4FZZA

Exonuclease x in complex with 5' overhanging duplex dna
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
b'MLRIIDTETCGLQGGIVEIASVDVIDGKIVNPMSHLVRPDRPISPQAMAIHRITEAMVADKPWIEDVIPHYYGSEWYVAHNASFDRRVLPEMPGEWICTMKLARRLWPGIKYSNMALYKTRKLNVQTPPGLHHHRALYDCYITAALLIDIMNTSGWTAEQMADITG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords DNA (5'-D(*GP*TP*CP*AP*TP*TP*GP*TP*GP*GP*AP*TP*CP*CP*GP*AP*G
publication title Recognition and processing of double-stranded DNA by ExoX, a distributive 3'-5' exonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/dna
total genus 44
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.-:
pdb deposition date 2012-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4fzzA00
3PO4A 4KI4A 3AVBA 1Q9XA 3DYAA 4UQGA 4FK4A 1RILA 2IGIA 3G0ZA 4GMJB 4CCHA 4CJTA 4HHTA 4H4MA 1HPZA 2QKKA 1FXXA 1RTDA 3DRSA 4JS4A 3V9XA 3VQAA 4DTPA 5C42A 3DOLA 3KLFA 3RMBA 1KRPA 4DTSA 2RN2A 1A5VA 2ITGA 4FLYA 3SNNA 4AHRA 4RG8A 2YV0X 3HK2A 1TL3A 3OYFA 1XWLA 4CFDA 3KLIA 3OVNA 3VQDA 1BIZA 1QSLA 4F8RA 3ZSWA 4DS5A 4CJUA 3LZJA 2G8IA 4H8KA 2DY4A 4CF9A 1U45A 1JLGA 3SV3A 1UA0A 4HCBA 3VQCA 4K8ZA 1TKXA 3HPGA 1L3SA 5KGWA 4CEDA 1SUQA 4CHYA 3RMDA 3AA4A 1YVUA 4W5QA 4N76A 5SZTA 3S3OA 3P5JA 4CERA 3JSMA 3NGYA 1S1TA 3SPZA 5K14A 3L2VA 1B9FA 1KVBA 3IRXA 1XC9A 4M42A 4PQUA 3C6TA 1TL1A 2B6AA 3RR7A 1KTQA 3I0RA 3HL8A 3NE6A 4FLWA 4LH4A 1QSYA 1VSDA 4CEOA 3NAEA 1IG9A 5C25A 4CJRA 3RWUA 3VQ8A 2FBXA 5SWMA 4RW6A 4M3WA 4M3TA 4DQRA 1KFSA 4DSEA 3BGRA 1WAFA 1DTQA 4RW7A 5E41A 1WLJA 1BQMA 2YNFA 3KLGA 4IG3A 1L3TA 2P5GA 2HVIA 1HQEA 1D9DA 4OLAA 4DQQA 3IS9A 3DLBA 3P1GA 5HBMA 3SPYA 1XI1A 3DLGA 3AVJA 1X9MA 1CLQA 2Z1HA 3NCIA 1U49A 3DOKA 4GW6A 3V1OA 4OPJA 3O3GA 4ZHRA 3K57A 1T7PA 4LSLA 1D5AA 1UOCA 3OY9A 1JXBA 1SL1A 2X6NA 3S3NA 4C8NA 4FYDA 3O3HA 1UA1A 2A1SA 3VQ9A 3C94A 1TKDA 4CGGA 3KD5E 2HB5A 1JLAA 1RT2A 5I42A 1DTTA 2G8WA 4BWJA 4KV8A 3QIOA 4CJ5A 3C95A 4RW9A 4ZTFA 2HNZA 4KRFA 1RDDA 2FBTA 4HUFA 2VG6A 4DU4A 1U04A 2OPSA 1KFDA 1Y97A 3T19A 3ZT3A 4JS5A 4E0DA 4DFMA 1CZ9A 4W5RA 3DI6A 4CF2A 3SUNA 3QEPA 1X9WA 3QEVA 5FRNA 1JKHA 4KHWA 1A5WA 3QO9A 3IAYA 2G8HA 1EP4A 3VA0A 1KLMA 1S1VA 3VQPA 1WSEA 2Z1JA 3ISNC 4FW2A 3QEXA 3LAKA 3KD1E 4CJVA 3HSTB 3DLKA 3ITHA 2Z1IA 4B9MA 5HP1A 2YNHA 3B6OA 1KCFA 3TAPA 2HNDA 5J2MA 4OLBA 3OS1A 4CJQA 2IS3A 3AVLA 4J2DA 5JS1A 4G1QA 3WNEA 3SQ1A 4FJKA 2IDOA 1RTJA 2Z1GA 4CGJA 3AO4A 4CHNA 4DTNA 1SKWA 2PY5A 2QKBA 2ZQBA 1VSIA 3HP9A 4CK3A 2JGUA 1LV5A 1GOCA 2HHQA 2ZD1A 1SKSA 1ZBLA 3SZ2A 4FLVA 1YTAA 4Y1DA 3RRHA 1T8EA 1X1PA 3SUPA 1C1CA 2G8FA 4CESA 4KI6A 4EZ6A 4C8MA 1HNVA 4GVMA 2OPPA 3RRGA 3CYMA 5CYMA 4E7IA 4FJLA 5HLFA 4OVLA 4FJMA 4KTWA 2GUIA 3SYZA 4E7HA 5CYQA 3ALYA 3ZSXA 4AILC 1KSPA 2DFEA 3PX4A 1TK8A 4RW8A 4O4GA 1F21A 3AVHA 3LANA 2O4IA 1U47A 4IFYA 3HVRA 3QNNA 4KAZA 1HJRA 3L2UA 4AHTA 1Z25A 3P83D 3L2WA 3CQ8A 4FM0A 3PX0A 2F8SA 4KPYA 4FLTA 4N56A 1QSSA 1GOAA 3AO2A 3QINA 3NGZA 4I9QA 2HHSA 1VSKA 4CEBA 1T05A 2YHAA 4DF4A 1HNIA 1IKWA 5CZ1A 2VG5A 4XIUA 2Y1JA 2XY6A 4ZTJA 2XY5A 1QTMA 4J2AA 3NBPA 1C0MA 4B9LA 4J2BA 3AVMA 1RTIA 3IG1A 3KK3A 1ZBUA 3ZSQA 4ID1A 3NF8A 4AHUA 1S1XA 3L3UA 3LALA 4CHQA 3OS0A 2P1JA 1R0AA 4FXDA 3V6DA 1NK9A 3MEDA 4DFJA 3MEEA 1BISA 3O4QA 4NYNA 2A1RA 1CXQA 4KHUA 5KRSA 3QETA 4KTZA 3VQ7A 2XRIA 5HRRA 3F73A 2W42A 4MQ3A 2HHUA 1NOYA 4JRQA 5HROA 1WSHA 3OYCA 4FJNA 3HP6A 3MXIA 4KTQA 2P5OA 1LWEA 4CGIA 3HT3A 3TI0A 1VSHA 2X78A 3MECA 3AVAA 2BDPA 2I5JA 4NCBA 1C0UA 4E1NA 1LWFA 4M3UA 1NK6A 1ASVA 1C6VA 4BWMA 1QS4A 5J2PA 2FBYA 3PX6A 4ID5A 4C8KA 4FJIA 2XHBA 3MXJA 4ELUA 2QK9A 3THVA 1O1WA 4N47A 1HYZA 1J54A 3UIQA 1U4BA 1NKEA 4CHOA 4QCLA 4OGCA 1RNHA 3WNFA 4CJ3A 1L3VA 3LP2A 3PV8A 4CEAA 4FZZA 4OKKA 3AVIA 3TAMA 2HNYA 5FROA 4CIGA 1B9DA 3VQ5A 4M3YA 3DLEA 2PZSA 2DTUA 3KK1A 3VQQA 4DG1A 4LSNA 3TAGA 1WSIA 3L2RA 3RMAA 1NK8A 4BE0A 5C24A 4AHCA 3U3GA 2OZSA 3OYIA 1FKPA 2B4JA 3ZT2A 1VSEA 3A2FA 4BDPA 1KVCA 1RTHA 2RPIA 3ZCMA 2GV9A 4E7JA 4EP4A 4QOZB 4QAGA 3K5MA 1QHTA 2O4GA 3DMJA 1N5YA 1IKXA 2HMIA 4J2EA 1WSGA 3EY1A 1NJWA 1S6PA 4DQIA 3QIPA 1LAVA 1VSFA 3ZT1A 2DFFA 3VQEA 3TAQA 1NJYA 4PUOA 1TV6A 1NKBA 3SQ0A 4DSIA 2WONA 2FC0A 3V81A 3PUFA 3LP0A 3K59A 5J2QA 2HHWA 4F3TA 4FK0A 3DLRA 3OJSA 3ZSVA 1BCMA 4OKEA 3WNHA 2G8UA 4F2SA 4DTOA 1ZBIA 1SL0A 1MU2A 1RBRA 2ETJA 2IC3A 4DS4A 1JXEA 4DQSA 1JLEA 1JL1A 2B5JA 3LPTA 4FM2A 4F2RA 4BE2A 4HCCA 2XO7A 1FKOA 3LPUA 4B8CA 1S1WA 4IFVA 3VA3A 3OJUA 1NOZA 1VSLA 3EYZA 3OYNA 2R7YA 4ELVA 2KQ2A 3CFRA 3CM5A 1Q9YA 4FJJA 3KKRA 5KRTA 4B08A 4KO0A 3KK2A 1RBTA 1WSJA 4O0IA 4DSFA 3LP1A 3V9WA 5CZ2A 2WOMA 4AHVA 1EETA 4DTUA 1QQCA 4B9NA 2JLEA 4R5PA 3TWHA 2FBVA 1ASWA 2QXFA 1S9GA 4NYFA 2EHGA 3NFAA 4WE1A 4KHQA 3AA2A 1WAJA 1C1AA 2XY8A 4FLUA 1NJZA 2KZMA 4OGEA 3ZSRA 4Z4CA 4FZYA 2HHXA 4CF1A 3HPOA 2HW3A 1BCOA 3ASMA 1IKVA 1L5UA 3L2QA 3T1AA 2ATQA 3D45A 2KZZA 4IG0A 1GOBA 3OYLA 1JLCA 1RT4A 4DU1A 1SKRA 3TR8A 3I0SA 1BL3A 4M41A 3V9UA 2BANA 2DFHA 3AA3A 3NF7A 4OJRA 4E89A 4N5SA 3KLHA 3M8RA 3SJJA 1RT1A 4W5OA 3U6FA 2E6LA 1CZBA 5T7BA 2AJQA 4E3SA 4F4KA 3PO5A 3ZSZA 4HTUA 4W5TA 4O44A 3NDKA 1ZBHA 3HM9A 4E7LA 5DK5A 2KFNA 4CJFA 3NH1A 3KLEA 3G10A 3SI6A 4CECA 4FM1A 2OZMA 1IKYA 4O5BA 1KVAA 2YNGA 4IBNA 1RBSA 1TK0A 1HYVA 1XHXA 3L3VA 1RDCA 4Z4GA 1RDBA 3OYAA 3NGIA 4FJ8A 1LAWA 4CGHA 4AHSA 3H08A 3HYFA 3OYDA 1S9EA 2D5RA 4FZXC 3QEIA 1NK5A 3ZT4A 4Q0BA 3QNOA 3KJVA 4CJ4A 3B6PA 4DSLA 4LH5A 3SUOA 2BGGA 4CJPA 4C8LA 1SV5A 1ZBFA 3TABA 4CEEA 3SCXA 3M8QA 1RDAA 1VRUA 1RT3A 4CHZA 1RBUA 1VRTA 4KB0A 4HVJA 1HYSA 3DM2A 1JLQA 4HUGA 1UWBA 1HQUA 1LW0A 1WSFA 4I2PA 1DLOA 1C1BA 2VWKA 3LWMA 5HRPA 4BDZA 1BI4A 3RTVA 4CEFA 3KTQA 2YKNA 4DFKA 3LP3A 3TAFA 4FJXA 4DTMA 4KFBA 2YHBA 4LY7A 4I7FA 2OPQA 1BIUA 4FJHA 4PA1A 2G8KA 4FJ9A 5EU7A 1VSMA 4PWDA 4FJ7A 4M3XA 3S3MA 2NUBA 2RKIA 5FRMA 1I3AA 3HXMA 2KW4A 1WN7A 5DMRA 4BE1A 3DRRA 3K5NA 1FK9A 2LSNA 2YKMA 2KTQA 4DMNA 5KTQA 1BQNA 1W9HA 5CY4A 3WNGA 4CGFA 3OYBA 3OYHA 4E7KA 4OPKA 3CG7A 4Z4FA 4EP5A 2OA8A 3AVNA 3EZ5A 4DQPA 3AA5X 1LWCA 2HHTA 3HPHA 1TK5A 1TGOA 3K5LA 2E4LA 4CJKA 1NKCA 4IKFA 3CFPA 4FLZA 3LWLA 4FK2A 2Q3SA 3NF6A 3ZT0A 1L3UA 4FJGA 4K8XA 2F8TA 4CFBA 1NK4A 2D0BA 1J53A 4AH9A 5HRSA 1CXUA 4DSKA 3TANA 4E1MA 4O55A 3CFOA 3ULDA 3AVFA 3M8PA 1JL2A 4BDYA 1RBVA 2GBZA 3E01A 1EKEA 4CJLA 4L8RB 3QLHA 1ASUA 3HVTA 3S9HA 3AVCA 4YFUA 4DTXA 1TAUA 3DRPA 1IH7A 1UAXA 4KHSA 1QE1A 3DLHA 3SQ4A 2OYQA 2IAJA 1TVRA 3BDPA 4Y1CA 3U3YA 3NHGA 4FJ5A 1LW2A 4JRPA 3QERA 2RF2A 3V4IA 1VK0A 3I8DA 3TAEA 5J2NA 4DF8A 3ZSYA 4CK2A 3D0PA 4CEQA 4CK1A 1HMVA 1BI4B 3AO3A 3AVKA 3KKSA 4ICLA 5FDLA 4DFPA 3AV9A 4Q5VA 3O4NA 3K2PA 4NCGA 4KB1A 2IOCA 3SQ2A 1G15A 3RR8A 4DU3A 2ZE2A 2D0AA 2HVHA 1BHLA 3ZSOA 1NK0A 5JS2A 1KLNA 4KHNA 1S1UA 4IDKA 3V9ZA 4F3OA 4B9SA 4B9TA 4DTJA 1RT7A 2X74A 3O3FA 1TKTA 4CF8A 3KIOA 5KGXA 4O0JA 1NJXA 2PYJA 4CF0A 1D8YA 4HUEA 4N41A 3LDSA 3K5OA 3LAMA 1ITGA 2X6SA 4H4OA 1XHZA 4BACA 4M45A 4CIFA 3TARA 2HHVA 4DLEA 2G8VA 1RCHA 3F9KA 4RW4A 1TKZA 1B92A 1HRHA 4CJWA 2XY7A 1VSJA 3T3FA 3AO1A 3M8SA 4CGDA 3NH2A 1J9AA 4KHYA 2D0CA 4DWIA 3AO5A 1IO2A 4B8AB 3AVGA 3OYGA 3JYTA 2Y1IA 5I3UA 4B9UA 3C6UA 3OS2A 1WNSA 4DSJA 1A5XA 4LD0A 4C8OA 2KFZA 4CHPA 3HO1A 1JLBA 1JLFA 3OYMA 3PY8A 4PY5A 1EX4A 3OYEA 3VQBA 4CFCA 4Z4HA 3CM6A 3OYJA 4FLXA 1YTUA 4B9VA 1I39A 4FW1A 1ZYQA 1TAQA 3V1RA 4FCYA 4KREA 3SV4A 4CIEA 3NF9A 4DTRA 4Z4EA 3MXMA 1K6YA 5HRNA 2BE2A 2E6MA 3HJFA 4OKJA 4YNQA 4I2QA 1RT6A 2EX3A 3QEWA 3SUQA 1U48A 2P51A 4CE9A 1EXQA 4W5NA 1X9SA 3MEGA 1Q8IA 1RT5A 3FFIA 4JLHA 4TSXA 4MFBA 1NK7A 4M3RA 1YT3A 3NH0A 3QESA 3RMCA 5D3GA 3OYKA 4B3OA 1BGXT 4NCAA 3L8BA 3VQ4A 1REVA 4CJSA 3LZIA 4CFAA 4Z0UA 4M3ZA 2OPRA 4I9LA 4CJEA 3MAQA 1W0HA 3K58A 1SL2A 1T03A 4EZ9A 5KI6A 1J5OA 3V9SA 4KKOA 2PYLA 1S6QA 2VWJA 4E19A 3VQ6A 1S5JA 4ELTA 3V1QA 1D9FA 4Z4IA 2VG7A 5J1EA 4DLGA 2F96A 2YNIA 4FVMA 3VN5A 1Z26A 4CEZA 1C0TA 1N6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PO4A 4WFNL 2QWLA 1HPZA 4JS4A 3VQAA 5C42A 3DOLA 3N4PA 3KLFA 2HOEA 1KRPA 1Y64A 2ITGA 3ENOA 4FLYA 3SNNA 4AHRA 2P9KB 2YV0X 3OBWA 2IVNA 4C1NK 3TPQA 4F8RA 4H8KA 1U45A 3SV3A 5C2DA 3VQCA 1HUXA 3M1FA 3CC4N 3ENHA 4H03B 4LFBK 4NXMK 3VF6A 4NB4A 4H5WA 2QWQA 3SJHA 4CERA 3NGYA 1S1TA 4YOWA 2ZJPL 1B9FA 3C6TA 1TL1A 5LMUK 3QFUA 1QSYA 2VYPA 1NGFA 3NAEA 3QMLA 1IBKK 4M3WA 3KHYA 1XQSC 5E41A 2YNFA 3KLGA 2HVIA 1EQYA 4H0TB 4OLAA 3P1GA 1XC3A 3AVJA 1NGIA 1X9MA 4IXCA 4BG8A 1CLQA 4GW6A 4ZHRA 4BRGA 1JXBA 3MN7A 3S3NA 3NMUA 4K25A 3MDQA 2VQFK 4CGGA 2HB5A 4I6MB 5I42A 4BWJA 4GVEA 4KV8A 3QIOA 3O6WA 5AQLA 4KRFA 3A8YA 3H3NO 1KFDA 4JS5A 4E0DA 1CZ9A 1X9WA 1TUYA 1GLLO 1QZ6A 2PBDA 3IAYA 4JI5K 3VA0A 2VGNA 2GEMA 2ZJQL 3QEXA 1JCGA 4DR2K 3ITHA 2Z1IA 2YNHA 3B6OA 5J2MA 3CF5L 3D2FA 4BRIA 4CJQA 3FGUA 3WNEA 4FJKA 1RTJA 3F2KA 4BR4A 1SKWA 2ZQBA 2E2OA 2ASOA 3SZ2A 3LM2A 5JICA 3RRHA 1X1PA 1C1CA 1YXQA 4CESA 1BOTO 4EZ6A 1HNVA 2O8CA 4FJLA 2KHOA 4OVLA 3FZKA 4CD3A 1OVQA 4E7HA 3ALYA 1KSPA 4BC4A 4O4GA 2O4IA 1U47A 3HVRA 4CZFA 1QQNA 5AFUH 4DR6K 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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