3VEOA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with carbamoyl phosphate
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
571
structure length
571
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTKDLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 198
structure length 571
sequence length 571
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3veoA03
3ULEA 3LM9A 4CBUA 3A5MC 5EXWA 2E2NA 2QWLA 1MWKA 2YCHA 2YJEA 2YJFA 3AY9A 4XH4A 1ATNA 1BDGA 3H3OB 2ZWHA 3VEWA 3O80A 4BC5A 1MDUB 4BG9A 4HTLA 4CD1A 1C0GA 1GLAG 4WYBA 3ZX0A 4BRAA 5AQKA 5AQMA 4FPBA 4XEIA 5JMVA 5E84A 2ITMA 3ATVA 4PL8A 1QZ5A 3SJHA 3FZKA 1YXQA 2IVOA 5BRFA 4RCHA 1LOTB 4B1ZA 3AAPA 5AQPA 3EKSA 4MLEA 1Q18A 1KAYA 4BRCA 5FPEA 4H0YB 1GLCG 1YAGA 2DPNA 1NWKA 5F1XA 1YVNA 3WEEA 5ELZA 1XC3A 3UE5A 3WEEB 4EIAA 3HTVA 1HPMA 3QFUA 2P9UA 3BP8A 4DQ8A 1JCEA 2P9UB 3TU5A 3D2FA 3FFKB 3QFPA 2E20A 1RFQA 3H45C 1D4XA 3F9MA 3IUCA 4YDUA 2ASPA 4JN4A 5AZJA 3LDPA 5EY4A 2Q0UA 1CZAN 3QBXA 4BRFA 5AZJB 4F9OA 3DXKB 3VERA 3BF1A 3QBWA 3LDQA 2P9SA 2GEMA 1X3NA 2HF4A 2Q2RA 2PAVA 3C7NB 3DAWA 3JXUA 3MCPA 1TUUA 5AQOA 2QXLA 3FZLA 5AQVA 1G99A 1U2VB 2ASOA 5AQQA 1NGAA 1T44A 3D2EA 4B9QA 1NGIA 2FSNA 5BN8A 2VWBA 3A8YA 5AQYA 4BVPA 1NGJA 4A61A 4B1WB 2F9WA 4MO4A 4AM6A 4BRLA 1HJOA 3H6EA 3ZEUB 4O5FA 1TUYA 2Q31A 3HSCA 3VGKA 4BR5A 3VEYA 3VF4A 2QM1A 4BR9A 4BRNA 4DB3A 5AQLA 1KAXA 3LDOA 3U8XA 3I8BA 1XUPO 2KHOA 3S41A 2GWJA 1NGBA 3VGMA 5KPTA 4YDUC 4HWIA 5E26A 4E1JA 5FPDA 4BRPA 3LM2A 2HOEA 5AQZA 3VETA 3J8AA 1BUPA 2HF3A 3CJAA 4H0VB 2IVPA 3CJ7A 4M7XA 3IFRA 1HKGA 5AQWA 1SQKA 4K41A 5F0XA 4FPAA 5AQGA 2P9KB 2P9IA 4B1XB 1S3XA 3FR0A 2P9IB 1TYQA 2GTDA 5BR9A 2V51B 3WXJA 4CD3A 2E88A 3DXMB 3VEOA 4CZIA 5KPZA 3ZETA 3FLCO 3UKRA 1NBWA 3UKRB 2OANA 2VYPA 3MMVA 4IJNA 1MA9B 1JCGA 1NGFA 2QWQA 4NO7A 3WUHA 3KVGA 3WQUA 4FL9A 3HBTA 3VTHA 1QZ6A 1DEJA 1DGKN 3GOIA 3HI0A 1BO5O 2FF6A 3MDQA 5EOYA 5FPMA 4DCHA 2I7NA 1BU6O 1NMDA 5BREA 5LJVA 1RGIA 1C0FA 1BOTO 2A5XA 3FZFA 3VEZA 4Z94A 3W0LA 1BWFO 3WT0A 4BRIA 3MN5A 3O5BA 1RDWX 5LY3A 4BC2A 1K8KB 3WQTA 4IJAA 5BRHA 3L0QA 5AQNA 4GY2B 3FZMA 1EQYA 3KHYA 3GG4A 4WQ5C 4CBWA 3G25A 5AQTA 1T6CA 3A0IX 1KXPA 3EN9A 2J4RA 3IDHA 2W40A 3MK6A 2V52B 3TSPA 3U9DA 4BC3A 2AA4A 5AQXA 4BVOA 4PKGA 2CH6A 4BR7A 3H1VX 3VF6A 3EZWA 5KQDA 3ENHA 5AQSA 2UYTA 4JD2B 3BUZB 4A62A 2QWMA 3DXKA 3BF3A 3O6WA 1H1VA 4FSVA 3O4WA 3A5LC 2QWNA 3HM8A 4ISEA 3C7NA 4A2BA 2QWRA 5BRDA 3ATUA 2FSKA 3D7EO 3CETA 1ZC6A 1QHAA 1U2VA 2ZF5O 3WXIA 1JCFA 2HMPA 4FWPA 4H0TB 2GUPA 4CZEA 2D0PA 2A3ZA 4BRHA 2QW9A 4LC9B 4B1VA 4BC4A 3QMLA 3UB5A 2ASMA 3TTCA 3ZEUA 2CGLA 4BG8A 5CE3A 3CJCA 1E4FT 2E1ZA 4PKHA 5ADXH 2P9PA 2YI1A 1X3MA 2P9PB 1V4SA 3GL1A 4H0XB 3SLCA 4H0OA 1SAZA 1GLJO 5AQJA 3SMSA 4I6MA 4I6MB 5BN9A 4K42A 2BUPA 2CGJA 4K25A 1NGCA 1QQOA 4H5TA 3VEVA 4CI6A 4FOIA 2ZGZA 4FO0A 4FWSA 3I33A 4CZHA 3JS6A 5BPLA 4FWRA 4AM7A 3OHRA 1HLUA 2YHYA 4FWNA 4FWLA 2GELA 1E4GT 2P9KA 5AZIA 1GLFO 1Z05A 4Y0WA 3AAQA 5AZIB 4RWTA 1T6DA 2A40A 3ENOA 3DXMA 3W3DA 5KQ8A 1S22A 3L4IA 3VENA 2IVNA 4WQ5A 3DWLA 4FWQA 1XQSC 2D0OA 4IZ9A 3VOVA 3CJBA 3QDKA 5AQIA 3QB0A 1OKJA 1QQMA 4BR2A 5I9EB 2A6AA 3GBTA 4EFHA 3DJCA 4FWMA 3H46O 4KBOA 4CZFA 1J6ZA 2FXUA 3LDLA 4ISGA 4MLHA 3ZX2A 1QQNA 1HKCA 3C0BA 3TSUA 3QICA 2E2QA 2I7PA 1BA0A 1GLLO 3O1BA 4BRDA 4BR4A 2V7ZA 2Q1NA 3HZ6A 4O8KA 4QS8A 4M63C 4K43A 4M7YA 2W41A 3EO3A 4CZJA 4DHYA 2VCPA 2A41A 3TPQA 1ZBSA 1ESVA 1YUWA 5AFUA 1K8KA 3H3NO 3MN7A 3ULEB 2Q0RA 3R9PA 3FGUA 4H5NA 4FWOA 4QS9A 2E1YA 1ATRA 3TTDA 1Y64A 5ADXA 1NLVA 2YHWA 4IWVA 4JNEA 4WQ4A 4A2AA 4CZLA 1V4TA 4JHDA 1GLDG 3L6QA 3MN9A 3P4IA 4ISFA 4JHDB 4JAXA 3LDNA 1SZ2A 3O8MA 2FLOA 4JD2A 4CZMA 3CERA 1GLBG 1NGHA 4BGBA 2D4WA 3GE1A 3B8AX 3O08A 1R59O 2NZTA 3A5OC 2EWSA 3RSEA 2GWKA 4IXCA 3RSEB 2QWOA 5LJWA 4L3QA 4GNIA 2F9TA 4BROA 5BPMA 4CJ7A 3A5NC 1X9JA 1HKBA 5AFUH 3D2FB 4C23A 3M3ZA 3UKUA 5JLFA 3UKUB 1NM1A 2YHXA 3CJ1A 2CGKA 4H5VA 2QWPA 2IIRA 2P9NA 3VPZA 2Q97A 2P9NB 3CQYA 4FWKA 2P9SB 1IJJA 5AQHA 3R8EA 3U9ZA 3WXKA 1ATSA 4WQ4C 2V7YA 1KAZA 1NGGA 2H3GX 4FOEA 3ZX3A 4PKIA 3FE1A 1GLEG 4QS7A 4BRQA 4BREA 3M1FA 4BGAA 3D2EB 4J8FA 1ZXOA 1WUAA 2P9LA 1BA1A 2P9LB 4H5WA 5TKYA 3EKUA 2E8AA 5EVZA 1WOQA 2CH5A 2WUSA 3CQXA 4BR0A 4BQZA 5AQRA 3EL2A 1NGEA 4BRMA 4EHTA 1HUXA 5BPNA 3WXLA 1Z6RA 3H1QA 4BRKA 5AQFA 3O1WA 3VGLA 2NRHA 4EHUA 5EX5A 4CZKA 4B1UB 3CI5A 3FZHA 3VESA 2D1KA 3KZBA 4BRGA 5FPNA 2E2PA 4B1YB 3R6MA 4NB4A 4XH5A 2E2OA 5AQUA 3TTFA 1MWMA 4RTFD 3U4LA 5JICA 4BQLA 3GDQA 4CBXA 5B8HA 1U6ZA 3TSQA 1P8ZA 2A42A 2NLXA 3LL3A 3SK3A 1IG8A 1DKGD 3SMPA 1LCUA 3M6GA 3CJ9A 5AR0A 5KPRA 2Q36A 1TYQB 1NGDA 4EAHD 1HX1A 2FSJA 4IO8A 3CHWA 4PL7A 3ZETB 3CIPA 4H0PA 5JLHA 4XH1A 4H5RA 4CZGA 4H03B 3BEXA 3AARA 1BG3A 2BTFA 5F2RA 2AP1A 3ID8A 3MN6A 3IMXA 4MO5A 3VF2A 3VEXA 2PBDA 2FF3B 2ZGYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NAEA 4FK2A 1WSIA 4DF8A 1VSHA 3ZSOA 1MWKA 3E66A 3OYCA 3H3OB 3O3HA 1O13A 3O80A 4E1NA 3NH2A 3AO5A 2O8DB 1C0GA 4IEEA 4FPBA 4LH5A 3SBGA 3LZIA 4LF8K 1U04A 3A2FA 1W2BM 1GOAA 3OS0A 4H4OA 4DV7K 2I5JA 4FLWA 1BQNA 4FJ9A 4DS5A 4QOZB 1LOTB 1S6PA 1RDAA 1A5WA 4MLEA 3NH0A 4N76A 5C12A 3LWLA 3IAYA 1RBSA 3HSTB 2HHXA 5J2PA 5HROA 3WEEB 3QFUA 2O8BB 3I56N 4F8RA 2HNZA 3D2FA 4Z4HA 1ASUA 1RFQA 1RTIA 3H45C 4KREA 1HYSA 3CFOA 3F9MA 3IUCA 5I3UA 4JN4A 4DTOA 4H8KA 5AZJA 3CM5A 3CG7A 5LL6Z 4OPJA 2GEMA 4CGIA 2Q2RA 1YVUA 4W5OA 4N5SA 1IO2A 1TUUA 3FZLA 1YITN 1I39A 1U2VB 5KGWA 5AQQA 5HRNA 3TAMA 1NGAA 3D2EA 4DV0K 2FSNA 4C1NI 3OA9A 4BVPA 4CGJA 4I7FA 4MO4A 2F8SA 4BRLA 4FZXC 1IKXA 1ZBLA 1QSSA 4O5FA 4YY3K 3HSCA 4BR5A 3VEYA 4EP4A 4FM2A 4FJMA 4CJLA 4DB3A 1SS6A 4CJPA 4LF7K 3DLLL 4M3UA 3CF5L 1XUPO 3S41A 2HBJA 2YHAA 1M90O 5E26A 2BH1A 2EX3A 4CJFA 4M3YA 5J2QA 5AQZA 3VETA 1NKCA 1PVYA 3KLGA 4O44A 4DFJA 1NK7A 5CHIA 3NH1A 3IFRA 1IKWA 1VAZA 2KW4A 5JS2A 1HYVA 5AQGA 3MCAB 4KKOA 1TYQA 5BR9A 2V51B 4CD3A 3V1OA 4CHPA 3AV9A 5C10A 4FFJA 3SAGA 4AHRA 4DTUA 4J2BA 1WBBA 3VQCA 4IJNA 1KC8O 4H4MA 1SL2A 4CERA 3OY9A 4YOTA 4B8AB 2ETJA 3RR8A 1NK0A 1OH8A 3VTHA 3KWGA 3QNOA 3J7YP 2FF6A 1KK9A 2I7NA 1EXQA 5M1KA 1ZBIA 1C0FA 3FZFA 1NJYA 5E41A 3O5BA 4DU3A 4E7LA 2VGNA 3L0QA 2JWLA 4KHUA 1BCOA 3P38A 3FZMA 3MAQA 5GAEP 2B5JA 3G71N 1LAVA 1T6CA 4IFVA 2IGIA 1KTQA 4DQIA 3A0IX 1GOBA 2J4RA 2YNFA 4B3TK 3MK6A 1NKEA 2V52B 3TSPA 1RT4A 4DWIA 1S1XA 1RBRA 1K7JA 3CC2N 2AA4A 3RR7A 3AA4A 3MXJA 3H1VX 3VQ5A 3VF6A 2VQEK 3EZWA 2EQAA 4JI7K 1LW0A 4F4KA 3D6RA 3IKMA 1JKHA 3P5JA 3BUZB 1HNZK 3BF3A 1JLCA 1KD1O 2HVIA 4RW6A 4DTMA 3O4WA 3A5LC 1E3MA 3LRJA 4GMJB 3CCRN 1CXQA 1VQMN 1YJWN 1IBMK 4O0JA 1RTJA 3CETA 1QHAA 5HRRA 4KH4A 4CE9A 4CGHA 2E6LA 4HUFA 1NOYA 2OTLN 2GBZA 2QW9A 4LC9B 1NJWA 4B1VA 3T19A 4I2QA 3UB5A 2ASMA 2UXCK 4CGDA 5J2MA 1EETA 3CJCA 3SYZA 4WCEL 4PKHA 2YI1A 3TAGA 3MXMA 4E7KA 4FJKA 4YFUA 5BN9A 3RMAA 4K42A 4B3OA 1QQOA 4H5TA 2YNGA 3VEVA 1NJZA 3L8BA 1T8EA 3K57A 4FO0A 4FWSA 1IBKK 3SUNA 3F9KA 4CZHA 4P6PA 2Z1HA 2NRWA 5BPLA 3MK5A 4FWLA 1HJRA 3BZCA 2HVHA 1RDDA 1GLFO 4Y0WA 3AAQA 5AZIB 4RWTA 2A40A 5CYQA 4DMNA 4CJKA 3DXMA 3HK2A 1RDUA 1XQSC 3OYAA 1QQCA 2VGMA 5AQIA 3QB0A 1SKRA 2G8KA 3PX4A 4ELVA 3I55N 4ELTA 3LPUA 1PVWA 3T1AA 3DJCA 1N36K 4K8XA 4KBOA 3KJVA 1J6ZA 1HRHA 3OJSA 3L7VA 3ZSXA 1VSKA 5A2QO 4W5QA 3I0RA 4XIUA 4MLHA 1SV5A 1JLBA 5GAGP 4JS4A 2UUAK 4B9MA 3HJFA 3H07A 3C0BA 3TSUA 4LF6K 3ENBA 3QICA 1VHXA 2I7PA 4DTSA 1WLJA 2RIUA 4QS8A 4M63C 4M7YA 3EO3A 4EZ9A 3DLEA 4X62K 2A41A 4A57A 1U47A 4DF4A 1C0TA 1WAJA 4FLUA 2VG7A 4B9TA 3PLAA 4X66K 4DTJA 4B3MK 2NRXA 1NLVA 2YHWA 4KPYA 3KIOA 1RDCA 1GLDG 1XWLA 4JHDB 1HQUA 1J53A 1NKBA 3LDNA 2FBXA 4DS4A 4CZMA 1N6QA 5FRMA 1NGHA 3HYFA 4BGBA 2D4WA 3B8AX 3O08A 1XHZA 2FC0A 4CJRA 1EWRA 2GWKA 3RSEA 2QWOA 4KAZA 4RW9A 5BPMA 3HPOA 3A5NC 1HKBA 3D2FB 4OLAA 1DT9A 2VWKA 3THWA 4DUYK 3UKUA 4F3OA 3HL8A 5JLFA 4KV8A 3CJ1A 2CGKA 3THXB 2IIRA 3CQYA 4P77A 4FWKA 1S1TA 1L3VA 2V7YA 1KAZA 1NGGA 3QNNA 3ZX3A 4PKIA 3FE1A 3AVIA 4QS7A 4BRQA 1K4PA 3AA5X 1I94K 3B6PA 3M1FA 1J5OA 4BWMA 3D2EB 4CCHA 4Y1CA 3TAEA 3MEEA 4MQ3A 3EY1A 5J1EA 4DFMA 3NFAA 1UA0A 5DM7L 1NK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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