4XH5A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88g mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
394
structure length
391
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMENAFLSINDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIGHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Propionate kinase
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
total genus 135
structure length 391
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh5A02
5BPNA 1NGJA 3SMSA 1E4GT 1NGEA 3ATVA 2YJFA 3QFUA 4JAXA 3HM8A 3SLCA 4BRPA 4BRQA 4IO8A 5AZIA 1DKGD 3BP8A 3KZBA 3ID8A 5FPDA 4CZLA 3AAPA 4BRNA 3FE1A 1HLUA 2FLOA 3CQYA 3DWLA 3VGKA 4CZHA 5AQUA 2Q0RA 5AQMA 5BRFA 4BQLA 3ZEUB 4FWNA 1T6DA 3L0QA 2GTDA 2UYTA 4FWKA 3MDQA 4PKGA 4WQ5A 2NLXA 3QFPA 1YXQA 4BVPA 3VF2A 2BUPA 5LJWA 5KPTA 3VENA 3A5MC 1YUWA 2CH5A 5ADXH 2V52B 1ATRA 3AARA 5BREA 1ZBSA 3ZEUA 2QWNA 1H1VA 3QMLA 5BN8A 1HKGA 5LY3A 5I9EB 2F9TA 4CZFA 2YJEA 2YCHA 3A5NC 4JNEA 4QS8A 1BU6O 3VEZA 3AY9A 4JD2B 1NBWA 2NRHA 3EN9A 3U9ZA 4WQ4A 3R9PA 3FLCO 3VPZA 2D1KA 1GLEG 2ASPA 1ZC6A 4HTLA 3W3DA 2FSKA 3LDPA 3GE1A 3GG4A 4ISFA 1TUYA 3JXUA 4K41A 4QS7A 2HF3A 2YHWA 5B8HA 4JD2A 4F9OA 2IVPA 4BR4A 2Q97A 3GL1A 3SK3A 2I7NA 4WQ5C 1T6CA 3WQTA 1MWMA 1E4FT 2HF4A 3VETA 3C0BA 5BR9A 5AQLA 3UB5A 3EKSA 4PKIA 4BRAA 3VEVA 2ASOA 3WXLA 3MN7A 4O5FA 3HTVA 2GEMA 2P9UB 3H1QA 4J8FA 3EKUA 2CH6A 3GBTA 4MO5A 4IJAA 5AQOA 4IXCA 3VGLA 3CQXA 5EOYA 4I6MB 4QS9A 1C0GA 3VGMA 2D0PA 3A5LC 3GDQA 2P9SA 1IJJA 3U9DA 4BREA 4H5RA 1KAZA 2ZGYA 1EQYA 3I8BA 4FO0A 4FL9A 4WQ4C 3O6WA 4BRHA 1LOTB 2P9UA 2I7PA 1NMDA 5AQNA 4FOEA 4FWSA 2FF6A 1QZ5A 5AQSA 1SZ2A 2E2NA 2YHYA 3HI0A 4CZKA 5TKYA 3VEXA 4A2BA 1K8KB 5AQYA 1P8ZA 5BRHA 3EO3A 3G25A 2WUSA 5BPLA 1XC3A 3DAWA 3ZX3A 5AQGA 2W40A 2QM1A 4BRGA 2VCPA 1U6ZA 2ITMA 3DXMB 2E2OA 4FWMA 3L6QA 4CD1A 2V51B 1BOTO 3FGUA 1GLFO 3CIPA 3WXIA 2FSNA 1JCFA 3QICA 1RDWX 1GLDG 4PKHA 5AQVA 4JHDA 3DXMA 2GWKA 4BC2A 3FZLA 4XEIA 3U4LA 3QB0A 3I33A 2NZTA 1NGDA 2ZF5O 5AQQA 2CGKA 5ELZA 1MA9B 3H3OB 3CETA 5F1XA 2QWPA 3CJ7A 5AFUA 2J4RA 2Q0UA 4ISEA 1HJOA 3CJCA 5AQIA 3O5BA 4B1YB 1SAZA 3VESA 3MN5A 1ATSA 2QXLA 3FZMA 1V4SA 5LJVA 5BPMA 1GLJO 4XH1A 1DGKN 4BR0A 3P4IA 1JCEA 1RFQA 2KHOA 3LDOA 4EHUA 3MN6A 1QQNA 1CZAN 4FWOA 1BUPA 2P9LB 4NB4A 2Q31A 3D2EB 1GLAG 3VEYA 1KXPA 2IIRA 3QBWA 1ATNA 2HMPA 4K43A 4O8KA 3ZX2A 3M1FA 3R8EA 3ZETB 4BGAA 2CGJA 4FWPA 2P9KB 3EL2A 3IDHA 1NGBA 3O80A 1NGIA 3LDQA 1BO5O 4YDUA 1U2VB 3CJAA 3L4IA 2P9LA 5AQJA 1TUUA 4FWLA 3D2EA 2YHXA 5EX5A 1T44A 1BA0A 1RGIA 2HOEA 3O4WA 4XH4A 3CHWA 4CZEA 5KPZA 4DQ8A 3ZETA 5JLFA 3R6MA 1GLBG 2FSJA 3ENHA 4H03B 2P9KA 2A42A 2D0OA 3VEWA 3WT0A 1NGCA 1YVNA 4H0VB 3IFRA 4M63C 4DB3A 3A5OC 1U2VA 4CBUA 3SMPA 3A0IX 3VERA 5AFUH 2F9WA 3LDNA 4PL8A 3FR0A 4GY2B 1D4XA 4B1ZA 3FZHA 4BRMA 4FWRA 4AM6A 4B1XB 1TYQB 4E1JA 5KPRA 3ZX0A 3S41A 1WOQA 4AM7A 2A40A 1G99A 2ZWHA 4FWQA 1LCUA 2W41A 3QDKA 3VOVA 4H0TB 3RSEB 4M7XA 2ZGZA 3BUZB 4BC5A 1Z05A 1BA1A 1KAXA 1R59O 3M3ZA 4BROA 4CD3A 5AQTA 4YDUC 4CJ7A 4I6MA 1GLLO 4BRFA 4A2AA 5AQXA 3UKRB 2QW9A 2E2QA 1IG8A 3C7NB 3RSEA 1S3XA 2H3GX 3CJBA 4BR2A 4BC4A 1V4TA 3JS6A 4B1VA 3FZKA 3WQUA 4BG8A 5ADXA 4MLEA 2GUPA 5AQWA 5BRDA 1NGHA 2IVNA 4BRLA 1S22A 2ASMA 1K8KA 4FPAA 2AA4A 5E26A 3UKRA 3IMXA 5KQDA 2V7YA 3C7NA 4BRIA 5AQFA 1NLVA 3MN9A 4H5NA 5AQZA 3H45C 1X3NA 4MO4A 1Y64A 2A41A 5E84A 4A62A 4IJNA 1BDGA 3O1BA 3M6GA 3HSCA 4EFHA 3LL3A 2P9IB 4B1UB 2P9NB 3AAQA 2QWMA 4H5TA 1Z6RA 4L3QA 4DHYA 4EHTA 1KAYA 5AZJB 1NGAA 4CBXA 4K25A 4DCHA 3VF6A 4A61A 3GOIA 4H5VA 4BG9A 3MK6A 4H5WA 2D4WA 1X9JA 2FXUA 4BR9A 3O08A 3D2FB 4JN4A 1NGFA 5AQRA 4GNIA 3WUHA 2P9IA 4XH5A 2P9NA 1HX1A 4B9QA 3TU5A 2GELA 1MDUB 3MCPA 2YI1A 4BC3A 1BWFO 5AZJA 3WEEB 3ENOA 2P9PB 4H0PA 5JLHA 3UE5A 1HKCA 3QBXA 5AQHA 5FPEA 2E8AA 3BEXA 3D2FA 4LC9B 1YAGA 4CZIA 4CZJA 3ATUA 3F9MA 2VWBA 3A8YA 4C23A 1J6ZA 5FPMA 1WUAA 3HBTA 4BRDA 5JMVA 3DXKB 2QWRA 3WEEA 3OHRA 2PAVA 3HZ6A 3J8AA 3CI5A 4Y0WA 2P9PA 1QQMA 1HKBA 2DPNA 3O8MA 3FFKB 1OKJA 3VEOA 3EZWA 3CJ1A 3LM2A 5F0XA 2QWQA 3TPQA 3KVGA 1MWKA 5JICA 1DEJA 1XUPO 2A3ZA 3WXKA 2GWJA 1Q18A 2VYPA 4ISGA 4EIAA 3KHYA 3DXKA 2V7ZA 3CJ9A 5EY4A 3LM9A 2EWSA 5CE3A 3FZFA 4H0YB 5EVZA 4MLHA 2E88A 1QHAA 3D7EO 1GLCG 2Q2RA 4PL7A 2E20A 4K42A 4CZGA 3B8AX 1C0FA 4KBOA 3UKUB 2Q36A 4FPBA 3U8XA 4B1WB 3H46O 2P9SB 2CGLA 4BRKA 2PBDA 2Q1NA 4M7YA 3W0LA 3ULEB 1XQSC 3CERA 4BRCA 3MMVA 2OANA 1NWKA 2A5XA 4HWIA 5FPNA 5KQ8A 2FF3B 3BF3A 3WXJA 1JCGA 1TYQA 3H1VX 3SJHA 4EAHD 3LDLA 1NGGA 5AQKA 4H0OA 1SQKA 2E1ZA 3H6EA 3UKUA 1QQOA 4BR7A 4RTFD 1NM1A 2IVOA 4IZ9A 4IWVA 4WYBA 4CBWA 2E2PA 4CI6A 3ULEA 4Z94A 2BTFA 3DJCA 3VF4A 1ZXOA 2A6AA 3IUCA 3H3NO 4BVOA 4FSVA 4RCHA 5AR0A 4BR5A 5AQPA 1QZ6A 5BN9A 2QWLA 2QWOA 4FOIA 4RWTA 4CZMA 1HUXA 5AZIB 1X3MA 3O1WA 2AP1A 5EXWA 2E1YA 4BGBA 1BG3A 4H0XB 4BQZA 1ESVA 3BF1A 1HPMA 5F2RA 4JHDB 4NO7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBYA 2X74A 3DYAA 3HM8A 3SLCA 4Y1DA 4CF9A 4BRPA 5C0YA 1S1VA 4YOUA 1X9WA 1Z25A 4TSXA 4CZLA 1HLUA 3QIOA 4Q5VA 1RT7A 4CZHA 4DSJA 5AQUA 2Q0RA 2VGMA 4B3OA 1WLJA 2GTDA 4MDBA 3LDSA 4BDYA 3CD6N 1RBSA 4FWKA 1HNXK 3E01A 2E6MA 3EEQA 4CVNE 4CFBA 1YXQA 4BVPA 4FK4A 3T1HK 1N36K 3VA0A 5LJWA 4NXMK 5KPTA 2P5OA 3V1RA 2XY7A 1YUWA 3ISNC 1SKRA 5BREA 1ATRA 4CHQA 3MXIA 4M3UA 3ZEUA 4DU1A 2QWNA 3P31A 5BN8A 4DV3K 4E1NA 4LF5K 2YJEA 1U49A 2D0AA 3AY9A 2F96A 4JD2B 2NRHA 1ZBUA 1W2BM 1NKEA 1JLQA 3VPZA 4CJ4A 2D1KA 2WTUA 1ZC6A 3ZCMA 4K8XA 2E6LA 4DFMA 4B9TA 2HF3A 4E7JA 1VSDA 4F9OA 2IVPA 3GL1A 3ZSRA 2HBKA 2RF2A 5C42A 3VQEA 4X65K 3MX5A 1KFDA 3CC2N 4PKIA 1WNSA 4CJUA 1VQKN 2XO7A 3HTVA 3SV4A 1L3UA 4UQGA 3GBTA 4MO5A 3OW2M 3QEVA 2QKBA 5AQOA 4IXCA 1JKHA 4CEOA 5EOYA 3OYCA 3KJVA 1KQSM 2VG6A 4QS9A 4DTNA 3NAEA 2D0PA 3VQDA 3OYBA 3CCMN 3JYTA 3DLHA 3THYB 1RTJA 4FLWA 4BACA 2YX6A 2ZGYA 2HBJA 5C25A 4FWSA 4LF7K 1QZ5A 5HOOA 1SZ2A 4GMJB 1K8KB 1CLQA 4B9UA 4ZTJA 3QEXA 1TKTA 4GVMA 3C95A 2VCPA 3PSFA 1TAQA 4DS4A 1YJ9N 3DXMB 1VQ9N 2QA4N 3RVCA 3L6QA 4CD1A 2WFBA 1HJRA 4E0DA 2ZJQL 3SQ4A 4K0KK 4O44A 3WXIA 4BE1A 4CK2A 2O8DA 3B6PA 3QICA 4CJEA 4PKHA 4CIFA 5LL6Z 2HHWA 3O9RA 3K58A 4XEIA 3VQ8A 2NZTA 4V19S 2ZF5O 2GBZA 3CETA 4DUYK 4FLUA 3KKRA 1NK8A 3M8SA 3K9KA 1D9FA 5IT9O 3LP3A 4ISEA 3V9WA 5I3UA 1SAZA 3AVGA 1ATSA 3O9UA 4R79A 1QQCA 2P1JA 1NJZA 3J7YP 3MN6A 3SQ0A 1CZAN 4DSIA 4FWOA 4GKJK 4O0IA 3VEYA 1KXPA 2IIRA 1ATNA 4K43A 3OS1A 4O8KA 4FZXC 4YFUA 3M1FA 4YOVA 4BGAA 3CPEA 2P9KB 3EL2A 3IDHA 1NGBA 3O80A 2GV9A 3QNNA 3KTQA 4ID1A 5GADP 5HLFA 1IV0A 3HT3A 2HVHA 3PIOL 1IO2A 4DS5A 3D2EA 3SJJA 2NRTA 2HHQA 1QHTA 1T44A 5KPZA 3O3GA 3R6MA 1D9DA 2HHXA 3ENHA 4H03B 3FFIA 4AHSA 4HTUA 3IFRA 4W5OA 1U4BA 4KB0A 3NF7A 3KLEA 4CJVA 2LSNA 3VQ7A 3L4QA 4Z4CA 2VWKA 1DTTA 4NXNK 3M5RA 1HYZA 3MEGA 3FR0A 3FZHA 2KZMA 4B1XB 1TYQB 5KPRA 5KRSA 4O4GA 4B3TK 1LCUA 3VQ6A 1BCMA 3NF6A 3CFRA 4M7XA 1FKPA 1Z05A 1BA1A 1KAXA 4HVJA 1KC8O 4F2RA 3I0RA 5JVGL 2G8VA 4CD3A 1KCFA 3AVNA 3TTFA 4YOWA 3OYFA 4NYNA 4I6MA 4CJRA 4DTUA 4A5BA 4JI1K 4DLGA 5AQXA 3UKRB 1NK6A 4F3TA 2DY4A 4QOZB 2E2QA 3L3VA 3DMJA 3IS9A 3ZT1A 1YJWN 4CE9A 3HOTA 3CJBA 2HBMA 4FJXA 4BC4A 4FJLA 3DOKA 3NFAA 1ASVA 5ADXA 3D45A 3H08A 3AVBA 3TAFA 4M3RA 1RDBA 1NGHA 1S22A 3PLAA 4FPAA 1XHXA 2QXFA 1P90A 2V7YA 3C7NA 1XWLA 3TWHA 1HYSA 5IWAK 5AQZA 4PY5A 3SBTA 4FJ7A 3QINA 4MO4A 4A5AA 1Y64A 4RW8A 2A41A 5E84A 4A62A 3WNFA 3O1BA 2Z1GA 3NH2A 3HSCA 2OPPA 3LL3A 4B1UB 1JL2A 2QWMA 4CGDA 4DTOA 1Z6RA 4M41A 2ZJPL 1HNZK 4DHYA 4DTMA 1T3VA 4GV9A 3SUQA 4DCHA 4M3ZA 4A61A 4CESA 3GOIA 5AJ3K 4H5VA 2D4WA 1L5UA 3LZJA 1Z26A 1KD1O 5AQRA 3V1QA 1VQNN 2P9IA 2R7YA 2P9NA 2YNHA 4B9QA 3LAKA 1BCOA 3WEEB 4CJ5A 4CJFA 2HVIA 3D0PA 2E8AA 1TAUA 1YAGA 4M3TA 3NHGA 2VWBA 3ZT4A 3LP0A 4FVUA 5JMVA 5JVHL 4KHSA 1LAVA 5M1QA 3OHRA 1ZBHA 3J8AA 3MXMA 2X6SA 1HKBA 2DPNA 3ITHA 3I0SA 4JKDA 3E9LA 3V9SA 4E7IA 1W7AA 1LWCA 2A3ZA 3WXKA 2GWJA 3CPWM 1NJXA 4JKAA 2VYPA 4FM1A 3CCVN 4ELUA 4X64K 1BIZA 3ZT3A 4H0YB 5MLCQ 5EVZA 4J2BA 3EE9A 5DM7L 3B6OA 4MLHA 1WSEA 1QHAA 3C6TA 1SS6A 1BGXT 2Q2RA 5C24A 4IG0A 4FLTA 1OH8A 3UKUB 4FPBA 4B1WB 2KQ2A 3H46O 3ULEB 3SAHA 1XQSC 3MMVA 4FJMA 3VA3A 2KTQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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