3MMVA

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 106
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mmvA03
4WQ5C 4BGAA 3DXKA 5BPMA 3CHWA 3H1VX 1Z6RA 4MLHA 3EL2A 5FPDA 4CZKA 4GY2B 2E2QA 2Q1NA 5AQVA 3VOVA 4JN4A 1SAZA 4K25A 4DHYA 4H03B 4M63C 4FOIA 4H0YB 2NRHA 3I33A 1NGBA 1BA0A 1HLUA 1HKCA 5AQTA 3WXJA 3WUHA 1T44A 1KXPA 3MK6A 5KPRA 4DCHA 3A5NC 3FGUA 4CZFA 1GLCG 2IVNA 3W3DA 4BR4A 1KAYA 3IFRA 3LDQA 3ID8A 4H5RA 4XH1A 1MA9B 3DAWA 1NGEA 3QB0A 4B1WB 3ZX2A 3JS6A 2HOEA 2IVOA 4YDUA 5AQFA 3RSEB 3VF2A 1WOQA 1QQOA 3MN9A 1JCGA 1BO5O 3LM2A 4IXCA 2E2PA 2QWMA 2KHOA 1MWMA 1YVNA 1X3NA 3BUZB 1RDWX 3UE5A 3DXMB 2W40A 4ISGA 1HKGA 3U9ZA 5AQXA 4CI6A 4BRQA 4Z94A 3A8YA 5BN9A 3FZFA 3ATVA 5AQMA 4BRPA 1QQMA 2VYPA 4DB3A 5KPZA 4A61A 4QS8A 1X9JA 2ASPA 3FZKA 3QFUA 3GG4A 3AAPA 4CD3A 3VGLA 3M3ZA 2GUPA 5EY4A 4BRFA 1GLAG 2A42A 4BVPA 5AZJA 2P9NB 5LJWA 3UKUB 5EVZA 5AQSA 4QS9A 1D4XA 4IWVA 1OKJA 2V7ZA 1YXQA 2NZTA 1NGDA 3EN9A 2FSKA 1U2VA 4EHTA 4O5FA 3MN7A 4H0TB 2VWBA 5BREA 2ZF5O 4H5NA 4M7YA 1NGFA 2A41A 3FE1A 1BWFO 3DXKB 2ITMA 3QFPA 3JXUA 3WXLA 4PKIA 3CI5A 3ZEUA 1NGCA 4BC2A 2IIRA 4EFHA 3H1QA 4EAHD 2VCPA 1KAZA 4BRHA 2CGJA 5ELZA 5EXWA 3CJBA 1ATNA 2F9WA 2D0OA 2WUSA 2D1KA 1NMDA 1DEJA 2QWLA 1KAXA 4I6MA 4JD2A 4WYBA 5BN8A 2P9UA 2D4WA 2I7NA 1H1VA 4CBXA 5BPNA 4BG9A 3OHRA 1DKGD 2FSJA 3WXIA 5CE3A 3D2FA 4A2AA 2PBDA 4JAXA 3G25A 2I7PA 2CH5A 1C0GA 2V51B 4K43A 3IUCA 4BQZA 3BP8A 2OANA 4H0VB 3S41A 4CZEA 2ZWHA 2GEMA 5KQ8A 2BUPA 1E4FT 3VETA 3VESA 4BR0A 3VGMA 1NBWA 4QS7A 4FWNA 3IDHA 4LC9B 3H46O 3HI0A 5AQGA 3AAQA 5BR9A 5AQZA 4CD1A 1HKBA 4HWIA 4XEIA 3R6MA 4H0OA 4FWPA 5AQOA 2BTFA 3AARA 4MO4A 3VF6A 2GELA 2CGLA 2PAVA 1TYQA 3WEEA 4FWOA 3MCPA 4H5TA 5BRHA 3GL1A 4RCHA 3U8XA 2A3ZA 3VEZA 3A5MC 3QICA 5FPMA 3WXKA 3WQTA 4PL8A 3QBXA 4RWTA 1U6ZA 3LL3A 3HBTA 5AZJB 1GLDG 3GDQA 3D2EA 2CH6A 2CGKA 2QWNA 4YDUC 5AQKA 3H3OB 2QWPA 3A5LC 3D7EO 3LDLA 2Q36A 4FO0A 2E2OA 4A2BA 1U2VB 4B1YB 4NO7A 3ULEA 5AQRA 5FPNA 3WQUA 5AQHA 1HX1A 1Y64A 2UYTA 4PL7A 4IJAA 3J8AA 1SZ2A 1RFQA 1XQSC 2HF3A 2QW9A 5JLHA 3ZEUB 1G99A 4NB4A 3O80A 3I8BA 3O5BA 4PKGA 4FL9A 4CZLA 1K8KA 2A6AA 2P9SA 4BVOA 2IVPA 1S3XA 4ISFA 4CZMA 2H3GX 3EKUA 1EQYA 2DPNA 2YJEA 2HF4A 3ZX3A 1HPMA 2Q0RA 4CBWA 1GLJO 3L0QA 4CZJA 4I6MB 4JD2B 2P9UB 5AQJA 3VEVA 3LDNA 4FWQA 2J4RA 4K42A 2FF3B 3TPQA 1ATSA 4BREA 5I9EB 3IMXA 3O1WA 4F9OA 4BC5A 3D2FB 1WUAA 1P8ZA 1GLBG 2ASOA 4CBUA 3HM8A 3CERA 1QHAA 4FWSA 4IZ9A 4K41A 2FLOA 3VEOA 2P9PA 3EKSA 2EWSA 3MMVA 4BC4A 4BRKA 3ZETA 4BGBA 3SMSA 3U9DA 3KHYA 2P9IA 3O4WA 4XH4A 2ZGYA 4H5VA 3C7NA 4JHDA 4FOEA 4H0PA 4BRLA 4WQ4A 3DWLA 4BRDA 1T6CA 1T6DA 5AQWA 3MN6A 3O6WA 3QBWA 2HMPA 5F1XA 1TUUA 4WQ4C 4MO5A 3M1FA 2QWQA 5F0XA 1RGIA 2NLXA 3O1BA 3WT0A 4EHUA 3A0IX 4J8FA 1TYQB 3WEEB 2F9TA 3FFKB 1NGAA 1GLLO 3ENOA 5AR0A 3H45C 4MLEA 3ATUA 3C0BA 2FF6A 4AM7A 3SLCA 2GWJA 3QDKA 2QWOA 2P9LA 3QMLA 4RTFD 4JNEA 5AQNA 3D2EB 2FSNA 4BRCA 2E8AA 1R59O 1GLFO 2V7YA 3FZHA 1BA1A 4BRMA 1ATRA 3R9PA 1BOTO 2Q31A 2P9KA 2W41A 1QZ5A 3CJ9A 4BROA 2FXUA 3SMPA 4BRGA 4WQ5A 3ULEB 1JCEA 3UB5A 4DQ8A 1V4SA 3MDQA 4B1ZA 1BUPA 3LDPA 4A62A 5JLFA 1C0FA 2YHYA 3O08A 3SK3A 3VEWA 4CJ7A 3UKRA 2ASMA 3DJCA 5AQLA 1IG8A 5BRFA 1QZ6A 1K8KB 2P9SB 2YI1A 3U4LA 2V52B 3VGKA 4FWMA 3TU5A 4CZGA 5AFUH 4GNIA 1Q18A 4IJNA 4FPBA 1XUPO 3CQYA 2YHWA 5EX5A 3R8EA 1NGIA 4ISEA 4FWRA 2E1ZA 4BG8A 1DGKN 1NGHA 5LJVA 2AA4A 4IO8A 1ZC6A 1IJJA 2Q0UA 4FSVA 5AZIA 2A5XA 5AQPA 1TUYA 2Q2RA 1JCFA 2E2NA 3HSCA 2Q97A 3LM9A 4HTLA 1MWKA 3LDOA 1ZXOA 2P9PB 3HTVA 3P4IA 1YAGA 2YCHA 1YUWA 4KBOA 3CIPA 2YJFA 2GTDA 3AY9A 1NGJA 1LOTB 4BR9A 3CJCA 3ZETB 5KQDA 5BRDA 4B1UB 2P9IB 5AFUA 3GBTA 2E1YA 3ZX0A 1BU6O 3BEXA 1S22A 3EZWA 4BR7A 2YHXA 3C7NB 4JHDB 1X3MA 2QM1A 2E20A 3FZLA 5ADXH 1J6ZA 1V4TA 1NWKA 3VF4A 2GWKA 3VPZA 5EOYA 3VEYA 3ENHA 4C23A 5TKYA 5F2RA 2ZGZA 2E88A 3W0LA 4XH5A 3B8AX 3BF1A 3FR0A 5JICA 4BRIA 3KVGA 4M7XA 1SQKA 5JMVA 4CZIA 4FWKA 3O8MA 5KPTA 1QQNA 2P9LB 3CJ7A 5E26A 1Z05A 3L6QA 3M6GA 3VERA 3RSEA 1ESVA 4B9QA 3L4IA 1XC3A 3FZMA 3HZ6A 2P9KB 4AM6A 3F9MA 3H6EA 5AQUA 4BR5A 4FPAA 4B1VA 1BDGA 3FLCO 5LY3A 3EO3A 5AQYA 3H3NO 4FWLA 3VENA 4BC3A 1GLEG 3DXMA 4BQLA 4BR2A 5ADXA 1NLVA 4PKHA 3KZBA 3CJAA 1HJOA 3A5OC 3UKRB 1LCUA 3CQXA 5B8HA 4Y0WA 1MDUB 1BG3A 3BF3A 2AP1A 1E4GT 5E84A 4E1JA 4H0XB 5FPEA 4CZHA 1CZAN 5AQQA 2QXLA 5AQIA 4O8KA 2A40A 3GOIA 4L3QA 4EIAA 4BRNA 3VEXA 2P9NA 3CETA 1HUXA 5BPLA 3UKUA 4B1XB 2QWRA 5AZIB 3CJ1A 1NM1A 1ZBSA 3GE1A 2D0PA 4H5WA 3SJHA 4BRAA 3MN5A 1NGGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ASMA 1L3SA 4GW6A 4JKFA 4CF2A 1TKZA 3CM6A 4DU4A 4E7HA 4BGAA 3DRSA 5FPDA 4Q0BA 2QA4N 3OBWA 4GY2B 3NE6A 2P1JA 4DFMA 3VOVA 1KCFA 4O0JA 2UXDK 1U48A 4M3RA 1WSHA 2NRHA 3AVNA 1NGBA 3K0SA 3WXJA 1N34K 1IV0A 4E7JA 3Q7CA 1RT3A 4JS5A 3OW2M 4CGFA 1YTAA 4BR4A 4CJQA 1MA9B 1HYZA 4N5SA 5BR8K 3DAWA 1NGEA 1WN7A 3VQ7A 4YDUA 4IDHA 3J81O 4B9SA 3MN9A 1JCGA 3LM2A 4FJXA 1S1TA 2IS3A 4ELUA 4CEFA 2XY5A 3LP3A 3OYNA 2HVIA 4FZYA 3HJFA 4JS4A 3KLGA 4BRQA 3L2RA 4Z94A 3RMDA 5BN9A 1D9DA 4JKGA 3OBYA 2NRVA 4A61A 3L3VA 1EX4A 1X9JA 2ASPA 3QFUA 4E1NA 1UWBA 5EY4A 3NMUA 3NH1A 4OLAA 1RT5A 2XO7A 4BVPA 4DR2K 5M1OA 3KIOA 3ZT1A 3TAGA 5AQSA 4IWVA 3C65A 1WSEA 1JLAA 4CF1A 2V7ZA 4DSKA 3L8BA 2UUBK 4GKKK 2FSKA 4O5FA 4CHQA 4I2QA 2VWBA 4CEBA 2UUAK 2A41A 4BE0A 2ITMA 3QFPA 3JXUA 5LMNK 4M3WA 3OYIA 2NNWA 3CI5A 3DLKA 1IBMK 3KK1A 1KAZA 3M5RA 1NKEA 1FXXA 2ZJRL 4PQUA 4B8AB 2QTDA 1ATNA 4KO0A 3M8QA 2D5RA 5IWAK 5J2NA 3I0SA 5KRSA 5BN8A 4JD2A 2VQEK 3AVLA 1M1KO 4B9TA 3P1GA 3MXIA 2I7NA 1J5OA 1ZYQA 1FKOA 4F2SA 1S6PA 4DUZK 2HHQA 4BACA 5HP1A 1N36K 2CH5A 1RTDA 3IUCA 3BP8A 2OANA 3D6RA 3E9PA 3RVCA 3S41A 2GEMA 5KQ8A 3VESA 3VGMA 4GV3A 3PSIA 1QS4A 4M3XA 1TK8A 4BDPA 3DRRA 4O5BA 4M41A 4CD1A 3R1XA 3KK2A 4DWIA 4HWIA 2DFHA 2KZZA 2RHKA 3QNOA 4XEIA 3R6MA 1RILA 3THWB 2BTFA 3RMCA 3C94A 3PX0A 2GELA 1B9FA 4W5TA 4ID5A 4E72A 1QHTA 4RCHA 3U8XA 3DLHA 3QNNA 4PL8A 5JS1A 1SUQA 3ZT0A 4RWTA 2GX9A 5AZJB 1VQ5N 3DM2A 4JRQA 1HNWK 3D45A 3NF6A 3ZSWA 4YDUC 3H3OB 2YNIA 2Q36A 1NOYA 3TTCA 3T19A 5AQRA 1I39A 5TKWA 4CEQA 5AQHA 4ELTA 1Y64A 4PL7A 1FW6A 4EP5A 2HHHK 3J8AA 4W5RA 1RFQA 3T1YK 1WSIA 3ZEUB 3M8SA 4DR4K 4NB4A 3AVJA 4DLEA 1BQMA 3QIOA 4PKGA 1EWQA 4FL9A 4PA1A 1K8KA 1BIZA 2IVPA 1S3XA 1NKBA 1IBKK 2HF4A 3ZX3A 4DV2K 3T3FA 1RBRA 3P38A 4QOZB 4CZJA 2HNYA 4IFEA 3LDNA 3NGYA 4I7FA 4K42A 4BREA 3JSMA 3HM9A 5FLXO 4OPKA 4KB1A 1P8ZA 4CJVA 4GV9A 3HM8A 4CIFA 4G9ZA 3IS9A 1MU2A 2OZMA 4IZ9A 5HOOA 4B9LA 2FLOA 4LSNA 3VEOA 1NKCA 2RKIA 2EWSA 1RBUA 3LZJA 3O3HA 4OPHA 3HOTA 3SJJA 5C0YA 3G0ZA 3KHYA 2P9IA 4A59A 4DV0K 4DQIA 3O4WA 3AO5A 4XH4A 1LAWA 2DFFA 2ZGYA 3V9XA 4O44A 4IG0A 4JKCA 3MXMA 3ZSRA 4BRDA 5AQWA 5H1SQ 4CJUA 2IGIA 4DSLA 3QBWA 3LWMA 1RDBA 4PWDA 2QWQA 2NLXA 2QK9A 3O1BA 3SI6A 3WEEB 1RT2A 4E7KA 2F9TA 4RW7A 1GLLO 3RRGA 1I94K 4HUGA 4X64K 3SLCA 4KFBA 1VRUA 2GWJA 4OKEA 3RWUA 3V6DA 2P9LA 3QMLA 3V1OA 3WNHA 3CCUN 3NBPA 4JNEA 3OJUA 1YJWN 3KD1E 3D2EB 3ZYYX 3J7ZO 1R59O 3FZHA 3AGRA 3R9PA 2Q31A 3V81A 2P9KA 3OS2A 2O4GA 3LALA 4BROA 3OJSA 4CFCA 3OTOK 5J2PA 4WQ5A 2YV0X 3CYGA 3EY1A 1BHLA 3OYMA 1O13A 4FJMA 1LW2A 5CYQA 3SK3A 4CJTA 4CJ7A 3CMEN 2WONA 3G6EN 1Z25A 3F73A 4N41A 1RBTA 4DSEA 3U4LA 1B92A 5I3UA 5AFUH 1XUPO 1JL2A 4L8RB 3R3LA 3KLFA 2ZQBA 3TAEA 1JKHA 4BWJA 5LJVA 2W00A 4ZHRA 1RTIA 5LMUK 3VQ6A 1WNSA 2A5XA 4M45A 2O8EA 5KGXA 4O55A 4LF6K 3D0PA 4FCYA 4CJPA 5KTQA 3NFAA 2Q97A 4HTLA 3LDOA 1IKYA 4QCLA 3HTVA 1YAGA 2O4IA 2PZSA 4UY8O 1J54A 4IOCL 4RW4A 3BDPA 4FM0A 1D8YA 1BU6O 3BEXA 1S22A 1LWEA 4BR7A 1X3MA 3CCLN 4LFCK 3IG1A 3IRXA 4TSXA 1NWKA 2GWKA 5EOYA 3ENHA 5F2RA 2ATQA 3B8AX 3FR0A 3DLEA 3CFOA 4E89A 4M7XA 2JWLA 2OPRA 1QSSA 4FLVA 3M6GA 3RSEA 1ESVA 1RDCA 3LP1A 3TTDA 2QXFA 2DFEA 4IEIA 2GV9A 4FJLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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