2GWJA

Spvb adp-ribosylated actin: hexagonal crystal form
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 127
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwjA04
4NO7A 3A5LC 3ZEUB 4BRPA 4M7XA 2D0OA 3CJBA 3LDLA 4H0VB 3M1FA 4JAXA 5AR0A 3MDQA 4BRDA 4H0XB 1ESVA 1Z6RA 1QZ6A 4IO8A 2CH6A 3HTVA 3DXMB 1J6ZA 4O8KA 3RSEA 4RWTA 3GBTA 4IJNA 3ZX2A 1GLAG 1MWMA 2EWSA 1S22A 5BN9A 4HWIA 4BRFA 3VENA 3JS6A 3ENHA 2YHYA 4O5FA 2ZGZA 3A5OC 1TYQA 5AQMA 4QS9A 4BRHA 3AARA 3VOVA 2QM1A 4MO4A 1NGBA 1YAGA 1U2VA 3BF3A 3R6MA 4H5TA 5AFUA 3U4LA 3UKRA 4IZ9A 1NGJA 4H0YB 2GTDA 3C7NB 4BRNA 3R8EA 4I6MA 2OANA 2P9UB 2ZGYA 3LDQA 1JCEA 3L4IA 3FE1A 5KQDA 2GWKA 5BN8A 5FPDA 2CGLA 1T44A 3QMLA 2HF3A 2ZWHA 3JXUA 3WXIA 3BEXA 4JD2A 5AQYA 2V52B 3CQYA 3U8XA 3A5MC 3W3DA 3DJCA 4B1ZA 3CHWA 2ZF5O 3ID8A 5F2RA 2P9LA 3ZETA 4BRAA 2QWRA 1Y64A 1GLLO 5B8HA 2ITMA 2UYTA 2QWOA 4K41A 3H46O 4FWRA 1NLVA 1EQYA 3O08A 1T6CA 2P9PB 3O6WA 3FLCO 5BPMA 1NGCA 2W41A 5LJVA 3D2EA 3VEOA 3GL1A 4CZFA 3FZKA 2P9IA 1HUXA 4IJAA 3VERA 4BC2A 4CBUA 4WQ4A 1DEJA 5JICA 2IVOA 1HJOA 2GELA 3DXKB 5LJWA 3FZMA 3GG4A 4BGAA 1IG8A 4FWNA 3H3OB 3U9DA 1BA0A 3UB5A 5AQPA 5EOYA 3A0IX 3CJ9A 3CJAA 3GOIA 4EHTA 5KPZA 2KHOA 3VETA 5AQUA 2Q0UA 3O5BA 1JCFA 3L6QA 4BC5A 4NB4A 1HKCA 4WQ4C 3SMSA 3CJCA 3IDHA 3D2FA 2A5XA 4PKGA 4H5RA 5BPNA 2I7NA 5AQXA 3VF2A 1MWKA 3H1VX 4JHDA 2V7ZA 5AQWA 5EY4A 4BRMA 4FSVA 1NGIA 4H5VA 3UKUB 3J8AA 3P4IA 5AQFA 1NWKA 5BPLA 2FSNA 2I7PA 3FR0A 2Q1NA 3DWLA 3OHRA 1BOTO 1RGIA 1E4FT 5AQJA 4IWVA 3MCPA 4BC3A 3WQTA 1QZ5A 2QW9A 1NGGA 2NLXA 2V51B 5ADXA 3SLCA 1BDGA 1C0FA 1S3XA 3SJHA 1BWFO 3ZX0A 3WEEA 1G99A 1BG3A 5AQTA 5KPTA 3IFRA 4FWQA 3TU5A 5FPMA 5AFUH 1K8KA 4CZIA 3QICA 2FSKA 5AZJA 1DGKN 3KVGA 3RSEB 1Z05A 2BTFA 5AQOA 3O80A 1X3NA 4LC9B 4CJ7A 2H3GX 2IIRA 3U9ZA 1NMDA 1NGHA 3FZFA 3WQUA 4CZMA 3QDKA 1KAXA 3VEYA 3VF4A 1IJJA 4FWLA 5FPNA 4BRQA 5KQ8A 2AP1A 2FF3B 2CGJA 1V4TA 2FF6A 2QWMA 1LCUA 1TYQB 4XH1A 5JMVA 3S41A 2P9NA 2F9TA 1QHAA 2QWLA 4FWOA 4CZLA 5LY3A 1RDWX 2P9SA 1HKBA 3QB0A 1U2VB 4C23A 3EKUA 1QQMA 3H1QA 4DHYA 3UKRB 4ISEA 4M63C 4RCHA 3ZX3A 3CI5A 2NRHA 4BRGA 2ASMA 4I6MB 4CZEA 2E20A 2A40A 5ELZA 5AZIA 2QXLA 4ISFA 1SZ2A 4BR4A 1U6ZA 4B1VA 1D4XA 4BR0A 5AQIA 3WUHA 4FPBA 4A61A 3WT0A 1MDUB 5AQNA 5KPRA 4H5NA 3EO3A 3O4WA 4JD2B 1BU6O 1T6DA 4FOEA 3HSCA 4FWSA 1GLBG 5BR9A 4YDUC 2P9LB 3MN9A 4BVPA 3CJ1A 3ZETB 3B8AX 4BR7A 1GLEG 2Q0RA 4DCHA 4BG9A 4F9OA 3DAWA 4E1JA 4GNIA 1HPMA 3VESA 3D2EB 1ZXOA 2P9KA 4EAHD 3EL2A 4BQZA 4DQ8A 2P9IB 3HZ6A 3EN9A 4H03B 4M7YA 4PKHA 4HTLA 4QS7A 3LM2A 5F0XA 3WXJA 3IUCA 2E2OA 3A8YA 3D7EO 4BRLA 1XUPO 4CZKA 1SQKA 4B9QA 4MLEA 3MK6A 5AQHA 5AQQA 1SAZA 3H45C 5BREA 1GLDG 5AQLA 2BUPA 2QWNA 4CD1A 3EKSA 2VYPA 1HX1A 4XEIA 3GDQA 3AY9A 5JLFA 2ASPA 4FWKA 3VGKA 3MN7A 1RFQA 1QQOA 1ATSA 5ADXH 1X9JA 4PL7A 1MA9B 3GE1A 4BRKA 4H0PA 3D2FB 1ATNA 4CZJA 4FPAA 3WXKA 5BRHA 3VGMA 4WYBA 4JHDB 2E8AA 3MMVA 4CD3A 2GUPA 3G25A 3QBXA 2YCHA 3LDPA 5EXWA 4A2BA 4J8FA 3KHYA 4BROA 4EFHA 3ULEA 1ZBSA 2WUSA 3M3ZA 2Q97A 4EIAA 5AQSA 2D4WA 2W40A 3VF6A 4AM7A 1H1VA 3ZEUA 4AM6A 1KXPA 1ATRA 2QWQA 4B1YB 1R59O 4Y0WA 4A62A 3DXMA 4K43A 4MLHA 3I8BA 4K42A 3FFKB 3AAQA 3WEEB 1NM1A 3QFPA 4JN4A 5AQKA 3O1BA 1K8KB 5EX5A 2VCPA 1YVNA 4Z94A 4WQ5C 3QBWA 2E1YA 2YJFA 5AZJB 4CZHA 1NBWA 2NZTA 3MN6A 5CE3A 4B1XB 4K25A 4IXCA 4MO5A 5JLHA 2PAVA 3VEWA 4BVOA 3M6GA 1LOTB 2V7YA 4BR5A 3C7NA 2A3ZA 2P9NB 2IVPA 3BUZB 4YDUA 1HKGA 4CBWA 1XQSC 3FZHA 2P9UA 3BF1A 2PBDA 2P9SB 2F9WA 2A42A 3HI0A 1KAZA 2HOEA 2CH5A 2Q31A 1X3MA 1ZC6A 1NGFA 1TUUA 2HMPA 2YJEA 3I33A 4CI6A 5E26A 3ENOA 3W0LA 3CETA 5EVZA 5AZIB 1QQNA 4PKIA 3O8MA 3UE5A 5BRFA 1WUAA 3TPQA 1WOQA 2E2QA 5AQZA 3EZWA 2Q2RA 4QS8A 4DB3A 2E2PA 5E84A 3LM9A 4BG8A 4EHUA 1YUWA 4ISGA 4GY2B 2DPNA 5I9EB 3CERA 1CZAN 2P9PA 5TKYA 1P8ZA 1OKJA 2A41A 3MN5A 4FWMA 5AQGA 4FO0A 1NGAA 4H0TB 1E4GT 2QWPA 3FZLA 3HBTA 4PL8A 3R9PA 3BP8A 1DKGD 4B1UB 1XC3A 3FGUA 4KBOA 2E2NA 1HLUA 3DXKA 2D0PA 2VWBA 2HF4A 3CJ7A 2P9KB 3F9MA 4JNEA 2FSJA 4H5WA 2FXUA 4FOIA 1Q18A 2IVNA 1C0GA 3IMXA 2CGKA 4B1WB 2A6AA 1KAYA 3LL3A 4BR9A 4BRCA 1YXQA 3CIPA 1GLCG 5FPEA 5AQRA 1TUYA 2J4RA 2E88A 5BRDA 4H0OA 3VGLA 1GLFO 3VPZA 4FWPA 3SK3A 3C0BA 3QFUA 4BGBA 1GLJO 4XH5A 4BC4A 3A5NC 1NGEA 1BUPA 3VEVA 4BREA 1NGDA 3WXLA 1BO5O 2YI1A 2GEMA 3KZBA 2ASOA 4FL9A 2D1KA 2YHWA 3UKUA 3CQXA 3HM8A 3LDOA 5AQVA 3VEZA 2YHXA 4WQ5A 4XH4A 3LDNA 4CBXA 5F1XA 4BR2A 4BQLA 2Q36A 3SMPA 3H6EA 3O1WA 3AAPA 3H3NO 1V4SA 4A2AA 4L3QA 1BA1A 4BRIA 1JCGA 3L0QA 2AA4A 4CZGA 3ATUA 3ATVA 3VEXA 4RTFD 2E1ZA 3ULEB 2FLOA 2GWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AQYK 3ZEUB 4M7XA 2D0OA 1T7PA 3A2FA 3M1FA 4JAXA 5AR0A 4H0XB 2P5GA 3MECA 4RW9A 3SUOA 2FBVA 1RBVA 3MWPA 3GBTA 4LF9K 1GLAG 1MWMA 1X9SA 1ZBLA 3TWHA 3JS6A 1VSFA 4FZZA 2HSTA 4ILHA 2ZJQL 4AILC 4U7BA 3A5OC 1MU2A 2HNYA 4BRHA 3VOVA 3OYKA 2G8KA 2PY5A 3OYLA 1YAGA 4IOAL 3UKRA 3SQ0A 4IDHA 3CFPA 1XNRK 3R8EA 1HYZA 4DMNA 4I6MA 1VSEA 2VG7A 2BGGA 3LDQA 3HOSA 1JCEA 4IOCL 3CXCM 5KI6A 1HNZK 4C1NI 4KO0A 4CJPA 4FLVA 3HPOA 1M90O 3HK2A 1X9WA 3TAMA 4C8NA 4JD2A 2V52B 2ZF5O 5F2RA 5LL6Z 3G71N 2G8VA 4KKOA 1TAUA 5J2PA 3P31A 2QI2A 1NOZA 3NHGA 1IKWA 1I3AA 1NLVA 1WSGA 1O1WA 3O6WA 1RTJA 4B9UA 1KD1O 4CW7B 3C6AA 2OYQA 3VERA 3HO1A 4FZXC 4CBUA 4OPJA 4WQ4A 3P39A 5JICA 3DYAA 1NK4A 4YHHK 3WNHA 4BGAA 4LFBK 3E9OA 3VA3A 4JV5K 4Y1DA 1RTHA 1YJ9N 3QNOA 3CJ9A 3CJAA 1NNEA 1CXQA 4IO9L 4JI6K 3PO4A 3ZT1A 1W0HA 3N4PA 4BC5A 3SMSA 4M42A 3D0PA 4ICLA 3PX6A 5KRSA 2HVHA 3KLFA 1RT6A 3RMCA 1YJNN 1EWRA 1TKXA 4MQ3A 3VF2A 3V9SA 3DLHA 4FVMA 2ZD1A 4FSVA 4DU1A 3KK3A 4JI0K 3SPZA 1TVRA 3RMAA 2F8TA 2VWJA 4RG8A 4X62K 2ZJRL 3O3FA 4CEAA 2BDPA 1NGGA 2V51B 4NCAA 5ADXA 3OYHA 4RW8A 5GINA 3C6HA 3KKSA 1S3XA 1BWFO 2DFHA 5AQTA 3IFRA 4BDPA 5FPMA 4YY3K 3QICA 3I56N 5AZJA 2QA4N 1RBRA 3E9PA 3ZSXA 3RSEB 2BTFA 2JWLA 3O80A 4FCYA 1KAXA 1W7AA 4BRQA 3PY8A 4XH1A 4FLZA 5JMVA 4J2BA 3S41A 4DTUA 4CZLA 2QWLA 4DTNA 1HQEA 5M1KA 5FDLA 4JKEA 4DV6K 1U2VB 4DF8A 2HMIA 1C6VA 3I55N 3H1QA 4CJUA 1YT3A 4FJXA 2KFZA 1ASVA 3KTQA 2ASMA 2E20A 5AZIA 4ISFA 1SZ2A 1U6ZA 4B1VA 3KD1E 4CHOA 4KHYA 2JWKA 5GAHP 4KPYA 3WT0A 4JK7A 5KPRA 3OVNA 2NRRA 3C6TA 1BU6O 1YF5L 4FOEA 2X74A 3HSCA 4FWSA 5BR9A 4BVPA 3CJ1A 3B8AX 1NJZA 1LWCA 4BG9A 4CJSA 4DR3K 3ASMA 4E1JA 3SAHA 4BY9C 2HHVA 4NCBA 4LF4K 1N34K 5I3UA 4GNIA 3VQ8A 4BWMA 2O8FB 4BQZA 2P9IB 4O0IA 3DLBA 3M5RA 2BANA 3BY5A 4BE7B 1VHXA 2E2OA 3D7EO 1SQKA 4B9QA 3N4QA 1SKRA 1K6YA 1BI4A 4ILGB 2BUPA 3EKSA 4PA1A 2VYPA 4Q5VA 1HX1A 1W97L 3WNFA 4PWDA 4GV3A 1XHZA 4FK2A 2ASPA 1RFQA 1QQOA 4BRKA 1ATNA 4TSXA 1QHTA 3F2KA 5HRPA 2RHKA 3WXKA 1VSHA 2E8AA 3MMVA 4I9LA 3MWTA 4CIFA 3LDPA 5EXWA 5GIPA 4DR5K 1ZBHA 1KLNA 2KZZA 2O4GA 4DSEA 4EFHA 3OYGA 4FLXA 4EIAA 1L3SA 4CJEA 3IKMA 1ATRA 4B1YB 1R59O 4Y0WA 4K43A 4MLHA 3V1RA 3AAQA 1YVUA 3QFPA 1CLQA 5EX5A 2VCPA 1XWLA 1W9HA 1SL2A 3QBWA 2E1YA 3TAEA 3OY9A 1BHLA 1RDUA 4AHUA 2YNHA 5GIOA 3RWUA 4RW7A 3CF5L 3MN6A 4DSIA 2OA8A 4MO5A 3ZT0A 4CESA 2PFUA 1VSIA 1GOBA 3VEWA 3SV3A 2A3ZA 3BUZB 5C12A 1HKGA 1S9GA 4JKCA 2PBDA 1XHXA 4QOZB 1VQ5N 4DFKA 2HNZA 2HOEA 5LMUK 3MX5A 2Q31A 1ZC6A 1KFSA 1TUUA 2E4LA 3O3GA 2YJEA 5E26A 3QLHA 5EVZA 2B5JA 3AVIA 4LFAK 4YFUA 5CY4A 3QO9A 2Q2RA 2YNFA 4BG8A 3JAMO 3P38A 3HOTA 2DPNA 1CZAN 2P9PA 3SBTA 3T69A 3ZT2A 3K2PA 1LV5A 1VQNN 1QVGM 4FW1A 4HTUA 4DS5A 4NYFA 4DR2K 1E4GT 2QWPA 3FZLA 3KLIA 3HBTA 4CJKA 2XY7A 1D8YA 4KBOA 1CXUA 1KVBA 2VWBA 3CJ7A 2P9KB 3OYFA 4CGIA 4AHSA 1I94K 3O9QA 4JI4K 2ITGA 4ZTJA 3CG7A 2A6AA 4H8KA 4JEPA 3LL3A 4BR9A 1U45A 4E1MA 1YIJN 4Z4IA 2O8DA 1GLCG 5FPEA 3IG1A 4FJGA 5BRDA 4H0OA 1NJYA 1BQMA 1GLFO 3VGLA 4A5AA 4BGBA 3H08A 2E5LK 3EZ5A 3TAQA 4B3OA 2YI1A 2GEMA 2ASOA 4CF0A 1RT3A 4L8RB 3UKUA 1VQ4N 4DQQA 4LY7A 2YHXA 3OYBA 1CZBA 4XH4A 1N32K 5F1XA 2Y1JA 1JLBA 4JKGB 2UU9K 1VRUA 2ATQA 4A2AA 2UUCK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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