1RBTA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADGKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 53
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbtA00
1KLNA 3RRHA 1VSKA 2HHVA 4DTJA 1NKEA 4DSFA 1EX4A 4DU1A 2OPPA 1RT4A 4R5PA 1S6PA 3K2PA 2ITGA 1F21A 2KTQA 4DSLA 4OKJA 1JLGA 3SQ1A 1RBSA 3L3VA 4IFVA 1JXEA 1VSJA 4JRPA 2DFFA 5CZ1A 3QEPA 1RBUA 4CESA 4DQRA 1G15A 4OJRA 3O3HA 1UA0A 4O5BA 4DFJA 3AA5X 3SQ2A 3T19A 1CLQA 4O55A 4AHUA 4J2AA 4BDZA 3QERA 4FJ5A 4W5OA 4CK1A 4PWDA 3OYLA 1YTAA 2IC3A 2GUIA 2OPSA 3OS2A 3JSMA 4DTOA 4CIEA 2G8UA 3CYMA 4DU3A 4OGCA 1K6YA 3L2RA 2GBZA 2ATQA 3K58A 5CYQA 1LAVA 4FZXC 3OJSA 3PY8A 3OYCA 1WAFA 4E7HA 3TAGA 5KRSA 4F8RA 4JS5A 1RT1A 4FJLA 1KTQA 3PO5A 4CJWA 4LSNA 2ETJA 5E41A 4RW6A 1BIZA 1RBVA 2JGUA 3LP1A 1RT2A 5KTQA 2OA8A 3D45A 4C8NA 4DSEA 3HT3A 4E7KA 2PYJA 3BDPA 4KKOA 2B5JA 3G10A 5J2MA 5KGXA 3TAEA 1T03A 1RDBA 1L3UA 4AHCA 4OPKA 2P5GA 4B9VA 3JYTA 4DFPA 3O4NA 4E7IA 3DLBA 1A5XA 2HHWA 4LD0A 4DFMA 3VQCA 3NH1A 1BISA 2YV0X 4LH5A 1SV5A 3U3GA 4CF8A 4B08A 1QS4A 3QEWA 4B9TA 3ISNC 3MEEA 4C8OA 2O4GA 1UOCA 4RW7A 4QCLA 2VWJA 3AO5A 4DF4A 5J2QA 4KI4A 3NF9A 3TANA 3KD5E 1WSFA 5JS1A 3MXIA 1RBRA 4CGJA 3SI6A 2YNIA 3ULDA 4DQIA 1KCFA 4KHNA 1SUQA 1TGOA 4FJGA 3K5LA 4FZZA 4B8AB 1QHTA 2Y1IA 1RT6A 3QIOA 2G8WA 3RMAA 3ZSYA 1NK7A 4FW1A 1VSIA 1J9AA 3ZT2A 2HHXA 1C1BA 3NGYA 3WNHA 4DQPA 4DLGA 1IKXA 3A2FA 3H08A 4FLYA 3V1RA 1LAWA 3K5OA 1RILA 2RKIA 3EZ5A 2EHGA 1IH7A 4FLWA 2XY6A 5KRTA 4ELTA 3NHGA 4DTRA 3LPTA 4GW6A 2XRIA 4CK3A 3VQEA 1NK5A 1T8EA 2XY5A 4RW4A 3LAKA 1WSJA 4W5QA 4Q0BA 4QAGA 4KHUA 4C8MA 1IKWA 1X9SA 1HNIA 2YNFA 4MQ3A 1FKOA 4M41A 1WLJA 3K5MA 4M3UA 3QO9A 2OYQA 1TAQA 2BANA 1NJXA 3MEDA 4GMJB 4FJMA 4O44A 4FJ7A 1VSLA 1VSHA 4E89A 2A1RA 3C94A 3QETA 1HNVA 4IBNA 1J54A 4ID5A 3SNNA 3MXMA 4DTUA 4C8LA 4RG8A 4KO0A 3ZSOA 2G8KA 3IAYA 4LSLA 4FCYA 1BL3A 4J2BA 4OGEA 4FJKA 2DTUA 3AVFA 3VQPA 1WAJA 3ZSRA 3S9HA 3TAFA 3IRXA 1IO2A 4GVMA 4W5RA 3AVGA 1VSDA 1S9EA 1Q8IA 3QNOA 2R7YA 4C8KA 2HW3A 1ITGA 3HYFA 1TK5A 1NKCA 4M3ZA 1KVBA 3L8BA 4B9MA 1EXQA 2VWKA 4FJIA 3E01A 3QIPA 3OYFA 2XO7A 3NE6A 3CM5A 5CYMA 3I0SA 1L5UA 3KLEA 4W5TA 3CQ8A 4KHSA 3OYEA 4KB1A 4CIGA 4O0JA 4ZTFA 3DLRA 3VN5A 1JLAA 1U04A 4F3OA 1JLQA 3LPUA 2Q3SA 3NFAA 4DU4A 5HLFA 4Q5VA 1KVCA 2FBYA 4CHZA 4DFKA 3CFPA 1REVA 4H4MA 4CJEA 1RDDA 5K14A 2I5JA 1KFSA 3LAMA 1CXUA 4KB0A 4CHNA 3PX6A 2P51A 4FM0A 4FLXA 5I42A 2HNZA 3SYZA 4DTSA 1NJZA 3AVLA 1D8YA 3LZIA 1NK4A 1RTJA 4CJ4A 2HVIA 5SWMA 3U3YA 3QINA 2EX3A 4BDPA 4CJSA 1JLFA 4KI6A 4FLVA 4MFBA 1LW2A 4FYDA 1TL3A 3AO1A 4OKKA 4K8ZA 1C1AA 3V81A 3VQ5A 2IS3A 1MU2A 4CHPA 4AHVA 1TK0A 2D5RA 1ZBLA 2DY4A 5DK5A 2B4JA 4CE9A 1C0UA 4CCHA 3DM2A 1HYZA 1ZBIA 1EETA 2IDOA 3KKSA 3ASMA 4HUGA 3F73A 4H8KA 3KLHA 2KFZA 1W0HA 1HRHA 3AA3A 3AO3A 1NK0A 4F2RA 4FK0A 3LP3A 1BQMA 1UWBA 4CJQA 1EKEA 1HPZA 3I0RA 3AA2A 2HHUA 4HTUA 3TABA 3O3FA 1XI1A 5C24A 3UIQA 1RDCA 3QLHA 4I9LA 3RR7A 3L3UA 5DMRA 2KW4A 1YTUA 3IG1A 3DRSA 3KLFA 3RMDA 5C42A 4B9SA 2Z1IA 1IKVA 3LALA 2F8TA 1VSFA 4I2QA 1JLBA 1RT3A 2GV9A 3AVNA 3SPZA 5HRRA 2Z1HA 2KZMA 4Z4HA 2HHQA 3VQDA 3DOKA 2X6NA 2KQ2A 1U45A 4HCCA 2IGIA 3QEVA 3AVJA 4KAZA 4F2SA 3CM6A 2AJQA 4ICLA 2BE2A 2LSNA 3DRPA 1Q9XA 1EP4A 1FXXA 1A5WA 4LH4A 4CF0A 4EP4A 1SL0A 3AVAA 2OPRA 4CJVA 4DSKA 1I3AA 1XWLA 1N6QA 4N5SA 3L2WA 1GOCA 1N5YA 2JLEA 1ZBUA 4OLAA 3NF8A 3KK2A 3ZSXA 2QXFA 1DTQA 3TWHA 3SUQA 3HSTB 4CEBA 3S3NA 3THVA 1S1TA 3SQ0A 1JKHA 1WN7A 1QSLA 1D9DA 3OYBA 4LY7A 4CJUA 1QQCA 5C25A 4G1QA 4KPYA 4ID1A 3RR8A 2ZQBA 3AVMA 4YNQA 2XY8A 1W9HA 4CERA 2BDPA 4N76A 2P5OA 2WOMA 1TKZA 2E6MA 1KVAA 3ZT3A 4F4KA 4ELVA 1WSEA 4ZHRA 3OYKA 3I8DA 4CHYA 3G0ZA 5I3UA 3FFIA 4HCBA 3V1QA 3T1AA 3DLHA 2A1SA 1SKRA 4HUEA 1CZBA 1LW0A 4NYFA 4E7JA 5HROA 3RWUA 3WNGA 3AVHA 3VQ6A 4CGFA 4E7LA 3KKRA 1TKTA 4IFYA 4CEAA 5FDLA 2IAJA 3DMJA 3V9SA 3LDSA 4IG0A 1YVUA 1DTTA 3LANA 3HP9A 1BIUA 4BACA 1HQEA 1TK8A 1NOZA 2VG7A 4M3RA 3DLGA 4O0IA 1FKPA 4E3SA 1JXBA 4CGIA 4EZ9A 3TAQA 1L3TA 4OVLA 1S1VA 1U49A 3OYHA 3TR8A 1RBTA 3MECA 5T7BA 1X9WA 5HBMA 3OY9A 4J2DA 2G8IA 1VK0A 2X74A 1J53A 1GOBA 1RCHA 4KTZA 4FLTA 3SCXA 4B9LA 4FK4A 3VA3A 4FJXA 1XHXA 3SPYA 1JLEA 4CHOA 4DTPA 1NK8A 4PA1A 1ZYQA 4PQUA 3NCIA 1TKDA 1I39A 2DFHA 3OYAA 2OZMA 4Z4FA 1RTDA 1GOAA 3PX0A 2E4LA 3M8QA 4NYNA 1NJYA 4AHRA 3P5JA 4B8CA 1BGXT 3PUFA 5J1EA 4N56A 3BGRA 1RTIA 3K5NA 1D9FA 3KK1A 2RF2A 1XHZA 1BQNA 1YT3A 4J2EA 4CEOA 4XIUA 1RTHA 3MEGA 4CGGA 1BHLA 5CY4A 1S1XA 1WSHA 2X6SA 4KREA 3LP2A 1JL2A 2FBVA 4FVMA 3LP0A 3WNEA 1TV6A 3NH2A 4O4GA 4DMNA 4DTMA 4CEQA 3VA0A 4KTWA 1UA1A 4PUOA 2P1JA 1KSPA 5D3GA 4FJJA 2Z1GA 5JS2A 4FK2A 2YHAA 1BCMA 3VQAA 4CJLA 4KRFA 4DWIA 2YHBA 1VRTA 3KK3A 3SV4A 2QKBA 4FLZA 4FZYA 4B3OA 4N47A 4H4OA 2IOCA 3ZT0A 1HQUA 1RT5A 3O3GA 3KIOA 5CZ2A 3B6OA 1NK9A 1RNHA 3V9UA 5HRNA 4M3YA 1KLMA 2XY7A 3ALYA 5HRSA 3LZJA 4FM2A 1TVRA 1C6VA 3VQBA 4CF9A 5J2NA 4FM1A 2B6AA 3P1GA 1WSIA 3VQ4A 2X78A 3OYIA 2BGGA 4BWJA 1IKYA 2VG5A 2D0BA 3DRRA 1C1CA 4CJ3A 5FRMA 1SKSA 3HXMA 3F9KA 3HPOA 4F3TA 4HUFA 3ZSVA 1WSGA 1QSSA 4DS5A 3QEXA 5HP1A 3U6FA 3RTVA 2HMIA 4W5NA 1RDAA 3NAEA 3KTQA 1WNSA 1SL2A 4CIFA 4E0DA 4QOZB 1Q9YA 3C95A 1DLOA 2G8VA 2DFEA 3AV9A 3RMBA 3KJVA 4FW2A 4CEZA 3ZSZA 4FJ9A 3D0PA 1S1UA 1LWFA 3VQ9A 3HVRA 2XHBA 3NBPA 1QTMA 4Z4CA 3O4QA 3NGIA 2G8FA 4DSIA 3IS9A 2YKNA 1CZ9A 3NH0A 1ASWA 4B9UA 2OPQA 4CECA 4M3WA 3VQ8A 3AO2A 1Y97A 3HPGA 5KGWA 4Z4GA 4DSJA 4WE1A 3TARA 4FXDA 1S6QA 4Z0UA 1JL1A 4CF2A 3ZSWA 4CEDA 4B9NA 4OKEA 4KHWA 1L3VA 2Z1JA 3MXJA 3TAMA 4IG3A 2HNYA 5FROA 4OPJA 1XC9A 2QKKA 3VQ7A 4E19A 4KHYA 3ZCMA 4Z4IA 3V9WA 2YNGA 4N41A 2KZZA 4TSXA 3C6TA 1U4BA 4M45A 3V9ZA 1L3SA 1ASUA 4PY5A 4KHQA 2KFNA 3AVKA 4L8RB 4M3TA 4CJKA 4UQGA 3OS0A 4CGHA 3SZ2A 2ZD1A 2G8HA 3LWMA 2HVHA 2OZSA 1B9FA 3V9XA 3NF7A 1HYSA 4DF8A 3ZT1A 1RT7A 4CJTA 3OS1A 1KRPA 4Z4EA 3DYAA 3HPHA 4JLHA 3SV3A 3SQ4A 1R0AA 1LWCA 3MAQA 5J2PA 3RRGA 4AHTA 1HJRA 3V6DA 1KFDA 3M8PA 3SUOA 1LWEA 3EY1A 2HNDA 1BI4A 2NUBA 3EYZA 3HJFA 3DLKA 4KTQA 3AVIA 3CG7A 4CJRA 4I7FA 3CFRA 1B92A 2D0AA 4BDYA 1U47A 1B9DA 4DQSA 3HO1A 2RPIA 2QK9A 1TAUA 4YFUA 4I9QA 4IDKA 3AVCA 4CJPA 3CFOA 4KFBA 3VQQA 2FC0A 3V4IA 4NCBA 4E1MA 3HK2A 4JRQA 1HMVA 3HM9A 2HHSA 1C0MA 4DS4A 2VG6A 5FRNA 1IG9A 1FK9A 2F96A 4CHQA 4DQQA 3SJJA 3DLEA 1SKWA 1J5OA 4CJFA 4K8XA 4HHTA 4CGDA 3C6UA 3KLGA 3PV8A 2F8SA 3OVNA 1SL1A 1D5AA 2YNHA 4DLEA 3S3MA 5KI6A 1ZBHA 2D0CA 1X9MA 2WONA 4RW9A 3AO4A 4I2PA 4FJ8A 4CK2A 4AHSA 3M8RA 1C0TA 1TL1A 2RN2A 3DI6A 3NGZA 3AA4A 2E6LA 2FBXA 3P83D 3QESA 3TI0A 3M8SA 3RMCA 2PYLA 3OYMA 1NK6A 1O1WA 1S1WA 1LV5A 2PY5A 4BE2A 3ITHA 4CFBA 3OYGA 4CEEA 3KD1E 1BI4B 1VSEA 2YKMA 1TKXA 3KLIA 3B6PA 4DTNA 4CFDA 3OYJA 3ZT4A 4CF1A 1NOYA 3OJUA 1U48A 1NJWA 3NF6A 3WNFA 2PZSA 3PX4A 4NCGA 3QNNA 4DTXA 2Y1JA 3AVBA 4BWMA 4CFAA 4BE0A 4AH9A 4CEFA 4Y1DA 3V1OA 1VRUA 3K57A 3T3FA 4ZTJA 1T05A 4EZ6A 1BCOA 1Z26A 4FLUA 4M42A 2ZE2A 4RW8A 4CFCA 1NKBA 1X1PA 2FBTA 3SUPA 2HHTA 1JLCA 3OYNA 3L2UA 1HYVA 3ZSQA 5EU7A 4BE1A 3OYDA 3L2VA 1A5VA 1UAXA 5SZTA 3QEIA 4JS4A 1QE1A 1T7PA 4ELUA 3L2QA 3HP6A 4OLBA 4M3XA 2W42A 1S5JA 1S9GA 1QSYA 4IKFA 3LWLA 3NDKA 4CJ5A 3HVTA 4FJNA 4KV8A 1Z25A 3TAPA 3DOLA 4DG1A 4E1NA 4EP5A 1VSMA 3S3OA 1CXQA 3SUNA 1ZBFA 4AILC 2HB5A 3PO4A 2O4IA 3K59A 4FJHA 3HL8A 4Y1CA 4HVJA 5HRPA 1ASVA 4NCAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5TKYA 3WXMB 1VSKA 4DTJA 5KPRA 3CF5L 3OW2M 2OPPA 4CZGA 4B1WB 4R5PA 1NMDA 1JLGA 2YI1A 5CZ1A 3EKSA 4CZEA 1W97L 3SQ2A 2V52B 3T19A 1CLQA 2E8AA 4FPAA 4PKIA 4CK1A 2IC3A 2GUIA 1K9MO 2O8BA 4DU3A 1X3MA 5CYQA 1LAVA 3OYCA 1WAFA 4JS5A 1RT1A 3LM9A 4GNIA 3PO5A 2ETJA 4BRAA 3T7ZA 4B1VA 3GE1A 4DSEA 4E7KA 2PYJA 4U67L 4KKOA 2P5GA 3J7ZO 4DFPA 3DLBA 2HHWA 4LD0A 3CHWA 1GLAG 3THYA 1YJ9N 1QS4A 3ISNC 3MEEA 4M7XA 4RW7A 4QCLA 2ZGYA 4DF4A 2NLXA 4KI4A 2F4VK 3O08A 1BO5O 3C6HA 3KD5E 5JS1A 3MXIA 1RBRA 3LDOA 1TGOA 4FZZA 1QHTA 2Y1IA 1RT6A 3QIOA 3RMAA 3P31A 3ZEUA 1IKXA 4GV3A 3V1RA 4LFAK 3K5OA 3AAPA 1IH7A 2XY6A 1MDUB 4GW6A 2XY5A 4CD3A 2QWOA 3LAKA 1WSJA 5B8HA 4C8MA 4B3MK 4MQ3A 4M41A 1WLJA 3D2EB 3T1YK 3FR0A 2OYQA 5ADXH 1NMNA 3SLCA 4E89A 4IBNA 4C8LA 4FJNA 1NG9A 2G8KA 3A8YA 2GWJA 1BL3A 2DTUA 1P8ZA 1GLJO 3AVFA 4BR4A 2YCHA 3U8XA 3TAFA 3S9HA 1IBLK 4W5RA 4JKCA 4QS8A 1NBWA 4X66K 4WQ5A 3HYFA 1NKCA 4M3ZA 3O1BA 2KLAA 2VWKA 4FJIA 3OYFA 4YOTA 3NE6A 2WTUA 3KLEA 4KHSA 4CZFA 5BRFA 1K73O 3DLRA 2VQFK 2OCEA 4A2AA 4CHZA 4M63C 2I5JA 5BR8K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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