3VEOA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with carbamoyl phosphate
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
571
structure length
571
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTKDLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
total genus 198
structure length 571
sequence length 571
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3veoA03
2NLXA 3H6EA 5AZJA 4CZGA 2ZGYA 4AM7A 3M6GA 3RSEB 3KHYA 3MDQA 4CBXA 3SLCA 3UKUA 3LM2A 2A5XA 1BUPA 4JHDB 2GUPA 2YJFA 4H5VA 1HKGA 1QHAA 4BRAA 2E2QA 3GE1A 2CH5A 5FPDA 3D2FA 4BC3A 3WEEB 4BRLA 3U9DA 3WXJA 2CGKA 3FGUA 4JD2A 2YHYA 3VETA 5CE3A 3JXUA 5F1XA 5JICA 5FPEA 5AQVA 1XQSC 2IVNA 4BR2A 4BQZA 2E1YA 3KZBA 4K43A 5KPTA 2A41A 4CZFA 3HI0A 3TSPA 2P9NB 2GWJA 1GLBG 1SAZA 1NMDA 5FPNA 3UKRA 4JAXA 3VF4A 4FPAA 3VEXA 4CD1A 3DXKA 2KHOA 4CD3A 4DCHA 4E1JA 3DXMB 1T6DA 4O8KA 2P9KB 5AQLA 1ZXOA 3GBTA 1BOTO 1R59O 3D7EO 3QFPA 3H1QA 2FLOA 2QWPA 5AFUH 5AQSA 5ADXA 5BRFA 1NGFA 2P9SB 3CJCA 5AQQA 2ASPA 1GLLO 4EIAA 3BP8A 4IXCA 2P9PA 4BVOA 2E1ZA 3EKSA 3FR0A 3LDOA 3M1FA 2AP1A 1V4TA 3CHWA 1ATSA 1KXPA 3VEVA 1RGIA 1MWKA 1NGAA 1XC3A 2FSJA 3IFRA 4YDUC 4M7YA 1LCUA 4BRCA 4JNEA 2FXUA 3L0QA 5AQNA 3TSUA 3QB0A 1X3NA 1ESVA 2IVOA 3CERA 3C0BA 3HSCA 4FPBA 3CJBA 3QBWA 3MCPA 5FPMA 1NGBA 2E2PA 3D2FB 1X3MA 4BR7A 2E20A 3IDHA 2E8AA 4CZJA 3VEWA 4YDUA 4FWRA 2YHWA 3U9ZA 1P8ZA 2FF6A 3IMXA 2A42A 1Z6RA 4MO4A 1TUYA 3O6WA 3FFKB 2QWRA 3DAWA 3WQTA 4BRGA 3SMSA 3LDQA 5JLHA 3FZKA 3SK3A 4H0TB 4L3QA 3FZFA 5BN9A 3EN9A 2V51B 4BG8A 4NO7A 3ID8A 3AAPA 3VOVA 5KPZA 4I6MB 5AQFA 1BO5O 4BRFA 3TTCA 3QMLA 1QZ5A 5ADXH 4QS7A 1NGDA 4BRDA 1NLVA 4FWMA 1Z05A 2GWKA 3AARA 1JCFA 4BRHA 3KVGA 3O4WA 3ENHA 4BGAA 4IO8A 5AQHA 3QICA 1E4FT 1NGCA 3DWLA 4XH1A 3WXIA 3MN5A 1GLEG 2GEMA 3CQXA 3AY9A 3EO3A 5BN8A 5KPRA 2J4RA 1Y64A 3A5MC 2V7YA 4H03B 4EFHA 4DHYA 3O80A 4NB4A 3FZMA 4FOIA 5AQKA 4BC4A 3CJ9A 1TUUA 3CJ7A 3EKUA 3QBXA 4BG9A 4H0YB 4XH4A 4O5FA 2V52B 4FWPA 3A8YA 4FL9A 1G99A 3CI5A 2P9LB 2HOEA 5AQXA 4DQ8A 3ZEUA 5LY3A 4CZMA 2YCHA 1QQMA 3ZETB 1HLUA 2DPNA 1ZC6A 3GG4A 1HKBA 1NGHA 1DKGD 4B1YB 4BROA 4PL8A 3I8BA 3VEYA 3A5LC 1TYQA 1NGJA 4K25A 2D1KA 4M63C 5F0XA 2D0PA 1T6CA 3O1WA 4IZ9A 3D2EB 2BTFA 5AQPA 4FWOA 4RWTA 4PKGA 3GL1A 3QDKA 2Q97A 5BPLA 4WQ5A 5AQWA 2ASOA 2Q31A 3C7NB 3FZHA 4A61A 2VWBA 3MN6A 2PBDA 3GOIA 1YUWA 2QWMA 3VGLA 4HWIA 5E26A 3ULEA 3SMPA 4BRIA 1LOTB 4ISEA 4IWVA 4FWLA 3B8AX 1S3XA 4B1UB 5AZJB 2V7ZA 2YJEA 3CJ1A 1NBWA 4XEIA 3VGKA 4CJ7A 3TU5A 3UKUB 1JCGA 2ASMA 2Q0UA 4EAHD 4BRKA 4F9OA 1KAXA 3R9PA 3U4LA 3L4IA 3A0IX 2E2NA 3RSEA 4QS8A 3FE1A 4A62A 5AZIA 1EQYA 2FSNA 1MWMA 5KQ8A 4JD2B 1BWFO 1GLAG 4RCHA 2GTDA 3U8XA 3VESA 3WXLA 5AQRA 5BR9A 4CZLA 4CZKA 5JLFA 1YAGA 1BA0A 1T44A 2WUSA 3G25A 3HBTA 4BR4A 4GY2B 3WEEA 4WYBA 2QXLA 3CIPA 2HMPA 3I33A 5LJWA 2IIRA 4FSVA 2D4WA 4BVPA 4PKIA 3L6QA 3UKRB 1HUXA 4IJAA 2Q1NA 3ZX3A 2F9TA 2VCPA 2F9WA 3HTVA 5EVZA 3DXKB 4K41A 3H3OB 2ITMA 4CZHA 3AAQA 2E2OA 5AR0A 2A3ZA 2P9NA 4J8FA 4MLEA 4A2AA 3BF1A 3VTHA 4BC5A 3SJHA 2QW9A 4H0OA 1DGKN 3VGMA 5BPMA 2I7NA 1H1VA 1V4SA 1C0FA 3ZX2A 3DXMA 2NRHA 4B9QA 2E88A 1MA9B 5F2RA 3MMVA 4QS9A 1ATRA 1BDGA 2P9PB 1J6ZA 3JS6A 4BGBA 2HF3A 1GLCG 1ATNA 3UB5A 2GELA 2QWQA 4H5WA 2P9SA 2AA4A 1GLJO 4PL7A 2EWSA 3A5OC 4WQ4A 2P9UA 4A2BA 3MN9A 3W3DA 4PKHA 1SZ2A 4BREA 3WT0A 2OANA 2Q2RA 4FWQA 3LDPA 3VPZA 3J8AA 5EXWA 3WXKA 4FOEA 3LL3A 1DEJA 4ISFA 5B8HA 4B1VA 3BF3A 4H0VB 3H45C 4WQ5C 2QWLA 4GNIA 1NGIA 3TPQA 1HJOA 5AZIB 4BRQA 3R8EA 5AQJA 5EY4A 3ATVA 3CQYA 3UE5A 4H0PA 1QQOA 4H5NA 2P9IA 2H3GX 2QWOA 3BUZB 1NGEA 3OHRA 3O5BA 1XUPO 1IJJA 1NM1A 2NZTA 4ISGA 4IJNA 2VYPA 3VF2A 2HF4A 4BQLA 3HZ6A 1D4XA 2Q0RA 5AQTA 2D0OA 4AM6A 2A6AA 1U2VA 4FWNA 1BA1A 3QFUA 4B1XB 4LC9B 4Y0WA 3MK6A 1QZ6A 5AQIA 2CGJA 1BG3A 4CZEA 4RTFD 2IVPA 4I6MA 5TKYA 2BUPA 4JN4A 1KAZA 3O8MA 3LM9A 1X9JA 3EL2A 1IG8A 3MN7A 4MO5A 4KBOA 3LDLA 3VEZA 1RFQA 1K8KA 1SQKA 4BR0A 4BC2A 2I7PA 2QWNA 5BRHA 4B1ZA 1YVNA 2P9UB 3ENOA 1YXQA 4C23A 5AQYA 2FF3B 3EZWA 1BU6O 3A5NC 3P4IA 1KAYA 1NWKA 3H3NO 4JHDA 2A40A 1CZAN 4XH5A 1WOQA 3O08A 1QQNA 5E84A 2PAVA 1HPMA 5AQOA 1U6ZA 3ZEUB 2UYTA 3ATUA 4CBUA 5AQGA 5AQMA 3TSQA 1OKJA 2ZGZA 4BR5A 4HTLA 3DJCA 4EHTA 5BRDA 3TTFA 2CGLA 3VENA 4MLHA 2P9LA 5KQDA 3FLCO 2ZF5O 2P9IB 1C0GA 4EHUA 2ZWHA 2QM1A 4H0XB 3CETA 4H5RA 3ZETA 4Z94A 5I9EB 3R6MA 5AQUA 4WQ4C 3VEOA 1WUAA 5BREA 1TYQB 4DB3A 4B1WB 3M3ZA 1NGGA 5LJVA 2Q36A 4K42A 1RDWX 3FZLA 3S41A 1GLDG 3H46O 5EOYA 4CZIA 2P9KA 4BRPA 2W40A 3WUHA 2W41A 1U2VB 2FSKA 3W0LA 3D2EA 3VF6A 2YHXA 4CBWA 3ULEB 5AFUA 1HKCA 2CH6A 5AQZA 1JCEA 1MDUB 4FWSA 2YI1A 4CI6A 5BPNA 3VERA 1HX1A 3H1VX 3C7NA 1Q18A 3LDNA 4BR9A 3HM8A 1S22A 3ZX0A 3IUCA 3BEXA 3GDQA 4FO0A 4FWKA 4BRNA 1ZBSA 5EX5A 4BRMA 1GLFO 1K8KB 3CJAA 1E4GT 3TTDA 3O1BA 5ELZA 4H5TA 5JMVA 3WQUA 3F9MA 4M7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZGA 2ZGYA 1HPZA 4A5BA 3CFPA 3KHYA 4EZ6A 3AVHA 3UKUA 3SNNA 1IBMK 4YHHK 4YOVA 4O5BA 4BRAA 4W5RA 3LPTA 1JXEA 1RT4A 2E2QA 4WFAL 3GE1A 4JK9A 1U49A 2CH5A 2GV9A 5FPDA 1QSYA 2G8KA 3VQ6A 3WXJA 3SBGA 4JD2A 2YHYA 3VETA 4YOYA 5CE3A 5JICA 1HNVA 4CJFA 3I0SA 5AQVA 4DTPA 1VQON 1XQSC 2P51A 4LH5A 3CCRN 1TL3A 5CHIA 3K5MA 3V9WA 5KPTA 3J7YP 3TSPA 2E5LK 2GWJA 1NMDA 4BDZA 3VF4A 1YI2N 3ZSOA 3SCXA 3DXKA 1S1UA 1YIJN 3DLRA 4HUEA 4O8KA 4JKAA 5AQLA 1TKZA 1R0AA 1WSIA 3H1QA 1J54A 5ADXA 5BRFA 3AO3A 1YTUA 2ASPA 1L3VA 1RDUA 1A5VA 4EIAA 4BWJA 4BVOA 3T3FA 4CGHA 1K4LA 3M1FA 4KHPK 2AP1A 2ZE2A 3G10A 1BQMA 1NGAA 2FSJA 5K14A 3RVCA 1LCUA 1T3VA 1UOCA 4CHOA 2FXUA 5HRNA 2OPSA 3SBTA 4CEZA 2IVOA 3ZSRA 3HO1A 4FPBA 4I2QA 3K5LA 3HM9A 1NGBA 3MXMA 3D2FB 4ID1A 3NH0A 4DF8A 3MAQA 4P77A 2LSNA 5C2DA 4CZJA 1EETA 3VEWA 2HBKA 3AVMA 1P8ZA 3IMXA 1Z6RA 3U3YA 1TUYA 3FFKB 1ASVA 5J2NA 1VK0A 3LDQA 1ILYA 1Q9YA 3V9ZA 4H4OA 4JI5K 3ID8A 3VOVA 3SJJA 4DQRA 4FCYA 5AQFA 4BRFA 3KK2A 3CCUN 4J2DA 4OPKA 1QZ5A 3CCJN 1VQPN 5HLFA 4FJ9A 4YOTA 4FWMA 3AARA 1JCFA 4C8OA 4CJQA 2X6SA 3V4IA 3K9JA 1KLNA 5AQHA 4DF4A 3QICA 1E4FT 1NGCA 1VSLA 1RTJA 2W6KA 4KB0A 3H07A 4P8EA 3EO3A 3ZT0A 2V7YA 2X6NA 4H03B 4NB4A 4GV9A 4DLEA 4O4GA 4CEFA 4BG9A 4F2RA 4H0YB 4XH4A 4DTXA 1HR0K 2V52B 4FXDA 1RBRA 4FWPA 4CK3A 5EU7A 1DT9A 2WC9A 2RIUA 5AQXA 3HOTA 4DWIA 3OS2A 4J2EA 1KTQA 1ASUA 2B5JA 3T7ZA 3E9OA 3ZETB 4DQQA 1HLUA 4E7LA 1C0TA 1J5OA 1ITGA 1NJZA 2VWJA 1HKBA 3THWB 4DS4A 5HRSA 2F96A 4YORA 4DQSA 4P8JA 3D2EB 3OYKA 2BTFA 4FWOA 2B6AA 5AQWA 2ASOA 3C7NB 4A61A 4A57A 4I9QA 5J2MA 4JKGA 3C6UA 2QWMA 3GOIA 3SMPA 4BRIA 5E41A 3AJEA 4ISEA 4DFJA 4CEDA 1EXQA 3ZSWA 4CJSA 4B1UB 2IDOA 5JVGL 3EY1A 4XEIA 3UKUB 2HNZA 5LMUK 3MX5A 4AQYK 4Z4HA 4BRKA 1KAXA 3R9PA 3U4LA 3A0IX 4QS8A 3LP0A 1BQNA 4JD2B 3U8XA 1WAJA 5BR9A 3KLHA 1NK5A 5JLFA 1JCUA 1YVUA 1BA0A 4E1MA 3G25A 4GY2B 3WEEA 4WYBA 4FSVA 2QK9A 1WBDA 2IS3A 1LAVA 4PKIA 4BVPA 4CEAA 3E1YA 3QEXA 2F9WA 5CR4A 3OYGA 3DXKB 4FJNA 3CD6N 3AAQA 1W0HA 4JKFA 1DLOA 4J8FA 3VTHA 4DSEA 1HQUA 1S6QA 2QW9A 3VQ4A 5D3GA 4CJ3A 5CZ1A 4MDBA 2I7NA 1V4SA 4B9NA 1VQ8N 3DXMA 2NRHA 2NRVA 4B9QA 2E88A 1X9WA 3DLHA 4KTZA 4DR5K 4E7HA 1GLCG 4IEIA 4CGFA 4EP4A 4KB1A 1VSIA 3BZCA 3OYJA 1BL3A 4Y1CA 5FLXO 3EEQA 3A5OC 4A2BA 3VQ7A 1RILA 4NXMK 1YITN 3MIOA 4BREA 4KHNA 4DKWA 3CC2N 4P6DA 3THXB 5EXWA 4FOEA 3LL3A 4FJKA 2YNFA 3H45C 4CCHA 1RBTA 1HJOA 4CJPA 1S1TA 2FBTA 4BACA 3P83D 5AQJA 1I3AA 3S3NA 4M42A 2QA4N 1D5AA 5HRPA 3PLAA 4DQIA 4DV2K 2H3GX 2QWOA 3CMAN 4JI6K 4DU1A 4DTNA 2XHBA 4WFBL 1TVRA 3VQEA 4PQUA 1KRPA 3Q7CA 1VRTA 3HZ6A 1D4XA 2NRZA 3KD1E 2A6AA 3M8RA 4FWNA 4B9LA 4Y0WA 1QZ6A 1NU0A 4CVNE 4RTFD 4I6MA 5TKYA 4JN4A 4CGDA 3ASMA 1RT6A 2E6MA 2HBMA 4CJ4A 4M3TA 4V19S 2HB5A 3ZSXA 3VA3A 4DR6K 5I42A 3R1XA 4BR0A 4BC2A 1HYSA 4RW4A 3SQ2A 4E0DA 3NVMA 3TAFA 1U48A 3SQ0A 2YV0X 1BU6O 4FW1A 2XY7A 1XMQK 3L2VA 4XH5A 3A2FA 1VSDA 1WOQA 4HUFA 3V9SA 4HUGA 2PAVA 3MX2A 4DV4K 4E89A 1OKJA 4RW8A 4BR5A 1T7PA 3NGYA 4OKKA 3QESA 3QEPA 2OPQA 3TAPA 2HHVA 5MLCQ 3C6AA 2ZF5O 3VQBA 2P9IB 4ICLA 2QM1A 4H5RA 5AQUA 3V1RA 3LZIA 3HJFA 3Q7BA 4DB3A 3M3ZA 3AVLA 4JKBA 3I8DA 3KK1A 2HBJA 3PIPL 4B3OA 4RG8A 2X78A 2XY5A 2W40A 2W41A 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 2O4G A;  3L2U A;  3DLE A;  5T7B A;  3MMV A;  4QS9 A;  1ATR A;  3QIN A;  1J6Z A;  3JS6 A;  2HF3 A;  1ATN A;  3RRG A;  2QWQ A;  4H5W A;  3C6H A;  3OYD A;  3ZT1 A;  1DTT A;  1BI4 B;  1S9G A;  4FLX A;  5CZ2 A;  4DTJ A;  4WQ4 A;  3CF5 L;  3PY8 A;  1ZYQ A;  4IG0 A;  3KLG A;  5M1O A;  4NXN K;  4QCL A;  2Q2R A;  2X74 A;  2I5J A;  4O44 A;  4ISF A;  5B8H A;  3JYT A;  1RDC A;  4H0V B;  5M1Q A;  4WQ5 C;  2QWL A;  1UAX A;  4J2B A;  1NGI A;  3TPQ A;  1NJI O;  1ZBH A;  2NUB A;  5LMN K;  4C8L A;  1FKO A;  3R8E A;  4BRQ A;  1RT1 A;  5EY4 A;  1G58 A;  4BE2 A;  1RT3 A;  1QQO A;  3OYE A;  4H5N A;  3KKS A;  4DR1 K;  4BWM A;  3BUZ B;  1NGE A;  1TKD A;  3LQU A;  1VQN N;  3NH2 A;  3CYM A;  3THY B;  4LF4 K;  1IJJ A;  1KLM A;  1TK5 A;  3AVC A;  5HL7 L;  4ISG A;  2WFB A;  2VYP A;  4IJN A;  1ZBI A;  5J1E A;  1PVW A;  2HF4 A;  2OA8 A;  4B9S A;  1VQM N;  3OYH A;  1U2V A;  1XNR K;  1BA1 A;  4CJV A;  2G8W A;  3D45 A;  1JLF A;  5HRR A;  3MK6 A;  1SKW A;  2IVP A;  3KK3 A;  2ZJR L;  1VHX A;  3LM9 A;  4EP5 A;  4M3W A;  3S3M A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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