3MMVA

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
b'VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 106
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mmvA03
2HF4A 2QWLA 3AARA 3SLCA 3W3DA 4DQ8A 4BR5A 1KAZA 4QS8A 4BC3A 5FPNA 5LJWA 5AQLA 4FWNA 2VCPA 2Q36A 2ZGYA 5ADXH 2V7YA 2P9LA 3JS6A 3MN7A 2P9KA 3L0QA 2A40A 4MLHA 3KHYA 3H1QA 2YCHA 2A42A 4M7YA 3QB0A 4H5NA 4YDUA 3HM8A 4PL7A 4IO8A 3CETA 1TYQB 2YHYA 1C0FA 2KHOA 3FZFA 1U2VA 4ISGA 5F2RA 4E1JA 2YJEA 1ATRA 3WXJA 4BGBA 4M7XA 3VEOA 2D0OA 5AQKA 3LDPA 4BREA 4BR9A 3A0IX 4DHYA 3MN9A 1DEJA 1IG8A 2E20A 5AQHA 2A6AA 4BRDA 4B1VA 4FOEA 2P9IB 4H5WA 4XH4A 3O5BA 5AQNA 4BRCA 1T6CA 2V52B 2E2OA 4BRPA 1KAYA 1XUPO 1RFQA 5EY4A 4BROA 3FLCO 5AZIA 4O8KA 4CZGA 3O1BA 2Q1NA 1GLDG 2IVOA 4BRMA 3FZKA 4H0YB 3HZ6A 3VPZA 1GLBG 5AQSA 4IJAA 1BU6O 3EZWA 3HSCA 1GLEG 2GWKA 2HOEA 3HTVA 3DXKB 4HTLA 3C7NA 4QS7A 3M1FA 1TUYA 3EN9A 4AM6A 5BRHA 1BG3A 1KXPA 3CIPA 4JNEA 3L4IA 1SAZA 2I7NA 3UKUB 2ASPA 5E26A 1NBWA 5EXWA 1NGEA 3MDQA 4PKIA 3EKSA 3LM2A 5AQMA 3AY9A 5AQVA 3U8XA 3ULEB 4PL8A 5JICA 4CJ7A 4B1WB 2GWJA 2Q0UA 2E1YA 1E4GT 2NZTA 3VGKA 1E4FT 4XEIA 2E2NA 2Q97A 1G99A 3A5NC 1SQKA 5ELZA 2P9LB 3A5MC 3GE1A 1YUWA 4RWTA 4FO0A 4NB4A 3ENHA 4BVPA 5E84A 4A2AA 1YAGA 5AQZA 4L3QA 4BRFA 3ZX3A 3VETA 5FPDA 1U2VB 2DPNA 3DXMB 1HUXA 2GUPA 2QM1A 4GNIA 4MO5A 5BREA 2UYTA 4MLEA 2I7PA 3VGLA 3BUZB 2NRHA 1MWMA 3MN5A 3O6WA 1NM1A 5AR0A 1HKGA 1T44A 4YDUC 4DB3A 1HKBA 5AZJA 3ATUA 4H0PA 1S22A 3ATVA 2QWPA 4WQ5C 3VF6A 4IZ9A 4F9OA 2HMPA 2E2PA 1BOTO 3IUCA 3QICA 2QXLA 3CJ9A 3QMLA 1NGFA 4FPAA 3ULEA 5AZIB 4BRKA 3BF1A 4WYBA 1NGAA 4K42A 3W0LA 1NMDA 3ENOA 3I33A 3FFKB 1KAXA 4PKGA 2FXUA 4BRGA 1T6DA 4A61A 3H1VX 2ZGZA 1V4TA 1HJOA 3FZLA 3C7NB 4BG9A 3R6MA 4LC9B 2A5XA 4HWIA 3WUHA 4CZKA 1XQSC 4JAXA 4EHUA 3UB5A 4Z94A 2CGLA 5AQQA 3QFUA 1NLVA 4I6MA 4WQ5A 4CBUA 1NGCA 4FWLA 3IDHA 5KPZA 1BWFO 3QFPA 3A5OC 2A41A 4CZMA 3KVGA 3VEVA 3R9PA 3DXMA 1X3NA 2J4RA 4RTFD 3LDOA 4BRQA 2OANA 4IWVA 2GEMA 1WOQA 1HKCA 3CJCA 4CZFA 3BEXA 4FWSA 5JLHA 1HX1A 3MMVA 5TKYA 4CZLA 3B8AX 2QWQA 4O5FA 4BRLA 5AQUA 4DCHA 3L6QA 1Z05A 5CE3A 1NGGA 3SK3A 1GLLO 3M6GA 1U6ZA 2ZF5O 1X3MA 4BC4A 2H3GX 5AFUA 3A8YA 2D4WA 1H1VA 1RDWX 5BR9A 3A5LC 3FR0A 3P4IA 2YI1A 1P8ZA 2QWRA 3SMSA 1K8KB 2QWNA 1NGDA 4K43A 3CJ1A 4FPBA 2Q31A 4KBOA 4FL9A 5AZJB 5EOYA 4CZHA 3WQUA 2D0PA 5AQTA 3MCPA 4ISEA 4FWOA 2ASOA 3H3NO 1BA1A 4M63C 3LDLA 3VF2A 1ZC6A 4CZJA 4BQLA 3CI5A 5BPNA 4K25A 5KPTA 1DKGD 3H46O 3VEXA 3CERA 5F0XA 2FSNA 4AM7A 2P9UB 3VGMA 3VEZA 2IVPA 1JCGA 2CH5A 3HI0A 1MA9B 2W41A 5BN8A 4C23A 4H0TB 4I6MB 3D2EA 1QZ5A 1HPMA 5AQGA 1D4XA 4BGAA 5AQFA 3BP8A 3U9DA 4CZIA 2Q0RA 4CD1A 3ZETB 2P9PA 3DWLA 1NGBA 4FWKA 4H0XB 4BRIA 2E8AA 3GDQA 1JCFA 4BRAA 3UKRA 1K8KA 4A62A 3VEYA 1Q18A 5EX5A 1MWKA 1YXQA 4B1UB 3CJAA 5AQJA 3CHWA 5AQXA 4IJNA 2GTDA 4GY2B 4FWRA 3GG4A 4JHDB 3FE1A 4QS9A 3VEWA 1S3XA 4Y0WA 3MK6A 2AA4A 3KZBA 5BPMA 1BDGA 3AAQA 3QDKA 2EWSA 2QWMA 1NGIA 1QHAA 2W40A 5AQWA 3WT0A 4JN4A 3WXKA 1GLAG 3ZX2A 1GLCG 3J8AA 5AQYA 1Z6RA 2P9UA 3D2FA 2PAVA 5LY3A 4NO7A 3I8BA 2P9SA 5BN9A 4B1YB 4B1ZA 2ITMA 1GLFO 4BR7A 1NWKA 3H45C 1V4SA 2YJFA 1ZXOA 2FSKA 2BUPA 1GLJO 1HLUA 5AQPA 2WUSA 3S41A 3LDNA 5BRDA 3LDQA 4EIAA 1ATNA 2CH6A 2GELA 2PBDA 4FOIA 5EVZA 3ZETA 3SMPA 3O1WA 4FWPA 4BG8A 2VWBA 3RSEA 1BO5O 4BR2A 3IFRA 3C0BA 5JLFA 3SJHA 3WEEA 1LCUA 1BA0A 3O8MA 3ZX0A 3ZEUA 2NLXA 3TPQA 4BC5A 4IXCA 3G25A 3CQYA 3VOVA 1X9JA 1QQNA 5AQIA 3QBWA 4JHDA 2F9WA 4RCHA 3AAPA 4H5TA 1JCEA 3IMXA 3D2EB 3U4LA 1QZ6A 3O08A 4H03B 3WXIA 3WQTA 2AP1A 2P9PB 4K41A 4CBXA 3O4WA 2P9NB 2FSJA 1OKJA 5FPMA 3M3ZA 3OHRA 3UKRB 4H5RA 4EAHD 2CGKA 3GOIA 2FF3B 3GL1A 2F9TA 3CJBA 3R8EA 5ADXA 4BR0A 2CGJA 2FF6A 4BRHA 3JXUA 3FZMA 4XH1A 3WXLA 3VF4A 3MN6A 3VENA 5KQDA 3TU5A 1YVNA 1NGJA 4J8FA 2YHXA 1DGKN 1RGIA 1CZAN 4EFHA 4B9QA 5FPEA 3GBTA 4FWMA 4JD2B 3D2FB 2QW9A 5B8HA 2IVNA 1TYQA 3QBXA 4CI6A 1LOTB 2P9SB 1NGHA 2BTFA 3U9ZA 1QQMA 4FSVA 3ID8A 5AQOA 3VESA 1BUPA 2E88A 1EQYA 4B1XB 2V51B 1QQOA 1SZ2A 3DJCA 3DAWA 1TUUA 2P9NA 3RSEB 3UE5A 1MDUB 4MO4A 5BPLA 5AQRA 4BR4A 3HBTA 1ZBSA 2E2QA 5LJVA 4WQ4C 2Q2RA 2P9IA 2P9KB 3WEEB 2E1ZA 4XH5A 2YHWA 3ZEUB 2FLOA 3EL2A 2A3ZA 2QWOA 1WUAA 2IIRA 3LM9A 3D7EO 4H5VA 2ZWHA 3F9MA 3H3OB 2D1KA 4BRNA 5JMVA 5KQ8A 2ASMA 3CQXA 4H0VB 4BQZA 5KPRA 3EO3A 5F1XA 4H0OA 3EKUA 5I9EB 4FWQA 3CJ7A 3DXKA 1J6ZA 1Y64A 1C0GA 4A2BA 4CD3A 4EHTA 4CZEA 3H6EA 5BRFA 1ATSA 4PKHA 2V7ZA 4JD2A 4BVOA 3UKUA 1XC3A 3LL3A 3FGUA 4WQ4A 1R59O 2VYPA 3VERA 1ESVA 1IJJA 3O80A 2HF3A 3FZHA 3BF3A 5AFUH 4ISFA 4BC2A 4CBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HF4A 3AARA 2ZJRL 3WNFA 4CJEA 3SLCA 3W3DA 4DQ8A 1VQ7N 1KAZA 1EP4A 4QS8A 3DLRA 1M90O 3ALYA 5LJWA 1VQ8N 1BIUA 3MN7A 4MLHA 1KC8O 1RT2A 3K5LA 4JKAA 4JI7K 3LDSA 4M7YA 3QB0A 4H5NA 4K0KK 5DK5A 4IO8A 1TYQB 3MEGA 4E7KA 5F2RA 3CM6A 4CE9A 1VQNN 4AF1A 3WNEA 4DHYA 2FBTA 1DEJA 3MN9A 3C6UA 2E20A 3C95A 5AQHA 1C1BA 3BZCA 4CW7B 1RDBA 4QOZB 2HHVA 4HCCA 2ZE2A 1KVBA 4E7LA 3Q7BA 3SBGA 1U49A 2ZQBA 3NF6A 4BACA 4O8KA 1N34K 1NG9A 3D0PA 2Q1NA 2ZM6K 1GLDG 4CEAA 4FJIA 4DUYK 2D0CA 1WB9A 1GLEG 2HOEA 1W97L 3HTVA 4OJRA 3DXKB 2X6SA 1LAWA 3M1FA 1NKCA 1TUYA 1O13A 3EN9A 5BRHA 3CIPA 3LP3A 5HRNA 3SCXA 1SAZA 3UKUB 5EXWA 4Z4FA 3U3GA 3MDQA 3L4QA 4JI1K 4N41A 3I0SA 2P5GA 2O4IA 1C1CA 4X66K 4B9UA 4HTUA 3TAPA 1RDAA 3ULEB 3B6OA 5JICA 3OYGA 4Z4IA 1QVFM 4ILGB 3AA3A 2NZTA 1U04A 2X6NA 3HSTB 3VTIA 2Q97A 3O9RA 4FM0A 4M3UA 2XHBA 4ID1A 5SZTA 3K5NA 3T1AA 3ENHA 4LF9K 4BVPA 1WLJA 5E84A 1HNZK 2IDOA 3R1XA 4HUEA 2W6KA 4DFPA 3I56N 2IAJA 3DXMB 3CPEA 5BREA 4Z4CA 2UYTA 4YORA 3OYEA 2BGGA 2OPRA 1NM1A 2KKZA 4OVLA 4YDUC 4DB3A 4CFAA 1KFSA 3ATUA 4DTXA 1S22A 3ATVA 1DT9A 3VQ9A 4I2QA 4IZ9A 3QMLA 4FPAA 1CXQA 1JLBA 3QINA 3F73A 3I0RA 1YJ9N 3I33A 3V1QA 3S9HA 3AVFA 1EWQA 3H1VX 4I7FA 3EZ5A 2A5XA 3G4SN 3WUHA 4FK0A 4E72A 4NXMK 5KGXA 4AHCA 4N5SA 3HVRA 3MWPA 3QFUA 3N4PA 5JVHL 4CBUA 1BWFO 3A5OC 4B9TA 3KVGA 3AVJA 3VEVA 4CGHA 3SUQA 3C6TA 4DSJA 1HYSA 1XNQK 1HKCA 3CJCA 1KSPA 2KLAA 2O8BB 3O3FA 5JLHA 3E01A 1J9AA 2HNZA 5TKYA 4BRLA 4O5FA 3CPWM 4DCHA 3CCRN 3ZSRA 3BGRA 4CEDA 4Z4HA 3M8RA 4RW7A 1RTJA 2ZF5O 3ZT4A 3DLKA 1NJYA 1IBMK 4FW1A 3G71N 4B3RK 1XNRK 3CC7N 5BR9A 3A5LC 1CZBA 3FR0A 4W5QA 2QWRA 1K8KB 1BIZA 2QWNA 2G8WA 4KHYA 1A5XA 4RW9A 2HHQA 1LW0A 3DLLL 4DSIA 4CZHA 4B08A 3CCJN 2D0PA 5AQTA 3MCPA 3TTDA 4YOTA 4FZZA 3H3NO 4HUFA 1BA1A 3RTVA 2NRWA 4LSLA 1BQMA 4BQLA 1L3UA 2X78A 3SNNA 3OW2M 3SJJA 1DTQA 4JI2K 5F0XA 4AM7A 3C6AA 3ZCMA 1GOCA 1X1PA 1X9SA 1CZ9A 1JCGA 4IFVA 4DU3A 4PUOA 1FK9A 3KKSA 1NKEA 5GAHP 1RT5A 2HBKA 1ZBUA 3LP1A 2OTJN 4H0TB 3D2EA 2HHWA 4JKBA 2P51A 1HRHA 3BP8A 3HPGA 3OS2A 3NF7A 4LSNA 3ZETB 2P9PA 3NVKA 4F3TA 4FLYA 1S1WA 3GDQA 1JCFA 4JKFA 3UKRA 1B9FA 3A2FA 4A62A 5E41A 3VEYA 2WONA 1FKPA 4B1UB 3CJAA 5AQJA 1QTMA 3CHWA 4IJNA 3LANA 1VSHA 3GG4A 1B9DA 1S3XA 3O9SA 3DRRA 3MK6A 3HPOA 2AA4A 1W2BM 3KK2A 2W6LA 2UXDK 3CFRA 1QHAA 1U48A 2W40A 4Z4EA 5GINA 1JKHA 4E7JA 1VQLN 1GLCG 4CJWA 3E1YA 3L2UA 4O5BA 3TI0A 4IEIA 2PAVA 5LY3A 4CGIA 5GIOA 5BN9A 1FXXA 4JI4K 3AVCA 4M3WA 3N4QA 1SL2A 3H45C 5J2MA 2Z1IA 3BY5A 2BUPA 1GLJO 4CK3A 1RCHA 3LDNA 4EIAA 3AO2A 1JL2A 5BR8K 2F8SA 3RRHA 3RSEA 3VQ4A 3KKRA 1WSIA 3THXA 3C0BA 5JLFA 4FW2A 3T69A 3ZX0A 5C15A 4X65K 2NLXA 3TPQA 4BC5A 1Z26A 3AVKA 4KI4A 4KRFA 3OYJA 2HVHA 2JWLA 3VOVA 4CECA 4YOWA 3QBWA 4FJ9A 4IFEA 4H5TA 1JCEA 3IMXA 3D2EB 3U4LA 2O8EB 1VQON 2P9PB 5K14A 3O4WA 2BDPA 5SWMA 2P9NB 1LAVA 3SQ1A 5GADP 3VA0A 3DM2A 3RMCA 1OKJA 5FPMA 1RTDA 3V1RA 3UKRB 3VTHA 3AGKA 4JK9A 1BI4A 3NF9A 2VG5A 1RDUA 4CGJA 4CK2A 4KPYA 4IOAL 3L2VA 3TAQA 3QEWA 3D6RA 3JXUA 3G6EN 3P1GA 3HYFA 3TAGA 1ASUA 3TU5A 3VQDA 4CIGA 3VA3A 4JKEA 1KLMA 4CF0A 4B9QA 5B8HA 1EXQA 5CYMA 3ZSWA 4CI6A 3MEEA 1NGHA 1T03A 1Q82O 4FSVA 3TTFA 5AQOA 2E88A 3O9UA 2E5LK 4CJ3A 3HXMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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