2GWJA

Spvb adp-ribosylated actin: hexagonal crystal form
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
total genus 127
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwjA04
4BGBA 5AFUH 1GLDG 4Y0WA 3ZX2A 4CZJA 1S22A 2W40A 5AQMA 2KHOA 5EXWA 3CJBA 4RWTA 3M6GA 4FPAA 1U2VB 4A61A 2Q0UA 3JS6A 3TU5A 4WYBA 3D2FB 3HSCA 2VYPA 1NM1A 4E1JA 3LDPA 4XH4A 5BPLA 4FPBA 3CJCA 3BEXA 3MN6A 3ENHA 3CQYA 5AQYA 5AR0A 2W41A 3G25A 2GTDA 2A42A 4BRQA 4BRPA 4IJNA 3WXLA 1TUUA 3ZETB 4QS8A 3QMLA 5AQZA 2V51B 3WXIA 4I6MB 2CGLA 3R8EA 5AZJA 1RFQA 3MMVA 3VEOA 4IJAA 2IIRA 3J8AA 1GLJO 4CBWA 4BR5A 4M7YA 4JD2A 2P9KB 3L0QA 2YJEA 3SMPA 4DHYA 1JCGA 3EN9A 4JHDA 3SK3A 4BRNA 2QWNA 1DGKN 3VERA 3U9ZA 4FWRA 5F1XA 4BRAA 2P9UA 1V4SA 3U8XA 2Q31A 2HF3A 1HLUA 3O5BA 2IVNA 3ATVA 4PL8A 3KHYA 3O1BA 3R9PA 1ZC6A 1NGAA 1NGFA 2QM1A 4H0OA 2ITMA 1RDWX 1X3NA 2HOEA 4BR4A 3WEEA 2H3GX 3I33A 3UE5A 3DXMB 3UKUB 4CBXA 3VESA 5LJVA 4QS9A 4DB3A 1TUYA 3CHWA 2P9NA 1ESVA 1G99A 4M7XA 4FOIA 1SAZA 4MO5A 4BRMA 5BN8A 5BRDA 2DPNA 1K8KA 4CZHA 4EIAA 3DXKA 5AQFA 1R59O 4EHUA 2E2OA 2QWPA 2FF3B 3ID8A 4MLEA 1XC3A 5JLFA 4XEIA 3LL3A 1ATRA 1QQNA 3CIPA 1JCFA 1NGBA 1D4XA 2V52B 1C0FA 3ATUA 1YUWA 3VETA 1NGIA 3EKUA 5I9EB 4BC3A 3U9DA 4BRCA 4PL7A 1HKCA 2Q0RA 3DAWA 1HX1A 4H5RA 4BRFA 2I7NA 3LDQA 3IFRA 1NGHA 1NGDA 2A41A 3EKSA 5FPDA 3M3ZA 3O6WA 5KQ8A 3BUZB 3MK6A 3ZX0A 1EQYA 3O4WA 1H1VA 4BR2A 3IMXA 4FWQA 3SJHA 3A0IX 3IUCA 2FF6A 5AQQA 4EFHA 1NGJA 2CH6A 1C0GA 1YVNA 3EL2A 1U2VA 5KPZA 2P9IA 1HJOA 4YDUC 2P9SB 3H3NO 4Z94A 2YHXA 3D2FA 3WT0A 5F2RA 2GEMA 2ASMA 4WQ4A 4A2BA 4MLHA 1ZXOA 4H5WA 1LCUA 1NMDA 4FWMA 1E4GT 3GOIA 3LDOA 3ZETA 4EAHD 2Q2RA 4NO7A 3ULEB 5BPMA 5JMVA 1SZ2A 3H6EA 4H5VA 3VEYA 2FSKA 2QWQA 1V4TA 4IO8A 3QB0A 4GY2B 5BPNA 3A5OC 3FZFA 4JN4A 3HM8A 3VEVA 4RCHA 5CE3A 1BA0A 2P9KA 2VCPA 2FXUA 3FZLA 3H45C 4K41A 4H0VB 4DCHA 4H0TB 2P9PB 4BQZA 4BRGA 2QW9A 1YAGA 3DJCA 2NRHA 4FWKA 5BR9A 1Q18A 1GLFO 3UKRA 1TYQB 3QBXA 4CI6A 4CZLA 2ZWHA 4AM7A 4M63C 1BOTO 3FE1A 5AQSA 4XH1A 2D0OA 2E8AA 4RTFD 2ZF5O 5AQIA 2OANA 1WOQA 4PKGA 3H3OB 2GUPA 3AY9A 5AQVA 4WQ4C 4ISFA 3O8MA 5FPMA 1XQSC 3VGKA 1KXPA 1QQOA 4BRIA 2QWRA 3FZHA 3IDHA 4CZMA 4C23A 3O80A 5KPRA 5AZIB 1MWMA 5F0XA 3CQXA 3W0LA 3LDLA 4H0YB 3RSEB 4CZKA 4FWNA 3D2EA 4YDUA 4J8FA 4L3QA 2D0PA 1LOTB 4XH5A 4PKHA 4FSVA 3AARA 1GLCG 3C7NA 4H03B 2ASPA 4JNEA 5ADXA 3LM9A 4BC5A 5LJWA 3B8AX 4BROA 5AQHA 4FWOA 3ZEUA 4CD3A 3O1WA 2CH5A 2YI1A 4JAXA 3FGUA 4NB4A 3FFKB 1U6ZA 5AQPA 3VEWA 1CZAN 4FO0A 3EZWA 5AQRA 1NGGA 3HI0A 2A40A 3F9MA 3D7EO 5JLHA 1DEJA 4WQ5A 1J6ZA 2CGJA 2Q36A 4QS7A 4CZGA 4BR0A 4FOEA 1KAYA 2FLOA 3CERA 5BRFA 2P9UB 5FPNA 1P8ZA 4H0PA 4CZEA 3ZX3A 2AA4A 4BRLA 1YXQA 5EY4A 4CD1A 3ULEA 3W3DA 4IXCA 4O8KA 3AAQA 1NLVA 1IG8A 1MWKA 1S3XA 3FZKA 3UB5A 3VEZA 4CBUA 4DQ8A 5LY3A 2P9NB 5AFUA 3L4IA 2QWOA 5EOYA 1KAZA 3ENOA 4AM6A 3MN5A 1GLEG 4CZFA 3MDQA 1K8KB 2E20A 1MA9B 3OHRA 1DKGD 2P9PA 4A62A 4H0XB 3QFUA 5AQJA 2CGKA 1BU6O 3M1FA 2A3ZA 5AQXA 3VF4A 4B1VA 4H5NA 3QDKA 4EHTA 3R6MA 4CJ7A 3BP8A 4BVOA 4I6MA 5AQNA 3H46O 2IVOA 2E1ZA 4ISEA 4LC9B 3TPQA 4WQ5C 1NGEA 5AQLA 2V7YA 3MN9A 3SMSA 4K42A 5BRHA 4B1YB 4BQLA 2GWKA 4BRKA 3EO3A 3WUHA 1JCEA 5FPEA 5JICA 4GNIA 1MDUB 1XUPO 2BTFA 2PAVA 2ZGZA 3A5MC 2P9LB 2PBDA 5AZIA 1BDGA 1HUXA 2E88A 3VGMA 3GG4A 2E2NA 3RSEA 5BREA 3UKUA 3DXMA 2BUPA 2P9IB 1T44A 1QQMA 3LM2A 2ZGYA 1T6CA 2V7ZA 1ATSA 2HF4A 1ZBSA 1BWFO 2F9TA 2F9WA 3WXKA 2GELA 4KBOA 3L6QA 1QZ5A 3GL1A 3QICA 4BR7A 5E26A 3KVGA 2I7PA 2E2QA 3O08A 3VF2A 3HTVA 3HZ6A 3I8BA 3VGLA 4CZIA 1Y64A 3QBWA 1X3MA 5BN9A 4H5TA 2HMPA 2J4RA 4PKIA 3QFPA 2ASOA 2NLXA 1GLBG 4FWLA 2NZTA 3A8YA 4B1WB 3GDQA 2UYTA 4FWSA 3CETA 5AQKA 5AQUA 4BRDA 2YJFA 5AQWA 3VOVA 2FSNA 3FR0A 3FZMA 2D1KA 3BF1A 3U4LA 1SQKA 5B8HA 4K43A 2VWBA 4K25A 4HWIA 3DWLA 4BR9A 1KAXA 2YHWA 3A5LC 5E84A 2QWMA 1ATNA 3UKRB 3CJ9A 3CJ7A 5ELZA 2QXLA 1HKGA 4BG8A 1BO5O 4BC2A 2GWJA 5AZJB 2Q97A 2P9SA 4B1XB 5KQDA 3MCPA 1NGCA 3VEXA 3KZBA 4JD2B 3JXUA 4BRHA 2IVPA 3BF3A 3MN7A 4JHDB 4B1UB 4BG9A 3VPZA 1GLAG 5AQTA 5TKYA 3VF6A 4IZ9A 4HTLA 4F9OA 3H1QA 5EVZA 2FSJA 4B9QA 3FLCO 1HKBA 5ADXH 3P4IA 3WEEB 4MO4A 1WUAA 3D2EB 2YHYA 1QZ6A 4A2AA 1IJJA 1Z05A 1Z6RA 2AP1A 2D4WA 1BG3A 3SLCA 3C7NB 4FWPA 2A6AA 3CJAA 1T6DA 4O5FA 4BC4A 1BA1A 3CJ1A 1RGIA 3ZEUB 5AQOA 1NBWA 2A5XA 3DXKB 2E2PA 2Q1NA 3AAPA 3LDNA 3H1VX 2P9LA 3CI5A 3VENA 1BUPA 1QHAA 4ISGA 2E1YA 4IWVA 4BVPA 3A5NC 2QWLA 1TYQA 3WQUA 3WXJA 2YCHA 3C0BA 1OKJA 1NWKA 5KPTA 1X9JA 4B1ZA 2EWSA 5AQGA 4BGAA 4BREA 1E4FT 5EX5A 2WUSA 3S41A 3HBTA 3GE1A 4FL9A 1HPMA 3WQTA 3GBTA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C1BA 5AFUH 3ZX2A 3AVLA 3LALA 3CJBA 1WSHA 4RWTA 3QETA 3L2QA 4FVUA 5D3GA 3AO1A 4A5BA 4WYBA 3D2FB 1VRTA 4E1JA 4DSEA 1NG9A 4XH4A 1DLOA 3ZT1A 2QEXN 3J7AP 3MN6A 1B9FA 3ENHA 4JKGB 2D0AA 5AQYA 1KTQA 4IDHA 3QNOA 1EWRA 3QMLA 5CR4A 5AQZA 4CGGA 4I2PA 3WXIA 1A5VA 1RILA 3MMVA 3OBYA 1Q9YA 1RBSA 1GLJO 3AVKA 4CBWA 4YY3K 4IFEA 4KHNA 3KLFA 4JHDA 1DGKN 1EO1A 1WAJA 1LV5A 3VMFB 4FM0A 4ELVA 3SUPA 1NGAA 3NVMA 1JLCA 1NGFA 4H0OA 3P5JA 1RDWX 1X3NA 4AH9A 4BR4A 3WEEA 3I33A 4FYDA 1TUYA 4JK7A 1K9MO 3CHWA 1C1CA 4PUOA 2XY5A 2E6MA 1KLMA 1G99A 4CHOA 5BN8A 4MO5A 3ZT2A 3OYDA 4CGIA 3L8BA 3ZT3A 1N6QA 1NK0A 4B9SA 2F96A 4CZHA 4DV0K 2E2OA 2W6LA 4YOXA 2O4IA 4KHWA 1VSLA 3VETA 2QKKA 3WNGA 4BC3A 4CEEA 2UUBK 3U9DA 4PL7A 4Q0BA 3JSMA 3DYAA 3DAWA 3NH0A 4H5RA 4BRFA 2XRIA 4C8LA 1IV0A 1IKWA 3VQ9A 2BANA 1JLBA 4IKFA 4ILJA 3C6UA 4FWQA 1HNZK 3CPWM 3IUCA 4CEQA 5AQQA 3EL2A 4YDUC 4CJ4A 3RR8A 4Z94A 3D2FA 2HVHA 2GEMA 2ASMA 4DLEA 3NDKA 4H5WA 4KPYA 2BGGA 1JLGA 1E4GT 3GOIA 3U3GA 3LDOA 3C6TA 4KHSA 3B6PA 4O0IA 4ILHA 2Z1GA 3MX2A 5FLXO 5BPMA 5J2NA 4C1NK 2KZMA 3OYLA 4IO8A 4J2EA 3KK7A 1G15A 4JN4A 3ZT0A 5J2MA 3HM8A 2ETJA 1BA0A 4CFDA 3ZSRA 3BDPA 4DCHA 1RDBA 2G8HA 3N4PA 3K5LA 3HJFA 2FBVA 3BZKA 4FWKA 4B9UA 3NF6A 3THYB 2F7TA 3OYJA 3MWTA 5CHIA 4CZLA 4AM7A 1LWFA 4CJWA 3FE1A 4GVEA 1UA1A 4KHUA 2D0OA 2E8AA 1ZBHA 1BHLA 2OANA 5T7BA 2YNIA 3T69A 4DQRA 3QIOA 3O8MA 4HCBA 2C1IA 4X64K 4FJ7A 1RT3A 3O80A 4DTSA 3PY8A 2HVIA 3O4NA 4FWNA 2O4GA 3LP2A 4L3QA 4B3MK 4HUFA 4F3OA 4IEEA 4B9TA 2G8IA 2BE2A 1SKRA 2OZMA 2NRVA 3SZ2A 4PKHA 3G10A 3DMJA 4H03B 4DTPA 4JKFA 2GV9A 2Z1JA 5LJWA 1KQSM 3TAQA 4I7FA 3ZEUA 3AA3A 2KZZA 3OYEA 3LP0A 4MQ3A 3FFKB 4LH5A 3QIPA 4FO0A 3EZWA 3F9MA 3D7EO 3ZSQA 5JLHA 4AHUA 4WE1A 4EP4A 5C12A 3V9SA 4FJ8A 3SUNA 1HNVA 1IKXA 4BWJA 1VSKA 5KI6A 5BRFA 2VG7A 5HROA 1O1WA 4BRLA 2QKBA 1BCMA 2YKMA 2G8VA 3VN5A 4O8KA 1X1PA 4BE2A 4U67L 4EZ9A 3G6EN 3TWHA 3RRHA 1RDDA 3OYMA 4DR2K 4JS4A 4CFCA 3IG1A 1BIUA 1RBTA 3OJUA 3NBPA 3LP3A 2W00A 3KLEA 4H0XB 1LAVA 4DG1A 3T1HK 4CEOA 1WBDA 1OVQA 4H5NA 4B1VA 3R6MA 3AA5X 4CJ7A 3ZSWA 3BP8A 5KRSA 3RMDA 4B9LA 3PLAA 4FLTA 3ZYYX 1WSFA 4E7LA 1XMQK 1K8AO 2HNZA 3QEWA 4GVMA 4AHTA 5BRHA 4B1YB 3AVIA 2GWKA 4LFCK 1JLQA 4A5AA 3P83D 3CCEN 2WTUA 3D6RA 1HUXA 4JV5K 3M8RA 3DXMA 2P9IB 4WFBL 1NJWA 2HB5A 1QQMA 4PY5A 3LM2A 3M8QA 1N8RO 4DQPA 1ATSA 4Z4IA 1BWFO 3NMUA 2GELA 4DFPA 4JKBA 1N5YA 4KBOA 4JKEA 3PIOL 3KVGA 2I7PA 3O08A 3MWPA 4K8ZA 4B3OA 1BL3A 1S9EA 3TSUA 3SI6A 5BN9A 4WFNL 3AVGA 3CXCM 3OS1A 4CJFA 2NZTA 3A8YA 3GDQA 3CETA 3AGKA 1NK4A 3THXA 5AQUA 2YJFA 1VSEA 2R7YA 4FJMA 1D5AA 3SCXA 2IS3A 3HM9A 4B3RK 4OKJA 1L5UA 2WONA 2HHTA 4CEDA 3MX5A 3TAFA 2RE2A 2QWMA 1ATNA 5A2QO 5K14A 3UKRB 1YITN 4HUEA 2Q97A 1NGCA 2B4JA 3PSFA 3VEXA 4GMJB 4JD2B 2IGIA 3BF3A 3B6OA 1GLAG 4IZ9A 4F2SA 3SAFA 3V9ZA 1SL0A 4E7HA 3LPTA 1IH7A 1DTTA 3T1AA 1WUAA 3VA0A 2G8KA 1Z6RA 2NRTA 2OA8A 1A5WA 3S3OA 4MDAA 1HYSA 3C7NB 4ELUA 2O8CB 5C42A 5BR8K 2A6AA 3CJAA 1T6DA 2KFZA 2I5JA 4KV8A 4M3TA 1KD1O 1XWLA 2RN2A 4KB0A 3AVAA 4CIFA 5C24A 4OLBA 3AAPA 3VENA 4JYAK 1QHAA 4IWVA 4DFJA 1Y97A 1TYQA 4KHYA 3J80O 1NWKA 1XMOK 3KK1A 4BE0A 1F21A 2Z1IA 3RMAA 3SAHA 4JS5A 1RCHA 2EWSA 4CJSA 3AVCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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