3FR0A

Human glucokinase in complex with 2-amino benzamide activator
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Identification of novel and potent 2-amino benzamide derivatives as allosteric glucokinase activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fr0A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3fr0A01
3MN6A 2V52B 5EY4A 1RDWX 4IXCA 3VF6A 4CBUA 2PAVA 3ID8A 4BG9A 4B1UB 4B1XB 1XQSC 3BEXA 2E8AA 2YJFA 4Y0WA 4BRKA 3ULEB 3H45C 1HKCA 2E1YA 4BRNA 2F9WA 3ATUA 3VEVA 1KAYA 3O08A 5KPZA 3VETA 4BGBA 4PKGA 2W40A 1ZXOA 4H0VB 3GBTA 2VYPA 5B8HA 3CI5A 4PKHA 2J4RA 3CETA 5AQIA 3VGMA 3R9PA 1Z05A 1KXPA 3DXMB 4AM6A 4CZFA 4NB4A 4BRDA 2UYTA 2OANA 2QWLA 2Q0RA 3SMSA 1GLDG 4A2AA 1YXQA 3U9DA 3O5BA 4BC2A 1QHAA 2Q1NA 4M63C 3FGUA 2QW9A 2P9IB 3IDHA 5AZJB 5FPDA 4BR5A 1BO5O 1TYQA 4JHDA 4H5VA 3CQXA 2KHOA 1QZ6A 4BQLA 4YDUA 3GDQA 3QMLA 2AA4A 2V51B 3C7NA 3LDNA 3G25A 4O5FA 2P9NB 1NGIA 4FOIA 4CBWA 1ZC6A 4BG8A 3SLCA 4BRIA 4L3QA 1OKJA 3GG4A 2P9SB 4IWVA 4XH4A 1X3NA 2I7NA 4H5RA 2P9UB 1DEJA 5BPLA 5AQZA 3TU5A 1Z6RA 1NWKA 3R6MA 1C0GA 3BF1A 2BUPA 1T6DA 4M7XA 5EX5A 2QXLA 5AQOA 1Q18A 3VENA 5EOYA 3H6EA 1GLBG 4FWQA 2YHWA 2WUSA 1S22A 3FZFA 3CIPA 4FWOA 3U8XA 3WEEA 1X3MA 1GLFO 5F1XA 4FOEA 5BN8A 2E20A 4FO0A 5JMVA 4HWIA 3O6WA 5AQXA 2DPNA 4K41A 2FF3B 2FSJA 4BR7A 3AARA 4CZGA 2CGLA 4BR0A 5BRFA 1NGCA 1E4FT 3CERA 3VEZA 1TUUA 4MLEA 1LCUA 2IVNA 3VGKA 2ZGYA 4EIAA 1IJJA 3D2EB 3VEYA 3BP8A 2P9KB 4ISFA 5AQPA 4CBXA 3IMXA 4H5WA 3UKUB 4EAHD 2BTFA 2FSNA 1NGDA 4FL9A 5AQUA 5KPTA 4RWTA 3ZX3A 1BUPA 5KQ8A 2VCPA 3VEWA 3RSEB 3QICA 3D2FA 1C0FA 5AQGA 4WQ5A 4EHUA 1NGEA 3M3ZA 3S41A 5E84A 1V4TA 5TKYA 1YVNA 3FZMA 3MN7A 3DAWA 3LDQA 4IJAA 1NLVA 3UKRA 3W0LA 1YAGA 1U2VA 1BU6O 4BVPA 5AQNA 4BRAA 4M7YA 1HKGA 2Q2RA 4A2BA 1XC3A 4IO8A 3VEXA 1GLCG 3I8BA 5AZIA 3HTVA 2QWPA 4K42A 4K43A 5AR0A 5AQWA 4JD2B 4CD1A 3H1VX 5AQQA 4FWNA 4BGAA 5AQRA 3EO3A 1S3XA 4B1ZA 1P8ZA 2HF4A 2FF6A 2QM1A 3O1BA 3A8YA 2A5XA 2E88A 3DXKB 3FLCO 5FPNA 1K8KA 4FWKA 4BRCA 1HKBA 4I6MA 3H1QA 1GLEG 3DWLA 1BWFO 4H0PA 4CZLA 2P9LA 3ZETA 1GLAG 1IG8A 1SQKA 3MDQA 2QWQA 5JLHA 1QQNA 2GWKA 3WXKA 1MWMA 4ISGA 3R8EA 1ATSA 1BG3A 3D7EO 3WXIA 3FZLA 2P9SA 2P9UA 3QDKA 5EXWA 4GNIA 1QZ5A 3A0IX 3OHRA 3HBTA 3WT0A 2P9PA 5I9EB 1NBWA 5AQSA 2D4WA 3TPQA 3VGLA 3O1WA 4Z94A 4BC5A 2HF3A 3LM9A 3A5NC 4H0YB 3WQUA 2ZF5O 1HUXA 4GY2B 2GWJA 3GE1A 3I33A 1NGJA 4BQZA 2Q31A 4WQ4C 2CH6A 1BA0A 3C0BA 3ENOA 1MA9B 4XH5A 5FPMA 4B1YB 4F9OA 4XH1A 3LM2A 1TYQB 2V7YA 3CHWA 4FWMA 4JHDB 2FLOA 3WXJA 1ATNA 3MN5A 3ZX2A 4MO4A 1LOTB 3CJ9A 4AM7A 4JNEA 1WUAA 3IUCA 2H3GX 3F9MA 5AFUH 4DQ8A 3C7NB 2VWBA 4CZHA 2A3ZA 4CI6A 2HOEA 2CGKA 3L4IA 3L0QA 4BRQA 5AQMA 5LJVA 3B8AX 5LY3A 4JN4A 5JICA 1NM1A 3IFRA 4BR2A 4BC3A 5KQDA 2GUPA 1NGGA 3LDOA 3ZEUB 3GL1A 4H5NA 3VF2A 4QS7A 2E2QA 3QBWA 4MLHA 4PKIA 4IZ9A 1G99A 2ZWHA 4PL7A 5BPNA 5LJWA 1NGBA 4YDUC 5AFUA 2AP1A 3M6GA 2F9TA 2Q97A 3U4LA 3WEEB 3EKSA 3O8MA 5AQVA 2QWOA 3QB0A 5CE3A 3ULEA 1GLJO 4FWPA 3W3DA 3ZX0A 1YUWA 2ASPA 5ADXA 3A5OC 1BOTO 1HLUA 4H0XB 5F2RA 2GEMA 1ESVA 3KZBA 1GLLO 4RTFD 3FE1A 5F0XA 4CZKA 3AY9A 2E1ZA 4BR9A 3FZKA 3GOIA 3CJCA 3JXUA 1KAZA 5AQTA 2HMPA 4B1WB 3ATVA 3DXMA 2NRHA 1RFQA 1SZ2A 1H1VA 3VF4A 4JAXA 3SJHA 3SK3A 3VOVA 1X9JA 4WQ4A 1TUYA 3BUZB 3VERA 2P9IA 5AZJA 5AQFA 2A40A 5KPRA 2A42A 4BRHA 4BVOA 3CJAA 1JCGA 3UE5A 4FPAA 2GELA 3D2FB 3O80A 1BA1A 2ASOA 2I7PA 4PL8A 4IJNA 4A61A 2YHXA 4DB3A 4ISEA 1ZBSA 2P9NA 1Y64A 2YCHA 3UKRB 3BF3A 3H46O 3HSCA 4C23A 5AQJA 3LDLA 3CQYA 1DKGD 1U2VB 3A5MC 3M1FA 2ITMA 3ENHA 2QWNA 2ZGZA 5BREA 4CZMA 1NGHA 3LDPA 3FFKB 1DGKN 2QWMA 3SMPA 4BROA 1D4XA 2ASMA 3HZ6A 5AZIB 3KHYA 1J6ZA 2YJEA 3VESA 4CJ7A 4EHTA 1EQYA 3KVGA 2D0PA 3EL2A 3JS6A 1NGAA 2CGJA 2IVOA 4FWSA 3AAQA 4WQ5C 1ATRA 3P4IA 4BRGA 1K8KB 5AQHA 1HX1A 4I6MB 4QS8A 5BRHA 2W41A 3HM8A 3QFUA 4O8KA 3EZWA 5AQKA 2P9LB 1KAXA 3H3OB 3ZETB 4CZJA 1QQOA 1V4SA 4MO5A 5BPMA 5AQLA 4H03B 3WUHA 4FWRA 4DHYA 2CH5A 4WYBA 4B1VA 4XEIA 5FPEA 2PBDA 2D0OA 3EKUA 3CJBA 3FZHA 4H0TB 5ELZA 3VEOA 2A41A 1MWKA 2A6AA 3ZEUA 2P9PB 4BRFA 2IIRA 2FXUA 1HPMA 3D2EA 5AQYA 3UB5A 4FPBA 5ADXH 3WQTA 1HJOA 2P9KA 2GTDA 3DJCA 4BRLA 3EN9A 3UKUA 2NZTA 2E2NA 4CD3A 1JCFA 2YI1A 1R59O 1U6ZA 3U9ZA 3J8AA 2YHYA 1NGFA 3WXLA 4K25A 1RGIA 3HI0A 3VPZA 4EFHA 3A5LC 3LL3A 3CJ7A 4BC4A 3MN9A 3RSEA 1T6CA 2E2PA 1SAZA 1BDGA 2E2OA 4FSVA 4DCHA 4J8FA 1CZAN 5BR9A 2FSKA 4BR4A 4LC9B 3H3NO 5E26A 5BN9A 3FR0A 2NLXA 3AAPA 4RCHA 3O4WA 2IVPA 3MCPA 4BREA 2Q0UA 2Q36A 1NMDA 2EWSA 3QFPA 4KBOA 4B9QA 4HTLA 4E1JA 4FWLA 4CZIA 1JCEA 4CZEA 4QS9A 3QBXA 4NO7A 4JD2A 1E4GT 4BRPA 1T44A 2QWRA 1QQMA 2V7ZA 2D1KA 5EVZA 1MDUB 3MMVA 5BRDA 4BRMA 3DXKA 1XUPO 1WOQA 3MK6A 4A62A 4H0OA 5JLFA 4H5TA 3L6QA 3CJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OBYA 3DLBA 3PY8A 4CFDA 4BG9A 4CECA 4B1UB 4B1XB 4YOTA 2D0CA 4KAZA 2YJFA 1OVYA 3BZCA 1Q9XA 1FW6A 3ATUA 3ZT0A 3HPOA 3OYGA 4ELTA 3P1GA 1KAYA 4JKCA 1HNXK 3V9XA 5KPZA 4JS4A 3SQ4A 4DTPA 1ZXOA 5M1NA 2G8HA 5B8HA 4FXDA 3EZ5A 1VRUA 1RT7A 1SUQA 1Z05A 3R3LA 4NB4A 2UYTA 2OANA 2KFNA 2Q0RA 4CF1A 3G4SN 3O5BA 4YOYA 4BC2A 4IDKA 1QHAA 4FLWA 2QW9A 2P9IB 5FPDA 5AZJB 3CC4N 4BR5A 1TYQA 1QE1A 4JHDA 4H5VA 3CQXA 4DTNA 2GV9A 4IO9L 1QZ6A 1S1WA 2KTQA 3HVRA 2V51B 1C0UA 3NBPA 1TKZA 2P9NB 4FOIA 3SAHA 1WN7A 4FVUA 3TARA 2FBVA 4L3QA 1OKJA 3ITHA 2P9SB 3RR7A 2KFZA 1X3NA 2I7NA 2NNWA 1T7PA 2P9UB 5BPLA 4XIUA 2HHVA 5AQZA 1JLEA 5HRPA 2NRZA 3TU5A 3O4QA 4KI6A 3V9UA 1C0GA 3OVNA 3DYAA 2O8DA 3AVBA 1ZBUA 5K14A 1JL2A 1T6DA 4DV5K 1QVFM 2QK9A 3M8SA 3H6EA 1NMNA 1CZBA 2YHWA 5HRSA 4BDYA 2WUSA 3ID6A 4KV8A 3AVIA 2XY5A 1GLFO 2FBXA 4AHSA 1TVRA 2VG6A 3HSTB 3EEQA 2FF3B 2CGLA 1NGCA 3DOLA 3K9KA 3ZSWA 5C12A 4Q5VA 1TUUA 1VSLA 3KLHA 2WC9A 4DR3K 2ZGYA 4EIAA 1IJJA 1HPZA 4KHPK 2OZSA 1U45A 4J2AA 4YNQA 5AQPA 4BE2A 1QSYA 1C0TA 2BTFA 4IG3A 2QI2A 5KPTA 4RWTA 1HYVA 5KQ8A 2VCPA 3PV8A 2GBZA 2P5OA 1NGEA 1HNWK 3LPTA 2O8EB 4CIEA 1O1WA 1U2VA 2VWJA 4FYDA 5AQNA 3C95A 1HKGA 2VQEK 4IO8A 3VEXA 3RMCA 1GLCG 1XMQK 3I8BA 5AZIA 3HTVA 1TAUA 2O8CB 4DU3A 2Z1GA 4JD2B 4DS4A 2W6LA 3H1VX 3L2UA 1L3UA 2HBMA 1K9MO 3HPGA 4BGAA 3DMJA 1RT3A 3BZKA 4CHPA 5KGXA 5GIOA 2FF6A 3O1BA 4PHTX 2A5XA 2HVHA 1HKBA 3TSPA 4KPYA 3Q7BA 2HHWA 4H0PA 4FK2A 3KKRA 1ZBLA 3OYJA 2RPIA 4AHCA 5J2MA 1NK6A 1VQKN 4O44A 3HJFA 4CJTA 5EXWA 3QEIA 4MDBA 4CESA 3HBTA 3I8DA 4Z4IA 1T03A 2HSTA 2D4WA 3RWUA 3VGLA 4E7IA 2R7YA 3VQ6A 4M3ZA 3MXJA 4BC5A 3ZCMA 2HF3A 3LM9A 3WQUA 1A5VA 3I0SA 1S5JA 3CCQN 3I33A 4M3RA 1NGJA 4BQZA 3NH2A 3PX6A 2VQFK 3SQ2A 2F4VK 4FJJA 3OS0A 5KGWA 3HO1A 3CHWA 1VQLN 4YOWA 2UXDK 1R0AA 2FLOA 3RRHA 4MO4A 4OPKA 2O4IA 1JXEA 1WUAA 5AFUH 1VSJA 4DFPA 4RW7A 3THXA 2PZSA 1B9DA 2A3ZA 4CI6A 4DR6K 4B9SA 2HOEA 3L4IA 5AQMA 4CGGA 4JN4A 3DLEA 5M1PA 4C8NA 4DR5K 1Y97A 3IS9A 3LDOA 1YI2N 1CLQA 2E2QA 3QBWA 2UUCK 1RTHA 4J2DA 3F73A 5JS2A 4DTOA 2ZWHA 4NXNK 4PL7A 1D9FA 1NGBA 5AFUA 1HNIA 2F9TA 3BDPA 3EKSA 3QB0A 4F8RA 4FWPA 4JV5K 3M8PA 1YUWA 2ASPA 1VQ8N 3ASMA 3SJJA 3CCRN 4CK3A 4DS5A 2A1SA 3T1YK 2KLAA 2QXFA 4BR9A 4OPJA 1N32K 3GOIA 5CHIA 4DSJA 1KAZA 2ETJA 4K8XA 3VQ4A 4PUOA 4KTWA 4ILJA 3PLAA 1WSJA 2ZQBA 1JLBA 3OTOK 4IFVA 1IG9A 3P5JA 3VQEA 4CIGA 4DG1A 3SJHA 3VQ5A 1X9JA 2O8BA 1TUYA 3LP2A 1VRTA 3S3MA 2RHKA 3OJUA 3AA3A 4G1QA 4BRHA 1YITN 2KQ2A 1NOYA 2Z1HA 4WF9L 3OYDA 1BA1A 2Y1IA 3NF7A 3AV9A 4YORA 1KC8O 2OYQA 1TL3A 3OYBA 2F8TA 4O4GA 3MXIA 3DRSA 3CCSN 2YCHA 4KI4A 2OA8A 1TKXA 3H46O 3SPZA 4LSLA 5AQJA 1X9WA 5BREA 3CM6A 3FFKB 3HZ6A 4E3SA 1J6ZA 3IKMA 1RTDA 4X66K 4LF8K 3DLKA 3MEGA 3VA3A 2ZM6K 3JS6A 4W5OA 4KHSA 1P90A 1YJNN 5J2QA 3E01A 1ATRA 4BACA 1HYZA 1RT6A 1HX1A 3TWHA 4O8KA 5AQKA 4BDZA 1SKSA 1XI1A 2HBLA 5BPMA 3MAQA 3WUHA 3EYZA 3O9RA 4IFYA 4W5NA 3EE9A 3MWPA 4JI5K 4QOZB 3NH0A 2X78A 4FK4A 4JI1K 2BE2A 1YIJN 3JYTA 3MXMA 4XEIA 1BISA 3DI6A 5FPEA 2PBDA 3EKUA 5ELZA 3THVA 1MWKA 1RILA 3ZEUA 2FXUA 3M8RA 3D2EA 4CEFA 5AQYA 3UB5A 1HJOA 4FJ8A 2P9KA 2ZJRL 5J2NA 1KSPA 2NZTA 4CJKA 2YI1A 1KD1O 1RGIA 4BC4A 3MN9A 3RSEA 4NLBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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