4HVJA

Crystal structure of a putative uncharacterized protein from mycobacterium tuberculosis in complex with amp
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
160
structure length
156
Chain Sequence
b'SMVRYFYDTEFIEDGHTIELISIGVVAEDGREYYAVSTEFDPERAGSWVRTHVLPKLPPPASQLWRSRQQIRLDLEEFLRIDGTDSIELWAWVGAYDHVALCQLWGPMTALPPTVPRFTRELRQLWEDRGCPRMPPVHDALVDARDQLRRFRLITS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mycobacterium tuberculosis Rv2179c Protein Establishes a New Exoribonuclease Family with Broad Phylogenetic Distribution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Unknown function
total genus 52
structure length 156
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4hvjA00
4CFDA 3OS2A 5KI6A 3SQ0A 5SZTA 1O1WA 2GBZA 4CEBA 3CYMA 5HBMA 3PV8A 1Z26A 1Z25A 5E41A 4DTPA 3TAFA 3DM2A 4E89A 2IC3A 2YKNA 2YNGA 3AVKA 4I2QA 4I9LA 3SV4A 4FK4A 4UQGA 4B9VA 2B4JA 4GVMA 1ZBIA 3PX0A 2FBYA 1NKEA 1BHLA 4LSLA 4FJIA 3OYIA 3AVBA 1NK0A 4CIGA 3QNOA 2YHAA 1WSJA 3ALYA 4FJLA 5JS2A 4OGEA 4EP5A 4CERA 3V81A 3WNGA 4KI4A 4BE2A 1KFDA 1NOZA 4FM1A 2KFNA 4FLUA 2YNFA 4FJKA 5KRSA 1S9GA 3QIPA 3HPHA 2KTQA 1RDAA 3CQ8A 3TR8A 1VSIA 2XY6A 1B92A 2E6MA 4IFVA 2G8HA 2HHVA 1BCMA 2QKBA 3T1AA 4DS5A 4KB0A 4O4GA 3HJFA 3O4NA 3TAPA 4Z0UA 1BQNA 1T03A 5J2NA 2RPIA 3V6DA 4FJXA 1WSHA 4DMNA 2IGIA 2EX3A 4E0DA 2JGUA 3DRRA 4RG8A 5I3UA 4CEZA 3C6TA 4E3SA 4CHPA 4KREA 3IRXA 4ID5A 1JLAA 3LALA 4B9NA 4M3WA 1WAJA 4CECA 1U49A 4CF1A 5HRSA 1D9DA 2A1SA 4DU3A 4HCCA 2AJQA 4CJ4A 3SCXA 3O3GA 1MU2A 3SQ1A 4DTMA 1RBSA 5CYMA 4HUGA 3DLHA 3C94A 1WAFA 4CFBA 4FLYA 4IKFA 2DTUA 1WLJA 2IAJA 1Y97A 1U04A 1F21A 3KIOA 4HUEA 4DU1A 3PX4A 2KFZA 1QS4A 1KFSA 4IDKA 4CGFA 1WSEA 4E7LA 1VRTA 4IG3A 3AVGA 4I7FA 4OKKA 3ZSQA 3QEVA 5HLFA 3LDSA 1C0MA 5CY4A 4CE9A 1X9SA 3DOLA 3S3OA 1I39A 2Z1HA 3SUOA 4B9TA 4B8CA 3FFIA 1LWCA 3V9WA 4B08A 3L3VA 3OYKA 1BI4A 1FK9A 4ID1A 2ZD1A 3PUFA 1ZYQA 3AO2A 3RR8A 1SL1A 4FXDA 4OKJA 2DY4A 3RTVA 3V1QA 4B8AB 5KRTA 3TAEA 1BIZA 3V4IA 4BDYA 1JLFA 3ZT4A 3RRHA 2X74A 3LAMA 5C25A 1XHZA 1JKHA 4MQ3A 4DLGA 4DFMA 5HRNA 1VSMA 1HRHA 3CM5A 1T8EA 4RW4A 5J1EA 1JXEA 4GMJB 4WE1A 4CJFA 2YHBA 4BWJA 3LPTA 3VQ7A 4FYDA 1WSGA 3B6PA 3IG1A 3U6FA 2XY5A 1I3AA 1TV6A 3VQ6A 2OZSA 3AVHA 3KLGA 4LSNA 3SQ2A 4F2SA 3DLGA 3K5OA 3D45A 2BGGA 4DSLA 1JL1A 1HJRA 1JXBA 4KHSA 1RT4A 4CHQA 1R0AA 4BE0A 2PY5A 4ELTA 1VK0A 1UAXA 3HPGA 1QQCA 1EETA 4FJJA 2DFHA 5CZ2A 4CHOA 4KFBA 4E19A 4DLEA 3SPYA 3OYEA 3C95A 3NGZA 4C8KA 4CHNA 3OS0A 3S3MA 4N76A 2X6SA 4GW6A 4HVJA 3VA3A 1K6YA 1NK8A 4KI6A 3VQAA 1UA0A 4H8KA 4FZZA 3VQ4A 4HTUA 4M3XA 3QIOA 4NYFA 3P1GA 3OS1A 3NF9A 1L3UA 2XHBA 3MAQA 4DSIA 4RW9A 4FLVA 4K8XA 2PZSA 1NK7A 3PO5A 1KVBA 1TKXA 4DTJA 4HCBA 2RF2A 3VN5A 3HT3A 3AA3A 4DQSA 3T19A 1LWFA 1HNVA 4CF0A 2HNZA 4M3UA 2VG6A 3NF8A 4ZHRA 1NOYA 4E7KA 3TARA 1D9FA 4K8ZA 3OYGA 4IBNA 1CLQA 3QEIA 4B9LA 4W5NA 1CZBA 4O5BA 3HPOA 2XY8A 1KVCA 5SWMA 2O4IA 3LAKA 3QLHA 3OYFA 2Y1IA 4FJ5A 4CFAA 1VSLA 1KTQA 2BE2A 1ASWA 3QERA 4Z4EA 3TANA 4L8RB 4E7IA 1GOCA 3MEEA 4CESA 3L8BA 1TK0A 3DLKA 4CHYA 4JS5A 4CF2A 3KLHA 4W5TA 2FBXA 2WONA 1SUQA 3DLBA 4O0JA 4IG0A 1VSJA 3HVRA 4KHWA 1YTUA 1RT5A 2ZE2A 1LAWA 4F4KA 4BDPA 4I9QA 1RBTA 2X78A 3NH1A 4E1MA 1RTHA 3K5LA 4DS4A 2G8UA 2QKKA 3NF7A 3OJSA 3NAEA 3S9HA 2P51A 3IAYA 1REVA 2IS3A 4H4MA 1Q9YA 1TVRA 4F2RA 3KD5E 3NHGA 3V1RA 3NGIA 3SQ4A 2XO7A 3M8RA 4OPKA 1SKRA 2F8SA 4M41A 3A2FA 3DLRA 3KLEA 5HP1A 4KHYA 3L3UA 1EXQA 4DFJA 4M42A 4DFKA 3ITHA 2OA8A 4CGGA 1C0UA 3V9XA 4O0IA 1VSEA 1NK6A 1U45A 2KW4A 1JLQA 4Y1CA 3OYLA 3G0ZA 4Q5VA 4CJPA 3T3FA 5D3GA 1WSIA 2HVHA 1LAVA 3QINA 4DSFA 1ASVA 3AVNA 1IKXA 3ZSXA 2Q3SA 4TSXA 1JLGA 3F73A 1QSYA 1BI4B 3K5MA 3DYAA 1T7PA 2HHWA 3QEWA 4F8RA 1RDCA 1W9HA 3G10A 4DTXA 1RCHA 2QK9A 4J2BA 2HHTA 1S5JA 4M45A 3OVNA 4C8NA 1LWEA 3AVIA 4E7JA 2YNIA 2F8TA 4CJRA 3SV3A 1FKPA 4JS4A 2RKIA 3QEPA 1CXUA 2DFEA 4KTZA 1BL3A 5J2MA 5HROA 1J5OA 1CXQA 2D5RA 5FROA 4CEOA 4CEDA 5KTQA 4FJNA 2ETJA 3THVA 1S1TA 3HP6A 4FLWA 3NGYA 3NBPA 3VQ5A 4B9MA 3SZ2A 3SPZA 2D0BA 3LZIA 4W5RA 2G8VA 5FRNA 1RBUA 4Z4CA 1VSFA 3PX6A 3KK1A 3DMJA 5JS1A 3WNEA 4CJSA 2YNHA 3NDKA 3CM6A 1TL3A 3L2RA 4QOZB 1VSKA 4AHSA 4CGDA 3AVLA 4YFUA 1S1UA 3LZJA 4HHTA 3NF6A 3HXMA 3LP3A 1ITGA 3TAGA 4LY7A 4FLTA 3I0SA 2RN2A 3VA0A 5DK5A 4N56A 2KQ2A 4FW2A 4B9SA 3O4QA 1N5YA 4M3ZA 1X1PA 1FKOA 3M8QA 3OYDA 3NCIA 1J9AA 3VQ9A 4CHZA 3OYHA 3MEGA 2G8IA 4CK2A 4N5SA 3L2QA 1C0TA 4Z4FA 4CCHA 4JRQA 3EZ5A 3SNNA 3BGRA 4C8MA 3ULDA 4CGJA 3CFOA 4B9UA 3HK2A 4CJLA 4CJVA 1XWLA 3RR7A 1NKCA 3I0RA 1NK5A 2E6LA 4NCAA 3LP0A 1RT2A 3PO4A 1HQUA 1TKZA 2FC0A 2GUIA 2XRIA 4BWMA 1XC9A 4PA1A 1KSPA 2BDPA 3KLFA 2LSNA 3AA5X 3MEDA 2ATQA 4FZXC 4B3OA 1HYVA 2G8WA 5I42A 3AVMA 2VWKA 4DQQA 1WNSA 3SUQA 2D0CA 4I2PA 2HMIA 1SKSA 3MXJA 3K5NA 3NH2A 3OYAA 3K57A 1IG9A 2VWJA 4DTUA 1DTTA 3AVCA 3CG7A 1BISA 4CEQA 1RTDA 4FW1A 1RT3A 1QSLA 1U48A 2HHSA 2PYLA 1JLBA 3LWMA 2VG7A 2WOMA 3CFRA 4DF4A 1N6QA 5KGWA 1TAUA 4KHUA 3OJUA 1KCFA 4IFYA 2EHGA 5DMRA 1J53A 4FCYA 3HM9A 4J2AA 1JL2A 4PY5A 1YVUA 4DTOA 4CIFA 5EU7A 4PQUA 2P5OA 4CK1A 4OPJA 4EZ6A 3UIQA 3D0PA 4ICLA 3JSMA 3SI6A 3RMBA 1EKEA 2HVIA 2W42A 3V1OA 1IO2A 4KKOA 3AO4A 4AHUA 3HP9A 1A5VA 1EP4A 1Q8IA 4Y1DA 1U4BA 3H08A 2HW3A 2QXFA 4OVLA 5T7BA 1Q9XA 1KRPA 3AA2A 3ZT2A 1NJYA 3VQQA 4C8OA 1U47A 4CEEA 4FM0A 3B6OA 1J54A 4CJEA 3V9SA 3SUPA 1SL2A 4KHQA 4CJQA 1NJXA 1VRUA 1BGXT 3MECA 2KZZA 3ZSRA 2BANA 4AHVA 4C8LA 4CK3A 3KLIA 3QO9A 4JLHA 4KTQA 1D8YA 1LV5A 1NJWA 3QETA 1BQMA 1D5AA 3K2PA 3KKRA 3VQCA 2HHXA 4KHNA 3K58A 1NKBA 3S3NA 4FJ8A 3MXIA 1TK5A 3ISNC 1C1BA 5HRPA 1FXXA 4CEFA 3RMCA 1HNIA 1XI1A 1KLNA 3HSTB 1GOAA 1RILA 2Z1GA 4ZTFA 4M3TA 2YKMA 4BDZA 4F3OA 4YNQA 4ELVA 4KV8A 3ZSOA 1A5WA 4OLAA 4FJMA 2P1JA 1RT7A 1UWBA 3ASMA 3ZSZA 5C42A 4BE1A 4EP4A 2G8FA 1RBRA 4O44A 4CJ5A 1QSSA 3TAQA 4LH4A 1L3TA 1TGOA 2Z1JA 1RDDA 3M8SA 1C1AA 3OY9A 3CFPA 4NCBA 2HHUA 3ZT1A 3KKSA 1A5XA 2F96A 3LWLA 3VQEA 4FLZA 4LH5A 2OPQA 2OPSA 2VG5A 3RMAA 3OYNA 1X9WA 1VSHA 1UOCA 3L2VA 2ZQBA 1SL0A 2P5GA 4EZ9A 4FM2A 4KTWA 1CZ9A 3KK2A 4Z4GA 4F3TA 5FRMA 1DTQA 4ELUA 1XHXA 2D0AA 4NCGA 3U3GA 4CF8A 3LP2A 4PWDA 3ZCMA 4RW7A 1LW2A 2HB5A 3AO1A 3AVAA 3LANA 3M8PA 4AHRA 3O3HA 3TABA 4DWIA 3BDPA 3ZSYA 3SJJA 4FZYA 3VQ8A 3AVJA 1QE1A 5J2QA 2IDOA 3AO3A 3HVTA 4OGCA 3KTQA 4DU4A 3O3FA 1SV5A 4CEAA 1GOBA 2R7YA 5KGXA 3MXMA 1IH7A 2HNDA 4OJRA 5K14A 1NK4A 4AHCA 2B6AA 2OYQA 4OLBA 1NK9A 1RBVA 2NUBA 1KVAA 4CJ3A 4CJTA 3VQDA 4FJ7A 3RRGA 3K59A 4CJKA 1ZBUA 4DTNA 1TK8A 1S6PA 4DQRA 3ZT0A 4JRPA 1IKWA 1QTMA 3HYFA 3U3YA 1S9EA 4J2DA 3ZSWA 2PYJA 3OYCA 4CF9A 4DG1A 4AHTA 4FJGA 2Y1JA 4E7HA 1EX4A 4ZTJA 4FJHA 4Z4IA 4DTSA 4XIUA 3AVFA 4DQIA 3I8DA 1L3VA 2XY7A 1SKWA 4OKEA 1RTIA 4QCLA 4BACA 3DOKA 3KD1E 4AILC 1S1VA 1G15A 1TL1A 1YTAA 5CYQA 4CFCA 3TI0A 4N47A 3DRPA 4CIEA 1NJZA 3SYZA 4J2EA 3JYTA 4DSEA 3EY1A 1X9MA 2E4LA 3DI6A 1ZBHA 3AO5A 1TKTA 2YV0X 3DLEA 4FLXA 4FK2A 2HHQA 1HYZA 3ZT3A 3OYMA 2G8KA 4DSJA 4W5OA 4FVMA 1TKDA 4H4OA 4DFPA 1HQEA 4FK0A 2JLEA 1L3SA 3DRSA 1C6VA 2I5JA 1VSDA 1RDBA 4KAZA 1B9FA 4M3RA 3VQBA 3VQPA 3NE6A 2OZMA 5C24A 3TAMA 4R5PA 4CJUA 5J2PA 3NH0A 2X6NA 4QAGA 3E01A 4HUFA 4NYNA 1KLMA 1C1CA 3WNHA 4W5QA 3OYBA 3SUNA 4G1QA 1BCOA 4DF8A 3F9KA 4MFBA 1ZBLA 4KPYA 2FBVA 5HRRA 3QNNA 2B5JA 3TWHA 1RTJA 3OYJA 3HO1A 3HL8A 4RW8A 4DSKA 1HMVA 4PUOA 4LD0A 1S1WA 1WSFA 4RW6A 4KB1A 5CZ1A 1RT6A 4Q0BA 2Z1IA 3LPUA 5FDLA 3EYZA 3V9ZA 3KJVA 1L5UA 4M3YA 4E1NA 2GV9A 4Z4HA 3V9UA 2KZMA 2HNYA 4CJWA 1W0HA 2DFFA 4N41A 1HPZA 1IKYA 4CGHA 3PY8A 4O55A 3WNFA 3RWUA 3LP1A 4KO0A 1JLCA 3P83D 1S1XA 4AH9A 4DQPA 3L2WA 3P5JA 1HYSA 1WN7A 1QHTA 3C6UA 3IS9A 1RT1A 2IOCA 2ITGA 3QESA 1BIUA 3ZSVA 2A1RA 1B9DA 2FBTA 1JLEA 1RNHA 2OPPA 1LW0A 1TAQA 1YT3A 1IKVA 2O4GA 1DLOA 3NFAA 4DTRA 1ASUA 4CGIA 3RMDA 1T05A 2OPRA 3L2UA 4FJ9A 3QEXA 4KRFA 1S6QA 1UA1A 3AV9A 3AA4A 3KK3A 1ZBFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQWA 5KQDA 3CYMA 3VEYA 1Z26A 3VETA 5AQYA 3TAFA 1WBBA 4E89A 2YNGA 4FK4A 4B9VA 5LY3A 2A41A 2IIRA 4LSLA 3OYIA 2YHAA 3BEXA 4H0VB 4FJLA 4KI4A 4ISGA 1KFDA 1NOZA 2KKZA 2KFNA 5KRSA 1S9GA 2KTQA 1RDAA 3GE1A 4X64K 1FW6A 2E6MA 2HHVA 2FXUA 3T1AA 4JV5K 2UXDK 4KB0A 5EX5A 1T03A 5J2NA 2RPIA 4FJXA 4BREA 2EX3A 3O9RA 2JGUA 5I3UA 4E3SA 3C6TA 5M1NA 4K42A 2QWLA 5CE3A 3IRXA 1ATRA 3LALA 1DGKN 1D9DA 1U49A 4DV5K 4HCCA 4YORA 3TPQA 4DTMA 4XH4A 1Y97A 3KIOA 3PX4A 1QS4A 4X65K 4E7LA 3Q7CA 1JCGA 3C0BA 4ILGB 5HLFA 1QVFM 1BA1A 3LDSA 1GLFO 3DOLA 1X9SA 1I39A 3U4LA 2YHYA 1N8RO 4B9TA 4JKGA 3FFIA 1OH8A 3L3VA 4CZKA 2F4VK 1U6ZA 1VQ7N 1ZYQA 3AO2A 4FXDA 5KRTA 4FOEA 3CQXA 2EWSA 1JLFA 3RRHA 5C25A 4B1WB 4PL8A 5I9EB 1VSMA 3CM5A 1JXEA 3N4QA 2YHBA 4BWJA 3LPTA 3B6PA 3SLCA 3CF5L 3SK3A 4JI2K 3SQ2A 1NGCA 2QM1A 4F2SA 3L6QA 1HJRA 1U2VA 1BG3A 4BGBA 1VK0A 1QQCA 1EETA 4FWLA 5CZ2A 5JMVA 1N32K 3GDQA 3NGZA 4C8KA 3S3MA 4GW6A 3VA3A 1NK8A 1K6YA 4KI6A 3MN5A 4H8KA 4NYFA 3NF9A 4BR4A 5FLXO 4K8XA 2PZSA 4AM6A 1Z6RA 1MA9B 5M1KA 3AA3A 3FR0A 2VG6A 1NOYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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