4FZZA

Exonuclease x in complex with 5' overhanging duplex dna
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
MLRIIDTETCGLQGGIVEIASVDVIDGKIVNPMSHLVRPDRPISPQAMAIHRITEAMVADKPWIEDVIPHYYGSEWYVAHNASFDRRVLPEMPGEWICTMKLARRLWPGIKYSNMALYKTRKLNVQTPPGLHHHRALYDCYITAALLIDIMNTSGWTAEQMADITG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords DNA (5'-D(*GP*TP*CP*AP*TP*TP*GP*TP*GP*GP*AP*TP*CP*CP*GP*AP*G
publication title Recognition and processing of double-stranded DNA by ExoX, a distributive 3'-5' exonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/dna
total genus 44
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.-:
pdb deposition date 2012-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4fzzA00
3B6PA 4DWIA 3VQPA 3DLHA 4KHWA 3NH1A 1RT1A 4CJ5A 2Z1GA 4CJQA 3S3MA 1S9GA 4E1NA 4FJIA 2B6AA 5KRTA 4FLXA 4LH5A 4NYNA 4GMJB 3TR8A 1HYVA 3P1GA 4JRQA 3PX0A 1KLNA 1QSLA 1QHTA 4DTXA 1QSYA 1ZBFA 4MFBA 3TANA 4NCGA 2D0CA 2HHTA 4CFDA 1BL3A 1TL1A 3RMDA 1ZBUA 2ZD1A 4DFKA 1B9FA 2IC3A 4O55A 4CIGA 3HXMA 1T7PA 4KPYA 3A2FA 3ZSQA 4RG8A 2PYJA 3QINA 4M3YA 4CERA 1IKXA 3AVKA 1JLAA 1ZBLA 4RW8A 4OJRA 3NFAA 1S1TA 3V81A 1RT6A 3QEPA 3SNNA 4F3OA 1IKYA 2KFZA 4N5SA 2YHBA 4KHQA 1XC9A 4OPJA 1HQEA 3CFPA 1WAFA 3ZSYA 1VSHA 4CJPA 1KTQA 4AHVA 3M8SA 4DU3A 3HVTA 4DSKA 3NAEA 1Q8IA 3ZSOA 3CFOA 4M45A 4CFCA 3CFRA 2R7YA 3RR8A 2OZMA 3VQ9A 1KFDA 3KIOA 3RMCA 1L5UA 1FKPA 4Z4GA 3L2VA 2OA8A 3ZT2A 1X1PA 3MECA 3E01A 4C8KA 2ITGA 4Z4EA 3T1AA 3UIQA 4PWDA 2DTUA 1K6YA 5HRPA 3QEXA 4K8ZA 1NK5A 2BANA 3V9ZA 3HL8A 4DU1A 3U3YA 4M3ZA 1VSDA 3CM6A 1JLFA 4C8OA 4B9LA 4KHSA 4B08A 1RDAA 3O4NA 3HM9A 3EY1A 5CZ1A 4CIEA 2O4GA 3M8RA 1T05A 4E19A 1NK9A 1D8YA 4FXDA 4O44A 2E6MA 4ZTJA 3SCXA 4W5NA 2QXFA 1VSFA 4N47A 3LZJA 1CLQA 4HHTA 4BE1A 4B9NA 4DLGA 3AO3A 3JYTA 3VA0A 3AA4A 3SQ0A 4OLAA 4HCBA 1UAXA 4ELVA 1NJZA 3AVAA 3V1OA 2YKNA 3TAPA 3QEWA 4KO0A 3VQ5A 2BDPA 2YNFA 4CF2A 4Q0BA 2BE2A 1GOAA 3MEEA 4BDZA 3KK3A 2FBXA 4CEBA 5D3GA 2P51A 1JLQA 3NGZA 1RDDA 1BISA 5J1EA 4FCYA 3BDPA 1NKBA 4CCHA 3RRHA 4DSIA 4N76A 1N6QA 2F8SA 3L8BA 3MEGA 3QEIA 4M41A 3KLHA 3SV4A 3LALA 3NF9A 3SQ1A 4KHYA 1WAJA 4DS5A 4CK3A 3QETA 2YV0X 3I8DA 2HNZA 3QEVA 4L8RB 1KVAA 3AV9A 3DM2A 1Y97A 1LWCA 4CFBA 4E0DA 3ZSXA 4HVJA 5SZTA 4B9VA 1HNVA 2Z1HA 1S1WA 3F9KA 3OVNA 4IBNA 4CEAA 4J2AA 3LWMA 4RW9A 4ZHRA 3KD1E 3QESA 4C8NA 2EX3A 3OY9A 1JLGA 3RTVA 3V9XA 4M3TA 4I2QA 4DTUA 1RILA 1VSMA 2YHAA 1GOCA 3OYCA 4LY7A 4CHPA 2D0AA 1LW2A 4E7KA 3DLKA 3CQ8A 3OS2A 4BE0A 3BGRA 1D9FA 3EYZA 3TAMA 1SL2A 3LP0A 2YKMA 4KFBA 1NK0A 4DTJA 2D0BA 2OPRA 2HHWA 4OKEA 1TKDA 1C0MA 2YNIA 3P83D 5HRSA 4FM2A 1Z26A 3KTQA 2VWJA 3SQ4A 3AVBA 4B3OA 2VG6A 1S6PA 3PX4A 1S1VA 4LSLA 1U04A 4FLVA 3TAFA 4CEOA 4ID1A 1JXBA 1HYZA 2HB5A 3OYHA 5HP1A 4M42A 4FVMA 3VQ8A 4CJLA 1W9HA 5K14A 3AVJA 3OS1A 1RBRA 3V6DA 2HNYA 4R5PA 3K5LA 3TWHA 3V9SA 5FDLA 3VQ6A 3VQAA 2HW3A 2Z1JA 3PUFA 4FLTA 5HLFA 3KLGA 3DYAA 3HPHA 4O4GA 4M3WA 1TK0A 3DRRA 4RW6A 4DTPA 4DSFA 2EHGA 2KZMA 2B5JA 1XHXA 2OPPA 3TARA 1XHZA 4TSXA 2OYQA 3PY8A 4B9SA 3LP1A 1NKEA 2HHQA 3HJFA 3T19A 2O4IA 1QQCA 4DTOA 2IOCA 2JLEA 5J2PA 4J2DA 3O3HA 4CECA 3HPOA 1NK4A 1ITGA 1XWLA 4NYFA 5EU7A 5HRRA 1L3TA 4FJGA 4IFYA 4FLZA 5CY4A 1RBSA 2BGGA 1TVRA 4DTRA 1F21A 3S3NA 4ELUA 2X74A 1JL1A 3LZIA 2DY4A 4CFAA 4HUFA 3ZSZA 3ASMA 4Z4IA 3NH2A 4CHOA 3VQBA 1X9SA 2HVHA 4BACA 2HHUA 1BIZA 1RT2A 1JLBA 2VG7A 2WONA 2A1SA 3DLRA 3G0ZA 3LP3A 1B9DA 4AHUA 4Q5VA 1FK9A 4W5TA 3D0PA 1KRPA 3KKSA 4HUEA 3HO1A 4LH4A 1T03A 4FW1A 1RBTA 4NCAA 4BDPA 5HBMA 1IH7A 4DTMA 3KD5E 2Y1JA 2FBYA 2F8TA 1HQUA 2HHXA 3TAQA 2F96A 3L2RA 1VK0A 3QERA 3AA3A 3ZT3A 1KFSA 3DLEA 3OYIA 3LP2A 4JRPA 1NK6A 2KZZA 1L3SA 3RR7A 3DOKA 4WE1A 1TL3A 2VG5A 5KRSA 4CGDA 1VRTA 3D45A 3M8PA 4PUOA 4XIUA 4KTWA 3RRGA 2HNDA 3ZSRA 4RW4A 1I39A 3QIPA 4IKFA 1C0UA 2G8KA 1EP4A 1WSEA 3S9HA 4EP4A 1RBVA 4N56A 1ZBIA 2XHBA 3KK2A 3FFIA 3ISNC 4FJJA 2VWKA 3K5OA 4FJMA 2ETJA 4AHRA 3CM5A 3NF6A 1RBUA 3MXIA 1VRUA 4M3UA 4FLUA 4DF8A 4CGIA 4OPKA 4CIFA 1TKXA 3OYFA 4HUGA 4KTQA 1Q9XA 4BWJA 4KI4A 2D5RA 2ZQBA 3MAQA 3HK2A 4KI6A 1G15A 1S5JA 4Y1DA 4B8AB 3IAYA 2FBTA 2XY5A 4AHCA 1J53A 3OYAA 2LSNA 1EETA 4KV8A 3OYMA 2QKBA 4ID5A 1ASUA 3RMBA 4Y1CA 1DTQA 1TAQA 2YNHA 3HP6A 4DFPA 2KTQA 1WN7A 3HYFA 3AO2A 1RTHA 4OGCA 4BE2A 4E7LA 4C8LA 1WSHA 4PY5A 3ZT0A 3NDKA 2X78A 3NGYA 3AVGA 3B6OA 1FKOA 4G1QA 4H4MA 4FJ5A 4FYDA 4Z4HA 1WSIA 4FJLA 4I2PA 4M3XA 3VN5A 3AVMA 4DF4A 1WLJA 4KB1A 3AVNA 1ZYQA 4PQUA 3H08A 3V9WA 4O0JA 4CF9A 3ZCMA 5C42A 3RWUA 1U45A 4FZYA 1I3AA 3DRPA 1C6VA 4DQQA 3SUPA 4CJUA 1WSGA 4I9QA 4ICLA 4IDKA 2IS3A 4CEEA 3IG1A 3C6UA 4H4OA 3K58A 3DRSA 1TKZA 5J2QA 4EZ6A 1R0AA 3K2PA 4DQRA 3ZT4A 4DSJA 1A5XA 5FROA 2Y1IA 4FK2A 1HMVA 1RDCA 1S9EA 3SI6A 4FW2A 3RMAA 3OYJA 1D5AA 4J2BA 4OKJA 1C1AA 1LAWA 3VA3A 3VQDA 4W5OA 2Z1IA 5I3UA 4MQ3A 4CHYA 4FJ8A 1JL2A 1DTTA 5C24A 4B9TA 4N41A 4YFUA 4DFJA 4CHZA 3SJJA 1B92A 1JKHA 4I9LA 2FC0A 2IGIA 1SV5A 3ITHA 5HROA 4EP5A 1BGXT 3AO5A 3HP9A 4KKOA 3QIOA 4Z4FA 1U47A 2PYLA 2GBZA 2HMIA 5JS1A 4H8KA 2RKIA 4Z4CA 5SWMA 3K57A 2ZE2A 2DFFA 3L3UA 4E89A 5J2NA 1J5OA 4ELTA 5JS2A 4F8RA 1A5WA 4E3SA 3DI6A 1U49A 1LW0A 4CJEA 4CJRA 4KRFA 1HNIA 3O4QA 3K59A 5T7BA 1KLMA 3VQ7A 3K5NA 3DLBA 2HHVA 2XRIA 5CZ2A 3MXJA 4K8XA 4F3TA 4F2RA 4FZXC 3NH0A 2RN2A 3LANA 4DQSA 4C8MA 1ASWA 3V1RA 5I42A 1BHLA 3WNEA 4F4KA 4E1MA 1VSIA 3OYLA 3HVRA 4E7HA 2JGUA 1NOZA 1SL0A 4QCLA 3V1QA 1HJRA 3NF7A 4CHNA 4DTNA 2HHSA 4CESA 4O0IA 1QTMA 2QKKA 4NCBA 2FBVA 4JS5A 4CK1A 4FLYA 4GW6A 4CF8A 4LD0A 4JS4A 1FXXA 2G8VA 3PV8A 1EKEA 1YTUA 3DOLA 1J54A 4J2EA 1S6QA 1NK7A 4OKKA 1NJYA 1LWEA 1NJWA 4CK2A 2X6SA 3SPYA 2OPSA 1C0TA 3L2WA 1X9WA 3PO4A 3OS0A 3OYNA 1KCFA 3U3GA 2PZSA 1RT4A 2G8IA 2KW4A 1SUQA 5CYQA 1JLEA 3AVHA 3KLFA 3G10A 1KVBA 3QNNA 2KFNA 4ZTFA 4F2SA 1RCHA 2P1JA 4KHUA 3PO5A 4CE9A 4DMNA 1MU2A 1QSSA 3AVLA 1NK8A 3KKRA 4UQGA 2DFHA 2W42A 2B4JA 3WNGA 3HSTB 4CJ3A 4CGGA 3LAKA 1UA0A 3O3FA 4BDYA 1TAUA 4W5RA 4FM0A 4YNQA 4DSEA 1BCOA 1TKTA 4PA1A 2HVIA 1VSJA 3WNFA 4CJFA 1RT3A 2X6NA 4FJXA 1RTIA 4CJSA 3AVIA 3LPUA 4DS4A 1VSEA 3SUNA 2P5GA 2G8WA 2A1RA 5CYMA 3F73A 1HRHA 1JXEA 1KVCA 3AO1A 1IKWA 3KLIA 4OVLA 1EX4A 3DMJA 3IS9A 4RW7A 4BWMA 3OYBA 4KAZA 3L3VA 3LWLA 3O3GA 2ATQA 2GV9A 2G8HA 4FK0A 3I0SA 3M8QA 4DU4A 3C6TA 2I5JA 3OJSA 4KHNA 1CXQA 2RPIA 1BQMA 1X9MA 4DSLA 4CJ4A 3SYZA 4HTUA 5FRNA 3LPTA 4B9MA 4AHTA 3OYKA 3L2QA 3JSMA 1TV6A 2XY8A 3THVA 1CZBA 5KGWA 3K5MA 1W0HA 4O5BA 4M3RA 3VQQA 4CGFA 3SZ2A 3SUQA 3SUOA 3C94A 1C1BA 2XO7A 4CF1A 3U6FA 3ULDA 1J9AA 3NCIA 5KTQA 4FZZA 3VQEA 3LDSA 1TGOA 3V4IA 1DLOA 4DFMA 1IG9A 2IDOA 4Z0UA 1S1UA 3KJVA 1RTDA 1UWBA 3QO9A 1UA1A 4CHQA 5E41A 2G8FA 1SKSA 3TI0A 4FJNA 4AH9A 1U48A 1LV5A 1EXQA 1CZ9A 3VQ4A 2XY7A 3SQ2A 1D9DA 3LAMA 1WSFA 1BI4B 1CXUA 3C95A 1N5YA 1RNHA 4CGJA 4FJHA 3NBPA 4HCCA 1RDBA 2QK9A 4QOZB 1LWFA 3SV3A 3ZSWA 1VSLA 3SPZA 4CEQA 1YTAA 2WOMA 3AVCA 3HT3A 3S3OA 2E6LA 4CEZA 3NGIA 1L3UA 1ZBHA 5HRNA 3PX6A 1XI1A 1NKCA 1ASVA 4B9UA 3OJUA 1WSJA 5J2MA 1BCMA 2GUIA 4LSNA 3IRXA 1HYSA 2DFEA 1BI4A 1RT5A 4OLBA 1RTJA 4CEFA 4KB0A 5KI6A 3VQCA 1QE1A 3MEDA 4CJWA 4DQIA 4FM1A 3NE6A 4I7FA 1SKRA 4FK4A 2G8UA 2AJQA 1HPZA 3AA2A 3MXMA 1IO2A 2KQ2A 1UOCA 3CYMA 4E7JA 2RF2A 1T8EA 3I0RA 1Q9YA 1SKWA 1NOYA 1C1CA 5C25A 3P5JA 3KK1A 4FLWA 4CF0A 1KSPA 4CGHA 3QNOA 3KLEA 3CG7A 4CJTA 2IAJA 1O1WA 4QAGA 4B8CA 1VSKA 1TK5A 5DK5A 3V9UA 1REVA 3OYGA 1BQNA 1TK8A 4EZ9A 1A5VA 4IG0A 2Q3SA 4JLHA 3AVFA 1Z25A 1QS4A 3EZ5A 4IFVA 1U4BA 4CJVA 2YNGA 3ZT1A 3ZSVA 4CEDA 2OZSA 5DMRA 1LAVA 2NUBA 4DTSA 2P5OA 2OPQA 3WNHA 3TAEA 1WNSA 4GVMA 3HPGA 4KTZA 4OGEA 4DG1A 1L3VA 2PY5A 4FJ7A 4DQPA 1BIUA 5KGXA 4DLEA 3T3FA 4KREA 3AO4A 1YT3A 3NF8A 3TAGA 4IG3A 4FJKA 4E7IA 4W5QA 3OYEA 1GOBA 1S1XA 1NJXA 3AA5X 2XY6A 1YVUA 3NHGA 3OYDA 4AHSA 4CJKA 4AILC 2E4LA 4FJ9A 1RT7A 3ALYA 1JLCA 3TABA 3L2UA 5FRMA 1IKVA 3QLHA 1SL1A 3DLGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0UA 4CJ5A 1IJJA 4E1NA 3LDNA 4FLXA 4NYNA 3PX0A 3T69A 3LDLA 3EE9A 4B1UB 2P9UB 3ZLJA 2V51B 1BL3A 4CFDA 3RMDA 1ZBUA 1T7PA 3RRGA 1B9FA 2IC3A 5JMVA 3C0BA 1IKXA 3AVKA 4CD3A 4OJRA 3NFAA 5LMNK 4F3OA 5AZIB 2KFZA 3WEEA 2YHBA 3ZETA 1WB9A 3VF4A 4OX9K 3ATUA 1WAFA 1KTQA 4DU3A 3SLCA 4DSKA 4JI7K 2QWPA 2OZMA 1L5UA 1J6ZA 3VEXA 1MA9B 4Z4EA 3GDQA 3PSFA 2ZJPL 4PWDA 3QEXA 4K8ZA 1RDWX 2P9SA 1YITN 1VSDA 4BR7A 1SS6A 1JLFA 2W6KA 4B08A 1X9JA 3EY1A 5CZ1A 2O4GA 1D8YA 3TSQA 4O44A 2O8FA 3SCXA 3O6WA 1VSFA 4BE1A 4KH4A 2PFUA 3AO3A 4DLGA 4A2BA 3VA0A 5M1QA 2HBKA 1NU0A 2YNFA 4XH1A 4CF2A 4WFNL 2FBXA 4CEBA 4CZLA 3HTVA 5AQZA 3VETA 5JVGL 4JKBA 2E20A 4DSIA 4N76A 3L8BA 1IBKK 3QEIA 4DV5K 3QMLA 1EWRA 3I56N 3I8DA 2HNZA 3QEVA 3AV9A 4RTFD 1LWCA 3ZSXA 5SZTA 3VGKA 4A62A 1S1WA 3F9KA 3A5NC 4IO8A 4CEAA 3LWMA 3QESA 1H1VA 1JLGA 4M3TA 4DTUA 1VSMA 2D0AA 4E7KA 1CZAN 3OBYA 3CPEA 4C1NI 4JI5K 4LF4K 1QHAA 2YKMA 4K0KK 2OPRA 3OA9A 1TKDA 4FM2A 5AQKA 4JKDA 2VG6A 4LSLA 2UXCK 4CEOA 2UUBK 5HP1A 3KK7A 2WC9A 3VQ8A 5AZJB 1W9HA 5K14A 3AVJA 3J80O 2ASOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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