3MMVA

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 106
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mmvA03
3S41A 3ZETB 1BWFO 4JD2B 4K25A 3JXUA 1NGDA 1YXQA 2IVPA 4BR5A 4A61A 1S3XA 5EVZA 3O1WA 3CERA 4WQ5C 5FPMA 2CH6A 5AFUA 3VESA 4JD2A 1KXPA 3B8AX 3JS6A 3VF6A 2D1KA 3A5OC 1T44A 4EHUA 3UKUB 4YDUC 5LY3A 3MN5A 3AAPA 5FPNA 5BRDA 4PKIA 2QXLA 3WEEB 1ZBSA 4CBWA 2P9UB 2ASMA 1GLEG 3FGUA 2D4WA 5I9EB 1WOQA 4H0TB 4XH5A 3LDQA 3U8XA 3UKUA 1V4SA 2E20A 5F0XA 5AFUH 2E8AA 5FPDA 3U9ZA 4Y0WA 3SJHA 4BRQA 5KPTA 3WEEA 3EKUA 3IUCA 2P9UA 3GL1A 3ZX0A 2HF3A 4ISFA 1S22A 1NGHA 3VEYA 3VF4A 5BREA 3D2EB 3FZHA 3CETA 3EZWA 4CZIA 4B1UB 4CZFA 3EKSA 1KAZA 4B1YB 2J4RA 2NRHA 3GOIA 3VEXA 4BRFA 4BVOA 3ENOA 3D2EA 4BR2A 3ULEB 3CJ1A 4BR4A 4BR0A 2IVNA 5BPLA 3O80A 2QWPA 1YAGA 2ASPA 1X3NA 3O1BA 3A5LC 4BGAA 3QBXA 3C0BA 4H5NA 1H1VA 1G99A 3ULEA 2E1ZA 5AZJB 3SMSA 4CD3A 5AQOA 3HTVA 4FPAA 3MDQA 3D7EO 3LDLA 3I8BA 3SK3A 1HKCA 3DJCA 5AZJA 2CGLA 4MLHA 3U4LA 1OKJA 2V52B 3H6EA 3WQTA 4XEIA 1BG3A 1P8ZA 3A8YA 5AQTA 4RCHA 4IZ9A 4PKGA 3ATUA 5AQVA 2YHXA 2E2NA 1IJJA 3OHRA 5AQWA 4ISEA 3KVGA 1BU6O 4C23A 2HMPA 1NWKA 5AQJA 5ELZA 3GE1A 4BROA 5JICA 2HF4A 2GELA 2YCHA 4CZLA 5AQIA 4FPBA 4KBOA 5EOYA 2FF6A 1V4TA 3FFKB 3LDPA 2QWQA 4BQZA 5ADXH 2YI1A 1YVNA 3KZBA 4MO5A 1NGEA 4J8FA 4IO8A 4MLEA 2W40A 2ASOA 4IJAA 3BEXA 4BC2A 3WXJA 2BTFA 1T6CA 4FWQA 4H0VB 5TKYA 5EY4A 4HWIA 2BUPA 4BRGA 4Z94A 5AQZA 3WUHA 3L6QA 4B9QA 2A42A 3LDNA 3BF3A 4O8KA 3UB5A 4B1ZA 1RGIA 2Q36A 3LDOA 3UE5A 3ZEUB 3L0QA 2P9IA 1NGGA 1TYQB 2FXUA 2YHYA 1LCUA 2QWLA 1E4FT 3ZEUA 5E26A 1XC3A 3VENA 1ATNA 4BC5A 4BRCA 1MWMA 3MN9A 4YDUA 1TYQA 4JN4A 2AA4A 4EIAA 3CQXA 2W41A 2QWNA 4ISGA 2P9PB 4QS7A 3O6WA 3HBTA 3CI5A 4XH4A 2A5XA 1SZ2A 3G25A 1GLAG 3IFRA 3IMXA 4DB3A 5AQRA 3WXKA 1BDGA 1SQKA 2P9PA 4BR9A 3EL2A 2KHOA 2P9KB 3ENHA 1U6ZA 3DAWA 3IDHA 4BC3A 5KPZA 1K8KB 1ZC6A 4F9OA 1CZAN 2PAVA 3FZMA 4FWRA 1BOTO 1ZXOA 3VEVA 3VGKA 2P9KA 4K42A 1MA9B 1K8KA 4GNIA 1JCEA 3DXMB 3R9PA 1GLLO 3QICA 1WUAA 2YJEA 1QHAA 4M7YA 1ATSA 2NLXA 4IXCA 3H46O 1NLVA 4CBUA 3DXMA 1QQOA 4BRNA 2A41A 3CJ7A 3R6MA 1ESVA 1TUUA 2ITMA 3WQUA 4H5VA 3WXLA 1GLCG 2IIRA 2GWJA 3UKRB 5CE3A 1RDWX 3QB0A 2QM1A 2E88A 2GWKA 3VGMA 3VOVA 2CGJA 2H3GX 2Q31A 5F2RA 4AM6A 4FL9A 2YHWA 1Y64A 4PKHA 1BUPA 3UKRA 2E2OA 4LC9B 4HTLA 4FWPA 2A3ZA 3W3DA 5EXWA 4FOIA 4I6MA 3A5MC 1E4GT 5JLHA 3CJAA 3KHYA 3M6GA 2QWMA 1QZ6A 2E2PA 1BO5O 3VERA 3H3OB 3VEOA 2ZWHA 3CHWA 1HKGA 1Q18A 3AARA 5AQSA 3HZ6A 4E1JA 2D0PA 2CH5A 3H1VX 5BRFA 4FOEA 5EX5A 3DXKB 3O08A 3HM8A 5AQMA 1NGCA 1QQMA 3SMPA 4BREA 3GG4A 1BA0A 3L4IA 3DXKA 2NZTA 3FZKA 2Q0RA 1Z6RA 1HUXA 2AP1A 3CQYA 1KAXA 3M1FA 5AQGA 5KPRA 1X9JA 4H0PA 2P9LB 4O5FA 5AZIB 5AQUA 3MCPA 1HX1A 2P9IB 3TPQA 4EHTA 1X3MA 1JCGA 1QQNA 2ZGZA 4DCHA 2FLOA 3J8AA 2P9LA 3FLCO 3O8MA 4BR7A 4FWMA 3MK6A 1HKBA 5AZIA 4FWSA 3VETA 1NBWA 4GY2B 3CJ9A 1BA1A 4CZKA 4QS8A 2I7NA 4FWNA 3D2FB 3ZX3A 4EAHD 3H1QA 4FSVA 3LL3A 5AQHA 1GLBG 3CJCA 4CD1A 4M7XA 4CI6A 2GEMA 1KAYA 4A2BA 5BPNA 3WXIA 3D2FA 2QWOA 1XQSC 3QMLA 4IJNA 5AR0A 4DHYA 4BGBA 4BG8A 2YJFA 4H5RA 5BPMA 1NGBA 5BRHA 3VGLA 3ID8A 2F9WA 5KQ8A 3QFUA 4B1XB 1TUYA 5E84A 2Q1NA 4M63C 2A6AA 3C7NB 4FWKA 3HSCA 4H5TA 3BP8A 2P9NB 3WT0A 4PL7A 1U2VB 3SLCA 4EFHA 5AQQA 4BRIA 3CIPA 3ZETA 3LM9A 1DKGD 2FSJA 3C7NA 5AQNA 1QZ5A 2F9TA 4BC4A 2Q2RA 3O4WA 1NMDA 2P9NA 4BG9A 1U2VA 2QWRA 4BRAA 3LM2A 3VEWA 4FO0A 5BN9A 1GLDG 4BRMA 4BRKA 4QS9A 2OANA 3AY9A 2FSKA 2V7ZA 4FWLA 4CZJA 1HPMA 1LOTB 2V7YA 3QFPA 1R59O 3U9DA 1D4XA 3BUZB 1JCFA 3CJBA 3EO3A 1NM1A 1NGFA 4FWOA 2Q97A 5BN8A 4PL8A 4MO4A 3RSEB 4L3QA 5AQPA 2GTDA 4BRHA 1HLUA 3MMVA 3MN6A 2D0OA 1GLJO 3FZFA 1MDUB 1ATRA 1J6ZA 2VCPA 3R8EA 1NGJA 4I6MB 3VPZA 3I33A 3GDQA 3RSEA 4CZMA 3O5BA 3EN9A 2P9SB 2DPNA 2FF3B 5JLFA 4RTFD 3W0LA 3ATVA 1MWKA 5AQKA 5AQFA 3F9MA 4H0XB 3A0IX 3HI0A 1NGIA 2WUSA 2P9SA 3GBTA 4JHDB 5B8HA 4NB4A 4H0OA 4JAXA 3FE1A 4CJ7A 5JMVA 4JNEA 4CZEA 3MN7A 4WQ4A 2FSNA 4BRPA 4H0YB 5ADXA 4JHDA 5LJVA 1T6DA 3FZLA 3TU5A 4CZHA 3A5NC 5KQDA 5AQLA 5AQXA 2VWBA 1C0FA 3H3NO 2E1YA 4WYBA 2V51B 2A40A 3VF2A 5LJWA 2VYPA 4WQ4C 2ZGYA 4BRLA 4A2AA 1NGAA 4A62A 4H03B 2PBDA 5FPEA 1EQYA 1XUPO 2HOEA 1HJOA 2Q0UA 4B1WB 4K43A 2E2QA 4BVPA 3QDKA 1GLFO 3AAQA 3BF1A 3H45C 3FR0A 4NO7A 2ZF5O 1C0GA 5AQYA 1IG8A 4CBXA 2IVOA 4CZGA 1SAZA 4AM7A 5BR9A 3QBWA 3DWLA 4K41A 4IWVA 4H5WA 3ZX2A 4BQLA 4DQ8A 4BRDA 5F1XA 4XH1A 3VEZA 2I7PA 1RFQA 3M3ZA 1DEJA 2CGKA 1YUWA 3P4IA 1DGKN 2EWSA 1Z05A 2QW9A 4WQ5A 4B1VA 2UYTA 2GUPA 4RWTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YNHA 1YJWN 4EZ9A 3SPYA 3G6EN 1VRTA 2IVPA 4A61A 3O1WA 4WQ5C 1T05A 3VTIA 4GW6A 4AHSA 5AFUA 2OCEA 1KXPA 3SAFA 3QERA 2D0AA 2F7TA 4QCLA 5CR4A 2O8EB 3Q7BA 3QESA 3M8QA 2P5OA 4RW6A 3L8BA 4YDUC 5BRDA 4PKIA 1ITGA 4BE7B 4CIGA 4CFCA 4CJRA 1CXQA 2E8AA 5HOOA 3K5MA 3SJHA 3DLHA 3CPWM 2OPPA 5KGXA 4B9VA 1NGHA 1HR0K 5C24A 3AVHA 4FZZA 4AF1A 3CETA 3K5NA 4PY5A 3MXJA 4DV0K 2HHSA 1C6VA 1N8RO 1G15A 3V1OA 1LV5A 4JKDA 3J7YP 4LF6K 1HYVA 2ZE2A 4BR2A 4BR0A 3G4SN 2IVNA 1JLBA 3AVNA 3NE6A 1C0MA 3IRXA 4MDAA 4GVMA 2ASPA 2E6LA 5LMUK 3A5LC 4BGAA 2O8DA 4DTOA 1S6PA 1L3UA 3ULEA 2E1ZA 1SKRA 2KLAA 4JI1K 3P39A 4MLHA 3DOLA 4J2DA 3HSTB 2B6AA 4CHPA 3WQTA 5FRNA 4FM1A 2LSNA 4PKGA 3E01A 1Z26A 3EE9A 2YHXA 1HNWK 1SKWA 5AQWA 4H4OA 3D6RA 4CGFA 4JYAK 4I2QA 2WOMA 3NFAA 5AQJA 3BZKA 1TK8A 2GX9A 4OX9K 4DF8A 5C10A 1YVNA 3KZBA 3PUFA 4MLEA 5KRSA 4J2EA 3QEXA 3TAMA 4BC2A 3SV4A 3MEEA 1KRPA 4OJRA 1QVFM 4BRGA 4Z94A 1W9HA 3L6QA 3BF3A 4RW4A 3R3LA 3DLGA 4B1ZA 4Z4FA 4YOYA 1QQCA 3PO4A 2HBJA 1NKCA 4KV8A 1KQSM 3I56N 4JKFA 3CMEN 2YHYA 2QWLA 1E4FT 5E26A 4WF9L 1N5YA 4F2SA 3O3HA 1RTHA 4TSXA 3MWTA 1ATNA 4BC5A 4ICLA 4BRCA 4IKFA 1L3TA 2AA4A 3CQXA 2W41A 1DTQA 2E4LA 2P9PB 3KWIA 3O6WA 3NGIA 1C1AA 1VQNN 3K5OA 3IMXA 4CK3A 3OYAA 4Z4IA 3EL2A 2KHOA 4DR5K 4B3OA 2P9KB 4DKWA 1RBVA 5KPZA 1U4BA 3MX2A 4F9OA 1HYZA 1CZAN 3TABA 4CJTA 4GV3A 4FWRA 2F8TA 1BOTO 3VGKA 2HSTA 1O13A 1WAJA 4YNQA 4JK9A 5HROA 2P51A 2YNIA 4B9NA 1BI4B 1U47A 2YJEA 3MXIA 4M3RA 1YJ9N 4M42A 3NBPA 3H46O 3CFRA 2ZM6K 1RBUA 1RT4A 4MFBA 2W6KA 3AGRA 1EP4A 1EXQA 3WQUA 3RMDA 4JKEA 3QB0A 3E1YA 2UUAK 1X1PA 4KB1A 1HQEA 4CJUA 1XHZA 1JL1A 4HUEA 5F2RA 4OGEA 3KIOA 2VG6A 4AM6A 2O8FB 1Y64A 3UKRA 3THXA 1S1VA 3KD1E 4CVNE 2HMIA 2ITGA 2OPRA 4HTLA 3HPOA 3KK1A 5EXWA 1UA1A 3A5MC 1WAFA 3VEOA 1JLFA 3CHWA 5HRRA 3AARA 1W7AA 3VQ7A 2CH5A 3AO3A 3H1VX 5EX5A 3O08A 2YKMA 3V9UA 3LP2A 3SZ2A 4BE2A 2WONA 1VQ5N 4BREA 3GG4A 3K0SA 2G8UA 5HLFA 3CCLN 4CIEA 1KAXA 5AQGA 4JI6K 2P9LB 3DLBA 4DSEA 1VSIA 5AQUA 2P9IB 4EHTA 1X3MA 4CESA 4JI7K 4OPJA 2ZJPL 4KHUA 4LFBK 1HKBA 3OYBA 3LPTA 1D9DA 4F2RA 5HRPA 2HHXA 2DTUA 3T1AA 1ZBFA 4C8MA 1DTTA 3C6TA 4QS8A 3D2FB 4B3SK 3LL3A 4JI4K 4F8RA 4O8UA 1YHQN 1QSLA 3IKMA 2GEMA 1KAYA 2I5JA 3THWB 3M8SA 3QMLA 1CLQA 5AR0A 3S3NA 4H5RA 5BPMA 1IG9A 2XY8A 3ID8A 3QFUA 4B1XB 2OYQA 2Q1NA 4M63C 2NRZA 2A6AA 3C7NB 3WXMB 1FKOA 1N34K 4PL7A 1C0TA 1U2VB 3ULDA 3SLCA 3DRSA 4BRIA 3OYGA 1A5WA 2VGNA 4DUYK 3LM9A 5CZ2A 3SAHA 1RT6A 2KZZA 2DFEA 1KVBA 4Q0BA 2X74A 1NMDA 3OYCA 1VSJA 2QWRA 4I9LA 3VEWA 3ZSYA 1BHLA 4FO0A 4K0KK 1WSEA 2QK9A 3K9JA 4BRMA 3L2QA 3CG7A 3LP1A 4QS9A 2OANA 3U6FA 1S9GA 2V7ZA 2V7YA 3QFPA 4FW2A 3CC7N 3EO3A 1JCFA 3QO9A 5HRSA 3QLHA 4FWOA 3M8RA 4CEQA 5BN8A 3QIPA 4RW9A 3TAPA 3O4NA 4L3QA 3P83D 3OYHA 1WSGA 4F3OA 4FM2A 4LH4A 3C6AA 4ELVA 1ATRA 4FJHA 1NOZA 3VPZA 3QINA 2XY6A 4DV4K 1BCOA 1LW0A 5GADP 1SL0A 1S1XA 3W0LA 4BE1A 1Q81O 3E9PA 2QKBA 1MWKA 4IDKA 1VSLA 4DR3K 4IEEA 3F9MA 3A0IX 1QHTA 1NGIA 4JK8A 4CE9A 4Z0UA 3ZSZA 4CJ7A 3VQ6A 4QOZB 3VA3A 2XHBA 4JNEA 5ADXA 4LF8K 4ILHA 3FZLA 3TU5A 4CCHA 4DG1A 3AO2A 1OH8A 4W5QA 3A5NC 4DTSA 3PIOL 1Y97A 1C0FA 3DRPA 3H3NO 4CGHA 1VAZA 2A40A 4JKHA 4NXNK 3CD6N 3VQ5A 3AA2A 1BIUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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