4XH5A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88g mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
394
structure length
391
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMENAFLSINDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIGHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Propionate kinase
total genus 135
structure length 391
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh5A02
4LC9B 2QWPA 4EHTA 5JMVA 5BPMA 2HOEA 5CE3A 4J8FA 3QICA 3BF1A 3CI5A 4IO8A 2I7PA 2PBDA 4B1YB 3EN9A 4BR0A 1HPMA 4CZMA 1NM1A 4A2AA 3O6WA 4BC5A 4RTFD 3R9PA 1V4TA 2VYPA 3O8MA 4Z94A 3ENHA 5AQRA 3VETA 3O80A 2GWJA 1BA1A 4IJAA 2V7YA 2I7NA 2D1KA 2UYTA 3EO3A 5FPMA 5AQMA 4JN4A 2QWLA 3SJHA 3U9ZA 4ISGA 1U6ZA 4PKIA 4JAXA 4H5NA 3D2EA 1SAZA 4FO0A 2IVPA 4EAHD 4NO7A 5FPDA 4CD3A 1GLDG 3R6MA 4IZ9A 4C23A 1BDGA 4BRAA 3UKUA 1JCGA 4PKHA 3UE5A 1NWKA 1NGIA 3IDHA 2H3GX 2A42A 3CETA 4WQ4C 1MWMA 3VEZA 4A2BA 3IUCA 1GLLO 4PKGA 3S41A 3W0LA 2FF6A 3DJCA 4AM7A 3D2EB 4M7YA 1ZXOA 3QDKA 3MCPA 2P9LB 5JICA 4FWMA 3WXLA 1IJJA 5AQPA 1Z05A 2KHOA 1TUUA 4BGAA 3J8AA 3A0IX 1Q18A 2PAVA 2Q31A 3WXJA 2FSKA 4IXCA 4HTLA 2FLOA 3KVGA 5F2RA 5AZJA 3EKUA 4MO4A 5AFUH 1HJOA 4BVPA 2Q97A 4BR2A 3AY9A 5EOYA 4BC3A 1U2VA 1XQSC 4FWRA 2P9UA 1ATNA 4MLHA 5KPRA 3DXMA 3CERA 5LJVA 2NLXA 3LDOA 4KBOA 3A5LC 4BRIA 5F1XA 3RSEA 2Q0RA 3VGKA 3CJBA 4BRHA 3VEWA 2ZF5O 4B9QA 3CQYA 3HM8A 4H0TB 4F9OA 3C7NB 1KAXA 4WYBA 4BGBA 1NGJA 4FOIA 4CBXA 3U4LA 5EY4A 3QFPA 3AAPA 4K42A 2E2QA 1P8ZA 5E26A 2A3ZA 5AQXA 5BRHA 3TPQA 1QQMA 1LOTB 2P9KB 3W3DA 3FZFA 5BREA 2HF4A 3ZX2A 4BRMA 4EIAA 1NGAA 3CJCA 2A5XA 2BTFA 3VF4A 4JNEA 2VWBA 3CIPA 1ATRA 2HMPA 3U8XA 3ZEUB 5AQYA 2QWQA 1X3MA 1X9JA 1J6ZA 4PL8A 4FWNA 3ZX3A 4Y0WA 3I8BA 5AQVA 1ESVA 5AQSA 1YUWA 1YAGA 4IWVA 3VGMA 5LJWA 4BC2A 3VF2A 3UKRB 5AQQA 3CJ7A 2YHXA 3GDQA 4BR7A 3BF3A 5KQ8A 1OKJA 4MO5A 4XH1A 2CH6A 1E4FT 4A61A 3AARA 5EX5A 1GLAG 2GELA 3M6GA 4B1WB 4FWOA 2CGJA 3KZBA 3LDNA 4WQ5C 3WQTA 2FSNA 1BU6O 1NGEA 1HLUA 2QWRA 1DKGD 3SK3A 1YVNA 3ATVA 1SZ2A 3AAQA 4H0OA 5I9EB 4H5RA 3MDQA 4CJ7A 3HSCA 2IIRA 1GLFO 1T6CA 2J4RA 4JD2B 4BROA 5EXWA 2P9LA 5KPZA 5F0XA 1ZBSA 2D0PA 2QXLA 2A41A 1WOQA 2AA4A 2AP1A 4K41A 4B1VA 2E88A 1C0FA 4GY2B 5AQUA 3H46O 5BRDA 4BRQA 1BUPA 5AQFA 3LDQA 3FZMA 3O5BA 3O4WA 1BOTO 4AM6A 4CZHA 5AQHA 1NGBA 4CZLA 3QBXA 3DXKB 2GWKA 1K8KB 4FWSA 3FZKA 4FSVA 3GL1A 2F9TA 3VEOA 4B1UB 4EFHA 2Q2RA 2YHYA 3ID8A 4YDUA 4FWKA 1ZC6A 2A6AA 1KAYA 3WEEA 4K25A 5B8HA 1BG3A 5AQIA 3C7NA 5BPNA 2V51B 4K43A 1RDWX 3ENOA 1DEJA 4QS8A 3QBWA 2Q1NA 3MN7A 1G99A 2P9KA 2E8AA 4O8KA 3CJ1A 4H0VB 4BR4A 1NGCA 4ISFA 3CJ9A 2GTDA 1RFQA 1Y64A 2YCHA 1BA0A 1NGGA 3LL3A 3WEEB 1NGHA 2ASPA 1Z6RA 1JCEA 3ZETB 2QWNA 3GOIA 3ZEUA 4XEIA 3QB0A 2E2OA 5ADXH 3CHWA 3KHYA 3GG4A 3QMLA 1IG8A 2QW9A 1JCFA 3MN5A 3VF6A 5KQDA 3M1FA 4FWQA 3BEXA 3HI0A 2IVOA 4BRGA 3O1WA 4DHYA 3BUZB 4H5VA 1MDUB 3UKRA 4DCHA 1NBWA 1KXPA 2FF3B 4JHDB 4BR9A 3LM9A 1QZ5A 1DGKN 2Q0UA 4XH4A 3VOVA 5AZIB 3ATUA 3O08A 3C0BA 4FWLA 1SQKA 2FXUA 3FE1A 3HBTA 3ULEB 2WUSA 2W41A 3L4IA 3VGLA 4CZEA 4BVOA 2E2PA 5TKYA 4BRCA 5JLHA 4BRDA 4B1ZA 3FZLA 4M7XA 3M3ZA 3WXKA 1S3XA 4M63C 3FR0A 2E1YA 4BRLA 3G25A 4FOEA 4CI6A 1HUXA 1S22A 4H03B 3H45C 3L6QA 2W40A 4IJNA 3EKSA 2P9PB 2VCPA 4I6MB 4DB3A 5E84A 4WQ4A 5EVZA 5AQJA 3FGUA 5JLFA 1HX1A 3I33A 4ISEA 2GUPA 2EWSA 4BG8A 2V52B 4JD2A 1MA9B 3JS6A 2D0OA 3MN9A 2P9NB 4BRNA 5BR9A 1TUYA 2V7ZA 4BRKA 4H5TA 2P9SB 3F9MA 3GBTA 2CGLA 3H1QA 1GLJO 1H1VA 4CD1A 2P9IB 4CZIA 1CZAN 2ZGZA 2ZGYA 3LM2A 4HWIA 1R59O 1XC3A 1YXQA 2E1ZA 1ATSA 3CJAA 5AQOA 2ITMA 3H3OB 3WUHA 5AFUA 1HKGA 3FZHA 4CBWA 1RGIA 3D2FB 2A40A 3DXKA 3MMVA 1K8KA 4RCHA 3HZ6A 1TYQB 2YJFA 1XUPO 3WQUA 4H0XB 3MN6A 2QWMA 3GE1A 1NLVA 1EQYA 4EHUA 3FLCO 5AQTA 1GLBG 2YHWA 2ZWHA 2Q36A 3D7EO 3R8EA 5ADXA 3CQXA 4O5FA 4RWTA 1C0GA 3JXUA 4QS7A 4DQ8A 2BUPA 4FWPA 5AQGA 4FL9A 3WT0A 3A8YA 4BC4A 3ZX0A 2DPNA 1GLCG 4BRFA 4BG9A 4CZKA 3FFKB 4B1XB 3BP8A 3QFUA 3SMSA 3VEXA 2QM1A 5AQNA 2D4WA 2F9WA 4XH5A 3SLCA 5KPTA 3VPZA 1BO5O 4BRPA 3ZETA 3L0QA 4QS9A 1V4SA 3HTVA 2IVNA 1QQNA 1NGFA 4NB4A 2NRHA 2YI1A 1T6DA 4H0PA 3DWLA 3VERA 5AQWA 3A5OC 2NZTA 1BWFO 4JHDA 1D4XA 3VESA 5AZIA 5BPLA 1QQOA 5AR0A 3UKUB 4CZFA 3ULEA 4BQLA 1KAZA 2FSJA 2QWOA 3IMXA 3DAWA 4WQ5A 1NGDA 1WUAA 2ASMA 3UB5A 4L3QA 5LY3A 2HF3A 3A5MC 1LCUA 3VENA 4BQZA 4PL7A 4CBUA 4H0YB 4E1JA 2P9PA 5BN8A 3IFRA 1HKBA 4I6MA 4MLEA 3O1BA 1T44A 3TU5A 1E4GT 1HKCA 3OHRA 3SMPA 3LDLA 3LDPA 4GNIA 3VEYA 3H3NO 5AZJB 2YJEA 2P9NA 5BN9A 4A62A 3U9DA 2ASOA 1GLEG 2P9SA 1U2VB 4CZJA 5BRFA 2P9UB 5AQLA 2P9IA 3DXMB 1QZ6A 3P4IA 3EZWA 5AQZA 5FPEA 3VEVA 3RSEB 2CH5A 1NMDA 3A5NC 4YDUC 5AQKA 4FPAA 5FPNA 3WXIA 4FPBA 3B8AX 2CGKA 4CZGA 3H1VX 3D2FA 3H6EA 1MWKA 4BR5A 1TYQA 1X3NA 2GEMA 3MK6A 2OANA 5ELZA 2E2NA 1QHAA 4H5WA 3EL2A 2E20A 4BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAQA 2ZJQL 1S9EA 3HP9A 2RKIA 2NNWA 5JMVA 1OVQA 2HOEA 2P1JA 3VQ4A 4FLUA 1NK4A 2UUCK 4DQIA 4NXNK 4Z4GA 3BF1A 1VQKN 4FVUA 3EN9A 4OKKA 4BR0A 3RR7A 4CZMA 1L3SA 3WNGA 2OYQA 3R9PA 3O8MA 4DSJA 4K8ZA 4CJWA 1RBRA 2I7NA 2V7YA 1KTQA 4FZXC 1XC9A 3SYZA 3AA2A 3WNEA 3KK3A 1BQNA 2FBXA 2HHTA 4JAXA 4DKWA 4DF4A 2O8EB 3V81A 4CD3A 1XHXA 4F2RA 1BDGA 1NK9A 3CCUN 1NK0A 5CZ2A 3UE5A 4G1QA 1VSFA 1NWKA 3KKRA 3L3UA 1NGIA 4DSEA 2H3GX 2A42A 3AVGA 4ELVA 3PLAA 4CE9A 3IUCA 3OYCA 2FF6A 2R7YA 4M7YA 1TL3A 1HNZK 3V1RA 2HNYA 2YNIA 3WXLA 4JKDA 1Z05A 1NKEA 4JK7A 3V9ZA 4LD0A 3TABA 4CEOA 3EKUA 1L5UA 1IKWA 4BVPA 2Q97A 3AY9A 5EOYA 4B3RK 3DOLA 2FBYA 1NKCA 1EKEA 3N4PA 1XQSC 2P9UA 5LJVA 5KPRA 3QNNA 2G8HA 1W2BM 2OPRA 3LDOA 3A5LC 4BRIA 5MLCQ 3RSEA 1U47A 2KZMA 3OBYA 4OLAA 3VGKA 4BRHA 4HCBA 4B9QA 4Z4CA 3OY9A 3C7NB 3CD6N 5FRNA 2QXFA 4BGBA 4CBXA 4DR7K 5EY4A 3AAPA 5E26A 5BRHA 3V9SA 4M3YA 4MDBA 1QQMA 1LOTB 3KKSA 3VQAA 1NGAA 4FJ7A 3VF4A 4DUYK 4JNEA 2E6MA 1S72N 2ZD1A 2HBKA 3AVHA 1WSIA 2KW4A 3CM6A 2D0BA 2HMPA 3VQQA 3ZEUB 4B08A 3VQEA 3QINA 3DRPA 1SL2A 1YAGA 5LJWA 2PYJA 4DLGA 2YHXA 3MEEA 2P51A 4O55A 1OKJA 2CH6A 2G8IA 4DR4K 2GELA 3K5OA 4LH4A 1BIZA 5KI6A 1S6QA 4B1WB 4OGCA 3KZBA 3LDNA 1VQ5N 1BU6O 3EE8A 2UXCK 3E9LA 3SK3A 3OS1A 1SZ2A 3AAQA 3RWUA 3QO9A 5FDLA 1TAUA 3SV4A 3DLGA 4KFBA 3MDQA 3OYKA 2VQEK 4KHYA 3L2VA 5CYQA 2F4VK 4O0JA 4AHVA 5F0XA 1Q7YO 4FCYA 3EY1A 2IOCA 1RDDA 4H4OA 3SUNA 2AP1A 3CFPA 4K41A 3IS9A 5D3GA 1IBLK 2Q3SA 1C0FA 1LWFA 2O8BA 3E1YA 3H46O 3RR8A 3OYNA 3FZMA 3O5BA 3QBXA 2HBLA 1UWBA 4FJ9A 4FWSA 3RMBA 1JJ2M 3GL1A 3VEOA 2OCEA 2Q2RA 1IBKK 4JKGB 4KB0A 3DLLL 3C6AA 3WNFA 3OJUA 1BIUA 4BDZA 5B8HA 2O8BB 4X65K 5LMNK 2V51B 1RDWX 4F3OA 3ENOA 2ZJPL 3HVTA 1KCFA 3E01A 4BWJA 3VQCA 2BH1A 4KPYA 1U4BA 2P9KA 3KLFA 1VSLA 2Y1IA 1JXBA 1M1KO 3KLIA 4ISFA 5JS2A 3QESA 2GTDA 4CIFA 2OPSA 1J53A 1RFQA 1Y64A 4IG0A 1QVFM 3AVFA 3ZETB 2QWNA 3ZSXA 3S3OA 3CHWA 4DV7K 4R79A 4Z4FA 4YNQA 5JVGL 5KQDA 4JKFA 4EZ9A 2FF3B 4BR9A 4JHDB 1U49A 1RT4A 1DTQA 2Q0UA 4XH4A 5AZIB 3QEPA 3ATUA 1U45A 4N76A 2WFBA 3MXJA 4OPKA 4YOYA 2W41A 3O9SA 4C8OA 3RVCA 1FJGK 5JLHA 3HK2A 5M1OA 4J2AA 1HNWK 1S3XA 3PX4A 4M63C 4BY9C 3AA3A 4FOEA 3O3GA 4DWIA 4HTUA 1S22A 2VCPA 4CJEA 4DB3A 3V1OA 4KHQA 5E84A 3ZSWA 3THWA 5GADP 1IKXA 2D5RA 4ISEA 4BDPA 1JLAA 5GAHP 4DV4K 3DMJA 4JYAK 3HOSA 3M8RA 3KK1A 2V7ZA 1LWCA 2P9SB 2RN2A 1H1VA 1WSFA 3CPWM 2KQ2A 2ZGYA 1JLGA 4HWIA 1R59O 4B8CA 3CJAA 1ATSA 3ZCMA 4CEQA 3HPHA 4LF7K 1FKPA 3FZHA 1RGIA 4CHYA 4FK4A 1P90A 2A40A 3L4QA 1W97L 4B9NA 2UU9K 1TYQB 1XUPO 3QEVA 4H0XB 4B3SK 4DTSA 4YOTA 1NLVA 1J54A 5AQTA 1OH8A 2UUAK 1T3VA 4YOXA 1QSLA 3D7EO 3R8EA 2X6SA 3KTQA 4O5FA 2YKNA 1U48A 5M1NA 3JXUA 5HP1A 4FWPA 3A8YA 3ZX0A 3OS0A 4BG9A 3FFKB 4KHNA 3ID6A 2QM1A 3DYAA 2D4WA 5KPTA 2QK9A 4QS9A 4CEAA 1TK0A 4A57A 1UA1A 3AVKA 3MX5A 4NB4A 5DMRA 2NRHA 4M3RA 2HHHK 1BWFO 1N34K 3DLRA 5A2QO 1NG9A 4PUOA 4CW7B 4DSKA 2HNZA 2FSJA 5HRPA 4J2BA 3IMXA 4YOVA 3ZLJA 1NGDA 1WUAA 2ASMA 5C0YA 3C6HA 3CMEN 2HHVA 1BI4A 3QIOA 2HB5A 3EE9A 3A5MC 4ILGB 3VENA 5JS1A 3MCAB 3HO1A 2P9PA 5BN8A 4NCBA 1HNIA 3IFRA 1KRPA 2IDOA 4MLEA 4DQSA 2D0CA 3OHRA 5KGWA 3QIPA 4DV0K 2HVIA 5TKWA 1BQMA 4FM1A 1NK5A 1EWRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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