3MMVA

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 106
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mmvA03
2FF6A 2W40A 3U8XA 1HX1A 5EX5A 5JLFA 1NGBA 2GWJA 5AQRA 2P9IA 3QB0A 2YHXA 3O8MA 2YHWA 2EWSA 1NGCA 3U9ZA 1QQMA 1ZBSA 3LL3A 1QQOA 3BUZB 3QMLA 3VEXA 2E1ZA 5JICA 3VF6A 4BC4A 4BGAA 1GLEG 3MN5A 2P9IB 3MN6A 4FOIA 1MDUB 3TU5A 3DXMB 3MCPA 4IZ9A 3QFUA 2PAVA 4JHDA 2A3ZA 4B1XB 3SK3A 2P9KA 4PL7A 1H1VA 2E88A 3A5MC 4CZHA 1NGDA 3CJ7A 2YJEA 4BR5A 4C23A 2YJFA 1MWKA 3HSCA 2P9NA 1GLLO 1NGAA 4EIAA 3D2FA 4JHDB 3M3ZA 2QWQA 4CZKA 4H5NA 3H46O 1GLCG 2P9KB 4QS8A 4BREA 2HF4A 1ATNA 1WOQA 1NBWA 3LDLA 2QWOA 1QZ6A 5AQNA 3ZX2A 2CH5A 3HTVA 1D4XA 4JNEA 4GY2B 4B1YB 2I7PA 3FZMA 4BRNA 5AQPA 3D2FB 4BGBA 2I7NA 5EVZA 3UKRA 4BR7A 3HBTA 2BUPA 3L6QA 4BRPA 3R8EA 5BRFA 3FZKA 4IJAA 3CI5A 3WXIA 4IO8A 3A5LC 4H5RA 5AQWA 4B1ZA 2CGLA 5F2RA 1JCGA 4XEIA 1GLDG 3FR0A 1V4TA 3UKRB 1X3MA 4H03B 3EZWA 3EN9A 1NGIA 1HUXA 3KHYA 1P8ZA 3JXUA 3ENOA 2V51B 3ID8A 3CQYA 2F9TA 3BF1A 5B8HA 3VEVA 2Q1NA 4FWMA 4H0OA 1IG8A 4K25A 4PKIA 3ATUA 4H0TB 5AQIA 2UYTA 3BEXA 2GTDA 3DAWA 1DKGD 3A8YA 4BR0A 3P4IA 3VEZA 3WXKA 5CE3A 4AM6A 1ZC6A 1QZ5A 3I8BA 4EHTA 1OKJA 2P9PA 1EQYA 4WQ4C 2PBDA 4HWIA 4ISEA 3CJ9A 3ZETA 4RTFD 3FFKB 1BWFO 4CZGA 4FWRA 1IJJA 1XUPO 3R6MA 4BG8A 2P9SA 4H0PA 4MO4A 3B8AX 3SJHA 1Z6RA 5BRDA 3RSEB 1Z05A 3C0BA 2P9PB 5AQSA 3VESA 4M7XA 4H0YB 2QWNA 5JMVA 3QFPA 3F9MA 5BPLA 1ESVA 2ASOA 5FPNA 4ISFA 3CJBA 3ZETB 4B1UB 1NLVA 4BRIA 1K8KA 4PL8A 2KHOA 4CD3A 4CZFA 4M63C 3CHWA 4YDUA 5AFUH 3ZEUA 2GUPA 2P9SB 3UB5A 3I33A 4BC3A 2A42A 4EHUA 5BN9A 4MLHA 2VCPA 4BRCA 1NGGA 4BRLA 3OHRA 2V7YA 2W41A 1C0FA 3DXKB 2IVPA 3HM8A 5EY4A 5KPTA 1K8KB 1LOTB 2ASMA 3VEOA 2QWLA 3WUHA 3ZEUB 3WEEA 1NGFA 3DJCA 4CBUA 1GLAG 5AQFA 3H1QA 3D7EO 1TUUA 4JD2A 3DWLA 4A2AA 4XH4A 1QHAA 2A41A 4RWTA 5AFUA 3MK6A 4I6MA 4BRHA 3MDQA 2FSNA 2QWMA 5BR9A 1NMDA 4K43A 5AQZA 4FO0A 4HTLA 5AQUA 3O1BA 3VOVA 1JCEA 1KAZA 2P9UA 4BC5A 2FF3B 2ZF5O 4M7YA 5LJVA 4I6MB 2Q97A 3A5NC 4FPAA 3CETA 4F9OA 2VYPA 3ATVA 2QWRA 3W3DA 2NLXA 3S41A 1GLJO 2YCHA 5KPZA 4BQZA 4BVOA 2P9UB 2P9NB 5F1XA 1HKCA 1SQKA 1T44A 3QBXA 1J6ZA 2ZGYA 3O6WA 5AQTA 4WYBA 3VEYA 3VEWA 3EO3A 4EAHD 4J8FA 2Q31A 4FWNA 4KBOA 1HJOA 1BA0A 4MLEA 2BTFA 4IJNA 2P9LA 1NWKA 4QS7A 5FPDA 3JS6A 4DHYA 2FSKA 2CGJA 4DCHA 1ATRA 5LY3A 4WQ5A 4H5WA 2E2PA 2FSJA 1GLFO 3HI0A 3O4WA 5AQOA 4FWQA 4H0VB 5AQKA 3GE1A 2WUSA 1S22A 1ATSA 3AARA 3M6GA 3AAQA 3IUCA 2P9LB 3CERA 4E1JA 2IVNA 2NRHA 5ELZA 3ENHA 3UKUA 4H5VA 2YI1A 4PKGA 3L4IA 1X3NA 1KXPA 2ZGZA 4A62A 3SMSA 3VERA 3H1VX 5AQXA 4BRMA 3VGMA 3WXLA 1E4GT 1KAXA 2HOEA 4K42A 2AP1A 3R9PA 2FXUA 2Q2RA 4JN4A 2A5XA 5AQQA 2E2NA 4H5TA 3FZLA 2AA4A 2GWKA 2Q0RA 2HF3A 4DB3A 5AR0A 2ASPA 1KAYA 4WQ5C 1Y64A 3EL2A 5KQ8A 5JLHA 2F9WA 5FPMA 4CBXA 1V4SA 3CQXA 5BPMA 4FSVA 2D0OA 3VPZA 3H45C 1HKGA 2E8AA 3QBWA 1DGKN 3CJCA 1BUPA 3ULEA 3KVGA 3MMVA 3H6EA 4Z94A 3CJ1A 3ZX0A 5LJWA 4B1WB 1E4FT 2DPNA 2YHYA 4BG9A 5EXWA 4CBWA 4XH1A 3J8AA 1MWMA 1X9JA 2CH6A 1SZ2A 1BU6O 1BDGA 1JCFA 2QWPA 3D2EA 3SLCA 4CZLA 1Q18A 2D1KA 4CD1A 5AQGA 3MN9A 1C0GA 3ULEB 4XH5A 1HKBA 3DXMA 5KPRA 4BQLA 3IFRA 1YAGA 4B9QA 3BP8A 3WEEB 2QXLA 3ZX3A 3D2EB 3O5BA 4FPBA 4IWVA 4JD2B 5AQJA 4RCHA 2E20A 1WUAA 3H3NO 3VF2A 2E2OA 3LDNA 3TPQA 3LDPA 3VETA 3MN7A 3FGUA 3L0QA 4FWOA 4ISGA 4PKHA 4CZEA 5BPNA 4MO5A 3U4LA 4BVPA 3EKSA 1RGIA 3LM2A 3QICA 3LDQA 1RFQA 4QS9A 4BR9A 1TYQA 4LC9B 1U6ZA 5AQVA 2ITMA 1T6CA 3GL1A 1BOTO 4O8KA 4YDUC 5AQMA 4BC2A 5AZIA 3VENA 3CJAA 2CGKA 1NM1A 3HZ6A 1XQSC 4AM7A 4CZJA 1RDWX 3C7NA 2OANA 1NGEA 1TYQB 3GBTA 2E1YA 3FE1A 1LCUA 5AZIB 4NB4A 4JAXA 4CJ7A 2A6AA 1CZAN 5ADXH 3VF4A 4A61A 1YVNA 3WQTA 1G99A 1BA1A 2A40A 4WQ4A 4CZIA 3KZBA 3C7NB 4BRAA 2GELA 3EKUA 4BRQA 5E26A 5BREA 3QDKA 3W0LA 5F0XA 1NGHA 3FZHA 1ZXOA 4FWLA 1SAZA 4A2BA 2FLOA 1QQNA 3A0IX 4FOEA 2NZTA 1S3XA 3VGKA 4B1VA 4DQ8A 3BF3A 4BRDA 5AQLA 1T6DA 3M1FA 1YUWA 3IDHA 5EOYA 5I9EB 1TUYA 1R59O 2QW9A 3FZFA 3A5OC 5ADXA 1MA9B 4BR2A 4EFHA 5KQDA 2Q36A 2V7ZA 3UKUB 4K41A 3H3OB 3GG4A 5TKYA 2V52B 4CZMA 2ZWHA 2HMPA 3LDOA 2QM1A 3UE5A 4L3QA 4BRKA 2Q0UA 1U2VA 3AAPA 5AQHA 3WT0A 3FLCO 4GNIA 1BG3A 4FL9A 4NO7A 1BO5O 1HPMA 1NGJA 5BRHA 3CIPA 4IXCA 3GDQA 3RSEA 4BRFA 5AZJA 1DEJA 2J4RA 4O5FA 5E84A 2VWBA 3VGLA 4BR4A 1U2VB 4FWKA 3IMXA 2H3GX 4H0XB 3AY9A 2D4WA 2GEMA 3GOIA 3U9DA 2D0PA 1GLBG 1XC3A 3O80A 5FPEA 1HLUA 2IVOA 4CI6A 3WXJA 4BROA 2E2QA 3SMPA 3O1WA 5AZJB 1YXQA 3WQUA 4FWSA 3DXKA 3LM9A 3O08A 5BN8A 2IIRA 4FWPA 3G25A 4Y0WA 4BRGA 5AQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F2SA 4GV3A 2FF6A 3U8XA 1HQUA 4M3WA 1HX1A 4WFAL 2YX6A 1Q86O 3CCQN 3VQ8A 1IKWA 4KHNA 4W5QA 4C8MA 2YHXA 3O8MA 1T05A 1TV6A 2YHWA 4NYNA 3U9ZA 2NRZA 4FJIA 3SI6A 3P38A 4DR3K 3NH0A 3QMLA 3CFRA 1NKBA 1S5JA 1GLEG 3G0ZA 2PAVA 4K8ZA 3WXMB 4JHDA 4KH4A 2G8VA 3V9UA 3OYMA 1ZBIA 1T3VA 2Y1IA 2E88A 3A5MC 1J5EK 3VQ6A 3PX6A 3SNNA 4CGHA 2YJEA 2E6MA 2Z1JA 1NJZA 4N41A 1GLLO 1NGAA 4JKCA 3MWPA 3PSFA 3KK3A 3AVHA 3CMEN 1E3MA 4H5NA 2P9KB 5CY4A 2HF4A 1XC9A 4LF6K 2RPIA 1ATNA 2VGMA 3LDLA 3QIPA 1VQ9N 5AQNA 3ZX2A 2CH5A 3QO9A 4DSEA 2GX9A 4GY2B 1JLGA 3AO1A 3FZMA 3WNEA 4BGBA 1EWRA 3TSPA 1C0MA 3HJFA 4FJ5A 3L8BA 2A1SA 2BUPA 3L6QA 3NHGA 1M1KO 3CI5A 4LSNA 5GADP 5DM6L 4F2RA 4IO8A 3JSMA 4HUEA 3O9QA 4IOCL 1KSPA 1GLDG 2W42A 5DMRA 5A2QO 5TKWA 4E7LA 1N8RO 1S72N 3EZWA 1K9MO 1W97L 1HUXA 3CXCM 1P8ZA 3M8QA 3VN5A 4DFJA 2IDOA 3K5LA 3RWUA 4C8LA 4I2PA 4JKHA 3CQYA 3S9HA 1SV5A 4M3UA 1WSEA 1YITN 3ATUA 4UY8O 5C25A 3BEXA 2GTDA 1DKGD 2YNFA 4DTNA 1HYZA 4IOXA 1UAXA 1JXEA 1RNHA 3DRRA 5GAHP 1TAQA 4W5RA 1EQYA 3PSIA 4DFKA 4J2EA 4FJKA 3ZETA 1NK5A 1VSIA 4RTFD 1BWFO 2O8FA 4ELVA 4AHCA 1XUPO 1NK0A 3B8AX 4FK0A 4WFNL 1ZBLA 3VESA 1KC8O 4H0YB 2OYQA 3I0SA 1ESVA 3CJBA 5JVHL 3IS9A 1K8KA 3R3LA 4AHUA 1HRHA 2KHOA 4CZFA 3MX5A 4JK8A 4M63C 4JS4A 2FBXA 2BE2A 3D0PA 3SZ2A 1VQ6N 1L3SA 4FJJA 1GOCA 2BDPA 4EZ6A 3SPYA 3ZSWA 2X74A 3DI6A 2V7YA 2IVPA 5KPTA 4C1NK 1JJ2M 3VEOA 1N32K 1RT3A 4DSJA 4KRFA 3O4QA 5HRNA 3PY8A 1DTTA 3NGZA 4F8RA 3H1QA 1Q81O 4E7HA 4OPAA 1RT5A 1LW0A 1QHAA 4FVMA 5AFUA 1DT9A 2RHKA 3J7ZO 4BRHA 3U6FA 4CEZA 2JWLA 5C12A 4OO1J 4PQUA 4BDYA 5BR9A 3WNFA 2ATQA 5C2FA 1N5YA 4ZTFA 4HTLA 3VOVA 1JCEA 1KAZA 1Q82O 3N4PA 3SAHA 3LZIA 1RDAA 3DM2A 3A5NC 3THWB 3CCVN 4J2DA 5MLCQ 3ATVA 1D5AA 4IOAL 2NLXA 1TKDA 2YCHA 1W7AA 5KPZA 4DQQA 3QESA 2P9UB 3CQ8A 3RMAA 2XHBA 3A2FA 3OA9A 3VEWA 1VQ4N 3EO3A 2KZZA 3B6PA 3ALYA 3LWLA 1RDCA 4BE1A 1BA0A 4CK3A 1QQCA 2LSNA 3SQ2A 4CJLA 2P9LA 3MCAB 1KVAA 3JS6A 4DHYA 4FJNA 1RBTA 5LY3A 4WQ5A 4B9UA 4DSFA 3O4WA 1JL1A 4CEOA 5FRNA 3LZJA 3T1YK 3TAEA 3LWMA 2WUSA 1S22A 3AAQA 4DR1K 1C0TA 3CERA 5KRTA 3OYLA 1NJYA 3CG7A 3VQDA 3AVIA 2G8FA 3TTFA 4JI8K 1B92A 4DS5A 2X6SA 3NE6A 3OYAA 2ZGZA 1VQ7N 1TKZA 3SUPA 3S3NA 3H1VX 2QTDA 5AQXA 4YFUA 4DF8A 3VGMA 3WXLA 2HHWA 1YF5L 4K42A 3OYIA 4NXNK 4JI3K 2WOMA 1REVA 2Q2RA 1UWBA 3HK2A 4CFAA 2E2NA 4H5TA 4CCHA 5CZ1A 3ITHA 3FZLA 2AA4A 2Q0RA 2HF3A 1KAYA 3O9TA 1Y64A 3MXIA 2D5RA 4YHHK 3ZYYX 4B9SA 2OZSA 3EL2A 5JLHA 4YOTA 3CMAN 3OY9A 5BPMA 4FLYA 2D0OA 3LP1A 4DV3K 1B9FA 3KLFA 3CJCA 1NK4A 5FRMA 3MMVA 4Z94A 3CJ1A 3CPEA 3O9RA 3E9LA 4B9LA 5LJWA 2YHBA 1E4FT 1D8YA 2DPNA 2OA8A 3ZSZA 4PWDA 3AO3A 3HP9A 3DMJA 1X9JA 5C10A 2CH6A 1BU6O 4DTMA 1KVCA 4N76A 4CD1A 2HSTA 3SQ0A 1HKBA 4ICLA 3M8PA 3F2KA 5J2NA 3RMCA 3SUNA 3IFRA 1YAGA 2DFEA 3NVMA 4X66K 1LWEA 4I7FA 3WEEB 4CJQA 1VQON 3ZX3A 3QERA 4FPBA 5GAEP 4RCHA 4RW8A 1VK0A 1WUAA 3THYB 4NXMK 4F3OA 5BPNA 5M1QA 4CHNA 3QICA 1NJXA 1RFQA 3ZT1A 3D45A 1BCMA 1RTIA 1BOTO 3C6TA 3QLHA 4YDUC 4BC2A 3VENA 2B6AA 3KJVA 1VSDA 1WB9A 1NM1A 4DR4K 5M1FA 3CCJN 4AM7A 4CJTA 4M45A 3V6DA 1TYQB 3GBTA 2E1YA 3C94A 1LCUA 2W00A 3K5NA 1VQMN 4CJ7A 2A6AA 1CZAN 5ADXH 5KGXA 4A57A 2A40A 3NF6A 4G1QA 1I39A 3HRGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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