3MMVA

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 106
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mmvA03
3AY9A 3HI0A 3ZX3A 4GNIA 4BR9A 4BR2A 1QZ6A 3HBTA 4H0VB 2F9TA 2E20A 3CQXA 5AQSA 4QS7A 2W40A 1QHAA 4FSVA 5AQKA 4CBUA 5F0XA 1ZBSA 3BF3A 4J8FA 4IXCA 3VGLA 3O08A 4FWOA 5FPMA 5AZJB 3CIPA 2PBDA 1T44A 3GBTA 1C0GA 1JCGA 5FPEA 4F9OA 3H46O 4FO0A 3FE1A 5AQPA 3WT0A 5AZIB 5KPRA 3BP8A 2D0PA 2AA4A 3ZX2A 4CD3A 3VEZA 3MN6A 2HF3A 4CZIA 5AZIA 3CJ7A 1GLDG 2GUPA 4HTLA 5TKYA 2HOEA 3ZX0A 2Q2RA 3C7NB 4NO7A 1RFQA 4ISGA 2D4WA 1NGBA 5ADXH 2P9LB 3SJHA 3G25A 1R59O 5EY4A 3VF6A 2E2NA 3C7NA 3L0QA 4BVOA 2CGKA 1NGAA 2E2OA 4HWIA 3MN5A 3DXKB 1WOQA 2P9IB 3ID8A 5BRFA 3H45C 1BA1A 5LJVA 3L4IA 3DXKA 5LY3A 3O8MA 4JD2B 1XQSC 1ATRA 1ESVA 2I7NA 5BPNA 3EL2A 3KVGA 1T6DA 2GELA 4BGBA 1TUUA 3FLCO 4H0TB 4H5VA 2IVOA 3SMSA 1BDGA 1QZ5A 4BRAA 3R9PA 5FPNA 2BTFA 3FR0A 4EAHD 3B8AX 5AQQA 2FF3B 4DB3A 3FGUA 2CH6A 1JCFA 4B1VA 4PL7A 3A5MC 3M1FA 3IDHA 5AQJA 2P9KB 1MDUB 5JMVA 1LCUA 3A5OC 3VF4A 3FZKA 1QQNA 1P8ZA 1HJOA 4FL9A 1T6CA 2Q0RA 1Z6RA 3H3OB 3QFPA 4WQ4A 1X3NA 4FWNA 2CGJA 1GLFO 3VEVA 1GLLO 3FZMA 2HMPA 5AQWA 5BN8A 3QMLA 2DPNA 4C23A 1OKJA 2QWOA 3VEOA 4BROA 4A2AA 4BQLA 3ATVA 4DHYA 1BOTO 2GTDA 3HZ6A 2WUSA 4CBWA 3AAPA 3SMPA 3VPZA 5I9EB 1NMDA 2FSNA 2V7YA 2KHOA 3CJ1A 2FXUA 2V51B 4I6MB 4BRLA 5AFUA 4WYBA 5CE3A 4I6MA 1E4FT 5AR0A 3OHRA 2Q36A 4DCHA 4BRHA 2E2QA 4XH4A 3LM9A 5EVZA 3ZETA 4BRFA 3WQTA 4BC4A 4QS9A 3FZFA 1V4TA 1EQYA 3VEYA 3KHYA 1J6ZA 2V7ZA 1KAXA 3R6MA 4CI6A 2ASPA 4BG8A 5ADXA 1XUPO 3UKUA 3EZWA 4AM7A 2YHWA 5EOYA 4H5RA 3CQYA 3LDLA 4WQ5A 1HKCA 3ATUA 3CJCA 5AFUH 2A42A 4BRCA 3A8YA 1YXQA 1NGIA 4CZHA 1NGHA 4BRGA 1E4GT 2QWRA 2QWPA 3QBXA 4FWLA 1KAZA 3GOIA 1Y64A 1GLJO 2AP1A 3HTVA 1BWFO 3A5NC 5AQOA 3EKUA 5BRHA 4JN4A 4BR0A 2YI1A 3WXJA 1MWMA 1JCEA 2E8AA 2QXLA 3A5LC 3M3ZA 4IO8A 4MO5A 4K25A 1K8KB 4DQ8A 3O6WA 1CZAN 4FWRA 1MWKA 2QWMA 4MLHA 2YJFA 4NB4A 1K8KA 2QWNA 4B1UB 2VWBA 4M63C 4Y0WA 2D0OA 2GWKA 3SLCA 3BUZB 1BG3A 1BU6O 1NGEA 4IJAA 1S22A 1RDWX 3RSEB 3QICA 1SQKA 2E1ZA 1G99A 3EO3A 2VCPA 3EN9A 5AQVA 1DEJA 4FOIA 3CJAA 3RSEA 1GLAG 2H3GX 3IUCA 2FSKA 3JS6A 2V52B 5BREA 4CBXA 1LOTB 2FSJA 3HM8A 1X9JA 2CGLA 4K41A 5KQDA 2A6AA 3D7EO 1DGKN 2P9NB 4IZ9A 1NGJA 4JAXA 4EHTA 4LC9B 2IIRA 2YCHA 2IVPA 2P9NA 4FWQA 2QWQA 5JICA 1HLUA 3W3DA 3VESA 2NZTA 5AQHA 1GLCG 2HF4A 3UKRA 3CERA 3DJCA 5AQLA 4B1YB 2Q0UA 3JXUA 2ZF5O 3VGKA 2EWSA 2UYTA 5EX5A 4H5NA 1KAYA 4IWVA 4B1XB 2A3ZA 4B9QA 4CZLA 3LDQA 2QWLA 4BR5A 3L6QA 1IJJA 4RWTA 3ENOA 4K43A 1U2VB 4IJNA 3WUHA 3FZLA 4O5FA 1S3XA 2P9PB 2ASMA 4XEIA 3VERA 3MN7A 1U2VA 3DAWA 3VGMA 2P9PA 4BC3A 3A0IX 3AARA 1TUYA 2F9WA 4BQZA 4EHUA 4H0YB 3U9ZA 2Q1NA 1ZXOA 3BEXA 1HKGA 4CJ7A 3MK6A 4CZEA 5BPLA 3ZETB 3WXKA 4MLEA 3ULEB 4H03B 3D2EB 4PKHA 3VEWA 3H6EA 4BRPA 5AQIA 2GEMA 3ULEA 3D2EA 3MCPA 3LDPA 1HPMA 2VYPA 3WEEB 2Q31A 4H0OA 3UKUB 3O1WA 4XH5A 3UE5A 5AQRA 3WEEA 4H0PA 4Z94A 5AQXA 1NGDA 5F2RA 5JLFA 5BN9A 1NGCA 3AAQA 3LM2A 3H3NO 3D2FB 3GE1A 4WQ4C 1YVNA 3BF1A 2YJEA 3TU5A 1ZC6A 2ITMA 1NGGA 2QW9A 3D2FA 4JHDB 2ZGZA 2P9UB 2A40A 4H5WA 3ZEUB 1DKGD 4BRQA 2OANA 3IMXA 4AM6A 3VEXA 1V4SA 2D1KA 4BG9A 4CZFA 4JHDA 3DXMB 3LL3A 2P9UA 5AQFA 3ZEUA 5BPMA 4L3QA 3DXMA 4YDUA 5AZJA 2Q97A 4M7YA 1C0FA 2QM1A 1YAGA 3MDQA 5F1XA 5AQNA 4CZJA 5JLHA 4CZMA 1Q18A 1D4XA 3S41A 3WQUA 1HKBA 3O5BA 2ASOA 3MN9A 5KQ8A 4PL8A 3WXIA 5ELZA 4RCHA 2E2PA 5AQGA 4FWKA 4XH1A 4BRKA 1BA0A 1YUWA 5E84A 2E1YA 2P9LA 3F9MA 4K42A 2NLXA 2W41A 3GG4A 3M6GA 3QBWA 4A61A 3CHWA 5KPZA 4BR4A 3W0LA 5E26A 1X3MA 2P9IA 4M7XA 3VETA 1HX1A 1IG8A 3QB0A 3VENA 4BRNA 3TPQA 4BRDA 4JD2A 4BRIA 2CH5A 1TYQB 1SAZA 3I8BA 5BRDA 4O8KA 4CD1A 4A2BA 1ATSA 3R8EA 3FZHA 3IFRA 1NWKA 1TYQA 4RTFD 3UB5A 1ATNA 5EXWA 3UKRB 4WQ5C 3CJBA 2NRHA 5AQZA 1Z05A 3VOVA 5AQTA 1BUPA 1QQOA 4FWMA 3MMVA 3SK3A 3CI5A 4QS8A 2P9KA 1SZ2A 1GLBG 3GL1A 3CETA 1H1VA 3U8XA 3P4IA 2IVNA 4ISEA 4BRMA 3VF2A 3QFUA 5AQMA 2PAVA 5BR9A 4YDUC 3DWLA 4KBOA 2A41A 2I7PA 2YHYA 1U6ZA 3KZBA 4FWPA 4BC5A 1RGIA 3I33A 5AQYA 5KPTA 4JNEA 4B1WB 4CZGA 1MA9B 4FPBA 3H1QA 4EIAA 4BC2A 2FF6A 4H5TA 4H0XB 1QQMA 2YHXA 2FLOA 5LJWA 3CJ9A 1WUAA 3J8AA 4MO4A 1NLVA 2ZGYA 3QDKA 2A5XA 3LDOA 3HSCA 1NGFA 4PKIA 4EFHA 4BGAA 3O80A 3EKSA 4PKGA 3WXLA 3U4LA 1HUXA 4E1JA 1NBWA 3C0BA 4ISFA 1GLEG 5B8HA 4A62A 3FFKB 1KXPA 3ENHA 3GDQA 2ZWHA 2P9SB 4GY2B 5AQUA 4FWSA 2BUPA 4BVPA 4FOEA 4BREA 1NM1A 3LDNA 3O4WA 4B1ZA 5FPDA 4FPAA 1BO5O 2E88A 2P9SA 1XC3A 3U9DA 3H1VX 4BR7A 4CZKA 3O1BA 2J4RA 2GWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OPAA 4GNIA 1ZYQA 1ASUA 3PSFA 4FSVA 2OPQA 4WFNL 3LZIA 2NRXA 1VQMN 3BF3A 2P5OA 1RILA 4J8FA 4IXCA 4W5RA 3B6OA 1NK6A 4JKEA 2OZSA 4R79A 5BR8K 3CCSN 1QS4A 1KD1O 4JRPA 1J5OA 4FO0A 4B8AB 2HBMA 2YHAA 4E89A 3NH1A 3NCIA 1ASVA 3MN6A 2HF3A 3ZYYX 4E3SA 3SUQA 1EP4A 4OO1J 3P38A 3OW2M 1NJZA 4CFAA 1YHQN 1RFQA 2D4WA 2P9LB 4BDZA 3SJHA 3G25A 3VF6A 2E2NA 1JLCA 3NAEA 4HWIA 4JI8K 1WOQA 4IEIA 4JKHA 2P9IB 4JI0K 1W97L 3RWUA 1T03A 4LY7A 4OGEA 4CEOA 1ATRA 3ZSZA 1L3TA 2I7NA 2KZMA 2HW3A 4BGBA 3RMDA 1RNHA 4H5VA 3OYEA 5FPNA 4EAHD 3B8AX 4DB3A 1KVCA 2FBTA 3M1FA 3H08A 4KHPK 1BHLA 4WFAL 3L2RA 3WNGA 3A5OC 1QQNA 1P8ZA 4CGJA 3EY1A 1C0UA 2KW4A 4CJPA 4FL9A 1T6CA 2OTLN 3L3VA 4O0IA 5LMUK 1BISA 3VQ4A 2Q0RA 1Z6RA 3H3OB 4FJ9A 3NF8A 3LWMA 1NOYA 3E1YA 4FWNA 3ENBA 3AVCA 3ISNC 1VQ6N 2Y1IA 4DTRA 2IS3A 3RTVA 1YIJN 3LPUA 1OKJA 4JI2K 1U4BA 1NJIO 3VEOA 1XHZA 1IV0A 2IGIA 4DTOA 2OA8A 3HZ6A 1N34K 4B3SK 3SPYA 3SBGA 3VPZA 3DRRA 1N8RO 1RT1A 3MEDA 4DU4A 2FXUA 4BRLA 1JL2A 4WYBA 1ZBHA 1E4FT 3OHRA 4YOYA 1FKOA 2ZD1A 4CF0A 3C94A 3ZETA 4BRFA 3WQTA 2WFBA 4QS9A 4X64K 4I9QA 2G8WA 1V4TA 3QERA 1EQYA 3HSTB 1VQ8N 1YITN 2HHHK 3AV9A 4CCHA 3UKUA 3SUNA 2YHWA 5EOYA 4H5RA 3CQYA 3LDLA 2HHSA 2ZE2A 4KI6A 4BWJA 1OH7A 2KFNA 2A42A 1YXQA 4CZHA 1I3AA 2QWPA 3QBXA 4OVLA 4CEZA 1ZBLA 1GOBA 1NKBA 3GOIA 4OKKA 4O44A 5C0YA 1S72N 4DF4A 4CE9A 4HUFA 3NGZA 1TVRA 3L2VA 4BR0A 5GIOA 2YI1A 4O8UA 2QXLA 4MO5A 3PX6A 2XY6A 1K8KB 4CGFA 4FWRA 2QWMA 2BANA 1RCHA 4NB4A 3HP6A 1L3VA 1K8KA 1LWCA 2QWNA 4B1UB 3OYMA 4Y0WA 2D0OA 2GWKA 3I56N 2OPPA 1O13A 1UAXA 3NF7A 4CECA 4IFYA 3HP9A 3CMEN 3QICA 3AA2A 1XNRK 2RE2A 3EN9A 4YOWA 2H3GX 3IUCA 3JS6A 2UXBK 4CBXA 1TKZA 4CGGA 5M1OA 3ZSQA 4LH5A 2O4GA 2RN2A 4K41A 4FM0A 5KQDA 4ID1A 4CJSA 3PO4A 4IZ9A 1NJYA 3HOTA 2IIRA 2YCHA 2IVPA 4FWQA 2HHQA 2BDPA 1ASWA 2X74A 4CIGA 1GLCG 3HPGA 3OYFA 3CERA 3DJCA 5AQLA 1KVBA 2D5RA 2EWSA 2UYTA 2WBNA 4H5NA 2X6NA 3LDQA 4FLXA 2PYLA 3L6QA 4RWTA 4K43A 1U2VB 3B6PA 3WUHA 3AVGA 4O5FA 1S3XA 3BZKA 4JI5K 3MN7A 1U2VA 4Q5VA 3ZT4A 4DUYK 3LWLA 4EHUA 4C8MA 5H1SQ 1ZXOA 1LV5A 3BEXA 1HKGA 4MDAA 3CCLN 4IG3A 3WXKA 3K0SA 2ATQA 4MLEA 3KK7A 4PKHA 5DM7L 3H6EA 3VQ5A 4DV6K 4DFPA 4N47A 4B3RK 5AQIA 3EE9A 4CJEA 3DLBA 1KFSA 1HPMA 3TTFA 3WEEB 1KCFA 3MCAB 4XH5A 4NYFA 4E72A 5AQRA 3WEEA 5CZ1A 3ZSYA 5I42A 1HYZA 3TSQA 1ZBIA 2OTJN 1NGCA 1C6VA 2VQFK 4C1NI 4DKWA 3AVAA 4OGCA 3K2PA 2Z1HA 4FXDA 1YVNA 2YJEA 3TU5A 3THVA 3TAFA 2ITMA 1NGGA 4JHDB 3M8SA 2P9UB 2GX9A 2A1RA 4ILGB 1DKGD 3AVMA 2OANA 4BG9A 4AM6A 3VEXA 2D1KA 4JHDA 3U6FA 5EU7A 2P9UA 3NBPA 5AQFA 3DRSA 3MEEA 1N6QA 4DQPA 5AZJA 2Q97A 2QM1A 2OCEA 3ZLJA 5M1PA 5F1XA 3LAMA 3PIOL 4FLUA 3KLEA 4DTNA 3OYKA 3TR8A 2FC0A 2LSNA 3O9RA 1Q18A 3AO3A 4CZMA 1D4XA 3L2QA 1EWRA 1UA0A 1HKBA 3O5BA 2ASOA 3K5NA 3I0RA 3BZCA 2DTUA 1IBKK 3C95A 4JKFA 4CEEA 2B5JA 3DRPA 2YHBA 5CR4A 4LH4A 4K42A 4CW7B 1RTHA 1YVUA 3J7AP 3GG4A 3U3YA 3W0LA 1X3MA 1BL3A 3VETA 3V9ZA 3QB0A 3NVMA 4BRNA 3CCRN 2NRWA 5JS2A 5C25A 4QOZB 3IKMA 1TYQB 5BRDA 4O8KA 1IKYA 3G10A 4A2BA 3MX2A 3R8EA 1WAJA 3FZHA 1TYQA 4I2PA 4AQYK 5EXWA 3UKRB 4KHNA 5JENA 4LD0A 3VOVA 5AQTA 1HJRA 1BUPA 1QQOA 4FWMA 2P9KA 3EEQA 1SZ2A 1I94K 3UIQA 3P4IA 3LP3A 1RT5A 2YX6A 4AHCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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