4QAGA 5CZ1A 4CZFA 3QEVA 4F3OA 4EIAA 2A41A 3DLRA 1QQNA 3TPQA 1YTAA 3OYLA 4B9LA 3KD1E 3F9KA 4BWMA 5LY3A 2OANA 4CF9A 3D2FA 3I0SA 3O4QA 4YOUA 2BGGA 4IDHA 3KVGA 2A6AA 3O6WA 4OPKA 4CJUA 4E7IA 1Z05A 4CJFA 1NGFA 4KHUA 3CERA 2PZSA 1EXQA 3EKSA 4MFBA 3NH1A 1KFSA 3WXLA 4W5QA 1NMDA 1V4SA 5AQYA 3IS9A 3TARA 2HBMA 4OO1J 1K9MO 5AR0A 1UWBA 5AZIA 4DQSA 3CF5L 1EWRA 3O4NA 3F9MA 2RKIA 3LP2A 4BRIA 1NGEA 3C0BA 4Z4HA 2GV9A 5FLXO 1HR0K 5EOYA 1WSHA 1QSSA 4BROA 2D0CA 2RE2A 4U7BA 3O9QA 2IGIA 3D2EB 4GV6A 1IH7A 4FL9A 1QQCA 2D0AA 4PKGA 3QNOA 3EO3A 3WQUA 1A5WA 4CW7B 1N8RO 1KVCA 1A5XA 1NGHA 4EZ9A 3LANA 3TTFA 4BR0A 2LSNA 3JSMA 3A2FA 4Z4IA 2OYQA 2GEMA 2F7TA 3NBPA 3HP9A 3CCLN 4M41A 4CCHA 1HNVA 1CXUA 1Z25A 2P9UB 3C65A 1VQ4N 4XH5A 4WQ4C 1SS6A 3VQ7A 1JL1A 1IO2A 2VG7A 4W5RA 3VQ4A 1HMVA 4UQGA 3DLBA 3KK1A 3CCSN 3KLGA 4X66K 3LPUA 2P5GA 4BQLA 4KFBA 3RMCA 3MECA 3VEYA 2Z1JA 2X74A 4AHRA 4PWDA 3SQ2A 3AO2A 1HQEA 3C6TA 1ATSA 4M3WA 3VPZA 4IOAL 3ID6A 5AQSA 4QS8A 3ZSYA 3ULDA 1TV6A 2FBTA 4YOYA 3QERA 4DSIA 1YITN 3THWB 1H1VA 1TKDA 3PIPL 1NMNA 1KTQA 4FJLA 3O3FA 2E5LK 5DK5A 5DM7L 3R6MA 4FSVA 1NK6A 5F2RA 4FVMA 4H4OA 5AQVA 4B1WB 1BIZA 4FZZA 1IG8A 5KI6A 1RDCA 3HT3A 4FK2A 3TAFA 1C6VA 1TL3A 3NF7A 2DY4A 3CM6A 1QVFM 2GX9A 1WSIA 2E2NA 1KD1O 5KQ8A 2RHKA 1RT2A 2Q0RA 4H5NA 2GUPA 3AGKA 2BDPA 5AQNA 3NCIA 3ATUA 4JKAA 1K6YA 3K58A 2YJEA 4B08A 4FO0A 2QM1A 3ULEA 4NXNK 4BWJA 4DTPA 3NH2A 3ZT1A 2BH1A 1NK5A 2Q31A 1KRPA 4E19A 3UKUB 4DHYA 4IG3A 4CZMA 1D9FA 2GWJA 3NMUA 4JD2A 5AQIA 2HHSA 1J6ZA 5JS2A 4BRDA 4IO9L 2XY7A 3U3YA 3C7NA 1KFDA 2G8VA 3L8BA 3KHYA 3FLCO 1NJZA 4N76A 3I8BA 4AM6A 2Q36A 2ZGZA 2NRHA 1ITGA 2P9PA 3AARA 3D6RA 2G8KA 3QINA 3T1HK 3V9UA 2KLAA 1C0GA 2HBJA 4M3UA 4J8FA 3PSIA 4HUGA 2XY8A 4CD3A 2CGJA 4I2PA 4WQ5A 4DTOA 2A40A 4A59A 3HYFA 1D5AA 1VQON 4DQIA 4WE1A 3CCEN 4JI4K 2P9IA 5I42A 4Q0BA 4F2RA 4ISGA 3MN6A 3RMAA 4K8ZA 2KW4A 3O4WA 1IJJA 3AVNA 3NDKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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