4HVJA

Crystal structure of a putative uncharacterized protein from mycobacterium tuberculosis in complex with amp
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
160
structure length
156
Chain Sequence
b'SMVRYFYDTEFIEDGHTIELISIGVVAEDGREYYAVSTEFDPERAGSWVRTHVLPKLPPPASQLWRSRQQIRLDLEEFLRIDGTDSIELWAWVGAYDHVALCQLWGPMTALPPTVPRFTRELRQLWEDRGCPRMPPVHDALVDARDQLRRFRLITS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Putative uncharacterized protein
molecule tags Unknown function
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Mycobacterium tuberculosis Rv2179c Protein Establishes a New Exoribonuclease Family with Broad Phylogenetic Distribution.
pubmed doi rcsb
total genus 52
structure length 156
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4hvjA00
1NJYA 1WAFA 3ULDA 4ELVA 4DTJA 5HP1A 5DMRA 4CHYA 1CZ9A 3K5OA 1TKXA 4CGJA 1LWCA 4I2PA 3SQ0A 3LZIA 1T8EA 1J5OA 3DOLA 1Q9YA 3D45A 3ZCMA 5C25A 3A2FA 3V9XA 1CLQA 3SI6A 3K5MA 1S9GA 2OYQA 4IDKA 1L5UA 3O4QA 1JKHA 4FK0A 1S5JA 4OVLA 4ELTA 4FM1A 1CZBA 1HYZA 4ICLA 4HUFA 3QIOA 4DU3A 3V4IA 4HTUA 1BCOA 4JRPA 2ITGA 3ALYA 4KHNA 1ZBIA 1SL0A 5HRNA 3QEPA 1D5AA 1BIUA 4CFAA 3KLHA 4Z4EA 3ZT1A 4E3SA 3ZT4A 4M3RA 3RRGA 2Y1JA 2QXFA 4IFVA 3OJSA 3SPZA 3P83D 3CFRA 4BDYA 3OYLA 3HPGA 5J2NA 2YKNA 4BE1A 3SV3A 3TAMA 3LAMA 1LAWA 3ZT3A 4B9NA 1W0HA 4KTQA 3DOKA 4DMNA 2FBVA 2VWKA 4CJEA 3P5JA 3EYZA 3K57A 3ISNC 2FBXA 2ETJA 2Z1IA 1S1WA 4O55A 2JGUA 3VQ8A 3TWHA 4FXDA 3VQ5A 1JLQA 4KPYA 1XHZA 3F73A 4RW7A 1Y97A 4I2QA 4FLVA 2OZMA 1D9DA 2F8TA 1J54A 4N41A 4CJQA 3AVJA 5I42A 4E1NA 4E7KA 1S9EA 1B9DA 1I3AA 4CFDA 4HUGA 3DLRA 1WSIA 4AHUA 3I8DA 4F8RA 1ASVA 3B6OA 4KKOA 1IKWA 1TL1A 4G1QA 1TKTA 1NK7A 3CFPA 1QTMA 4DS4A 2YNIA 2O4IA 2DTUA 5J2PA 3MEDA 4MQ3A 4OKKA 4CJUA 5HRPA 3K5NA 4CEAA 4DTOA 4LD0A 4CJRA 2DFFA 3QEXA 5HBMA 1VSFA 1BI4A 1VSIA 2IAJA 2KW4A 3V9SA 1LWFA 3HP6A 1XI1A 3KKSA 2R7YA 4DG1A 3M8RA 2KZMA 4Z4IA 3CG7A 3PO4A 4CESA 3NGYA 4KHUA 3LWMA 3QEVA 1EP4A 3DRRA 1WNSA 4B9LA 1O1WA 3LANA 3S3OA 3LALA 4N5SA 4NYFA 3HM9A 5SZTA 4CEQA 3RTVA 3CQ8A 3DLBA 4KHSA 3RRHA 4H8KA 4RW6A 1FKOA 1WSFA 1S1XA 2ATQA 3DYAA 1FKPA 4BE2A 3V9WA 3VA3A 3AVKA 3MXJA 4CJKA 4DF4A 3L2UA 4CHQA 1Q9XA 4FJKA 3ITHA 2HHQA 3K5LA 4E7JA 1KLMA 4FJMA 3HPHA 2QKKA 3UIQA 3KKRA 1BISA 3QEWA 3FFIA 3MEGA 4N47A 2YNGA 4FJ7A 2OZSA 1NKCA 4FLWA 1JLCA 4KFBA 4AHTA 4E1MA 4CJLA 1DTQA 3HT3A 1NOYA 2VWJA 4FYDA 1JLBA 3C6UA 3KK1A 2HNYA 4AHRA 1N6QA 4I9QA 2HHSA 4AILC 5DK5A 4J2BA 4CJTA 2BDPA 4O44A 4FJGA 1KVBA 2HB5A 3ZSRA 3HPOA 3OYNA 3AO1A 3KLEA 4ID1A 2G8IA 4B9VA 2FC0A 2HNZA 1HJRA 3QINA 1QHTA 3OS1A 3LWLA 3EZ5A 1TKDA 1D8YA 4BWMA 4M3YA 4EZ6A 4OGCA 1RTHA 4NYNA 1WSGA 4HCCA 3G0ZA 3LDSA 1GOAA 1L3VA 2OA8A 3QIPA 1TKZA 4OJRA 1F21A 2XY7A 1N5YA 2HW3A 4O4GA 1I39A 3NGIA 4Q0BA 3KJVA 2GUIA 3AV9A 5K14A 3ZSWA 4CIGA 3NH1A 5HRRA 4CJVA 1JXBA 3OYMA 3PX0A 1NK5A 4B9MA 4FZYA 4B3OA 2WOMA 4FLYA 1IO2A 1BCMA 4CK3A 1NJZA 3LAKA 4ZTFA 1IKVA 1C1CA 3NFAA 4E89A 3NF9A 3S9HA 4DSLA 2E4LA 1A5WA 3KLFA 1S6PA 3AO3A 4K8XA 3TR8A 5D3GA 4ID5A 3SJJA 1VSLA 2IGIA 1S1TA 1Z26A 1U45A 1RBTA 1EKEA 3OYIA 3HO1A 1FK9A 1GOCA 1BQMA 3SUPA 4DSIA 4N76A 3AVCA 3PUFA 2G8HA 2RF2A 4CEBA 2E6MA 2P5GA 3AVLA 4CE9A 3TAFA 1QE1A 4CJPA 3V1QA 1J53A 1RT3A 1RT2A 3TANA 4KV8A 1JLGA 4IG3A 3ZSZA 3C6TA 4FJJA 2QK9A 5HRSA 2G8VA 5I3UA 1U47A 4E19A 3T3FA 1VK0A 3AVIA 3KD1E 4FVMA 1A5VA 4CK1A 1VSKA 1WSHA 1ZBFA 3AO4A 4O0IA 3SQ4A 2PYLA 2G8KA 4JS5A 3PX4A 3OYAA 1EX4A 1K6YA 4XIUA 3TAGA 1VRTA 3TARA 1ZYQA 3VQ4A 3RR7A 2BANA 4FJIA 2VG7A 1HQEA 2YHBA 4FLUA 3CYMA 3AA5X 4PQUA 4W5QA 3MXIA 2HVIA 3VQCA 4FCYA 2X6NA 4FW1A 4CIEA 4W5TA 2HNDA 4DSJA 2IC3A 4B9SA 2XY5A 3LP2A 5C24A 4YFUA 3L3VA 1QQCA 1T05A 3AVHA 1BGXT 1VSJA 2Z1GA 4C8KA 3NBPA 3LPUA 3IRXA 2P51A 3M8QA 2Z1HA 3KLGA 3P1GA 1W9HA 3SYZA 1YTAA 4B9TA 5FRNA 3LZJA 1KVAA 4KHQA 5FRMA 3PO5A 1RT4A 4OKJA 3VQPA 4DQQA 2HHTA 1XWLA 2ZQBA 3HVRA 3S3MA 2A1SA 2NUBA 3V9UA 2IDOA 2RPIA 4N56A 1RNHA 4J2EA 4Q5VA 2D0CA 4IFYA 5CY4A 2XRIA 4HUEA 4BDZA 2DFHA 4IG0A 4RG8A 1BHLA 3AA3A 1UA0A 1FXXA 4HHTA 4FM0A 4C8NA 5JS1A 4R5PA 3O4NA 3V6DA 4OLAA 3VQBA 5CZ2A 4DTSA 1JLAA 3PV8A 3TAQA 1S1VA 3PY8A 2XO7A 1ZBHA 4Z0UA 1DLOA 2HHXA 3M8PA 3THVA 3L2RA 4CJ3A 4NCAA 1WAJA 4B9UA 2BGGA 1ASWA 1RCHA 4CK2A 3SPYA 2D0AA 1NK0A 2D0BA 1CXUA 3OYHA 1QSLA 2OPPA 3OYBA 2A1RA 4FJ5A 2HVHA 4RW9A 3T1AA 4M41A 1RDBA 2G8FA 3V9ZA 4EZ9A 1C0UA 1YTUA 1RTDA 4AHSA 4CFCA 5HROA 4FZZA 3ZSQA 4QAGA 1RT1A 4CEFA 4DSFA 4CCHA 4CJFA 1KFSA 3AVGA 3OS0A 1B9FA 3AVAA 3KLIA 3AVFA 1REVA 1EETA 4OKEA 4DFMA 4DF8A 5J2MA 4CGIA 3RMBA 1UAXA 2IOCA 3RMDA 2P1JA 3AVBA 4CF0A 1LV5A 4FZXC 1TAUA 1KLNA 1SUQA 1U48A 4RW4A 3U6FA 1IH7A 3RMAA 4DQPA 3VN5A 4CEOA 4NCBA 1C0MA 1NK4A 3QESA 1X9MA 3U3GA 2YHAA 3IAYA 2DFEA 3K59A 1L3UA 1SKWA 3OYJA 3SUNA 2RN2A 3MEEA 1LWEA 3NF7A 4LH5A 1ZBUA 3VQAA 4DLEA 4NCGA 1YT3A 4RW8A 1JL2A 2X78A 3OJUA 4E7IA 1NJWA 3BGRA 4CGGA 1Q8IA 1VSHA 2B4JA 4ZHRA 3OYEA 3V1OA 4JRQA 1S1UA 4Z4GA 2AJQA 1G15A 4CEDA 3SUOA 1VSDA 4CIFA 2KFNA 4CJ5A 4FJLA 4JS4A 3AA4A 1RBRA 3LP0A 4DU1A 3VQ7A 4Z4HA 4CFBA 2XY8A 4CEEA 4K8ZA 1UWBA 1VSMA 4CJSA 3ZSXA 4C8LA 3ZSYA 2F8SA 2GBZA 5SWMA 5KGWA 4E7LA 4M3TA 2OPRA 1HRHA 2PZSA 4FJXA 4M3XA 4E7HA 2B5JA 2PYJA 3KK2A 4L8RB 1JLEA 4KI6A 3KIOA 4FJNA 5KGXA 3S3NA 4KB0A 1NJXA 2EHGA 1RBSA 2Q3SA 4CGHA 4UQGA 4FM2A 3WNHA 1JXEA 3O3HA 4M45A 2GV9A 2EX3A 4DQSA 4M3ZA 3OYCA 3KK3A 3L2VA 4FLZA 1U04A 4DFKA 1NK6A 1KSPA 4CECA 3L8BA 3DRSA 4FW2A 4W5OA 3HYFA 3L2WA 2PY5A 3KD5E 4IKFA 4LY7A 4OLBA 4FLTA 2KTQA 4I9LA 1KVCA 4C8MA 4ZTJA 5J2QA 1LW2A 1LAVA 4C8OA 1WSJA 1RDCA 4KO0A 2VG6A 1UA1A 2HMIA 4KI4A 3ZT0A 4FK4A 4QCLA 4FLXA 3LP1A 3OYFA 3NE6A 3DI6A 3RWUA 4KAZA 3JYTA 2BE2A 1NOZA 1WSEA 1BQNA 3QO9A 4OPKA 1R0AA 1L3SA 1X1PA 4DTNA 4F2RA 4TSXA 3L2QA 4GVMA 4CHNA 3I0RA 3VQQA 4O0JA 2I5JA 4CJ4A 3D0PA 3SZ2A 3TAEA 1CXQA 3MXMA 1IKYA 4CF9A 2D5RA 1QSSA 3RR8A 1SL2A 3AO5A 4CJWA 2KQ2A 3ZT2A 4DQRA 3SUQA 3B6PA 2FBTA 4I7FA 4YNQA 1X9SA 4F3OA 3ZSOA 5FDLA 4Z4CA 3O3FA 1HMVA 1QS4A 4BWJA 2O4GA 3VQEA 4BDPA 4J2AA 1BI4B 4KB1A 4J2DA 1U4BA 4FJ9A 4QOZB 2F96A 3E01A 4HCBA 2YKMA 5CYQA 4EP4A 4IBNA 2YV0X 4DS5A 1C6VA 3QETA 4O5BA 1T03A 3DLEA 4CGFA 2YNHA 2WONA 3IG1A 4B8CA 1BL3A 4DSEA 4ELUA 3L3UA 4DSKA 2XY6A 1LW0A 4PUOA 1JLFA 4FJHA 4DTXA 1SL1A 2ZE2A 1C1AA 5T7BA 3OS2A 3OY9A 4DFJA 1NK8A 3BDPA 3HJFA 5KRTA 3M8SA 4M3UA 5KI6A 2OPQA 3AA2A 3OVNA 4DFPA 1IKXA 3KTQA 4KHWA 3DMJA 1WN7A 4OPJA 1Z25A 4DTRA 1ZBLA 3NHGA 3HXMA 4PY5A 3TABA 3DRPA 3HSTB 2G8UA 2QKBA 3OYGA 2B6AA 3NF8A 4Y1CA 3AVNA 4CERA 3I0SA 3QEIA 2LSNA 3OYKA 4GW6A 2KZZA 4H4OA 3DLKA 4AHCA 4KREA 1UOCA 4DU4A 4DQIA 1A5XA 1ITGA 3SV4A 1NKEA 3U3YA 1RBUA 3EY1A 4OGEA 5FROA 4CHPA 1KFDA 1X9WA 1BIZA 1GOBA 1KCFA 1TV6A 4B08A 3T19A 2W42A 2FBYA 3VQ9A 4BE0A 4LSNA 1C1BA 2RKIA 1RDAA 3SQ2A 5CYMA 1YVUA 4H4MA 4DWIA 5KRSA 2KFZA 4CF1A 1C0TA 3AVMA 4PA1A 3CM6A 1EXQA 3LP3A 4HVJA 2JLEA 3NH2A 4DTPA 3MECA 3DLHA 4FK2A 4Z4FA 2DY4A 1RT5A 1RTJA 4BACA 1TL3A 3OYDA 1JL1A 1RILA 4MFBA 4CHZA 3TI0A 4DTMA 3ASMA 3SQ1A 4CF2A 1HYSA 2Z1JA 3VA0A 1TK0A 3NF6A 3VQ6A 2HHWA 3HVTA 3WNEA 5E41A 1HPZA 3NGZA 3K58A 1U49A 1WLJA 3F9KA 4CF8A 2X74A 1XHXA 4CGDA 3QERA 1J9AA 1QSYA 1RBVA 3H08A 1MU2A 2ZD1A 4M42A 4Y1DA 5J1EA 2P5OA 2HHUA 1HNVA 1NK9A 3TAPA 3ZSVA 1SKRA 1SKSA 3NAEA 1RT6A 5CZ1A 3WNGA 3DM2A 5KTQA 3QNNA 4F3TA 3O3GA 2G8WA 2IS3A 3VQDA 4LSLA 1HYVA 1RT7A 1TK5A 4KTWA 3G10A 1TAQA 1TVRA 3LPTA 1HQUA 4JLHA 4AH9A 4CHOA 1HNIA 5EU7A 4AHVA 3SCXA 3MAQA 1KRPA 1L3TA 2E6LA 4W5RA 3DLGA 1VRUA 1B92A 3SNNA 1S6QA 5HLFA 1VSEA 3HK2A 1DTTA 1TK8A 4KTZA 1RDDA 3V1RA 3WNFA 4B8AB 5C42A 4FJ8A 3NDKA 3C95A 3IS9A 4WE1A 3K2PA 1TGOA 3NCIA 2HHVA 4F4KA 4M3WA 3HP9A 2X6SA 4W5NA 1ASUA 4EP5A 2VG5A 4DTUA 1XC9A 1D9FA 3AO2A 1RTIA 4DLGA 1NKBA 3RMCA 3QNOA 1T7PA 1KTQA 3V81A 4PWDA 1IG9A 3C94A 2XHBA 4KHYA 4E0DA 4F2SA 3JSMA 2Y1IA 4GMJB 2YNFA 3QLHA 4KRFA 3HL8A 2OPSA 1SV5A 4CEZA 3CFOA 4LH4A 3NH0A 3CM5A 5JS2A 3PX6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ULDA 3IUCA 1CZ9A 4CGJA 1TKXA 2AA4A 1WOQA 4NLBA 4AM6A 4C1NI 3SI6A 1QQOA 2OYQA 1L5UA 5AQIA 4FK0A 1K8KB 4ELTA 1HYZA 3V4IA 4HTUA 3R1XA 4CZLA 3SK3A 1ZBIA 2WC9A 3QEPA 2O8FA 3ZT4A 5AQJA 2QWLA 3RRGA 1ZC6A 2Y1JA 2AP1A 2QXFA 1MWMA 1YIJN 1YAGA 4YORA 3P5JA 1VQ4N 2CH6A 1BUPA 5AQKA 3MCPA 3O5BA 5AQVA 3F73A 1BA1A 1D9DA 3EE9A 3A5LC 3LM9A 3U9DA 4FWRA 3TSPA 1I3AA 4HUGA 1ASVA 1NK7A 4B9VA 2O4IA 2YNIA 1VAZA 2KW4A 1LWFA 3KKSA 4DG1A 5C15A 2CGLA 5FPEA 3NGYA 4KHUA 3VF4A 3CC7N 3DRRA 1J5EK 3GL1A 2UXDK 2E5LK 3LANA 5C12A 4N5SA 3BZCA 1Q7YO 3QFUA 1MA9B 3RTVA 2QTDA 3CQ8A 1ATRA 3FR0A 3LDPA 3PIOL 1WSFA 1FKPA 4CHQA 2HHQA 4JD2A 1NGFA 2FF3B 2HOEA 4K42A 2IIRA 3UIQA 1YHQN 4A62A 3QEWA 3O9UA 4FJ7A 4FLWA 1OKJA 4YOTA 4CJLA 1NOYA 5LL6Z 3KK1A 3IFRA 4JI0K 2D1KA 2PBDA 4YOYA 4ID1A 5EXWA 2G8IA 1HJRA 4BQZA 3LWLA 4BC4A 4IOCL 5AQOA 4BR2A 2Q97A 4NLCA 3LDSA 1W7AA 1L3VA 5AQTA 3QIPA 3ENOA 5KPZA 4OJRA 1OVYA 1N5YA 1I39A 5M1OA 4Q0BA 3KJVA 4CZGA 2D0PA 5HRRA 2Q1NA 4DHYA 1WB9A 4DR5K 4FLYA 1IO2A 3LAKA 1IKVA 4E89A 3S9HA 5ELZA 1S6PA 4ID5A 2P9KB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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