1WSJA

Crystal structure of e.coli rnase hi active site mutant (k87a/h124a)
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
b'MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGAAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Ribonuclease HI
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2004-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wsjA00
1DTQA 4KFBA 3PO4A 2ITGA 1Q8IA 4E0DA 4FLUA 1XWLA 3CYMA 2HNYA 4CF2A 3PO5A 4QCLA 3AVCA 4IKFA 1VSKA 2IC3A 1VSMA 4HHTA 3KTQA 4KHYA 3K5LA 3QLHA 4B9TA 3VQDA 4CHYA 1SV5A 3I0RA 3DYAA 3M8PA 3AO1A 4KV8A 3V1QA 1RDAA 1IG9A 3OYGA 5C42A 4FLZA 3NH1A 1XHXA 2IS3A 2DFEA 4BACA 4Z4CA 5HLFA 4Z4FA 5JS1A 3S9HA 4FW2A 3AA5X 1S5JA 3FFIA 3WNGA 3CG7A 4I2PA 2JGUA 1HQUA 3O3GA 1HRHA 1LWEA 3VQ5A 3OYJA 1O1WA 3HPHA 3QEWA 4N5SA 3DM2A 4DFKA 2RKIA 4IBNA 1LWCA 1XI1A 1BCMA 2FBVA 4O0IA 2Z1IA 4B8CA 4DFPA 3MEDA 4BWJA 1RBSA 3MXMA 4CJ5A 4LY7A 4FJ5A 4C8OA 1KSPA 3NGZA 1I3AA 4CE9A 2O4GA 1JLBA 1RBTA 1VK0A 3OS1A 4JRQA 2F96A 2YNFA 1VSEA 3VQPA 3RR7A 4FJ9A 4K8ZA 4CEDA 1BI4B 2G8UA 1HMVA 1Z25A 1CZ9A 1S1WA 3DLKA 3OS2A 3AVKA 1SL1A 1QS4A 3TWHA 1I39A 2F8SA 5FRNA 2X6SA 3TAQA 2E6LA 4CF9A 2O4IA 1EKEA 1U04A 4J2EA 3WNEA 4O55A 1SKRA 4CJLA 1L3TA 1L3UA 3S3NA 3K5MA 1IH7A 4DU4A 5D3GA 3SUQA 1RTIA 2GBZA 3PV8A 3TAPA 4KTQA 2B6AA 4B8AB 5J2QA 2D5RA 3OY9A 1JLFA 3MECA 1G15A 4MFBA 3M8QA 5C24A 3HPOA 3ZSZA 3OJUA 2E4LA 3LAKA 2G8VA 2VG5A 1LAVA 4JRPA 4BDYA 3NCIA 2HHQA 2QK9A 1VRTA 2QXFA 3DOLA 4OLBA 1RDDA 4YNQA 3HP9A 4B9SA 4CJ3A 4DF8A 2HVHA 1JLQA 4GMJB 3KKSA 1TGOA 4M41A 4KTZA 4PQUA 4CHZA 3G10A 4CECA 4E7KA 1YT3A 3SUPA 3KK2A 2RF2A 2QKBA 3HO1A 4PWDA 3AO2A 4KRFA 3VQCA 4EP5A 1J54A 2PZSA 4FJIA 2YKMA 4KPYA 3TANA 4DSJA 3ZCMA 3CM5A 3TAGA 4CJQA 4CHPA 4CEFA 3TABA 1NKEA 2P5OA 1HNIA 2A1SA 5J1EA 4Y1CA 3C6UA 3SZ2A 3WNHA 2WOMA 1IKVA 4RW8A 3SPYA 2NUBA 2P51A 2E6MA 3VQAA 2X78A 1Q9YA 1HYSA 1ASWA 2DFHA 1RT2A 2D0CA 4DQIA 1SL0A 2FBYA 1KFDA 1TKZA 3MXIA 2HMIA 1TK5A 3NHGA 4E7LA 1J5OA 2PYLA 4DSIA 2Z1JA 4JS5A 4M3UA 3OJSA 1T03A 5CY4A 3U3GA 1NK7A 4IFYA 3B6OA 4RW6A 3C95A 3ZT3A 3U6FA 2KZMA 1LW0A 3PUFA 3ZSWA 3VA0A 3O3FA 4CJTA 4CHQA 2AJQA 3HM9A 1NK8A 3C6TA 3AO5A 1KVBA 2OPRA 3ZSXA 4DU1A 3SYZA 4Z4IA 4LSLA 2OZSA 3RR8A 1L5UA 3ZT4A 4CGIA 5KGWA 1TK0A 4XIUA 1RDCA 3IG1A 4FK2A 4KI6A 4N56A 1TV6A 3WNFA 3M8RA 4DTJA 4RW7A 4E7IA 3AV9A 3CFRA 1TVRA 3TI0A 1NJXA 4I9LA 3QESA 2VWJA 1BIUA 3V9ZA 4KTWA 3F73A 4M42A 3QINA 4CF0A 4CEZA 4DU3A 2G8IA 5HRNA 4B9MA 3DRSA 3LPTA 1TL1A 4CGGA 4FLVA 3QEXA 3O4QA 3SQ2A 2QKKA 2KFNA 1C1CA 4OVLA 4FM1A 4FJXA 2Z1HA 2FC0A 3SQ0A 3RMDA 1NK5A 4F3TA 1HNVA 1RNHA 1TKDA 3AVFA 3OVNA 4Z4EA 1QSYA 4OKEA 1NOZA 3SI6A 3ITHA 2GV9A 5KRSA 3SNNA 5DK5A 3MXJA 3DI6A 4O5BA 3CM6A 4O4GA 4DTMA 1U45A 4M3YA 1UA1A 3SPZA 2KQ2A 2HNZA 2XY8A 4ID1A 4C8KA 3DLGA 1BGXT 1VSHA 1WSEA 3AA4A 1DTTA 4W5QA 1RT6A 1Q9XA 1WSGA 3L2UA 2KTQA 3QIPA 4CJEA 1S9EA 1RT5A 2WONA 3CFOA 4LH5A 1ZBHA 3OYKA 1C0MA 1BIZA 3KLEA 4L8RB 1GOAA 1RT7A 3A2FA 3O4NA 4QOZB 3HYFA 4CJUA 1WSFA 1T7PA 2VG6A 1RTHA 1KTQA 4CFDA 4E89A 4DS4A 1JLAA 3LAMA 1B92A 4HUGA 3SUNA 1CXQA 5CZ1A 4CEBA 1XC9A 1WSIA 4M3WA 4CGHA 2OA8A 2HB5A 1QSSA 2YNIA 4DQSA 1JXBA 1A5XA 4AH9A 2G8HA 3EZ5A 2B5JA 1K6YA 4AHSA 1S1TA 4OPJA 4F3OA 3LWLA 1BHLA 4OLAA 1JL2A 4CEOA 3CFPA 1NOYA 2XRIA 4Z4HA 3KLGA 2HW3A 4FZXC 4CF8A 4E1MA 2PY5A 2G8WA 3VQQA 1NKBA 1QE1A 4CK3A 4NCAA 1JL1A 5CYQA 3LWMA 1UAXA 3AVMA 3TR8A 1VSDA 3T3FA 1SKWA 1LV5A 4HCCA 1A5VA 2YNGA 4LSNA 4I9QA 4KHNA 2DTUA 5KTQA 1EETA 4N76A 4OJRA 4FLXA 3KD1E 1R0AA 1T8EA 4CGFA 3RMCA 4B9NA 3OYMA 4QAGA 3VQ7A 4Q5VA 2D0AA 4DG1A 4FM0A 3MEGA 4CK2A 2IAJA 4FLWA 1WN7A 1B9DA 3KK3A 2XHBA 1BQMA 4FCYA 4ID5A 3AO4A 1C0UA 4CJWA 4UQGA 4CGDA 4ZTFA 2OPPA 4R5PA 3S3MA 3VQEA 2A1RA 4FZZA 3MEEA 1N6QA 4JS4A 3DOKA 4OGCA 1YTAA 4CJFA 3HJFA 1UA0A 4GW6A 3KLHA 3B6PA 1J9AA 3HL8A 3E01A 2G8KA 4DQPA 1T05A 4HUEA 2HHUA 1RBRA 4E1NA 3MAQA 4FK0A 3HXMA 1S6PA 4W5TA 2Y1JA 4FJGA 4DSLA 1XHZA 4Q0BA 2G8FA 4DFJA 1KLNA 1S1VA 3D45A 5SWMA 5EU7A 3AVJA 1JLEA 5K14A 3M8SA 5KI6A 3RRHA 5HRRA 1N5YA 3BDPA 3G0ZA 1RTJA 3ZSQA 4KAZA 2PYJA 4FXDA 4AHRA 4G1QA 3L8BA 4J2BA 3LP0A 3SJJA 4FJMA 3AO3A 4C8MA 1RDBA 3NH0A 2XY5A 4BE2A 1X9SA 2HHVA 2YV0X 1FK9A 3V9WA 4M3XA 2HHTA 3NF6A 4FW1A 4DQQA 1Z26A 1D9DA 4HTUA 3C94A 4CHNA 5KRTA 2XY6A 5I42A 2ETJA 1C6VA 1S1XA 1IKXA 4OKKA 3PY8A 1ASUA 4ELUA 3VQBA 1WNSA 3EY1A 4CJPA 3K58A 4N41A 4Z0UA 1D5AA 4F8RA 2ZQBA 3P83D 4CJRA 3OYNA 4F2RA 3RRGA 1HPZA 4HUFA 1B9FA 2EX3A 3K5OA 4WE1A 2BE2A 4CJKA 1ASVA 4DSFA 1JKHA 4B9UA 4ELVA 1FKOA 4FM2A 4KKOA 3ZSRA 4M3RA 4DTUA 3DRPA 2HHSA 3OYLA 3LZJA 4DSEA 3NBPA 5E41A 1RTDA 4CIFA 3LPUA 4MQ3A 4PA1A 2YHBA 3V6DA 1ZBIA 1KVAA 3THVA 3PX6A 4F2SA 1LWFA 4KB1A 3LP1A 1FKPA 4FVMA 4CGJA 1EXQA 4DS5A 3ZT1A 4M3ZA 3F9KA 3LP3A 2HNDA 3PX0A 4OGEA 4FJLA 4HVJA 1RILA 3AVAA 1UOCA 3ALYA 4LH4A 3DLEA 3DLRA 4C8NA 3KD5E 1ZBFA 4J2DA 3V1OA 3IAYA 3DLHA 4CIGA 1TKXA 4BWMA 3LP2A 3QEVA 4CFCA 3AVNA 3OS0A 4CJSA 3PX4A 2YHAA 5FROA 3V1RA 3VN5A 4ZHRA 3OYFA 1NJYA 5CZ2A 3OYIA 4AHCA 5I3UA 2HHXA 3AA3A 1CXUA 4C8LA 2R7YA 1KCFA 5J2PA 4RG8A 1SL2A 4O44A 3V9XA 1WLJA 1L3SA 1RBVA 4IDKA 3KKRA 1S1UA 1TAUA 1NK9A 2Z1GA 3T19A 4GVMA 4FJJA 2KZZA 3TAMA 3NE6A 2XY7A 3QIOA 5HRPA 1YTUA 3ZSYA 3DLBA 2KFZA 5J2NA 4OPKA 2GUIA 1TK8A 4RW4A 1W9HA 1W0HA 3L2QA 1VRUA 1S6QA 5HRSA 1WSHA 1VSIA 1A5WA 2KW4A 4RW9A 2IGIA 3RMBA 3ZSOA 1VSFA 2YNHA 1SKSA 3QEIA 4FYDA 5C25A 3SQ1A 3V81A 2BANA 1VSLA 4CESA 1QSLA 4DWIA 4M3TA 2EHGA 3OYEA 2X6NA 3KLFA 1L3VA 4W5NA 5FRMA 1TKTA 2ZE2A 4CHOA 4DF4A 1KFSA 1HYZA 4B08A 4KB0A 1BQNA 1WAFA 1RT4A 1HYVA 3HVRA 2ZD1A 3HPGA 5CYMA 5SZTA 3NF8A 4I2QA 3AVGA 4EZ9A 3K5NA 2OZMA 2LSNA 4TSXA 3LDSA 3NAEA 4IG0A 3RMAA 3V4IA 3NGYA 3ZSVA 2HVIA 1C1AA 3KIOA 3AVBA 5J2MA 3NH2A 3SQ4A 3TARA 4FLYA 1MU2A 4IFVA 4I7FA 1X9MA 4E7HA 4DTSA 3QETA 4FJNA 3TAEA 1ZYQA 3DRRA 4CFBA 1YVUA 2IOCA 2IDOA 4O0JA 3ASMA 1EP4A 5HBMA 4ICLA 4LD0A 3QO9A 4YFUA 4JLHA 1UWBA 4H8KA 4FK4A 2P5GA 4KHSA 3L2VA 4FJ7A 2D0BA 4HCBA 2FBTA 2ATQA 2RPIA 3QNNA 3TAFA 3P5JA 1NKCA 4KO0A 1LW2A 3LZIA 5JS2A 1ZBUA 3VQ4A 4EP4A 1NK0A 3HT3A 4DTRA 4Z4GA 4BDPA 4FJHA 1HJRA 3ISNC 1WSJA 1RCHA 1Y97A 2JLEA 5FDLA 4CF1A 3I8DA 3NFAA 4CEQA 4CERA 2Y1IA 2RN2A 4IG3A 1BISA 4E19A 3L2WA 4BDZA 3QEPA 2DFFA 1IO2A 3ZT0A 1IKWA 3I0SA 4CK1A 3JYTA 3NDKA 3V9UA 3S3OA 1CLQA 1SUQA 4J2AA 1J53A 4CIEA 4H4OA 3L2RA 3KLIA 4DFMA 3K57A 2BDPA 1QHTA 4E7JA 1GOBA 4CFAA 5T7BA 1CZBA 1JXEA 1RT3A 4DLGA 2I5JA 4DTNA 3L3VA 1U4BA 4B9LA 4BE1A 1RBUA 4CEAA 3OYDA 3VA3A 2BGGA 1X1PA 3P1GA 4NYNA 1REVA 1D8YA 4B9VA 3EYZA 1VSJA 5DMRA 3AVLA 3IRXA 3OYBA 2OPQA 1QQCA 3CQ8A 3QNOA 3D0PA 3K59A 2Q3SA 3AA2A 3HSTB 1GOCA 3SV3A 1TL3A 3SV4A 3IS9A 5HROA 4NYFA 3L3UA 3HVTA 3OYAA 3U3YA 2P1JA 3KK1A 4PY5A 1BCOA 4FJKA 2XO7A 3V9SA 4EZ6A 4FJ8A 3VQ8A 4W5OA 3NF9A 4DTPA 3QERA 3DMJA 4KHUA 1X9WA 3BGRA 3SCXA 2HHWA 3NF7A 4PUOA 2YKNA 5KGXA 3SUOA 4ZTJA 4AHTA 4ELTA 4BE0A 1C1BA 1F21A 1KVCA 4NCGA 3H08A 4KHQA 2DY4A 4Y1DA 3ZT2A 1HQEA 4B3OA 4DQRA 4W5RA 1JLGA 3T1AA 1LAWA 4N47A 1NK4A 2OYQA 4CCHA 4KREA 2OPSA 2F8TA 4KI4A 1S9GA 3VQ6A 3JSMA 3O3HA 1BL3A 4CJVA 1NK6A 4DLEA 3UIQA 4CEEA 1NJWA 4DSKA 4DTXA 1U49A 4K8XA 4KHWA 1EX4A 3LANA 2B4JA 1NJZA 4H4MA 4OKJA 5HP1A 3HK2A 3OYHA 3AVHA 1KLMA 1BI4A 1FXXA 3VQ9A 3LALA 4CJ4A 2X74A 3K2PA 1QTMA 3RWUA 1TAQA 1U48A 4AILC 1ZBLA 4FZYA 1D9FA 1IKYA 1U47A 4AHUA 3OYCA 3KJVA 4AHVA 2W42A 3ULDA 1KRPA 2VG7A 1JLCA 2VWKA 4DMNA 4NCBA 1C0TA 4FLTA 4DTOA 3RTVA 1DLOA 3HP6A 1RT1A 4M45A 1ITGA 1WAJA 4E3SA 4F4KA 3AVIA 2FBXA 3NGIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BWFO 3DLLL 4BRNA 4QCLA 2IC3A 4HHTA 4KHYA 4B9TA 3I0RA 3M8PA 4A59A 3AO1A 3OYGA 4FLZA 1XHXA 5JMVA 2QWNA 1VQ5N 1BO5O 3TSPA 3SMPA 3WNGA 4C23A 4EIAA 4N5SA 3DM2A 4DFKA 2RKIA 1LWCA 5EXWA 4O0IA 4DFPA 3MXMA 4KBOA 3LDNA 4C8OA 1QZ5A 1I3AA 4CE9A 3NGZA 4JKGB 4CZLA 1Q18A 3CXCM 2O4GA 4JKHA 2NLXA 1RBTA 5AQFA 3OS1A 3VQPA 2A5XA 4HWIA 3J7ZO 4K8ZA 3BY5A 1HMVA 1NM1A 3TWHA 3BUZB 2F8SA 3TAQA 4JKEA 2YHXA 4CJLA 1L3TA 3K5MA 1IH7A 2ASPA 2ZWHA 5A2QO 2E2NA 3SUQA 1RTIA 2UUCK 3EKUA 2GBZA 4FO0A 2B6AA 5J2QA 2D5RA 3FZMA 1JLFA 2YHYA 4DCHA 1NU0A 3HPOA 3ZSZA 2E4LA 3LAKA 2VG5A 4BDYA 4JI7K 2HHQA 2QK9A 5GIOA 2VWBA 4CJ3A 4CVNE 2GELA 4C1NI 4M41A 4KTZA 5CHIA 2QKBA 3CMEN 2HOEA 2YKMA 1RGIA 3TSUA 3JAMO 4DSJA 3TAGA 3E1YA 2A1SA 5B8HA 3HZ6A 3SZ2A 2P51A 1HYSA 1XQSC 2X78A 1XNRK 1SL0A 2FBYA 1KFDA 1TKZA 1TK5A 4M3UA 3WXMB 4DSIA 3FZLA 1T03A 2IVPA 3C95A 3FZFA 4LF6K 1LW0A 4BR4A 4CJTA 2P9IB 3HM9A 1NK8A 5C2FA 3AO5A 4DU1A 4WFAL 1QZ6A 5AQWA 4H0PA 2OZSA 4O8UA 2CH6A 3UKUA 4LFCK 4R79A 4MO4A 1TK0A 1RDCA 1K73O 3AV9A 3CFRA 1TVRA 2CGJA 5KQ8A 4KTWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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